View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19678_high_17 (Length: 456)

Name: NF19678_high_17
Description: NF19678
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19678_high_17
NF19678_high_17
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (16-438)||(33059226-33059648)
chr6 (45-438)||(33411645-33412038)
chr6 (45-438)||(31560804-31561197)
chr6 (45-438)||(33642597-33642990)
chr6 (34-438)||(33273473-33273877)
chr6 (16-438)||(33287205-33287627)
chr6 (45-438)||(33389764-33390157)
chr6 (50-438)||(33402311-33402699)
chr6 (45-437)||(33306178-33306570)
chr6 (45-438)||(9168463-9168859)
chr6 (51-433)||(33264347-33264729)
chr6 (190-438)||(33359916-33360164)
chr6 (129-438)||(31567123-31567432)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (34-433)||(17438828-17439227)
[»] scaffold0428 (1 HSPs)
scaffold0428 (34-433)||(8441-8840)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (34-438)||(31496922-31497326)
chr4 (45-201)||(31150031-31150187)
chr4 (45-189)||(31158932-31159076)
chr4 (34-382)||(31477025-31477373)
chr4 (50-438)||(31502091-31502482)
chr4 (34-144)||(31489964-31490074)
chr4 (45-144)||(31019483-31019582)
chr4 (45-144)||(31029364-31029463)
chr4 (336-438)||(31019771-31019873)
chr4 (336-438)||(31489673-31489775)
chr4 (336-438)||(31029652-31029754)
chr4 (94-192)||(31033713-31033811)
[»] scaffold1749 (1 HSPs)
scaffold1749 (357-433)||(3-79)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Original strand, 33059226 - 33059648
Alignment:
Q  16 ataacatgtgagcttcattccaatccaatagtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33059226 ataacatgtgagcttcattccaatccaatagtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataat 33059325  T
Q  116 tctactacctggacctaaccattcacgatgcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33059326 tctactacctggacctaaccattcacgatgcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacat 33059425  T
Q  216 agcttcctttgtatcaaagtagttgcatggtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33059426 agcttcctttgtatcaaagtagttgcatggtaacgattgcatatttgttggtgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtg 33059525  T
Q  316 gatcatcatgtaatccataaattttggttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33059526 gatcatcatgtaatccataaattttggttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgt 33059625  T
Q  416 tttccctattcctcccattccac 438  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33059626 tttccctattcctcccattccac 33059648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 45 - 438
Target Start/End: Original strand, 33411645 - 33412038
Alignment:
Q  45 agtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcacgat 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33411645 agtggaactttgtaaactacatccactccgtactctttcaatatatgctcatctctagaaatgataacgattctactacccgcacctaaccattcacgat 33411744  T
Q  145 gcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaagtagttgcatg 244  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||| || | | | | ||||||||  |||||||      
T  33411745 gcacagctattttttccaattgttcaacttgatccacattatcaaaaatcagaagggccttttcatgacgtaacctacgtcgtatcaaatcagttgcact 33411844  T
Q  245 gtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccataaattttggtt 344  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||    
T  33411845 gtaacgattgcatatttgatggtgttctatgccgacagtttgaagtaggatttgcctttgtgcatcgaggggaccatcatataatctataaattttgctt 33411944  T
Q  345 acatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccattccac 438  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  33411945 acatcgtctataaaacaagatgcactaaattgatgagatatctggccatataaagtcatagcaagggttgtctttcctattccgcccattccac 33412038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 45 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31561197 - 31560804
Alignment:
Q  45 agtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcacgat 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  31561197 agtggaactttgtaaactacatccactccatactctttcaatatatgctcatctctagaaatgataataattctactccctgcacctaaccattcacgac 31561098  T
Q  145 gcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaagtagttgcatg 244  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||  || | |||||| |||||||       
T  31561097 gcacagctattttttccaattgtccaacttgatctacattatcaagaatcagaagggccctttcatgacatagatttattcgcatcaaattagttgcgct 31560998  T
Q  245 gtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccataaattttggtt 344  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||  | ||| |||||||||| ||    
T  31560997 gtaatgattgcatatttgattgtgttctatgccgacagtttgaagtaggatttgcttttgtgcatcgaggggaccatcacctgatctataaattttgctt 31560898  T
