View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19667_low_1 (Length: 493)

Name: NF19667_low_1
Description: NF19667
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19667_low_1
NF19667_low_1
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (1-484)||(14757-15243)
scaffold0328 (294-428)||(13048-13182)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (233-428)||(9238973-9239171)
chr6 (233-428)||(34147344-34147542)
chr6 (233-428)||(34159960-34160158)
chr6 (233-428)||(15360099-15360297)
chr6 (235-428)||(11448871-11449067)
chr6 (233-428)||(3222637-3222833)
chr6 (228-428)||(654147-654350)
chr6 (233-428)||(21982322-21982519)
chr6 (233-428)||(1344935-1345131)
chr6 (233-428)||(9843936-9844134)
chr6 (233-428)||(28672065-28672263)
chr6 (233-428)||(21148512-21148709)
chr6 (233-428)||(5360072-5360270)
chr6 (233-420)||(11007163-11007353)
chr6 (233-428)||(17081055-17081253)
chr6 (229-428)||(14212886-14213078)
chr6 (243-428)||(11840909-11841096)
chr6 (275-403)||(12390465-12390596)
chr6 (228-348)||(12591630-12591750)
chr6 (233-428)||(9208250-9208448)
chr6 (233-341)||(13753238-13753346)
chr6 (237-428)||(9690639-9690833)
chr6 (233-428)||(33499472-33499671)
chr6 (233-318)||(22576065-22576150)
chr6 (259-403)||(17149482-17149629)
chr6 (228-420)||(33718478-33718662)
chr6 (258-420)||(17706328-17706481)
chr6 (233-326)||(8479310-8479403)
chr6 (252-341)||(28968133-28968222)
chr6 (228-386)||(31039013-31039173)
chr6 (333-428)||(15730496-15730594)
chr6 (234-427)||(10377714-10377911)
chr6 (363-428)||(14504083-14504148)
chr6 (367-404)||(32596211-32596248)
chr6 (364-415)||(27866217-27866268)
chr6 (347-419)||(21903629-21903703)
chr6 (395-428)||(4797260-4797293)
chr6 (363-428)||(17225797-17225862)
chr6 (260-325)||(28741948-28742013)
chr6 (286-326)||(6385921-6385961)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (228-428)||(7275274-7275477)
chr7 (233-428)||(22119890-22120088)
chr7 (233-428)||(40542911-40543109)
chr7 (233-420)||(7175871-7176061)
chr7 (233-428)||(2751273-2751471)
chr7 (233-428)||(21217834-21218032)
chr7 (233-428)||(21835153-21835351)
chr7 (228-428)||(11997846-11998049)
chr7 (233-428)||(2103057-2103253)
chr7 (233-428)||(10091190-10091387)
chr7 (233-428)||(18044109-18044307)
chr7 (233-428)||(28089818-28090019)
chr7 (233-428)||(17196951-17197149)
chr7 (231-428)||(23012509-23012709)
chr7 (248-420)||(22703503-22703678)
chr7 (273-428)||(654706-654863)
chr7 (228-420)||(17212050-17212245)
chr7 (233-428)||(2344301-2344499)
chr7 (234-428)||(27312155-27312352)
chr7 (233-428)||(27009361-27009560)
chr7 (228-428)||(22638289-22638488)
chr7 (232-428)||(27704003-27704201)
chr7 (240-428)||(28950877-28951071)
chr7 (240-428)||(42913514-42913705)
chr7 (233-428)||(19421233-19421431)
chr7 (233-360)||(7799902-7800031)
chr7 (271-428)||(16374034-16374194)
chr7 (258-428)||(31273941-31274113)
chr7 (228-345)||(13332510-13332627)
chr7 (283-428)||(29861722-29861870)
chr7 (228-428)||(32849588-32849791)
chr7 (233-428)||(31197593-31197790)
chr7 (233-420)||(39145661-39145851)
chr7 (227-418)||(25333415-25333593)
chr7 (228-425)||(43785303-43785503)
chr7 (245-326)||(22299863-22299944)
chr7 (233-428)||(31712903-31713094)
chr7 (228-303)||(23854393-23854468)
chr7 (302-428)||(23092167-23092296)
chr7 (286-428)||(41907515-41907659)
chr7 (315-428)||(3851841-3851957)
chr7 (233-428)||(23330740-23330938)
chr7 (263-428)||(36772304-36772471)
chr7 (234-428)||(28646972-28647169)
chr7 (233-416)||(9683828-9684014)
chr7 (234-348)||(42814867-42814981)
chr7 (229-428)||(22696318-22696521)
chr7 (233-348)||(9718071-9718186)
chr7 (233-308)||(21370599-21370674)
chr7 (259-383)||(14199713-14199839)
chr7 (233-428)||(21574103-21574302)
chr7 (233-326)||(8435801-8435894)
chr7 (233-326)||(40332101-40332194)
chr7 (233-321)||(12211646-12211734)
chr7 (229-279)||(577677-577727)
chr7 (259-420)||(22643351-22643515)
chr7 (232-297)||(28003837-28003902)
chr7 (334-420)||(8943410-8943500)
chr7 (350-428)||(33137826-33137904)
chr7 (225-302)||(1469106-1469183)
chr7 (230-326)||(3951096-3951193)
chr7 (227-312)||(22264622-22264707)
chr7 (230-325)||(3950895-3950991)
chr7 (299-348)||(6491675-6491724)
chr7 (286-330)||(21558187-21558231)
chr7 (229-325)||(38864553-38864649)
chr7 (233-415)||(36173037-36173223)
chr7 (363-420)||(1766153-1766210)
chr7 (310-403)||(21373789-21373885)
chr7 (374-427)||(30345511-30345564)
chr7 (239-319)||(26459394-26459477)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (233-428)||(8484662-8484860)
chr5 (233-428)||(11926502-11926701)
chr5 (236-420)||(38684209-38684395)
chr5 (233-428)||(15641107-15641304)
chr5 (233-428)||(27498732-27498930)
chr5 (233-428)||(32059441-32059639)
chr5 (228-428)||(30485821-30486024)
chr5 (252-428)||(19456212-19456389)
chr5 (239-420)||(33709512-33709694)
chr5 (233-420)||(13038464-13038653)
chr5 (233-420)||(13108459-13108648)
chr5 (259-428)||(18207231-18207403)
chr5 (227-428)||(34310134-34310338)
chr5 (233-428)||(19145413-19145610)
chr5 (228-428)||(31287947-31288150)
chr5 (246-428)||(37495058-37495250)
chr5 (233-428)||(7085627-7085825)
chr5 (233-420)||(36954816-36955006)
chr5 (233-428)||(4603775-4603973)
chr5 (233-420)||(11464917-11465106)
chr5 (241-420)||(42193491-42193671)
chr5 (239-428)||(6014281-6014473)
chr5 (220-420)||(23270531-23270734)
chr5 (233-384)||(25586930-25587085)
chr5 (233-428)||(38630980-38631160)
chr5 (237-420)||(10869574-10869760)
chr5 (232-407)||(15971144-15971322)
chr5 (227-428)||(22392693-22392884)
chr5 (233-420)||(27487563-27487754)
chr5 (223-346)||(1827616-1827739)
chr5 (233-428)||(25750614-25750810)
chr5 (252-428)||(12398449-12398628)
chr5 (233-428)||(12317156-12317349)
chr5 (233-385)||(15931057-15931211)
chr5 (233-428)||(34049820-34050007)
chr5 (233-428)||(21236363-21236561)
chr5 (286-416)||(5049188-5049320)
chr5 (304-420)||(35425082-35425201)
chr5 (233-428)||(26009265-26009463)
chr5 (362-428)||(22693065-22693131)
chr5 (315-428)||(9659312-9659428)
chr5 (347-428)||(41351105-41351186)
chr5 (233-428)||(930487-930684)
chr5 (226-403)||(15485317-15485498)
chr5 (252-343)||(7151346-7151437)
chr5 (234-325)||(37397712-37397803)
chr5 (362-420)||(13659254-13659312)
chr5 (249-428)||(28614487-28614667)
chr5 (248-428)||(36895438-36895621)
chr5 (224-428)||(10399762-10399970)
chr5 (233-326)||(40330631-40330724)
chr5 (228-312)||(5067294-5067378)
chr5 (363-418)||(5067392-5067447)
chr5 (252-428)||(17015420-17015593)
chr5 (234-286)||(3715055-3715107)
chr5 (378-428)||(10631290-10631340)
chr5 (229-279)||(42006787-42006837)
chr5 (233-428)||(22253145-22253344)
chr5 (226-273)||(19230466-19230513)
chr5 (229-280)||(21042677-21042728)
chr5 (233-280)||(33025478-33025525)
chr5 (369-428)||(41084120-41084179)
chr5 (288-326)||(21589349-21589387)
chr5 (233-302)||(16616117-16616186)
chr5 (367-420)||(42006868-42006921)
chr5 (368-428)||(8821120-8821180)
chr5 (364-428)||(25548535-25548599)
chr5 (368-428)||(33737878-33737937)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (236-428)||(26174114-26174309)
chr3 (233-428)||(53424178-53424375)
chr3 (233-428)||(35492909-35493107)
chr3 (227-428)||(8456151-8456355)
chr3 (233-428)||(30807154-30807352)
chr3 (239-428)||(15566501-15566692)
chr3 (233-428)||(45529756-45529953)
chr3 (233-428)||(46576346-46576544)
chr3 (234-428)||(52821637-52821833)
chr3 (225-428)||(25289716-25289921)
chr3 (233-428)||(40133450-40133648)
chr3 (233-428)||(49258263-49258461)
chr3 (233-428)||(21362941-21363139)
chr3 (233-420)||(30257622-30257812)
chr3 (233-428)||(48977386-48977584)
chr3 (234-420)||(25379760-25379949)
chr3 (233-428)||(45272417-45272615)
chr3 (233-420)||(18176896-18177086)
chr3 (227-428)||(31537839-31538043)
chr3 (228-428)||(34492576-34492779)
chr3 (247-428)||(53233912-53234095)
chr3 (252-428)||(10190743-10190922)
chr3 (233-428)||(40940823-40941021)
chr3 (252-428)||(10083820-10083999)
chr3 (256-428)||(39041853-39042028)
chr3 (233-428)||(52455650-52455848)
chr3 (233-428)||(7485532-7485724)
chr3 (233-411)||(29915288-29915468)
chr3 (233-411)||(29964441-29964621)
chr3 (239-428)||(32151428-32151620)
chr3 (242-385)||(26108299-26108445)
chr3 (233-401)||(7470244-7470414)
chr3 (229-428)||(4462627-4462828)
chr3 (275-428)||(8097280-8097436)
chr3 (283-428)||(24407309-24407457)
chr3 (233-428)||(25344059-25344256)
chr3 (334-428)||(24165716-24165812)
chr3 (259-420)||(33398477-33398641)
chr3 (264-428)||(1692863-1693029)
chr3 (241-417)||(53288725-53288903)
chr3 (286-420)||(2511306-2511443)
chr3 (234-420)||(11390601-11390790)
chr3 (239-420)||(19857056-19857239)
chr3 (258-428)||(8958036-8958210)
chr3 (229-420)||(26158812-26158999)
chr3 (233-403)||(51532787-51532960)
chr3 (233-420)||(4252405-4252595)
chr3 (362-428)||(53848435-53848501)
chr3 (233-319)||(55287801-55287887)
chr3 (242-321)||(9853623-9853702)
chr3 (233-403)||(50582990-50583162)
chr3 (288-428)||(17579136-17579280)
chr3 (226-428)||(6041671-6041878)
chr3 (228-348)||(38732959-38733079)
chr3 (234-420)||(55371303-55371483)
chr3 (291-428)||(1178228-1178366)
chr3 (227-321)||(9842913-9843006)
chr3 (334-428)||(54475780-54475877)
chr3 (289-428)||(48972715-48972854)
chr3 (257-403)||(34844400-34844548)
chr3 (362-428)||(48105007-48105073)
chr3 (367-428)||(4048085-4048146)
chr3 (249-325)||(49167070-49167146)
chr3 (368-428)||(50731238-50731298)
chr3 (368-428)||(50781556-50781616)
chr3 (227-326)||(25017508-25017606)
chr3 (298-398)||(1242036-1242139)
chr3 (381-428)||(3747730-3747777)
chr3 (242-414)||(14343304-14343478)
chr3 (233-280)||(16140295-16140342)
chr3 (239-319)||(10445123-10445207)
chr3 (233-303)||(36660768-36660838)
chr3 (363-428)||(25017620-25017684)
chr3 (347-404)||(33793567-33793624)
chr3 (239-329)||(11092144-11092236)
chr3 (347-399)||(26599429-26599481)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (233-428)||(4718647-4718845)
chr8 (233-428)||(34237656-34237854)
chr8 (234-428)||(28193477-28193674)
chr8 (228-420)||(39349253-39349448)
chr8 (233-428)||(3734624-3734822)
chr8 (233-428)||(2618188-2618386)
chr8 (242-428)||(21603241-21603430)
chr8 (233-428)||(19471611-19471810)
chr8 (233-428)||(19542535-19542734)
chr8 (233-428)||(19589962-19590161)
chr8 (228-428)||(32879276-32879479)
chr8 (233-428)||(15259407-15259605)
chr8 (233-428)||(20305910-20306108)
chr8 (233-428)||(21092543-21092741)
chr8 (257-428)||(8765527-8765701)
chr8 (233-428)||(42643119-42643317)
chr8 (233-428)||(42328007-42328204)
chr8 (234-420)||(264409-264597)
chr8 (234-420)||(651324-651512)
chr8 (234-420)||(837059-837247)
chr8 (233-416)||(27746348-27746534)
chr8 (237-420)||(28088292-28088478)
chr8 (252-420)||(14632975-14633146)
chr8 (239-428)||(4698724-4698916)
chr8 (233-428)||(7557952-7558142)
chr8 (233-428)||(18532109-18532298)
chr8 (257-428)||(20469943-20470116)
chr8 (233-416)||(26168862-26169047)
chr8 (233-428)||(2166699-2166896)
chr8 (286-428)||(6953009-6953153)
chr8 (250-428)||(34610688-34610869)
chr8 (234-428)||(24018385-24018583)
chr8 (289-428)||(25248407-25248546)
chr8 (233-416)||(28964035-28964220)
chr8 (233-428)||(34694576-34694775)
chr8 (233-410)||(21667552-21667731)
chr8 (362-428)||(2639412-2639478)
chr8 (284-428)||(10292108-10292254)
chr8 (233-420)||(36848759-36848948)
chr8 (233-420)||(8042656-8042834)
chr8 (233-345)||(34639295-34639405)
chr8 (233-428)||(18128515-18128713)
chr8 (286-386)||(24999289-24999392)
chr8 (237-326)||(41070767-41070856)
chr8 (348-428)||(12312965-12313045)
chr8 (233-326)||(8387550-8387643)
chr8 (240-326)||(15974915-15974999)
chr8 (233-428)||(3403503-3403701)
chr8 (233-322)||(3794793-3794882)
chr8 (359-420)||(13749187-13749248)
chr8 (362-428)||(33747016-33747082)
chr8 (229-271)||(13580064-13580106)
chr8 (291-416)||(1219409-1219537)
chr8 (383-428)||(9713609-9713654)
chr8 (367-420)||(16990722-16990775)
chr8 (347-416)||(42332025-42332094)
chr8 (362-419)||(43817759-43817816)
chr8 (286-330)||(6536579-6536623)
[»] chr1 (73 HSPs)
chr1 (233-428)||(4621238-4621436)
chr1 (233-428)||(7766728-7766926)
chr1 (229-428)||(24122017-24122219)
chr1 (233-420)||(24674391-24674581)
chr1 (228-428)||(46607803-46608006)
chr1 (227-428)||(15059403-15059607)
chr1 (233-420)||(27454873-27455065)
chr1 (233-427)||(8077645-8077841)
chr1 (227-428)||(30677168-30677372)
chr1 (228-428)||(7197248-7197450)
chr1 (226-428)||(34778333-34778535)
chr1 (243-428)||(17935777-17935965)
chr1 (257-428)||(9500356-9500530)
chr1 (228-428)||(32729538-32729740)
chr1 (233-420)||(168199-168389)
chr1 (245-428)||(7578419-7578605)
chr1 (233-420)||(23734114-23734305)
chr1 (233-420)||(23741306-23741497)
chr1 (240-425)||(1378903-1379090)
chr1 (233-400)||(7946842-7947011)
chr1 (233-420)||(21726727-21726917)
chr1 (250-428)||(37351454-37351643)
chr1 (257-420)||(45859052-45859218)
chr1 (234-420)||(18646852-18647041)
chr1 (259-428)||(36155889-36156061)
chr1 (252-428)||(33905511-33905690)
chr1 (233-386)||(23232304-23232464)
chr1 (234-339)||(46113495-46113600)
chr1 (228-420)||(2272337-2272532)
chr1 (283-428)||(8254753-8254901)
chr1 (233-325)||(20487297-20487389)
chr1 (233-403)||(29057364-29057536)
chr1 (259-420)||(8779745-8779909)
chr1 (234-420)||(25496503-25496686)
chr1 (227-321)||(14258538-14258632)
chr1 (235-420)||(32930749-32930937)
chr1 (233-428)||(1486418-1486616)
chr1 (362-428)||(48699889-48699955)
chr1 (233-420)||(18533733-18533923)
chr1 (233-327)||(24216976-24217070)
chr1 (241-326)||(25237095-25237180)
chr1 (227-323)||(1378737-1378833)
chr1 (233-307)||(1818732-1818806)
chr1 (233-409)||(2537702-2537870)
chr1 (351-428)||(26513149-26513226)
chr1 (315-428)||(45331622-45331739)
chr1 (362-428)||(22910001-22910067)
chr1 (362-428)||(35138118-35138184)
chr1 (233-325)||(1138577-1138669)
chr1 (352-428)||(27159205-27159281)
chr1 (234-420)||(40145890-40146079)
chr1 (365-428)||(23041655-23041718)
chr1 (233-280)||(47091688-47091735)
chr1 (249-326)||(19034492-19034569)
chr1 (233-326)||(52135128-52135221)
chr1 (233-326)||(16899509-16899594)
chr1 (239-344)||(39964514-39964621)
chr1 (286-420)||(16539659-16539795)
chr1 (233-428)||(40802070-40802266)
chr1 (366-428)||(50202680-50202741)
chr1 (228-273)||(1095154-1095199)
chr1 (379-428)||(5315478-5315527)
chr1 (239-280)||(6776148-6776189)
chr1 (383-428)||(14603947-14603992)
chr1 (239-326)||(809226-809313)
chr1 (362-400)||(12876965-12877003)
chr1 (239-326)||(15581119-15581208)
chr1 (362-420)||(47091751-47091809)
chr1 (367-420)||(52135261-52135314)
chr1 (288-428)||(26820240-26820383)
chr1 (239-319)||(33700757-33700840)
chr1 (347-428)||(36921513-36921595)
chr1 (363-419)||(43769975-43770031)
[»] chr4 (77 HSPs)
chr4 (228-428)||(32986190-32986393)
chr4 (233-428)||(33696280-33696478)
chr4 (233-428)||(34844759-34844957)
chr4 (233-428)||(40058853-40059051)
chr4 (233-428)||(52983617-52983815)
chr4 (228-428)||(5609203-5609406)
chr4 (233-428)||(46714390-46714589)
chr4 (233-428)||(19660533-19660731)
chr4 (237-428)||(27528796-27528990)
chr4 (233-428)||(20566347-20566546)
chr4 (233-428)||(25852212-25852411)
chr4 (227-428)||(45787705-45787908)
chr4 (228-420)||(54127351-54127546)
chr4 (234-428)||(44343512-44343710)
chr4 (227-420)||(51535605-51535809)
chr4 (257-427)||(20077986-20078159)
chr4 (239-420)||(35229172-35229356)
chr4 (252-428)||(7391966-7392143)
chr4 (233-428)||(36131511-36131709)
chr4 (249-420)||(49287872-49288045)
chr4 (225-348)||(22625154-22625277)
chr4 (233-403)||(13873321-13873494)
chr4 (231-416)||(34835525-34835713)
chr4 (234-414)||(32942369-32942552)
chr4 (221-379)||(33992612-33992773)
chr4 (228-428)||(35674750-35674945)
chr4 (228-428)||(1985829-1986030)
chr4 (284-428)||(34723848-34723995)
chr4 (233-428)||(18875518-18875715)
chr4 (288-416)||(32990488-32990619)
chr4 (273-420)||(27574356-27574506)
chr4 (232-343)||(43719154-43719265)
chr4 (259-428)||(12500060-12500231)
chr4 (242-346)||(2351020-2351124)
chr4 (286-420)||(9517650-9517787)
chr4 (233-416)||(13550206-13550392)
chr4 (235-416)||(55961767-55961939)
chr4 (226-308)||(42245737-42245819)
chr4 (259-420)||(30879175-30879338)
chr4 (233-348)||(13584338-13584453)
chr4 (267-428)||(20527035-20527198)
chr4 (233-345)||(41621684-41621795)
chr4 (282-420)||(21387496-21387635)
chr4 (366-428)||(23639758-23639820)
chr4 (366-428)||(23645416-23645478)
chr4 (239-428)||(4911926-4912122)
chr4 (367-428)||(52494623-52494684)
chr4 (235-420)||(25969512-25969700)
chr4 (362-420)||(4064990-4065048)
chr4 (362-428)||(9978510-9978576)
chr4 (234-287)||(34722169-34722222)
chr4 (362-420)||(43719096-43719154)
chr4 (363-428)||(55158344-55158409)
chr4 (368-428)||(23131437-23131497)
chr4 (358-420)||(33289180-33289242)
chr4 (286-339)||(3392759-3392811)
chr4 (315-420)||(22488037-22488145)
chr4 (363-428)||(51595153-51595218)
chr4 (368-428)||(17637853-17637912)
chr4 (286-326)||(22630292-22630332)
chr4 (368-420)||(37302623-37302675)
chr4 (369-428)||(7093508-7093567)
chr4 (365-428)||(9646217-9646280)
chr4 (286-325)||(38740901-38740940)
chr4 (257-319)||(38869797-38869860)
chr4 (350-428)||(45302953-45303032)
chr4 (348-410)||(4585732-4585793)
chr4 (362-416)||(13017843-13017897)
chr4 (366-420)||(13716459-13716513)
chr4 (245-306)||(12710189-12710250)
chr4 (367-420)||(12824535-12824588)
chr4 (233-326)||(13771589-13771682)
chr4 (258-326)||(28635726-28635795)
chr4 (236-276)||(10125783-10125823)
chr4 (239-319)||(37109335-37109418)
chr4 (368-428)||(41621583-41621643)
chr4 (236-312)||(43352444-43352520)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (228-428)||(44946054-44946257)
chr2 (233-428)||(11941211-11941409)
chr2 (228-428)||(33827574-33827777)
chr2 (228-428)||(17324759-17324960)
chr2 (228-428)||(15037952-15038155)
chr2 (232-410)||(44976172-44976354)
chr2 (233-428)||(30466831-30467029)
chr2 (233-428)||(24196002-24196198)
chr2 (233-428)||(25293164-25293355)
chr2 (233-428)||(19054023-19054222)
chr2 (233-420)||(4567438-4567636)
chr2 (266-428)||(35171831-35171996)
chr2 (252-428)||(43374331-43374505)
chr2 (248-403)||(10582018-10582174)
chr2 (233-420)||(41313990-41314179)
chr2 (251-420)||(34516423-34516589)
chr2 (234-428)||(41329842-41330038)
chr2 (233-428)||(8192353-8192550)
chr2 (252-420)||(36242321-36242492)
chr2 (233-428)||(36390570-36390765)
chr2 (282-428)||(2140487-2140633)
chr2 (234-420)||(8258896-8259085)
chr2 (245-428)||(27290598-27290770)
chr2 (233-428)||(27269345-27269549)
chr2 (233-326)||(32845089-32845182)
chr2 (252-420)||(5394034-5394205)
chr2 (229-320)||(4852552-4852643)
chr2 (252-428)||(13266507-13266685)
chr2 (252-413)||(1191530-1191694)
chr2 (233-309)||(18976548-18976624)
chr2 (308-428)||(28668946-28669069)
chr2 (252-420)||(45271401-45271572)
chr2 (286-420)||(3943791-3943928)
chr2 (233-326)||(6714387-6714480)
chr2 (244-381)||(23787056-23787196)
chr2 (233-428)||(14946777-14946974)
chr2 (239-326)||(19605951-19606038)
chr2 (259-428)||(29361578-29361744)
chr2 (362-428)||(18692090-18692156)
chr2 (322-428)||(31778114-31778227)
chr2 (363-420)||(18976464-18976521)
chr2 (232-347)||(918782-918899)
chr2 (233-348)||(40997434-40997549)
chr2 (362-428)||(14486955-14487021)
chr2 (233-326)||(28194239-28194333)
chr2 (362-428)||(44929847-44929913)
chr2 (237-322)||(4618795-4618880)
chr2 (289-420)||(19174817-19174950)
chr2 (249-416)||(19849847-19850017)
chr2 (365-428)||(39957891-39957954)
chr2 (335-428)||(44610139-44610235)
chr2 (363-419)||(4852660-4852716)
chr2 (233-348)||(5608118-5608233)
chr2 (228-307)||(18691975-18692054)
chr2 (289-401)||(19525428-19525539)
chr2 (233-306)||(32526211-32526284)
chr2 (364-428)||(6714296-6714360)
chr2 (362-428)||(714126-714192)
chr2 (241-319)||(3405265-3405343)
chr2 (362-420)||(9400970-9401028)
chr2 (362-428)||(28194139-28194205)
chr2 (285-319)||(33569842-33569876)
chr2 (251-301)||(44610090-44610140)
chr2 (362-420)||(45132417-45132475)
chr2 (252-345)||(29698164-29698256)
chr2 (286-326)||(12086106-12086146)
chr2 (237-326)||(13747611-13747702)
chr2 (368-428)||(19605847-19605907)
chr2 (362-410)||(32845206-32845254)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (233-428)||(5083-5281)
[»] scaffold0623 (1 HSPs)
scaffold0623 (232-428)||(1058-1256)
[»] scaffold0366 (2 HSPs)
scaffold0366 (232-428)||(9301-9499)
scaffold0366 (232-411)||(12019-12200)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (232-428)||(10696-10893)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (233-428)||(40323-40520)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (234-420)||(7318-7507)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (257-428)||(161831-162005)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (233-428)||(52872-53070)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (233-428)||(97367-97565)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (233-420)||(41654-41843)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (274-428)||(39131-39288)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (228-428)||(66755-66950)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (233-326)||(8513-8606)
scaffold0199 (367-428)||(8452-8513)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (289-428)||(32342-32483)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (259-428)||(20246-20417)
[»] scaffold0460 (1 HSPs)
scaffold0460 (233-325)||(8286-8378)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (234-428)||(29144-29340)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (240-386)||(1-150)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (233-428)||(27774-27966)
[»] scaffold1175 (1 HSPs)
scaffold1175 (334-428)||(2427-2524)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (234-302)||(12884-12952)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (228-325)||(26650-26747)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (257-319)||(11557-11620)


Alignment Details
Target: scaffold0328 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 484
Target Start/End: Original strand, 14757 - 15243
Alignment:
Q  1 cgaacaatttaatttgtgaaattaatgaaattttcaagtgatcttgaaaaataaaaattctctttcagctactacaatgtgatcaagaaattaaaaattt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14757 cgaacaatttaatttgtgaaattaatgaaattttcaagtgatcttgaaaaataaaaattctctttcagctactacaatgtgatcaagaaatttaaaattt 14856  T
Q  101 tattaatttgaagaccaaaatattgttccctctttacaattctatagactaaaatgataaaggtgtttgtgtgcttagtgataaaagttagattgtgtag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14857 tattaatttgaagaccaaaatattgttccctctttacaattctatggactaaaatgataaaggtgtttgtgtgcttagtgataaaagttagattgtgtag 14956  T
Q  201 aagagtatgattagatgacaatattataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcga 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14957 aagagtatgattaaatgacaatattataaacccatttggggttggcctagtggttggcctgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaa 15056  T
Q  301 ttccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcgga 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  15057 ttccctctggtgctaatttcggtgggttaagtccatccagagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtgggcgg-gggattggtctcctcgga 15155  T
Q  398 ttagtcaattcttggatcggataacgagttt-nnnnnnntgacaatattataagatggtaaatttaaaaaatgctattgatgatgatg 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15156 ttagtcaattcttggatcggataacaagtttaaaaaaaatgacaatattataagatggtaaatttgaaaaatgctattgatgatgatg 15243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13182 - 13048
Alignment:
Q  294 ggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccc 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13182 ggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagagcttgcta-ctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccc 13084  T
Q  393 tcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    || |||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  13083 tcagattagttgattcttggatcggataccgagttt 13048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 9238973 - 9239171
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9238973 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagt 9239072  T
Q  333 tcatacagagcttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9239073 ccatatagagcttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 9239171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 34147344 - 34147542
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  34147344 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 34147443  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34147444 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34147542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 34159960 - 34160158
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  34159960 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 34160059  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34160060 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34160158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15360297 - 15360099
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  15360297 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 15360198  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15360197 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 15360099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 428
Target Start/End: Original strand, 11448871 - 11449067
Alignment:
Q  235 tttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 334  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  11448871 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 11448970  T
Q  335 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  11448971 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggatatcgagttt 11449067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3222833 - 3222637
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  3222833 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctc-agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 3222735  T
Q  333 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3222734 ccatacagagcttgctctgtctttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 3222637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 654350 - 654147
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  654350 aaacccatttgggtttggcctagtggctgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 654251  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  654250 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattattggatcggataccga 654151  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  654150 gttt 654147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21982519 - 21982322
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |    
T  21982519 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgaagtttgctcctccagaggtctgaggttcgattcccgatggtgccaatttcagtgggctaagt 21982420  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21982419 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 21982322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 1344935 - 1345131
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  1344935 catttggggttgacctagtggttgg--tgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagt 1345032  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1345033 ccatacaaagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 1345131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 9843936 - 9844134
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||| |    
T  9843936 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgacttcctctggtgtcaattttggtgggttaagt 9844035  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9844036 ccatacagagcttgttctggctttaaacggggccccctcaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 9844134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 28672065 - 28672263
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |    
T  28672065 catttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctctagaggtcttaggttcgattccctctggtgtcaattttggtgggctaagt 28672164  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||   ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  28672165 ccatacagagcttgttttggctttaaacgggcccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 28672263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21148709 - 21148512
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |    
T  21148709 catttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctttttcagaggtctcaagttcgattccctctagtgccaatttcgatgggctaagt 21148610  T
Q  333 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  21148609 ccatacagagcttgctctgactttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 21148512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5360270 - 5360072
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |    
T  5360270 catttggagttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgcttctcaagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggctaagt 5360171  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  5360170 ccatacagagcttgctctgactttaaacggaacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggataccgagttt 5360072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Original strand, 11007163 - 11007353
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||| |    
T  11007163 catttggggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcactctgctctcaatttcggtgggctaagt 11007262  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaa-atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||| ||||||  || |||||||   || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11007263 ccatacaaagcttgctctagctttaagcggggcccccgcaagtgggcggtgggattggccccctcggattagtcgattctttgatcggata 11007353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17081253 - 17081055
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||| |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  17081253 catttgaggttagtctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaagtttgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagt 17081154  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||   ||||||||||| ||| |||||||    
T  17081153 ccatacagagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaataagttgtttcttggatcgaataccgagttt 17081055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 229 - 428
Target Start/End: Original strand, 14212886 - 14213078
Alignment:
Q  229 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 328  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |    
T  14212886 aactcatttgggattgacctaatggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggct 14212985  T
Q  329 aaattcatacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    || | |||| ||||||       || ||  ||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14212986 aagtccatatagagct-------ttaaacgggggccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 14213078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 243 - 428
Target Start/End: Original strand, 11840909 - 11841096
Alignment:
Q  243 tggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag 342  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||    
T  11840909 tggccaagtggttggcttgggatattagaatttgctcctccagaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacaaag 11841008  T
Q  343 cttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||  ||| |||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  11841009 cttgctttggttttaaacggggccccataagtggacggtgggattagtcccctcgaattagtcgattattggatcggataccgagttt 11841096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Original strand, 12390465 - 12390596
Alignment:
Q  275 tgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaag 371  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||    
T  12390465 tgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaag 12390564  T
Q  372 tgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12390565 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtc 12390596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 228 - 348
Target Start/End: Original strand, 12591630 - 12591750
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||     
T  12591630 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctcgtgccaatttcagtgggc 12591729  T
Q  328 taaattcatacagagcttgct 348  Q
    ||| | |||||||||||||||    
T  12591730 taagtccatacagagcttgct 12591750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 9208250 - 9208448
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |    
T  9208250 catttggggttgttctagtggttggattgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattccccctggtgccaatttcggtggg-caagt 9208348  T
Q  333 tcatacagag-cttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  9208349 ccatacagagccttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcagaatagtcgattcttggatcaaataccgagttt 9208448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 233 - 341
Target Start/End: Original strand, 13753238 - 13753346
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13753238 catttggggttggcctagtggttggctttggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggctaaat 13753337  T
Q  333 tcatacaga 341  Q
     ||||||||    
T  13753338 ccatacaga 13753346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 237 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9690833 - 9690639
Alignment:
Q  237 tggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcat 336  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||| |||  |||||||||||| ||| | |||    
T  9690833 tggggttgacctagtggttggtttgagattttggagtttgctcttccagaggtcttaggttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccat 9690734  T
Q  337 acagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||  |||||||||||  || ||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9690733 acagagcttgctctggctttaaacggggccctcacaagtggacggtgggattggtcctctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 9690639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 33499472 - 33499671
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttc-gattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | |     
T  33499472 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcagattccctctggtgtcaatttcggtgggct-ag 33499570  T
Q  332 ttcatacagagc-ttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 427  Q
    | |||||| | | ||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||    
T  33499571 tccatacaaatctttgctttggctttaaatgggccctccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcagttgatggaccggataccgagtt 33499670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 233 - 318
