View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19755_high_24 (Length: 422)

Name: NF19755_high_24
Description: NF19755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19755_high_24
NF19755_high_24
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (11-393)||(26927348-26927730)
chr1 (11-392)||(39587996-39588374)
chr1 (18-392)||(25843844-25844214)
chr1 (11-392)||(47450855-47451232)
chr1 (18-404)||(10140165-10140556)
chr1 (11-392)||(19798630-19799020)
chr1 (11-256)||(16649263-16649508)
chr1 (46-392)||(40166068-40166420)
chr1 (46-392)||(16035696-16036053)
chr1 (204-392)||(51041282-51041470)
chr1 (11-392)||(38620780-38621172)
chr1 (18-189)||(10135617-10135788)
chr1 (216-392)||(33301011-33301187)
chr1 (228-392)||(8138027-8138191)
chr1 (11-154)||(51041138-51041281)
chr1 (211-392)||(16833572-16833753)
chr1 (211-392)||(23192644-23192824)
chr1 (11-176)||(33300875-33301038)
chr1 (210-392)||(28434399-28434581)
chr1 (148-380)||(3094188-3094414)
chr1 (148-363)||(18784325-18784535)
chr1 (148-370)||(8267606-8267817)
chr1 (196-371)||(41097769-41097940)
chr1 (248-395)||(11806444-11806591)
chr1 (285-392)||(16649513-16649620)
chr1 (148-371)||(33055145-33055365)
chr1 (223-312)||(12260158-12260246)
chr1 (150-232)||(11806585-11806667)
chr1 (299-392)||(10135544-10135637)
chr1 (146-226)||(39200527-39200607)
chr1 (226-337)||(25779155-25779270)
chr1 (233-276)||(40233186-40233229)
chr1 (146-196)||(32626384-32626434)
chr1 (283-328)||(17214158-17214203)
chr1 (355-392)||(47455356-47455393)
chr1 (210-254)||(25779080-25779124)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (11-392)||(18467311-18467692)
chr3 (11-392)||(18472093-18472474)
chr3 (11-392)||(39775355-39775735)
chr3 (11-392)||(757995-758375)
chr3 (46-392)||(7570880-7571225)
chr3 (18-392)||(23661098-23661471)
chr3 (18-392)||(23665757-23666130)
chr3 (18-392)||(24038005-24038378)
chr3 (11-392)||(55325862-55326243)
chr3 (11-392)||(55431401-55431782)
chr3 (11-392)||(29350326-29350707)
chr3 (10-392)||(2207374-2207756)
chr3 (18-392)||(14438332-14438702)
chr3 (18-392)||(27709022-27709392)
chr3 (11-404)||(46964089-46964476)
chr3 (11-392)||(3656856-3657247)
chr3 (146-392)||(20520140-20520386)
chr3 (46-226)||(32473581-32473760)
chr3 (217-392)||(32474511-32474687)
chr3 (148-389)||(25726553-25726792)
chr3 (46-392)||(3419081-3419436)
chr3 (146-318)||(10708438-10708613)
chr3 (148-400)||(3033722-3033968)
chr3 (148-392)||(3672672-3672911)
chr3 (148-392)||(3692704-3692943)
chr3 (230-392)||(12971478-12971640)
chr3 (148-392)||(6596125-6596364)
chr3 (148-392)||(8069765-8070003)
chr3 (211-380)||(8888028-8888192)
chr3 (211-392)||(12965699-12965880)
chr3 (148-392)||(8883256-8883495)
chr3 (248-392)||(49971291-49971431)
chr3 (196-371)||(10586000-10586171)
chr3 (182-319)||(17025903-17026041)
chr3 (196-278)||(45904355-45904437)
chr3 (196-278)||(45904811-45904893)
chr3 (147-400)||(19276682-19276935)
chr3 (200-319)||(31002856-31002970)
chr3 (211-352)||(28125268-28125404)
chr3 (11-137)||(17025732-17025858)
chr3 (46-143)||(12112329-12112424)
chr3 (260-392)||(12112516-12112648)
chr3 (146-210)||(12112442-12112506)
chr3 (211-346)||(16013835-16013969)
chr3 (73-106)||(20520435-20520468)
chr3 (207-254)||(13156223-13156270)
chr3 (46-112)||(11399729-11399794)
chr3 (300-362)||(47567111-47567172)
[»] chr4 (58 HSPs)
chr4 (11-400)||(8693791-8694181)
chr4 (11-392)||(5927845-5928226)
chr4 (18-392)||(37264198-37264571)
chr4 (18-392)||(37259498-37259884)
chr4 (18-392)||(31269122-31269487)
chr4 (18-392)||(31273609-31273976)
chr4 (11-392)||(51698005-51698386)
chr4 (46-400)||(13059490-13059841)
chr4 (18-392)||(5271056-5271426)
chr4 (11-392)||(19102065-19102446)
chr4 (11-363)||(19106725-19107077)
chr4 (73-392)||(47244336-47244655)
chr4 (18-392)||(31729024-31729394)
chr4 (11-392)||(16421117-16421506)
chr4 (11-392)||(19540809-19541168)
chr4 (146-362)||(12823662-12823878)
chr4 (11-199)||(31766153-31766339)
chr4 (216-404)||(55251795-55251983)
chr4 (138-289)||(31766001-31766152)
chr4 (211-392)||(48276475-48276656)
chr4 (211-392)||(8030302-8030483)
chr4 (146-338)||(13065578-13065769)
chr4 (146-277)||(32081893-32082024)
chr4 (211-392)||(33463182-33463363)
chr4 (147-349)||(15134283-15134486)
chr4 (11-261)||(6942987-6943248)
chr4 (223-392)||(33468811-33468980)
chr4 (211-392)||(19906339-19906519)
chr4 (147-320)||(40408361-40408535)
chr4 (216-404)||(12878315-12878502)
chr4 (148-374)||(13521756-13521978)
chr4 (196-371)||(7902923-7903094)
chr4 (148-343)||(31298157-31298348)
chr4 (196-317)||(34560588-34560704)
chr4 (223-392)||(8649473-8649637)
chr4 (223-392)||(8661280-8661444)
chr4 (148-319)||(47574817-47574984)
chr4 (196-371)||(3997874-3998045)
chr4 (148-288)||(23093293-23093434)
chr4 (148-375)||(42758514-42758745)
chr4 (148-318)||(39319735-39319893)
chr4 (148-343)||(41816919-41817109)
chr4 (11-112)||(55252029-55252130)
chr4 (286-392)||(12874627-12874733)
chr4 (270-392)||(4551085-4551203)
chr4 (285-392)||(32545183-32545291)
chr4 (148-264)||(52690891-52691008)
chr4 (248-340)||(55810142-55810233)
chr4 (159-246)||(39217184-39217272)
chr4 (147-210)||(4551242-4551305)
chr4 (11-133)||(12823519-12823638)
chr4 (300-392)||(2819932-2820024)
chr4 (319-377)||(40840431-40840488)
chr4 (323-392)||(32082029-32082098)
chr4 (323-392)||(47574713-47574782)
chr4 (324-392)||(16948089-16948157)
chr4 (258-348)||(39217262-39217356)
chr4 (73-103)||(1150949-1150979)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (11-392)||(29167600-29167980)
chr5 (11-400)||(36423717-36424106)
chr5 (11-392)||(36428797-36429178)
chr5 (11-392)||(26667360-26667741)
chr5 (11-392)||(26938957-26939338)
chr5 (11-392)||(40147983-40148364)
chr5 (18-392)||(7451846-7452216)
chr5 (49-392)||(35679540-35679882)
chr5 (11-392)||(37248431-37248802)
chr5 (11-392)||(12103113-12103494)
chr5 (11-246)||(37549779-37550014)
chr5 (11-246)||(37652577-37652812)
chr5 (91-392)||(10759527-10759827)
chr5 (148-392)||(6155181-6155426)
chr5 (73-392)||(20180739-20181070)
chr5 (219-392)||(12501733-12501906)
chr5 (148-392)||(556783-557021)
chr5 (148-392)||(561555-561793)
chr5 (11-187)||(9726382-9726557)
chr5 (211-392)||(39523137-39523317)
chr5 (223-400)||(11981118-11981295)
chr5 (211-392)||(39518498-39518678)
chr5 (146-348)||(34707299-34707500)
chr5 (148-392)||(16116011-16116256)
chr5 (211-392)||(4872010-4872191)
chr5 (148-392)||(36937280-36937518)
chr5 (148-392)||(36942034-36942272)
chr5 (229-392)||(6514444-6514608)
chr5 (151-363)||(15414647-15414859)
chr5 (148-392)||(32461316-32461556)
chr5 (193-392)||(12102637-12102838)
chr5 (148-392)||(12044907-12045146)
chr5 (225-392)||(12041772-12041939)
chr5 (226-397)||(9726529-9726699)
chr5 (271-392)||(41587048-41587167)
chr5 (148-392)||(42001522-42001755)
chr5 (148-392)||(41996753-41996986)
chr5 (196-319)||(13301299-13301417)
chr5 (218-371)||(21323805-21323954)
chr5 (196-371)||(31731650-31731821)
chr5 (285-404)||(3666008-3666127)
chr5 (11-227)||(6513544-6513768)
chr5 (11-112)||(15414496-15414597)
chr5 (148-246)||(3666139-3666237)
chr5 (145-243)||(7086595-7086693)
chr5 (211-321)||(1429827-1429931)
chr5 (148-187)||(4872148-4872187)
chr5 (148-214)||(23977359-23977424)
chr5 (11-104)||(16115861-16115955)
chr5 (148-188)||(9911369-9911409)
chr5 (148-188)||(39518634-39518674)
chr5 (19-103)||(39518880-39518962)
chr5 (148-188)||(39523273-39523313)
chr5 (19-103)||(39523519-39523601)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (11-392)||(19892100-19892473)
chr2 (11-392)||(18344519-18344891)
chr2 (18-392)||(1934627-1935000)
chr2 (11-400)||(25477924-25478312)
chr2 (16-390)||(28603393-28603764)
chr2 (18-392)||(9180361-9180731)
chr2 (11-392)||(25496952-25497332)
chr2 (11-404)||(31326815-31327218)
chr2 (11-392)||(12797013-12797393)
chr2 (151-392)||(9189573-9189810)
chr2 (211-392)||(30651017-30651197)
chr2 (73-404)||(17544975-17545317)
chr2 (211-392)||(29677855-29678036)
chr2 (146-348)||(40847360-40847563)
chr2 (11-173)||(17968590-17968751)
chr2 (18-156)||(9185052-9185190)
chr2 (159-392)||(35602010-35602238)
chr2 (211-392)||(7737677-7737858)
chr2 (150-392)||(10160495-10160731)
chr2 (227-391)||(21523571-21523726)
chr2 (148-363)||(17453348-17453557)
chr2 (150-363)||(19578180-19578392)
chr2 (148-390)||(19094256-19094499)
chr2 (148-371)||(28855112-28855330)
chr2 (196-371)||(6297703-6297874)
chr2 (148-370)||(19538493-19538711)
chr2 (285-392)||(30658351-30658458)
chr2 (307-380)||(29677481-29677554)
chr2 (345-392)||(35638957-35639004)
chr2 (296-404)||(30631655-30631766)
chr2 (319-392)||(30618951-30619024)
chr2 (149-256)||(30629074-30629181)
chr2 (11-103)||(40847219-40847310)
chr2 (299-381)||(13291455-13291536)
chr2 (210-255)||(30643408-30643453)
chr2 (324-381)||(32079478-32079535)
chr2 (230-267)||(42926361-42926398)
chr2 (148-188)||(30651153-30651193)
chr2 (19-103)||(30651399-30651481)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (18-392)||(6407495-6407867)
chr6 (11-392)||(17964186-17964566)
chr6 (11-392)||(11559847-11560228)
chr6 (11-392)||(11534337-11534718)
chr6 (11-392)||(11570375-11570756)
chr6 (51-363)||(11428126-11428436)
chr6 (10-392)||(12689059-12689441)
chr6 (11-321)||(25314083-25314393)
chr6 (11-321)||(26201577-26201887)
chr6 (50-392)||(16835826-16836163)
chr6 (11-392)||(2699724-2700113)
chr6 (146-392)||(19995164-19995410)
chr6 (10-392)||(4156983-4157376)
chr6 (46-392)||(12406003-12406360)
chr6 (156-392)||(29892032-29892268)
chr6 (223-392)||(14509072-14509241)
chr6 (146-330)||(5856158-5856341)
chr6 (216-392)||(33687434-33687610)
chr6 (146-321)||(11613527-11613703)
chr6 (149-392)||(8747870-8748108)
chr6 (196-309)||(17913768-17913881)
chr6 (11-175)||(33687277-33687430)
chr6 (10-234)||(22694937-22695172)
chr6 (238-392)||(24589022-24589171)
chr6 (208-392)||(22609656-22609841)
chr6 (270-400)||(20748169-20748299)
chr6 (253-326)||(21309168-21309241)
chr6 (300-377)||(9751724-9751800)
chr6 (148-271)||(6112724-6112846)
chr6 (148-345)||(2863229-2863429)
chr6 (207-366)||(2882592-2882755)
chr6 (224-278)||(5495983-5496037)
chr6 (322-392)||(13736615-13736685)
chr6 (207-405)||(15991560-15991760)
chr6 (207-405)||(15999222-15999422)
chr6 (73-103)||(20747884-20747914)
chr6 (355-392)||(21309119-21309156)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (11-392)||(26341287-26341675)
chr7 (10-380)||(42626216-42626586)
chr7 (46-392)||(13313896-13314243)
chr7 (11-392)||(8268381-8268760)
chr7 (16-392)||(44422766-44423144)
chr7 (58-380)||(12799510-12799840)
chr7 (46-392)||(4930321-4930655)
chr7 (146-392)||(30258188-30258434)
chr7 (46-392)||(27238330-27238688)
chr7 (52-392)||(10388024-10388374)
chr7 (147-353)||(3045682-3045888)
chr7 (147-395)||(21671280-21671528)
chr7 (148-392)||(44510440-44510684)
chr7 (167-392)||(13142683-13142908)
chr7 (211-363)||(3880112-3880264)
chr7 (149-392)||(23866156-23866394)
chr7 (224-353)||(3357470-3357599)
chr7 (216-380)||(26286977-26287140)
chr7 (260-392)||(25543237-25543369)
chr7 (230-390)||(3284818-3284978)
chr7 (236-392)||(12254167-12254322)
chr7 (148-374)||(9650731-9650953)
chr7 (148-371)||(19640405-19640624)
chr7 (146-246)||(3356857-3356957)
chr7 (207-337)||(23318128-23318257)
chr7 (196-371)||(27256349-27256520)
chr7 (211-319)||(40865185-40865288)
chr7 (148-392)||(4579596-4579844)
chr7 (162-392)||(8076138-8076358)
chr7 (163-278)||(15642379-15642495)
chr7 (224-392)||(6590818-6590990)
chr7 (296-392)||(9008251-9008346)
chr7 (166-366)||(16372507-16372712)
chr7 (174-241)||(3025666-3025733)
chr7 (46-112)||(30258466-30258532)
chr7 (307-390)||(45748562-45748647)
chr7 (17-103)||(21671573-21671658)
chr7 (158-210)||(15642506-15642558)
chr7 (313-392)||(23246861-23246940)
chr7 (153-207)||(23319115-23319169)
chr7 (147-209)||(23319181-23319243)
chr7 (145-193)||(15973037-15973085)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (15-392)||(36683667-36684044)
chr8 (11-392)||(15951181-15951563)
chr8 (11-392)||(44925550-44925930)
chr8 (46-392)||(33416635-33416981)
chr8 (11-392)||(1910585-1910976)
chr8 (146-392)||(2965718-2965964)
chr8 (146-392)||(28564582-28564826)
chr8 (146-392)||(28572205-28572449)
chr8 (211-392)||(40125712-40125892)
chr8 (145-392)||(19166722-19166969)
chr8 (11-392)||(18876018-18876374)
chr8 (18-242)||(1807685-1807908)
chr8 (146-392)||(23548391-23548639)
chr8 (63-392)||(28559333-28559661)
chr8 (211-392)||(17026023-17026204)
chr8 (211-392)||(17556515-17556696)
chr8 (146-348)||(17020470-17020672)
chr8 (146-348)||(17550907-17551109)
chr8 (11-392)||(38181873-38182244)
chr8 (148-380)||(4238110-4238336)
chr8 (148-380)||(4242849-4243075)
chr8 (216-392)||(24090715-24090886)
chr8 (147-392)||(31449633-31449873)
chr8 (259-392)||(34118554-34118687)
chr8 (148-374)||(24673097-24673320)
chr8 (148-392)||(43302456-43302698)
chr8 (196-371)||(25367797-25367968)
chr8 (196-371)||(34818516-34818687)
chr8 (285-390)||(1807563-1807668)
chr8 (196-319)||(8331174-8331292)
chr8 (46-312)||(26779268-26779548)
chr8 (196-371)||(37771818-37771989)
chr8 (147-298)||(17793645-17793797)
chr8 (313-392)||(17953800-17953880)
chr8 (325-392)||(15875608-15875675)
chr8 (155-303)||(22714777-22714926)
chr8 (11-112)||(17020715-17020816)
chr8 (11-112)||(17551152-17551253)
chr8 (11-112)||(19167011-19167112)
chr8 (223-298)||(12820504-12820579)
chr8 (46-150)||(23548280-23548381)
chr8 (46-103)||(28564470-28564527)
chr8 (323-377)||(10933534-10933588)
chr8 (66-115)||(18260199-18260248)
chr8 (146-187)||(24090848-24090889)
chr8 (148-243)||(14035669-14035764)
chr8 (46-102)||(22714656-22714712)
chr8 (207-339)||(29220480-29220619)
chr8 (73-104)||(4237946-4237977)
chr8 (73-104)||(4242685-4242716)
chr8 (229-319)||(7001849-7001940)
chr8 (207-277)||(15875506-15875576)
chr8 (145-193)||(27415788-27415836)
chr8 (63-103)||(28572110-28572150)
chr8 (148-188)||(40125716-40125756)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (11-392)||(7192-7573)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (11-392)||(443572-443952)
scaffold0002 (211-392)||(4162-4342)
scaffold0002 (207-254)||(150718-150765)
scaffold0002 (148-188)||(4298-4338)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (148-392)||(9650-9894)
[»] scaffold0054 (4 HSPs)
scaffold0054 (11-283)||(25640-25921)
scaffold0054 (146-373)||(29262-29497)
scaffold0054 (263-392)||(25487-25616)
scaffold0054 (46-133)||(29521-29606)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (9-349)||(5421-5766)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (146-295)||(148166-148316)
scaffold0009 (290-392)||(164928-165036)
scaffold0009 (11-148)||(148020-148154)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (195-361)||(4092-4259)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (196-371)||(45891-46062)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (182-392)||(83154-83356)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (196-371)||(152725-152896)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (147-353)||(146192-146402)
scaffold0011 (355-392)||(155488-155525)
[»] scaffold0060 (2 HSPs)
scaffold0060 (216-371)||(47694-47845)
scaffold0060 (196-371)||(52717-52888)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (241-371)||(1088-1214)
[»] scaffold2020 (1 HSPs)
scaffold2020 (290-392)||(459-567)
[»] scaffold0128 (3 HSPs)
scaffold0128 (290-388)||(13364-13460)
scaffold0128 (207-262)||(13466-13521)
scaffold0128 (46-104)||(13601-13659)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (310-390)||(1230-1309)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (332-392)||(35722-35782)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (296-392)||(165998-166093)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (252-392)||(2396-2540)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (169-246)||(42184-42262)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (314-392)||(255905-255983)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (169-246)||(3002-3080)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Original strand, 26927348 - 26927730
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927348 ataatatatgtcccttcagaataaagagtatttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgttccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 26927447  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927448 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 26927547  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26927548 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcgccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 26927647  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatt 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26927648 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaagtgtacagttgtagctgggcttgttttatt 26927730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 39587996 - 39588374
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||||||||| || |||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  39587996 ataatatatgtcccatcggaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaatgacaatgtcccgtcgaaattaagaatggtcttaacggtata 39588095  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||  || | ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39588096 ta--aatattatttta-tatttttctaattgaggagaaatggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 39588192  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||    
T  39588193 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggttttagtattaaagattggtctcag 39588292  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  39588293 taccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacactgcagtagttaatcgaacaattgtagatgagcttgctttat 39588374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25844214 - 25843844
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25844214 atgtcccttcaggataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaatagcaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 25844115  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    |||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||    
T  25844114 agtatttcaa-atattt---tttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaat 25844019  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    ||||  | || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25844018 ggtgacagcatcatatttgagtggtctcaacaccataagagagtggtaacaataccatattaaggtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 25843919  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    | ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25843918 tatgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttat 25843844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 47450855 - 47451232
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47450855 ataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaatggtata 47450954  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||  || | ||||| | || ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  47450955 ta--aatattatttta-tagttttctaattgaggagaaatgatggtatcgccatatttgagtggttgtaatatcatattgatagtttggagaacttaaag 47451051  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |  ||||    
T  47451052 ttagaatggagttaatatcatatttgagtggtctcagcgtcataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaa-aaaagaattag 47451150  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47451151 taccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctgcagtacagtagttaatcgaacagttgtagttgagcttgttttat 47451232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10140556 - 10140165
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatata--a 115  Q
    ||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  10140556 atgtcccttcataataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatatataa 10140457  T
Q  116 aaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttagg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   ||||||||   ||||||||| ||||||||||     
T  10140456 aaagtatttcaatatttttctatgtgaggagaaatggtggtatcacaatatttgaatggtcgtagtggcatattgaagttttggagaaattaaagttaga 10140357  T
Q  216 atggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtacca 315  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    | || |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10140356 atggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacaaagtggttacaataccat----aggtggtttcaatattaaagaatggtcttagtacca 10140261  T
Q  316 tatttggaggtgtaattctcgaa-------cgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgaggtggc 404  Q
    ||||||  |||||||||||||||       || |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  10140260 tatttgagggtgtaattctcgaacggttttcggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttatcctagaggtggc 10140165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 19798630 - 19799020
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19798630 ataatataagtcccttcggaataaagagtactatgaagatcatagtccctttttggaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 19798729  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaa--------------tggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtt 196  Q
    ||  || | | |||||||| |||   | |||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  19798730 ta--aatattctttcaatacttt---aattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactt 19798824  T
Q  197 tggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatta 296  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19798825 tggagaaattaaagttagaatgggggtaacaccatatttgagttgtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggttttagtatta 19798924  T
Q  297 aagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  19798925 aagagtggtcttagtgccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttat 19799020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Original strand, 16649263 - 16649508
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16649263 ataatatatgtcccttcagaataaagagtatttttaagatcatagtccttatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgattttaacggtata 16649362  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  16649363 tataaaaagtatttcaatatttttccatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtctcatattgatgttttggagaaattaaag 16649462  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataac 256  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16649463 ttagaatcgtggtaacaccatatttgagtggtttcaacaccataac 16649508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40166420 - 40166068
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga 145  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |  |||||||| | | |||||||||||   || |||||||    
T  40166420 aagatcatagtccct-tttgaaataataatgttccgtctgaattaagaatgatcttaacag--tatataaatattctttcaatattt---taattgagga 40166327  T
Q  146 gaaat------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatat 233  Q
    |||||             |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  40166326 gaaattaaaaagtggaaagtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatat 40166227  T
Q  234 ttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattc 333  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |     
T  40166226 ttgagtggtctcaataccataagagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatattcgaatgtgtaaatt 40166127  T
Q  334 tcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||    
T  40166126 tcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgtatagttgtagttgtgcttgttttat 40166068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16036053 - 16035696
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga 145  Q
    |||||||||||| || || |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  || | | ||||||||||||||||||||||||    
T  16036053 aagatcatagtctcttttcggaacaataatgtcccttccgaattaagaatgatcttaatagtatata--aatattctttcaatatttttctatttgagga 16035956  T
Q  146 gaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccat 231  Q
    |||||              |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16035955 gaaataaaaaatttgaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtgataacaccat 16035856  T
Q  232 atttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaa-agagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaa 330  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16035855 atttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtcattttaatattaacataatggtcttggtaccata-ttggaggtgtaa 16035757  T
Q  331 ttctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
     ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  16035756 -tctcgaatggttttctaaagtgcagtagttaaccacacatttgtagatgagcttgttttat 16035696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 204 - 392
Target Start/End: Original strand, 51041282 - 51041470
Alignment:
Q  204 cttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtg 303  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51041282 cttaaagttagaatgatattaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaattccatattaaagtggtttcaatattaaagagtg 51041381  T
Q  304 gtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
     |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51041382 atcttagtaccatatttggaggtatagttctcgaacgattttctacagtgcagtaattaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 51041470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38621172 - 38620780
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||        ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38621172 ataatataagtcccttcggaataaagattactattaagatcatagtccct-tttgaaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 38621074  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatattttt-ctatttgagga--------------gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagt 195  Q
    ||   ||  | ||||||||||||| |||||||||||              |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |    
T  38621073 ta---aatttctttcaatattttttctatttgaggataaattaaaaagtcgaaatgttgttattaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatatt 38620977  T
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||    
T  38620976 ttggagaaattaaagttagaatggtgaaaacaccatatttgagtggtcttaacatcataacagagtggtgacgataccatattaaagtgatttcagtatt 38620877  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |||| |||  ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| ||  ||||||||||    
T  38620876 aaagagtggtcttaataccatattttagggtgtaaatctcaaacagttttctacaatgcagtagttaaccgcacagttgtagttggacttgttttat 38620780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10135788 - 10135617
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    ||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10135788 atgtcccttcataataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaa 10135689  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatatt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10135688 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcgccatatttgagtggtcgtagtgccatatt 10135617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 216 - 392
Target Start/End: Original strand, 33301011 - 33301187
Alignment:
Q  216 atggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtacca 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33301011 atggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttaagtattaacgagtggtcttagtacca 33301110  T
Q  316 tatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||  |||||||||    
T  33301111 tatttgaaggtgtaattctcgaacagttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagatgaaattgttttat 33301187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 228 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8138191 - 8138027
Alignment:
Q  228 ccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg 327  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  8138191 ccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaagagtatcatattaaagtggtttcagtattaaagggtggtcttagtaccatatttgagggtg 8138092  T
Q  328 taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8138091 taattctcgaacggttttctacattgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttat 8138027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 154
Target Start/End: Original strand, 51041138 - 51041281
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51041138 ataatatatgttcctttagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccatcggaattaagaatgatcttaacgatata 51041237  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51041238 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtg 51041281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16833753 - 16833572
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtctta 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||     
T  16833753 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtttcaacaccaaaatagaatggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttg 16833654  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16833653 gtaccata-ttggaggtgtaattttcgaacggttttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagctgaggctgttttat 16833572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Original strand, 23192644 - 23192824
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtctta 309  Q
    |||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||     
T  23192644 ttagaatggtggtaacattatattcgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacagtatcatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttg 23192743  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23192744 gtaccatatt-ggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacaattgtagctg-gcttgttttat 23192824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 33300875 - 33301038
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||| ||    
T  33300875 ataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttgaaataacaatgtcccgtcgaaattaaaaataatcttaa-ggt-ta 33300972  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtc 176  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33300973 tataaaaattatttcaatatatttctatttgaggagaaatggtggtaacaccatatttgagtggtc 33301038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 210 - 392
Target Start/End: Original strand, 28434399 - 28434581
Alignment:
Q  210 gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtctt 308  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  28434399 gttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatgatctt 28434498  T
Q  309 agtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||||||  | ||| |||||| ||| ||||||||||    
T  28434499 tgtaccata-ttggaggtgtaaatctcgaacggttttctatagtaaagtagttaactgcacaattgtagttgaacttgttttat 28434581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3094414 - 3094188
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3094414 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 3094317  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     || |||||  ||||||| |||||||||||||      |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  3094316 acatcataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttaataccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtttt 3094223  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctg 380  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3094222 ctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctg 3094188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 363
Target Start/End: Original strand, 18784325 - 18784535
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||| |||| |||||  |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18784325 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttgaagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccagatttgagtggtctca 18784423  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
      ||||||| |||||||  ||| |||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  18784424 ataccataatagagtggctacagtaccatattt-----gtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtttt 18784517  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaa 363  Q
    |||||||| |||||||||    
T  18784518 ctacagtgcagtagttaa 18784535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 370
Target Start/End: Original strand, 8267606 - 8267817
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcat 247  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |       ||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  8267606 aatggtcgtagcaccatatttgagtggtcatagtaccatagt-------tggagaagttaaaattagaatggtgataacaacatatttgagtggtctcaa 8267698  T
Q  248 caccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattttc 346  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||| |     
T  8267699 caccataatagagtgatcacaataccatat-----tggtttcagtatttaagagtggtcttagtaccatattagagggtgttatttctcgaacgattatt 8267793  T
Q  347 tacagtgtagtagttaatcgaaca 370  Q
    ||||||| | || |||||||||||    
