View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19738_high_12 (Length: 253)

Name: NF19738_high_12
Description: NF19738
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19738_high_12
NF19738_high_12
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (23-234)||(27592362-27592574)
chr6 (35-234)||(27676961-27677161)
chr6 (23-232)||(27717842-27718052)
chr6 (23-232)||(28786867-28787077)
chr6 (23-232)||(28792988-28793198)
chr6 (23-232)||(27604047-27604257)
chr6 (23-232)||(27610463-27610673)
chr6 (35-207)||(27705772-27705945)
chr6 (25-207)||(26803077-26803260)
chr6 (35-225)||(27426962-27427153)
chr6 (23-232)||(28781730-28781940)
chr6 (23-232)||(27697929-27698139)
chr6 (23-219)||(27679579-27679776)
chr6 (35-207)||(26623912-26624085)
chr6 (35-207)||(26729889-26730062)
chr6 (36-207)||(27337463-27337635)
chr6 (36-207)||(27398203-27398375)
chr6 (34-207)||(26824459-26824633)
chr6 (20-232)||(27530644-27530857)
chr6 (34-207)||(26647119-26647293)
chr6 (34-207)||(26753087-26753261)
chr6 (34-209)||(26884710-26884886)
chr6 (34-207)||(26656605-26656779)
chr6 (34-207)||(26762576-26762750)
chr6 (35-206)||(31285200-31285372)
chr6 (35-207)||(25492687-25492860)
chr6 (44-207)||(25580372-25580536)
chr6 (44-207)||(26056572-26056736)
chr6 (44-207)||(26076542-26076706)
chr6 (44-207)||(26862230-26862394)
chr6 (34-234)||(27215092-27215293)
chr6 (124-207)||(25539274-25539357)
chr6 (124-207)||(26143599-26143682)
chr6 (44-207)||(25483709-25483873)
chr6 (133-209)||(28140275-28140351)
chr6 (146-207)||(25511645-25511706)
chr6 (118-209)||(29843353-29843444)
chr6 (154-207)||(26937790-26937843)
chr6 (118-211)||(29826711-29826804)
chr6 (161-209)||(28097809-28097857)
chr6 (152-209)||(26849471-26849528)
chr6 (152-209)||(26975710-26975767)
chr6 (173-209)||(25074647-25074683)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (23-232)||(8116-8326)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (23-232)||(13018-13228)
scaffold0277 (23-232)||(4055-4265)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (23-232)||(2882-3092)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (23-232)||(18678899-18679109)
chr4 (23-232)||(18698739-18698949)
chr4 (23-232)||(18723424-18723634)
chr4 (23-232)||(18730843-18731053)
chr4 (35-225)||(18074402-18074593)
chr4 (23-232)||(18654816-18655026)
chr4 (152-209)||(5090319-5090376)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (35-225)||(60210-60401)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (23-207)||(267708-267893)
chr1 (34-232)||(28163718-28163917)
chr1 (35-232)||(28127018-28127216)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (35-207)||(29273206-29273379)
chr8 (32-93)||(16440691-16440753)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (113-209)||(16691587-16691683)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (152-209)||(3280418-3280475)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27592574 - 27592362
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27592574 agtcgacagcccttaaatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 27592475  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27592474 atatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataactttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttct 27592375  T
Q  222 tgaaaatgtgaaa 234  Q
    |||||||||||||    
T  27592374 tgaaaatgtgaaa 27592362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27677161 - 27676961
Alignment:
Q  35 ttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27677161 ttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaaatgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 27677062  T
Q  134 tttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtgaa 233  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27677061 tttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaa 27676962  T
Q  234 a 234  Q
    |    
T  27676961 a 27676961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27718052 - 27717842
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27718052 agtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtcc 27717953  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
    | ||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27717952 acatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttct 27717853  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  27717852 tgaaaatgtga 27717842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Original strand, 28786867 - 28787077
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28786867 agtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtcc 28786966  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
      ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  28786967 gcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttct 28787066  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  28787067 tgaaaatgtga 28787077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Original strand, 28792988 - 28793198
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28792988 agtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtcc 28793087  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
      ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  28793088 gcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttct 28793187  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  28793188 tgaaaatgtga 28793198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27604257 - 27604047
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27604257 agtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctattggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatctcttcttgatgaaagatctgatgatggagtcc 27604158  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
    | ||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27604157 acatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttct 27604058  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  27604057 tgaaaatgtga 27604047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27610673 - 27610463
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27610673 agtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcaagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtcc 27610574  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
    | ||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27610573 acatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttct 27610474  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  27610473 tgaaaatgtga 27610463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27705945 - 27705772
Alignment:
