View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19736_high_3 (Length: 598)

Name: NF19736_high_3
Description: NF19736
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19736_high_3
NF19736_high_3
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (9-348)||(26455797-26456148)
chr3 (422-580)||(26455565-26455723)
chr3 (422-580)||(20813441-20813599)
chr3 (422-580)||(38446459-38446617)
chr3 (422-578)||(1017029-1017185)
chr3 (422-578)||(1687636-1687792)
chr3 (422-578)||(20760071-20760227)
chr3 (422-578)||(33151681-33151837)
chr3 (422-569)||(35346471-35346618)
chr3 (422-580)||(21656501-21656659)
chr3 (422-578)||(21564481-21564637)
chr3 (422-578)||(47329175-47329331)
chr3 (422-572)||(31122653-31122803)
chr3 (422-578)||(50287551-50287707)
chr3 (422-572)||(20086314-20086464)
chr3 (428-578)||(22851981-22852131)
chr3 (422-580)||(36314972-36315130)
chr3 (422-580)||(42016856-42017014)
chr3 (422-580)||(53925979-53926137)
chr3 (427-580)||(19664524-19664677)
chr3 (430-578)||(12748376-12748524)
chr3 (422-578)||(42107099-42107255)
chr3 (422-569)||(41250880-41251027)
chr3 (422-580)||(32650820-32650978)
chr3 (422-580)||(51562145-51562303)
chr3 (422-580)||(3697129-3697287)
chr3 (422-580)||(10618480-10618638)
chr3 (422-572)||(21890161-21890311)
chr3 (422-572)||(44798259-44798408)
chr3 (422-580)||(52821049-52821207)
chr3 (422-580)||(53195997-53196155)
chr3 (423-572)||(29677467-29677616)
chr3 (422-578)||(27070739-27070895)
chr3 (422-578)||(35608131-35608287)
chr3 (422-572)||(37247947-37248097)
chr3 (422-580)||(48651231-48651389)
chr3 (422-572)||(55164115-55164265)
chr3 (422-571)||(40922165-40922314)
chr3 (444-581)||(51475268-51475405)
chr3 (422-580)||(1448735-1448890)
chr3 (422-578)||(20913754-20913910)
chr3 (422-578)||(20921872-20922028)
chr3 (444-580)||(50977847-50977983)
chr3 (444-580)||(51080979-51081115)
chr3 (454-569)||(19268515-19268630)
chr3 (422-580)||(33473239-33473397)
chr3 (422-580)||(39069709-39069867)
chr3 (444-572)||(50364909-50365037)
chr3 (422-580)||(45380260-45380418)
chr3 (450-578)||(28699670-28699798)
chr3 (422-572)||(38923998-38924148)
chr3 (444-580)||(34019443-34019579)
chr3 (486-578)||(44152685-44152777)
chr3 (99-199)||(26456315-26456413)
chr3 (503-580)||(47473213-47473290)
chr3 (444-532)||(42641200-42641288)
chr3 (252-329)||(26456171-26456248)
chr3 (422-464)||(44152772-44152814)
[»] chr1 (64 HSPs)
chr1 (422-580)||(23767414-23767572)
chr1 (422-580)||(19315623-19315781)
chr1 (422-580)||(38473626-38473784)
chr1 (422-580)||(46051433-46051591)
chr1 (422-580)||(7553016-7553174)
chr1 (422-578)||(7651647-7651803)
chr1 (422-578)||(12143057-12143213)
chr1 (422-578)||(46825516-46825672)
chr1 (422-572)||(41106007-41106157)
chr1 (422-580)||(52146976-52147134)
chr1 (422-578)||(26549373-26549529)
chr1 (422-578)||(28425363-28425519)
chr1 (422-577)||(9962737-9962892)
chr1 (422-577)||(49094711-49094866)
chr1 (422-580)||(36157678-36157835)
chr1 (422-580)||(49814283-49814441)
chr1 (422-578)||(25988271-25988427)
chr1 (422-578)||(50689928-50690084)
chr1 (422-580)||(36781172-36781330)
chr1 (422-578)||(33674002-33674158)
chr1 (423-578)||(19274544-19274699)
chr1 (422-580)||(9878784-9878942)
chr1 (422-580)||(23228194-23228352)
chr1 (422-580)||(52067651-52067809)
chr1 (422-578)||(48802331-48802487)
chr1 (422-580)||(45670486-45670644)
chr1 (422-580)||(5400854-5401011)
chr1 (422-580)||(7608766-7608924)
chr1 (422-580)||(48669396-48669554)
chr1 (422-578)||(18892314-18892470)
chr1 (422-578)||(26069877-26070033)
chr1 (422-570)||(33325720-33325868)
chr1 (422-578)||(52349924-52350080)
chr1 (425-578)||(24204474-24204627)
chr1 (422-578)||(45350717-45350871)
chr1 (423-580)||(50533366-50533523)
chr1 (422-578)||(46095075-46095231)
chr1 (422-568)||(16705865-16706011)
chr1 (422-580)||(17983898-17984056)
chr1 (422-580)||(18782089-18782247)
chr1 (422-580)||(43396658-43396816)
chr1 (444-580)||(33194673-33194809)
chr1 (422-578)||(37216881-37217037)
chr1 (424-580)||(41982237-41982393)
chr1 (444-580)||(48319068-48319204)
chr1 (422-572)||(6711431-6711581)
chr1 (422-572)||(8141486-8141636)
chr1 (423-580)||(18917507-18917664)
chr1 (444-580)||(9974825-9974961)
chr1 (459-578)||(12964631-12964750)
chr1 (422-580)||(40721325-40721484)
chr1 (422-580)||(34971063-34971221)
chr1 (444-580)||(16506810-16506946)
chr1 (422-577)||(21965051-21965206)
chr1 (444-572)||(30281622-30281750)
chr1 (422-580)||(21929504-21929667)
chr1 (422-580)||(33714361-33714517)
chr1 (422-571)||(25800636-25800782)
chr1 (485-580)||(50099203-50099298)
chr1 (422-523)||(44978768-44978868)
chr1 (515-580)||(44979281-44979346)
chr1 (519-580)||(32373650-32373711)
chr1 (533-578)||(49973927-49973972)
chr1 (519-568)||(17989864-17989913)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (422-580)||(1293469-1293627)
chr8 (422-578)||(2533257-2533413)
chr8 (422-581)||(36400070-36400229)
chr8 (422-578)||(37933627-37933783)
chr8 (422-580)||(43806533-43806691)
chr8 (422-578)||(513293-513448)
chr8 (422-570)||(3875901-3876049)
chr8 (422-580)||(35443294-35443452)
chr8 (422-572)||(38107090-38107240)
chr8 (422-578)||(22683988-22684144)
chr8 (422-557)||(15847118-15847253)
chr8 (422-578)||(259963-260118)
chr8 (422-578)||(655803-655958)
chr8 (422-578)||(841538-841693)
chr8 (422-577)||(38633710-38633865)
chr8 (422-580)||(28496355-28496512)
chr8 (422-580)||(28707446-28707604)
chr8 (422-580)||(35884430-35884588)
chr8 (422-580)||(12010532-12010693)
chr8 (422-580)||(40301893-40302051)
chr8 (444-580)||(7434869-7435005)
chr8 (422-578)||(9056338-9056494)
chr8 (422-580)||(23972295-23972454)
chr8 (422-580)||(440823-440981)
chr8 (422-580)||(33651824-33651982)
chr8 (422-578)||(41536527-41536683)
chr8 (422-580)||(38208735-38208894)
chr8 (422-580)||(24430571-24430729)
chr8 (444-569)||(23935227-23935352)
chr8 (427-580)||(39513344-39513497)
chr8 (422-580)||(4649133-4649291)
chr8 (422-580)||(36218781-36218938)
chr8 (444-572)||(6016196-6016324)
chr8 (422-578)||(13797074-13797229)
chr8 (444-580)||(29485270-29485405)
chr8 (422-578)||(42988227-42988382)
chr8 (485-580)||(24193356-24193450)
chr8 (423-487)||(24193131-24193195)
chr8 (503-580)||(8137156-8137234)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (422-580)||(35600122-35600280)
chr7 (422-580)||(31684134-31684292)
chr7 (422-578)||(47281124-47281280)
chr7 (423-578)||(44544394-44544549)
chr7 (422-572)||(1469493-1469643)
chr7 (422-580)||(30876242-30876400)
chr7 (423-577)||(33884305-33884459)
chr7 (422-580)||(37393998-37394156)
chr7 (422-578)||(47271966-47272122)
chr7 (423-578)||(47219130-47219285)
chr7 (422-580)||(8162712-8162870)
chr7 (422-580)||(11476556-11476714)
chr7 (422-580)||(23842288-23842446)
chr7 (422-580)||(27364339-27364497)
chr7 (422-580)||(30798368-30798526)
chr7 (422-572)||(38427563-38427713)
chr7 (422-577)||(40851260-40851415)
chr7 (422-577)||(47294291-47294446)
chr7 (422-580)||(43968259-43968417)
chr7 (422-578)||(30971941-30972097)
chr7 (422-578)||(45723491-45723647)
chr7 (422-578)||(48628790-48628946)
chr7 (422-580)||(41113360-41113518)
chr7 (422-580)||(43752776-43752934)
chr7 (422-580)||(44800410-44800568)
chr7 (422-580)||(11050261-11050419)
chr7 (427-572)||(4923207-4923352)
chr7 (422-550)||(2960640-2960768)
chr7 (444-580)||(3797545-3797681)
chr7 (422-578)||(41139408-41139568)
chr7 (422-580)||(42979338-42979496)
chr7 (423-580)||(29248325-29248482)
chr7 (422-580)||(47119974-47120134)
chr7 (444-580)||(37354285-37354421)
chr7 (422-578)||(47579086-47579243)
chr7 (422-578)||(7336045-7336200)
chr7 (422-540)||(221298-221416)
chr7 (444-572)||(27774099-27774227)
chr7 (422-580)||(18353127-18353285)
chr7 (470-580)||(40520901-40521011)
chr7 (503-578)||(39034047-39034122)
chr7 (422-475)||(42888937-42888990)
chr7 (520-580)||(43025095-43025155)
chr7 (514-580)||(29739764-29739829)
chr7 (422-478)||(5106127-5106182)
chr7 (519-580)||(29739653-29739713)
chr7 (512-551)||(12583313-12583352)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (422-578)||(33807780-33807936)
chr4 (422-571)||(11795154-11795303)
chr4 (422-578)||(42273787-42273943)
chr4 (422-578)||(55517185-55517341)
chr4 (422-578)||(28264628-28264784)
chr4 (422-580)||(4544985-4545143)
chr4 (422-580)||(19496102-19496260)
chr4 (422-580)||(31973574-31973732)
chr4 (423-580)||(32118697-32118854)
chr4 (423-580)||(40988616-40988773)
chr4 (422-578)||(31591061-31591216)
chr4 (422-572)||(26017414-26017564)
chr4 (422-580)||(28159953-28160111)
chr4 (422-580)||(33693333-33693491)
chr4 (423-580)||(37381829-37381986)
chr4 (422-570)||(12196462-12196610)
chr4 (422-578)||(48707733-48707889)
chr4 (422-580)||(2055261-2055419)
chr4 (422-580)||(5227373-5227531)
chr4 (422-580)||(8882013-8882171)
chr4 (422-580)||(17847096-17847253)
chr4 (422-578)||(23135006-23135162)
chr4 (422-578)||(28812287-28812442)
chr4 (422-578)||(49118596-49118752)
chr4 (423-578)||(33174021-33174176)
chr4 (422-580)||(24458631-24458789)
chr4 (422-580)||(30467003-30467161)
chr4 (422-572)||(32317944-32318094)
chr4 (422-580)||(35930023-35930180)
chr4 (424-580)||(10588563-10588719)
chr4 (422-570)||(15985003-15985151)
chr4 (422-578)||(17993017-17993173)
chr4 (444-580)||(19168817-19168953)
chr4 (422-578)||(44490304-44490460)
chr4 (422-557)||(23553071-23553205)
chr4 (422-580)||(14564779-14564937)
chr4 (422-580)||(39995167-39995325)
chr4 (422-580)||(50542354-50542512)
chr4 (422-578)||(9339123-9339282)
chr4 (422-579)||(30141108-30141265)
chr4 (422-571)||(48149491-48149640)
chr4 (422-567)||(48551764-48551909)
chr4 (444-572)||(24623139-24623267)
chr4 (422-580)||(50276138-50276293)
chr4 (422-580)||(51371047-51371205)
chr4 (422-580)||(25734223-25734381)
chr4 (422-581)||(22298499-22298659)
chr4 (422-578)||(31208733-31208885)
chr4 (422-572)||(25730231-25730381)
chr4 (422-568)||(39700040-39700186)
chr4 (444-580)||(42549644-42549779)
chr4 (482-572)||(56555200-56555290)
chr4 (422-497)||(20534231-20534306)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (422-580)||(3408172-3408330)
chr6 (422-578)||(10256222-10256378)
chr6 (422-580)||(12626619-12626777)
chr6 (423-572)||(6503709-6503858)
chr6 (422-578)||(1915343-1915499)
chr6 (422-580)||(1077217-1077378)
chr6 (422-580)||(9382502-9382660)
chr6 (422-580)||(29050255-29050413)
chr6 (422-580)||(30379000-30379158)
chr6 (422-578)||(2390250-2390406)
chr6 (422-578)||(2707444-2707600)
chr6 (422-572)||(8178249-8178399)
chr6 (422-580)||(17943019-17943177)
chr6 (422-580)||(26393009-26393167)
chr6 (422-580)||(3258807-3258965)
chr6 (422-580)||(17428272-17428430)
chr6 (422-578)||(26230932-26231088)
chr6 (422-580)||(11133856-11134015)
chr6 (422-578)||(2598099-2598257)
chr6 (422-580)||(16193293-16193451)
chr6 (444-580)||(26936590-26936726)
chr6 (444-580)||(35223921-35224057)
chr6 (422-580)||(6785101-6785256)
chr6 (422-580)||(26196321-26196479)
chr6 (422-572)||(10931148-10931301)
chr6 (423-578)||(25820550-25820705)
chr6 (422-509)||(31375971-31376058)
chr6 (422-480)||(12612971-12613029)
chr6 (422-502)||(12612848-12612928)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (422-580)||(14717588-14717746)
chr5 (422-580)||(39002025-39002183)
chr5 (423-580)||(30863236-30863393)
chr5 (422-578)||(38964114-38964269)
chr5 (422-580)||(3352002-3352160)
chr5 (422-580)||(6739955-6740113)
chr5 (422-580)||(30297749-30297907)
chr5 (422-580)||(31710265-31710423)
chr5 (422-578)||(8215885-8216041)
chr5 (422-578)||(26593280-26593436)
chr5 (422-580)||(11000728-11000886)
chr5 (422-580)||(14952307-14952465)
chr5 (422-578)||(16095960-16096115)
chr5 (422-570)||(27457197-27457345)
chr5 (422-578)||(33760470-33760626)
chr5 (423-578)||(41282327-41282482)
chr5 (422-580)||(6600136-6600294)
chr5 (422-580)||(8689555-8689713)
chr5 (422-572)||(11692147-11692297)
chr5 (422-580)||(23128913-23129071)
chr5 (422-572)||(35342171-35342321)
chr5 (422-580)||(39824539-39824697)
chr5 (422-580)||(40074933-40075091)
chr5 (422-580)||(42993501-42993659)
chr5 (422-578)||(6251957-6252113)
chr5 (422-580)||(20079258-20079416)
chr5 (422-580)||(20408516-20408674)
chr5 (422-578)||(30208402-30208558)
chr5 (422-580)||(28078405-28078563)
chr5 (422-568)||(43166269-43166415)
chr5 (422-567)||(19659501-19659646)
chr5 (444-580)||(16752099-16752235)
chr5 (422-579)||(1052520-1052674)
chr5 (422-565)||(4015874-4016017)
chr5 (422-578)||(27116099-27116255)
chr5 (444-578)||(26035368-26035502)
chr5 (422-580)||(19398193-19398351)
chr5 (461-578)||(6331362-6331479)
chr5 (422-578)||(11935431-11935586)
chr5 (422-572)||(8694857-8695007)
chr5 (422-580)||(27509961-27510112)
chr5 (444-555)||(444962-445073)
chr5 (422-466)||(6332873-6332917)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (422-578)||(16246193-16246349)
chr2 (422-580)||(7378946-7379104)
chr2 (422-580)||(27328567-27328725)
chr2 (422-580)||(40854592-40854750)
chr2 (428-580)||(771981-772133)
chr2 (422-580)||(11949426-11949584)
chr2 (422-580)||(41500502-41500660)
chr2 (422-571)||(9276566-9276715)
chr2 (422-578)||(2455995-2456151)
chr2 (422-578)||(28650426-28650582)
chr2 (422-572)||(33865267-33865417)
chr2 (422-572)||(34253133-34253283)
chr2 (422-570)||(921015-921163)
chr2 (422-578)||(37838282-37838438)
chr2 (422-580)||(1106559-1106717)
chr2 (423-572)||(17134220-17134369)
chr2 (423-580)||(38751031-38751188)
chr2 (422-578)||(2094410-2094566)
chr2 (422-578)||(12759750-12759905)
chr2 (422-578)||(19180407-19180562)
chr2 (422-578)||(33106969-33107125)
chr2 (429-580)||(3430631-3430782)
chr2 (423-578)||(36444229-36444384)
chr2 (422-580)||(2056909-2057067)
chr2 (422-572)||(8899673-8899822)
chr2 (422-580)||(17484550-17484708)
chr2 (444-580)||(8396573-8396709)
chr2 (422-557)||(7297234-7297369)
chr2 (422-580)||(25087796-25087954)
chr2 (422-580)||(29737731-29737889)
chr2 (422-572)||(43249412-43249562)
chr2 (427-580)||(36211029-36211182)
chr2 (422-569)||(2314975-2315122)
chr2 (422-580)||(42629945-42630103)
chr2 (422-578)||(37732193-37732349)
chr2 (422-578)||(45124104-45124260)
chr2 (447-578)||(37654093-37654224)
chr2 (462-578)||(41178059-41178175)
chr2 (444-572)||(19916009-19916137)
chr2 (422-514)||(14630663-14630755)
chr2 (422-562)||(9331757-9331897)
chr2 (507-578)||(23672958-23673029)
chr2 (422-512)||(23671811-23671901)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (422-580)||(218868-219027)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (422-572)||(105-255)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (422-580)||(5027-5185)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (422-557)||(5192-5326)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (422-580)||(252438-252596)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (444-580)||(1995-2131)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (422-580)||(47945-48103)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (422-580)||(13078-13236)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (422-580)||(59608-59766)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (423-557)||(11364-11498)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (510-580)||(289-359)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (422-497)||(605-680)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (422-497)||(1913-1988)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (422-497)||(3371-3446)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (422-497)||(1883-1958)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (513-572)||(19772-19831)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26456148 - 26455797
Alignment:
Q  9 gaagaaaatatggtgcnnnnnnnggtttatactgttattgataagtgtgaaaaaacgaagggagttttagagcttgaggaagnnnnnnntttggagcgtt 108  Q
    ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  26456148 gaagaaaatatggtgcaaaaaaaggtttatactgttattgataagtgtgaaaaaacgaagggagttttagagcttgaggaagaaaaaaatttggagcgtt 26456049  T
Q  109 tgtttgcagtcaccaagttcatggataaaatcgtgctaaaatcactcattttaagcatgctgatgcagagtctttgcatgacacatgagagca-nnnnnn 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  26456048 tgtttgcagtcaccaagttcatggataaaatcgtgctaaaatcactcattttaagcatgctgatgcagagtctttgcatgacacatgagagcattttttt 26455949  T
Q  208 nattgttactgaaatggtgtcctggccacgatatagatgagctc-----------aatctcccctcaaaggttgagagccctaataagaaagttggtgga 296  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455948 tattgttactgaaatggtgtcctggccacgatatagatgagctcaaccaaatgaaaatctcccctcaaaggttgagagccctaataagaaagttggtgga 26455849  T
Q  297 tgcttcagctaggaacaccatgatgacaaagtcggtcaaatgcatctaaagg 348  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455848 tgcttcagctgggaacaccatgatgacaaagtcggtcaaatgcatctaaagg 26455797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 26455723 - 26455565
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455723 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 26455624  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455623 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 26455565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 20813441 - 20813599
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20813441 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20813540  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20813541 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 20813599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 38446617 - 38446459
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38446617 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38446518  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38446517 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtagataatgctctttgttgctatcatctga 38446459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1017185 - 1017029
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  1017185 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 1017086  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1017085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 1017029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1687792 - 1687636
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  1687792 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 1687693  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  1687692 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgatctttgttgctatcatct 1687636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 20760071 - 20760227
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  20760071 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 20760170  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  20760171 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactctttgttgctatcatct 20760227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 33151837 - 33151681
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33151837 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33151738  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33151737 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 33151681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 569
Target Start/End: Original strand, 35346471 - 35346618
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35346471 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35346570  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttg 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  35346571 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttg 35346618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 21656659 - 21656501
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21656659 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 21656560  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21656559 ttagtcacctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 21656501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21564637 - 21564481
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21564637 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacccacttaaaa 21564538  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  21564537 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttattgctatcatct 21564481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 47329175 - 47329331
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47329175 gaatcgtttccaacaagtcatatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47329274  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47329275 ttagtcatctttttaggtatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 47329331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 31122803 - 31122653
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  31122803 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaagacccgcttaaaa 31122704  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31122703 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgcta 31122653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 50287707 - 50287551
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50287707 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattaaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50287608  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  50287607 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgatctttattgctatcatct 50287551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Original strand, 20086314 - 20086464