T  8267794 tacagtgcaatacttaatcgaaca 8267817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Original strand, 41097769 - 41097940
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||     | |||||||||||    
T  41097769 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaataccatatttgcgtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtatt 41097863  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || || ||||||||||||  | ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  41097864 aaagagtggtcttagtaccatattagaggatgttatttctcgaacgatcatatacggtgcagtatttaatcgaacag 41097940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11806591 - 11806444
Alignment:
Q  248 caccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttct 347  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  11806591 caccataaaagagtggtaataataccatattaaagttgcttaagtattaaagagtgatcttagtgccatatttgaaagtgtaaatctcaaacgattttct 11806492  T
Q  348 acagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattct 395  Q
     || || |||| |||| || ||| |||||| ||| ||| |||||||||    
T  11806491 gcactgcagtatttaaccgcacaattgtagttgaacttcttttattct 11806444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Original strand, 16649513 - 16649620
Alignment:
Q  285 gtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagct 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||  ||    
T  16649513 gtttcagtattaaagagtggtattagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacagttttctacagtgcagtagttaaccacacagttgtagctggact 16649612  T
Q  385 tgttttat 392  Q
    ||||||||    
T  16649613 tgttttat 16649620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33055365 - 33055145
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgta-gcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | | | || ||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33055365 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaagtacgatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtgataacaccatatttgagtggtctc 33055267  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattt 344  Q
    | |||||||  |||||||| ||||||||||||     |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |  |||| || ||||||||| |||     
T  33055266 aacaccatagtagagtggtcacaataccatat-----tagttttagtattaaagagtggcattagtaccatattagagggtgttatttctcgaacaatta 33055172  T
Q  345 tctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    | |||  || |||| ||||||||||||    
T  33055171 tttacgatgcagtacttaatcgaacag 33055145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12260246 - 12260158
Alignment:
Q  223 taacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12260246 taacaccatatttgagtggtctcagcacaataatagagtggtcacaataccatattataatagtttcagtatt-aagagtggtcttagta 12260158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11806667 - 11806585
Alignment:
Q  150 tggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccata 232  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||    
T  11806667 tggtggtatcactgtatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaacttaaagttataatggtgctgacaccata 11806585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 299 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10135637 - 10135544
Alignment:
Q  299 gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||    
T  10135637 gagtggtcgtagtgccatatttgagggtgtaattcttgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcaactgggcttgttttat 10135544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Original strand, 39200527 - 39200607
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaac 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  39200527 gaaacggtggtatcaccatatttgagtgatcgtaatgccatattgatactttggagaaattaaagttagaatggtggtaac 39200607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 337
Target Start/End: Original strand, 25779155 - 25779270
Alignment:
Q  226 caccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa---gagtggtcttagta-ccatatttg 321  Q
    ||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||||  | |||||||||    
T  25779155 caccatatttgagtgatcttaataccataatagagtggtcataatactatattatagtggtttcagtattaaatttgagtggtcttaaaagccatatttg 25779254  T
Q  322 gaggtgtaattctcga 337  Q
      ||||||||||||||    
T  25779255 agggtgtaattctcga 25779270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 276
Target Start/End: Original strand, 40233186 - 40233229
Alignment:
Q  233 tttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccata 276  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40233186 tttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccata 40233229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32626434 - 32626384
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtt 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  32626434 gaaattgtggtaacaccatatttgagtgattgtagtaccatattgatagtt 32626384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 328
Target Start/End: Original strand, 17214158 - 17214203
Alignment:
Q  283 tagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgt 328  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||    
T  17214158 tagtttcagtattaaagtgttgtcttagcaccatatttgaaggtgt 17214203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 392
Target Start/End: Original strand, 47455356 - 47455393
Alignment:
Q  355 agtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  47455356 agtagttaatcgaacagttgtagctaggcttgttttat 47455393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 254
Target Start/End: Original strand, 25779080 - 25779124
Alignment:
Q  210 gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccata 254  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25779080 gttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcacattaccata 25779124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18467692 - 18467311
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18467692 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 18467593  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18467592 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 18467493  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18467492 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaaatggtttcagtattaaagagtggtcttag 18467393  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  18467392 taccatatttggaagtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacaattgtagttggacttgttttat 18467311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18472474 - 18472093
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18472474 ataatatatgtccctttagaataaagagtacttttaagatgatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtata 18472375  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18472374 tataaaaagtattttaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 18472275  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18472274 ttagaatgatattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacaaagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 18472175  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18472174 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 18472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 39775355 - 39775735
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39775355 ataatatatgtcccttcagaataaatagtacttttaagatcatagtctctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 39775454  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39775455 tataaaaagtagttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 39775553  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  39775554 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcatcataacagagtagtaacaataccatattaaagtggtttcagtagtaaagagttgtcttag 39775653  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39775654 taccatatttggaggtgtaattttcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 39775735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 757995 - 758375
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  757995 ataatatatgtcccttcagattaaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtata 758094  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  758095 tataaaaagtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 758193  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  758194 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 758293  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  758294 taccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttat 758375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Original strand, 7570880 - 7571225
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7570880 aagatcatagtccatatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaaagtatttcaatattttt-tatttgagga 7570978  T
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7570979 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttataatggtattaacaccatatttgagtggtctc 7571078  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7571079 agcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagcgtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggtttt 7571178  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  7571179 ctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttat 7571225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Original strand, 23661098 - 23661471
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23661098 atgtcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 23661197  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23661198 agtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaat 23661296  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23661297 ggtatgaacaccatatttgagtggtctcagcaccttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 23661396  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  23661397 tttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttat 23661471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Original strand, 23665757 - 23666130
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23665757 atgtcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatctaaacggtatatataaaa 23665856  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23665857 agtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaat 23665955  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665956 ggtatgaacaccatatttgagtggtctcagcaccttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 23666055  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  23666056 tttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttat 23666130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Original strand, 24038005 - 24038378
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24038005 atgtcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatctaaacggtatatataaaa 24038104  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24038105 agtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaat 24038203  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24038204 ggtatgaacaccatatttgagtggtctcagcaccttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 24038303  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  24038304 tttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttat 24038378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 55326243 - 55325862
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55326243 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtata 55326144  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||    
T  55326143 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggaaaaattaaag 55326044  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55326043 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagaatgataacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 55325944  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaac-gattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||| |||||   |||||||||||||| | | |||||||||||| | ||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  55325943 taccgtatttaagggtgtaattctcgatcgggttttctacagtgca-tagttaaccgcacagttgtaactgggcttgttttat 55325862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 55431782 - 55431401
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55431782 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcataatccatatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtata 55431683  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  55431682 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaattgtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatgttttggagaaattaaag 55431583  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||    
T  55431582 ttagaatggtgacaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtgataacaatgccatattaaggtggtttaagtatcaaagagtggtcttag 55431483  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  55431482 taccatatttgagggtgcaattctcgaacagttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttat 55431401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29350707 - 29350326
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||| ||||    
T  29350707 ataatatatgtcccttcagaataaagaatatttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgttccattagaattatgaatgatcttaacgatata 29350608  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||     
T  29350607 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaaa 29350508  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  29350507 ttagaatggtggcaacaccatatttgagtgctctcaacactataacagagtggtaacaatatcatattaaagtgattttagtattaaagagtggtcttag 29350408  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  29350407 taccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtaattaaccacacagttgtagttgagcttgttttat 29350326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 10 - 392
Target Start/End: Original strand, 2207374 - 2207756
Alignment:
Q  10 aataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtat 109  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||       |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2207374 aataatatatgtctcttcggaataaagagtacttttaagatcatggtccctgtttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtat 2207473  T
Q  110 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||| |||||    
T  2207474 atataaaaagtatttcaacatttttctatttgaggagaaatggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttgaagaaattaaa 2207573  T
Q  210 gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtctta 309  Q
    ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2207574 gttagaacggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacaataccatataaaagtggtttcagtattaaagagtggtctta 2207673  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||| || ||| |||||| || |||||||||||    
T  2207674 gtaccatatttgagggtgtaattctcgaagggttttctacagtacagtagttaaccgcacaattgtagatgggcttgttttat 2207756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Original strand, 14438332 - 14438702
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    |||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14438332 atgttccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaa 14438431  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| |||||||||| ||    
T  14438432 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaagttagaat 14438531  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    |||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14438532 ggtagcaaaaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccat----aggtggtttcaatattaaagagtggtcttagtaccata 14438627  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  14438628 tttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttat 14438702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27709392 - 27709022
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27709392 atgtcccttcagaataaagagtatttttaagatcatagtctctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 27709293  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||    
T  27709292 agtattttaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaat 27709193  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||    | || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27709192 ggtggtaacaccatatttgagtggtcgcaacaccataatagagtggttacaatactat----aggtggtttcagtattgaagagtgatcttagtaccata 27709097  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  27709096 tttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgaagctgggcttgttttat 27709022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 46964476 - 46964089
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46964476 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcataatttatatttggaatagcaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtata 46964377  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagt-ttggagaacttaaa 209  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||     || ||||| || |||||    
T  46964376 ta--aaaattatttcaatatttttctatttgaagagaaattgtggtatcaccatacttgagttgtcgtagtgccatat-----gtcttggataaattaaa 46964284  T
Q  210 gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtctta 309  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46964283 gttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatatcaaagtggtttcagtattaaagagtggtctta 46964184  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgaggtggc 404  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||||| |  | ||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  46964183 ataccatatttgagggtgtaaatctcgaacggttttctatagtgcaatagttaaccacatagttgtatctgagtttgttttatcctagaggtggc 46964089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 3656856 - 3657247
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||       ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3656856 ataatataagtcccttcgtaataaagagtactgttaagatcataatccctttttggaataataatgtcccgtcggaattaagaacgatcttaaaggtata 3656955  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtt 196  Q
    ||  || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||              |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  3656956 ta--aatattatttgaatatttttctaattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatc--catatttgagtggtcgtagtgccatattgatattt 3657051  T
Q  197 tggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatta 296  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  3657052 tggagaaattaaagttagaatggtggtaacatcatatttgattggtctcagcaccgtaacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagcatta 3657151  T
Q  297 aagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  3657152 aagagtggtcttagtaccatatttaagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatctaacagttgtagctggacttgttttat 3657247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20520386 - 20520140
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  20520386 gaaatggcgatatcaccatatttgagtggtcgtagtgcaatattgatactttggagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatattttagtggtttc 20520287  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||||    
T  20520286 agcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtactatatttgaaggtgtaaatctcgaacagtttt 20520187  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||  ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  20520186 ctacagtacagtagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttat 20520140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 226
Target Start/End: Original strand, 32473581 - 32473760
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga 145  Q
    |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32473581 aagaccatggtccctgtttggaaaaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttta-tatttgagga 32473679  T
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32473680 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaac 32473760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 217 - 392
Target Start/End: Original strand, 32474511 - 32474687
Alignment:
Q  217 tggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtc-ttagtacca 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32474511 tggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtctttagtacca 32474610  T
Q  316 tatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32474611 tatttagaggtataattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 32474687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 148 - 389
Target Start/End: Original strand, 25726553 - 25726792
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  25726553 aatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtaccatattgatattttggagaacttaaaggttagaatgatgataacaccatatttgagtggtctta 25726652  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttc 346  Q
     |||||||  | |||||| |||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25726653 acaccata--atagtggtcacaataccatattagaatgatttcagtatttaagagtggtcttagtaccata-ttggaggtgtaaatctcgaacggttttc 25726749  T
Q  347 tacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttt 389  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||| |||  |||||||    
T  25726750 tacagtgcagtagttaaccgcacagttgtaactgcacttgttt 25726792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3419436 - 3419081
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga 145  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || | | ||||||||||||   | |||||||    
T  3419436 aagatcatagtccctttttagaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatata--aatattctttcaatatttt---aattgagga 3419342  T
Q  146 gaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagca--ccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacacc 229  Q
    |||||              |||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||    
T  3419341 gaaattaaaaagtgaaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtgtgccatattgatattttggagaaattaaagttagaatggtggcaacacc 3419242  T
Q  230 atatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgta 329  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  3419241 atatt-gagtggtcacagcgccataacagagcggtaacaatacaatattaaagtggtttcagtattaa-gagtggtcttagtaccatatttgagggtgta 3419144  T
Q  330 attctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    | |||| |||| ||||||||  || | ||||||| || ||||||| || ||||||||||||||    
T  3419143 aatctcaaacggttttctacgatgcaatagttaaccgcacagttgcagttgagcttgttttat 3419081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 318
Target Start/End: Original strand, 10708438 - 10708613
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10708438 gaaatggtggtatcaccatatttgagtgctcgtagtaccatattgatagttcggagaacttaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 10708537  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaata--ccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatat 318  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10708538 agcaccataacagagtgttaacaatatcacatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttagtcccatat 10708613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3033968 - 3033722
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3033968 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 3033871  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     || |||||  ||||||| |||||||||||||      |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  3033870 acatcataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattgatcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtttt 3033777  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgagg 400  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3033776 ctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatccttgagg 3033722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3672911 - 3672672
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||   |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3672911 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 3672814  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattt 344  Q
    | || |||||  ||||||| |||||||||||||      |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  3672813 aacatcataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttt 3672720  T
Q  345 tctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3672719 tctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 3672672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3692943 - 3692704
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||   |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3692943 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 3692846  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattt 344  Q
    | || |||||  ||||||| |||||||||||||      |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  3692845 aacatcataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttt 3692752  T
Q  345 tctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3692751 tctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 3692704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 230 - 392
Target Start/End: Original strand, 12971478 - 12971640
Alignment:
Q  230 atatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgt 328  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  12971478 atatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggttttagtattaaaagattagtcttggtaccatatt-ggaggtgt 12971576  T
Q  329 aattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  12971577 aattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaattgaacagttgtagttgggcttgttttat 12971640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Original strand, 6596125 - 6596364
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |  || ||||||| | ||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6596125 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatactatattgaca-tttggagaagttagatgttagaatggtggtaacacaatatttgagtggtctca 6596223  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     |||||||| |||||||| |||  ||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  6596224 gcaccataatagagtggtcacagcaccatattg-----gtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtttt 6596317  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||| || ||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||    
T  6596318 ctacaatgcagtagttaaccacataattgtagctgagcttgttttat 6596364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8070003 - 8069765
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8070003 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 8069906  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     ||||||||  ||||||| |||||||||||||      |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |    
T  8069905 acaccataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtgttaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttat 8069812  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  8069811 ctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttat 8069765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8888192 - 8888028
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtctta 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||      |||||||||||||| || ||||||||    
T  8888192 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtctta 8888098  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctg 380  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  8888097 gtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgtagtagttaaccgcacagttgcagctg 8888028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Original strand, 12965699 - 12965880
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtctta 309  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||     
T  12965699 ttagaatggtggtaacaccatatttgagttgtctcagttccataatagagtggtaatattaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttg 12965798  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  12965799 gtaccata-ttggaggtgtaattcttgaacagttttctacagtgcattagttaatcgaacaattgtagttggacttgttttat 12965880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8883495 - 8883256
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||   |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8883495 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 8883398  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaag-agtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattt 344  Q
    | ||||||||  ||||||| |||||||||||||      ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  8883397 aacaccataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaatattggtctttgtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttt 8883304  T
Q  345 tctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  8883303 tctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttat 8883256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 248 - 392
Target Start/End: Original strand, 49971291 - 49971431
Alignment:
Q  248 caccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttct 347  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  49971291 caccataacatagtggttacaatatcata----agtggtttcagtattaaagagtggtctcagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttct 49971386  T
Q  348 acagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||| |||||||||  | ||||||| |||||  ||||||||||    
T  49971387 acagtgaagtagttaactgcacagttgcagctggacttgttttat 49971431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Original strand, 10586000 - 10586171
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||     | |||||||||||    
T  10586000 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccaaaatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtatt 10586094  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||  | ||| ||| |||| || |||||||||    
T  10586095 aaagaatggtcttagtaccatattagagggtgttatttctcgaacgatcatatacggtgcagtatttgatcgaacag 10586171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 319
Target Start/End: Original strand, 17025903 - 17026041
Alignment:
Q  182 accatattgatagtttggagaacttaaagttagga-tggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaa 280  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||||||| |||  |||||||||     
T  17025903 accatattgatactttagagaacttaaaggctggaatggtgataacaccatatttaagtggtcttagcaccatactagagtggtcacagcaccatattag 17026002  T
Q  281 agtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatt 319  Q
    |||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17026003 agtgatttcaatattaaagagtggtattaggaccatatt 17026041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 278
Target Start/End: Original strand, 45904355 - 45904437
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatatt 278  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  45904355 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatagtaacaataccatatt 45904437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 278
Target Start/End: Original strand, 45904811 - 45904893
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatatt 278  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  45904811 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataataggatggtaacaataccatatt 45904893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 400
Target Start/End: Original strand, 19276682 - 19276935
Alignment:
Q  147 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgata-gtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||  |||| || | ||||| ||||| | | || |||||||| ||||||||||| |    
T  19276682 aaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccatattgatatttttgaaggatttaaaggttagaacgatgataacaccaaatttgagtggt-t 19276780  T
Q  245 catcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattt 344  Q
     | |||||||| ||||| || | | || ||||||| | | || | ||||| ||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||    
T  19276781 tagcaccataatagagtagtcatagtatcatattagactggtgttagtataaaagagatgtcttcgtatcata-ttagaggtgtaaatctcgaacaattt 19276879  T
Q  345 tctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgagg 400  Q
    || ||| || ||||| ||| || | |||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  19276880 tcaacattgcagtagctaaccgcatagttttaattgagcttgttttattctagagg 19276935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31002970 - 31002856
Alignment:
Q  200 agaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaag 299  Q
    |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||     | ||||| || ||||||    
T  31002970 agaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaataccataatagaatggtaacaatatcatat-----tggtttcggtgttaaag 31002876  T
Q  300 agtggtcttagtaccatatt 319  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  31002875 agtggtcttagtaacatatt 31002856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28125404 - 28125268