Q  35 ttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27705945 ttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcacttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaa 27705846  T
Q  134 tttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27705845 tttttggcattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatttataattttgttgctgatcaatttgaa 27705772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Original strand, 26803077 - 26803260
Alignment:
Q  25 tcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccat 123  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  26803077 tcgtcagcccttacatgttgctaattaccctgttggattgcactctcgagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccat 26803176  T
Q  124 atggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26803177 atggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcagcacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaa 26803260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27427153 - 27426962
Alignment:
Q  35 ttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27427153 ttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaa 27427054  T
Q  134 tttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaa 225  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  27427053 tttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaa 27426962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Original strand, 28781730 - 28781940
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||     
T  28781730 agtcgtcagcacttacatgttgccaattaccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatcgcttcttggtgaaggatatgataatggagtca 28781829  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
      ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28781830 ggatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgtaaaagcagtttataacttaattgctgatcaatttgaatgctcatgttttct 28781929  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  28781930 tgaaaatgtga 28781940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27698139 - 27697929
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  27698139 agtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcaagtacaaagagtgaaatcaattcttgataatggatctgatgatggggtcc 27698040  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||| |    
T  27698039 atatggttggaatttttgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcaagagcaatctataatttggttgctgatcaatttgaaggtttatgttttct 27697940  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    | | |||||||    
T  27697939 tcataatgtga 27697929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Original strand, 27679579 - 27679776
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  27679579 agtcgacagcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggatccgatgatggggtcc 27679678  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgtttt 219  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  27679679 atatggttggaatttatggcattggaggtttggggaaatcaacacttgcaagacaaatctataattttgttgcagatcaattcgaaggttcatgtttt 27679776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 207
Target Start/End: Original strand, 26623912 - 26624085
Alignment:
Q  35 ttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 133  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||| | |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26623912 ttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaa 26624011  T
Q  134 tttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
    | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26624012 tgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaa 26624085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 207
Target Start/End: Original strand, 26729889 - 26730062
Alignment:
Q  35 ttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 133  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||| | |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26729889 ttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaa 26729988  T
Q  134 tttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
    | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26729989 tgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaa 26730062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27337635 - 27337463
Alignment:
Q  36 tacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaat 134  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||| | |||||| | ||||| ||| |    
T  27337635 tacacgttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggact 27337536  T
Q  135 ttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
    ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27337535 ttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaa 27337463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27398375 - 27398203
Alignment:
Q  36 tacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaat 134  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||| | |||||| | ||||| ||| |    
T  27398375 tacacgttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggact 27398276  T
Q  135 ttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
    ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27398275 ttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaa 27398203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 26824459 - 26824633
Alignment:
Q  34 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 132  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  26824459 tttacatgttgccaaatacccggttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatctcttcttgataacgaatctgatgatgtggtccatatggtagga 26824558  T
Q  133 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
     |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||    
T  26824559 ctttacggtattggaggtttaggtaaatcaacacttgcaaaagcaacttttaattctattgctgataaatttgaa 26824633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27530857 - 27530644
Alignment:
Q  20 attagtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatgggg 118  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| || |||   | ||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  27530857 attagtcgtgagcccttagatgttgccaaatatcctgttggattacagtcccgagtacaacatgtgaaagggcatcttgatgaaaaatctgatgatgagg 27530758  T
Q  119 tccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttt 218  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||    
T  27530757 tccacatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaagttttatgttt 27530658  T
Q  219 tgttgaaaatgtga 232  Q
    | | ||||||||||    
T  27530657 tctagaaaatgtga 27530644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 26647119 - 26647293
Alignment:
Q  34 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 132  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||| || ||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  26647119 tttacatgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtagga 26647218  T
Q  133 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
     |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26647219 ctttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaa 26647293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 26753087 - 26753261
Alignment:
Q  34 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 132  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||| || ||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  26753087 tttacatgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtagga 26753186  T
Q  133 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
     |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26753187 ctttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaa 26753261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Original strand, 26884710 - 26884886
Alignment:
Q  34 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 132  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||| | ||||  ||||||||| | | |||| |  | ||||| || ||||| |||    
T  26884710 tttacatgtagccaaataccctgttggattacagtaccgagtacaacaattaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtagga 26884809  T
Q  133 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 209  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26884810 atttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattatgttgctgatcaatttgaatg 26884886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 26656605 - 26656779
Alignment:
Q  34 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||| |  ||| ||| |  ||||| |||    
T  26656605 tttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtagga 26656704  T
Q  133 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
     |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26656705 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaa 26656779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 26762576 - 26762750
Alignment:
Q  34 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||| |  ||| ||| |  ||||| |||    
T  26762576 tttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtagga 26762675  T
Q  133 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
     |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26762676 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaa 26762750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 206
Target Start/End: Original strand, 31285200 - 31285372
Alignment:
Q  35 ttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||||||||| ||||  ||||||||| | | | || || | ||||| || ||||| |||     
T  31285200 ttacatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtacacatggtaggac 31285299  T
Q  134 tttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttga 206  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31285300 tttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttattggtgatcaatttga 31285372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25492860 - 25492687
Alignment:
Q  35 ttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| | ||||||  ||| | |||| ||||| |||     
T  25492860 ttacatgttgccaaataccctgttggattacaatcccgagtacaacacgtgaaattgcttctagatgaggtatctgaggatgagttccacatggtaggac 25492761  T
Q  134 tttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  25492760 tttatggtactggaggcttaggtaaatcaacacttgcaaaatcaatctataacttcattgctgatcaatttgaa 25492687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 25580372 - 25580536
Alignment:
Q  44 gccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggta 142  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||| || ||||||| ||||  ||||||||    || |||||  ||| |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  25580372 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgtggtccacatggtaggactttatggta 25580471  T
Q  143 tcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25580472 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaa 25580536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 26056572 - 26056736
Alignment:
Q  44 gccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggta 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||  ||||||||    || |||||  ||| |||||  ||||| ||||||| |||||    
T  26056572 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggta 26056671  T
Q  143 tcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26056672 ccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaa 26056736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 26076542 - 26076706
Alignment:
Q  44 gccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggta 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||  ||||||||    || |||||  ||| |||||  ||||| ||||||| |||||    
T  26076542 gccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggta 26076641  T
Q  143 tcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26076642 ccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaa 26076706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 26862230 - 26862394
Alignment:
Q  44 gccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggta 142  Q
    ||||| ||||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||||  |||||||||   | ||||||| | ||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  26862230 gccaaataccctgttggattaaagtcccgagtagaacaagtgaaattgcttcttgatatggaatctgatgaaggggtacacatggtaggactttatggta 26862329  T
Q  143 tcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
      |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26862330 ctggaggcatggggaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttgttgccgatcaatttgaa 26862394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Original strand, 27215092 - 27215293
Alignment:
Q  34 tttacatgttgccaattaccctgttggattgcat-ctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 132  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | | | |||||||||| ||||  ||||||||  | |||||| |  | | |||||| ||||| |||    
T  27215092 tttacatgttgccaaacaccctgttggattacatacccaaatacaacaagtaaaattgcttcttgacaagggatctaaggaagaggtccacatggtagga 27215191  T
Q  133 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtga 232  Q
     || ||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | |||| |||| | ||| ||||||    
T  27215192 cttcatggagctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttttaatttcattgctgatcagtttgaaggttcatattttctagaagatgtga 27215291  T
Q  233 aa 234  Q
    ||    
T  27215292 aa 27215293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 25539274 - 25539357
Alignment:
Q  124 atggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25539274 atggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttgttgctgatcaatttgaa 25539357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 26143599 - 26143682
Alignment:
Q  124 atggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
    ||||| ||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26143599 atggtaggactttttggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaa 26143682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 25483709 - 25483873
Alignment:
Q  44 gccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatggta 142  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||| || ||||||| ||||  ||||||||    || |||||  ||| |||||  ||||| ||| ||| |||||    
T  25483709 gccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggta 25483808  T
Q  143 tcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25483809 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttcttgctgatcaatttgaa 25483873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Original strand, 28140275 - 28140351
Alignment:
Q  133 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 209  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28140275 atttatgggatgggagggtcgggtaaaacaacacttgcacaagcaatttataattttattgccgatcaatttgaatg 28140351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 207
Target Start/End: Original strand, 25511645 - 25511706
Alignment:
Q  146 gaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25511645 gaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaa 25511706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29843444 - 29843353
Alignment:
Q  118 gtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 209  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29843444 gtccagatggtggggatttatggaattggtggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgataaatttgaatg 29843353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 207
Target Start/End: Original strand, 26937790 - 26937843
Alignment:
Q  154 ggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26937790 ggtaaatcaacacttgcacgagcaatttataatttgattggtgatcaatttgaa 26937843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 211
Target Start/End: Original strand, 29826711 - 29826804
Alignment:
Q  118 gtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgct 211  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  29826711 gtccagatggtggggatttatggaattggcggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatatgattggtgataaatttgaatgct 29826804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28097857 - 28097809
Alignment:
Q  161 caacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 209  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28097857 caacacttgcaaaagcggtttataatttcattgctggtcaatttgaatg 28097809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 209
Target Start/End: Original strand, 26849471 - 26849528
Alignment:
Q  152 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 209  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26849471 tgggaaaaacaacacttgctcaagcagtttataattcgattgctgatcaatttgaatg 26849528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 209
Target Start/End: Original strand, 26975710 - 26975767
Alignment:
Q  152 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 209  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26975710 tgggtaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaatg 26975767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 209
Target Start/End: Original strand, 25074647 - 25074683
Alignment:
Q  173 aagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 209  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25074647 aagcaatttataatttgattgctaatcaatttgaatg 25074683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Original strand, 8116 - 8326
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8116 agtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtcc 8215  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
    | ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8216 acatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttct 8315  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  8316 tgaaaatgtga 8326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13228 - 13018
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13228 agtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtcc 13129  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
    | ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13128 acatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttct 13029  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  13028 tgaaaatgtga 13018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4265 - 4055
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4265 agtcatcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggagccc 4166  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
    | ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  4165 acatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttattgctgatgaatttgaatgctcatgttttct 4066  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  4065 tgaaaatgtga 4055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3092 - 2882
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  3092 agtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggaatgaagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtcc 2993  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
    | ||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2992 acatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttct 2893  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  2892 tgaaaatgtga 2882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18679109 - 18678899
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||||    
T  18679109 agtcggcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaatgatcttatgatggagtcc 18679010  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
      ||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18679009 gcatggtaggactttatggcattggaggcatgggtaaattaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttct 18678910  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  18678909 tgaaaatgtga 18678899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18698949 - 18698739
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  18698949 agtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaagcgcttcttgataaaggatctgatgatggagtcc 18698850  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
      ||| | ||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18698849 gcatgttaggactttatggcattggaggcatgggtaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttct 18698750  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  18698749 tgaaaatgtga 18698739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18723634 - 18723424