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20086314 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatacttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20086413  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20086414 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctctttgttgcta 20086464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 428 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22852131 - 22851981
Alignment:
Q  428 tttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtc 527  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22852131 tttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtc 22852032  T
Q  528 atctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22852031 atctgtttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 22851981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 36314972 - 36315130
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  36314972 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaa 36315071  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  36315072 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttattgctatcatctga 36315130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 42017014 - 42016856
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  42017014 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42016915  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| || |||||||    
T  42016914 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatactttttgttgttatcatctga 42016856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 53925979 - 53926137
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  53925979 gaatcatttcaaataagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaa 53926078  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  53926079 ttagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 53926137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 427 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 19664677 - 19664524
Alignment:
Q  427 gtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagt 526  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||| |||||||||||||||    
T  19664677 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcataacatccacttaaaattagt 19664578  T
Q  527 catctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19664577 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 19664524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 430 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12748524 - 12748376
Alignment:
Q  430 tcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcat 529  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  12748524 tcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgttttctaacacccacttaaaattagtcat 12748425  T
Q  530 ctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  12748424 ctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttactatcatct 12748376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 42107099 - 42107255
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  42107099 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattacttccttgaactcatctttgacaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42107198  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  42107199 ttagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 42107255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 422 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 41251027 - 41250880
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  41251027 gaattgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 41250928  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttg 569  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41250927 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttg 41250880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 32650820 - 32650978
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  32650820 gaatcatttcaaacaagttctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 32650919  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  32650920 ttagtcatctttctaggcatggcaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 32650978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 51562303 - 51562145
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  51562303 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagataacatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 51562204  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  51562203 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctcttttttgctatcatctga 51562145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 3697287 - 3697129
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  3697287 gaatcctttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaattcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaa 3697188  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  3697187 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctatttgttgctatcatctga 3697129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 10618480 - 10618638
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  10618480 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 10618579  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10618580 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 10618638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 21890311 - 21890161
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  21890311 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatatttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 21890212  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  21890211 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatattctttgttgcta 21890161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 44798408 - 44798259
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44798408 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 44798309  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44798308 ttactcat-tttttaggcatgtcaaatggtggataatgctctttgttgcta 44798259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 52821049 - 52821207
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  52821049 gaatcgttttaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtagtaaaactggctcctaacacccacttaaaa 52821148  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  52821149 ttagtcatctttttaggcataacaaatgatggataatgctctttgttgctatcatctga 52821207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 53196155 - 53195997
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  53196155 gaatcgtttcaaagaagtcttattgtagataacatagttggtaattatttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaa 53196056  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  53196055 ttagttatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 53195997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 423 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 29677616 - 29677467
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  29677616 aatcgtttcaaacaggtcctatcgtagatatcatagtttgtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccatttaaaat 29677517  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29677516 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgcta 29677467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 27070739 - 27070895
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  27070739 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacactcacttaaaa 27070838  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||| || ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27070839 ttagtcatcttttcagacattataaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 27070895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 35608131 - 35608287
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||     
T  35608131 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatcggactcctaacacccacttaaac 35608230  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  35608231 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactctttgttgctatcatct 35608287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 37248097 - 37247947
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  37248097 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37247998  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  37247997 ttagtcatcttttcatgcatgacaaatgatgaataatgctctttgttgcta 37247947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 48651389 - 48651231
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  48651389 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 48651290  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  48651289 ttaatcgtctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgttatcatctga 48651231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Original strand, 55164115 - 55164265
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  55164115 gaattgtttcaaataagtcatattgtagatagcatagttgctaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacctacttaaaa 55164214  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  55164215 ttagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatgctctttgttgcta 55164265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 422 - 571
Target Start/End: Original strand, 40922165 - 40922314
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  40922165 gaatcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40922264  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgct 571  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  40922265 ttagtaatttttttaggcatggaaaatggtggataatgttctttgttgct 40922314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 444 - 581
Target Start/End: Original strand, 51475268 - 51475405
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51475268 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatga 51475367  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctgat 581  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  51475368 caaatggtggataatggtctttgttgctatcatctgat 51475405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 1448735 - 1448890
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1448735 gaatcgtttcaaagaagtcctattgt---taccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1448831  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1448832 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 1448890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 20913754 - 20913910
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  20913754 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20913853  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  20913854 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgctatttgttgctatcatct 20913910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 20921872 - 20922028
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  20921872 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20921971  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  20921972 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgctatttgttgctatcatct 20922028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 50977983 - 50977847
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  50977983 ttgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatga 50977884  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  50977883 caaatggtggataatgctttttgttgctatcatctga 50977847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 51081115 - 51080979
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  51081115 ttgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatga 51081016  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  51081015 caaatggtggataatgctttttgttgctatcatctga 51080979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 454 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 19268630 - 19268515
Alignment:
Q  454 catagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgg 553  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268630 catagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgg 19268531  T
Q  554 ataacgctctttgttg 569  Q
    |||| |||||||||||    
T  19268530 ataatgctctttgttg 19268515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 33473239 - 33473397
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  33473239 gaatcgtttcaaacaagttttattgtagataacatagttggtaattgtttccttgattttatctttggtaccaaatctggtttctaacacgcacttaaaa 33473338  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33473339 ttagtcatctttttagtcatgataaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 33473397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 39069867 - 39069709
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39069867 gaatcgtttcaaacaagtcatattgttaatagcatagttgataattgtttcctttaacttatctttggtaccaaatctggctcttaacacccacttaaaa 39069768  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39069767 ttagtcatcttttcatgcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 39069709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 444 - 572
Target Start/End: Original strand, 50364909 - 50365037
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  50364909 ttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacactcacttaaaatcagtaatctttttaggcatgg 50365008  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50365009 caaatggtgggtaatgctctttgttgcta 50365037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 45380260 - 45380418
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttgg-taattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  45380260 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagtttgataattgcttctttaaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacc-acttaaa 45380358  T
Q  521 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45380359 attagtcatctttttatgcatggtaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 45380418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 450 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 28699798 - 28699670
Alignment:
Q  450 atagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatg 549  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28699798 atagcttagtagataattgcttccttgaactcatctttggcaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatg 28699699  T
Q  550 gtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28699698 gtggataatgctctttgttgctatcatct 28699670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Original strand, 38923998 - 38924148
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  38923998 gaattgtttcaaacaagtcctatcgtagataaaatagttggtaattgcttcgttgaacttatctttggtaccaaattggactcctaacatccacttaaaa 38924097  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  38924098 ttaatcatctctttaagcatgacaaataatgaataacgctctttgttgcta 38924148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 34019579 - 34019443
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||     
T  34019579 ttgtagatagcatagttgataattgcttacttgaactcactgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagccatatttttaggcatgt 34019480  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  34019479 caaatggtggataatgctttttgttgctatcatctga 34019443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 486 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 44152777 - 44152685
Alignment:
Q  486 ttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44152777 ttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 44152685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26456413 - 26456315
Alignment:
Q  99 ttggagcgtttgtttgcagtcaccaagttcatggataaaatcgtgctaaaatcactcattttaagcatgctgatgcagagtctttgcatgacacatgaga 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26456413 ttggagcgtttatttgcagtcaccaagttcatggg--aaatcgtgctaaagtcactcattttgagcatgttgatgcatattctttgcatgacacatgaga 26456316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 503 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 47473290 - 47473213
Alignment:
Q  503 tcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47473290 tcctaacatccacttaaaattagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 47473213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 444 - 532
Target Start/End: Original strand, 42641200 - 42641288
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctt 532  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42641200 ttgtatatagccaagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaagtctgcctcctaacacccacttaaaatcaatcatctt 42641288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26456248 - 26456171
Alignment:
Q  252 aatctcccctcaaaggttgagagccctaataagaaagttggtggatgcttcagctaggaacaccatgatgacaaagtc 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||  ||||||||    
T  26456248 aatctccactcaaaggttgagagcccaaataagaatgttgttggatgcttaagttgggaacaccatgaaaacaaagtc 26456171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 44152814 - 44152772
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggta 464  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  44152814 gaatcgtttcaaacaagtcatattatagataacatagttggta 44152772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 64)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 23767414 - 23767572
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23767414 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23767513  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23767514 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 23767572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 19315781 - 19315623
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  19315781 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 19315682  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19315681 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 19315623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 38473626 - 38473784
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38473626 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 38473725  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38473726 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 38473784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 46051591 - 46051433
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46051591 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 46051492  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  46051491 ctagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 46051433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 7553016 - 7553174
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7553016 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7553115  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7553116 ttagtcatctttttagccatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 7553174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 7651803 - 7651647
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7651803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttgataattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7651704  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7651703 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 7651647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12143213 - 12143057
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12143213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 12143114  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12143113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 12143057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 46825672 - 46825516
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  46825672 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 46825573  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  46825572 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 46825516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 41106157 - 41106007
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  41106157 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41106058  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41106057 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgcta 41106007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 52147134 - 52146976
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52147134 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtatatagcatagtttgtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 52147035  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  52147034 ttattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 52146976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 26549529 - 26549373
