View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19664_high_6 (Length: 548)

Name: NF19664_high_6
Description: NF19664
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19664_high_6
NF19664_high_6
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (1-384)||(39811895-39812276)
chr2 (1-384)||(32246579-32246966)
chr2 (34-384)||(44312563-44312908)
chr2 (5-365)||(19344236-19344596)
chr2 (5-365)||(19349094-19349454)
chr2 (1-338)||(11098844-11099180)
chr2 (1-338)||(14291331-14291668)
chr2 (1-338)||(9296318-9296655)
chr2 (1-291)||(25398386-25398674)
chr2 (1-291)||(25403524-25403812)
chr2 (1-178)||(3491751-3491929)
chr2 (93-179)||(8040059-8040147)
chr2 (96-178)||(40738844-40738926)
chr2 (84-175)||(13569331-13569425)
chr2 (84-179)||(21629943-21630040)
chr2 (84-178)||(28259178-28259274)
chr2 (84-179)||(10445444-10445542)
chr2 (84-179)||(17865202-17865300)
chr2 (84-179)||(20522219-20522317)
chr2 (84-179)||(34682334-34682432)
chr2 (1-148)||(25407653-25407801)
chr2 (84-177)||(34388859-34388955)
chr2 (84-179)||(14699008-14699105)
chr2 (84-177)||(10707252-10707348)
chr2 (84-175)||(8390150-8390244)
chr2 (93-178)||(31056044-31056131)
chr2 (84-179)||(33528621-33528719)
chr2 (84-179)||(39482930-39483028)
chr2 (93-179)||(16940219-16940307)
chr2 (93-179)||(17010884-17010972)
chr2 (84-178)||(23078471-23078567)
chr2 (84-178)||(42039670-42039766)
chr2 (94-179)||(33118135-33118222)
chr2 (95-178)||(36757774-36757859)
chr2 (115-175)||(1345574-1345635)
chr2 (115-175)||(2838063-2838124)
chr2 (115-174)||(35215586-35215646)
chr2 (115-174)||(35217963-35218023)
chr2 (95-157)||(27149306-27149369)
chr2 (95-175)||(2869705-2869787)
chr2 (118-174)||(45332181-45332238)
chr2 (115-174)||(23452237-23452297)
chr2 (115-174)||(36558864-36558924)
chr2 (115-174)||(36561141-36561201)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (1-384)||(31109490-31109870)
chr7 (1-384)||(24024233-24024616)
chr7 (1-364)||(12406149-12406510)
chr7 (1-384)||(12396712-12397090)
chr7 (5-363)||(19992130-19992487)
chr7 (5-365)||(21812149-21812508)
chr7 (89-384)||(4866530-4866820)
chr7 (1-338)||(20357464-20357801)
chr7 (5-363)||(24266112-24266471)
chr7 (5-363)||(24261233-24261592)
chr7 (1-338)||(2057802-2058146)
chr7 (5-363)||(16879889-16880248)
chr7 (5-363)||(16884745-16885104)
chr7 (1-338)||(1533360-1533694)
chr7 (1-338)||(21639656-21639987)
chr7 (1-338)||(21645854-21646185)
chr7 (1-178)||(18408764-18408942)
chr7 (1-178)||(18413641-18413818)
chr7 (84-179)||(29159802-29159900)
chr7 (94-177)||(21983285-21983370)
chr7 (84-179)||(46516310-46516408)
chr7 (84-179)||(49091660-49091758)
chr7 (84-178)||(44848685-44848781)
chr7 (84-179)||(2647696-2647794)
chr7 (84-179)||(33332450-33332548)
chr7 (96-179)||(9190021-9190106)
chr7 (96-179)||(20284088-20284173)
chr7 (84-179)||(55947-56044)
chr7 (96-179)||(2580389-2580474)
chr7 (95-179)||(35960815-35960901)
chr7 (96-179)||(9185178-9185263)
chr7 (84-179)||(4796667-4796765)
chr7 (99-178)||(47263678-47263757)
chr7 (95-178)||(2479337-2479421)
chr7 (115-175)||(28617258-28617319)
chr7 (94-177)||(21988909-21988992)
chr7 (115-174)||(31155911-31155971)
chr7 (115-174)||(1049296-1049356)
chr7 (115-174)||(2935497-2935557)
chr7 (115-174)||(3035953-3036013)
chr7 (115-178)||(5817303-5817366)
chr7 (115-174)||(7351652-7351712)
chr7 (131-178)||(8153466-8153514)
chr7 (115-174)||(9027194-9027254)
chr7 (115-174)||(22108295-22108355)
chr7 (115-174)||(22137306-22137366)
chr7 (115-174)||(40550055-40550115)
chr7 (115-174)||(40552333-40552393)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (5-384)||(39784734-39785112)
chr8 (1-384)||(25328185-25328566)
chr8 (1-334)||(7289832-7290166)
chr8 (1-358)||(6311121-6311476)
chr8 (1-338)||(36979221-36979557)
chr8 (5-363)||(35745208-35745566)
chr8 (1-338)||(33037724-33038060)
chr8 (1-338)||(30655484-30655826)
chr8 (1-338)||(4759992-4760329)
chr8 (1-338)||(18853084-18853422)
chr8 (5-363)||(10684174-10684533)
chr8 (1-338)||(18870478-18870813)
chr8 (1-338)||(10689059-10689396)
chr8 (1-178)||(1261872-1262050)
chr8 (96-178)||(26287902-26287985)
chr8 (96-178)||(26301159-26301242)
chr8 (96-178)||(26313153-26313236)
chr8 (1-178)||(31071147-31071326)
chr8 (93-179)||(26403240-26403328)
chr8 (84-178)||(4456028-4456124)
chr8 (84-175)||(7412344-7412437)
chr8 (84-178)||(19175755-19175851)
chr8 (84-179)||(23799577-23799675)
chr8 (96-179)||(4696609-4696694)
chr8 (84-179)||(5702483-5702581)
chr8 (84-175)||(6127224-6127318)
chr8 (115-176)||(9765852-9765914)
chr8 (96-179)||(19752407-19752492)
chr8 (115-174)||(43079877-43079937)
chr8 (115-174)||(43082248-43082308)
chr8 (112-178)||(6813683-6813750)
chr8 (115-148)||(18810982-18811015)
chr8 (115-174)||(44721118-44721178)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (1-384)||(28184299-28184683)
chr6 (1-384)||(14737483-14737864)
chr6 (1-384)||(14742343-14742723)
chr6 (1-384)||(11856767-11857153)
chr6 (1-384)||(22010603-22010981)
chr6 (1-394)||(28155477-28155869)
chr6 (5-363)||(6438319-6438674)
chr6 (5-363)||(6005234-6005592)
chr6 (1-363)||(16838561-16838923)
chr6 (1-363)||(33330351-33330715)
chr6 (1-363)||(33335848-33336212)
chr6 (1-338)||(5674686-5675021)
chr6 (133-363)||(5343297-5343527)
chr6 (84-178)||(5757479-5757575)
chr6 (84-178)||(21356036-21356132)
chr6 (94-179)||(10077176-10077263)
chr6 (84-179)||(5572241-5572339)
chr6 (95-179)||(31086485-31086571)
chr6 (234-338)||(30125944-30126048)
chr6 (94-178)||(4629954-4630040)
chr6 (84-179)||(31979512-31979610)
chr6 (84-179)||(22963699-22963796)
chr6 (84-179)||(23824597-23824694)
chr6 (84-166)||(21801344-21801429)
chr6 (96-156)||(22709041-22709102)
chr6 (84-157)||(18232867-18232942)
chr6 (96-179)||(5017482-5017567)
chr6 (115-179)||(31936586-31936651)
chr6 (115-174)||(12195515-12195575)
chr6 (115-174)||(4816231-4816291)
chr6 (115-174)||(5273216-5273276)
chr6 (115-174)||(19704567-19704627)
chr6 (115-174)||(20915356-20915416)
chr6 (115-174)||(26932562-26932622)
chr6 (115-174)||(29754709-29754769)
chr6 (115-174)||(33309110-33309170)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (1-384)||(15044486-15044864)
chr5 (1-384)||(43592082-43592458)
chr5 (1-358)||(1457068-1457423)
chr5 (1-384)||(43598527-43598903)
chr5 (1-384)||(43604019-43604395)
chr5 (1-384)||(43609511-43609887)
chr5 (5-365)||(28807485-28807844)
chr5 (1-358)||(27444793-27445149)
chr5 (1-358)||(27449637-27449993)
chr5 (5-364)||(37561355-37561715)
chr5 (5-360)||(37556533-37556889)
chr5 (1-334)||(30631253-30631586)
chr5 (5-363)||(2785192-2785550)
chr5 (5-363)||(33791133-33791491)
chr5 (1-256)||(31180138-31180393)
chr5 (5-363)||(31396901-31397261)
chr5 (5-363)||(31401758-31402118)
chr5 (46-363)||(33767996-33768314)
chr5 (1-291)||(38192064-38192352)
chr5 (1-291)||(38219289-38219577)
chr5 (1-337)||(24135696-24136027)
chr5 (1-178)||(35387663-35387841)
chr5 (84-178)||(9353333-9353429)
chr5 (84-178)||(36932351-36932447)
chr5 (84-178)||(10281751-10281848)
chr5 (84-178)||(15464532-15464628)
chr5 (84-177)||(11916972-11917068)
chr5 (84-178)||(14520230-14520326)
chr5 (93-179)||(17003970-17004058)
chr5 (84-179)||(3880298-3880396)
chr5 (84-175)||(12084176-12084269)
chr5 (84-178)||(19588746-19588843)
chr5 (96-179)||(28832258-28832343)
chr5 (96-179)||(42127423-42127508)
chr5 (115-174)||(4410241-4410301)
chr5 (99-179)||(31300612-31300694)
chr5 (115-174)||(15552464-15552524)
chr5 (115-174)||(31179371-31179431)
chr5 (115-174)||(31542953-31543013)
chr5 (115-174)||(31545299-31545359)
chr5 (121-174)||(27910675-27910729)
chr5 (96-179)||(24553520-24553604)
chr5 (115-174)||(3373137-3373197)
chr5 (115-174)||(10749919-10749979)
chr5 (115-174)||(15354575-15354635)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (1-384)||(45357203-45357586)
chr4 (1-384)||(45347723-45348107)
chr4 (4-384)||(5732460-5732839)
chr4 (1-384)||(9224313-9224696)
chr4 (1-384)||(9229100-9229482)
chr4 (1-384)||(3813818-3814201)
chr4 (5-363)||(18855544-18855900)
chr4 (1-358)||(51520280-51520636)
chr4 (48-384)||(56146664-56146993)
chr4 (1-338)||(24741784-24742120)
chr4 (2-338)||(29760486-29760821)
chr4 (96-178)||(28468542-28468625)
chr4 (84-179)||(10047378-10047476)
chr4 (84-179)||(39245993-39246091)
chr4 (84-179)||(36315230-36315327)
chr4 (84-179)||(36329439-36329536)
chr4 (84-178)||(31985635-31985730)
chr4 (84-179)||(16623293-16623391)
chr4 (84-178)||(5396672-5396768)
chr4 (93-179)||(38152449-38152537)
chr4 (96-181)||(5269204-5269291)
chr4 (84-178)||(3796519-3796616)
chr4 (94-177)||(5143260-5143345)
chr4 (94-177)||(5147678-5147763)
chr4 (93-179)||(24333808-24333896)
chr4 (84-177)||(3777550-3777645)
chr4 (93-173)||(6743425-6743507)
chr4 (84-179)||(16630680-16630778)
chr4 (96-179)||(25862035-25862120)
chr4 (115-174)||(16931789-16931849)
chr4 (115-174)||(16934143-16934203)
chr4 (115-174)||(22780373-22780433)
chr4 (115-174)||(44599838-44599898)
chr4 (84-157)||(39774305-39774380)
chr4 (94-179)||(54867183-54867269)
chr4 (115-174)||(6765117-6765177)
chr4 (115-174)||(7941596-7941656)
chr4 (115-174)||(18709164-18709224)
chr4 (115-174)||(22782738-22782798)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (1-384)||(9550-9928)
scaffold0355 (236-384)||(28-169)
scaffold0355 (1-92)||(3755-3845)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (4-384)||(18656230-18656609)
chr3 (1-384)||(22173101-22173482)
chr3 (1-338)||(7167088-7167424)
chr3 (1-334)||(28503781-28504104)
chr3 (1-365)||(2676993-2677358)
chr3 (1-365)||(2672837-2673202)
chr3 (1-338)||(2671503-2671840)
chr3 (5-363)||(8512032-8512392)
chr3 (5-363)||(8516912-8517272)
chr3 (3-338)||(8738982-8739318)
chr3 (3-338)||(9091220-9091556)
chr3 (1-330)||(24967957-24968286)
chr3 (5-363)||(32475301-32475659)
chr3 (5-363)||(32480158-32480517)
chr3 (1-338)||(8477208-8477544)
chr3 (1-135)||(28501614-28501750)
chr3 (130-363)||(10207750-10207983)
chr3 (1-196)||(40372713-40372908)
chr3 (1-178)||(26928508-26928687)
chr3 (1-178)||(32143321-32143500)
chr3 (84-178)||(1305949-1306044)
chr3 (84-178)||(8370477-8370573)
chr3 (84-178)||(27974943-27975039)
chr3 (84-179)||(18552873-18552971)
chr3 (84-179)||(21711222-21711319)
chr3 (84-178)||(16264350-16264446)
chr3 (84-178)||(27452958-27453054)
chr3 (96-178)||(27986449-27986533)
chr3 (84-177)||(36029094-36029190)
chr3 (84-175)||(1736295-1736389)
chr3 (84-178)||(30709780-30709877)
chr3 (96-178)||(33386669-33386753)
chr3 (84-179)||(3715992-3716090)
chr3 (84-179)||(40592772-40592870)
chr3 (84-179)||(48438213-48438311)
chr3 (84-179)||(6794704-6794801)
chr3 (84-179)||(26298987-26299085)
chr3 (96-179)||(1417493-1417578)
chr3 (84-178)||(25795781-25795878)
chr3 (84-179)||(47923896-47923994)
chr3 (96-179)||(37466290-37466375)
chr3 (96-178)||(39039995-39040079)
chr3 (84-179)||(40844651-40844748)
chr3 (96-179)||(3328359-3328444)
chr3 (112-178)||(4386947-4387014)
chr3 (84-179)||(24695154-24695252)
chr3 (268-338)||(40372980-40373049)
chr3 (115-174)||(38210569-38210629)
chr3 (115-174)||(50494198-50494258)
chr3 (111-174)||(53894055-53894119)
chr3 (96-157)||(3323693-3323755)
chr3 (115-174)||(458483-458543)
chr3 (115-174)||(6063444-6063504)
chr3 (115-174)||(10621528-10621588)
chr3 (131-178)||(39153357-39153405)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (1-384)||(41398034-41398414)
chr1 (1-384)||(25444996-25445380)
chr1 (5-384)||(44023785-44024161)
chr1 (5-384)||(39445294-39445673)
chr1 (5-363)||(1054923-1055279)
chr1 (1-280)||(41390485-41390759)
chr1 (1-338)||(24787281-24787621)
chr1 (5-363)||(43988372-43988734)
chr1 (1-291)||(24202687-24202973)
chr1 (282-384)||(41386545-41386646)
chr1 (1-178)||(19358761-19358939)
chr1 (1-178)||(19361350-19361528)
chr1 (1-178)||(19379990-19380168)
chr1 (84-178)||(26644898-26644994)
chr1 (93-179)||(47703946-47704034)
chr1 (84-178)||(19072928-19073025)
chr1 (84-178)||(19120818-19120915)
chr1 (84-179)||(16124516-16124614)
chr1 (84-179)||(27104372-27104470)
chr1 (1-74)||(25439803-25439875)
chr1 (84-178)||(3281708-3281804)
chr1 (93-179)||(9476260-9476348)
chr1 (93-179)||(13598397-13598485)
chr1 (93-179)||(29651810-29651898)
chr1 (86-178)||(37069770-37069864)
chr1 (93-179)||(775671-775759)
chr1 (96-179)||(47098837-47098922)
chr1 (84-178)||(13604624-13604720)
chr1 (84-178)||(21536570-21536666)
chr1 (96-179)||(32889438-32889523)
chr1 (115-175)||(47102874-47102935)
chr1 (115-174)||(9459419-9459479)
chr1 (115-174)||(9463246-9463306)
chr1 (115-174)||(16226386-16226446)
chr1 (115-174)||(23786058-23786118)
chr1 (115-174)||(51752582-51752642)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (1-384)||(34968-35350)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (5-384)||(157-536)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (5-363)||(148866-149224)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (5-363)||(2161-2519)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (5-363)||(14219-14578)
scaffold0197 (5-363)||(19075-19433)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (110-363)||(181980-182233)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (1-291)||(17870-18157)
scaffold0188 (1-178)||(23963-24141)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (282-384)||(34136-34237)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (146-338)||(300-491)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (84-178)||(8420-8516)
scaffold0140 (115-174)||(22343-22403)
scaffold0140 (115-174)||(24618-24678)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (84-177)||(85684-85779)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (295-384)||(13143-13233)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (84-178)||(43962-44058)
scaffold0087 (84-178)||(36833-36929)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (93-179)||(5682-5770)
scaffold0006 (93-179)||(2491-2579)
scaffold0006 (84-178)||(133281-133377)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (84-179)||(10728-10826)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (96-178)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (84-175)||(17266-17360)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (115-174)||(269-329)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (115-148)||(11500-11533)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (115-174)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 39811895 - 39812276
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39811895 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 39811994  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  39811995 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggttcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttctt 39812093  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttc 300  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812094 ttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttc 39812193  T
Q  301 tcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812194 tcattgattatcactatcacttgctccacacatctttggtttatt-tcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 39812276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32246966 - 32246579
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32246966 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtataatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgta 32246867  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttct---tt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  32246866 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcctt 32246767  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
      |||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32246766 tttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttggagaccatttg 32246667  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttg--gaaccggattcacaa 384  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32246666 ttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaaggtttctttgtagaaccggattcacaa 32246579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 384
Target Start/End: Original strand, 44312563 - 44312908
Alignment:
Q  34 caaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312563 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 44312662  T
Q  133 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  44312663 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatct 44312760  T
Q  233 c-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacac 331  Q
    | |||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44312761 ctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 44312860  T
Q  332 atctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||    
T  44312861 atcatt-gtttatt-tcattggtgtgaagat---ttttgaaccggattcacaa 44312908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19344596 - 19344236
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaac 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19344596 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaac 19344498  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  19344497 acattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcctt 19344398  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  19344397 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 19344302  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttc 365  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19344301 tctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttggtttatt-tcattggtgtgaaggtttc 19344236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19349454 - 19349094
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaac 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19349454 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaac 19349356  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  19349355 acattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcctt 19349256  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  19349255 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 19349160  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttc 365  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19349159 tctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttggtttatt-tcattggtgtgaaggtttc 19349094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 11098844 - 11099180
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| | ||||  ||  ||||||||| ||||    
T  11098844 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaaccctttg 11098942  T
Q  99 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  11098943 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-tt 11099040  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatt 295  Q
    |||||    ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11099041 cctttcttccttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccatt 11099138  T
Q  296 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    | |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11099139 t-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttg 11099180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14291668 - 14291331
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||    
T  14291668 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttg 14291570  T
Q  99 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  14291569 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-tt 14291472  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatt 295  Q
    |||||   |||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14291471 cctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacattagtctagggctgtttttgttgttgtttgcttggaaaccatt 14291373  T
Q  296 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14291372 t-tgcccattgattaccactatctcttgctccacacacctttg 14291331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 9296318 - 9296655
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||  |||||  ||| ||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||    
T  9296318 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtataa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttg 9296416  T
Q  99 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  9296417 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-tt 9296514  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatt 295  Q
    |||||   |||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9296515 cctttcttgcttttcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtttgcttggaaaccatt 9296613  T
Q  296 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    | | ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  9296614 t-tgctcatagattaccactaccttttgctccacacatctttg 9296655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25398674 - 25398386
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  25398674 tttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 25398576  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttcttt 197  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||    
T  25398575 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-tt 25398478  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagac 291  Q
    |||||   |||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25398477 cctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac 25398386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25403812 - 25403524
