View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19755_low_44 (Length: 297)

Name: NF19755_low_44
Description: NF19755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19755_low_44
NF19755_low_44
[»] chr7 (86 HSPs)
chr7 (1-282)||(16213902-16214185)
chr7 (12-282)||(15081516-15081786)
chr7 (1-282)||(8940497-8940784)
chr7 (11-282)||(14269630-14269901)
chr7 (1-282)||(27217078-27217361)
chr7 (11-282)||(41523135-41523406)
chr7 (11-282)||(41525597-41525868)
chr7 (1-282)||(456539-456822)
chr7 (1-282)||(15376375-15376657)
chr7 (1-282)||(20384785-20385067)
chr7 (1-282)||(16410277-16410559)
chr7 (11-282)||(16232738-16233009)
chr7 (1-283)||(13869565-13869848)
chr7 (11-282)||(14948796-14949066)
chr7 (11-282)||(32125709-32125979)
chr7 (1-282)||(45847316-45847599)
chr7 (11-282)||(11303465-11303736)
chr7 (11-282)||(16108362-16108633)
chr7 (11-282)||(21189269-21189539)
chr7 (11-280)||(23664626-23664895)
chr7 (11-282)||(18430930-18431200)
chr7 (11-281)||(29796829-29797099)
chr7 (11-281)||(29800648-29800918)
chr7 (1-282)||(18627784-18628066)
chr7 (1-282)||(18640490-18640772)
chr7 (11-282)||(24702456-24702717)
chr7 (11-282)||(24704903-24705164)
chr7 (1-282)||(26355643-26355925)
chr7 (1-282)||(26358095-26358377)
chr7 (41-280)||(8468955-8469194)
chr7 (11-282)||(11392973-11393231)
chr7 (11-207)||(10501067-10501263)
chr7 (11-206)||(25926803-25926998)
chr7 (14-207)||(8940769-8940961)
chr7 (1-207)||(14269425-14269633)
chr7 (11-206)||(13918076-13918272)
chr7 (1-207)||(14156740-14156944)
chr7 (41-280)||(11972768-11973007)
chr7 (11-206)||(1856903-1857097)
chr7 (43-207)||(14269276-14269440)
chr7 (44-207)||(38897741-38897904)
chr7 (41-207)||(16214170-16214336)
chr7 (41-207)||(8940962-8941128)
chr7 (108-280)||(13841274-13841446)
chr7 (41-207)||(21189106-21189272)
chr7 (44-207)||(14156592-14156755)
chr7 (41-199)||(15081352-15081510)
chr7 (44-174)||(10500934-10501064)
chr7 (45-207)||(17985092-17985254)
chr7 (211-282)||(38897996-38898067)
chr7 (120-208)||(11310239-11310327)
chr7 (215-283)||(45847638-45847706)
chr7 (11-122)||(11310133-11310243)
chr7 (89-207)||(45847213-45847331)
chr7 (117-187)||(11286976-11287046)
chr7 (118-187)||(125965-126034)
chr7 (41-110)||(23461795-23461864)
chr7 (215-282)||(11972714-11972780)
chr7 (215-282)||(14269940-14270006)
chr7 (215-282)||(15081825-15081891)
chr7 (215-282)||(38898106-38898172)
chr7 (215-282)||(8940392-8940458)
chr7 (77-187)||(7822013-7822123)
chr7 (77-187)||(7829324-7829434)
chr7 (121-187)||(15951637-15951703)
chr7 (77-187)||(27102511-27102621)
chr7 (77-187)||(27109859-27109969)
chr7 (77-187)||(27175705-27175815)
chr7 (77-187)||(38784603-38784713)
chr7 (118-187)||(15760779-15760848)
chr7 (89-169)||(10000996-10001076)
chr7 (89-175)||(16202766-16202852)
chr7 (89-187)||(32495062-32495160)
chr7 (89-207)||(15376272-15376390)
chr7 (89-207)||(20384682-20384800)
chr7 (215-280)||(15119918-15119983)
chr7 (89-133)||(13475728-13475772)
chr7 (216-280)||(13745569-13745633)
chr7 (216-280)||(38294567-38294631)
chr7 (168-207)||(16410544-16410583)
chr7 (168-207)||(18628051-18628090)
chr7 (168-207)||(18640757-18640796)
chr7 (168-207)||(26355619-26355658)
chr7 (168-207)||(26358071-26358110)
chr7 (117-171)||(15851992-15852046)
chr7 (78-110)||(20110747-20110779)
[»] chr4 (84 HSPs)
chr4 (1-282)||(14970368-14970651)
chr4 (1-279)||(52872734-52873014)
chr4 (1-282)||(3515225-3515508)
chr4 (1-282)||(19617728-19618011)
chr4 (14-282)||(362398-362666)
chr4 (1-282)||(15118014-15118296)
chr4 (1-282)||(15495835-15496118)
chr4 (11-282)||(29267571-29267842)
chr4 (11-282)||(15534399-15534670)
chr4 (11-282)||(50222013-50222283)
chr4 (11-282)||(14746185-14746456)
chr4 (11-282)||(44615506-44615777)
chr4 (11-282)||(19242918-19243189)
chr4 (11-282)||(36038088-36038359)
chr4 (11-282)||(49547447-49547718)
chr4 (1-282)||(44772745-44773027)
chr4 (1-282)||(7640848-7641130)
chr4 (1-280)||(52312782-52313062)
chr4 (1-282)||(19857806-19858079)
chr4 (11-238)||(1837193-1837420)
chr4 (11-279)||(14048798-14049066)
chr4 (41-280)||(11958-12197)
chr4 (1-205)||(362668-362874)
chr4 (1-207)||(14745980-14746188)
chr4 (1-207)||(52313047-52313255)
chr4 (11-226)||(30147189-30147404)
chr4 (41-207)||(19858064-19858230)
chr4 (41-207)||(14970217-14970383)
chr4 (41-207)||(52872583-52872749)
chr4 (44-207)||(18214717-18214880)
chr4 (41-207)||(19617577-19617743)
chr4 (43-207)||(3515493-3515657)
chr4 (41-207)||(362859-363025)
chr4 (41-207)||(52313240-52313406)
chr4 (73-207)||(15495716-15495850)
chr4 (161-282)||(18214992-18215113)
chr4 (1-100)||(18214865-18214966)
chr4 (187-282)||(15355068-15355163)
chr4 (101-207)||(14185621-14185727)
chr4 (1-158)||(14185477-14185636)
chr4 (41-115)||(12778386-12778460)
chr4 (168-282)||(18239250-18239363)
chr4 (1-107)||(22725386-22725494)
chr4 (215-282)||(19857700-19857767)
chr4 (77-187)||(14951270-14951380)
chr4 (11-75)||(12033447-12033511)
chr4 (89-199)||(22725284-22725393)
chr4 (117-185)||(55377225-55377293)
chr4 (215-282)||(12185-12251)
chr4 (215-282)||(18215152-18215218)
chr4 (89-187)||(25120046-25120144)
chr4 (215-280)||(15355202-15355266)
chr4 (86-187)||(43281694-43281795)
chr4 (215-282)||(52312728-52312794)
chr4 (77-187)||(14995644-14995754)
chr4 (41-99)||(15489659-15489717)
chr4 (77-187)||(18247739-18247849)
chr4 (117-187)||(18293695-18293765)
chr4 (77-187)||(47357183-47357293)
chr4 (77-185)||(15287858-15287966)
chr4 (77-185)||(15294968-15295076)
chr4 (215-282)||(14746495-14746561)
chr4 (215-282)||(15496949-15497015)
chr4 (215-282)||(19618050-19618116)
chr4 (215-282)||(52873056-52873122)
chr4 (89-187)||(5683367-5683465)
chr4 (77-187)||(10643746-10643856)
chr4 (77-175)||(16731688-16731786)
chr4 (77-187)||(17146279-17146389)
chr4 (89-187)||(22355071-22355169)
chr4 (118-187)||(18168293-18168362)
chr4 (137-199)||(14745925-14745987)
chr4 (77-187)||(19020009-19020119)
chr4 (137-187)||(19698032-19698082)
chr4 (137-187)||(19708617-19708667)
chr4 (77-187)||(8374040-8374150)
chr4 (89-207)||(15117911-15118029)
chr4 (85-185)||(9198558-9198658)
chr4 (77-159)||(630279-630361)
chr4 (91-133)||(11940064-11940106)
chr4 (41-86)||(14745886-14745931)
chr4 (41-82)||(15355028-15355069)
chr4 (170-207)||(44772723-44772760)
chr4 (89-133)||(11557892-11557936)
[»] chr6 (84 HSPs)
chr6 (1-282)||(30676371-30676654)
chr6 (1-282)||(1598275-1598557)
chr6 (1-282)||(26924302-26924584)
chr6 (1-282)||(18334254-18334536)
chr6 (1-282)||(24422765-24423047)
chr6 (1-282)||(33864496-33864778)
chr6 (11-282)||(33862012-33862282)
chr6 (1-282)||(18914150-18914433)
chr6 (11-282)||(12742535-12742806)
chr6 (1-282)||(19847633-19847912)
chr6 (1-280)||(19005371-19005652)
chr6 (41-282)||(34963591-34963832)
chr6 (11-282)||(1540585-1540855)
chr6 (1-282)||(2290842-2291124)
chr6 (11-282)||(8055247-8055518)
chr6 (11-282)||(31630214-31630485)
chr6 (11-282)||(19858596-19858863)
chr6 (1-282)||(22782445-22782727)
chr6 (11-282)||(25688720-25688991)
chr6 (41-266)||(25535641-25535866)
chr6 (11-282)||(28289010-28289279)
chr6 (66-282)||(17377576-17377792)
chr6 (11-282)||(12942419-12942678)
chr6 (41-282)||(23992641-23992881)
chr6 (1-207)||(1598542-1598750)
chr6 (11-207)||(25688988-25689184)
chr6 (11-199)||(23415265-23415453)
chr6 (11-206)||(27557016-27557211)
chr6 (1-199)||(26924109-26924309)
chr6 (41-207)||(19005637-19005803)
chr6 (44-207)||(1871-2034)
chr6 (44-207)||(8830-8993)
chr6 (15-160)||(15892086-15892231)
chr6 (11-145)||(17883171-17883305)
chr6 (1-199)||(18914426-18914626)
chr6 (44-207)||(19847485-19847648)
chr6 (41-207)||(1598735-1598901)
chr6 (41-207)||(30676220-30676386)
chr6 (41-199)||(18914619-18914777)
chr6 (44-207)||(79-242)
chr6 (41-187)||(31630051-31630197)
chr6 (1-114)||(25737028-25737143)
chr6 (75-207)||(25689181-25689313)
chr6 (1-106)||(8978-9085)
chr6 (88-207)||(25737128-25737247)
chr6 (1-84)||(22981401-22981486)
chr6 (1-84)||(23806922-23807007)
chr6 (164-282)||(15875629-15875737)
chr6 (215-282)||(31630524-31630591)
chr6 (112-207)||(22981321-22981416)
chr6 (112-207)||(23806992-23807087)
chr6 (89-187)||(19984130-19984228)
chr6 (77-187)||(16240296-16240406)
chr6 (77-187)||(16556944-16557054)
chr6 (77-187)||(16633500-16633610)
chr6 (77-187)||(16650174-16650284)
chr6 (77-187)||(22593581-22593691)
chr6 (215-280)||(19005266-19005330)
chr6 (215-282)||(18914045-18914111)
chr6 (77-187)||(25904474-25904585)
chr6 (77-187)||(27654596-27654706)
chr6 (117-187)||(35016043-35016113)
chr6 (117-187)||(22226608-22226679)
chr6 (77-187)||(10487971-10488081)
chr6 (77-187)||(16377247-16377357)
chr6 (77-187)||(16384571-16384681)
chr6 (77-187)||(16826367-16826477)
chr6 (118-187)||(1555527-1555596)
chr6 (118-187)||(33315116-33315185)
chr6 (77-185)||(19609582-19609690)
chr6 (1-48)||(2019-2068)
chr6 (77-187)||(25175112-25175222)
chr6 (215-280)||(15875526-15875590)
chr6 (89-207)||(18334151-18334269)
chr6 (89-187)||(21776107-21776205)
chr6 (137-187)||(23153035-23153085)
chr6 (89-207)||(24423032-24423150)
chr6 (89-134)||(10905416-10905461)
chr6 (216-280)||(35056717-35056781)
chr6 (11-50)||(239-278)
chr6 (168-207)||(33864763-33864802)
chr6 (232-282)||(25656847-25656897)
chr6 (117-187)||(29665374-29665444)
chr6 (216-274)||(32259078-32259136)
[»] chr2 (97 HSPs)
chr2 (1-282)||(24642410-24642693)
chr2 (16-282)||(23706896-23707161)
chr2 (1-282)||(24681662-24681945)
chr2 (1-282)||(24918358-24918641)
chr2 (1-282)||(39682531-39682814)
chr2 (1-282)||(24671243-24671526)
chr2 (1-282)||(18809161-18809443)
chr2 (1-282)||(23711675-23711957)
chr2 (1-282)||(28577317-28577599)
chr2 (1-280)||(22105685-22105966)
chr2 (11-282)||(20261437-20261708)
chr2 (1-280)||(24368046-24368327)
chr2 (1-282)||(571615-571898)
chr2 (1-282)||(23131080-23131362)
chr2 (1-282)||(23133547-23133829)
chr2 (1-282)||(24529208-24529491)
chr2 (1-282)||(34402184-34402466)
chr2 (11-282)||(38967697-38967968)
chr2 (11-280)||(21154681-21154950)
chr2 (14-274)||(45027581-45027840)
chr2 (11-282)||(23709206-23709476)
chr2 (1-280)||(41523734-41524015)
chr2 (14-282)||(32214607-32214865)
chr2 (1-282)||(26505597-26505879)
chr2 (1-282)||(26508075-26508357)
chr2 (11-282)||(24897869-24898139)
chr2 (11-282)||(24905306-24905576)
chr2 (11-281)||(10684436-10684706)
chr2 (11-282)||(24900352-24900622)
chr2 (11-282)||(24902829-24903099)
chr2 (11-282)||(24907781-24908051)
chr2 (11-280)||(6726267-6726536)
chr2 (1-282)||(32039160-32039442)
chr2 (11-238)||(23135841-23136068)
chr2 (1-207)||(41523541-41523749)
chr2 (13-185)||(23931775-23931947)
chr2 (1-207)||(21154476-21154684)
chr2 (11-207)||(23709013-23709209)
chr2 (41-207)||(22105951-22106117)
chr2 (101-282)||(25616399-25616580)
chr2 (1-191)||(23706687-23706878)
chr2 (41-207)||(24529057-24529223)
chr2 (43-207)||(24918626-24918790)
chr2 (41-207)||(6726533-6726699)
chr2 (41-207)||(24681930-24682096)
chr2 (41-199)||(41523390-41523548)
chr2 (43-204)||(23931949-23932110)
chr2 (41-207)||(23706536-23706702)
chr2 (41-207)||(24368312-24368478)
chr2 (41-205)||(32214440-32214604)
chr2 (41-199)||(21154325-21154483)
chr2 (41-199)||(24671519-24671677)
chr2 (44-205)||(45027418-45027579)
chr2 (12-109)||(31345570-31345667)
chr2 (118-187)||(16900815-16900884)
chr2 (118-187)||(16994206-16994275)
chr2 (118-187)||(34823750-34823819)
chr2 (116-187)||(67339-67410)
chr2 (215-282)||(6726213-6726279)
chr2 (77-187)||(24686597-24686707)
chr2 (219-282)||(21154942-21155004)
chr2 (215-282)||(22105631-22105697)
chr2 (215-282)||(23707200-23707266)
chr2 (215-282)||(24367992-24368058)
chr2 (215-282)||(24642732-24642798)
chr2 (215-282)||(24681557-24681623)
chr2 (215-282)||(38967592-38967658)
chr2 (77-187)||(19887274-19887384)
chr2 (117-187)||(27261332-27261402)
chr2 (118-187)||(12727711-12727780)
chr2 (218-282)||(24671138-24671201)
chr2 (142-206)||(31345490-31345554)
chr2 (215-282)||(24918253-24918319)
chr2 (77-187)||(11232212-11232322)
chr2 (77-187)||(22514059-22514169)
chr2 (77-187)||(28776661-28776771)
chr2 (101-159)||(34135071-34135129)
chr2 (216-280)||(21368375-21368439)
chr2 (119-187)||(22274022-22274090)
chr2 (155-207)||(24642373-24642425)
chr2 (215-259)||(41524003-41524046)
chr2 (89-133)||(44584588-44584632)
chr2 (77-159)||(6483113-6483195)
chr2 (89-207)||(18809428-18809546)
chr2 (119-187)||(22283255-22283323)
chr2 (216-280)||(23799467-23799531)
chr2 (168-207)||(23131347-23131386)
chr2 (168-207)||(23711651-23711690)
chr2 (168-207)||(26505864-26505903)
chr2 (168-207)||(26508342-26508381)
chr2 (168-207)||(27920402-27920441)
chr2 (168-207)||(32039136-32039175)
chr2 (168-207)||(34402160-34402199)
chr2 (137-187)||(5889314-5889364)
chr2 (77-159)||(6486580-6486662)
chr2 (171-207)||(23708980-23709016)
chr2 (89-133)||(24788042-24788086)
[»] chr8 (90 HSPs)
chr8 (11-282)||(24485717-24485988)
chr8 (1-283)||(27472078-27472362)
chr8 (1-282)||(16412977-16413260)
chr8 (1-282)||(32121946-32122229)
chr8 (1-280)||(38549666-38549947)
chr8 (1-283)||(15070777-15071061)
chr8 (1-282)||(1484620-1484902)
chr8 (1-282)||(14409106-14409388)
chr8 (1-282)||(5852954-5853236)
chr8 (12-270)||(24048841-24049098)
chr8 (15-279)||(16198115-16198379)
chr8 (11-282)||(18677738-18678009)
chr8 (1-282)||(14823993-14824275)
chr8 (11-282)||(16401598-16401869)
chr8 (11-282)||(4542047-4542317)
chr8 (1-282)||(4483498-4483780)
chr8 (1-280)||(15202840-15203121)
chr8 (1-282)||(20045857-20046139)
chr8 (11-282)||(22001971-22002241)
chr8 (1-280)||(20403499-20403780)
chr8 (1-282)||(19936569-19936842)
chr8 (1-280)||(19896541-19896822)
chr8 (41-282)||(1326635-1326876)
chr8 (1-207)||(19896807-19897015)
chr8 (16-206)||(14397419-14397609)
chr8 (1-208)||(15202647-15202856)
chr8 (11-207)||(38549485-38549681)
chr8 (77-279)||(25657892-25658094)
chr8 (1-179)||(45290209-45290389)
chr8 (1-207)||(16401201-16401408)
chr8 (1-191)||(16401393-16401585)
chr8 (81-280)||(45290385-45290584)
chr8 (41-207)||(20403765-20403931)
chr8 (41-207)||(27471927-27472093)
chr8 (41-207)||(32122214-32122380)
chr8 (41-196)||(38549323-38549478)
chr8 (41-199)||(15202496-15202654)
chr8 (41-207)||(15071046-15071212)
chr8 (42-207)||(16412827-16412992)
chr8 (41-199)||(24049104-24049262)
chr8 (41-199)||(19897008-19897166)
chr8 (41-199)||(19936418-19936576)
chr8 (41-185)||(11361024-11361168)
chr8 (41-134)||(32810262-32810355)
chr8 (215-282)||(13425336-13425403)
chr8 (215-282)||(20982498-20982565)
chr8 (215-282)||(20982604-20982671)
chr8 (215-282)||(38549988-38550055)
chr8 (77-187)||(15319988-15320098)
chr8 (77-187)||(15500357-15500467)
chr8 (118-187)||(29759429-29759498)
chr8 (226-282)||(13425241-13425297)
chr8 (215-282)||(20403445-20403511)
chr8 (215-282)||(32810149-32810215)
chr8 (215-282)||(45290572-45290638)
chr8 (89-187)||(24717722-24717820)
chr8 (118-187)||(13663129-13663198)
chr8 (118-187)||(22007126-22007195)
chr8 (215-282)||(1326915-1326981)
chr8 (215-282)||(19896487-19896553)
chr8 (117-187)||(17150655-17150725)
chr8 (216-282)||(19936882-19936947)
chr8 (215-280)||(16401908-16401972)
chr8 (215-282)||(15203109-15203175)
chr8 (77-187)||(223304-223414)
chr8 (77-187)||(272163-272273)
chr8 (77-187)||(643576-643686)
chr8 (77-187)||(688075-688185)
chr8 (77-187)||(736927-737037)
chr8 (77-187)||(829382-829492)
chr8 (77-187)||(860822-860932)
chr8 (117-187)||(22089412-22089482)
chr8 (117-187)||(39114415-39114485)
chr8 (137-187)||(18611952-18612002)
chr8 (118-187)||(18618830-18618899)
chr8 (118-187)||(22146977-22147046)
chr8 (219-282)||(21513644-21513707)
chr8 (92-159)||(24678771-24678838)
chr8 (89-207)||(1484887-1485005)
chr8 (216-282)||(18815609-18815675)
chr8 (118-207)||(20045783-20045872)
chr8 (216-280)||(38988740-38988804)
chr8 (216-280)||(39019837-39019901)
chr8 (168-207)||(5852930-5852969)
chr8 (168-207)||(14409082-14409121)
chr8 (101-187)||(19866454-19866540)
chr8 (216-282)||(36733302-36733368)
chr8 (223-280)||(5083001-5083058)
chr8 (216-280)||(19936829-19936893)
chr8 (216-280)||(38549936-38550000)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (11-282)||(17516837-17517108)
chr5 (11-282)||(2154305-2154576)
chr5 (1-282)||(20901582-20901865)
chr5 (1-282)||(20909230-20909512)
chr5 (1-282)||(264430-264712)
chr5 (1-283)||(23064730-23065014)
chr5 (11-282)||(29346198-29346468)
chr5 (1-283)||(38619653-38619936)
chr5 (1-282)||(39363602-39363884)
chr5 (11-282)||(10732614-10732884)
chr5 (11-282)||(29348671-29348941)
chr5 (11-282)||(29351144-29351414)
chr5 (1-280)||(20917508-20917789)
chr5 (11-280)||(32027665-32027934)
chr5 (1-282)||(39245354-39245636)
chr5 (11-282)||(42245039-42245309)
chr5 (11-281)||(37804576-37804846)
chr5 (11-280)||(29330203-29330471)
chr5 (1-199)||(295936-296136)
chr5 (1-207)||(32028124-32028333)
chr5 (1-207)||(17516632-17516840)
chr5 (11-191)||(32027947-32028127)
chr5 (11-199)||(32028326-32028514)
chr5 (41-207)||(17516481-17516647)
chr5 (41-207)||(20901431-20901597)
chr5 (41-207)||(29330468-29330634)
chr5 (77-281)||(9776577-9776781)
chr5 (43-207)||(32028511-32028675)
chr5 (44-191)||(2154145-2154292)
chr5 (41-207)||(295785-295951)
chr5 (41-199)||(20917357-20917515)
chr5 (215-282)||(20901904-20901971)
chr5 (77-187)||(22883903-22884013)
chr5 (117-187)||(27183208-27183278)
chr5 (215-282)||(29330149-29330215)
chr5 (215-282)||(32027611-32027677)
chr5 (77-187)||(43444008-43444118)
chr5 (118-187)||(1220384-1220453)
chr5 (118-187)||(10778832-10778901)
chr5 (91-187)||(23511127-23511223)
chr5 (215-282)||(20917830-20917896)
chr5 (77-187)||(11903-12013)
chr5 (117-187)||(23506503-23506573)
chr5 (77-187)||(25426177-25426287)
chr5 (77-185)||(7424879-7424987)
chr5 (77-187)||(11342190-11342300)
chr5 (77-187)||(21933242-21933352)
chr5 (77-187)||(21939412-21939522)
chr5 (77-187)||(22367094-22367204)
chr5 (77-187)||(35581340-35581450)
chr5 (77-187)||(36990638-36990748)
chr5 (118-187)||(1168832-1168901)
chr5 (118-187)||(11212734-11212803)
chr5 (215-280)||(20917777-20917842)
chr5 (118-187)||(21074249-21074318)
chr5 (77-187)||(18778605-18778715)
chr5 (117-187)||(32950213-32950283)
chr5 (89-187)||(35791736-35791834)
chr5 (219-282)||(18743973-18744036)
chr5 (89-187)||(19499428-19499526)
chr5 (118-178)||(28901495-28901555)
chr5 (118-178)||(28937890-28937950)
chr5 (168-207)||(264406-264445)
chr5 (168-207)||(20909497-20909536)
chr5 (168-207)||(39245621-39245660)
chr5 (168-207)||(39363869-39363908)
chr5 (216-282)||(1628169-1628235)
chr5 (218-280)||(21399896-21399958)
chr5 (89-127)||(23280293-23280331)
chr5 (216-257)||(24067282-24067323)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (11-283)||(806-1078)
scaffold0747 (58-207)||(1075-1224)
scaffold0747 (41-177)||(1225-1360)
scaffold0747 (215-282)||(702-768)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (1-282)||(3964-4247)
scaffold0741 (1-207)||(3771-3979)
scaffold0741 (11-199)||(3590-3778)
scaffold0741 (155-199)||(3541-3585)
[»] chr3 (99 HSPs)
chr3 (1-282)||(46822479-46822762)
chr3 (11-282)||(7781020-7781291)
chr3 (1-282)||(17463396-17463678)
chr3 (1-282)||(34159544-34159826)
chr3 (11-282)||(45606580-45606851)
chr3 (11-282)||(53301177-53301448)
chr3 (11-279)||(13436520-13436788)
chr3 (1-282)||(27165470-27165753)
chr3 (11-282)||(15977751-15978021)
chr3 (13-283)||(8499737-8500007)
chr3 (1-283)||(10557125-10557409)
chr3 (1-282)||(55476709-55476991)
chr3 (11-282)||(6468808-6469078)
chr3 (11-282)||(10247397-10247667)
chr3 (11-282)||(54521040-54521311)
chr3 (1-283)||(15412648-15412931)
chr3 (14-282)||(16453957-16454225)
chr3 (11-282)||(13153929-13154199)
chr3 (1-280)||(38961499-38961781)
chr3 (1-280)||(41124159-41124440)
chr3 (41-282)||(12119357-12119598)
chr3 (11-280)||(17444437-17444706)
chr3 (11-224)||(20629865-20630078)
chr3 (1-250)||(16282419-16282670)
chr3 (36-282)||(12567778-12568023)
chr3 (11-282)||(13151464-13151734)
chr3 (11-238)||(28848295-28848522)
chr3 (36-282)||(13544243-13544487)
chr3 (12-280)||(25237063-25237331)
chr3 (11-282)||(29544515-29544786)
chr3 (41-266)||(24513910-24514135)
chr3 (12-280)||(25229476-25229744)
chr3 (11-206)||(15465448-15465643)
chr3 (11-207)||(55318977-55319173)
chr3 (11-206)||(5223677-5223872)
chr3 (11-206)||(26054938-26055133)
chr3 (41-207)||(41124425-41124591)
chr3 (41-214)||(10379613-10379786)
chr3 (41-207)||(10557394-10557560)
chr3 (41-207)||(20629702-20629868)
chr3 (41-207)||(27165738-27165904)
chr3 (41-204)||(8500009-8500172)
chr3 (41-207)||(38961348-38961514)
chr3 (41-199)||(46822755-46822913)
chr3 (41-207)||(53301014-53301180)
chr3 (44-207)||(55318817-55318980)
chr3 (43-196)||(13937485-13937638)
chr3 (129-282)||(12305363-12305516)
chr3 (1-131)||(15007868-15008003)
chr3 (41-207)||(17444274-17444440)
chr3 (11-128)||(16358341-16358458)
chr3 (41-207)||(17393201-17393367)
chr3 (86-208)||(36528447-36528569)
chr3 (41-199)||(16282268-16282426)
chr3 (76-207)||(14567430-14567561)
chr3 (11-122)||(36528340-36528451)
chr3 (11-97)||(12305525-12305611)
chr3 (101-208)||(3264324-3264431)
chr3 (101-199)||(16358238-16358336)
chr3 (1-98)||(14567546-14567645)
chr3 (215-283)||(9707484-9707552)
chr3 (1-122)||(3264415-3264538)
chr3 (11-74)||(13937646-13937709)
chr3 (77-199)||(25058286-25058408)
chr3 (215-282)||(8899312-8899378)
chr3 (215-282)||(16282689-16282755)
chr3 (215-282)||(17444694-17444760)
chr3 (215-282)||(38961769-38961835)
chr3 (41-107)||(8899418-8899484)
chr3 (117-187)||(51158683-51158753)
chr3 (118-187)||(16934851-16934920)
chr3 (118-187)||(49231768-49231837)
chr3 (215-282)||(25237009-25237075)
chr3 (215-282)||(41124105-41124171)
chr3 (77-187)||(14528624-14528734)
chr3 (119-187)||(30152450-30152518)
chr3 (215-282)||(11913928-11913994)
chr3 (118-185)||(54039167-54039234)
chr3 (77-187)||(1468613-1468723)
chr3 (155-199)||(15007996-15008040)
chr3 (77-187)||(8269362-8269472)
chr3 (77-187)||(8276473-8276583)
chr3 (62-108)||(10555766-10555812)
chr3 (118-187)||(17956869-17956938)
chr3 (77-187)||(12808505-12808615)
chr3 (89-187)||(14263640-14263738)
chr3 (101-191)||(21026092-21026182)
chr3 (77-187)||(27840459-27840569)
chr3 (117-187)||(28557370-28557440)
chr3 (89-207)||(34159811-34159929)
chr3 (118-187)||(16820462-16820531)
chr3 (216-280)||(25201333-25201397)
chr3 (168-207)||(17463663-17463702)
chr3 (168-207)||(55476976-55477015)
chr3 (85-187)||(2281000-2281102)
chr3 (216-274)||(15025934-15025992)
chr3 (137-187)||(44228516-44228566)
chr3 (215-280)||(17044330-17044395)
chr3 (89-157)||(6158993-6159061)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (1-282)||(4912-5195)
scaffold0716 (41-207)||(5180-5346)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (1-282)||(13610-13893)
scaffold0444 (167-207)||(13878-13918)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (1-282)||(38039-38322)
scaffold0134 (89-207)||(38307-38425)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (1-282)||(94629-94911)
scaffold0023 (11-282)||(17113-17384)
scaffold0023 (44-207)||(16953-17116)
scaffold0023 (118-187)||(154892-154961)
scaffold0023 (89-207)||(94896-95014)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (1-280)||(27161248-27161529)
chr1 (1-282)||(13989084-13989366)
chr1 (11-282)||(21840985-21841255)
chr1 (11-282)||(21922965-21923235)
chr1 (1-282)||(21474748-21475031)
chr1 (1-280)||(29776960-29777241)
chr1 (11-282)||(16362136-16362407)
chr1 (1-280)||(31612585-31612866)
chr1 (11-282)||(15859682-15859952)
chr1 (11-282)||(16274929-16275201)
chr1 (1-280)||(29298461-29298742)
chr1 (11-280)||(22122688-22122957)
chr1 (11-234)||(13227129-13227352)
chr1 (11-282)||(23593407-23593678)
chr1 (11-234)||(29535317-29535540)
chr1 (1-207)||(31612851-31613059)
chr1 (44-280)||(22050543-22050779)
chr1 (41-207)||(22122524-22122691)
chr1 (41-207)||(15859506-15859672)
chr1 (41-207)||(29298727-29298893)
chr1 (43-199)||(29777234-29777390)
chr1 (44-199)||(9044711-9044866)
chr1 (40-207)||(16401407-16401574)
chr1 (41-207)||(16274766-16274932)
chr1 (41-199)||(31613052-31613210)
chr1 (41-197)||(40129387-40129543)
chr1 (43-207)||(27161099-27161263)
chr1 (41-132)||(43543269-43543360)
chr1 (1-159)||(10812667-10812827)
chr1 (1-147)||(16401274-16401422)
chr1 (11-75)||(41372896-41372960)
chr1 (215-282)||(16275240-16275307)
chr1 (215-282)||(22050767-22050833)
chr1 (215-282)||(29776906-29776972)
chr1 (215-282)||(31612531-31612597)
chr1 (137-207)||(10812612-10812682)
chr1 (215-282)||(29298354-29298420)
chr1 (117-187)||(21858592-21858662)
chr1 (89-187)||(44035830-44035928)
chr1 (215-282)||(22122945-22123011)
chr1 (77-187)||(17003909-17004019)
chr1 (216-282)||(27161518-27161583)
chr1 (118-187)||(21650910-21650979)
chr1 (118-187)||(22366527-22366596)
chr1 (41-93)||(43630292-43630344)
chr1 (80-187)||(18060577-18060684)
chr1 (215-280)||(29298408-29298473)
chr1 (89-207)||(13989351-13989469)
chr1 (118-178)||(16655942-16656002)
chr1 (137-187)||(7641619-7641669)
chr1 (118-187)||(15862081-15862150)
chr1 (125-185)||(22029817-22029877)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (11-282)||(6165-6435)
[»] scaffold0230 (6 HSPs)
scaffold0230 (11-282)||(14165-14436)
scaffold0230 (1-282)||(23192-23475)
scaffold0230 (41-207)||(22881-23047)
scaffold0230 (1-85)||(23032-23118)
scaffold0230 (121-207)||(23121-23207)
scaffold0230 (41-91)||(20714-20764)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (11-282)||(11507-11778)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (1-282)||(6597-6880)
scaffold0317 (41-207)||(6446-6612)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (11-282)||(20965-21237)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (1-282)||(30237-30520)
scaffold0149 (40-207)||(30505-30672)
scaffold0149 (217-282)||(30131-30196)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-282)||(40618-40900)
scaffold0044 (77-199)||(37848-37969)
scaffold0044 (167-207)||(40885-40925)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (11-282)||(9460-9730)
[»] scaffold1792 (4 HSPs)
scaffold1792 (1-282)||(425-708)
scaffold1792 (41-207)||(853-1019)
scaffold1792 (1-85)||(782-868)
scaffold1792 (121-207)||(693-779)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (1-279)||(6682-6952)
scaffold0574 (41-207)||(6937-7103)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (1-282)||(10009-10292)
scaffold0043 (1-207)||(10277-10485)
scaffold0043 (44-199)||(10478-10633)
scaffold0043 (215-249)||(9936-9970)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (11-282)||(3241-3512)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (11-282)||(134429-134699)
scaffold0028 (11-282)||(136898-137168)
scaffold0028 (11-282)||(139367-139637)
scaffold0028 (11-282)||(141836-142106)
scaffold0028 (11-282)||(144305-144575)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (41-282)||(227-468)
scaffold0494 (215-282)||(507-574)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (1-243)||(7996-8240)
scaffold0278 (13-207)||(8225-8419)
scaffold0278 (41-204)||(8421-8584)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (1-237)||(43002-43240)
scaffold0040 (90-282)||(13379-13571)
scaffold0040 (41-207)||(43225-43391)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (1-282)||(15140-15413)
scaffold0306 (1-249)||(11001-11251)
scaffold0306 (43-207)||(10852-11016)
scaffold0306 (41-207)||(15398-15563)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (11-234)||(68227-68450)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (11-206)||(17947-18142)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (11-199)||(33472-33660)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (41-282)||(38359-38600)
[»] scaffold0711 (4 HSPs)
scaffold0711 (1-206)||(7352-7558)
scaffold0711 (14-207)||(7174-7367)
scaffold0711 (1-76)||(7544-7621)
scaffold0711 (112-205)||(7079-7172)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (78-282)||(53612-53816)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (1-218)||(501347-501565)
scaffold0001 (41-207)||(501550-501716)
scaffold0001 (233-279)||(501305-501351)
scaffold0001 (89-187)||(139589-139687)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (11-206)||(31497-31692)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (15-206)||(39626-39817)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (11-207)||(8311-8507)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (11-206)||(19762-19957)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (41-207)||(18423-18589)
scaffold0322 (1-85)||(18352-18438)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (101-282)||(1646-1827)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (43-207)||(1740-1904)
scaffold1296 (1-120)||(1634-1755)
[»] scaffold0151 (3 HSPs)
scaffold0151 (1-207)||(36860-37068)
scaffold0151 (81-207)||(36749-36875)
scaffold0151 (11-56)||(37065-37110)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (116-273)||(57708-57865)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (130-282)||(10991-11142)
scaffold0454 (11-75)||(1-65)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (41-187)||(113329-113475)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (155-280)||(28061-28186)
scaffold0114 (215-282)||(28007-28073)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (38-122)||(75605-75689)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (203-282)||(10647-10726)
scaffold0513 (215-282)||(10765-10831)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (77-187)||(6195-6305)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (77-187)||(30470-30580)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (86-187)||(12489-12590)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (41-121)||(398-478)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (215-282)||(9949-10016)
scaffold0145 (217-279)||(10005-10067)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (77-187)||(8566-8676)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (77-187)||(725-835)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (118-187)||(6970-7039)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (215-282)||(15150-15216)
scaffold0106 (193-282)||(15032-15111)
scaffold0106 (117-185)||(41259-41327)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (77-187)||(1375-1485)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (89-187)||(1267-1365)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (119-185)||(15780-15846)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (89-187)||(32118-32216)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (89-187)||(40628-40726)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (77-187)||(110064-110174)
scaffold0035 (77-187)||(118565-118675)
scaffold0035 (89-132)||(15910-15953)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (117-187)||(39965-40035)
scaffold0034 (117-187)||(45448-45518)
scaffold0034 (117-187)||(79003-79073)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (118-185)||(912-979)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (117-187)||(868-938)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (77-187)||(18205-18315)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (77-187)||(28469-28579)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (77-187)||(38375-38485)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (117-187)||(53946-54016)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (117-187)||(19939-20009)
[»] scaffold0959 (1 HSPs)
scaffold0959 (85-199)||(1219-1333)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (117-187)||(8122-8192)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (217-280)||(16263-16326)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (137-187)||(1959-2009)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (227-280)||(35955-36007)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (118-187)||(167129-167198)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (216-280)||(15297-15361)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 86)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16214185 - 16213902
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16214185 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttacgtgtaaaca 16214086  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16214085 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatgactgcacgtaggtc 16213986  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16213985 acagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 16213902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 15081516 - 15081786
Alignment:
Q  12 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081516 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagg 15081615  T
Q  112 tatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataact 211  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  15081616 tatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataatt 15081715  T
Q  212 gaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081716 gaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 15081786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8940784 - 8940497
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8940784 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttaagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaaca 8940685  T
Q  99 ca----aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcaccta 194  Q
    ||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8940684 cacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgta 8940585  T
Q  195 ggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940584 ggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 8940497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 14269630 - 14269901
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14269630 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 14269729  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||     
T  14269730 gtatggatgttagctttctaattccgttggttcgacttcaaaaggatttatagaaattgagttatggtcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataat 14269829  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14269830 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 14269901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27217361 - 27217078
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217361 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 27217262  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27217261 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 27217162  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27217161 acagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 27217078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41523406 - 41523135
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41523406 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtag 41523307  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  41523306 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataat 41523207  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41523206 tgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 41523135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41525868 - 41525597
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41525868 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtag 41525769  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  41525768 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataat 41525669  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41525668 tgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 41525597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 456822 - 456539
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456822 gtaggtcacattgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 456723  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  456722 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 456623  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  456622 acagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 456539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 15376375 - 15376657