Q  345 acatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccattccac 438  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31560897 acatcatcaataaaacaggatgcactaaatcgatgagatatttggccatacaaagtcatagcaagggctgtcttccctattcctcccattccac 31560804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 45 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 33642990 - 33642597
Alignment:
Q  45 agtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcacgat 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||     
T  33642990 agtggaactttgtaaactacatccactccatacactttcaatatatgctcatctctagaaatgataataactatactacctgcacctaaccattcacgac 33642891  T
Q  145 gcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaagtagttgcatg 244  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   | ||| ||| |||| | | | ||||||||  ||||||       
T  33642890 gcacacctattttttcaaattgttcaacttgatcaacattatcaagaatcagaagggccttctcacgacgtagcctacgtcgtatcaaatcagttgccat 33642791  T
Q  245 gtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccataaattttggtt 344  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  33642790 gttacgattgcatatttgatggtgttctatgccaagagtttgaaataggatttgcttttgtgcttcgagtggaccatcatgtaatctataaattttgctt 33642691  T
Q  345 acatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccattccac 438  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33642690 acatcatcaataaaacatgatgcactaaatcgatgagatatttggtcatataaagccgtagcaagggttgtcttccctattcctcccattccac 33642597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 34 - 438
Target Start/End: Original strand, 33273473 - 33273877
Alignment:
Q  34 tccaatccaatagtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaa 133  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33273473 tccaattcaaaagtggaactttgtaaactgcatccactccatagtatttcaatatatgctcatctctagaaatgattataattctactacctgcacctaa 33273572  T
Q  134 ccattcacgatgcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaa 233  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  33273573 ccattcacgatgcacacctattttttccaactgtgcaacttgatccacattatcaagaatcagaaggaccctttcacgacatagcctacttcgtatcaaa 33273672  T
Q  234 gtagttgcatggtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccat 333  Q
     ||||| |   |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||    
T  33273673 ttagttacgctgtaatgattgcatatttgatggtgttctatgccgagagtttgaagtaggatttgcttttgtgcatcgaggggaccatcatgtaatttat 33273772  T
Q  334 aaattttggttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccat 433  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33273773 aaattttgcttacatcatctataaaacaggatgcactaaatcgatgagatatttgatcatataaagccatagcaagggttgtcttccctattcctcccat 33273872  T
Q  434 tccac 438  Q
    |||||    
T  33273873 tccac 33273877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 438
Target Start/End: Original strand, 33287205 - 33287627
Alignment:
Q  16 ataacatgtgagcttcattccaatccaatagtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33287205 ataacatgtgagcttcattccaatccaagagtggaactttgtagactacatccactccatactcttccaatatatgctcatctctagaaatgataataat 33287304  T
Q  116 tctactacctggacctaaccattcacgatgcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacat 215  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||||| ||| |    
T  33287305 tctactacctacgcctaaacattcacgatgcacacctattttttccaattgttcaactcgatctacattatcaagaataagaagggccctttcacgacgt 33287404  T
Q  216 agcttcctttgtatcaaagtagttgcatggtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtg 315  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| || || | |||||| ||||  ||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |    
T  33287405 agcctactttgtatcaaattagttgcacggtgacgattgcatatatgatggtcttctattccgacggtttgaagtaggatttccttttgtgcatcgaggg 33287504  T
Q  316 gatcatcatgtaatccataaattttggttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgt 415  Q
    || |||||||||||| | |  ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||    
T  33287505 gaccatcatgtaatctaaattttttggcaacatcttcaataaaacaagatccactaaatcgatgggatatttgatcatataaagccatagaaagggttgt 33287604  T
Q  416 tttccctattcctcccattccac 438  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33287605 tttccctattcctcccattccac 33287627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 45 - 438
Target Start/End: Original strand, 33389764 - 33390157
Alignment:
Q  45 agtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcacgat 144  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33389764 agtggaactttgtaaactacgtccactccatactctttcaatatatgctcatctctagaaatgataattattctactacctgcacctaaccactcacgat 33389863  T
Q  145 gcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaagtagttgcatg 244  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||| |||| | | | ||||||||  |||||||      
T  33389864 gcacagctattttttccgattgttcaccttgatccacattatcaagaatcactagggtcttttcacgacttagcctacgtcgtatcaaatcagttgcaat 33389963  T