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  25403812 tttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 25403714  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttcttt 197  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||    
T  25403713 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgagtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-tt 25403616  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagac 291  Q
    |||||   |||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25403615 cctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac 25403524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3491929 - 3491751
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  3491929 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 3491831  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491830 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 3491751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8040147 - 8040059
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8040147 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 8040059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40738926 - 40738844
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40738926 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 40738844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13569425 - 13569331
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  13569425 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 13569331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21630040 - 21629943
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21630040 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 21629943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 28259178 - 28259274
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28259178 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 28259274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 10445444 - 10445542
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  10445444 tcttgtaactcttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttg 10445542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17865300 - 17865202
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17865300 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatcttg 17865202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20522317 - 20522219
Alignment:
Q  84 tcttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20522317 tcttgtaacccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20522219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 34682334 - 34682432
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34682334 tcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 34682432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25407801 - 25407653
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  25407801 tttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 25407703  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattagg 148  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407702 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34388955 - 34388859
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  34388955 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatct 34388859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 14699008 - 14699105
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14699008 tcttgtaactcttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 14699105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 177
Target Start/End: Original strand, 10707252 - 10707348
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10707252 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 175
Target Start/End: Original strand, 8390150 - 8390244
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 175  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8390150 tcttgtaactcttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaat 8390244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31056131 - 31056044
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  31056131 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctt 31056044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 33528621 - 33528719
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33528621 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 33528719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39483028 - 39482930
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  39483028 tcttgtaactcttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 39482930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Original strand, 16940219 - 16940307
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  16940219 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 16940307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Original strand, 17010884 - 17010972
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  17010884 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 17010972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 23078471 - 23078567
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  23078471 tcttgtaactctttctaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaacattctt 23078567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 42039670 - 42039766
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  42039670 tcttgtaactcttcgtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatctt 42039766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33118222 - 33118135
Alignment:
Q  94 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||    
T  33118222 ttttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaatcttg 33118135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Original strand, 36757774 - 36757859
Alignment:
Q  95 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36757774 tttgaaacactttcatcatactggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 36757859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 175
Target Start/End: Original strand, 1345574 - 1345635
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 175  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1345574 tggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1345635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 175
Target Start/End: Original strand, 2838063 - 2838124
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 175  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  2838063 tggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 2838124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35215646 - 35215586
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35215646 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35215586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35218023 - 35217963
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35218023 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35217963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 157
Target Start/End: Original strand, 27149306 - 27149369
Alignment:
Q  95 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 157  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  27149306 tttgtatcactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatagtaggtcatattgg 27149369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 175
Target Start/End: Original strand, 2869705 - 2869787
Alignment:
Q  95 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 175  Q
    |||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  2869705 tttgtatcactttcatcttagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaat 2869787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45332238 - 45332181
Alignment:
Q  118 attggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  45332238 attggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 45332181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23452297 - 23452237
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  23452297 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 23452237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36558924 - 36558864
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  36558924 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36558864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36561201 - 36561141
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  36561201 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36561141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 31109490 - 31109870
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109490 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 31109589  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  31109590 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcctt 31109689  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttc 300  Q
    ||   | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109690 ttcttgtttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttc 31109788  T
Q  301 tcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109789 tcattgattatcactatcacttgctgcacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 31109870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 24024233 - 24024616
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24024233 tttagggttcatcgtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaacattttgta 24024332  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtg-ttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  24024333 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttcttcct 24024432  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
    |||   |||| |||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24024433 tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatatactagtcata-ggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 24024530  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaagg-tttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24024531 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggttttctttggaaccggattcacaa 24024616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12406510 - 12406149
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12406510 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgt 12406411  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  12406410 aacactttctcatattggattggagagctattctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttct 12406312  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12406311 tttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 12406213  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggttt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12406212 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggttt 12406149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12397090 - 12396712
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12397090 tttagggttcatattgtgatagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagattaaaggctagagttcttgtaaccttttgt 12396991  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  12396990 aacactttctcatattggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccc 12396892  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12396891 tttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 12396793  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  12396792 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggt---ttttgaaccggattcacaa 12396712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19992487 - 19992130
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaaca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19992487 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaaca 19992389  T
Q  104 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-ttt 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19992388 ctttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttt 19992289  T
Q  203 accgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttct 301  Q
    |||| || |||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||    
T  19992288 accgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagccatttgttct 19992191  T
Q  302 cattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19992190 cattgattatcactatcacctgctccacacatctttggtttatt-tcattggtgtgaaggtt 19992130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 365
Target Start/End: Original strand, 21812149 - 21812508
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagctt-ga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||     
T  21812149 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagctttgacaagctagagtcttggaaccttttgtaag 21812247  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttcctt 201  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  21812248 actt-cacatattggattggaaagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcttt 21812346  T
Q  202 taccgcttgtcttgtttatgctt-tggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttc 300  Q
    ||||| || |||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| ||    
T  21812347 taccgtttatcttgtttatgcttgttaactct-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgttagcttggaagccatttgctc 21812444  T
Q  301 tcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttc 365  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21812445 tcatagattaccactatctcttgctccacacatctttggtttatt-tcattggtgtgaaggtttc 21812508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 89 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4866820 - 4866530
Alignment:
Q  89 taaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4866820 taaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgtt 4866722  T
Q  189 ttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatc-tcttgtgtgg-ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttg 286  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  4866721 ttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttg 4866623  T
Q  287 gagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  4866622 gagaccatttgtcctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggt---ttttgaaccggattcacaa 4866530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 20357464 - 20357801
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||    
T  20357464 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcatgttcttgtgtaaagcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttg 20357563  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  20357564 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtattttgttcttcc 20357662  T
Q  199 ctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccattt 296  Q
     |||   |||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20357663 ttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttagcttggagaccattt 20357760  T
Q  297 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20357761 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttg 20357801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Original strand, 24266112 - 24266471
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaac 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24266112 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaac 24266210  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||    
T  24266211 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcct 24266310  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttg 297  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  24266311 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttg 24266405  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
      ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24266406 cactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaaggtt 24266471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Original strand, 24261233 - 24261592
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaac 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24261233 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaac 24261331  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |    
T  24261332 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctt 24261431  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttg 297  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  24261432 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttg 24261526  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
      ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24261527 cactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaaggtt 24261592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2058146 - 2057802
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaa-gggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||    
T  2058146 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaacccttt 2058048  T
Q  98 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2058047 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctt 2057949  T
Q  197 tcctttaccgcttgtcttg----tttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggaga 290  Q
     | ||||  |||| |||||    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || || ||  |||||| | ||||||||||||| ||||||| |    
T  2057948 ccttttattgcttatcttgtttttttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcggtttttgttgttgtttgcttggaaa 2057849  T
Q  291 ccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2057848 ccatttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatctttg 2057802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16880248 - 16879889
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaat-accaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaac 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||  |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||     
T  16880248 gggttcatagtgtgaggttgggaaatttatcaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaaa 16880150  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |    
T  16880149 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctt 16880050  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttg 297  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  16880049 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttg 16879955  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
      ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16879954 cactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaaggtt 16879889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16885104 - 16884745
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaat-accaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaac 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||  |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||     
T  16885104 gggttcatagtgtgaggttgggaaatttatcaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaaa 16885006  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |    
T  16885005 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctt 16884906  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttg 297  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  16884905 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttg 16884811  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
      ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16884810 cactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaaggtt 16884745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 1533360 - 1533694
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttat-gtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||  ||  ||||||||| |||    
T  1533360 tttagggttcatattgtgagagtgggaaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaacccttt 1533458  T
Q  98 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttct 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  1533459 gtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttatt-ggtgtgtttgttct 1533557  T
Q  196 ttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggct-gttttgttgttgttggcttggagaccat 294  Q
    || ||||   |||| | |||||  ||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||| ||  |    
T  1533558 tt-ctttcttgcttatattgtt--tgctttgtattctctt-tgtggtgttgctctacactagactggggctggttttgttgttgtt-gcttggaaac--t 1533650  T
Q  295 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  1533651 tttttctcattgattaccactatattttgctccacacatctttg 1533694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21639987 - 21639656
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  21639987 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 21639889  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttcttt 197  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||    
T  21639888 aacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-tt 21639791  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccattt 296  Q
    |||||   |||| |||||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  21639790 cctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagacactt- 21639697  T
Q  297 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
     | ||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  21639696 -tactcatagattaccactcccttttgctccacacatctttg 21639656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21646185 - 21645854
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||| |    