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376375 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 15376474  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15376475 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 15376574  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15376575 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 15376657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 20384785 - 20385067
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384785 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 20384884  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20384885 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 20384984  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20384985 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20385067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16410559 - 16410277
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410559 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 16410460  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16410459 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 16410360  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16410359 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16410277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16233009 - 16232738
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16233009 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 16232910  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  16232909 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgaattcaaaaggatttatagaatttgagttattgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataat 16232810  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16232809 tgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16232738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13869848 - 13869565
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13869848 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaaca 13869750  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  13869749 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtc 13869650  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 283  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13869649 acagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtt 13869565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 14948796 - 14949066
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14948796 gaatttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 14948895  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  14948896 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 14948995  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14948996 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 14949066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32125979 - 32125709
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32125979 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 32125880  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  32125879 gtataaatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 32125780  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32125779 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 32125709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 45847316 - 45847599
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45847316 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaataatattgattggtacaaaattggtcttaggtataaaca 45847415  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  45847416 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtc 45847515  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45847516 acagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 45847599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11303736 - 11303465
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11303736 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtag 11303637  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  11303636 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaat 11303537  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  11303536 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 11303465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 16108362 - 16108633
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16108362 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 16108461  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| ||     
T  16108462 gtatggatgttagttttctaatgctgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaat 16108561  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  16108562 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacaatattgtcaatgattgatgaagt 16108633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 21189269 - 21189539
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21189269 gaatttttatgaatttccgcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagagttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtag 21189368  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  21189369 gtatgaatgttagctttttaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 21189468  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21189469 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-gtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 21189539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Original strand, 23664626 - 23664895
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23664626 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23664725  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||     
T  23664726 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaat 23664825  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  23664826 tgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaa 23664895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18431200 - 18430930
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18431200 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 18431101  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||     
T  18431100 gtatgaatcttaggtttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagaacatagtgaataat 18431001  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18431000 tgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18430930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29797099 - 29796829
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29797099 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtag 29797000  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||     
T  29796999 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaat 29796900  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaag 281  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  29796899 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 29796829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29800918 - 29800648
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29800918 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtag 29800819  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||     
T  29800818 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaat 29800719  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaag 281  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  29800718 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 29800648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18628066 - 18627784
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18628066 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttaaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaaca 18627967  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18627966 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtc 18627867  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  18627866 acagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccgtgattgatgaagt 18627784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18640772 - 18640490
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18640772 gtaggtcacagtgaatttttaagaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaaca 18640673  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18640672 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtc 18640573  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18640572 acagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 18640490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24702717 - 24702456
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24702717 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtag 24702618  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  24702617 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 24702518  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24702517 tgaatatgattcatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 24702456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24705164 - 24704903
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24705164 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtag 24705065  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  24705064 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 24704965  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24704964 tgaatatgattcatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 24704903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 26355643 - 26355925
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26355643 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaaca 26355742  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  26355743 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtc 26355842  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26355843 acagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccataattgatgaagt 26355925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 26358095 - 26358377
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26358095 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaaca 26358194  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  26358195 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtc 26358294  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26358295 acagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgtccataattgatgaagt 26358377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 41 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8469194 - 8468955
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8469194 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttgg 8469095  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 240  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8469094 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 8468995  T
Q  241 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8468994 gtatatgtttttgaatacgatattgttcatgattgatgaa 8468955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 11392973 - 11393231
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||| ||||||||||    
T  11392973 gaatttttatgaatttcagcataactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaga-------------gtaaacacgaaagttgtag 11393059  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  11393060 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataat 11393159  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11393160 tgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 11393231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Original strand, 10501067 - 10501263
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10501067 gaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 10501166  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  10501167 gtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaatggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Original strand, 25926803 - 25926998
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25926803 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 25926902  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25926903 gtatggatattagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaaagagttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8940961 - 8940769
Alignment:
Q  14 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8940961 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataattggtcttaggtgtaaaca-aaaagttgtaggta 8940863  T
Q  114 tggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8940862 tggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 14269425 - 14269633
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269425 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 14269524  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||    
T  14269525 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtatgacgtcaaaaaaatttatagaacttgagttatcatcaaattattgcacgcaggtc 14269624  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    |||||||||    
T  14269625 agagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Original strand, 13918076 - 13918272
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtc-ttaggtgtaaacacaaaagttgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||    
T  13918076 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgta 13918175  T
Q  110 ggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13918176 ggtatgaatgttagctttctaattccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 14156740 - 14156944
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||    
T  14156740 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggt----aca 14156835  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14156836 ctaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtc 14156935  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    | |||||||    
T  14156936 acagtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11973007 - 11972768
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  11973007 ccgaacttaaaatgaaatctggtattgataggtccagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttgg 11972908  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 240  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11972907 tttgacttcaaaaggatctatagaacttgagttatagtcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 11972808  T
Q  241 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | |||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  11972807 gcatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 11972768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Original strand, 1856903 - 1857097
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1856903 gaatttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacac-gaagttgtag 1857001  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1857002 gtatgaatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 207
Target Start/End: Original strand, 14269276 - 14269440
Alignment:
Q  43 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14269276 gaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtt 14269375  T
Q  143 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14269376 tgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 38897741 - 38897904
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38897741 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 38897840  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38897841 gacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16214336 - 16214170
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16214336 ccgaatttgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 16214237  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  16214236 tatgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8941128 - 8940962
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8941128 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 8941029  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  8941028 tctgaagtcaaaatgatttatagaacttgagttatgctcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841274
Alignment:
Q  108 taggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  208 aactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 21189106 - 21189272
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  21189106 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttgg 21189205  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21189206 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 14156592 - 14156755
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14156592 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 14156691  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  14156692 gacttcaaaaggatttatagaacttgacttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 15081352 - 15081510
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15081352 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccataattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 15081451  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15081452 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtca 15081510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 10500934 - 10501064
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10500934 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttt 10501033  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagtta 174  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10501034 gacttcaaaaggatttatagaacttgagtta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 207
Target Start/End: Original strand, 17985092 - 17985254
Alignment:
Q  45 atttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttg 144  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||    
T  17985092 atttcaaatgaaatctggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttg 17985191  T
Q  145 acttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | | | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17985192 attccaaaatgatatttagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 211 - 282
Target Start/End: Original strand, 38897996 - 38898067
Alignment:
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897996 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 38898067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  120 ttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaata 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 283
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847706
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtt 45847706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11310243 - 11310133
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  11310243 gaatatttatgaatttcagcacaacctttcccgaatttgaaatgaaaact-gtattgataagtacataattggtcttaggtgttttcacaaaagttgtag 11310145  T
Q  111 gtatggatgtta 122  Q
    |||| |||||||    
T  11310144 gtatagatgtta 11310133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 45847213 - 45847331
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847213 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 45847312  T
Q  189 cacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  45847313 cacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11287046 - 11286976
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11287046 atgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125965
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 110
Target Start/End: Original strand, 23461795 - 23461864
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23461795 ccgaatttgaaatgaagtctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972714
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgcccatgattgatgaagt 11972714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14270006
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 14270006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15081891
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 15081891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898172
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 38898172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940392
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 8940392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7822123 - 7822013
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7822123 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 7822024  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  7822023 atcaaattact 7822013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7829434 - 7829324
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7829434 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 7829335  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  7829334 atcaaattact 7829324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 187
Target Start/End: Original strand, 15951637 - 15951703
Alignment:
Q  121 tagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15951637 tagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 15951703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 27102511 - 27102621
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27102511 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27102610  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  27102611 atcaaattact 27102621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 27109859 - 27109969
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27109859 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27109958  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  27109959 atcaaattact 27109969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27175815 - 27175705
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27175815 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 27175716  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  27175715 atcaaattact 27175705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 38784603 - 38784713
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38784603 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 38784702  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  38784703 atcaaattact 38784713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 15760779 - 15760848
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  15760779 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 169
Target Start/End: Original strand, 10000996 - 10001076
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttg 169  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10000996 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttg 10001076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Original strand, 16202766 - 16202852
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttat 175  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||   ||||||| ||||| |||||||||    
T  16202766 ggtgtaaacataaaagttgtaggtagtgatgttagatttctaatggctttggttttacttcatgatgatttctagaatttgagttat 16202852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 32495062 - 32495160
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | |||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32495062 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttatctttctaatggctttggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcatattact 32495160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 15376272 - 15376390
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  15376272 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15376371  T
Q  189 cacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  15376372 cacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 20384682 - 20384800
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  20384682 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 20384781  T
Q  189 cacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  20384782 cacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 280
Target Start/End: Original strand, 15119918 - 15119983
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||    
T  15119918 tatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 15119983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 133
Target Start/End: Original strand, 13475728 - 13475772
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13475728 ggtgtaaacacaaaggttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 13475772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 13745569 - 13745633
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||| |||||    
T  13745569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaa 13745633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38294631 - 38294567
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||    
T  38294631 atgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410544
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18628051
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640757
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355658
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358110
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15852046 - 15851992
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgag 171  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  15852046 atgttatctttctaatggctttggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgag 15851992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110747
Alignment:
Q  78 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 20110747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 84)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 14970368 - 14970651
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14970368 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaaca 14970467  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14970468 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtc 14970567  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14970568 acagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcataattgatgaagt 14970651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 52872734 - 52873014
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52872734 gtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaaca 52872833  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52872834 cgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 52872933  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 279  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52872934 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 52873014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3515508 - 3515225
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3515508 gtaggtcacagtgaatttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgatcggtacaaaattggtcttaggtgtaaaca 3515409  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3515408 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtc 3515309  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3515308 acagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 3515225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 19617728 - 19618011
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19617728 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagagttggtcttaggtgttaaca 19617827  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19617828 caaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtgtgacttcaaaaggatttatagaagttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 19617927  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617928 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 19618011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 362666 - 362398
Alignment:
Q  14 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  362666 tttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggta 362567  T
Q  114 tggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactga 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  362566 tggatgttagctttctaatgtcgttagtttgacttcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattga 362467  T
Q  214 atatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  362466 atatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 362398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 15118014 - 15118296
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118014 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 15118113  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15118114 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 15118213  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15118214 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 15118296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 15495835 - 15496118
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15495835 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcctaatttggaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 15495934  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15495935 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcgaaaggttttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtc 15496034  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15496035 acagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttctgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 15496118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29267842 - 29267571
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29267842 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 29267743  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  29267742 gtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataat 29267643  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29267642 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29267571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15534670 - 15534399
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15534670 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 15534571  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  15534570 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaat 15534471  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15534470 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 15534399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 50222013 - 50222283
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50222013 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtag 50222112  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  50222113 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 50222212  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50222213 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 50222283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 14746185 - 14746456
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  14746185 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtag 14746284  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  14746285 gtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgactttaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 14746384  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14746385 taaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttgtgaatactattatgttcatgattgatgaagt 14746456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44615777 - 44615506
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  44615777 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtag 44615678  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  44615677 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 44615578  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44615577 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 44615506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19243189 - 19242918
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  19243189 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgtag 19243090  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  19243089 gtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataat 19242990  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19242989 tgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19242918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36038359 - 36038088
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36038359 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtag 36038260  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  36038259 gtatggatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaat 36038160  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  36038159 tgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 36038088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 49547447 - 49547718
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  49547447 gaatttttatgaatttcagcacaaatttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtag 49547546  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  49547547 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaat 49547646  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  49547647 tatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 49547718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 44772745 - 44773027
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44772745 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacattgtccgaattttaaatgaaaactggtatttattggtagagaattggtcttaggtgtaaaca 44772844  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44772845 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 44772944  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44772945 acaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 44773027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 7640848 - 7641130
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640848 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 7640947  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||    
T  7640948 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagttaaattactgcctgtaggtc 7641047  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7641048 acagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatttttcatgattgatgaagt 7641130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 52313062 - 52312782
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313062 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaagtttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 52312963  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||    
T  52312962 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtc-aattactgcacgcaggtc 52312864  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  52312863 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 52312782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19858079 - 19857806
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19858079 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatgagaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaaca 19857980  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19857979 cgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtc 19857880  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19857879 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 19857806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 1837193 - 1837420
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1837193 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtag 1837292  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  1837293 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttaaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataat 1837392  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837393 tgaatatgattgatgaattagtatatgt 1837420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14049066 - 14048798
