View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19718_low_8 (Length: 460)

Name: NF19718_low_8
Description: NF19718
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19718_low_8
NF19718_low_8
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (47-441)||(4734444-4734837)
chr5 (39-441)||(43511426-43511827)
chr5 (39-438)||(42291734-42292133)
chr5 (83-433)||(20975800-20976151)
chr5 (39-433)||(3349584-3349975)
chr5 (48-434)||(29156004-29156390)
chr5 (39-441)||(10591128-10591526)
chr5 (38-392)||(17513790-17514154)
chr5 (83-429)||(5829213-5829549)
chr5 (88-435)||(40956107-40956475)
chr5 (160-318)||(138075-138233)
chr5 (83-316)||(27351282-27351516)
chr5 (94-319)||(13474559-13474787)
chr5 (108-435)||(19099236-19099582)
chr5 (160-364)||(17325725-17325934)
chr5 (108-434)||(26377695-26378042)
chr5 (108-434)||(12661102-12661451)
chr5 (160-418)||(13656023-13656300)
chr5 (160-306)||(10033489-10033636)
chr5 (161-277)||(18873425-18873545)
chr5 (84-246)||(33281677-33281840)
chr5 (160-441)||(13423652-13423954)
chr5 (174-319)||(16515454-16515599)
chr5 (160-307)||(36718540-36718689)
chr5 (83-314)||(40779127-40779357)
chr5 (83-196)||(8379340-8379453)
chr5 (160-245)||(7390375-7390460)
chr5 (330-433)||(8398778-8398884)
chr5 (160-440)||(931168-931464)
chr5 (192-325)||(23069144-23069277)
chr5 (326-376)||(26311864-26311915)
chr5 (322-416)||(40778663-40778761)
chr5 (326-425)||(36718723-36718824)
chr5 (204-249)||(37029051-37029096)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (37-435)||(48626882-48627279)
chr3 (38-434)||(43905707-43906076)
chr3 (114-435)||(51939483-51939822)
chr3 (110-436)||(23164496-23164838)
chr3 (174-441)||(41707044-41707328)
chr3 (160-318)||(42009237-42009395)
chr3 (108-441)||(46791619-46791970)
chr3 (108-433)||(21784705-21785048)
chr3 (175-441)||(8363963-8364246)
chr3 (160-319)||(36538161-36538320)
chr3 (110-319)||(18408121-18408331)
chr3 (108-441)||(23067646-23067998)
chr3 (160-435)||(52655097-52655390)
chr3 (160-436)||(29387728-29388022)
chr3 (160-308)||(50677289-50677437)
chr3 (108-307)||(25599009-25599208)
chr3 (173-307)||(7767005-7767139)
chr3 (165-318)||(27303118-27303271)
chr3 (174-320)||(21596264-21596410)
chr3 (83-263)||(46904728-46904908)
chr3 (160-319)||(28132710-28132870)
chr3 (160-319)||(54430482-54430642)
chr3 (161-319)||(40152105-40152264)
chr3 (161-319)||(1649807-1649965)
chr3 (108-435)||(24252416-24252762)
chr3 (173-247)||(13401461-13401535)
chr3 (160-436)||(6715247-6715528)
chr3 (84-316)||(19965776-19966013)
chr3 (326-441)||(27110962-27111079)
chr3 (160-325)||(51146861-51147027)
chr3 (160-441)||(27729743-27730040)
chr3 (160-278)||(1255027-1255143)
chr3 (111-242)||(15987207-15987338)
chr3 (160-246)||(20762052-20762139)
chr3 (326-434)||(51064299-51064408)
chr3 (326-376)||(18408050-18408101)
chr3 (374-441)||(29843864-29843931)
chr3 (174-249)||(4207347-4207418)
chr3 (337-377)||(54430411-54430452)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (39-441)||(34523808-34524207)
chr8 (39-436)||(39697793-39698188)
chr8 (46-404)||(12531406-12531761)
chr8 (47-393)||(23567138-23567480)
chr8 (83-429)||(32098075-32098438)
chr8 (160-435)||(44665020-44665308)
chr8 (161-433)||(5869298-5869579)
chr8 (160-441)||(43926297-43926596)
chr8 (160-319)||(3628722-3628881)
chr8 (108-436)||(7857883-7858227)
chr8 (160-435)||(13585098-13585389)
chr8 (108-319)||(18420531-18420744)
chr8 (160-319)||(43968044-43968205)
chr8 (108-277)||(3471572-3471742)
chr8 (166-307)||(30915268-30915410)
chr8 (161-277)||(27074546-27074663)
chr8 (152-421)||(29372180-29372454)
chr8 (175-319)||(35874854-35875000)
chr8 (108-262)||(18112103-18112259)
chr8 (84-319)||(42777683-42777911)
chr8 (160-247)||(1004060-1004150)
chr8 (190-319)||(42951774-42951908)
chr8 (322-434)||(41666088-41666196)
chr8 (326-373)||(3445544-3445591)
chr8 (333-441)||(18111606-18111717)
chr8 (161-314)||(33452728-33452880)
chr8 (181-263)||(42076094-42076176)
chr8 (326-441)||(3471385-3471504)
chr8 (83-229)||(36515053-36515200)
chr8 (330-376)||(18420770-18420817)
chr8 (326-441)||(27074377-27074494)
chr8 (326-365)||(1003958-1003998)
chr8 (388-433)||(12531360-12531405)
chr8 (326-436)||(42951928-42952042)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (84-435)||(12971219-12971571)
chr1 (83-427)||(27703427-27703787)
chr1 (102-319)||(5560413-5560631)
chr1 (115-441)||(33124559-33124905)
chr1 (84-319)||(15441220-15441455)
chr1 (108-433)||(48722292-48722637)
chr1 (83-303)||(50371080-50371301)
chr1 (160-319)||(24556736-24556895)
chr1 (161-435)||(51110076-51110369)
chr1 (160-319)||(12884112-12884272)
chr1 (160-434)||(17487257-17487551)
chr1 (160-319)||(37873737-37873897)
chr1 (108-316)||(6150653-6150864)
chr1 (110-435)||(20905210-20905556)
chr1 (160-311)||(42740048-42740199)
chr1 (161-319)||(17674330-17674487)
chr1 (108-320)||(10109647-10109862)
chr1 (160-441)||(14084674-14084973)
chr1 (108-364)||(30899526-30899800)
chr1 (108-425)||(50552301-50552637)
chr1 (108-319)||(25930532-25930745)
chr1 (83-258)||(13120764-13120939)
chr1 (94-441)||(18127844-18128212)
chr1 (110-377)||(29208022-29208303)
chr1 (83-304)||(44836623-44836840)
chr1 (161-311)||(22386812-22386963)
chr1 (84-324)||(1269484-1269716)
chr1 (185-435)||(52055347-52055616)
chr1 (108-276)||(28885593-28885762)
chr1 (83-275)||(9777387-9777580)
chr1 (160-319)||(26486348-26486499)
chr1 (160-250)||(30004882-30004972)
chr1 (108-247)||(9-149)
chr1 (160-319)||(6333491-6333650)
chr1 (326-441)||(20470519-20470637)
chr1 (175-319)||(3907402-3907545)
chr1 (342-435)||(6150503-6150599)
chr1 (189-309)||(38263804-38263924)
chr1 (231-314)||(31369435-31369518)
chr1 (255-319)||(28189327-28189391)
chr1 (157-209)||(31369376-31369428)
chr1 (327-409)||(1269382-1269468)
chr1 (326-376)||(12884292-12884343)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (48-436)||(45172510-45172895)
chr4 (83-435)||(34982038-34982391)
chr4 (47-433)||(55134024-55134410)
chr4 (108-441)||(53011507-53011854)
chr4 (38-317)||(5545261-5545539)
chr4 (83-319)||(35653878-35654114)
chr4 (161-434)||(21791523-21791816)
chr4 (160-441)||(32130764-32131062)
chr4 (108-441)||(19661172-19661521)
chr4 (108-433)||(11681664-11682008)
chr4 (108-433)||(11689943-11690287)
chr4 (160-425)||(28463562-28463845)
chr4 (160-364)||(22423560-22423775)
chr4 (160-316)||(23426140-23426298)
chr4 (160-435)||(27632199-27632488)
chr4 (160-318)||(43154763-43154921)
chr4 (108-319)||(41038178-41038392)
chr4 (160-433)||(23256394-23256683)
chr4 (160-441)||(29221595-29221896)
chr4 (111-263)||(10575450-10575601)
chr4 (175-319)||(24449054-24449200)
chr4 (108-306)||(29579823-29580022)
chr4 (108-277)||(44478011-44478182)
chr4 (218-441)||(21168848-21169088)
chr4 (195-319)||(16072523-16072648)
chr4 (218-416)||(26329065-26329278)
chr4 (326-434)||(39372816-39372927)
chr4 (326-426)||(29579654-29579757)
chr4 (337-379)||(16072268-16072310)
chr4 (323-433)||(51066738-51066851)
chr4 (330-441)||(41038040-41038154)
chr4 (108-210)||(51066347-51066449)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (39-441)||(26282395-26282798)
chr7 (39-436)||(1365822-1366218)
chr7 (46-436)||(40001573-40001946)
chr7 (83-429)||(26633172-26633529)
chr7 (253-433)||(25609907-25610087)
chr7 (85-319)||(32956704-32956940)
chr7 (160-436)||(33909863-33910154)
chr7 (83-311)||(36438249-36438477)
chr7 (173-425)||(18015570-18015837)
chr7 (94-435)||(46221610-46221969)
chr7 (185-433)||(8358294-8358558)
chr7 (37-316)||(42311943-42312221)
chr7 (39-224)||(25610091-25610275)
chr7 (168-319)||(9479057-9479208)
chr7 (152-364)||(7366565-7366784)
chr7 (85-319)||(30739052-30739288)
chr7 (108-435)||(42161044-42161389)
chr7 (108-435)||(36796293-36796636)
chr7 (83-319)||(41852197-41852432)
chr7 (165-278)||(41908149-41908262)
chr7 (160-319)||(44894003-44894164)
chr7 (115-319)||(6380013-6380220)
chr7 (188-311)||(40737994-40738117)
chr7 (41-298)||(773740-773997)
chr7 (160-319)||(18895372-18895531)
chr7 (108-376)||(33419039-33419322)
chr7 (160-376)||(4099826-4100058)
chr7 (195-435)||(25061702-25061957)
chr7 (108-262)||(12251210-12251365)
chr7 (175-277)||(7636316-7636418)
chr7 (326-436)||(12251542-12251655)
chr7 (160-376)||(11672442-11672676)
chr7 (83-319)||(28590041-28590274)
chr7 (326-433)||(38524984-38525094)
chr7 (120-408)||(40841180-40841485)
chr7 (39-325)||(3799618-3799898)
chr7 (160-312)||(44876131-44876276)
chr7 (339-435)||(27432390-27432489)
chr7 (337-377)||(32956449-32956489)
chr7 (284-319)||(12251487-12251522)
chr7 (386-429)||(41907994-41908037)
chr7 (394-436)||(2263933-2263975)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (39-433)||(18172797-18173187)
chr2 (39-441)||(17117500-17117893)
chr2 (83-441)||(15457309-15457667)
chr2 (38-435)||(18915907-18916304)
chr2 (39-441)||(38985564-38985954)
chr2 (38-337)||(21747085-21747382)
chr2 (108-441)||(26151669-26152019)
chr2 (160-441)||(13020213-13020513)
chr2 (160-433)||(19367393-19367683)
chr2 (83-309)||(36059803-36060029)
chr2 (157-319)||(1418840-1419001)
chr2 (161-319)||(39081328-39081485)
chr2 (160-433)||(42411532-42411822)
chr2 (108-441)||(45618768-45619118)
chr2 (175-440)||(18676301-18676583)
chr2 (108-433)||(7993433-7993775)
chr2 (160-364)||(13997190-13997403)
chr2 (108-435)||(41096459-41096806)
chr2 (157-416)||(27302500-27302771)
chr2 (161-316)||(29480613-29480768)
chr2 (160-436)||(25222119-25222413)
chr2 (160-307)||(6530601-6530749)
chr2 (161-374)||(1226242-1226465)
chr2 (175-442)||(2063599-2063879)
chr2 (160-436)||(4855786-4856083)
chr2 (160-433)||(45042187-45042482)
chr2 (83-429)||(31273063-31273426)
chr2 (162-319)||(34061832-34061990)
chr2 (112-434)||(36481204-36481532)
chr2 (83-248)||(38599403-38599567)
chr2 (160-376)||(12269285-12269514)
chr2 (384-441)||(21747902-21747959)
chr2 (167-278)||(18482488-18482600)
chr2 (326-376)||(6530518-6530568)
chr2 (160-229)||(42759730-42759800)
chr2 (236-377)||(9029471-9029625)
chr2 (326-436)||(42759903-42760015)
chr2 (236-313)||(13001581-13001658)
chr2 (250-311)||(32186215-32186276)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (37-435)||(1092894-1093290)
chr6 (47-441)||(29308330-29308723)
chr6 (171-435)||(1690619-1690884)
chr6 (46-435)||(31860815-31861187)
chr6 (110-425)||(2618163-2618495)
chr6 (108-436)||(6360558-6360901)
chr6 (110-436)||(6754003-6754346)
chr6 (162-319)||(12614692-12614850)
chr6 (83-438)||(19231407-19231779)
chr6 (108-422)||(57498-57830)
chr6 (160-441)||(3514824-3515124)
chr6 (83-307)||(30915259-30915488)
chr6 (160-307)||(3748543-3748690)
chr6 (108-262)||(628018-628172)
chr6 (160-434)||(29400939-29401230)
chr6 (109-307)||(29149345-29149544)
chr6 (108-319)||(7525089-7525301)
chr6 (326-436)||(24455016-24455129)
chr6 (352-435)||(5877009-5877091)
chr6 (160-247)||(21946109-21946196)
chr6 (108-241)||(22503751-22503885)
chr6 (161-319)||(11088486-11088635)
chr6 (165-278)||(350385-350499)
chr6 (87-224)||(6294279-6294416)
chr6 (326-441)||(31258612-31258731)
chr6 (180-290)||(14893412-14893522)
chr6 (354-441)||(12622144-12622233)
chr6 (231-364)||(7341087-7341227)
chr6 (204-249)||(31234911-31234956)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (108-436)||(16501-16852)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (160-429)||(46148-46433)
[»] scaffold0181 (2 HSPs)
scaffold0181 (110-319)||(17056-17268)
scaffold0181 (338-440)||(18128-18233)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (160-403)||(8368-8622)
[»] scaffold0564 (2 HSPs)
scaffold0564 (108-224)||(1086-1203)
scaffold0564 (234-320)||(1001-1088)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (326-436)||(22919-23032)
scaffold0035 (160-224)||(22779-22844)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 47 - 441
Target Start/End: Original strand, 4734444 - 4734837
Alignment:
Q  47 aagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4734444 aagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaattaagtgaaagagatgtagaatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgg 4734543  T
Q  147 gacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaat 246  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4734544 gaaatgggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgagtgatcaagggattatacaaat 4734643  T
Q  247 tggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttattt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4734644 tggtggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacatgtaaagaagtaacatatatattttttattt 4734743  T
Q  347 aagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  4734744 aagt-ggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcattttgcactccctcaaggccgggc 4734837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 39 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 43511827 - 43511426
Alignment:
Q  39 agaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatc 138  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43511827 agaatcagcagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcgtttggatttgtcacttatc 43511729  T
Q  139 cgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgatt 238  Q
    || ||||||| | || | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43511728 cgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttccatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgatt 43511629  T
Q  239 atacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43511628 atacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 43511529  T
Q  339 ttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctg 438  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43511528 ttttatttaagtggaggtgggtattagatttaattttttctgaggcccatagcttttggaggtccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggccg 43511429  T
Q  439 ggc 441  Q
    |||    
T  43511428 ggc 43511426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 39 - 438
Target Start/End: Original strand, 42291734 - 42292133
Alignment:
Q  39 agaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnn-ttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttat 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  42291734 agaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttaccaacgatgacatttggatttgtcacttat 42291833  T
Q  138 ccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgat 237  Q
    |||| |||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42291834 ccgcggtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgattaagtgat 42291933  T
Q  238 tatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatat 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42291934 tatacaaattggtggtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtttagaaaaaagtcaaacgtgtaaagaagtaacatatatat 42292033  T
Q  338 tttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggct 437  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42292034 tttttatttaagtgggcgtgagtattagagttaattttttctgaggcctatagcttttggaggcccggc-taattgagcaccttgcactccctcaaggct 42292132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20976151 - 20975800
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaa 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   || || |||| ||||||||||||||||||    
T  20976151 ttaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaagacgaaaacgaatagtttatgtgaaaaagaaa 20976052  T
Q  183 ttattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaaga 282  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20976051 tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccaaatttatgtcaaga 20975952  T
Q  283 taggagaactaaagtctagaa--aaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatg 380  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20975951 taagagaactaaagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtggaggtgggtattagagttaa-tttttctg 20975853  T
Q  381 aggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20975852 aggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 20975800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 39 - 433
Target Start/End: Original strand, 3349584 - 3349975
Alignment:
Q  39 agaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatc 138  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||        || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3349584 agaatcagaagagtttctaaacatgaaactaaatacaaaaaac-ttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcacttatc 3349682  T
Q  139 cgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgatt 238  Q
    || ||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  3349683 cgttgtgggaaaggggaaaacgaacggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 3349782  T
Q  239 atacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 338  Q
    || | ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3349783 attccaattggtagtggtttgat-gtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatgtatt 3349881  T
Q  339 ttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3349882 ttttatttaagt-gaggtgggtattacaattaattttatcggaggcccatagattttggaggcctgacttgattgagcatcttgcactccctcaa 3349975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 48 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 29156390 - 29156004
Alignment:
Q  48 agagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtggg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||        |||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29156390 agagcttctaaacatgaaacaaaatacaaaaaaa-ttaattgaaagagaggtagaatttactaacggtatcgtttgaatttgtcacttatccgttgtggg 29156292  T
Q  148 acatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaatt 247  Q
    | | |||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29156291 aaaggggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaatt 29156192  T
Q  248 ggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt-ttttattt 346  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29156191 aggggtggtttgatagtaccagatttatgttcagataggataactatagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatttttttattt 29156092  T
Q  347 aagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaag 434  Q
    || | | ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29156091 aaatagaggtgggtattagatttaattttttctgaggtccataacttttggaggtccggtttgattgagcatcttgcactccctcaag 29156004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 39 - 441
Target Start/End: Original strand, 10591128 - 10591526
Alignment:
Q  39 agaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatc 138  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||    
T  10591128 agaatcagaatagtttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgccgtttggattgattacttatc 10591226  T
Q  139 cgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgatt 238  Q
    || ||||||| | |||| || ||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||    
T  10591227 cgttgtgggaaaggggataacgaatgatttttgtgaaaaataaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattaactgattaagtgatt 10591326  T
Q  239 atacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||    
T  10591327 atacaaattgggggtggtttgatagtaccatatttatgttcagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaaaaaagaac--atatatt 10591424  T
Q  339 ttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctg 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10591425 ttttatttaaatgggggtgggtattagagttga-tttttctaaagcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggccg 10591523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 38 - 392
Target Start/End: Original strand, 17513790 - 17514154
Alignment:
Q  38 tagaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttat 137  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||| ||||   || ||||||||||||||||||    
T  17513790 tagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagaggtagaatttaccaacgacctcgtttggatttgtcacttat 17513888  T
Q  138 ccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgat 237  Q
    ||| ||||||| | || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  17513889 ccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcagtgaaataacttttcaaattgactgattaagtgat 17513988  T
Q  238 tatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaac-------- 329  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||            
T  17513989 tatacaaattgggggtggtttgttagtaccagatttatatccagataggagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgtaaagaagtaacattttttt 17514088  T
Q  330 ---atatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagct 392  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  17514089 tttatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagatttaatttttttttaggcccatagct 17514154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 83 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5829549 - 5829213
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaa 182  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| | || | || |||||||||||||||||||||||    
T  5829549 ttaagtgaaagagaggtagagtttactaacagtgtcgtttggatttgtcacctatccgttgtaggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaa 5829450  T
Q  183 ttattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaaga 282  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5829449 tgattgttgtgattcttttaatgaaatagcttt--aaattgactgattaagtgattatacaaattgaggttggtttgatagtaccagatttatgtcaaga 5829352  T
Q  283 taggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgag 382  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  5829351 taggagaactaaagtctataaaaaactcaaacgt--------gtaacatacatattttttatttaaatgggggtgggtattaaggttaattttttctgag 5829260  T
Q  383 gcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccc 429  Q
     ||||||  |||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  5829259 acccataatttttagaggtctgacttaattgagcaccttgcactccc 5829213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 88 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 40956475 - 40956107
Alignment:
Q  88 tgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattat 186  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||  ||||||| | |||| || ||||||| ||||  |||||||||| ||    
T  40956475 tgaaagagaggtgaaatttatctaacggcgtcgtttggatttgtcactcttccattgtgggaaaggggaaaacgaatggtgtatgcaaaaaagaaatgat 40956376  T
Q  187 tgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagatagg 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |   ||||||| | | |||||||||||| | | |||    
T  40956375 tgttgtgattcttttaatgaaatagtttttcaaattaaatgattaagtgattatacaaattggagaatgtttgattgcatcagatttatgtccacaaagg 40956276  T
Q  287 agaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg--------taaagaagtaacatatata-----------ttttttatttaagtgggg-gtgggtattaga 366  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||           ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40956275 agaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgaagaaagaaaaagaagtaacatatatatatatatattttttttaatttaagtggggtgtgggtattaga 40956176  T
Q  367 gttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
     |||||||||| | ||| |||||||||||||||| || | ||| ||||||  ||||||| ||| |||||    
T  40956175 cttaatttttttttagggccatagcttttggaggtccagtttggttgagctacttgcacacccccaagg 40956107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 138233 - 138075
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  138233 gaatggtttatgcggaaaaaaaataattgttgtgattatttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttg 138134  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 318  Q
    |||| | || |||||||||   | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  138133 atagcatcaaatttatgtccgaaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgt 138075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27351516 - 27351282
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||| |   || ||||| |||||||||  ||||||||    
T  27351516 ttaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatagtgtcgtttagatttgtcactcctccgttgtgggaaagaagaaaatgactggtttatgcaaaaaagaa 27351417  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || |||   || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  27351416 atgatttaggttattctttcaatgaaataactttccaaattgactgattaagtggttatacaaattggaggtggtttgatagcaccaaatttatgttcag 27351317  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 316  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27351316 aaaggagaactagagtctagaaaaatctcaaacgt 27351282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13474787 - 13474559
Alignment:
Q  94 agaggtataattta-ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttg 191  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  13474787 agaggtaaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttg 13474688  T
Q  192 tgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaac 291  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | | ||||||    
T  13474687 tgattctttcaatgaaacaacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaac 13474588  T
Q  292 taaagtctag-aaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13474587 tagagtttagaaaaaaactcaaacgtgta 13474559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 435
Target Start/End: Original strand, 19099236 - 19099582
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||| |  ||  | || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19099236 ctaacggtgtcgtttggatttgtcacttctcggttgtggaaagtgataaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 19099335  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaa 306  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||  | | |||||||||| |||||| |||||    
T  19099336 aatagctttttaaattgactgattaagtgattatacaaattagggatggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactatagtctaaaaaaa 19099435  T
Q  307 a---ctcaaacgtgt------aaag---aag----taacatatatattttttatttaagtggggg-tgggtattagagttaattttttat--gaggccca 387  Q
    |   ||||||| |||      ||||   |||    ||||| || | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||     
T  19099436 aaaactcaaacatgtgccgaaaaaggaaaaggatataacacattt-ttttttatttaaatggggggtgggtattagacttaattttttgtttgaggcccg 19099534  T
Q  388 tagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    |||  |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||    
T  19099535 tagtatttggaggcccgacctggttgagcaccttgcactcccacaagg 19099582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17325934 - 17325725
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatag-attttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||    
T  17325934 gaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttcaaattgactgattaagtgattattcaaatcgatggtagttt 17325835  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt----aaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggg 354  Q
     |||| | || ||||||||| ||| ||  |||||| |||||| |||||||||| |||| |    ||| ||  ||||||||  ||||| |||||||||||     
T  17325834 aatagcatcaaatttatgtccagaaagtggaactagagtctaaaaaaaactcatacgtctgaaaaaaaaaaaaacatataattttttaatttaagtggga 17325735  T
Q  355 gtgggtatta 364  Q
    ||||||||||    
T  17325734 gtgggtatta 17325725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 434
Target Start/End: Original strand, 26377695 - 26378042
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa--aaagaaattattgttgtgattctttcaatg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||  | | || | || |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26377695 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctcagttgtgaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 26377794  T
Q  206 aaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag--aa 303  Q
    |||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| |||||||  ||    
T  26377795 aaatagcttctcacattgactgaataagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaa 26377894  T
Q  304 aaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt--gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggccc 386  Q
    ||||||||||||||   |||||||           |||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||  |  ||| |||    
T  26377895 aaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaaaatataacatatatattttttatttaagtgggggggtgattattagatttaatttttcgttagagaccc 26377994  T
Q  387 atagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaag 434  Q
     |||  |||| ||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  26377995 gtagaatttgaaggcccgacctggttgagcaccttgcacaccctcaag 26378042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12661451 - 12661102
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12661451 ctaacagtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatattgttgtgattctttcaatga 12661352  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgt------caagataggagaactaaagtcta 300  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||| |       || | |  | ||||| ||||||    
T  12661351 aatagctttccaaattgactggttaagtgattatacaaattagaggtggtttgatagaatccgatttatatacaaaaaaaaaaaaaaaaactagagtcta 12661252  T
Q  301 gaaaaaactcaaacgtgt-------------aaagaagtaacatatatattttttatttaagtgg-gggtgggtattagagttaatttttt--atgaggc 384  Q
    ||||||||||||||||||             || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||   |||||     
T  12661251 gaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgaaataacatatatattttttatttaagtggagggtagatattagatttaattttttgattgaggt 12661152  T
Q  385 ccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaag 434  Q
    || |||| ||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||    
T  12661151 ccgtagcatttggaggcccgatctggttgagcaccttgcacaccctcaag 12661102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 13656300 - 13656023
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaatt---ggtggtgg 255  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||      
