View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19687_high_4 (Length: 663)

Name: NF19687_high_4
Description: NF19687
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19687_high_4
NF19687_high_4
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (19-652)||(1756330-1756963)
chr5 (401-602)||(1754672-1754873)
chr5 (448-564)||(1754243-1754359)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (349-635)||(27478786-27479072)
chr4 (19-283)||(27522047-27522311)
chr4 (321-640)||(27527107-27527429)
chr4 (349-600)||(27475482-27475733)
chr4 (395-602)||(27425796-27426003)
chr4 (349-600)||(27468230-27468481)
chr4 (375-634)||(27506650-27506909)
chr4 (440-635)||(27485937-27486132)
chr4 (395-608)||(27415602-27415812)
chr4 (349-600)||(27514877-27515128)
chr4 (401-638)||(27497277-27497514)
chr4 (395-602)||(27412654-27412855)
chr4 (395-602)||(27420392-27420599)
chr4 (395-608)||(27569998-27570211)
chr4 (398-602)||(27563298-27563502)
chr4 (398-602)||(27565903-27566107)
chr4 (389-600)||(27503908-27504119)
chr4 (348-600)||(27524510-27524761)
chr4 (389-600)||(27508838-27509049)
chr4 (407-602)||(27585672-27585867)
chr4 (396-602)||(27423206-27423412)
chr4 (429-619)||(27489927-27490117)
chr4 (446-602)||(27486967-27487123)
chr4 (446-602)||(27513776-27513932)
chr4 (437-607)||(17970278-17970448)
chr4 (446-608)||(27526112-27526274)
chr4 (447-602)||(27498399-27498554)
chr4 (446-608)||(27444794-27444956)
chr4 (437-602)||(27411447-27411612)
chr4 (437-608)||(27557467-27557638)
chr4 (448-602)||(27501301-27501455)
chr4 (436-602)||(27567239-27567405)
chr4 (437-602)||(27424505-27424670)
chr4 (446-607)||(27431148-27431309)
chr4 (446-602)||(27469444-27469600)
chr4 (446-602)||(27479885-27480041)
chr4 (174-283)||(27509440-27509548)
chr4 (446-602)||(27505702-27505858)
chr4 (448-608)||(27502809-27502969)
chr4 (448-608)||(27554287-27554447)
chr4 (447-602)||(27571607-27571762)
chr4 (437-602)||(27414295-27414460)
chr4 (446-602)||(27476671-27476827)
chr4 (446-602)||(27523403-27523559)
chr4 (447-602)||(27419072-27419227)
chr4 (446-605)||(27500338-27500497)
chr4 (436-602)||(27556369-27556535)
chr4 (175-283)||(27504460-27504567)
chr4 (446-548)||(27495574-27495676)
chr4 (36-110)||(27525119-27525192)
chr4 (482-602)||(27421971-27422091)
chr4 (446-557)||(27460507-27460618)
chr4 (447-557)||(27473921-27474031)
chr4 (436-602)||(27559230-27559396)
chr4 (176-283)||(27515454-27515558)
chr4 (446-557)||(27516609-27516720)
chr4 (438-500)||(27577404-27577466)
chr4 (437-602)||(27446131-27446296)
chr4 (74-158)||(27527595-27527679)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (439-607)||(38024868-38025036)
chr3 (439-607)||(38031320-38031488)
chr3 (437-591)||(55084781-55084935)
chr3 (440-607)||(38043882-38044049)
chr3 (393-607)||(50909939-50910153)
chr3 (440-607)||(50911863-50912030)
chr3 (394-607)||(38028714-38028927)
chr3 (394-607)||(38040029-38040242)
chr3 (446-607)||(50904792-50904953)
chr3 (394-607)||(38033723-38033940)
chr3 (371-607)||(38036718-38036954)
chr3 (437-610)||(48840703-48840875)
chr3 (532-602)||(50913480-50913550)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (438-607)||(21607288-21607457)
chr8 (394-607)||(21604702-21604915)
chr8 (437-524)||(21634605-21634692)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (437-607)||(3073548-3073718)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (532-599)||(21477460-21477526)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 614; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 614; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 652
Target Start/End: Original strand, 1756330 - 1756963
Alignment:
Q  19 aaactgagttagaaagatctgaaaaaattgaagtataggaactgatttcttcttgggagataagatattagttgagataatcatgttcaacttttcattt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756330 aaactgagttagaaagatctgaaaaaattgaagtataggagctgatttcttcttgggagataagatattagttgagataatcatgttcaacttttcattt 1756429  T
Q  119 ttgaggatatgtgaaaattataaccaaaagagctcttaattaacatataatcacagcaaaggcaatttctgaagacataggccgagccttatcaatttgg 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756430 ttgaggatatgtgaaaaatataaccaaaagagctcttaattaacatataatcacagcaaaggcaatttctgaagacataggccgagccttatcaatttgg 1756529  T
Q  219 ctaaatcgtcaatagttattgattccgttcaagcactttagttagcttacctggaattagcaaaaataattatgctagtattccgagagacacaaatata 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756530 ctaaatcgtcaatagttattgattccgttcaagcattttagttagcttacctggaattagcaaaaataattatgctagtattccgagagacacaaatata 1756629  T
Q  319 tttttacaagttaaaaagatatgtattataaaaaatgtctaaactaatctggtctatgtcagtatgctacagtaaaagattcatagcccattcaagcaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756630 tttttacaagttaaaaagatatgtattataaaaaatgtctaaactaatctggtctatgtcagtatgctacagtaaaagattcatagcccattcaagcaag 1756729  T
Q  419 aggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1756730 aggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtattg 1756829  T
Q  519 aaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacatctgatgatttt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756830 aaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacatctgatgatttt 1756929  T
Q  619 gaagctgcttggctagcagtagcacttgatgatg 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1756930 gaagctgcttggctagcagtagcacttaatgatg 1756963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 401 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 1754873 - 1754672
Alignment:
Q  401 atagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagc 500  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||    
T  1754873 atagcccatttaagctagaagttatattttcgaagacatcttctgtgcaaagaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttccgcagc 1754774  T
Q  501 ttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagcccttt 600  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  1754773 ttgactcaacaaggattgaaacgatggttgattcaagtatgatattgggatcacatgccgtttctgtttctctccaatatacactgcaacatagcccttt 1754674  T
Q  601 gg 602  Q
    ||    
T  1754673 gg 1754672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 564
Target Start/End: Original strand, 1754243 - 1754359
Alignment:
Q  448 caaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattg 547  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||| | ||| |||| ||   | | ||| | |||||| || | |||||||||||||||||  |    
T  1754243 caaggaatagtgagaccacccatcggatgatcatattcaaactgttcctcagatttgtttagcaatttttgaaatgacgattggttcaagtatgatacgg 1754342  T
Q  548 ggatcacaaaccgcttc 564  Q
    |||||||||||||||||    
T  1754343 ggatcacaaaccgcttc 1754359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 349 - 635
Target Start/End: Original strand, 27478786 - 27479072
Alignment:
Q  349 aaaaatgtctaaactaatctggtctatgtcagtatgctacagtaaaagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgc 448  Q
    |||||||||| | ||||||| |  ||| |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| ||    
T  27478786 aaaaatgtctcagctaatctagcgtatatcagtatgttacagtgtaagaatcatagcccattcaagcaagaagttatatgttggaacacatcttcggagc 27478885  T
Q  449 aaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27478886 aaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaattcttcttccgcttgatgtagcaattcttgaaacaatggttggttcaagtatgatattgg 27478985  T
Q  549 gatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacatctgatgattttgaagctgcttggctagc 635  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||  |||||||||||||||    