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  14049066 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgg 14048967  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||     
T  14048966 gtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttacagaacttgtgttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaat 14048867  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 279  Q
    ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  14048866 tgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatga 14048798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 280
Target Start/End: Original strand, 11958 - 12197
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  11958 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttgg 12057  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12058 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaat 12157  T
Q  241 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    |||||||||| ||  || ||| ||||| ||||||||||||    
T  12158 gtatatgtttatgtgtattatgttgtttatgattgatgaa 12197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 362874 - 362668
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362874 gtaggtcacagtgaatttttatgaatatcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 362775  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  362774 ctaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacatcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 362675  T
Q  199 agagtga 205  Q
    | |||||    
T  362674 atagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 14745980 - 14746188
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745980 gtaggtcacagtaaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 14746079  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  14746080 agaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatc 14746179  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    | |||||||    
T  14746180 atagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 52313255 - 52313047
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  52313255 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaaca 52313156  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  52313155 caaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtc 52313056  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    | |||||||    
T  52313055 acagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30147404 - 30147189
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30147404 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaatggaattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaa 30147305  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    |||||||| | |  ||   |||||| ||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||     
T  30147304 gtatggatataaaattaaaaatgacattggtatgacaacaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaataat 30147205  T
Q  211 tgaatatgattgatga 226  Q
    ||||||||||||||||    
T  30147204 tgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19858230 - 19858064
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19858230 ccgaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 19858131  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  19858130 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 14970217 - 14970383
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14970217 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgatttgtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 14970316  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14970317 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 52872583 - 52872749
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  52872583 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttgg 52872682  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  52872683 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 18214717 - 18214880
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18214717 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtct 18214816  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  18214817 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 19617577 - 19617743
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19617577 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 19617676  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | | ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19617677 tctaacgccaaaatgatttattgaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3515657 - 3515493
Alignment:
Q  43 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  3515657 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtc 3515558  T
Q  143 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3515557 tcacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 363025 - 362859
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  363025 ccgaatttgaaatgaaatgtggtattgatttgtatagaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 362926  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  362925 tctgacgtcaaaaagatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 52313406 - 52313240
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52313406 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 52313307  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  52313306 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 207
Target Start/End: Original strand, 15495716 - 15495850
Alignment:
Q  73 tacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||    
T  15495716 tacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagt 15495815  T
Q  173 tatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15495816 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 161 - 282
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215113
Alignment:
Q  161 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacta 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  261 tattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18215092 tattgttcatgattgatgaagt 18215113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 18214865 - 18214966
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214865 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 18214964  T
Q  99 ca 100  Q
    ||    
T  18214965 ca 18214966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 282
Target Start/End: Original strand, 15355068 - 15355163
Alignment:
Q  187 tgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15355068 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 15355163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14185727 - 14185621
Alignment:
Q  101 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||     
T  14185727 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtaggtcac 14185628  T
Q  201 agtgaat 207  Q
    |||||||    
T  14185627 agtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14185636 - 14185477
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14185636 gtaggtcacagtgaatctttaggaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgttaaca 14185537  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatt 158  Q
      |||||||||| || |  ||||||||||| | || | ||||| ||||||  ||||||||    
T  14185536 tgaaagttgtagataagtgtgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgatt 14185477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 115
Target Start/End: Original strand, 12778386 - 12778460
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12778386 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 12778460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 282
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239363
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtt 267  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtc 18239348  T
Q  268 catgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||    
T  18239349 catgattgatgaagt 18239363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 22725386 - 22725494
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22725386 gtaggtcacactgaatctttatgaatttcagcacaacttttcccaaatttgaaatgaaaactgatattgataggtacagaattggtctttggtgtaaaca 22725485  T
Q  99 caaaagttg 107  Q
      |||||||    
T  22725486 tgaaagttg 22725494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857700
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19857700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14951380 - 14951270
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    |||||||| ||  |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14951380 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatg 14951281  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  14951280 atcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Original strand, 12033447 - 12033511
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12033447 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtaaagattggtac 12033511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 199
Target Start/End: Original strand, 22725284 - 22725393
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22725284 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaatc-cgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactg 22725382  T
Q  189 cacctaggtca 199  Q
    ||| |||||||    
T  22725383 cacgtaggtca 22725393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 185
Target Start/End: Original strand, 55377225 - 55377293
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  55377225 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12251
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 12251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215218
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18215218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 25120046 - 25120144
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25120046 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25120144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 280
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355266
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 15355266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 187
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281795
Alignment:
Q  86 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 185  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||   |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 43281793  T
Q  186 ct 187  Q
    ||    
T  43281794 ct 43281795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312728
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagt 52312728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14995754 - 14995644
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14995754 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatg 14995655  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  14995654 atcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Original strand, 15489659 - 15489717
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15489659 ccgaatttgaaatgaagtctggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacac 15489717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18247849 - 18247739
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18247849 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 18247750  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  18247749 attaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Original strand, 18293695 - 18293765
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18293695 atgttagatttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18293765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47357293 - 47357183
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  47357293 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatg 47357194  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  47357193 attaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 185
Target Start/End: Original strand, 15287858 - 15287966
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15287858 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15287957  T
Q  177 gtcaaatta 185  Q
     ||||||||    
T  15287958 atcaaatta 15287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 185
Target Start/End: Original strand, 15294968 - 15295076
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15294968 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 15295067  T
Q  177 gtcaaatta 185  Q
     ||||||||    
T  15295068 atcaaatta 15295076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746561
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 14746561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15497015
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 15497015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618116
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19618116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 52873056 - 52873122
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  52873056 tatgattgatgaattaatatacgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 52873122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 5683367 - 5683465
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||    ||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5683367 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 5683465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10643856 - 10643746
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10643856 gaattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatg 10643757  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  10643756 attaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16731786 - 16731688
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttat 175  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16731786 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttttgaacttgagttat 16731688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 17146279 - 17146389
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| | ||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17146279 gaattggactttgatgtaaacattaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 17146378  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  17146379 attaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 22355071 - 22355169
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22355071 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18168362 - 18168293
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  18168362 tgttagctttctaatggcgttgatttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 18168293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 199
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745987
Alignment:
Q  137 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 14745987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19020119 - 19020009
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19020119 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 19020020  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  19020019 attaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 19698032 - 19698082
Alignment:
Q  137 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19698032 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19698082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 19708617 - 19708667
Alignment:
Q  137 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19708617 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19708667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8374150 - 8374040
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||| |||||||||| | ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8374150 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttaactttctaatggctttgattttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 8374051  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  8374050 attaaattact 8374040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 15117911 - 15118029
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  15117911 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15118010  T
Q  189 cacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  15118011 cacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9198658 - 9198558
Alignment:
Q  85 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 184  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  9198658 cttagttgtaaacatgaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtcttacttcaaaatgatttctacaacttgatttatggtcaaatt 9198559  T
Q  185 a 185  Q
    |    
T  9198558 a 9198558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 159
Target Start/End: Original strand, 630279 - 630361
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgattt 159  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  630279 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattt 630361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11940106 - 11940064
Alignment:
Q  91 tgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 133  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11940106 tgtaaacataaaagttgtaggtatggatgtaagctttccaatg 11940064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 86
Target Start/End: Original strand, 14745886 - 14745931
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtct 86  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14745886 ccgaatttgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtct 14745931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 82
Target Start/End: Original strand, 15355028 - 15355069
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattg 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  15355028 ccgaatttgaaatgaaaactggtatcgattgctacataattg 15355069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 207
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772760
Alignment:
Q  170 agttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11557936 - 11557892
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 133  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11557936 ggtgtaaacattcaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 11557892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 84)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 30676371 - 30676654
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30676371 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaaca 30676470  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  30676471 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgagttatggtaaaattacttcacgtaggtc 30676570  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30676571 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 30676654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1598557 - 1598275
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598557 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 1598458  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  1598457 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtcatagtcaaattactgcacgtaggtc 1598358  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1598357 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 1598275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 26924302 - 26924584
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26924302 gtaggtcacagttaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaaca 26924401  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26924402 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtacgtc 26924501  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26924502 atagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 26924584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 18334254 - 18334536
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334254 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 18334353  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18334354 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 18334453  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18334454 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18334536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24423047 - 24422765
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24423047 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 24422948  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24422947 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 24422848  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24422847 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24422765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33864778 - 33864496
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864778 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 33864679  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33864678 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 33864579  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33864578 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 33864496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33862282 - 33862012
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33862282 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 33862183  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  33862182 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 33862083  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33862082 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 33862012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18914433 - 18914150
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18914433 gtaggtcacagtcaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggggtaaaca 18914334  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18914333 cgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttggtttaacttcaaaaggatgtatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 18914234  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18914233 atagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtaaatacgatattgttcatgattgatgaagt 18914150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12742806 - 12742535
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12742806 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 12742707  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||     
T  12742706 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataat 12742607  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  12742606 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgaccttgtccatgattgatgaagt 12742535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 19847633 - 19847912
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19847633 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaaca 19847732  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||     ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19847733 cgaaagttgtaggtatgc----tagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 19847828  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19847829 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19847912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19005652 - 19005371
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19005652 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacatctttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattagtcttaggtgtaaaca 19005553  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19005552 caaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtc 19005453  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  19005452 atagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttgtgaatgcgatattgttcataattgatgaa 19005371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34963832 - 34963591
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34963832 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 34963733  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963732 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 34963633  T
Q  241 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34963632 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 34963591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 1540585 - 1540855
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1540585 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 1540684  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  1540685 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 1540784  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1540785 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 1540855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 2290842 - 2291124
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290842 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 2290941  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2290942 cgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 2291041  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  2291042 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgactgatgaagt 2291124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8055518 - 8055247
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8055518 gaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 8055419  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||     
T  8055418 gtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataat 8055319  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8055318 tgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 8055247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 31630214 - 31630485
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31630214 gaatttttatgaatttcagcacaattttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtag 31630313  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||     
T  31630314 gtatagacgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataat 31630413  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31630414 taaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagt 31630485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 19858596 - 19858863
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19858596 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 19858695  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  19858696 gtatgaatgt---ctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataat 19858792  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19858793 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ctgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19858863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22782727 - 22782445
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22782727 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaaatggtattaattggtacagaattggtcttaggtgtaagta 22782628  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22782627 ggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacataggtc 22782528  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22782527 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 22782445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25688991 - 25688720
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25688991 gaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatcaaaactggtatttattggtaccgaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtag 25688892  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  25688891 gtatggatgttagctttgtaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaaattgagttatggtcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataat 25688792  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  25688791 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgtccatgattgaggaagt 25688720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25535866 - 25535641
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25535866 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 25535767  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535766 tttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 25535667  T
Q  241 gtatatgtttgtgaatactatattgt 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  25535666 gtatatgtttgtgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 28289010 - 28289279
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28289010 gaatttttatgaattttagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtag 28289109  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  28289110 gtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaat 28289209  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   | ||||||| |||||||||||||||    
T  28289210 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtga--gcgatattgtccatgattgatgaagt 28289279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 66 - 282
Target Start/End: Original strand, 17377576 - 17377792
Alignment:
Q  66 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  17377576 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaa 17377675  T
Q  166 cttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377676 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattg 17377775  T
Q  266 ttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||    
T  17377776 ttcatgattgatgaagt 17377792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12942678 - 12942419
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  12942678 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta- 12942580  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
               |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  12942579 -----------agctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaat 12942491  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  12942490 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 12942419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23992881 - 23992641
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  23992881 ccgaatttgaaatgaaatccggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttgg 23992782  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 240  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992781 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 23992682  T
Q  241 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23992681 gtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23992641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1598750 - 1598542
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  1598750 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtataaaca 1598651  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1598650 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 1598551  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    | |||||||    
T  1598550 acagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25689184 - 25688988
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689184 gaatttttatgaatatcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 25689085  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| || |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  25689084 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaaaaatttatagaacttgcgttatggtcatattactgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23415453 - 23415265
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23415453 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23415354  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23415353 gtatggatgttagttttctaatgccattggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtca 23415265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27557211 - 27557016
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27557211 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtag 27557112  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27557111 gtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgttaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 26924109 - 26924309
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  26924109 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagcctttggtgtaaaca 26924208  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
      ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26924209 tgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 26924308  T
Q  199 a 199  Q
    |    
T  26924309 a 26924309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19005803 - 19005637
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19005803 ccgaatttgaaatgaaatttggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 19005704  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19005703 tctgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2034
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1871 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 1970  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1971 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 8830 - 8993
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  8830 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 8929  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8930 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Original strand, 15892086 - 15892231
Alignment:
Q  15 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15892086 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 15892185  T
Q  115 ggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgattta 160  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15892186 ggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 17883171 - 17883305
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17883171 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtag 17883270  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttga 145  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17883271 gtatggatgttagcattctaatgtcgttggtttga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18914626 - 18914426
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18914626 gtaggtcacagtaaacttttatgaattttagcacaacttagaccgaattttaaattaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaaca 18914527  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18914526 cgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgattgatagaacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtc 18914427  T
Q  199 a 199  Q
    |    
T  18914426 a 18914426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 19847485 - 19847648
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |    
T  19847485 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtct 19847584  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19847585 gacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1598901 - 1598735
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1598901 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgg 1598802  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1598801 tctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 30676220 - 30676386
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  30676220 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgaatggtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgc 30676319  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30676320 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18914777 - 18914619
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  18914777 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataagtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttgg 18914678  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    | |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18914677 tctgacatcaaaaaaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 18914619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 79 - 242