Target Start/End: Original strand, 22576065 - 22576150
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22576065 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatt 22576150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17149629 - 17149482
Alignment:
Q  259 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag-cttgc--tggcttta 355  Q
    ||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | ||||||||| |||||  ||||||||    
T  17149629 ttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggttgg-caagtccatacagagccttgctttggcttta 17149531  T
Q  356 aat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 403  Q
    ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17149530 aatggggcccccgcaagtgaacggtgggattggtcccctcgaattagtc 17149482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 33718662 - 33718478
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||       
T  33718662 aaacccatttagggttggtctagtggttggtttgggatcttggagtttacttctccagagatctcaggttcgattctctctggtgcaaattttggtgaac 33718563  T
Q  328 taaattcatacagagcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||| | |||||||||         ||||||  || || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33718562 taagtacatacagag---------tttaaacggggcctctgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggata 33718478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 17706481 - 17706328
Alignment:
Q  258 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggctttaaa 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| ||        |||  |||||||||||    
T  17706481 cttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaagttcgattccttctggtgtcaatttcggtggactaattt--------gct--ctggctttaaa 17706392  T
Q  358 -tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17706391 ctgggccctcgcaagtggacggtgtgattggtttcctcggataagtcaattcttggatcggata 17706328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Original strand, 8479310 - 8479403
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |   || | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  8479310 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctcttaagatttcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcggtggg 8479403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28968222 - 28968133
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||| | |  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  28968222 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcagattcgattctctctagcgtcaatttcggtgggttaagtccatacaga 28968133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 386
Target Start/End: Original strand, 31039013 - 31039173
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| |||||||||||| || ||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||| ||   ||||||| ||||     
T  31039013 aaacccatttggggttgacccagtagttggctttgaatcttggagtttgctccaccaaagatctcaagtttgattccctctagtatcaatttcgatgggc 31039112  T
Q  328 taaattcatacagagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattg 386  Q
    ||| | ||||||||| ||||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  31039113 taagtccatacagagtttgctatggctatgaatggacccccacaagtgggcggtgtgattg 31039173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 333 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15730594 - 15730496
Alignment:
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  15730594 tcatacagagcttgttctggctttaaacgtggcccccacacgtgggcggtgggattggtcacctcggattagtcgattctttgatcggatatcgagttt 15730496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 427
Target Start/End: Original strand, 10377714 - 10377911
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||      ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  || |     
T  10377714 atttggggttggcccagttgttggcttgagatcttggagtgtgctcatgtcaaggtctcaggttcaattccctatggtgccaatttcggtgggc-aagtc 10377812  T
Q  334 catacagagcttg---ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 427  Q
    |||||| |||||    ||| ||| ||| ||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  | ||||||| ||||| ||||||    
T  10377813 catacatagctttgctctgacttaaaacggggccccccacaagtgggcggtggcattggtcccctcggagtagtcggtccttggattggataccgagtt 10377911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14504148 - 14504083
Alignment:
Q  363 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  14504148 ccccgcaagtgggcggtgggattgatcctctcgaattagtcgatccttgtatcggataccgagttt 14504083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 404
Target Start/End: Original strand, 32596211 - 32596248
Alignment:
Q  367 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtca 404  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32596211 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtca 32596248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27866268 - 27866217
Alignment:
Q  364 cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  27866268 cccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcgaattagtcgatttttggatc 27866217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21903703 - 21903629
Alignment:
Q  347 ctggctttaaatggcccccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccc-tcggattagtcaattcttggatcggat 419  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  21903703 ctggctttaaatggggcaccagcaagtgggcggtgggaatggtccccctcagattagtcgattcttggatcggat 21903629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 428
Target Start/End: Original strand, 4797260 - 4797293
Alignment:
Q  395 ggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4797260 ggattagtcgattcttggatcggataacgagttt 4797293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 428
Target Start/End: Original strand, 17225797 - 17225862
Alignment:
Q  363 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||  | ||| ||||||||| |||||||    
T  17225797 ccccgcaaatgggcggtgggattgatctcctcagattagtcggtccttagatcggatatcgagttt 17225862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28742013 - 28741948
Alignment:
Q  260 tgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 325  Q
    |||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||    
T  28742013 tgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattcgttctggtgttaattttggtgg 28741948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 326
Target Start/End: Original strand, 6385921 - 6385961
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  6385921 aggtctcaggttcgattctctccggtgctaatttgggtggg 6385961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 7275274 - 7275477
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  7275274 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 7275373  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  7275374 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 7275473  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  7275474 gttt 7275477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 22119890 - 22120088
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  22119890 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 22119989  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22119990 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 22120088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40543109 - 40542911
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  40543109 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 40543010  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40543009 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40542911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 7176061 - 7175871
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  7176061 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 7175962  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7175961 ccatacagagcttgctctggctttaaacaggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 7175871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 2751273 - 2751471
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  2751273 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 2751372  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2751373 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 2751471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21218032 - 21217834
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  21218032 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagt 21217933  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  21217932 ccatacagagcttgctctagctttaaacgggccccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagttgattcttggatcggataccgagttt 21217834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 21835153 - 21835351
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  21835153 catttagggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 21835252  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21835253 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 21835351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 11997846 - 11998049
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  11997846 aaacccatttgtggttgggctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggttggc 11997945  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | |||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  11997946 taagtccatacatagcttgctctggctttaaactgggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccga 11998045  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  11998046 gttt 11998049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 2103057 - 2103253
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    
T  2103057 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 2103156  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  2103157 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcat-gatcggataccgagttt 2103253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 10091190 - 10091387
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    
T  10091190 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 10091289  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||    
T  10091290 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt-gatccgataccgagttt 10091387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 18044109 - 18044307
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  18044109 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcccaggttcgattccctcttgtgccaatttcggtgggctaagt 18044208  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18044209 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggtggtggaattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18044307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 28089818 - 28090019
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  28089818 catttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgataccctctggtgtcaatttcggtgggctaagt 28089917  T
Q  333 tcataca----gagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagt 426  Q
     ||||||    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28089918 ccatacaaagtgagcttgctctggctttaaatgggcccccgcaagtgggcgatgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagt 28090017  T
Q  427 tt 428  Q
    ||    
T  28090018 tt 28090019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17197149 - 17196951
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |    
T  17197149 catttggggtcggcctagtggttggtttgcgatcttggagtttgctcctccataggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagt 17197050  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17197049 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 17196951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 231 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23012709 - 23012509
Alignment:
Q  231 ctcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaa 330  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  23012709 ctcatttagggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtcttaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaa 23012610  T
Q  331 attcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 427  Q
     | |||||||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  23012609 gtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcaattcattgatcggataccgagtt 23012510  T
Q  428 t 428  Q
    |    
T  23012509 t 23012509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 248 - 420
Target Start/End: Original strand, 22703503 - 22703678
Alignment:
Q  248 tagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg- 346  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||||     
T  22703503 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgc 22703602  T
Q  347 -ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22703603 tctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctttgatcggata 22703678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 273 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 654863 - 654706
Alignment:
Q  273 tttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaa 370  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  654863 tttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaa 654764  T
Q  371 gtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  654763 gtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggatcggataccgagttt 654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 228 - 420
Target Start/End: Original strand, 17212050 - 17212245
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||     
T  17212050 aaacccatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggc 17212149  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||| | ||||||||| |||  ||||||| |||  || |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17212150 taagtccatacagagattgctctggcttaaaacgggacccctgcaagtgagtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagata 17212245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 2344301 - 2344499
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |    
T  2344301 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagctctcagattcgattccttctggtgccaattttggtgggctaagt 2344400  T
Q  333 tcatacagagc--ttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||||||||  ||  ||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  2344401 ccatacagagctttttttggctttaaacgggacccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 2344499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 234 - 428
Target Start/End: Original strand, 27312155 - 27312352
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  || |     
T  27312155 atttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtttcaggttcgattccctctagtgccaatttcgatgtgccaagtc 27312254  T
Q  334 catacagagct--tgctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||    ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27312255 catacagagctacctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27312352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 27009361 - 27009560
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  27009361 catttggggttggcctagtggttggcttcggatcttggagtttgctcatccagaggtctcaggttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 27009460  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgc-aagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||  || |||| || |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  27009461 ccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccctgcaaagtggacggtgggattggtcccctcaaattagtcgattcttggattggataccgagttt 27009560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 22638289 - 22638488
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22638289 aaacccatttggggttggtctagtggttgacttgagatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 22638388  T
Q  328 taaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggcccc-ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| ||||    |||||||||  ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22638389 taagttca----gagcttgctctggctttaaacggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatctcctcgaattagtcgattcttggatcggataccga 22638484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 232 - 428
Target Start/End: Original strand, 27704003 - 27704201
Alignment:
Q  232 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    |||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||     
T  27704003 tcatttggagttggtccagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctacagaggtctcaggttcgatttcctttggtgccaatttcggtgggctaag 27704102  T
Q  332 ttcatacagagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    | |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  27704103 tccatagagagcttgctttggctttaaatggacccccgcaagtgggtggtgtgattgatcccctcagattagtcgattcttgaatcagataccgagttt 27704201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 240 - 428
Target Start/End: Original strand, 28950877 - 28951071
Alignment:
Q  240 ggttggcctagtggttagcttgggatcttggagt---ttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcat 336  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  28950877 ggttggcctagtggttggcttggggtcttggagtagtttgctccttcagaggtctcaggttcgactccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcat 28950976  T
Q  337 acagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    | ||||||||  |||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28950977 atagagcttgctctggctttaaacgggtccctcgcaagtcggcggtgggattggtcccctcgaactagacaattcttggatcggataccgagttt 28951071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 42913705 - 42913514
Alignment:
Q  240 ggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcataca 339  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||| ||| | |||||     
T  42913705 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcatatggtgccaatttcgatgggataagtccatacg 42913606  T
Q  340 gagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    || ||||  |||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  42913605 gaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttagatcggataccgagttt 42913514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 19421233 - 19421431
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| |||| ||| |    
T  19421233 catttggggttgacttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcttctggtgtcaatttcgatgggctaagt 19421332  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  19421333 ccatacagagcttgctctgactttaaatggggcgcccacaagtgggcggtgggattggtctcctcggattagtcgattcttgaatcagataccgagttt 19421431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7800031 - 7799902
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  7800031 catttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggttaagt 7799932  T
Q  333 tcatacagagcttgc--tggctttaaatgg 360  Q
     |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  7799931 ccatagagagcttgctatggctttaaatgg 7799902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 271 - 428
Target Start/End: Original strand, 16374034 - 16374194
Alignment:
Q  271 agtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc--tggctttaaa-tggccccccg 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||  ||||||||||  || ||||||    
T  16374034 agtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagaatttgctatggctttaaacgggacccccg 16374133  T
Q  368 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16374134 caaatggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 16374194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 428
Target Start/End: Original strand, 31273941 - 31274113
Alignment:
Q  258 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttta 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  31273941 cttgggatcttggagtttgctcctccagagctctcaagttcgattccctctggagctaatttcggcgggctaagtccatacagagcttgctctggcttta 31274040  T
Q  356 aatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    || ||  | |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  31274041 aacggggctccgcaagtgggcagtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggaccggataccgagttt 31274113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 228 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13332627 - 13332510
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||     
T  13332627 aaactcatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctcctgaggtctcaggtacgattccctctggagccaatttcggtgggc 13332528  T
Q  328 taaattcatacagagctt 345  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  13332527 taagtccatacagagctt 13332510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 283 - 428
Target Start/End: Original strand, 29861722 - 29861870
Alignment:
Q  283 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  29861722 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 29861821  T
Q  380 gggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  29861822 gggattgatcccctcgaattagtcgattcttagatcggataccgagttt 29861870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 32849588 - 32849791
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||   ||||| ||||||     
T  32849588 aaacccatttggggttagcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcgggtttgattccctctagtctcaattttggtgggc 32849687  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | || || |||||||  |||||||||||| || | |||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  32849688 taagtccacactgagcttgctctggctttaaatgggactcccataagtgggcagtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccga 32849787  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  32849788 gttt 32849791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 31197593 - 31197790
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||  | || ||  ||||||||||| |||| |    
T  31197593 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccagatgtctcaggtttgattcattatg-tgtcaatttcggtggattaagt 31197691  T
Q  333 tcatacagagcttgctg--gctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||| ||||||   |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31197692 ccatacagatcttgctcttgctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 31197790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 39145851 - 39145661
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |    
T  39145851 catttgaggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagatgtcttcggttcgattccctgtggtgccaatttcggtgggctaagt 39145752  T
Q  333 tcat-acagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
      || ||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  39145751 caataacagagcttgctctggctttaaacgggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttgaatcagata 39145661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 418
Target Start/End: Original strand, 25333415 - 25333593
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||    
T  25333415 taaacccatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgataccctctggcaccaatttcgttggg 25333514  T
Q  327 ttaaattcatacagagcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgga 418  Q
    |||| |              ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25333515 ttaact--------------ctgactttaaacaggccccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcgga 25333593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 43785503 - 43785303
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||      
T  43785503 aaacccatttggggttgacctaatggttggcttgggatctttgagattgctcctccaaaggtctcaagttcgattcccacttgtgctaatttcagtggac 43785404  T
Q  328 taaattcatacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | ||||||||||||   |||| ||||||  || || |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  43785403 taagtccatacagagcttactctggttttaaacggggcctccgcaagtggacggtgagattggtccccttggattagtcgatttttggatcggataccga 43785304  T
Q  425 g 425  Q
    |    
T  43785303 g 43785303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 22299863 - 22299944
Alignment:
Q  245 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22299863 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 22299944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 31713094 - 31712903
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||||| |||        | ||| |    
T  31713094 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggattgatttcctctggtgccaat-------agataagt 31713002  T
Q  333 tcatacagagctt--gctggctttaa-atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||||  ||||   ||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31713001 ccatacaacgcttactctggctttaagcgggaccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 31712903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Original strand, 23854393 - 23854468
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattc 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23854393 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattc 23854468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 302 - 428
Target Start/End: Original strand, 23092167 - 23092296
Alignment:
Q  302 tccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggat 398  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23092167 tccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggat 23092266  T
Q  399 tagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  23092267 tagtcgattcatggatcggataccgagttt 23092296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 286 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 41907659 - 41907515
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtggg 382  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| |||  ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||    
T  41907659 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagaggttgctctggctttaaacgtggcccccgcaagtgggtggtggg 41907560  T
Q  383 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41907559 attggtcccc-cagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 41907515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 428
Target Start/End: Original strand, 3851841 - 3851957
Alignment:
Q  315 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 411  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3851841 aatttcggtgggctaagtccatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 3851940  T
Q  412 gatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||| |||||||    
T  3851941 gatcggataccgagttt 3851957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23330938 - 23330740
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| |   ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  || |    
T  23330938 catttggggttagcctagtggttggcttgggattttagagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgactccctccggtgccaatttcggtggg-caagt 23330840  T
Q  333 tcatacagagctt---gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||||||||||    ||||||| |||  || || |||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23330839 ccatacagagctttgctctggcttaaaacgggacctccgcaagtgggcggtaagattggtcccctcaaattagtcaatccttggatcggataccgagttt 23330740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36772471 - 36772304
Alignment:
Q  263 gatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg 360  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  36772471 gatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggtttgatttccccta-tgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgg 36772373  T
Q  361 c-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
      ||||||  |||||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  36772372 ggcccccgggagtgggcggtggaattagtcctctcggattagtcgattctttgatcggataccgagttt 36772304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 428
Target Start/End: Original strand, 28646972 - 28647169
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| | |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |     
T  28646972 atttggggttggcctagtgattgacttgggatcttggagtgtgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg-caagtc 28647070  T
Q  334 catacagagctt---gctggctt-taaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||| ||    ||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  28647071 aatacagagttttgctctggcttataacggggcccccacaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtctgtccttggatcggatatcgagttt 28647169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 416
Target Start/End: Original strand, 9683828 - 9684014
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  9683828 catttgcggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaagt 9683927  T
Q  333 tcatacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
     ||||| ||||||   |||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9683928 ccataccgagcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttggatcg 9684014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 348
Target Start/End: Original strand, 42814867 - 42814981
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |     
T  42814867 atttggagttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcttgaagtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 42814966  T
Q  334 catacagagcttgct 348  Q
    |||||| ||||||||    
T  42814967 catacaaagcttgct 42814981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 229 - 428
Target Start/End: Original strand, 22696318 - 22696521
Alignment:
Q  229 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  22696318 aactcattaggggttggcctagtggttgatttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtggg-- 22696415  T
Q  329 aaattcatacagagctt---gctggctttaaa--tggccccc-cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataac 422  Q
     | | ||||||||||||    |||||||  ||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  22696416 gactccatacagagctttgctctggcttagaacgaggcccccgcgcaagtaggcggcgggattggtcctctcggattagtcggtccttggatcggatacc 22696515  T
Q  423 gagttt 428  Q
    ||||||    
T  22696516 gagttt 22696521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9718186 - 9718071
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |    
T  9718186 catttgaggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagt 9718087  T
Q  333 tcatacagagcttgct 348  Q
     |||| ||||||||||    
T  9718086 ccatagagagcttgct 9718071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 308
Target Start/End: Original strand, 21370599 - 21370674
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  21370599 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttactccttcagatgtctcaggttcgattccctct 21370674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14199839 - 14199713
Alignment:
Q  259 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 356  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| ||| |  ||| ||||||||  ||| ||||||    
T  14199839 ttggaatcttggagtttcctcctccagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaattttggtgggctaagtctatatagagcttgctctgcctttaa 14199740  T
Q  357 atggccccccgcaagtgggcggtggga 383  Q
    | ||  ||||||||||||| |||||||    
T  14199739 acggggccccgcaagtgggtggtggga 14199713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21574302 - 21574103
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt-ccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| |   ||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||  ||     
T  21574302 catttggggttggcctagtggttggtttgggattttggagtgtgctcctctcaaggtcacaggttcgattcccctttggtgccaacttcggtggg-caag 21574204  T
Q  332 ttcatacagagctt---gctggctt-taaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 427  Q
    | ||||||||||||    | |||||  ||  || ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  21574203 tccatacagagctttgcccaggcttagaacggggcccccacaagtaggcggtgagattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagtt 21574104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8435894 - 8435801
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||     || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8435894 catttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctttgaagatcttaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtggg 8435801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Original strand, 40332101 - 40332194
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||    
T  40332101 catttggagttggtctagtggttggcttgaaatcttggagtttgctcctctaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcgatggg 40332194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12211734 - 12211646
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |   || ||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  12211734 catttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtgtgctcctctcaagatctcaggtttgatttcctctggtgccaatttcg 12211646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 279
Target Start/End: Original strand, 577677 - 577727
Alignment:
Q  229 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  577677 aactcatttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttagagtttgctc 577727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 22643515 - 22643351
Alignment:
Q  259 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 356  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||| | |||||||| |||||| ||  ||||||||| || ||| | |||||||||||||  ||| ||||||    
T  22643515 ttgggatcttgaagtttactccactagaggtcttatgttcgatttcctctgatgtcaatttcggtaggctaagtccatacagagcttgctctgactttaa 22643416  T
Q  357 atgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    | ||  ||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| || |||||| |||| ||||    
T  22643415 acggagccctcgcaagtggccggtgtgattagtcccctcggattaatcgattctttgatcagata 22643351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 297
Target Start/End: Original strand, 28003837 - 28003902
Alignment:
Q  232 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggtt 297  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  28003837 tcatttggggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtcttaggtt 28003902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 8943500 - 8943410
Alignment:
Q  334 catacagagcttg--ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  8943500 catacagagcttggtctggttttaaacgggcccccccgcaagtgggcggtgtgattggtccccttgaattagtcgattcttggatcggata 8943410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 350 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33137904 - 33137826
