View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1969_low_25 (Length: 360)

Name: NF1969_low_25
Description: NF1969
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1969_low_25
NF1969_low_25
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (6-343)||(13601-13940)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (10-254)||(51966854-51967098)
chr1 (6-254)||(50559934-50560183)
chr1 (6-254)||(4891013-4891260)
chr1 (6-254)||(18110601-18110849)
chr1 (6-254)||(29187227-29187474)
chr1 (6-254)||(43255672-43255920)
chr1 (6-254)||(50396086-50396334)
chr1 (6-254)||(10695309-10695556)
chr1 (6-254)||(29841805-29842052)
chr1 (6-254)||(33360615-33360863)
chr1 (6-254)||(13663534-13663782)
chr1 (6-254)||(18813102-18813350)
chr1 (6-254)||(31618573-31618820)
chr1 (6-254)||(38846342-38846590)
chr1 (6-254)||(42681280-42681522)
chr1 (6-254)||(28566836-28567084)
chr1 (6-254)||(34686471-34686718)
chr1 (6-254)||(52308719-52308966)
chr1 (6-254)||(15314137-15314384)
chr1 (6-254)||(52522687-52522935)
chr1 (6-254)||(48339277-48339525)
chr1 (6-254)||(41831174-41831421)
chr1 (6-254)||(41964049-41964296)
chr1 (6-254)||(34691009-34691257)
chr1 (79-253)||(18095697-18095870)
chr1 (122-254)||(49225161-49225293)
chr1 (6-101)||(21736710-21736805)
chr1 (6-81)||(18097673-18097748)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (6-254)||(40621040-40621288)
chr4 (6-254)||(15519742-15519990)
chr4 (6-254)||(35496661-35496909)
chr4 (8-251)||(16904172-16904415)
chr4 (6-254)||(52799939-52800185)
chr4 (6-254)||(741425-741673)
chr4 (6-254)||(17738936-17739183)
chr4 (6-254)||(575151-575399)
chr4 (6-254)||(28971987-28972235)
chr4 (6-254)||(39715644-39715892)
chr4 (6-254)||(55999846-56000094)
chr4 (6-254)||(13626946-13627194)
chr4 (6-254)||(15655958-15656206)
chr4 (6-254)||(35713259-35713501)
chr4 (6-254)||(7645258-7645506)
chr4 (6-254)||(19832533-19832781)
chr4 (6-254)||(23477798-23478045)
chr4 (6-254)||(28136202-28136450)
chr4 (6-254)||(53341303-53341551)
chr4 (6-254)||(5274893-5275140)
chr4 (6-254)||(33504134-33504382)
chr4 (6-254)||(14830658-14830905)
chr4 (6-254)||(47721211-47721459)
chr4 (54-254)||(10260502-10260702)
chr4 (6-254)||(19589741-19589989)
chr4 (54-254)||(21563753-21563953)
chr4 (54-254)||(24078572-24078772)
chr4 (54-254)||(26925444-26925644)
chr4 (6-254)||(34057712-34057959)
chr4 (54-254)||(43331274-43331474)
chr4 (54-254)||(51451340-51451540)
chr4 (6-254)||(39745992-39746240)
chr4 (11-254)||(1943393-1943636)
chr4 (54-254)||(36856024-36856224)
chr4 (6-142)||(54332788-54332924)
chr4 (149-254)||(16892043-16892148)
chr4 (26-95)||(16892158-16892227)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (6-254)||(18093845-18094093)
chr2 (6-254)||(10049116-10049364)
chr2 (6-254)||(6343845-6344093)
chr2 (6-254)||(14324329-14324577)
chr2 (6-254)||(1994057-1994305)
chr2 (6-254)||(28501192-28501440)
chr2 (6-254)||(28608134-28608382)
chr2 (6-254)||(4291769-4292016)
chr2 (6-254)||(19168749-19168997)
chr2 (6-254)||(26826438-26826686)
chr2 (6-254)||(30567987-30568235)
chr2 (6-254)||(16882843-16883091)
chr2 (6-254)||(17040533-17040781)
chr2 (6-254)||(26820530-26820778)
chr2 (6-254)||(4810459-4810707)
chr2 (6-254)||(9544744-9544994)
chr2 (6-254)||(14752081-14752328)
chr2 (6-254)||(21096611-21096858)
chr2 (6-254)||(42884303-42884550)
chr2 (54-254)||(3709821-3710021)
chr2 (6-254)||(9917825-9918068)
chr2 (54-254)||(11867395-11867595)
chr2 (6-254)||(33664896-33665144)
chr2 (54-254)||(35358788-35358988)
chr2 (6-254)||(36634209-36634456)
chr2 (6-254)||(45206088-45206336)
chr2 (6-181)||(33906255-33906430)
chr2 (149-254)||(7360942-7361047)
chr2 (177-254)||(33905207-33905284)
chr2 (6-95)||(7361057-7361146)
chr2 (26-82)||(11446729-11446785)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (8-254)||(44384062-44384308)
chr8 (6-254)||(23967508-23967756)
chr8 (6-254)||(37028588-37028836)
chr8 (6-254)||(42061782-42062030)
chr8 (6-254)||(6301594-6301842)
chr8 (6-254)||(12759124-12759372)
chr8 (6-254)||(44939193-44939441)
chr8 (6-254)||(14079950-14080198)
chr8 (6-254)||(44598395-44598644)
chr8 (6-254)||(22357565-22357813)
chr8 (6-254)||(36603188-36603436)
chr8 (6-254)||(41155261-41155508)
chr8 (6-254)||(41976088-41976335)
chr8 (6-254)||(41627522-41627770)
chr8 (6-254)||(42812070-42812318)
chr8 (6-254)||(45295172-45295420)
chr8 (6-254)||(39203261-39203509)
chr8 (6-253)||(27629302-27629549)
chr8 (54-254)||(20664096-20664296)
chr8 (54-254)||(30549462-30549662)
chr8 (46-254)||(30825075-30825283)
chr8 (6-254)||(33425377-33425623)
chr8 (6-254)||(41906478-41906726)
chr8 (54-254)||(44214212-44214412)
chr8 (82-254)||(19396543-19396714)
chr8 (6-177)||(19246809-19246980)
chr8 (6-177)||(19319993-19320164)
chr8 (6-172)||(6478611-6478776)
chr8 (209-254)||(38961188-38961233)
chr8 (209-254)||(38991533-38991578)
chr8 (202-254)||(29432941-29432993)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (6-254)||(17169939-17170186)
chr7 (6-254)||(47574457-47574705)
chr7 (6-254)||(6912479-6912727)
chr7 (17-254)||(33639834-33640069)
chr7 (6-254)||(39650074-39650323)
chr7 (6-254)||(5961578-5961826)
chr7 (6-254)||(31898913-31899163)
chr7 (6-254)||(47173369-47173614)
chr7 (6-254)||(3794392-3794634)
chr7 (6-254)||(19519478-19519726)
chr7 (6-254)||(42686448-42686696)
chr7 (6-254)||(14307810-14308057)
chr7 (6-254)||(19518904-19519152)
chr7 (18-254)||(42916729-42916965)
chr7 (6-254)||(27736191-27736432)
chr7 (17-254)||(47164703-47164941)
chr7 (6-254)||(19520052-19520300)
chr7 (6-254)||(23767574-23767820)
chr7 (45-254)||(11499511-11499720)
chr7 (6-254)||(9227357-9227605)
chr7 (54-254)||(33231130-33231330)
chr7 (54-254)||(20764276-20764476)
chr7 (54-254)||(34283273-34283473)
chr7 (6-254)||(48528887-48529134)
chr7 (46-254)||(8927067-8927275)
chr7 (54-254)||(19034830-19035030)
chr7 (54-254)||(20719606-20719806)
chr7 (54-254)||(29489854-29490054)
chr7 (6-195)||(17476838-17477028)
chr7 (6-195)||(17576186-17576376)
chr7 (6-195)||(17512481-17512670)
chr7 (6-195)||(17540544-17540733)
chr7 (8-199)||(4485786-4485977)
chr7 (6-195)||(17481284-17481474)
chr7 (6-195)||(17571740-17571930)
chr7 (6-136)||(9148358-9148488)
chr7 (152-250)||(9148275-9148373)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (6-254)||(1074403-1074651)
chr6 (6-254)||(1219437-1219684)
chr6 (6-254)||(7221603-7221851)
chr6 (6-254)||(13457852-13458100)
chr6 (6-254)||(24444840-24445087)
chr6 (6-254)||(9980188-9980434)
chr6 (6-254)||(18600126-18600374)
chr6 (6-254)||(22374986-22375234)
chr6 (6-254)||(34319950-34320198)
chr6 (6-254)||(25532128-25532376)
chr6 (6-254)||(15274462-15274710)
chr6 (6-254)||(33977829-33978077)
chr6 (6-254)||(17938381-17938630)
chr6 (6-254)||(3089172-3089418)
chr6 (17-254)||(14889090-14889326)
chr6 (6-254)||(7219933-7220181)
chr6 (6-254)||(34854815-34855062)
chr6 (54-254)||(248787-248987)
chr6 (6-254)||(11936926-11937174)
chr6 (54-254)||(12580966-12581166)
chr6 (6-253)||(2520017-2520270)
chr6 (6-254)||(1080731-1080978)
chr6 (6-189)||(4423308-4423491)
chr6 (149-254)||(11517657-11517762)
chr6 (149-254)||(11269588-11269693)
chr6 (17-83)||(33325612-33325678)
chr6 (6-95)||(11517558-11517647)
chr6 (17-83)||(35135274-35135340)
chr6 (58-95)||(11269703-11269740)
chr6 (214-254)||(3052127-3052167)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (6-254)||(31296662-31296910)
chr5 (6-254)||(34716501-34716747)
chr5 (6-254)||(19394330-19394578)
chr5 (6-254)||(25697647-25697894)
chr5 (6-254)||(34375531-34375779)
chr5 (6-254)||(27064743-27064991)
chr5 (6-254)||(3211327-3211575)
chr5 (6-254)||(30141416-30141665)
chr5 (6-254)||(41690188-41690434)
chr5 (6-254)||(3151734-3151982)
chr5 (6-254)||(12589409-12589651)
chr5 (6-254)||(35540990-35541238)
chr5 (6-254)||(3027300-3027549)
chr5 (6-254)||(289449-289697)
chr5 (6-254)||(7284518-7284766)
chr5 (6-254)||(30688157-30688404)
chr5 (6-254)||(3398463-3398711)
chr5 (10-254)||(4881126-4881370)
chr5 (6-254)||(20997074-20997316)
chr5 (6-254)||(26322205-26322451)
chr5 (6-248)||(1853048-1853290)
chr5 (6-254)||(33612269-33612517)
chr5 (54-254)||(37463241-37463441)
chr5 (6-254)||(19446985-19447220)
chr5 (6-193)||(20348847-20349029)
chr5 (6-161)||(2194100-2194254)
chr5 (157-254)||(2193628-2193725)
chr5 (6-118)||(21029083-21029195)
chr5 (214-254)||(18037352-18037392)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (6-254)||(5253374-5253622)
chr3 (26-254)||(55295931-55296159)
chr3 (6-254)||(11952409-11952657)
chr3 (10-254)||(39797466-39797710)
chr3 (6-254)||(2845879-2846127)
chr3 (6-254)||(8241581-8241829)
chr3 (6-254)||(16494756-16495004)
chr3 (6-254)||(36168584-36168832)
chr3 (6-254)||(52841654-52841902)
chr3 (6-254)||(51247246-51247494)
chr3 (6-254)||(35088967-35089215)
chr3 (10-254)||(40828063-40828307)
chr3 (6-254)||(54794086-54794334)
chr3 (8-254)||(17910885-17911131)
chr3 (6-254)||(11326774-11327022)
chr3 (6-230)||(22476607-22476830)
chr3 (6-254)||(35435851-35436099)
chr3 (6-254)||(54648642-54648890)
chr3 (6-254)||(23192407-23192655)
chr3 (6-254)||(16340549-16340794)
chr3 (6-254)||(12169066-12169314)
chr3 (6-254)||(31370150-31370397)
chr3 (10-250)||(52854577-52854817)
chr3 (54-254)||(917574-917774)
chr3 (6-254)||(6105247-6105494)
chr3 (54-254)||(44073890-44074090)
chr3 (6-254)||(49111948-49112198)
chr3 (6-254)||(21700690-21700938)
chr3 (6-254)||(48975558-48975806)
chr3 (11-195)||(50740297-50740482)
chr3 (11-195)||(50772372-50772557)
chr3 (6-135)||(28165211-28165347)
chr3 (201-254)||(18742115-18742168)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (6-254)||(19507-19753)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (6-254)||(12683-12929)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (6-254)||(153299-153547)
scaffold0006 (11-254)||(65764-66007)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (6-254)||(8804-9051)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (6-249)||(13978-14221)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (6-254)||(27492-27739)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (6-254)||(48943-49191)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (6-254)||(118917-119165)
scaffold0010 (144-213)||(118592-118661)
scaffold0010 (6-99)||(49896-49989)
scaffold0010 (6-99)||(57429-57522)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (6-199)||(231552-231745)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (6-254)||(5392-5633)
scaffold0032 (6-254)||(11841-12082)
[»] scaffold1884 (2 HSPs)
scaffold1884 (96-254)||(705-863)
scaffold1884 (6-77)||(862-933)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (120-254)||(16576-16710)
[»] scaffold2007 (1 HSPs)
scaffold2007 (21-116)||(109-204)


Alignment Details
Target: scaffold0079 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 6 - 343
Target Start/End: Original strand, 13601 - 13940
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgat--gctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtca 103  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13601 tgagaagaagccgaactctgacttaagttccgactgatatgttttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatgttca 13700  T
Q  104 aaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13701 aaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaatttactaagtcttaaacttctcaacaaccgg 13800  T
Q  204 ataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatattcttgctatttttgggacttaatttttgttcatgaccaagtgacgtgtat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13801 ataatgtaggttgatgagcagccttgaatctgatcaattgttacatatattcttgctatttttgggacttaatttttgttcatgaccaagtgacgtgtat 13900  T
Q  304 tggttttttatcgccctaacttttttgtgatttgcttatt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13901 tggttttttatcgccctaacttttttgtgatttgcttatt 13940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Original strand, 51966854 - 51967098
Alignment:
Q  10 aagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaac 109  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51966854 aagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaac 51966953  T
Q  110 aatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51966954 aatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatg 51967053  T
Q  210 taggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51967054 taggttgatgagcagccttgaacctgatcaattgttacatatatt 51967098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50560183 - 50559934
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgact-ttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaa 104  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50560183 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactcttgagcttgagaagtgttaaggtcacgataacaattcaagaaacatggtcaa 50560084  T
Q  105 aaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgga 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50560083 aaaccaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgga 50559984  T
Q  205 taatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50559983 taatgtaggttgatgaacagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 50559934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4891260 - 4891013
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4891260 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 4891161  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4891160 aaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 4891062  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4891061 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 4891013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18110849 - 18110601
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18110849 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 18110750  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18110749 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 18110650  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18110649 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 18110601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 29187227 - 29187474
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29187227 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 29187326  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29187327 aaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 29187425  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29187426 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 29187474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 43255672 - 43255920
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43255672 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 43255771  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43255772 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 43255871  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43255872 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 43255920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 50396086 - 50396334
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50396086 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 50396185  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50396186 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 50396285  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50396286 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 50396334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 10695309 - 10695556
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695309 tgagaagaagccgaactctgacttaagttttgactgatgctttgactatgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 10695408  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10695409 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagtt-ctctaacactgtattgtgaaatcataacgcaaacttactaagtcttaaacttcccaacaaccggat 10695507  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10695508 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 10695556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 29841805 - 29842052
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29841805 tgagaagaagccgaactctgacttaagttcagactgatgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagtcaaa 29841904  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29841905 a-acaatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 29842003  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29842004 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctaaccaattgttacatatatt 29842052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33360863 - 33360615
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgcttt-gactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaa 104  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33360863 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgcttttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaa 33360764  T
Q  105 aaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgga 204  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33360763 aaaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgga 33360665  T
Q  205 taatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33360664 taatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 33360615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 13663534 - 13663782
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13663534 tgagaagaagccgaactctaacttaagttctgactgtagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgataacaattcaagaaacatggtcaaa 13663633  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13663634 aaataatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 13663733  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13663734 gatgtaggttgatgagcaacctcaaacctgactaattgttacatatatt 13663782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18813350 - 18813102
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813350 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagttttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 18813251  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813250 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 18813151  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18813150 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 18813102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31618820 - 31618573
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31618820 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 31618722  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31618721 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 31618622  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31618621 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 31618573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 38846342 - 38846590
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38846342 tgagaagaagtcaaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttaagaagtgttaaggtcacaacaacaattcaagaaacatggtcaaa 38846441  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38846442 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 38846541  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38846542 gatgtaggttgatgagaagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 38846590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42681522 - 42681280