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26549529 gaatcgttttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 26549430  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26549429 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 26549373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 28425363 - 28425519
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  28425363 gaatcgtttcaaacaagtcctattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 28425462  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28425463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 28425519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 9962892 - 9962737
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9962892 gaatcgtttcaaacaagttctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagttcctaacacccacttaaaa 9962793  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatc 577  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  9962792 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgttctttgttgctatcatc 9962737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 577
Target Start/End: Original strand, 49094711 - 49094866
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  49094711 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49094810  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatc 577  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  49094811 ttagtcatctttttaggcataacaaatggtggataatgttctttgttgctatcatc 49094866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 36157678 - 36157835
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36157678 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgg-aattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 36157776  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  36157777 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 36157835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 49814441 - 49814283
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  49814441 gaatcgtttcaaataagtcatattctagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49814342  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||    
T  49814341 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctttttattgctatcatctga 49814283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 25988271 - 25988427
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  25988271 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 25988370  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  25988371 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctttttgttgctatcatct 25988427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 50690084 - 50689928
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50690084 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50689985  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  50689984 ttagtcatctttttaggcatagcaaatgatggataatgctctttgttgctatcatct 50689928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 36781172 - 36781330
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36781172 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 36781271  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  36781272 ttagtcgtctttttgggcatggcaaatggtggataatgctttttgttgctatcatctga 36781330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 33674158 - 33674002
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33674158 gaatcgtgtcaaacaagtcctattgtagatagcatagctggtaattgcttccttgaactcatctttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33674059  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33674058 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 33674002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 423 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19274699 - 19274544
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19274699 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagctggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 19274600  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19274599 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctctttgttgctatcatct 19274544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 9878784 - 9878942
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  9878784 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccatatcgggttcctaacacccacttaaaa 9878883  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||    
T  9878884 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttgctgtcatctga 9878942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 23228194 - 23228352
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||    
T  23228194 gaatcgtttcaaacaagtactattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccatttaaaa 23228293  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23228294 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctctttgttgctatcatctga 23228352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 52067651 - 52067809
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  52067651 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatggcataatttgtaattgcttccttgaactcatcgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 52067750  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  52067751 ttattcatctttttagggatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 52067809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 48802331 - 48802487
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  48802331 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacctacttaaaa 48802430  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48802431 ttagtcatctttgtaggcatgataaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 48802487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 45670486 - 45670644
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagtt-ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  45670486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacc-acttaaa 45670584  T
Q  521 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  45670585 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 45670644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 5401011 - 5400854
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  5401011 gaatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggtttctaacatccacttaaaa 5400912  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||||||    
T  5400911 ttagtcatctttttaggcatg-caaatggtggataatactatttgttgctatcatctga 5400854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 7608766 - 7608924
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  7608766 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatcttttgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 7608865  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7608866 ttagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 7608924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 48669396 - 48669554
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  48669396 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtgattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 48669495  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  48669496 ttagtcatctttttaggcatgacaaataatggataatgttctttgttgctatcatctga 48669554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18892470 - 18892314
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  18892470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccactgaaaa 18892371  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18892370 ttagtcatccttttaggaatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 18892314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 26070033 - 26069877
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||||||||||    
T  26070033 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatttttggtatcaaatccggctcctaacacccacttaaaa 26069934  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||    
T  26069933 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgatctttgttgttatcatct 26069877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 33325868 - 33325720
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  33325868 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttggtatcaaatctggcttctaagacccacttaaaa 33325769  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgc 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33325768 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgc 33325720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 52349924 - 52350080
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  52349924 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 52350023  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  52350024 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctctttgttgctatcatct 52350080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 425 - 578
Target Start/End: Original strand, 24204474 - 24204627
Alignment:
Q  425 tcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaatta 524  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |    
T  24204474 tcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaatga 24204573  T
Q  525 gtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  24204574 gtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctctttattgctatcatct 24204627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 45350717 - 45350871
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45350717 gaatcgtttcaaacaa--cctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgatctcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 45350814  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||    
T  45350815 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttttttgttgctatcatct 45350871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 423 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 50533523 - 50533366
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  50533523 aatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 50533424  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  50533423 tagtcatctttttaggcatgtcaaattttggataatgctctttgttgctatcatctga 50533366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 46095075 - 46095231
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  46095075 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttgatatcaaatctgtctcctaacatccacttaaaa 46095174  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  46095175 ttagtcatctttttaaacatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 46095231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 16706011 - 16705865
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  16706011 gaatcgtttcaaacaagtcttattttagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcgcctaaaacccacttaaaa 16705912  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgtt 568  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  16705911 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctctttgtt 16705865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 17983898 - 17984056
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  17983898 gaatcgtttcaaccaagtcctaatgtaaataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgattcataacacccacttaaaa 17983997  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17983998 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctctttgttgctatcatctga 17984056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 18782089 - 18782247
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  18782089 gaatcatttcaaacaagtcatattctagatagcatagttgataattgcttatttgaactcatctttggtacaaaatctggttcatagcacccacttaaaa 18782188  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  18782189 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 18782247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 43396816 - 43396658
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  43396816 gaatcgtttcaaacaaatcctactgtagatagcagagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 43396717  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43396716 ttagtcatctttttaagcatagcaaatgatggataatgctctttgttgctatcatctga 43396658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Original strand, 33194673 - 33194809
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  33194673 ttgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgg 33194772  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  33194773 cgaatggtggttaatgctctttgttgctatcatctga 33194809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 37217037 - 37216881
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||||||||||||||    
T  37217037 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaactctagctcataacacccacttaaaa 37216938  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||||    
T  37216937 ttagtcatctttttagacatggcaaatggtggataatgttctttgttggtatcatct 37216881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 424 - 580
Target Start/End: Original strand, 41982237 - 41982393
Alignment:
Q  424 atcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaatt 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  41982237 atcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccatttaaaatt 41982336  T
Q  524 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||    
T  41982337 agtcatatttttaggcatgacaaatggtggataatgttttttgttgctatcatctga 41982393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Original strand, 48319068 - 48319204
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  48319068 ttgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatta 48319167  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  48319168 caaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 48319204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 6711581 - 6711431
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  6711581 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagacattatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6711482  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6711481 ttagccatctttttacacatggtaaatggtggataatgctctttgttgcta 6711431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Original strand, 8141486 - 8141636
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  8141486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataatttgtaattgcttctttgaactcatctttagtaccaaatctgacttgtaacacccacttaaaa 8141585  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8141586 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttgcta 8141636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 423 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 18917664 - 18917507
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  18917664 aatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcatatttaataattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaat 18917565  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  18917564 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataattctctttgttactatcatctga 18917507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 9974961 - 9974825
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9974961 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtactaaatatggctcgtaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgg 9974862  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  9974861 taaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 9974825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 459 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12964750 - 12964631
Alignment:
Q  459 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataac 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  12964750 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatgttgtataat 12964651  T
Q  559 gctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  12964650 gctctttgttgctatcatct 12964631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 40721484 - 40721325
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacaccc-acttaaa 520  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| || ||||    
T  40721484 gaatcgtttccaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgctttcttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaatacccaacctaaa 40721385  T
Q  521 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40721384 attaattatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 40721325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 34971221 - 34971063
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  34971221 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgtttctttgaactcatatttggtatcaaatctgactcctaacactcacttaaaa 34971122  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  34971121 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 34971063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Original strand, 16506810 - 16506946
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||     
T  16506810 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagccatctttttaagcatgg 16506909  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  16506910 caaatggtggataatgatctttgttgctatcatctga 16506946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 422 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 21965206 - 21965051
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  21965206 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattaaactcatctttggtaccaaatctgactccttacacccacttaaaa 21965107  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatc 577  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  21965106 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtgtataatgttctttgttgctatcatc 21965051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 444 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 30281750 - 30281622
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||     
T  30281750 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaataccagttatctttttaggcatgt 30281651  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30281650 aaaatggtggataatgctctttgttgcta 30281622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 21929667 - 21929504
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatcttt-------ggtaccaaatttggttcctaacaccca 514  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||| |||||| |||||    
T  21929667 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttcatctttggtaccaaatctggctcctaaaaccca 21929568  T
Q  515 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  21929567 cttaaaattagtcatctttttag--atggcaaatggtggataatcttctttgttgctatcatctga 21929504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 33714361 - 33714517
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| | |    
T  33714361 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagataacatagttgataattgtttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaaca-ccactt-aca 33714458  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  33714459 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatattctttgttgctatcatctga 33714517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 422 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 25800782 - 25800636
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctt----tggtaccaaatttggttcctaacacccactt 517  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |      ||||||||||||    
T  25800782 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatcttaatttggtaccaaatct------taacacccactt 25800690  T
Q  518 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgct 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  25800689 aaaattagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgttcttttttgct 25800636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 485 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 50099298 - 50099203
Alignment:
Q  485 tttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||| ||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  50099298 tttggtaccaaatatgacttttaacatccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 50099203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 422 - 523
Target Start/End: Original strand, 44978768 - 44978868
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  44978768 gaatcgtttcaaacaagtcagaatgtagatagcataattgataattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaata-ccacttaaaa 44978866  T
Q  522 tt 523  Q
    ||    
T  44978867 tt 44978868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 515 - 580
Target Start/End: Original strand, 44979281 - 44979346
Alignment:
Q  515 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44979281 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 44979346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 519 - 580
Target Start/End: Original strand, 32373650 - 32373711
Alignment:
Q  519 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  32373650 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttactatcatctga 32373711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 533 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 49973972 - 49973927