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  79 aatttaaaatgaaaactggtattgagttgtacaaaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtct 178  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  179 gacgtcaaaacgatttatataacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Original strand, 31630051 - 31630197
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31630051 ccgaatttaaaatgaaatctggtattgataagtacatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttgg 31630150  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630151 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 31630197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 25737143 - 25737028
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25737143 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaaca 25737044  T
Q  99 caaaagttgtaggtat 114  Q
    | ||||||||||||||    
T  25737043 cgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25689313 - 25689181
Alignment:
Q  75 cagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagtta 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||    
T  25689313 cagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagtta 25689214  T
Q  175 tggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25689213 tggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 8978 - 9085
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8978 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtaatgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 9077  T
Q  99 caaaagtt 106  Q
    | ||||||    
T  9078 cgaaagtt 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737128
Alignment:
Q  88 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  188 gcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||  ||||||| |||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 22981401 - 22981486
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 84  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981401 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 22981486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23807007 - 23806922
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 84  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23807007 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggt 23806922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875629
Alignment:
Q  164 aacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatat 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| ||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatat 15875648  T
Q  264 tgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15875647 tgttcatgattgatgaagt 15875629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630591
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 31630591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 207
Target Start/End: Original strand, 22981321 - 22981416
Alignment:
Q  112 tatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | | || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22981321 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23807087 - 23806992
Alignment:
Q  112 tatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | | || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23807087 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 19984130 - 19984228
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19984130 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19984228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16240406 - 16240296
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16240406 gaattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatg 16240307  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  16240306 atcaaattact 16240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 16556944 - 16557054
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16556944 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16557043  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  16557044 atcaaattact 16557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 16633500 - 16633610
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16633500 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 16633599  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  16633600 atcaaattact 16633610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 16650174 - 16650284
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16650174 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatg 16650273  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  16650274 atcaaattact 16650284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 22593581 - 22593691
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    |||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22593581 gaattgggtttaggtgttaacataaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatg 22593680  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  22593681 atcaaattact 22593691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005266
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 19005266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18914045
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttatgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18914045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25904585 - 25904474
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatga-tttatagaacttgagttat 175  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25904585 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttat 25904486  T
Q  176 ggtcaaattact 187  Q
    | ||||||||||    
T  25904485 gatcaaattact 25904474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 27654596 - 27654706
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27654596 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 27654695  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  27654696 attaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Original strand, 35016043 - 35016113
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35016043 atgttagctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 35016113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Original strand, 22226608 - 22226679
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatga-tttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22226608 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattact 22226679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10488081 - 10487971
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10488081 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 10487982  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  10487981 atcaaattact 10487971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 16377247 - 16377357
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16377247 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 16377346  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  16377347 atcaaattact 16377357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 16384571 - 16384681
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16384571 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 16384670  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  16384671 atcaaattact 16384681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 16826367 - 16826477
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||  |    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16826367 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagacaattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 16826466  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  16826467 attaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1555596 - 1555527
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  1555596 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 33315116 - 33315185
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  33315116 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 33315185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19609690 - 19609582
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  19609690 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagatatg 19609591  T
Q  177 gtcaaatta 185  Q
     ||||||||    
T  19609590 atcaaatta 19609582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 2019 - 2068
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 48  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2019 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattt 2068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25175222 - 25175112
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||    
T  25175222 gaattggactttggtgtaaacatcaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagatattgagatatg 25175123  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  25175122 attaaattact 25175112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875526
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtaaatgattaatgaa 15875526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 18334151 - 18334269
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  18334151 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18334250  T
Q  189 cacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  18334251 cacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 21776107 - 21776205
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21776107 ggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23153085 - 23153035
Alignment:
Q  137 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  23153085 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgataaaattact 23153035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24423150 - 24423032
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  24423150 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 24423051  T
Q  189 cacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  24423050 cacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 134
Target Start/End: Original strand, 10905416 - 10905461
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatga 134  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10905416 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatga 10905461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35056781 - 35056717
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  35056781 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaa 35056717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 50
Target Start/End: Original strand, 239 - 278
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttga 50  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  239 gaatttttgtgaatttcagcacaactttgttcgaatttga 278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33864802 - 33864763
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33864802 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656847
Alignment:
Q  232 tatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagt 25656847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29665444 - 29665374
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||| | ||||||||    
T  29665444 atgttagctttctattggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatgagagttatgattaaattact 29665374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32259136 - 32259078
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 274  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||    
T  32259136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgatt 32259078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 97)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 24642410 - 24642693
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  24642410 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaaagaaaactggtattgattggtacagaattgctcttaggtgtaaacc 24642509  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24642510 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcatgtaggtc 24642609  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642610 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 24642693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 282
Target Start/End: Original strand, 23706896 - 23707161
Alignment:
Q  16 tttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706896 tttatgaatttcagcacaacttt-tccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatg 23706994  T
Q  116 gatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaat 215  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  23706995 gatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaat 23707094  T
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707095 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 23707161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24681945 - 24681662
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24681945 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttagctgtaaaca 24681846  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24681845 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttgggcttccaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 24681746  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681745 acaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 24681662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24918641 - 24918358
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24918641 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtagagaattggtcttaagtgtaaaca 24918542  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24918541 tgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 24918442  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918441 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 24918358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39682814 - 39682531
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682814 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 39682715  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  39682714 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 39682615  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39682614 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 39682531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24671526 - 24671243
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24671526 gtaggtcacaatgaatttttaagaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaaaa 24671427  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24671426 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtc 24671327  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671326 acaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 24671243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18809443 - 18809161
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809443 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 18809344  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18809343 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 18809244  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18809243 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 18809161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 23711675 - 23711957
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711675 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 23711774  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23711775 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 23711874  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23711875 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23711957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28577599 - 28577317
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577599 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 28577500  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28577499 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 28577400  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28577399 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 28577317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22105966 - 22105685
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22105966 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtgcagaattggtcttaggtgtaaaca 22105867  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22105866 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 22105767  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  22105766 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 22105685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20261708 - 20261437
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20261708 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 20261609  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  20261608 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaat 20261509  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  20261508 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 20261437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24368327 - 24368046
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368327 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 24368228  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  24368227 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagttaaattactgcacgtaggtc 24368128  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  24368127 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatcatgttgtttatgattgatgaa 24368046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 571898 - 571615
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  571898 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaaca 571799  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  571798 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 571699  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  571698 acagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagt 571615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23131362 - 23131080
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23131362 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaaca 23131264  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23131263 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 23131164  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23131163 acagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 23131080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23133829 - 23133547
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23133829 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaaca 23133731  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23133730 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 23133631  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23133630 acagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 23133547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 24529208 - 24529491
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24529208 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccaaatttaaaatgaaaacttgtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaaca 24529307  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  || ||||||    
T  24529308 caaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagcacttgagatatggtgaaattactaaacgtaggtc 24529407  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24529408 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24529491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 34402184 - 34402466
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34402184 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaaca 34402282  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  34402283 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 34402382  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  34402383 acagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 34402466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38967968 - 38967697
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  38967968 gaatttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtag 38967869  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || ||| |||||||||     
T  38967868 atatggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaataat 38967769  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38967768 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgttgaagt 38967697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Original strand, 21154681 - 21154950
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21154681 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtag 21154780  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  21154781 gtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataat 21154880  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| || |||||||||    
T  21154881 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttataattgatgaa 21154950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 274
Target Start/End: Original strand, 45027581 - 45027840
Alignment:
Q  14 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45027581 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggta 45027680  T
Q  114 tggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactga 213  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  45027681 tgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaattatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattga 45027780  T
Q  214 atatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  45027781 atatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgatt 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 23709206 - 23709476
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709206 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 23709305  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||     
T  23709306 gtatgaatgttagctttctaatgcagttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaat 23709405  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23709406 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23709476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 41523734 - 41524015
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41523734 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtgtaaaca 41523833  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41523834 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 41523933  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  41523934 atagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 41524015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 32214607 - 32214865
Alignment:
Q  14 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggta 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214607 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggta 32214706  T
Q  114 tggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactga 213  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  32214707 tggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattga 32214806  T
Q  214 atatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||          ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32214807 atatgattgatgaatta----------gtatatgtttgtgtatacgatattgttcatgattgatgaagt 32214865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26505879 - 26505597
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26505879 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaaca 26505780  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26505779 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 26505680  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  26505679 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 26505597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26508357 - 26508075
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508357 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 26508258  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26508257 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 26508158  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  26508157 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 26508075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 24897869 - 24898139
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24897869 gaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtag 24897968  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  24897969 gtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataat 24898068  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24898069 tgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24898139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 24905306 - 24905576
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24905306 gaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtag 24905405  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  24905406 gtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataat 24905505  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24905506 tgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24905576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Original strand, 10684436 - 10684706
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10684436 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtag 10684535  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||     
T  10684536 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaat 10684635  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaag 281  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  10684636 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaag 10684706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 24900352 - 24900622
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24900352 gaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtag 24900451  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  24900452 gtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataat 24900551  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24900552 tgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24900622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 24902829 - 24903099
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24902829 gaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtag 24902928  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  24902929 gtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataat 24903028  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24903029 tgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24903099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 24907781 - 24908051
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  24907781 gaatttttatgaatttcagcacaactttatccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtag 24907880  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  24907881 gtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataat 24907980  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24907981 tgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24908051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6726536 - 6726267
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6726536 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataagtggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 6726437  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  6726436 gtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataat 6726337  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  6726336 tgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 6726267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 32039160 - 32039442
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32039160 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaaggattggtcttaggtgtaaaca 32039259  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  32039260 cgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 32039359  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||||||||    
T  32039360 acagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatctgatattgtccatgatcgatgaagt 32039442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23136068 - 23135841
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23136068 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23135969  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  23135968 gtataaatgttagctttctaatcccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 23135869  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135868 tgaatatgattgatgaattagtatatgt 23135841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 41523541 - 41523749
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523541 gtaggtcacagtaaatttttatgaatttcagcacaactttgtacgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 41523640  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41523641 cgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 41523740  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    | |||||||    
T  41523741 acagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23931947 - 23931775
Alignment:
Q  13 atttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23931947 atttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggt 23931848  T
Q  113 atggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 185  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23931847 attgatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 21154476 - 21154684
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  21154476 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcagaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgttatagaattggtcctaggtgtaaaca 21154575  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  21154576 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaatttgagttacggtcaaattactgcacgtagatc 21154675  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    | |||||||    
T  21154676 acagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Original strand, 23709013 - 23709209
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  23709013 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggcacagaattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtag 23709112  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23709113 gtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22106117 - 22105951
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22106117 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 22106018  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  22106017 tctgatgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25616580 - 25616399
Alignment:
Q  101 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||     
T  25616580 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtcac 25616481  T
Q  201 agtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25616480 aatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25616399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 23706687 - 23706878
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706687 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacttt-tccgaatttgaaatgaaaacggctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 23706785  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 191  Q
    | |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706786 cgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacgtcaaaacgaattatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 23706878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 24529057 - 24529223
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24529057 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccttaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 24529156  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  24529157 tatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24918790 - 24918626
Alignment:
Q  43 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||     
T  24918790 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtc 24918691  T
Q  143 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24918690 tgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6726699 - 6726533
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6726699 ccgaatttgaaatgaaatctcatattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 6726600  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6726599 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24682096 - 24681930
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |    
T  24682096 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttag 24681997  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24681996 tctgacatcaaaaagatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 41523390 - 41523548
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41523390 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccataattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 41523489  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41523490 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 41523548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23932110 - 23931949
Alignment:
Q  43 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  23932110 gaatttgaaatgaaagctggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtc 23932011  T
Q  143 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtg 204  Q
    |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||    
T  23932010 tgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 23706536 - 23706702
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23706536 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttgg 23706635  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||  |  || |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  23706636 ttctatgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24368478 - 24368312
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24368478 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 24368379  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||  || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24368378 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 205
Target Start/End: Original strand, 32214440 - 32214604
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  32214440 ccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgc 32214539  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtga 205  Q
    | |||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  32214540 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttaagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 21154325 - 21154483
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21154325 ccgaatttgaaatgaaatctagtattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 21154424  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    | |||  || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  21154425 tctgatgtcaaaatgatttatagaacttgacttttagtcaaattactgcacgtaggtca 21154483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24671677 - 24671519
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||      
T  24671677 ccgaatttggaatgaaatctggtattgatatgtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccattta 24671578  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    |||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24671577 tttgacatcaaaaatatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24671519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 205
Target Start/End: Original strand, 45027418 - 45027579