Q  245 gtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccataaattttggtt 344  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |  ||| |||||  ||||| ||| |||||| ||    
T  33389964 gtaacgattgcatatttgatggtgttttatgtcgagagtttgaaatagaatttgcttttgtgcatccaaaggaccatcacataatctatatattttgctt 33390063  T
Q  345 acatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccattccac 438  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33390064 acatcatcaataaaacaatttgcactaaatcgatgagatatttggtcatataaagtcatggcaagggttgtcttccctattcctcccattccac 33390157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 438
Target Start/End: Original strand, 33402311 - 33402699
Alignment:
Q  50 aactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcacgatgcacc 149  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||     
T  33402311 aactttgtaaactacgtccacttcatactctttcaatatatgttcatctctagaaatgataataattctactacccgcacctaaacattcacgatgcaca 33402410  T
Q  150 gctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaagtagttgcatggtaac 249  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |   ||||| ||| |||| | | ||||||||||  | |||||  |||||    
T  33402411 cctattttttccaattgttcaacttgatccacattatcaaaaatcagaagagccttttcacgacgtagcctacgttgtatcaaatcaattgcactgtaac 33402510  T
Q  250 gattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccataaattttggttacatc 349  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| | |||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  33402511 gattgcatatttgatggtgttctatgccgagagtttgatgtaggatttgcttttgtgcatcaattgggccatcatataatctataaattttgcttacatc 33402610  T
Q  350 gtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccattccac 438  Q
     ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33402611 atcaatgaaacaggatgcactaaatcgatgagagatttggccatataaattcatagcaagggttgtcttccctattcctcccattccac 33402699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 45 - 437
Target Start/End: Original strand, 33306178 - 33306570
Alignment:
Q  45 agtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcacgat 144  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33306178 agtggaactttgtaaaatacatccactccatactccttcaatatatgctcatctctagaaatgacaacgattctactacctgcacctaaccattcgcgat 33306277  T
Q  145 gcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaagtagttgcatg 244  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||    ||||| ||| |||| | | | ||||||||  |||||| |     
T  33306278 gcactgcaattttttccaattgttcaacttcattgacattatcaagaatcagaaggaccttttcacgacgtagcctacgtcgtatcaaatcagttgcgtt 33306377  T
Q  245 gtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccataaattttggtt 344  Q
    ||||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  33306378 gtaacgattgcttattagatggtgttctatgcctagagtttgaaataggatttgcttttgtgcattgagtggaccatcatgtaaactataaattttggtt 33306477  T
Q  345 acatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccattcca 437  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33306478 acatcatcaatatagcaggatgcactaaatcgatgagatatttggtcatataaagccatagcaagggttgtcttccctattcctcccattcca 33306570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 438
Target Start/End: Original strand, 9168463 - 9168859
Alignment:
Q  45 agtgaaactttgtaaactacatcca---ctccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcac 141  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  9168463 agtggaactttgtaaactacatccagtactccatactctttcaatatatgctcatctcaagatacgataataattctactacccacacctaaccattcac 9168562  T
Q  142 gatgcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaagtagttgc 241  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||  | | |  ||||||| | || ||    
T  9168563 gatgcacatctattttttccaattgttcaacttgatcaacattatcaagaatcaggagggccctttcacgacatagtatacgtcatatcaaatttgtggc 9168662  T
Q  242 atggtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccataaattttg 341  Q
    |  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||||||     
T  9168663 actgtagcgattgcatatttgatggtgttctatgccgagagtttgaagtaagatttgcttttgtgcatcgagtgggccatcatgcaatctataaatttta 9168762  T
Q  342 gttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccattccac 438  Q
     ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9168763 cttatatcatcaataaaacaggatgcactaaatcgatgagatatttggtcatataaaaccattgcaagagttgtcttccctattcctcccattccac 9168859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 51 - 433
Target Start/End: Original strand, 33264347 - 33264729
Alignment:
Q  51 actttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcacgatgcaccg 150  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  33264347 actttgtaaactacatccactttatattctttcaatatatgttcatctcttgaaatgataacgattctactacctgcacctaaccattcacgatgcacac 33264446  T