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtctta 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||||      ||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  28125404 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtttcaacactataatagagtggtcacagtaccatat-----gagtttcaatattaaaagagttgtctta 28125310  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagt 352  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  28125309 ataccata-ttggaggtgtaatactcgaactgttttctacagt 28125268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Original strand, 17025732 - 17025858
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||       |||| |||||||||| |||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  17025732 ataatatatgtcccttcagaataaaaagtatttttaagaccatagtccctttttgtaatgataatgtcccgtcgggattaagaatgatctttacagtata 17025831  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttcta 137  Q
    || ||| | | |||| |||| ||||||    
T  17025832 taaaaatattctttcgatatctttcta 17025858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 143
Target Start/End: Original strand, 12112329 - 12112424
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgag 143  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||   | | |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  12112329 aagatcatactccctatttgaaataataatgtcatgtggaaattaagaatgatcttaacgg--tatataaatattattttaatatttttctacttgag 12112424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 392
Target Start/End: Original strand, 12112516 - 12112648
Alignment:
Q  260 gtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagta 358  Q
    ||||||| |||||  | ||||||| |||| ||||||||| || | ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |    
T  12112516 gtggtaataatacatttttaaagtggtttaagtattaaaagaatagtctttgcaccatatt-ggaggtgtaaatctcgaatggttttctacagtgtagca 12112614  T
Q  359 gttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||| |   || |||||| ||||||||||||||    
T  12112615 gttaaccacccatttgtagttgagcttgttttat 12112648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 210
Target Start/End: Original strand, 12112442 - 12112506
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  12112442 gaaatggtagaatcaccatatttgaggggtcgtagtgccatattgatatattggagaacttaaag 12112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16013969 - 16013835
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||| | | ||||||| |  | | |||||| |||||||   |||| |||     
T  16013969 ttagaatggtggtaacatcatatttgaatggtcacaataccataatagagtggtcatagtaccataattgattggtttcaatattaaaatatggtgttac 16013870  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttc 346  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16013869 taccatatt-ggaggtgtaattctcgaatgattttc 16013835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20520468 - 20520435
Alignment:
Q  73 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacgg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520468 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacgg 20520435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Original strand, 13156223 - 13156270
Alignment:
Q  207 aaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccata 254  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13156223 aaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcacattaccata 13156270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11399794 - 11399729
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11399794 aagatcatagtccct-tttggaacaataatgtctgatcgaaattaagaatgatcttaacagtatata 11399729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 362
Target Start/End: Original strand, 47567111 - 47567172
Alignment:
Q  300 agtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagtta 362  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  47567111 agtgctcttagtatcatatt-ggagatgtaattctcgaaggattttctacagtgcaatagtta 47567172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 58)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8694181 - 8693791
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8694181 ataatatatgtccctttagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaatagcaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 8694082  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtg--gtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8694081 tataaaaagtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtgtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaa 8693983  T
Q  209 agttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtctt 308  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8693982 agttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagaaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtctt 8693883  T
Q  309 agtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgagg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8693882 agtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttatccttgagg 8693791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 5927845 - 5928226
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5927845 ataatatatgtcccttcaaaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtata 5927944  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||     
T  5927945 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtggtaccattttgatagtttgaaaaacttaaaa 5928044  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5928045 ttagaacggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttaagtattaaagagtggtcttag 5928144  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5928145 taccatatttggaggtgtaattcttgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgcagctgggcttgttttat 5928226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Original strand, 37264198 - 37264571
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37264198 atgtcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 37264297  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37264298 agtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaat 37264396  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37264397 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 37264496  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||    
T  37264497 tttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacaattgtagctgggcttgttttat 37264571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Original strand, 37259498 - 37259884
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacgg----------- 106  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||               
T  37259498 atgtcccttcagaataaagaatatttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggatgatcttaac 37259597  T
Q  107 --tatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaac 204  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37259598 ggtatatataaaaagtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaac 37259696  T
Q  205 ttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtgg 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37259697 ttaaagttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtgg 37259796  T
Q  305 tcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  37259797 tcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttat 37259884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31269487 - 31269122
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31269487 atgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacgatatatataaaa 31269388  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31269387 agtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtatcatattgatagtttggagaacttaaagttagaat 31269289  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
            ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31269288 --------caccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 31269197  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||  ||||||||||    
T  31269196 tttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccacacggttgtagctggacttgttttat 31269122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31273976 - 31273609
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31273976 atgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacgatatatataaaa 31273877  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatg--gtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttagg 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31273876 agtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtgtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttaga 31273778  T
Q  216 atggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtacca 315  Q
    ||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31273777 at--------caccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtacca 31273686  T
Q  316 tatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  31273685 tatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccacacagttgtagctgggcttgttttat 31273609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 51698386 - 51698005
Alignment:
Q  11 ataatatatgtccc-ttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtat 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  51698386 ataatatatgtcccattcagaataatgagtacttttaagatcgtagtccctatttggaataacaatgtcccgccggaattaagaatgatcttaacggtat 51698287  T
Q  110 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||  ||||||||| |||||    
T  51698286 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgtcatattgatgttttggagaaattaaa 51698187  T
Q  210 gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtctta 309  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  51698186 gttaggatggtggtaaaaccatatttgagtggtctcaacaccctaacagagtggtgacaataccatattaaagtagtttcaatattaaagagtgatctta 51698087  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  51698086 gtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca-tagttaaccgcacaattgtagttgagcttgttttat 51698005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 46 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13059841 - 13059490
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13059841 aagatcatagtccctatttagaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatata--aaaattatttcaatatttttctatttgagga 13059744  T
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13059743 gaaatggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttagaatggtgacaacaccatatttgagtggtctc 13059644  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  13059643 agcaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagaaccatatttgaaggtgtaa-tctcgaacggtttt 13059545  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgagg 400  Q
    ||||| || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13059544 ctacaatgcagtagttaaccacacagttgtagctgagcttgttttattctagagg 13059490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Original strand, 5271056 - 5271426
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5271056 atgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaa 5271155  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| |||||||||| ||    
T  5271156 agtatttcaatatttttctatttgtggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaagttagaat 5271255  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5271256 ggtggcaacaccatatttgagtggtctgaacaccataacagagtggttacaataccat----aggtggtttcagtattaaagagtggtcttagcaccata 5271351  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  5271352 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcaatagtgaatcaaacagttgtagttggacttgttttat 5271426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19102446 - 19102065
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19102446 ataatatatgtccattcgaaataaagagtacttttaagatcattgtccctatttggaataacaatgtcctgtcgaaattaagaatgatcttaacggtata 19102347  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  19102346 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaacggtggtatcaccatatttgagtggtcgtatggccatattgatgttttggagaaattaaag 19102247  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  19102246 ttagaatggtggcaacatcatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaaatggttttagtattaaagagtggtcttag 19102147  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||  ||||||||||    
T  19102146 taccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagttggacttgttttat 19102065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19107077 - 19106725
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19107077 ataatatatgtctcttcggaataaagagtacttttaagatcatagcccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaaaaatgatcttaacggtata 19106978  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  19106977 tataaaaaatatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 19106878  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||     
T  19106877 ttagaatggtggcaacaccatatttgagtgttctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaaatggtttctgtattaaagagtgatcttaa 19106778  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaa 363  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19106777 taccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaa 19106725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 73 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47244655 - 47244336
Alignment:
Q  73 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47244655 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacgatatatataaaaagtattttaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttaagt 47244556  T
Q  173 ggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaatac 272  Q
    |||||||    |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47244555 ggtcgtaatgtcatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaatac 47244456  T
Q  273 catattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagt 372  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  47244455 catattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgggggtttaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagt 47244356  T
Q  373 tgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  47244355 tgtagttgtgcttgttttat 47244336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Original strand, 31729024 - 31729394
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    |||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31729024 atgtcccttcagaataaaaagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttatcagtatatataaaa 31729123  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| |||||||||| ||    
T  31729124 agtatatcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaagttagaat 31729223  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31729224 ggttgcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccat----aggtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 31729319  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||    
T  31729320 tttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttat 31729394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16421506 - 16421117
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16421506 ataatataagtccctttggaataaagagtactattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 16421407  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat-------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagttt 197  Q
    ||  || | | |||| |||||||   | ||||||||||||             ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  16421406 ta--aatattctttcgatatttt---aattgaggagaaattaaaagtggaaatggtcgtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatacttt 16421312  T
Q  198 ggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaa 297  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  16421311 ggagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaatacaatattaaagtggtttcaatattaa 16421212  T
Q  298 agagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  16421211 agagtggtcttagtaccatattcgaaggtgtaaatctcggacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttat 16421117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 19540809 - 19541168
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19540809 ataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgctccgttggatttaagaatggtcttaacggtata 19540908  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||  || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||                   ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19540909 ta--aatattattt-aatatttttctaattgaggagaaatggtagt-------------------cgtaataccatattgatagtttggagaacttaaag 19540986  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19540987 ttagaatagtgttaacaccatatttgagtggtctcaacaccatagcagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttag 19541086  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  19541087 taccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaatcgaactgttgtagctggacttgttttat 19541168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 362
Target Start/End: Original strand, 12823662 - 12823878
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12823662 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttggagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 12823761  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||    
T  12823762 agcaccataacagagtggtaacaataccattttaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatattcgaaggtgtaaatctcgaacggtttt 12823861  T
Q  346 ctacagtgtagtagtta 362  Q
    |||||||| ||||||||    
T  12823862 ctacagtgcagtagtta 12823878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31766339 - 31766153
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31766339 ataatatatgtcccttcagaataaaaagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 31766240  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttgg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31766239 tataaaaagtatttcaatatttt--tatttgaggaaaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttgg 31766153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 216 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 55251983 - 55251795
Alignment:
Q  216 atggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtacca 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55251983 atggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtacca 55251884  T
Q  316 tatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgaggtggc 404  Q
    ||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  55251883 tattcaaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgtacagttgtagttgggcttgttttatcctggaggtggc 55251795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31766152 - 31766001
Alignment:
Q  138 tttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttga 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31766152 tttgaggaaaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaatggtattaacaccatatttga 31766053  T
Q  238 gtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttc 289  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31766052 gtggtctcagcaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttc 31766001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Original strand, 48276475 - 48276656
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtctta 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||     
T  48276475 ttagaatggtggtaacaccatattcgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttg 48276574  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48276575 gtaccata-ttggaggtgtaattctcgaatggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgaacttgttttat 48276656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Original strand, 8030302 - 8030483
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtctta 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| ||||| || ||||     
T  8030302 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggtaacagtaccatattaaaatggttttagtattaaaagaatgatcttg 8030401  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8030402 gtatcata-ttggaggtgtaattttcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacatttgtagctgggcttgttttat 8030483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 13065578 - 13065769
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  13065578 gaaattgtgttatcaccatatttgagtggtcgtagtgttatattgatattttg-agaacttaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtagtatc 13065676  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaa 338  Q
    | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  13065677 agcactataacagactgataacaataacatattaaagtggtttcggtattaaagagtggttttagtaccatatttgagggtgtaaatctcgaa 13065769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Original strand, 32081893 - 32082024
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32081893 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttggagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 32081992  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatat 277  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32081993 agcaccataatagagcggtaacaataccatat 32082024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Original strand, 33463182 - 33463363
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtctta 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||     
T  33463182 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagttgtaatagtacaatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggttttg 33463281  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33463282 gtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagttgtgcttgttttat 33463363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15134486 - 15134283
Alignment:
Q  147 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15134486 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcctagtggcatattgatattttggagaacttaaatgttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctt 15134387  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | |||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| | | |||||||||||||||   ||| ||| ||||||||  ||||    
T  15134386 aacaccataatagagtagtcacaatacgatattagagtggttttagtattaaagaatagccttagtaccatatttaagggtataaatctcgaacagtttt 15134287  T
Q  346 ctac 349  Q
    ||||    
T  15134286 ctac 15134283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6943248 - 6942987
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||       ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6943248 ataatatatgtccattcggaataaatagtatttttaagatcatagtccct-tttggaataataatgtcgcgtcggaattaagaatgatcttaatggtata 6943150  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtt 196  Q
    ||  || | | |||||||||||||||| || || ||||||              |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6943149 ta--aatattctttcaatatttttctaattaagaagaaattaaaaagtcaaaatggtgatatcaccatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtt 6943052  T
Q  197 tggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagt 261  Q
    | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6943051 ttgagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtagtctcagcaccataacagagt 6942987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 223 - 392
Target Start/End: Original strand, 33468811 - 33468980
Alignment:
Q  223 taacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttg 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |    
T  33468811 taacaccaaatttgagtggtctcaacatcataatagagttgtaatagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttggtaccatatt-g 33468909  T
Q  322 gaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||| |||  | ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33468910 gaggtgtaattctcaaaccttattcaacagtgcagtagttaatcgaacaattgtagctgagcttgttttat 33468980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19906519 - 19906339
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtctta 309  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||||||     
T  19906519 ttagaatggtgatagcaccatatttgagtgatctcggcaccataatagagtggtaacaataccatattagagtggtttaagtattaaaagaatggtcttg 19906420  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19906419 gtaccata-ttggaggtgtaattttcgaacggttttctaaagcgcagtagtt-atcaaacagttgtagttgagcttgttttat 19906339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40408535 - 40408361
Alignment:
Q  147 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  || |||   |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| ||    
T  40408535 aaatggtggtatcatcgtatttgaattatcatagggtcatattgatattttggagaacttaaagttagaatggtggtggcaccatatttgagtggtccca 40408436  T
Q  247 tcaccataa-cagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatattt 320  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40408435 gcaccataaacagagtgctaacaataccatattaaagtgatttcaatattaaaaagtggtcttagtaccatattt 40408361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 216 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12878502 - 12878315
Alignment:
Q  216 atggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtcttagtacc 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
T  12878502 atggtggtaacaccatatttgagtgttctcaacaccataactgagtggtcaccgtaccatactagagtcgtttcaacattaaaagagtggtcttagtatc 12878403  T
Q  315 atatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgaggtggc 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12878402 ata-ttggaggtgtaattctcgaacggttttctac-gtgcagtaattaacaacacagttgtagctgaacttgttttattctggaggtggc 12878315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 374
Target Start/End: Original strand, 13521756 - 13521978
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||| |||||   |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13521756 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaacatatttgagtggtctc 13521854  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattt 344  Q
    | |||||||| |||||||| | | ||||||||     | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||    
T  13521855 aacaccataatagagtggtcatagtaccatat-----tggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttaaaagtgtaattctcgaacggttt 13521948  T
Q  345 tctacagtgtagtagttaatcgaacagttg 374  Q
    ||||||||| |||||| || || |||||||    
T  13521949 tctacagtgcagtagtcaaccgtacagttg 13521978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Original strand, 7902923 - 7903094
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||     | |||||||||||    
T  7902923 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtatt 7903017  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttg-gaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||   || ||||||||||||  | ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  7903018 aaagagtggtcttagtaccatattagagagtgttatttctcgaacgatcatatacggtgcagtatttaatcgaacag 7903094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 343
Target Start/End: Original strand, 31298157 - 31298348
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31298157 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaagtaccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaaaaccatatttgagtggtctca 31298255  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgatt 343  Q
     |||||||  |||||||| ||||||||||||     | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  31298256 acaccatagtagagtggtcacaataccatat-----tggtttcaatattaaagagtggttatagtaccatatttgatggtgttatttctcgaacgatt 31298348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34560704 - 34560588
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||     | |||||| ||||    
T  34560704 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcaatatt 34560610  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34560609 aaagagtggtcttagtaccata 34560588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 392
Target Start/End: Original strand, 8649473 - 8649637
Alignment:
Q  223 taacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttg 321  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  8649473 taacaccatatctaaatggtctcaacatcataatagagtggtcacagtaccatattg-----gtttcagtattaaaagagtggtgttagtaccatatt-g 8649566  T
Q  322 gaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||||    
T  8649567 aaggtgtaattctcgaacagttttctacagtgtagtagttaaccgcacagttgtagttaggcttgttttat 8649637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 392
Target Start/End: Original strand, 8661280 - 8661444
Alignment:
Q  223 taacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttg 321  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  8661280 taacaccatatctaaatggtctcaacatcataatagagtggtcacagtaccatattg-----gtttcagtattaaaagagtggtgttagtaccatatt-g 8661373  T
Q  322 gaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||||    
T  8661374 aaggtgtaattctcgaacagttttctacagtgtagtagttaaccgcacagttgtagttaggcttgttttat 8661444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 47574984 - 47574817
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47574984 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 47574886  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatt 319  Q
     |||||||| |||||||| | | ||||||||     | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47574885 acaccataatagagtggtcatagtaccatat-----tggtttcagtattaaaagagtggtcatagtaccatatt 47574817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Original strand, 3997874 - 3998045
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||     | |||||||||||    
T  3997874 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataataaaatggtagcaataccatat-----tggtttcagtatt 3997968  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    ||||| |||| |||||||||||||    |||| || ||||||||||||  | ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  3997969 aaagaatggttttagtaccatattatagggtgttatttctcgaacgatcatatacggtgcagtatttaatcgaacag 3998045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23093434 - 23093293
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||   |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| || |||||| |||||   ||||||| |    
T  23093434 aatggtggtatcaccattttttagcggtcgcagtgtcatattgatattttagagaacttaaaggttagaatgatgataacactatattctggtggtctta 23093335  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagttt 288  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23093334 gcaccataatagagtggttacaataccatattaaagtagttt 23093293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 375
Target Start/End: Original strand, 42758514 - 42758745
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| | | |  |||||||||| | ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  42758514 aatggtggtagcgccatatttgagtgattgaaataccatattgaca-tttggagatgttaaaagttagaatggtggtaacaccatatttaaatggtctca 42758612  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaag---agtggtcttagta-ccatatttggaggtgtaattctcgaacgat 342  Q
      ||||||| ||| |||| ||| ||| |||| | ||| |  ||||||| |||    |||||  ||| || |||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  42758613 gtaccataatagaatggtcacagtacgatataatagtggggtcagtatcaaattaaagtggctttaatagccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 42758712  T
Q  343 tttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42758713 tttctacagtgcagtagttaatcgcacagttgt 42758745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39319893 - 39319735
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcat 247  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |       ||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  39319893 aatggtagtaacaccatatttgagtggtcatagtaccataat-------tggagaagttaaaattaaaatggtggtaacaccatatttgagtgttctcag 39319801  T
Q  248 caccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatat 318  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| ||||     | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39319800 caccataatagaatggtcacaatactatat-----tggtttcagtattgaagagtgatcttagtaccatat 39319735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41817109 - 41816919
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcat 247  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||||| |||||  | | ||| || ||||| ||||||| | ||||||||     
T  41817109 aatggttgtagcaccatatttgagtggttgaagtaccatattgata-cttggagaagttaaaaattgaatgatggtaacatcatattttaatggtctcaa 41817011  T
Q  248 caccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgatt 343  Q
    |||||||| |||||||||| || |||| ||     | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||    
T  41817010 caccataatagagtggtaataacaccacat-----tggtttcaacattaaagagtggtcttagtaccatattagagggtgttatttctcgaacgatt 41816919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 55252130 - 55252029
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||        ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  55252130 ataatataagtcccttcggaataaagaatactattaagatcatagtccctttttggaataataatgtcccgtcagaattaagaatgattttaacggtata 55252031  T
Q  111 ta 112  Q
    ||    