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42681522 tgagaagaagccgaactctgacttaagttcagactgatgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagtcaaa 42681423  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42681422 aa-caatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 42681324  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  42681323 aatgtaggttgatgagcagcctcgaac-----caattgttacatatatt 42681280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 28566836 - 28567084
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28566836 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgactgtagctttgactctgagcttgagaagtgttaatgtcacgataacaattcaagaaacatggtcaaa 28566935  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28566936 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaccaaccggat 28567035  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  28567036 gatgtaggttgatgagcaagctcaaacctgaccaattgttacatatatt 28567084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34686718 - 34686471
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34686718 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 34686620  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34686619 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagat 34686520  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34686519 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 34686471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 52308966 - 52308719
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  52308966 tgagaagaagccaaactctgacttaagttctaactgatgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaaca-tacaagaaacatggtcaaa 52308868  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  52308867 aaacaatcaaatcagattggaaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataattcaaacttactaagtcttaaatttctcaacaatcggat 52308768  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  52308767 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgctacatatatt 52308719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15314384 - 15314137
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15314384 tgagaagaagccgaactctgacttaagttttgactgatgctttgaccttgaacttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaa-catggtaaaa 15314286  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15314285 aaaaaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttattaagtcttaaacttcttaacaaccgaat 15314186  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15314185 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 15314137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 52522687 - 52522935
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52522687 tgagaagaagttgaactctgacttaagttctaactgaagttttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaatatggtcaaa 52522786  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  52522787 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaatttctcaacaaccagat 52522886  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52522887 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 52522935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48339525 - 48339277
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  48339525 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaatttaataaacatggtcaaa 48339426  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48339425 aaacaatcaaatctgattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaatttactaagtcttaaacttatcaacaaccggat 48339326  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
      ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  48339325 gttgtaggttgatgagcagcctcgaacttaaccaattgttacatatatt 48339277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 41831174 - 41831421
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41831174 tgagaagaagttgaactctgacttaagttctaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 41831272  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  41831273 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaaacactggat 41831372  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  41831373 gatgtaggttgatgagcaacctcaaacctgaccaattgttacatatatt 41831421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 41964049 - 41964296
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| | ||||||| |||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41964049 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttttaactgaag-tttgactctgagtttgagaagtgttaaaatcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 41964147  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41964148 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagat 41964247  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41964248 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 41964296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34691257 - 34691009
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||| | | | | ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34691257 tgagaagaagttaaactctgacttaagttctaactaaagttttgactcttagcttgagaagtgttaaagtcacgactacaattcaagaaacatggtcaaa 34691158  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34691157 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatcataatgcaaacttactaagttttaaacttctcaacaaccggat 34691058  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34691057 gatgtaggttgatgagcaacctcgaaccttaccaattgttacatatatt 34691009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18095870 - 18095697
Alignment:
Q  79 gacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttac 177  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18095870 gacaactattcaagaaacatggtaaaaaaaacaatcgaatcagattgtgaaataataagttactctaac--tgtattgtaaaatcataatgcaaacttac 18095773  T
Q  178 taagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  18095772 taagtcttaaacttctcaacaaccagatgatgtaggttgatgagcagcctcaaacctgaccaattgttaaatatat 18095697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 122 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 49225293 - 49225161
Alignment:
Q  122 ttgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgag 221  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||    
T  49225293 ttgtgaaataataagttactctaacaatgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaatctgattatttaggttgatgag 49225194  T
Q  222 cagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49225193 cagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 49225161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21736805 - 21736710
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggt 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21736805 tgagaagaagcataactctaacttaagttctgactgaagctttgactgtgagctttagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggt 21736710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18097748 - 18097673
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgac 81  Q
    |||||||||| | ||| || | ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097748 tgagaagaagtcaaaccctgatttaagttctgactgaaactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgac 18097673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40621288 - 40621040
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40621288 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgacttatgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 40621189  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40621188 aaacaatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 40621089  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40621088 aatgtaggttgatgaacagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 40621040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15519990 - 15519742
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15519990 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 15519891  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15519890 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 15519791  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15519790 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 15519742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 35496661 - 35496909
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35496661 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 35496760  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35496761 aaccaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 35496860  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  35496861 aatgtaggttgatgagcaacctcaaacctgaccaattgttacatatatt 35496909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16904415 - 16904172
Alignment:
Q  8 agaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaa 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16904415 agaagaagccgaactctaacttaagttctgactgatgttttgactctgagctttagaagtgttaacgtcacgagaacaattcaagaaatatggtcaaaaa 16904316  T
Q  108 acaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16904315 acaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataa 16904216  T
Q  208 tgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16904215 tgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaacaattgttacatat 16904172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 52800185 - 52799939
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52800185 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 52800086  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52800085 aaa--atcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 52799988  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52799987 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 52799939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 741425 - 741673
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  741425 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgcctctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 741524  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  741525 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 741624  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  741625 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 741673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17739183 - 17738936
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17739183 tgagaagaagccgaactctgacttaagttcatactgatgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 17739084  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17739083 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgta-tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaactaccggat 17738985  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17738984 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 17738936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 575151 - 575399
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  575151 tgagaagaagccgaactctgacttaagttcagactgatgctttgactctgagcttgagtagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagtcaaa 575250  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  575251 aaacaatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaactggat 575350  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  575351 aatgtaggttgataagcagcctcgaacctaaccaattgttacatatatt 575399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28972235 - 28971987
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28972235 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaataattcaagaaacatggtcaaa 28972136  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28972135 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactataacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttcttaacaaccggat 28972036  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28972035 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 28971987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 39715644 - 39715892
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39715644 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagtttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 39715743  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39715744 aaaaaatcaaattagattgtgaaataataatttactttaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttattaagtcttaaacttctcaacaatcggat 39715843  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39715844 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 39715892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 55999846 - 56000094
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55999846 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 55999945  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55999946 aaacaatcaaatcggattgtgaaattataagttactctaacactgtactgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 56000045  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56000046 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 56000094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13627194 - 13626946
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13627194 tgagaataaggcgaactctgacttaagttctaaatgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcatgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 13627095  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13627094 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacaatgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 13626995  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13626994 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 13626946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 15655958 - 15656206
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655958 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagttttgactctgaacttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 15656057  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656058 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 15656157  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15656158 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgatcaattattacatatatt 15656206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 35713259 - 35713501
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  35713259 tgagaagaagccgaactctaacttaagttcagactgatgctttcactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagttaaa 35713358  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35713359 a-acaatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 35713457  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  35713458 aatgtaggttgatgagcagcctcgaac-----caattgttacatatatt 35713501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 7645258 - 7645506
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7645258 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactaaagctttgactatgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 7645357  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7645358 aaacaatcaaattagattgtgaaataataagttattctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtattaaagttctcaacaaccggat 7645457  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  7645458 gatgtaggttgatgagcagctttgaacctgaccaattgttacatatatt 7645506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 19832533 - 19832781
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  19832533 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagcattgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacctggtaaaa 19832632  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19832633 aaacaatcaaattggattgtaaaataataagttactgtaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 19832732  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19832733 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 19832781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23478045 - 23477798
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23478045 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttttaactgaag-tttgactttgagcttgagaagtgttaaagtcatgacgacaattcaagaaacatggtcaaa 23477947  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23477946 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 23477847  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23477846 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 23477798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 28136202 - 28136450
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28136202 tgagaagaagtcgaactctgactttagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatgttcaaa 28136301  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  28136302 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacatccggat 28136401  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28136402 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 28136450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 53341551 - 53341303
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53341551 tgagaagaaatcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagtttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 53341452  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53341451 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtaaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 53341352  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  53341351 gatgtaggttaatgagcagcctcgaacgtgaccaattattacatatatt 53341303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 5274893 - 5275140
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5274893 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttttaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcatgacaacaatttaagaaacatggtcaaa 5274991  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5274992 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 5275091  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5275092 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 5275140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 33504134 - 33504382
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||| | | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33504134 tgagaagaagtcgagctctgacttaagttctaactaaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaatatggtcaaa 33504233  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33504234 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctcacactgtattgtaaaatcataatgcaaacttaccaagtcttaaacttctcaacaaccggat 33504333  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33504334 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaacaattgttacatatatt 33504382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 14830658 - 14830905
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14830658 tgagaagaagtcgaactctgacttacgttctaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtccaa 14830756  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14830757 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagat 14830856  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14830857 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 14830905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 47721211 - 47721459
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  47721211 tgagaagaagctgaactctgacttaagttctgactgaagctttgactctaagtttgagaagtgttaaggtcacaacaacaattcaataaacatggtcaaa 47721310  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47721311 caacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagat 47721410  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47721411 gatttaggttgatgaccagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 47721459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 10260502 - 10260702
