View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19755_low_41 (Length: 312)

Name: NF19755_low_41
Description: NF19755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19755_low_41
NF19755_low_41
[»] chr2 (97 HSPs)
chr2 (56-297)||(23706920-23707161)
chr2 (56-297)||(24918358-24918599)
chr2 (56-297)||(24642452-24642693)
chr2 (58-297)||(24681662-24681901)
chr2 (56-297)||(24671243-24671484)
chr2 (56-297)||(28577317-28577557)
chr2 (56-297)||(39682531-39682772)
chr2 (56-295)||(22105685-22105924)
chr2 (56-297)||(18809161-18809401)
chr2 (56-297)||(23711717-23711957)
chr2 (58-297)||(20261437-20261676)
chr2 (56-295)||(24368046-24368285)
chr2 (57-297)||(38967697-38967937)
chr2 (62-297)||(23131080-23131315)
chr2 (62-297)||(23133547-23133782)
chr2 (62-297)||(34402231-34402466)
chr2 (59-297)||(24529253-24529491)
chr2 (56-297)||(571615-571856)
chr2 (56-289)||(45027608-45027840)
chr2 (56-295)||(21154711-21154950)
chr2 (56-297)||(32214634-32214865)
chr2 (56-297)||(23709236-23709476)
chr2 (56-297)||(24897899-24898139)
chr2 (56-297)||(24905336-24905576)
chr2 (56-297)||(26505597-26505837)
chr2 (56-297)||(26508075-26508315)
chr2 (56-295)||(41523776-41524015)
chr2 (58-296)||(10684468-10684706)
chr2 (56-297)||(24900382-24900622)
chr2 (56-297)||(24902859-24903099)
chr2 (56-297)||(24907811-24908051)
chr2 (46-222)||(6726533-6726709)
chr2 (56-295)||(6726267-6726506)
chr2 (116-297)||(25616399-25616580)
chr2 (56-297)||(32039202-32039442)
chr2 (46-222)||(24918626-24918802)
chr2 (56-253)||(23135841-23136038)
chr2 (46-222)||(24529047-24529223)
chr2 (46-214)||(41523380-41523548)
chr2 (46-214)||(21154315-21154483)
chr2 (46-222)||(22105951-22106127)
chr2 (46-222)||(24368312-24368488)
chr2 (46-222)||(24681930-24682106)
chr2 (46-222)||(23706526-23706702)
chr2 (46-214)||(24671519-24671687)
chr2 (46-220)||(45027405-45027579)
chr2 (46-219)||(23931949-23932122)
chr2 (57-222)||(41523584-41523749)
chr2 (56-200)||(23931775-23931919)
chr2 (56-222)||(21154518-21154684)
chr2 (46-220)||(32214430-32214604)
chr2 (56-222)||(23709043-23709209)
chr2 (56-206)||(23706728-23706878)
chr2 (133-202)||(16900815-16900884)
chr2 (133-202)||(16994206-16994275)
chr2 (133-202)||(34823750-34823819)
chr2 (131-202)||(67339-67410)
chr2 (230-297)||(6726213-6726279)
chr2 (92-202)||(24686597-24686707)
chr2 (234-297)||(21154942-21155004)
chr2 (230-297)||(22105631-22105697)
chr2 (230-297)||(23707200-23707266)
chr2 (230-297)||(24367992-24368058)
chr2 (230-297)||(24642732-24642798)
chr2 (230-297)||(24681557-24681623)
chr2 (230-297)||(38967592-38967658)
chr2 (92-202)||(19887274-19887384)
chr2 (132-202)||(27261332-27261402)
chr2 (133-202)||(12727711-12727780)
chr2 (233-297)||(24671138-24671201)
chr2 (157-221)||(31345490-31345554)
chr2 (230-297)||(24918253-24918319)
chr2 (92-202)||(11232212-11232322)
chr2 (92-202)||(22514059-22514169)
chr2 (92-202)||(28776661-28776771)
chr2 (56-124)||(31345570-31345638)
chr2 (116-174)||(34135071-34135129)
chr2 (231-295)||(21368375-21368439)
chr2 (134-202)||(22274022-22274090)
chr2 (170-222)||(24642373-24642425)
chr2 (230-274)||(41524003-41524046)
chr2 (104-148)||(44584588-44584632)
chr2 (92-174)||(6483113-6483195)
chr2 (104-222)||(18809428-18809546)
chr2 (134-202)||(22283255-22283323)
chr2 (231-295)||(23799467-23799531)
chr2 (183-222)||(23131347-23131386)
chr2 (183-222)||(23711651-23711690)
chr2 (183-222)||(26505864-26505903)
chr2 (183-222)||(26508342-26508381)
chr2 (183-222)||(27920402-27920441)
chr2 (183-222)||(32039136-32039175)
chr2 (183-222)||(34402160-34402199)
chr2 (152-202)||(5889314-5889364)
chr2 (92-174)||(6486580-6486662)
chr2 (186-222)||(23708980-23709016)
chr2 (104-148)||(24788042-24788086)
[»] chr6 (80 HSPs)
chr6 (46-297)||(34963591-34963842)
chr6 (46-281)||(25535641-25535876)
chr6 (56-297)||(30676413-30676654)
chr6 (46-297)||(23992641-23992891)
chr6 (56-297)||(1598275-1598515)
chr6 (56-297)||(26924344-26924584)
chr6 (91-297)||(17377586-17377792)
chr6 (56-297)||(12742535-12742776)
chr6 (56-297)||(1540615-1540855)
chr6 (56-297)||(18334296-18334536)
chr6 (56-297)||(24422765-24423005)
chr6 (56-297)||(33862012-33862252)
chr6 (56-297)||(33864496-33864736)
chr6 (56-295)||(19005371-19005610)
chr6 (56-297)||(18914150-18914391)
chr6 (56-297)||(19847675-19847912)
chr6 (56-297)||(8055247-8055488)
chr6 (56-297)||(31630244-31630485)
chr6 (56-297)||(2290884-2291124)
chr6 (56-297)||(25688720-25688961)
chr6 (58-297)||(28289042-28289279)
chr6 (56-297)||(19858626-19858863)
chr6 (56-297)||(22782445-22782685)
chr6 (46-222)||(19005637-19005813)
chr6 (46-214)||(18914619-18914787)
chr6 (58-297)||(12942419-12942646)
chr6 (46-222)||(1598735-1598911)
chr6 (59-222)||(1871-2034)
chr6 (59-222)||(8830-8993)
chr6 (46-202)||(31630041-31630197)
chr6 (56-222)||(1598542-1598708)
chr6 (56-222)||(25688988-25689154)
chr6 (46-222)||(19847472-19847648)
chr6 (46-222)||(30676210-30676386)
chr6 (56-221)||(27557016-27557181)
chr6 (56-214)||(23415265-23415423)
chr6 (91-222)||(25689181-25689312)
chr6 (56-214)||(26924151-26924309)
chr6 (93-222)||(113-242)
chr6 (56-175)||(15892112-15892231)
chr6 (103-222)||(25737128-25737247)
chr6 (56-214)||(18914426-18914584)
chr6 (58-160)||(17883203-17883305)
chr6 (179-297)||(15875629-15875737)
chr6 (230-297)||(31630524-31630591)
chr6 (127-222)||(22981321-22981416)
chr6 (127-222)||(23806992-23807087)
chr6 (104-202)||(19984130-19984228)
chr6 (92-202)||(16240296-16240406)
chr6 (92-202)||(16556944-16557054)
chr6 (92-202)||(16633500-16633610)
chr6 (92-202)||(16650174-16650284)
chr6 (92-202)||(22593581-22593691)
chr6 (230-295)||(19005266-19005330)
chr6 (230-297)||(18914045-18914111)
chr6 (92-202)||(25904474-25904585)
chr6 (92-202)||(27654596-27654706)
chr6 (132-202)||(35016043-35016113)
chr6 (56-129)||(25737028-25737101)
chr6 (132-202)||(22226608-22226679)
chr6 (92-202)||(10487971-10488081)
chr6 (92-202)||(16377247-16377357)
chr6 (92-202)||(16384571-16384681)
chr6 (92-202)||(16826367-16826477)
chr6 (133-202)||(1555527-1555596)
chr6 (133-202)||(33315116-33315185)
chr6 (92-200)||(19609582-19609690)
chr6 (92-202)||(25175112-25175222)
chr6 (230-295)||(15875526-15875590)
chr6 (104-222)||(18334151-18334269)
chr6 (104-202)||(21776107-21776205)
chr6 (152-202)||(23153035-23153085)
chr6 (104-222)||(24423032-24423150)
chr6 (56-121)||(9020-9085)
chr6 (104-149)||(10905416-10905461)
chr6 (231-295)||(35056717-35056781)
chr6 (183-222)||(33864763-33864802)
chr6 (247-297)||(25656847-25656897)
chr6 (132-202)||(29665374-29665444)
chr6 (231-289)||(32259078-32259136)
[»] chr7 (87 HSPs)
chr7 (56-297)||(15081545-15081786)
chr7 (46-295)||(8468955-8469204)
chr7 (56-297)||(16213902-16214143)
chr7 (56-297)||(8940497-8940742)
chr7 (56-297)||(14269660-14269901)
chr7 (56-297)||(27217078-27217319)
chr7 (56-297)||(41523135-41523376)
chr7 (56-297)||(41525597-41525838)
chr7 (56-297)||(456539-456780)
chr7 (56-297)||(15376417-15376657)
chr7 (56-297)||(20384827-20385067)
chr7 (56-297)||(14948826-14949066)
chr7 (56-297)||(16232738-16232979)
chr7 (56-297)||(16410277-16410517)
chr7 (56-297)||(45847358-45847599)
chr7 (62-298)||(13869565-13869801)
chr7 (56-297)||(32125709-32125949)
chr7 (46-295)||(11972768-11973017)
chr7 (58-297)||(11303465-11303704)
chr7 (59-297)||(21189302-21189539)
chr7 (56-297)||(18640490-18640730)
chr7 (58-297)||(16108394-16108633)
chr7 (56-297)||(18627784-18628024)
chr7 (58-295)||(23664658-23664895)
chr7 (58-296)||(29796829-29797067)
chr7 (58-296)||(29800648-29800886)
chr7 (56-297)||(18430930-18431170)
chr7 (107-297)||(11393041-11393231)
chr7 (56-297)||(24702456-24702687)
chr7 (56-297)||(24704903-24705134)
chr7 (56-297)||(26355685-26355925)
chr7 (56-297)||(26358137-26358377)
chr7 (46-222)||(38897728-38897904)
chr7 (46-222)||(16214170-16214346)
chr7 (46-222)||(8940962-8941138)
chr7 (46-222)||(21189096-21189272)
chr7 (46-222)||(14269264-14269440)
chr7 (123-295)||(13841274-13841446)
chr7 (46-214)||(15081342-15081510)
chr7 (56-222)||(10501097-10501263)
chr7 (56-222)||(8940769-8940934)
chr7 (56-221)||(25926833-25926998)
chr7 (56-222)||(14269467-14269633)
chr7 (56-222)||(14156782-14156944)
chr7 (59-222)||(14156592-14156755)
chr7 (56-221)||(13918106-13918272)
chr7 (56-221)||(1856933-1857097)
chr7 (60-222)||(17985092-17985254)
chr7 (59-189)||(10500934-10501064)
chr7 (226-297)||(38897996-38898067)
chr7 (135-223)||(11310239-11310327)
chr7 (230-298)||(45847638-45847706)
chr7 (104-222)||(45847213-45847331)
chr7 (52-125)||(23461791-23461864)
chr7 (132-202)||(11286976-11287046)
chr7 (133-202)||(125965-126034)
chr7 (230-297)||(11972714-11972780)
chr7 (230-297)||(14269940-14270006)
chr7 (230-297)||(15081825-15081891)
chr7 (230-297)||(38898106-38898172)
chr7 (230-297)||(8940392-8940458)
chr7 (92-202)||(7822013-7822123)
chr7 (92-202)||(7829324-7829434)
chr7 (136-202)||(15951637-15951703)
chr7 (92-202)||(27102511-27102621)
chr7 (92-202)||(27109859-27109969)
chr7 (92-202)||(27175705-27175815)
chr7 (92-202)||(38784603-38784713)
chr7 (133-202)||(15760779-15760848)
chr7 (104-184)||(10000996-10001076)
chr7 (55-137)||(11310133-11310214)
chr7 (104-190)||(16202766-16202852)
chr7 (104-202)||(32495062-32495160)
chr7 (104-222)||(15376272-15376390)
chr7 (104-222)||(20384682-20384800)
chr7 (46-84)||(45846945-45846983)
chr7 (230-295)||(15119918-15119983)
chr7 (104-148)||(13475728-13475772)
chr7 (231-295)||(13745569-13745633)
chr7 (231-295)||(38294567-38294631)
chr7 (183-222)||(16410544-16410583)
chr7 (183-222)||(18628051-18628090)
chr7 (183-222)||(18640757-18640796)
chr7 (183-222)||(26355619-26355658)
chr7 (183-222)||(26358071-26358110)
chr7 (132-186)||(15851992-15852046)
chr7 (93-125)||(20110747-20110779)
[»] chr4 (82 HSPs)
chr4 (56-297)||(14970410-14970651)
chr4 (56-297)||(3515225-3515466)
chr4 (56-294)||(52872776-52873014)
chr4 (58-297)||(19617772-19618011)
chr4 (47-295)||(11949-12197)
chr4 (58-297)||(362398-362637)
chr4 (59-297)||(15495880-15496118)
chr4 (56-297)||(15118056-15118296)
chr4 (56-297)||(29267571-29267812)
chr4 (58-297)||(15534399-15534638)
chr4 (56-297)||(50222043-50222283)
chr4 (56-297)||(14746215-14746456)
chr4 (58-297)||(49547479-49547718)
chr4 (56-297)||(44615506-44615747)
chr4 (56-297)||(44772787-44773027)
chr4 (58-297)||(36038088-36038327)
chr4 (56-297)||(19242918-19243159)
chr4 (56-295)||(52312782-52313020)
chr4 (56-297)||(7640890-7641130)
chr4 (64-297)||(19857806-19858029)
chr4 (46-222)||(18214704-18214880)
chr4 (46-222)||(52313240-52313416)
chr4 (56-253)||(1837223-1837420)
chr4 (46-222)||(3515493-3515669)
chr4 (58-294)||(14048798-14049034)
chr4 (46-222)||(362859-363035)
chr4 (56-222)||(52313047-52313213)
chr4 (56-220)||(362668-362832)
chr4 (46-222)||(14970207-14970383)
chr4 (46-222)||(19617567-19617743)
chr4 (46-222)||(19858064-19858240)
chr4 (46-222)||(52872573-52872749)
chr4 (56-222)||(14746022-14746188)
chr4 (91-222)||(15495719-15495850)
chr4 (176-297)||(18214992-18215113)
chr4 (56-241)||(30147189-30147374)
chr4 (202-297)||(15355068-15355163)
chr4 (116-222)||(14185621-14185727)
chr4 (46-130)||(12778376-12778460)
chr4 (183-297)||(18239250-18239363)
chr4 (230-297)||(19857700-19857767)
chr4 (92-202)||(14951270-14951380)
chr4 (104-214)||(22725284-22725393)
chr4 (132-200)||(55377225-55377293)
chr4 (230-297)||(12185-12251)
chr4 (230-297)||(18215152-18215218)
chr4 (104-202)||(25120046-25120144)
chr4 (230-295)||(15355202-15355266)
chr4 (101-202)||(43281694-43281795)
chr4 (230-297)||(52312728-52312794)
chr4 (92-202)||(14995644-14995754)
chr4 (92-202)||(18247739-18247849)
chr4 (132-202)||(18293695-18293765)
chr4 (92-202)||(47357183-47357293)
chr4 (92-200)||(15287858-15287966)
chr4 (92-200)||(15294968-15295076)
chr4 (46-114)||(15489649-15489717)
chr4 (46-101)||(14745876-14745931)
chr4 (230-297)||(14746495-14746561)
chr4 (230-297)||(15496949-15497015)
chr4 (230-297)||(19618050-19618116)
chr4 (230-297)||(52873056-52873122)
chr4 (104-202)||(5683367-5683465)
chr4 (92-202)||(10643746-10643856)
chr4 (92-190)||(16731688-16731786)
chr4 (92-202)||(17146279-17146389)
chr4 (104-202)||(22355071-22355169)
chr4 (133-202)||(18168293-18168362)
chr4 (56-115)||(18214907-18214966)
chr4 (59-122)||(22725431-22725494)
chr4 (55-173)||(14185477-14185595)
chr4 (152-214)||(14745925-14745987)
chr4 (92-202)||(19020009-19020119)
chr4 (152-202)||(19698032-19698082)
chr4 (152-202)||(19708617-19708667)
chr4 (92-202)||(8374040-8374150)
chr4 (104-222)||(15117911-15118029)
chr4 (100-200)||(9198558-9198658)
chr4 (92-174)||(630279-630361)
chr4 (106-148)||(11940064-11940106)
chr4 (185-222)||(44772723-44772760)
chr4 (104-148)||(11557892-11557936)
[»] chr3 (97 HSPs)
chr3 (46-297)||(12119347-12119598)
chr3 (46-281)||(24513910-24514145)
chr3 (56-297)||(46822479-46822720)
chr3 (56-297)||(7781050-7781291)
chr3 (56-297)||(53301207-53301448)
chr3 (56-297)||(17463396-17463636)
chr3 (56-297)||(34159544-34159784)
chr3 (56-297)||(45606610-45606851)
chr3 (56-298)||(10557125-10557367)
chr3 (56-294)||(13436520-13436758)
chr3 (56-297)||(12567778-12568018)
chr3 (56-297)||(27165470-27165711)
chr3 (58-297)||(54521040-54521279)
chr3 (56-298)||(8499737-8499979)
chr3 (56-297)||(13544243-13544482)
chr3 (56-297)||(15977751-15977991)
chr3 (56-297)||(16453984-16454225)
chr3 (56-297)||(6468838-6469078)
chr3 (56-297)||(10247427-10247667)
chr3 (56-297)||(55476709-55476949)
chr3 (62-298)||(15412648-15412884)
chr3 (56-297)||(13153959-13154199)
chr3 (56-295)||(38961541-38961781)
chr3 (56-295)||(17444467-17444706)
chr3 (56-295)||(41124159-41124398)
chr3 (56-239)||(20629895-20630078)
chr3 (56-265)||(16282461-16282670)
chr3 (58-297)||(29544547-29544786)
chr3 (56-297)||(13151494-13151734)
chr3 (56-253)||(28848325-28848522)
chr3 (46-222)||(20629692-20629868)
chr3 (46-222)||(38961338-38961514)
chr3 (56-295)||(25237063-25237302)
chr3 (46-222)||(55318804-55318980)
chr3 (56-295)||(25229476-25229715)
chr3 (47-222)||(41124425-41124600)
chr3 (46-222)||(10557394-10557570)
chr3 (46-211)||(13937473-13937638)
chr3 (46-229)||(10379613-10379796)
chr3 (46-219)||(8500009-8500182)
chr3 (46-222)||(17444264-17444440)
chr3 (46-222)||(27165738-27165914)
chr3 (46-214)||(16282258-16282426)
chr3 (56-221)||(15465448-15465613)
chr3 (46-222)||(53301004-53301180)
chr3 (59-222)||(55319010-55319173)
chr3 (144-297)||(12305363-12305516)
chr3 (46-214)||(46822755-46822923)
chr3 (56-221)||(5223677-5223842)
chr3 (101-223)||(36528447-36528569)
chr3 (46-222)||(17393201-17393378)
chr3 (56-221)||(26054968-26055133)
chr3 (91-222)||(14567430-14567561)
chr3 (116-223)||(3264324-3264431)
chr3 (116-214)||(16358238-16358336)
chr3 (46-122)||(8899418-8899494)
chr3 (230-298)||(9707484-9707552)
chr3 (92-214)||(25058286-25058408)
chr3 (55-137)||(36528340-36528422)
chr3 (230-297)||(8899312-8899378)
chr3 (230-297)||(16282689-16282755)
chr3 (230-297)||(17444694-17444760)
chr3 (230-297)||(38961769-38961835)
chr3 (132-202)||(51158683-51158753)
chr3 (133-202)||(16934851-16934920)
chr3 (133-202)||(49231768-49231837)
chr3 (56-143)||(16358371-16358458)
chr3 (230-297)||(25237009-25237075)
chr3 (230-297)||(41124105-41124171)
chr3 (92-202)||(14528624-14528734)
chr3 (134-202)||(30152450-30152518)
chr3 (230-297)||(11913928-11913994)
chr3 (56-146)||(15007868-15007961)
chr3 (133-200)||(54039167-54039234)
chr3 (92-202)||(1468613-1468723)
chr3 (170-214)||(15007996-15008040)
chr3 (58-137)||(3264459-3264538)
chr3 (92-202)||(8269362-8269472)
chr3 (92-202)||(8276473-8276583)
chr3 (58-112)||(12305525-12305579)
chr3 (133-202)||(17956869-17956938)
chr3 (92-202)||(12808505-12808615)
chr3 (104-202)||(14263640-14263738)
chr3 (116-206)||(21026092-21026182)
chr3 (92-202)||(27840459-27840569)
chr3 (132-202)||(28557370-28557440)
chr3 (104-222)||(34159811-34159929)
chr3 (133-202)||(16820462-16820531)
chr3 (231-295)||(25201333-25201397)
chr3 (183-222)||(17463663-17463702)
chr3 (183-222)||(55476976-55477015)
chr3 (100-202)||(2281000-2281102)
chr3 (55-113)||(14567587-14567645)
chr3 (231-289)||(15025934-15025992)
chr3 (152-202)||(44228516-44228566)
chr3 (230-295)||(17044330-17044395)
chr3 (104-172)||(6158993-6159061)
[»] chr8 (90 HSPs)
chr8 (56-295)||(38549708-38549947)
chr8 (56-297)||(24485747-24485988)
chr8 (56-298)||(27472120-27472362)
chr8 (56-297)||(16413019-16413260)
chr8 (56-297)||(32121946-32122187)
chr8 (56-298)||(15070777-15071019)
chr8 (56-294)||(16198115-16198353)
chr8 (56-297)||(1484620-1484860)
chr8 (56-297)||(14409148-14409388)
chr8 (46-297)||(1326625-1326876)
chr8 (56-285)||(24048841-24049069)
chr8 (56-297)||(5852996-5853236)
chr8 (56-297)||(14823993-14824233)
chr8 (56-297)||(16401628-16401869)
chr8 (56-297)||(18677768-18678009)
chr8 (92-294)||(25657892-25658094)
chr8 (56-297)||(22001971-22002211)
chr8 (56-297)||(4542077-4542317)
chr8 (62-297)||(4483498-4483733)
chr8 (56-295)||(15202882-15203121)
chr8 (56-297)||(20045899-20046139)
chr8 (56-295)||(20403499-20403738)
chr8 (96-295)||(45290385-45290584)
chr8 (56-297)||(19936611-19936842)
chr8 (46-214)||(15202486-15202654)
chr8 (46-222)||(27471917-27472093)
chr8 (46-222)||(32122214-32122390)
chr8 (56-295)||(19896541-19896780)
chr8 (46-214)||(24049104-24049272)
chr8 (56-222)||(16401243-16401408)
chr8 (46-211)||(38549313-38549478)
chr8 (46-214)||(19897008-19897176)
chr8 (46-222)||(20403765-20403941)
chr8 (56-223)||(15202689-15202856)
chr8 (56-221)||(14397444-14397609)
chr8 (56-222)||(19896807-19896973)
chr8 (46-222)||(15071046-15071222)
chr8 (56-222)||(38549515-38549681)
chr8 (49-214)||(19936411-19936576)
chr8 (57-194)||(45290252-45290389)
chr8 (46-222)||(16412816-16412992)
chr8 (58-206)||(16401437-16401585)
chr8 (46-200)||(11361024-11361178)
chr8 (46-149)||(32810262-32810365)
chr8 (230-297)||(13425336-13425403)
chr8 (230-297)||(20982498-20982565)
chr8 (230-297)||(20982604-20982671)
chr8 (230-297)||(38549988-38550055)
chr8 (92-202)||(15319988-15320098)
chr8 (92-202)||(15500357-15500467)
chr8 (133-202)||(29759429-29759498)
chr8 (241-297)||(13425241-13425297)
chr8 (230-297)||(20403445-20403511)
chr8 (230-297)||(32810149-32810215)
chr8 (230-297)||(45290572-45290638)
chr8 (104-202)||(24717722-24717820)
chr8 (133-202)||(13663129-13663198)
chr8 (133-202)||(22007126-22007195)
chr8 (230-297)||(1326915-1326981)
chr8 (230-297)||(19896487-19896553)
chr8 (132-202)||(17150655-17150725)
chr8 (231-297)||(19936882-19936947)
chr8 (230-295)||(16401908-16401972)
chr8 (230-297)||(15203109-15203175)
chr8 (92-202)||(223304-223414)
chr8 (92-202)||(272163-272273)
chr8 (92-202)||(643576-643686)
chr8 (92-202)||(688075-688185)
chr8 (92-202)||(736927-737037)
chr8 (92-202)||(829382-829492)
chr8 (92-202)||(860822-860932)
chr8 (132-202)||(22089412-22089482)
chr8 (132-202)||(39114415-39114485)
chr8 (152-202)||(18611952-18612002)
chr8 (133-202)||(18618830-18618899)
chr8 (133-202)||(22146977-22147046)
chr8 (234-297)||(21513644-21513707)
chr8 (107-174)||(24678771-24678838)
chr8 (104-222)||(1484887-1485005)
chr8 (231-297)||(18815609-18815675)
chr8 (133-222)||(20045783-20045872)
chr8 (231-295)||(38988740-38988804)
chr8 (231-295)||(39019837-39019901)
chr8 (183-222)||(5852930-5852969)
chr8 (183-222)||(14409082-14409121)
chr8 (116-202)||(19866454-19866540)
chr8 (231-297)||(36733302-36733368)
chr8 (238-295)||(5083001-5083058)
chr8 (231-295)||(19936829-19936893)
chr8 (231-295)||(38549936-38550000)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (58-297)||(17516869-17517108)
chr5 (56-297)||(2154335-2154576)
chr5 (56-297)||(20901624-20901865)
chr5 (56-297)||(20909230-20909470)
chr5 (56-297)||(264472-264712)
chr5 (62-298)||(38619653-38619889)
chr5 (56-298)||(23064730-23064972)
chr5 (56-297)||(29346198-29346438)
chr5 (62-297)||(39363602-39363837)
chr5 (56-297)||(10732644-10732884)
chr5 (56-297)||(29348671-29348911)
chr5 (56-297)||(29351144-29351384)
chr5 (56-297)||(39245354-39245594)
chr5 (56-295)||(20917550-20917789)
chr5 (56-295)||(32027665-32027904)
chr5 (56-297)||(42245069-42245309)
chr5 (59-296)||(37804609-37804846)
chr5 (46-222)||(29330468-29330644)
chr5 (56-295)||(29330203-29330441)
chr5 (46-222)||(32028511-32028687)
chr5 (56-222)||(32028124-32028291)
chr5 (56-214)||(295978-296136)
chr5 (46-206)||(2154132-2154292)
chr5 (92-296)||(9776577-9776781)
chr5 (46-222)||(17516471-17516647)
chr5 (46-222)||(20901421-20901597)
chr5 (46-222)||(295775-295951)
chr5 (46-214)||(20917347-20917515)
chr5 (91-222)||(17516709-17516840)
chr5 (56-206)||(32027947-32028097)
chr5 (56-214)||(32028326-32028484)
chr5 (230-297)||(20901904-20901971)
chr5 (92-202)||(22883903-22884013)
chr5 (132-202)||(27183208-27183278)
chr5 (230-297)||(29330149-29330215)
chr5 (230-297)||(32027611-32027677)
chr5 (92-202)||(43444008-43444118)
chr5 (133-202)||(1220384-1220453)
chr5 (133-202)||(10778832-10778901)
chr5 (106-202)||(23511127-23511223)
chr5 (230-297)||(20917830-20917896)
chr5 (92-202)||(11903-12013)
chr5 (132-202)||(23506503-23506573)
chr5 (92-202)||(25426177-25426287)
chr5 (92-200)||(7424879-7424987)
chr5 (92-202)||(11342190-11342300)
chr5 (92-202)||(21933242-21933352)
chr5 (92-202)||(21939412-21939522)
chr5 (92-202)||(22367094-22367204)
chr5 (92-202)||(35581340-35581450)
chr5 (92-202)||(36990638-36990748)
chr5 (133-202)||(1168832-1168901)
chr5 (133-202)||(11212734-11212803)
chr5 (230-295)||(20917777-20917842)
chr5 (133-202)||(21074249-21074318)
chr5 (92-202)||(18778605-18778715)
chr5 (132-202)||(32950213-32950283)
chr5 (104-202)||(35791736-35791834)
chr5 (234-297)||(18743973-18744036)
chr5 (104-202)||(19499428-19499526)
chr5 (133-193)||(28901495-28901555)
chr5 (133-193)||(28937890-28937950)
chr5 (183-222)||(264406-264445)
chr5 (183-222)||(20909497-20909536)
chr5 (183-222)||(39245621-39245660)
chr5 (183-222)||(39363869-39363908)
chr5 (231-297)||(1628169-1628235)
chr5 (233-295)||(21399896-21399958)
chr5 (104-142)||(23280293-23280331)
chr5 (231-272)||(24067282-24067323)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (46-297)||(217-468)
scaffold0494 (230-297)||(507-574)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (56-298)||(806-1048)
scaffold0747 (46-192)||(1225-1370)
scaffold0747 (93-222)||(1075-1204)
scaffold0747 (230-297)||(702-768)
[»] scaffold0230 (5 HSPs)
scaffold0230 (59-297)||(23237-23475)
scaffold0230 (56-297)||(14165-14406)
scaffold0230 (46-222)||(22871-23047)
scaffold0230 (136-222)||(23121-23207)
scaffold0230 (46-106)||(20704-20764)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (56-297)||(4006-4247)
scaffold0741 (56-222)||(3813-3979)
scaffold0741 (56-214)||(3620-3778)
scaffold0741 (170-214)||(3541-3585)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (56-297)||(4912-5153)
scaffold0716 (46-222)||(5180-5356)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (56-297)||(17143-17384)
scaffold0023 (56-297)||(94629-94869)
scaffold0023 (46-222)||(16940-17116)
scaffold0023 (133-202)||(154892-154961)
scaffold0023 (104-222)||(94896-95014)
[»] scaffold1792 (3 HSPs)
scaffold1792 (59-297)||(425-663)
scaffold1792 (46-222)||(853-1029)
scaffold1792 (136-222)||(693-779)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (56-297)||(13610-13851)
scaffold0444 (182-222)||(13878-13918)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (56-297)||(38039-38280)
scaffold0134 (104-222)||(38307-38425)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (58-295)||(27161292-27161529)
chr1 (56-297)||(13989084-13989324)
chr1 (56-297)||(21840985-21841225)
chr1 (56-297)||(21922995-21923235)
chr1 (46-295)||(22050530-22050779)
chr1 (56-295)||(22122718-22122957)
chr1 (56-297)||(16274959-16275201)
chr1 (56-297)||(21474790-21475031)
chr1 (56-295)||(29776960-29777199)
chr1 (56-297)||(16362136-16362377)
chr1 (56-295)||(31612585-31612824)
chr1 (56-297)||(15859712-15859952)
chr1 (57-295)||(29298461-29298699)
chr1 (56-297)||(23593437-23593678)
chr1 (56-249)||(13227129-13227322)
chr1 (46-222)||(22122514-22122691)
chr1 (46-222)||(29298727-29298903)
chr1 (56-249)||(29535317-29535510)
chr1 (46-222)||(16274756-16274932)
chr1 (46-214)||(31613052-31613220)
chr1 (58-222)||(31612851-31613015)
chr1 (46-212)||(40129387-40129553)
chr1 (46-214)||(29777234-29777402)
chr1 (46-214)||(9044698-9044866)
chr1 (46-222)||(15859496-15859672)
chr1 (46-222)||(16401407-16401583)
chr1 (58-222)||(27161099-27161263)
chr1 (46-147)||(43543269-43543370)
chr1 (230-297)||(16275240-16275307)
chr1 (230-297)||(22050767-22050833)
chr1 (230-297)||(29776906-29776972)
chr1 (230-297)||(31612531-31612597)
chr1 (152-222)||(10812612-10812682)
chr1 (230-297)||(29298354-29298420)
chr1 (132-202)||(21858592-21858662)
chr1 (104-202)||(44035830-44035928)
chr1 (230-297)||(22122945-22123011)
chr1 (92-202)||(17003909-17004019)
chr1 (231-297)||(27161518-27161583)
chr1 (133-202)||(21650910-21650979)
chr1 (133-202)||(22366527-22366596)
chr1 (95-202)||(18060577-18060684)
chr1 (46-108)||(43630282-43630344)
chr1 (230-295)||(29298408-29298473)
chr1 (104-222)||(13989351-13989469)
chr1 (133-193)||(16655942-16656002)
chr1 (152-202)||(7641619-7641669)
chr1 (56-174)||(10812709-10812827)
chr1 (133-202)||(15862081-15862150)
chr1 (140-200)||(22029817-22029877)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (58-297)||(11507-11746)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (56-297)||(6165-6405)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (56-297)||(6639-6880)
scaffold0317 (46-222)||(6436-6612)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (56-297)||(30237-30478)
scaffold0149 (46-222)||(30505-30681)
scaffold0149 (232-297)||(30131-30196)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (56-297)||(20965-21207)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (56-297)||(9460-9700)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (56-297)||(40618-40858)
scaffold0044 (92-214)||(37848-37969)
scaffold0044 (182-222)||(40885-40925)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (58-297)||(10009-10248)
scaffold0043 (52-214)||(10478-10640)
scaffold0043 (58-222)||(10277-10441)
scaffold0043 (230-264)||(9936-9970)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (56-294)||(6682-6910)
scaffold0574 (46-222)||(6937-7113)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (95-297)||(15140-15342)
scaffold0306 (56-264)||(11043-11251)
scaffold0306 (46-222)||(10839-11016)
scaffold0306 (46-222)||(15398-15573)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (58-297)||(3241-3480)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (56-297)||(134429-134669)
scaffold0028 (56-297)||(136898-137138)
scaffold0028 (56-297)||(139367-139607)
scaffold0028 (56-297)||(141836-142076)
scaffold0028 (56-297)||(144305-144545)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (93-297)||(53612-53816)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (46-297)||(38349-38600)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (46-222)||(43225-43401)
scaffold0040 (105-297)||(13379-13571)
scaffold0040 (56-252)||(43002-43198)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (46-222)||(1740-1916)
scaffold1296 (56-135)||(1634-1713)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (58-258)||(7996-8196)
scaffold0278 (56-222)||(8225-8391)
scaffold0278 (46-219)||(8421-8594)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (46-222)||(501550-501726)
scaffold0001 (57-233)||(501347-501522)
scaffold0001 (248-294)||(501305-501351)
scaffold0001 (104-202)||(139589-139687)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (116-297)||(1646-1827)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (56-249)||(68227-68420)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (46-222)||(18423-18599)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (131-288)||(57708-57865)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (58-221)||(17947-18110)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (56-222)||(8311-8477)
[»] scaffold0711 (3 HSPs)
scaffold0711 (57-221)||(7395-7558)
scaffold0711 (56-222)||(7201-7367)
scaffold0711 (127-220)||(7079-7172)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (58-214)||(33472-33628)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (56-221)||(39626-39791)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (56-221)||(19792-19957)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (56-221)||(31497-31662)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (145-297)||(10991-11142)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (59-222)||(36905-37068)
scaffold0151 (96-222)||(36749-36875)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (170-295)||(28061-28186)
scaffold0114 (230-297)||(28007-28073)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (218-297)||(10647-10726)
scaffold0513 (230-297)||(10765-10831)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (54-202)||(113329-113477)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (46-136)||(398-488)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (92-202)||(6195-6305)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (92-202)||(30470-30580)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (101-202)||(12489-12590)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (230-297)||(9949-10016)
scaffold0145 (232-294)||(10005-10067)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (92-202)||(8566-8676)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (92-202)||(725-835)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (133-202)||(6970-7039)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (56-137)||(75608-75689)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (230-297)||(15150-15216)
scaffold0106 (208-297)||(15032-15111)
scaffold0106 (132-200)||(41259-41327)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (92-202)||(1375-1485)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (104-202)||(1267-1365)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (134-200)||(15780-15846)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (104-202)||(32118-32216)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (104-202)||(40628-40726)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (92-202)||(110064-110174)
scaffold0035 (92-202)||(118565-118675)
scaffold0035 (104-147)||(15910-15953)
scaffold0035 (46-75)||(107108-107137)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (132-202)||(39965-40035)
scaffold0034 (132-202)||(45448-45518)
scaffold0034 (132-202)||(79003-79073)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (133-200)||(912-979)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (132-202)||(868-938)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (92-202)||(18205-18315)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (92-202)||(28469-28579)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (92-202)||(38375-38485)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (132-202)||(53946-54016)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (132-202)||(19939-20009)
[»] scaffold0959 (1 HSPs)
scaffold0959 (100-214)||(1219-1333)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (132-202)||(8122-8192)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (232-295)||(16263-16326)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (152-202)||(1959-2009)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (242-295)||(35955-36007)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (133-202)||(167129-167198)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (231-295)||(15297-15361)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 97)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 23706920 - 23707161
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23706920 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgg 23707019  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707020 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 23707119  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707120 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 23707161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24918599 - 24918358
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24918599 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtagagaattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgg 24918500  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918499 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 24918400  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918399 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 24918358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 24642452 - 24642693
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24642452 ccgaatttgaaaagaaaactggtattgattggtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 24642551  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642552 tttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 24642651  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642652 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 24642693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24681901 - 24681662
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24681901 gaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 24681802  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681801 gggcttccaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 24681702  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681701 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 24681662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24671484 - 24671243
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| || |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24671484 ccgaatttgaaatgcaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttgg 24671385  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671384 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 24671285  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671284 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 24671243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28577557 - 28577317
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28577557 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 28577458  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28577457 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 28577358  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28577357 gtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 28577317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39682772 - 39682531
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  39682772 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 39682673  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682672 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 39682573  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39682572 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 39682531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22105924 - 22105685
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22105924 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtgcagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 22105825  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22105824 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 22105725  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  22105724 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 22105685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18809401 - 18809161
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  18809401 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 18809302  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18809301 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 18809202  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18809201 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18809161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 23711717 - 23711957
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  23711717 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 23711816  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23711817 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 23711916  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23711917 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23711957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20261676 - 20261437
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20261676 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 20261577  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20261576 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 20261477  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  20261476 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 20261437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24368285 - 24368046
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24368285 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 24368186  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24368185 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 24368086  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  24368085 gtatatgtttatgagtatcatgttgtttatgattgatgaa 24368046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38967937 - 38967697