T  13656300 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattagggatggttt 13656201  T
Q  256 tttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatatttttt 342  Q
    |||  ||| | | |||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||           |||||||||||||||||    
T  13656200 ttttttaggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatttttt 13656101  T
Q  343 atttaagtgggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcac 418  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  |  |||||||  ||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  13656100 atttaagtggaggtggttattagatttaatttttcgttagaggcccgaagtatttggaggcccagcctgattgagcac 13656023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10033636 - 10033489
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgac--tgatcaagtgattatacaaattggtggtggtt 257  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10033636 gaatggtttatgcgaaaaagaaataattattgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattgactttaatc-agtgattatacaaattgatgggggtt 10033538  T
Q  258 tgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaa 306  Q
    |||||| | || ||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  10033537 tgatagcatcaaatttatgtacagaaagtagaactagagtctagaaaaa 10033489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18873545 - 18873425
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattataca----aattggtggtggt 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    ||||| |||||||    
T  18873545 aatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattggctgattaagtggttatacaaattaattgatggtggt 18873446  T
Q  257 ttgatagtaccagatttatgt 277  Q
    ||||||| | || ||||||||    
T  18873445 ttgatagcatcaaatttatgt 18873425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33281840 - 33281677
Alignment:
Q  84 taagtgaaagagaggtataatttact-aacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaa 182  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| | || | |   ||||||||||| ||||||||||    
T  33281840 taagtgaaagagaggtgaaatttacttaacgatgtcgtttgaatttgtcactcatccgttgtgggaaaaggaaaagcaaatggtttatgcgaaaaagaaa 33281741  T
Q  183 ttattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaat 246  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33281740 tgattattgggattctttcaatgaaataactttttaaattgactaattaagtgattatacaaat 33281677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13423954 - 13423652
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  13423954 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgattgattaagtgattatacaaattaggaatggttt 13423855  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtct----agaaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttt 341  Q
    ||||| | | |||||||||  | | | |||||||| |||||    | |||||||||| |||||   |||||||           ||||||||||||||||    
T  13423854 gataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctaaaaaaaaaaaactcatacgtgtgctaaagaaagaaaaggatataacatatatattttt 13423755  T
Q  342 tatttaagtggg-ggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctg 438  Q
    |||||||||||| | | ||||||||| |||||||||  |  ||||||| || | ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  13423754 tatttaagtgggagataggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtaacatttggaggccccgcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggcgg 13423655  T
Q  439 ggc 441  Q
    |||    
T  13423654 ggc 13423652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16515599 - 16515454
Alignment:
Q  174 aaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagattt 273  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| | || ||||    
T  16515599 aaaaagaaataattgttgtgattctttcaataaaataatttttcaaattgattgattaagtgattattaaaattgatggtgttttaatagcatcaaattt 16515500  T
Q  274 atgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||||||    
T  16515499 atgtctagaaagtagaactaaagtttaaaaaaagctcatacgtgta 16515454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Original strand, 36718540 - 36718689
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa--aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtt 257  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  36718540 gaatggtttatgcgaagaaaaaaaattatggttgtgattctttcaataaaataactttacaaattgactgattaaatgattatacaaattaggggtggtt 36718639  T
Q  258 tgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaa 307  Q
    |||||| | | |||| ||||  | | |||||||||| |||||||||||||    
T  36718640 tgataggatccgattcatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaa 36718689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40779357 - 40779127
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaa-ga 180  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||  |||  ||||||| |  ||| || |||||||||||  |||||| ||    
T  40779357 ttaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatgatgtcgtttcgatttgtcactcctccattgtgggaaa--ggaaaacgaatggtttatacgaaaaaaga 40779260  T
Q  181 aattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaa 280  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| | | ||||||||  | || ||||||||  |    
T  40779259 aatgattgttgtgattcct-caatggaatagtttttcaaattgacttattaaacgattatacaaattggggatagtttgataacatcaaatttatgttca 40779161  T
Q  281 gataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaac 314  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40779160 gaaaggagaactagactctagaaaaaactcaaac 40779127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 196
Target Start/End: Original strand, 8379340 - 8379453
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttact-aacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  8379340 ttaagtgaaagagaggtgaaatttacgcaacggtgtcgtttggatttgtcactcatccgttgtggga-aggggaaaacgaatggattatgcgaaaaagaa 8379438  T
Q  182 attattgttgtgatt 196  Q
    |||||||||||||||    
T  8379439 attattgttgtgatt 8379453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 245
Target Start/End: Original strand, 7390375 - 7390460
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaa 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7390375 gaatggtttatgcgaaaaagaaataattgtcgtgattctttcgatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaa 7390460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 330 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8398884 - 8398778
Alignment:
Q  330 atatatattttttatttaagtg-ggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcact 426  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||  |  | ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  8398884 atatatattttttatttaagtggggggtgagtattagatttaatttttcgttaggggcccgtagcatttggaggtccggcctgattgagcaccttgcaca 8398785  T
Q  427 ccctcaa 433  Q
    |||||||    
T  8398784 ccctcaa 8398778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 931464 - 931168
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||     ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||     
T  931464 gaatggtttatgcgaaaaagaaatgattattgtgattctttc-----aatagctttctaaattgactgattaagtgattatacaaattgggtgtgattta 931370  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-----aaaaaactcaaacgtgt----------aaagaagtaaca----tatatatttt 340  Q
    |||| | || |||||| |  ||| | |||||||| |||||||     ||||||||||||| |||          ||||||||||||    | | | ||||    
T  931369 atagcatcaaatttatatatagaaaagagaactatagtctagaagaaaaaaaactcaaacatgtaaagaaagaaaaagaagtaacatttgtttttttttt 931270  T
Q  341 ttatttaagtgggggtgggtattagagttaat--tttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctg 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||     || ||||||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  931269 ttattaaagtgggggtgggtattagacttaattatttttttgaaagttattgcttttggaggtctggcttggttgaacaccttgtactccctcaaggctg 931170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23069277 - 23069144
Alignment:
Q  192 tgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaac 291  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | || ||||||||  ||| |||||||     
T  23069277 tgattcttgtaatgaaatagctttccaaatcgaatgattaagggattatacaaattgggggtggtttgctagcatcatatttatgttcagaaaggagaat 23069178  T
Q  292 taaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag 325  Q
    || ||| || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  23069177 tagagtataaaaaaaacacaaacgtgtaacgaag 23069144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26311915 - 26311864
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaag-tgggggtgggtattagagttaattttt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26311915 taacatatatattttttatttaagttgggggtaggtattagatttaattttt 26311864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 40778761 - 40778663
Alignment:
Q  322 gaagtaacatatatatt-ttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagc 416  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||| |  ||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  40778761 gaagtaacatatattttattttatttaagtagggggtgagtattagacttaatattttgtttgaggctcataacttttggaggcccgccttggttgagc 40778663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 425
Target Start/End: Original strand, 36718723 - 36718824
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtgggg-gtgggtattagagttaatttt--ttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| ||||  ||| ||| ||| |||| || ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  36718723 taacatatatattttttatttaagtggggagagagtattagatttatttttcgtta-gagacccgtagcattcggaggcccggcctagttgagcaccttg 36718821  T
Q  423 cac 425  Q
    |||    
T  36718822 cac 36718824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Original strand, 37029051 - 37029096
Alignment:
Q  204 tgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattgg 249  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37029051 tgaaatagctttttaaattgattgattaagtgattatacaaattgg 37029096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 37 - 435
Target Start/End: Original strand, 48626882 - 48627279
Alignment:
Q  37 ttagaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcactta 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48626882 ttagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaaataagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcatttggatttgtcactta 48626981  T
Q  137 tccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtga 236  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48626982 tccgctgtggga-atgggaaaacgaatggtttatgtgaaaaataaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtga 48627080  T
Q  237 ttatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatata 336  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48627081 ttatacaaattggcggtggtctgatagtatcagatttatgtccagatatgagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatata 48627180  T
Q  337 ttttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48627181 ttttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcaccccctcaagg 48627279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 38 - 434
Target Start/End: Original strand, 43905707 - 43906076
Alignment:
Q  38 tagaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttat 137  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905707 tagaatcataagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttat 43905805  T
Q  138 ccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgat 237  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  43905806 ccgctgtgggaaagggaaaaatgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtg----------tgaaataacttttcaaattgactgattgagtgat 43905895  T
Q  238 tatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatat 337  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||             |||||||    
T  43905896 tatacaaattgagggtagtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctaaaaaaacctcaaacgtg-------------tatatat 43905982  T
Q  338 tttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaag 434  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  | | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905983 tttttatttaagt-ggggtggataatagagttaattttt--ttaagctcatagcttttggaggtccgacttgattgagcaccttgcactccctcaag 43906076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 435
Target Start/End: Original strand, 51939483 - 51939822
Alignment:
Q  114 gtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa--aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatag 211  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  | ||||| | | || | || ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51939483 gtgtcgtttggatttgtcacttctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatag 51939582  T
Q  212 attttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactca 311  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | | |||||||| |||||||||||||||||    
T  51939583 cttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagaaaaaactca 51939682  T
Q  312 aacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagctttt 395  Q
    ||||||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||  |||    
T  51939683 aacgtggactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaattttttgttagaggcccatagaattt 51939782  T
Q  396 ggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  51939783 ggaggccccgcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 51939822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 436
Target Start/End: Original strand, 23164496 - 23164838
Alignment:
Q  110 aacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaa 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23164496 aacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattattgttgtgattctttcaatgaaa 23164595  T
Q  209 tagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaac 308  Q
    |||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||||    
T  23164596 tagacttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaac 23164695  T
Q  309 tcaaacgtgt-------aaagaa------gtaacatatatattttttatttaagtg-ggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagct 392  Q
    ||||||||||       ||||||       |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||| ||     
T  23164696 tcaaacgtgtactgaaaaaagaaaaggatataacatatat-ttttttatttaagtgaggggtgggtattagacataattttttgtttgaggcccatggca 23164794  T
Q  393 tttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||||||||||| ||||||    
T  23164795 tttggaggcccgacctggttgaacaccttgcactcccccaaggc 23164838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 174 - 441
Target Start/End: Original strand, 41707044 - 41707328
Alignment:
Q  174 aaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagattt 273  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||| | | |||||    
T  41707044 aaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatgcaaattaggggtggtttgataggatccgattt 41707143  T
Q  274 atgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgt-------------aaagaagtaacatatatattttttatttaagt-gggggtgg 358  Q
    ||||  | | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||             |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41707144 atgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaagatataacatatatattttttatttaagtggggggtgg 41707243  T
Q  359 gtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    |||||| | |||||||||  |  ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  41707244 gtattaaatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggttgaacaccttgcacaccctcaaggctgggc 41707328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 318
Target Start/End: Original strand, 42009237 - 42009395
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42009237 gaatggtttatgtgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttg 42009336  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 318  Q
    |||| | || ||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42009337 atagcatcaaatttatgtccagaaagtagaactaaagtctaaaaaaaactcatacgtgt 42009395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 441
Target Start/End: Original strand, 46791619 - 46791970
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | ||   | ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  46791619 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtcaagtgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttgcaatga 46791718  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaa 305  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||| ||||    
T  46791719 aatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagaggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaa 46791818  T
Q  306 aactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccata 389  Q
    ||||||||||||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  |||| || ||    
T  46791819 aactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgttataacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggtccgta 46791918  T
Q  390 gcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    || |||||||||||| |||  || |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  46791919 gcatttggaggcccgacttagttaagcaccttgcacaccctcaaggcggggc 46791970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 433
Target Start/End: Original strand, 21784705 - 21785048
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa--aaagaaattattgttgtgattctttcaatg 205  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21784705 ctaacggcgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 21784804  T
Q  206 aaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaa 305  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| |||||||||||    
T  21784805 aaatagctttccaaattaactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaa 21784904  T
Q  306 aactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatata-ttttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccata 389  Q
    ||||||||||||   |||||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |  ||| ||| ||    
T  21784905 aactcaaacgtgtactaaagaaataaagttatataacatatatatttttttatttaagtgggggtgaatattagatttaatttttcgttagagacccgta 21785004  T
Q  390 gcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    || || ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||    
T  21785005 gcattgggaggcccggcctggttaagcaccttgcacaccctcaa 21785048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 175 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8364246 - 8363963
Alignment:
Q  175 aaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagattta 274  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||    
T  8364246 aaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgattta 8364147  T
Q  275 tgtcaagataggagaactaaagtctagaa-aaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtggg 359  Q
    |||  | | |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8364146 tgtacaaaaaggagaacaagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaagtggggggtgga 8364047  T
Q  360 tattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    ||||||| |||||||||  |  ||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8364046 tattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcaattggaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggccgggc 8363963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Original strand, 36538161 - 36538320
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36538161 gaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttg 36538260  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    |||| | ||  |||||||| | | || | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  36538261 atagcatcaagtttatgtccataaagtataactagagtttagaaaaaactcatacgtgta 36538320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 110 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18408331 - 18408121
Alignment:
Q  110 aacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtg-aaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaa 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |     
T  18408331 aacggtgtcgtttggatttgtcactgctctgttgtggaaaagggtaaaacgaattgtttatgcgaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatggat 18408232  T
Q  209 tagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | | |||||||||||||||||||||||    
T  18408231 tagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaactaaagtctagaaaaaac 18408132  T
Q  309 tcaaacgtgta 319  Q
    |||||||||||    
T  18408131 tcaaacgtgta 18408121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 441
Target Start/End: Original strand, 23067646 - 23067998
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaa-aagaaattattgt-tgtgattctttcaatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || | ||||| | | || | ||  ||||||||||| |||  || |||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  23067646 ctaacggtgtcatttggatttttcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgaattaaaaaatgattgtgtgtgattctttaaatg 23067745  T
Q  206 aaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag--aa 303  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | ||||||||||||||||||  ||    
T  23067746 aaataacttttcaaattgactggtgaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactaaagtctagaaaa 23067845  T
Q  304 aaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccat 388  Q
    ||||||||||||||   |||||||           |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |  |||| || |    
T  23067846 aaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatattttatttaaatgggggtgggtattaaatttaatttttcgttagaggtccgt 23067945  T
Q  389 agcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23067946 agcaattggaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggccgggc 23067998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 435
Target Start/End: Original strand, 52655097 - 52655390
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52655097 gaatggtttatgcgaggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagtggtggttt 52655196  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctaga-aaaaactcaaacgtg-----taaagaa----------gtaacatatatatttttt 342  Q
    ||||| | | ||||||| |  | | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||     |||||||           |||||||||||||||||    
T  52655197 gataggatccgatttatatacaaaaaggagaactagagtctagagaaaaactcaaacgtgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatttttt 52655296  T
Q  343 atttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt-tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||| | ||| |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  52655297 atttatgtagggggtggggattagatttaatttttgttagaggcccataacattt-gaggcccggcctggttaagcaccttgcacaccctcaagg 52655390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 436
Target Start/End: Original strand, 29387728 - 29388022
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29387728 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggttt 29387827  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtct-agaaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttat 344  Q
    ||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||           |||||||||||||||||||    
T  29387828 gataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttat 29387927  T
Q  345 ttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  || || | |||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  29387928 ttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaagctcgtagcatttgaaggtccggcctggttgagcaccttgcacacactcaaggc 29388022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 308
Target Start/End: Original strand, 50677289 - 50677437
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50677289 gaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattgtttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttg 50677388  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaac 308  Q
    |||  | || |||| |||| ||| || | ||||||||||||| ||||||    
T  50677389 ataacaacaaatttttgtccagaaagtataactaaagtctaggaaaaac 50677437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 307
Target Start/End: Original strand, 25599009 - 25599208
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaa 207  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||    
T  25599009 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaacatgattgttgtgattctttcaatgaa 25599108  T
Q  208 atagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaa 307  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||  | | |||||||||| |||||| ||||||    
T  25599109 atagtttttcaaattgactgattaagtgattatataaattagaggtggtttgatagaatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaaaaaaaa 25599208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 173 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7767139 - 7767005
Alignment:
Q  173 gaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatt 272  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| | || |||    
T  7767139 gaaaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggttgtttgatagcatcaaatt 7767040  T
Q  273 tatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaa 307  Q
    |||||| ||| || ||||||  |||||||||||||    
T  7767039 tatgtccagaaagtagaactggagtctagaaaaaa 7767005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27303271 - 27303118
Alignment:
Q  165 gtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagt 264  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |     
T  27303271 gtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgatggtggtttcatggc 27303172  T
Q  265 accagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 318  Q
    | || ||||||||| | | || |||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  27303171 atcaaatttatgtccataaagtagaagtagagtctagaaaaaacacatacgtgt 27303118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21596410 - 21596264
Alignment:
Q  174 aaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagattt 273  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| | | |||||    
T  21596410 aaaaataaatgattgttgtgattcttgtaatgaaatagctttccaaatcgactgattaagtgattatacaaattgggagtggtttgatagcatctgattt 21596311  T
Q  274 atgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaa 320  Q
    ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  21596310 atgtccagaaaggagaattagagtctagaaaaaacgcaaacgtgtaa 21596264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 46904908 - 46904728
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||  | ||  || ||| | || | ||| || ||||||||  ||||||||    
T  46904908 ttaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaagggaaaaataaaaggtttatgcaaaaaagaa 46904810  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatag 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46904809 ataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatag 46904728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Original strand, 28132710 - 28132870
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||    
T  28132710 gaatggtttatgcgaagaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaagggtgatttg 28132809  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaa-ctcaaacgtgta 319  Q
    |||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  28132810 ataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaatctcaaatgtgta 28132870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 54430642 - 54430482
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  54430642 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgcaattcttttaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggttt 54430543  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||||  | |||||||||||  | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  54430542 gataacatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagcctagaaaaaactcaaacgtgta 54430482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 319
Target Start/End: Original strand, 40152105 - 40152264
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattc-tttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||||    
T  40152105 aatggtttatgcgcaaaagaaatgattgttgtgattcgttttaatgaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattggggatgatttg 40152204  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
     ||| | ||||| |||||| | | || |||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  40152205 gtagcatcagatctatgtctaaaaagaagaattagagtctaaaaaaaactcaaacgtgta 40152264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 319
Target Start/End: Original strand, 1649807 - 1649965
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttga 260  Q
    ||||| |||||  |||||||| | ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1649807 aatggcttatgcaaaaaagaattgattgttgcgaagctttcagtgaaatagattttcaaattgaatgattaagtgattatacaaattgggggtgatttga 1649906  T
Q  261 tagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||| |||||||||||||| ||| | |||||||| | | |||| |||||| ||| |||||    
T  1649907 tagcaccagatttatgtctagaaaagagaactagattttagacaaaacttaaatgtgta 1649965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24252762 - 24252416
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| || |||    
T  24252762 ctaacggggtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttgcactga 24252663  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag---aa 303  Q
    ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| | | || ||||||  | | || ||||||| |||||||   ||    
T  24252662 aataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaagggtggtttgataggatctga-ttatgtacaaaaagaagaactagagtctagaaaaa 24252564  T
Q  304 aaaactcaaacgtgt-------------aaagaagtaacatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggccca 387  Q
    |||||||||||||||             |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |  |||||||     