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |    
T  45027418 aatttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtct 45027517  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtga 205  Q
    ||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  45027518 gacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 31345667 - 31345570
Alignment:
Q  12 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31345667 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31345570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900815
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16900815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994206
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16994206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823750
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 67410 - 67339
Alignment:
Q  116 gatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  67410 gatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6726213
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 6726213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 24686597 - 24686707
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24686597 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatg 24686696  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  24686697 atcaaattact 24686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 282
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21155004
Alignment:
Q  219 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 21155004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105631
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 22105631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707266
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23707266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24367992
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 24367992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642798
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtacatgattgatgaagt 24642798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681557
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24681557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967592
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 38967592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 19887274 - 19887384
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19887274 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 19887373  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  19887374 attaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27261402 - 27261332
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  27261402 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatgatcaaattact 27261332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12727780 - 12727711
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12727780 tgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12727711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671138
Alignment:
Q  218 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24671138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  142 ttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 206  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918253
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 24918253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 11232212 - 11232322
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11232212 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 11232311  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  11232312 atcaaattact 11232322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 22514059 - 22514169
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22514059 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 22514158  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  22514159 atcaaattact 22514169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 28776661 - 28776771
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28776661 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 28776760  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  28776761 atcaaattact 28776771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 159
Target Start/End: Original strand, 34135071 - 34135129
Alignment:
Q  101 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgattt 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||    
T  34135071 aaagttgtaggtatggaagttagctttctaattgctttggtttgacttccatatgattt 34135129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21368439 - 21368375
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||    
T  21368439 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 21368375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22274090 - 22274022
Alignment:
Q  119 gttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  22274090 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 22274022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  155 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 215 - 259
Target Start/End: Original strand, 41524003 - 41524046
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatact 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41524003 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatact 41524046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 133
Target Start/End: Original strand, 44584588 - 44584632
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44584588 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6483195 - 6483113
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgattt 159  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  6483195 gaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgattt 6483113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18809546 - 18809428
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  18809546 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18809447  T
Q  189 cacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  18809446 cacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22283323 - 22283255
Alignment:
Q  119 gttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22283323 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaatacttgagttatgatcaaattact 22283255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23799531 - 23799467
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || || |||||||||||||||    
T  23799531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaa 23799467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131347
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Original strand, 23711651 - 23711690
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23711651 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26505903 - 26505864
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26505903 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26508381 - 26508342
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26508381 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Original strand, 27920402 - 27920441
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27920402 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Original strand, 32039136 - 32039175
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32039136 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402199
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 5889314 - 5889364
Alignment:
Q  137 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  5889314 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 5889364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6486662 - 6486580
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgattt 159  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||    
T  6486662 gaattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 6486580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 207
Target Start/End: Original strand, 23708980 - 23709016
Alignment:
Q  171 gttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23708980 gttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaat 23709016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24788086 - 24788042
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 133  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24788086 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttatctttccaatg 24788042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 90)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 24485717 - 24485988
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24485717 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtag 24485816  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  24485817 gtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 24485916  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24485917 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 24485988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 27472078 - 27472362
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27472078 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagctgtaaaca 27472177  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27472178 cgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 27472277  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 283  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27472278 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtt 27472362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 16412977 - 16413260
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16412977 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaaca 16413076  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  16413077 cgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtagatc 16413176  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16413177 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 16413260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32122229 - 32121946
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32122229 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgtaaactgatattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaaca 32122130  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32122129 cgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 32122030  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32122029 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 32121946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 38549666 - 38549947
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38549666 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcatcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtaaagaattggtcttaggtataaaca 38549765  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  38549766 caaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtatgtc 38549865  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38549866 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 38549947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15071061 - 15070777
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15071061 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaaca 15070962  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15070961 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttaaaaatgatttatacaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 15070862  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 283  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15070861 atagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtt 15070777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1484902 - 1484620
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484902 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 1484803  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1484802 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 1484703  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1484702 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 1484620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 14409106 - 14409388
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409106 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 14409205  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14409206 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 14409305  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14409306 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 14409388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 5852954 - 5853236
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5852954 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 5853053  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5853054 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 5853153  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5853154 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 5853236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24049098 - 24048841
Alignment:
Q  12 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049098 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagg 24048999  T
Q  112 tatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataact 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  24048998 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataatt 24048900  T
Q  212 gaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24048899 gaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16198379 - 16198115
Alignment:
Q  15 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16198379 ttttatgaatttcaccacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 16198280  T
Q  115 ggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaa 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  16198279 ggatattagctttctaatgccgttggtttgactttaaaaatatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaa 16198180  T
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16198179 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 18677738 - 18678009
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18677738 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtag 18677837  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  18677838 gtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 18677937  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18677938 tgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgtgaatacgatattatccatgattgatgaagt 18678009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14824275 - 14823993
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14824275 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaaca 14824176  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14824175 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 14824076  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  14824075 acagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattatccatgattgatgaagt 14823993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 16401598 - 16401869
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16401598 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 16401697  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||| |||||||||     
T  16401698 gtattgatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatagtcagattacagcaggtaggtcacagtgaataat 16401797  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401798 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 16401869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 4542047 - 4542317
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4542047 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 4542146  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||     
T  4542147 gtataaatgttagctttctaatgccgttcgcttgacttcaaaatgatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataat 4542246  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4542247 tgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 4542317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4483780 - 4483498
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4483780 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggtataaaca 4483682  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4483681 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 4483582  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  4483581 acactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 4483498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 15202840 - 15203121
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202840 gtaggtcacagtgaatatttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 15202939  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15202940 caaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 15203039  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||  || || || ||||||||||||    
T  15203040 acagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttatttatgattgatgaa 15203121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 20045857 - 20046139
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045857 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 20045956  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  20045957 cgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcatgtaggtc 20046056  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  20046057 atagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagt 20046139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22002241 - 22001971
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22002241 gaatttgtatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtag 22002142  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | | |||||||     
T  22002141 gtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaataat 22002042  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22002041 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 22001971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20403780 - 20403499
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20403780 gtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaaca 20403681  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||    
T  20403680 cgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttgaaaaggatttatagaacttgagttattgtcatattactgcgcgtaggtc 20403581  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  20403580 acagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20403499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 19936569 - 19936842
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936569 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 19936668  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19936669 cgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaggtatagtcaaattactgcacgtaggtc 19936768  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||  ||||||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19936769 acagtgaataattgtttatgattgatgaatta----------gtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgatgaagt 19936842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19896822 - 19896541
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19896822 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaaca 19896723  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||| ||||||||||| || ||| |||||||  | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19896722 cgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 19896623  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  19896622 acagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 19896541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Original strand, 1326635 - 1326876
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  1326635 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttgg 1326734  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 240  Q
    | |||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326735 tctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 1326834  T
Q  241 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1326835 gtacatgtttgtaaatacgatattgtttatgattgatgaagt 1326876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19897015 - 19896807
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19897015 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaaca 19896916  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19896915 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcaagtaggtc 19896816  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    | |||||||    
T  19896815 acagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 14397419 - 14397609
Alignment:
Q  16 tttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14397419 tttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatg 14397518  T
Q  116 gatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 206  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14397519 aatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 15202647 - 15202856
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202647 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaacgttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 15202746  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15202747 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 15202846  T
Q  199 agagtgaata 208  Q
    | ||||||||    
T  15202847 acagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Original strand, 38549485 - 38549681
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  38549485 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgtag 38549584  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38549585 gtatggatgttagctttttaattccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 77 - 279
Target Start/End: Original strand, 25657892 - 25658094
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25657892 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 25657991  T
Q  177 gtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattga 276  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25657992 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattga 25658091  T
Q  277 tga 279  Q
    |||    
T  25658092 tga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 45290209 - 45290389
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45290209 gtaggtcacagttaatttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaaca 45290308  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45290309 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 16401201 - 16401408
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16401201 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggt-ttaggtgtaaaca 16401299  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16401300 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtaggtc 16401399  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    | |||||||    
T  16401400 acagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16401393 - 16401585
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16401393 gtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcaatacaactttgtcagaatttgaaatgcaaactggtattgattggtacgtaattggtcttaggtgtaaaca 16401492  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 191  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16401493 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcac 16401585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 280
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290584
Alignment:
Q  81 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtca 180  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  181 aattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 45290584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20403931 - 20403765
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20403931 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgg 20403832  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20403831 tctgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 27471927 - 27472093
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27471927 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 27472026  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27472027 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32122380 - 32122214
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32122380 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 32122281  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32122280 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Original strand, 38549323 - 38549478
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38549323 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 38549422  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctagg 196  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38549423 tatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 38549478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 15202496 - 15202654
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15202496 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgatagatccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttgg 15202595  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15202596 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 15202654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15071212 - 15071046
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15071212 ccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtaaagaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 15071113  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  15071112 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Original strand, 16412827 - 16412992
Alignment:
Q  42 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggt 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16412827 cgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggt 16412926  T
Q  142 ttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
     |||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||    
T  16412927 ctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24049262 - 24049104
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24049262 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 24049163  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    | |||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24049162 tctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19897166 - 19897008
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  19897166 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttgg 19897067  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19897066 tctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 19897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 19936418 - 19936576
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  19936418 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttgg 19936517  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    | || | |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19936518 tctggcgttaaaacgatttatagaacttgagttatgctcaaattactgcacgtaggtca 19936576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11361168 - 11361024
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  11361168 ccgaatttgaaatgaaatctagtattgataggtgcataattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttgg 11361069  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 185  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  11361068 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatagttaaatta 11361024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 32810355 - 32810262
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatga 134  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32810355 ccgaatttgaaatgaaatctaatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatga 32810262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425403
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 13425403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982565
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 20982565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982671
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20982671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550055
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 38550055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 15319988 - 15320098
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15319988 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15320087  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  15320088 atcaaattact 15320098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 15500357 - 15500467
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15500357 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 15500456  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  15500457 atcaaattact 15500467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425297
Alignment:
Q  226 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 13425297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403445
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20403445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810149
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 32810149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290638
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 45290638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 24717722 - 24717820
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24717722 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 24717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 22007126 - 22007195
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22007126 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1326981
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 1326981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896487
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19896487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Original strand, 17150655 - 17150725
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  17150655 atgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 17150725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19936947
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19936947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 280
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16401972
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaa 16401972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203175
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaataagatattatccatgattgatgaagt 15203175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 223304 - 223414
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  223304 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 223403  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  223404 attaaattact 223414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 272163 - 272273
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  272163 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 272262  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  272263 atcaaattact 272273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 643686 - 643576
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  643686 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 643587  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  643586 atcaaattact 643576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 688075 - 688185
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  688075 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 688174  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  688175 attaaattact 688185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 736927 - 737037
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  736927 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 737026  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  737027 attaaattact 737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 829492 - 829382
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  829492 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 829393  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  829392 atcaaattact 829382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 860822 - 860932
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  860822 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 860921  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  860922 attaaattact 860932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Original strand, 22089412 - 22089482
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22089412 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatgatcaaattact 22089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39114485 - 39114415
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39114485 atgttagttttctaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcagattact 39114415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18612002 - 18611952
Alignment:
Q  137 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18612002 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18611952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18618899 - 18618830
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  18618899 tgttagctttctaatggctttggtttgccgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18618830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22147046 - 22146977
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||  || | |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22147046 tgttagctttcttttggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22146977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513644
Alignment:
Q  219 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagt 21513644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 159
Target Start/End: Original strand, 24678771 - 24678838
Alignment:
Q  92 gtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgattt 159  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  24678771 gtaaacatgaaagttgtaggtatggaagttaaatttctaatgaatttggtttgacttccatatgattt 24678838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1485005 - 1484887
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  1485005 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 1484906  T
Q  189 cacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  1484905 cacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Original strand, 18815609 - 18815675
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18815609 atgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagt 18815675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 207
Target Start/End: Original strand, 20045783 - 20045872
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20045783 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38988804 - 38988740
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  38988804 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaa 38988740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 39019901 - 39019837
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  39019901 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaa 39019837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Original strand, 5852930 - 5852969
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5852930 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Original strand, 14409082 - 14409121