Alignment:
Q  350 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  33137904 gctttaaatggggccctgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcggatatcgagttt 33137826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 302
Target Start/End: Original strand, 1469106 - 1469183
Alignment:
Q  225 tataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||  |   |||||||||||||||||    
T  1469106 tataaactcatttggggttggcctagtggttgacttgaaatcttggagtttgttcatctcaaggtctcaggttcgatt 1469183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3951193 - 3951096
Alignment:
Q  230 actcatttggggttggcctagtggttagctt-gggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |   | ||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  3951193 actcatttggggttggtctagtggttggcttggggatcttggagtgtgctcctctcaaagtctcgggttcgcttttctctgatgctaatttcggtggg 3951096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22264707 - 22264622
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtg 312  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||| | |||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22264707 taaacccatttggggttggccgaagggttggtttggaatcttggagtttgctcctctcaaggtctcagattcgattccctctggtg 22264622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3950991 - 3950895
Alignment:
Q  230 actcatttggggttggcctagtggttagcttggga-tcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||  |||||| |   | |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3950991 actcatttggggttggtctagtggttggcttgagaatcttggagcgtgctcctctcaatgtctcatgttcgattccctttggtgctaattttggtgg 3950895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 299 - 348
Target Start/End: Original strand, 6491675 - 6491724
Alignment:
Q  299 gattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6491675 gattccctctggtgtcaatttcgatgggctaaattcatacagagcttgct 6491724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 330
Target Start/End: Original strand, 21558187 - 21558231
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaa 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21558187 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttaggtgggttaa 21558231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 38864649 - 38864553
Alignment:
Q  229 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||||| |   ||||| |||||| ||| |||||| | | |||| |||||||||||    
T  38864649 aactcatttggggttgacctagtggttgacttgagatctttgagtttgtttttccagaagtctcacgtttgattccttttagtgccaatttcggtgg 38864553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 415
Target Start/End: Original strand, 36173037 - 36173223
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||  || ||  |||||||| |||||||||| ||  |   |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  || |    
T  36173037 catttggggttggccttatgattgacttgggattttggagtttgttcatctcaaggtttcaggttcgattccctcttgtgccaattttggtggg-caagt 36173135  T
Q  333 tcatacagagct---tgctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatc 415  Q
     |||||||||||     || | || ||||||  ||||||| |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  36173136 ccatacagagctaagctcttgtttaaaatgggcccccccgtaagttggcgctgggattggtcctctcgaattagtcaattcttcgatc 36173223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 1766210 - 1766153
Alignment:
Q  363 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  1766210 ccccacaagtgggcggttggattggtcccctcggattagtcggtacttgaatcggata 1766153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 403
Target Start/End: Original strand, 21373789 - 21373885
Alignment:
Q  310 gtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 403  Q
    |||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  21373789 gtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctcacggattagtc 21373885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30345564 - 30345511
Alignment:
Q  374 ggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  30345564 ggcggtgggattggtcccctcgggttagtcggttcttagatcggataccgagtt 30345511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26459477 - 26459394
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccaga-ggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 319  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| || ||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26459477 gggttggcctagtggtattggcttgggacctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattctctctggtgccaattt 26459394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8484860 - 8484662
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  8484860 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 8484761  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8484760 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 8484662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11926701 - 11926502
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  11926701 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttagattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 11926602  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11926601 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 11926502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 236 - 420
Target Start/End: Original strand, 38684209 - 38684395
Alignment:
Q  236 ttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattca 335  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  38684209 ttggggttggcccagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcca 38684308  T
Q  336 tacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38684309 tacagagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 38684395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15641304 - 15641107
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    
T  15641304 catttggggttagcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 15641205  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  15641204 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 15641107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27498930 - 27498732
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  27498930 catttggggttgacctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 27498831  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||| ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27498830 ccatacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27498732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32059639 - 32059441
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |    
T  32059639 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggctaagt 32059540  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  32059539 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 32059441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 30485821 - 30486024
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||     
T  30485821 aaacccatttggggttggcccagcggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattcactctggtgtcaatttcggtgggc 30485920  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | |||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30485921 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgatgcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttggatcggataccga 30486020  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  30486021 gttt 30486024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19456389 - 19456212
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--g 349  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |    
T  19456389 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgat-ccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 19456291  T
Q  350 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19456290 gctttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 19456212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 239 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 33709694 - 33709512
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 338  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||    
T  33709694 gggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatac 33709595  T
Q  339 agagcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||    |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33709594 agagagctctggctttaaacgggacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 33709512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13038653 - 13038464
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |    
T  13038653 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagt 13038554  T
Q  333 tcatacagagcttg-ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13038553 tcatacagagcaagtatggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 13038464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13108648 - 13108459
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |    
T  13108648 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagt 13108549  T
Q  333 tcatacagagcttg-ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13108548 tcatacagagcaagtctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 13108459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 259 - 428
Target Start/End: Original strand, 18207231 - 18207403
Alignment:
Q  259 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 356  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  18207231 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgttctggctttaa 18207330  T
Q  357 atg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18207331 acgaggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18207403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Original strand, 34310134 - 34310338
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34310134 taaacccatttggggttggcctagtggtcggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtggg 34310233  T
Q  327 ttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 423  Q
     ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || |||||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| ||    
T  34310234 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccataagtggacggtgggattggtcccctcgaattaatcgattcttggatcggataccg 34310333  T
Q  424 agttt 428  Q
    |||||    
T  34310334 agttt 34310338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19145610 - 19145413
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  19145610 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtatgctcctctcaaggtctccggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc-aagt 19145512  T
Q  333 tcatacagagcttg---ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||    
T  19145511 ccatacagagctttgctctggctttaaatggtcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttggttcttggatcggataccgagttt 19145413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 31288150 - 31287947
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31288150 aaacccattttgggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggtgggt 31288051  T
Q  328 taaattcatacagagcttgc--tggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | |||||| |||||||  || |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||| |||||| |||    
T  31288050 taagtccatacaaagcttgctttgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcgaattagtcggttcttggaccggataccga 31287951  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  31287950 gttt 31287947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 246 - 428
Target Start/End: Original strand, 37495058 - 37495250
Alignment:
Q  246 cctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt 345  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||    
T  37495058 cctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagctt 37495157  T
Q  346 g--ctggctttaaatggccc--------cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |  ||||||||||| | |||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37495158 gctctggctttaaacgcccccccccccgcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 37495250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7085825 - 7085627
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |    
T  7085825 catttggggctggcttagtggttggcttgggatcttggagttttctcctccagaggtctccggttcgattccctctagtgtcaatttcggtgggctaagt 7085726  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  7085725 ccatacagagcttgctctgactttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 7085627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Original strand, 36954816 - 36955006
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| |    
T  36954816 catttggggttggcctagtggttgccttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggttctaatttcggcgtgctaagt 36954915  T
Q  333 tcatacagagcttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  36954916 ccatacagagtttgctttggctttaaatgggccccccgcaagtggactgtgggattagtcccctcatattagtcgattcttggatcggata 36955006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 4603775 - 4603973
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| |    
T  4603775 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaagttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagt 4603874  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||||||||| |  |||||||||||  || |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  4603875 ccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 4603973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 11465106 - 11464917
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |    
T  11465106 catttcgggttggcctagtgattggcttgaaatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgatttcctctggtgccaattttggtgggctaagt 11465007  T
Q  333 tcatacagagctt--gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11465006 tcatacagagcttactctggctttaaacggggccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 11464917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 241 - 420
Target Start/End: Original strand, 42193491 - 42193671
Alignment:
Q  241 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 340  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |  ||||||    
T  42193491 gttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgcttccccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgccaatttcggtgggctaagtctatacag 42193590  T
Q  341 agcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    || ||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42193591 agtttgctttggctttaaatgg-accccgcaagtgggcggtggggttggtcctctcggattagtcgattcttggatcagata 42193671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 239 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6014473 - 6014281
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 338  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  6014473 gggttggcctagtgattggcttgggatcttggagtttgcttctccagagatctcaggttcgattacttctggtgccaatttcggtgggttaagtccatac 6014374  T
Q  339 agagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||  || ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6014373 agagcttgctctggctttaaacggggtccacgcaagtgggcggtgagattagtcccctcgaattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 6014281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 23270734 - 23270531
Alignment:
Q  220 aatattataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 319  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||| | ||| |||||    
T  23270734 aatataatcaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccaaaggtctcaagttcgatttcctccgatgccaattt 23270635  T
Q  320 cggtgggttaaattcatacagagcttgc--tggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |    
T  23270634 cggtgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttggattg 23270535  T
Q  417 gata 420  Q
    ||||    
T  23270534 gata 23270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 233 - 384
Target Start/End: Original strand, 25586930 - 25587085
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  25586930 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaagt 25587029  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaa--atggccccccgcaagtgggcggtgggat 384  Q
     |||||||||||||  ||||||||||  | | |||||| |||||||||||| ||||    
T  25587030 ccatacagagcttgctctggctttaaacaggaccccccccaagtgggcggtcggat 25587085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 38631160 - 38630980
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |    
T  38631160 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagt 38631061  T
Q  333 tcatacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||||||||                | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  38631060 ccatacagagc---------------aggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggataccgagttt 38630980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 237 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 10869760 - 10869574
Alignment:
Q  237 tggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcat 336  Q
    |||||||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||| | ||     
T  10869760 tggggttggcatggtggttgacttgcgatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccatctggttccaatttcggtgggctaagtccac 10869661  T
Q  337 acagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    || |||||||  |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10869660 actgagcttgctctggctttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggatcggata 10869574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 232 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15971322 - 15971144
Alignment:
Q  232 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| |||     
T  15971322 tcatttagggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgtcaatttcggtgggctaag 15971223  T
Q  332 ttcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaatt 407  Q
    | |||||| ||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15971222 tccatacatagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgagattgatcccctcggattaatcaatt 15971144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Original strand, 22392693 - 22392884
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  22392693 taaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctc---tgccaatttcggtggg 22392789  T
Q  327 ttaaattcatacagagcttgctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgag 425  Q
     | || || |     |||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  22392790 ct-aagtctt-----gct--ctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcagattagtcgatttttggatcggataccgag 22392881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 27487754 - 27487563
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || | |||||| |||||||||||  ||| |    
T  27487754 catttggggttggcctagtggttgatttgggattttggagtttgctcttccagaggtctcaggtttgatcccatttggtgccaatttcggtggactaagt 27487655  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||||||||||  || ||||||||   || |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27487654 ccatacagagcttgctctagctttaaacgggggcccttgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 27487563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 223 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1827739 - 1827616
Alignment:
Q  223 attataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcgg 322  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  1827739 attattaacccatttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgataccaatttcgg 1827640  T
Q  323 tgggttaaattcatacagagcttg 346  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  1827639 tgggttaagtccatacagagcttg 1827616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25750810 - 25750614
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcg--attccctctggtgctaatttcggtgggttaa 330  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25750810 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttggatattccttctggtgccaatttcggtgggttaa 25750711  T
Q  331 attcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     | |||| ||||||||  ||||| ||||  || ||||  |||||||| |||| ||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25750710 gtccatatagagcttgctctggc-ttaacgggacccc--caagtggggggtgagattggtcccttcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 25750614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12398628 - 12398449
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 349  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||    
T  12398628 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgtcaatttcggtggcctaagttcatacagagcttgctctg 12398529  T
Q  350 gctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  12398528 gctttaaatggggcccccgcaaatggacggtgagattgatcctctcaaattagtcggttcttggattggataccgagttt 12398449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12317349 - 12317156
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||      
T  12317349 catttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctcttgaggtctcgggtttgatttcatctggtgtcaatttcggtgggttaa-- 12317252  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaa-atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
       | |||||||||  ||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12317251 --gtccagagcttgctctgactttaagcgggccccccgcaagtgggtggtgggattgat-ccctcggattagtcaattcttagatcggataccgagttt 12317156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 233 - 385
Target Start/End: Original strand, 15931057 - 15931211
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |    
T  15931057 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgcttcttcacaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggct-aagt 15931155  T
Q  333 tcatacagagcttgct--ggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggatt 385  Q
     |||||||||| ||||  |||||||||  || | | ||||||||||||||||||||    
T  15931156 ccatacagagcctgctctggctttaaacagggctctcgcaagtgggcggtgggatt 15931211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 34049820 - 34050007
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           | |||||| ||| |    
T  34049820 catttggggttgggctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttc-----------taggtgggctaagt 34049908  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  |||||   |||||||| |||||||    
T  34049909 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtaggattggtcccctcggattagttgattctcaaatcggataccgagttt 34050007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21236561 - 21236363
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||||| |||| |||  ||||||  |||| ||| |    
T  21236561 catttagggttggcttagtagttcgcttaggatcttggagttttctccttcagaggtcttcggttcgattctctctagtgtcaatttcaatgggctaagt 21236462  T
Q  333 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||||||| || ||  | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  21236461 ccatacagagttttctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcagattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 21236363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 286 - 416
Target Start/End: Original strand, 5049188 - 5049320
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtggga 383  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||    
T  5049188 aggtctcagattcaattccctctggtaccaatttcgatggtctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaaatggacggtggga 5049287  T
Q  384 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  5049288 ttggtcccatcgaattagtcgattcttggatcg 5049320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 420
Target Start/End: Original strand, 35425082 - 35425201
Alignment:
Q  304 cctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatta 400  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35425082 cctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcggatta 35425181  T
Q  401 gtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  35425182 gtcgattcttggatcggata 35425201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26009463 - 26009265
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||| || ||||||||||| | |||||||||  |||||| |||| | | |||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| |    
T  26009463 catttgggttttgcctagtggttggtttgggatctcagagtttactcctcgaaaggtttccggttcgattccctttggtgccaatttcagtgggctaagt 26009364  T
Q  333 tcatacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||| ||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||    
T  26009363 ccatgcagagcttactctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtagtgggattagtcccctcggattagtcggttcttgaatcgaatatcgagttt 26009265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Original strand, 22693065 - 22693131
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22693065 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 22693131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9659428 - 9659312
Alignment:
Q  315 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 411  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||    
T  9659428 aatttcggtgggctaagtccatacacagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtggacggtgggattggtcccttcggattagttgattcttg 9659329  T
Q  412 gatcggataacgagttt 428  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  9659328 gatgggataccgagttt 9659312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 41351186 - 41351105
Alignment:
Q  347 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41351186 ctggctttaaacggggctccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 41351105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 930684 - 930487
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctc-tggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |   | |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||  |||    
T  930684 catttggggttggcccagtggttggcttgagattttagagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattcccacttggtgccaatttcggt-ggacaaa 930586  T
Q  332 ttcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||| ||||||||  |||||  ||    ||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  930585 ttcatacatagcttgctccggcttagaacaagccctcgcaagtggacagtgtgattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggatatcgagttt 930487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15485498 - 15485317
Alignment:
Q  226 ataaactcatttggggttggcctagtgg-ttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtg 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||    
T  15485498 ataaacccatttggggttggcctagcgggttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccc-ctgacaccaatttcggtg 15485400  T
Q  325 ggttaaattcatacagagct---tgctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 403  Q
    |||||| | |||||| | ||   | |||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15485399 ggttaagtccatacaaaactatgttctggctttaaatggggtccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggattagtc 15485317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 343
Target Start/End: Original strand, 7151346 - 7151437
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagc 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  7151346 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctcaagaggtcttaggttcgactccctctggcgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc 7151437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 234 - 325
Target Start/End: Original strand, 37397712 - 37397803
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 325  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||    
T  37397712 atttggggttggtctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcctccaaaggtctaaggtttgattccccctggtgtcaattttggtgg 37397803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 362 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13659312 - 13659254
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13659312 cccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattaatcgattcttggatcggata 13659254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28614667 - 28614487
Alignment:
Q  249 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg-- 346  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||| | ||| | |||||| ||||||      
T  28614667 agtggttggcttgagatcttagagtttgttcctccaaagatctcaggttcgattacctctgatgtcaatt-cggtgagataagtccatacaaagcttgtt 28614569  T
Q  347 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||| ||||||| ||   ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  28614568 ctgactttaaacgggatcccgcagatggacggtgggattgatcccctcgaattagtcgatttttggatcggataccgagttt 28614487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 428
Target Start/End: Original strand, 36895438 - 36895621
Alignment:
Q  248 tagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg- 346  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | || | |||||| |||||      
T  36895438 tagtgattagcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtttcatgttcgattccctctggtaccaatttcggtgg-tcaagtccatacaaagctttg 36895536  T
Q  347 --ctggctttaaatggcccc-ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
      |||||||  || |   || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  36895537 ctctggcttagaacgtagccgccgcaagtgggcggggggattgttctcctcgaattagtcggttcttggatcggataccgagttt 36895621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 428
Target Start/End: Original strand, 10399762 - 10399970
Alignment:
Q  224 ttataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggt 323  Q
    |||||||  ||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  || || | ||||||| ||||| |||||| || ||||||| |    
T  10399762 ttataaatccatttggtgttggtctagtggttgactttggatcttggagtttgcttcttcaaagatttcaggtttgattctctctggcgccaatttcgat 10399861  T
Q  324 gggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttc-ccctcggattagtcaattcttggatcggat 419  Q
    ||| ||| | ||||| |||| ||  ||| |||||||  || |||||| |||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||  ||    
T  10399862 gggctaagtccatacggagcatgctctgactttaaacggggcccccgtaagtggacggtgggattggtcaccctcgaattagtcgattcttggatcaaat 10399961  T
Q  420 aacgagttt 428  Q
    | |||||||    
T  10399962 agcgagttt 10399970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Original strand, 40330631 - 40330724
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||||||| |||| |||| || |||||||||||||| ||||    
T  40330631 catttgaggttggcttagtggttagcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaagttcaattctctatggtgctaatttcgttggg 40330724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 312
Target Start/End: Original strand, 5067294 - 5067378
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtg 312  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  5067294 aaacccatttggagttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattttctctggtg 5067378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 418
Target Start/End: Original strand, 5067392 - 5067447
Alignment:
Q  363 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgga 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5067392 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattagtcgattcttggatcgga 5067447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17015593 - 17015420
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggc 351  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||| | |||||   ||||  ||||    
T  17015593 ggttggcttgagatcttgaagtttcctctttcagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcattgggataagtccatac-ttgctt--tggc 17015497  T
Q  352 tttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||| ||  ||||||||||  ||||| ||| || | ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||    
T  17015496 tttaaacggatccccgcaagtaagcggtaggaatggtaccctcggattaattaattcttgaatcggataccgagttt 17015420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3715107 - 3715055
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccaga 286  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3715107 atttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaga 3715055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10631340 - 10631290
Alignment:
Q  378 gtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10631340 gtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 10631290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 279
Target Start/End: Original strand, 42006787 - 42006837
Alignment:
Q  229 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctc 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42006787 aactcatttggggttgggctagtggttggcttgagatcttggagtttgctc 42006837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22253344 - 22253145
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |   || |||||||||||| |  |||| |||| ||||||| |||| ||| |    
T  22253344 catttggggttggtctagtggttggcttgggatctttgactttgctcctctctagatctcaggttcgactttctctagtgccaatttcgatgggctaagt 22253245  T
Q  333 tcatacagagct---tgctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||| ||||   | |||| |||||||| | ||||| ||| ||| | | ||||||  |||||||  |||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  22253244 ccatacaaagctatgttctggatttaaatgaggcccccacaactggacagcgggattcgtcccctcaaattagtcggatcttggatcgaataacgagttt 22253145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 273
Target Start/End: Original strand, 19230466 - 19230513
Alignment:
Q  226 ataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagt 273  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19230466 ataaacccaattggggttggcctagtggttagtttgggatcttggagt 19230513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21042728 - 21042677
Alignment:
Q  229 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 280  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  21042728 aactcatttggggttggtttagtgattggtttgggatcttggagtttgctcc 21042677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 280
Target Start/End: Original strand, 33025478 - 33025525
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 280  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33025478 catttggggttggcctcgcggttggcttgggatcttggagtgtgctcc 33025525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 428
Target Start/End: Original strand, 41084120 - 41084179
Alignment:
Q  369 aagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  41084120 aagtgggcggtaggattgatcccttcggattagtcggttcttgaatcggataccgagttt 41084179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 326
Target Start/End: Original strand, 21589349 - 21589387
Alignment:
Q  288 gtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21589349 gtctcaggttcgattccctctggtgccaatttaggtggg 21589387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 302
Target Start/End: Original strand, 16616117 - 16616186
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt 302  Q
    |||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |||||||    
T  16616117 catttgagattggcttagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctctaaagatctcagattcgatt 16616186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 420
Target Start/End: Original strand, 42006868 - 42006921
Alignment:
Q  367 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||    
T  42006868 gcaagtgggcggtggaattgttccacttggattagttgattctttgatcggata 42006921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Original strand, 8821120 - 8821180
Alignment:
Q  368 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||| |||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  8821120 caagtgggtggtgggattggtcacttcgaattagtctattcttggatcagataccgagttt 8821180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25548599 - 25548535
Alignment:
Q  364 cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  25548599 cccgcaagtacgcggtgggattggtcatctcgaattagtcgattcttggatcgaataccgagttt 25548535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Original strand, 33737878 - 33737937
Alignment:
Q  368 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  33737878 caagtgggcggtgagattggtcccctcgg-ttagttgattcttgaatcggataccgagttt 33737937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 428
Target Start/End: Original strand, 26174114 - 26174309
Alignment:
Q  236 ttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattca 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  26174114 ttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggttaagtcca 26174213  T
Q  336 tacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26174214 tacagagcttgctctggctttaaatagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 26174309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 53424375 - 53424178
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |    
T  53424375 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 53424276  T
Q  333 tcatacagagcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||||||| ||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  53424275 ccatacagagtttgctatggctttaaacgggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 53424178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 35492909 - 35493107
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  35492909 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 35493008  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  35493009 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattgaataccgagttt 35493107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8456355 - 8456151
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8456355 taaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 8456256  T
Q  327 ttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 423  Q
     ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  8456255 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccg 8456156  T
Q  424 agttt 428  Q
    |||||    
T  8456155 agttt 8456151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30807352 - 30807154
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  30807352 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 30807253  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30807252 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtaggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 30807154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 239 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15566692 - 15566501
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||    
T  15566692 gggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatac 15566593  T
Q  339 agagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15566592 agagcttgctctggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccgagttt 15566501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 45529953 - 45529756
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| |    
T  45529953 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcgatgggctaagt 45529854  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  45529853 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 45529756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 46576346 - 46576544
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  46576346 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagt 46576445  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46576446 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtcggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 46576544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 234 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 52821833 - 52821637
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |     
T  52821833 atttggtgttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagtc 52821734  T
Q  334 catacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52821733 catacagagcttgctctggctttaaacggggccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 52821637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 225 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25289921 - 25289716
Alignment:
Q  225 tataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtg 324  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25289921 tataaacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtg 25289822  T
Q  325 ggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataa 421  Q
    || ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  25289821 ggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcgaattagtcgattcttggatcggatac 25289723  T
Q  422 cgagttt 428  Q
    |||||||    
T  25289722 cgagttt 25289716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40133648 - 40133450
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  40133648 catttggggttggcctagtggttggcttgggattttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagt 40133549  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40133548 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40133450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 49258461 - 49258263
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  49258461 catttggggtttgcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagt 49258362  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  49258361 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 49258263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 21362941 - 21363139
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |    
T  21362941 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagt 21363040  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  21363041 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcggattaatcgattcttggatcggataccgagttt 21363139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Original strand, 30257622 - 30257812
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||| |    
T  30257622 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggactaagt 30257721  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30257722 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtggcattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 30257812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 48977386 - 48977584
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  48977386 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggttaagt 48977485  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  48977486 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 48977584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 234 - 420
Target Start/End: Original strand, 25379760 - 25379949
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||| |     
T  25379760 atttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggagggctaagtc 25379859  T
Q  334 catacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25379860 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagcgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 25379949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 45272615 - 45272417
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  45272615 catttggggttggcctagtcgttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcagtttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 45272516  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||| |||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  45272515 ccatacggagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgactcttggatcggataccgagttt 45272417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18177086 - 18176896
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  18177086 catttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcttccagaggtatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagt 18176987  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18176986 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcgattcttggatcggata 18176896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 31538043 - 31537839
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31538043 taaacccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgtttgattccctctggtgccaattttggtggg 31537944  T
Q  327 ttaaattcatacagagctt--gctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 423  Q
     ||| |  |||||||||||   ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  31537943 ctaagtctatacagagcttactctggctttaaacggagcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcaattcttggatcggatatcg 31537844  T
Q  424 agttt 428  Q
    |||||    
T  31537843 agttt 31537839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34492779 - 34492576
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||     
T  34492779 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctctgctgccaatttcgttgggc 34492680  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||  ||||||||||| |||| |||    
T  34492679 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtccattcagattagttgattcttggatctgataccga 34492580  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  34492579 gttt 34492576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 247 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 53234095 - 53233912
Alignment:
Q  247 ctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg 346  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  53234095 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 53233996  T
Q  347 --ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
      |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  53233995 ctctggctctaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 53233912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10190922 - 10190743
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 349  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||    
T  10190922 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10190823  T
Q  350 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10190822 gctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 10190743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 40940823 - 40941021
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  40940823 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagt 40940922  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||  || ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  40940923 ccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccacaagtgggtggtaggattggtcccctcgaattactcaattcttgaatcagataccgagttt 40941021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10083999 - 10083820
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 349  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||    
T  10083999 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10083900  T
Q  350 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10083899 gctttaaacggggcccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 10083820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 39042028 - 39041853
Alignment:
Q  256 agcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||| |||||||||  |||||||    
T  39042028 agcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatgcagagcttgctctggctt 39041929  T
Q  354 taaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||  || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  39041928 taaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 39041853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 52455848 - 52455650
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |    
T  52455848 catttggggttggcctagtggttggctagggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagt 52455749  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
      | ||||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  52455748 ctacacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgactggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattggataccgagttt 52455650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7485724 - 7485532
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  7485724 catttggggttggcatagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagt 7485625  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||    ||||||  |||||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7485624 tcat----agcttgatctggctttaaacaggcccctgcaagtggccggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 7485532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 29915468 - 29915288
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| |    
T  29915468 catttagggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggctaagt 29915369  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 411  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  29915368 acatacagagcttgccctggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29915288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 29964621 - 29964441
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| |    
T  29964621 catttagggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggctaagt 29964522  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 411  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||    
T  29964521 acatacagagcttgccctggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29964441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 239 - 428
Target Start/End: Original strand, 32151428 - 32151620
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 338  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||  ||||||    
T  32151428 gggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtttcaaattcgattctctctagtgccaatttcggtgggctaagctcatac 32151527  T
Q  339 agagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32151528 agagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 32151620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 385
Target Start/End: Original strand, 26108299 - 26108445
Alignment:
Q  242 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||    
T  26108299 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaga 26108398  T
Q  342 gcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggatt 385  Q
    |||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  26108399 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggctgtgggatt 26108445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 233 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7470414 - 7470244
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |    
T  7470414 catttggggtttgcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggctaagt 7470315  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattag 401  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  7470314 tcatacagagcttgctctggctttaaacggggccctgcaagtgggcagtgggattggtcccctcagattag 7470244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 229 - 428
Target Start/End: Original strand, 4462627 - 4462828
Alignment:
Q  229 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  || | |||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||| |    
T  4462627 aactcatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctacttcaaaagtctcatgttcgattccctctggcaccaatttcgatgggct 4462726  T
Q  329 aaattcatacagagctt--gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagt 426  Q
    || ||||||||||||||   || |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  4462727 aagttcatacagagcttactctagctttaaacggggccccgcaagtggacggtgggattgatccactcggattagtttattcttggattggataccgagt 4462826  T
Q  427 tt 428  Q
    ||    
T  4462827 tt 4462828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8097436 - 8097280
Alignment:
Q  275 tgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaag 371  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||    
T  8097436 tgctcctccagaggcctcaggttcgattccctcttgtgctaatttcgatgggctaagtccatacagagcatgctctggctttaaacggggcccccgcaag 8097337  T
Q  372 tgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8097336 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 8097280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 283 - 428
Target Start/End: Original strand, 24407309 - 24407457
Alignment:
Q  283 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccc-cgcaagtgggcggt 379  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||  | ||||||| ||  ||  ||||||||||||||    
T  24407309 cagaggtctcagattcgattctctctggtgctaatttcggtgggttaagtatatacagaatttgctctgactttaaacggggccatcgcaagtgggcggt 24407408  T
Q  380 gggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24407409 gggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 24407457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25344256 - 25344059
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||  ||| |    
T  25344256 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggtttgattccctttggtgtcaatttttgtggtctaagt 25344157  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||||||| |||  |||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||    
T  25344156 ccatacagagtttgctctggctttaaacggggcccccgctagtgggcgatgggattggt-tcctcggattagtcgattcttagatcgaataccgagttt 25344059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 334 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24165812 - 24165716
Alignment:
Q  334 catacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24165812 catacagagcttgctctggctttaaacggggccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 24165716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 33398641 - 33398477
Alignment:
Q  259 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gctttaa 356  Q
    ||||||||||| |||||||||  | | || ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||   |||||||    
T  33398641 ttgggatcttgtagtttgctcttctaaagatctcaagttcgattccctctagtgccaattttggtgggttatgtccatacagagcttgctctagctttaa 33398542  T
Q  357 atggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33398541 acggggcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtcgattcttggatcggata 33398477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 264 - 428
Target Start/End: Original strand, 1692863 - 1693029
Alignment:
Q  264 atcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc 361  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||||||  ||| |  ||||||| ||||||  ||||||| |  |     
T  1692863 atcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccatttagtgtcaatttcggtggactaagtctatacagaacttgctctggctttagacagg 1692962  T
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  1692963 cccccgcaagtgggcggtgggatttgccccctcagattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 1693029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 241 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 53288903 - 53288725
Alignment:
Q  241 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacag 340  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||||     
T  53288903 gttggccaagtggttggtttgggatattagagtttgctcctccaaaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagtccatacaa 53288804  T
Q  341 agcttgc--tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcgg 417  Q
    |||||||  |||||||||| ||  ||||||||  || ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  53288803 agcttgctttggctttaaacggggccccgcaaacggacggtgagattagtcccctcgaattagtcgattattggatcgg 53288725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 286 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 2511443 - 2511306
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtggg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||| |||||||  || || ||||||||||||||||||    
T  2511443 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctcgctctgactttaaacgggacctccgcaagtgggcggtggg 2511344  T
Q  383 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||| || ||||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  2511343 attggtctcctcgaattagtagattcttgaatcggata 2511306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 234 - 420
Target Start/End: Original strand, 11390601 - 11390790
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||| || | ||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||| |     
T  11390601 atttggggttggcctagtggttggtttgagatcttggagttttctcctccaaagatttcaggtttgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtc 11390700  T
Q  334 catacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| || || |||||| ||    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11390701 catacagagcttgctctgtctttaaatgggtcctccgcaaatgattcgtgagattattcccctcggattagtcgattcttggatcggata 11390790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 420
Target Start/End: Original strand, 19857056 - 19857239
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 338  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||       
T  19857056 gggttggcctggtggttggcttgg-atcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctttggtgtcaatttcggtgggctaagttcagtt 19857154  T
Q  339 agagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||||||  ||  |||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||| || |||||    
T  19857155 agagcttgctctaactttaaatggggtctccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcgcaatagtcgattcttgaattggata 19857239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8958210 - 8958036
Alignment:
Q  258 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gcttta 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||   ||||||    
T  8958210 cttgggatcttggagtctgctccttcaaaggtcttatgttcgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtccatacaaagcttgctctagcttta 8958111  T
Q  356 aat--ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||    
T  8958110 aaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattaatcgattcttggatcagataccgagttt 8958036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 420
Target Start/End: Original strand, 26158812 - 26158999
Alignment:
Q  229 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 328  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||| |||||| |   ||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  26158812 aactcatttggggttggcctatgtgttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttcattccctttggtgccaatttcggtggg-t 26158910  T
Q  329 aaattcatacagagcttgctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    || | |||||  ||||  |||||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  26158911 aagtccatac--agct--ctggcttagaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcggtccttggatcggata 26158999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 403
Target Start/End: Original strand, 51532787 - 51532960
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||| |||| | ||| | ||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||| |    
T  51532787 catttggggttgacctattagttggtttgagattttggagtttgcttctccaaaggtctcatgttcgattctctctaatgccaatttcggtgggctaagt 51532886  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 403  Q
     |||||||||||||  ||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51532887 ccatacagagcttgctctaactttaaatgggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagtc 51532960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 4252595 - 4252405
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |   |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || | | || |    
T  4252595 catttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaagtttgattccctctggtgccaatttcagt-gatcaagt 4252497  T
Q  333 tcatacagagctt---gctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||| |||||    |||| ||  || || |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4252496 ccatacaaagctttactctggtttagaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttggatcggata 4252405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 53848501 - 53848435
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  53848501 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 53848435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 319
Target Start/End: Original strand, 55287801 - 55287887
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 319  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55287801 catttggggttggcatagtggttggcttggaatcttagagtttgctccttcagaggtttcaggttcgattccctctggtgccaattt 55287887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 321
Target Start/End: Original strand, 9853623 - 9853702
Alignment:
Q  242 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcg 321  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  9853623 ttggtctagtggttagtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcccaccggtgccaatttcg 9853702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 403
Target Start/End: Original strand, 50582990 - 50583162
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| |    
T  50582990 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcttaaggtttcaggttcgatttcctctgttgccaatttcgttggg-taagt 50583088  T
Q  333 tcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 403  Q
     |||||| | |||     || ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  50583089 ccatacaaaactttgatttgactttaaatggagccccgtaagtgagcggtgggattggtcctctcgaattagtc 50583162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17579280 - 17579136
Alignment:
Q  288 gtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtggga 383  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||   |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||    
T  17579280 gtctcaggtttgatttcctctagtgttaattttggtgggctaagtccatacagagcttgctttagctttaaacgggaccctccgcaagtgggcggtgaga 17579181  T
Q  384 ttgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| |||||||    
T  17579180 ttggtcccctcagattagtcgatttttggatcgaatatcgagttt 17579136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6041878 - 6041671
Alignment:
Q  226 ataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||  ||||||||||||||||| |   |||  ||| |||||||| || || |||| |||||||||||    
T  6041878 ataaactcatttggggttgccctaatggttgacttgaaatcttggagtttgctcctctcaaggagtcatgttcgattgcccctagtgccaatttcggtgg 6041779  T
Q  326 gttaaattcatacagagct-tg--ctggctttaaatg--gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||| | ||||||||| | ||  ||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||    
T  6041778 attaagtccatacagagttatgctctgactttaaacgaagcccccctcaaatgggcggtgagattgttccccttagattagtcggttcttggatcagata 6041679  T
Q  421 acgagttt 428  Q
     |||||||    
T  6041678 ccgagttt 6041671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 348
Target Start/End: Original strand, 38732959 - 38733079
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| |||||| |||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||||||     
T  38732959 aaacccatttgaggttgggctaatggttgacttggaatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggtccgattctctctgttgtcaatttcggtgggc 38733058  T
Q  328 taaattcatacagagcttgct 348  Q
    | | ||||||||||| |||||    
T  38733059 tgagttcatacagaggttgct 38733079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 234 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 55371483 - 55371303
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| | |   |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||   || ||    
T  55371483 atttgaggttggcctagtggttggcttgcgattttggagtatgcttctctcaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggcggac-aagtt 55371385  T
Q  334 catacagagcttgctggctttaaatggccccc-cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||    |||  ||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  55371384 cata----gct--ctggcttaaaacggggccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttggatcggata 55371303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 428
Target Start/End: Original strand, 1178228 - 1178366
Alignment:
Q  291 tcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg---ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgt 387  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || | |||||||| |||    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||     
T  1178228 tcaggttcgattctccctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagaactttgctctggctttaaatggggccccacacgtgggcggtgggattgg 1178326  T
Q  388 tcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  1178327 tccc-tcggattagtcgaatcttggatcggataccgagttt 1178366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 321
Target Start/End: Original strand, 9842913 - 9843006
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcg 321  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||    
T  9842913 taaacccatttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggagttttctcctccagaggtctc-gattcgattcccactggtgtcaatttcg 9843006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 428
Target Start/End: Original strand, 54475780 - 54475877
Alignment:
Q  334 catacagagcttgct--ggctttaaatggcccc-ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  54475780 catacagagcttgctttggctttaaacggggccaccgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 54475877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 48972854 - 48972715
Alignment:
Q  289 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattg 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||||| ||  |||  |||||||| ||||  ||||    
T  48972854 tctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggttaagttcatatagagtttgctctgactttaaacggatccc--caagtggggggtgaaattg 48972757  T
Q  387 ttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||  ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  48972756 gtccattcgaattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 48972715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 403
Target Start/End: Original strand, 34844400 - 34844548
Alignment:
Q  257 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt-gct--ggctt 353  Q
    ||||| || |||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||  | |||||||||||| |||  |||||    
T  34844400 gcttgagaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctccagagccaatttcggtggactag-tacatacagagctttgctatggctt 34844498  T
Q  354 taaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  34844499 taaatgggcccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggattagtc 34844548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Original strand, 48105007 - 48105073
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48105007 cccccacaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 48105073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 428
Target Start/End: Original strand, 4048085 - 4048146
Alignment:
Q  367 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  4048085 gcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttggatcggataccgagttt 4048146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 325
Target Start/End: Original strand, 49167070 - 49167146
Alignment:
Q  249 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 325  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  49167070 agtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaagatatcaggttcgattctctctggtgtcaatttcggtgg 49167146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 50731298 - 50731238
Alignment:
Q  368 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  50731298 caagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatccttggatcggataccgagttt 50731238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Original strand, 50781556 - 50781616
Alignment:
Q  368 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  50781556 caagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatccttggatcggataccgagttt 50781616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 326
Target Start/End: Original strand, 25017508 - 25017606
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  25017508 taaacccatttggggttggcccagatgttggcttgg-atcttggagtttgctcctccaaagatcttaggttcgattccatctagtgtcaatttcggtggg 25017606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 398
Target Start/End: Original strand, 1242036 - 1242139
Alignment:
Q  298 cgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctc 394  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||    ||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  1242036 cgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagctttgctctggctttaaacggggtcccgcaagtgggcggtggaattggtcccctt 1242135  T
Q  395 ggat 398  Q
    ||||    
T  1242136 ggat 1242139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 428
Target Start/End: Original strand, 3747730 - 3747777
Alignment:
Q  381 ggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3747730 ggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 3747777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 14343478 - 14343304
Alignment:
Q  242 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 341  Q