T  27478986 gacaacaaaccgcttctgtttctctccaacatacactgcaacatagccctttggaacttctgctgattttagagctgcttggctagc 27479072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27522311 - 27522047
Alignment:
Q  19 aaactgagttagaaagatctgaaaaaattg-aagtataggaactgatttcttcttgggagataagatattagttgagataatcatgttcaacttttcatt 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27522311 aaactgagttagagagatctgaaaaaattggaagtatagaagcttatttcttcttgggagataagatattagttaaggtaatcatgttcaacttttcatt 27522212  T
Q  118 tttgaggatatgtgaaaattataaccaaaagagctcttaattaacatataatcacagcaaaggcaatttctgaagacataggccgagccttatcaatttg 217  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| || |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27522211 tttgagtatatgtgaaaaatttaaccaaaacagctcttaatgaatatataatcactgctaatgcaatttctgaaaacataggccgagccttatcaatttg 27522112  T
Q  218 gctaaatcgtcaatagttattgattccgttcaagcactttagttagcttacctggaattagcaaaa 283  Q
    |||| ||| |||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27522111 gctagatcatcaatagttattgaattcgtgcgagcattttagttagc-tacctcgaatttgcaaaa 27522047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 321 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27527429 - 27527107
Alignment:
Q  321 tttacaagttaaaaagatatgtattataaaaaatgtctaaactaatctggtctatgtcagtatgctacagtaaaagattcatagcccattcaa------- 413  Q
    |||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||             
T  27527429 tttataagtcaaaaagatacctattataaaaaatgtctcaactaatctagtctatgtcagtatcctagagtataagattcatagaccattcttcctggct 27527330  T
Q  414 gcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaag 513  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||     |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  27527329 gcaagaagttatatgttggaagacatcttcactgcaaggaattgggat----cccatgggatgatcatatccaaactcttcctcagcttgactcagcaac 27527234  T
Q  514 tgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacatctgatg 613  Q
    | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27527233 tctagaaacgatggttggtttaagtgtgatattgggatcacaaaccgtttctgtttatctccaacatacaccgcaagatagccctttggtacttctgatg 27527134  T
Q  614 attttgaagctgcttggctagcagtag 640  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||    
T  27527133 attttggagatgcttggttagcagtag 27527107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 349 - 600
Target Start/End: Original strand, 27475482 - 27475733
Alignment:
Q  349 aaaaatgtctaaactaatctggtctatgtcagtatgctacagtaaaagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgc 448  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  27475482 aaaaatgtctcaactaatctagtgtatgtcagtatgttacaatataagattcatagcccattcaagcaagaagttatatgttggaagacatcttcggagc 27475581  T
Q  449 aaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||  ||    
T  27475582 aaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaactcttcctcggcttgactcaacaagtcttgaaatgaaggttgattcaagtatgatacagg 27475681  T
Q  549 gatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagcccttt 600  Q
     |  |||||||||  |  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  27475682 aactacaaaccgcgccaatttctctccaacatacacggcaacatagcccttt 27475733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 395 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27426003 - 27425796
Alignment:
Q  395 agattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttc 494  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27426003 agattcataggccattcaagcgagatgtcatatgttgaaatacatcctcggtgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaactcttc 27425904  T
Q  495 ttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatag 594  Q
     |||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  27425903 ctcaaattgactcaataagtcttgaaatgatggttggttcaagtatgatattgggatcacataccgcttttgtttctctccaacatatactgcaagatat 27425804  T
Q  595 ccctttgg 602  Q
    ||||||||    
T  27425803 ccctttgg 27425796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 349 - 600
Target Start/End: Original strand, 27468230 - 27468481
Alignment:
Q  349 aaaaatgtctaaactaatctggtctatgtcagtatgctacagtaaaagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgc 448  Q
    |||| ||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||||| ||||    
T  27468230 aaaattgtctcaattaatctagtctatgtgagtatgctacagtgtaagattcatagtccattcaaggaagaaattatatgttggaagacatcttccgtgc 27468329  T
Q  449 aaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||  ||    
T  27468330 aaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaattcttcctcggattgactcaacaagtcttgaaatgaaggttggtttaagtatgatacagg 27468429  T
Q  549 gatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagcccttt 600  Q
    ||  |||||||||  | ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  27468430 gactacaaaccgcaccagtttctctccaacatacaccgcaacatagcccttt 27468481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 375 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 27506909 - 27506650
Alignment:
Q  375 tgtcagtatgctacagtaaaagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatgggg 474  Q
    ||||||||||||| |||   ||||| || || ||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27506909 tgtcagtatgctaaagtgtcagatttatggctcattcaagcaagaagttatgtgttgaaagacatcttcagtgcaaggaatggtgagtccacccatggga 27506810  T
Q  475 tgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctc 574  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27506809 tgatcatatccaaattcttcttccgcttgatgtagcaattcttgaaacaatggttggtttaagtatgatattgggatcacaaaccgcgtctgtttctctc 27506710  T
Q  575 caacattcactgcaagatagccctttggtacatctgatgattttgaagctgcttggctag 634  Q
    | ||||  ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27506709 cgacatatactgcaacatagccctttggaactcctgctgattttgatgctgcttggctag 27506650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 440 - 635
Target Start/End: Original strand, 27485937 - 27486132
Alignment:
Q  440 cttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagta 539  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  27485937 cttcagtgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaattcttcttccgcttgatgtagcaattcttgaaacaatggttggttcaagta 27486036  T
Q  540 tgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacatctgatgattttgaagctgcttggctagc 635  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||  |||||||||||||||    
T  27486037 tgatattgggacaacaaaccgcttctgtttctctccaacatacactgcaacatagccctttggaacttctgctgattttagagctgcttggctagc 27486132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 395 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 27415812 - 27415602
Alignment:
Q  395 agattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttc 494  Q
    |||||||||  || ||||||| ||| || || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  27415812 agattcatattccgttcaagcgagatgttatgtgttgaaagacatcttctgtgcaaggaatggtgaggccacccatggaatgatcatatccaaactcttc 27415713  T
Q  495 ttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatag 594  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||   |||||||| ||||||||||||     
T  27415712 ctcagcttgactcaacaagtcttgaaacgatggttggttcaagtatgatatggggatcacaaatcgcttttgttt---tccaacatacactgcaagatat 27415616  T
Q  595 ccctttggtacatc 608  Q
    |||||||| |||||    
T  27415615 ccctttggcacatc 27415602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 349 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 27515128 - 27514877
Alignment:
Q  349 aaaaatgtctaaactaatctggtctatgtcagtatgctacagtaaaagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgc 448  Q
    |||| ||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||| |||||| ||||||| || |    
T  27515128 aaaattgtctcaattaatctagtctatgtgagtatgctacagtgtaagattcatagtccattcaaggaagaaattatatgctggaagacatcttctgtac 27515029  T
Q  449 aaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgg 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||  ||    
T  27515028 aaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaattcttcctcggattgactcaacaagtcttgaaatgaaggttgattcaagtatgatacagg 27514929  T
Q  549 gatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagcccttt 600  Q
    ||  |||||||||  | ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  27514928 gactacaaaccgcaccagtttctctccaacatacaccgcaacatagcccttt 27514877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 401 - 638
Target Start/End: Original strand, 27497277 - 27497514
Alignment:
Q  401 atagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagc 500  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  27497277 atagcccattcaagcgagaagttatgcgttggaagacattttcagtgcaaggaatggtgaggccacctgtgggatgatcatatccaaactcttcctcagc 27497376  T
Q  501 ttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagcccttt 600  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27497377 ttgactcaacaaatattgaaacaatggttggtttaagtatgagatagggatcacaaaccgcttttgtttatctccaacatacactgcaacatagcccttt 27497476  T
Q  601 ggtacatctgatgattttgaagctgcttggctagcagt 638  Q
    || || |||   |||||||| | |||||| ||||||||    
T  27497477 ggaacttctacagattttgatgatgcttgtctagcagt 27497514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 395 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27412855 - 27412654
Alignment:
Q  395 agattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttc 494  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  27412855 agattcatagcccattcgagcgagatgttatatgttgaaagacatcttccgtgcaaggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttc 27412756  T
Q  495 ttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatag 594  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||| |||| |||     
T  27412755 ttcagcttgactcaataagtcttgaaataatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaacc------gtttctctccaacatacacggcaatatat 27412662  T
Q  595 ccctttgg 602  Q
    ||||||||    
T  27412661 ccctttgg 27412654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 395 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27420599 - 27420392
Alignment:
Q  395 agattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttc 494  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27420599 agattcatagcccattgaagcaagaagttatatgttgaaagacatcttccgtgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaactcttc 27420500  T
Q  495 ttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatag 594  Q
     ||| ||||||||| ||||  |||||| || |||||| ||||||||||||  ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  27420499 ctcaacttgactcagcaagccttgaaatgaaggttggctcaagtatgatacggggattaaataccgcgtctgtttctctccaacatatactgcaagatat 27420400  T
Q  595 ccctttgg 602  Q
    ||||||||    
T  27420399 ccctttgg 27420392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 395 - 608
Target Start/End: Original strand, 27569998 - 27570211
Alignment:
Q  395 agattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttc 494  Q
    ||||||||| ||| |||| || ||| || |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  27569998 agattcatatcccgttcatgcgagatgttatatgttgaaagatatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccgaactcttc 27570097  T
Q  495 ttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatag 594  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| | ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  27570098 ctcagcttgactcagcaagtcttgaaatgaaggttggcttaagtatgatacggggatcacataccgcgtctgtttctctccaacatatactgcaagatat 27570197  T
Q  595 ccctttggtacatc 608  Q
    |||||||| |||||    
T  27570198 ccctttggcacatc 27570211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 398 - 602
Target Start/End: Original strand, 27563298 - 27563502
Alignment:
Q  398 ttcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttc 497  Q
    |||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  27563298 ttcatagctcattcaagcgagaagttatatgttgaaaggcatcttcagtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttcttc 27563397  T
Q  498 agcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccc 597  Q
     |||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||  | ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  27563398 ggcttgactcagcaaatcttgaaacaatgtttggttcaagtatgatacggggatcacaattctcttttgtttatctccaacgtacactgcaagatagccc 27563497  T
Q  598 tttgg 602  Q
    |||||    
T  27563498 tttgg 27563502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 398 - 602
Target Start/End: Original strand, 27565903 - 27566107
Alignment:
Q  398 ttcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttc 497  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||    
T  27565903 ttcatagtccattcaagcaagaagttatatgttggaagacatcttcgccacaaggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccatgctcttcctc 27566002  T
Q  498 agcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccc 597  Q
    | ||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  27566003 aacttgtatcagcaagtcttgaaacaatggttggttcaggtatgatatggggatcacaaatcgcttttgtttctctccaacatacactgcaagatatccc 27566102  T
Q  598 tttgg 602  Q
    |||||    
T  27566103 tttgg 27566107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 389 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 27504119 - 27503908
Alignment:
Q  389 agtaaaagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaa 488  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27504119 agtataagattcatagtccattcaagcaagaagttatgtgttggaagacatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaa 27504020  T
Q  489 ttcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgca 588  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  || |  |||||||||  |  |||||||||||||| ||| | |    
T  27504019 ctcttcctcggcttgactcaacaagtcttgaaatgaaggttggttcaagtatgatacaggaactacaaaccgcgccaatttctctccaacatacacggaa 27503920  T
Q  589 agatagcccttt 600  Q
    | ||||||||||    
T  27503919 acatagcccttt 27503908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 348 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 27524761 - 27524510
Alignment:
Q  348 aaaaaatgtctaaactaatctggtctatgtcagtatgctacagtaaaagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtg 447  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| || |||  ||| ||||  | ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||    
T  27524761 aaaaaatgtctcaactaatctag-ctatttcagtatgttaaagtgtaaggttcaagggccattcaagcatgaagttatatgttggaagacatcttcggtg 27524663  T
Q  448 caaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattg 547  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||  |    
T  27524662 cacggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttcctcagcttgattcaacaagtcttgaaatgaaggttggttcaaatatgatacag 27524563  T
Q  548 ggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagcccttt 600  Q
    | |  |  |||||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  27524562 gaactatgaaccgcgtcagtttctctccaacatacactgcaacgtagcccttt 27524510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 389 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 27509049 - 27508838