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10260502 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 10260601  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  10260602 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 10260701  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  10260702 t 10260702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19589989 - 19589741
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||| |||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19589989 tgagaagaagccgaactatgacttaagttatgacggaagctttgactctgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatgatcaat 19589890  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19589889 aaacaatcaaatcagattgtcaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccgaat 19589790  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19589789 gatgtaggttgatgaacagcctcgaacctgaccaattgttacatctatt 19589741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21563953 - 21563753
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21563953 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 21563854  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  21563853 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 21563754  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  21563753 t 21563753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 24078572 - 24078772
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24078572 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 24078671  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  24078672 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 24078771  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  24078772 t 24078772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 26925444 - 26925644
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26925444 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 26925543  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26925544 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 26925643  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  26925644 t 26925644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 34057712 - 34057959
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34057712 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttttaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaactcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 34057810  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  34057811 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaattcttaaacttctcaacaaccagat 34057910  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34057911 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 34057959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 43331474 - 43331274
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43331474 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 43331375  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43331374 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 43331275  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  43331274 t 43331274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 51451540 - 51451340
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  51451540 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 51451441  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  51451440 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 51451341  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  51451340 t 51451340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 39745992 - 39746240
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39745992 tgagaagaagtcgagctctgacttaagttctaattgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 39746091  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  39746092 aaactatcaaattggattgtgaattaataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatacaaaattactaagtcttaaacttttcaacaaccagat 39746191  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  39746192 gatgtaggttgatgagaagccttaaacctgaccaattgttacatatatt 39746240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1943636 - 1943393
Alignment:
Q  11 agaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaaca 110  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1943636 agaagccgaactccgacttaagttctgactgaagctttgactctgagcttcagaagtgttaaggttacgacaacaattcaagaaaaatggtcaaaaaaca 1943537  T
Q  111 atcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  1943536 atcaaattagactgtgaaataataagttactctaacattgtattgttaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggttgatgt 1943437  T
Q  211 aggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1943436 aggttgatgaacaaccacgaacctgaccaattgttacatatatt 1943393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36856224 - 36856024
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  36856224 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaatgcaaaaaacatggtcaaaagataatcaaatcggattgtgaaataataagatactccaacactgtat 36856125  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  36856124 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatgtat 36856025  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  36856024 t 36856024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 142
Target Start/End: Original strand, 54332788 - 54332924
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54332788 tgagaagaagtcgaactatgacttaagttctaactgaagttttgactccgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 54332887  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactc 142  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  54332888 aaacaatcaaatcggattgtaaaataataagttactc 54332924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16892148 - 16892043
Alignment:
Q  149 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttaca 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16892148 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttaccaagtcttaaacttctaaacaatcgggtgatgtaggttaatgagaagcctcaaacttgaccaattgttaca 16892049  T
Q  249 tatatt 254  Q
    ||||||    
T  16892048 tatatt 16892043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16892227 - 16892158
Alignment:
Q  26 acttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaa 95  Q
    ||||| ||| |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16892227 acttacgttatgattgaaactttgactctgagcttgaaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaa 16892158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 18093845 - 18094093
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18093845 tgagaagaagtcgaaccctgacttaagttctgactgatgttttgactctgagcttgataagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 18093944  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18093945 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 18094044  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18094045 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 18094093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 10049116 - 10049364
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10049116 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 10049215  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10049216 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatacaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 10049315  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10049316 aatataggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 10049364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 6343845 - 6344093
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6343845 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 6343944  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6343945 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 6344044  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6344045 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 6344093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 14324329 - 14324577
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14324329 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 14324428  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14324429 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 14324528  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14324529 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 14324577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 1994057 - 1994305
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1994057 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 1994156  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1994157 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 1994256  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1994257 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacttatatt 1994305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28501440 - 28501192
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28501440 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacaacaacaattcaagaaacatggtcaaa 28501341  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501340 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 28501241  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28501240 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 28501192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28608382 - 28608134
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28608382 tgagaagaagctgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagtttgagaagtgttaaggtcacgaaaacaattcaagaaacatggtcaaa 28608283  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28608282 aaacaatcaaatcagattgtcaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 28608183  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28608182 aatgtaggttgatgagtagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 28608134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 4291769 - 4292016
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4291769 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 4291868  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4291869 aga-aatcaaattagattgtaaaataataatttactctaacaatgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 4291967  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4291968 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 4292016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 19168749 - 19168997
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19168749 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaacttaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 19168848  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19168849 aatcaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactttattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 19168948  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19168949 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgattaattgttacatatatt 19168997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26826686 - 26826438
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26826686 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaataattcaagaaacatggtcaaa 26826587  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26826586 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactataacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttcttaacaaccggat 26826487  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26826486 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 26826438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 30567987 - 30568235
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30567987 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgagaacaattcaagaaacatggtcaaa 30568086  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30568087 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacatccggat 30568186  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30568187 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 30568235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16883091 - 16882843
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883091 tgagaagaaaccgaactctgacttaagttctgactgaagctttgactctgagcttgagaagttttaaggccacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 16882992  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16882991 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatcataaggcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggat 16882892  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16882891 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 16882843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17040781 - 17040533
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17040781 tgagaagaaaccgaactctgacttaagttctgactgaagctttgactctgagcttgagaagttttaaggccacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 17040682  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17040681 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatcataaggcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggat 17040582  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17040581 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 17040533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26820778 - 26820530
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26820778 tgagaagaagtcgaactatgacttaagttctaactgaagttttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaatatggtcaaa 26820679  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26820678 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 26820579  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26820578 aatgtaggttgatgggcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 26820530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4810707 - 4810459
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4810707 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgactgtagctttgactctgatcttgagaagtgttaaggtcacgataataattcaagaaacatggtcaaa 4810608  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4810607 aaacaatcaaataagattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttaataagtcttaaacttctcaacaaccggat 4810508  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4810507 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgtcacatatatt 4810459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 9544744 - 9544994
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtca---cgacaacaattcaagaaacatggtc 102  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||     
T  9544744 tgagaagaagttgaactctgacttaagttctgactgatactttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcgtcgcgacaacaattcaagaaacatggta 9544843  T
Q  103 aaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccg 202  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544844 aaaaaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactatattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccg 9544942  T
Q  203 gataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9544943 gataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 9544994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14752328 - 14752081
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14752328 tgagaagaagccgaactctaacttaagttctgactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaataattcaagaaacatggtcaaa 14752229  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||     
T  14752228 caacaatcaaattagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatcataatgcaaacttaccaagtcttaaacttctcaac-accagac 14752130  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14752129 gatgtaggttgatgaccagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 14752081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21096858 - 21096611
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21096858 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttttaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcatgacaacaatttaagaaacatggtcaaa 21096760  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21096759 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 21096660  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21096659 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 21096611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42884550 - 42884303
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  42884550 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttaagaagtgttacggtcacaacaacaattcaagaaacatggt-aaa 42884452  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42884451 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtatcgtgaaatcataatgcaaacttactaagttttaaacttctcaacaaccggat 42884352  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42884351 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 42884303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3710021 - 3709821
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3710021 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 3709922  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3709921 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 3709822  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  3709821 t 3709821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 9917825 - 9918068
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9917825 tgagaagaagccgaactctgacttaagttcagactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagtcaaa 9917924  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  9917925 aaacaatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactctattgtgaaatcataatgcaaacttactaagatttaaacttatcaacaaccggat 9918024  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||     |||||||||||||||||    
T  9918025 aatgtaggttaatgagcagccttgaac-----caattgttacatatatt 9918068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 11867395 - 11867595
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11867395 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 11867494  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  11867495 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 11867594  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  11867595 t 11867595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 33664896 - 33665144
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33664896 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaaatgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 33664995  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33664996 aaacaataaaatcggattgtgaaataataagttactctagcactgttttgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttatcaacaatcggat 33665095  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33665096 gatgtaggttgatgctcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 33665144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 35358788 - 35358988
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35358788 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 35358887  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  35358888 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 35358987  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  35358988 t 35358988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 36634209 - 36634456