T  55252030 ta 55252029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 286 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12874733 - 12874627
Alignment:
Q  286 tttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagct 384  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||    
T  12874733 tttcagtattaaaagggtggtcttactaccatatt-ggaagtgtaattcattaacggttttctacagtgtagtagttaaccgcacaattttagctgagct 12874635  T
Q  385 tgttttat 392  Q
    ||||||||    
T  12874634 tgttttat 12874627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 270 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4551203 - 4551085
Alignment:
Q  270 taccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaac 369  Q
    |||||||||| ||| |||||||||    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||||| |     
T  4551203 taccatattagagtggtttcagta----agaatggtcttagtaccatatttgatggtgtaaatcttaaacggttttctacagtgcagtagttaatcgcag 4551108  T
Q  370 agttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||  |||| |||||||||    
T  4551107 agttgtaattgagtttgttttat 4551085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32545291 - 32545183
Alignment:
Q  285 gtttcagtattaaagagtg--gtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgag 382  Q
    |||||||||||||| || |  ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||    
T  32545291 gtttcagtattaaatagagcagtcttagtaacatatt-ggagttgtaattctcgaacgattaattacagtgcagtagttagtcgcacaattgtagttgag 32545193  T
Q  383 cttgttttat 392  Q
    ||||||||||    
T  32545192 cttgttttat 32545183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 264
Target Start/End: Original strand, 52690891 - 52691008
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||| || |||||| ||| |||||||||||||    
T  52690891 aatggtggtagcatcgtatttgagtggtcgtagtaccatatcgatattttggaaaagttaaatgttagaatgatgataacacaataattgagtggtctca 52690990  T
Q  247 tcaccataacagagtggt 264  Q
    | || |||| ||| ||||    
T  52690991 ttactataatagaatggt 52691008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 340
Target Start/End: Original strand, 55810142 - 55810233
Alignment:
Q  248 caccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacg 340  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  55810142 caccataagagtgtggtaacaatactatcttaaa-tggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttgaacgtgtaattctcgaacg 55810233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Original strand, 39217184 - 39217272
Alignment:
Q  159 caccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagtt-aggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || || ||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  39217184 caccatatttgaatggtcgtagtaccatattgatattttggagaagttaaaattcagaatgatcgaaacaccatatttgagtggtctca 39217272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4551305 - 4551242
Alignment:
Q  147 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  4551305 aaatggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtgccacattgatattttggacaacttaaag 4551242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 12823519 - 12823638
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||       |||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  12823519 ataatataagtcctttcggaataaagagtattattaagatcatagaccct-tttggaataataatgttccgtcggaattaagaatgatcttaacag--ta 12823615  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttt 133  Q
    |||||| | | ||||||||||||    
T  12823616 tataaatattctttcaatatttt 12823638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2820024 - 2819932
Alignment:
Q  300 agtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||| | | |||||||||| | ||||||||||    
T  2820024 agtggtcttagtgtcatatttgagggtgtaaatctcgaacgattttctatagtgcaacagttaattgcatagttgtagctaaacttgttttat 2819932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40840488 - 40840431
Alignment:
Q  319 ttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtag 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  40840488 ttggaggtgtaattctcgaacgattttct-tagtgcagtggttaatcgcacagttgtag 40840431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 392
Target Start/End: Original strand, 32082029 - 32082098
Alignment:
Q  323 aggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||| || ||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||    
T  32082029 aggtgtaaatctcgaatggttttctacactgcagtagttaaccgcacaattgtaactgagcttgttttat 32082098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47574782 - 47574713
Alignment:
Q  323 aggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  47574782 aggtgtaattctcgaacagttttctacatggcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttat 47574713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16948157 - 16948089
Alignment:
Q  324 ggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||    
T  16948157 ggtgtaattctagaatgattagctacagtgtagtagttaatcgcacagttgtcaatgaacttgttttat 16948089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 348
Target Start/End: Original strand, 39217262 - 39217356
Alignment:
Q  258 gagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa---gagtggtcttagta-ccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttcta 348  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  39217262 gagtggtctcaataccatataacagtggtttcagtattaaattcgagtggtcttaatagccatgtttgagggtgtaagtctcgaacgattttcta 39217356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 103
Target Start/End: Original strand, 1150949 - 1150979
Alignment:
Q  73 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1150949 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaa 1150979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 29167600 - 29167980
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29167600 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 29167699  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29167700 tatcaaaagtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatagtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 29167798  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29167799 ttagaatggtgttaacaccatatttgagcggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 29167898  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29167899 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagttgggcttgttttat 29167980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 11 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 36424106 - 36423717
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36424106 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgttccgtcggaattaataatgatcttaagggtata 36424007  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36424006 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 36423907  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36423906 ttagaatggtgttaataccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 36423807  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgagg 400  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36423806 caccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcattagttaatcaaacagtagtagctgggcttgttttattctggagg 36423717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36429178 - 36428797
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36429178 ataatatatgtcccttcagaataaagagtatttttaagatcatagtacctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 36429079  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36429078 tataaaaagtattttaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagttgtcgtattaccatattgatagtttggagaacttaaag 36428979  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36428978 ttagaatggtgttaacatcatatttgagtggtctcaacactataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 36428879  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36428878 aaccatatttggaggtgtaattctcgagcgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 36428797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26667741 - 26667360
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26667741 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 26667642  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  26667641 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccattttggtagtttgtagaacttaaag 26667542  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26667541 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 26667442  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  26667441 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctagagtgcagtagttaatcgaacagttgcagctggacttgttttat 26667360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26939338 - 26938957
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26939338 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 26939239  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  26939238 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtggtaccattttggtagtttgtagaacttaaag 26939139  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26939138 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtgataacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 26939039  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  26939038 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctagagtgcagtagttaatcgaacagttgcagctggacttgttttat 26938957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40148364 - 40147983
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40148364 ataatatatgtcccttcagaataaaaagtacttttaagatcattgtccctatttggaataacaatgtctcgtcggaattgagaatgatgttaacggtata 40148265  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  40148264 tgtaaaaaatatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 40148165  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||| |  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  40148164 ttagaatgggggcaacaccatatttaagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcgtag 40148065  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  40148064 taccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgtagtagttaattgaacaattgaagctgagcttattttat 40147983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7452216 - 7451846
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7452216 atgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcaaaattaagaatgatcttaacagtatatataaaa 7452117  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| |||||||||| ||    
T  7452116 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccgtatttgagtggtcgtagtgccatattgaagttttggagaaattaaagttagaat 7452017  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7452016 ggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccat----aggtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 7451921  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  7451920 tttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgtagtagttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttat 7451846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 49 - 392
Target Start/End: Original strand, 35679540 - 35679882
Alignment:
Q  49 atcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaa 148  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35679540 atcatagtccctttttggaataataatgtcgcgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaa 35679639  T
Q  149 atggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  35679640 atggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctgaac 35679739  T
Q  249 accataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttcta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  35679740 accataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttcta 35679839  T
Q  349 cagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    || || | |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||    
T  35679840 caatgca-tagttaactgcacagttgtagttgagcttgttttat 35679882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 37248431 - 37248802
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37248431 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtata 37248530  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37248531 tataaaaagtatttcaatattttt-tatttgagaagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 37248629  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37248630 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggta--------atattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 37248721  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  37248722 taccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctatagtacagta-ttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttat 37248802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12103494 - 12103113
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12103494 ataatatacgtgccttcagaatatagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatatcctgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 12103395  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  12103394 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttaagtagtcgcagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 12103295  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12103294 ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaataccataacagagtggtaacaataccattttaaagtggtttcagtattaaagagtgatcttag 12103195  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  12103194 taccatatttaagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgcacatttgtagttgggcttgttttat 12103113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 37549779 - 37550014
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37549779 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 37549878  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37549879 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtaccatattgatagtttagagaacttaaag 37549978  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37549979 ttagaatgatattaacaccatatttgagtggtctca 37550014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 37652577 - 37652812
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37652577 ataatatatgtcccttcagaataaagagcacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaataatgatcttaacggtata 37652676  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37652677 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtaccatattgatagtttagagaacttaaag 37652776  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37652777 ttagaatgatattaacaccatatttgagtggtctca 37652812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 91 - 392
Target Start/End: Original strand, 10759527 - 10759827
Alignment:
Q  91 agaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattg 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  10759527 agaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatacttttcaatttgaggagaaaaggtggtatcaccgtatttgagtgctcgtagtgccatattg 10759626  T
Q  191 atagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttca 290  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10759627 atgttttggagaaattaaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccacattaaagtggtttca 10759726  T
Q  291 gtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgtttt 390  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| || |||||||||  || |||||||||    
T  10759727 gtatgacagagtggtcttagtaccatatttgagggtataattctcgaacggttttctaccgtgca-tagttaaccgcacagttgtaaatgggcttgtttt 10759825  T
Q  391 at 392  Q
    ||    
T  10759826 at 10759827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Original strand, 6155181 - 6155426
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaactta--aagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||| |||  || |||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6155181 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttagaaaattaaaatgttggtaacaccatatttgagtggtctc 6155279  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6155280 aacaccataacagagtggtaacaataccaaattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggtttt 6155379  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6155380 ctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 6155426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 73 - 392
Target Start/End: Original strand, 20180739 - 20181070
Alignment:
Q  73 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtat 158  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  || | |  ||||||||||||||| ||||||||||||              ||||||||    
T  20180739 aatgtcccttcaaaattaagaatgatcttaacggtatata--aatattcattcaatatttttctaattgaggagaaattaaaaagtgaaaatggtggtat 20180836  T
Q  159 caccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacag 258  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20180837 caccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacag 20180936  T
Q  259 agtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagta 358  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  20180937 aatggtagcaataccgtattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttggtatcatatttgagggtgtaaatctcgaacagttttctacagtgcagta 20181036  T
Q  359 gttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  20181037 gttaaccgcacaattgtagttgagcttgttttat 20181070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 219 - 392
Target Start/End: Original strand, 12501733 - 12501906
Alignment:
Q  219 gtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12501733 gtgttaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcggtattaaatagtggtcttagtatcatat 12501832  T
Q  319 ttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12501833 ttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaaccgaacagttgtagctgggcttgttttat 12501906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 557021 - 556783
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  557021 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 556924  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttc 346  Q
     ||||||||  ||||||| |||||||||||||      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  556923 acaccataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattatagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttc 556829  T
Q  347 tacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  556828 tacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 556783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 561793 - 561555
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  561793 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 561696  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttc 346  Q
     ||||||||  ||||||| |||||||||||||      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  561695 acaccataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattatagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggttttc 561601  T
Q  347 tacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  561600 tacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 561555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 9726382 - 9726557
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9726382 ataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaaaggtata 9726481  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccata 187  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9726482 ta-aaaaattatttcaatatttttttatttgaggagaaatggtggaatcaccatatttgagtggtctcagcaccata 9726557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39523317 - 39523137
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39523317 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat-agagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 39523219  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||    
T  39523218 taccatatttggaggtgtaattcttgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttat 39523137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 223 - 400
Target Start/End: Original strand, 11981118 - 11981295
Alignment:
Q  223 taacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatttg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||     
T  11981118 taacaccatatttgagtggtctcatcaccacaatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcggtattaaaagaatggtcttggtaccata-tta 11981216  T
Q  322 gaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgagg 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  11981217 gaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcaatagttaatcgaacagttgtagatgtgcttgttttattctggagg 11981295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39518678 - 39518498
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39518678 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat-agagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 39518580  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||    
T  39518579 taccatatttggaggtgtaattcttgaacggttttctacactgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttat 39518498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Original strand, 34707299 - 34707500
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | |     
T  34707299 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggatttagtatcatattgatagttttgagaacttaaagttagaatagtgataacaccatatttgagtgatttt 34707398  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | |||||||||||| || |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||    
T  34707399 agcaccataacagaatgataacaataacatattaaaatgatttcagtattaaagagtggtcttagtaccatattt-aaggtgtaaatctcgaacggtttt 34707497  T
Q  346 cta 348  Q
    |||    
T  34707498 cta 34707500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Original strand, 16116011 - 16116256
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcat 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |     
T  16116011 aatggtggtatcatcatatttgagtggttgtagtaccatattgatagtttgaagaacttaaaggtagaatggtgataacatcatatttgagtggtcttaa 16116110  T
Q  248 caccataacagagtg--gtaacaataccatatt--aaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatt 343  Q
    |||||||| ||||||  || |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  16116111 caccataatagagtggtgtcacaataccatattagaaagcggtttcagtattaaagagtg--attagtatcata-ttggatgtgtaattctcgaacggtt 16116207  T
Q  344 ttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||| |||| |||||||||  | || ||||||| ||| ||||||||||    
T  16116208 ttctatagtgcagtagttaacagtactgttgtagttgaacttgttttat 16116256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4872191 - 4872010
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtctta 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||     
T  4872191 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcttagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcattattaaaagaatggtcttt 4872092  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4872091 gtaccata-ttgaaggtataattctcaaacggttttctacagtacagtagttaatcgaacagttgtagttgagcttgttttat 4872010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Original strand, 36937280 - 36937518
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36937280 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 36937377  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     || |||||  ||||||| |||||||||||||      |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  36937378 acatcataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtttt 36937471  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36937472 ctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 36937518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Original strand, 36942034 - 36942272
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36942034 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 36942131  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     || |||||  ||||||| |||||||||||||      |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  36942132 acatcataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtttt 36942225  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36942226 ctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 36942272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 229 - 392
Target Start/End: Original strand, 6514444 - 6514608
Alignment:
Q  229 catatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtg 327  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6514444 catatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaatacaatatcaaagtggtttcaatattaaaagagtggttttagtaccatatttgaaggtg 6514543  T
Q  328 taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  6514544 taaatctcgaatgattttctacaatgcagtagttaaccacacagttgtagctaagcttgttttat 6514608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 363
Target Start/End: Original strand, 15414647 - 15414859
Alignment:
Q  151 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatca 249  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||  | ||    
T  15414647 ggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttgaagaacttaaatgttagaatggtgataacaccatattttagtggtcataaca 15414746  T
Q  250 ccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctac 349  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||| |||  ||  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| | |||||||     
T  15414747 ccataacagagtggtcaaggtaccatattagagtgattctagtattaaagattggtcttagtagcata-ttggaggtgtaaatttcgaaaggttttctat 15414845  T
Q  350 agtgtagtagttaa 363  Q
    |||| |||||||||    
T  15414846 agtgcagtagttaa 15414859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Original strand, 32461316 - 32461556
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||| ||| |||||||||| || ||| | |  |||||||||||| ||||||||| |||||   |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32461316 aatggtcgtaacaccatattttagcggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 32461414  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattt 344  Q
    | |||||||| |||||||| | | |||||||||      ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  32461415 aacaccataatagagtggtcatagtaccatattg-----gtttcagcattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttt 32461508  T
Q  345 tctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  32461509 tctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgaacttgttttat 32461556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 193 - 392
Target Start/End: Original strand, 12102637 - 12102838
Alignment:
Q  193 agtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatca-ccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcag 291  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  12102637 agtttggagaacttaaagttagaatggtggtaacaccatatttaagtggtctcaaaaaccataacagagtggtaacaatgtcatattaaagtggtttcag 12102736  T
Q  292 tattaaagagtggtcttagtac----catatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||| || || | |||| ||||||||   ||||||||||| || |||||||||| ||  |||||    
T  12102737 tattaaagagtggtcttagtacataccatatttgagggtgaaaatcccaaacggttttctac---gtagtagttaaccgcacagttgtagttggtcttgt 12102833  T
Q  388 tttat 392  Q
    |||||    
T  12102834 tttat 12102838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Original strand, 12044907 - 12045146
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||| |||||  |||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12044907 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaaaggtggtaacaccatatttgattggtctca 12045005  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     |||||||| |||||||  | | |||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |  |    
T  12045006 acaccataatagagtggccatagtaccatattg-----gtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtagt 12045099  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||    
T  12045100 ctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctatgcttgttttat 12045146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 392
Target Start/End: Original strand, 12041772 - 12041939
Alignment:
Q  225 acaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatttgga 323  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||| |||||    
T  12041772 acaccatatttgagtagtcttagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaatgtggtttcagtattaaaagaatgtacttggtaccata-ttgga 12041870  T
Q  324 ggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12041871 ggtgtaattctcgaacagttttttatagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctggacttgttttat 12041939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 226 - 397
Target Start/End: Original strand, 9726529 - 9726699
Alignment:
Q  226 caccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggagg 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  | |    
T  9726529 caccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacaataccatatgaaaatggtttcagtattaaagaatggtcttaataccatattt-aaag 9726627  T
Q  326 tgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttg 397  Q
    |||||  || ||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||  |||||| |||| ||||    
T  9726628 tgtaaaccttgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtaactatgcttgtcttatacttg 9726699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 271 - 392
Target Start/End: Original strand, 41587048 - 41587167
Alignment:
Q  271 accatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaaca 370  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||    
T  41587048 accatattaaagtggtttcagtgttaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaat--tcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcaca 41587145  T
Q  371 gttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41587146 gttgtagctgagcttgttttat 41587167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 42001755 - 42001522
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42001755 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 42001658  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     ||||||||  ||||||| ||||||||||||     | |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42001657 acaccataattgagtggttacaataccatat-----tggtttcagtgttaaaagattggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggtttt 42001564  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||     ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  42001563 ctac-----agtagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttat 42001522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41996986 - 41996753
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41996986 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 41996889  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     ||||||||  ||||||| ||||||||||||     | |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41996888 acaccataattgagtggttacaataccatat-----tggtttcagtgttaaaagattggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggtttt 41996795  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||     ||||||||| || |||||||||| || |||||||||||    
T  41996794 ctac-----agtagttaaccgcacagttgtagttgggcttgttttat 41996753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 196 - 319
Target Start/End: Original strand, 13301299 - 13301417
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||     | |||||||||||    
T  13301299 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaccaataccatat-----tggtttcagtatt 13301393  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13301394 aaagagtggtcttagtaccatatt 13301417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 218 - 371
Target Start/End: Original strand, 21323805 - 21323954
Alignment:
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||     | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21323805 ggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtattaaagactggtcttagtaccata 21323899  T
Q  318 tttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    || |  |||| || ||||||||||||  | ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  21323900 ttagagggtgttatttctcgaacgatcatatacggtgcagtatttaatcgaacag 21323954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31731821 - 31731650
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||     | |||| ||||||    
T  31731821 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaataccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttaagtatt 31731727  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |  |||| || ||||||||||||  | ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  31731726 aaagagtagtcttggtaccatattagagggtgttatttctcgaacgatcatatacggtgcagtatttaatcgaacag 31731650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 3666127 - 3666008
Alignment:
Q  285 gtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagc 383  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |    
T  3666127 gtttcagtattaaaagagtggtattagtaccatatt-gaaggtgtaattcccgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagttggac 3666029  T
Q  384 ttgttttattcttgaggtggc 404  Q
    ||||||||| || ||||||||    