    |||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||  || ||||||  |||| ||| | ||||||||    
T  14343478 ttggtctattggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcagattcgatttcatctgacgccaatttcaatgggctaagtccatacaga 14343379  T
Q  342 gcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggat 414  Q
     ||||  ||| ||||||| ||   ||| |||||| ||||| | |||| ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  14343378 acttgctctgcctttaaacggtatcccacaagtgagcggtagaattgatccccttagattagtcgattcttggat 14343304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 280
Target Start/End: Original strand, 16140295 - 16140342
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  16140295 catttggggttggcctagtgattagtttgggatcttggagcttgctcc 16140342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10445207 - 10445123
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtgg---ttagcttgggatcttggagtttgctccccca-gaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 319  Q
    |||||||||||||||   || |||||||| || ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10445207 gggttggcctagtggcaattggcttgggacctgggagtgtgctcctcctcgaggtctcaggttcgattctctctggtgctaattt 10445123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 303
Target Start/End: Original strand, 36660768 - 36660838
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattc 303  Q
    |||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||    
T  36660768 catttggggttgacctagtggttggtttaggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcaattc 36660838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 428
Target Start/End: Original strand, 25017620 - 25017684
Alignment:
Q  363 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  25017620 ccccgcaagtgggcggtgggattggt-tccttggattagtcgattcttggatcgaataccgagttt 25017684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 404
Target Start/End: Original strand, 33793567 - 33793624
Alignment:
Q  347 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtca 404  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33793567 ctggcttaaaaagggctcccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtca 33793624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11092236 - 11092144
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtta 329  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| |||| ||| |||| | |   ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11092236 gggttggcctagtggtgttggcttgggaccttgtagtgtgctactctcaaggtctcaacttcgattctccctggtgctaatttcggtgggtta 11092144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 399
Target Start/End: Original strand, 26599429 - 26599481
Alignment:
Q  347 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatt 399  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  26599429 ctggctttaaatggcgccccacaagtggacggtgggattggacccctcagatt 26599481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 4718647 - 4718845
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  4718647 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 4718746  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4718747 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 4718845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34237854 - 34237656
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  34237854 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 34237755  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34237754 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34237656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 234 - 428
Target Start/End: Original strand, 28193477 - 28193674
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  28193477 atttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtc 28193576  T
Q  334 catacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28193577 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccctacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 28193674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 228 - 420
Target Start/End: Original strand, 39349253 - 39349448
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  39349253 aaacccatttggggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 39349352  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39349353 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggata 39349448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3734822 - 3734624
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  3734822 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 3734723  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3734722 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 3734624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 2618188 - 2618386
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  2618188 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttgggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagt 2618287  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  2618288 ccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggattccgagttt 2618386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 242 - 428
Target Start/End: Original strand, 21603241 - 21603430
Alignment:
Q  242 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||   ||||||||    
T  21603241 ttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagcccatacaga 21603340  T
Q  342 gcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21603341 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 21603430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 19471611 - 19471810
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |    
T  19471611 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagt 19471710  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19471711 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgagttt 19471810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 19542535 - 19542734
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |    
T  19542535 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagt 19542634  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19542635 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgagttt 19542734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19590161 - 19589962
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |    
T  19590161 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagt 19590062  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19590061 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttggatcggataccgagttt 19589962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 32879276 - 32879479
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  32879276 aaacccatttggggttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttggtcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 32879375  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  32879376 taagttcatacagagcttgctctgacattaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggattggataccga 32879475  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  32879476 gttt 32879479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15259605 - 15259407
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  15259605 catttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggattttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 15259506  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  15259505 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgtaattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggatgccgagttt 15259407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 20305910 - 20306108
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| |    
T  20305910 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagt 20306009  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  20306010 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttggatcggataccgagttt 20306108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 21092543 - 21092741
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| |    
T  21092543 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagt 21092642  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  21092643 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttggatcggataccgagttt 21092741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 257 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8765701 - 8765527
Alignment:
Q  257 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 354  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  8765701 gcttgagatcttggagtttgctcccccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 8765602  T
Q  355 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  8765601 aaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 8765527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 42643317 - 42643119
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  42643317 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagt 42643218  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  ||| ||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  42643217 ccatacagagcttgctctgtcttgaaacgggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgcattagttgattcttggatcggataccgagttt 42643119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 42328007 - 42328204
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  42328007 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagttt-ctcctccagaggtgtcaggtttgattccctctgttgccaatttcggtgggctaagt 42328105  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42328106 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtggacgatgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 42328204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 234 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 264597 - 264409
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |     
T  264597 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 264498  T
Q  334 catacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     ||||| ||||||  ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  264497 tatacatagcttgctctggctttaaacgggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 264409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 234 - 420
Target Start/End: Original strand, 651324 - 651512
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |     
T  651324 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 651423  T
Q  334 catacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     ||||| ||||||  ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  651424 tatacatagcttgctctggctttaaacgggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 651512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 234 - 420
Target Start/End: Original strand, 837059 - 837247
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |     
T  837059 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 837158  T
Q  334 catacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     ||||| ||||||  ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  837159 tatacatagcttgctctggctttaaacgggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 837247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 27746534 - 27746348
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |    
T  27746534 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagt 27746435  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagt-gggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27746434 ccatacagagcttgctctggctttaaaaggggccccacaagtggggcgatggaattagtcccctcggattagtcgattcttggatcg 27746348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 420
Target Start/End: Original strand, 28088292 - 28088478
Alignment:
Q  237 tggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcat 336  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | |||    
T  28088292 tggggttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgttcatccagaggtctcagattcgattccctttggtgtcaatttcggtgggttaagtccat 28088391  T
Q  337 acagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  28088392 acagagcttgctctgactttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcagaatagtcgattcttggatcggata 28088478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 420
Target Start/End: Original strand, 14632975 - 14633146
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 349  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||  |||    
T  14632975 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctg 14633074  T
Q  350 gctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||| || ||  |  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14633075 gctttgaacggagcgtccacaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggata 14633146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 239 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4698916 - 4698724
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 338  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||      
T  4698916 gggttggcccagcggttggtttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatga 4698817  T
Q  339 agagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||| ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  4698816 agaacttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcatggattggataccgagttt 4698724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7558142 - 7557952
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |    
T  7558142 catttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcagattcgatttcctctggtgccaattttggtgggctaagt 7558043  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |       |||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  7558042 cc-------gcttgttctggctttaaacggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgatttttgcatcggataccgagttt 7557952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 18532109 - 18532298
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||| |    
T  18532109 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcagatgtcaatttcggtgggctaagt 18532208  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||| ||||  |||| ||||||  || |||| |||||||||||||| ||||         ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18532209 ccatacagaacttgctctggatttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgagatt---------ggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18532298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 257 - 428
Target Start/End: Original strand, 20469943 - 20470116
Alignment:
Q  257 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | |||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  20469943 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagagccaatttagatgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 20470042  T
Q  355 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  20470043 aaacagagcccccgcaagtgggcggtgggattggt-tcctcggattagtcgatttttggatcggataccgagttt 20470116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 233 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26169047 - 26168862
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||  || |    
T  26169047 catttagggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggtttgattcctcctgatgccaatttcggtggg-caagt 26168949  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26168948 tcatacagagcttgttctggctttaaatgagcccctcgcaagtgggggatgagattggtcccctcggagtagtcgattcttggatcg 26168862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 2166699 - 2166896
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtg--gttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaa 330  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || || |||    
T  2166699 catttggggttggcccagtgcagttggtttgggatcttggagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgattccctc--gtgccaatttcagtaggctaa 2166796  T
Q  331 attcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     | |||||||||||||||  ||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||| ||||| |||||||    
T  2166797 gtccatacagagcttgctctggctttaaataagaccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattttttgattggataccgagttt 2166896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 286 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6953153 - 6953009
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtggg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  6953153 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagttggcggtggg 6953054  T
Q  383 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  6953053 attggt-ccctcggattagtcgattcttggatcgaataccgagttt 6953009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34610869 - 34610688
Alignment:
Q  250 gtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct- 348  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| |  ||||||||||||||     
T  34610869 gtggttggcttaggattttggagtttgttcatccagatgtctgaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggtctaagtctatacagagcttgctc 34610770  T
Q  349 -ggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34610769 tggctttaaacgagcccctcgcaagtgggcggtagaattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34610688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 234 - 428
Target Start/End: Original strand, 24018385 - 24018583
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||  ||  |||||| ||||| ||| |     
T  24018385 atttggggttgatctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctgaggttcgatttcctctaatgtcaatttcagtgggctaagtc 24018484  T
Q  334 catacagagcttg--ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  24018485 catacagagcttgctctggctttaaacgggcctccccacaagtgggcggtgagattggtccccttgaattagtcggttcttggaccggatatcgagttt 24018583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 289 - 428
Target Start/End: Original strand, 25248407 - 25248546
Alignment:
Q  289 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattg 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| | ||||||||| |||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  25248407 tctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagt-catacagagtttgctctggctttaaacgggccctcgcaagtgggcggtgggattg 25248505  T
Q  387 ttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||    
T  25248506 gtcccctcggattagtcgatt-tttgatcggataccgagttt 25248546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 233 - 416
Target Start/End: Original strand, 28964035 - 28964220
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| |   |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |    
T  28964035 catttggggttggtctagtggttggtttgagatcttagagtttgctcctcttaaggtttcatgttcgattccatctggtgccaatttcggtgggctaagt 28964134  T
Q  333 tcatacagagct-tg-ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  28964135 ccatacggagctatgtctggctttaaacggggcccccgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatcg 28964220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34694775 - 34694576
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  34694775 catttggggttggtctagtggttgacttgtgatcttggagtttgctcctctcaaggtcttaggttcgattccatctggtgccaatttcggtggg-caaat 34694677  T
Q  333 tcatacagagc-ttgct--ggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 427  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||  || ||   ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  34694676 tcatacaaagctttgctccggcttagaacggaatccccctctagtggacggtgggattggtcccctcagattagtctgtccttggatcggataacgagtt 34694577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 410
Target Start/End: Original strand, 21667552 - 21667731
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  21667552 catttgaggttggtctagtggttggcttggaatcttggaggttgctcctccaaagatttcaggttcgatttcctttggtgctaatttcggtgggctaagt 21667651  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 410  Q
     |||||||||||||  ||| ||||||| ||  |  ||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||    
T  21667652 ccatacagagcttgctctgcctttaaacggagcatccgcaagtgggcggtggaattggt-ccctcagattagtcgattctt 21667731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2639478 - 2639412
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2639478 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 2639412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 428
Target Start/End: Original strand, 10292108 - 10292254
Alignment:
Q  284 agaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | | ||| ||||| |||||  ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  10292108 agaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctgagtccat-cagagattgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtg 10292206  T
Q  381 ggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  10292207 ggattggtcccttcggattagttgattcttggatcgaataccgagttt 10292254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 36848948 - 36848759
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||| |   |||| | || ||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  36848948 catttggggttggcatagtggttgacttgggtttttggagtttgctcctctcaaggttttagattccatttcctctggtgccaatttcggtgggctaagt 36848849  T
Q  333 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     ||||| ||| |||||  |||||||||||   | || ||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  || ||||||||||||    
T  36848848 ccatacggagtttgctcgggctttaaatgaggcaccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcggtttttggatcggata 36848759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Original strand, 8042656 - 8042834
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||       |||||| ||||| |||||| ||  |    
T  8042656 catttggggttgacctagtgcttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcaggttcga-------tggtgccaattttggtgggctatgt 8042748  T
Q  333 tcatacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||  ||||||||||| | |||| | |||| ||  |||||||||||||||    
T  8042749 ccatacagagtttgctggcttttaatgg-tccccgcaaatgaacggtgggattggt-cccttgaattaatcggttcttggatcggata 8042834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 34639405 - 34639295
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  34639405 catttggggttagtctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggctcga-tccctctggtgccaatttcggtggg-taagt 34639308  T
Q  333 tcatacagagctt 345  Q
     ||||||||||||    
T  34639307 ccatacagagctt 34639295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 18128515 - 18128713
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||| |||||  | |||||  |||||||||||| ||| ||||||     |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |    
T  18128515 catttgggattggctcattggttgacttgggatcttgaagtgtgctcctttcaaggtcttagattcgattctctctggtgccaatttcggtgggcgaa-t 18128613  T
Q  333 tcatacagagcttg---ctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||| |||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  18128614 ccataaagagctttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcagattagtcggttcttggatcgaataccgagttt 18128713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 386
Target Start/End: Original strand, 24999289 - 24999392
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtggg 382  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  24999289 aggtcttaggttcgattccctctgatgccaattttgatgggctaagttcatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggg 24999388  T
Q  383 attg 386  Q
    ||||    
T  24999389 attg 24999392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 326
Target Start/End: Original strand, 41070767 - 41070856
Alignment:
Q  237 tggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |   |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41070767 tggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctactctcaaggtctcaagttcgattccctttggtgtcaatttcggtggg 41070856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 428
Target Start/End: Original strand, 12312965 - 12313045
Alignment:
Q  348 tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| || |||| | |||||||    
T  12312965 tggctttaaatgggcccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcggttcttagagcggaaaccgagttt 12313045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8387643 - 8387550
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgc-tcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  8387643 catttggggttggcctagtggttgtcttgagatcttagagtttgcttctctcag-ggtctcaagttcgatttcctctggtgccaattttggtggg 8387550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 326
Target Start/End: Original strand, 15974915 - 15974999
Alignment:
Q  240 ggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |   |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  15974915 ggttggcctagtggtta-cttgggatcttggagtatgctcctctcaaggtctcaagttcgattccc-ctagtgcaaatttcggtggg 15974999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3403701 - 3403503
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||| ||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||  |   |||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |    
T  3403701 catttgaggttggccttggggttggcctgagatcttggagtttgctcatctcaaggtcttatgttcgattccatctggtgccaatttcggtggg-caagt 3403603  T
Q  333 tcatacagagct---tgctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||| | ||   |  ||||||||||| || ||| || |||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| || | |||| |||||||    
T  3403602 ccatacaaaactttgttttggctttaaatggggccctcgtaagtgggcggtgaggttggtcccctcgaattagtcaattcttagaccagataccgagttt 3403503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 322
Target Start/End: Original strand, 3794793 - 3794882
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcgg 322  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| |   |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3794793 catttgtggttgacctaatggttggcttaggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcatgttcggttccctctggtgccaatttcgg 3794882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 420
Target Start/End: Original strand, 13749187 - 13749248
Alignment:
Q  359 ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  13749187 ggccccccgcaagtgggcagtggaattggtcccctcggattagtcagtccttggatcagata 13749248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Original strand, 33747016 - 33747082
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  33747016 cccccgcaagtggacggtggaattggttctctcggattagtcgatccttggatcggataccgagttt 33747082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13580106 - 13580064
Alignment:
Q  229 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttgga 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  13580106 aactcatttggggttggtctagtagttaggttgggatcttgga 13580064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 416
Target Start/End: Original strand, 1219409 - 1219537
Alignment:
Q  291 tcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgt 387  Q
    ||||||||||||||||||| |   |||||| ||||| ||| | ||||||||  |||  ||||||||||| ||  |||||  ||||||||||| |||| |     
T  1219409 tcaggttcgattccctctgatatcaatttcagtgggctaagtccatacagaatttgttctggctttaaacggggcccccataagtgggcggtaggatcgg 1219508  T
Q  388 tcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  1219509 tcccttcggattagtcgattcttagatcg 1219537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 428
Target Start/End: Original strand, 9713609 - 9713654
Alignment:
Q  383 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9713609 attggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 9713654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 420
Target Start/End: Original strand, 16990722 - 16990775
Alignment:
Q  367 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  16990722 gcaagtgggcggtgggactggtccccttggattagtcggtccttggatcggata 16990775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 42332094 - 42332025
Alignment:
Q  347 ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  42332094 ctggctttaaacggtcctccgcaagtgggcgttaggattggtcccttcagataagtcaattattggatcg 42332025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 43817816 - 43817759
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 419  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| || |||||||||||||||    
T  43817816 cccccgcaagtgggcggtggaattggtctcctcaaattaatcgattcttggatcggat 43817759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 330
Target Start/End: Original strand, 6536579 - 6536623
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaa 330  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6536579 aggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttaggtgggttaa 6536623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4621436 - 4621238
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  4621436 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 4621337  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4621336 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 4621238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7766926 - 7766728
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7766926 cattcggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggctaagt 7766827  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  7766826 ccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggatatcgagttt 7766728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 229 - 428
Target Start/End: Original strand, 24122017 - 24122219
Alignment:
Q  229 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 328  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24122017 aactcatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 24122116  T
Q  329 aaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgag 425  Q
    || | |||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24122117 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgag 24122216  T
Q  426 ttt 428  Q
    |||    
T  24122217 ttt 24122219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Original strand, 24674391 - 24674581
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  24674391 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 24674490  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24674491 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttggatcggata 24674581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 46607803 - 46608006
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  46607803 aaacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 46607902  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | |||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  46607903 taagtccatacagagcttgctctgactttaaaaggcccccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcggtccttggatcggatatcga 46608002  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  46608003 gttt 46608006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15059607 - 15059403
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15059607 taaacccatttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtggg 15059508  T
Q  327 ttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 423  Q
     ||| | |||||||||||||  |||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15059507 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccg 15059408  T
Q  424 agttt 428  Q
    |||||    
T  15059407 agttt 15059403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 27455065 - 27454873
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| |    
T  27455065 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcactctgatgccaatttcggtgagctaagt 27454966  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatgg---ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27454965 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccccgcatgtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 27454873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 427
Target Start/End: Original strand, 8077645 - 8077841
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  8077645 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagt 8077744  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 427  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||| | ||||||    
T  8077745 ccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc-gattaatcgattattggatcggagaccgagtt 8077841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Original strand, 30677168 - 30677372
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30677168 taaacccatttggggttgacctagtggttggtttgggatctaggagtttgctcctccaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtggg 30677267  T
Q  327 ttaaattcatacagagcttgc--tggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 423  Q
     ||| | ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||    
T  30677268 ctaagtccatacagagcttgctttggctttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcggttcttggaccggatatcg 30677367  T
Q  424 agttt 428  Q
    |||||    
T  30677368 agttt 30677372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7197450 - 7197248
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  7197450 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggg- 7197352  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| |  ||||||| ||||  ||||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  7197351 taagtcaatacagaccttgctctggctttaaacgaggcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattcatggatcggataccga 7197252  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  7197251 gttt 7197248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 226 - 428
Target Start/End: Original strand, 34778333 - 34778535
Alignment:
Q  226 ataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  34778333 ataaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtaccaattttggtgg 34778432  T
Q  326 gttaaattcatacagagcttgc--tggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataac 422  Q
    |||   | ||||||||| ||||  ||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  34778433 gtt---tccatacagagtttgctttggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggatacc 34778529  T
Q  423 gagttt 428  Q
    ||||||    
T  34778530 gagttt 34778535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 243 - 428
Target Start/End: Original strand, 17935777 - 17935965
Alignment:
Q  243 tggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagag 342  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||    
T  17935777 tggcatagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagag 17935876  T
Q  343 cttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||  |||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17935877 tttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcgatgggattggtccactcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 17935965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 257 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9500530 - 9500356
Alignment:
Q  257 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  9500530 gcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 9500431  T
Q  355 aaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9500430 aaacggagcccccacaagtgggcggtgagattggtctcttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 9500356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 32729538 - 32729740
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |   | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  32729538 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtggg- 32729636  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
     || | |||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  32729637 caagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatccccttggattagtcggtctttggatcggataccga 32729736  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  32729737 gttt 32729740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Original strand, 168199 - 168389
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  168199 catttggagttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 168298  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||  || | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  168299 tcatacagagcttgttctgactttaaacgggactcccgctagtggccggtgggattggtcccctcggattagttagttcttagaccggata 168389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 428
Target Start/End: Original strand, 7578419 - 7578605
Alignment:
Q  245 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  7578419 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagct 7578518  T
Q  345 tg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||  ||| |||||||  || ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||    
T  7578519 tgctctgactttaaacggggccctcgcaagtgggtggtgggattggttccctcggattagttgatttttggatcggataccgagttt 7578605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Original strand, 23734114 - 23734305
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  23734114 catttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagt 23734213  T
Q  333 tcatacagagcttgc--tggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     ||||||||| ||||  || |||||||   ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  23734214 ccatacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttgaatcggata 23734305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Original strand, 23741306 - 23741497
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  23741306 catttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagt 23741405  T
Q  333 tcatacagagcttgc--tggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     ||||||||| ||||  || |||||||   ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  23741406 ccatacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttgaatcggata 23741497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 240 - 425
Target Start/End: Original strand, 1378903 - 1379090
Alignment:
Q  240 ggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcataca 339  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||    
T  1378903 ggttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcatgttcgatttcctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccataca 1379002  T
Q  340 gagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgag 425  Q
    || ||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  1379003 gaacttgctctggctttaaacgggcccccgcaagtggacggtgagattggtcccctcagattagtcgattcttagatcggataccgag 1379090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 233 - 400
Target Start/End: Original strand, 7946842 - 7947011
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  7946842 catttggggtcgacctagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 7946941  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatta 400  Q
      ||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||    
T  7946942 ctatacagagcttgctctcgctttaaatggggccccgcaagtgggtggtgagattggtcccctcagatta 7947011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Original strand, 21726727 - 21726917
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||| ||||| ||||||||||   ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  21726727 catttgaggttgacctagtggttgatttgggttcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatgggttaagt 21726826  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||| ||||||||  || ||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21726827 ccatatagagcttgttctagctttaaacgggtcccccacaagtgggcggtggggttgatcccctcagattaatcgattcttggatcggata 21726917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 250 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 37351643 - 37351454
Alignment:
Q  250 gtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--- 346  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||       
T  37351643 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgattccttctgatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctc 37351544  T
Q  347 --------ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
            ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  37351543 tggaagctctggctttaaacgggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 37351454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 257 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 45859218 - 45859052
Alignment:
Q  257 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||  || |||||    
T  45859218 gcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacatcgcttgctcttgcttt 45859119  T
Q  355 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||  || |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  45859118 aaacagggcccccgcaagtgggtggtaggattggtcccctcggattagttgattattggatcggata 45859052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 234 - 420
Target Start/End: Original strand, 18646852 - 18647041
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |     
T  18646852 atttggggttgacctagtggttggcttgtgatctttgagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 18646951  T
Q  334 catacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     ||||| || |||  ||||||||||| ||  |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  18646952 tatacaaagtttgctctggctttaaacggagcccctgtaagtgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttgaatcggata 18647041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36156061 - 36155889
Alignment:
Q  259 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc--tggctttaa 356  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | ||| ||||||||||  | | |||||    
T  36156061 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgtcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggccaagtccatgcagagcttgctttagttttaa 36155962  T
Q  357 a-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |  || |||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  36155961 acagggcccccgcaggtgggcggtgggattggtcccttcaaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 36155889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33905690 - 33905511
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 349  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||    
T  33905690 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtatcaatttcggtgggttaagtccatacagagtttgttctg 33905591  T
Q  350 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||  || || ||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||  || |||||| ||||||||| |||||||    
T  33905590 gctttaaacggggcctccgtaagtggacggtgggattgatcccctcaaatttatcgattctttgatcggataccgagttt 33905511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 233 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23232464 - 23232304
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    
T  23232464 catttgggattggcctagtggttgacttgggatcttgaagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctctggcgccaatttcggtgggctaagt 23232365  T
Q  333 tcatacagagcttg------ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattg 386  Q
     |||||||||||||      |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  23232364 ccatacagagcttgcaagctctggctttaaatgggacccccgcaagtgggtggtgggattg 23232304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 234 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 46113600 - 46113495
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |     
T  46113600 atttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtaccaatttcggtgggctaagtc 46113501  T
Q  334 cataca 339  Q
    ||||||    
T  46113500 cataca 46113495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 228 - 420
Target Start/End: Original strand, 2272337 - 2272532
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||     
T  2272337 aaacacatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctacagaggtctcaggtttgattccctctgatgccaatttcgctgggc 2272436  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||| |||||||| || |||  ||| |||||||  || ||||  |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  2272437 taagttcatacaaagtttgctctgactttaaacggggcccctacaagggggcggtaggattgatcccatcggattagtcgattctaagatcggata 2272532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 283 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8254901 - 8254753
Alignment:
Q  283 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggt 379  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  8254901 cagaggtctcaggttcgattatctctggtgtcaatttcggtgggctaagttcatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 8254802  T
Q  380 gggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  8254801 gggattgatccccttgaattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 8254753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 233 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20487389 - 20487297
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 325  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20487389 catttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 20487297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 233 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29057536 - 29057364
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||     
T  29057536 catttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctgctccaaaggtctcaggttcgattccctcttgtgccaatttcgatgg--taaag 29057439  T
Q  333 tc-atacagagcttg--ctggcttt-aaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 403  Q
    || ||||||||||||  |||||||| ||  || ||||||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||    
T  29057438 tctatacagagcttgctctggctttcaacgggacccccgcaaatgggcgatgtgattggtcccctcaaattagtc 29057364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 8779909 - 8779745
Alignment:
Q  259 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg--gctttaa 356  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||| |||  |||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||   |||||||    
T  8779909 ttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcagcttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacacagcttactctagctttaa 8779810  T
Q  357 atggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    | ||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8779809 acggggcccccacaagtaggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttagatcggata 8779745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25496686 - 25496503
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |  || ||    
T  25496686 atttggcgttggcctagtgattggcttgggatcttggagattgctcctcttaaggtctcaagttcgattccctctagtgcctatttcggtgag-caagtt 25496588  T
Q  334 catacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||  |||||| ||||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  25496587 catattgagcttactggcttaaaatggggctccgcaagtggacggtgggattgatcccct--gattagtctgtacttggatcggata 25496503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14258632 - 14258538
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcg 321  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  14258632 taaacccatttgggcttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagatgtctctggttcgattccctctggtaccaatttcg 14258538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 235 - 420
Target Start/End: Original strand, 32930749 - 32930937
Alignment:
Q  235 tttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 334  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||| | |    
T  32930749 tttggggttgacctagtggttggtttggaatcttggagtttactccttcagaggtctcaagttcgatttcctctggtgcccattttggtgggctaagtcc 32930848  T
Q  335 atacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    || |||||||||  |||||||||||  ||  ||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| || |||||| ||| |||||    
T  32930849 atgcagagcttgctctggctttaaacggggtccctgcaagtggatggtgggattgatcccctcagattaatcgattcttagattggata 32930937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 1486418 - 1486616
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |    
T  1486418 catttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagt--gctactctcaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatgggt-aagt 1486514  T
Q  333 tcatacagagcttg---ctggctttaaatgg---ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagt 426  Q
     ||||||||||||    ||| |||  || ||   |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  1486515 ccatacagagctttgctctgacttagaacggggcccccccgcaagtggacggtgggatcggtcccctccgattagtcggtccttggatcggataccgagt 1486614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Original strand, 48699889 - 48699955
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48699889 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccttcggattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 48699955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18533923 - 18533733
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||| | ||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||| |||| ||||||| |||  ||| |    
T  18533923 catttggggttgacatagtggttgacttgagatcttagagtttgctcctccagaggtatcagatttgattctctctagtgccaatttcgatggactaagt 18533824  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||| ||||||||  ||| |||||||  || |||| |||||||||| ||||||||| |||||||  |||| || |||||| |||||||||    
T  18533823 ccatatagagcttgttctgactttaaacggggcccctgcaagtgggccgtgggattggtcccctcatattaatcgattcttagatcggata 18533733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 327
Target Start/End: Original strand, 24216976 - 24217070
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  24216976 catttggggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattacctttggtgccaatttcggtgggt 24217070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25237180 - 25237095
Alignment:
Q  241 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25237180 gttggcctaatggttagtttgggatcttggagtttgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtggg 25237095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 323
Target Start/End: Original strand, 1378737 - 1378833
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggt 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  1378737 taaactcatttggggttggtctagtggttgacttggaatcttggagtttactcctccaaaggtctcatgttcgattttctctggtgtcaatttcggt 1378833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 307
Target Start/End: Original strand, 1818732 - 1818806
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctc 307  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  1818732 catttggggttggcctggtagttggcttaggatcttggagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctc 1818806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 409
Target Start/End: Original strand, 2537702 - 2537870
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||      |||||| |   |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||  |    
T  2537702 catttggggttggcctagtggttggattgggatctt------tgctcctctcaaggtctcaggtttgattccatttggtgccaatttcggtgggctatgt 2537795  T
Q  333 tcatacagagcttgct--ggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattct 409  Q
     ||     ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2537796 cca-----agcttgctttggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggagggattggtcccctcggattagtcagttct 2537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 351 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26513226 - 26513149
Alignment:
Q  351 ctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  26513226 ctttaaacgggcccccacaagtgggcggtgggaatggtcccctcggattagtcgattcttggatcgaataccgagttt 26513149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 45331739 - 45331622
Alignment:
Q  315 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 410  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  45331739 aatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggctccccgcaagtggacggtgggattaatcccctcagattaatcgattctt 45331640  T
Q  411 ggatcggataacgagttt 428  Q
    | |||||||| |||||||    
T  45331639 gaatcggataccgagttt 45331622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Original strand, 22910001 - 22910067
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||    
T  22910001 cccccgcaagtgggcggtgggatttgtcccctcggattagtcgatacttcgatcggataccgagttt 22910067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Original strand, 35138118 - 35138184
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  35138118 cccccgcaagtgggcggtgggattgattccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 35138184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 325
Target Start/End: Original strand, 1138577 - 1138669
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 325  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |   |||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||    
T  1138577 catttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtcttaggttcgaatctctctagtgccaatttcggtgg 1138669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 428
Target Start/End: Original strand, 27159205 - 27159281
Alignment:
Q  352 tttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  27159205 tttaaacgggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagtcgatctttggatcggatatcgagttt 27159281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 40146079 - 40145890
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||| |||| ||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||  |||     |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| ||| |     
T  40146079 atttggagttgacctagtggttgatttgtgatcttgaagtttgctccttcag-----tcaggttcgatttcctctagtgccaatttatgtgggctaagtc 40145985  T
Q  334 catacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaa------gtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||      ||||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40145984 catacagagcttgctctgactttaaatgggcccccacaaccacaagtgggtggtgagtttggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 40145890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 428
Target Start/End: Original strand, 23041655 - 23041718
Alignment:
Q  365 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23041655 ccgcaagtggacagtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 23041718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 280
Target Start/End: Original strand, 47091688 - 47091735
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47091688 catttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcc 47091735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19034569 - 19034492
Alignment:
Q  249 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19034569 agtggttggtttgggatcttggagtttgttcctcaaaaggtttcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtggg 19034492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Original strand, 52135128 - 52135221
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |   | |||||||||||||||  |||| |||| |||| |||||||    
T  52135128 catttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcatctcaatgtctcaggttcgattatctctagtgccaattccggtggg 52135221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Original strand, 16899509 - 16899594
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||| |        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16899509 catttggggttggcctagtggttgacttgtaatcttggagtgtgctgc--------tctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 16899594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 39964514 - 39964621
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcat 336  Q
    |||||||||||| |||  | ||||| || |||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||     
T  39964514 gggttggcctagaggtgttggcttgcgaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctgagttcac 39964613  T
Q  337 acagagct 344  Q
    ||||||||    
T  39964614 acagagct 39964621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 420
Target Start/End: Original strand, 16539659 - 16539795
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtggg 382  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  || | ||||||||||||   ||||||||  || ||  ||| | ||||||| ||||||    
T  16539659 aggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtggg-caagtccatacagagctttgcgctggcttagaacggggccctgtaagtgggtggtggg 16539757  T
Q  383 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||| |||||||  ||||||| || |||| ||||||||    
T  16539758 attggtcccctcaaattagtcgatacttgtatcggata 16539795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40802266 - 40802070
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||||  |   |||||||| ||| ||||| |  |||||| ||||| | || |  || |    
T  40802266 catttggggttggctttgtggttggcttgagatattggagtttgctcatctcaaggtctcatgtttgattctccatggtgccaattttgatgagc-aagt 40802168  T
Q  333 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||||  | ||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||| ||| || | ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||    
T  40802167 ccatacagagcttgctctgactttaaacgggtccccgcaagtgggtggtgagattggtcctctagaattagtcgattcttgaatcgaataccgagttt 40802070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 428
Target Start/End: Original strand, 50202680 - 50202741
Alignment:
Q  366 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||    
T  50202680 cgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattaatcgattctt-gatcggatatcgagttt 50202741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1095199 - 1095154
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagt 273  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1095199 aaacttatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagt 1095154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 379 - 428
Target Start/End: Original strand, 5315478 - 5315527
Alignment:
Q  379 tgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5315478 tgggattggtcccctcggataagtcgattcttggatcggataccgagttt 5315527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 280
Target Start/End: Original strand, 6776148 - 6776189
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcc 280  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6776148 gggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcc 6776189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 383 - 428
Target Start/End: Original strand, 14603947 - 14603992
Alignment:
Q  383 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14603947 attggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 14603992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 326
Target Start/End: Original strand, 809226 - 809313
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| |   |||||||||||| |||| || || |||  ||||||||||||    
T  809226 gggttggcctcgtggttggtttgggatcttggagtttactcctcttaaggtctcaggtttgattacccctagtgtcaatttcggtggg 809313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 12877003 - 12876965
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggatta 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12877003 cccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggatta 12876965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15581208 - 15581119
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||| |||| | | |||||| |||||||||||    
T  15581208 gggttggcctggtggtgttggcttgggaccttggagtgtgctcctctaaaggtctcaggttcaattctccccggtgctgatttcggtggg 15581119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 420
Target Start/End: Original strand, 47091751 - 47091809
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||||||||    
T  47091751 cccccgcaagtggggggtgggattggtccattcgatttagtaaattcttggatcggata 47091809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 420
Target Start/End: Original strand, 52135261 - 52135314
Alignment:
Q  367 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  52135261 gcaagtggacggtgggattggtcccctcatattagtcggttcttggatcggata 52135314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 428
Target Start/End: Original strand, 26820240 - 26820383
Alignment:
Q  288 gtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggcccccc-gcaagtgggcggtgggat 384  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  |||||   |||||||| | |||||||| ||||||  | ||||||||||  |||| ||||||||  ||||| ||    
T  26820240 gtctcagattcgattccctatgatgtcaatttttatgggttaagtccatacagaacttgctctgcctttaaatgggacccctgcaagtggatggtggaat 26820339  T
Q  385 tgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    || || | ||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  26820340 tgatcgcttcggattagtcgattcttggattgaataccgagttt 26820383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 33700840 - 33700757
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccaga-ggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 319  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| |||| ||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33700840 gggttggcctagtggtattggcttggaatctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattctctctggtgccaattt 33700757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36921595 - 36921513
Alignment:
Q  347 ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  | |||||  ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  36921595 ctggctttaaatgggaccccccgcaagtggacggtgggattagt-ccctcaaattagtcgattattgaatcggataccgagttt 36921513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 43770031 - 43769975
Alignment:
Q  363 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 419  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  43770031 ccccacaaatgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcgattctaggatcggat 43769975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 77)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 32986190 - 32986393
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  32986190 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggc 32986289  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | |||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  32986290 taagtccatacagagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggaatagtcgattcttggatcggataccga 32986389  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  32986390 gttt 32986393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33696478 - 33696280
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  33696478 catttagggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 33696379  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33696378 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcggattagtcaattcttggatcggatatcgagttt 33696280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34844957 - 34844759
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  34844957 catttggggttggcctagtggtttgcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagt 34844858  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34844857 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34844759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40059051 - 40058853
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  40059051 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagt 40058952  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40058951 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40058853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 52983617 - 52983815
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  52983617 catttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagt 52983716  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52983717 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 52983815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5609406 - 5609203
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  5609406 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcattcagtggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggc 5609307  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  5609306 taagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 5609207  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  5609206 gttt 5609203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 46714390 - 46714589
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcga-ttccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  46714390 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttccctttggtgccaatttcggtgggctaag 46714489  T
Q  332 ttcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    | |||||||||||||  || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  46714490 tccatacagagcttgcccttgctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttgaatcggataccgagttt 46714589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19660731 - 19660533
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  19660731 catttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattctctctgatgcaaatttcggtgggataagt 19660632  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19660631 ccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 19660533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 237 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27528990 - 27528796
Alignment:
Q  237 tggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcat 336  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||    
T  27528990 tggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccat 27528891  T
Q  337 acagagcttg--ctggcttta-aatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||  ||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27528890 acagagcttgctctggctttatacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27528796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 20566347 - 20566546
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggt-ctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||     
T  20566347 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaag 20566446  T
Q  332 ttcatacagagcttg--ctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20566447 tccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcgctgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 20566546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 25852212 - 25852411
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  25852212 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 25852311  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||   || ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  25852312 ccatacagagcttgctctggctttaaaacgggaccctcgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcggttcttggaccggataccgagttt 25852411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 227 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 45787908 - 45787705
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  45787908 taaactcatttggggttggcctagtggttggcttggaatcttgga-tttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtggg 45787810  T
Q  327 ttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 423  Q
     ||| | |||||||||||||||  |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  45787809 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccg 45787710  T
Q  424 agttt 428  Q
    |||||    
T  45787709 agttt 45787705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 228 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 54127546 - 54127351
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||     
T  54127546 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcaattccctcttgtgccaatttcggtgggc 54127447  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||| |  ||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  54127446 taagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttggaccggata 54127351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 234 - 428
Target Start/End: Original strand, 44343512 - 44343710
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttag-cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  44343512 atttggggttgggctagtggtttggcttgggatcttggagtttgctcccccaaaggactcaagttcgattccctctggtgctaattttggtgggctaagt 44343611  T
Q  333 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggccc-cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||||  | ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  44343612 ccatacagagcttgctctgactttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 44343710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 227 - 420
Target Start/End: Original strand, 51535605 - 51535809
Alignment:
Q  227 taaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51535605 taaactcatttagggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccacaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtggg 51535704  T