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14409082 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19866540 - 19866454
Alignment:
Q  101 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||  |||| ||||||| ||||  || ||||||||| ||| ||||    
T  19866540 aaagttgtaggtatgaaagttagatttctaatggctttggtttgagctccatatgatttttagatttttagttatggtgaaaatact 19866454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Original strand, 36733302 - 36733368
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||  || || |||||||||||||||||    
T  36733302 atgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagt 36733368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 280
Target Start/End: Original strand, 5083001 - 5083058
Alignment:
Q  223 atgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||    
T  5083001 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 5083058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 19936829 - 19936893
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  19936829 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttcatgattgatgaa 19936893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 38549936 - 38550000
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  38549936 atgattgatgaatttttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38550000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 17516837 - 17517108
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17516837 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 17516936  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  17516937 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 17517036  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17517037 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 17517108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 2154305 - 2154576
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154305 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtag 2154404  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  2154405 gtatgaatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 2154504  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2154505 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatactgtccatgattgatgaagt 2154576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 20901582 - 20901865
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901582 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 20901681  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20901682 tgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 20901781  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20901782 actgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 20901865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20909512 - 20909230
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20909512 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaaca 20909413  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20909412 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 20909313  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20909312 agagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20909230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 264430 - 264712
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264430 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaaccttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 264529  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  264530 caaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 264629  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  264630 acagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 264712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23065014 - 23064730
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23065014 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatataaaca 23064915  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23064914 cgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 23064815  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 283  Q
    | ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23064814 acagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtt 23064730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29346468 - 29346198
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29346468 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 29346369  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29346368 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataat 29346269  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29346268 tgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29346198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38619936 - 38619653
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38619936 gtaggtcacaatgaaattttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaaca 38619838  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  38619837 cgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 38619738  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 283  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38619737 acagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtt 38619653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39363884 - 39363602
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39363884 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaaca 39363786  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  39363785 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 39363686  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  39363685 acactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 39363602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 10732614 - 10732884
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10732614 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 10732713  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||     
T  10732714 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataat 10732813  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  10732814 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgattttgtccatgattgatgaagt 10732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29348941 - 29348671
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348941 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 29348842  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29348841 gtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataat 29348742  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29348741 tgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29348671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29351414 - 29351144
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29351414 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 29351315  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29351314 gtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataat 29351215  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29351214 tgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29351144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 20917508 - 20917789
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917508 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaattcgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 20917607  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  20917608 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaagtc 20917707  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  20917708 acggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20917789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32027934 - 32027665
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32027934 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtag 32027835  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  32027834 gtatgaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataat 32027735  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  32027734 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 32027665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39245636 - 39245354
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39245636 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttgagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtaaaca 39245537  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||    
T  39245536 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatagttaaattactgcacgtaggtc 39245437  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39245436 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 39245354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 42245039 - 42245309
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42245039 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 42245138  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  42245139 gtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 42245238  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42245239 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 42245309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Original strand, 37804576 - 37804846
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37804576 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcataatttgaaatgaaaactggcattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 37804675  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||     
T  37804676 gtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaat 37804775  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaag 281  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  37804776 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattaatgaag 37804846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29330471 - 29330203
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29330471 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 29330372  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| ||     
T  29330371 gtatgaatgttagctttctaatgctgttggtttgatttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aat 29330273  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||  || ||||| ||||||||||||    
T  29330272 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttacgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29330203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 295936 - 296136
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  295936 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtataca 296035  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  296036 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 296135  T
Q  199 a 199  Q
    |    
T  296136 a 296136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32028333 - 32028124
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  32028333 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaaca 32028234  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg-tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggt 197  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32028233 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 32028134  T
Q  198 cagagtgaat 207  Q
    || |||||||    
T  32028133 catagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 17516632 - 17516840
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17516632 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgatttttaaatgaaaaatggtattgattggcacagaattggtcctaggtgtaaaca 17516731  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  17516732 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatcgtcgaattactgcacataggtc 17516831  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    | |||||||    
T  17516832 acagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32028127 - 32027947
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  32028127 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtat 32028028  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 191  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||  ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32028027 ttatggatgttagctttctaatgccattggtcggacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcac 32027947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32028514 - 32028326
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  32028514 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtag 32028415  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    ||||  |||||||||||||| ||  |||||| |||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028414 gtatatatgttagctttctagtgctgttggtctgacgtcaaaacaatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 32028326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 17516481 - 17516647
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17516481 ccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 17516580  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17516581 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 20901431 - 20901597
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20901431 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttgg 20901530  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20901531 tctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29330634 - 29330468
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29330634 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttgg 29330535  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  29330534 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 77 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 9776781 - 9776577
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9776781 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatg 9776682  T
Q  177 gtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattga 276  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||     
T  9776681 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgg 9776582  T
Q  277 tgaag 281  Q
    |||||    
T  9776581 tgaag 9776577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32028675 - 32028511
Alignment:
Q  43 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  32028675 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtc 32028576  T
Q  143 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32028575 tgacatcaaaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 2154145 - 2154292
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  2154145 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtct 2154244  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 191  Q
    ||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2154245 gacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcac 2154292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 295785 - 295951
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || | |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  295785 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataagtccggaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttga 295884  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  295885 tctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 20917357 - 20917515
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  20917357 ccgaatttgaaatgaaatcaggtattgataggtccataattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctgg 20917456  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    | |||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20917457 tctgacgtcaaaatcatttataaaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 20917515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20901971
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20901971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 22883903 - 22884013
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22883903 gaattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatg 22884002  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  22884003 atcaaattact 22884013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Original strand, 27183208 - 27183278
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27183208 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29330149
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29330149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027611
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 32027611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 43444008 - 43444118
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43444008 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 43444107  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  43444108 attaaattact 43444118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220453
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23511223 - 23511127
Alignment:
Q  91 tgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23511223 tgtaaacataaaagttttaggtaattaagttagctttttaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 23511127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20917896
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagt 20917896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12013 - 11903
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12013 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 11914  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  11913 attaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23506573 - 23506503
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23506573 atgttagttttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgtgttatgatcaaattact 23506503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25426287 - 25426177
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25426287 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 25426188  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  25426187 attaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7424987 - 7424879
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7424987 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 7424888  T
Q  177 gtcaaatta 185  Q
     ||||||||    
T  7424887 atcaaatta 7424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11342300 - 11342190
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    |||||||| ||  |||||||||  |||||||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11342300 gaattggtttttcgtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 11342201  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  11342200 attaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 21933242 - 21933352
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21933242 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 21933341  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  21933342 atcaaattact 21933352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 21939412 - 21939522
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21939412 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 21939511  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  21939512 atcaaattact 21939522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 22367094 - 22367204
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||    
T  22367094 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaaaacttgagatatg 22367193  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  22367194 attaaattact 22367204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35581450 - 35581340
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35581450 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 35581351  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  35581350 atcaaattact 35581340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 36990638 - 36990748
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36990638 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 36990737  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  36990738 atcaaattact 36990748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 1168832 - 1168901
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  1168832 tgttagctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttttggacttgagttatgatcaaattact 1168901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 11212734 - 11212803
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11212734 tgttagctttcttatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11212803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 215 - 280
Target Start/End: Original strand, 20917777 - 20917842
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  20917777 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtattatgttgtttatgattgatgaa 20917842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 21074249 - 21074318
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21074249 tgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 18778605 - 18778715
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18778605 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttctaatggctttggttttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 18778704  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  18778705 attaaattact 18778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32950283 - 32950213
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  32950283 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaatgtgagttatgatcaaattact 32950213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 35791736 - 35791834
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  35791736 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgttcaaataatttttagaacttgagatatgattaaattact 35791834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743973
Alignment:
Q  219 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagt 18743973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19499526 - 19499428
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  19499526 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatagctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagatatgattaaattact 19499428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28901555 - 28901495
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggt 178  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  28901555 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28901495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28937950 - 28937890
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggt 178  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  28937950 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28937890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Original strand, 264406 - 264445
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  264406 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20909536 - 20909497
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20909536 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245621
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363869
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Original strand, 1628169 - 1628235
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  1628169 atgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagt 1628235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 280
Target Start/End: Original strand, 21399896 - 21399958
Alignment:
Q  218 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  21399896 gattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaa 21399958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 127
Target Start/End: Original strand, 23280293 - 23280331
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagcttt 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23280293 ggtgtaaacacaaaagttgtagatattgatgttagcttt 23280331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24067323 - 24067282
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaata 257  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24067323 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtttatgaata 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1078 - 806
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1078 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagcattcgtcttaggagtaaacacgaaagttgtag 979  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  978 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaattatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataat 879  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  878 tgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1224 - 1075
Alignment:
Q  58 actggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgat 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| |||    
T  1224 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagat 1125  T
Q  158 ttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  1124 ttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1360 - 1225
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1360 ccgaatttgaaatgaaatctcatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttgg 1262  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatgg 177  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1261 tctgacgtctaaacgatttatagaacttgagttatgg 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 702
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 3964 - 4247
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3964 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaaca 4063  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4064 tgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtc 4163  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4164 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgtccatgattgatgaagt 4247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 3771 - 3979
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3771 gtaggtcacagttaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtggaaaca 3870  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||  || ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3871 cgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaacgatttatgaaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtc 3970  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    | |||||||    
T  3971 acagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Original strand, 3590 - 3778
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  3590 gaatttttatgaatttcaacacaagtttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtag 3689  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  3690 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgaggtcaaaacgatttatgtaacttgagttatgctcaaattactgaacgtaggtca 3778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 199
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3585
Alignment:
Q  155 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtca 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 99)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 46822762 - 46822479
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  46822762 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgattttgaaatgaaaagtggtattgattggtaaacaattggtcttaggtgtaaaca 46822663  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46822662 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 46822563  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  46822562 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 46822479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 7781020 - 7781291
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781020 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 7781119  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  7781120 gtataaacgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaataat 7781219  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7781220 tgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 7781291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17463678 - 17463396
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463678 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 17463579  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17463578 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 17463479  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17463478 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 17463396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34159826 - 34159544
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159826 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 34159727  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34159726 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 34159627  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34159626 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 34159544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 45606580 - 45606851
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45606580 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 45606679  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||     
T  45606680 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataat 45606779  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45606780 tgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 45606851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 53301177 - 53301448
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53301177 gaatttttatgaatttcagcacaactttgaccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 53301276  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  53301277 gtatggatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataat 53301376  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  53301377 tgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagt 53301448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13436788 - 13436520
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  13436788 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaacttgtattgattggtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgtag 13436689  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  13436688 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 13436589  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13436588 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27165753 - 27165470
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27165753 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggggtaaaca 27165654  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  27165653 cgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgaacgtaggtc 27165554  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27165553 acagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 27165470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15978021 - 15977751
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15978021 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 15977922  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  15977921 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 15977822  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  15977821 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgataaagt 15977751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8500007 - 8499737
Alignment:
Q  13 atttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  8500007 atttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagat 8499908  T
Q  113 atggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactg 212  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||||||| ||    
T  8499907 atggaagttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtgaaattacggaacataggtcacagtgaataattg 8499808  T
Q  213 aatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 283  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  8499807 attatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtt 8499737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10557409 - 10557125
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10557409 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaataattggtcttaggtgtaaaca 10557310  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10557309 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcagattactgcacataggtc 10557210  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 283  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  10557209 actgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgtccatgattgatgaagtt 10557125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 55476991 - 55476709
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476991 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgactggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 55476892  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  55476891 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 55476792  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  55476791 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 55476709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 6468808 - 6469078
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  6468808 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggag 6468907  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  6468908 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 6469007  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6469008 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 6469078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 10247397 - 10247667
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10247397 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 10247496  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  10247497 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataat 10247596  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10247597 tgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 10247667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 54521311 - 54521040
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  54521311 gaatttttatggatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgg 54521212  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  54521211 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaat 54521112  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  54521111 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 54521040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15412931 - 15412648
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15412931 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatt-gaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaaca 15412833  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  15412832 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatggtcaaattactgaacgtaggtc 15412733  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 283  Q
    | |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15412732 acagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtt 15412648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 16453957 - 16454225
Alignment:
Q  14 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16453957 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggta 16454056  T
Q  114 tggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaat-gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactg 212  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  16454057 taaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattg 16454156  T
Q  213 aatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16454157 aatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16454225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 13153929 - 13154199