T  24252563 aaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaagatataacatatatattttttacttaagtcgggggtgggtattagatctaatttttagttagaggcccg 24252464  T
Q  388 tagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    || | |||||||||||||  || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  24252463 taacatttggaggcccggtctggttgagcaccttacacaccctcaagg 24252416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13401535 - 13401461
Alignment:
Q  173 gaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaatt 247  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13401535 gaaaaaaaaatgattgttgtgattcttccaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 13401461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6715528 - 6715247
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||          ||||||||   |||||||||    
T  6715528 gaatggtttatgcgaaaaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaataactttcaaaattgactgat----------tacaaattataggtggtttg 6715439  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta------------aagaagtaacatatatattttttattta 347  Q
    |||| | | ||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||            ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6715438 ataggatccgatttatatacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaatcaaacgtgtattaaaagatataaagatataacatatatattttttattta 6715339  T
Q  348 agtgg-gggtgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    | ||| |||||||||||| | |||||||||  |  ||||||| || | ||| ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6715338 aatggagggtgggtattaaatttaatttttcgttagaggcccgtaacatttagaggctcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggc 6715247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 316
Target Start/End: Original strand, 19965776 - 19966013
Alignment:
Q  84 taagtgaaagagaggtataatttac-taa--cggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaaga 180  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||  |||  ||||||| |||| ||| | ||||| ||||||| | | || || |||||||||||| |  ||| |    
T  19965776 taagtgaaagagaggtgaaatttacctaaagcggcatcatttgaatttctcattcatccgttgtgggaaaggagaaaacgaatggtttatgcgggaaa-a 19965874  T
Q  181 aattattgtt-gtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtca 279  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||     
T  19965875 aatgattgtttgtgattcttttaatgaaatagcttttcaatttaactaattaagtgattatacaaattggcagtggtttgatagcatcagatttatgtcc 19965974  T
Q  280 agataggagaactaaagtctagaaaa--aactcaaacgt 316  Q
    | | ||||||| || ||| || ||||  |||||||||||    
T  19965975 aaaaaggagaattagagtttaaaaaaccaactcaaacgt 19966013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 441
Target Start/End: Original strand, 27110962 - 27111079
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||||||     
T  27110962 taacatatatattttttatttaagtagggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggccccgcctggttgagcacctt- 27111060  T
Q  423 cactccctcaaggctgggc 441  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  27111061 cacaccctcaaggccgggc 27111079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 51147027 - 51146861
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaa-aagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  51147027 gaatggtttatgcgagagaaaaaataattgttgtgattctttcaataaaatagttttttaaattgactgattaagtga-tattcaaattgatggtggttt 51146929  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgtaaagaag 325  Q
     |||| | || ||||||||| | | ||  |||||| | ||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  51146928 aatagcatcaaatttatgtccaaaaagtggaactagaatctagaaaaaaactcatacgtgtaacgaag 51146861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 441
Target Start/End: Original strand, 27729743 - 27730040
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaaga-aattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||| || |||| | ||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  27729743 gaatggtttatgcgaagaaaataatgattgttgtgattctttcgatcaaattgctttccaaattgattgattatgtgattatacaaattaggggtggttt 27729842  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtcta-gaaaaaactcaaacgtgt-------aaagaa------gtaacatatatattttttat 344  Q
    ||||  | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||       ||||||       |||||||||||||||||||    
T  27729843 gataagatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctacaaaaaaactcaaacgtgtactaatgaaagaaaatgatataacatatatattttttat 27729942  T
Q  345 ttaagtgggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    |||||| |||||  |||||| | |||||||||  |  ||||||| || | |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||    
T  27729943 ttaagt-ggggtacgtattatatttaatttttcgttagaggcccgtaccatttggaggtccgacctgattgagcatcttgcacactctcaaagctgggc 27730040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 278
Target Start/End: Original strand, 1255027 - 1255143
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||  |||||||| ||| |||| ||||||||||||   ||| |||||    
T  1255027 gaatggtttatgcgaaaaacaaattattgttg--attctttcaatgaaataactttctaaattgaccgattaagtcattatacaaattaaaggtcgtttg 1255124  T
Q  260 atagtaccagatttatgtc 278  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  1255125 atagcatcagatttatgtc 1255143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15987338 - 15987207
Alignment:
Q  111 acggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaata 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| | || | || |||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||    
T  15987338 acggtgtcatttgaatttgtcactcctccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaaaaataaatgatagttgtaattcttttaatgaaata 15987239  T
Q  211 gattttcaaattgactgatcaagtgattatac 242  Q
      |||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  15987238 actttcgaaattgaatgattaagtgattatac 15987207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20762139 - 20762052
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaat 246  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20762139 gaatggtttatgcgacgaaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaatagacttccaaattaactgatcaagtgattatacaaat 20762052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 51064408 - 51064299
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||  |  |||| || |||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  51064408 taacatatatattttttatttaagt-ggaatgggtattagatttaatttttcgttagaggtccgtagtatttggaagcccggcctgattgaacaccttgc 51064310  T
Q  424 actccctcaag 434  Q
    || ||||||||    
T  51064309 acaccctcaag 51064299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18408101 - 18408050
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtgg-gggtgggtattagagttaattttt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||    
T  18408101 taacatatatattttttatttaagtggaaggtgggtattatatttaattttt 18408050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 441
Target Start/End: Original strand, 29843864 - 29843931
Alignment:
Q  374 ttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||    
T  29843864 ttttttgaggcccataccttttggaggaccagcttgattgagctgtttgcactcccccaaggccgggc 29843931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 249
Target Start/End: Original strand, 4207347 - 4207418
Alignment:
Q  174 aaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattgg 249  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||    ||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4207347 aaaaagaaaggattgttgtgattcttt----gaaatatctttccaaattgaatgattaagtgattatacaaattgg 4207418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 54430452 - 54430411
Alignment:
Q  337 ttttttatttaagtggg-ggtgggtattagagttaatttttt 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  54430452 ttttttatttaagtgggaggtgggtattagacttaatttttt 54430411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 39 - 441
Target Start/End: Original strand, 34523808 - 34524207
Alignment:
Q  39 agaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatc 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34523808 agaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagag--gtagaatttaataacggtgtcgtttggatttgtcacttatc 34523904  T
Q  139 cgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgatt 238  Q
    || ||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34523905 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgatt 34524004  T
Q  239 atacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34524005 atacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 34524104  T
Q  339 ttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34524105 ttttatttaagtgggggtgggtattagatttaattttttctgaggcccgtagcttttggaggtccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggccg 34524204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 39 - 436
Target Start/End: Original strand, 39697793 - 39698188
Alignment:
Q  39 agaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatc 138  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39697793 agaatcagaagagtttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaat-aagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcatttggatttgtcacttatc 39697891  T
Q  139 cgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgatt 238  Q
    || ||||||| | | || || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||     
T  39697892 cgttgtgggaaaggcgaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactaattaaatgatc 39697991  T
Q  239 atacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39697992 atacaaattggtggtggtttgatagtaccaaatttatgccaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 39698091  T
Q  339 ttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  39698092 ttttatttaagtggaggtgggtattaaagttaa-tttttctgagacccataacttttggaggtccaacttaattgaacaccttgcattccctcaaggc 39698188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 46 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12531761 - 12531406
Alignment:
Q  46 gaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||| ||||    
T  12531761 gaagagcttctaaacatgaaacgaaata-taaaaaaattaagtgaaagagaggtataatttactaacggcgtcgtttgaatttgtcatttatccgttgtg 12531663  T
Q  146 ggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaa 245  Q
    ||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12531662 ggaaaggggaaaacaaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagatttttaaattgactgattaagtgattatacaaa 12531563  T
Q  246 ttggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatt 345  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12531562 ttggaggtagtttgatagtacaagatttatgttcggataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatctattttttatt 12531463  T
Q  346 taagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccg 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12531462 taagt-ggggtgggtattagagttga-tttttctgaggtccatagcttttggaggcccg 12531406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 393
Target Start/End: Original strand, 23567138 - 23567480
Alignment:
Q  47 aagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23567138 aagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaa--ttaagtgaaagagtggtagaatttactaacggcgtcgtttggatttgtcatttatccgttgtgg 23567235  T
Q  147 gacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaat 246  Q
    || | || | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23567236 gaaaaggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatcattgttgtgatactttcaatgaaatagtatttcaaattgactgattaagtgattatacaaat 23567335  T
Q  247 tggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttattt 346  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23567336 tgggggtggtttgatagtagcagatttatgttcagataagagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgtaaaaaagtaccatatatattttttattt 23567435  T
Q  347 aagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagctt 393  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23567436 aagt-ggagtgggtatcagagttaatttttt-ttaggcccatagctt 23567480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 429
Target Start/End: Original strand, 32098075 - 32098438
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  || | |||||||   |||| || ||||||||||||  ||||||||    
T  32098075 ttaagtgaaagagaagtgaaatttacgtaacggtgtcgtttggattcgtcactcctctgttgtgggaatggggaaaacgaatggtttatgcaaaaaagaa 32098174  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    |||||||||||| | || ||||||||| |     
T  32098175 ataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttccaaattgactgattaagtgatcatacaaattaagagtggtttgatagcatcaaatttatgtccaa 32098274  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt-------------aaagaagtaacatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagag 367  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  32098275 aaaggataactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactgaagaaagaaaaagaagtaacatatatattttttaattaagtggggggtgggtattagac 32098374  T
Q  368 ttaa--ttttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccc 429  Q
    ||||  |||||| | ||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32098375 ttaattttttttctcaggcctagagtttttggaggaccggcttggttgagcaccttgcactccc 32098438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 435
Target Start/End: Original strand, 44665020 - 44665308
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  44665020 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaatagactgattaagtgatgatacaaattagaggtggttt 44665119  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtc--tagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------taacatatatattttttatttaag 349  Q
    ||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||  |||       ||  | ||||||||||||||||||    
T  44665120 gataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctataaaaaaaactcaaacgtgtaagaaagaaaaagatataacatatattttttatttaag 44665219  T
Q  350 tg-ggggtgggtattagagttaatttt---ttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |   ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44665220 tgaggggtgggtattagatttaattatgcgtta-gaggcccgtagcatttggaggcccggcttgattgagcaccttacacaccctcaagg 44665308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 161 - 433
Target Start/End: Original strand, 5869298 - 5869579
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttga 260  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  5869298 aatggtttatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattttaaaaatt-gtggtggtttga 5869396  T
Q  261 tagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt-------------aaagaagtaacatatatattttttattta 347  Q
    ||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||             ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  5869397 tagtatca-atttatgtacagaaaggagaactaaagtctaaaaaaaactcaatcgtgtactgaataaagaaaaataagtaacatat-ttttttttattta 5869494  T
Q  348 agtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
       | ||||||||||||||  ||||||||| | |||||  || | |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  5869495 gacgagggtgggtattagacataatttttt-ttaggccagtaccatttggaggcccggcctggtagagcaccttgcactccctcaa 5869579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 441
Target Start/End: Original strand, 43926297 - 43926596
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||    
T  43926297 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattatgggtggttt 43926396  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag--aaaaaactcaaacgtg------------taaagaagtaacatatatattttttat 344  Q
    ||||| | | ||||||| |  | | || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||            ||||||  |||||||||||||||||||    
T  43926397 gataggatccgatttatatacaaaaagtagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaatgatataaagatataacatatatattttttat 43926496  T
Q  345 ttaagtggg-ggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |  ||||||| | || ||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43926497 ttaagtgggaggtgggtattaaatttaatttttccttagaggcccgtggcatttggagacccgacctgattgagcaccttgcacaccctcaaggccgggc 43926596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Original strand, 3628722 - 3628881
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||    
T  3628722 gaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattatgtgattatacaaattaatggtggtttg 3628821  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    |||| | || ||||||| | |||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3628822 atagcatcaaatttatgaccagaatgtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgta 3628881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 7858227 - 7857883
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  7858227 ctaacggtgtcatttggatttttcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttaaatga 7858128  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaa-aa 305  Q
    | ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||||| ||    
T  7858127 attaactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgatttgataggatccgatttatgttcaaaaaggagaactagagtctagaaaaa 7858028  T
Q  306 aactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatag 390  Q
    ||||||||||||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |  || |||| |||    
T  7858027 aactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagt-ggggtgggtattaaatttaatttttcgttagaagcccgtag 7857929  T
Q  391 cttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    |  ||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7857928 caattggaggcccgacctggttgagcaccttgcacaccctcaaggc 7857883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13585389 - 13585098
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  13585389 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaattgattatacaaattaggggtggttt 13585290  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtg---taaagaagtaacat--------atatattttttattt 346  Q
    ||||| | | |||||||||  | | | || ||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||  || ||        |||||||||||| ||    
T  13585289 gataggatctgatttatgtacaaaaaagaaaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatattttttagtt 13585190  T
Q  347 aagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    || | |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||| | || |||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13585189 aaatggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgttgcatttgaaggcccggtctgattgagcaccttgcacacccttaagg 13585098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 319
Target Start/End: Original strand, 18420531 - 18420744
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||  | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18420531 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtgaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 18420630  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaa 305  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||| | ||||    
T  18420631 aacagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaagtgtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctggaaaaa 18420730  T
Q  306 aactcaaacgtgta 319  Q
    ||||||||||||||    
T  18420731 aactcaaacgtgta 18420744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Original strand, 43968044 - 43968205
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  43968044 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattaggagtggttt 43968143  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43968144 gataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgta 43968205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3471742 - 3471572
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||  || | ||||| | | || | ||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3471742 ctaacggtgtcgtttggatctatcactcctctgttgtggaaaagggtaaaatgaatggttcatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 3471643  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgt 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||    
T  3471642 aatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgatagaatcacatttatgt 3471572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 307
Target Start/End: Original strand, 30915268 - 30915410
Alignment:
Q  166 tttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttc-aatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagt 264  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| |||     
T  30915268 tttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattggaggaggtttggtagc 30915367  T
Q  265 accagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaa 307  Q
    | ||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  30915368 atcagatctatgtccagaaaggagaattagagtctaaaaaaaa 30915410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27074663 - 27074546
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27074663 aatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattttttcaatgaaatagacttttaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttg 27074564  T
Q  260 atagtaccagatttatgt 277  Q
    |||| | |||||||||||    
T  27074563 ataggatcagatttatgt 27074546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 29372454 - 29372180
Alignment:
Q  152 gggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtg 251  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |    
T  29372454 gggaaaatgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtcattctttcaattgaataactttccaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 29372355  T
Q  252 gtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg---taaag------aagtaacatatatatttttt 342  Q
    || ||||||||| |       |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||      || |||||||||  |||||     
T  29372354 gtagtttgatagca-------tatgtccagaaaggaaaactaaagtttagaaaaaactcaaacatgtactaaagtttccaaattaacatataatttttta 29372262  T
Q  343 atttaagtggg-ggtgggtattagagttaa--ttttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcacctt 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  29372261 atttaagtgggtggtgggtattagacttaattttttttttgcggcccatcgtttttggtggcccagcttggttgagctcctt 29372180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 35875000 - 35874854
Alignment:
Q  175 aaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattg--gtggtggtttgatagtaccagatt 272  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||| | || |||    
T  35875000 aaaagaaataattgttgtggttctttctaagaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgatatagtggtttgatagcatcaaatt 35874901  T
Q  273 tatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35874900 tatatccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgta 35874854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18112259 - 18112103
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa--aaagaaattattgttgtgattctttcaatg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||| | | || | || |||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  18112259 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaata 18112160  T
Q  206 aaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgata 262  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  18112159 aaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggagtggtttgata 18112103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42777911 - 42777683
Alignment:
Q  84 taagtgaaagagaggtataatttact-aacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaa 182  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||  |||| ||||||| ||| || || ||||||| |||| | |||| |||    
T  42777911 taagtgaaagagaggtgaaatttactgaacggtgtggtttggttttgtcactcctccgttgtgggaaatgagaaaacgaatggtatatgcggaaaaaaaa 42777812  T
Q  183 ttattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaaga 282  Q
    | |||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||        | |||| ||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||  |||    
T  42777811 tgattgttgtgattcttttaattaaatagctttctaaattgac--------taattacacaaattgggggtggtttgatatcatcatatttatgtataga 42777720  T
Q  283 taggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
     ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||    
T  42777719 aaggagaattagaatctagaaaaaattcaaacgtgta 42777683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1004150 - 1004060
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtga--aaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagatttt-caaattgactgatcaagtgattatacaaatt 247  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1004150 gaatggtttatgcgatgaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataattttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 1004060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 319
Target Start/End: Original strand, 42951774 - 42951908
Alignment:
Q  190 tgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggaga 289  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| |   |||||||||  | | | ||||    
T  42951774 tgtgattctttcaataaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggagtggtttgataggattcgatttatgtacaaaaatgaga 42951873  T
Q  290 actaaagtctag-----aaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    |||| |||||||     ||||||||||||||||||    
T  42951874 actagagtctagaagaaaaaaaactcaaacgtgta 42951908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 434
Target Start/End: Original strand, 41666088 - 41666196
Alignment:
Q  322 gaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcacctt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||| |||||| |||  || |||  |||||||||||    
T  41666088 gaagtaacatatatattttttatttaagt-ggggttggtattagacttaatttttt-ttaggcacataacttttgaaggttcgactt--ttgagcacctt 41666183  T
Q  422 gcactccctcaag 434  Q
    |||||||| ||||    
T  41666184 gcactcccccaag 41666196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3445591 - 3445544
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaatt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3445591 taacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagatttaatt 3445544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 333 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18111717 - 18111606
Alignment:
Q  333 tatattttttatttaagtgg-gggtgggtattagagttaatttttt-at-gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccc 429  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||  || ||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||    
T  18111717 tatattttttatttaagttgagggtgggtgttagatttaatttttcgatagagacccatagcatttggaggtccgacctgattgagcaccttgcacaccc 18111618  T
Q  430 tcaaggctgggc 441  Q
    ||||||| ||||    
T  18111617 tcaaggccgggc 18111606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33452880 - 33452728
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattc-tttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||  |||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33452880 aatgatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattaaaataacttttcaaattgattaattgagtgattatataaattggaggtggtttg 33452781  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaac 314  Q
    |||  |  |||||||||||   | | ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33452780 ataccataagatttatgtc--caaaagagaattagagtctagaaaaaactcaaac 33452728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42076176 - 42076094
Alignment:
Q  181 aattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatag 263  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || | |||||||||    
T  42076176 aattattattatgattctttcaatgttatagcttttcaaattgattgattaagttattatacaaattgatgatagtttgatag 42076094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 3471504 - 3471385
Alignment:
Q  326 taacatatatatttttt-atttaagtggggg-tgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcacctt 421  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |  ||||||| |||| |||||||| ||| | || ||||||| |||    
T  3471504 taacatatttttttttttatttaagtggggggtgggtattacacttaattttttgtttgaggcccgtagcatttggaggtccgacctggttgagcatctt 3471405  T
Q  422 gcactccctcaaggctgggc 441  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  3471404 gcactcccccaaggccgggc 3471385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Original strand, 36515053 - 36515200
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaaga 180  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||  | ||  || ||| |||||| ||  |||| |||||| ||| ||| |    
T  36515053 ttaagtgaaagagagctgaaatttatctaacggtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaatgggaaaacaaatgatttatgcgaagaaaaa 36515151  T
Q  181 aattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgat 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  36515152 aataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttaaattaactgat 36515200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 376
Target Start/End: Original strand, 18420770 - 18420817
Alignment:
Q  330 atatatattttttatttaagtgg-gggtgggtattagagttaattttt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18420770 atatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 18420817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27074494 - 27074377
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtgggg-gtgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttg 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| |  |||| |||| || |||| |||||||   | |||||||| ||||    
T  27074494 taacatatat-ttttttatttaagtagggagtgagtattagacttaattttttgtttgaggtccattgcatttgaaggcccgatctaattgagcatcttg 27074396  T
Q  423 cactccctcaaggctgggc 441  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  27074395 cactccctcaaggccgggc 27074377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1003998 - 1003958