Q  151 ctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaagtagttgcatggtaacg 250  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||| ||| |||| |  ||  |||||||  |||||||   ||| |    
T  33264447 ctattctttccaattgttcaacttgatccacattatcaagaattagaagggtcttttcacgacttagcctatttcttatcaaatcagttgcactataatg 33264546  T
Q  251 attgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccataaattttggttacatcg 350  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||     
T  33264547 attgcatatttgatggtgttctatgccaagagtttgatgtaggatttgcttttgtgcatctattggaccatcatgtaatctaaaaattttgcttacatca 33264646  T
Q  351 tcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccat 433  Q
    ||||| ||||| ||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33264647 tcaatgaaacaggatgcatcaaatcgatgacagatttggccatataaattcatagcaagggttgtcttccctattcctcccat 33264729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 190 - 438
Target Start/End: Original strand, 33359916 - 33360164
Alignment:
Q  190 gaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaagtagttgcatggtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaa 289  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||    
T  33359916 gaatcaaaagggctctttcatgacatagcctcctttgtatcaaagtagttgcatggtaacaatcgcatattttattgtgttctatgctgagagtttgaaa 33360015  T
Q  290 taggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccataaattttggttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttgg 389  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33360016 taggattttcttttgtgcatcgagtggattatcatgtagtctgtaaattttagttacatcatcaataaaaaaagatgcactaaattggtgagagatttgg 33360115  T
Q  390 ccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccattccac 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33360116 ccatataaagtcgtagcaagggttgttttcccaattcctccaattccac 33360164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31567432 - 31567123
Alignment:
Q  129 cctaaccattcacgatgcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgta 228  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||| | ||| |||    
T  31567432 cctaaccattcacgacgcacaactattttttccatttgttcaacttgatctacattttcaagaatcagaagggccctttcacgacatagccttcttcgta 31567333  T
Q  229 tcaaagtagttgcatggtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaa 328  Q
    ||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| | |    
T  31567332 tcaaattagtggcgctgtaatgattgcatatttgttggtgatctatgccaacagtttgaagtaggatttgcttttgtgcatcgaggggaccatcatatga 31567233  T
Q  329 tccataaattttggttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcct 428  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||     
T  31567232 tctataaattttgcttacatcatcaatataacaagatgcactaaatcgatgagatatttggccatataaagtctcagcaagggctgtcttccctattccc 31567133  T
Q  429 cccattccac 438  Q
    ||||||||||    
T  31567132 cccattccac 31567123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 34 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 17439227 - 17438828
Alignment:
Q  34 tccaatccaatagtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaa 133  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17439227 tccaattcaaaagtggaactttgtaaactacatccactccatactttttcaatatatgctcatctctagaaatgataatgattctactacctgcacctaa 17439128  T
Q  134 ccattcacgatgcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaa 233  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||  |     ||||||||    
T  17439127 ccattcaagatgcacatctattttttccaattgttcaacttgatccacattatcaagaatcagaagtgccctttcatgacatagtctatgccgtatcaaa 17439028  T
Q  234 gtagttgcatggtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccat 333  Q
       ||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | || |||||| |||||||||||| ||    
T  17439027 tatgttgcactgtaacgattgcatatttgatggtgttctatgccaagagtttgaaatatgatttgcttttgtgcttcaagtggaccatcatgtaatctat 17438928  T
Q  334 aaattttggttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccat 433  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17438927 aaattttgcttacatcatcaatgaaacaagatgcatcaaatcgatgagagatttggccatataaatccaaagcaagggttgtcttccctattcctcccat 17438828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0428 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0428
Description:

Target: scaffold0428; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 34 - 433
Target Start/End: Original strand, 8441 - 8840
Alignment:
Q  34 tccaatccaatagtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaa 133  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  8441 tccaatccaacagtggaactttgtaaactacatccactttatattctttcaatatatgttcatctcttgaaatgataacgattctactacctgcacctaa 8540  T
Q  134 ccattcacgatgcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaa 233  Q
    |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||| ||| |||| |   |  |||||||    