Alignment:
Q  57 cgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggt 156  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38967937 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggt 38967838  T
Q  157 ttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatg 256  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967837 ttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatg 38967738  T
Q  257 tatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38967737 tatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgttgaagt 38967697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 62 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23131315 - 23131080
Alignment:
Q  62 ttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgac 161  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23131315 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 23131216  T
Q  162 ttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 261  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23131215 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtat 23131116  T
Q  262 gtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23131115 gtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 23131080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 62 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23133782 - 23133547
Alignment:
Q  62 ttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgac 161  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23133782 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 23133683  T
Q  162 ttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 261  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23133682 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtat 23133583  T
Q  262 gtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23133582 gtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 23133547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 62 - 297
Target Start/End: Original strand, 34402231 - 34402466
Alignment:
Q  62 ttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgac 161  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34402231 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 34402330  T
Q  162 ttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 261  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34402331 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtat 34402430  T
Q  262 gtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  34402431 gtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 34402466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 59 - 297
Target Start/End: Original strand, 24529253 - 24529491
Alignment:
Q  59 aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 158  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24529253 aatttaaaatgaaaacttgtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggttt 24529352  T
Q  159 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 258  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529353 gacttcaaaaggatttatagcacttgagatatggtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 24529452  T
Q  259 tatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24529453 tatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24529491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 571856 - 571615
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  571856 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttgg 571757  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  571756 tttgacgtcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 571657  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  571656 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagt 571615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 56 - 289
Target Start/End: Original strand, 45027608 - 45027840
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  45027608 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattgg 45027707  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45027708 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgaattatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 45027807  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 289  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  45027808 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 21154711 - 21154950
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21154711 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 21154810  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21154811 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 21154910  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| || |||||||||    
T  21154911 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttataattgatgaa 21154950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 32214634 - 32214865
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  32214634 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattgg 32214733  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||              
T  32214734 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta---------- 32214823  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32214824 gtatatgtttgtgtatacgatattgttcatgattgatgaagt 32214865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 23709236 - 23709476
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  23709236 ccgaatttgaaataaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttgg 23709335  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23709336 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 23709435  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23709436 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23709476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 24897899 - 24898139
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  24897899 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24897998  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24897999 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaat 24898098  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24898099 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24898139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 24905336 - 24905576
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  24905336 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24905435  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24905436 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaat 24905535  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24905536 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24905576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26505837 - 26505597
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  26505837 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 26505738  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26505737 tttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 26505638  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  26505637 gtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 26505597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26508315 - 26508075
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |    
T  26508315 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttag 26508216  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26508215 tttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 26508116  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  26508115 gtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 26508075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 41523776 - 41524015
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  41523776 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttgg 41523875  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  41523876 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaat 41523975  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  41523976 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 41524015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 296
Target Start/End: Original strand, 10684468 - 10684706
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10684468 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 10684567  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10684568 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 10684667  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaag 296  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  10684668 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 10684706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 24900382 - 24900622
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  24900382 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24900481  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24900482 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaat 24900581  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
     |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24900582 ttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24900622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 24902859 - 24903099
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  24902859 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24902958  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24902959 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaat 24903058  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
     |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24903059 ttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24903099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 24907811 - 24908051
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  24907811 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 24907910  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24907911 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaat 24908010  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24908011 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24908051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6726709 - 6726533
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726709 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctcatattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 6726610  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6726609 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6726506 - 6726267
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |  | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6726506 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataagtggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 6726407  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6726406 tttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaat 6726307  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  6726306 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 6726267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25616580 - 25616399
Alignment:
Q  116 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||     
T  25616580 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtcac 25616481  T
Q  216 agtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25616480 aatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25616399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 32039202 - 32039442
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||    
T  32039202 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaaggattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttgg 32039301  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32039302 tttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 32039401  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||||||||    
T  32039402 gtatatg-ttgtgaatctgatattgtccatgatcgatgaagt 32039442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24918802 - 24918626
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24918802 catctctgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttcta 24918703  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24918702 ataccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23136038 - 23135841
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||    
T  23136038 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttgg 23135939  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgt 253  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135938 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 23135841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 24529047 - 24529223
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529047 catctttgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccttaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 24529146  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  24529147 atgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 41523380 - 41523548
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523380 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccataattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 41523479  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41523480 atgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 41523548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 21154315 - 21154483
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154315 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctagtattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 21154414  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  21154415 atgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgacttttagtcaaattactgcacgtaggtca 21154483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22106127 - 22105951
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22106127 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 22106028  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  22106027 atgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24368488 - 24368312
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368488 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 24368389  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||  || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24368388 atgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24682106 - 24681930
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24682106 catctctcccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattcta 24682007  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| |||| || |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24682006 atgccgttagtctgacatcaaaaagatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 23706526 - 23706702
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706526 catctctggcccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 23706625  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||  |||||||  |  || |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  23706626 atggtgttggttctatgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24671687 - 24671519
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24671687 catctctgccccgaatttggaatgaaatctggtattgatatgtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttcta 24671588  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||| | ||  |||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24671587 atgccatttatttgacatcaaaaatatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24671519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 220
Target Start/End: Original strand, 45027405 - 45027579
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  45027405 catctctgccccaaatttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcga 45027504  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtga 220  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  45027505 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23932122 - 23931949
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23932122 catctctgccctgaatttgaaatgaaagctggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 23932023  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtg 219  Q
    ||  ||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||    
T  23932022 atttcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 222
Target Start/End: Original strand, 41523584 - 41523749
Alignment:
Q  57 cgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggt 156  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||    
T  41523584 cgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggt 41523683  T
Q  157 ttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41523684 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23931919 - 23931775
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23931919 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttgg 23931820  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 200  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23931819 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Original strand, 21154518 - 21154684
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21154518 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgttatagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 21154617  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    | |||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  21154618 tctgacgtcaaaacgatttatagaatttgagttacggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 220
Target Start/End: Original strand, 32214430 - 32214604
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214430 catctctgccccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 32214529  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtga 220  Q
    ||| ||||| | |||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  32214530 atgccgttgctctgacgtcaaaacaatttatagaacttaagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Original strand, 23709043 - 23709209
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||   |||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23709043 ccgattttgaaatgaaaactggtattgattggcacagaattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttgg 23709142  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23709143 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 206
Target Start/End: Original strand, 23706728 - 23706878
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  23706728 ccgaatttgaaatgaaaacggctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtagg 23706827  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 206  Q
    | |||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706828 tctgacgtcaaaacgaattatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 23706878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900815
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16900815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994206
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16994206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823750
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 67410 - 67339
Alignment:
Q  131 gatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  67410 gatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6726213
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 6726213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 24686597 - 24686707
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24686597 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatg 24686696  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  24686697 atcaaattact 24686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 234 - 297
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21155004
Alignment:
Q  234 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 21155004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105631
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 22105631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707266
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23707266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24367992
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 24367992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642798
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtacatgattgatgaagt 24642798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681557
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24681557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967592
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 38967592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 19887274 - 19887384
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19887274 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 19887373  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  19887374 attaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27261402 - 27261332
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  27261402 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatgatcaaattact 27261332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12727780 - 12727711
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12727780 tgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12727711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671138
Alignment:
Q  233 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24671138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  157 ttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918253
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24918253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 11232212 - 11232322
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11232212 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 11232311  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  11232312 atcaaattact 11232322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 22514059 - 22514169
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22514059 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 22514158  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  22514159 atcaaattact 22514169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 28776661 - 28776771
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28776661 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 28776760  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  28776761 atcaaattact 28776771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31345638 - 31345570
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31345638 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31345570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 174
Target Start/End: Original strand, 34135071 - 34135129
Alignment:
Q  116 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgattt 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||    
T  34135071 aaagttgtaggtatggaagttagctttctaattgctttggtttgacttccatatgattt 34135129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21368439 - 21368375
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||    
T  21368439 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 21368375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22274090 - 22274022
Alignment:
Q  134 gttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  22274090 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 22274022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 222
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  170 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Original strand, 41524003 - 41524046
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatact 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41524003 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatact 41524046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 148
Target Start/End: Original strand, 44584588 - 44584632
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44584588 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6483195 - 6483113
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgattt 174  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  6483195 gaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgattt 6483113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18809546 - 18809428
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  18809546 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18809447  T
Q  204 cacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  18809446 cacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22283323 - 22283255
Alignment:
Q  134 gttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22283323 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaatacttgagttatgatcaaattact 22283255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23799531 - 23799467
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || || |||||||||||||||    
T  23799531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaa 23799467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131347
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 23711651 - 23711690
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23711651 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26505903 - 26505864
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26505903 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26508381 - 26508342
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26508381 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 27920402 - 27920441
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27920402 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 32039136 - 32039175
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32039136 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402199
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Original strand, 5889314 - 5889364
Alignment:
Q  152 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  5889314 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 5889364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6486662 - 6486580
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgattt 174  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||    
T  6486662 gaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 6486580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 222
Target Start/End: Original strand, 23708980 - 23709016
Alignment:
Q  186 gttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23708980 gttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaat 23709016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24788086 - 24788042
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 148  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24788086 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttatctttccaatg 24788042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 80)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 46 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34963842 - 34963591
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963842 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 34963743  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaatta 245  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34963742 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 34963643  T
Q  246 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34963642 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 34963591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 46 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25535876 - 25535641
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535876 catctttgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 25535777  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaatta 245  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25535776 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatta 25535677  T
Q  246 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25535676 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 30676413 - 30676654
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30676413 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 30676512  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676513 tttgacttcaaaataatttatagaacttgagttatggtaaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 30676612  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30676613 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 30676654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 46 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23992891 - 23992641
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23992891 catctctgccccgaatttgaaatgaaatccggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttcta 23992792  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaatta 245  Q
    |||  |||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23992791 atgttgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaatta 23992692  T
Q  246 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23992691 gtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23992641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1598515 - 1598275
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1598515 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 1598416  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598415 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtcatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 1598316  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1598315 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 1598275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 26924344 - 26924584
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26924344 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 26924443  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924444 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 26924543  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26924544 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 26924584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 91 - 297
Target Start/End: Original strand, 17377586 - 17377792
Alignment:
Q  91 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  17377586 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttat 17377685  T
Q  191 ggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattg 290  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377686 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattg 17377785  T
Q  291 atgaagt 297  Q
    |||||||    
T  17377786 atgaagt 17377792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12742776 - 12742535
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  12742776 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 12742677  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742676 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 12742577  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  12742576 gtatatgtttgtgaatacgaccttgtccatgattgatgaagt 12742535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 1540615 - 1540855
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  1540615 ccgaatttgaaatgcaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 1540714  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1540715 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 1540814  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1540815 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 1540855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 18334296 - 18334536
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  18334296 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 18334395  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18334396 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 18334495  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18334496 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18334536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24423005 - 24422765
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  24423005 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 24422906  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24422905 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 24422806  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24422805 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24422765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33862252 - 33862012
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  33862252 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 33862153  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33862152 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 33862053  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33862052 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 33862012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33864736 - 33864496
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  33864736 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 33864637  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33864636 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 33864537  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33864536 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 33864496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19005610 - 19005371
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19005610 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 19005511  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19005510 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtat 19005411  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  19005410 gtatatgtttgtgaatgcgatattgttcataattgatgaa 19005371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18914391 - 18914150
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || |||  | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  18914391 ccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttgg 18914292  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914291 tttaacttcaaaaggatgtatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 18914192  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18914191 gtatatgtttgtaaatacgatattgttcatgattgatgaagt 18914150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 19847675 - 19847912
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||| ||||||||| ||||||    
T  19847675 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgc----tagatttctaatgccgttgg 19847770  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847771 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 19847870  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19847871 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19847912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8055488 - 8055247
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||    
T  8055488 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttgg 8055389  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8055388 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 8055289  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8055288 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 8055247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 31630244 - 31630485
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||| |    
T  31630244 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttag 31630343  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630344 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtat 31630443  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31630444 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagt 31630485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 2290884 - 2291124
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  2290884 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttgg 2290983  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2290984 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 2291083  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  2291084 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgactgatgaagt 2291124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25688961 - 25688720