Alignment:
Q  533 tttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  49973972 tttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 49973927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 519 - 568
Target Start/End: Original strand, 17989864 - 17989913
Alignment:
Q  519 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgtt 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  17989864 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtgaataatgctatttgtt 17989913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 1293627 - 1293469
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1293627 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggtttctaacacccacttaaaa 1293528  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1293527 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 1293469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 2533413 - 2533257
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2533413 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctccaaacacccacttaaaa 2533314  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2533313 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 2533257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 422 - 581
Target Start/End: Original strand, 36400070 - 36400229
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||     
T  36400070 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaac 36400169  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctgat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36400170 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctgat 36400229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 37933783 - 37933627
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37933783 gaatcgtttcaaacaagtcttatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37933684  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  37933683 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttgctatcatct 37933627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 43806533 - 43806691
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  43806533 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacactcacttaaaa 43806632  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43806633 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctctttgttgctatcatctga 43806691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 513448 - 513293
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  513448 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 513349  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  513348 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 513293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 3876049 - 3875901
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  3876049 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactatatctggttcctaacacccacttaaaa 3875950  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgc 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3875949 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgc 3875901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 35443452 - 35443294
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35443452 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35443353  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35443352 ttagttatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctctttgttgctatcatctga 35443294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 38107240 - 38107090
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38107240 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38107141  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38107140 ttaatcatctttttaggcatgataaatggtggataatgttctttgttgcta 38107090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 22683988 - 22684144
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22683988 gaatcatttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 22684087  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  22684088 ttagtcatctttttagccatgacaaatggtgaataatgctctttgttgctatcatct 22684144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 15847253 - 15847118
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15847253 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 15847154  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 557  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15847153 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 15847118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 260118 - 259963
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  260118 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 260019  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  260018 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatgttctttcttgctatcatct 259963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 655803 - 655958
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  655803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 655902  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  655903 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatgttctttcttgctatcatct 655958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 841538 - 841693
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  841538 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 841637  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  841638 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatgttctttcttgctatcatct 841693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 422 - 577
Target Start/End: Original strand, 38633710 - 38633865
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  38633710 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgatttctaacacccacttaaaa 38633809  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatc 577  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  38633810 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttactatcatc 38633865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 28496355 - 28496512
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  28496355 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagtt-ctaatacccacttaaaa 28496453  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  28496454 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatactctttgttgctatcatctga 28496512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 28707446 - 28707604
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  28707446 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatatcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaa 28707545  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28707546 ttagtcatcttttaaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 28707604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 35884430 - 35884588
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  35884430 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 35884529  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||    
T  35884530 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgctatttattgctatcatctga 35884588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 12010693 - 12010532
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtag---atagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccactta 518  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12010693 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagtagatagcatagttggtaattgttgccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccactta 12010594  T
Q  519 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12010593 aaattagtcatctttttatgcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 12010532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 40301893 - 40302051
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||    
T  40301893 gaatcgtttcaaaaaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaatttatctttggtaccaaatctagctcctaacactcacttaaaa 40301992  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  40301993 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 40302051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 7435005 - 7434869
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7435005 ttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttataggcttga 7434906  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7434905 caaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 7434869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 9056338 - 9056494
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  9056338 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 9056437  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9056438 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 9056494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 23972295 - 23972454
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  23972295 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgactcctatcacccacttaaaa 23972394  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgac-aaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  23972395 ttagtcatctttttagacatgacaaaatgttggataatactctttgttgctatcatctga 23972454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 440981 - 440823
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  440981 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 440882  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  440881 ttactcatctttttagacatggcaaacggtggataatgttctttgttgctatcatctga 440823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 33651982 - 33651824
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  33651982 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagtttgtaattgtttccttgaactcatctttcataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 33651883  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33651882 ttagtcatctttttagacatgacaaacggtggataatgctctttgttgctatcatctga 33651824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 41536527 - 41536683
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  41536527 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41536626  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||| ||| |||||    
T  41536627 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtgaaaaatactctttgttactatcatct 41536683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 38208894 - 38208735
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38208894 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgctaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38208795  T
Q  522 ttagtcat-ctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||    
T  38208794 ttagtcatccattttagacatggcaaatggtggataatgttttttgttgctatcatctga 38208735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 24430571 - 24430729
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||    
T  24430571 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttgataattgttttattgaactcatctttggtaccaaatctcactactaacacccacttaaaa 24430670  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24430671 ttagtcatctttttaggcatgacaaaaggtggataatgctctttgttgctatcatctga 24430729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 444 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 23935352 - 23935227
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  23935352 ttgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgg 23935253  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttg 569  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  23935252 caaatggtggataatgctctttgttg 23935227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 580
Target Start/End: Original strand, 39513344 - 39513497
Alignment:
Q  427 gtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagt 526  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  39513344 gtttcaaataagtcctaatgtagataacatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaattagt 39513443  T
Q  527 catctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  39513444 catctttttaggcatggcatatggtggataatactctttgttgctatcatctga 39513497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 4649291 - 4649133
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  | | |||| ||||||||||    
T  4649291 gaatcgtttcaaacaagtccaattgtagatagcataattggtaattgtttccttgaactcgtctttggtaccaaatctgacttccaacatccacttaaaa 4649192  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  4649191 ttagtcatttttttaggcatggcaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 4649133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 36218781 - 36218938
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  36218781 gaatcgtttcaaacaagtcatgatgtagataatatagttgataattgcttc-ttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctagcacccacttaaaa 36218879  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  36218880 ttagccatctttttaggcatggcaaatggtggataatggtctttgttgttatcatctga 36218938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 444 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 6016324 - 6016196
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6016324 ttgtagatagcatagttggtaattgcttctttaaactcatctttgatactcaatttggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatga 6016225  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6016224 caaatggtggataatgctttttgttgcta 6016196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 13797229 - 13797074
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  13797229 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtatatagcatagttggtaattgcttctttgaactcat-tttggtatcaaatctggctcctaacatccacataaaa 13797131  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  13797130 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggacgatgctctttgttgctatcatct 13797074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 29485405 - 29485270
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  29485405 ttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaatcagtcat-tttttaggcatgg 29485307  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  29485306 caaatgatggataatgctctttgttgctatcatctga 29485270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 42988227 - 42988382
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||| || |||| || ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  42988227 gaatcgtttcaaa-aagtcctattgtagataatatagttgataattgcttcatttaacttatatttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 42988325  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||    
T  42988326 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctctttattgctatcatct 42988382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 485 - 580
Target Start/End: Original strand, 24193356 - 24193450
Alignment:
Q  485 tttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  24193356 tttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctctttgttgctatcatctga 24193450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 423 - 487
Target Start/End: Original strand, 24193131 - 24193195
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatcttt 487  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24193131 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcttt 24193195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 503 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 8137234 - 8137156
Alignment:
Q  503 tcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggat-aacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| |||||||    
T  8137234 tcctaacacctacttaaaattagtcatttttttaggcatagcaaatggtggataaatgttctttgttgctatcatctga 8137156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 35600122 - 35600280
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35600122 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 35600221  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35600222 ttagttatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 35600280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 31684134 - 31684292
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31684134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 31684233  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31684234 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 31684292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 47281124 - 47281280
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47281124 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47281223  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47281224 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 47281280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 423 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 44544549 - 44544394
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  44544549 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 44544450  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44544449 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 44544394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Original strand, 1469493 - 1469643
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1469493 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1469592  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1469593 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgcta 1469643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 30876400 - 30876242
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30876400 gaatcgtttcaaacaagtgctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttggtaccaaattgggctcctaacacccacttaaaa 30876301  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30876300 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 30876242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 423 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 33884459 - 33884305
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  33884459 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 33884360  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatc 577  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  33884359 tagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttgctatcatc 33884305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 37393998 - 37394156
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  37393998 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacacccagttaaaa 37394097  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  37394098 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 37394156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 47272122 - 47271966
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47272122 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 47272023  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47272022 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctctttgttgctatcatct 47271966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 423 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 47219285 - 47219130
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  47219285 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaat 47219186  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  47219185 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttattgctatcatct 47219130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 8162712 - 8162870
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8162712 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8162811  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8162812 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctctttgttgctatcatctga 8162870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 11476556 - 11476714
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11476556 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11476655  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  11476656 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctctttgttgctatcatctga 11476714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 23842446 - 23842288
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  23842446 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttcaaa 23842347  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23842346 ttagtcatctttttaggcatggcagatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 23842288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 27364339 - 27364497
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27364339 gaatcgtttcaaacagatcctattgtagataacatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 27364438  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27364439 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 27364497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 30798368 - 30798526
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30798368 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 30798467  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30798468 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctctttgttgctatcatctga 30798526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Original strand, 38427563 - 38427713