T  8541 ccattcacgatgcacacctattctttccaattgttcaacttgatccacattatcaagaattagaagggtcttttcacgacttagcctatgtcttatcaaa 8640  T
Q  234 gtagttgcatggtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccat 333  Q
      |||||||   ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||||||| |     
T  8641 tcagttgcactataatgattgcatatttgatggtgttctatgccaagagtttgatgtaggatttgcttttgtgcatcaattggaccatcatgtaatctaa 8740  T
Q  334 aaattttggttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccat 433  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8741 aaattttgcttacatcatcaatgaaacaggatgcatcaaatcgatgacagatttggccatataaattcatagcaagggttgtcttccctattcctcccat 8840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31497326 - 31496922
Alignment:
Q  34 tccaatccaatagtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaa 133  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||   | ||||    
T  31497326 tccaatccaaaagaggaactttgtaaacctcatccactccatactctttcagtatatgctcgtctctagaaatgataatgattttactacccacatctaa 31497227  T
Q  134 ccattcacgatgcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaa 233  Q
    ||| |||||| | ||  ||||||| || |||||||||||||  || |||||||||| ||||| |||| | |||| |  ||||||| | | | |||||||     
T  31497226 ccaatcacgacgaacaactattttttctaattgttcaactttatcaacattatcaaaaatcaaaaggatactttgacaacatagcctgcgtcgtatcaag 31497127  T
Q  234 gtagttgcatggtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccat 333  Q
     ||| |||   || | |||||||||| || || ||||||     ||||||||||  ||| ||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||| |     
T  31497126 ttagatgcgatgtgaagattgcatatatgatggtgttcttcattgagagtttgatgtagaatttgcttttgaacattgagtggtccatcatgtaatctaa 31497027  T
Q  334 aaattttggttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccat 433  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||  |||||||| ||| ||||   |||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31497026 aaattttgcttacatcatcaataaaacatcatgcatcaaattgattagagattttagcatacaaagcagtagcaagggtagtcttccctattcctcccat 31496927  T
Q  434 tccac 438  Q
     ||||    
T  31496926 cccac 31496922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 201
Target Start/End: Original strand, 31150031 - 31150187
Alignment:
Q  45 agtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcacgat 144  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||    
T  31150031 agtggaactttgtaaacaacatccactccatactctttcaagatatgctcgtctctagaaattataatgattctactccccgcacctaaccattcacgat 31150130  T
Q  145 gcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataaggg 201  Q
     ||| |||| |||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  31150131 tcacggctaatttctcgagttgttcaacttgatcaacattgtcaagaattataaggg 31150187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 189
Target Start/End: Original strand, 31158932 - 31159076
Alignment:
Q  45 agtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcacgat 144  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  31158932 agtggaactttgtaaactacatcaactccatactctttcaagatatgttcatctctagaaattataacgattctactccctgcacctaagcattcacgat 31159031  T
Q  145 gcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaa 189  Q
     ||| |||| ||| || | |||||||||||  || ||||||||||    
T  31159032 tcacagctaatttatcaagttgttcaactttatcaacattatcaa 31159076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 31477373 - 31477025
Alignment:
Q  34 tccaatccaatagtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaa 133  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||   |||||     
T  31477373 tccaatccaagagaggaactttgtaaacttcatctactccataattcttcaatatatgctcatctctagaaattataatgattttacttccctcacctag 31477274  T
Q  134 ccattcacgatgcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaa 233  Q
    ||||||||||   ||  ||||||| |||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||   |||| | |||||||  | | |   |||||     
T  31477273 ccattcacgacaaacacctattttttccagttgttcaactttatcaacattatcaaaaatcataaggaccctttgacgacatagtctacgtctaatcaag 31477174  T
Q  234 gtagttgcatggtaacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccat 333  Q
     ||| ||||  | || |||||||||| || |  || | |   ||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||| |     
T  31477173 ttagatgcagtggaaagattgcatatctgattgtgattttcaccgagagtttgatgtagaatttgcttttgaacatcgagtggcccatcatgtaatctaa 31477074  T
Q  334 aaattttggttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgaga 382  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  31477073 acattttgcttacatcatcaataaaacagcatgcaccaaattgatgaga 31477025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31502482 - 31502091
Alignment:
Q  50 aactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcac----gatg 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||     |      