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  13153929 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttag 13154028  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  13154029 gtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataat 13154128  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13154129 tgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 13154199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 38961499 - 38961781
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38961499 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaaca 38961598  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat-gacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggt 197  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38961599 cgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 38961698  T
Q  198 cagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  38961699 cacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38961781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41124440 - 41124159
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124440 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 41124341  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  41124340 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgatttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattattgcacgtaggtc 41124241  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  41124240 acagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 41124159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Original strand, 12119357 - 12119598
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12119357 ccgaatttgaaataaaaactggtattgatcagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgg 12119456  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119457 tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 12119556  T
Q  241 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12119557 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 12119598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Original strand, 17444437 - 17444706
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17444437 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtag 17444536  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||     
T  17444537 gtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttattgaacttgagttatagtcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataat 17444636  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  17444637 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 17444706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 20629865 - 20630078
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629865 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 20629964  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  20629965 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 20630064  T
Q  211 tgaatatgattgat 224  Q
    ||||||||||||||    
T  20630065 tgaatatgattgat 20630078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 16282419 - 16282670
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282419 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 16282518  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16282519 cgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtc 16282618  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 250  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16282619 acaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 16282670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12568023 - 12567778
Alignment:
Q  36 tttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12568023 tttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcc 12567924  T
Q  136 gttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtata 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12567923 gttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtata 12567824  T
Q  236 tgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12567823 tgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 12567778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 13151464 - 13151734
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  13151464 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggaacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttag 13151563  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  13151564 gtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataat 13151663  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||||||||    
T  13151664 tgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgcctgatgaagt 13151734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 28848295 - 28848522
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28848295 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 28848394  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  28848395 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 28848494  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848495 tgaatatgattgatgaattagtatatgt 28848522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13544487 - 13544243
Alignment:
Q  36 tttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  13544487 tttgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcc 13544388  T
Q  136 gttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtata 235  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13544387 gttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaa-tactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtata 13544289  T
Q  236 tgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13544288 tgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 13544243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25237331 - 25237063
Alignment:
Q  12 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25237331 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttgg 25237232  T
Q  112 tatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataact 211  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  25237231 tatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataatt 25237132  T
Q  212 gaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  25237131 gaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 25237063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 29544515 - 29544786
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29544515 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 29544614  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||     
T  29544615 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgatttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaat 29544714  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |  |||||||  ||||||||||||||    
T  29544715 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttgttaaaatgatattgtcaatgattgatgaagt 29544786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24514135 - 24513910
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24514135 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgatagctccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 24514036  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 240  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514035 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtat 24513936  T
Q  241 gtatatgtttgtgaatactatattgt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24513935 gtatatgtttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25229744 - 25229476
Alignment:
Q  12 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25229744 aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttgg 25229645  T
Q  112 tatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataact 211  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||  |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||| |    
T  25229644 tatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacataagtcacagtgaataatt 25229545  T
Q  212 gaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  25229544 gaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 25229476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15465643 - 15465448
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15465643 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 15465544  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15465543 gtatgaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Original strand, 55318977 - 55319173
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55318977 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 55319076  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  55319077 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5223872 - 5223677
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5223872 gaatttttatgaatttcagaacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttatag 5223773  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  5223772 gtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Original strand, 26054938 - 26055133
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26054938 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaaggaaaattggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtag 26055037  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26055038 gtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41124591 - 41124425
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41124591 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 41124492  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41124491 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10379786 - 10379613
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10379786 ccgaatatgaaataaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 10379687  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaa 214  Q
    | |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  10379686 tctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10557560 - 10557394
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10557560 ccgaatttgaaacgaaatatggtattgattggtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 10557461  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10557460 tcggacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 20629702 - 20629868
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20629702 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 20629801  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20629802 tctgacattaaagcgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27165904 - 27165738
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27165904 ccgaatttgaaataaaaactagtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttgg 27165805  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27165804 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8500172 - 8500009
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8500172 ccgaatttgaaataaaaactggtattgatcgatatagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttgg 8500073  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtg 204  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  8500072 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 38961348 - 38961514
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38961348 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 38961447  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  38961448 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 46822913 - 46822755
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46822913 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 46822814  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    | |||| || ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46822813 tctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtca 46822755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 53301014 - 53301180
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  53301014 ccgaatttgaaataaaaacaagtattgatcggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttgg 53301113  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  53301114 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 55318817 - 55318980
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  55318817 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtat 55318916  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  55318917 gacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 196
Target Start/End: Original strand, 13937485 - 13937638
Alignment:
Q  43 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13937485 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggacaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtc 13937584  T
Q  143 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctagg 196  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13937585 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgtgttatggtcaaattactgcacgtagg 13937638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 129 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12305516 - 12305363
Alignment:
Q  129 taatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaat 228  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||    
T  12305516 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaat 12305417  T
Q  229 tagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  12305416 taatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 12305363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15008003 - 15007868
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaa---ctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaa 95  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15008003 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaagtactggtattgattggtacaaaattggttttaggtgtaa 15007904  T
Q  96 acacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 131  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15007903 acacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 17444274 - 17444440
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17444274 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttgg 17444373  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | | || || |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17444374 tctaacgtcaaaacaatttatacaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Original strand, 16358341 - 16358458
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  16358341 gaatttttatgaatttcagcacaattttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttag 16358440  T
Q  111 gtatggatgttagctttc 128  Q
     ||| |||||||||||||    
T  16358441 atatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17393367 - 17393201
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||| |||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  17393367 ccgaatttcaaatgaactcttctattgatcggtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttgg 17393268  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17393267 tttgactccaaaatgatttttagaacattagttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaat 17393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  86 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  186 ctgcacctaggtcagagtgaata 208  Q
    |||||| ||||||| ||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 16282268 - 16282426
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||| |    
T  16282268 ccgaatttaaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttag 16282367  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    | |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16282368 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 16282426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Original strand, 14567430 - 14567561
Alignment:
Q  76 agaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttat 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||||    
T  14567430 agaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttat 14567529  T
Q  176 ggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
     ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  14567530 agtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 36528451 - 36528340
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36528451 gaatatttatgaatttcagcacaacctttcccgaatttgaaatgaaaactggtattgataagtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtag 36528352  T
Q  111 gtatggatgtta 122  Q
    ||||||||||||    
T  36528351 gtatggatgtta 36528340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 12305611 - 12305525
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305611 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 12305525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 208
Target Start/End: Original strand, 3264324 - 3264431
Alignment:
Q  101 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  3264324 aaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcac 3264423  T
Q  201 agtgaata 208  Q
    ||||||||    
T  3264424 agtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 199
Target Start/End: Original strand, 16358238 - 16358336
Alignment:
Q  101 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16358238 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcataggtca 16358336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 14567546 - 14567645
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14567546 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaatgaaaactggtattggtaggtacagaattggcctttggtgtaaaca 14567645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 283
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707552
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtt 9707552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 3264415 - 3264538
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||   ||    
T  3264415 gtaggtcacagtgaatatttatgaatttcagcacaacctttcctgaatttgaaatgaaaattggtattgataagtatagaattgatcttaggtgtcttca 3264514  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgtta 122  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  3264515 cgaaagttgtaggtatggatgtta 3264538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 13937646 - 13937709
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggta 74  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13937646 gaatttttatgaattttagcacaactttgtccgaatttgaaataaaaactggtattgattggta 13937709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25058408 - 25058286
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25058408 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatg 25058309  T
Q  177 gtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
     |||||||||| ||| |||||||    
T  25058308 atcaaattactacacataggtca 25058286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899312
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 8899312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282755
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16282755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444760
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 17444760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38961835
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 38961835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 8899484 - 8899418
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttg 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8899484 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 8899418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Original strand, 51158683 - 51158753
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51158683 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 51158753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 16934851 - 16934920
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934851 tgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 49231837 - 49231768
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49231837 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237009
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41124171 - 41124105
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  41124171 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattggtgaagt 41124105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 14528624 - 14528734
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14528624 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttagaactttagttatg 14528723  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  14528724 attaaattact 14528734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30152518 - 30152450
Alignment:
Q  119 gttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30152518 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11913994
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 11913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 185
Target Start/End: Original strand, 54039167 - 54039234
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 185  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  54039167 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatta 54039234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 1468613 - 1468723
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1468613 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 1468712  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  1468713 atcaaattact 1468723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15008040 - 15007996
Alignment:
Q  155 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15008040 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 15007996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 8269362 - 8269472
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8269362 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatg 8269461  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  8269462 attaaattact 8269472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 8276473 - 8276583
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8276473 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatg 8276572  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  8276573 attaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 10555812 - 10555766
Alignment:
Q  62 gtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10555812 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 10555766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 17956869 - 17956938
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17956869 tgttagctttccaatggctttggtttgacatctaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 17956938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12808615 - 12808505
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||| |||| |  |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12808615 gaattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttagtttcaggtccaaacgatttttagaacttgagatatg 12808516  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  12808515 attaaattact 12808505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14263738 - 14263640
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||   |   ||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14263738 ggtgtaaacattaaatttgtatctatggatgttagctttctttggggtttggtttgactccattatgatttctagaacttgagttatggtcaaattact 14263640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21026182 - 21026092
Alignment:
Q  101 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||  ||  |||||| |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21026182 aaagttgtaggtatggatgttagatttctaatggctttgttttgaagtcataatgatgttcagatcttgagttatgatcaaaatactgcac 21026092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27840569 - 27840459
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| || |||||||  |||||||||| ||    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  27840569 gaattggactttggagtaaacatgaaagttgtagataattttgttagccttctaatgactttggtttgacgtccaaataattattagaacttgagatatg 27840470  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     | ||||||||    
T  27840469 attaaattact 27840459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28557440 - 28557370
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||| |||| | ||| |||||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28557440 atgttagctttcaaatggctttgatttgaagtccaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 28557370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34159929 - 34159811
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  34159929 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 34159830  T
Q  189 cacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  34159829 cacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16820531 - 16820462
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  16820531 tgttagctttctaatggcattggtttggtgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 16820462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25201397 - 25201333
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  25201397 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaa 25201333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17463702 - 17463663
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17463702 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 55477015 - 55476976
Alignment:
Q  168 tgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  55477015 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2281102 - 2281000
Alignment:
Q  85 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 184  Q
    ||||| ||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||| ||| | | |||||||||||||   || |||| || ||||||||||||| | |||||    
T  2281102 cttagttgtaaacatgaaagttttaggtatgtatgttacctttgtaaaggctttggtttgacttcattattatttctataacttgagttatgattaaatt 2281003  T
Q  185 act 187  Q
    |||    
T  2281002 act 2281000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 15025934 - 15025992
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgatt 274  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||    
T  15025934 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44228566 - 44228516
Alignment:
Q  137 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  44228566 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 44228516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17044395 - 17044330
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||   |||||  || ||||||||||||||||||    
T  17044395 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 17044330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6159061 - 6158993
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgat 157  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  6159061 ggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgat 6158993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5195 - 4912
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5195 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttggccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaaca 5096  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  5095 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacagcacgtaggtc 4996  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4995 atagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5346 - 5180
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  5346 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttgg 5247  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5246 tctgacgtcaaaacgatatatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13893 - 13610
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13893 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 13794  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13793 caaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 13694  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13693 acagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 13610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13918 - 13878
Alignment:
Q  167 ttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  13918 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38322 - 38039
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38322 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 38223  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  38222 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtc 38123  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38122 acagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 38039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38425 - 38307
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  38425 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 38326  T
Q  189 cacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  38325 cacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 94911 - 94629
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94911 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 94812  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  94811 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 94712  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  94711 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 94629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 17113 - 17384
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17113 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 17212  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||      
T  17213 gtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagt 17312  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17313 tgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 17384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 16953 - 17116
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16953 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtgttaggggataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtct 17052  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||  || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  17053 gatatcaaaaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtcatagtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 154892 - 154961
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  154892 tgttagctttataatgacgttggtttgaggtccaaatcatttttagaacttgagttatgatcaaattact 154961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 95014 - 94896
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  95014 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 94915  T
Q  189 cacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  94914 cacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 27161248 - 27161529
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27161248 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaacaggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaaca 27161347  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27161348 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 27161447  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  27161448 acaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttatgaataaaatattgttaatgattgatgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13989366 - 13989084
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989366 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 13989267  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13989266 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 13989167  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13989166 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 13989084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21841255 - 21840985
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21841255 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 21841156  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | |||||||||     
T  21841155 gtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataat 21841056  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  21841055 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 21840985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 21922965 - 21923235
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21922965 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 21923064  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  21923065 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 21923164  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21923165 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 21923235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 21474748 - 21475031
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474748 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatatgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 21474847  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  21474848 cgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtc 21474947  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21474948 acagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 21475031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29777241 - 29776960
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  29777241 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaatca 29777142  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29777141 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgggttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 29777042  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  29777041 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29776960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16362407 - 16362136
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16362407 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtag 16362308  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  16362307 gtatggaagttagctttctaatgcggttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataat 16362208  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16362207 ttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgttaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16362136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31612866 - 31612585
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31612866 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaaca 31612767  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  31612766 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 31612667  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||  |||||||| ||||||||||||    
T  31612666 aaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatcagtatgatattgtttatgattgatgaa 31612585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 15859682 - 15859952
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15859682 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtag 15859781  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||     
T  15859782 gtatggatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatacaacttgagttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataat 15859881  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  15859882 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-cttgcgaatacgatattgtccatggttgatgaagt 15859952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 16274929 - 16275201
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16274929 gaatgtttatgaattttagcacaactctgtccgaattggaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 16275028  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaa-tgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataa 209  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16275029 gtatggatgttagctttctaaatgtcattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataa 16275128  T