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| || |||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25688961 ccgaatttgaaatcaaaactggtatttattggtaccgaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttgg 25688862  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688861 tttgacttcaaaaggatttataaaaattgagttatggtcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 25688762  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  25688761 gtatatttttgtgaatacgatattgtccatgattgaggaagt 25688720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Original strand, 28289042 - 28289279
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28289042 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 28289141  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28289142 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 28289241  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||| |||||||   | ||||||| |||||||||||||||    
T  28289242 atatatttgtga--gcgatattgtccatgattgatgaagt 28289279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 19858626 - 19858863
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||    
T  19858626 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgt---ctttctaatgccgttgg 19858722  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19858723 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 19858822  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19858823 gtatatg-ctgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19858863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22782685 - 22782445
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||||||||  || |||| || |||  ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22782685 ccgaatttgaaatgaaaaatggtattaattggtacagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 22782586  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782585 tttgacttcaaaagaatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 22782486  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22782485 gtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 22782445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19005813 - 19005637
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005813 catctctgccccgaatttgaaatgaaatttggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 19005714  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19005713 atgtcgttggtctgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18914787 - 18914619
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  18914787 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataagtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttcta 18914688  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||| ||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18914687 atgtcgttggtctgacatcaaaaaaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 18914619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12942646 - 12942419
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||            |||||||||||| ||||||||    
T  12942646 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta------------agctttctaatgtcgttggtt 12942559  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12942558 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 12942459  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  12942458 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 12942419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1598911 - 1598735
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598911 catctctaccccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 1598812  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||  ||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1598811 attccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2034
Alignment:
Q  59 aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 158  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1871 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 1970  T
Q  159 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1971 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Original strand, 8830 - 8993
Alignment:
Q  59 aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 158  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  8830 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 8929  T
Q  159 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8930 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Original strand, 31630041 - 31630197
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||  | | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31630041 catctctgccccgaatttaaaatgaaatctggtattgataagtacatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttcta 31630140  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630141 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 31630197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1598708 - 1598542
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1598708 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 1598609  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    | |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1598608 tatgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25689154 - 25688988
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25689154 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 25689055  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |  ||| || |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  25689054 tcggacgtcaaaaaaatttatagaacttgcgttatggtcatattactgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 19847472 - 19847648
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847472 catctctgccccaaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 19847571  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| | || || |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19847572 atgccattagtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 30676210 - 30676386
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||  | |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676210 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgaatggtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 30676309  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||  ||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30676310 attccgttgctctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27557181 - 27557016
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  27557181 ccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattgg 27557082  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
    | |||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27557081 tctgacgttaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23415423 - 23415265
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  23415423 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattgg 23415324  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    | |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23415323 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtca 23415265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25689312 - 25689181
Alignment:
Q  91 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||||||    
T  25689312 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttat 25689213  T
Q  191 ggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25689212 ggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Original strand, 26924151 - 26924309
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  26924151 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttgg 26924250  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26924251 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 26924309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 222
Target Start/End: Original strand, 113 - 242
Alignment:
Q  93 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatgg 192  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  113 aattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatgg 212  T
Q  193 tcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  213 tcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 175
Target Start/End: Original strand, 15892112 - 15892231
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15892112 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttgg 15892211  T
Q  156 tttgacttccaaatgattta 175  Q
    ||||||||| ||| ||||||    
T  15892212 tttgacttcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737128
Alignment:
Q  103 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  203 gcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||  ||||||| |||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18914584 - 18914426
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||| |||| ||  ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  18914584 ccgaattttaaattaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttgg 18914485  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    | |||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18914484 tctgaagtcaaaacgattgatagaacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtca 18914426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 160
Target Start/End: Original strand, 17883203 - 17883305
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17883203 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggtt 17883302  T
Q  158 tga 160  Q
    |||    
T  17883303 tga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875629
Alignment:
Q  179 aacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| ||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatat 15875648  T
Q  279 tgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15875647 tgttcatgattgatgaagt 15875629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630591
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 31630591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 222
Target Start/End: Original strand, 22981321 - 22981416
Alignment:
Q  127 tatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | | || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22981321 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23807087 - 23806992
Alignment:
Q  127 tatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | | || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23807087 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 19984130 - 19984228
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19984130 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19984228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16240406 - 16240296
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16240406 gaattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatg 16240307  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  16240306 atcaaattact 16240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 16556944 - 16557054
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16556944 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16557043  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  16557044 atcaaattact 16557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 16633500 - 16633610
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16633500 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16633599  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  16633600 atcaaattact 16633610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 16650174 - 16650284
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16650174 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatg 16650273  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  16650274 atcaaattact 16650284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 22593581 - 22593691
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    |||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22593581 gaattgggtttaggtgttaacataaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatg 22593680  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  22593681 atcaaattact 22593691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005266
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 19005266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18914045
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttatgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18914045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25904585 - 25904474
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatga-tttatagaacttgagttat 190  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25904585 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttat 25904486  T
Q  191 ggtcaaattact 202  Q
    | ||||||||||    
T  25904485 gatcaaattact 25904474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 27654596 - 27654706
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27654596 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 27654695  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  27654696 attaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 35016043 - 35016113
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35016043 atgttagctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 35016113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25737101 - 25737028
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 129  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25737101 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 22226608 - 22226679
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatga-tttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22226608 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattact 22226679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10488081 - 10487971
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10488081 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 10487982  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  10487981 atcaaattact 10487971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 16377247 - 16377357
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16377247 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 16377346  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  16377347 atcaaattact 16377357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 16384571 - 16384681
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16384571 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 16384670  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  16384671 atcaaattact 16384681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 16826367 - 16826477
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||  |    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16826367 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagacaattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 16826466  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  16826467 attaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1555596 - 1555527
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  1555596 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 33315116 - 33315185
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  33315116 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 33315185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19609690 - 19609582
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  19609690 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagatatg 19609591  T
Q  192 gtcaaatta 200  Q
     ||||||||    
T  19609590 atcaaatta 19609582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25175222 - 25175112
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||    
T  25175222 gaattggactttggtgtaaacatcaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagatattgagatatg 25175123  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  25175122 attaaattact 25175112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875526
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtaaatgattaatgaa 15875526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Original strand, 18334151 - 18334269
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  18334151 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18334250  T
Q  204 cacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  18334251 cacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 21776107 - 21776205
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21776107 ggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23153085 - 23153035
Alignment:
Q  152 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  23153085 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgataaaattact 23153035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24423150 - 24423032
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  24423150 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 24423051  T
Q  204 cacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  24423050 cacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 121
Target Start/End: Original strand, 9020 - 9085
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagtt 121  Q
    |||||||| |||||||| ||| || |||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9020 ccgaattttaaatgaaaactggtaatgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 149
Target Start/End: Original strand, 10905416 - 10905461
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatga 149  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10905416 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatga 10905461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35056781 - 35056717
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  35056781 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaa 35056717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33864802 - 33864763
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33864802 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656847
Alignment:
Q  247 tatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagt 25656847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29665444 - 29665374
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||| | ||||||||    
T  29665444 atgttagctttctattggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatgagagttatgattaaattact 29665374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32259136 - 32259078
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 289  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||    
T  32259136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgatt 32259078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 87)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 15081545 - 15081786
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15081545 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 15081644  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081645 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 15081744  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081745 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 15081786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 46 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8469204 - 8468955
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8469204 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttcta 8469105  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaatta 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8469104 atgacgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaatta 8469005  T
Q  246 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8469004 gtatatgtatgtatatgtttttgaatacgatattgttcatgattgatgaa 8468955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16214143 - 16213902
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16214143 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 16214044  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16214043 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtat 16213944  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16213943 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 16213902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8940742 - 8940497
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacaca----aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacg 151  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8940742 ccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccg 8940643  T
Q  152 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatat 251  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8940642 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatat 8940543  T
Q  252 gtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940542 gtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 8940497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 14269660 - 14269901
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14269660 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgg 14269759  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269760 ttcgacttcaaaaggatttatagaaattgagttatggtcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 14269859  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14269860 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 14269901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27217319 - 27217078
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  27217319 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 27217220  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27217219 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 27217120  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27217119 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 27217078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41523376 - 41523135
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  41523376 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 41523277  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41523276 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 41523177  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41523176 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 41523135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41525838 - 41525597
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  41525838 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 41525739  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41525738 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 41525639  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41525638 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 41525597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 456780 - 456539
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  456780 ccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 456681  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  456680 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 456581  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  456580 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 456539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 15376417 - 15376657
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  15376417 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 15376516  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15376517 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 15376616  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15376617 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 15376657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 20384827 - 20385067
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  20384827 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 20384926  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20384927 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 20385026  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20385027 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20385067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 14948826 - 14949066
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  14948826 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 14948925  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14948926 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 14949025  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14949026 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 14949066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16232979 - 16232738
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16232979 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 16232880  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16232879 tttgaattcaaaaggatttatagaatttgagttattgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 16232780  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16232779 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16232738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16410517 - 16410277
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16410517 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 16410418  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16410417 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaat 16410318  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16410317 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16410277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 45847358 - 45847599
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |    
T  45847358 ccgaatttgaaatgaaaaataatattgattggtacaaaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttag 45847457  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45847458 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtat 45847557  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45847558 gtatatgtctgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 45847599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 62 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13869801 - 13869565
Alignment:
Q  62 ttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgac 161  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13869801 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 13869702  T
Q  162 ttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 261  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869701 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 13869602  T
Q  262 gtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 298  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13869601 gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtt 13869565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32125949 - 32125709
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||    
T  32125949 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttgg 32125850  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32125849 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 32125750  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32125749 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 32125709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11973017 - 11972768
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11973017 catctctgccccgaacttaaaatgaaatctggtattgataggtccagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcta 11972918  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaatta 245  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11972917 atgccgttggtttgacttcaaaaggatctatagaacttgagttatagtcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 11972818  T
Q  246 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  11972817 gtatatgaatgcatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 11972768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11303704 - 11303465
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11303704 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 11303605  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11303604 tgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 11303505  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  11303504 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 11303465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 297
Target Start/End: Original strand, 21189302 - 21189539
Alignment:
Q  59 aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 158  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || |||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21189302 aatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagagttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggttt 21189401  T
Q  159 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 258  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21189402 gacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgta 21189501  T
Q  259 tatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21189502 ta-gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 21189539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18640730 - 18640490
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  18640730 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttgg 18640631  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18640630 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaat 18640531  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18640530 gtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 18640490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Original strand, 16108394 - 16108633
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  16108394 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtt 16108493  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16108494 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 16108593  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  16108594 atatatttgtgaatacaatattgtcaatgattgatgaagt 16108633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18628024 - 18627784
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  18628024 ccgaatttaaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 18627925  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18627924 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaat 18627825  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  18627824 gtatatg-ttgtgaatacgatattttccgtgattgatgaagt 18627784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 58 - 295
Target Start/End: Original strand, 23664658 - 23664895
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23664658 gaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 23664757  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| || ||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23664758 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgt 23664857  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  23664858 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaa 23664895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29797067 - 29796829
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29797067 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 29796968  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29796967 tgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 29796868  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaag 296  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  29796867 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 29796829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29800886 - 29800648
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29800886 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 29800787  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29800786 tgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 29800687  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaag 296  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  29800686 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 29800648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18431170 - 18430930
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||    
T  18431170 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttgg 18431071  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18431070 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaat 18430971  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18430970 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18430930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 107 - 297
Target Start/End: Original strand, 11393041 - 11393231
Alignment:
Q  107 gtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11393041 gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaac 11393140  T
Q  207 ctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
     ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11393141 gtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 11393231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24702687 - 24702456
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  24702687 ccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 24702588  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||          
T  24702587 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtat------ 24702494  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24702493 ----atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 24702456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24705134 - 24704903
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  24705134 ccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 24705035  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||          
T  24705034 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtat------ 24704941  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24704940 ----atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 24704903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 26355685 - 26355925
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  26355685 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttgg 26355784  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  26355785 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaat 26355884  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26355885 gtatatg-ttgtaaatacgatattgtccataattgatgaagt 26355925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 26358137 - 26358377
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  26358137 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttgg 26358236  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  26358237 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaat 26358336  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26358337 gtatatg-ttgtaaatacgatattgtccataattgatgaagt 26358377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 38897728 - 38897904
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897728 catctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 38897827  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38897828 atgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16214346 - 16214170
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16214346 catctctgccccgaatttgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttcta 16214247  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  16214246 atgccgttggtatgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8941138 - 8940962
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8941138 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 8941039  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  8941038 atgccgttggtctgaagtcaaaatgatttatagaacttgagttatgctcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 21189096 - 21189272
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21189096 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagcttttta 21189195  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21189196 atgccgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 14269264 - 14269440
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269264 catctctgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 14269363  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||  |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14269364 attccgttggtttgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 123 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841274
Alignment:
Q  123 taggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  223 aactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 15081342 - 15081510
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081342 catctatgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccataattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 15081441  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15081442 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtca 15081510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Original strand, 10501097 - 10501263