Alignment:
Q  389 agtaaaagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaa 488  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  27509049 agtataagattcatagtccattgaagcaagaagttatatgttggaacacatcttcggagcatggaatggtgaggccacccgttggatgatcatatccaaa 27508950  T
Q  489 ttcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgca 588  Q
     ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |  || |  ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  27508949 ctcttcctcagcctgattcaacaagtcttgaaatgaaggttggttcaaatatgacacaggaacgacaaaacgcgtcagtttctctccaacatacactgca 27508850  T
Q  589 agatagcccttt 600  Q
    | ||||||||||    
T  27508849 acatagcccttt 27508838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 407 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27585867 - 27585672
Alignment:
Q  407 cattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgact 506  Q
    ||||||||| | | || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27585867 cattcaagcgataagttatatgtttgaaggcatcttctgtgcaaggaatggtgagacctcccattggatgatcatatccaaactcttcttcggcttgact 27585768  T
Q  507 caacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
    || ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| ||||| || |||||   |||||| ||||| ||||||||    
T  27585767 catcaaatcttgaaacaatggttggttcaagtatgatacggggatcacaaatctcttttgtttatcaccaacgcacactgcgagatatccctttgg 27585672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 396 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27423412 - 27423206
Alignment:
Q  396 gattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttct 495  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||     
T  27423412 gattcatagtccattcaagtgagaagttatatgttggaaaacatcttccgtgcaaggaacggtgaggccacccatgggatgattgtaaccaaactcttcc 27423313  T
Q  496 tcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagc 595  Q
    || |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||  ||||||||| ||||||||  || |||||||| |    
T  27423312 tcggcttgactcaacaattcttgaaatgaaggttggttcaagtatgatatgcggatcacatgccgtgtctgtttctatccaacatatacagcaagatatc 27423213  T
Q  596 cctttgg 602  Q
     ||||||    
T  27423212 tctttgg 27423206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 429 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 27490117 - 27489927
Alignment:
Q  429 ttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggt 528  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| | |||||| ||||||    
T  27490117 ttggaagtcatcttcgttgacaggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttcctcggcttgattcaacaaatcttgaaatgatggt 27490018  T
Q  529 tggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacatctgatgattttg 619  Q
    | ||| |||||||| |  ||||  |||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  27490017 ttgtttaagtatgacacagggactacaaaccgtttttgtttctctccaacatacactacaacatagccctttcttacttctgctgattttg 27489927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 446 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27487123 - 27486967
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||| || || |||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27487123 tgcaaggaatagtaagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagcttggttcaacaattcttgaaacgatggttggtttaagtatgataa 27487024  T
Q  546 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||    
T  27487023 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 27486967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 446 - 602
Target Start/End: Original strand, 27513776 - 27513932
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  27513776 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatgatcatattcatattgttcttcagcttggttcaacaattcttggaacgaggtttggttcaagtatgatat 27513875  T
Q  546 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||    
T  27513876 tgggatcacaaaccgcttcattttctctcctacatacactgctagatatccttttgg 27513932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 437 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 17970448 - 17970278
Alignment:
Q  437 catcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaa 536  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||  |||||| ||||| |||||| || | |||||||||    
T  17970448 catcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcgtatccgaattcttcctctgcccgactcagcaagtattgaaatgaagtttggttcaa 17970349  T
Q  537 gtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacat 607  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||  || ||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  17970348 gtatgacgtagggatcacaaaccgcttcatttcctctccaacgtacaccgcaagatatccctttggcacat 17970278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 446 - 608
Target Start/End: Original strand, 27526112 - 27526274
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| | ||| || || | |||||||||||||||||     
T  27526112 tgcaaggaatagtgagaccacccgttggatgatcatattcaaattgttcctcagcttggctcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 27526211  T
Q  546 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacatc 608  Q
     || |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27526212 aggaatcacaaaccgcttcattttctctccaacatacactgctagatatccctttggaacatc 27526274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 447 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27498554 - 27498399
Alignment:
Q  447 gcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatatt 546  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| ||| || |||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  27498554 gcaaggaatagtgagaccacccattggatgatcatattcgaattgttcctcggcttggttcaacaagtcttggaacgatggttggttcaagtatgatata 27498455  T
Q  547 gggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
    ||||||||||| || |||  || |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  27498454 gggatcacaaaacgtttcatttcctctccaacatatactgctagatatccctttgg 27498399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 446 - 608
Target Start/End: Original strand, 27444794 - 27444956
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||| || |||||| |||| || | |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  27444794 tgcaaggaattgtgagaccacccattggatggtcatatccgaattgttcctcggcttgattcaataattcttgaaatgatgattggctcaagtatgatat 27444893  T
Q  546 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacatc 608  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  27444894 tgggatcacaaacctcttcatttcctctccaacgtatactgcaagatatccctttggcacatc 27444956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 437 - 602
Target Start/End: Original strand, 27411447 - 27411612
Alignment:
Q  437 catcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaa 536  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |  || | |||||||||||||||||||||    
T  27411447 catcctcgctgcaaggaattgtgagaccacccataggatgatcatatccaaattcttcttctgcttgatttagtaattcttgaaacgatggttggttcaa 27411546  T
Q  537 gtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||  ||  | | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  27411547 gtatgatactggaatcacgaaccgtctcattctatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27411612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 437 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 27557638 - 27557467