T  21646185 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaacccttttt 21646087  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttcttt 197  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||    
T  21646086 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-tt 21645989  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccattt 296  Q
    |||||   |||| |||||||  || |||| | |||||  |||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  21645988 cctttcttgcttatcttgtt--tgttttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagacactt- 21645895  T
Q  297 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
     | ||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  21645894 -tactcatagattaccactcccttttgctccacacatctttg 21645854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18408942 - 18408764
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | | ||   | ||||||||| |||||    
T  18408942 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttatttttcttgtaaccctttgt 18408844  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408843 aacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18408764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18413818 - 18413641
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| |  |||   | ||||||||| |||||    
T  18413818 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaatctatttttcttgtaaccctttgt 18413720  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413719 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18413641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29159900 - 29159802
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29159900 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 29159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21983370 - 21983285
Alignment:
Q  94 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 177  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21983370 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 46516310 - 46516408
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46516310 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 46516408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 49091758 - 49091660
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  49091758 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatcttg 49091660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 44848685 - 44848781
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  44848685 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 44848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 2647696 - 2647794
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  2647696 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatcttg 2647794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 33332450 - 33332548
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  33332450 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 33332548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 9190021 - 9190106
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9190021 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9190106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20284173 - 20284088
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20284173 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20284088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 56044 - 55947
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  56044 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 55947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2580474 - 2580389
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  2580474 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 2580389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35960901 - 35960815
Alignment:
Q  95 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  35960901 tttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatcttg 35960815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 9185178 - 9185263
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9185178 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9185263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 4796667 - 4796765
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4796667 tcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaatcttg 4796765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 47263757 - 47263678
Alignment:
Q  99 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47263757 taacactttcatcatagtggattggagagctgc--tctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47263678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2479421 - 2479337
Alignment:
Q  95 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  2479421 tttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 2479337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 175
Target Start/End: Original strand, 28617258 - 28617319
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  28617258 tggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaat 28617319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21988992 - 21988909
Alignment:
Q  94 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 177  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||  | |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21988992 ttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttgctctc--ctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21988909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 31155971 - 31155911
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31155971 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31155911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1049356 - 1049296
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  1049356 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1049296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 2935497 - 2935557
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2935497 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 2935557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 3035953 - 3036013
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  3035953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3036013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 178
Target Start/End: Original strand, 5817303 - 5817366
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  5817303 tggattggagagctgctctct-ccccagagtaggtcatattggaccgaactgagttaacaatctt 5817366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7351712 - 7351652
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  7351712 tggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 7351652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153514
Alignment:
Q  131 tctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctt 8153514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9027254 - 9027194
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9027254 tggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9027194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 22108295 - 22108355
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22108295 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22108355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 22137306 - 22137366
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22137306 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22137366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 40550055 - 40550115
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  40550055 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40550115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 40552333 - 40552393
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  40552333 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40552393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 384
Target Start/End: Original strand, 39784734 - 39785112
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaaca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  39784734 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaaca 39784832  T
Q  104 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccttt- 202  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39784833 ctt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttt 39784931  T
Q  203 accgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctc 302  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39784932 accgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttattggcttggagaccatttgttctc 39785031  T
Q  303 attgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39785032 attgattatcactatcacttgctccacacatctttggtttatt-tcattggtgtgaaggtttctttggaaccagattcacaa 39785112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 25328185 - 25328566
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328185 tttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 25328284  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttcc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  25328285 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttttcc 25328383  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgtt 299  Q
    ||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328384 tttaccgtttatctcgtttatgttttggtatctcttgtgtggttttgctatacactag-ttagggttgttttgttgttgttggcttggagaccatttgtt 25328482  T
Q  300 ctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328483 ctcattgattatcactatcacttgctccgcacatcattgatttatt-tcattgttgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 25328566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 7289832 - 7290166
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7289832 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatatagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgt 7289931  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |     
T  7289932 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcct 7290030  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||| | ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7290031 tttatcacttatcttgtttatggtttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgtttggagaccatttgt 7290130  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7290131 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatc 7290166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6311476 - 6311121
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6311476 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgtct-tgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttg 6311378  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  6311377 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttc 6311280  T
Q  199 ctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6311279 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctcttagtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggaaaccatttg 6311180  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtga 358  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  6311179 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 6311121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36979557 - 36979221
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||    
T  36979557 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttg 36979459  T
Q  99 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  36979458 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-tt 36979361  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatt 295  Q
    |||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36979360 cctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccatt 36979263  T
Q  296 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    | |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36979262 t-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttg 36979221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 35745566 - 35745208
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaac 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35745566 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaac 35745468  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |    
T  35745467 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcctt 35745369  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  35745368 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 35745273  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
     ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745272 actcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaaggtt 35745208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 33037724 - 33038060
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||    
T  33037724 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttg 33037822  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  33037823 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-ttc 33037920  T
Q  199 ctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtt--ttgttgttgttggcttggagaccatt 295  Q
     |||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33037921 ttttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttattgttgttgtt-gcttggaaaccatt 33038018  T
Q  296 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    | |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33038019 t-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttg 33038060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30655826 - 30655484
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||    
T  30655826 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttg 30655728  T
Q  99 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtg----ttttgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    |||||||    
T  30655727 taacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttttttgtt 30655629  T
Q  194 ctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctct-tgtgtggttttgctatacactagcttagggctg--ttttgttgttgttggcttggaga 290  Q
    | |||||||   |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |    
T  30655628 c-ttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctatgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttttgttgttgtt-gcttggaaa 30655531  T
Q  291 ccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30655530 ccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttg 30655484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 4759992 - 4760329
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||    
T  4759992 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttg 4760090  T
Q  99 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||    
T  4760091 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-gatgttttgttc-tt 4760188  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatt 295  Q
    |||||   |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4760189 cctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccatt 4760287  T
Q  296 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4760288 t-tgctcattgattaccactatctctagctccacacatctttg 4760329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 18853084 - 18853422
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacc-tttt 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||    
T  18853084 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtaaaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaaccctttt 18853182  T
Q  98 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 196  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  18853183 gtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-t 18853280  T
Q  197 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggc-tgttttgttgttgttggcttggagaccat 294  Q
    ||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || || ||  |||||| | |||| |||||||| ||||||| |||||    
T  18853281 tcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttttttgttgtttgcttggaaaccat 18853379  T
Q  295 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18853380 ttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatctttg 18853422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Original strand, 10684174 - 10684533
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaac 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10684174 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaac 10684272  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |    
T  10684273 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctt 10684372  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttg 297  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  10684373 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttg 10684467  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
      ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10684468 cactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaaggtt 10684533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 18870478 - 18870813
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacc-tttt 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||    
T  18870478 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaaccctttt 18870576  T
Q  98 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 196  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  18870577 gtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-t 18870674  T
Q  197 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatt 295  Q
    ||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || || ||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  18870675 tcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggc-gtttt-ttgttgtttgcttggaaaccatt 18870771  T
Q  296 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    |   ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18870772 t-aactcatagattaccattatctcttgctccacacatctttg 18870813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 10689059 - 10689396
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaa-gggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| | |    
T  10689059 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctct 10689157  T
Q  98 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  10689158 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-t 10689255  T
Q  197 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccat 294  Q
    ||||||    ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10689256 tcctttcttacttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactacactagggttgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccat 10689353  T
Q  295 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    | |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10689354 tag-actcatagattaccactatctcttgctccacacatctttg 10689396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 1261872 - 1262050
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  1261872 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgtacttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 1261970  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1261971 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaatctt 1262050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26287985 - 26287902
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287985 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26287902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26301242 - 26301159
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26301242 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26301159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26313236 - 26313153
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313236 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26313153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 31071147 - 31071326
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  31071147 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 31071245  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  31071246 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctt 31071326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Original strand, 26403240 - 26403328
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26403240 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 26403328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4456124 - 4456028
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  4456124 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatctt 4456028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7412437 - 7412344
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 175  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  7412437 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 7412344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 19175755 - 19175851
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19175755 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19175851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 23799577 - 23799675
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23799577 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 23799675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 4696609 - 4696694