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10501097 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttgg 10501196  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  10501197 tttgacttcaaatggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8940934 - 8940769
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8940934 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataattggtcttaggtgtaaaca-aaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 8940836  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8940835 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 25926833 - 25926998
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  25926833 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattgg 25926932  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
    | |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25926933 tctgacgtcaaaaagagttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Original strand, 14269467 - 14269633
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  14269467 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttgg 14269566  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    | |||| || |||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  14269567 tatgacgtcaaaaaaatttatagaacttgagttatcatcaaattattgcacgcaggtcagagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Original strand, 14156782 - 14156944
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14156782 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggt----acactaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 14156877  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14156878 tttgacttcaaaaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Original strand, 14156592 - 14156755
Alignment:
Q  59 aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 158  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14156592 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 14156691  T
Q  159 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  14156692 gacttcaaaaggatttatagaacttgacttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 13918106 - 13918272
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtctt-aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttg 154  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  13918106 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattg 13918205  T
Q  155 gtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
    || |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13918206 gtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 1856933 - 1857097
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  1856933 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaa-gttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattgg 1857031  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
    | |||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1857032 tctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 17985092 - 17985254
Alignment:
Q  60 atttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttg 159  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||    
T  17985092 atttcaaatgaaatctggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttg 17985191  T
Q  160 acttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    | | | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17985192 attccaaaatgatatttagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 189
Target Start/End: Original strand, 10500934 - 10501064
Alignment:
Q  59 aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 158  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10500934 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 10501033  T
Q  159 gacttccaaatgatttatagaacttgagtta 189  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10501034 gacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 297
Target Start/End: Original strand, 38897996 - 38898067
Alignment:
Q  226 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897996 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 38898067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  135 ttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaata 223  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 298
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847706
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtt 45847706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Original strand, 45847213 - 45847331
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847213 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 45847312  T
Q  204 cacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  45847313 cacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 125
Target Start/End: Original strand, 23461791 - 23461864
Alignment:
Q  52 tgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23461791 tgccccgaatttgaaatgaagtctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11287046 - 11286976
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11287046 atgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125965
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972714
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgcccatgattgatgaagt 11972714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14270006
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 14270006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15081891
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 15081891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898172
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 38898172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940392
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 8940392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7822123 - 7822013
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7822123 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 7822024  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  7822023 atcaaattact 7822013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7829434 - 7829324
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7829434 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 7829335  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  7829334 atcaaattact 7829324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 202
Target Start/End: Original strand, 15951637 - 15951703
Alignment:
Q  136 tagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15951637 tagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 15951703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 27102511 - 27102621
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27102511 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27102610  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  27102611 atcaaattact 27102621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 27109859 - 27109969
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27109859 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27109958  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  27109959 atcaaattact 27109969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27175815 - 27175705
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27175815 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27175716  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  27175715 atcaaattact 27175705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 38784603 - 38784713
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38784603 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 38784702  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  38784703 atcaaattact 38784713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 15760779 - 15760848
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  15760779 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 184
Target Start/End: Original strand, 10000996 - 10001076
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttg 184  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10000996 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttg 10001076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11310214 - 11310133
Alignment:
Q  55 cccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtta 137  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  11310214 cccgaatttgaaatgaaaactg-tattgataagtacataattggtcttaggtgttttcacaaaagttgtaggtatagatgtta 11310133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 190
Target Start/End: Original strand, 16202766 - 16202852
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttat 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||   ||||||| ||||| |||||||||    
T  16202766 ggtgtaaacataaaagttgtaggtagtgatgttagatttctaatggctttggttttacttcatgatgatttctagaatttgagttat 16202852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 32495062 - 32495160
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | |||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32495062 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttatctttctaatggctttggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcatattact 32495160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Original strand, 15376272 - 15376390
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  15376272 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15376371  T
Q  204 cacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  15376372 cacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Original strand, 20384682 - 20384800
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  20384682 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 20384781  T
Q  204 cacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  20384782 cacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 84
Target Start/End: Original strand, 45846945 - 45846983
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgat 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45846945 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgat 45846983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 295
Target Start/End: Original strand, 15119918 - 15119983
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||    
T  15119918 tatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 15119983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 148
Target Start/End: Original strand, 13475728 - 13475772
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 148  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13475728 ggtgtaaacacaaaggttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 13475772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 13745569 - 13745633
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||| |||||    
T  13745569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaa 13745633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38294631 - 38294567
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||    
T  38294631 atgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410544
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18628051
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640757
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355658
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358110
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15852046 - 15851992
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgag 186  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  15852046 atgttatctttctaatggctttggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgag 15851992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110747
Alignment:
Q  93 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 125  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 20110747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 82)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 14970410 - 14970651
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14970410 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 14970509  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14970510 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtat 14970609  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14970610 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcataattgatgaagt 14970651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3515466 - 3515225
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3515466 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgatcggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 3515367  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3515366 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtat 3515267  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3515266 gtatatttttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 3515225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 56 - 294
Target Start/End: Original strand, 52872776 - 52873014
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  52872776 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttgg 52872875  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872876 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 52872975  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52872976 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 52873014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Original strand, 19617772 - 19618011
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  19617772 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagagttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtg 19617871  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617872 tgacttcaaaaggatttatagaagttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 19617971  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617972 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 19618011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 295
Target Start/End: Original strand, 11949 - 12197
Alignment:
Q  47 atctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11949 atctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaa 12048  T
Q  147 tgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattag 246  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12049 tgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattag 12148  T
Q  247 tatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||| |||||||||||| ||  || ||| ||||| ||||||||||||    
T  12149 tatatgaatgtatatgtttatgtgtattatgttgtttatgattgatgaa 12197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 362637 - 362398
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| | |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  362637 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtt 362538  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362537 tgacttcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 362438  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  362437 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 362398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 59 - 297
Target Start/End: Original strand, 15495880 - 15496118
Alignment:
Q  59 aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 158  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15495880 aatttggaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 15495979  T
Q  159 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 258  Q
     | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15495980 aaattcgaaaggttttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 15496079  T
Q  259 tatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15496080 tatgtttctgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 15496118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 15118056 - 15118296
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  15118056 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 15118155  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15118156 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 15118255  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15118256 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 15118296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29267812 - 29267571
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||    
T  29267812 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttgg 29267713  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267712 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 29267613  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29267612 gtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29267571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15534638 - 15534399
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15534638 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 15534539  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15534538 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 15534439  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15534438 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 15534399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 50222043 - 50222283
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  50222043 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 50222142  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50222143 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 50222242  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50222243 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 50222283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 14746215 - 14746456
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  14746215 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttgg 14746314  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  14746315 tttgactttaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatat 14746414  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14746415 gtatatgtttgtgaatactattatgttcatgattgatgaagt 14746456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Original strand, 49547479 - 49547718
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49547479 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 49547578  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  49547579 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgt 49547678  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  49547679 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 49547718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44615747 - 44615506
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  44615747 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 44615648  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44615647 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 44615548  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44615547 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 44615506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 44772787 - 44773027
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44772787 ccgaattttaaatgaaaactggtatttattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 44772886  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  44772887 tttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaat 44772986  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44772987 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 44773027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36038327 - 36038088
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36038327 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtt 36038228  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36038227 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgt 36038128  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  36038127 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 36038088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19243159 - 19242918
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19243159 ccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttgg 19243060  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19243059 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 19242960  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19242959 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19242918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 52313020 - 52312782
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  52313020 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 52312921  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52312920 ttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtc-aattactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 52312822  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  52312821 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 52312782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 7640890 - 7641130
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||    
T  7640890 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattgg 7640989  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  7640990 tttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaat 7641089  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7641090 gtatatg-ttgtgaatacgatatttttcatgattgatgaagt 7641130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 64 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19858029 - 19857806
Alignment:
Q  64 gaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgactt 163  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19858029 gaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgactt 19857930  T
Q  164 ccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgt 263  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||          ||||    
T  19857929 caaaataatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgt 19857840  T
Q  264 ttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19857839 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 19857806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 18214704 - 18214880
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214704 catctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 18214803  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  18214804 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 52313416 - 52313240
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52313416 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttcta 52313317  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  52313316 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 253
Target Start/End: Original strand, 1837223 - 1837420
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  1837223 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 1837322  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgt 253  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837323 tttgacttaaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 1837420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3515669 - 3515493
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515669 catctctaccctgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 3515570  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3515569 atgccgttggtctcacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14049034 - 14048798
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||  | ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14049034 gaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtt 14048935  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14048934 tgacttcaaaaggatttacagaacttgtgttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgt 14048835  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  14048834 atatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatga 14048798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 363035 - 362859
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  363035 catctctgccccgaatttgaaatgaaatgtggtattgatttgtatagaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 362936  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  362935 atgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 52313213 - 52313047
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  52313213 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttgg 52313114  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  52313113 tatgacgtcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 56 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 362832 - 362668
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  362832 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 362733  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtga 220  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  362732 tctgacatcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 14970207 - 14970383
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970207 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgatttgtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 14970306  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14970307 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 19617567 - 19617743
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617567 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 19617666  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| | ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19617667 atgccgttggtctaacgccaaaatgatttattgaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19858240 - 19858064
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858240 catctctaccccgaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 19858141  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  19858140 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 52872573 - 52872749
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872573 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 52872672  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||   |||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  52872673 attctgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Original strand, 14746022 - 14746188
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14746022 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 14746121  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  14746122 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Original strand, 15495719 - 15495850
Alignment:
Q  91 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||||||    
T  15495719 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttat 15495818  T
Q  191 ggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15495819 ggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 176 - 297
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215113
Alignment:
Q  176 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacta 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  276 tattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18215092 tattgttcatgattgatgaagt 18215113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30147374 - 30147189
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||||||||  ||  |||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||   |||||| ||||    
T  30147374 ccgaatttgaaatgaaaaatggaattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattgg 30147275  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatga 241  Q
    | ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30147274 tatgacaacaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 297
Target Start/End: Original strand, 15355068 - 15355163
Alignment:
Q  202 tgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15355068 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 15355163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14185727 - 14185621
Alignment:
Q  116 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||     
T  14185727 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtaggtcac 14185628  T
Q  216 agtgaat 222  Q
    |||||||    
T  14185627 agtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 130
Target Start/End: Original strand, 12778376 - 12778460
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatg 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12778376 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 12778460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 297
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239363
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtt 282  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtc 18239348  T
Q  283 catgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||    
T  18239349 catgattgatgaagt 18239363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857700
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19857700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14951380 - 14951270
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    |||||||| ||  |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14951380 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatg 14951281  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  14951280 atcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 214
Target Start/End: Original strand, 22725284 - 22725393
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22725284 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaatc-cgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactg 22725382  T
Q  204 cacctaggtca 214  Q
    ||| |||||||    
T  22725383 cacgtaggtca 22725393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 200
Target Start/End: Original strand, 55377225 - 55377293
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 200  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  55377225 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12251
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 12251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215218
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18215218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 25120046 - 25120144
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25120046 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25120144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 295
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355266
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 15355266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281795
Alignment:
Q  101 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 200  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||   |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 43281793  T
Q  201 ct 202  Q
    ||    
T  43281794 ct 43281795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312728
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagt 52312728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14995754 - 14995644
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14995754 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatg 14995655  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  14995654 atcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18247849 - 18247739
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18247849 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 18247750  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  18247749 attaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 18293695 - 18293765
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18293695 atgttagatttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18293765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47357293 - 47357183
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  47357293 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatg 47357194  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  47357193 attaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 200
Target Start/End: Original strand, 15287858 - 15287966
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15287858 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15287957  T
Q  192 gtcaaatta 200  Q
     ||||||||    
T  15287958 atcaaatta 15287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 200
Target Start/End: Original strand, 15294968 - 15295076
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15294968 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15295067  T
Q  192 gtcaaatta 200  Q
     ||||||||    
T  15295068 atcaaatta 15295076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 114
Target Start/End: Original strand, 15489649 - 15489717
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  15489649 catctctgccccgaatttgaaatgaagtctggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacac 15489717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 101
Target Start/End: Original strand, 14745876 - 14745931
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  14745876 catctctgccccgaatttgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtct 14745931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746561
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 14746561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15497015
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 15497015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618116
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19618116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 52873056 - 52873122
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  52873056 tatgattgatgaattaatatacgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 52873122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 5683367 - 5683465
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||    ||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5683367 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 5683465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10643856 - 10643746
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10643856 gaattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatg 10643757  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  10643756 attaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16731786 - 16731688
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttat 190  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16731786 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttttgaacttgagttat 16731688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 17146279 - 17146389
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17146279 gaattggactttgatgtaaacattaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 17146378  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  17146379 attaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 22355071 - 22355169
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22355071 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18168362 - 18168293
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  18168362 tgttagctttctaatggcgttgatttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 18168293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 115
Target Start/End: Original strand, 18214907 - 18214966
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacaca 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18214907 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaca 18214966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Original strand, 22725431 - 22725494
Alignment:
Q  59 aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttg 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  22725431 aatttgaaatgaaaactgatattgataggtacagaattggtctttggtgtaaacatgaaagttg 22725494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14185595 - 14185477
Alignment:
Q  55 cccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttg 154  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| || |  ||||||||||| | || | |||    
T  14185595 cccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgttaacatgaaagttgtagataagtgtgttagctttccagtggctttg 14185496  T
Q  155 gtttgacttccaaatgatt 173  Q
    || ||||||  ||||||||    
T  14185495 gtgtgacttgaaaatgatt 14185477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 214
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745987
Alignment:
Q  152 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 14745987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19020119 - 19020009
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19020119 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 19020020  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  19020019 attaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Original strand, 19698032 - 19698082