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtg-ggggtgggtattag 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1003998 taacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattag 1003958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 12531405 - 12531360
Alignment:
Q  388 tagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  12531405 tagcttttggaggcccgacgtgattgagcaccttgcatttcctcaa 12531360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 436
Target Start/End: Original strand, 42951928 - 42952042
Alignment:
Q  326 taacatatatatttttt-atttaagtgggg-gtgggtattagagttaattttt---tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcacct 420  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||   || || ||||||||| ||| || | |||   |||| ||||||||    
T  42951928 taacatatatttttttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgcta-gaagcccatagcatttagaagtccgaactgatcgagcacct 42952026  T
Q  421 tgcactccctcaaggc 436  Q
    ||||| ||||||||||    
T  42952027 tgcacaccctcaaggc 42952042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 84 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12971571 - 12971219
Alignment:
Q  84 taagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaat 183  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12971571 taagtgaaagataggtagaatttactaacggagtcgtttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaat 12971472  T
Q  184 tattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagat 283  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  12971471 gattgttgtgattctttcgatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgataatatcagatttatgtccagat 12971372  T
Q  284 aggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtg-ggggtgggtattagagttaattttttatgag 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12971371 aggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagagttaattttttctgag 12971272  T
Q  383 gcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12971271 gcccattgctcttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 12971219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 83 - 427
Target Start/End: Original strand, 27703427 - 27703787
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||  ||||  |||| | | || | || |||||||||||| ||||| |||    
T  27703427 ttaagtgaaggagaggtgaaatttacctaacagtgtcgtttggatt-gtcactcttccgtggtggaaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaa 27703525  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||  |     
T  27703526 atgattgttgtgattctttcgatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagcatcaaatttatgttcaa 27703625  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt-------------aaagaagtaacatatatatttttt---atttaagt-gggggtgggtatta 364  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  27703626 aaaagagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaagaagtaacatatatattttttttaatttaagtggggggtgggtatta 27703725  T
Q  365 gagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactc 427  Q
    || |||||||||| || || || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27703726 gacttaatttttt-tgtggtccgtagtttttggaggcccagcttggttgagcaccttgcactc 27703787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5560631 - 5560413
Alignment:
Q  102 aatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa-attattgttgtgattcttt 200  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| | | || ||||||| ||||||| | |||| || || ||||||||||||||||    
T  5560631 aatttacgtacggtgttatttggatttgtcactcctccgttgtgggaaaagagaaaatgaatagtttatgcggaaaaaaatatgattgttgtgattcttt 5560532  T
Q  201 caatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtcta 300  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  5560531 caatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttggtagcaccagatttatgtccagaaatgagaactatagtcta 5560432  T
Q  301 gaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  5560431 aaaaaatctcaaacgtgta 5560413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 441
Target Start/End: Original strand, 33124559 - 33124905
Alignment:
Q  115 tgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagat 213  Q
    |||| |||||||||||||||  || | ||||| | |||| | || |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33124559 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaatggtataacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagct 33124658  T
Q  214 tttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaac--taaagtct-agaaaaaactc 310  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| |||| | | |||||||||  | | ||||||||  || ||||| | |||||||||    
T  33124659 tttcaaattgacttattaagtgattatacaaattagaggtggtttaataggatccgatttatgtagaaaaaggagaactatagagtctaaaaaaaaactc 33124758  T
Q  311 aaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaag-tgggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttt 394  Q
    |||||||   |||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||  |  ||||||| |||| ||    
T  33124759 aaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaagttggggatgggtattaaatttaatttttcgttagaggcccgtagcgtt 33124858  T
Q  395 tggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33124859 tggaggcccagcctgattgagcaccttgcacaccctcaaggcagggc 33124905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15441455 - 15441220
Alignment:
Q  84 taagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaa 182  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  || | ||||| | | |||| |||||||| ||||||  ||||||||     
T  15441455 taagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggcgtcgtttggatttgtcactcttctgttgtggaaaa-gggaaaatgaatgatttatgcaaaaaagaa- 15441358  T
Q  183 ttattgttgtgattctttc-aatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  | ||||||||| ||    
T  15441357 ttattgttgtgattctttttaatgaaatagctttataaattgagtgattaagtgattatacaaattgtaggtggtttgatagcattatatttatgtctag 15441258  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15441257 aaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgta 15441220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 433
Target Start/End: Original strand, 48722292 - 48722637
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  48722292 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattatttcaatga 48722391  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag---aa 303  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | | ||||| || |||||||   ||    
T  48722392 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaaatagagtctagaaaaa 48722491  T
Q  304 aaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggccca 387  Q
    ||||||||||||||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||  |  |||||||     
T  48722492 aaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaagtggggggtggatattaaatttaatttttcgttagaggcccg 48722591  T
Q  388 tagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  48722592 tagcatttggaggcccggcctggttgagcactttgcacaccctcaa 48722637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 50371301 - 50371080
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||  |||| ||||||  | || | ||  |||| |||||| |||||||||    
T  50371301 ttaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacgatgttgtttggatttgtcactcctccgttgtgggtaagggaaaaactaatgatttatgcgaaaaagaa 50371202  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||  ||||| || ||    
T  50371201 atgattgttgtgattctttcaatgaaacagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgagggtgatttgatagcatcaactttatatccag 50371102  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaa 303  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  50371101 aaaggagaactagagtctagaa 50371080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24556895 - 24556736
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||     
T  24556895 gaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttaaatgaaatagtttttcaaattgacttattaagtgattattcaaattgatggtggttta 24556796  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    |||| |||| ||||||||  ||| ||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  24556795 atagcaccaaatttatgttgagaaagtggaattagagtctagaaaaaactcatacgtgta 24556736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 435
Target Start/End: Original strand, 51110076 - 51110369
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaaaaagaaa-ttattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  51110076 aatggtttatgcgaagaaaaaacttattgttgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgactgattaagtgattatagaaattaggggtggtttg 51110175  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatata-ttttttat 344  Q
    |||| | | |||||||||  | | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||           ||||||||||| ||||||||    
T  51110176 ataggatccgatttatgtacaaaaaggataactatagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatttttttat 51110275  T
Q  345 ttaagtggg-ggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  |  ||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  51110276 ttaagtgggtggtaggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcaccttacacaccctcaagg 51110369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Original strand, 12884112 - 12884272
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12884112 gaatggtttatgcgaagaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttttaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttg 12884211  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    |||| | | |||||||||  | | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12884212 ataggatccgatttatgtacaaaaaggaaaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgta 12884272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 434
Target Start/End: Original strand, 17487257 - 17487551
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    ||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | || ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  17487257 gaatggtttatgcaaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgatttattaagtgattatataaattaggggtggttt 17487356  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtg-----taaagaa----------gtaacatatatatttttt 342  Q
    ||||| | | ||||||||| || | |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||     |||||||           |||||||||||||||||    
T  17487357 gataggatccgatttatgtaaaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaatgtgtacactaaagaaagaaaagaatataacatatatatttttt 17487456  T
Q  343 atttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaag 434  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  17487457 atttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtatcatttggaggcccggcttggttgaggaccttgcacaccctcaag 17487551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Original strand, 37873737 - 37873897
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37873737 gaatggtttatgcagaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaacagtttttcaaattaactgattaagtgactatacaaattgatggtggtttg 37873836  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    |||| | || ||||||||| ||| || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  37873837 atagcatcaaatttatgtctagaaagtagaactagagtctagaaaaaaactcatacgtgta 37873897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6150864 - 6150653
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatggg-agaatgaatggtttatgtgaaaaagaaatt-attgttgtgattctttcaatg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | |  || | || |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6150864 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaattgattgttgtgattctttcaatg 6150765  T
Q  206 aaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaa-a 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||||| |    
T  6150764 aaatagcttttcaaattgactgattaaatgattatataaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaa 6150665  T
Q  305 aaactcaaacgt 316  Q
    ||||||||||||    
T  6150664 aaactcaaacgt 6150653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 435
Target Start/End: Original strand, 20905210 - 20905556
Alignment:
Q  110 aacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatggg-agaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaa 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | ||| | || |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20905210 aacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaagggtaaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaattattgttgtgattctttcaatgaa 20905309  T
Q  208 atagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaa--aa 305  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||||||||  | | |||||||||| |||||||||  ||    
T  20905310 atagacttccaaattgactgaataagtgattatacaaattagggctggtttgataggattagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaataa 20905409  T
Q  306 aactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatata-tattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccat 388  Q
    ||||||||||||   |||||||           ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  | |||| |||||    
T  20905410 aactcaaacgtgtactaaagaaagaaaagaatataacatatatttttttttatttaagtcgggggtgagtattagacttaattttttgtttgagacccat 20905509  T
Q  389 agcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
      | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  20905510 gacatttggaggcccggcctgattgatcaccttgcattcccccaagg 20905556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42740199 - 42740048
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  42740199 gaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttgcgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactaattaagttattatacaaattgatggttgtttg 42740100  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactca 311  Q
    |||| | || | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  42740099 atagcatcaaacttatgtccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactca 42740048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 319
Target Start/End: Original strand, 17674330 - 17674487
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttga 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  17674330 aatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattattcaaattgatggtggtttaa 17674429  T
Q  261 tagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||| | || |||||| || ||| ||   ||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  17674430 tagcatcaaatttatatctagaaagtgaaactagagtctag-aaaaactcatacgtgta 17674487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10109862 - 10109647
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10109862 ctaacggcgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 10109763  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag--aaa 304  Q
    ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||||||  | | |||||||||| |||||||  |||    
T  10109762 aattgctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagtggtggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaa 10109663  T
Q  305 aaactcaaacgtgtaa 320  Q
    ||||||||||||||||    
T  10109662 aaactcaaacgtgtaa 10109647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 441
Target Start/End: Original strand, 14084674 - 14084973
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaatt-attgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtt 257  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  || | |||| ||    
T  14084674 gaatggtttatgcgaagaaaaaaattgattattgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgactgattaagtgattatacattttaggggtgatt 14084773  T
Q  258 tgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatattttttat 344  Q
    |||||| | |||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  ||||             |||||||||||||||||||    
T  14084774 tgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacctgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttat 14084873  T
Q  345 ttaagtgg-gggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |   |||||| || | |||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14084874 ttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttaaaggcccgtaacatttggaggtccggtctggttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggc 14084973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30899800 - 30899526
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa---aaagaaattattgttgtgattctttcaat 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  || | ||||| | | || | || |||||||||||| |||   ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  30899800 ctaacggtgtcgtttggatttgtcattcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaat 30899701  T
Q  205 gaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaa- 303  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | |||| |||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| |||||||||     
T  30899700 gaaatagctttccaaattgactaattaagtgattatacaaattaggggtgatttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaa 30899601  T
Q  304 -aaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtatta 364  Q
     ||||||||||||||   |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30899600 aaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaagtgggggtgggtatta 30899526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 50552637 - 50552301
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||||| | | || | ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  50552637 ctaatggtgtcgtttggatttgtcactcctatgttgtggaaaaaggtaaaatgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 50552538  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtcta-gaaaa 305  Q
    ||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||  ||||    
T  50552537 aataacttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctacaaaaa 50552438  T
Q  306 aactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatata-ttttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccat 388  Q
    ||||||||||||   |||||||           ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  |||| ||||    
T  50552437 aactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatttttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggtccat 50552338  T
Q  389 agcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcac 425  Q
    ||| ||||||| || ||  || |||||||||||||||    
T  50552337 agcatttggagacctggtctggttgagcaccttgcac 50552301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25930745 - 25930532
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaa 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| | | || | ||  ||||||||||   || || |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25930745 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatccaaagaaaaaatgattgttgtgatcctttcaatgaa 25930646  T
Q  208 atagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag--aaaa 305  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||  | | | |||||||| |||||||  ||||    
T  25930645 atagcttttcaagttgactgattaagtgattatacaaattaggggtagtttgataggatcagatttatgtacaaaaatgagaactagagtctagacaaaa 25930546  T
Q  306 aactcaaacgtgta 319  Q
    ||||||||||||||    
T  25930545 aactcaaacgtgta 25930532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 258
Target Start/End: Original strand, 13120764 - 13120939
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||  | ||  || ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13120764 ttaagtgatagagaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaa 13120862  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  13120863 ataattgtggtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattattcaaattaatggtggttt 13120939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 441
Target Start/End: Original strand, 18127844 - 18128212
Alignment:
Q  94 agaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttg 191  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |  | ||||| | | || | || |||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  18127844 agaggtaaaatttacctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctttgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaataattgttg 18127943  T
Q  192 tgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaac 291  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| | | |||||| || |  | ||||||||    
T  18127944 tgattcttgcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatccgatttacgt-acaaaaggagaac 18128042  T
Q  292 taaagtctag--aaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattt--tttatttaagtggggg-tgggtattagagttaatt 373  Q
    || | |||||  ||||||||||||||||   |||||||           |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  18128043 tagaatctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatattttttatttatttaagtgggggctgggtattaaatttaatt 18128142  T
Q  374 ttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    |||  |  |||| || |||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18128143 tttcgttagaggtccgtagcatttagaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggccgggc 18128212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 377
Target Start/End: Original strand, 29208022 - 29208303
Alignment:
Q  110 aacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||   ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29208022 aacggtgtcatttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaa 29208121  T
Q  209 tagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaa 307  Q
    |||| || || |||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||  |  ||||||||||  | | | |||||||| ||||||| ||||||    
T  29208122 tagacttccagattgactgattaaatgattatacaaattaggggtggtttgatatgattagatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagaaaaaaa 29208221  T
Q  308 ctcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaatttttt 377  Q
     |||||||||||  ||||             |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29208222 ttcaaacgtgtaccgaagaaagaaaaggatataacatatat-ttttttatttaagtgggggtgagtattagacttaatttttt 29208303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 304
Target Start/End: Original strand, 44836623 - 44836840
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||| | ||||||  | ||  |||||| | || | || |||||||||||| |||||||||    
T  44836623 ttaagtgaaagagatgtgaaatttacctagcggtgtcatttggaat-gtcactcctacgtcgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaa 44836721  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || ||    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||  ||    
T  44836722 atgat----gtgattctttcagtgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgttcag 44836817  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaa 304  Q
    | || ||||||| | ||||||||    
T  44836818 aaagtagaactagaatctagaaa 44836840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Original strand, 22386812 - 22386963
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaaaaagaaatta-ttgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||      
T  22386812 aatggtttatgcaaaaaaaatattaattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattgttcaaattgatggtggttaa 22386911  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactca 311  Q
    |||| | || ||||||||| ||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  22386912 atagcatcaaatttatgtccagacagtggaactagagtctagaaaaaactca 22386963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1269716 - 1269484
Alignment:
Q  84 taagtgaaagagaggtataatttact-aacggtgtcatttggatttgtcacttatccgct-gtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| | | || || ||||| | |||| | |||| ||    
T  1269716 taagtgaaagaaaggtgaaatttacggaacggtgtcgtttggatttgtcactcctccgcttgtgggaaaggagaaaacgaatg-tatatgcggaaaa-aa 1269619  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||        | |||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  1269618 atgattgttgtgattcttttaatgaaatagcttttcaaattgactaat--------tttacaaattgggggtggtttcatagcatcagatttatgtctag 1269527  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaa 324  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1269526 aaaggagaattagagtctagaaaaaactcaaacgtgtacagaa 1269484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 52055616 - 52055347
Alignment:
Q  185 attgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagata 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||   | | ||||||||  |  ||||||||||  | | |    
T  52055616 attgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgattgattaagtgattatataaattatggatagtttgatatgattagatttatgtacaaaaa 52055517  T
Q  285 ggagaactaaagtctagaaaaaa--ctcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatttttt-atttaagtgggg-gtgggtattagag 367  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||             |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||     
T  52055516 ggagaactagagtctaaaaaaaaaactcaaacgtatactgaagaaagaaaatgatataacatatatttttattcatttaagtggggagtgggtattagac 52055417  T
Q  368 ttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  52055416 ttaattttttatttgagacccatagcatttggaggctcggcctggttgagcaccttgcactcccccaagg 52055347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 276
Target Start/End: Original strand, 28885593 - 28885762
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| | | |  | || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28885593 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaaagataaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttacaatga 28885692  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatg 276  Q
    ||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| | | ||||||||    
T  28885693 aatagctttcaaaattgattgattaagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatccgatttatg 28885762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9777580 - 9777387
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||  | ||||| | |||| ||  ||||||||||| ||||| | |    
T  9777580 ttaagtgaaagagaagtgaaatttacctaacggtgtcgtttggatttatcattcatccattatgggaaagggga-aacaaatggtttatgagaaaaggta 9777482  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaat-gaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttat 275  Q
    || ||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||||    
T  9777481 atgattgttgtgattctttttattgaaatagttattcaaattgactgattgagtgattatataaattgggggtggtttggtagcatcagatttat 9777387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Original strand, 26486348 - 26486499
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||        |||||||||||||||||| || |||||||    
T  26486348 gaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttatgattttttcaatgaaatagcttttcagatt--------aagtgattatacaaattgatgatggtttg 26486439  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    |||| | || |||||| || ||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  26486440 atagcatcaaatttatttccagaaagtagaactagagtttagaaaaaactcatacgtgta 26486499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 250
Target Start/End: Original strand, 30004882 - 30004972
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggt 250  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  30004882 gaatggtttatgggaagaacaaatgattgttgcgattctttcaatgaaatagcttttcaaattaattgattaagtgattatacaaattggt 30004972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 149 - 9
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||| | | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  149 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 50  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaatt 247  Q
    |||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49 aatcactttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Original strand, 6333491 - 6333650
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||| | | |||||||    
T  6333491 gaatggtttatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattcttttaataaaataactttccaatttgactgattaagtgattttacagattag-gatggtttg 6333589  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctaga-aaaaactcaaacgtgta 319  Q
    |||||| |||||||||||  ||  | |||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  6333590 atagtatcagatttatgtacaggaatgagaactagagtctaaagaaaaactcaaacgtgta 6333650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20470637 - 20470519
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtggggg-tgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttg 422  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||    
T  20470637 taacatatatattttttatttatgtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttgtaggtccggcctggttgagcaccttg 20470538  T
Q  423 cactccctcaaggctgggc 441  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  20470537 cacaccctcaaggcggggc 20470519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3907545 - 3907402
Alignment:
Q  175 aaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagattta 274  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||  |||||||||||  | |  |||||    
T  3907545 aaaagaaattatttttatgattctttcaatgaaataatttttcaaattgattgattaaatgattatacaaattgg-agtggtttgataccatcgtattta 3907447  T
Q  275 tgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    |||  | | || | || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3907446 tgttcataaagaaaaaataaagtctaaaaaaaacttaaacgtgta 3907402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6150599 - 6150503
Alignment:
Q  342 tatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6150599 tatttaagtagggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaagcccggcctgattgagcaccttgcacaccctcaagg 6150503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38263924 - 38263804
Alignment:
Q  189 ttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggag 288  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || || ||||| | | ||||||| |||| | || ||||||||| | | ||  |    
T  38263924 ttgtgattctatcaatgaaatagttttttaaattgactgattaagtaataattcaaatcgatagtggtttaatagcatcaaatttatgtccaaaaagtgg 38263825  T
Q  289 aactaaagtctagaaaaaact 309  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  38263824 aactagagtctagaaaaaact 38263804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 314
Target Start/End: Original strand, 31369435 - 31369518
Alignment:
Q  231 aagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaac 314  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  31369435 aagtgattatacaaattgaaagtggtttgataacatcagatttatgtccagaaaggagaattagagtttagaaaaaactcaaac 31369518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 28189391 - 28189327
Alignment:
Q  255 gtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||||||||| | |||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28189391 gtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactaaagtctaaaaaaaactcaaacgtgta 28189327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Original strand, 31369376 - 31369428
Alignment:
Q  157 aatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaat 209  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  31369376 aatgaatggtttatgcaaaaaagaaatgatttttgtgattcttttaatgaaat 31369428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1269468 - 1269382
Alignment:
Q  327 aacatatatat-tttttatttaagtgggg-gtgggtattagagttaatt--ttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttg 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  1269468 aacatatatatatttttatttaagtgaggtgtggatattagacttaattgtttttttgaggcccataacttttagaagcccggcttg 1269382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 376
Target Start/End: Original strand, 12884292 - 12884343
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||    
T  12884292 taacatatatattttttatttaagtaggggttggatattagatttaattttt 12884343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 48 - 436
Target Start/End: Original strand, 45172510 - 45172895
Alignment:
Q  48 agagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtggg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45172510 agagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa--taagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgttgtggg 45172607  T
Q  148 acatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaatt 247  Q
    | | |||| || ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45172608 aaaggggaaaacgaatggtctatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttccatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 45172707  T
Q  248 ggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttattta 347  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45172708 ag-ggtggtttgatagtaccagatttatgtccagattggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttattta 45172806  T
Q  348 agtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45172807 agtgggggtggatattagatttaattttttttgaggcacataacttttgtaggtccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 45172895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 83 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 34982391 - 34982038
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttg-gatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||| | |||| ||  |||| ||||| ||||||||||    
T  34982391 ttaagtaaaagagaggtagaatttactaacggggtcgtttgagatttgtcatttatctgttgtgggaaaggggaaaacaaatgatttatatgaaaaagaa 34982292  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  34982291 ataattgttgtgattctttcaacgaaatagtttttccaattgactgattaagtgattatacaaattggggatggtttgttagtaccagatttatgtccag 34982192  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatga 381  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34982191 atagaaaaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtaggggtgggtattagatttaattttttctga 34982092  T
Q  382 ggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34982091 ggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcacattgcactccctcaagg 34982038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 47 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 55134410 - 55134024
Alignment:
Q  47 aagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  55134410 aagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcatttggatttattacttatccgttgcgg 55134312  T
Q  147 gacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaa-gaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaa 245  Q
    || | |||| || ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  55134311 gaaaagggaaaacgaatgatttatgtaaaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 55134212  T
Q  246 ttggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatt 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55134211 ttggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctacaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaatatatatattttttatt 55134112  T
Q  346 taagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  55134111 taagtgggggtgggtattagagtaaattttttcgaagacacatagcttttgaaggcccggcttgtttgagcaccttgcaccccctcaa 55134024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 53011854 - 53011507
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  53011854 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttttaatga 53011755  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaa 306  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | ||||||| || ||| ||||||||    
T  53011754 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaattagagtttagaaaaa 53011655  T
Q  307 actcaaacgtg---taaagaagtaacat--------atatattttttatttaagtggggg-tgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagct 392  Q
    |||||||||||   |||||||  || ||        ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  |  ||||||| ||||     
T  53011654 actcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatattttttatttaaatgggggatgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagca 53011555  T
Q  393 tttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53011554 tttggagg-ccggtctggttgagcaccttgcacaccctcaaggctgggc 53011507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5545539 - 5545261
Alignment:
Q  38 tagaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcactta 136  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||   ||  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||      
T  5545539 tagaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaaattaagtgaaagac--gtgaaatttacctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcc 5545442  T
Q  137 tccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtga 236  Q
    |||| |||| ||   |||| || |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  5545441 tccgttgtgagaagggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagctttccaaattgaccgattaagtga 5545342  T
Q  237 ttatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5545341 ttatacaaattggtggtggtttgatggcatcaaatttatgtccagacagaagaattagagtctagaaaaaactcaaacgtg 5545261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 319
Target Start/End: Original strand, 35653878 - 35654114
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | | ||||||  | ||  || ||| | || | || |||| ||||||| |||||||||    
T  35653878 ttaagtgaaagagaggtgaaatttatctaacggtgtcatttgaaat-gtcactcctacgtcgtaggaaagggaaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaa 35653976  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||| ||    
T  35653977 ataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcatatttatgtccag 35654076  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35654077 aaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgta 35654114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 434
Target Start/End: Original strand, 21791523 - 21791816
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttga 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  21791523 aatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacacattgaaggtggtttga 21791622  T
Q  261 tagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt-------------aaagaagtaacatatata-------tttt 340  Q
    | | | || ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||             ||||||||||||||||||       ||||    
T  21791623 tggcatcaaatttatgttcagaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacatgtactgatgaaagaaaaagaagtaacatatatatatatattttt 21791722  T
Q  341 ttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaag 434  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||||||||| |||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  21791723 taatttaagtgggggtgggtattagactgacctttttttaaggcccatagtttttagagatctggcttgattgaacacattgcactcccccaag 21791816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 441
Target Start/End: Original strand, 32130764 - 32131062
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32130764 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggttt 32130863  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatt 345  Q
    ||||| | | |||||||||  | | || |||||||  |||||||||||||||||||| |   |||||||           ||||||||||||||||||||    
T  32130864 gataggatccgatttatgtacaaaaagaagaactagtgtctagaaaaaactcaaacgggtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatt 32130963  T
Q  346 taagt-gggggtgggtattagagttaattttttatgag--gcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||  || | |||| ||||||||||| || || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  32130964 taagtggggggtgggtattagatttaatttttcgtgagaagctcgtagcatttggaggcccagcctggttgaacaccttacacaccctcaaggccgggc 32131062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19661521 - 19661172
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  | ||||| | | || | || ||||||||||||  || ||| |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19661521 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctttgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaaggattgttgtgtttctttcaatga 19661422  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaa 306  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | | |||||||| ||||||||||||    
T  19661421 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctagaaaaa 19661322  T
Q  307 actcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtggggg-tgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatag 390  Q
    |||||||||||   |||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |  ||| |||||||    
T  19661321 actcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaagtgggggatgggtattaaatttaatttttcgttagagacccatag 19661222  T
Q  391 cttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    | |||| |||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19661221 catttgaaggccc-gcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggcggggc 19661172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 433
Target Start/End: Original strand, 11681664 - 11682008
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||| | | || | || | |||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11681664 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaagggtaaaacggatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 11681763  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgt-caagataggagaactaaagtctag-aaa 304  Q
    ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  || | |||||||||| ||||||| |||    
T  11681764 aataactttccaaattgactgattaagtgattataaaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtaaaaaaaaggagaactagagtctagaaaa 11681863  T
Q  305 aaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccat 388  Q
    |||||||||||||   |||||||           ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| | |    
T  11681864 aaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaagaatataatatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggctcgt 11681963  T
Q  389 agcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  11681964 agcatttgaaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 11682008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 433
Target Start/End: Original strand, 11689943 - 11690287
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||| | | || | || | |||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11689943 ctaacggtgttgtttggatttgtcactcatctgttgtggaaaagggtaaaacggatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 11690042  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgt-caagataggagaactaaagtctag-aaa 304  Q
    ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  || | |||||||||| ||||||| |||    
T  11690043 aataactttccaaattgactgattaagtgattataaaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtaaaaaaaaggagaactagagtctagaaaa 11690142  T
Q  305 aaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccat 388  Q
    |||||||||||||   |||||||           ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| | |    
T  11690143 aaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaagaatataatatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggctcgt 11690242  T
Q  389 agcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  11690243 agcatttgaaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 11690287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 425
Target Start/End: Original strand, 28463562 - 28463845
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28463562 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaacttgattgattaagtgattatacaaattaggggtggttt 28463661  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgt---gtaaagaa----------gtaacatatatattttttat 344  Q
    ||||  | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    |||||||           |||||||||||||||||||    
T  28463662 gataagatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtttactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttat 28463761  T
Q  345 ttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcac 425  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  28463762 ttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggtccggcctgattgaacaccttgcac 28463845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22423775 - 22423560
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtg--aaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtt 257  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22423775 gaatgatttatgtggaaaaaataaataattgttttgattctttcaataaaatagtttttcaaattgattgattaagtgatcatacaaattgatggtggtt 22423676  T
Q  258 tgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt---------aaagaagtaacatatatattttttatttaa 348  Q
    |||||| | || ||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||         ||| ||||||||||||  ||||| || |||    
T  22423675 tgatagcatcaaatttatgtccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgtaccaaagaaaaaaaagtaacatataattttttaatataa 22423576  T
Q  349 gtgggggtgggtatta 364  Q
    ||||||||||||||||    
T  22423575 gtgggggtgggtatta 22423560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 316
Target Start/End: Original strand, 23426140 - 23426298
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23426140 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagaggtggttt 23426239  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgt 316  Q
    ||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23426240 gataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgt 23426298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27632488 - 27632199
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    ||||| |||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27632488 gaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgatgtgattctttcaatgaagtagcttttcaaattgactaattaagtgattatacaaattaggggtggttt 27632389  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaa-aaaactcaaacgtgta---aagaagtaacat--------atatattttttattt 346  Q
    ||||| | || ||||||||  | | |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||  || ||        |||| ||||||||||    
T  27632388 gataggatcaaatttatgtacaaaaaggagaactagaatctagaaaaaaactcaaacgtgtactgaagaaagaaaattatataacatattttttttattt 27632289  T
Q  347 aagtggggg-tgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    ||  ||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  27632288 aacagggggatgggtattagtcttaatatttttttaggcccgtagcatttggaggcccggcctagttgagcaccttgcactccctcaagg 27632199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 318
Target Start/End: Original strand, 43154763 - 43154921
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    ||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43154763 gaatgatttatgcgaaaaataaataattgttgtgattcttttaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttg 43154862  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 318  Q
    |||| | || ||||||||| | | || ||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  43154863 atagcatcaaatttatgtccaaaaagtagaactagaatctagaaaaaactcatacgtgt 43154921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 41038392 - 41038178
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41038392 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 41038293  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgt-caagataggagaactaaagtctag-aaa 304  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||| |   ||||||||| ||| | |  | ||||| ||||||| |||    
T  41038292 aatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgatttgataggattcgatttatgtacaaaaaaaaaaaactagagtctagaaaa 41038193  T
Q  305 aaactcaaacgtgta 319  Q
    |||||||||||||||    
T  41038192 aaactcaaacgtgta 41038178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23256683 - 23256394
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  23256683 gaatggtttatgggaagaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaatagctttctaaattgactgattaagtggttatacaaattaggggtggtttg 23256584  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta--aagaa----------gtaacatatata--ttttttatt 345  Q
    |||| | | |||||||||  | | |||||||||  |||||| |||||||||||| |||||  |||||           |||||||||||  |||||| ||    
T  23256583 ataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactggagtctaaaaaaaactcaaatgtgtactaagaaagaaaaggatataacatatatattttttttgtt 23256484  T
Q  346 taagtgggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||  |   || |||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23256483 taagtgggggtggatattatatttaatttttcgttaaagacccataacatttggaggttcggcctgattgagcaccttgcacaccctcaa 23256394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 441
Target Start/End: Original strand, 29221595 - 29221896
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||||    |||||||    
T  29221595 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattccttcaatgaaatagacttccaaattgaccgtttaagtgattatacaaattaagagtggttt 29221694  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatata--tttttt 342  Q
    ||||| | |||||||||||  | | | ||||| || ||||||| |||||||||||||||| || ||||             |||||||||||  ||||||    
T  29221695 gataggatcagatttatgtacaaaaacgagaattagagtctagaaaaaaactcaaacgtgaaatgaagaaagaaaaggatataacatatatatttttttt 29221794  T
Q  343 atttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgg 439  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||  | |||||||||| || ||||||||||| |   | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  29221795 atttaagtggggggtgggtattaaacttaattttttgtttgaggcccatggcatttggaggcccagtccggttgagcaccttgcactcccacaaggccgg 29221894  T
Q  440 gc 441  Q
    ||    
T  29221895 gc 29221896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 263
Target Start/End: Original strand, 10575450 - 10575601
Alignment:
Q  111 acggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaata 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||  |||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10575450 acggtgtcattcggatt-gtcactcctccgtcgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattatttcaatgaaata 10575548  T
Q  211 gattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatag 263  Q
      |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  10575549 actttctaaattgactgattaagtgattatacaagttgagggtggtttgatag 10575601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24449200 - 24449054
Alignment:
Q  175 aaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattg--gtggtggtttgatagtaccagatt 272  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||| | || |||    
T  24449200 aaaagaaataattgttgtggttctttctaagaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgatatagtggtttgatagcatcaaatt 24449101  T
Q  273 tatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24449100 tatatccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgta 24449054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29580022 - 29579823
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  || | ||||| | |||| | || |||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  29580022 ctaacggtatcatttggatttgtcactactctgttgtggaaaatggtaaaacgaattgtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcattga 29579923  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaa 306  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||  | | |  ||||||| ||||||||||||    
T  29579922 aatagcttttcaatttgactgattaattaattatacaaattatgggtggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaatagaactagagtctagaaaaa 29579823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44478182 - 44478011
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa--aaagaaattattgttgtgattctttcaatg 205  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  || | ||||| | | || | || |||| ||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  44478182 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 44478083  T
Q  206 aaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgt 277  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||| | | |||||||||    
T  44478082 aaatagctttccaaattgactgatttagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatctgatttatgt 44478011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21169088 - 21168848
Alignment:
Q  218 aaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaa-ctcaaacgt 316  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| | |||| |||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21169088 aaattgactcattaattgattatacaaattaggggtgatttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgt 21168989  T
Q  317 gtaaagaag-------------taacatatatattttttatttaagtg-ggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggagg 400  Q
    ||| | |||             |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  |  ||||||| || | |||||||     
T  21168988 gtacaaaagaaagaaaaggttataacatatatattttttatttaagtgtggggtgggcattagatttaatttttcgttagaggcccgtatcatttggaga 21168889  T
Q  401 cccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
     ||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  21168888 tccggcctggttgagcaccttgcataccctcaaggccgggc 21168848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16072648 - 16072523
Alignment:
Q  195 ttctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaa 294  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | ||||||||||| | || ||||||||  | | |||||| |||     
T  16072648 ttctttcattgaaatagtttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattagggatggtttgataggatcaaatttatgtacaaaaaggagatctag 16072549  T
Q  295 agtctag-aaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  16072548 agcttagaaaaaaactcaaacgtgta 16072523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 416
Target Start/End: Original strand, 26329065 - 26329278
Alignment:
Q  218 aaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg 317  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||   | ||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  26329065 aaattgactgattgaatgattatataaattggaggtggtttggtagcatcagatttatgtc--caaaggagaattacagtctagaaaaaattcaaacgtg 26329162  T
Q  318 t-------------aaagaagtaacatatatattt-tttatttaagtgggggtgggtattagagttaatt--tttta-tgaggcccatagcttttggagg 400  Q
    |             ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  26329163 taccaaagaaagaaaaagaagtaacatatatttttatttatttaagtggggtgtggcattagacttaatttattttattggggcccataggttttggagg 26329262  T
Q  401 cccggcttgattgagc 416  Q
    ||||||||| ||||||    
T  26329263 cccggcttggttgagc 26329278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 434
Target Start/End: Original strand, 39372816 - 39372927
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtgg-gggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |   |||||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  39372816 taacatatatattttttatttaagtggcgggtggatattagatttaatttttcgttaaaggcccgtagaatttggaggtccggcctggttgagcaccttg 39372915  T
Q  423 cactccctcaag 434  Q
    ||| ||||||||    
T  39372916 cacaccctcaag 39372927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 29579757 - 29579654
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtg-ggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttg 422  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||  | |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  29579757 taacatatattttttttatttaagtggggggtgagcattagacttaattttttgtttgagacccgtagcatttggaggtccggcctgattgagcactttg 29579658  T
Q  423 cact 426  Q
    ||||    
T  29579657 cact 29579654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16072310 - 16072268
Alignment:
Q  337 ttttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttat 379  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16072310 ttttttatttatgtgggggtgggtattagacttaattttttat 16072268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 433
Target Start/End: Original strand, 51066738 - 51066851
Alignment:
Q  323 aagtaacatatatattttttatttaagtgggg-gtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcacc 419  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||  | |||||||| || | ||| |||| ||||| || | ||| |||    
T  51066738 aagtaacatatatttcttttatttaaatggggagtggatattagacttaattttttgtttgaggcccgtaacatttagaggtccggcctggtagagaacc 51066837  T
Q  420 ttgcactccctcaa 433  Q
    ||||||||||||||    
T  51066838 ttgcactccctcaa 51066851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41038154 - 41038040
Alignment:
Q  330 atatatatttttt-atttaagtggggg-tgggtattagagttaattttttatgag-gcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcact 426  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||  | || | || || | |||||||||||||| || ||||||| |||||||     
T  41038154 atatatatttttttatttaaatggggggtggatattagatttaatttttcgttagagaccgtatcatttggaggcccggcctggttgagcatcttgcaca 41038055  T
Q  427 ccctcaaggctgggc 441  Q
    |||||||||| ||||    
T  41038054 ccctcaaggccgggc 41038040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Original strand, 51066347 - 51066449
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtg--aaaaagaaattattgttgtgattctttcaatg 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  | || | |||||   |||| ||  ||||||||||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  51066347 ctaacagtgtcatttggatttgtcactccttcgttttgggaa--gggaaaacaaatggtttatgcggaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 51066444  T
Q  206 aaata 210  Q
    |||||    
T  51066445 aaata 51066449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 39 - 441
Target Start/End: Original strand, 26282395 - 26282798
Alignment:
Q  39 agaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatc 138  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||     
T  26282395 agaatcagaagagtttctaaacatgaaatgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcatttgtatttttcacttata 26282493  T
Q  139 cgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa--aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtga 236  Q
     | ||||||| | | || |||||||| ||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26282494 tgttgtgggaaaggagaaaatgaatgatttatatgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtga 26282593  T
Q  237 ttatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatata 336  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26282594 ttatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtgcagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatata 26282693  T
Q  337 ttttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26282694 ttttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttctgaggcctatagcttttggaggcccggcttgattgagtaccttgcactccctcaaggc 26282793  T
Q  437 tgggc 441  Q
     ||||    
T  26282794 cgggc 26282798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 39 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1366218 - 1365822
Alignment:
Q  39 agaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatc 138  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1366218 agaatcagaagagcttgtaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagaggtagaatttacaaacggtgtcatttgaatatgtcaattatc 1366120  T
Q  139 cgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgatt 238  Q
    || ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||    
T  1366119 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaataacttttcaaattgactgattaagtcatt 1366020  T
Q  239 atacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 338  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1366019 ataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtctagaagaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 1365920  T
Q  339 ttt-tatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1365919 tttatatttaagt-ggggtgggtattagagttaattttttcggaggcccatagattttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 1365822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 46 - 436