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36634209 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 36634308  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||| |||||  | ||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36634309 aaacaattaaatcgaaatgtgaaa-aataggttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttatcaacaacaggat 36634407  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36634408 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 36634456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 45206088 - 45206336
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  45206088 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctatctgaagttttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacagttaaataaacatggtcaaa 45206187  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  45206188 aaacaatcaaattggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttatcaacaactggat 45206287  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  45206288 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacttaaccaattgttacatatatt 45206336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33906430 - 33906255
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906430 tgagaagaaatcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 33906331  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaag 181  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906330 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaag 33906255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7361047 - 7360942
Alignment:
Q  149 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttaca 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  7361047 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttaccaagtcttaaacttctaaacaatcgggtgatgtaggttaatgagcagcctcaaacttgaccaattgttaca 7360948  T
Q  249 tatatt 254  Q
    ||||||    
T  7360947 tatatt 7360942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33905284 - 33905207
Alignment:
Q  177 ctaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33905284 ctaagtcttaaacttcttaacaaccagatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 33905207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 7361146 - 7361057
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaa 95  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7361146 tgagaagaagtcgaaccctgacttaagttatgactgaagctttgactctgagcttgaaaagtgttaaggtcacgaaaactattcaagaaa 7361057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11446785 - 11446729
Alignment:
Q  26 acttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgaca 82  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446785 acttaagttctaattgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgaca 11446729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 254
Target Start/End: Original strand, 44384062 - 44384308
Alignment:
Q  8 agaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaa 107  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44384062 agaagaagtcgaactgtgacttaagttctgactgatgctttgactttgagcttgaaaagtattaaggtcacgacaacaattcaataaacatggtcaaaaa 44384161  T
Q  108 acaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384162 acaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactatattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataa 44384261  T
Q  208 tgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44384262 tgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 44384308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 23967508 - 23967756
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23967508 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 23967607  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23967608 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 23967707  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23967708 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 23967756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37028836 - 37028588
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37028836 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 37028737  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37028736 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 37028637  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37028636 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 37028588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 42061782 - 42062030
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42061782 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 42061881  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42061882 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 42061981  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42061982 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 42062030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 6301594 - 6301842
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6301594 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 6301693  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6301694 aaacaatcaaatcaaattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 6301793  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6301794 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 6301842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12759372 - 12759124
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759372 tgagaagaagccgaactcttacttaagttctgactgttgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 12759273  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759272 aaacaatcaaatcagattttgaaataataatttactctaacaccgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 12759173  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  12759172 aatgtaggttgatgatcagcctcgaacctgactaattgttatatatatt 12759124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44939441 - 44939193
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44939441 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaat 44939342  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44939341 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 44939242  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44939241 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 44939193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 14079950 - 14080198
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079950 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagttttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 14080049  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14080050 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 14080149  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14080150 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 14080198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44598644 - 44598395
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44598644 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 44598545  T
Q  106 aaacaa-tcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgga 204  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44598544 aaacaaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttcttaacaaccgga 44598445  T
Q  205 taatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44598444 tgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 44598395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 22357565 - 22357813
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357565 tgagaagaagtcaaactctgacttaagttctaactgaagctttgactatgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 22357664  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22357665 aaacaatcaaatcggattgtgagataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctaaagaaccggat 22357764  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22357765 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 22357813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 36603188 - 36603436
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36603188 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgataacaattcaagaaacatggtcaaa 36603287  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36603288 aaacaatcaaatcggattatgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacatccggat 36603387  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36603388 gatgtacgttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 36603436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41155508 - 41155261
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41155508 tgagaagaagccgaactctgacttaagttttgactgatgctttga-tctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 41155410  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41155409 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 41155310  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41155309 aatgtaggtaaatgaacagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 41155261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41976335 - 41976088
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  41976335 tgagaagaagccaaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacaacaacaattcaagaaacatggt-aaa 41976237  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41976236 aaacaatcaaatgagattgtgaaataatgatttactctaacactgcattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggaa 41976137  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41976136 aatgtaggttaatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 41976088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41627770 - 41627522
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41627770 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgaatctgagcttgagaagtgtcaatgtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 41627671  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41627670 aaacaatcaaataagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 41627571  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41627570 gatgtaggttgatgaaaaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 41627522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 42812070 - 42812318
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42812070 tgagaagaagtcgaactctaacttaagttctaactgaagctttgactatgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 42812169  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42812170 aaacaatcaaatcgaattgtgaaataataagttattctaacactgtattgtgaaattataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 42812269  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  42812270 gatgtaggttgatgagcagcctctaatctgaccaattattacatatatt 42812318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 45295172 - 45295420
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45295172 tgagaagaaaccaaactctgacttaagttctgactaatgttttgactctaagcttgagaagttttaaggtcacgacaacaattcaaggaacatggtcaaa 45295271  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45295272 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 45295371  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45295372 aatgtaggttgatgatcaacctcaaacctgatcaattgttacatatatt 45295420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39203509 - 39203261
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  39203509 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgactgaagctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaagaattcaagaaatatggtcaat 39203410  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  39203409 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattgtgaaatcataatgcaaacttactaaatcttaaacttctcaataactggat 39203310  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39203309 aatggaggttgataagcagtctcgaacctgaccaattgttacatatatt 39203261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27629549 - 27629302
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27629549 tgagaagaagtcgaaccctaacttaaattctgattgaagctttgactctgagcttgagaaatgttaagatcacgacaactattcaagaaacatggtcaaa 27629450  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27629449 taacaatcaaattggattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatcttaatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagat 27629350  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27629349 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctaaccaattgttacatatat 27629302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 20664096 - 20664296
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20664096 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 20664195  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20664196 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 20664295  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  20664296 t 20664296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 30549462 - 30549662
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30549462 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 30549561  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  30549562 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 30549661  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  30549662 t 30549662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 46 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30825283 - 30825075
Alignment:
Q  46 tttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaa 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  30825283 tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcacatcggattgtgaaataataagttactctaa 30825184  T
Q  146 cactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgtt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30825183 cactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgtt 30825084  T
Q  246 acatatatt 254  Q
    |||||||||    
T  30825083 acatatatt 30825075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 33425377 - 33425623
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33425377 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaag-tttgactatgagcttgagaagtgttaaagtcacggcaacaattcaagaaacatggtcaaa 33425475  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33425476 aaaaaatcaaatcggattgt-aaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatccaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 33425574  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33425575 gatgtaggttaatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 33425623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41906726 - 41906478
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| |||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41906726 tgagaagaagtcgaactttgacttaatttctaactgaagctttgactctgagtttgagaagtgttaatgtcacgataacaattcaagaaacatggtaaaa 41906627  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41906626 aaataatcaaatcaaattgtgaaataataagttactctaacactttattgtgaaatcataatgcaaacttaccaagtcttaaacttctcaacaaccggat 41906527  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41906526 gatataggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 41906478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 44214212 - 44214412
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  44214212 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatcgtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacacagtat 44214311  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  44214312 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 44214411  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  44214412 t 44214412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 82 - 254
Target Start/End: Original strand, 19396543 - 19396714
Alignment:
Q  82 aacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaag 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19396543 aacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaactta-taag 19396641  T
Q  182 tcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19396642 tcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 19396714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19246980 - 19246809
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19246980 tgagaagaaaccgaactctgacttaagttatgaatgatgctttgactctgagcttgagaagttttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 19246881  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttac 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19246880 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataacgcaaacttac 19246809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19320164 - 19319993
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19320164 tgagaagaaaccgaactctgacttaagttatgaatgatgctttgactctgagcttgagaagttttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 19320065  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttac 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19320064 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataacgcaaacttac 19319993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Original strand, 6478611 - 6478776
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6478611 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaagcatggtc-aa 6478709  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6478710 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtaatatgaaatcataatgcaaa 6478776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38961233 - 38961188
Alignment:
Q  209 gtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38961233 gtaggttgatgaacagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 38961188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38991578 - 38991533
Alignment:
Q  209 gtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38991578 gtaggttgatgaacagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 38991533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29432993 - 29432941
Alignment:
Q  202 ggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  29432993 ggatgatgtaagttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttgtatatatt 29432941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17170186 - 17169939
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17170186 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 17170087  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17170086 aaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 17169988  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17169987 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 17169939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 47574457 - 47574705
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47574457 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 47574556  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47574557 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 47574656  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47574657 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 47574705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 6912479 - 6912727
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6912479 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 6912578  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6912579 aaacaatcaaatcagattgtgaaatgataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 6912678  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6912679 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 6912727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 33639834 - 33640069