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4696609 ttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 4696694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 5702483 - 5702581
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5702483 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5702581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6127318 - 6127224
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  6127318 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 6127224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 176
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765914
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 19752407 - 19752492
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19752407 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 19752492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 43079877 - 43079937
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43079877 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43079937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 43082248 - 43082308
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43082248 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43082308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6813750 - 6813683
Alignment:
Q  112 tattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  6813750 tattggattggagagctgctctctcccctagtgtaggttatattggaccgaactgggttaacaatctt 6813683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Original strand, 18810982 - 18811015
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18810982 tggattggagggctgctctctcccccagattagg 18811015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 44721118 - 44721178
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  44721118 tggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 44721178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28184683 - 28184299
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28184683 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtgttgtaaccttttgta 28184584  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc-c 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||      
T  28184583 acactttctcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttctt 28184485  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagacca--tttg 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  28184484 tttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttttg 28184385  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28184384 ttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaaggtttgtttgaaaccggattcacaa 28184299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 14737483 - 14737864
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737483 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 14737582  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  14737583 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggatcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttctt 14737681  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc--ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14737682 ttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctcttttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 14737780  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14737781 tctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggtttatttgaaaccggattcacaa 14737864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 14742343 - 14742723
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742343 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 14742442  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  14742443 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttctt 14742541  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgtt 299  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14742542 ttaccgcttatcttgttt-tgctttgatatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtatgcttggagaccatttgtt 14742640  T
Q  300 ctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14742641 ctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggtttatttgaaaccggattcacaa 14742723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11857153 - 11856767
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11857153 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgt 11857054  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtg---ttttgttctt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||||    
T  11857053 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgtttttttgttctt 11856955  T
Q  197 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatt 295  Q
     | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11856954 ccttttatcgcttgtcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatt 11856856  T
Q  296 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaagg--tttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  11856855 tgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggttttttttttgaaccggattcacaa 11856767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 22010603 - 22010981
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22010603 tttagggttcatattgtgagagtggggaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgt 22010702  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |     
T  22010703 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcct 22010801  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22010802 tttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 22010900  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||    
T  22010901 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaagat---ttttgaaccggattcacaa 22010981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Original strand, 28155477 - 28155869
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  28155477 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaaattcttgtaaccttttgta 28155575  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc- 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28155576 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcca 28155675  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28155676 tttaccgtttatcttgtttatgctt-gttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcatagg-ctgttttgttgttgttagcttgaagaccatttg 28155773  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaagg-tttctttggaaccggattcacaagatgtttggt 394  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  28155774 ctctcattgattatcactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-gcattggtgtgaaggttttgtttagaaccggattcacaacatctttggt 28155869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6438674 - 6438319
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaaca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6438674 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaaccttttgtaaca 6438576  T
Q  104 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-ttt 202  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6438575 ctt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggacaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttt 6438477  T
Q  203 accgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttct 301  Q
    |||| || |||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  6438476 accgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccattggttct 6438379  T
Q  302 cattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  6438378 cattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggtt 6438319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6005592 - 6005234
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaac 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6005592 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaac 6005494  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |    
T  6005493 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcctt 6005395  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  6005394 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 6005299  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
     ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005298 actcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaaggtt 6005234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16838923 - 16838561
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  16838923 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttg 16838825  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tt 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||    
T  16838824 taacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttt 16838726  T
Q  197 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccat 294  Q
    || |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  16838725 tcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttgaaggccat 16838630  T
Q  295 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
    |||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838629 ttgcactcatagattatctctatcacttgctccacatatcattggtttattctcattggtgtgaaggtt 16838561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 33330351 - 33330715
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  33330351 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttg 33330449  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||     
T  33330450 taacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctttt 33330548  T
Q  199 cttt--accgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg-ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagacca 293  Q
    ||||  |  | || ||||| |||||| |||  | ||||| |||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  33330549 cttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggtttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggcca 33330645  T
Q  294 tttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
    ||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33330646 tttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctaattggtgtgaaggtt 33330715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 33335848 - 33336212
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  33335848 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttg 33335946  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 198  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||     
T  33335947 taacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctttt 33336045  T
Q  199 cttt--accgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg-ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagacca 293  Q
    ||||  |  | || ||||| |||||| |||  | ||||| |||||| |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  33336046 cttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggtttttactatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagtttggaggcca 33336142  T
Q  294 tttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
    ||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33336143 tttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaaggtt 33336212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 5674686 - 5675021
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttat-gtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||  ||  ||||||||| |||    
T  5674686 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaacccttt 5674784  T
Q  98 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttct 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  5674785 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc-tctttggtgtgtttgttct 5674883  T
Q  196 ttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggct-gttttgttgttgttggcttggagaccat 294  Q
    || ||||   |||| | |||||  ||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||  | ||| ||  |    
T  5674884 tt-ctttcttgcttatattgtt--tgctttgtattctctt-tgtggtgttgctctacactagactagggctggttttgttgttgttgcttgggaaac--t 5674977  T
Q  295 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    || | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5674978 ttttactctttgattaccactatcttttgctccacacatctttg 5675021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 133 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5343527 - 5343297
Alignment:
Q  133 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaat 230  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| || || ||||||  |||||| |  |     
T  5343527 tctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttt-gttcgttttcctttatcgtttatcttgt--atgctt-gttag 5343432  T
Q  231 ctctt-gtgtggtttt-gctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctcc 327  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  5343431 ctcttagtgtggtttttgctatactttaggcttagg-ctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcc 5343333  T
Q  328 acacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  5343332 acacatcattgacttattctcattggtgtgaaggtt 5343297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 5757479 - 5757575
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5757479 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21356132 - 21356036
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21356132 tcttgtaactcttagtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 179
Target Start/End: Original strand, 10077176 - 10077263
Alignment:
Q  94 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  10077176 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 10077263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 5572241 - 5572339
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  5572241 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 5572339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 179
Target Start/End: Original strand, 31086485 - 31086571
Alignment:
Q  95 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31086485 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 31086571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 338
Target Start/End: Original strand, 30125944 - 30126048
Alignment:
Q  234 ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacaca 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  30125944 ttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtagttagcttggagaccatttg-gctcatagattatcactacctcttgctccacaca 30126042  T
Q  333 tctttg 338  Q
    ||||||    
T  30126043 tctttg 30126048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4630040 - 4629954
Alignment:
Q  94 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4630040 ttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctt 4629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31979610 - 31979512
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31979610 tcttgtaactcttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31979512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22963796 - 22963699
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  22963796 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 22963699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 23824597 - 23824694
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  23824597 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 23824694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 166
Target Start/End: Original strand, 21801344 - 21801429
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgg 166  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21801344 tcttgtaactcttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22709102 - 22709041
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 156  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22709102 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattg 22709041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18232942 - 18232867
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 157  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232942 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattgg 18232867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017567
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata-ttggctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatcttg 5017567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31936651 - 31936586
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  31936651 tggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 31936586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12195575 - 12195515
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  12195575 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4816291 - 4816231
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  4816291 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4816231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5273276 - 5273216
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  5273276 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5273216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19704627 - 19704567
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  19704627 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 19704567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20915416 - 20915356
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  20915416 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20915356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26932622 - 26932562
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  26932622 tggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 26932562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29754769 - 29754709
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  29754769 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 29754709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 33309110 - 33309170
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  33309110 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 33309170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15044864 - 15044486
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15044864 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgta 15044765  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |    
T  15044764 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcctt 15044666  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttc 300  Q
    ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15044665 ttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgttggtttggagaccatttgttc 15044566  T
Q  301 tcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044565 tcattgattaccactatcacttgctctacacgtcattg---tatt-tcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 15044486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43592458 - 43592082
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43592458 tttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgt 43592359  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |     
T  43592358 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcct 43592260  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43592259 tttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 43592160  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||      ||||||||||||||||||||    
T  43592159 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattgatgtga------ctttggaaccggattcacaa 43592082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 1457068 - 1457423
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1457068 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgt 1457167  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  1457168 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttcc 1457265  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||    ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1457266 tttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 1457365  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtga 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  1457366 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 1457423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43598903 - 43598527
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43598903 tttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgt 43598804  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |     
T  43598803 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcct 43598705  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43598704 tttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgt 43598605  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  43598604 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga------ctttggaaccggattcacaa 43598527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43604395 - 43604019
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43604395 tttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgt 43604296  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |     
T  43604295 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcct 43604197  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43604196 tttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgt 43604097  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  43604096 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga------ctttggaaccggattcacaa 43604019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43609887 - 43609511