Alignment:
Q  437 catcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaa 536  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||| ||    
T  27557638 catcttctctgcatggaatagtgagaccacccattggatgaacatattcaaattgttcctcagcttgattcagcaattcttgaaatgatggttggtttaa 27557539  T
Q  537 gtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacatc 608  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||  || |||||||||||  || |||||||| ||| |||| |||||    
T  27557538 gtatgacattgggatcacaaacctcttcatttcctctccaacatatacggcaagatatccccttggcacatc 27557467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 448 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27501455 - 27501301
Alignment:
Q  448 caaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattg 547  Q
    |||||||| ||||| |||||| | || ||||| ||| |||||| ||| || |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27501455 caaggaatagtgagaccacccgttggatgatcgtattcaaattgttcctcggcttggttcaacaagtcttgaaacaatggttggtttaagtatgatattg 27501356  T
Q  548 ggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
    ||||||||||||| |||  || |||||||||||  ||||| ||| | ||||||||    
T  27501355 ggatcacaaaccgtttcatttcctctccaacatatactgctagacatccctttgg 27501301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 436 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27567405 - 27567239
Alignment:
Q  436 gcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttca 535  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| | |||| | |  || | ||||||||||||||||||||    
T  27567405 gcatcttcgctgcaaggaattgtgagaccacccattggatgatcataaccaaattcttcttctgtttgatttagtaattcttgaaacgatggttggttca 27567306  T
Q  536 agtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||  ||  | | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  27567305 agtatgatactggaatcacgaaccgtctcattctatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27567239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 437 - 602
Target Start/End: Original strand, 27424505 - 27424670
Alignment:
Q  437 catcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaa 536  Q
    |||| ||| |||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||| | |||||| || |||||||||||    
T  27424505 catcctcgctgcacggaatggtaagaccacccattggatgatcatatccatattcttcttcagattgatttagcaattcttgaaatgaaggttggttcaa 27424604  T
Q  537 gtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||  ||  ||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  27424605 gtatgatactggaatcacaaaccgcctcatttgatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27424670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 446 - 607
Target Start/End: Original strand, 27431148 - 27431309
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||| ||||| |||||  | || || ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27431148 tgcaaggaattgtgagaccaccggttggatggtcatatccaaattgttcctcggcttgattcaacaattcttgaaatgacggttggttcaagtatgatat 27431247  T
Q  546 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacat 607  Q
    |||||||||||||| ||||  ||  || |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  27431248 tgggatcacaaacctcttcatttcatccccaacatatactgcaatatatccctttggcacat 27431309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 446 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27469600 - 27469444
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||| || || |||||||| || || |||||| |||||| |||||||||||| |||||||  | ||| || |||| ||| ||||| ||||||||    
T  27469600 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgttcatattcaaattgttcttcagcttggctcaacagttcttgtaatgatgtttgcttcaaatatgatat 27469501  T
Q  546 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||    
T  27469500 agggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccctttgg 27469444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 446 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27480041 - 27479885
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||     
T  27480041 tgcaaggaatggtgagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaacttttggaatgatgtttggttcaagtatgatac 27479942  T
Q  546 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
     || |||||||| ||||||  ||||||||| || |  ||||| |||||||| |||||    
T  27479941 aggaatcacaaaacgcttcattttctctcctacgtatactgctagatagccttttgg 27479885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27509548 - 27509440
Alignment:
Q  174 gcaaaggcaatttctgaagacataggccgagccttatcaatttggctaaatcgtcaatagttattgattccgttcaagcactttagttagcttacctgga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||  |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  27509548 gcaaaggcaatttctgaagacataggacaagccttgttaaactggctaaataatcaatagttattgatttagttcaagaattttagttagc-tacctgga 27509450  T
Q  274 attagcaaaa 283  Q
    ||||||||||    
T  27509449 attagcaaaa 27509440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 446 - 602
Target Start/End: Original strand, 27505702 - 27505858
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||| | ||| || || | |||||||||||||||||     
T  27505702 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 27505801  T
Q  546 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
     || |||||||||||||||  ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||    
T  27505802 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 27505858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 448 - 608
Target Start/End: Original strand, 27502809 - 27502969
Alignment:
Q  448 caaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattg 547  Q
    |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||| || | ||| ||||| ||||| ||||    
T  27502809 caaggaatagtaagaccacccattggatggtcatatccaaattcttccacagcttggctcagcaagtcttgaaatgaagtttgattcaaatatgacattg 27502908  T
Q  548 ggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacatc 608  Q
    | |||||||||||||||   |||||||| ||||  || |||||||| || ||||| |||||    
T  27502909 gaatcacaaaccgcttcatcttctctcctacataaacggcaagatatccttttggcacatc 27502969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 448 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 27554447 - 27554287
Alignment:
Q  448 caaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattg 547  Q
    |||||||| ||||| | |||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| | ||  | || ||||    
T  27554447 caaggaattgtgagactacccgttggatgatcatatccaaattgttcctcagcttgattcagcaattcttgaaacgatggttggcttaacaaagaaattg 27554348  T
Q  548 ggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacatc 608  Q
      |||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||    
T  27554347 atatcacaaaccgcttcatttcctctccaacatatactgcaaggtatccctttggcacatc 27554287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 447 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27571762 - 27571607
Alignment:
Q  447 gcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatatt 546  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| | |  || | |||||||||||| ||| |||| ||||||| |    
T  27571762 gcaaggaattgtgagaccacccattggatgatcatatccaaattcttcttctgattgatttagtaattcttgaaacgatggctggctcaaatatgatact 27571663  T
Q  547 gggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
    || ||||| |||||| ||  | | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  27571662 ggaatcacgaaccgcctcattctatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27571607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 602