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||  ||| ||||    
T  18723634 agtcgtcagcccttacatgttgccacttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctaatggtggagtcc 18723535  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
      ||| | ||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18723534 gcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaaggaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttct 18723435  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||| ||||    
T  18723434 tgaaaacgtga 18723424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18731053 - 18730843
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||  ||| ||||    
T  18731053 agtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatcttatggtggagtcc 18730954  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
      ||| | ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18730953 gcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgctaaagtaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttct 18730854  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  18730853 tgaaaatgtga 18730843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Original strand, 18074402 - 18074593
Alignment:
Q  35 ttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18074402 ttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaa 18074501  T
Q  134 tttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaa 225  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  18074502 tttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaa 18074593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18655026 - 18654816
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||||    
T  18655026 agtcgtcagcccttacatgctgccagttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtcc 18654927  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgt 221  Q
      ||| | ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18654926 gcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaattaataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttct 18654827  T
Q  222 tgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||||    
T  18654826 tgaaaatgtga 18654816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5090376 - 5090319
Alignment:
Q  152 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 209  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  5090376 tgggtaaaaccacacttggaaaagcaatttacaatttcattgctcatcaatttgaatg 5090319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Original strand, 60210 - 60401
Alignment:
Q  35 ttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  60210 ttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaa 60309  T
Q  134 tttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaa 225  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  60310 tttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaa 60401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 267893 - 267708
Alignment:
Q  23 agtcgtcagcctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtcc 121  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  267893 agtcgtgagcccttacatgttgccaattaccctgttggattatggtctcaagtacaacaagtgaaattgcttcttgataatggatctgatgatggggtcc 267794  T
Q  122 atatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  267793 atatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataattttattgctgatcaatttgaa 267708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28163917 - 28163718
Alignment:
Q  34 tttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 132  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||| ||| | |||| |||| ||| |||||| ||||| |||    
T  28163917 tttacatgttgcaaaatatcctgttggattacaatctcaagtacaacaagtgaaattgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtagga 28163818  T
Q  133 atttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtga 232  Q
     |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| | ||| ||||||    
T  28163817 ctttatgatactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtga 28163718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28127216 - 28127018
Alignment:
Q  35 ttacatgttgccaattaccctgttggattgcatctcga-gtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 133  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||   | | ||||||||||| || |  ||||| ||| | |||| |||| ||| |||||| ||||| |||     
T  28127216 ttacatgttgccaaatatcctgttggattacaggaccaagtacaacaagtgaatttgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggac 28127117  T
Q  134 tttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttgttgaaaatgtga 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| | ||| ||||||    
T  28127116 tttatggtattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtga 28127018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29273379 - 29273206
Alignment:
Q  35 ttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcacttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaa 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29273379 ttacatgttgccaaataccctgttggattacagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaa 29273280  T
Q  134 tttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaa 207  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29273279 tttatgggattggtggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataatttttttgctgatcaatttgaa 29273206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 93
Target Start/End: Original strand, 16440691 - 16440753
Alignment:
Q  32 cctttacatgttgccaattaccctgttggattgca-tctcgagtacaacaagttaaatcactt 93  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||||    
T  16440691 cctttacatgttgctaattaccctgttggattggagtctcgagtgcaccaagtaaactcactt 16440753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Original strand, 16691587 - 16691683
Alignment:
Q  113 atggggtccatatggttggaatttatggtatcggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 209  Q
    |||||||  |||||||||| ||  |||| || |||||  | |||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16691587 atggggtatatatggttgggatccatggaattggaggaatcggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgatcaatttgaatg 16691683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 209
Target Start/End: Original strand, 3280418 - 3280475
Alignment:
Q  152 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatg 209  Q
    |||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3280418 tgggtaagacaactcttgcaagagcagtttataatttcattgctaatcaatttgaatg 3280475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University