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43609887 tttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgt 43609788  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |     
T  43609787 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcct 43609689  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43609688 tttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgt 43609589  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  43609588 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga------ctttggaaccggattcacaa 43609511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 365
Target Start/End: Original strand, 28807485 - 28807844
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28807485 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagattcttgtaaccttttgtaacac 28807583  T
Q  105 tttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-ttta 203  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28807584 tt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttta 28807682  T
Q  204 ccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtgg--ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttc 300  Q
    ||| || |||||||||||| |||  | ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  28807683 ccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgagtggttttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttc 28807780  T
Q  301 tcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttc 365  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28807781 tcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaaggtttc 28807844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27445149 - 27444793
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27445149 tttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgt 27445050  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |     
T  27445049 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgcctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcct 27444951  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27444950 tttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgt 27444851  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtga 358  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  27444850 actcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 27444793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27449993 - 27449637
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27449993 tttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgt 27449894  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |     
T  27449893 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcct 27449795  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27449794 tttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgt 27449695  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtga 358  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  27449694 actcattgattaccactatctcttgctccacatatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 27449637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 364
Target Start/End: Original strand, 37561355 - 37561715
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaaca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  37561355 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagatacttgtaaccttttgtaaca 37561453  T
Q  104 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-ttt 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  37561454 ctttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccattt 37561553  T
Q  203 accgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttc 300  Q
    |||| || |||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  37561554 accgtttatcttgtttatgctt-gttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcatagg-ctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctc 37561651  T
Q  301 tcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggttt 364  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37561652 tcatagattatcactatcacttgctccacacatctttggtttattatcattggtgtgaaggttt 37561715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Original strand, 37556533 - 37556889
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaaca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  37556533 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagatacttgtaaccttttgtaaca 37556631  T
Q  104 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-ttt 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  37556632 ctttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccattt 37556731  T
Q  203 accgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttc 300  Q
    |||| || |||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  37556732 accgtttatcttgtttatgctt-gttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcatagg-ctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctc 37556829  T
Q  301 tcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaag 360  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37556830 tcatagattatcactatcacttgctccacacatctttggtttattatcattggtgtgaag 37556889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30631586 - 30631253
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  30631586 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttg 30631487  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  30631486 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-ttc 30631389  T
Q  199 ctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctct-tgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
    ||||    ||| ||||||||||||||||  |||| | | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  30631388 ctttcttacttatcttgtttatgctttgttatctatatatgtgattttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtt-gcttgaaaaccatttg 30631290  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 334  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30631289 ttctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 30631253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2785550 - 2785192
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaac 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2785550 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgagtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaac 2785452  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |    
T  2785451 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcctt 2785353  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  2785352 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 2785257  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
     ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785256 actcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaaggtt 2785192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33791491 - 33791133
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaac 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33791491 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaac 33791393  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |    
T  33791392 acattcacatattggattggagagctgctctttcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcctt 33791294  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctct-tgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | |||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  33791293 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctctatatgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 33791198  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
     ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33791197 actcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattgatgtgaaggtt 33791133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31180393 - 31180138
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  31180393 tttatggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgtct-tgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttg 31180295  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31180294 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctttc 31180196  T
Q  199 ctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta 256  Q
     |||    ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31180195 -tttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacacta 31180138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Original strand, 31396901 - 31397261
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgttta--tgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgta 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||    |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  31396901 gggttcatagtgtgaggatgggaaaatgccaaagggtaga-tctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgta 31396999  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttt-tgttctttcc 199  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||     
T  31397000 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgttttct 31397099  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
    |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31397100 tttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctttacattaggctta-ggatgttttgttgttgttagcttggaggccatttg 31397195  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
      ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31397196 cactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctcattggtgtgaaggtt 31397261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Original strand, 31401758 - 31402118
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgttta--tgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgta 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||    |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  31401758 gggttcatagtgtgaggatgggaaaatgccaaagggtaga-tctagagttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgta 31401856  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttc 198  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||    
T  31401857 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttc 31401955  T
Q  199 ctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccattt 296  Q
     |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31401956 ttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctttacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccattt 31402051  T
Q  297 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
    |  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31402052 gcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctcattggtgtgaaggtt 31402118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33768314 - 33767996
Alignment:
Q  46 tctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 143  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33768314 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctcccccccaga 33768215  T
Q  144 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctct-tgtgtg 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||| || || || ||  ||||| |||  | |||| | ||||    
T  33768214 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcctg--tatgc-ttgttagctctatatgtg 33768119  T
Q  241 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttgg 339  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33768118 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggtcatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgg 33768020  T
Q  340 tttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  33768019 tttattctcattgatgtgaaggtt 33767996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38192352 - 38192064
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  38192352 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 38192254  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttcttt 197  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||    
T  38192253 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-tt 38192156  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagac 291  Q
    |||||   |||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38192155 cctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac 38192064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38219577 - 38219289
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  38219577 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 38219479  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttcttt 197  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||    
T  38219478 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-tt 38219381  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagac 291  Q
    |||||   |||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38219380 cctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac 38219289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24136027 - 24135696
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  24136027 tttagggttcacattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 24135929  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttcttt 197  Q
    ||||||||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||     
T  24135928 aacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgtgtttgttcttc 24135830  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
    | |||   |||| |||||||  ||||||| | | |||  |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |     
T  24135829 cttttctagcttatcttgtt--tgctttgtattatct--tgtggtgttgctctacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagac--tctt 24135736  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatcttt 337  Q
    | ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  24135735 tactcatagattaccactcccttttgctccacacatcttt 24135696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35387841 - 35387663
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  35387841 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttattcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 35387743  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35387742 aacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaatctt 35387663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 9353333 - 9353429
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9353333 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9353429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 36932351 - 36932447
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36932351 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10281848 - 10281751
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10281848 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15464628 - 15464532
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15464628 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 15464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 177
Target Start/End: Original strand, 11916972 - 11917068
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11916972 tcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 11917068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14520326 - 14520230
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14520326 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Original strand, 17003970 - 17004058
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17003970 cttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 17004058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3880396 - 3880298
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  3880396 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaatcttg 3880298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 175
Target Start/End: Original strand, 12084176 - 12084269
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 175  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  12084176 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat 12084269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19588843 - 19588746
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19588843 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28832343 - 28832258
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  28832343 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatcttg 28832258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 42127423 - 42127508
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  42127423 ttgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 42127508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 4410241 - 4410301
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  4410241 tggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 4410301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 179
Target Start/End: Original strand, 31300612 - 31300694
Alignment:
Q  99 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31300612 taacactttcatcttagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31300694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 15552464 - 15552524
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15552464 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15552524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 31179431 - 31179371
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31179431 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31179371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 31542953 - 31543013
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31542953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31543013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 31545299 - 31545359
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31545299 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31545359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 174
Target Start/End: Original strand, 27910675 - 27910729
Alignment:
Q  121 ggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  27910675 ggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27910729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 24553520 - 24553604
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  24553520 ttgtaacactttcatcttagtggagtggag-gctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttg 24553604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3373197 - 3373137
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  3373197 tggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 3373137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 10749919 - 10749979
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  10749919 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 10749979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15354635 - 15354575
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15354635 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15354575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 45357203 - 45357586
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45357203 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgta 45357302  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc- 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  45357303 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcct 45357401  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgtt 299  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45357402 tttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgtt 45357501  T
Q  300 ctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttg--gaaccggattcacaa 384  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  45357502 ctcatagattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggtttctttgtagaaccggattcacaa 45357586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 45347723 - 45348107
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagag-tcttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45347723 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagaggtcttgtaaccttttgt 45347822  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45347823 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgttttgttctttcc 45347921  T
Q  200 ttt-accgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45347922 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgt 45348021  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttg--gaaccggattcacaa 384  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  45348022 tctcatagattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggtttctttgtagaaccggattcacaa 45348107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 4 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5732839 - 5732460
Alignment:
Q  4 agggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaaca 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5732839 agggtttatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaaca 5732741  T
Q  104 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtg----ttttgttctttcc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  5732740 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcc 5732641  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5732640 tttaccgtttatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgtggttttactatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgt 5732543  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732542 tctcattgattaccaccatcacttgctccacacatcattg---tattttcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 5732460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 9224313 - 9224696