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38427563 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38427662  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38427663 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggcggataatgctctttgttgcta 38427713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 40851415 - 40851260
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40851415 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaggtagaatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 40851316  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatc 577  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40851315 ttagtcatctttttaggcacgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatc 40851260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 577
Target Start/End: Original strand, 47294291 - 47294446
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  47294291 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatcgttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttataa 47294390  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatc 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  47294391 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttattgctatcatc 47294446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 43968259 - 43968417
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  43968259 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcgtagttggtaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatttggctcataatacccacttaaaa 43968358  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43968359 ttagtcatctttataggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 43968417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 30971941 - 30972097
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30971941 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatggcatagttggtaattacttccttaaacccatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 30972040  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  30972041 ttagtcatctttttaagcatgacaaattgtggataatgctctttgttactatcatct 30972097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 45723491 - 45723647
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  45723491 gaatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcataattagtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 45723590  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45723591 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 45723647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 48628946 - 48628790
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48628946 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcattttttgcaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 48628847  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  48628846 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgtttctatcatct 48628790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 41113518 - 41113360
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41113518 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 41113419  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||    
T  41113418 ttagtcatctttttagacatggcaaatgatgaataatgctctttgttgctatcatctga 41113360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 43752776 - 43752934
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  43752776 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctgactcctaacatccacttaaaa 43752875  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43752876 ttagtcatcttttgaggcaggacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 43752934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 44800410 - 44800568
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44800410 gaattgtttcaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgtttcattgaactcatctttggtaccaaatatggttcctaacacccacttaaaa 44800509  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  44800510 ttagtcatctttttaggcatgatatatggtggataatgttccttgttgctatcatctga 44800568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 11050261 - 11050419
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||    
T  11050261 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatatttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctgcctcctaatacccacttaaaa 11050360  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  11050361 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 11050419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 427 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 4923352 - 4923207
Alignment:
Q  427 gtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagt 526  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4923352 gtttcaaacaagtcctattgtggatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaattagt 4923253  T
Q  527 catctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4923252 catctttttaggcatggcaaatggtggataatgttctttgttgcta 4923207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 422 - 550
Target Start/End: Original strand, 2960640 - 2960768
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2960640 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2960739  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgg 550  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2960740 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgg 2960768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Original strand, 3797545 - 3797681
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  3797545 ttgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgt 3797644  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3797645 taaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 3797681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 41139408 - 41139568
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcata----gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccactt 517  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||    
T  41139408 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatatatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccgctt 41139507  T
Q  518 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  41139508 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctctttgttgctatcatct 41139568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 42979338 - 42979496
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  42979338 gaatcgtttcaaacaagtcctactgtagataacatagttggtaattgcttcgttgaactcatctttgatatcaaatctgactcctaacatccacttaaaa 42979437  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  42979438 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctctttgttgctatcatctga 42979496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 423 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 29248482 - 29248325
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  29248482 aatcatttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcatcaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 29248383  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  29248382 tagtcatctttttaggcatggcaaattgtggataattctctttgttgctatcatctga 29248325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 47120134 - 47119974
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcata--gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaa 519  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47120134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagagagcatatagttggtaattgctttcttgaactcatatttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaa 47120035  T
Q  520 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47120034 aattagttatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 47119974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Original strand, 37354285 - 37354421
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  37354285 ttgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatttggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgg 37354384  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||    
T  37354385 caaatggtggataatgttgtttgttgctatcatctga 37354421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 47579086 - 47579243
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaatt-gcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaa 520  Q
    |||| |||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47579086 gaattgtttcagacaagtcctattatagatagcataattggtaatttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaa 47579185  T
Q  521 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47579186 attaaccatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 47579243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 7336200 - 7336045
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7336200 gaatcgtttcaaacagttc-tattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatcattgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7336102  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| |||||    
T  7336101 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatactatttgttgctatcatct 7336045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 422 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 221416 - 221298
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  221416 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221317  T
Q  522 ttagtcatctttttaggca 540  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  221316 ttagtcttctttttaggca 221298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 444 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 27774227 - 27774099
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  27774227 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaatcagccatctttttaggcatgg 27774128  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27774127 caaatggtggataatgctctttgttgcta 27774099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 18353285 - 18353127
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| | ||||||    
T  18353285 gaatcgtttcaaacaagtcctaaggtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacacctaattaaaa 18353186  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  18353185 ttagtcatctttttagacatgataaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 18353127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 40521011 - 40520901
Alignment:
Q  470 ttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttg 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40521011 ttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttagccatggcaaatggtggataatgctctttgttg 40520912  T
Q  570 ctaccatctga 580  Q
    ||| |||||||    
T  40520911 ctatcatctga 40520901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 503 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 39034122 - 39034047
Alignment:
Q  503 tcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39034122 tcctaacgcccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 39034047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 422 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 42888990 - 42888937
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttcctt 475  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42888990 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcctt 42888937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 520 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 43025155 - 43025095
Alignment:
Q  520 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  43025155 aattagtcatctttttaggcatgacaaatgatggatattgctctttgttgctatcatctga 43025095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 514 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 29739829 - 29739764
Alignment:
Q  514 acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  29739829 acttaaaattagtcatctttt-aggcatggtaaatggtggataatgctctttgttactatcatctga 29739764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5106182 - 5106127
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaa 478  Q
    |||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5106182 gaatcgtttcaaacat-tcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaa 5106127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 519 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 29739713 - 29739653
Alignment:
Q  519 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  29739713 aaattagtcatctttt-aggcatggtaaatggtggataatgctctttgttactatcatctga 29739653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12583352 - 12583313
Alignment:
Q  512 ccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggt 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12583352 ccacttaaaattagtcatctttttacgcatgaaaaatggt 12583313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 33807780 - 33807936
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33807780 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 33807879  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33807880 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 33807936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 422 - 571
Target Start/End: Original strand, 11795154 - 11795303
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11795154 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 11795253  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgct 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11795254 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgct 11795303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 42273943 - 42273787
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  42273943 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 42273844  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  42273843 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 42273787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 55517185 - 55517341
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  55517185 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 55517284  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  55517285 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 55517341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 28264784 - 28264628
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  28264784 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 28264685  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28264684 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 28264628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 4544985 - 4545143
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4544985 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 4545084  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4545085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 4545143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 19496102 - 19496260
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19496102 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggcgcctaacacccacttaaaa 19496201  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19496202 ttagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 19496260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 31973732 - 31973574
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  31973732 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 31973633  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31973632 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 31973574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 423 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 32118854 - 32118697
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  32118854 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccccttaaaat 32118755  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32118754 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctatcatctga 32118697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 423 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 40988773 - 40988616
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40988773 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 40988674  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40988673 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctctttgttgctatcatctga 40988616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 31591216 - 31591061
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31591216 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 31591117  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31591116 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 31591061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 26017564 - 26017414
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26017564 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26017465  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  26017464 ttagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatgctatttgttgcta 26017414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 28159953 - 28160111
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28159953 gaatcatttcaaacaagtcttattgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28160052  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28160053 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 28160111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 33693333 - 33693491
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33693333 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 33693432  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33693433 ttattcatctttttagacatggcaaatgatagataatgctctttgttgctatcatctga 33693491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 423 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 37381986 - 37381829
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  37381986 aatcatttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatttttggtaccatatctggttcctaacacccacttaaaat 37381887  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  37381886 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgctttttgttgctatcatctga 37381829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 422 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 12196610 - 12196462
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12196610 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 12196511  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgc 570  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12196510 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgc 12196462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 48707733 - 48707889
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  48707733 gaatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 48707832  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  48707833 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgttatcatct 48707889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 2055419 - 2055261
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  2055419 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaag 2055320  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  2055319 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctttttgttgctatcatctga 2055261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 5227531 - 5227373
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||    
T  5227531 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctagtatccacttaaaa 5227432  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  5227431 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctcttcgttgctatcatctga 5227373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 8882013 - 8882171
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8882013 gaatcgtttcaaacaagtcctattctagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8882112  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  8882113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctttttgttgctatcatctga 8882171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 17847096 - 17847253
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17847096 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17847195  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17847196 ttagtcatc-ttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 17847253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 23135006 - 23135162
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23135006 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23135105  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| |||||    
T  23135106 ttagtcatttttttaggcatgccaaatggtggctaatgttctttgttgctatcatct 23135162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 28812287 - 28812442