T  3666028 ttgttttatcctagaggtggc 3666008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 6513544 - 6513768
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  6513544 ataatataagtcccttcggaataaagagtgctattaagatcatagtccct-tttggaatat-aatgtcccgtcataattaagaatgatcttaaaggtata 6513641  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga--------------gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtt 196  Q
    ||  || | | |||||||||||||||| |||||||              |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  6513642 ta--aatattctttcaatatttttctaattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtat--ccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactt 6513737  T
Q  197 tggagaacttaaagttaggatggtgttaaca 227  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  6513738 tggagaaatgaaagttagaatggtggtaaca 6513768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Original strand, 15414496 - 15414597
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||       ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15414496 ataatttatgtcccttcaaaataaagagtacttgtaagatcatagttcctttttggaataataatgtctcgtcggaatcaagaatgatcttaacagtata 15414595  T
Q  111 ta 112  Q
    ||    
T  15414596 ta 15414597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3666237 - 3666139
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3666237 aatggttgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttagatgttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 3666139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7086693 - 7086595
Alignment:
Q  145 agaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtc 243  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7086693 agaaatggtggtagcatcatatttgagtgattgtaataccatattgata-tttggagatgttaaaggttagaatggtgataacaccatatttgagtggtc 7086595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 321
Target Start/End: Original strand, 1429827 - 1429931
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| ||||||||| ||     | |||||| ||||||||| |||||||||    
T  1429827 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataa-ataatggtcacaataccacat-----tggtttcaatattaaagaatggtcttag 1429920  T
Q  311 taccatatttg 321  Q
    |||||||||||    
T  1429921 taccatatttg 1429931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4872187 - 4872148
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccata 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4872187 aatggtggtaacaccatatttgagtggtcttagcaccata 4872148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 214
Target Start/End: Original strand, 23977359 - 23977424
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttag 214  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  23977359 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaagtaccatattgata-tttggagaagttaaaattag 23977424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 16115861 - 16115955
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaa-taacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaac 104  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||       ||||||||||||| | ||| ||| ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  16115861 ataatatacatcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccattttttgaaataataatgtcctgtcagaattaagaatgatcttaac 16115955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9911409 - 9911369
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatat 188  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9911409 aatggtggtaacatcatatttgagtggtcttagcaccatat 9911369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39518674 - 39518634
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatat 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39518674 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat 39518634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 39518962 - 39518880
Alignment:
Q  19 tgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||       |||| ||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39518962 tgtcccttcggaataaagagtgttcttaagaccatagtccctattcggtttaa--atgtcccttcggaattaagaatggtcttaa 39518880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39523313 - 39523273
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatat 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39523313 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat 39523273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 39523601 - 39523519
Alignment:
Q  19 tgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||       |||| ||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39523601 tgtcccttcggaataaagagtgttcttaagaccatagtccctattcggtttaa--atgtcccttcggaattaagaatggtcttaa 39523519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 19892100 - 19892473
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||      |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19892100 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaat------gtctagtcggaattaagaatgatcttaacggtata 19892193  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  19892194 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccat--tgatagtttggagaatttaaag 19892291  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19892292 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtcttagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 19892391  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19892392 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 19892473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18344891 - 18344519
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18344891 ataatatatgtcccttcagaataaatagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 18344792  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18344791 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatctgagaggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 18344692  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||         | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  18344691 ttagaatggtattaacaccatatttgagtggtctcagcgccataacagagtggtaacaat---------atgtggtttcagtattaaatagtggtcttag 18344601  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18344600 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 18344519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Original strand, 1934627 - 1935000
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1934627 atgtcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 1934726  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1934727 agtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatatgagtgatcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaagttagaat 1934825  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1934826 ggtatgaacaccatatttgagtggtctcagaaccttaacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 1934925  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  1934926 tttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcattagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttat 1935000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 400
Target Start/End: Original strand, 25477924 - 25478312
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477924 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtacttatttgaaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 25478023  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  25478024 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 25478123  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25478124 ttagaatggtggtaacatcatatttgagtagtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 25478223  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgagg 400  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25478224 tactatatttgagggtgtaattcttgaacggttttctacagtgca-tagttattcgcacagttgtagctgggcttgttttattctggagg 25478312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28603764 - 28603393
Alignment:
Q  16 atatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataa 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  28603764 atatgtcgcttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtatata--a 28603667  T
Q  116 aaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttagg 215  Q
    | | ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  28603666 atattatttct-tatttttctaattgaggagaaatggtggtatcatcatatttgagtggtcgtagtaccatattaatagtttggagaacttaaagttaga 28603568  T
Q  216 atggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtacca 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28603567 atggtgttaacaccatatttaagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaatattaaaaagtggtcttagtacca 28603468  T
Q  316 tatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgtttt 390  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28603467 tatttggaggtgtaattcttgaacggttttttacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgaacttgtttt 28603393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Original strand, 9180361 - 9180731
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9180361 atgtcccttcaggataaagagtacttttaagatcatagttcctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 9180460  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||    
T  9180461 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgctatattgatgttttggagaaattaaagttagaat 9180560  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9180561 ggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccat----aggtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 9180656  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9180657 tttgagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcaaacagttgtagctgggcttgttttat 9180731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 25496952 - 25497332
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25496952 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtacttatttggaataacaatgtcacgtcggaattaagaatgattttaacggtata 25497051  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  25497052 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgaggggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 25497151  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25497152 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaataataccatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttag 25497251  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25497252 tatcatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca-tagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttat 25497332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 31327218 - 31326815
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31327218 ataatatatgtcccttcgaaataaaaagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaatggtata 31327119  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  31327118 tataaaaagtatttcaatatgtttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 31327019  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagt-----------ggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaag 299  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||           |||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  31327018 ttagaatggtgacaacaccatatttgagtggttgtagaacggtggcaacaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaat 31326919  T
Q  300 agtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgag 399  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  31326918 agtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttcta-agtgcagtagttaatcgcacagttgtagttgggcttgttttatcctggag 31326820  T
Q  400 gtggc 404  Q
    |||||    
T  31326819 gtggc 31326815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12797393 - 12797013
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12797393 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcataatccctgtttggaataacaatgtcccgtcagaattaaaaatgatcttaacgatata 12797294  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||      
T  12797293 tataaaaagtgtttcaatatttttctattcgaggagaaatgatg-tatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaata 12797195  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12797194 ttagaatggtggcaataccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccatattaaggtggtttcagtattaaagagtggtcttag 12797095  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||    
T  12797094 taccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacggtgcagtagttaaccgcacagttgtagccggacttgttttat 12797013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 151 - 392
Target Start/End: Original strand, 9189573 - 9189810
Alignment:
Q  151 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9189573 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacac 9189672  T
Q  251 cataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctaca 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9189673 cataacagagtggttacaataccatag----gtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttctaca 9189768  T
Q  351 gtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9189769 gtgcagtagttaatcaaacagttgtagctgggcttgttttat 9189810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30651197 - 30651017
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30651197 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat-agagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 30651099  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30651098 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacggtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 30651017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 404
Target Start/End: Original strand, 17544975 - 17545317
Alignment:
Q  73 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtat 158  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  || | | |||||||||||||||||||||||||||||              ||| ||||    
T  17544975 aatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaacagtatata--aatattctttcaatatttttctatttgaggagaaattaaaaagtcgaaaaggtagtat 17545072  T
Q  159 caccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacag 258  Q
    || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  17545073 catcatatttgagtgttcgtaataccatattgatagtttagagaacttaaagttagaatggtggtaacaccatattttagtggtctcagcaccataacaa 17545172  T
Q  259 agtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagta 358  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||   ||    
T  17545173 agtggtaacaata-tagattaaagtggtttccgtattaaagagtggtcttagtatcatatttgagggtgtaaatctcgaatgattttctacaatgcgtta 17545271  T
Q  359 gttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgaggtggc 404  Q
    ||||| || || ||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  17545272 gttaaccgcactgttgtagatgtgcttgttttatcctcgaggtggc 17545317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29678036 - 29677855
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  29678036 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtatcaatattaaagagtggtcttag 29677937  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||    
T  29677936 taccatatttgtgggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgggctttttttat 29677855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Original strand, 40847360 - 40847563
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  40847360 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtatcatcttgatagtttggagaacttaaagttagaatggacgtaacatcatatttgagtggtctc 40847459  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagt-accatatttggaggtgtaattctcgaacgattt 344  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||   |||||| ||||||||| |||    
T  40847460 aacaccattacaaagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttggtaaccatatttgagagtgtaaatctcgaacggttt 40847559  T
Q  345 tcta 348  Q
    ||||    
T  40847560 tcta 40847563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 17968590 - 17968751
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17968590 ataatatatgtcccttcaaaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgttggaattaagaatgatcttcacggtata 17968689  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtg 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17968690 tataaaaagtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtg 17968751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Original strand, 9185052 - 9185190
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    |||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185052 atgtcccttcaggataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 9185151  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185152 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggt 9185190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 159 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35602238 - 35602010
Alignment:
Q  159 caccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataaca 257  Q
    ||||||||||||||||| | |  ||||||||| || ||||||||| |||||  |||| ||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  35602238 caccatatttgagtggttgaaataccatattggta-tttggagaagttaaaaattagaattttggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataata 35602140  T
Q  258 gagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagt 357  Q
    ||||||| | | |||||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  35602139 gagtggtcatagtaccatattg-----gtttcaatattaaagagtggtcttagtaccatatttggatgtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagt 35602045  T
Q  358 agttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  35602044 agttaatcgaacaattgtagctgggtttgttttat 35602010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Original strand, 7737677 - 7737858
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtctta 309  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||     
T  7737677 ttagcatggtggtaacaccatgtttgagtggtctcaacaccataatagagtggtgacaatatcatattaaagtgatttcagtattaaaagaatggttttg 7737776  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  7737777 gtatcata-ttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcaatagttaatcgaacaattgtagttgggcttgttttat 7737858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 150 - 392
Target Start/End: Original strand, 10160495 - 10160731
Alignment:
Q  150 tggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatc 248  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || | |  |||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10160495 tggtcgtaacaccatatttgagtagttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaataccatatttgagtggtctcaac 10160593  T
Q  249 accataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttct 347  Q
    |||| || |||||||| | | ||||||||| |     ||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  10160594 accaaaatagagtggtcatagtaccatattga-----tttcagtattaaaagaatggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttct 10160687  T
Q  348 acagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  10160688 acagtgca-tagttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttat 10160731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 391
Target Start/End: Original strand, 21523571 - 21523726
Alignment:
Q  227 accatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggt 326  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21523571 accatatttgagtggtcttaacacgataatagagtggtg----taccatattaaagtagtttaagttttaaagagtggtcttagtaccatatttgagggt 21523666  T
Q  327 gtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgtttta 391  Q
    |||| ||||||||||||||||||     ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  21523667 gtaaatctcgaacgattttctac-----agtagttaaccgcacagttgtagctgaacttgtttta 21523726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 363
Target Start/End: Original strand, 17453348 - 17453557
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttg-gagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |  |  ||||||||| |||  ||||  |||||  |||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17453348 aatggtcgtatcaccatatttgagtggttgaaatattatattgatatttttagagatgttaaaaattagaatgatgataacaccatatttgagtggtctc 17453447  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||||     ||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17453448 aacaccataatagagtggttacaataccatat-----tagtttca--attatagaatggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggtttt 17453539  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaa 363  Q
    |||||||| |||||||||    
T  17453540 ctacagtgcagtagttaa 17453557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 363
Target Start/End: Original strand, 19578180 - 19578392
Alignment:
Q  150 tggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatc 248  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||   ||||| | |||| | | |    
T  19578180 tggttgtatcaccatatttgaatggtcgtagcaccgtattgataatttagagaacttaaatgttagaatggtgataacaatttatttaaatggtataaac 19578279  T
Q  249 accataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttcta 348  Q
    | ||||| |||||||| | | |||||||||| |||  ||| |||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19578280 agcataatagagtggtta-agtaccatattagagtgattttagtattaaagagtgattttaataccata-ttgaaggtgtaaatctcgaacgattttcta 19578377  T
Q  349 cagtgtagtagttaa 363  Q
    ||||| | |||||||    
T  19578378 cagtgcaatagttaa 19578392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 390
Target Start/End: Original strand, 19094256 - 19094499
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | | |  |||||||||| | ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| | |||||||     
T  19094256 aatggtggtagcaccatatttgagtgattgaaataccatattgaca-tttggagatattaaaagttagaatggtggtaacatcatatttaaatggtctcg 19094354  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa---gagtggtcttagta-ccatatttggaggtgtaattctcgaacgat 342  Q
    | ||||||   || |||| | | |||||||| | | | ||||||||||||||   |||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  19094355 ttaccata---gaatggtcatagtaccatataataatggtttcagtattaaattggagtggccttaatagccatatttgagggtgtaattctcgaacggt 19094451  T
Q  343 tttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgtttt 390  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19094452 tttctacagtgcagtaattaatcgcacagttgtagctgagcttgtttt 19094499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28855330 - 28855112
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaactt-aaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||| |||| || ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  28855330 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaagtaccatattgatattttg-agaagttcaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggttgca 28855232  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgatttt 345  Q
     |||||||  ||| |||| ||||||||||||     | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||| |    
T  28855231 gcaccatagtagaatggtcacaataccatat-----tggtttcagtatt-aagagtgatcttagtaccatatctgagggtgttatttctcgaacgattat 28855138  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||    
T  28855137 ttacggtgtagtacttaatcgaacag 28855112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Original strand, 6297703 - 6297874
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||     | |||||||||||    
T  6297703 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacaacataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtatt 6297797  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |  |||| || ||||||||||||  | ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  6297798 aaagaatggtcttagtaacatattagagggtgttatttctcgaacgatcatatacggtgcagtatttaatcgaacag 6297874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19538711 - 19538493
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaact-taaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||| |  ||| |||| |||||  |||||||||| | ||||||||| |    
T  19538711 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagtaaaaaattagaatggtagtaacaccataatagagtggtctta 19538613  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttg-gaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     |||||||| |||||||| ||| ||||||||     | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||   || ||||||||||||| |    
T  19538612 gcaccataatagagtggtcacattaccatat-----tggtttcagtattaaagagtgatcttaataccatattagagagtgttatttctcgaacgattat 19538518  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaaca 370  Q
     ||| |||||||| |||||||||||    
T  19538517 ttacggtgtagtacttaatcgaaca 19538493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30658458 - 30658351
Alignment:
Q  285 gtttcagtattaaaga-gtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagc 383  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||    
T  30658458 gtttcagtattaaaaaagttgtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggc 30658360  T
Q  384 ttgttttat 392  Q
    |||||||||    
T  30658359 ttgttttat 30658351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29677554 - 29677481
Alignment:
Q  307 ttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctg 380  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  29677554 ttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctg 29677481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 392
Target Start/End: Original strand, 35638957 - 35639004
Alignment:
Q  345 tctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35638957 tctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 35639004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 30631766 - 30631655
Alignment:
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaa-ttctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcg---aacagttgtagctgagcttgtttta 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||   |||||||| || || ||||||||||    
T  30631766 aaagagttgtcttagtaccatatt-gaaggtgtaaattctcgaacggttttctacagtgcagtagataaccgcacaacagttgcagttgggcttgtttta 30631668  T
Q  392 ttcttgaggtggc 404  Q
    | || ||||||||    
T  30631667 tcctggaggtggc 30631655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 319 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30619024 - 30618951
Alignment:
Q  319 ttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||| | |||| ||| | ||||||||||||    
T  30619024 ttggaggtgtaattctcgaatgattttctacaatgcagtaactaatcgcatagttataggtaagcttgttttat 30618951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30629181 - 30629074
Alignment:
Q  149 atggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcat 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| || |||| |||  ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  30629181 atggtggtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattggtattttg-agatgttaaatgttacaatggtggtaacaccatatttgagtggtcacaa 30629083  T
Q  248 caccataac 256  Q
     ||||||||    
T  30629082 taccataac 30629074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 40847219 - 40847310
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaa 103  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||       || |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40847219 ataacatatctcccttaagaataaagagtgcttttaatatcatagtccct-tttggaacaataatgtcccgtcgtaattaagaatgatcttaa 40847310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 381
Target Start/End: Original strand, 13291455 - 13291536
Alignment:
Q  299 gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctga 381  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| | | | |||||||||| | ||||||||||||    
T  13291455 gagtggttttagtacgatatt-ggaggtttaattatcgaacggttttctactgagcaatagttaatcgcatagttgtagctga 13291536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30643453 - 30643408
Alignment:
Q  210 gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataa 255  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30643453 gttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcaacaccataa 30643408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 32079535 - 32079478
Alignment:
Q  324 ggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctga 381  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| | || | |||||||||| ||||||||||||||    
T  32079535 ggtgtaattctcgaacgattagctataatgcaatagttaatcgcacagttgtagctga 32079478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 267
Target Start/End: Original strand, 42926361 - 42926398
Alignment:
Q  230 atatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaac 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  42926361 atatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaac 42926398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30651193 - 30651153
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatat 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30651193 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat 30651153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 30651481 - 30651399
Alignment:
Q  19 tgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||       |||| ||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30651481 tgtcccttcggaataaagagtgttcttaagaccatagtccctattcggtttaa--atgtcccttcggaattaagaatggtcttaa 30651399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Original strand, 6407495 - 6407867
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6407495 atgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 6407594  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6407595 agtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatgatggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccgtattgatagtttggaaaacttaaagttagaat 6407693  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6407694 ggtattaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccata 6407793  T
Q  318 tttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6407794 tttggaggtgtaattcttgaacggttttctacagtg-agtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttat 6407867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 17964186 - 17964566
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17964186 ataatatatgtccattcaaaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaagaacaatgtcgcgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 17964285  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17964286 tataaaaagtatttcaatattttt-tatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaag 17964384  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17964385 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaatttcatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 17964484  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  17964485 taccatatttgaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgggcttgttttat 17964566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 11559847 - 11560228
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  11559847 ataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccatcggaattaagaatgatcttaacagtatt 11559946  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||  |||||||||  |||||    
T  11559947 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatctaagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaactaaag 11560046  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11560047 ttagaatggtgacaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttag 11560146  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||    
T  11560147 taccatatttgagggtgtaattctggaacggttttctacaatgcagtagttcaccgcacagttgtagttgagcttgttttat 11560228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 11534337 - 11534718
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  11534337 ataatatatgtcccttaggaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccatcgaaattaagaatgatcttaacagtatt 11534436  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||||||||  |||||||||  |||||    
T  11534437 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatataagtggtcatagtgccatattgatgttttggagaaactaaag 11534536  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11534537 ttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttag 11534636  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||    
T  11534637 taccatatttgagggtgtaattctggaacggttttctacaatgcagtagttcaccgcacagttgtagttgagcttgttttat 11534718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 11570375 - 11570756
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||     
T  11570375 ataatatatgtcccttcggattaaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtccct-cagaattaagaatgatcttaacagtatt 11570473  T
Q  111 tataaaaa-gtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa 209  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||  ||||||||| |||||    
T  11570474 tataaaaaagtatgtcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtaatgacatattgatgttttggagaaattaaa 11570573  T