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9224313 tttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgt 9224412  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |     
T  9224413 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcct 9224511  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9224512 tttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 9224610  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaagg--tttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  9224611 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggttttttttttgaaccggattcacaa 9224696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 9229100 - 9229482
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9229100 tttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgt 9229199  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |     
T  9229200 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcct 9229298  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9229299 tttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 9229397  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaagg-tttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  9229398 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggttttttttttaaccggattcacaa 9229482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3814201 - 3813818
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3814201 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgta 3814103  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcct 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  3814102 acactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgttttgttc-ttcct 3814004  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtgg-ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    ||   |||| |||||||||||| |||  | ||| |||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  3814003 ttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggtttttgcgatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgc 3813905  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttg--gaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3813904 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaaggtttctttgtagaaccggattcacaa 3813818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18855900 - 18855544
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaaca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18855900 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaaca 18855802  T
Q  104 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-ttt 202  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18855801 ctt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttt 18855703  T
Q  203 accgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttct 301  Q
    |||| || |||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  18855702 accgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttct 18855605  T
Q  302 cattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18855604 cattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaaggtt 18855544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51520636 - 51520280
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51520636 tttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgt 51520537  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |     
T  51520536 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggcagaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcct 51520438  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51520437 tttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtatggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 51520338  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtga 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  51520337 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 51520280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 48 - 384
Target Start/End: Original strand, 56146664 - 56146993
Alignment:
Q  48 taggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatta 146  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146664 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatta 56146763  T
Q  147 ggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggtttt 245  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| | |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  56146764 ggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggtttt 56146862  T
Q  246 gctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttatt 345  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  56146863 gctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt 56146961  T
Q  346 ctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
     |||||||||||||      |||||||||||||||||||    
T  56146962 -tcattggtgtgaa------tttggaaccggattcacaa 56146993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24742120 - 24741784
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||    
T  24742120 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttg 24742022  T
Q  99 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  24742021 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-tt 24741924  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatt 295  Q
    |||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24741923 cctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccatt 24741826  T
Q  296 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    | |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24741825 t-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttg 24741784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29760821 - 29760486
Alignment:
Q  2 ttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgttt-atgtgtaaagcttgaaggcta--gagtcttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||| ||||    
T  29760821 ttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgt-aagcttgcaggctattgtttcttgtaaccctttg 29760723  T
Q  99 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  29760722 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-tt 29760625  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccattt 296  Q
    |||||   |||| |||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29760624 cctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggttgttttgttgttgtt-gcttggaaaccattt 29760527  T
Q  297 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
     |  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29760526 -tgtttattgattaccactatctcttgctccacacatctttg 29760486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 178
Target Start/End: Original strand, 28468542 - 28468625
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28468542 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 28468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10047476 - 10047378
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10047476 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 10047378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39246091 - 39245993
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39246091 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 39245993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 36315230 - 36315327
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  36315230 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36315327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 36329439 - 36329536
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  36329439 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36329536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 31985635 - 31985730
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31985635 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 31985730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 16623293 - 16623391
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  16623293 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 16623391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 5396672 - 5396768
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5396672 tcttgtaactctttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5396768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Original strand, 38152449 - 38152537
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttctc-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38152449 cttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 38152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Original strand, 5269204 - 5269291
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgtt 181  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  5269204 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttgtt 5269291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 3796519 - 3796616
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3796519 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctt 3796616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5143345 - 5143260
Alignment:
Q  94 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 177  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5143345 ttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct 5143260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5147763 - 5147678
Alignment:
Q  94 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 177  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5147763 ttttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 5147678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24333896 - 24333808
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  24333896 cttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaatcttg 24333808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3777645 - 3777550
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 177  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3777645 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatct 3777550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 173
Target Start/End: Original strand, 6743425 - 6743507
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 173  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  6743425 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 16630680 - 16630778
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  16630680 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaaccttg 16630778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 25862035 - 25862120
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  25862035 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 25862120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16931849 - 16931789
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16931849 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16931789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16934203 - 16934143
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16934203 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16934143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22780433 - 22780373
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22780433 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22780373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 44599898 - 44599838
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  44599898 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 44599838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Original strand, 39774305 - 39774380
Alignment:
Q  84 tcttgtaacct-tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 157  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  39774305 tcttgtaacctatttgtatcactttcattttagtggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattgg 39774380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 54867269 - 54867183
Alignment:
Q  94 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||| |||| ||||| | ||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  54867269 ttttgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 54867183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 6765117 - 6765177
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  6765117 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6765177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 7941596 - 7941656
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  7941596 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7941656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18709224 - 18709164
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18709224 tggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 18709164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22782798 - 22782738
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||| |||||||    
T  22782798 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaa 22782738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 9550 - 9928
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9550 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 9648  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  9649 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttcct 9746  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttc 300  Q
    ||   |||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  9747 ttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctcttgtgtggttttgctatatactagcttagggctgttttgttgttgtttggttggagaccatttgctc 9845  T
Q  301 tcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9846 tcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaaggtttgtttgaaaccggattcacaa 9928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 384
Target Start/End: Original strand, 28 - 169
Alignment:
Q  236 gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatct 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||      |||| |||||||||||||||     
T  28 gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtttacttggagaccatttgctctcattgat------tatcacttgctccacacatca 121  T
Q  336 ttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  122 ttggtttatt-taattggtgtgaaggtttgtttgaaaccggattcacaa 169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 3755 - 3845
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaac 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3755 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaac 3845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 4 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18656609 - 18656230
Alignment:
Q  4 agggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaaca 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18656609 agggtttatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatgctagagtcttgtaaccttttgtaaca 18656511  T
Q  104 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtg----ttttgttctttcc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  18656510 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcc 18656411  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18656410 tttaccgtttatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgtggtttttctatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgt 18656313  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656312 tctcattgattaccaccatcacttgctccacacatcattg---tattttcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 18656230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 22173101 - 22173482
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22173101 tttagggttcatattaggagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgt 22173200  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |     
T  22173201 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcct 22173299  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22173300 tttaccgcttatcttattt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 22173398  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  22173399 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaagatttgtttgaaaccggattcacaa 22173482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7167424 - 7167088
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||    
T  7167424 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttg 7167326  T
Q  99 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  7167325 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-tt 7167228  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccattt 296  Q
    |||||   |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7167227 cctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttgttgttgtt-gcttggaaaccattt 7167129  T
Q  297 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
     | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7167128 -tgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttg 7167088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 28503781 - 28504104
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28503781 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttg 28503880  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  28503881 taacactttctcatattggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttc 28503978  T
Q  199 ctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
    |||         ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  28503979 ctt---------tcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtcaagggctgttttgttgttgtt-gcttggaaaccattt- 28504067  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 334  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  28504068 ttctcatagattatcactaccttttgctccacacatc 28504104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 2676993 - 2677358
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  2676993 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttg 2677091  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||     
T  2677092 taacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctttt 2677190  T
Q  199 cttt--accgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccat 294  Q
    ||||  |  | || ||||| |||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2677191 cttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccat 2677287  T
Q  295 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttc 365  Q
    ||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677288 ttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaaggtttc 2677358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 2672837 - 2673202
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttg 98  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  2672837 tttaaggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttg 2672935  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 198  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||     
T  2672936 taacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctttt 2673034  T
Q  199 cttt--accgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccat 294  Q
    ||||  |  | || ||||| |||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2673035 cttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccat 2673131  T
Q  295 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttc 365  Q
    ||  |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2673132 ttactctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtgaaggtttc 2673202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 2671503 - 2671840
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||  ||| |  ||||||| ||||| |  |||  ||  ||||||||| ||||    
T  2671503 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttggtcttgtgtaa-gcttgcaatctattgtttcttgtaaccctttg 2671601  T
Q  99 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  2671602 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-tt 2671699  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatt 295  Q
    |||||   |||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2671700 cctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttgttgttgtttgcttggagaccatt 2671798  T
Q  296 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2671799 tg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttg 2671840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8512392 - 8512032
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaac 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8512392 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaac 8512294  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |    
T  8512293 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgt 8512194  T
Q  201 ttaccg-cttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
    ||| ||  || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  8512193 ttatcgttttatcttg--tatgc-ttgttaactcttagtgtggttgtgctacacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttg 8512098  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
     |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8512097 ctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctcattggtgtgaaggtt 8512032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8517272 - 8516912