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  28812287 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaagtcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 28812385  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  28812386 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttattgctatcatct 28812442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 49118752 - 49118596
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  49118752 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 49118653  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |||||    
T  49118652 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactattttttgctatcatct 49118596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 423 - 578
Target Start/End: Original strand, 33174021 - 33174176
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  33174021 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatttcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33174120  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  33174121 tagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctccttgttgctatcatct 33174176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 24458631 - 24458789
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  24458631 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 24458730  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||    
T  24458731 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgctatttattgctatcatctga 24458789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 30467003 - 30467161
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  30467003 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccatttaaaa 30467102  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  30467103 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 30467161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 32318094 - 32317944
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  32318094 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgtctcctaacacccacttaaaa 32317995  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32317994 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttgcta 32317944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 35930180 - 35930023
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35930180 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35930081  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  35930080 ttagtcatctttttaggcatgacaaa-ggtggataatgctctttgttgttatcatctga 35930023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 424 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 10588719 - 10588563
Alignment:
Q  424 atcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaatt 523  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  10588719 atcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaact 10588620  T
Q  524 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10588619 agtcatctttttaggcatggtaaatggcagataatgctctttgttgctatcatctga 10588563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 15985151 - 15985003
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  15985151 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 15985052  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgc 570  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15985051 tcagtaatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgc 15985003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 17993017 - 17993173
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17993017 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 17993116  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17993117 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctctttgttgctatcatct 17993173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Original strand, 19168817 - 19168953
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19168817 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatttgactcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatga 19168916  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19168917 caaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 19168953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 44490460 - 44490304
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||     
T  44490460 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaag 44490361  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  44490360 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactatttgttgctatcatct 44490304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 23553205 - 23553071
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  23553205 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 23553107  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23553106 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 23553071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 14564937 - 14564779
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  14564937 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 14564838  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14564837 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctctttgttgctatcatctga 14564779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 39995167 - 39995325
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  39995167 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaa 39995266  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  39995267 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatcctctttgttgctatcatctga 39995325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 50542354 - 50542512
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  50542354 gaatcgttttaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 50542453  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  50542454 ttaatcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 50542512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 9339123 - 9339282
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatc---tttggtaccaaatttggttcctaacacccactta 518  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9339123 gaatcatttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccactta 9339222  T
Q  519 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||    
T  9339223 aaattagtcatctttttatgcatgacaaatggtgaataatgctctttgtcgctatcatct 9339282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 579
Target Start/End: Original strand, 30141108 - 30141265
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  30141108 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaa 30141207  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctg 579  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30141208 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctctttgttgctatcatctg 30141265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 48149640 - 48149491
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  48149640 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctgacacccacttaaaa 48149541  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgct 571  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  48149540 ttactcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgcactttgttgct 48149491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 567
Target Start/End: Original strand, 48551764 - 48551909
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  48551764 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatggttggtaattgctttcttgaactcatctttggtacaaaatctgactcctaacacccacttaaaa 48551863  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgt 567  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  48551864 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttctttgt 48551909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 444 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 24623267 - 24623139
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  24623267 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagttatttttttaggcatga 24623168  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24623167 caaatggtggataatgctctttgttgcta 24623139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 50276138 - 50276293
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  50276138 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 50276237  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||   |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||    
T  50276238 ttag---tctttttaggcatggcaaacggtggataatgctatttgttactatcatctga 50276293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 51371047 - 51371205
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  51371047 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 51371146  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  51371147 ttagtcatttttttagacatggcaaatggtgaataatgctctttgttgctatcatctga 51371205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 25734223 - 25734381
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  25734223 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttaattgaactcatctttcgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 25734322  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||    
T  25734323 ttagtcatctttttaggcatgacaaacggtggataatgttatttgttgctatcatctga 25734381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 422 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 22298659 - 22298499
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22298659 gaatcgtttcaaacaagccctattgtagatagcataattggtaattgtttccttaaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 22298560  T
Q  522 ttagtcatct-ttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctgat 581  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22298559 ttagtcatcttttttaggcatagcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctgat 22298499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 31208885 - 31208733
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  31208885 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcccaacacccacttaaaa 31208786  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||    ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31208785 ttagtcatc----taaacatgataaatggtggataatgctctttgttgctaacatct 31208733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 25730381 - 25730231
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |  |||||||| ||||||||||    
T  25730381 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcactaaatccgactcctaacatccacttaaaa 25730282  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  25730281 ttagtcatctttttaggcatagcaaatagtggataatgttctttgttgcta 25730231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 422 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 39700186 - 39700040
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||    
T  39700186 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacataattggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcttaacactcacttaaaa 39700087  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgtt 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  39700086 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtgaataatgctctttgtt 39700040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Original strand, 42549644 - 42549779
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42549644 ttgtagataacatagttggtaattgcttcattgaacttatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaatcaatcatctttttaggcatga 42549743  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  42549744 caaa-ggtggaaaatgctctttgttgctatcatctga 42549779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 482 - 572
Target Start/End: Original strand, 56555200 - 56555290
Alignment:
Q  482 atctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  56555200 atctttggtaccaaatctggctcctgacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgcta 56555290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 422 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20534306 - 20534231
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 497  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20534306 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaat 20534231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 3408330 - 3408172
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3408330 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 3408231  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3408230 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 3408172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 10256378 - 10256222
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10256378 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 10256279  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10256278 ttagtcatctttttaggcattgcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 10256222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 12626777 - 12626619
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12626777 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 12626678  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12626677 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 12626619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 423 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 6503858 - 6503709
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6503858 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaacccatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 6503759  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6503758 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgcta 6503709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 1915343 - 1915499
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1915343 gaatagtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1915442  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1915443 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 1915499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 1077378 - 1077217
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1077378 gaatcgtttcaaataagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 1077279  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggata---acgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||| |||||||    
T  1077278 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgatgctctttgttgctatcatctga 1077217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 9382660 - 9382502
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  9382660 gaatcgtttcaaacaagtcctgatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 9382561  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  9382560 ttagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatgctctttgtttctatcatctga 9382502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 29050413 - 29050255
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29050413 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 29050314  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  29050313 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctctttgttgctatcatctga 29050255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 30379158 - 30379000
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30379158 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 30379059  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  30379058 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 30379000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 2390406 - 2390250
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||    
T  2390406 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatagctcctaacacccacttataa 2390307  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  2390306 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctatttgttgctatcatct 2390250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 2707600 - 2707444
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  2707600 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 2707501  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2707500 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 2707444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Original strand, 8178249 - 8178399
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8178249 gaatcgtttcaaacatgtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8178348  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8178349 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctctttgttgcta 8178399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 17943177 - 17943019
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17943177 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcataattggtaattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17943078  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  17943077 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgttctttgttgctatcatctga 17943019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 26393009 - 26393167
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  26393009 gaatcgtttcaaaaaacttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 26393108  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  26393109 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 26393167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 3258807 - 3258965
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagtt-ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  3258807 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataccatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaa 3258905  T
Q  521 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3258906 attagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctatcatctga 3258965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 17428272 - 17428430
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  17428272 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaa 17428371  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||    
T  17428372 ttagtcatctttttaggcatgacaaacggtgaataatgttctttgttgctatcatctga 17428430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 26230932 - 26231088
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26230932 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtaaataacatagttggtagtttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 26231031  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26231032 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 26231088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 11134015 - 11133856
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttcctt-gaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11134015 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagatggtaattgcttcctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaa 11133916  T
Q  521 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11133915 attagtcatctttttagacataacaaatgatggataatgctctttgttgctatcatctga 11133856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 2598099 - 2598257
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2598099 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgctttattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2598198  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatg--gtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  2598199 ttactcatctttttaggcatggcaaatggtgtggataatgctttttgttgctatcatct 2598257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 16193451 - 16193293
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||  |  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16193451 gaatcgtttcaaacaagttctaatgcagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 16193352  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16193351 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttctttgttgttatcatctga 16193293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 26936726 - 26936590
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26936726 ttgtagatagcatagttgataattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatccggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatga 26936627  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  26936626 caaatggtggataatactctttgttgctatcatctga 26936590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Original strand, 35223921 - 35224057
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35223921 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctagctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgt 35224020  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||| ||| |||  | |||||||||||| |||||||    
T  35224021 caaattgtgtatattgttctttgttgctatcatctga 35224057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 6785101 - 6785256
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6785101 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacataattggt---tgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 6785197  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  || |||| |||||||||||||| |||||||    