Alignment:
Q  17 cgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaa 116  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33639834 cgaactctgacttaagttcttactgatgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaa-caatcaaa 33639932  T
Q  117 tcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33639933 tcagattgtgaaataataatt-actctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttg 33640031  T
Q  217 atgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33640032 atgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 33640069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 39650074 - 39650323
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39650074 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgattgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 39650173  T
Q  106 aaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgga 204  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39650174 aaaacaattaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgtaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgaa 39650273  T
Q  205 taatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  39650274 taatgtaggttgatgagtagcctcgaacctgaccaattgttatatatatt 39650323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5961826 - 5961578
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5961826 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttaactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggacaaa 5961727  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5961726 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgcat 5961627  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5961626 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatgtatt 5961578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 31898913 - 31899163
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31898913 tgagaagaagccgaactctgacttaagttatgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 31899012  T
Q  106 aaacaa--tcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgg 203  Q
    ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31899013 aaaaaaaatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccga 31899112  T
Q  204 ataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31899113 ataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 31899163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47173614 - 47173369
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  47173614 tgagaagaagccgaactctaacttaagttctgactgaagctttgactatgagcttgagaagtgttaaggtcac---aacaattcaagaaacatggtcaaa 47173518  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47173517 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaatttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 47173418  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  47173417 ggtgtaggttgatgagcagtctcgaacctgaccaattgttttatatatt 47173369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3794634 - 3794392
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3794634 tgagaagaagccgaactctgacttaagttcagactgatgctttgactctgagctggagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagtcaaa 3794535  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3794534 aa-caatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagat 3794436  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  3794435 aatgtaggttgatgagcagcctcgaac-----caattgttacatatatt 3794392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19519726 - 19519478
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19519726 tgagaagaagtcgaattctgacttaagttctaactgaatctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattctataaacatggtcaaa 19519627  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19519626 aaccaatcaaatcggattgtgaaataataacttattctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 19519527  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19519526 gatgtaggttgacgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 19519478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42686696 - 42686448
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42686696 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaacagaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 42686597  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42686596 aaataatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattttattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 42686497  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42686496 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattattacatatatt 42686448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14308057 - 14307810
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14308057 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttttaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 14307959  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14307958 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 14307859  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14307858 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacccgaccaattgttacatatatt 14307810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19519152 - 19518904
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19519152 tgagaagaagtcgaattctgacttaagttctaactgaatctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattctataaacatggtcaaa 19519053  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19519052 aaccaatcaaatcggattgtgaaataataacttattctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 19518953  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19518952 gatgtaggttgacgagcagcctcgaacctgaccaatttttacatatatt 19518904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42916965 - 42916729
Alignment:
Q  18 gaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaat 117  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  42916965 gaactctgacataagttctgactgatgctttgactatgagcttgagaagttttaagttcacgacaacaattcaagaaacttggtcaaaaaacaaccaaat 42916866  T
Q  118 cagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42916865 cagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaactgactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttga 42916766  T
Q  218 tgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  42916765 tgatcagcctcgaaccacaccaattgttacatatatt 42916729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 27736191 - 27736432
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||       ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27736191 tgagaagaagccgaactgtgactttagttctgactgatgctttgactt-------gagaattgttaaggtcacaacaacaattcaagaaacatggtcaaa 27736283  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27736284 aaacaatcaaatcagattgtgaaataatagtttactctaacagtgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgaat 27736383  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27736384 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 27736432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 47164703 - 47164941
Alignment:
Q  17 cgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaa-aacaatcaa 115  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  47164703 cgaactccgacttaagttctgactgaagctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaaacaatcaa 47164802  T
Q  116 atcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggtt 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47164803 atcagattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggtt 47164902  T
Q  216 gatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47164903 gatgaacaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 47164941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19520300 - 19520052
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19520300 tgagaagaagtcgaattctgacttaagttctaactgaatctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 19520201  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19520200 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatcataatggaaacttactaagtcttaaacttctcaacaatcggat 19520101  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19520100 gatgtaggttgacgaacagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 19520052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 23767574 - 23767820
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767574 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 23767672  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23767673 aatcaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctc-acaaccggat 23767771  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23767772 gatgtaggttgatgaccaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 23767820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 45 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11499720 - 11499511
Alignment:
Q  45 ctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaa 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  11499720 ctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaattaaatcggattgtgaaataataagttactcta 11499621  T
Q  145 acactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgt 244  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11499620 acattgtattgtaaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgaatgatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgatcaattgt 11499521  T
Q  245 tacatatatt 254  Q
    ||||||||||    
T  11499520 tacatatatt 11499511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 9227357 - 9227605
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    ||||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9227357 tgagatgaagccgaactttgacttaagttctgactgaaactttgactatgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 9227456  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9227457 caacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatcataatgcaaacttatcaagtcttaaacttttcaacaactggat 9227556  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9227557 gatctaggttgatgaccagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 9227605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 33231130 - 33231330
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33231130 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 33231229  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  33231230 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 33231329  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  33231330 t 33231330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20764476 - 20764276
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  20764476 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacacagtat 20764377  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20764376 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 20764277  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  20764276 t 20764276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 34283273 - 34283473
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34283273 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 34283372  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  34283373 tgtgaaatcataatgcaaacttaccaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 34283472  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  34283473 t 34283473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 48528887 - 48529134
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  48528887 tgagaagaagctgaactctgacttaagttctgactgatactttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcgcgacaacaattcaagaaatatggtaaaa 48528986  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48528987 aaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacaatatattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 48529085  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  48529086 aatgtaggttgatgaacaacctcaaacctgaaaaattgttacatatatt 48529134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 254
Target Start/End: Original strand, 8927067 - 8927275
Alignment:
Q  46 tttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaa 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  8927067 tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcatgacaacaatttaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaa 8927166  T
Q  146 cactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgtt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  8927167 cactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaacggatgatgtaggttgatgagcaacctcgagcctgaccaattgtt 8927266  T
Q  246 acatatatt 254  Q
    |||||||||    
T  8927267 acatatatt 8927275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 19034830 - 19035030
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19034830 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcatattgtgaaataataagttactctaacactgtat 19034929  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19034930 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaatcggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 19035029  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  19035030 t 19035030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20719806 - 20719606
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20719806 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcatattgtgaaataataagttactctaacactgtat 20719707  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20719706 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaatcggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 20719607  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  20719606 t 20719606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29490054 - 29489854
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  29490054 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcatattgtgaaataataagttactctaacactgtat 29489955  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29489954 tgtgaaatcataatacaaacttactaagtcttaaacttttcaacaatcggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 29489855  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  29489854 t 29489854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17477028 - 17476838
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17477028 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgaaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 17476929  T
Q  106 aaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 195  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17476928 aaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 17476838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 17576186 - 17576376
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17576186 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgaaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 17576285  T
Q  106 a-aacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 195  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17576286 aaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 17576376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17512670 - 17512481
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17512670 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgaaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 17512571  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17512570 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatcttaatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 17512481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 17540544 - 17540733
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540544 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgaaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 17540643  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540644 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatcttaatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 17540733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Original strand, 4485786 - 4485977
Alignment:
Q  8 agaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaa 107  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  4485786 agaagaagctgaactctgacttaagttctgattgaagctttgactctgagcttgagaagtgttatggtcacgacaataattcaagaaatgtggtcaaaaa 4485885  T
Q  108 acaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaa 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4485886 acaatcaaatcagattatgaaataataagttactctaacactatattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaa 4485977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17481474 - 17481284
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17481474 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgaaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 17481375  T
Q  106 aaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 195  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17481374 aaaacaatcaaattggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 17481284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 17571740 - 17571930
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17571740 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgaaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 17571839  T
Q  106 a-aacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 195  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17571840 aaaacaatcaaattggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 17571930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9148488 - 9148358
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148488 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctgagtttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 9148389  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148388 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataat 9148358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9148373 - 9148275
Alignment:
Q  152 attgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacata 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9148373 attgtgaaataataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacata 9148275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 1074403 - 1074651
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1074403 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 1074502  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1074503 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 1074602  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1074603 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 1074651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1219684 - 1219437
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1219684 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 1219585  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219584 aaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 1219486  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1219485 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 1219437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7221851 - 7221603