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaac 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8517272 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaac 8517174  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |    
T  8517173 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgt 8517074  T
Q  201 ttaccg-cttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
    ||| ||  || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  8517073 ttatcgttttatcttg--tatgc-ttgttaactcttagtgtggttgtgctacacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttg 8516978  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
     |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8516977 ctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctcattggtgtgaaggtt 8516912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 338
Target Start/End: Original strand, 8738982 - 8739318
Alignment:
Q  3 tagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttgta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||    
T  8738982 tagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgta 8739080  T
Q  101 acactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  8739081 acactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-ttcc 8739178  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtgg-ttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccattt 296  Q
    |||   |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | || || ||  |||||| | |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  8739179 tttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgcttggaaaccattt 8739277  T
Q  297 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    |  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8739278 g-actcatagattaccactatttcttgctccacacatctttg 8739318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 338
Target Start/End: Original strand, 9091220 - 9091556
Alignment:
Q  3 tagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttgta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||    
T  9091220 tagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgta 9091318  T
Q  101 acactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  9091319 acactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-ttcc 9091416  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtgg-ttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccattt 296  Q
    |||   |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | || || ||  |||||| | |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  9091417 tttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgcttggaaaccattt 9091515  T
Q  297 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    |  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9091516 g-actcatagattaccactatttcttgctccacacatctttg 9091556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24968286 - 24967957
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttg 98  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  24968286 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaagtaccaaagggtaga-tctcgggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttg 24968188  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tt 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||    
T  24968187 taacacattcacatattggattggagagctactctctccccaaaattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttt 24968089  T
Q  197 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccat 294  Q
    || |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24968088 tcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccat 24967993  T
Q  295 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccaca 330  Q
    |||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||    
T  24967992 ttgcactcatagattatctctatcacttgctccaca 24967957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 32475659 - 32475301
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaat-accaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaac 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||  |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||     
T  32475659 gggttcatagtgtgaggttgggaaatttatcaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaa- 32475562  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |    
T  32475561 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctt 32475462  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttg 297  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||    
T  32475461 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttg 32475367  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
      ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32475366 cactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaaggtt 32475301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 32480517 - 32480158
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaat-accaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaac 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||  |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||     
T  32480517 gggttcatagtgtgaggttgggaaatttatcaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaa- 32480420  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |    
T  32480419 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttggttggtgttttgttcgttttctt 32480320  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttg 297  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||    
T  32480319 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttg 32480225  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttgg-tttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
      ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32480224 cactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttggatttattctcattggtgtgaaggtt 32480158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8477544 - 8477208
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtggga-aaataccaaagggtagaatctaggctttgtttat-gtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttt 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||| | ||||  ||  ||||||||| ||    
T  8477544 tttagggttcatattgtgagagtgggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttattgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaaccctt 8477446  T
Q  97 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttc 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  8477445 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgtgtttgttc 8477347  T
Q  195 tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggct-gttttgttgttgttggcttggagacca 293  Q
    ||| ||||   |||| |||||||  ||||||| | | |||| |||||| ||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||  | ||| ||      
T  8477346 ttt-ctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattatctt-tgtggtgttgttctacactagtctagggctggttttgttgttgttgcttgggaaac-- 8477253  T
Q  294 tttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8477252 tttttactctttgattaccactatcttttgctccacacatctttg 8477208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 28501614 - 28501750
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28501614 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttg 28501713  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctct 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501714 taacactttctcatattggattggagagctgctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10207983 - 10207750
Alignment:
Q  130 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttacc--gcttgtcttgtttatgctttgg 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| |   | || ||||||| |||||| |     
T  10207983 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttt-gttcttttcttttcatggtttatcttgtt-atgctt-gt 10207887  T
Q  228 aatctctt-gtgtggttttgctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgct 325  Q
     | ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  10207886 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttagg-ctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 10207788  T
Q  326 ccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10207787 ccacacatcattggtttattctcattggtgtgaaggtt 10207750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 40372713 - 40372908
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  40372713 tttagggttcatattatgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 40372811  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40372812 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctt 40372908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 26928508 - 26928687
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   |  ||||||||| ||||    
T  26928508 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttttcttgtaaccctttg 26928606  T
Q  99 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26928607 taacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 26928687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32143500 - 32143321
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  32143500 tttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 32143402  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  32143401 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 32143321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1306044 - 1305949
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306044 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 1305949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 8370477 - 8370573
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8370477 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 27974943 - 27975039
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27974943 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27975039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 18552873 - 18552971
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18552873 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 18552971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21711319 - 21711222
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21711319 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 21711222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16264446 - 16264350
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16264446 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 16264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27453054 - 27452958
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  27453054 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 27452958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 178
Target Start/End: Original strand, 27986449 - 27986533
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27986449 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27986533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36029190 - 36029094
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36029190 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatct 36029094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 175
Target Start/End: Original strand, 1736295 - 1736389
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1736295 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1736389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 30709780 - 30709877
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30709780 tcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 30709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 178
Target Start/End: Original strand, 33386669 - 33386753
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  33386669 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 33386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 3715992 - 3716090
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3715992 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 3716090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 40592772 - 40592870
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40592772 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 40592870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48438311 - 48438213
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  48438311 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatcttg 48438213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 6794704 - 6794801
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  6794704 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatcttg 6794801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26299085 - 26298987
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  26299085 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 26298987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 1417493 - 1417578
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1417493 ttgtaacactttcttcttagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 1417578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25795878 - 25795781
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25795878 tcttgtaactctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 25795781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 47923896 - 47923994
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47923896 tcttgtaactcttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 47923994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37466375 - 37466290
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  37466375 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 37466290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 178
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040079
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39040079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40844748 - 40844651
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  40844748 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaatcttg 40844651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 3328359 - 3328444
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3328359 ttgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatcttg 3328444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 178
Target Start/End: Original strand, 4386947 - 4387014
Alignment:
Q  112 tattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  || |||||||| |||||||||    
T  4386947 tattggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatactgaactaaactgggtaaacaatctt 4387014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 24695154 - 24695252
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| ||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  24695154 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 24695252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 338
Target Start/End: Original strand, 40372980 - 40373049
Alignment:
Q  268 ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40372980 ttttgatgttgtttgcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacacacctttg 40373049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 38210569 - 38210629
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  38210569 tggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 38210629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 50494198 - 50494258
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  50494198 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 50494258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 53894119 - 53894055
Alignment:
Q  111 atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  53894119 atattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 53894055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 157
Target Start/End: Original strand, 3323693 - 3323755
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 157  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3323693 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtcatattgg 3323755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 458483 - 458543
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  458483 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaa 458543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6063504 - 6063444
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||| ||||    
T  6063504 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaa 6063444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10621588 - 10621528
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  10621588 tggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaa 10621528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153357
Alignment:
Q  131 tctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctt 39153357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41398414 - 41398034
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398414 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 41398315  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  41398314 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgacctgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttcct 41398217  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtgg--ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttg---gcttggagaccat 294  Q
    |     ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  41398216 t-----cttatcttgtttatgctttggtatctctttgtgtggttttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgttgtttgcttggagaccat 41398123  T
Q  295 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398122 atgttctcattgattatcactatcacttgctccacacataattggtttatt-tcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 41398034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 25444996 - 25445380
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25444996 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagc-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgt 25445094  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25445095 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcc 25445194  T
Q  200 -tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
     ||||||| || ||||||||| || |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  25445195 ttttaccgtttatcttgtttacgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttg 25445292  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttg--gaaccggattcacaa 384  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  25445293 ttctcattgattatcactatcgcttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaaggttcgtttgtagaaccggattcacaa 25445380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 384
Target Start/End: Original strand, 44023785 - 44024161
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaaca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  44023785 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaaccttttgtaaca 44023883  T
Q  104 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccttta 203  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44023884 ctt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttta 44023982  T
Q  204 ccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctc 302  Q
    ||  || |||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  44023983 ccatttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctc 44024080  T
Q  303 attgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44024081 attgattatcactatcagttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaaggtttatttggaatcggattcacaa 44024161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39445673 - 39445294
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaaca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  39445673 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaaca 39445575  T
Q  104 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-ttt 202  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39445574 ctt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttt 39445476  T
Q  203 accgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttct 301  Q
    |||| || |||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||     
T  39445475 accgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttca 39445378  T
Q  302 cattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttg--gaaccggattcacaa 384  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  39445377 cattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaaggttcgtttgtagaaccggattcacaa 39445294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Original strand, 1054923 - 1055279
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaaca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1054923 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaaca 1055021  T
Q  104 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-ttt 202  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1055022 ctt-cacatattggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttt 1055120  T
Q  203 accgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttct 301  Q
    |||| || |||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||   |||||||||     
T  1055121 accgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagacatttgttca 1055218  T