Q  210 gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtctta 309  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11570574 gttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtcttaacaccataacagagtggttacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtctta 11570673  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  11570674 gtaccatatttgagggtataattctggaacggttttctacagcggagtagttcaccgcacagttgtagctgagcttgttttat 11570756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 51 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11428436 - 11428126
Alignment:
Q  51 catagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11428436 catagtccctatttggaataacaatgttccgtcagaattaagaatgatcttaacggtatata--aaaattatttcaatatttttctatttgaggagaaat 11428339  T
Q  151 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  11428338 ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaatgaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacac 11428239  T
Q  251 cataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctaca 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11428238 cataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtagtcttagtaccatatttgatggtgtaaatctcgaacggttttctaca 11428139  T
Q  351 gtgtagtagttaa 363  Q
    ||| |||| ||||    
T  11428138 gtgcagtacttaa 11428126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12689441 - 12689059
Alignment:
Q  10 aataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtat 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |   |||  ||||||||||||||||||    
T  12689441 aataatatatgtctcttcagaataaatagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgttctccctttatttggaatgatcttaacggtat 12689342  T
Q  110 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||   |||||||||  ||||||||| |||||    
T  12689341 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtaccatcatatttgagtggtcatagtgtcatattgatgttttggagaaattaaa 12689242  T
Q  210 gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtctta 309  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  12689241 gttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaatacgatattaaagtggtttcaatattaaagagtcgtctta 12689142  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
     ||||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12689141 ataccataattgagggtgtaattgtcgaacggttttctacagtgtagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttat 12689059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 25314083 - 25314393
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccc--tatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25314083 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggta 25314182  T
Q  109 tatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaa 208  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25314183 ta--taaaaagtatttcaacatttttctatttgaggagaaatagtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaa 25314280  T
Q  209 agttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtctt 308  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25314281 agttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaagagtggtctt 25314380  T
Q  309 agtaccatatttg 321  Q
    |||||||||||||    
T  25314381 agtaccatatttg 25314393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 321
Target Start/End: Original strand, 26201577 - 26201887
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccc--tatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26201577 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggta 26201676  T
Q  109 tatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaa 208  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26201677 ta--taaaaagtatttcaacatttttctatttgaggagaaatagtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaa 26201774  T
Q  209 agttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtctt 308  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26201775 agttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaagagtggtctt 26201874  T
Q  309 agtaccatatttg 321  Q
    |||||||||||||    
T  26201875 agtaccatatttg 26201887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 50 - 392
Target Start/End: Original strand, 16835826 - 16836163
Alignment:
Q  50 tcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16835826 tcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacagtatatataaaaa-tatttcaatatttttctatttaaggagaaa 16835924  T
Q  150 tggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatca 249  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16835925 ttgtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattaatgttttggagaagttaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaaca 16836024  T
Q  250 ccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctac 349  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16836025 ccataacagtgtggttacaataccat----aggtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccaaatatgagggtgtaattctcgaacggttttctac 16836120  T
Q  350 agtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||| ||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  16836121 agtgcagtaactaaccgcacagttgtagctgggcttgttttat 16836163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 2699724 - 2700113
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||       ||||||||||||||| || | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||    
T  2699724 ataatataagttccttcggaataaagagtactattaagatcatagtcccttttcgaaataataatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaacg--ata 2699821  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggaga--------------aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtt 196  Q
    |||||| | | ||||||||||||   | |||||||||              ||||| | ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| ||    
T  2699822 tataaatattctttcaatatttt---aattgaggagatattaaaaagtggaaatggcgatatcaccatatttgaatggtcgtagtgtcatattgatattt 2699918  T
Q  197 tggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatta 296  Q
    | || || |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2699919 tagaaaaattaaagttagaatggtggcaacaccgtatttgagtggtctcagcaccataacatagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtatta 2700018  T
Q  297 aagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2700019 aagagtgatcttagtaccatatttggaggtgtaattctcg-acgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagttgggcttgttttat 2700113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 19995164 - 19995410
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || ||||| ||||||    
T  19995164 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatattttggagaacttaaagttagaatgatggtaacaccgtagttgaggggtctc 19995263  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||  ||||||| ||||||| | ||||    
T  19995264 ataaccataacaaagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaatagtgtttttagtacgatatttgagggtgtaaatctcgaaaggtttt 19995363  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||| ||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||    
T  19995364 ctacggtgtagtagttaaccgcatagttgtagctgggcttgttttat 19995410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 392
Target Start/End: Original strand, 4156983 - 4157376
Alignment:
Q  10 aataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtat 109  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||       ||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  4156983 aataatataagtcccttcggaataaagagtattattaagatcataatccctttttagaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaatgggat 4157082  T
Q  110 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga-----------gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttg 198  Q
    ||||||| | | ||||||||||||  |    ||| |           ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  ||||    
T  4157083 atataaatattctttcaatattttaattgaagagaaattaaaaagtggaaatggtgatatcaccatatttgagtggtggtagtatcatattgatgttttg 4157182  T
Q  199 gagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa 298  Q
    ||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  4157183 gagaaattaaagtttgaatggtggtgacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagcggtaacaataacatattaaagtgatttcagtattaaa 4157282  T
Q  299 gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||| | |||| |||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  4157283 gagtgatattagcaccatatttaagggtgtaaatttcgaacgattttctacagtgcagtagttaaccgcaccgttgtagctgagtttgttttat 4157376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Original strand, 12406003 - 12406360
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||  || | | |||||||||||||||| |||||||    
T  12406003 aagatcatagtccct-tttggaacaataatgtcccgtcgaaattaagaatgagcttaacagtatata--aatattctttcaatatttttctaattgagga 12406099  T
Q  146 gaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccat 231  Q
    |||||              ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| ||||| |||    
T  12406100 gaaattaaaatgtcaaaatggtagtatcaccatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaaattaaagttaaaatagtggtaacatcat 12406199  T
Q  232 atttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaat 331  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||  ||| |||     
T  12406200 atttgagtggtatcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaaaagtgattttagtatcatatttgagggtataaa 12406299  T
Q  332 tctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||  ||| |||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12406300 tctctcacggttttctacggtgcagtagttaaccacacagttgtagttgagcatgttttat 12406360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 156 - 392
Target Start/End: Original strand, 29892032 - 29892268
Alignment:
Q  156 tatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataa 255  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |  |||||||    
T  29892032 tatcactatatttgagtggtcgtagtaccatattgatagtttggagaaattaaatttagaatggtggtaacaccatatttgagtgctcttagtaccataa 29892131  T
Q  256 cagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgta 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||||| | ||||||||| || |    
T  29892132 cagagtggtaacaataccatattaaagcgatttcagtattaaagagtgatcttagtaccatatttgagggtgtaaatatcgaaaggttttctacaatgca 29892231  T
Q  356 gtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
     ||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||    
T  29892232 atagttaaccacacagttgtagctggacttgttttat 29892268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 223 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14509241 - 14509072
Alignment:
Q  223 taacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |    
T  14509241 taacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtgataacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttggtaccatatt-g 14509143  T
Q  322 gaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14509142 gaggtgtaattctcgaacgattttctacaatgcagtagttaatcgaacagttgtagatgagcttgttttat 14509072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5856341 - 5856158
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  5856341 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtaatgccatattgatactttggaaaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctt 5856242  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaa 330  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||    
T  5856241 aacaccataatagagtggtaacaataccatatt-aagtggtttcagtattatagagtgattttactaccatatttgaaggtgtaa 5856158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 216 - 392
Target Start/End: Original strand, 33687434 - 33687610
Alignment:
Q  216 atggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtacca 315  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33687434 atggtggtaacatcatatttgagtggtctcggcaccataacagagtggtgacaatatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggttttagtacca 33687533  T
Q  316 tatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||    
T  33687534 tatttgagggtgtaaatctcgaaggattttctacaatgcagtagttaaccgcacagttgtagttgagtttgttttat 33687610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 146 - 321
Target Start/End: Original strand, 11613527 - 11613703
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||     
T  11613527 gaaatggtggtatcaccataattgagtggtcgtagg-ctatattgatattttggagaactcaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagaggtctt 11613625  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaatacc--atattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttg 321  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11613626 agcaccataatagagtggtaataataccatatattaaagtggtttcagtattaaatagtgatcttagtaccatatttg 11613703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8748108 - 8747870
Alignment:
Q  149 atggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaa-cttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcat 247  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||  || ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  8748108 atggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagatgctaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgaatggtctcaa 8748010  T
Q  248 caccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttc 346  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||      ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||    
T  8748009 caccataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtaataaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattttcgaacggttttc 8747916  T
Q  347 tacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||| ||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||    
T  8747915 tacagtgcagtagttaaccacatagttgcagctgagcttgttttat 8747870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17913881 - 17913768
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17913881 ttggagaacttaaagttagaatggtaataacactatatttaagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaatactgtattaaagtagtttcagtatt 17913782  T
Q  296 aaagagtggtctta 309  Q
    ||||||||||||||    
T  17913781 aaagagtggtctta 17913768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 33687277 - 33687430
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |           |    
T  33687277 ataatatatgttccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaaaggt-----------a 33687365  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggt 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33687366 tataaaaattatttcaatatttttctacttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggt 33687430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 22694937 - 22695172
Alignment:
Q  10 aataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtat 109  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||       ||||||||||||||| |||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22694937 aataatgtatgccccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccct-tttgaaacaataatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacagtat 22695035  T
Q  110 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagt 195  Q
    | |  || | | |||||||||||||||| || |||||||||              ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  22695036 aga--aatattctttcaatatttttctaattaaggagaaattaaaaagtcgaattggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtatcatgttgatagt 22695133  T
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatt 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  22695134 ttggagaacttaaagttagaatggtggtgacaccatatt 22695172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 238 - 392
Target Start/End: Original strand, 24589022 - 24589171
Alignment:
Q  238 gtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcg 336  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24589022 gtggtctcaacaccataatagagtggttacattaccatattg-----gtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcg 24589115  T
Q  337 aacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| ||  ||||||||||    
T  24589116 aacggttttctacaatgcagtagttaaccgcacagttgtagttggacttgttttat 24589171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22609841 - 22609656
Alignment:
Q  208 aagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatta--aagagtggt 305  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || |  |||| ||||||| ||||| |||| |  ||||  |||||||||    
T  22609841 aagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataataatgttggcacaacaccatatcaaagtggtttaaaaattaataagagtggt 22609742  T
Q  306 cttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  22609741 catattaccata-ttggaggtgtaattctcgaatagttttctaccgtgcagttgttaatcacgcagttgtagttgagcttgttttat 22609656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 270 - 400
Target Start/End: Original strand, 20748169 - 20748299
Alignment:
Q  270 taccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaa 368  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| || |    
T  20748169 taccatattggagtagttttagtattaaaagagtggttttagtaccatattta-aggtgtaattctcgaaccgttttctacggtgcagtagttaaccgca 20748267  T
Q  369 cagttgtagctgagcttgttttattcttgagg 400  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  20748268 cagttgtagatggacttgttttattctggagg 20748299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21309241 - 21309168
Alignment:
Q  253 taacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21309241 taacagagtggtaacaataccatattaatgtgatttcagtattaaagagtggtcttagtaccgtatttgaaggt 21309168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 377
Target Start/End: Original strand, 9751724 - 9751800
Alignment:
Q  300 agtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtag 377  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  9751724 agtggtcttagtgccatatt-ggaggtgtaattctcgaatggtgttctacagtgcagtagttaatcgcacaattgtag 9751800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 271
Target Start/End: Original strand, 6112724 - 6112846
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| || | | || |||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  6112724 aatggtcgtagcactatatttgaatgcttgaagtaccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtgataacaccatatttgagtggtctta 6112822  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaata 271  Q
     || ||||| |||||||||||||||    
T  6112823 aca-cataatagagtggtaacaata 6112846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 345
Target Start/End: Original strand, 2863229 - 2863429
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | |    |||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  2863229 aatggtgataacaccatatttgagtggttgaaatttcatattgata-tttggagatgttaaaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtcaca 2863327  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa----gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgat 342  Q
      ||||||  |||||||| | | ||||||| |  | | ||||||||| ||||    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  2863328 ataccatagtagagtggtcatagtaccataattgattggtttcagtactaaaatatgagtggccttagtatcata-ttggaggtgtaattttcgaacgtt 2863426  T
Q  343 ttt 345  Q
    |||    
T  2863427 ttt 2863429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 366
Target Start/End: Original strand, 2882592 - 2882755
Alignment:
Q  207 aaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa----gagt 302  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||| | |  |||||| |  | | ||||||||| ||||    ||||    
T  2882592 aaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtcacaataccatagtagagtggtcatagcaccataattgattggtttcagtactaaaatatgagt 2882691  T
Q  303 ggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgat-tttctacagtgtagtagttaatcg 366  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||    
T  2882692 ggccttagtatcatatt-ggaggtgtaattttcgaacgttgtttttacagcgtagtagttaatcg 2882755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5496037 - 5495983
Alignment:
Q  224 aacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatatt 278  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  5496037 aacaccatattagagtggtctcattaccataatagagtggtagaaataccatatt 5495983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 392
Target Start/End: Original strand, 13736615 - 13736685
Alignment:
Q  322 gaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  13736615 gaggtgtaaatctcgaacagttttctacagtgcagtagttattcgcacatttgtagatgtgcttgttttat 13736685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 405
Target Start/End: Original strand, 15991560 - 15991760
Alignment:
Q  207 aaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggt 305  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||  |  ||||||  |||||||| | | ||||||| |  | | |||||||| ||||| ||||||     
T  15991560 aaagttagagtggtggtaacaccatatttgaatggtcataataccatagtagagtggtcatagtaccataattgattggtttcagttttaaaagagtggc 15991659  T
Q  306 cttagtacc-atatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgaggtggc 404  Q
     ||| |||| |||||||   ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||  | ||| ||| |||||| |||||||||| || |||| |||    
T  15991660 attaatacccatatttgattgtgtaattctcaaacggttttcgacagtgcagtagttaactgcacaattgcagctgaacttgttttatcctagaggcggc 15991759  T
Q  405 t 405  Q
    |    
T  15991760 t 15991760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 405
Target Start/End: Original strand, 15999222 - 15999422
Alignment:
Q  207 aaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggt 305  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||  |  ||||||  |||||||| | | ||||||| |  | | |||||||| ||||| ||||||     
T  15999222 aaagttagagtggtggtaacaccatatttgaatggtcataataccatagtagagtggtcatagtaccataattgattggtttcagttttaaaagagtggc 15999321  T
Q  306 cttagtacc-atatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattcttgaggtggc 404  Q
     ||| |||| |||||||   ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||  | ||| ||| |||||| |||||||||| || |||| |||    
T  15999322 attaatacccatatttgattgtgtaattctcaaacggttttcgacagtgcagtagttaactgcacaattgcagctgaacttgttttatcctagaggcggc 15999421  T
Q  405 t 405  Q
    |    
T  15999422 t 15999422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 103
Target Start/End: Original strand, 20747884 - 20747914
Alignment:
Q  73 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20747884 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaa 20747914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21309156 - 21309119
Alignment:
Q  355 agtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21309156 agtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttat 21309119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26341675 - 26341287
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26341675 ataatatatgtcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 26341576  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatat-ttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26341575 tataaaaagtatttcaatattttttttatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcggagtaccatattgatagtttggagaacttaaa 26341476  T
Q  210 gttaggatggtgttaacacc------atatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtg 303  Q
    ||||| ||| | ||||||||      ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26341475 gttagaatgatattaacaccatattgatatttgagtggtctcagcatcataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaagagtg 26341376  T
Q  304 gtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26341375 gtcttagtaccatatttggaggtgtaattcttgaatgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctggacttgttttat 26341287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 10 - 380
Target Start/End: Original strand, 42626216 - 42626586
Alignment:
Q  10 aataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42626216 aataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatattccctatttggaataacaatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacggtat 42626315  T
Q  110 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  42626316 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggttgtagtgccatattaatgttttggagaaattaaa 42626415  T
Q  210 gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtctta 309  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||| |||||    
T  42626416 gttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaggtggttttaatattaaagagtgatctta 42626515  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctg 380  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||    
T  42626516 gtaccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtaattaaccgcacagttgtagctg 42626586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Original strand, 13313896 - 13314243
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13313896 aagatcatagaccctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaacggtatataaaaaaattattttaatatttttctatttgagga 13313995  T
Q  146 gaaatggtg--gtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtc 243  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  13313996 gaaatggtgtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatagtggtaacacaatatttgagtggtc 13314095  T
Q  244 tcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatt 343  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13314096 tcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtatt-aagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggtt 13314194  T
Q  344 ttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13314195 ttctacagtgcagtagttaattgaacagttgtagctgagcttgttttat 13314243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8268760 - 8268381
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268760 ataatatatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 8268661  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||  || | |||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8268660 ta--aatattatt-ctatatttttctaattgaggagatatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtaccatatagatagtttggagaacttaaag 8268564  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8268563 ttagaatggtgttaacaacatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtactaaagagtgatcttag 8268464  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaac-gattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8268463 taccatatttggaggtgtaattatcgaacggtttttctacggtgcagtagttaatcgaacagttgtagctggacttgttttat 8268381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Original strand, 44422766 - 44423144
Alignment:
Q  16 atatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44422766 atatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggactaacaatgtcctgtcggaattaagaatgatcttaacggtatatataa 44422865  T
Q  116 aa--agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagtta 213  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  44422866 aaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccacattgatgttttggagaaattaaagtta 44422965  T
Q  214 ggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtac 313  Q
    | || |||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44422966 gaattgtgacaacaccatatttgattggtttcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaggtagtttcagtattaaagagtggtcttagtac 44423065  T
Q  314 catatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||  ||||||||||    
T  44423066 catatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagatggacttgttttat 44423144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 58 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12799840 - 12799510
Alignment:
Q  58 cctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggta 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12799840 cctatttggaataacaatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaatggtatatataaaaagtatttcaatgtttttctatttgaggagaaatggtggta 12799741  T
Q  158 tcaccatatttgagtggtcgtagcaccata--------ttgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatca 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||        |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12799740 tcaccatatttgagtggtcgtagtgccatagtgctatattgatattttggagaaattaaagttagaatggtggcaacaccatatttgagtggtctcaaca 12799641  T
Q  250 ccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctac 349  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |    
T  12799640 ccataacaaagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctgc 12799541  T
Q  350 agtgtagtagttaatcgaacagttgtagctg 380  Q
    | || ||||||||| || |||||||||||||    
T  12799540 aatgcagtagttaaccgcacagttgtagctg 12799510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4930655 - 4930321
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||    
T  4930655 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtattt------------atttgagga 4930568  T
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  4930567 gaaatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattaatgttttggagaaattaaagttagaatggtgacagcaccatatttgagtggtctc 4930468  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  4930467 aacaccataacagagtggtaacaataccatattaaggtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatatgagggtgtaattctcgaacggtttt 4930368  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||| || |||||||||||    
T  4930367 ctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagttgggcttgttttat 4930321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30258434 - 30258188
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30258434 gaaatggtggtattatcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactttaaagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 30258335  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  30258334 agcaccataacatagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgaaggtgtaaatttcgaacaatttt 30258235  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| ||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||    
T  30258234 ctacagtgcagtagttaaccgcactgttgtagctggacttgttttat 30258188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27238688 - 27238330
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga 145  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||| ||| |  | |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||    
T  27238688 aagaccatagtccctttttgaaataataatatttcgtcggaagtaagaatgatcttaaagg--tatataaatattctttcaatatttttctaattgagga 27238591  T
Q  146 --------------gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccat 231  Q
                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||| |||||||||    
T  27238590 gaaattaaaaggtggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaaattacaattagaatggtggtaacaccat 27238491  T
Q  232 atttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaat 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||     
T  27238490 atttgagtggtctcagcaccataacaaagtggtaacattatcatattaaagtggtttcagaattaaagagtggtcttagtatcatatttgagggtgtaaa 27238391  T
Q  332 tctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||  ||||||||||    
T  27238390 tctcgaacgattttctacagtgcagtagttaagcacgcagttgtagctggacttgttttat 27238330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 52 - 392
Target Start/End: Original strand, 10388024 - 10388374
Alignment:
Q  52 atagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat- 150  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  10388024 atagtccct-tttggaacaataatgtctcatcggaattgagaatgatcttaacggtatata--aatattctttcaatatttttctaattgaggagaaatt 10388120  T
Q  151 -------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttga 237  Q
                 ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||   | ||| |||||||| ||||||    
T  10388121 aaaaagtcgaaatggtggtatcaccatatttgagtgatcgtagtgccatattgatattttggagaaattaaagttaaagttgtggtaacacca-atttga 10388219  T
Q  238 gtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcga 337  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  10388220 gtggtctcagcaccataatagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtattagtaccttatttgagggtgtaaatctcga 10388319  T
Q  338 acgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  10388320 acaattttttagagtgcagtagttaatcgcacagttgtagttgagtttgttttat 10388374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3045888 - 3045682
Alignment:
Q  147 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3045888 aaatggtagtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttagaaaacttaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 3045789  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttc 346  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  3045788 gcaccataacagagtggtaacaataccatattaaaatggtttcaatattaaagagcggtcttagtaccatatttgagggtgtaaatctcgaacgattttc 3045689  T
Q  347 tacagtg 353  Q
    |||||||    
T  3045688 tacagtg 3045682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21671528 - 21671280
Alignment:
Q  147 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  21671528 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttggaaaaattaaagttataatggtggtaacaccatatttgagttatctca 21671429  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     |||||||  | |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21671428 acaccatattaaagtggtaataataccatattaaagtggtttcattattaaaagaatggtctttgtcccata-ttggaggtttaaatctcgaacgatttt 21671330  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttattct 395  Q
    ||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21671329 ctacactgcagtagttaaccgcacagttgtaggtgagcttgttttattct 21671280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Original strand, 44510440 - 44510684
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44510440 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 44510538  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44510539 acaacataacagaatggtaacaatgtcatattaaagtggtttcagtattaaaagtgtggtcttagtaccata-ttgaaggtgtaattctcgaacggtttt 44510637  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| || |||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  44510638 ctacagtgcagaagttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttat 44510684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 13142683 - 13142908
Alignment:
Q  167 ttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaa 266  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||  || |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13142683 ttgagtgatcgtagttccatattgatattttgtagaacttgaagaaagaatggtggtaacaccatatttaagtggtctcagcaccataacaaagtggtaa 13142782  T
Q  267 caataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcg 366  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||  ||||||| |||| | ||||||  |     
T  13142783 caataccatattaaagtggtttcaatattaaagagtgatcttagtaccatatttaacggtgtaaatctcgaacagttttctatagtgcaatagttagcct 13142882  T
Q  367 aacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
     |||||||||||||| ||||||||||    
T  13142883 tacagttgtagctgaacttgttttat 13142908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 211 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3880264 - 3880112
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3880264 ttagaatggtgataacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaacagtatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttag 3880165  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaa 363  Q
    || ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3880164 tatcatatttgagagtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaa 3880112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 149 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23866394 - 23866156
Alignment:
Q  149 atggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||| |||||   |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23866394 atggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatattt-agtggtctca 23866297  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     ||| |||| |||||||| | | |||||||||      ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  23866296 acacaataatagagtggtcatagtaccatattg-----gtttcagcattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtttt 23866203  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  23866202 ctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctgagcttgttttat 23866156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 224 - 353
Target Start/End: Original strand, 3357470 - 3357599
Alignment:
Q  224 aacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgga 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  3357470 aacactatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcggtattaaagagtgatcttagtaccatattttag 3357569  T
Q  324 ggtgtaattctcgaacgattttctacagtg 353  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3357570 ggtgtaaatcttgaacgattttctacagtg 3357599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 216 - 380
Target Start/End: Original strand, 26286977 - 26287140
Alignment:
Q  216 atggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtcttagtacc 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  26286977 atggtggtaacaccatatttgagtggtctca-cacgataatagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaaagaatggtcttggtacc 26287075  T
Q  315 atatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctg 380  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  26287076 ata-ttggaggtgtaaagctcgaacgattttctatagtgcagtagttaactgcacagttgtagctg 26287140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 260 - 392
Target Start/End: Original strand, 25543237 - 25543369
Alignment:
Q  260 gtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagta 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25543237 gtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagta 25543335  T
Q  359 gttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||| || ||||||||||||   ||||||||||    
T  25543336 gttaaccgcacagttgtagctagacttgttttat 25543369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 230 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3284978 - 3284818
Alignment:
Q  230 atatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgta 329  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  3284978 atatttgattggtctcagcaccataacagagtagtaaaaataccttattaaagtggtttcgacattaaagagtggtctcagtaccatatttgagggtgta 3284879  T
Q  330 attctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgtttt 390  Q
    ||||||||||| |||||||  |||  |||||||| || || |||||||||||| |||||||    
T  3284878 attctcgaacggttttctattgtgcggtagttaaccgcacggttgtagctgagtttgtttt 3284818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12254322 - 12254167
Alignment:
Q  236 gagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctc 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12254322 gagtggtctcaacaccataacagagtggtagcaatatcatattaaagtggtttcagtaggaaagactggacttagtaccatattt-gaggtgtaaatctc 12254224  T
Q  336 gaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
     |||| |||||||||  | | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  12254223 aaacggttttctacacagcattagttaaccgcacagttgtagctgaacttgttttat 12254167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 374
Target Start/End: Original strand, 9650731 - 9650953
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||| |||||   |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9650731 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctc 9650829  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattt 344  Q
    | |||||||| |||||||| | | ||||||||     | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||    
T  9650830 aacaccataatagagtggtcatagtaccatat-----tggtttcagtattaaaagagtggtcttagtaccata-ttaaaagtgtaattctcgaacggttt 9650923  T
Q  345 tctacagtgtagtagttaatcgaacagttg 374  Q
    ||||||||| |||||| || || |||||||    
T  9650924 tctacagtgcagtagtcaaccgtacagttg 9650953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19640624 - 19640405
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | || | |||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19640624 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaagtatcatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatattttagtggtctca 19640526  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaat-tctcgaacgatttt 345  Q
     |||||||| |||||| | ||||||||||||     | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| |    
T  19640525 gcaccataatagagtgttcacaataccatat-----tggttttagtattaaagagtggtgttagtaccatatttgagggtgttatctctcgaacgattat 19640431  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
     ||| ||| ||||  |||||||||||    
T  19640430 ttacggtgcagtacgtaatcgaacag 19640405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 246
Target Start/End: Original strand, 3356857 - 3356957
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3356857 gaaatggtggtatcaccatatttgattggtcgtagtaccgtattgatagtttggagaacttacagttagaattgtgataacaccatatttgagtggtctc 3356956  T
Q  246 a 246  Q
    |    
T  3356957 a 3356957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 207 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23318257 - 23318128
Alignment:
Q  207 aaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtc 306  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23318257 aaagttagaatggtgataacatcatatttgaatggcctcatcactataatagagtgatcacaatgccatattagagtggtttcagtattaaagagtggtc 23318158  T
Q  307 ttagtaccatatttggaggtgtaattctcga 337  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23318157 ttagtaccata-ttggaggtgtaaatctcga 23318128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27256520 - 27256349
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||     | |||||||||||    
T  27256520 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaataataccatat-----tggtttcagtatt 27256426  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||  | ||| ||| | || ||||||||||||    
T  27256425 aaatagtggtcttagtaccatattagagggtgttatttctcgaacgatcatatacggtgcaatatttaatcgaacag 27256349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 319
Target Start/End: Original strand, 40865185 - 40865288
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||||    
T  40865185 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcttaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtattaaagagtggtcttag 40865279  T
Q  311 taccatatt 319  Q
    |||||||||    
T  40865280 taccatatt 40865288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4579844 - 4579596
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| | | |  |||||||||| | ||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |    
T  4579844 aatggtggtagcatcatatttaagtgctggaaataccatattgaca-tttggagatgttaaatgttagaatggtggtaacaccatatttgaacggtctta 4579746  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa---gagtggtcttagta-ccatatttggaggtgtaattctcgaacgat 342  Q
      || |||| ||| |||| |||||||||||| |  || |||||| ||||||    |||||| |||| || |||||||||  ||||||||||| ||||| |    
T  4579745 gtactataatagaatggtcacaataccatataatcgtggtttcattattaatttcgagtggccttaatagccatatttgagggtgtaattcttgaacggt 4579646  T
Q  343 tttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  4579645 tttctacagtgcagtagttaatcgcacagttgtagctggacttgttttat 4579596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8076358 - 8076138
Alignment:
Q  162 catatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacaga 259  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||| |||||   |||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  8076358 catatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaaattagaacggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccgtaataga 8076260  T
Q  260 gtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagta 358  Q
    ||||| | | |||||||||      ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||||     |    
T  8076259 gtggtcatagtaccatattg-----gtttcaacattaaaagagtggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaat-ctcgaacagttttctacagt-----a 8076172  T
Q  359 gttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8076171 gttaatcgcacagttgcagctgagcttgttttat 8076138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15642495 - 15642379
Alignment:
Q  163 atatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagt 261  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||    
T  15642495 atatttgagtggtcgtagtaccatcttgatattttggagaacttaaaggttagaatggtgataataccatatctgaatggtcttagcaccataagagagt 15642396  T
Q  262 ggtaacaataccatatt 278  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  15642395 ggtcacagtaccatatt 15642379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 392
Target Start/End: Original strand, 6590818 - 6590990
Alignment:
Q  224 aacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa---gagtggtcttagta-ccatatt 319  Q
    |||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| |||| | | |||||||| | | | ||||||||||||||   |||||| |||| || |||||||    
T  6590818 aacaccatatttgaatggtcttggtaccataatagaatggttatagtaccatataataatggtttcagtattaaattcgagtggccttaatagccatatt 6590917  T
Q  320 tggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||||    
T  6590918 tgagggtgtaattctcaaacgattttctacaatgtagtagttaatcacacagttataactgaacttgttttat 6590990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9008346 - 9008251
Alignment:
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||    
T  9008346 aaagagtgattttagtatcatatt-gaaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcacacagttgtagttggacttgttttat 9008251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16372712 - 16372507
Alignment:
Q  166 tttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaa-ag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtgg 263  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||  |||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||     
T  16372712 tttgagtggtcgtagaactatattgaca-tttggagatgttaagagattagaatggtggtaaaagcatatttgagtggtctcagtaccatagtagaatga 16372614  T
Q  264 taacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa---gagtggtcttagta-ccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtag 359  Q
      ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||   |||||| |||| || |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16372613 ccacagtaccatataatagtggtttcagtattaaattcgagtggccttaatagccatatttgatggtttaattctcaaacgattttctacagtgaagtag 16372514  T
Q  360 ttaatcg 366  Q
    |||||||    
T  16372513 ttaatcg 16372507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3025733 - 3025666
Alignment:
Q  174 gtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtgg 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||    
T  3025733 gtcgtagtaccatattgatagttttgagaacttaaagttagaatgacggtaacaccatattttagtgg 3025666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 30258532 - 30258466
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatata 112  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  30258532 aagatcatagtccctttttgaaataataatgtcccgtcgaaattaataatgatcttaactgtatata 30258466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 390
Target Start/End: Original strand, 45748562 - 45748647
Alignment:
Q  307 ttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacga---ttttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgtttt 390  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||    
T  45748562 ttagtaccatatttgaag-tataattctcgaacgacgattttctacagtgcagtagttaatcgcatagttgtagttgaacttgtttt 45748647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21671658 - 21671573
Alignment:
Q  17 tatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaa 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||       |||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21671658 tatgtcccttcggaataaagagtacttttaagatcatggtccct-tttgaaataataatgttccgtcggaattaagaatgatcttaa 21671573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15642558 - 15642506
Alignment:
Q  158 tcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15642558 tcaccatatttgagtggttgtagtactatattaatattttggagaacttaaag 15642506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 313 - 392
Target Start/End: Original strand, 23246861 - 23246940
Alignment:
Q  313 ccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||| |    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23246861 ccatatttgagggtgtaattttggaacggttttctataaaacagtagttaatcgcacagttgtaggtgagcttgttttat 23246940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23319169 - 23319115
Alignment:
Q  153 tggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaactta 207  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||    
T  23319169 tggtatcactatgtttgagtggtcgtagtaccatattgacatttaggagaactta 23319115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23319243 - 23319181
Alignment:
Q  147 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||  |||| |||||||| ||||||    
T  23319243 aaatggtggtatcaccatatttgagcggttgtagtacaataacgatattttggagatcttaaa 23319181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15973085 - 15973037
Alignment:
Q  145 agaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgata 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||    
T  15973085 agaaatggtggtaacaccatatttgagtgattgtagtaccatgttgata 15973037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36684044 - 36683667
Alignment:
Q  15 tatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36684044 tatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcataattaagaatgatcttaacggtatatata 36683945  T
Q  115 aaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  36683944 aaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatcttttggagaaattaaagttag 36683845  T
Q  215 gatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtacc 314  Q
     ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36683844 aatggtggcaagaccatatttgagtggtctcaacaccataacatagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaagagtggtcttagtacc 36683745  T
Q  315 atatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  36683744 atatttgagggtgtaattctcaaacgattttctacagtgcagtagttaatcgcacagatgtagctgaccttgttttat 36683667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 15951181 - 15951563
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951181 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgttccgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 15951280  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15951281 tataaaaagtatttcaatatttttctatttaaggagaaacagtggtatcactatatttgagtggtcgtagtaccaaattgatagtttggagaacttaaag 15951380  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15951381 ttagaatggtgttaacaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattaaagagtggtcttag 15951480  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctac--agtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||| | | | |||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  15951481 taccata-tcgaacgtgtaaatctcgaacggttttctacagagtgcagtagttaactgcacagttgtagctgggcttgttttat 15951563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 44925550 - 44925930
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  44925550 ataatatatgtcccttcagaataaatagtacttttaagatcatagtccctatttggattaacaatgtcccgtcggaaataagaatgattttaacagtata 44925649  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  44925650 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgaatggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 44925749  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44925750 ttagaatggtggtaaaaccatatttgagtggtctcgacaccataacagagtggtaacagtatcatattaaagtggtttcagtattaaagagtggttttag 44925849  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||    
T  44925850 taccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgca-tagttaaccgcatagttgtagatgaccttgttttat 44925930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 46 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33416981 - 33416635
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaa-tgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33416981 aagatcatagtccctatttggaataacaaatgtcccgtcgaaattaagaatgattttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttaagg 33416882  T
Q  145 agaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtct 244  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33416881 ataaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtct 33416782  T
Q  245 catcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattt 344  Q
    || |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  33416781 caacaccataacagaatgataacaatatcatattaaagtggtttcagtattaaagagcggtcttagtaccgtatttgagggtgtaattctcgaacggttt 33416682  T
Q  345 tctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  33416681 tctacagtgca-tagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttat 33416635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 1910585 - 1910976
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||       ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1910585 ataatataagtcccttcgaaataaagagtactattaagatcatagtcccttttttgaataataatgtcccgtcggaattaagaatgaccttaacggtata 1910684  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttct---------atttga--ggagaaatggtggta-tcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttg 198  Q
    ||  || | | ||||||||||||  |         |||| |  |  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  1910685 ta--aatattctttcaatattttaatcgaggagaaatttaaaagtggaaatggtggtaataaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatactttg 1910782  T
Q  199 gagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa 298  Q
    ||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1910783 gagaaattaaagtcagaatggtggtaacatcatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacagtaccatattaaagtggtttcagtattaaa 1910882  T
Q  299 gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  1910883 gagtggtcttaataccatatttgaatgtgtaaatctcgaatggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagttgagcttgttttat 1910976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2965964 - 2965718
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  2965964 gaaatggtggtatcaccatatttgagtgggcgtagtaccatatcgatagattagagaacttaacgttaaaatggtggtaacatcatatttgagtagtctc 2965865  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || | ||||    
T  2965864 aacaccataacagagtggtaacaatactatattaaagtagttttagtattaaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaaatctcaaatggtttt 2965765  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| |||||||||  | | |||||||||||  ||||||||||    
T  2965764 ctacagtgcagtagttaactgcatagttgtagctggacttgttttat 2965718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 28564582 - 28564826
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28564582 gaaatagtggtatcagcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaa-ttaaagttaaaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 28564680  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28564681 agcaccataagagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaacattaaagagtggtcttactatcata-ttgaaggtgtaattctcgaacggtttt 28564779  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  28564780 ctacactgcaatagttaatcgaacagttctaaccgggcttgttttat 28564826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 28572205 - 28572449
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28572205 gaaatagtggtatcagcatatttgagtggtcgtagtgccatattgatattttggagaa-ttaaagttaaaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 28572303  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28572304 agcaccataagagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcaacattaaagagtggtcttactatcata-ttgaaggtgtaattctcgaacggtttt 28572402  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  28572403 ctacactgcaatagttaatcgaacagttctaaccgggcttgttttat 28572449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Original strand, 40125712 - 40125892
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40125712 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat-agagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 40125810  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40125811 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacggtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 40125892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 145 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19166969 - 19166722
Alignment:
Q  145 agaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagttt-ggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19166969 agaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtaatgccatattg-tagttttggagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatatgagtggtc 19166871  T
Q  244 tcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatt 343  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  19166870 tcaacaccataatagagtggtaaccacaccatattaaagtgatttaagttttaaagaatgatcttagtaccatatttgagggtgtaattctcgaacggtt 19166771  T
Q  344 ttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||| |||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||    
T  19166770 ttctatagtgcagtagttaacagcacagttgtagttgagcttgttttat 19166722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 18876018 - 18876374
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18876018 ataatataagtcccttcggaataaagagtaatattaagatcatagtccct-tttggaataataatgtcccgtcggaattaagaatgatcttaacgctata 18876116  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||  || | | ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  18876117 ta--aatattctttcaatttttttctatttgagcagaaattgtggtatcgccatatttgagtggttgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 18876214  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||                      ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||    
T  18876215 ttagaatggtggcaacaacatatttgagtggtctcaacaccat----------------------attaaggtggtttcaatattaaagagtggtattag 18876292  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||    
T  18876293 tatcatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagatgagtttgttttat 18876374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1807908 - 1807685
Alignment:
Q  18 atgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1807908 atgtcccttcagaataaagattacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtaaaaattaagaatgatcttaacggtatatataaaa 1807809  T
Q  118 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||    
T  1807808 agtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtcgttgt-gtgccatattgatgttttggataaattaaagttagaat 1807710  T
Q  218 ggtgttaacaccatatttgagtggt 242  Q
    ||||  ||||||||| | |||||||    
T  1807709 ggtggcaacaccataatagagtggt 1807685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 23548391 - 23548639
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||||||||| | |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23548391 gaaatggtggtatcatcatatttgagtggtcatagtgcgatattgatattatggagaacttaaagttcgaatggtggtaacaccatatttgagtgatctc 23548490  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtat--taaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatt 343  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||   |||| || ||| ||||| ||    
T  23548491 aacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtgatttcagtattataaatagtggtcttagtatcatatttaagggtgaaaatcttgaacggtt 23548590  T
Q  344 ttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  23548591 ttctacaatgcagtagttaaccgcgcagttgtagctgaacttgttttat 23548639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 392
Target Start/End: Original strand, 28559333 - 28559661
Alignment:
Q  63 ttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat------------ 150  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||  || | | |||||||||||||||| ||||||||||||                
T  28559333 ttggaataataatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaaatgtatata--aacattctttcaatatttttctaattgaggagaaattaaaagtggaaa 28559430  T
Q  151 -ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatca 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  28559431 tggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatattttggagaa-ttaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagca 28559529  T
Q  250 ccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctac 349  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||          |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  28559530 ccataagagagtggtaacaataccatattaaagtggtttc----------agtggtcttactaccgta-ttgaaggtgtaattctcgaacggttttttac 28559618  T
Q  350 agtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||| | ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  28559619 agtgcaatagttaatcgaacagttctaactgggcttattttat 28559661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17026204 - 17026023
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtctta 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||     
T  17026204 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaatagtaccatattaaagtggtttcaatattaaaagaatggtcttg 17026105  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  17026104 gtaccata-ttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctagacttgttttat 17026023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17556696 - 17556515
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtctta 309  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||     
T  17556696 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccataatagagtggtaatagtaccatattaaagtggtttcaatattaaaagaatggtcttg 17556597  T
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  17556596 gtaccata-ttggaggtgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctagacttgttttat 17556515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17020672 - 17020470
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17020672 gaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcatagtgccatattgatactttgaagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatgtttgagtggtctc 17020573  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | | |||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||| ||||    
T  17020572 agcgccataagagaattgtaacaatatcatatgaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtaccatattcgaatgtgtaaatctcaaacggtttt 17020473  T
Q  346 cta 348  Q
    |||    
T  17020472 cta 17020470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17551109 - 17550907
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17551109 gaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcatagtgccatattgatactttgaagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatgtttgagtggtctc 17551010  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | | |||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||| ||||    
T  17551009 agcgccataagagaattgtaacaatatcatatgaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtaccatattcgaatgtgtaaatctcaaacggtttt 17550910  T
Q  346 cta 348  Q
    |||    
T  17550909 cta 17550907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 38181873 - 38182244
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38181873 ataatataagtcccttcggaataaagagtaccattaagatcatagtccttttttggaataataatgtcccgtcggaattaaaaatgatcttaacggtata 38181972  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtt 196  Q
    ||  || | | ||||| |||||    | ||||||||||||              ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  38181973 ta--aatattctttcattattta---aattgaggagaaattaaaaagttgaaatggtgagatcaccatatttgagtggtcgtagtgccatattgatactt 38182067  T
Q  197 tggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatta 296  Q
    ||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||                    
T  38182068 tggagaaattaaagtttgaatagtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataacagagtggtaacaatatcatattaa---------------- 38182151  T
Q  297 aagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
       |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||| |||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  38182152 ---agtggttttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttttatagtgcagtagttaacagcacagttgtagctgtgcttgttttat 38182244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Original strand, 4238110 - 4238336
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4238110 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 4238207  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     || |||||  ||||||| |||||||||||||      |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  4238208 acatcataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtttt 4238301  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctg 380  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4238302 ctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctg 4238336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Original strand, 4242849 - 4243075
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4242849 aatggtcgtaacaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctca 4242946  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
     || |||||  ||||||| |||||||||||||      |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  4242947 acatcataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtttt 4243040  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctg 380  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4243041 ctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctg 4243075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 216 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24090886 - 24090715
Alignment:
Q  216 atggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtacca 315  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24090886 atggtggtatcaccatatttgagtggtctcagcaccataacagagtggtaacaatatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtacaa 24090787  T