Target Start/End: Original strand, 40001573 - 40001946
Alignment:
Q  46 gaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  40001573 gaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagaggtggaatttactaacggcgtcgtttgaatttgtcacttatccgttgtg 40001671  T
Q  146 ggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaa 245  Q
    ||| | || | || |||||||||                ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40001672 ggaaagggaaaaacgaatggtttg---------------attgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaa 40001756  T
Q  246 ttggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatt 345  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40001757 ttggaggtggtttgatagtaccagatttatgttcagatagaagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatt 40001856  T
Q  346 taagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40001857 taagtaggggtgggtattagagttaatttttt-ttaggcccatagcttttggaggcccggcttaattgagcaccttgcactctctcaaggc 40001946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 26633529 - 26633172
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttact-aacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| | |||||| || ||  |||||| | || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  26633529 ttaagtgaaagagaggtgaaatttacttaacggtgtcgtttggaat-gtcactcatacgtcgtgggaaagggaaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaa 26633431  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | || ||||||||| ||    
T  26633430 atgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggttttatagcatcaaatttatgtccag 26633331  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt-------------aaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagt 368  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||             |||||||||||  || || ||||| ||||||| ||||||||||||| | |    
T  26633330 aaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgtaccgaagaaagaaaaagaagtaac--atgtaatttttctttaagttggggtgggtattatact 26633233  T
Q  369 taattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccc 429  Q
    |||||| || | ||||||| || |||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  26633232 taatttgtttttaggcccaaagtttttagaggtccggcttagttgagctccttgcactccc 26633172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 25610087 - 25609907
Alignment:
Q  253 tggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtgg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  25610087 tggtttgatagtaccagatttatgttcagataggagaactaaagtctagaaaaaacccaaatgtgtaaagaagtaacatacatattttttatttaaatgg 25609988  T
Q  353 gggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
     |||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25609987 aggtgggtattagagttaattttttctgtgactcataacttttagagactcgacttgattgagcaccttgcactccctcaa 25609907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 32956940 - 32956704
Alignment:
Q  85 aagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaat 183  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  32956940 aagtgaaagataggtgaaatttacctaacagtgtcgtttggatttgtcactcatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaat 32956841  T
Q  184 tattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagat 283  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||     
T  32956840 cattgttgtgattctttcaatgaaataactttataaattgactgattaaatgattataaaaattgggggtggtttgatagcatcagatttatgtccagaa 32956741  T
Q  284 aggagaactaaagtct-agaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  32956740 aggagaactagagtctaaaaaaaaactcaaacgtgta 32956704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 33910154 - 33909863
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  33910154 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagcgattatacaaattaggggtgattt 33910055  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaa-aaaactcaaacgtgt-----------aaagaagtaacatatatattttttattt 346  Q
    ||||| | |||||||||||  | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||           |||||  |||||||| | ||||||||||    
T  33910054 gataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtaccgaagaaagaaagatataacatat-ttttttttattt 33909956  T
Q  347 aagtg-ggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  33909955 aagtgaggggtgggtattagacttaattttttgtttgaggcccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcaccttgcacacccccaaggc 33909863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 311
Target Start/End: Original strand, 36438249 - 36438477
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  | ||  || ||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  36438249 ttaagtgaaagataggtgaaatttacctaacggtgtcatttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaagggaaaacgaatggtttatgtgaaaaataa 36438347  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| | || ||||||||| ||    
T  36438348 attattgttgtgattctttcaatgaaatggtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatagtggtttgatagcatcaaatttatgtccag 36438447  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactca 311  Q
    | || ||||||| || ||||||||||||||    
T  36438448 aaagtagaactagagcctagaaaaaactca 36438477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 425
Target Start/End: Original strand, 18015570 - 18015837
Alignment:
Q  173 gaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatt 272  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||    
T  18015570 gaaaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatt 18015669  T
Q  273 tatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggggtggg 359  Q
    |||||  | | |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18015670 tatgtacaaaaaggaaaactagagtctagaaaaaactcaaacatgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaagtgggggtggg 18015769  T
Q  360 tattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcac 425  Q
    ||||||| |||||||||  |  ||||||| || | |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  18015770 tattagatttaatttttcgttagaggcccgtaacatttggaggcccggcctggttgagcatcttgcac 18015837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 435
Target Start/End: Original strand, 46221610 - 46221969
Alignment:
Q  94 agaggtataattta-ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttg 191  Q
    ||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||| |  || | ||||| | |||| | || |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  46221610 agaggtaaaatttatctaacgatatcatttggatttgtcattcttctgttgtggaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaataaaaaaatgattgttg 46221709  T
Q  192 tgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaac 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |   |||||||||  | | | ||||||    
T  46221710 tgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattctacaaattaggggtagtttgataggattcgatttatgtacaaaaaagagaac 46221809  T
Q  292 taaagtctag-aaaaaactcaaacgt---gtaaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttt- 376  Q
    || ||||||| |||||||||||||||    |||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  46221810 tagagtctagaaaaaaactcaaacgtatactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtaggggtgggtattagatttaatttttc 46221909  T
Q  377 -tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
     |  |||| || |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  46221910 gttagaggtccgtagcatttggaggcccggcctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 46221969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 185 - 433
Target Start/End: Original strand, 8358294 - 8358558
Alignment:
Q  185 attgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagata 284  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | |    
T  8358294 attgttgtgattctttcaatgagataactttttaaattgactgattaagtgattatataaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaa 8358393  T
Q  285 ggagaactaaagtctaga-aaaaactcaaacgt---gtaaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagtta 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||           |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  8358394 ggagaactaaagtctagagaaaaactcaaacgtatactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtgagggtggatattagattta 8358493  T
Q  371 attttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    ||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||    
T  8358494 attttttgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggatgagcaccttgcacaccctcaa 8358558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42312221 - 42311943
Alignment:
Q  37 ttagaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttact-aacggtgtcatttggatttgtcactt 135  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||     
T  42312221 ttagaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacttaacggtgtcgtttagatttgtcgctc 42312122  T
Q  136 atccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtg 235  Q
    ||||| ||||| | | |||| || ||||  |||| | |||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  42312121 atccgttgtggaa-aggggaaaacgaattatttaagcgaaaaataaatgactgttgtgattcttttaatgaaatagcttttcaaattgactaatcaagtg 42312023  T
Q  236 attatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 316  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||| ||  | |||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42312022 attatacaaatcgagggtagtttg-taacatcagatttatgtccagaaaagagaattagagtctagaaaaaactcaaacgt 42311943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25610275 - 25610091
Alignment:
Q  39 agaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatc 138  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25610275 agaatcagaagagcttccaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagagatagaatttactaacggtgtcgtttggatttgtcacctatc 25610177  T
Q  139 cgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattga 224  Q
    |  ||||||| | |||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  25610176 cattgtgggaaaggggaaaactattggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatgacttttcaaattga 25610091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 168 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9479208 - 9479057
Alignment:
Q  168 tatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtacc 267  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  9479208 tatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaacgaaatagttttttaaattgactgattaagtaattatacaaattgatggtggtttgatagcatc 9479109  T
Q  268 agatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    | ||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  9479108 aaatttatgtccagaaagtagaactagagtttagaaaaaaatcatacgtgta 9479057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7366784 - 7366565
Alignment:
Q  152 gggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtg 251  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||| ||||| ||||||| ||    
T  7366784 gggaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaataaaatagtttttcaaattgacaaattaagtaattattcaaattgatg 7366685  T
Q  252 gtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt-------aaagaagtaacatatatattttttat 344  Q
    ||||||| |||  | || ||||||||| ||| ||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||||       ||| ||||||||||||   |||| ||    
T  7366684 gtggtttaatatcatcaaatttatgtccagaaagtggaactagagtatagaaaaaactcatacgtgtgctgaaaaaaaaagtaacatataatattttaat 7366585  T
Q  345 ttaagtgggggtgggtatta 364  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  7366584 ttaagtgggggtgggcatta 7366565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30739288 - 30739052
Alignment:
Q  85 aagtgaaagagaggtataatttactaa-cggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaat 183  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| ||||  | | |||| ||  ||| ||||||| ||||| |||||    
T  30739288 aagtgaaagagaggtgaaatttaccaaacggtgtcatttggatttgtcactccgccgttgtgaaaaaggggaaaactaattgtttatgcgaaaaggaaat 30739189  T
Q  184 tattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagat 283  Q
     || ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||||| | | |||||||||| |||     
T  30739188 gatcgttgtgattcttttaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattataaaaattgaagatggtttgatagcatccgatttatgtccagaa 30739089  T
Q  284 aggagaactaaagtctagaa-aaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||||||| |  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  30739088 aggagaattggaatctagaaaaaaactcaaacgtgta 30739052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 435
Target Start/End: Original strand, 42161044 - 42161389
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42161044 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaa-aaattgttgctgtgattctttcaatgaa 42161142  T
Q  208 atagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg--atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaa 304  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| | |  ||||||||  | | | ||||| || ||||||| |||    
T  42161143 atagctttccaaattaactgatcaagtgattatacaaattaggggtggtttgatataggatccaatttatgtacaaaaatgagaattagagtctagaaaa 42161242  T
Q  305 aaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccat 388  Q
    |||||||||||||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||  |  ||||||| |    
T  42161243 aaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggggggaggatattaaatttaatttttcgttagaggcccgt 42161342  T
Q  389 agcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  42161343 agcatttggaggctcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 42161389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 435
Target Start/End: Original strand, 36796293 - 36796636
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa--aaagaaattattgttgtgattctttcaatg 205  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  36796293 ctaacggtgtcgttttgatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 36796392  T
Q  206 aaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaacta-aagtctagaaa 304  Q
    |||||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||| ||||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| |||||||||||    
T  36796393 aaataattttccaaattgactgattaagttattatacaaattaagggtagtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagaagtctagaaa 36796492  T
Q  305 aaactcaaacgtg---taaagaa---------gtaacatatatattttttatttaagtggg-ggtgggtattagagttaatttt--ttatgaggcccata 389  Q
    |||||||||||||   |||||||          ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| || ||    
T  36796493 aaactcaaacgtgtactaaagaaagaaatgatataacatatatattttttatttaaatgggaggtgggtattagatttatttttcgtta-gaggtccgta 36796591  T
Q  390 gcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  36796592 gtatttggagg-ccggcctggttgagcaccttgcacagcctcaagg 36796636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 319
Target Start/End: Original strand, 41852197 - 41852432
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||||| | | |||| |||||||  ||||||  ||||||||    
T  41852197 ttaagtgaaagagatgtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctccgttgtggaaaaggggaaaatgaattatttatgcaaaaaagaa 41852296  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||| |||| |||| |||||  ||  |    
T  41852297 atgagtgttgcgattctttcaatgaaataactctttaaattgactgagtaagtgattata-aaattgg-agtggttttatagcaccatatttacatcctg 41852394  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41852395 aaaggagaactaaagtctagaaaaaacccaaacgtgta 41852432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41908262 - 41908149
Alignment:
Q  165 gtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagt 264  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||     
T  41908262 gtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagcttttctaattgactgattaagtgattgtacaaattggaggtggtttgaaagc 41908163  T
Q  265 accagatttatgtc 278  Q
    | ||||||||||||    
T  41908162 atcagatttatgtc 41908149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Original strand, 44894003 - 44894164
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44894003 gaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaaatagctttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggttt 44894102  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgta 319  Q
     |||| | | |||||||||  | | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  44894103 aataggatccgatttatgtacaaaaagaagaactatagtctagaaaaaaactcaaacgtgta 44894164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 319
Target Start/End: Original strand, 6380013 - 6380220
Alignment:
Q  115 tgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa-attattgttgtgattctttcaatgaaatagat 213  Q
    |||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  6380013 tgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaatatgattgttgtgattctttcaatgaaatagac 6380112  T
Q  214 tttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag--aaaaaactca 311  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||  | | || ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  6380113 ttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatcagattcatgtacaaaaagaagaactagagtctagaaaaaaaactca 6380212  T
Q  312 aacgtgta 319  Q
    ||||||||    
T  6380213 aacgtgta 6380220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 311
Target Start/End: Original strand, 40737994 - 40738117
Alignment:
Q  188 gttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagatagga 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| | || |    
T  40737994 gttgtgattctttcaataaaatagctttttaaattgactgattaagtaattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtcaaaaaagta 40738093  T
Q  288 gaactaaagtctagaaaaaactca 311  Q
    |||||| ||| |||||||||||||    
T  40738094 gaactagagtttagaaaaaactca 40738117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 298
Target Start/End: Original strand, 773740 - 773997
Alignment:
Q  41 aatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatcc 139  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||| |||| |||||| |||  |||    
T  773740 aatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaata--aaaaaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaacggcgtcgtttgaatttgtgactcctcc 773837  T
Q  140 gctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtg--aaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgat 237  Q
    | ||| ||| | |||| || ||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  773838 gttgttggaaa-gggaaaacgaatggtttatgcacaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattgactgataaagtaat 773936  T
Q  238 tatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtc 298  Q
    |||||||||| | |||| |||||||| | ||||||||| || ||| | || ||||||||||    
T  773937 tatacaaattaggggtgatttgatagcatcagatttatttccagaaatgataactaaagtc 773997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 319
Target Start/End: Original strand, 18895372 - 18895531
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||    
T  18895372 gaattgtttatgcgaaaaggaaataattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaattgattatacaaattaatagtggtttg 18895471  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    |||  | || ||||||||| |   || ||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  18895472 ataacatcaaatttatgtctaataagtagaactcgagtctagaaaaaactcatacgtgta 18895531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 376
Target Start/End: Original strand, 33419039 - 33419322
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||| | | |||| | || |||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33419039 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtagaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattattgtgattctttcaatga 33419138  T
Q  207 aatagattttcaaattgac-tgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaa 304  Q
    ||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| | | |||||||||  | | |  ||||||| ||||||| |||    
T  33419139 aataacttttcaaattgacttaattaagtgattatacaaattaggggtagtttgataggatccgatttatgtacaaaaacaagaactagagtctagaaaa 33419238  T
Q  305 aaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttt 376  Q
    |||||||||||||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  33419239 aaactcaaacgtgtattaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaagt-ggggtggttattagatttaattttt 33419322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4100058 - 4099826
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    ||||||||| || ||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4100058 gaatggtttttgcgaagaaaaaaatgattgttgtaattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggtggttt 4099959  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag--aaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatatttttta 343  Q
    ||||| | | |||||||||  | | ||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||   |||||||           ||||||||||||||||||    
T  4099958 gatag-atccgatttatgtacaaaaaggagaattagcgtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatatttttta 4099860  T
Q  344 tttaagtggg-ggtgggtattagagttaattttt 376  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  4099859 tttaagtgggaggtgggtattaaatttaattttt 4099826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25061957 - 25061702
Alignment:
Q  195 ttctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaa 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    | ||||||||| | |||||||||||| | | || |||||||     
T  25061957 ttctttcaatgaaatagcttttcaaattaactgataaagtgattgtacaaattgagaatagtttgatagcatcagatttatgtccaaaaagaagaactag 25061858  T
Q  295 agtctagaaaaaactcaaacgtgta-------------aagaagtaacatatatatttttt-atttaagt-gggggtgggtattagagttaattttttat 379  Q
    |||||| |||||| | |||||||||             |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  25061857 agtcta-aaaaaattaaaacgtgtaccgaagaaagaaaaagaagtaacatatttttttttttatttaagtagggggtggatattagacttaatttttttt 25061759  T
Q  380 g-aggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
      |||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25061758 ttaggcccataatatttggaggtccggcttggttgagcaccttgcactcccccaagg 25061702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 12251210 - 12251365
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12251210 ctaacggtgacgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 12251309  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgata 262  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  12251310 aatagctttccaaattgactgattaaatgattatagaaattaggggtggtttgata 12251365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 277
Target Start/End: Original strand, 7636316 - 7636418
Alignment:
Q  175 aaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagattta 274  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||    
T  7636316 aaaaaaaatgattgttgcgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattaggggtggtttgataggatcagagtta 7636415  T
Q  275 tgt 277  Q
    |||    
T  7636416 tgt 7636418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 436
Target Start/End: Original strand, 12251542 - 12251655
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtgg-gggtgggtattagagttaatttttt-at-gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||| | |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12251542 taacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttttgatagaggctcgtagcatttggaggtccggcctgattgagtaccttg 12251641  T
Q  423 cactccctcaaggc 436  Q
    ||| ||||||||||    
T  12251642 cacaccctcaaggc 12251655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11672676 - 11672442
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    ||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||    
T  11672676 gaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggagtggttt 11672577  T
Q  259 gatagtaccagatt--tatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatatttttt 342  Q
    ||||| | | ||||  |||||  | | |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||   |||||||           |||||||||||||||||    
T  11672576 gataggatccgatttatatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaatgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatttttt 11672477  T
Q  343 atttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt 376  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  11672476 atttaagtggggggtggatattagatttaattttt 11672442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 319
Target Start/End: Original strand, 28590041 - 28590274
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    ||||||| |||||||||  | ||||| ||||  |||| |||||||||||||||  |||| ||||||| | |||| || |||||||| | | |||||||||    
T  28590041 ttaagtggaagagaggtgaattttacctaacaatgtcgtttggatttgtcactcctccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtt-acgcgaaaaagaa 28590139  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||| | ||| || |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| | |  |||| |||| ||    
T  28590140 ataattgttgtgattcttttaatgaaatag--ttaaaaagtaactaattaagtaattatataaattgggggtggtttggtagcatcgtatttttgtccag 28590237  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28590238 aaaggataactaaa-tctagaaaaaactcaaacatgta 28590274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38525094 - 38524984
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtgggg-gtgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |  |||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38525094 taacatatatattttttatttaagtggagagtgggtattagatttaatttttcgttagaggtccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcaccttg 38524995  T
Q  423 cactccctcaa 433  Q
    ||| |||||||    
T  38524994 cacaccctcaa 38524984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 408
Target Start/End: Original strand, 40841180 - 40841485
Alignment:
Q  120 tttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaa 219  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| |||  ||||  |||  ||    
T  40841180 tttggatttgtcacttctccgttgtaggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgagtgttgtaattcttttaatagaataactttataa 40841279  T
Q  220 attgactgatcaagtgattatacaaatt-ggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt 318  Q
    ||||| |  | |||| |||||||||||| || ||||||||||||  | || ||||||||| | | || | || || |||||||||||||||||||| |||    
T  40841280 attgattagttaagtaattatacaaattaggaggtggtttgataacatcatatttatgtccaaaaagaataattagagtctagaaaaaactcaaacatgt 40841379  T
Q  319 a-------------aagaagtaacatatatatttt---ttatttaagtgggg-gtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggc 401  Q
    |             |||||| ||||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  40841380 actgaagaaagaaaaagaagaaacatatattttttattttatttcagtggggtgtgggtattaaacttaatttttttt-aggcccatagtatttggaggc 40841478  T
Q  402 ccggctt 408  Q
    |||||||    
T  40841479 ccggctt 40841485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 325
Target Start/End: Original strand, 3799618 - 3799898
Alignment:
Q  39 agaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttat 137  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  |    
T  3799618 agaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaata---aaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggatttg-cgctcct 3799713  T
Q  138 ccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgat 237  Q
    ||  |||||||  |   | || |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| || || || ||||    
T  3799714 ccattgtgggaatttctaaaacgaatggtttatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttccaaaattggcttattaaatgat 3799812  T
Q  238 tatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag 325  Q
    ||||||| |||| |||||||||| || | || |||||  || ||| |||||||||||| |||| || |||| |||||| |||| ||||    
T  3799813 tatacaatttggaggtggtttga-agcatcaaattta-atccagaaaggagaactaaaatctaaaagaaacccaaacgcgtaatgaag 3799898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 312
Target Start/End: Original strand, 44876131 - 44876276
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| || ||||| || |||||||| | ||||||    
T  44876131 gaatggtttatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagctttctaaattgactgattaaatgattttaaaaattggt-gcggtttg 44876228  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaa 312  Q
    |||||| || ||||||||    | |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44876229 atagtatca-atttatgt----acaggagaactagagtctaaaaaaaactcaa 44876276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27432489 - 27432390
Alignment:
Q  339 ttttatttaagtg-ggggtgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27432489 ttttatttaagtgtggggtgggtattaaatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttgaaggccgggcctggttgagcaccttacacaccctcaagg 27432390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32956489 - 32956449
Alignment:
Q  337 ttttttatttaagtgggggtgggtattagagttaatttttt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32956489 ttttttatttaagtgggggtgggttttagatttaatttttt 32956449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 319
Target Start/End: Original strand, 12251487 - 12251522
Alignment:
Q  284 aggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12251487 aggagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgta 12251522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 41908037 - 41907994
Alignment:
Q  386 catagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccc 429  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41908037 cataacttttggaggcccggcttggttgagcaccttgctctccc 41907994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 2263975 - 2263933
Alignment:
Q  394 ttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2263975 ttggaggtccggcttaattgagcaccttgcactctctcaaggc 2263933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 39 - 433