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7221851 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 7221752  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7221751 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 7221652  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7221651 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 7221603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 13457852 - 13458100
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13457852 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 13457951  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13457952 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 13458051  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13458052 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 13458100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24445087 - 24444840
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24445087 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 24444988  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24444987 aaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 24444889  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24444888 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 24444840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 9980188 - 9980434
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9980188 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 9980287  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9980288 aaa--atcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 9980385  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9980386 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 9980434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 18600126 - 18600374
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18600126 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagttttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 18600225  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18600226 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 18600325  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18600326 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 18600374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 22374986 - 22375234
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374986 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagttttgactctgagcttgagaagtgttagtgtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 22375085  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22375086 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 22375185  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22375186 gatgtaggttgatgtgcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 22375234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34320198 - 34319950
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34320198 tgagaagaaaccgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctgagcttgagaagttttaaggtcacgacaacaattcaagaaacttggtcaaa 34320099  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34320098 aaacaatcaaatcagattgtgaaatagtaagttactctaacactctattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 34319999  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  34319998 aatgtaggttgatgatcagcctcgaacctaaccaattcttacatatatt 34319950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25532376 - 25532128
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25532376 tgagaagaagctgaactctgacttaagttctgactgatgctttgattctgagcttgagaaatattaaggccacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 25532277  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25532276 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcattatgcaaacttactaagttttaaacttctcaacaactggat 25532177  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25532176 aatttaggttgatgagcatcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 25532128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15274710 - 15274462
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15274710 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaaactttgactttgaacttgagaaatgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 15274611  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15274610 aagcaatcaaatcggattgagaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaacctgat 15274511  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15274510 gatgtaggttgatgagcagcctcaaacctgaccaattgttacatatatt 15274462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33978077 - 33977829
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33978077 tgagaagaagccgaactctcacttaagttatgacggaagctttgactctgagcttgagaagtgttaagttcacgaaaacaattcaagaaacatggtcaat 33977978  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33977977 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggat 33977878  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33977877 gatgtaggttgatgaacagcctcgaacctgaccaattgttacatctatt 33977829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17938630 - 17938381
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17938630 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagttttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 17938531  T
Q  106 aaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgga 204  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17938530 aaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgtaaacttactaagtcttaaacttctcaacaatcgga 17938431  T
Q  205 taatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17938430 tgatgtaggttaatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 17938381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 3089172 - 3089418
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3089172 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgactgaagttttgactatgagcctgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 3089271  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  3089272 aaacaatcaaatcagattatgaaataataagttactctaacac--tattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaataacctgat 3089369  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3089370 tatttaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatttatt 3089418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 14889090 - 14889326
Alignment:
Q  17 cgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaa 116  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14889090 cgaactctgacttaagttctaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgaaaacagttcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaa 14889188  T
Q  117 tcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttg 216  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14889189 tcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttg 14889288  T
Q  217 atgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14889289 atgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 14889326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 7219933 - 7220181
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7219933 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttggctctgagcttgagaagcgttaaggtcacgacaacaattaaataaacatggtcaaa 7220032  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7220033 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 7220132  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  7220133 tatgtaggttgatgattagcctcgaacttgactaattgttacatatatt 7220181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34855062 - 34854815
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||| | ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34855062 tgagaagaagtcgaattctgacttaagttctaactgaag-tttgactctaagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaatttaagaaacatggtcaaa 34854964  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34854963 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 34854864  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34854863 gatggaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 34854815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 248987 - 248787
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  248987 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 248888  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  248887 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 248788  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  248787 t 248787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 11936926 - 11937174
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11936926 tgagaagaagttgaactctgacttaagttctaactgaagttttgactctgagcttgaaaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 11937025  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11937026 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactatattatgaaataataatgcaaaattactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 11937125  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11937126 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 11937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 12580966 - 12581166
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12580966 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 12581065  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  12581066 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacttgaccaattgttacatctat 12581165  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  12581166 t 12581166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2520270 - 2520017
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2520270 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttttaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcatgacaacaatttaagaaacatggtcaaa 2520172  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2520171 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 2520072  T
Q  206 -------aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
           | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2520071 gatgtagattgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatat 2520017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 1080731 - 1080978
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | |||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1080731 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttttaactgaaa-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcatgacaacaatt-aagaaacatggtcaaa 1080828  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1080829 aaacaatcaaatcggactgtgaaataataagttactctaacaatgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 1080928  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcc-tcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1080929 gatgtaggttgatgagcaaccgtcgaacctgaccaattgttacatatatt 1080978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4423491 - 4423308
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423491 tgagaagaagtcgaactttgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 4423392  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaac 189  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423391 aaacaatcaaatcaggttgtgaaataataagttactctaacattctattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaac 4423308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 254
Target Start/End: Original strand, 11517657 - 11517762
Alignment:
Q  149 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttaca 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  11517657 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttatcaagtcttaaacttctaaacaatcgggtgatgtaggttaatgagcagcctcaaacttgaccaattgttaca 11517756  T
Q  249 tatatt 254  Q
    ||||||    
T  11517757 tatatt 11517762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11269693 - 11269588
Alignment:
Q  149 tgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttaca 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||    
T  11269693 tgtattctgaaatcataatgcaaacttaccaagtcttaaacttttaaacaatcgggtgatgtaggttaatgagcaacctcaaacttgaccaattgttaca 11269594  T
Q  249 tatatt 254  Q
    ||||||    
T  11269593 tatatt 11269588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 33325612 - 33325678
Alignment:
Q  17 cgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaa 83  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33325612 cgaactctgacttaagttctgactcatgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaa 33325678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 95
Target Start/End: Original strand, 11517558 - 11517647
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaa 95  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11517558 tgagaagaagtcgaaccctgacttaagttatgactgaagctttgactctgagcttgaaaagtgttaaggtcacgaaaactattcaagaaa 11517647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 35135340 - 35135274
Alignment:
Q  17 cgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaa 83  Q
    |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35135340 cgaactctgatttaagttctgactcatgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaa 35135274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 11269740 - 11269703
Alignment:
Q  58 cttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaa 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11269740 cttgaaaagtgttaaggtcacgacaactattcaagaaa 11269703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 254
Target Start/End: Original strand, 3052127 - 3052167
Alignment:
Q  214 ttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3052127 ttgatgagtagcctcgaacttgaccaattgttacatatatt 3052167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 31296662 - 31296910
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31296662 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 31296761  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31296762 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 31296861  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31296862 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 31296910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34716747 - 34716501
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34716747 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 34716648  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34716647 aaa--atcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 34716550  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34716549 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 34716501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19394578 - 19394330
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19394578 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 19394479  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19394478 aaataatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 19394379  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19394378 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 19394330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 25697647 - 25697894
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25697647 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 25697746  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25697747 aaa-aatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 25697845  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25697846 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 25697894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 34375531 - 34375779
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34375531 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 34375630  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34375631 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttcttaacaaccggat 34375730  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34375731 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 34375779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27064991 - 27064743
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064991 tgagaagaagtcgaactctgactgaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtattaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 27064892  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064891 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataaattactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 27064792  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064791 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 27064743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 3211327 - 3211575
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3211327 tgagaagaagccgaactatgacttaagttctgactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaatatggtcaaa 3211426  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3211427 aaacaatcatatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtaaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaataactggat 3211526  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3211527 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 3211575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30141665 - 30141416
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30141665 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgattgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 30141566  T
Q  106 aaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgga 204  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  30141565 aaaacaattaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagttttaaacttctcaacaaccgaa 30141466  T
Q  205 taatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  30141465 taatgtaggttgatgagtagcctcgaacctgaccaattattatatatatt 30141416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41690434 - 41690188
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41690434 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttcttactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 41690335  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41690334 aaa--atcaaattagattgtgaaataatattttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 41690237  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41690236 aatgtaggttgatgagcagcttcgaacctgaccaattgttacatatatt 41690188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 3151734 - 3151982
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3151734 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactaaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggccacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 3151833  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3151834 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttgctaagtcttaaacttctcaacaaccggat 3151933  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3151934 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 3151982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 12589409 - 12589651
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12589409 tgagaagaagccgaactctgacttaagttcagactgatgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagtcaaa 12589508  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12589509 a-acaatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 12589607  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  12589608 aatgcaggttgatgagcagcctcgaac-----caattgttacatatatt 12589651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 35540990 - 35541238