Alignment:
Q  152 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19698032 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19698082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Original strand, 19708617 - 19708667
Alignment:
Q  152 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19708617 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19708667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8374150 - 8374040
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||| |||||||||| | ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8374150 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttaactttctaatggctttgattttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 8374051  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  8374050 attaaattact 8374040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Original strand, 15117911 - 15118029
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  15117911 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15118010  T
Q  204 cacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  15118011 cacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9198658 - 9198558
Alignment:
Q  100 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 199  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  9198658 cttagttgtaaacatgaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtcttacttcaaaatgatttctacaacttgatttatggtcaaatt 9198559  T
Q  200 a 200  Q
    |    
T  9198558 a 9198558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 174
Target Start/End: Original strand, 630279 - 630361
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgattt 174  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  630279 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattt 630361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11940106 - 11940064
Alignment:
Q  106 tgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11940106 tgtaaacataaaagttgtaggtatggatgtaagctttccaatg 11940064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772760
Alignment:
Q  185 agttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11557936 - 11557892
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 148  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11557936 ggtgtaaacattcaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 11557892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 97)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 46 - 297
Target Start/End: Original strand, 12119347 - 12119598
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119347 catctctgccccgaatttgaaataaaaactggtattgatcagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 12119446  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaatta 245  Q
     || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12119447 gtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 12119546  T
Q  246 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12119547 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 12119598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 46 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 24514145 - 24513910
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514145 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgatagctccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 24514046  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaatta 245  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24514045 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 24513946  T
Q  246 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24513945 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 46822720 - 46822479
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46822720 ccgattttgaaatgaaaagtggtattgattggtaaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 46822621  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822620 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 46822521  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  46822520 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 46822479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 7781050 - 7781291
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  7781050 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttgg 7781149  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7781150 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtat 7781249  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7781250 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 7781291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 53301207 - 53301448
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53301207 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttgg 53301306  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53301307 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 53301406  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  53301407 gtatatgtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagt 53301448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17463636 - 17463396
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  17463636 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 17463537  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17463536 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 17463437  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17463436 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 17463396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34159784 - 34159544
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  34159784 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 34159685  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34159684 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 34159585  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34159584 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 34159544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 45606610 - 45606851
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  45606610 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 45606709  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45606710 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 45606809  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45606810 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 45606851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10557367 - 10557125
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10557367 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttag 10557268  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10557267 ttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtat 10557168  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 298  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  10557167 gtatatgtttgtgaattcgatattgtccatgattgatgaagtt 10557125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13436758 - 13436520
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||||||| |||  | |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13436758 ccgagtttgaaatgaaaacttgtattgattggtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 13436659  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436658 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 13436559  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 294  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13436558 atatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12568018 - 12567778
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12568018 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 12567919  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567918 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 12567819  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12567818 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 12567778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27165711 - 27165470
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  27165711 ccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttag 27165612  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27165611 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 27165512  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27165511 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 27165470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 54521279 - 54521040
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54521279 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 54521180  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  54521179 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 54521080  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  54521079 atatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 54521040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8499979 - 8499737
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8499979 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttgg 8499880  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8499879 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 8499780  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  8499779 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtt 8499737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13544482 - 13544243
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13544482 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 13544383  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544382 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaa-tactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 13544284  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13544283 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 13544243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15977991 - 15977751
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  15977991 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 15977892  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15977891 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 15977792  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  15977791 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgataaagt 15977751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 16453984 - 16454225
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16453984 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 16454083  T
Q  156 tttgacttccaaat-gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgta 254  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16454084 tttgacttcaaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 16454183  T
Q  255 tgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16454184 tgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16454225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 6468838 - 6469078
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  6468838 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 6468937  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6468938 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 6469037  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6469038 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 6469078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 10247427 - 10247667
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  10247427 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 10247526  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  10247527 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaat 10247626  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10247627 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 10247667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 55476949 - 55476709
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  55476949 ccgaatttgaaattaaaactggtattgactggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 55476850  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55476849 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 55476750  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  55476749 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 55476709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 62 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15412884 - 15412648
Alignment:
Q  62 ttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgac 161  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15412884 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 15412785  T
Q  162 ttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 261  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15412784 ttcaaaaggatttatagaacttgatttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatat 15412685  T
Q  262 gtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 298  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15412684 gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtt 15412648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 13153959 - 13154199
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  13153959 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 13154058  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  13154059 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaat 13154158  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13154159 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 13154199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 38961541 - 38961781
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgac-gttg 154  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||    
T  38961541 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttg 38961640  T
Q  155 gtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgta 254  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38961641 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaa 38961740  T
Q  255 tgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  38961741 tgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38961781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 17444467 - 17444706
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17444467 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 17444566  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17444567 tttgacttcaaaaggatttattgaacttgagttatagtcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 17444666  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  17444667 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 17444706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41124398 - 41124159
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  41124398 ccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttga 41124299  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  41124298 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaat 41124199  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  41124198 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 41124159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 239
Target Start/End: Original strand, 20629895 - 20630078
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20629895 ccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 20629994  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgat 239  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20629995 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 20630078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 265
Target Start/End: Original strand, 16282461 - 16282670
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||    
T  16282461 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattgg 16282560  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16282561 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 16282660  T
Q  256 gtatatgttt 265  Q
    ||||||||||    
T  16282661 gtatatgttt 16282670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Original strand, 29544547 - 29544786
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29544547 gaatttgaaatgaaaactgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 29544646  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29544647 tgatttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatct 29544746  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||| ||||| || |  |||||||  ||||||||||||||    
T  29544747 atatatttgttaaaatgatattgtcaatgattgatgaagt 29544786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 13151494 - 13151734
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  13151494 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggaacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttag 13151593  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |     
T  13151594 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaag 13151693  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||||||||    
T  13151694 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgcctgatgaagt 13151734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 253
Target Start/End: Original strand, 28848325 - 28848522
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  28848325 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 28848424  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgt 253  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848425 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 28848522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 20629692 - 20629868
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20629692 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttcta 20629791  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20629792 atgtcgttggtctgacattaaagcgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 38961338 - 38961514
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961338 catctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 38961437  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  38961438 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25237302 - 25237063
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||  |    
T  25237302 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtg 25237203  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25237202 tttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 25237103  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  25237102 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 25237063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 55318804 - 55318980
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55318804 catctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttcta 55318903  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  55318904 atgccgttggtatgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25229715 - 25229476
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||  |    
T  25229715 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtg 25229616  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25229615 tttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 25229516  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  25229515 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 25229476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41124600 - 41124425
Alignment:
Q  47 atctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41124600 atctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaa 41124501  T
Q  147 tgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    || ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41124500 tgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10557570 - 10557394
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557570 catctctgccccgaatttgaaacgaaatatggtattgattggtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 10557471  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| |||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10557470 atgccgttggtcggacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 211
Target Start/End: Original strand, 13937473 - 13937638
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13937473 catctttgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgataggacaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 13937572  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctagg 211  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13937573 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgtgttatggtcaaattactgcacgtagg 13937638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10379796 - 10379613
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379796 catctctgccccgaatatgaaataaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 10379697  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaa 229  Q
    ||| ||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  10379696 atgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8500182 - 8500009
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8500182 catctcttccccgaatttgaaataaaaactggtattgatcgatatagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttcta 8500083  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtg 219  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  8500082 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 17444264 - 17444440
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17444264 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttcta 17444363  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| | || || |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17444364 atgtcgttggtctaacgtcaaaacaatttatacaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27165914 - 27165738
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27165914 catctctgccccgaatttgaaataaaaactagtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttcta 27165815  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27165814 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 16282258 - 16282426
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  16282258 catctctgccccgaatttaaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatcttttta 16282357  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    |||  ||| || |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16282358 atgttgttagtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 16282426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15465613 - 15465448
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  15465613 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattgg 15465514  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15465513 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 53301004 - 53301180
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |   ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53301004 catctttgccccgaatttgaaataaaaacaagtattgatcggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttcta 53301103  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  53301104 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Original strand, 55319010 - 55319173
Alignment:
Q  59 aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 158  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  55319010 aatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 55319109  T
Q  159 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  55319110 gacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 144 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12305516 - 12305363
Alignment:
Q  144 taatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaat 243  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||    
T  12305516 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaat 12305417  T
Q  244 tagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  12305416 taatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 12305363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 46822923 - 46822755
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822923 catctgtgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttcta 46822824  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46822823 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtca 46822755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5223842 - 5223677
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  5223842 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattgg 5223743  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  5223742 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  101 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  201 ctgcacctaggtcagagtgaata 223  Q
    |||||| ||||||| ||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17393378 - 17393201
Alignment:
Q  46 catctctgcccc-gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttct 144  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  17393378 catctctgcccccgaatttcaaatgaactcttctattgatcggtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttcc 17393279  T
Q  145 aatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17393278 aatggcgttggtttgactccaaaatgatttttagaacattagttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaat 17393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 26054968 - 26055133
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26054968 ccgaatttgaaaggaaaattggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttgg 26055067  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26055068 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Original strand, 14567430 - 14567561
Alignment:
Q  91 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||||    
T  14567430 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttat 14567529  T
Q  191 ggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
     ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  14567530 agtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 223
Target Start/End: Original strand, 3264324 - 3264431
Alignment:
Q  116 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  3264324 aaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcac 3264423  T
Q  216 agtgaata 223  Q
    ||||||||    
T  3264424 agtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 214
Target Start/End: Original strand, 16358238 - 16358336
Alignment:
Q  116 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16358238 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcataggtca 16358336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8899494 - 8899418
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8899494 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 8899418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 298
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707552
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtt 9707552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25058408 - 25058286
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25058408 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatg 25058309  T
Q  192 gtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
     |||||||||| ||| |||||||    
T  25058308 atcaaattactacacataggtca 25058286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 36528422 - 36528340
Alignment:
Q  55 cccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtta 137  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36528422 cccgaatttgaaatgaaaactggtattgataagtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 36528340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899312
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 8899312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282755
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16282755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444760
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 17444760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38961835
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 38961835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 51158683 - 51158753
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51158683 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 51158753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 16934851 - 16934920
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934851 tgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 49231837 - 49231768
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49231837 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 143
Target Start/End: Original strand, 16358371 - 16358458
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttc 143  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16358371 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttagatatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237009
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41124171 - 41124105
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  41124171 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattggtgaagt 41124105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 14528624 - 14528734
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14528624 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttagaactttagttatg 14528723  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  14528724 attaaattact 14528734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30152518 - 30152450
Alignment:
Q  134 gttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30152518 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11913994
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 11913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15007961 - 15007868
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaat---ctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 146  Q
    |||||||||||||||||    ||| ||||||| |||  | ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15007961 ccgaatttgaaatgaaaagtactggtattgattggtacaaaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 200
Target Start/End: Original strand, 54039167 - 54039234
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 200  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  54039167 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatta 54039234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 1468613 - 1468723
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1468613 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 1468712  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  1468713 atcaaattact 1468723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15008040 - 15007996
Alignment:
Q  170 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15008040 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 15007996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 137
Target Start/End: Original strand, 3264459 - 3264538
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtta 137  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| || |||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3264459 gaatttgaaatgaaaattggtattgataagtatagaattgatcttaggtgtcttcacgaaagttgtaggtatggatgtta 3264538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 8269362 - 8269472
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8269362 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 8269461  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  8269462 attaaattact 8269472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 8276473 - 8276583
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8276473 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatg 8276572  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  8276573 attaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12305579 - 12305525
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaac 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  12305579 gaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 12305525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 17956869 - 17956938
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17956869 tgttagctttccaatggctttggtttgacatctaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 17956938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12808615 - 12808505
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||| |||| |  |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12808615 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttagtttcaggtccaaacgatttttagaacttgagatatg 12808516  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  12808515 attaaattact 12808505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14263738 - 14263640
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||   |   ||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14263738 ggtgtaaacattaaatttgtatctatggatgttagctttctttggggtttggtttgactccattatgatttctagaacttgagttatggtcaaattact 14263640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21026182 - 21026092
Alignment:
Q  116 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||  ||  |||||| |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21026182 aaagttgtaggtatggatgttagatttctaatggctttgttttgaagtcataatgatgttcagatcttgagttatgatcaaaatactgcac 21026092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27840569 - 27840459
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| || |||||||  |||||||||| ||    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  27840569 gaattggactttggagtaaacatgaaagttgtagataattttgttagccttctaatgactttggtttgacgtccaaataattattagaacttgagatatg 27840470  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  27840469 attaaattact 27840459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28557440 - 28557370
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||| |||| | ||| |||||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28557440 atgttagctttcaaatggctttgatttgaagtccaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 28557370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34159929 - 34159811
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  34159929 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 34159830  T
Q  204 cacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  34159829 cacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16820531 - 16820462
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  16820531 tgttagctttctaatggcattggtttggtgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 16820462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25201397 - 25201333
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  25201397 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaa 25201333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17463702 - 17463663
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17463702 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 55477015 - 55476976
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  55477015 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2281102 - 2281000
Alignment:
Q  100 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 199  Q
    ||||| ||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||| | | |||||||||||||   || |||| || ||||||||||||| | |||||    
T  2281102 cttagttgtaaacatgaaagttttaggtatgtatgttacctttgtaaaggctttggtttgacttcattattatttctataacttgagttatgattaaatt 2281003  T
Q  200 act 202  Q
    |||    
T  2281002 act 2281000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 113
Target Start/End: Original strand, 14567587 - 14567645
Alignment:
Q  55 cccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaaca 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  14567587 cccgaatttgaaatgaaaactggtattggtaggtacagaattggcctttggtgtaaaca 14567645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 289
Target Start/End: Original strand, 15025934 - 15025992
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 289  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||    
T  15025934 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 44228566 - 44228516
Alignment:
Q  152 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  44228566 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 44228516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17044395 - 17044330
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||   |||||  || ||||||||||||||||||    
T  17044395 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 17044330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 6159061 - 6158993
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgat 172  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  6159061 ggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgat 6158993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 90)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 38549708 - 38549947