Target Start/End: Original strand, 18172797 - 18173187
Alignment:
Q  39 agaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatc 138  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||        |   |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18172797 agaatcagaagagtttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaatt---gtgaaagagaggtagaatttaccaacggcgtcgtttggatttgtcacttatc 18172893  T
Q  139 cgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgatt 238  Q
    || ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  18172894 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagcttttcaaattgagtgattaagtgatt 18172993  T
Q  239 atacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 338  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18172994 atacaaattaggggtggtttgatagtaccagatttatgtccatataggagaa-taaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 18173092  T
Q  339 ttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18173093 ttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttctgaggtccatagctcttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 18173187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 39 - 441
Target Start/End: Original strand, 17117500 - 17117893
Alignment:
Q  39 agaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatc 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17117500 agaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcgtttggatttgtcacttatc 17117598  T
Q  139 cgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgatt 238  Q
    || ||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |    
T  17117599 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgat--------t 17117690  T
Q  239 atacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17117691 atacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagagctaaaatctagaaaaaattcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 17117790  T
Q  339 ttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctg 438  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  17117791 ttttatttaagtgggggtgagtattagatttaattttttgtggggcccatagtttttggaggtccggcttgattgagcaccttacacttcctcaaggccg 17117890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 83 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15457667 - 15457309
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaa 182  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| || ||||||||| ||||||||| |||    
T  15457667 ttaagtgaaagagagatagaatttactaacagcgtcgtttggatttgtcacttgtccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttgtgtgaaaaaaaaa 15457568  T
Q  183 -ttattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  15457567 attattgttgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtagtttgatagtaccagatttatgtccgg 15457468  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatga 381  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15457467 ataagtgaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaat-ttttctga 15457369  T
Q  382 ggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15457368 ggcccataacttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactctctcaaggccgggc 15457309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 38 - 435
Target Start/End: Original strand, 18915907 - 18916304
Alignment:
Q  38 tagaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttg-tcactta 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||    
T  18915907 tagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagaggtagaatttactaacggcgtcgtttcgattttatcactta 18916005  T
Q  137 tccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtga 236  Q
    |||| ||||||| | || | ||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  18916006 tccgttgtgggaaagggaaaaacaaatagtttatgtgaaaaagaaatgattgctgtgattctttcagtgaaatagcttttcaaattgattgattaagtga 18916105  T
Q  237 ttatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatata 336  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18916106 ttatacaaattggggatggtttgatagtaccagatttatgtccagattgaagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgtaaaaaagtaacatatata 18916205  T
Q  337 ttttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18916206 ttttttatttaagtgggggtgggtattagagttaatttttttttaggcccatagctattggaggcccgacttgattgagcaccttgcacttcctcaagg 18916304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 39 - 441
Target Start/End: Original strand, 38985564 - 38985954
Alignment:
Q  39 agaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatc 138  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38985564 agaatcagaagagtttctaaaaatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagatgtagaattcactaacggcgtcttttggatttgtcacttatc 38985662  T
Q  139 cgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgatt 238  Q
    || ||||| | | |||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  38985663 cgttgtggaaaaggggaaaacaaatgttttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaaatgatt 38985762  T
Q  239 atacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38985763 atacaaattggaggtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaa-taaagtttagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatt 38985861  T
Q  339 ttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctg 438  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  38985862 ttttatttaagtggggtggggtattagagttaattttttctgaggcccat----------cgcccggcttgattgagcaccttgcactctctcaaggccg 38985951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 337
Target Start/End: Original strand, 21747085 - 21747382
Alignment:
Q  38 tagaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttat 137  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||        || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  21747085 tagaatcaaaagagcttttaaacatgaaacgaaatacaaaaaa--ttcagtgaaagagaggtagaatttactaacggcgtcgtttgaatttctcacttat 21747182  T
Q  138 ccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgat 237  Q
    | | ||||||| | || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||||||    
T  21747183 ctgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgacatagtattttaaattgactgattaagtgat 21747282  T
Q  238 tatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatat 337  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21747283 tatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgttcagatagaagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgtaaaaaagtaatatatatat 21747382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 441
Target Start/End: Original strand, 26151669 - 26152019
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||| | | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  26151669 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 26151768  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaacta-aagtctag-aaa 304  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| |||||||| |||    
T  26151769 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagaagtctagaaaa 26151868  T
Q  305 aaactcaaacgt---gtaaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaatttt--ttatgaggcccata 389  Q
    ||||||||||||    |||||||           ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||| ||| ||    
T  26151869 aaactcaaacgtatactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaaatgggggtgggtattagatttatttttcgtta-gagacccgta 26151967  T
Q  390 gcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    || |||||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  26151968 gcatttggaggcccgacctggttgagcatcttgcacaccctcaaggccgggc 26152019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13020513 - 13020213
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13020513 gaatggtttatgcgaagaaaaaaattattgttgtgattctttaaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggttt 13020414  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag--aaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatata-tttttt 342  Q
    ||||| | | |||||||||  | | | |||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||||           ||||||||||| ||||||    
T  13020413 gataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttt 13020314  T
Q  343 atttaagtgggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctggg 440  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  |  ||||||| ||||  ||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13020313 atttaagtgggggtgggtattaaatttaatttttcgttagaggcccgtagcaattggaggcccgccctggttgagcaccttgcacaccctcaaggccggg 13020214  T
Q  441 c 441  Q
    |    
T  13020213 c 13020213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 433
Target Start/End: Original strand, 19367393 - 19367683
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19367393 gaatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggttt 19367492  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttat 344  Q
    ||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||           |||||||||||||||||||    
T  19367493 gatagaatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttat 19367592  T
Q  345 ttaagtggggg-tgggtattagagttaatttt--ttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    |||| |||||| | ||||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||    
T  19367593 ttaaatgggggataggtattagatttaattttcgtta-gagacccgtagcatttggaggcccgacctggttgagcaccttgcacaccctcaa 19367683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 309
Target Start/End: Original strand, 36059803 - 36060029
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| | |||||| || ||  |||||| | |||| || ||||||||||||  ||||||||    
T  36059803 ttaagtgaaagagaggtaaaatttacgtaacggcgtcgtttggaat-gtcactcatacgtcgtgggaaaagggaaaacgaatggtttatgcaaaaaagaa 36059901  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||| |||| |     
T  36059902 atgattgttgtggttctttcaatgaaatagctttttaaattaactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttttgtctaa 36060001  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaact 309  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||    
T  36060002 aaagtagaactagagtctagaaaaaact 36060029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 157 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1419001 - 1418840
Alignment:
Q  157 aatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggt 256  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1419001 aatgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagctttacaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggt 1418902  T
Q  257 ttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||||||| | || | ||||||| | | || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1418901 ttgatagcatca-aattatgtctaaaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgta 1418840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 39081485 - 39081328
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttga 260  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39081485 aatggtttatatgaaaa-gaaataattgttgtaattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttga 39081387  T
Q  261 tagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||| | || ||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  39081386 tagcatcaaatttatgtccagaaagtaaaactagagtctagaaaaaactcatacgtgta 39081328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 433
Target Start/End: Original strand, 42411532 - 42411822
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaa-aagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  42411532 gaatggtttatgcgaagtaaaaaatgattgttgtgattctttaaatgaaatagctttccaaattgactaattaagtgattatacaaattaggggtggttt 42411631  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatt 345  Q
    ||||| | | |||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||           |||||||||||| |||| ||    
T  42411632 gataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatatattttttt 42411731  T
Q  346 taagtggggg-tgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |  ||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  42411732 taagtgggggttgggtattagatttaatttttcgttagaggctcttagcaattggaggcccggcctgattgagcaccttgcacaccctcaa 42411822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 45619118 - 45618768
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | ||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  45619118 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 45619019  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaacta-aagtctagaaaa 305  Q
    ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||    
T  45619018 aatagcttc-caaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagaagtctagaaaa 45618920  T
Q  306 aactcaaacgt---gtaaagaa----------gtaacatatata-ttttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaatttt--ttatgaggcccat 388  Q
    |||||||||||    |||||||           ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||| |    
T  45618919 aactcaaacgtatactaaagaaagaaaaggatataacatatatatttttttatttaaatggggggtgggtattagatttatttttcgtta-gaggcccgt 45618821  T
Q  389 agcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  45618820 agcatttggaggcccggcctggctgagcaccttgcacaccctcaaggttgggc 45618768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 175 - 440
Target Start/End: Original strand, 18676301 - 18676583
Alignment:
Q  175 aaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagattta 274  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||| | | ||||||    
T  18676301 aaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagttattatacaaattaggggtagtttgataggatccgattta 18676400  T
Q  275 tgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtg-ggggtggg 359  Q
    |||  | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||           |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18676401 tgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtgaggggtggg 18676500  T
Q  360 tattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctggg 440  Q
    ||||||| |||||||||  |  ||  ||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18676501 tattagatttaatttttcgttagaaacccgtagcatttggatgcccggcctggttgagcaccttgcacactctcaaggctggg 18676583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7993775 - 7993433
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa--aaagaaattattgttgtgattctttcaatg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||| | | || | || |||||||||||| |||  ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  7993775 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaagattgttgtgattctttcaatg 7993676  T
Q  206 aaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaa 305  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | | |||||||  | | |||||||||| |||||||||||    
T  7993675 aaatagctttccaaattggctgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccggtttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaa 7993576  T
Q  306 aactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttttatgag-gcccatag 390  Q
    |||||||| |||   |||||||           ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||  | || | |  |||    
T  7993575 aactcaaatgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaaatagggggtgggtattaaatttaatttttcgttagaggctgtag 7993476  T
Q  391 cttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    | |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  7993475 catttggaggcccggtcagattgagcaccttgcacaccctcaa 7993433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13997403 - 13997190
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||  |||||||      
T  13997403 gaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactcattaagtgattattcaaattgacggtggttca 13997304  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt---------aaagaagtaacatatatattttttatttaagt 350  Q
    |||| | || ||||||||| ||| ||   ||||| ||||||| ||||||||| ||||||         ||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13997303 atagcatcaaatttatgtccagaaagtgaaactagagtctaggaaaaactcatacgtgtattgaataaaaaaaagtaacatataatttttttatttaagt 13997204  T
Q  351 gggggtgggtatta 364  Q
     |||||| ||||||    
T  13997203 tggggtgagtatta 13997190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 435
Target Start/End: Original strand, 41096459 - 41096806
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa--aaagaaattattgttgtgattctttcaatg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||| ||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41096459 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggttaatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 41096558  T
Q  206 aaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaa 304  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||| |||    
T  41096559 aaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgatttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaa 41096658  T
Q  305 aaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatat-tttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggccca 387  Q
    ||||||||| |||   |||||||           |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  |  ||| |||     
T  41096659 aaactcaaatgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatatatttttatttaagtggggggtgggtattaaatttaatttttcgttagagacccg 41096758  T
Q  388 tagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||||||    
T  41096759 tagcatttagaggtccggcctgattgagtaccttgcacaccttcaagg 41096806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 416
Target Start/End: Original strand, 27302500 - 27302771
Alignment:
Q  157 aatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggt 256  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||| |    
T  27302500 aatgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtgattcttttaatgatatagcttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgagggtgat 27302599  T
Q  257 ttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt-----------aaagaagtaacatatatattttttatt 345  Q
    ||| ||| | |  |||| |||| ||| || |||| || ||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  27302600 ttggtagcatcgaatttttgtccagacagaagaattagagtctagaaaaaactcaaatgtgtttcgaaaagaaaaaaaagtaacatgtat-ttttttatt 27302698  T
Q  346 taagtgggggtgggtattagagttaa--ttttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagc 416  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  | |||| |||||||| |||  |||| ||||||| ||| |||||||    
T  27302699 taagtgggcgtgggtattagacttaaattcttttttgaggcccgtagtatttgtaggcccgactttattgagc 27302771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 316
Target Start/End: Original strand, 29480613 - 29480768
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttga 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||| |    
T  29480613 aatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataatttttcaaattgactgaataagtgtttattcaaattgatggtggtttaa 29480712  T
Q  261 tagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt 316  Q
    ||| | || ||||||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  29480713 tagcatcaaatttatgtccagaaagttgaactaaagtctaaaaaaaaatcatacgt 29480768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25222413 - 25222119
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| || ||||||||||||||||| |   || |||    
T  25222413 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttctaaattgactaattaagtgattatacaaattaggaatgattt 25222314  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttat 344  Q
    ||||| | | |||||||||  | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||           |||||||||||||||||||    
T  25222313 gataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactaaagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttat 25222214  T
Q  345 ttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    |||||| || ||| ||||||||| |||||||||  |  ||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  25222213 ttaagtaggcggtcggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcacctttcataccctcaaggc 25222119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6530749 - 6530601
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaaga-aattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6530749 gaatggtttatgcgaagaaaataatgattgttgtgattctttcaatgaaataccttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggttt 6530650  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaa 307  Q
    ||||||| | |||||||||  | | | |||||||| |||||||||||||    
T  6530649 gatagtatccgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctagaaaaaa 6530601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 374
Target Start/End: Original strand, 1226242 - 1226465
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattc-tttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  1226242 aatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaataacttttcaaattgtctgattgagtgattatataaattgagggtggtttg 1226341  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt---------aaagaagtaacatatata--ttttttatttaa 348  Q
     ||| | ||||||||||||   | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1226342 gtagcatcagatttatgtc--caaaggagaattagagtctagaaaaaactcaaacgtgtaccgaagaaaaagaagtaacatatatattttttttatttaa 1226439  T
Q  349 gtgggggtgggtattagagttaattt 374  Q
    ||||||   ||||||||| |||||||    
T  1226440 gtggggtgtggtattagacttaattt 1226465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 2063879 - 2063599
Alignment:
Q  175 aaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagattta 274  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  | |||||    
T  2063879 aaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggattatattta 2063780  T
Q  275 tgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaa------catat-atattt-----tttatttaagtgggggtgggtat 362  Q
    |||  | | |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||       |||| ||||||     ||||||||||| |||||||||||    
T  2063779 tgtacaaaaaggaaaactagagtctaaaaaaaactcaaacgtataccgaagaaagaaaaggatataatatttttttatttatttaagt-ggggtgggtat 2063681  T
Q  363 tagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggct 442  Q
    |||| |||||||||  | |||||||| |||  |||||||||||||  || |||| |||||||||||||| || ||| |||||    
T  2063680 tagacttaattttttgtttgaggcccgtagtatttggaggcccggtctggttgaacaccttgcactcccccagggccgggct 2063599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 4856083 - 4855786
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4856083 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattcactgattaagtgattatacaaattaggggtggttt 4855984  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtca-agataggagaact-aaagtctag--aaaaaactcaaacgtgt---aaagaa----------gtaacatatata-tttt 340  Q
    ||||| | | ||||||||| | | | ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||   ||||||           ||||||||||| ||||    
T  4855983 gataggatctgatttatgttacaaaaaggagaactaaaaatctagaaaaaaaactcaaacgtgtacgaaagaaagaaagggatataacatatatattttt 4855884  T
Q  341 ttatttaagtgg-gggtgggtattagagttaatttt--ttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4855883 ttatttaaatggagggtgggtattagatttatttttcgtta-gaggcccgtagaatttggaggtccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggc 4855786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 45042482 - 45042187
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttca---aattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtgg 255  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  45042482 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagactttcaccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgg 45042383  T
Q  256 tttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag--aaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatttt 340  Q
    |||||||| | || ||||||||    | || ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||  ||||             | |||||||| ||||    
T  45042382 tttgataggatcaaatttatgtacgaaaagaagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtatactgaagaaagaaaatgatatgacatatatttttt 45042283  T
Q  341 ttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaa 433  Q
    |||||||| |  || |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  45042282 ttatttaaataaggagtgggtattagacttaattttttgtttgaggcccataacatttggaggcccgacctgattgagcaccttgcgctccctcaa 45042187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 429
Target Start/End: Original strand, 31273063 - 31273426
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || | ||||||| |  | | ||  ||||||||||| |||||||||    
T  31273063 ttaagcgaaagagaagtgaaatttacctaactgtgtcgtttggatttgtcacttttctgttgtgggaaagagaaaaacaaatggtttatgcgaaaaagaa 31273162  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || | |||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||  | || ||||| ||| ||    
T  31273163 atgaatgttatgattcttttaatgaaatagtattccaaattgactgattaaatgattatacaaattgg-ggtggtttgataacatcaaatttaagtccag 31273261  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgt---gtaaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagt 368  Q
    | |||||| ||  ||| || |||||||||||| ||    |||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  31273262 aaaggagagctggagtatacaaaaaactcaaatgtatactaaagaaagaaaatgatgtaacatatatattttttatttgagtgggggtgggtattaaact 31273361  T
Q  369 taa----ttttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccc 429  Q
    |||    |||||| | ||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||| |  |||||||||||    
T  31273362 taatatttttttttttaggtccataatttttgaaggcccgacttgattgaactacttgcactccc 31273426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 34061832 - 34061990
Alignment:
Q  162 atggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttga 260  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || |||||||||   ||||||||||    
T  34061832 atggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtaatcatacaaattatgggtggtttga 34061931  T
Q  261 tagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||| |||||||||||||  | | || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  34061932 taggaccagatttatgtacaaaaagaagaactatagtctaaaaaaaactcatacgtgta 34061990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 36481532 - 36481204
Alignment:
Q  112 cggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaata 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36481532 cggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaata 36481433  T
Q  211 gattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactc 310  Q
    | ||| ||          | ||||||||||||||||| | |||||||||| || | |  ||||||||  | | ||||||| || |||||| || ||||||    
T  36481432 gctttcca----------ttaagtgattatacaaattaggggtggtttgaaaggatccaatttatgtacaaaaaggagaattagagtctaaaagaaactc 36481343  T
Q  311 aaacgtgta------aagaag------taacatatatattttttatttaagtggggg-tgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagctttt 395  Q
    ||| |||||      |||||       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |  ||||||| |||| |||    
T  36481342 aaatgtgtactaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcattt 36481243  T
Q  396 ggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaag 434  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  36481242 ggaggtccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaag 36481204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38599567 - 38599403
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||| | | | |||| || ||  |||||| | |||| || ||||||||||||  ||||| ||    
T  38599567 ttaagtgaaagagagatgaaatttacctaacggtgtcgtttgaaat-gccactcatacgtcgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatga-aaaaataa 38599470  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattg 248  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38599469 ataattgttttgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattg 38599403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12269514 - 12269285
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12269514 gaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgtggtgatttttttaatgaaatagctttccaaatc-actgattaagtgattatacaaattaggggtggttt 12269416  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatt 345  Q
    ||||| | | |||||||||  | | | |||||||| |||||| |||||| ||||| |||   |||||||           ||||||||||||||||||||    
T  12269415 gataggatctgatttatgtgcaaaaaagagaactagagtctaaaaaaaattcaaatgtgtactaaagaaaaaaaatgatataacatatatattttttatt 12269316  T
Q  346 taagtgggggtgggtattagagttaattttt 376  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  12269315 taagctggggtggatattagatttaattttt 12269285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 384 - 441
Target Start/End: Original strand, 21747902 - 21747959
Alignment:
Q  384 cccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21747902 cccatagcttttggaagcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggccgggc 21747959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 278
Target Start/End: Original strand, 18482488 - 18482600
Alignment:
Q  167 ttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagat-tttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagta 265  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | | | |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |    
T  18482488 ttatgagaaaaagacattattgttgttattctttcaatgaaataactgtgttaaattgactgattaagcgattatacaaattgggggtagtttgttagca 18482587  T
Q  266 ccagatttatgtc 278  Q
     || |||||||||    
T  18482588 tcaaatttatgtc 18482600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6530568 - 6530518
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttt 376  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6530568 taacgtatatattttttatttaagtgggggtggatattagatttaattttt 6530518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 42759730 - 42759800