Target Start/End: Original strand, 27414295 - 27414460
Alignment:
Q  437 catcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaa 536  Q
    |||||||  |||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| | |  || | |||||| || |||||||||||    
T  27414295 catcttcactgcacggaattgtaagaccacccattggatgatcatatccaaattcttcttctgattgatttagtaattcttgaaatgagggttggttcaa 27414394  T
Q  537 gtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
    ||||||||  || |||||||||||  ||  ||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  27414395 gtatgatacaggaatcacaaaccgtctcattttatctccaacgtagactgcaagatagccttttgg 27414460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 446 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27476827 - 27476671
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||| || || |||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||  ||| |||| ||  | ||| || || | |||||||||||||||||     
T  27476827 tgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcctcactttggctcagcagttcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 27476728  T
Q  546 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
     || |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  27476727 aggaatcacaaaccgcttcattttctcaccaacatacactgctagatatccctttgg 27476671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 446 - 602
Target Start/End: Original strand, 27523403 - 27523559
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||| || || |||||||| || || |||||| |||||| ||| || ||||  |||||||| | ||| || || | ||||||||| |||||||     
T  27523403 tgcaaggaatagttagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcggcttcgctcaacaattcttggaatgaagtttggttcaaatatgatac 27523502  T
Q  546 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
     || |||||||||||||||  ||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  27523503 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatagccctttgg 27523559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 602
Target Start/End: Original strand, 27419072 - 27419227
Alignment:
Q  447 gcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatatt 546  Q
    ||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| | |  || | |||||||||||| ||| |||| ||||||| |    
T  27419072 gcaaggaattgtaagaccacccattggatgatcatatccaaattcttcttctgattgatttagtaattcttgaaacgatggctggctcaaatatgatact 27419171  T
Q  547 gggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
    || ||||| |||||| ||  | | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  27419172 ggaatcacgaaccgcctcattctatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27419227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 605
Target Start/End: Original strand, 27500338 - 27500497
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||| || | |||||||| ||| |||| ||| | ||| || ||   |||||| |||||||||||    
T  27500338 tgcaaggaatagtgatgccacccattggatggtcatatccgaactgttcttcagattggctcagcaattcttggaatgaactttggtttaagtatgatat 27500437  T
Q  546 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtac 605  Q
     ||||||||||| ||||||  ||||||||| || | |||||| ||||| || ||||||||    
T  27500438 agggatcacaaatcgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccttttggtac 27500497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 602
Target Start/End: Original strand, 27556369 - 27556535
Alignment:
Q  436 gcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttca 535  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||   |  || | |||||| || ||||||||||    
T  27556369 gcatcttcactgcatggaattgtgagaccacccatagaatgatcatatccaaattcttcttctgcttgatgtagtaattcttgaaatgaaggttggttca 27556468  T
Q  536 agtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
    |  |||| || || |||||||| ||||||  ||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  27556469 ataatgaaatgggaatcacaaatcgcttcattttttctccaacataaactgcgagatagccttttgg 27556535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27504567 - 27504460
Alignment:
Q  175 caaaggcaatttctgaagacataggccgagccttatcaatttggctaaatcgtcaatagttattgattccgttcaagcactttagttagcttacctggaa 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||  |||||||||  ||| ||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  27504567 caaaggcaatttctgaagacatagaacaagccttgttaaactggctaaataatcagtagttatcgatttagttcaagaattttagttagc-tacctggaa 27504469  T
Q  275 ttagcaaaa 283  Q
    |||||||||    
T  27504468 ttagcaaaa 27504460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 27495676 - 27495574
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||| ||  | ||| |||||||| |  ||||| | ||||||||||||    
T  27495676 tgcaaggaatggtgagaccacccattggatgattaaatccaaactcttcttcagctttacctagcaattgttgaaaagcaggttgatgcaagtatgatat 27495577  T
Q  546 tgg 548  Q
    |||    
T  27495576 tgg 27495574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 27525192 - 27525119
Alignment:
Q  36 tctgaaaaaattgaagtataggaactgatttcttcttgggagataagatattagttgagataatcatgttcaact 110  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  27525192 tctgaaaaaattgaagcgtaggagctgatttctactttggagataagatattagtt-aaataatcaagttcaact 27525119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 602
Target Start/End: Original strand, 27421971 - 27422091
Alignment:
Q  482 atccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacatt 581  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  || | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||  | | ||||||||||     
T  27421971 atccaaattcttcttctgcttgatttagtaattcttgaaataatggttggttcaagtatgatactggaatcacgaaccgtttcattctatctccaacata 27422070  T
Q  582 cactgcaagatagccctttgg 602  Q
     ||||| |||||||| |||||    
T  27422071 gactgcgagatagccttttgg 27422091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 27460618 - 27460507
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||  ||| |||| ||| | ||| || |||  ||| ||||| ||||||||    
T  27460618 tgcaaggaatggtgagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcctcactttggctcagcaattcttggaatgatttttgcttcaaatatgatat 27460519  T
Q  546 tgggatcacaaa 557  Q
     |||||||||||    
T  27460518 agggatcacaaa 27460507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 27474031 - 27473921
Alignment:
Q  447 gcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatatt 546  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||  ||| |||| ||| | ||| || |||  ||| ||||| ||||||||     
T  27474031 gcaaggaatggtgagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcctcactttggctcagcaattcttggaatgatttttgcttcaaatatgatata 27473932  T
Q  547 gggatcacaaa 557  Q
    |||||||||||    
T  27473931 gggatcacaaa 27473921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 602
Target Start/End: Original strand, 27559230 - 27559396
Alignment:
Q  436 gcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttca 535  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| || || || | |||||| || | ||| ||||    
T  27559230 gcatcttcactgcaaggaattgtgagaccacccattggatgatcatatccaaactcttcttctgattggcttaataactattgaaatgaagattgattca 27559329  T
Q  536 agtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
    |  |||| || || |||| ||| | ||||  ||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  27559330 ataatgaaataggaatcagaaatctcttcattttgtctccaacataaactgcgagatagccttttgg 27559396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27515558 - 27515454
Alignment:
Q  176 aaaggcaatttctgaagacataggccgagccttatcaatttggctaaatcgtcaatagttattgattccgttcaagcactttagttagcttacctggaat 275  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |  || || |||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  27515558 aaaggcattttctgaagaca--ggccaaaactaattaatttggctaaattatcaatggttattgatttagttcaataactttagtta-tttacctggaat 27515462  T
Q  276 tagcaaaa 283  Q
    ||||||||    
T  27515461 tagcaaaa 27515454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 557
Target Start/End: Original strand, 27516609 - 27516720
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || || |||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||| | ||| || |||  ||| ||||| ||||||||    
T  27516609 tgcaaggaatagtgagaccccccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgatttttgcttcaaatatgatat 27516708  T
Q  546 tgggatcacaaa 557  Q
     |||||||||||    
T  27516709 agggatcacaaa 27516720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 438 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27577466 - 27577404
Alignment:
Q  438 atcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagc 500  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  27577466 atcttcagtgcatggaattgtgagaccacccatagggtgattgaatccaaattcttcttcagc 27577404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27446296 - 27446131
Alignment:
Q  437 catcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaa 536  Q
    |||||||  |||||||||| | ||| ||| ||||  | ||||||||| |||| |||||||| | ||| || ||| | | |||||| || ||||| |||||    
T  27446296 catcttcactgcaaggaatcgagagaccatccattcgatgatcatattcaaactcttcttctgattggcttaacgactcttgaaatgaaggttgattcaa 27446197  T
Q  537 gtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
      ||||  |||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  27446196 taatgaagttggaatcacaaatcgcttcattttttctccaacataaaccgcaagatagccttttgg 27446131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27527679 - 27527595
Alignment:
Q  74 ggagataagatattagttgagataatcatgttcaac-ttttcatttttgaggatatgtgaaaattataaccaaaagagctcttaat 158  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| |||| | ||||||||  ||||||||||    
T  27527679 ggagataggatattagttaa-ataatcatgttcaactttttcctttttgagtacatgtcaaaaatttaaccaaactagctcttaat 27527595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 439 - 607
Target Start/End: Original strand, 38024868 - 38025036
Alignment:
Q  439 tcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagt 538  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||    
T  38024868 tcttctgtgcaaggaatcgtgaggccacccattgggtgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcaataagttttgaaaggaagcttggttcaagt 38024967  T
Q  539 atgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacat 607  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  38024968 atgacatggggataacaaaccgcttcatttgctctccaacatatactgcaagatagccctttggtacat 38025036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 439 - 607
Target Start/End: Original strand, 38031320 - 38031488
Alignment:
Q  439 tcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagt 538  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||    
T  38031320 tcttctgtgcaaggaatcgtgaggccacccattgggtgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcaataagttttgaaaggaagcttggttcaagt 38031419  T
Q  539 atgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacat 607  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  38031420 atgacatggggataacaaaccgcttcatttgctctccaacatatactgcaagatagccctttggtacat 38031488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 437 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 55084935 - 55084781
Alignment:
Q  437 catcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaa 536  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  55084935 catcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcgtatccaaattcttcctccgcccgactcaacaagtcttgaaatgatggttggttcaa 55084836  T
Q  537 gtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaaga 591  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  55084835 gtaagacatagggatcacaaaccgcttcattttctctccaacatacactgcaaga 55084781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 440 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 38044049 - 38043882
Alignment:
Q  440 cttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||    
T  38044049 cttcggtgcaaggaattgtgaggccgcccattggatgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcagcaagtcttgaaacgaagtttgattcaagta 38043950  T
Q  540 tgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacat 607  Q
    ||| || ||||||||||||||||||  || ||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  38043949 tgacatagggatcacaaaccgcttcatttcctctccaaagtacactgcaagatagctctttggcacat 38043882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 393 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 50910153 - 50909939
Alignment:
Q  393 aaagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattct 492  Q
    ||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||| ||   |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  50910153 aaagatttatagctcattgaagcgagaagtaatttgcaagaagacatcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcatatccaaattct 50910054  T
Q  493 tcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagat 592  Q
    || ||  ||||| ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||  |  || ||||||||||| |||||||||||    
T  50910053 tcctccacttgattcaacaagttttgaaatgaagcttggttcaagtatgacatggggataacaaaccgcagcatttgctctccaacatacactgcaagat 50909954  T
Q  593 agccctttggtacat 607  Q
    | |||||||| ||||    
T  50909953 aaccctttggcacat 50909939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 440 - 607
Target Start/End: Original strand, 50911863 - 50912030
Alignment:
Q  440 cttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagta 539  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||    
T  50911863 cttctgtgcaaggaattgttaggccacccattgggtgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcaacaagttttgaaatgaagcttggttcaagta 50911962  T
Q  540 tgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacat 607  Q
    |||  | |||||||||||||| |||   || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  50911963 tgacttggggatcacaaaccgtttcatcttgtctccaacatataccgcaagatagccctttggcacat 50912030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 394 - 607
Target Start/End: Original strand, 38028714 - 38028927
Alignment:
Q  394 aagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattctt 493  Q
    |||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||   |||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  38028714 aagatttatagcccattgaagtgagaagtaatatgcaagaaaacgtcttctgtgcaaggaattgtgaggccgcccattggatggtcatatccaaattctt 38028813  T
Q  494 cttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagata 593  Q
    | || ||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||  || ||||||||| | ||||||||||||    
T  38028814 cctcggcttgactcaacaggttttgaaatgaagcttggttcaagtatgacgtggggataacaaatcgcttcatttgctctccaacgtacactgcaagata 38028913  T
Q  594 gccctttggtacat 607  Q
    ||||||||| ||||    
T  38028914 gccctttggcacat 38028927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 394 - 607
Target Start/End: Original strand, 38040029 - 38040242
Alignment:
Q  394 aagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattctt 493  Q