T  6785198 ttagtcatctttttagtcatgtcaaattttgtataatgctctttgttgctatcatctga 6785256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 26196321 - 26196479
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagtt-ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaa 520  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| | |||||||    
T  26196321 gaatcggttcaaccaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccgtgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacaac-acttaaa 26196419  T
Q  521 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||    
T  26196420 attaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttttttgttgctatcatctga 26196479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Original strand, 10931148 - 10931301
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||||    
T  10931148 gaatcgtatcaaacaagtcctaatgtggatagcatagttg-taattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctaacacccgcttaaaa 10931246  T
Q  522 ttagtcatctttttag----gcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    ||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  10931247 ttagtcatctttttaggcatgcatgagaaatggtggataatgttctttattgcta 10931301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 423 - 578
Target Start/End: Original strand, 25820550 - 25820705
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    ||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |   || ||||||||| |||||||    
T  25820550 aatcgtttcaaacaattcctatcgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatgtttggtaccaaatctaactcataacacccatttaaaat 25820649  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||  ||||||| | | |||||| ||| |||||    
T  25820650 tagtcataattttagtcatgtcaaattatggataatgttatttgttactatcatct 25820705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 422 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31376058 - 31375971
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaac 509  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31376058 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgttaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaac 31375971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 422 - 480
Target Start/End: Original strand, 12612971 - 12613029
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaact 480  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12612971 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaact 12613029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 422 - 502
Target Start/End: Original strand, 12612848 - 12612928
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggt 502  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12612848 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcaaagttagtacttgcttcattgaactcatctttgctaccaaatctggt 12612928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 14717746 - 14717588
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14717746 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14717647  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  14717646 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 14717588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 39002025 - 39002183
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39002025 gaattgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 39002124  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  39002125 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctatttgttgctatcatctga 39002183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 423 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 30863393 - 30863236
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30863393 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 30863294  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30863293 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 30863236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 38964114 - 38964269
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38964114 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38964213  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  38964214 ttagtcat-tttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 38964269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 3352002 - 3352160
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3352002 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 3352101  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3352102 ttagtcatctttttaggcatgacaaagggtggataatgctctttgttgctatcatctga 3352160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 6739955 - 6740113
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  6739955 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 6740054  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6740055 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 6740113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 30297749 - 30297907
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  30297749 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttcaactcatctttggtaccaaatctggctcctagcacccacttaaaa 30297848  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30297849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 30297907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 31710423 - 31710265
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  31710423 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 31710324  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31710323 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 31710265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 8216041 - 8215885
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8216041 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8215942  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8215941 ttagtcatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 8215885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 26593280 - 26593436
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26593280 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26593379  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26593380 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 26593436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 11000728 - 11000886
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11000728 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11000827  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11000828 ttagtcatctttttaggcctggcaagtggtggataatgctctttgttgctatcatctga 11000886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 14952465 - 14952307
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14952465 gaatcgtttcaaacaagtcttgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14952366  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  14952365 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 14952307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 16095960 - 16096115
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16095960 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctt-ggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16096058  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16096059 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 16096115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 570
Target Start/End: Original strand, 27457197 - 27457345
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  27457197 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccactttaaa 27457296  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgc 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27457297 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgc 27457345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 33760470 - 33760626
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33760470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33760569  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33760570 ttagtcatctttttagtcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 33760626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 423 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 41282482 - 41282327
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  41282482 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 41282383  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  41282382 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 41282327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 6600136 - 6600294
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  6600136 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6600235  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  6600236 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 6600294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 8689713 - 8689555
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8689713 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgattccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8689614  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8689613 ttagtcatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctctttgttgctatcatctga 8689555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Original strand, 11692147 - 11692297
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  11692147 gaatcgtttcaaacaagtcatattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 11692246  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11692247 ttagtcatctttttaggcatcacaaatggtggataatgctctttgttgcta 11692297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 23128913 - 23129071
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  23128913 gaatcgtttcaaacaagtcatatcgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacaaccacttaaaa 23129012  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23129013 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgctgctatcatctga 23129071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 35342321 - 35342171
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35342321 gaatcgtttcaaacaagtctcattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35342222  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35342221 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgcta 35342171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 39824697 - 39824539
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  39824697 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 39824598  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39824597 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 39824539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 40075091 - 40074933
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40075091 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaa 40074992  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40074991 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 40074933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 42993659 - 42993501
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42993659 gaattgtttcaaacaattcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 42993560  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  42993559 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctctttgttactatcatctga 42993501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6252113 - 6251957
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  6252113 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaaa 6252014  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  6252013 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctctttgttgctatcatct 6251957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 20079258 - 20079416
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  20079258 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 20079357  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20079358 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctctttgttgctatcatctga 20079416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 20408674 - 20408516
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||    
T  20408674 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatatttggtaccaaatctagctcctaacacccgcttaaaa 20408575  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  20408574 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 20408516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 30208402 - 30208558
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30208402 gaatcatttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacctacttaaaa 30208501  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30208502 ttaatcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 30208558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 28078405 - 28078563
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28078405 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28078504  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28078505 ttagtaaactaattaggcatgacaaatggtagataatgctctttgttgctatcatctga 28078563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 568
Target Start/End: Original strand, 43166269 - 43166415
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  43166269 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcataacacccacttaaaa 43166368  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgtt 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43166369 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctctttgtt 43166415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 567
Target Start/End: Original strand, 19659501 - 19659646
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  19659501 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttttttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaa 19659600  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgt 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19659601 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctctttgt 19659646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 16752235 - 16752099
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16752235 ttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggatcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatga 16752136  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  16752135 caaatggtgaataatgctctttgttgctatcatctga 16752099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 1052674 - 1052520
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1052674 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1052575  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctg 579  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  1052574 ttactcatctttttaagcatggcaaatggtggat---gctctttgttgctatcatctg 1052520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 565
Target Start/End: Original strand, 4015874 - 4016017
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  4015874 gaatcgtttcaagcaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 4015973  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctcttt 565  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4015974 ttagtcatatttttaggcatgataaatggtggataatgctcttt 4016017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 27116099 - 27116255
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||    
T  27116099 gaatcattttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacatccacttcaaa 27116198  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||    
T  27116199 ttagtcatctttttaggcattacaaatcgtggataatgttctttgttgctatcatct 27116255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 444 - 578
Target Start/End: Original strand, 26035368 - 26035502
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26035368 ttgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaatacccacttaaaatcagtcatctttttaggcacga 26035467  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26035468 caaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 26035502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 19398193 - 19398351
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||    
T  19398193 gaatcatttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgtttctttgaactcatctttggtaccaaatctagcctctaacacccacttaaaa 19398292  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||    
T  19398293 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgttctttgttactatcatctga 19398351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 461 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6331479 - 6331362
Alignment:
Q  461 ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6331479 ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgc 6331380  T
Q  561 tctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||| ||| |||||    
T  6331379 tctttgttactatcatct 6331362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 11935586 - 11935431
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  11935586 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgtttccttgatctcatctttga-accaaatgtggctcctaacactcacttaaaa 11935488  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| || |||||    
T  11935487 ttagccatctttttaggcataacaaatagtggataatgatctttgttgttatcatct 11935431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 8695007 - 8694857
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| || |||||||||    
T  8695007 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgataattatttcattgaactcatctttagtaccaaatctggctcataatactcacttaaaa 8694908  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8694907 ttagtcatgttcttaggcatgataaatggtggataatgctctttgttgcta 8694857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 27510112 - 27509961
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||| |   ||||||||    
T  27510112 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaataagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaaaa------ctaaaagg-acttaaaa 27510020  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27510019 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 27509961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 444 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 445073 - 444962
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||     
T  445073 ttgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatatgactcctaaaacccacttaaaatcagtcgtctttttaggcgtgg 444974  T
Q  544 caaatggtggat 555  Q
    ||||||||||||    
T  444973 caaatggtggat 444962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 422 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6332917 - 6332873
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaat 466  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  6332917 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagaatagttggtaat 6332873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 16246193 - 16246349
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16246193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16246292  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  16246293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctctttgttgctatcatct 16246349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 7379104 - 7378946
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7379104 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7379005  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7379004 ttagtcctctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 7378946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 27328725 - 27328567
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  27328725 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 27328626  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  27328625 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgttatcatctga 27328567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 40854750 - 40854592
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  40854750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40854651  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40854650 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 40854592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 428 - 580
Target Start/End: Original strand, 771981 - 772133
Alignment:
Q  428 tttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtc 527  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  771981 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 772080  T
Q  528 atctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  772081 atctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 772133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 11949426 - 11949584
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |    