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38549708 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtaaagaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttgg 38549807  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549808 tttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 38549907  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38549908 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 38549947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 24485747 - 24485988
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24485747 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 24485846  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485847 tttgacttcaaaatgatttataaaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 24485946  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24485947 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 24485988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 27472120 - 27472362
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27472120 ccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttgg 27472219  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472220 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 27472319  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27472320 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtt 27472362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 16413019 - 16413260
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16413019 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttgg 16413118  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413119 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 16413218  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16413219 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 16413260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32122187 - 32121946
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  32122187 ccgaatttgaaatgtaaactgatattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttag 32122088  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122087 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 32121988  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32121987 gcatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 32121946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15071019 - 15070777
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15071019 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgg 15070920  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15070919 tttgacttaaaaatgatttatacaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 15070820  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15070819 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtt 15070777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 56 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16198353 - 16198115
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16198353 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttgg 16198254  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198253 tttgactttaaaaatatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 16198154  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16198153 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1484860 - 1484620
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  1484860 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 1484761  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1484760 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 1484661  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1484660 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 1484620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 14409148 - 14409388
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  14409148 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 14409247  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14409248 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 14409347  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14409348 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 14409388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 46 - 297
Target Start/End: Original strand, 1326625 - 1326876
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1326625 catctttgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttcta 1326724  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaatta 245  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1326725 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 1326824  T
Q  246 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1326825 gtatatgtatgtacatgtttgtaaatacgatattgtttatgattgatgaagt 1326876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24049069 - 24048841
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24049069 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 24048970  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048969 tttgacttcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 24048871  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcat 285  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24048870 gtatatgtttgtgaatacgatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 5852996 - 5853236
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  5852996 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 5853095  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5853096 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 5853195  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5853196 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 5853236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14824233 - 14823993
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14824233 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 14824134  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14824133 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaat 14824034  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  14824033 gtatatg-ttgtaaatacgatattatccatgattgatgaagt 14823993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 16401628 - 16401869
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  16401628 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttgg 16401727  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401728 tttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatagtcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 16401827  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401828 gtgtatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 16401869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 18677768 - 18678009
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18677768 ccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgg 18677867  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18677868 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatat 18677967  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18677968 gtatatgtttgtgaatacgatattatccatgattgatgaagt 18678009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 92 - 294
Target Start/End: Original strand, 25657892 - 25658094
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25657892 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 25657991  T
Q  192 gtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattga 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25657992 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattga 25658091  T
Q  292 tga 294  Q
    |||    
T  25658092 tga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22002211 - 22001971
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  22002211 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttgg 22002112  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22002111 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 22002012  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22002011 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 22001971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 4542077 - 4542317
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |    
T  4542077 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcg 4542176  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  4542177 cttgacttcaaaatgatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaat 4542276  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4542277 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 4542317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 62 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4483733 - 4483498
Alignment:
Q  62 ttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgac 161  Q
    ||||||||||| ||| |||| || |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4483733 ttgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgac 4483634  T
Q  162 ttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 261  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4483633 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtat 4483534  T
Q  262 gtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  4483533 gtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 4483498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 15202882 - 15203121
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15202882 ccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 15202981  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15202982 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaat 15203081  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || || || ||||||||||||    
T  15203082 gtatatgtttatgagtatgatgttatttatgattgatgaa 15203121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 20045899 - 20046139
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  20045899 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttgg 20045998  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20045999 tttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaat 20046098  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  20046099 gtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 20046139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20403738 - 20403499
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  20403738 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttgg 20403639  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20403638 tttgacttgaaaaggatttatagaacttgagttattgtcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaat 20403539  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  20403538 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20403499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290584
Alignment:
Q  96 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtca 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  196 aattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 45290584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 19936611 - 19936842
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||    
T  19936611 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattgg 19936710  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||              
T  19936711 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgaggtatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaatta---------- 19936800  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19936801 gtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgatgaagt 19936842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 15202486 - 15202654
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202486 catctctaccccgaatttgaaatgaaatctggtattgatagatccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 15202585  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||  ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15202586 ataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 15202654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 27471917 - 27472093
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471917 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 27472016  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27472017 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32122390 - 32122214
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122390 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 32122291  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32122290 atgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19896780 - 19896541
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |||||||  | ||||||    
T  19896780 ccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttgg 19896681  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  19896680 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaat 19896581  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  19896580 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 19896541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24049272 - 24049104
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24049272 catctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttcta 24049173  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24049172 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Original strand, 16401243 - 16401408
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16401243 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggt-ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 16401341  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  16401342 tttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 211
Target Start/End: Original strand, 38549313 - 38549478
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38549313 catctctcccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttcta 38549412  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctagg 211  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38549413 atgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 38549478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19897176 - 19897008
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19897176 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttcta 19897077  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19897076 atgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 19897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20403941 - 20403765
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20403941 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttcta 20403842  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20403841 atgccgttggtctgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 223
Target Start/End: Original strand, 15202689 - 15202856
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  15202689 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattgg 15202788  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaata 223  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15202789 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 14397444 - 14397609
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14397444 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 14397543  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14397544 tttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19896973 - 19896807
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19896973 ccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 19896874  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  19896873 tttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15071222 - 15071046
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071222 catctctgccccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtaaagaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 15071123  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  15071122 atgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Original strand, 38549515 - 38549681
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  38549515 ccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttgg 38549614  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38549615 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 214
Target Start/End: Original strand, 19936411 - 19936576
Alignment:
Q  49 ctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  19936411 ctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaatt 19936510  T
Q  149 acgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
     ||||||| || | |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19936511 ccgttggtctggcgttaaaacgatttatagaacttgagttatgctcaaattactgcacgtaggtca 19936576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 194
Target Start/End: Original strand, 45290252 - 45290389
Alignment:
Q  57 cgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggt 156  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45290252 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggt 45290351  T
Q  157 ttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtc 194  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45290352 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 16412816 - 16412992
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412816 catctctgccgcgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 16412915  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||  ||||||| |||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||    
T  16412916 attccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 206
Target Start/End: Original strand, 16401437 - 16401585
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16401437 gaatttgaaatgcaaactggtattgattggtacgtaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtt 16401536  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16401537 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcac 16401585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11361178 - 11361024
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11361178 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctagtattgataggtgcataattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttcta 11361079  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 200  Q
    ||   |||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  11361078 atactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatagttaaatta 11361024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 32810365 - 32810262
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32810365 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctaatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgta 32810266  T
Q  146 atga 149  Q
    ||||    
T  32810265 atga 32810262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425403
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 13425403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982565
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 20982565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982671
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20982671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550055
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 38550055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 15319988 - 15320098
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15319988 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15320087  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  15320088 atcaaattact 15320098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 15500357 - 15500467
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15500357 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15500456  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  15500457 atcaaattact 15500467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 297
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425297
Alignment:
Q  241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 13425297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403445
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20403445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810149
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 32810149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290638
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 45290638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 24717722 - 24717820
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24717722 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 24717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 22007126 - 22007195
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22007126 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1326981
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 1326981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896487
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19896487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 17150655 - 17150725
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  17150655 atgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 17150725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 297
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19936947
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19936947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 295
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16401972
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaa 16401972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203175
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaataagatattatccatgattgatgaagt 15203175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 223304 - 223414
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  223304 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 223403  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  223404 attaaattact 223414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 272163 - 272273
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  272163 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 272262  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  272263 atcaaattact 272273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 643686 - 643576
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  643686 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 643587  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  643586 atcaaattact 643576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 688075 - 688185
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  688075 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 688174  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  688175 attaaattact 688185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 736927 - 737037
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  736927 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 737026  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  737027 attaaattact 737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 829492 - 829382
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  829492 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 829393  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  829392 atcaaattact 829382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 860822 - 860932
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  860822 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 860921  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  860922 attaaattact 860932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 22089412 - 22089482
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22089412 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatgatcaaattact 22089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39114485 - 39114415
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39114485 atgttagttttctaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcagattact 39114415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18612002 - 18611952
Alignment:
Q  152 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18612002 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18611952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18618899 - 18618830
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  18618899 tgttagctttctaatggctttggtttgccgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18618830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22147046 - 22146977
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||  || | |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22147046 tgttagctttcttttggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22146977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513644
Alignment:
Q  234 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagt 21513644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 174
Target Start/End: Original strand, 24678771 - 24678838
Alignment:
Q  107 gtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgattt 174  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  24678771 gtaaacatgaaagttgtaggtatggaagttaaatttctaatgaatttggtttgacttccatatgattt 24678838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1485005 - 1484887
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  1485005 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 1484906  T
Q  204 cacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  1484905 cacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 297
Target Start/End: Original strand, 18815609 - 18815675
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18815609 atgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagt 18815675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 222
Target Start/End: Original strand, 20045783 - 20045872
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20045783 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38988804 - 38988740
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  38988804 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaa 38988740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39019901 - 39019837
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  39019901 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaa 39019837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 5852930 - 5852969
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5852930 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 14409082 - 14409121
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14409082 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19866540 - 19866454
Alignment:
Q  116 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||  |||| ||||||| ||||  || ||||||||| ||| ||||    
T  19866540 aaagttgtaggtatgaaagttagatttctaatggctttggtttgagctccatatgatttttagatttttagttatggtgaaaatact 19866454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 297
Target Start/End: Original strand, 36733302 - 36733368
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||  || || |||||||||||||||||    
T  36733302 atgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagt 36733368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 295
Target Start/End: Original strand, 5083001 - 5083058
Alignment:
Q  238 atgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||    
T  5083001 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 5083058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 19936829 - 19936893
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  19936829 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttcatgattgatgaa 19936893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 38549936 - 38550000
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  38549936 atgattgatgaatttttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38550000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Original strand, 17516869 - 17517108
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17516869 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 17516968  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516969 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 17517068  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17517069 atatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 17517108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 2154335 - 2154576
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  2154335 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttgg 2154434  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154435 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 2154534  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2154535 gtatatgtttgtgaatacgatactgtccatgattgatgaagt 2154576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 20901624 - 20901865
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20901624 ccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttgg 20901723  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901724 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 20901823  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20901824 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 20901865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20909470 - 20909230
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  20909470 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 20909371  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20909370 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 20909271  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20909270 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20909230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 264472 - 264712
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  264472 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttgg 264571  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  264572 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaat 264671  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  264672 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 264712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 62 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38619889 - 38619653
Alignment:
Q  62 ttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgac 161  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  38619889 ttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgac 38619790  T
Q  162 ttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 261  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619789 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 38619690  T
Q  262 gtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 298  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38619689 gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtt 38619653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23064972 - 23064730
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |    
T  23064972 ccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcg 23064873  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23064872 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtat 23064773  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23064772 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtt 23064730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29346438 - 29346198
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  29346438 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 29346339  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  29346338 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaat 29346239  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29346238 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29346198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 62 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39363837 - 39363602
Alignment:
Q  62 ttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgac 161  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  39363837 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgac 39363738  T
Q  162 ttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 261  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39363737 ttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtat 39363638  T
Q  262 gtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  39363637 gtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 39363602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 10732644 - 10732884
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  10732644 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 10732743  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10732744 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 10732843  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  10732844 gtatatg-ttgtgaatacgattttgtccatgattgatgaagt 10732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29348911 - 29348671
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  29348911 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttgg 29348812  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  29348811 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaat 29348712  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29348711 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29348671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29351384 - 29351144
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  29351384 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttgg 29351285  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  29351284 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaat 29351185  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29351184 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29351144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39245594 - 39245354
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  39245594 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 39245495  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39245494 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 39245395  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39245394 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 39245354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 20917550 - 20917789
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20917550 ccgaattcgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 20917649  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20917650 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 20917749  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  20917750 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20917789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32027904 - 32027665
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  32027904 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttgg 32027805  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32027804 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 32027705  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  32027704 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 32027665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 42245069 - 42245309
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  42245069 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttgg 42245168  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42245169 tttgacttcaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 42245268  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42245269 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 42245309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 59 - 296
Target Start/End: Original strand, 37804609 - 37804846
Alignment:
Q  59 aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 158  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37804609 aatttgaaatgaaaactggcattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttt 37804708  T
Q  159 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 258  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37804709 gacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgta 37804808  T
Q  259 tatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaag 296  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  37804809 tatatttgtgaatacgatattgtcaatgattaatgaag 37804846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29330644 - 29330468