    |||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||   |||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  38040029 aagatttatagcccattgaagtgagaagtaatatgcaagaaaacgtcttctgtgcaaggaattgtgaggccgcccattggatggtcatatccgaattctt 38040128  T
Q  494 cttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagata 593  Q
    | || ||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||  || ||||||||| | ||||||||||||    
T  38040129 cctcggcttgactcaacaggttttgaaatgaagcttggttcaagtatgacgtggggataacaaatcgcttcatttgctctccaacgtacactgcaagata 38040228  T
Q  594 gccctttggtacat 607  Q
    ||||||||| ||||    
T  38040229 gccctttggcacat 38040242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 446 - 607
Target Start/End: Original strand, 50904792 - 50904953
Alignment:
Q  446 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatat 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||| |||||| || | |||||||||||| || ||    
T  50904792 tgcaaggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccgaattcatcctctgctcgactcaacaagtcttgaaatgaagtttggttcaagtaggacat 50904891  T
Q  546 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacat 607  Q
      |||||||||||||||||  ||  |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  50904892 atggatcacaaaccgcttcatttcttctccaacgtacactgcaagatatccctttggcacat 50904953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 394 - 607
Target Start/End: Original strand, 38033723 - 38033940
Alignment:
Q  394 aagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatg----gggtgatcatatccaaat 489  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||   |||  ||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||     || || ||||||||||||    
T  38033723 aagatttatagcccattgaagcgagaagtaatatgcaagaaaacatcttctgtgcagggaattgtgatgccgcccattaattggatggtcatatccaaat 38033822  T
Q  490 tcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaa 589  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  || ||||||||  | ||||||||    
T  38033823 tcttcctcggcttgactcaacaagttttgaaatgaagcttggttcaagtatgacgtggggataacaaaccgcttcatttgctctccaatgtacactgcaa 38033922  T
Q  590 gatagccctttggtacat 607  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  38033923 gatagccctttggcacat 38033940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 607
Target Start/End: Original strand, 38036718 - 38036954
Alignment:
Q  371 tctatgtcagtatgctacagtaaaagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccat 470  Q
    ||||||||||| | ||| |||  |||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||   |||  | | ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  38036718 tctatgtcagtctcctatagtgtaagatttatagcccattgaagtgagaagtaatatgcaagaaaacgtattctgtgcaaggaattgtgaggccgcccat 38036817  T
Q  471 ggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttc 570  Q
     || || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||  || ||||  |||||||| |||  || |    
T  38036818 tggatggtcatatccgaattcttcctcggcttgactcaacaaattttgaaatgaagcttggttcaagtatggcatggggacaacaaaccgtttcatttgc 38036917  T
Q  571 tctccaacattcactgcaagatagccctttggtacat 607  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38036918 tctccaacgtacactgcaagatagccctttggcacat 38036954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 437 - 610
Target Start/End: Original strand, 48840703 - 48840875
Alignment:
Q  437 catcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaa 536  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  48840703 catcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcatatccaaattctttctccactt-actcaacaagtcttgaaatgaggcttggttcaa 48840801  T
Q  537 gtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacatctg 610  Q
    |||||  || ||||| ||||| ||||||   | |||||| || | || ||||||||| |||||||| |||||||    
T  48840802 gtatggcatggggattacaaatcgcttcatctcctctccgacgtacaatgcaagatatccctttggcacatctg 48840875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 532 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 50913550 - 50913480
Alignment:
Q  532 ttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 602  Q
    |||||| |||||||||| ||||  |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  50913550 ttcaagaatgatattggaatcaagaacctcttcattttctctccaacatacactgcaagatagccttttgg 50913480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 438 - 607
Target Start/End: Original strand, 21607288 - 21607457
Alignment:
Q  438 atcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaag 537  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| || | | ||||||||    
T  21607288 atcttctgtgcaaggaaccgtgaggccacccattgggtgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcaataagttttgaaaggaagctcggttcaag 21607387  T
Q  538 tatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacat 607  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||  || |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  21607388 tatgacatggggataacaaaccgcttcatttgctctccaacatataccgcaagatatccctttggtacat 21607457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 394 - 607
Target Start/End: Original strand, 21604702 - 21604915
Alignment:
Q  394 aagattcatagcccattcaagcaagaggtaatatgttggaaggcatcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattctt 493  Q
    |||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||   |||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  21604702 aagatttatagcccattgaagtgagaagtaatatgcaagaaaacgtcttctgtgcaaggaattgtgaggccgcccattggatggtcatatcctaattctt 21604801  T
Q  494 cttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagata 593  Q
    | ||  |||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||  || |||||| || | ||||||||||||    
T  21604802 cctcgtcttgactcaacatgttttgaaatgaagcttggttcaagtatgacgtggggataacaaatcgcttcatttgctctcctacttacactgcaagata 21604901  T
Q  594 gccctttggtacat 607  Q
    ||||||||| ||||    
T  21604902 gccctttggcacat 21604915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 437 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 21634692 - 21634605
Alignment:
Q  437 catcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacga 524  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  21634692 catcttcggtgcaaggaattgtgaagccgcccattcgatgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcagcaagtcttgaaacga 21634605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 437 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 3073718 - 3073548
Alignment:
Q  437 catcttcggtgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtgttgaaacgatggttggttcaa 536  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||  |||||| ||||| |||||| || | |||||||||    
T  3073718 catcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcgtatccgaattcttcctctgcccgactcagcaagtattgaaatgaagtttggttcaa 3073619  T
Q  537 gtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttggtacat 607  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||  || ||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3073618 gtatgacgtagggatcacaaaccgcttcatttcctctccaacgtacaccgcaagatatccctttggcacat 3073548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 532 - 599
Target Start/End: Original strand, 21477460 - 21477526
Alignment:
Q  532 ttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctt 599  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21477460 ttcaagtatgatattgggat-acaaacggtgtcattttctctccaacatacactgcaacatagccctt 21477526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University