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgat 229  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  42759730 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgat 42759800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9029625 - 9029471
Alignment:
Q  236 attatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt-----------aaagaa 324  Q
    |||||||||||||| | || |||||||| | || ||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||||||||| | |           ||||||    
T  9029625 attatacaaattggggctgctttgatagcaacatatttatgtctagaaaggagaattagagtctaaaaaaaactcaaacatataccgaaaaaaaaaagaa 9029526  T
Q  325 gtaacatatata-ttttttatttaagtgggg-gtgggtattagagttaatttttt 377  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  9029525 ataacatatatatttttttatttaagtggggtgtggatattagacttaatttttt 9029471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 436
Target Start/End: Original strand, 42759903 - 42760015
Alignment:
Q  326 taacatatatatttttt-atttaagtgggggtgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttg 422  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  |  ||||||  |||| |||||||||||| | |  ||||||||||||    
T  42759903 taacatatatatttttttatttaagtgggg-tggatattagatttaatttttcgttagaggcctgtagcatttggaggcccgacctagttgagcaccttg 42760001  T
Q  423 cactccctcaaggc 436  Q
     || ||||||||||    
T  42760002 tacaccctcaaggc 42760015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13001658 - 13001581
Alignment:
Q  236 attatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||  | | ||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  13001658 attatacaaattgggggtggtttgatagcatcaaatttatgtataaaaaggagaattagagtttagaaaaaactcaaa 13001581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 311
Target Start/End: Original strand, 32186215 - 32186276
Alignment:
Q  250 tggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactca 311  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||| | | || ||||||| |||||||||||||||||    
T  32186215 tggtggtttgatagcatcaaatttatgtctaaaaagtagaactagagtctagaaaaaactca 32186276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 37 - 435
Target Start/End: Original strand, 1092894 - 1093290
Alignment:
Q  37 ttagaatcggaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcactta 136  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1092894 ttagaatcaaaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagatgtagaatttactaacggtgtcatttggatttgtcactta 1092992  T
Q  137 tccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtga 236  Q
    |||| | ||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  ||| |    
T  1092993 tccgttttgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttca-tgaaatagctttttaaattgactgatttagtca 1093091  T
Q  237 ttatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatata 336  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1093092 ttataccaattggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacatgcaaagaagtaacatatata 1093191  T
Q  337 ttttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1093192 gtttttatttaagtgggggtgggtattagagttaattttttcggaggcccataaattttgaaggcccgacttaattgagcaccttgcactccctcaagg 1093290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 441
Target Start/End: Original strand, 29308330 - 29308723
Alignment:
Q  47 aagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  29308330 aagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaa-ttaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcatttagatttatcacttatccattgtgg 29308428  T
Q  147 gacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaat 246  Q
    || | |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  29308429 gaaaggggaaaacgaatgatttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattacttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtcattataccaat 29308528  T
Q  247 tggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttattt 346  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29308529 tggtagtggtttgatagtaccaaatttatgtccagatagaaaaactaaagtttagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaccatatatattttttattt 29308628  T
Q  347 aagtgggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29308629 aagtgggggtgggtattagagttaattttttcggaagcctataacttctggaggcccgacttgattgagcaccttgcactccctcaaggccgggc 29308723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 171 - 435
Target Start/End: Original strand, 1690619 - 1690884
Alignment:
Q  171 gtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccaga 270  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1690619 gtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataaattttcaaattgattgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccaga 1690718  T
Q  271 tttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtattagagtta 370  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1690719 tttatgtccaaataggagaactaaaatttagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatatattttatttaagtggaggtgggtattagagtta 1690818  T
Q  371 a-ttttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1690819 atttttttctgaggcccatagcttttggaggctcggcttgattgagcatcttgcactcccttaagg 1690884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 46 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31861187 - 31860815
Alignment:
Q  46 gaagagcttctaaacatgaaacgaaatacnnnnnnnnttaagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtg 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  31861187 gaagagcttctaaacataaaacgaaatacaaaaaa--ttaagtgaaagagagatagaatttactaacgacgttgtttgaatttgtcacttatccgttgtg 31861090  T
Q  146 ggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaa 245  Q
    ||| | || | || ||||||||               | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31861089 ggaaagggaaaaacgaatggtt---------------tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaa 31861005  T
Q  246 ttggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatt 345  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31861004 ttgg-ggtggtttgata-taccagatttatgtccagatagaagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgtaaagaagtaacatatatattttttatt 31860907  T
Q  346 taagtgggggtgggtattagagttaa--ttttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31860906 taggtgggggtgggtattagagttaatttttttttttaggcccatagcttttcgaggtccggcttgattgagcaccttgcattccctcaagg 31860815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2618495 - 2618163
Alignment:
Q  110 aacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaa 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2618495 aacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaa 2618396  T
Q  209 tagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | | |||||||||||||||||||||||    
T  2618395 tagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactaaagtctagaaaaaac 2618296  T
Q  309 tcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaatttttta--tgaggcccatagct 392  Q
    |||||||||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||| || |     
T  2618295 tcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcaatagaggcccgtaaca 2618196  T
Q  393 tttggaggcccggcttgattgagcaccttgcac 425  Q
    ||||||| |||| | || |||||||||||||||    
T  2618195 tttggagacccgacctggttgagcaccttgcac 2618163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6360901 - 6360558
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6360901 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 6360802  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaa 306  Q
    | ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| | | |||||||||  | | | |||||||| ||||||||||||    
T  6360801 a-taacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaagggtggtttgataggatccgatttatgtgcaaaaaagagaactagagtctagaaaaa 6360703  T
Q  307 actcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaatttt--ttatgaggcccatag 390  Q
    |||||||||||   |||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||    
T  6360702 actcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggggggtggatattagatttaattttcgtta-gaggcccgtag 6360604  T
Q  391 cttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6360603 catttggaggcctggcctgattgagcaccttgcacaccctcaaggc 6360558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6754346 - 6754003
Alignment:
Q  110 aacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6754346 aacggtgtcatttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaa 6754247  T
Q  209 tagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaac 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||||| | | |||||||||  | | | |||||||| | ||||||||||||    
T  6754246 tagctttccaaattgactgattaagtgactatacaaattagggatggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagaatctagaaaaaac 6754147  T
Q  309 tcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttatttaagtgggg-gtgggtattagagttaattttt-tat-gaggcccatagct 392  Q
    ||||||| |   |||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  || ||||||| ||||     
T  6754146 tcaaacgcgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggggagtgagtattagaattaatttttcgatagaggcccgtagca 6754047  T
Q  393 tttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    |||||||| ||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  6754046 tttggaggtccgacctgattgaacaccttgcacatcctcaaggc 6754003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 12614692 - 12614850
Alignment:
Q  162 atggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttga 260  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12614692 atggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttga 12614791  T
Q  261 tagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
    ||| | | |||||||||  | | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12614792 taggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaaaaaaaactcaaacgtgta 12614850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19231779 - 19231407
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa 181  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||  || |  ||||||||| |||||| |||  ||||||| |   || || |||| ||||||  |||||||||    
T  19231779 ttaagtgaaagagaggtgaaatttacctaagagtattgtttggatttatcacttctccattgtgggaaaattgaaaaagaatagtttatacgaaaaagaa 19231680  T
Q  182 attattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaag 281  Q
    || |||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19231679 atgattgttgtgattttttcaatgtcatagcttttcaaattgattgattaagtgat-atacaaattgaaggtagtttgatagcaccagatttatgtccag 19231581  T
Q  282 ataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt------------aaagaagtaacatatatattt---tttatttaagtgggggtgggtattaga 366  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||            ||| | ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||  |||||||    
T  19231580 aaagtagaactaaactctagaaaaaactcaaacgtgtcctgaagaaaaaaaaaatgtaacatatatttttctatttatttaagtgggggtgaatattaga 19231481  T
Q  367 gtta--attttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctg 438  Q
      ||  ||||||| | || || ||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  19231480 cataatattttttttaagacctataacttttggaggtccgacttggttgagcaccttgcacttccccaaggctg 19231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 57830 - 57498
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||   ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  57830 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttgaatga 57731  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtct-agaaaa 305  Q
    ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||  | | |||||||||| ||| | | ||||    
T  57730 aatagctttctaaattgactgattaagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtttaaaaaaa 57631  T
Q  306 aactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatattttttatttaagtgggg-gtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccata 389  Q
    ||||||||||||||  ||||             |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||| ||    
T  57630 aactcaaacgtgtaccgaagaaagaaaatgatataacatatatatcttttatttaagtggggagtgggtattagacttaattttttgtttgaggcccgta 57531  T
Q  390 gcttttggaggcccggcttgattgagcaccttg 422  Q
    || |||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  57530 gcatttggaggtccgacctggttgagcaccttg 57498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 441
Target Start/End: Original strand, 3514824 - 3515124
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  3514824 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgatatagctttccaaattgaatgattacgtgattatacaaattaggggtggttt 3514923  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatata-tttttta 343  Q
    ||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||   |||||||           ||||||||||| |||||||    
T  3514924 gataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtttagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttta 3515023  T
Q  344 tttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctggg 440  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||  |  ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3515024 tttaagtggggggtgagtattaaatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttgtaggcccggcttggttgagcaccttgcacaccctcaaggccggg 3515123  T
Q  441 c 441  Q
    |    
T  3515124 c 3515124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 307
Target Start/End: Original strand, 30915259 - 30915488
Alignment:
Q  83 ttaagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaa--- 178  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| | | ||||||| | ||  ||  || | |||| ||||||||||||||| ||||||       
T  30915259 ttaagtgaaagagagataaaatttacataacggtgtcgtttgaaat-gtcacttctacgtcgtaagaaaggggataatgaatggtttatgcgaaaaatta 30915357  T
Q  179 --gaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatg 276  Q
      ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||    
T  30915358 aagaaatgattgttgtgattctttcaattaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattgatgggggtttgatagcatcaaatttatg 30915457  T
Q  277 tcaagataggagaactaaagtctagaaaaaa 307  Q
    || ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  30915458 tccagaaagtagaactagagtctagaaaaaa 30915488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Original strand, 3748543 - 3748690
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3748543 gaatagtttatgtgacaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgatggcggtttg 3748642  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaa 307  Q
    |||| | || ||||||||| | | || ||||||| | |||| ||||||    
T  3748643 atagcatcaaatttatgtccaaaaagtagaactagaatctaaaaaaaa 3748690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Original strand, 628018 - 628172
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||||| | | |||| || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  628018 ctaacgatgtcgtttggatttatcacttctctgttgtggaaaa-gggaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 628116  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgata 262  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  628117 aatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgata 628172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 29401230 - 29400939
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||    
T  29401230 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatactaattaggggtagttt 29401131  T
Q  259 gatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtg---taaagaa----------gtaacatatatattttttat 344  Q
    ||||| |   |||||||||  | | | || ||||| |||| || ||||||||||||||||   |||||||           | |||||||||||||||||    
T  29401130 gataggattcgatttatgtacaaaaatgaaaactagagtcaagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatatgacatatatattttttat 29401031  T
Q  345 ttaagtgggggtgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaag 434  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||| |  ||||||| |||| ||||||  ||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29401030 ttaagtggaggtgggtattatatttaattttttgttagaggcccgtagcatttggaaacccgatctgattgagcaccttgcacaccctcaag 29400939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29149544 - 29149345
Alignment:
Q  109 taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaa 207  Q
    ||||||| || |||||||||||||||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29149544 taacggtatcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaa 29149445  T
Q  208 atagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaa 307  Q
     ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||    
T  29149444 ctaactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggtgtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaa 29149345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 319
Target Start/End: Original strand, 7525089 - 7525301
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||| | | || | ||| ||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  7525089 ctaacggtgtc-tttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaataaattgtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataa 7525187  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgt-caagataggagaactaaagtctag-aaa 304  Q
    ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| | | ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||    
T  7525188 aataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaat-ggagaactagagtctagaaaa 7525286  T
Q  305 aaactcaaacgtgta 319  Q
    |||||||||||||||    
T  7525287 aaactcaaacgtgta 7525301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 326 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24455129 - 24455016
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtg-ggggtgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttg 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| || |||| |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  24455129 taacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcattagaggtccgtagcatttggaggcccgacctggttgagcaccttg 24455030  T
Q  423 cactccctcaaggc 436  Q
    ||| ||||||||||    
T  24455029 cacaccctcaaggc 24455016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 435
Target Start/End: Original strand, 5877009 - 5877091
Alignment:
Q  352 ggggtgggtattagagttaattttttatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 435  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5877009 ggggttggtattagagttaatttttc-tgaggcccatagctcttggaggcccgacttgattgagcaccttgcactcccccaagg 5877091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21946196 - 21946109
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaatt 247  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21946196 gaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttatggttctttcaatgaaatagcttttcaaatagactgattaagtgattatacaaatt 21946109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22503885 - 22503751
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| | | || | ||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||| | |||||||||| ||    
T  22503885 ctaacggtgtcatttgaatttgtcacttctctgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttttaattctttcaacga 22503786  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattata 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22503785 aatagtttttcaaattgactgattaagtgattata 22503751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11088635 - 11088486
Alignment:
Q  161 aatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaat-gaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||    
T  11088635 aatggtttatgcaaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaatagcttttcaaattgactgat--------tatataaattgggggtggtttg 11088544  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 319  Q
     ||| | |||||||||||| | |  |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11088543 gtagcatcagatttatgtccaaa--ggagaattagagtctagaaaaaactcaaacgtgta 11088486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 350499 - 350385
Alignment:
Q  165 gtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaat-gaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatag 263  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  350499 gtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaatagctttcgaaattgactgattgagtgattatataaattgatggtggtttgatag 350400  T
Q  264 taccagatttatgtc 278  Q
     | || |||||||||    
T  350399 catcatatttatgtc 350385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6294416 - 6294279
Alignment:
Q  87 gtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaatta 185  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||  | ||  |||||| | |||| || |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  6294416 gtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtgggaaaggggaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaatga 6294318  T
Q  186 ttgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6294317 ttgttgtgattctttcaatgaaattgcttttcaaattga 6294279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 441
Target Start/End: Original strand, 31258612 - 31258731
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtggggg--tgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcacctt 421  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  31258612 taacatatatattttttatttatgtgggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttgtaggtccggcctggttgagcacctt 31258711  T
Q  422 gcactccctcaaggctgggc 441  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  31258712 gcacaccctcaaggcggggc 31258731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 14893412 - 14893522
Alignment:
Q  180 aaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtca 279  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    || ||||||||| | ||||||||| ||     
T  14893412 aaatgattgttgtgattcttttaacgaaatagtttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattcagagttgtttgatagcatcagatttatatct 14893511  T
Q  280 agataggagaa 290  Q
    ||| |||||||    
T  14893512 agaaaggagaa 14893522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 12622144 - 12622233
Alignment:
Q  354 ggtgggtattagagttaattttttat--gaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggctgggc 441  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |  |||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12622144 ggtggatattagatttaattttttgttagaggtccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggctgggc 12622233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7341227 - 7341087
Alignment:
Q  231 aagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt-------aaaga 323  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||| |||  | || ||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| | ||||       ||| |    
T  7341227 aagtgattattcaaattgacggtggtttaataacatcaaatttatgtccagaaagtggaactagagtctagaaaaaactcatatgtgtactgaagaaaaa 7341128  T
Q  324 agtaacatatatattttttatttaagtgggggtgggtatta 364  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7341127 agtaacatataattttttaatttaagtggtggtgggtatta 7341087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31234956 - 31234911
Alignment:
Q  204 tgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattgg 249  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  31234956 tgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgg 31234911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16852 - 16501
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaa-attattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  || | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| || || || || |||||||||||||||||||    
T  16852 ctaacggtgtcgtttggatttgttactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaatatgatcgttgtgattctttcaatga 16753  T
Q  207 aatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaa-aa 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | |||||||||  | | |||||||||| ||||||||| ||    
T  16752 aatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaa 16653  T
Q  306 aactcaaacgtg------------taaagaagta------acatatatattttttatttaagt-gggggtgggtattagagttaattttt--tatgaggc 384  Q
    ||||||||||||            ||||||  ||      | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  |||||    
T  16652 aactcaaacgtgtactaaaggatataaagatataatatatatatatatatcttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggc 16553  T
Q  385 ccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggc 436  Q
    || |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16552 ccgtagcatttggaggcccggtctggttgagcaccttgcacaccctcaaggc 16501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 429
Target Start/End: Original strand, 46148 - 46433
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttg 259  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||    
T  46148 gaatggtttatgtgaagaaaaaatgattgttgtgattatttcaatgaaatagacttccaaattgactgattaagtgattatccaaattatgggtggtttg 46247  T
Q  260 atagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgta---aagaagtaacat-atata--------ttttttattt 346  Q
    |||| | ||||| |||||  | | | |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||   ||||| ||| || |||||        ||||||||||    
T  46248 ataggatcagatatatgtataaaaatgagaactagagtctagaaaaaaattcaaatgtgtaccgaagaaataaaatgatataacatttttttttttattt 46347  T
Q  347 aagtgggggtgggtattagagttaattttt---tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccc 429  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||||||   | |||||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  46348 aagtgtgtgtgggtattagacttaatttttttgtttgaggcccatggcatttgaaggtccggcctggttgagcaccttgcactccc 46433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 319
Target Start/End: Original strand, 17056 - 17268
Alignment:
Q  110 aacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaaaaagaaatt-attgttgtgattctttcaatgaaa 208  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |  | ||||| | |||| | || |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  17056 aacggtgtcgtttgaatttgtcacttctttgttgtggaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaagaaaatgattgttgtgattctttcaacgaaa 17155  T
Q  209 tagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaac 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||| | | ||||||| |  | | | |||||||| ||||||||||||||    
T  17156 tagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtgatttgataggatccgatttatatacaaaaatgagaactagagtctagaaaaaac 17255  T
Q  309 --tcaaacgtgta 319  Q
      |||||||||||    
T  17256 attcaaacgtgta 17268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 440
Target Start/End: Original strand, 18128 - 18233
Alignment:
Q  338 tttttatttaagtggggg-tgggtattagagttaattttttatga--ggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactccctcaag 434  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||  | |  |||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  18128 tttttatttaaatggggggtgagtattagatttaatttttcgttaaaggcccataacatttggaggcccggcctgattgaacacctttcacaccctcaag 18227  T
Q  435 gctggg 440  Q
    ||||||    
T  18228 gctggg 18233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 403
Target Start/End: Original strand, 8368 - 8622
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtg--aaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggtggtggtt 257  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||    
T  8368 gaatggtttgtgtggaaaaaaaaaataatttttgtgattctttcaatgaaatagttttcgaaattgactgattaattgattatacaaattatgggtggtt 8467  T
Q  258 tgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgt-----aaagaagtaacatatatatt---ttttatttaag 349  Q
    |||||| |  || |||||||| ||| |||| | ||| ||||||| | |||||||||||  |     |||||| |||||||||| ||   |||||||| ||    
T  8468 tgatagcataaggtttatgtccagaaaggaaatctagagtctagtagaaactcaaacgcataagaaaaagaattaacatatattttttattttatttgag 8567  T
Q  350 tgggggtgggtattagagt-taattttttatgaggcccatagcttttggaggccc 403  Q
    |||||||||||| |||| | ||| || || | ||||||||| |||||||||||||    
T  8568 tgggggtgggtaatagactataaattatttttaggcccataacttttggaggccc 8622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1203 - 1086
Alignment:
Q  108 ctaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggacatgggagaatgaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  | ||||| | | || | || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1203 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 1104  T
Q  207 aatagattttcaaattga 224  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  1103 aatagctttccaaattga 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1088 - 1001
Alignment:
Q  234 tgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctag-aaaaaactcaaacgtgtaa 320  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||   | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1088 tgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgcacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacatgtaa 1001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 436
Target Start/End: Original strand, 22919 - 23032
Alignment:
Q  326 taacatatatattttttatttaagtgg-gggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |  ||| ||| || | |||||||| ||||| || |||||||||||     
T  22919 taacatatatattttttatttaagtggagggtggatattagatttaatttttcgttagagacccgtatcatttggaggtccggcctggttgagcacctta 23018  T
Q  423 cactccctcaaggc 436  Q
    ||| |||| |||||    
T  23019 cacaccctgaaggc 23032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 22779 - 22844
Alignment:
Q  160 gaatggtttatgtgaa-aaagaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattga 224  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22779 gaatggtttatgcgaagaaaaaaataattattgtgattctttcaatgaaatagtttttcatattga 22844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University