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330644 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 29330545  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    | | ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  29330544 aggccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29330441 - 29330203
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  29330441 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttgg 29330342  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29330341 tttgatttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 29330243  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||  || ||  || ||||| ||||||||||||    
T  29330242 gtatatgtttacgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29330203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32028687 - 32028511
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028687 catctctgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 32028588  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||  ||||||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32028587 atatcgttggtctgacatcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32028291 - 32028124
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32028291 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 32028192  T
Q  156 -tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
     |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32028191 ttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Original strand, 295978 - 296136
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  295978 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 296077  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    | |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  296078 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 296136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 206
Target Start/End: Original strand, 2154132 - 2154292
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2154132 catctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttttta 2154231  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 206  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2154232 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcac 2154292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 92 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9776781 - 9776577
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9776781 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatg 9776682  T
Q  192 gtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattga 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||     
T  9776681 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgg 9776582  T
Q  292 tgaag 296  Q
    |||||    
T  9776581 tgaag 9776577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 17516471 - 17516647
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516471 catctctgccccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 17516570  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17516571 atgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 20901421 - 20901597
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20901421 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttcta 20901520  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20901521 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 295775 - 295951
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  295775 catctctgtcccgaatttgaaatgaaatctggtattgataagtccggaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcta 295874  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||| | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  295875 atgtcgttgatctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 20917347 - 20917515
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20917347 catctctgccccgaatttgaaatgaaatcaggtattgataggtccataattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcta 20917446  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||| || |||| |||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20917447 atgccgctggtctgacgtcaaaatcatttataaaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 20917515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 91 - 222
Target Start/End: Original strand, 17516709 - 17516840
Alignment:
Q  91 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttat 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  17516709 agaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttat 17516808  T
Q  191 ggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
     ||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17516809 cgtcgaattactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32028097 - 32027947
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  32028097 ccgaatttgaaatgaaaattgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattgg 32027998  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 206  Q
    |  ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32027997 tcggacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcac 32027947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32028484 - 32028326
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||    
T  32028484 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttgg 32028385  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    | |||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028384 tctgacgtcaaaacaatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 32028326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20901971
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20901971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 22883903 - 22884013
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22883903 gaattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatg 22884002  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  22884003 atcaaattact 22884013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 27183208 - 27183278
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27183208 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29330149
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29330149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027611
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 32027611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 43444008 - 43444118
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43444008 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 43444107  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  43444108 attaaattact 43444118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220453
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23511223 - 23511127
Alignment:
Q  106 tgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23511223 tgtaaacataaaagttttaggtaattaagttagctttttaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 23511127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20917896
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagt 20917896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12013 - 11903
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12013 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 11914  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  11913 attaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23506573 - 23506503
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23506573 atgttagttttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgtgttatgatcaaattact 23506503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25426287 - 25426177
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25426287 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 25426188  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  25426187 attaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7424987 - 7424879
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7424987 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 7424888  T
Q  192 gtcaaatta 200  Q
     ||||||||    
T  7424887 atcaaatta 7424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11342300 - 11342190
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    |||||||| ||  |||||||||  |||||||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11342300 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 11342201  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  11342200 attaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 21933242 - 21933352
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21933242 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 21933341  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  21933342 atcaaattact 21933352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 21939412 - 21939522
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21939412 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 21939511  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  21939512 atcaaattact 21939522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 22367094 - 22367204
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||    
T  22367094 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaaaacttgagatatg 22367193  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  22367194 attaaattact 22367204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35581450 - 35581340
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35581450 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 35581351  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  35581350 atcaaattact 35581340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 36990638 - 36990748
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36990638 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 36990737  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  36990738 atcaaattact 36990748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 1168832 - 1168901
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  1168832 tgttagctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttttggacttgagttatgatcaaattact 1168901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 11212734 - 11212803
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11212734 tgttagctttcttatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11212803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 295
Target Start/End: Original strand, 20917777 - 20917842
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  20917777 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtattatgttgtttatgattgatgaa 20917842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 21074249 - 21074318
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21074249 tgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 18778605 - 18778715
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18778605 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttctaatggctttggttttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 18778704  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     | ||||||||    
T  18778705 attaaattact 18778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32950283 - 32950213
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  32950283 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaatgtgagttatgatcaaattact 32950213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 35791736 - 35791834
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  35791736 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgttcaaataatttttagaacttgagatatgattaaattact 35791834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743973
Alignment:
Q  234 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagt 18743973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19499526 - 19499428
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  19499526 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatagctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagatatgattaaattact 19499428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28901555 - 28901495
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggt 193  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  28901555 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28901495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28937950 - 28937890
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggt 193  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  28937950 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28937890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 264406 - 264445
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  264406 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20909536 - 20909497
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20909536 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245621
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363869
Alignment:
Q  183 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 297
Target Start/End: Original strand, 1628169 - 1628235
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  1628169 atgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagt 1628235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 295
Target Start/End: Original strand, 21399896 - 21399958
Alignment:
Q  233 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  21399896 gattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaa 21399958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 142
Target Start/End: Original strand, 23280293 - 23280331
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagcttt 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23280293 ggtgtaaacacaaaagttgtagatattgatgttagcttt 23280331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24067323 - 24067282
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaata 272  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24067323 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtttatgaata 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 46 - 297
Target Start/End: Original strand, 217 - 468
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | || ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  217 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttcta 316  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaatta 245  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  317 atgccgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaatta 416  T
Q  246 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  417 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagt 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 507 - 574
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1048 - 806
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1048 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagcattcgtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 949  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  948 tttgacttcaaaattatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtat 849  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  848 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1370 - 1225
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1370 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctcatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct- 1272  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatgg 192  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1271 atgccgttggtctgacgtctaaacgatttatagaacttgagttatgg 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1204 - 1075
Alignment:
Q  93 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1204 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 1105  T
Q  193 tcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  1104 tcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 702
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 5)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 59 - 297
Target Start/End: Original strand, 23237 - 23475
Alignment:
Q  59 aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 158  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || | | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23237 aatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggttt 23336  T
Q  159 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 258  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23337 gacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 23436  T
Q  259 tatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23437 tatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14406 - 14165
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  14406 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 14307  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14306 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 14207  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14206 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 14165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 22871 - 23047
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22871 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttcta 22970  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  22971 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacatgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 222
Target Start/End: Original strand, 23121 - 23207
Alignment:
Q  136 tagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  23121 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 106
Target Start/End: Original strand, 20704 - 20764
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  20704 catctctgccccgaattggaaatgaaatctgatattgattggtacagaattggtcttaggt 20764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 4006 - 4247
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4006 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 4105  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4106 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 4205  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4206 gtatatgtttgtgaatattatattgtccatgattgatgaagt 4247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Original strand, 3813 - 3979
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  3813 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttgg 3912  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    | |||  || ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3913 tctgatgtcaaaacgatttatgaaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Original strand, 3620 - 3778
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3620 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 3719  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    | |||  || ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  3720 tatgaggtcaaaacgatttatgtaacttgagttatgctcaaattactgaacgtaggtca 3778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 214
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3585
Alignment:
Q  170 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtca 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5153 - 4912
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||    
T  5153 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatgg 5054  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5053 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 4954  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4953 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5356 - 5180
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  5356 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttctt 5257  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5256 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatatatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 17143 - 17384
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  17143 ccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttgg 17242  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17243 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtat 17342  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17343 gtatatgcttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 17384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 94869 - 94629
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  94869 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 94770  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  94769 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 94670  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  94669 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 94629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 16940 - 17116
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16940 catctctgccccaaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtgttaggggataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 17039  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||  || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  17040 atgtcgttggtctgatatcaaaaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtcatagtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 154892 - 154961
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  154892 tgttagctttataatgacgttggtttgaggtccaaatcatttttagaacttgagttatgatcaaattact 154961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 95014 - 94896
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  95014 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 94915  T
Q  204 cacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  94914 cacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 59 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 663 - 425
Alignment:
Q  59 aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 158  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || | | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  663 aatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggttt 564  T
Q  159 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 258  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  563 gacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagta 464  T
Q  259 tatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  463 tatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1029 - 853
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1029 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttcta 930  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  929 atgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 693
Alignment:
Q  136 tagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  779 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13851 - 13610
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  13851 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttgg 13752  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13751 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 13652  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13651 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 13610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13918 - 13878
Alignment:
Q  182 ttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  13918 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38280 - 38039
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  38280 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 38181  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38180 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 38081  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38080 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 38039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38425 - 38307
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  38425 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 38326  T
Q  204 cacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  38325 cacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 58 - 295
Target Start/End: Original strand, 27161292 - 27161529
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27161292 gaatttgaaatgaaaacaggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 27161391  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161392 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 27161491  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  27161492 atatgtttatgaataaaatattgttaatgattgatgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13989324 - 13989084
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  13989324 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 13989225  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13989224 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 13989125  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13989124 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 13989084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21841225 - 21840985
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21841225 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 21841126  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841125 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 21841026  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  21841025 gtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 21840985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 21922995 - 21923235
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  21922995 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 21923094  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21923095 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 21923194  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21923195 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 21923235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 295
Target Start/End: Original strand, 22050530 - 22050779
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050530 catctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 22050629  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaatta 245  Q
    ||| |  |||| | |  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22050630 atgtcaatggtctaatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta 22050729  T
Q  246 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  22050730 gtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 22050779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Original strand, 22122718 - 22122957
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22122718 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttgg 22122817  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22122818 tttgacttcaaaacgatttatagaacttgggttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 22122917  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  22122918 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 22122957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 16274959 - 16275201
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa-tgacgttg 154  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  16274959 ccgaattggaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattg 16275058  T
Q  155 gtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgta 254  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16275059 gtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgta 16275158  T
Q  255 tgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16275159 tgtatatgtttgtgaattcgatattgttcatgattgatgaagt 16275201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 21474790 - 21475031
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  21474790 ccgaatatgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 21474889  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21474890 tttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 21474989  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21474990 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 21475031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29777199 - 29776960
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29777199 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 29777100  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29777099 gttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 29777000  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  29776999 gtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29776960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16362377 - 16362136
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  16362377 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttgg 16362278  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16362277 tttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtat 16362178  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16362177 gtatatgtttgttaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16362136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31612824 - 31612585
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  31612824 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttgg 31612725  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31612724 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 31612625  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||| | | ||  |||||||| ||||||||||||    
T  31612624 gtatatgtttatcagtatgatattgtttatgattgatgaa 31612585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 15859712 - 15859952
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15859712 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttgg 15859811  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859812 tttgacttcaaaagaatttatacaacttgagttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 15859911  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||  ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  15859912 gtatat-cttgcgaatacgatattgtccatggttgatgaagt 15859952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 57 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29298699 - 29298461
Alignment:
Q  57 cgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggt 156  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  29298699 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggt 29298600  T
Q  157 ttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatg 256  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29298599 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatg 29298500  T
Q  257 tatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  29298499 tatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 23593437 - 23593678
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23593437 ccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtgcataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttgg 23593536  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    | |||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23593537 tctgacgtcaaaataatttatagaacttgcgttatagttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 23593636  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  23593637 gtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagt 23593678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13227322 - 13227129
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13227322 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttgg 13227223  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtat 249  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13227222 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 22122514 - 22122691
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacac-aaaagttgtaggtatggatgttagctttct 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122514 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttct 22122613  T
Q  145 aatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  22122614 aatgccgttggttttacttcaaaacgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29298903 - 29298727
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298903 catctctgcaccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 29298804  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||| | |||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29298803 atgccgttgttctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29535510 - 29535317
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29535510 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttgg 29535411  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtat 249  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29535410 tttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 16274756 - 16274932
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16274756 catctctgccccgaatttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 16274855  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||  | ||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16274856 atatcattggtctgacgtcaaaactatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31613220 - 31613052
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31613220 catctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggttcataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttcta 31613121  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||  ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31613120 ataccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 31613052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31613015 - 31612851
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  31613015 gaatttgaactgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtt 31612916  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31612915 tgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40129553 - 40129387
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40129553 catctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttcta 40129454  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggt 212  Q
    ||| ||||||| || | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40129453 atgtcgttggtctggcatcaaaacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29777402 - 29777234
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29777402 catctctgccctgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttcta 29777303  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||| ||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29777302 atgccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 29777234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Original strand, 9044698 - 9044866
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9044698 catctctgccccaaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttcta 9044797  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||| ||||||| | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9044798 atgccgttggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 9044866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 15859496 - 15859672
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15859496 catctctatcccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcta 15859595  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15859596 atgtcgttggtctgacctcaaaactatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16401583 - 16401407
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401583 catctctgctccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 16401484  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
     |  | ||||| | || |  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16401483 tttccattggtctaacgtggaaaggatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 222
Target Start/End: Original strand, 27161099 - 27161263
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    |||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||     
T  27161099 gaatttgaaatggaatatagtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtc 27161198  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  27161199 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 43543370 - 43543269
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543370 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 43543271  T
Q  146 at 147  Q
    ||    
T  43543270 at 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275307
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16275307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050833
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 22050833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776906
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29776906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31612597 - 31612531
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31612597 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 31612531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  152 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298354