T  11949426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaata 11949525  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11949526 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 11949584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 41500502 - 41500660
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  41500502 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtacatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccgcttaaaa 41500601  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41500602 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 41500660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 422 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 9276715 - 9276566
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9276715 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 9276616  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgct 571  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9276615 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctctttgttgct 9276566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 2456151 - 2455995
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2456151 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttaactcctaacacccacttaaaa 2456052  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  2456051 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctctttgttgctatcatct 2455995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 28650426 - 28650582
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28650426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28650525  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  28650526 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgctctttgttgttatcatct 28650582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Original strand, 33865267 - 33865417
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33865267 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33865366  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33865367 ttagtcatttttttaggcatgacaaatggtggataatactctttgttgcta 33865417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 34253283 - 34253133
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  34253283 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaata 34253184  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34253183 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgcta 34253133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 422 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 921163 - 921015
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  921163 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 921064  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgc 570  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  921063 ttagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctctttattgc 921015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 37838438 - 37838282
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37838438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37838339  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||    
T  37838338 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgttctttgttgctatcatct 37838282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 1106559 - 1106717
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  1106559 gaatcatttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 1106658  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  1106659 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctctttgttgctatcatctga 1106717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 423 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 17134369 - 17134220
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  17134369 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaag 17134270  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17134269 tagtcatctttttaggaatggcaaatgatggataatgctctttgttgcta 17134220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 423 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 38751188 - 38751031
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  38751188 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatgtggctcctaacatccacttaaaat 38751089  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38751088 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 38751031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 2094410 - 2094566
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2094410 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttgatactaaatttggctccaaacacccacttaaaa 2094509  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2094510 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 2094566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 12759750 - 12759905
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  12759750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatttgcctc-taacacccacttaaaa 12759848  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12759849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 12759905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19180562 - 19180407
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  19180562 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagtatagttagtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctc-taacacccacttaaaa 19180464  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  19180463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactctttgttgctatcatct 19180407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 33106969 - 33107125
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33106969 gaatcgtttcaaacgagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 33107068  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||| |||||    
T  33107069 ttagtcatctttttaggcatgaaaaatggtaaataatgctctttgttgctatcatct 33107125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 429 - 580
Target Start/End: Original strand, 3430631 - 3430782
Alignment:
Q  429 ttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtca 528  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3430631 ttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaattagtca 3430730  T
Q  529 tctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  3430731 tctttttaggcatggcaaatggtgtataatgctctttgttgctatcatctga 3430782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 423 - 578
Target Start/End: Original strand, 36444229 - 36444384
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  36444229 aatcgtttcaaacaagtcctatagtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacctacttaaaat 36444328  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36444329 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 36444384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 2057067 - 2056909
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  2057067 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatccagctcctaacacccacttaaaa 2056968  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  2056967 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgcactttgttgctatcatctga 2056909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 8899822 - 8899673
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8899822 gaatcgtttcaa-caagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8899724  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8899723 ctagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctctttgttgcta 8899673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 17484550 - 17484708
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17484550 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacaaccacttaaaa 17484649  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  17484650 ttagtcatctttttaagcatggaaaatggtggataatgttctttgttgctatcatctga 17484708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Original strand, 8396573 - 8396709
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8396573 ttgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaaaacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatga 8396672  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8396673 caaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 8396709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 557
Target Start/End: Original strand, 7297234 - 7297369
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  7297234 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgtcttcttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 7297333  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7297334 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 7297369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 25087796 - 25087954
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25087796 gaattgtttcaaacaagtcttattgtatataacatagttgataattgcttccttgaactcatctctggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaa 25087895  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  25087896 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatggtctttgttgctatcatctga 25087954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 29737889 - 29737731
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||| ||||||    
T  29737889 gaattgtttcaaacaagtcctattgtcgatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaagatccatttaaaa 29737790  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  29737789 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 29737731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Original strand, 43249412 - 43249562
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  43249412 gaatcgtttcgaacaagtcctattgatgatagcatagttggtaattgtttccttgaatacatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 43249511  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43249512 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgcta 43249562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 427 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 36211182 - 36211029
Alignment:
Q  427 gtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagt 526  Q
    |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36211182 gtttcaaacaagtcctattctagataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagt 36211083  T
Q  527 catctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  36211082 catctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 36211029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 569
Target Start/End: Original strand, 2314975 - 2315122
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  2314975 gaattgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 2315074  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttg 569  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  2315075 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctatttgttg 2315122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 42630103 - 42629945
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  42630103 gaatcgtttcaaacaagtcctatcatagatagcataattgataattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 42630004  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||    
T  42630003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggatgatgctctttgttgttatcatctga 42629945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 37732193 - 37732349
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  37732193 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtaaataacatagttggtaattgctttcttgaactcatttttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37732292  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37732293 ttagtcatctttttatgtatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatct 37732349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 45124260 - 45124104
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  |  || ||||||||||||||||    
T  45124260 gaatcgtttcaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttaaactcatctttggtatcaaatcagactcttaacacccacttaaaa 45124161  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  45124160 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctccttgttgctatcatct 45124104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 447 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 37654224 - 37654093
Alignment:
Q  447 tagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaa 546  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37654224 tagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaa 37654125  T
Q  547 atggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    ||| || |||| | |||||||||||| |||||    
T  37654124 atgatgaataatgttctttgttgctatcatct 37654093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 462 - 578
Target Start/End: Original strand, 41178059 - 41178175
Alignment:
Q  462 gtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgct 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  41178059 gtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatttttttaggcatggtaaatggtggataatgct 41178158  T
Q  562 ctttgttgctaccatct 578  Q
    ||||||||||| |||||    
T  41178159 ctttgttgctatcatct 41178175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 444 - 572
Target Start/End: Original strand, 19916009 - 19916137
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||    
T  19916009 ttgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaatatcaatcatctttttaggcttga 19916108  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  19916109 caaattgtggataatgctcttggttgcta 19916137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 422 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 14630755 - 14630663
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacaccca 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14630755 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacaccca 14630663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 422 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 9331897 - 9331757
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||  ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  9331897 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtattgttggtaattgcttcccagatattatcttaggtaccaaatttggctcctaacacccacctaaga 9331798  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctc 562  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9331797 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctc 9331757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 507 - 578
Target Start/End: Original strand, 23672958 - 23673029
Alignment:
Q  507 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatct 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  23672958 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggaaaatgctctttgttgctatcatct 23673029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 422 - 512
Target Start/End: Original strand, 23671811 - 23671901
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacc 512  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  23671811 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacatggttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacc 23671901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 219027 - 218868
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaaca-cccacttaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  219027 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacaccccacttaaa 218928  T
Q  521 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  218927 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 218868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 105
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  255 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagtcggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 156  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  155 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgcta 105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 5027 - 5185
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  5027 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacaccctcttaaaa 5126  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||    
T  5127 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgttatttgttgctaacatctga 5185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 422 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 5326 - 5192
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  5326 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 5228  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 5192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 252438 - 252596
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  252438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 252537  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  252538 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctctttgttgctatcatctga 252596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 444 - 580
Target Start/End: Original strand, 1995 - 2131
Alignment:
Q  444 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1995 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacctacttaaaatcagtcatcttattaggcatga 2094  T
Q  544 caaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2095 caaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 2131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 48103 - 47945
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48103 gaatcgttttaaacaagtccgattgtatatcacatagttggtaattgcttccttgaactcacctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 48004  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||    
T  48003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatattttttgttgctatcatctga 47945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13236 - 13078
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||||||||    
T  13236 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 13137  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  13136 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgttctttgttgctatcatctga 13078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 580
Target Start/End: Original strand, 59608 - 59766
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||||||||    
T  59608 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 59707  T
Q  522 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  59708 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgttctttgttgctatcatctga 59766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 423 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 11498 - 11364
Alignment:
Q  423 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 522  Q
    |||||||| ||| ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11498 aatcgttttaaataagacctattgtaggtagcatagttggtaattgcttccttaaacttatctatggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 11399  T
Q  523 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 557  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11398 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataa 11364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 510 - 580
Target Start/End: Original strand, 289 - 359
Alignment:
Q  510 acccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgctaccatctga 580  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  289 acccacttaaaattattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgttgctatcatctga 359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 422 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 680 - 605
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 497  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  680 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 422 - 497
Target Start/End: Original strand, 1913 - 1988
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 497  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1913 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 422 - 497
Target Start/End: Original strand, 3371 - 3446
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 497  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3371 gaatcgtttcaaataagtcctaatgttgatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 3446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 422 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1883
Alignment:
Q  422 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 497  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1958 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttgatagcatagttgataattgcttccttgacctcatctttggtaccaaat 1883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 513 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 19831 - 19772
Alignment:
Q  513 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttgttgcta 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19831 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctctttgttgcta 19772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University