T  31502482 aactttgtaaacttcatccactccaaaaaatttcaatatatgctcatctctagaaattataatgattttactacc-ccacctaaccattcaccacacaca 31502384  T
Q  146 caccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaatcataagggttctttcatgacatagcttcctttgtatcaaagtagttgcatgg 245  Q
    |||  ||||||| |||| |||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||   |||| | |||||||| | | | | |||||  ||| ||||       
T  31502383 cacacctattttttccagttgttcaactttatcaacattatcaaaaatcaaaaggaccctttgacgacatagcctgcgtcgaatcaagttagatgcagta 31502284  T
Q  246 taacgattgcatatttgttgatgttctatgccgagagtttgaaataggatttgtttttgtacatcgagtggatcatcatgtaatccataaattttggtta 345  Q
     || ||||||||||||| |  ||||||   ||| | |||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||  |||||||||||| | | |||||| |||    
T  31502283 gaaagattgcatatttgattgtgttcttcaccgtgtgtttgatatagtatttgcttttgaacaccaagtggtccatcatgtaatctaaacattttgctta 31502184  T
Q  346 catcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccattccac 438  Q
    |||| || ||||||||| |||||| |||||||||||| |||    |||||| |  | || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  31502183 catcatcgataaaacaacatgcaccaaattgatgagaaattctatcatatagaaccctaccaagggttgtcttccctattccacccatcccac 31502091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31490074 - 31489964
Alignment:
Q  34 tccaatccaatagtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaa 133  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  31490074 tccaattcaagagtggaactctgtaaactacatcaactccatactctttcaagatatgttcatctccagaaattataatgattctactccctgcacctaa 31489975  T
Q  134 ccattcacgat 144  Q
    |||||||||||    
T  31489974 ccattcacgat 31489964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 31019483 - 31019582
Alignment:
Q  45 agtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcacgat 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  31019483 agtggaactttgtaaacttcatcaactccatactcattcaagatatgctcatctctagaaattataatgattctactccctacacctaaacattcacgat 31019582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 31029364 - 31029463
Alignment:
Q  45 agtgaaactttgtaaactacatccactccatacgctttcaatacatgctcatctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcacgat 144  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  31029364 agtggaactttgtaaacttcatcaactccatactcattcaagatatgctcatctctagaaattataatgattctactccctgcacctaaatattcacgat 31029463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 438
Target Start/End: Original strand, 31019771 - 31019873
Alignment:
Q  336 attttggttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccattc 435  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  31019771 attttgcttagatcatcaataaaacaacgtgcatcaaattgatgagagatttgaccatataaagcagtagccagagttgtcttccctattccacccatcc 31019870  T
Q  436 cac 438  Q
    |||    
T  31019871 cac 31019873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31489775 - 31489673
Alignment:
Q  336 attttggttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccattc 435  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  31489775 attttgcttagatcatcaataaaacaacgtgcatcaaattgatgagagatttgaccatataaagcagtagccagagttgtcttccctattccacccatcc 31489676  T
Q  436 cac 438  Q
    |||    
T  31489675 cac 31489673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 438
Target Start/End: Original strand, 31029652 - 31029754
Alignment:
Q  336 attttggttacatcgtcaataaaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccattc 435  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||  || ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  31029652 attttgcttagatcatcaataaaacaacgtgcatcaaattgatgagagatttgaccatataaagcagtagtcagagttgtcttccctattccacccatcc 31029751  T
Q  436 cac 438  Q
    |||    
T  31029752 cac 31029754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 192
Target Start/End: Original strand, 31033713 - 31033811
Alignment:
Q  94 catctctagaaatgataataattctactacctggacctaaccattcacgatgcaccgctattttctccaattgttcaacttggtccacattatcaagaa 192  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| || | |||||| ||||||| |  ||| |||| |||||||   ||||||||||| || |||||||||||||    
T  31033713 catctctagaagttataacaattctactcccagcacctaaacattcactactcacagctaatttctcctgctgttcaacttgatcaacattatcaagaa 31033811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1749 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1749
Description:

Target: scaffold1749; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 433
Target Start/End: Original strand, 3 - 79
Alignment:
Q  357 aaacaagatgcactaaattgatgagatatttggccatataaagtcgtagcaagggttgttttccctattcctcccat 433  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3 aaacaggatgcatcaaatcgatgacagatttggccatataaattcatagcaagggttgtcttccctattcctcccat 79  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University