Q  327 ----ttaaattcatacagagcttg-----ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatc 415  Q
        |||| | |||||||||||||     |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  51535705 ctaattaagtccatacagagcttgcagctctggctttaaacggggcccccagcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttagatc 51535804  T
Q  416 ggata 420  Q
    |||||    
T  51535805 ggata 51535809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 257 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20078159 - 20077986
Alignment:
Q  257 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  20078159 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattcccactggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 20078060  T
Q  355 aaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagtt 427  Q
    |||  || |||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20078059 aaacggggcccccgtaagtgggcggtgggattagttccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagtt 20077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 239 - 420
Target Start/End: Original strand, 35229172 - 35229356
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 338  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||| | |||||    
T  35229172 gggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttct-atgccaatttcggtgggctaagtccatac 35229270  T
Q  339 agagcttg--ctggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    | ||||||  ||| ||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35229271 atagcttgctctgactttaaacgggtccccccacaagtgagcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 35229356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7392143 - 7391966
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 349  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||  |||    
T  7392143 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggt-ggttaagtccatacagagtttgctctg 7392045  T
Q  350 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||||||    
T  7392044 gctttaaatgggacccccatagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcggttcttcgattggataccgagttt 7391966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36131709 - 36131511
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| |    
T  36131709 catttggggttggcatagtggtttgcttgggattttggagttcgttcctccagatgtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtggcctaagt 36131610  T
Q  333 tcatacagagcttgc--tggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||||||||||||  || |||||||  || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||    
T  36131609 ccatacagagcttgctatgactttaaacgggacccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattattagatcagataccgagttt 36131511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 249 - 420
Target Start/End: Original strand, 49287872 - 49288045
Alignment:
Q  249 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc- 347  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| |  ||||     
T  49287872 agtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaaatttgct 49287971  T
Q  348 -tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||||||| || | |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  49287972 atggctttaaacgggctcccgcaagtgggcgctgagattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagata 49288045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 225 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22625277 - 22625154
Alignment:
Q  225 tataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtg 324  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22625277 tataaacccatttgaggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttactcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtg 22625178  T
Q  325 ggttaaattcatacagagcttgct 348  Q
    || ||| | |||||||||||||||    
T  22625177 ggctaagtccatacagagcttgct 22625154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 233 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13873494 - 13873321
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |    
T  13873494 catttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtaggctaagt 13873395  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 403  Q
    |||||||||| |||  || |||| |||  || |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||    
T  13873394 tcatacagagtttgctctagcttcaaacagggcccccgcaagtgggtggtggaattgatcctctgggattagtc 13873321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 231 - 416
Target Start/End: Original strand, 34835525 - 34835713
Alignment:
Q  231 ctcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaa 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  34835525 ctcatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctcttaaggtctcatgttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaa 34835624  T
Q  331 attcatacagagct-tg-ctggctttaaat--ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
     | ||||| ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34835625 gtccatacggagctatgtctggctttaaatagggccccccgcaagtgggc-gtgagattggtcccctcggattagtcgattcttagatcg 34835713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 234 - 414
Target Start/End: Original strand, 32942369 - 32942552
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |     
T  32942369 atttggggttggtctagtggttggcttgagatcttggagtttactcctccagaggtttaaggttcgattctctctgatgccaatttcggtgggctaagtc 32942468  T
Q  334 catacagagctt--gctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggat 414  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||    
T  32942469 catacagagcttactctggctttaaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggataaatcgattcttggat 32942552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 221 - 379
Target Start/End: Original strand, 33992612 - 33992773
Alignment:
Q  221 atattataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttc 320  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33992612 atattaaaaacccatttagggttgacctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttc 33992711  T
Q  321 ggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggt 379  Q
    |||||| ||| | |||||| ||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  33992712 ggtgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 33992773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 35674945 - 35674750
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  35674945 aaacccatttggggttggccaagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccaaaggtcacaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggc 35674846  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | |||||||||||||  ||| |||||||  || |||||||||||||||||| ||||       |||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  35674845 taagtccatacagagcttgctctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggttggat-------ctcggattagtcgattctt-gatcggataccga 35674754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 1985829 - 1986030
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||     
T  1985829 aaacccatttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgcgaatttcgatgggc 1985928  T
Q  328 taaattcatacagag----cttgctggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataac 422  Q
    ||| | |||||||||    ||  ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  1985929 taagtccatacagagtaaact--ctggctttaaacggagcccccacaagtgggcggtggaattggt-ctatcggattagtcgattcttggat-ggatacc 1986024  T
Q  423 gagttt 428  Q
    ||||||    
T  1986025 gagttt 1986030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 284 - 428
Target Start/End: Original strand, 34723848 - 34723995
Alignment:
Q  284 agaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtg 380  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| ||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  34723848 agaggcctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtg 34723947  T
Q  381 ggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34723948 ggattggtcctctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 34723995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18875715 - 18875518
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||| ||||| | |||||||| | ||||||| || ||||||| | |  || || ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| |    
T  18875715 catttgtggttgacatagtggttggtttgggattttagagtttgtttcttcaaagatctcaggttcgattccctctgatgtcaatttcggtgggctaagt 18875616  T
Q  333 tcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  18875615 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggcccccacaagtgggtagtgggattgatcccctcggattagtcaatttttggatcagataccgagttt 18875518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 416
Target Start/End: Original strand, 32990488 - 32990619
Alignment:
Q  288 gtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggat 384  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  32990488 gtctcaggttcgattccctttagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggat 32990587  T
Q  385 tgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32990588 tggtcccctcggactagtcgattcttggatcg 32990619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 273 - 420
Target Start/End: Original strand, 27574356 - 27574506
Alignment:
Q  273 tttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgca 369  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||  | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||    
T  27574356 tttgctcctccataggtctcaggttcgattttctcttattccaatttcggtaggctaaattcatacagagcttgctctggctttaaaaggggcccccgca 27574455  T
Q  370 agtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27574456 agtgggcggtgagtttggtcccctcggattaatcaattcttggatcggata 27574506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 232 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43719265 - 43719154
Alignment:
Q  232 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||     
T  43719265 tcatttggggttggtctagtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattctctctagtgctaatttcggtgggctaag 43719166  T
Q  332 ttcatacagagc 343  Q
    | ||||||||||    
T  43719165 tccatacagagc 43719154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12500231 - 12500060
Alignment:
Q  259 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 356  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  12500231 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 12500132  T
Q  357 a-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |  || ||||||||||||||||||   |||| | | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12500131 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttggaccggataccgagttt 12500060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 346
Target Start/End: Original strand, 2351020 - 2351124
Alignment:
Q  242 ttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacaga 341  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| |||||| |    
T  2351020 ttggcctagtggttggcttggaatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtcgactaaatccatacata 2351119  T
Q  342 gcttg 346  Q
    |||||    
T  2351120 gcttg 2351124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 286 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 9517787 - 9517650
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtggg 382  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||| ||||| |||| |    
T  9517787 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaggtgggtggtgag 9517688  T
Q  383 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9517687 attggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 9517650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 416
Target Start/End: Original strand, 13550206 - 13550392
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  13550206 catttgcggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaagt 13550305  T
Q  333 tcatacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
     ||||| ||||||   |||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13550306 ccataccgagcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttggatcg 13550392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 55961939 - 55961767
Alignment:
Q  235 tttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattc 334  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||           | |||||||||| |||||||||||| ||| | |    
T  55961939 tttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtc-----------ttcctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 55961851  T
Q  335 atacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||| ||||    
T  55961850 atacagagcttgctctgactttaaacggggccccacaagtgggcggtgggattggttccttcggattaatcgattcttgaatcg 55961767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 42245737 - 42245819
Alignment:
Q  226 ataaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  42245737 ataaactcatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctctaaaggtctcgggttcgattccctct 42245819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 30879338 - 30879175
Alignment:
Q  259 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 356  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||  ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || |||  ||||||||||    
T  30879338 ttgggatcttgtagtttgctccttcatgggttttaggtttgattccctctggtgccaatttcgatgggttaaatccatacaaagtttgctctggctttaa 30879239  T
Q  357 atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    | ||   || |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  30879238 agggggtcctgcaagtggacggtgggattggttccctcagattaatcgattcttggatcagata 30879175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13584453 - 13584338
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |    
T  13584453 catttgaggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagt 13584354  T
Q  333 tcatacagagcttgct 348  Q
     |||| ||||||||||    
T  13584353 ccatagagagcttgct 13584338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 267 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20527198 - 20527035
Alignment:
Q  267 ttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggcccc 364  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||| ||||||||   | | ||||||  |  ||    
T  20527198 ttggagtttgttcctccagaggtctcaagtttgattccctctggcgccaatttcggtgggctaagtccatatagagcttgatttcggtttaaacagggcc 20527099  T
Q  365 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||    
T  20527098 ccgtaagtgggcggtaggattggtctcctcggattagtcgatttttggatcaaataccgagttt 20527035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41621795 - 41621684
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||    
T  41621795 catttggggttggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcatgtttgatttcctctggtgccaattttggtggg-caaat 41621697  T
Q  333 tcatacagagctt 345  Q
     ||||||||||||    
T  41621696 ccatacagagctt 41621684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 282 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 21387635 - 21387496
Alignment:
Q  282 ccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcgg 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||| ||| |  ||||||||||||  |||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  21387635 ccagagatctcaggttcgattccctatagtgtcaattttggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacgggatccccgcaagtgggcgg 21387536  T
Q  379 tgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21387535 tggg--tggtcccctcggattagtcgattattggatcggata 21387496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 366 - 428
Target Start/End: Original strand, 23639758 - 23639820
Alignment:
Q  366 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23639758 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 23639820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 366 - 428
Target Start/End: Original strand, 23645416 - 23645478
Alignment:
Q  366 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23645416 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 23645478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 239 - 428
Target Start/End: Original strand, 4911926 - 4912122
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatac 338  Q
    |||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||     ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||  | ||||     
T  4911926 gggttggcttagtggttgacttaagatcttggagtttgcttttttagaagtttcaggttcgattccctctggtgttaattttggtggcctatgtccatat 4912025  T
Q  339 agagcttgct------ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||      ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  4912026 agagcttgcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggtggtgtgattgatccccccgaattagtcgattcttggatcagataccgagttt 4912122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 428
Target Start/End: Original strand, 52494623 - 52494684
Alignment:
Q  367 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52494623 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 52494684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25969700 - 25969512
Alignment:
Q  235 tttggggttggcctagtggttagcttggg-atcttggagtttgctcccccagaggtctcag--gttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||| |   ||||| |||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||   ||     
T  25969700 tttggggttggcctactggttgatttggggatcttggagtttgctcctctcaaggtcccagaggttggattccccctggtgccaatttcggtggcc-aag 25969602  T
Q  332 ttcatacagagcttgct--ggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    | |||||||| ||||||  ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  25969601 tccatacagaacttgctctggctttaaacgggcccccgtaagtgagcggtgggattggt-ccctcgaattagtcgattcttgaatcggata 25969512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 420
Target Start/End: Original strand, 4064990 - 4065048
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4064990 cccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatttttggatcggata 4065048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9978576 - 9978510
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  9978576 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagttgattcttagatcggataccgagttt 9978510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 287
Target Start/End: Original strand, 34722169 - 34722222
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagag 287  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34722169 atttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagag 34722222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 43719154 - 43719096
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43719154 cccccgaaagtgggcggtgggattggtcatctcggattagtcgattcttggatcggata 43719096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 55158409 - 55158344
Alignment:
Q  363 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||    
T  55158409 ccccgcaaatgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgatttttggatcggaaaccgagttt 55158344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23131497 - 23131437
Alignment:
Q  368 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  23131497 caagtgggcggtaggattggtcccctcgaattagtcgattcttcgatcggataccgagttt 23131437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 420
Target Start/End: Original strand, 33289180 - 33289242
Alignment:
Q  358 tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33289180 tggccccctacaagtggacggtgagattagtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 33289242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3392811 - 3392759
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcataca 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  3392811 aggtctcaggttcgatttcctctggtgttaatttcggtggg-aaaattcataca 3392759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 22488145 - 22488037
Alignment:
Q  315 aatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 411  Q
    |||||||||||  ||| | |||| ||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||  | ||||    
T  22488145 aatttcggtggactaagtccatatagagcttgttctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattgatcccctcaaattagtcggtccttg 22488046  T
Q  412 gatcggata 420  Q
    |||||||||    
T  22488045 gatcggata 22488037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 363 - 428
Target Start/End: Original strand, 51595153 - 51595218
Alignment:
Q  363 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||| |||||| |||| || | |||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  51595153 ccccgcaagtggacggtggaattgatctcttcggattaatcgattcttggatcggataccgagttt 51595218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17637912 - 17637853
Alignment:
Q  368 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  17637912 caagtgggcggtgatattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 17637853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22630332 - 22630292
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22630332 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtggg 22630292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 420
Target Start/End: Original strand, 37302623 - 37302675
Alignment:
Q  368 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37302623 caagtgggcgatgggattggtcccttcggattagtcgattcttgaatcggata 37302675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 428
Target Start/End: Original strand, 7093508 - 7093567
Alignment:
Q  369 aagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  7093508 aagtgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcggtccttggatcggatatcgagttt 7093567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9646280 - 9646217
Alignment:
Q  365 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| || |||||||    
T  9646280 ccgcaagtgggcagtgggattgatcccctcggattagtcggtcattggatcgggtaccgagttt 9646217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 325
Target Start/End: Original strand, 38740901 - 38740940
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38740901 aggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgg 38740940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 319
Target Start/End: Original strand, 38869797 - 38869860
Alignment:
Q  257 gcttgggatcttggagtttgctcccccaga-ggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 319  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38869797 gcttgggatctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattt 38869860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 428
Target Start/End: Original strand, 45302953 - 45303032
Alignment:
Q  350 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggatt-gttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||  || ||||||||| ||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45302953 gctttaaatggggcctcgcaagtggacggtgagatttggtcatctcggattagtcaattcttgaatcggataccgagttt 45303032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4585793 - 4585732
Alignment:
Q  348 tggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 410  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  4585793 tggctttaaacgggcccccgcaagtgggcggt-ggattggtcctttcggattagtcgattctt 4585732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 416
Target Start/End: Original strand, 13017843 - 13017897
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||    
T  13017843 cccccgcaagtgggcagtgggattggtccactcggattagtcggtccttggatcg 13017897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 366 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 13716513 - 13716459
Alignment:
Q  366 cgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  13716513 cgcaagtgggcggtgggattggtcctcttggattggtcagttcttgaatcggata 13716459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 306
Target Start/End: Original strand, 12710189 - 12710250
Alignment:
Q  245 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccct 306  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |   |||||||||||||||||||||    
T  12710189 gcctagtggttggtttgggatcttggagtatgcttctcttaaggtctcaggttcgattccct 12710250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 420
Target Start/End: Original strand, 12824535 - 12824588
Alignment:
Q  367 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12824535 gcaagtggacggtgggattggtctcatcgaattagtcgattcttggatcggata 12824588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13771682 - 13771589
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||  |   ||||||||  |||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  13771682 catttggggttggtctgatggttggcttgggatcttgaagtttgctcatctcaaggtctcaaattcgattccctctgatgtcaatctcggtggg 13771589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 326
Target Start/End: Original strand, 28635726 - 28635795
Alignment:
Q  258 cttgggatcttggagtttgctcccccag-aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  28635726 cttgggatctgggagtgtgctcctcctggaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttgggtggg 28635795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 276
Target Start/End: Original strand, 10125783 - 10125823
Alignment:
Q  236 ttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttg 276  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10125783 ttggagttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttg 10125823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37109418 - 37109335
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccaga-ggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 319  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| || ||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37109418 gggttggcctagtggtattggcttgggacctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattctctctggtgccaattt 37109335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 41621643 - 41621583
Alignment:
Q  368 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  41621643 caagtgggtggtgggactaatcccctcagattagtcggtccttggatcggataacgagttt 41621583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43352520 - 43352444
Alignment:
Q  236 ttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtg 312  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |   ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  43352520 ttggggttggtctaatggttggcttgagatcatggagtttgctcctctcaagaactcaggttcgattctctctggtg 43352444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 44946257 - 44946054
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  44946257 aaacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 44946158  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | |||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  44946157 taagtccatacagaacttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccga 44946058  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  44946057 gttt 44946054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11941409 - 11941211
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| |    
T  11941409 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctatggtgccaattttggtgggttaagt 11941310  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11941309 ccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 11941211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33827777 - 33827574
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  33827777 aaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagattgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgttgggc 33827678  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  33827677 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccctgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttggatcggataccga 33827578  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  33827577 gttt 33827574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 17324759 - 17324960
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  17324759 aaactcatttggggttggcctagtggttggtttggtatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 17324858  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgag 425  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  17324859 taagtccatacagagcttgctctggctttaaatgggcccccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcgattctt-gatcggatatcgag 17324957  T
Q  426 ttt 428  Q
    |||    
T  17324958 ttt 17324960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 15037952 - 15038155
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  15037952 aaacccatttggggttggcctagtggttgactcgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggc 15038051  T
Q  328 taaattcatacagagcttgc--tggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15038052 taagtccatacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttggatcggataccga 15038151  T
Q  425 gttt 428  Q
    ||||    
T  15038152 gttt 15038155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 232 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 44976354 - 44976172
Alignment:
Q  232 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||     
T  44976354 tcatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaag 44976255  T
Q  332 ttcatacagagcttg--ctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 410  Q
    | ||||||||| |||  |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  44976254 tccatacagagtttgctctggctttaaacggggctccccgcaagtgggcggtgggattgatcccttcggattagtcgattctt 44976172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30467029 - 30466831
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  30467029 catttggggttggcctagtggttggtttgggatattggagtttgttcctctagaggtctcaggttcgattctctctgctgccaatttcggtgggctaagt 30466930  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30466929 ccatacagagcttgctctggctttaaaccgggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 30466831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 24196002 - 24196198
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  24196002 catttggggttggcctagtggttggcttgggattttggggttcgctcctccagaggtttcaggttcgattccctctggtgcaaatttcggtgggctaagt 24196101  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||| ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||    
T  24196102 ccatacagaacttgctctggctttaaacgg-gccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattttttgattggataccgagttt 24196198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 25293164 - 25293355
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  25293164 catttgaggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 25293263  T
Q  333 tcatacagagcttgctggctttaaa--tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||    ||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25293264 tcat----agct--ctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 25293355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 19054023 - 19054222
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  19054023 catttggggtgggcctagtgattggcttgagatcttggagtctgctcctccaaaggtctcaggtttgattccttctggtgttaacttcggtgggctaagt 19054122  T
Q  333 tcatacagagcttgc--tggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  19054123 ccatacagagcttgctttggctttaaatggaaccccccgcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 19054222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 4567636 - 4567438
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4567636 catttggggttggcctagtagttggcttgggatcttgaagtttgctccttcagaagtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaaat 4567537  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgt--------tcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4567536 ccatacagagcttgttctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattgtgggattggtcctctcggattagtcaattcttggatcggata 4567438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 266 - 428
Target Start/End: Original strand, 35171831 - 35171996
Alignment:
Q  266 cttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggcc 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||  || |    
T  35171831 cttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggcaccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggc 35171930  T
Q  363 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  35171931 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 35171996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 43374505 - 43374331
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 349  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||  |||    
T  43374505 ggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtttatacaaagcttgctctg 43374406  T
Q  350 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||     |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43374405 gctttaa----gcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccttcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 43374331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 248 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 10582174 - 10582018
Alignment:
Q  248 tagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg- 346  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||     
T  10582174 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 10582075  T
Q  347 -ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtc 403  Q
     || |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  10582074 tctagctttaaacgggccctcgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagtc 10582018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Original strand, 41313990 - 41314179
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  41313990 catttggggttgccgtagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagt 41314089  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
      ||||||||||||  ||| ||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  41314090 ctatacagagcttgctctgactttaaacgggatcccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattaatcgattcttcgatcggata 41314179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 251 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 34516589 - 34516423
Alignment:
Q  251 tggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctg- 349  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||      
T  34516589 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattc-----ggtggtaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 34516495  T