Q  316 tatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||     | ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||    
T  24090786 tatttgaggatgtaaatctcgaacggttttctac-----aatagttaaccgcacagttgtagataagcttgttttat 24090715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 31449633 - 31449873
Alignment:
Q  147 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtct 244  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31449633 aaatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtct 31449730  T
Q  245 catcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatt 343  Q
    || ||||||||  ||||||| |||||||||||||      |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  31449731 caacaccataattgagtggttacaataccatattg-----gtttcagtattaaaagattggtcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaacggtt 31449824  T
Q  344 ttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||    
T  31449825 ttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctggacttgttttat 31449873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34118687 - 34118554
Alignment:
Q  259 agtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagta 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  34118687 agtggtaacaataccatattaaagtggtttcattattaaagagtggccttagtaccatattcgaaggtgtaaatctcgaacagttttctacggtgcagta 34118588  T
Q  359 gttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  34118587 gttaacagcacagttgtagctgggcttgttttat 34118554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 374
Target Start/End: Original strand, 24673097 - 24673320
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  24673097 aatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtaccatattgttattttgaagaacttaaaggttggaatggtgataacatcatatttgagtggtctta 24673196  T
Q  247 tcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttc 346  Q
     |||||  | ||||| || | | |||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||  | ||     
T  24673197 gcaccactatagagt-gtcatagtaccatattagagtggtttcaacattaaaaagtggtcttagtaccata-ttggaggtgtaaatcttgaac--tcttt 24673292  T
Q  347 tacagtgtagtagttaatcgaacagttg 374  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  24673293 tacagtgtagtggttaaccgcacagttg 24673320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Original strand, 43302456 - 43302698
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggt---c 243  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  43302456 aatggtcgtaacatcatatttgagtggttgaaataccatattgata-tttggagaagttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtggtc 43302554  T
Q  244 tcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa-gagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgat 342  Q
    ||| |||||||| |||||||| | | |||||||||      |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  43302555 tcaacaccataatagagtggtcatagtaccatattg-----gtttcaatattaaaagagtagtcttagtaccacatt-gaaggtgtaattctcgaacgat 43302648  T
Q  343 tttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||| || ||||| |||||||||||    
T  43302649 tttctacagtgcagtagttaaccgcacaggtgcagctgggcttgttttat 43302698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Original strand, 25367797 - 25367968
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |     ||||||||||    
T  25367797 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatattga-----tttcagtatt 25367891  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||  | ||| ||| | || ||||||||||||    
T  25367892 aaagagtggacttagtaccatattagagggtgttatttctcgaacgatcatatacggtgcaatatttaatcgaacag 25367968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Original strand, 34818516 - 34818687
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||||     | |||||||||||    
T  34818516 ttggagaagttaaagttagaatggtggtagcaccatatttgagtggtcacaacaccataatagaatggtaacagtaccatat-----tggtttcagtatt 34818610  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||  | ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  34818611 aaagagtggtcttagtaccatattagagggtgttatttctcgaacgatcatatacggtgcagtatttaatcgaacag 34818687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 285 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1807668 - 1807563
Alignment:
Q  285 gtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagct 384  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||  ||    
T  1807668 gtttcagtattaaagagtgatcttagtaccatatttgaaggtgtaaatctcgaacggttttctacagtgcactagttaaccgcacagttgtagctggact 1807569  T
Q  385 tgtttt 390  Q
    ||||||    
T  1807568 tgtttt 1807563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 196 - 319
Target Start/End: Original strand, 8331174 - 8331292
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| |||||     | |||||||||||    
T  8331174 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcttaccaccataatagaatggtaacaataacatat-----ttgtttcagtatt 8331268  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8331269 aaagagtggtcttagtaccatatt 8331292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26779548 - 26779268
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||  || ||||  || | | ||||||||||||||||||||||||    
T  26779548 aagatcatagtccct-tttggaaaaataatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaaaagtttata--aatattctttcaatatttttctatttgagga 26779452  T
Q  146 gaaatg----------------gtggtatcaccatatttgagtggtc--gtagcaccatattgatagtttgg-agaacttaaagttaggatggtgttaac 226  Q
     ||||                 |||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||| ||| | |||| |||||||||  ||||||| | |    
T  26779451 aaaattaaaaaatcaaaatggtgtggtatcaccatatttgagtggtcccgtagtgccatattaatatttttgcagaagttaaagttaaaatggtgt-agc 26779353  T
Q  227 accatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagta 312  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26779352 accatatttgagtggtctcagcaacataacagagtgatatcaatatcatattaaa-tggtttcagtattaaagggtgatcttagta 26779268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37771989 - 37771818
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||     | |||||||||||    
T  37771989 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaatatcatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatat-----tggtttcagtatt 37771895  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |  |||| || ||||||||||||  | |||||||  ||| ||||||||||||    
T  37771894 aaagagtagtcttggtaccatattagagggtgttatttctcgaacgatcatatacagtgccgtatttaatcgaacag 37771818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17793797 - 17793645
Alignment:
Q  147 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||| |||| || |||||| ||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  17793797 aaatggtggtataaccatatttgaatggttgcagtaccatatcgatatttaggagaagttaaaggttagaatgatgataacatcatatttgagaggtctc 17793698  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa 298  Q
    |  | | | | |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17793697 aataacttcatagagtggtcacaataccatattataatagtttcggtattaaa 17793645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 392
Target Start/End: Original strand, 17953800 - 17953880
Alignment:
Q  313 ccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag-ttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||    
T  17953800 ccatatttgagggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcacacagtttgtaggtgagcttgttttat 17953880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 392
Target Start/End: Original strand, 15875608 - 15875675
Alignment:
Q  325 gtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15875608 gtgtaattcttgaacggttttctatagtgcagtagttaatcgtacaattgtagctgagcttgttttat 15875675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 303
Target Start/End: Original strand, 22714777 - 22714926
Alignment:
Q  155 gtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccat 253  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||| || ||| | ||||||    
T  22714777 gtatcatcatatttgagtgatcgtaataccatattgatatattgaagaagttaaatgttagaatggtcataacatcatatttgaatgatcttagcaccat 22714876  T
Q  254 aacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtg 303  Q
    || |||||| | | | || ||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  22714877 aaaagagtgatcaaagtatcatattagagtgatttcagtattaaagagtg 22714926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17020816 - 17020715
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||       |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17020816 ataatataagccccttcaaaataaagagtactattaagatcattgtccctttttggaataataatgttccgccagaattaagaatgatcttaacggtata 17020717  T
Q  111 ta 112  Q
    ||    
T  17020716 ta 17020715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17551253 - 17551152
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||       |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17551253 ataatataagccccttcaaaataaagagtactattaagatcattgtccctttttggaataataatgttccgccagaattaagaatgatcttaacggtata 17551154  T
Q  111 ta 112  Q
    ||    
T  17551153 ta 17551152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19167112 - 19167011
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19167112 ataatataagtcccttcggaataaagagtactattaagatcatagtccctttttgaaataataatgttctgccggaaataagaatgatcttaacggtata 19167013  T
Q  111 ta 112  Q
    ||    
T  19167012 ta 19167011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12820579 - 12820504
Alignment:
Q  223 taacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  12820579 taacaccatatttgagtggtcacaatatcatagcagagtggtcacaataccatattagagtggtttcagtactaaa 12820504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 23548280 - 23548381
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttttctatttgagga 145  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||  || | | |||||||| |||||||||||||||    
T  23548280 aagattatagtccct-tttggaacaataatgtcttgtcggaattaagaatgatcttaacagtttata--aatattctttcaatagttttctatttgagga 23548376  T
Q  146 gaaat 150  Q
    |||||    
T  23548377 gaaat 23548381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 103
Target Start/End: Original strand, 28564470 - 28564527
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaa 103  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28564470 aagatcatagttcctttttggaataataatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaa 28564527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10933588 - 10933534
Alignment:
Q  323 aggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtag 377  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  10933588 aggtgtaattctcgaacaattctctacagtgcagtagttaatcacacagttgtag 10933534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 18260248 - 18260199
Alignment:
Q  66 gaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataa 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  18260248 gaataataatgtcccttcggaattaagaatgatctcaatagtatatataa 18260199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24090889 - 24090848
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccata 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24090889 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtctcagcaccata 24090848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14035764 - 14035669
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtc 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |  |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||||||||    
T  14035764 aatggtggtagcaccatatttgagcggttgaaataccatattgata-tttggagatgttaaatgttagaatggtggtgacatcatatttgagtggtc 14035669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 102
Target Start/End: Original strand, 22714656 - 22714712
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatctta 102  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  22714656 aagatcatactccctttttggaataataatatcccatcgaaattaagaatgatctta 22714712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 29220619 - 29220480
Alignment:
Q  207 aaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa----gagt 302  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| | ||||||||| |  | ||||||||  ||||||    ||||    
T  29220619 aaagttagaatggtggtaacatcatatttgagtggtcacaatagcataatagagtggtcataataccataattgattagtttcaacattaaaatatgagt 29220520  T
Q  303 ggtcttagtaccatat---ttggaggtgtaattctcgaac 339  Q
    || |||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||    
T  29220519 ggacttaataccatattaattggaagtgtaattctcgaac 29220480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 104
Target Start/End: Original strand, 4237946 - 4237977
Alignment:
Q  73 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4237946 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaac 4237977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 104
Target Start/End: Original strand, 4242685 - 4242716
Alignment:
Q  73 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4242685 aatgtcccttcggaattaagaatgatcttaac 4242716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7001940 - 7001849
Alignment:
Q  229 catatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtcttagtaccatatt 319  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| |||||||| |||  | ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  7001940 catatttgagtggtctcaaaactataatagagtggtcacatcatcatattagagtgatttcagtattaaaagagtggtctttgtactatatt 7001849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 277
Target Start/End: Original strand, 15875506 - 15875576
Alignment:
Q  207 aaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatat 277  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  15875506 aaagttagagtggtggtaacaccatatttgaatggtctcagtaccataatagaatggtcacagtaccatat 15875576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27415836 - 27415788
Alignment:
Q  145 agaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgata 193  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  27415836 agaaatagtggtagcaccatatttgagtggttgtagtatcatattgata 27415788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 103
Target Start/End: Original strand, 28572110 - 28572150
Alignment:
Q  63 ttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28572110 ttggaataataatgtcccgtcgaaattaagaatgatcttaa 28572150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Original strand, 40125716 - 40125756
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatat 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40125716 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat 40125756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7573 - 7192
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7573 ataatatatgtctcttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaacggtata 7474  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  7473 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatgttttggagaaattaaag 7374  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  7373 ttagaatggtggcaacacaatatttaagtggtatcaacaccataacagagtggtaacaataccatattaaggtggtttcagtattaaagagtggtcttaa 7274  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||| |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  7273 tacaatatttgagggcgtaattctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctgagcttgttttat 7192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 443572 - 443952
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  443572 ataatatatgtcccttcagaataaagagtacttttaaaatcatagtccctatttggaataacaatgtcccgttggaattaagaatgatcttaacggtaca 443671  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  443672 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaatggtggtatcaccatatttaagtggtcgtagtgccatattgatgttttggagaaattaaag 443771  T
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  443772 ttagaatggtggaaacaccatattttagtggtctcaacaccataatagagtggttacaatatcatattaaggtgatttcagtattaaagagtggtcttag 443871  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  443872 taccatatttgagggtgtaattctcgaacggttttctatagtgca-tagttaaccgcacagttgtagctgggcttgttttat 443952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 211 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4342 - 4162
Alignment:
Q  211 ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttag 310  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4342 ttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat-agagtggtaacagtgccatattaaagtggtttcagtattaaagagtggtcttag 4244  T
Q  311 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4243 taccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 4162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 150765 - 150718
Alignment:
Q  207 aaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccata 254  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  150765 aaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtggtcacattaccata 150718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4338 - 4298
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatat 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4338 aatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagcaccatat 4298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Original strand, 9650 - 9894
Alignment:
Q  148 aatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag--ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||||||| |||||   |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9650 aatggtcgtagcaccatatttgagtggttgaaatgcc-tattgata-tttggagaagttaaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctc 9747  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgatttt 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9748 aacaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtggtttcagtattatagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacggtttt 9847  T
Q  346 ctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9848 ctacagtgcagtagttaatcgaacagttgtagctgggcttgttttat 9894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25921 - 25640
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtata 110  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921 ataatataagtcccttcggaataaagagtgctattaagatcatagtccctttttggaataataatgtctcgtcggaattaagaatgatcttaacggtata 25822  T
Q  111 tataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtt 196  Q
    ||  || | | ||||||||||||   | ||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  25821 ta--aatattctttcaatatttt---aattgaggagaaattaaaaagtggaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagtgtcatattgatactt 25727  T
Q  197 tggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagt 283  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25726 tggagaaattaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagaaccataacagagtggtaataatatcatattaaagt 25640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 146 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29497 - 29262
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttgg----agaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtgg 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  29497 gaaatggtggtgtcaccatatttgagtggtcgtagtgcaatattgatattttggttagagaaattaaagttagaatggtggtaacaccatatttgagtgg 29398  T
Q  242 tctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt-aaagagtggtc----ttagtaccatatttggaggtgtaattctcg 336  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||  | ||    |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  29397 tctcagaaccataacagagtggtaacaatactatactaaaatggtttcagtattaaaagaacgatcttaattagtatcata-ttgaaggtgtaattctcg 29299  T
Q  337 aacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagtt 373  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||    
T  29298 aacggttttctacaatgcagtagttaaccgcacagtt 29262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 263 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25616 - 25487
Alignment:
Q  263 gtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagtta 362  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25616 gtaataatatcatattaaagtggtttcaatattaaagagtggtcttagtaccatatttgaagatgtaagtctcgaacggttttctacagtgtagtagtta 25517  T
Q  363 atcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    | || |||||||||| || |||||||||||    
T  25516 accgcacagttgtagttgggcttgttttat 25487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 29606 - 29521
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggtatatataaaaagtatttcaatatttt 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||| | | ||||||||||||    
T  29606 aagatcatagtccctttttggaataataatgtctcgtcgaaattaagaatgatcttaacag--tatataaatattctttcaatatttt 29521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5766 - 5421
Alignment:
Q  9 gaataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggta 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| | |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||    
T  5766 gaataatttatgtcccttcagaataaagagtacttttaagatcatagtccat-tttggaataaaaatgtctcattggaattaagaatgatcttaacagta 5668  T
Q  109 tatataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaaat--------------ggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatag 194  Q
    ||||  || | | |||||||||||| | ||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||     
T  5667 tata--aatattctttcaatatttt-cgatttgaggagaaattaaaaaatcgaagtggtgttatcaccatatttgagtggtcatagtaccataaagataa 5571  T
Q  195 tttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtat 294  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||| ||||||||||| ||||||        
T  5570 tttggagaacttaaagtaagaatagtggtaacaccatatttgagtggtatcagcaccataacataattgtaacaata-catattaaagtggtttca---- 5476  T
Q  295 taaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctac 349  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||  ||||||||    
T  5475 ttaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgtaaatctcaaacagttttctac 5421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 295
Target Start/End: Original strand, 148166 - 148316
Alignment:
Q  146 gaaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtct 244  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  148166 gaaaaggtggtttcaccatattagagtggttgtagtaccatattgatagtttggagaacttaaaagttagaatggtggtaacactatatttgagtggtct 148265  T
Q  245 catcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    || || ||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  148266 caacatcataatagagtgataacaataccatattaatgtggttttagtatt 148316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 392
Target Start/End: Original strand, 164928 - 165036
Alignment:
Q  290 agtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaa------tcgaacagttgtagctgagc 383  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||       || ||||||||||||||||    
T  164928 agtatgaaagagtggtcttagtaccgtatttgagggtgtaaatctcaaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcgcgcgcacagttgtagctgagc 165027  T
Q  384 ttgttttat 392  Q
    |||||||||    
T  165028 ttgttttat 165036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 148
Target Start/End: Original strand, 148020 - 148154
Alignment:
Q  11 ataatatatgtcccttcagaataaagagnnnnnnnaagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaacggta-t 109  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||| |||| || || |||||||| ||  |||||||||||||||||   ||| |    
T  148020 ataatgtatctcccttcagaataaagaatacttttaagatcatagtccctttttgaaa-aataatgtcccatcaaaattaagaatgatctta---gtagt 148115  T
Q  110 atataaaaagtatttcaatatttttctatttgaggagaa 148  Q
    ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  148116 atataaatattctttaaatatttttctatttgaggagaa 148154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4259 - 4092
Alignment:
Q  195 tttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagta 293  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  ||| ||||    
T  4259 tttggagaaattaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcagtaccataatagagtggtaacattaccataaaaaagtgatttaagta 4160  T
Q  294 ttaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagtt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  4159 ttaaagagtggtcttagtaccatatttaagggtataaatctcgaatggttttctacaatgcagtagtt 4092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 46062 - 45891
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||| |||     | |||||||||||    
T  46062 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacagtaccgtat-----tggtttcagtatt 45968  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  | ||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  45967 aaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgttatttctcgaacgatcatatacggtgcagtatttaatggaacag 45891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 83356 - 83154
Alignment:
Q  182 accatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaa 280  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||  |||||      
T  83356 accatattgata-tttggagatgttaaaaattagaatggtagtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagagtggttatagtattatattg- 83259  T
Q  281 agtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctg 380  Q
        ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||    
T  83258 ----gtttcagtat--aagagtgatcttagtaccatatt-gaaggtgtaattctcgaaaggttttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgcagctg 83166  T
Q  381 agcttgttttat 392  Q
    ||||||||||||    
T  83165 agcttgttttat 83154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Original strand, 152725 - 152896
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||| |||     | |||||||||||    
T  152725 ttggagaagttaaaattagaatggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaatggtaacagtaccgtat-----tggtttcagtatt 152819  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  | ||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  152820 aaagagtggtcttagtaccatatttgagggtgttatttctcgaacgatcatatacggtgcagtatttaatggaacag 152896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 353
Target Start/End: Original strand, 146192 - 146402
Alignment:
Q  147 aaatggtggtatcaccatatttgagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaag-ttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctc 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||| | ||||||||  |||||  |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  146192 aaatggtggtagcaccatatttgagtggttgtactaccttattgaca-tttggagatgttaaaaattagaatggtggtaacaccatatttgaatggtctc 146290  T
Q  246 atcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa---gagtggtcttagta-ccatatttggaggtgtaattctcgaacga 341  Q
    |  ||||||| ||| |||| |||||||||||| | ||| |||||| |||||||   |||||  |||| || |||||||||   ||||||||||||||| |    
T  146291 agtaccataatagaatggtcacaataccatataatagtggtttcattattaaattcgagtgtccttactagccatatttgagagtgtaattctcgaacaa 146390  T
Q  342 ttttctacagtg 353  Q
    ||||||||||||    
T  146391 ttttctacagtg 146402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 392
Target Start/End: Original strand, 155488 - 155525
Alignment:
Q  355 agtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  155488 agtagttaatcgcacagttgtagctgaacttgttttat 155525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 371
Target Start/End: Original strand, 47694 - 47845
Alignment:
Q  216 atggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtacca 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47694 atggtggtaacaccatatttgagtggtctcaacaccataatagaaaaataacaataccatattg-----gtttcagtattaaagagtggtcttagtacca 47788  T
Q  316 tatttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    |||| |  |||| || ||||||||||||  | ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  47789 tattagagggtgttatttctcgaacgatcatatacggtgcagtatttaatcgaacag 47845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 371
Target Start/End: Original strand, 52717 - 52888
Alignment:
Q  196 ttggagaacttaaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtatt 295  Q
    ||||||||  |||| |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||| |||| ||||||      |||||||||||    
T  52717 ttggagaagataaaattagaatggtggtaaaaccatatttgagcggtctcaacaccataatagaatgataaaaatatcatattg-----gtttcagtatt 52811  T
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||  | ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  52812 aaagagtggtcttagtaccatattagagggtgttatttctcgaacgatcatatacggtgcagtatttaatcgaacag 52888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 241 - 371
Target Start/End: Original strand, 1088 - 1214
Alignment:
Q  241 gtctcatcaccataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtg-taattctcgaac 339  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||    
T  1088 gtctcaacaccataatagaatggtaacaataccatattg-----gtttcagtattaaagagtggtcttagtaccatattagagggtgttatttctcgaac 1182  T
Q  340 gattttctacagtgtagtagttaatcgaacag 371  Q
    |||  | ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  1183 gatcatatacggtgcagtatttaatcgaacag 1214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2020 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold2020
Description:

Target: scaffold2020; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 567 - 459
Alignment:
Q  290 agtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaa------tcgaacagttgtagctgagc 383  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||       || ||||||||||||||||    
T  567 agtatgaaagagtggtcttagtaccgtatttgagggtgtaaatctcaaacggttttctacagtgcagtagttaaccgcgcgcgcacagttgtagctgagc 468  T
Q  384 ttgttttat 392  Q
    |||||||||    
T  467 ttgttttat 459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 13460 - 13364
Alignment:
Q  290 agtattaaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgtt 388  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| ||||||    
T  13460 agtattaaa-agtggtcttagtaccatattag-aggtgtaaattgcgaaccattttctacagtgaagtagttaaccgcacagttgtagttgaacttgtt 13364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13521 - 13466
Alignment:
Q  207 aaagttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctcatcaccataacagagtg 262  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  13521 aaagttagaatggtgataacaccatatttaagtggtcacatgaccataatagagtg 13466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13659 - 13601
Alignment:
Q  46 aagatcatagtccctatttggaataacaatgtcccttcggaattaagaatgatcttaac 104  Q
    ||||||||||||||| ||||  | || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13659 aagatcatagtccctttttgataaaataatgtcccgtcagaattaagaatgatcttaac 13601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1309 - 1230
Alignment:
Q  310 gtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgtttt 390  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  1309 gtaccatatt-gaaggtgtaaatctcgaacgattttctatagtgcagtagttaaccgcacagtcgtagctgaacttgtttt 1230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 332 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35782 - 35722
Alignment:
Q  332 tctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  35782 tctcgaacgattttctacagtgcagtagttaaccgcacagttgtagctggacttgttttat 35722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 392
Target Start/End: Original strand, 165998 - 166093
Alignment:
Q  296 aaagagtggtcttagtaccatatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  165998 aaagattggtcttagtaccatagtaa-aggtgtaattctcgaacggttttttacagtgcagtaattaaccgcacagttgcagctgggcttgttttat 166093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2540 - 2396
Alignment:
Q  252 ataacagagtggtaacaataccatattaaagtagtttcagtattaaa---gagtggtcttagtac-catatttggaggtgtaattctcgaacgattttct 347  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||   |||||| |||| ||  |||||||   |||||||||||| ||| |||||||    
T  2540 ataatagaatggtcacaataccatattttagtggtttcaatattaaatttgagtggccttaatagacatatttaagggtgtaattctccaacaattttct 2441  T
Q  348 acagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    || ||| |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  2440 acggtgcagtagttaatctcacagttgtacctgagtttgttttat 2396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42262 - 42184
Alignment:
Q  169 gagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  42262 gagtggtcgtagtacaatattgatattttggagaagttaaaggttagaatggtgagaacaccatacttgagtggtctca 42184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 255983 - 255905
Alignment:
Q  314 catatttggaggtgtaattctcgaacgattttctacagtgtagtagttaatcgaacagttgtagctgagcttgttttat 392  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||    
T  255983 catatttgagggtgtaatcctcgaacggttttctacagtgcagtagttaaccacacagttgtagctggacttgttttat 255905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3080 - 3002
Alignment:
Q  169 gagtggtcgtagcaccatattgatagtttggagaacttaaa-gttaggatggtgttaacaccatatttgagtggtctca 246  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||    
T  3080 gagtggtcgtagtacaatattgatattttggagaagttaaaggttagaatggtgagaacaccgtacttgagtggtctca 3002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University