Q  302 cattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1055219 cattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaaggtt 1055279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41390759 - 41390485
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390759 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgta 41390660  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  41390659 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgatctgggtcaacaatctt-ctcgatgttttgttc-ttcct 41390562  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtgg--ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtt 280  Q
    |     ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41390561 t-----cttatcttgtttatgctttgatatctctttgtgtggttttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgtt 41390485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 24787281 - 24787621
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||    
T  24787281 tttagggttcatattgtgagagttgggaaacaccaaagggtagaatctaggatttgttcttgtgtaatgcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttg 24787380  T
Q  99 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  24787381 taacactttctcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttcc 24787479  T
Q  199 ctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg--ttttgttgttgttg--gcttggagacca 293  Q
     |||   |||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  24787480 ttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacataagtctagggctgttttttgttgttgttgttgcttggaaacca 24787577  T
Q  294 tttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24787578 ttt-tgctcatttattaccactatctcttgctccacacatctttg 24787621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Original strand, 43988372 - 43988734
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgttta--tgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgta 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||    |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    
T  43988372 gggttcatagtgtgaggatgggaaaatgccaaagggtaga-tctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgta 43988470  T
Q  101 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcct 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  43988471 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtaaacaatcttgcttggtgttttgttcttttct 43988570  T
Q  201 ttac-cgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
    || |  | || | |  | ||||| |||  | ||||| |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  43988571 tttcatggttttatcttgtatgc-ttgttagctcttagtgtggttgtgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttg 43988668  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
     |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43988669 ctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctcattggcgtgaaggtt 43988734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 24202687 - 24202973
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  24202687 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 24202785  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttcttt 197  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||    
T  24202786 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-tt 24202883  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagac 291  Q
    |||||   |||| |||||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24202884 cctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagtttagggctgttttgttgttgtttgcttggagac 24202973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 282 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41386646 - 41386545
Alignment:
Q  282 gcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattca 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386646 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattca 41386548  T
Q  382 caa 384  Q
    |||    
T  41386547 caa 41386545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 19358761 - 19358939
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  19358761 tttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 19358859  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19358860 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19358939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 19361350 - 19361528
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| |  |||   | ||||||||| |||||    
T  19361350 tttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactatttttcttgtaaccctttgt 19361448  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19361449 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19361528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 19379990 - 19380168
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| |  |||   | ||||||||| |||||    
T  19379990 tttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactatttttcttgtaaccctttgt 19380088  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19380089 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19380168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 26644898 - 26644994
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26644898 tcttgtaactctttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26644994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Original strand, 47703946 - 47704034
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47703946 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47704034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19073025 - 19072928
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19073025 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19120915 - 19120818
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19120915 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19120818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 16124516 - 16124614
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  16124516 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 16124614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 27104372 - 27104470
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  27104372 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 27104470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 25439803 - 25439875
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25439803 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtag-ctctagggtttgttcatgtgtaaagcttga 25439875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3281804 - 3281708
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3281804 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 3281708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9476348 - 9476260
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9476348 cttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9476260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13598485 - 13598397
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13598485 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 13598397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29651898 - 29651810
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  29651898 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatcttg 29651810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37069864 - 37069770
Alignment:
Q  86 ttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37069864 ttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 37069770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 775759 - 775671
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  775759 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 775671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 47098837 - 47098922
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47098837 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47098922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 13604624 - 13604720
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  13604624 tcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 13604720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 21536570 - 21536666
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca-tattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  | |||||||||||||||||||    
T  21536570 tcttgtaactctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaatctt 21536666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32889523 - 32889438
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  32889523 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaatcttg 32889438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 175
Target Start/End: Original strand, 47102874 - 47102935
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 175  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  47102874 tggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 47102935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9459479 - 9459419
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9459479 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9459419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9463306 - 9463246
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9463306 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9463246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 16226386 - 16226446
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16226386 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16226446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 23786058 - 23786118
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  23786058 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 23786118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 51752582 - 51752642
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  51752582 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 51752642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 34968 - 35350
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34968 tttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgt 35067  T
Q  100 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |     
T  35068 aacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcct 35166  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35167 tttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 35265  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaagg-tttctttggaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  35266 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtgaaggttttttttttaaccggattcacaa 35350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 536 - 157
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaaca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  536 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaaca 438  T
Q  104 ctttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-ttt 202  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  437 ctt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttt 339  T
Q  203 accgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttct 301  Q
    |||| || |||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  338 accgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttct 241  T
Q  302 cattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttg--gaaccggattcacaa 384  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  240 cattgattatcaccatcacttgctccacacatctttggtttatt-tcattggtgtgaaggttcgtttgtagaaccggattcacaa 157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Original strand, 148866 - 149224
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatcta-ggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaa 101  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||    
T  148866 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtaga-tctatggttttgtct-tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaa 148963  T
Q  102 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcc 199  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||    
T  148964 cacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcc 149062  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
    |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  149063 tttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttg 149158  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
      ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  149159 cactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctcattggtgtgaaggtt 149224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Original strand, 2161 - 2519
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatcta-ggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaa 101  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||    
T  2161 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtaga-tctatggttttgtct-tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaa 2258  T
Q  102 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcc 199  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||    
T  2259 cacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcc 2357  T
Q  200 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 297  Q
    |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2358 tttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttg 2453  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
      ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2454 cactcatggattatctttatcacttgctccacacatcattgatttattctcattggtgtgaaggtt 2519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Original strand, 14219 - 14578
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaac 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14219 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaac 14317  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcct 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |    
T  14318 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctt 14417  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttg 297  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  14418 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttg 14512  T
Q  298 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
      ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14513 cactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaaggtt 14578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Original strand, 19075 - 19433
Alignment:
Q  5 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaac 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19075 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtaga-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaac 19173  T
Q  103 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcct 200  Q
    ||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |    
T  19174 acactcacatattgtattggagagctgctctctcccccagattaggccacaatggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttctt 19272  T
Q  201 ttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgt 298  Q
    ||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  19273 ttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 19368  T
Q  299 tctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
     ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19369 actcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctcattggtgtgaaggtt 19433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 363
Target Start/End: Original strand, 181980 - 182233
Alignment:
Q  110 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||     
T  181980 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgt 182079  T
Q  208 ttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcat 304  Q
    || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||    
T  182080 ttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcat 182174  T
Q  305 tgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtt 363  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  182175 agattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtgaaggtt 182233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 17870 - 18157
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| ||| |  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  17870 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 17968  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttcttt 197  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||    
T  17969 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-tt 18066  T
Q  198 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg--ttttgttgttgttggcttggagac 291  Q
    |||||   |||| |||||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  18067 cctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttgtt-gcttggagac 18157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 23963 - 24141
Alignment:
Q  1 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| ||| |  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||||    
T  23963 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgt 24061  T
Q  100 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24062 aacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 24141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 282 - 384
Target Start/End: Original strand, 34136 - 34237
Alignment:
Q  282 gcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattca 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34136 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatt-tcattggtgtgaaggtttctttggaaccggattca 34234  T
Q  382 caa 384  Q
    |||    
T  34235 caa 34237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 300 - 491
Alignment:
Q  146 aggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttt 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||   |||| |||||||| ||||||   ||||||| |||||||||    
T  300 aggccatattggctgaactaggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctttc-tttctagcttatcttgttt-tgctttattatctctttgtgtggttt 396  T
Q  245 tgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttg--gcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttg 338  Q
    ||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  397 tgctcctcactagtttagggctgtttt-ttgttgttgttgcttggaaaccatttttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttg 491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 8420 - 8516
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8420 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 22343 - 22403
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22343 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 24618 - 24678
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24618 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 24678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 85779 - 85684
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 177  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85779 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatct 85684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13233 - 13143
Alignment:
Q  295 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctttggtttattctcattggtgtgaaggtttctttg--gaaccggattcacaa 384  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  13233 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacatatctttggtttatt-tcattggtgtgaaggttcgtttgtagaaccggattcacaa 13143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 43962 - 44058
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43962 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 44058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 36833 - 36929
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36833 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5682
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5770 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2579 - 2491
Alignment:
Q  93 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  2579 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatcttg 2491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Original strand, 133281 - 133377
Alignment:
Q  84 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  133281 tcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 133377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10826 - 10728
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10826 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 10728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45253
Alignment:
Q  96 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 178  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatctt 45253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17360 - 17266
Alignment:
Q  84 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  17360 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaat 17266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 269 - 329
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  269 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11533 - 11500
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11533 tggattggagagctgctctctcccccagactagg 11500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 69352 - 69292
Alignment:
Q  115 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  69352 tggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 69292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University