Q  350 -gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34516494 cgctttaaacgggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 34516423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 234 - 428
Target Start/End: Original strand, 41329842 - 41330038
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| |     
T  41329842 atttggggttggcctagtggttagtttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtttcagattcgattccctctggtgccaattttggcgggctaagtc 41329941  T
Q  334 catacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  41329942 cata-agagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgagattggtcccctcagattagtcggttcttggaccggataccgagttt 41330038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8192550 - 8192353
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  || |    
T  8192550 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatgtcggtggg-caagt 8192452  T
Q  333 tcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||| |||||||    |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  8192451 ccatatagagctttgctctggcttagaacggcccctcgcaagtgggcggtgggattgggcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 8192353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 252 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 36242492 - 36242321
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 349  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||  |||||||||  |||    
T  36242492 ggttggcttgggatcttgaaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccagccagagcttgctctg 36242393  T
Q  350 gctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36242392 gctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggata 36242321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36390765 - 36390570
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  36390765 catttggggttggcctagtggttggtttgggatct--gagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtggactaagt 36390668  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || |||| |||||||| |||||||    
T  36390667 ccatacaaagcttgctctgactttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggatcagtcgatacttgaatcggataccgagttt 36390570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 282 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2140633 - 2140487
Alignment:
Q  282 ccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatgg--ccccccgcaagtgggcg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    | | |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2140633 ccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgg----agtccatacagagcttgctctggctttaaatgggcccccccgcaagtgggcg 2140538  T
Q  378 gtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  2140537 gtgggattggtcccctcggattagtcgattattggatcggataccgagttt 2140487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 234 - 420
Target Start/End: Original strand, 8258896 - 8259085
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    ||||||||||| | || ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| |     
T  8258896 atttggggttgacataatggttagtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctctgacgccaattttggtgggttaagtc 8258995  T
Q  334 catacagagcttg--ctggctttaa-atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8258996 catacagatcttgttctggctttaatcggggcccccgcaagtaggcggtgggattagttccttcggattagtcgattcttggatcggata 8259085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 428
Target Start/End: Original strand, 27290598 - 27290770
Alignment:
Q  245 gcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagct 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  27290598 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcccttcggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagct 27290697  T
Q  345 tgct--ggctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||  ||||||||| || |||||||||||||              |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27290698 tgctctggctttaaacgggccccccgcaagtg--------------tcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 27290770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27269549 - 27269345
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgct------aatttcggtggg 326  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |||| | ||||| ||||||||||||||        ||||||||||||    
T  27269549 catttggggttggcatagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctaaaggttttaggtttgattccctctggtgtcggtgtcaatttcggtggg 27269450  T
Q  327 ttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccc-cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacg 423  Q
     ||| | |||| ||| ||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  27269449 ctaagtccatatagaacttgctctggctttaaacagccctcccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttggataggataccg 27269350  T
Q  424 agttt 428  Q
    |||||    
T  27269349 agttt 27269345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Original strand, 32845089 - 32845182
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32845089 catttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 32845182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 252 - 420
Target Start/End: Original strand, 5394034 - 5394205
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 349  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| | ||||||||| |||  |||    
T  5394034 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccatacagagtttgctctg 5394133  T
Q  350 gctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  | ||| |||||||||    
T  5394134 actttaaatggggccgccgcaagtgggcggtgggattggtccgttcggattagtcggtccttagatcggata 5394205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 229 - 320
Target Start/End: Original strand, 4852552 - 4852643
Alignment:
Q  229 aactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttc 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4852552 aactcatttggggttgacctagtggttgacttggaatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttc 4852643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 428
Target Start/End: Original strand, 13266507 - 13266685
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 349  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||| | |||||||||||||  |||    
T  13266507 ggttggcttgagatcttggaatttgctcctttagaggtctcatgttcgattcactctggtgccaattccggtggactaagtccatacagagcttgctctg 13266606  T
Q  350 gctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||   |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13266607 gctttaaacggggccccgcaagtgggtaatgggattggtcccctcaaattagtcgattcttggatcggatatcgagttt 13266685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 252 - 413
Target Start/End: Original strand, 1191530 - 1191694
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 349  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||| | ||||||||| |||  |||    
T  1191530 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgtttccctctagtaccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgctctg 1191629  T
Q  350 gctttaaatgg-ccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttgga 413  Q
    |||||||| ||   ||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1191630 gctttaaacggtgtccccgaaagtgaacggtggaattgttcccctcgaattagtcgattcttgga 1191694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 233 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18976624 - 18976548
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18976624 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctctg 18976548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 308 - 428
Target Start/End: Original strand, 28668946 - 28669069
Alignment:
Q  308 tggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtca 404  Q
    |||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  28668946 tggtgccaatttcggtggactaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg 28669045  T
Q  405 attcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||| |||||||||||| |||||||    
T  28669046 atttttggatcggataccgagttt 28669069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 420
Target Start/End: Original strand, 45271401 - 45271572
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctg 349  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||  |||    
T  45271401 ggttggcttgggatcttagagtttgcttctccagaggtttcatgttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctg 45271500  T
Q  350 gctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||| |   |||| ||||||| |||| | ||||| |||||||  ||||||| |||||| ||| |||||    
T  45271501 gctttaaacgaagcccctgcaagtgagcggagagattgatcccctcaaattagtcgattctttgattggata 45271572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 286 - 420
Target Start/End: Original strand, 3943791 - 3943928
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatggccc-cccgcaagtgggcggtggg 382  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||    
T  3943791 aggtctcagattcgattttctctggtgccaatttcggttggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggtggtggg 3943890  T
Q  383 attgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  3943891 attggtccccttggattagtcggttattggatcggata 3943928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6714480 - 6714387
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |   |||||||||||||    
T  6714480 catttgggattggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccatctagcattaatttcggtggg 6714387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23787196 - 23787056
Alignment:
Q  244 ggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagc 343  Q
    |||||||||||| | |||  || ||||| |||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||     
T  23787196 ggcctagtggttggtttgaaattttggaatttgcttctacaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaaatccatacagagt 23787097  T
Q  344 ttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgg 381  Q
    |||  ||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  23787096 ttgctctgactttaaatgggacctccgcaagtgggcggtgg 23787056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 14946777 - 14946974
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| |   |||| | ||||||||||  ||||||||  |||||| ||||| ||| |    
T  14946777 catttggagttggcctagtggttgacttgagatcttgaagtttgctcctctcaaggttttaggttcgattttctctggtgtcaatttcagtgggctaagt 14946876  T
Q  333 tcatacagagct-tg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||||| ||||| ||  || |||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||    
T  14946877 ccatacggagctatgctctagctttaaacggaccccc-caagtaggcagtgggattggtcccctcagattagtcagtttttggatcggagaccgagttt 14946974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19606038 - 19605951
Alignment:
Q  239 gggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19606038 gggttgccctagtggttggcttgggatcttggagtgcgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctaatgctaatttcggtggg 19605951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 428
Target Start/End: Original strand, 29361578 - 29361744
Alignment:
Q  259 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgc--tggctttaa 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||  ||| | ||    ||||||||  |||||||||    
T  29361578 ttgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaggt-cgatttcctctgatgtcaatttcggtggactaagtcca----gagcttgccgtggctttaa 29361672  T
Q  357 atggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    | ||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||    
T  29361673 acggagccccgcaagtgggcagtgggattgatctcctcggattaattgattcctggatcggatatcgagttt 29361744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Original strand, 18692090 - 18692156
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18692090 cccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttggatcggataccgagttt 18692156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 428
Target Start/End: Original strand, 31778114 - 31778227
Alignment:
Q  322 gtgggttaaattcatacagagcttgct------ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggat 414  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  31778114 gtgggttaagttcatacagagcttgcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctctcagattagtcagttcttggat 31778213  T
Q  415 cggataacgagttt 428  Q
    |||||| |||||||    
T  31778214 cggataccgagttt 31778227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 363 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18976521 - 18976464
Alignment:
Q  363 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18976521 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttggatcggata 18976464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 918899 - 918782
Alignment:
Q  232 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggt---tcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 328  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| || | ||||||||| ||   |||||||||||| |||| ||||||| |||| |    
T  918899 tcatttggggttgacctagtggttggcttgggattttgaagtttgct-cctctgaggtctcaagttcgtcgattccctcttgtgccaatttcgttgggct 918801  T
Q  329 aaattcatacagagcttgc 347  Q
    || | ||||||||||||||    
T  918800 aagtccatacagagcttgc 918782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40997549 - 40997434
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||| ||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| || || | |||||||||| | ||| |    
T  40997549 catttgaggtgggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcaattccccctagtaccaatttcggtgagataagt 40997450  T
Q  333 tcatacagagcttgct 348  Q
      ||||||||||||||    
T  40997449 caatacagagcttgct 40997434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Original strand, 14486955 - 14487021
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  14486955 cccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccgagttt 14487021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28194333 - 28194239
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttag-cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| |||||| |   |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28194333 catttggggttggcgtagtgatttggcttgggatcttggagtgtgctcctcttaaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtggg 28194239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 44929913 - 44929847
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44929913 cccccgcaagtggacggtgggattggtccccttgaattagtcgattcttggatcggataccgagttt 44929847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4618880 - 4618795
Alignment:
Q  237 tggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcgg 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |   |||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  4618880 tggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtatgctcctctcaaggtttcaggttcgatttcccctggtgccaatttcgg 4618795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 420
Target Start/End: Original strand, 19174817 - 19174950
Alignment:
Q  289 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt---gctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggatt 385  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||||    |||||||  || ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  19174817 tctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtggg-taggtccatacagagctttgctctggcttagaacggagccccgtaaatgggcggtgggatt 19174915  T
Q  386 gttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    | ||||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  19174916 gatcccctcggattaatcggtccttggatcggata 19174950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 416
Target Start/End: Original strand, 19849847 - 19850017
Alignment:
Q  249 agtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct 348  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| | | |||  ||||| | |||  ||| |  ||||||||||||||    
T  19849847 agtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtcttaagttcgattccttttagtgtcaattttgatggactaagtctatacagagcttgct 19849946  T
Q  349 --ggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcg 416  Q
      |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||| || ||||||||||||    
T  19849947 ctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcaaattaatcgattcttggatcg 19850017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 428
Target Start/End: Original strand, 39957891 - 39957954
Alignment:
Q  365 ccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  39957891 ccgcaagtgggcgatgggattggttccctcggattagtcgattcttggattggataccgagttt 39957954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 428
Target Start/End: Original strand, 44610139 - 44610235
Alignment:
Q  335 atacagagcttgctg--gctttaaatggcccccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| || ||| |||||||    
T  44610139 atacagagcttgctctagctttaaatggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcggttcttggaccgaataccgagttt 44610235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 419
Target Start/End: Original strand, 4852660 - 4852716
Alignment:
Q  363 ccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggat 419  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4852660 ccccgcaagtggacggtggaattggtcccctcggattaatcgattcttggatcggat 4852716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5608233 - 5608118
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||| |||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||| |    
T  5608233 catttcgggttggtctagcagttggcttgaaatcttggaatttgctccttcagaggtctcatattcgattctctctggtgtcaattttggtgggctaagt 5608134  T
Q  333 tcatacagagcttgct 348  Q
     |||| ||||||||||    
T  5608133 ccatatagagcttgct 5608118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 307
Target Start/End: Original strand, 18691975 - 18692054
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||  |   || |||||||||||||||||||    
T  18691975 aaactcatttggggttggcctaatggtttgcttggaattttggagtgtgctcatctcaagatctcaggttcgattccctc 18692054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 289 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19525539 - 19525428
Alignment:
Q  289 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgctggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggattgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | ||||||  || |  |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||     
T  19525539 tctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtggg-caagtccatacaatgc-taatggctttaaatgaggcccccgcaagtgggtggtgagattgg 19525442  T
Q  388 tcccctcggattag 401  Q
    |||||| |||||||    
T  19525441 tccccttggattag 19525428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32526284 - 32526211
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccct 306  Q
    ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  32526284 catttggagttggcttagtggttgatttgggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattccct 32526211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6714360 - 6714296
Alignment:
Q  364 cccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  6714360 cccgcaagtggacggtgagattggtcccctcaaattagtcgattcttggattggataccgagttt 6714296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 714192 - 714126
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||    
T  714192 cccccgcaaatgggcggtgggtttcgtcccctcagattagtcgattcttagattggataccgagttt 714126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3405343 - 3405265
Alignment:
Q  241 gttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 319  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||  |   ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3405343 gttgacctagtggttgacttgggatcttggaatgtgctcatctcaaggtcacaggttcgattccctctggtgccaattt 3405265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 9401028 - 9400970
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  9401028 cccccgcaagtgggcagtgggattggtttccttagattagtcgattcttggatcggata 9400970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28194205 - 28194139
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | || ||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  28194205 cccccgcaagtaggcggtgggattggtctcgtcagattagtcggtccttggatcggataccgagttt 28194139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 33569876 - 33569842
Alignment:
Q  285 gaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33569876 gaggtctcaggttcgattctctctggtgctaattt 33569842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 301
Target Start/End: Original strand, 44610090 - 44610140
Alignment:
Q  251 tggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgat 301  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  44610090 tggttggcttgagatcttggagtttgctcttccaaaggtctcaggttcgat 44610140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 420
Target Start/End: Original strand, 45132417 - 45132475
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45132417 cccccacaagtgggcagtaggattggtcctctcggattaatcgattcttggatcggata 45132475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 345
Target Start/End: Original strand, 29698164 - 29698256
Alignment:
Q  252 ggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagctt 345  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |   |||||||| |||  ||| |||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  29698164 ggttggcttgggatcttggaatttgctcctctcaaggtctcaagttttatttcctctggtgtcaatttcggtggg-caagttcatacagagctt 29698256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12086146 - 12086106
Alignment:
Q  286 aggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12086146 aggtctcgggttcgattccctccggtgctaatttaggtggg 12086106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13747702 - 13747611
Alignment:
Q  237 tggggttggcctagtggt--tagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    |||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||| || |||| | |||||  |||||||||||    
T  13747702 tggggttggcttagtggtgttggcttgggaccttggagtatgctcctcccaaggtctcaggtttgaatccccccggtgccgatttcggtggg 13747611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19605907 - 19605847
Alignment:
Q  368 caagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
T  19605907 caagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagttgacacttggatcggatatcgagttt 19605847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 410
Target Start/End: Original strand, 32845206 - 32845254
Alignment:
Q  362 cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattctt 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  32845206 cccctgcaagtgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcgattctt 32845254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5281 - 5083
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  5281 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 5182  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5181 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 5083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0623 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0623
Description:

Target: scaffold0623; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 232 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1256 - 1058
Alignment:
Q  232 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  1256 tcatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaag 1157  T
Q  332 ttcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  1156 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 1058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:

Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 232 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9499 - 9301
Alignment:
Q  232 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  9499 tcatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaag 9400  T
Q  332 ttcatacagagcttg--ctggctttaaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  9399 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 9301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 232 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12200 - 12019
Alignment:
Q  232 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||     
T  12200 tcatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaag 12101  T
Q  332 ttcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttg 411  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12100 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattcttg 12019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 232 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10893 - 10696
Alignment:
Q  232 tcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||     
T  10893 tcatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaag 10794  T
Q  332 ttcatacagagcttg--ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10793 tccatacagagcttgctctggctttaaatggggccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattctt-gatcggataccgagttt 10696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 40323 - 40520
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  40323 catttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 40422  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40423 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttggatcggataccgagttt 40520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 234 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 7507 - 7318
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |     
T  7507 atttggggttggcctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtc 7408  T
Q  334 catacagagctt--gctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
    ||||||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7407 catacagagctttctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcggata 7318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 257 - 428
Target Start/End: Original strand, 161831 - 162005
Alignment:
Q  257 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggcttt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  161831 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttt 161930  T
Q  355 aaat-ggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  161931 taatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 162005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 53070 - 52872
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  53070 catttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggcttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaaat 52971  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  52970 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaggtgggcggtaggattggtcctctcggattagtcgattcttgaatcggataccgagttt 52872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 97565 - 97367
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  97565 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgtagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 97466  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  || ||||| |||||| |||||||    
T  97465 ccatacagagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcgtattagtcggtttttggaccggataccgagttt 97367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 41843 - 41654
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| || | ||| |    
T  41843 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcttgttccaatttcgttgtgctaagt 41744  T
Q  333 tcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggata 420  Q
     |||||||||||||  |||||||||||  || |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41743 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggata 41654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 274 - 428
Target Start/End: Original strand, 39131 - 39288
Alignment:
Q  274 ttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaaatggc-cccccgcaa 370  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||| ||||  ||||||||||| ||  |||||||||    
T  39131 ttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctatgtccatacagaacttgttctggctttaaacggggcccccgcaa 39230  T
Q  371 gtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  39231 gtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttggatcagataccgagttt 39288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 428
Target Start/End: Original strand, 66755 - 66950
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggt 327  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  66755 aaacccatttgggattggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcacgttcgattccttctggtgccaattttggtgggc 66854  T
Q  328 taaattcatacagagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacga 424  Q
    ||| |         |||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  66855 taagt--------cgcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggtccttggatcggataccga 66946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8606 - 8513
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtggg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  8606 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtggg 8513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8513 - 8452
Alignment:
Q  367 gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  8513 gcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcgattcttagatcggataccgagttt 8452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 289 - 428
Target Start/End: Original strand, 32342 - 32483
Alignment:
Q  289 tctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttgct--ggctttaaatg-gccccccgcaagtgggcggtgggatt 385  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  32342 tctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaatgtggcccccgcaagtgggtggtgggatt 32441  T
Q  386 gttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  32442 ggtcccctcggattagtcgattctt-gatcggataccgagttt 32483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 428
Target Start/End: Original strand, 20246 - 20417
Alignment:
Q  259 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcatacagagcttg--ctggctttaa 356  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  20246 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 20345  T
Q  357 a-tggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |  || ||||||||||||||||||   |||| | | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20346 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttggaccggataccgagttt 20417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0460 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0460
Description:

Target: scaffold0460; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 233 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8378 - 8286
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 325  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378 catttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 8286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29340 - 29144
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaatt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||| || ||| |   |||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| || |     
T  29340 atttgggattggcctagtggttggcttggaatcttgaagtgtgttcctctcaaggtcttaggttcgattcccgctgatgccattttcggtcggt-aagtc 29242  T
Q  334 catacagagcttg---ctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    ||||||||||||    ||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29241 catacagagctttgctctggcttaaaatggacccccgcaaatggacagtgggattggtcccctcagattagtcagtccttggatcggataccgagttt 29144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 240 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 150 - 1
Alignment:
Q  240 ggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaattcataca 339  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||| ||| | ||||||    
T  150 ggttggcctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcgtccagaggtctcaggttcgattccctcttatgtcaatttcgatgggctaagtccataca 51  T
Q  340 gagcttg--ctggctttaaa-tggccccccgcaagtgggcggtgggattg 386  Q
    ||| |||  || ||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||    
T  50 gagtttgctctagctttaaacggggcccccacatgtgggcggtgggattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 27774 - 27966
Alignment:
Q  233 catttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaaat 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| |    
T  27774 catttggggttggtctagtggttggtttgggattttggagtttgctcctctcaaggtctcgggttcgattccctgtggtgccaatttgagtgggctaagt 27873  T
Q  333 tcatacagagcttgctggctttaaatggccccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
     |||||  ||||     ||||||||| |  | ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  27874 ccatacgaagct---atgctttaaatagggcgccgcaagtgggtggtgagatttgtcccctcggattagtcggttcttggatcagataccgagttt 27966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1175 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1175
Description:

Target: scaffold1175; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2524 - 2427
Alignment:
Q  334 catacagagcttgct--ggctttaaatggc-cccccgcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcaattcttggatcggataacgagttt 428  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||    
T  2524 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtccgtccttgaatcggataccgagttt 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12952 - 12884
Alignment:
Q  234 atttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12952 atttgggattggcctagtggttgacttgggatcttggagttcgctcctccagagatctcaggttcgatt 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26747 - 26650
Alignment:
Q  228 aaactcatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgg 325  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||   | |||||||||| ||| ||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  26747 aaacccatttggggttggcctactggttggcttaggatcttggagtttgcttttcaagaggtctcatgtttgattctctcttatgccaatttcggtgg 26650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 319
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11620
Alignment:
Q  257 gcttgggatcttggagtttgctccccca-gaggtctcaggttcgattccctctggtgctaattt 319  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11557 gcttgggatctgggagtgtgctcctcctcgaggtctcaggttcgattctctctggtgttaattt 11620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University