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35540990 tgagaagaagccgaactctgacttaagttttaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 35541089  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  35541090 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttaccaagtcttaaacttcttaacaaccggat 35541189  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35541190 gatgtaggttgatgagtagcctcgaacctgactaattgttacatatatt 35541238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3027549 - 3027300
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3027549 tgagaagaagttgaactctaacttaagttctaactgaagctttgactttgagctggagaagtgttaatgtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 3027450  T
Q  106 aaa-caatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgga 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3027449 aaaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacatcgtattgtgaaatcataatgcaaacttactgagtcttaaacttctcaacaaccgga 3027350  T
Q  205 taatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3027349 tgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctaaccaattgttacatatatt 3027300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 289697 - 289449
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  289697 tgagaagaaaccgaactctgacttaagttctgactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 289598  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  289597 caacaatcaaatcagattgtgaaataataagttcctctaacactatattttgaaatcataatgcaaacttaccaagttttaaacttctcaacaatcggat 289498  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  289497 gatgtaggttgatgaccagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 289449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7284766 - 7284518
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| |||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7284766 tgagaagaagttgaactctgacttaaattctaactgaagttttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 7284667  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7284666 aaacaatcaaatcaaattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 7284567  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7284566 gatgtaggttgataagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 7284518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30688404 - 30688157
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30688404 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttttaactgaag-tttgactatgagcttgagaagtgttaaagtcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 30688306  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30688305 aatcaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 30688206  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30688205 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 30688157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 3398463 - 3398711
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3398463 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttccaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 3398562  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3398563 aaa-aatcaaatcggattgtgaaataataagttattctaacactgtattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaatcggat 3398661  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatc-aattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3398662 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaaattgttacatatatt 3398711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4881370 - 4881126
Alignment:
Q  10 aagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaac 109  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4881370 aagaagtcgaactctgacttaagttctaactggagctttgactctgagcttgagagttgttaaggtcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaac 4881271  T
Q  110 aatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatg 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4881270 aattaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcaaaatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatg 4881171  T
Q  210 taggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4881170 taggtccatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 4881126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 20997074 - 20997316
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||     | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20997074 tgagaagaagtcgaactcttacttaag-----actgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 20997168  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20997169 aaacaatcaaattggattgtgaaa-aataggttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 20997267  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20997268 gatgtaagttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 20997316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 26322205 - 26322451
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||   ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26322205 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaat-tttgactctgagcttgagaagtgttgaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 26322303  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26322304 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctc-acaaccggat 26322402  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26322403 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctcaccaattgttacatatatt 26322451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 248
Target Start/End: Original strand, 1853048 - 1853290
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1853048 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttttaactgaagttttgactatgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 1853147  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1853148 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattgtatggtgaaaaaataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 1853247  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttaca 248  Q
     |||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  1853248 gatgtaggtcgatgagcagcctcgaagatgaccaattgttaca 1853290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 33612269 - 33612517
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||| | | | | ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33612269 tgagaagaagttaaactctgacttaagttctaactaaagttttgactcttagcttgagaagtgtaaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 33612368  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33612369 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagttttaaacttctcaacaaccggat 33612468  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  33612469 gatgtaggttgatgagcaacctcgaaccttaccaattgttatatatatt 33612517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37463441 - 37463241
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37463441 tgagcttgagaagtgttaagttcatgagaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 37463342  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  37463341 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 37463242  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  37463241 t 37463241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19447220 - 19446985
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19447220 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaatctttgactctgagctggagaagtgttaaggtcacgacaacaattctagaaacatggtcaaa 19447121  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19447120 aaataatcaaatcggattgtgaaataataagttattctaacactg-------------taatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 19447034  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19447033 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaacaattgttacatatatt 19446985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20349029 - 20348847
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20349029 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgaaaagtgttaagatcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 20348930  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttct 193  Q
    ||||||||      |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20348929 aaacaatcg-----gattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatgataatgcaaacttactaagtcttaaacttct 20348847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2194254 - 2194100
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||| | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  2194254 tgagaagaagtcgaactttgacttaagttttaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcatgacaacaatttaagaaacatggtaaaa 2194156  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaat 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2194155 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaat 2194100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 157 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2193725 - 2193628
Alignment:
Q  157 gaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2193725 gaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 2193628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21029195 - 21029083
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21029195 tgagaagaagtcaaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaa 21029096  T
Q  106 aaacaatcaaatc 118  Q
    |||||||||||||    
T  21029095 aaacaatcaaatc 21029083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 254
Target Start/End: Original strand, 18037352 - 18037392
Alignment:
Q  214 ttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18037352 ttgatgagcagcctcgaacttgaccaattgttacatatatt 18037392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 5253374 - 5253622
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5253374 tgagaagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 5253473  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5253474 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 5253573  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5253574 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 5253622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 254
Target Start/End: Original strand, 55295931 - 55296159
Alignment:
Q  26 acttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgt 125  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  55295931 actttagttctgactgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacaacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaattcagagtgt 55296030  T
Q  126 gaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagc 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55296031 gaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagc 55296130  T
Q  226 ctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55296131 ctcgaacctgaccaattgttacatatatt 55296159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 11952409 - 11952657
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11952409 tgagaagaagccgaactctgacttaagttcagactaatgctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacgtagtcaaa 11952508  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11952509 aaacaatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactatattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 11952608  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11952609 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctaaccaattgttacatatatt 11952657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Original strand, 39797466 - 39797710
Alignment:
Q  10 aagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaac 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39797466 aagaagccgaactctaacttaagttatgactgatactttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaac 39797565  T
Q  110 aatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatg 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39797566 aatcaaatcaaattgtgaaataataagttactctaatactatattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatg 39797665  T
Q  210 taggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39797666 taggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 39797710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 2845879 - 2846127
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2845879 tgagaagaagtcgaactctaacttaagttctaactgaatctttgactctgagcttaagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 2845978  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2845979 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaactgaat 2846078  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2846079 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 2846127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8241829 - 8241581
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8241829 tgagaagaagccgaactctgacttaagttcttactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaataattcaagaaacatggtcaaa 8241730  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8241729 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttcttaacaaccggat 8241630  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8241629 gatgtgggttgatgagcagactcgaacctgaccaattgttacatatatt 8241581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16495004 - 16494756
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16495004 tgagaagaagccgaactctaacttaagttctgactgtagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgataacaattcaagaaacatggtcaaa 16494905  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16494904 aaataatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 16494805  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  16494804 gatgtaggttgatgagcaacctcaaacctgactaattgttacatatatt 16494756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 36168584 - 36168832
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36168584 tgagaagaagtcgaactctaacttaagttatgactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 36168683  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36168684 caacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatcataatgcaaacttaccaagtcttaaacttctcaacaaccggat 36168783  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  36168784 gatgtaggttgatgagcagtcttgaacctgaccaattgttacatatatt 36168832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 52841654 - 52841902
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52841654 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctagccgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaagttggtcaaa 52841753  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52841754 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 52841853  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52841854 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 52841902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 51247494 - 51247246
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51247494 tgagaagaagtcgaactctgacttaatttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 51247395  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51247394 aaataatcaaatcggattgtcaaataataagttactctaacactgcattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 51247295  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51247294 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 51247246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 35088967 - 35089215
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| |  || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088967 tgagaagaagtcgaactatgacttaagttctaaccgaagttttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 35089066  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35089067 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtaaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 35089166  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35089167 aatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 35089215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Original strand, 40828063 - 40828307
Alignment:
Q  10 aagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaac 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40828063 aagaagccgaactctaacttaagttctgactgatgttttaactctgagcttaagaagtgttaaggttacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaac 40828162  T
Q  110 aatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatg 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40828163 aatcaaatcagattgtaaaataataatttactctaacactgttttgtgaaatcataatgcaaatttatcaagtcttaaacttctcaacaaccggataatg 40828262  T
Q  210 taggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40828263 taggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 40828307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 54794086 - 54794334
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54794086 tgagaagaagccgaactctcacttaagttctgactgtagctttgactctgagctcgagaagtgttaaggtcacgacaacaactcaagaaacatggtcaaa 54794185  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54794186 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagccttaaacttctcaacaaccggat 54794285  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  54794286 gatgtaggttgattaacagcctcaaacctgaccaattgttacatatatt 54794334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 254
Target Start/End: Original strand, 17910885 - 17911131
Alignment:
Q  8 agaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaa 107  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| | | | | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17910885 agaagaagtcgaactctgacttaagttttaactaaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaa 17910984  T
Q  108 acaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17910985 acaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttacgaagtcttaaacttctcaacaaccggatga 17911084  T
Q  208 tgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17911085 tgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatttatt 17911131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 11326774 - 11327022
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326774 tgagaagaattcgaactctaacttaagttctaactgaatctttgactctgagcttcagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 11326873  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11326874 aaacaatcaaattggattgtgaaattataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaactttttaacaaccggat 11326973  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11326974 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 11327022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22476830 - 22476607
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  22476830 tgagaagaagccgaactctaacttaagttcagactgatgctttcactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatagttaaa 22476731  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22476730 aa-caatcaaatcaaattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 22476632  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22476631 aatgtaggttgatgagcagcctcga 22476607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 35436099 - 35435851