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29298354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21858662 - 21858592
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21858662 atgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 21858592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 44035830 - 44035928
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  44035830 ggtgtaaacatcaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 44035928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 22122945 - 22123011
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22122945 tatgattgatgaattggtatatgtatgtttatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 22123011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17004019 - 17003909
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17004019 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 17003920  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  17003919 atcaaattact 17003909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 297
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161583
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 27161583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 21650910 - 21650979
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||    
T  21650910 tgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaattact 21650979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22366596 - 22366527
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22366596 tgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 202
Target Start/End: Original strand, 18060577 - 18060684
Alignment:
Q  95 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtc 194  Q
    |||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||| |     
T  18060577 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttaaaaacttgagatatgatt 18060676  T
Q  195 aaattact 202  Q
    ||||||||    
T  18060677 aaattact 18060684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 108
Target Start/End: Original strand, 43630282 - 43630344
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  43630282 catctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgattggtacagaattggtctcaggtgt 43630344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29298473 - 29298408
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  29298473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13989469 - 13989351
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 203  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  13989469 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 13989370  T
Q  204 cacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  13989369 cacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16656002 - 16655942
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggt 193  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  16656002 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 16655942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Original strand, 7641619 - 7641669
Alignment:
Q  152 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  7641619 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 7641669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 174
Target Start/End: Original strand, 10812709 - 10812827
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||   |||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||    ||||||||||| | || | ||||    
T  10812709 ccgaatttgaaattaaaactggtattgatcggtactgaattgatcttaggtgtaaacatgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgcctttgg 10812808  T
Q  156 tttgacttccaaatgattt 174  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  10812809 tttgacttagaaatgattt 10812827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 15862081 - 15862150
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||| ||||||||| | | |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  15862081 tgttagttttctaatggcttgggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15862150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22029877 - 22029817
Alignment:
Q  140 tttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 200  Q
    ||||||||| | |||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  22029877 tttctaatggctttggtttgatatacaaatgattttttgaacttgagttatgatcaaatta 22029817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11746 - 11507
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  11746 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggt 11647  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11646 tgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 11547  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11546 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 11507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6405 - 6165
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6405 ccgaatttgaaatgaaaactggtattcattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 6306  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6305 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 6206  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6205 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 6165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 6639 - 6880
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  6639 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttgg 6738  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    |  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6739 tccgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 6838  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6839 gtatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatgaagt 6880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 6436 - 6612
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6436 catctccgccccgaatttgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttcta 6535  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6536 atgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30478 - 30237
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  30478 ccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttgg 30379  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30378 tttcacttcaaaaggatttgtagtacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 30279  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30278 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 30237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30681 - 30505
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30681 catctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcca 30582  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| | ||||| |||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30581 atgccattggtgtgacgtcaaaacgatttataaaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30131
Alignment:
Q  232 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 30131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21207 - 20965
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaat-gaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttg 154  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  21207 ccgaatttgaaatagaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttg 21108  T
Q  155 gtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgta 254  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21107 gtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgta 21008  T
Q  255 tgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21007 tgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9700 - 9460
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  9700 ccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttgg 9601  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9600 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 9501  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  9500 gtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 9460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40858 - 40618
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  40858 ccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttgg 40759  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40758 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 40659  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40658 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 40618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37969 - 37848
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37969 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatg 37871  T
Q  192 gtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
     |||||||||| ||| |||||||    
T  37870 atcaaattactacacataggtca 37848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40925 - 40885
Alignment:
Q  182 ttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40925 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10248 - 10009
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10248 gaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagtgttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtt 10149  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10148 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgt 10049  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10048 atatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 10009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10640 - 10478
Alignment:
Q  52 tgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacg 151  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10640 tgccccaaatttgaactgaaatctggtattgataggtccataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccg 10541  T
Q  152 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10540 ttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgcgttatggtcaaattactgcatgtaggtca 10478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10441 - 10277
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  10441 gaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtc 10342  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10341 tgacatcaaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9936
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9970 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 56 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6910 - 6682
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6910 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 6811  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||          
T  6810 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat------ 6717  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 294  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6716 ----atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 6682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7113 - 6937
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113 catctctgtcccgaatatgaaatgaaaattgctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 7014  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7013 atgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 95 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15342 - 15140
Alignment:
Q  95 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtc 194  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15342 ttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 15243  T
Q  195 aaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 294  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15242 aaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatga 15143  T
Q  295 agt 297  Q
    |||    
T  15142 agt 15140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 264
Target Start/End: Original strand, 11043 - 11251
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  11043 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttgg 11142  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    |  ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11143 tccgacgtcaaaacgatttatagtacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 11242  T
Q  256 gtatatgtt 264  Q
    |||||||||    
T  11243 gtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 10839 - 11016
Alignment:
Q  46 catctctgccccg-aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttct 144  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10839 catctccgccccggaatttgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttct 10938  T
Q  145 aatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10939 aatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15573 - 15398
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15573 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattaataggtccagaattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttcta 15475  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15474 atgtcgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 58 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3480 - 3241
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| | |  | ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3480 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgttacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtt 3381  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3380 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgt 3281  T
Q  258 atatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  3280 atatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 3241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 134669 - 134429
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  134669 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 134570  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  134569 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 134470  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  134469 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 134429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 137138 - 136898
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  137138 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 137039  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  137038 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 136939  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  136938 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 136898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 139607 - 139367
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  139607 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 139508  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  139507 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 139408  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  139407 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 139367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 142076 - 141836
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  142076 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 141977  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  141976 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 141877  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  141876 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 141836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 144545 - 144305
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  144545 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 144446  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  144445 tttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 144346  T
Q  256 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  144345 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 144305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 93 - 297
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53816
Alignment:
Q  93 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatgg 192  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  193 tcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 292  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgat 53811  T
Q  293 gaagt 297  Q
    |||||    
T  53812 gaagt 53816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 297
Target Start/End: Original strand, 38349 - 38600
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||  ||  ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38349 catctctgccccgaatttgaaataaaaattagtattgatccgtaaagaattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 38448  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaatta 245  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |  |||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38449 atgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgttcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaatta 38548  T
Q  246 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38549 gtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 38600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43401 - 43225
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43401 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttcta 43302  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43301 atgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 105 - 297
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13571
Alignment:
Q  105 gtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  205 acctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    || ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43198 - 43002
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43198 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacatttttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 43099  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 252  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43098 tttgacttcaaaagggtttatagaacttgagttatagtcaaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1916 - 1740
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1916 catctctgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 1817  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1816 atgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 1713 - 1634
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgt 135  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1713 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8196 - 7996
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8196 gaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtt 8097  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8096 tgacttcaaaaggatttatagaatttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgt 7997  T
Q  258 a 258  Q
    |    
T  7996 a 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8391 - 8225
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||  | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||    
T  8391 ccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttgg 8292  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  8291 tttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8421
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8594 catctctgccccgaatttgaaatggaaactggtattgattggtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttcta 8495  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtg 219  Q
    ||  | ||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  8494 attccattggtatgacgtcaaaaagatttatacaacttgagttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 501726 - 501550
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501726 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 501627  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| ||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  501626 atgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 57 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 501522 - 501347
Alignment:
Q  57 cgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggt 156  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  501522 cgaatttgaaatgaaaagtgatattgattgttacagaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggt 501424  T
Q  157 ttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatg 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  501423 ttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatg 501347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 501351 - 501305
Alignment:
Q  248 atatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  501351 atatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 501305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 139589 - 139687
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||| ||||  || ||||||||| ||| ||||    
T  139589 ggtgtaaacatgaaagtcgtaggtatgaaagttagctttctaatggctttggtttgagctccatatgatttttagatttttagttatggtgaaaatact 139687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1827 - 1646
Alignment:
Q  116 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  1827 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 1728  T
Q  216 agtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1727 agtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 1646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 68420 - 68227
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||    
T  68420 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattgg 68321  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtat 249  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  68320 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18599 - 18423
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599 catctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttcta 18500  T
Q  146 atgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  18499 atgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 131 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 57865 - 57708
Alignment:
Q  131 gatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaat 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||    
T  57865 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaat 57766  T
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgat 288  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  57765 atgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18110 - 17947
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||     
T  18110 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtc 18011  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18010 tgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8477 - 8311
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  8477 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtatagaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattgg 8378  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  8377 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 221
Target Start/End: Original strand, 7395 - 7558
Alignment:
Q  57 cgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggt 156  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7395 cgaatttgaaatgaaa-ctggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggt 7493  T
Q  157 ttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  7494 ctgacatcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Original strand, 7201 - 7367
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||    
T  7201 ccgaatttgaaatgcaatctggtattgattggtaaagaatatgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttgg 7300  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    | |||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  7301 tctgacgtcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Original strand, 7079 - 7172
Alignment:
Q  127 tatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtga 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7079 tatggatgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33628 - 33472
Alignment:
Q  58 gaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  33628 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtc 33529  T
Q  158 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 214  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33528 tgacgtaaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 33472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39791 - 39626
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  39791 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattgg 39692  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
    | | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  39691 tctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 19792 - 19957
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19792 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattgg 19891  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
    | |||| || ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  19892 tctgacgtcaaaacgaattatataacttgagttatcgtcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31662 - 31497
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||    
T  31662 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattgg 31563  T
Q  156 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 221  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31562 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 10991
Alignment:
Q  145 aatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaatt 244  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  245 agtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 10991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Original strand, 36905 - 37068
Alignment:
Q  59 aatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 158  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||   | |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  36905 aatttgaaatgaaaactaatattgattggaaaaaaattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 37004  T
Q  159 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  37005 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 222
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36875
Alignment:
Q  96 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtca 195  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  196 aattactgcacctaggtcagagtgaat 222  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28186 - 28061
Alignment:
Q  170 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28186 gatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatga 28087  T
Q  270 atactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
     ||  || ||||| ||||||||||||    
T  28086 gtatgatgttgtttatgattgatgaa 28061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 28007
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 28007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 218 - 297
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10726
Alignment:
Q  218 tgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 10726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10831
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatactgtccataattgatgaagt 10831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 113477 - 113329
Alignment:
Q  54 ccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgtt 153  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||   || |||| ||| | ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  113477 ccccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtgcggatttggcctttgatgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgtt 113378  T
Q  154 ggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  113377 ggtttgactccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaattact 113329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 488 - 398
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtt 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  488 catctatgccccgaatttgaaataaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtatggatgtt 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 6195 - 6305
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6195 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatg 6294  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  6295 atcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30580 - 30470
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30580 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 30481  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  30480 atcaaattact 30470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Original strand, 12489 - 12590
Alignment:
Q  101 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 200  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||   |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12489 ttaggtgttaacctaaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 12588  T
Q  201 ct 202  Q
    ||    
T  12589 ct 12590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9949
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagt 9949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  232 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8676 - 8566
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  8676 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatg 8577  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  8576 atcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 835 - 725
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  835 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 736  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  735 atcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 6970 - 7039
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6970 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Original strand, 75608 - 75689
Alignment:
Q  56 ccgaatttgaaatgaaatctgatattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtta 137  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  75608 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 75689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 230 - 297
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15216
Alignment:
Q  230 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 15216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 297
Target Start/End: Original strand, 15032 - 15111
Alignment:
Q  208 taggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 297  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15032 taggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaattagtat----------atgtttgtgaatactatattgttcataattgatgaagt 15111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41259
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 200  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||    
T  41327 atgttagatttctaatggctttggcttgacttccaaattatttttagaacttgcattatgatcaaatta 41259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1375
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1485 gaattggccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatg 1386  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  1385 atcaaattact 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 1267 - 1365
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1267 ggtgtaaacataaaagttttagataattgtgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15846 - 15780
Alignment:
Q  134 gttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 200  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15846 gttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 32118 - 32216
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32118 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40726 - 40628
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40726 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 40628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 110064 - 110174
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  110064 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatg 110163  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  110164 atcaaattact 110174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 118565 - 118675
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  118565 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatg 118664  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  118665 atcaaattact 118675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 147
Target Start/End: Original strand, 15910 - 15953
Alignment:
Q  104 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 147  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15910 ggtgtacacataaaagttgtaggtatggaagttagctttctaat 15953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 107137 - 107108
Alignment:
Q  46 catctctgccccgaatttgaaatgaaatct 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107137 catctctgccccgaatttgaaatgaaatct 107108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40035 - 39965
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40035 atgtcagctttctaatggctttggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45518 - 45448
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  45518 atgttagctttctaatggctttggttttacttccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 45448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 79073 - 79003
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  79073 atgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 79003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 979 - 912
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 200  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  979 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttataacttgaattatgatcaaatta 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 938 - 868
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  938 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgatttttagaacctgagttatgatcaaattact 868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18315 - 18205
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  18315 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatg 18216  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  18215 atcaaattact 18205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28579 - 28469
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  28579 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatg 28480  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  28479 atcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38485 - 38375
Alignment:
Q  92 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38485 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 38386  T
Q  192 gtcaaattact 202  Q
     ||||||||||    
T  38385 atcaaattact 38375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 54016 - 53946
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  54016 atgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 53946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 19939 - 20009
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19939 atgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 20009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 1219
Alignment:
Q  100 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 199  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  1333 cttagatgtaaacataaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtctcacttcaaaatgttttctaaaacttgatttatggtcaaatt 1234  T
Q  200 actgcacctaggtca 214  Q
    ||| ||| |||||||    
T  1233 actacacataggtca 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 8122 - 8192
Alignment:
Q  132 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  8122 atgttagctatctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16263
Alignment:
Q  232 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2009 - 1959
Alignment:
Q  152 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2009 ttggtttgacgtccaaattatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36007
Alignment:
Q  242 attagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaa 36007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Original strand, 167129 - 167198
Alignment:
Q  133 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 202  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  167129 tgttagctttataatgtcgttggtttgaggaccaaattttttttagaacttgagttatgatcaaattact 167198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15361 - 15297
Alignment:
Q  231 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 295  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15361 atgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaa 15297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University