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35436099 tgagaagaggccgaactctgacttaagttctgactaaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 35436000  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35435999 caacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactccaacactgtattttgaaattataatgcaaacttaccaagtcttaaacttctcaacaaccggat 35435900  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35435899 gatgtaggttgatgatcagcctcgaacctgacaaattgttacatatatt 35435851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 54648642 - 54648890
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||  |||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54648642 tgagaagaaatcgaactttgacttaagttctaagtgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcatgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 54648741  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54648742 aaacaatcaaattggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtctcaaacttctcaacaaccggat 54648841  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54648842 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 54648890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23192655 - 23192407
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  23192655 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattaaataaacatggtctaa 23192556  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23192555 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataggttactctaatactgtactatgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 23192456  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23192455 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacttgatcaattgttacatatatt 23192407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16340794 - 16340549
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16340794 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaaaaaacatggtcaaa 16340695  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16340694 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttcttaacaaccggat 16340595  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     || ||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16340594 gatataggttgatg---agcctcaaacctgaccaattgttacatatatt 16340549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 12169066 - 12169314
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  12169066 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacaaaaacaattcaagaaagatggtcaaa 12169165  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  12169166 caacaattaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattttgaaatcataatgcaaaattactaagtattaaacttctcaacaaccagat 12169265  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12169266 gatgtaggttgatgagcatcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 12169314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 31370150 - 31370397
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31370150 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttttaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcatgacaacaatttaagaaccatggtcaaa 31370248  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31370249 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 31370348  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31370349 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 31370397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 52854577 - 52854817
Alignment:
Q  10 aagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaac 109  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52854577 aagaagtcaaactctgacttaagttctaactgaaactttgactatgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacattgtcaaaaaac 52854676  T
Q  110 aatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatg 209  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  52854677 aatcaaatcaaactgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagatgatg 52854776  T
Q  210 taggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacata 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  52854777 taggttgatgagcagcctcaaacctgaccaattgttacata 52854817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 917774 - 917574
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  917774 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 917675  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  917674 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 917575  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  917574 t 917574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 6105247 - 6105494
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | |||    
T  6105247 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttttaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcatgacaagaattcaagaaacatgttaaaa 6105345  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6105346 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttgctctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 6105445  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6105446 gatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 6105494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 44073890 - 44074090
Alignment:
Q  54 tgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtat 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  44073890 tgagcttgagaagtgttaagttcacgacaacaattcaagaaacatggtcaataaacaatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtat 44073989  T
Q  154 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatat 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  44073990 tgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttttcaacaaccggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatctat 44074089  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  44074090 t 44074090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 49112198 - 49111948
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  49112198 tgagaagaagtcgaactatgacttaagttctaactgtagctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacaacaacaattcaagaaacatggtaaaa 49112099  T
Q  106 aaa--caatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccgg 203  Q
    |||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49112098 aaaaacaatcaaattggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaatttactaagtcttaaacttctcaacaaccgg 49111999  T
Q  204 ataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  49111998 atgatgtaggttgatgagcagcctcaaacctgaccaattgttacatatatt 49111948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 21700690 - 21700938
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21700690 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttaactctgagcttgagaagtgttaaggttatgacaacaattcaagaaacattgtcaaa 21700789  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21700790 aaacaaccaaatcggattgtgaactaataagttactctaacactatattgtgaaatcataatgcaaatttactcagtcttaaacttctcaacaaccggat 21700889  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21700890 gatgtaggttgacgagcagccttgaacctgaccaattgttacatatatt 21700938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48975806 - 48975558
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  48975806 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactccgaacttgagaagtgctaaggttacgacgacaattcaaggaacatggtcaaa 48975707  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  48975706 aaacaatcgaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttattaagtcttaaacttctcaacaaccggct 48975607  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48975606 gatgtaggttgatgaacagtctcgaacctgaccaattgttacatatatt 48975558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50740482 - 50740297
Alignment:
Q  11 agaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaa-c 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50740482 agaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgaaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaaac 50740383  T
Q  110 aatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50740382 aatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaactcataatgtaaacttactaagtcttaaacttctca 50740297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 195
Target Start/End: Original strand, 50772372 - 50772557
Alignment:
Q  11 agaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaac- 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  50772372 agaagtcgaactctgacttaagttctaactgaagctttgactctgagcttgaaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtaaaaaaaca 50772471  T
Q  110 aatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50772472 aatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaactcataatgtaaacttactaagtcttaaacttctca 50772557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 135
Target Start/End: Original strand, 28165211 - 28165347
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacga-------caacaattcaagaaacat 98  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||       |||||||| |||||||||    
T  28165211 tgagaataagccgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctgagcttgagaagtgtgaaggtcatgagtcatgacaacaatttaagaaacat 28165310  T
Q  99 ggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28165311 ggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataa 28165347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 254
Target Start/End: Original strand, 18742115 - 18742168
Alignment:
Q  201 cggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18742115 cggatgatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 18742168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 19507 - 19753
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  19507 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatgg--aaa 19604  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19605 aaaaaatcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 19704  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19705 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 19753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12929 - 12683
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  12929 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctaagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaataaacatggtaaaa 12830  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12829 aaa--atcaaattagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 12732  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12731 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 12683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 153299 - 153547
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  153299 tgagaagaagccgaactctaacttaagttctgactgtagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgataacaattcaagaaacatggtcaaa 153398  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  153399 aaataatcaaatcagattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaattcttaaacttctcaacaaccggat 153498  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  153499 gatgtaggttgatgagcaacctcaaacctgactaattgttacatatatt 153547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 254
Target Start/End: Original strand, 65764 - 66007
Alignment:
Q  11 agaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaaca 110  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  65764 agaagccgaactccgacttaagttctgactgaagctttgactctgagcttcagaagtgttaaggttacgacaacaattcaagaaaaatggtcaaaaaaca 65863  T
Q  111 atcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  65864 atcaaattagactgtgaaataataagttactctaacattgtattgttaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggttgatgt 65963  T
Q  211 aggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    |||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  65964 aggttgatgaacaaccacgaacctgaccaattgttacatatatt 66007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9051 - 8804
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9051 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 8953  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8952 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 8853  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8852 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 8804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 249
Target Start/End: Original strand, 13978 - 14221
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13978 tgaggagaagtcgaactctgacttaagttttgactgatgctttgactatgagcttgagaattgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatgatcaaa 14077  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14078 aaacaatcaaatcagattgtgaaataatattttactctatcattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 14177  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14178 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctaaccaattgttacat 14221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 27492 - 27739
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27492 tgagaagaagtcgaactctgacttacgttctaactgaag-tttgactctgagcttgagaagtgttaaagtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 27590  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27591 aaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactctaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccagat 27690  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27691 gatgtaggttgatgagcaacctcgaacctgaccaattgttacatatatt 27739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 49191 - 48943
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49191 tgagaagaagccgaactctgacttaagttttgactgaagctttgactctgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggttaaa 49092  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49091 taacaatcaaatctgattgtgaaattataagttactctaacactgtattttgaaatcataatgcaaatttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 48992  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48991 gatgtaggttgatgtgcattctcgaacctgaccaattgttacatatatt 48943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 119165 - 118917
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||    
T  119165 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgaagctttgactatgagcttgagaagtgttaaggtcatggcaacaattgaagaaacatggtcgaa 119066  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119065 aaacaatcaaatcagattgtaaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggat 118966  T
Q  206 aatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     | ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  118965 caagtaggatgatgagtagcctcgaacctgaccaattgttttatatatt 118917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 118661 - 118592
Alignment:
Q  144 aacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtagg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  118661 aacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggatcatgtagg 118592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 49989 - 49896
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatg 99  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  49989 tgagaagacgtcgaactctgacttatgctctgactgaagctttgactatgagcttgagaagtgttaaggtcacggcaacaattgaagaaacatg 49896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 57522 - 57429
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatg 99  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  57522 tgagaagacgtcgaactctgacttatgctctgactgaagctttgactatgagcttgagaagtgttaaggtcacggcaacaattgaagaaacatg 57429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 231745 - 231552
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaa 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  231745 tgagaagaagccgaactctgacttaagttctgactgatgttttgactctaagcttgaaaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaaaatggtcaaa 231646  T
Q  106 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  231645 aaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaa 231552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 5392 - 5633
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatg----gt 101  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||           |||||||||||| ||||||    ||    
T  5392 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctgtgcttgagaagtgt-----------caacaattcaaggaacatgcatggt 5480  T
Q  102 caaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaacc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5481 caaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaacaccgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaacc 5580  T
Q  202 ggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5581 agataatttaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 5633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 11841 - 12082
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatg----gt 101  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||           |||||||||||| ||||||    ||    
T  11841 tgagaagaagtcgaactctgacttaagttctgactgatgctttgactctgtgcttgagaagtgt-----------caacaattcaaggaacatgcatggt 11929  T
Q  102 caaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaacc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11930 caaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactctaatactttattttgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaacc 12029  T
Q  202 ggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12030 agataatttaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 12082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1884 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold1884
Description:

Target: scaffold1884; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 863 - 705
Alignment:
Q  96 catggtcaaaaaacaatcaaatcagattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  863 catggtcaaaaaacaatcaaatcggattgtgaaataataagttactttaacattgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctta 764  T
Q  196 acaaccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  763 acacccggataatgtaggttgatgagcagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1884; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 933 - 862
Alignment:
Q  6 tgagaagaagacgaactctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtca 77  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  933 tgagaagaagtcgaactctgacttaaattctaactgaagctttgaatctgagcttgagaagtgttaaggtca 862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 254
Target Start/End: Original strand, 16576 - 16710
Alignment:
Q  120 gattgtgaaataataatttactcaaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttactaagtcttaaacttctcaacaaccggataatgtaggttgatg 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16576 gattgtgaaataataagttactctaacactgtattgtgaaatcataatgcaaacttattaagtcttaaacttctcaacaaccggatgatgtaggttgatg 16675  T
Q  220 agcagcctcgaacctgatcaattgttacatatatt 254  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16676 agaagcctcgaacctgaccaattgttacatatatt 16710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2007 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold2007
Description:

Target: scaffold2007; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Original strand, 109 - 204
Alignment:
Q  21 ctctaacttaagttctgattgatgctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaa 116  Q
    |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109 ctctgacttaagttctaactgaagctttgactttgagcttgagaagtgttaaggtcacgacaacaattcaagaaacatggtcaaaaaacaatcaaa 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University