Q  210 ctgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16275129 ttgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgttcatgattgatgaagt 16275201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29298742 - 29298461
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29298742 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaaca 29298643  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  29298642 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataagtc 29298543  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  29298542 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Original strand, 22122688 - 22122957
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22122688 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtag 22122787  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  22122788 gtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgggttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 22122887  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  22122888 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 22122957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13227352 - 13227129
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  13227352 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttat 13227253  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||     
T  13227252 gtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataat 13227153  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13227152 tgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 23593407 - 23593678
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23593407 gaattttcacgaatttcagcacaactttgtccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtgcataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtag 23593506  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  23593507 gtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaataatttatagaacttgcgttatagttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataat 23593606  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  23593607 tgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagt 23593678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29535540 - 29535317
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  29535540 gaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtat 29535441  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||     
T  29535440 gtatggatgttagctttctagtgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataat 29535341  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29535340 tgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31613059 - 31612851
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31613059 gtaggtcacaatgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaactgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaaca 31612960  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31612959 ctaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 31612860  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    | |||||||    
T  31612859 acagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 44 - 280
Target Start/End: Original strand, 22050543 - 22050779
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  22050543 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtct 22050642  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 243  Q
     |  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22050643 aatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgta 22050742  T
Q  244 tatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  22050743 tatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 22050779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 22122524 - 22122691
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac-aaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttg 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22122524 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttg 22122623  T
Q  140 gtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  22122624 gttttacttcaaaacgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 15859506 - 15859672
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15859506 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 15859605  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15859606 tctgacctcaaaactatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29298893 - 29298727
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  29298893 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgt 29298794  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29298793 tctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29777390 - 29777234
Alignment:
Q  43 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  29777390 gaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtc 29777291  T
Q  143 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29777290 tgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtca 29777234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Original strand, 9044711 - 9044866
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  9044711 aatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtct 9044810  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
     || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9044811 aacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 9044866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16401574 - 16401407
Alignment:
Q  40 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttg 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||    
T  16401574 tccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattg 16401475  T
Q  140 gtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    || | || |  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16401474 gtctaacgtggaaaggatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 16274766 - 16274932
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  16274766 ccgaatttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattgg 16274865  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16274866 tctgacgtcaaaactatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31613210 - 31613052
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  31613210 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggttcataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttgg 31613111  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31613110 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 31613052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40129543 - 40129387
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  40129543 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttgg 40129444  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggt 197  Q
    | || | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40129443 tctggcatcaaaacgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 207
Target Start/End: Original strand, 27161099 - 27161263
Alignment:
Q  43 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 142  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||     
T  27161099 gaatttgaaatggaatatagtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtc 27161198  T
Q  143 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  27161199 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 43543360 - 43543269
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543360 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 10812667 - 10812827
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10812667 gtaggtcacagtgaatttctatgaatttcagcacaactttctccgaatttgaaattaaaactggtattgatcggtactgaattgatcttaggtgtaaaca 10812766  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgattt 159  Q
      ||||| |||| ||    ||||||||||| | || | ||||||||||||  |||||||||    
T  10812767 tgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgcctttggtttgacttagaaatgattt 10812827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16401422 - 16401274
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||  |||||||||    
T  16401422 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacttttcccgaatttgaaatgaaaactggtattggtcggtacaaaattggcatttagtgtaaaca 16401323  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgact 147  Q
      |||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  16401322 tgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgact 16401274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 41372960 - 41372896
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41372960 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtaaagattggtac 41372896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275307
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 16275307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050833
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 22050833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776906
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29776906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31612597 - 31612531
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31612597 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 31612531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  137 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298354
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 29298354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21858662 - 21858592
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21858662 atgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 21858592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 44035830 - 44035928
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  44035830 ggtgtaaacatcaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 44035928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 22122945 - 22123011
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22122945 tatgattgatgaattggtatatgtatgtttatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 22123011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17004019 - 17003909
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17004019 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 17003920  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  17003919 atcaaattact 17003909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161583
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 27161583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 21650910 - 21650979
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||    
T  21650910 tgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaattact 21650979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22366596 - 22366527
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22366596 tgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 93
Target Start/End: Original strand, 43630292 - 43630344
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgt 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43630292 ccgaatttgaaatgaaatatggtattgattggtacagaattggtctcaggtgt 43630344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 187
Target Start/End: Original strand, 18060577 - 18060684
Alignment:
Q  80 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtc 179  Q
    |||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||| |     
T  18060577 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttaaaaacttgagatatgatt 18060676  T
Q  180 aaattact 187  Q
    ||||||||    
T  18060677 aaattact 18060684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29298473 - 29298408
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  29298473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13989469 - 13989351
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 188  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| ||||||||||  ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  13989469 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 13989370  T
Q  189 cacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  13989369 cacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16656002 - 16655942
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggt 178  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  16656002 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 16655942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 7641619 - 7641669
Alignment:
Q  137 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  7641619 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 7641669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 15862081 - 15862150
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||| ||||||||| | | |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  15862081 tgttagttttctaatggcttgggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15862150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22029877 - 22029817
Alignment:
Q  125 tttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 185  Q
    ||||||||| | |||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  22029877 tttctaatggctttggtttgatatacaaatgattttttgaacttgagttatgatcaaatta 22029817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6435 - 6165
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6435 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattcattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 6336  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  6335 gtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 6236  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6235 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 6165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 6)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14436 - 14165
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14436 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtag 14337  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  14336 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataat 14237  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14236 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 14165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 23192 - 23475
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |||||||||||    
T  23192 gtaggtcacagtgaatttgtatgaatttcagcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaaca 23291  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23292 caaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 23391  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23392 acaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 23475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 22881 - 23047
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22881 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttgg 22980  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  22981 tctgacgtcaaaacgatttatagaacatgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 23032 - 23118
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtc 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23032 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttttccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtc 23118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Original strand, 23121 - 23207
Alignment:
Q  121 tagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  23121 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 91
Target Start/End: Original strand, 20714 - 20764
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggt 91  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20714 ccgaattggaaatgaaatctgatattgattggtacagaattggtcttaggt 20764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11778 - 11507
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  11778 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcggaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtag 11679  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  11678 gtatggatgttagctttctattgccgttgggttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataat 11579  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11578 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 11507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 6597 - 6880
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6597 gtaggtcacagtgaattttaatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 6696  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6697 cgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtc 6796  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6797 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatgaagt 6880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 6446 - 6612
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6446 ccgaatttgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttgg 6545  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6546 tctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21237 - 20965
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaat-gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21237 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatagaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgta 21138  T
Q  110 ggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataa 209  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  21137 ggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataa 21038  T
Q  210 ctgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21037 ttgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 20965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30520 - 30237
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30520 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcaacacaactttgtccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaaca 30421  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30420 ttaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttcacttcaaaaggatttgtagtacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 30321  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30320 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 30237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30672 - 30505
Alignment:
Q  40 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  30672 tccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattg 30573  T
Q  140 gtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    || |||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30572 gtgtgacgtcaaaacgatttataaaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30131
Alignment:
Q  217 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 30131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40900 - 40618
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40900 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 40801  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  40800 cgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtc 40701  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40700 agagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 40618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 37969 - 37848
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37969 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatg 37871  T
Q  177 gtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
     |||||||||| ||| |||||||    
T  37870 atcaaattactacacataggtca 37848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40925 - 40885
Alignment:
Q  167 ttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40925 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9730 - 9460
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9730 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 9631  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  9630 gtatgaatgttagctctctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataat 9531  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  9530 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 9460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 708 - 425
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |||||||||||    
T  708 gtaggtcacagtgaatttgtatgaatttcagcacaactttgtccaaatttgaaatgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaaca 609  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  608 caaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 509  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  508 acaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1019 - 853
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1019 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttgg 920  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  919 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 868 - 782
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtc 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  868 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttttccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtc 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 693
Alignment:
Q  121 tagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  779 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6952 - 6682
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6952 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 6853  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6852 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 6753  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 279  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6752 atagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 6682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7103 - 6937
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7103 ccgaatatgaaatgaaaattgctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 7004  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7003 tatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10292 - 10009
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10292 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgactgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagtgttggtcttaggtgtaaaca 10193  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||    
T  10192 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattatttcatgtaggtc 10093  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10092 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 10009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10485 - 10277
Alignment:
Q  1 gtaggtcaca--gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  10485 gtaggtcacaatgaatttttgtgaatttcagcacaactttatctgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtcaaca 10386  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10385 cgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtc 10286  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    | |||||||    
T  10285 acagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10633 - 10478
Alignment:
Q  44 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggttt 143  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  10633 aatttgaactgaaatctggtattgataggtccataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtct 10534  T
Q  144 gacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10533 gacgtcaaaaagatttatagaacttgcgttatggtcaaattactgcatgtaggtca 10478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9936
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9970 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3512 - 3241
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3512 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattgttacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtag 3413  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  3412 gtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaat 3313  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  3312 tgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 3241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 134699 - 134429
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  134699 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtag 134600  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  134599 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 134500  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  134499 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 134429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 137168 - 136898
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  137168 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtag 137069  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  137068 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 136969  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  136968 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 136898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 139637 - 139367
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  139637 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtag 139538  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  139537 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 139438  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  139437 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 139367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 142106 - 141836
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  142106 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtag 142007  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  142006 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 141907  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  141906 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 141836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 144575 - 144305
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  144575 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtag 144476  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  144475 gtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataat 144376  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  144375 tgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 144305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Original strand, 227 - 468
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  227 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 326  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 240  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  327 tttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtat 426  T
Q  241 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  427 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgataaagt 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 507 - 574
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8240 - 7996
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8240 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaaca 8141  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8140 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtc 8041  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 243  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8040 atagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8419 - 8225
Alignment:
Q  13 atttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggt 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8419 atttttatgattttcagcacaactttgtccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagat 8320  T
Q  113 atggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  8319 atggatgttagctttctaatccccttggtttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8584 - 8421
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||    
T  8584 ccgaatttgaaatggaaactggtattgattggtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattgg 8485  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtg 204  Q
    | |||| || ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  8484 tatgacgtcaaaaagatttatacaacttgagttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43240 - 43002
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  43240 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacatttttggtcttaggtgtaaaca 43141  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  43140 cgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagggtttatagaacttgagttatagtcaaattagtgcacgtaggtc 43041  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 237  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43040 acagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 90 - 282
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13571
Alignment:
Q  90 gtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgc 189  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  190 acctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    || ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43391 - 43225
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43391 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgg 43292  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43291 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15413 - 15140
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          |||| |||||||||||||||| ||    
T  15413 gtaggtcacagtgaatgtttatgaatttcagcacaactttgttcgaatttgaaatgaaaactggta----------cagatttggtcttaggtgtaacca 15324  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15323 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtc 15224  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15223 atagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtccatgattgatgaagt 15140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 11001 - 11251
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11001 gtaggtcacagtgaattttcctgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 11100  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11101 cgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagtacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtc 11200  T
Q  199 agagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 249  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11201 acagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 207
Target Start/End: Original strand, 10852 - 11016
Alignment:
Q  43 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 142  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  10852 gaatttgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtc 10951  T
Q  143 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10952 tgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15563 - 15398
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15563 ccgaatttgaaatgaaatctggtattaataggtccagaattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttgg 15465  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15464 tctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 68450 - 68227
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  68450 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtat 68351  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataac 210  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||     
T  68350 gtatggatgttagctttctagtgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataat 68251  T
Q  211 tgaatatgattgatgaattagtat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  68250 tgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18142 - 17947
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18142 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtcagaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 18043  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18042 gtatggatgttagctttctaataccattggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33660 - 33472
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33660 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtctgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 33561  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtca 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33560 gtatggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacgtaaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 33472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 282
Target Start/End: Original strand, 38359 - 38600
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||  ||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38359 ccgaatttgaaataaaaattagtattgatccgtaaagaattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg 38458  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtat 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |  |||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38459 tttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgttcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtat 38558  T
Q  241 gtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38559 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 38600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 7352 - 7558
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7352 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacattgttcgaatttgaaatgaaa-ctggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaaca 7450  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7451 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtc 7550  T
Q  199 agagtgaa 206  Q
    | ||||||    
T  7551 acagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Original strand, 7174 - 7367
Alignment:
Q  14 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggta 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7174 tttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgcaatctggtattgattggtaaagaatatgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggta 7273  T
Q  114 tggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |  |||||| | |||||||| ||||||| |||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  7274 taaatgttatccttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 7544 - 7621
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 76  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7544 gtaggtcacagtgaaattttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaca 7621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 205
Target Start/End: Original strand, 7079 - 7172
Alignment:
Q  112 tatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtga 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7079 tatggatgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 78 - 282
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53816
Alignment:
Q  78 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatgg 177  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  178 tcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgat 277  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgat 53811  T
Q  278 gaagt 282  Q
    |||||    
T  53812 gaagt 53816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 501565 - 501347
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  501565 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaacattgtgcgaatttgaaatgaaaagtgatattgattgttacagaattggtcttatgtgtaaaca 501466  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  501465 cgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtc 501367  T
Q  199 agagtgaataactgaatatg 218  Q
    | ||||||||| ||||||||    
T  501366 acagtgaataattgaatatg 501347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 501716 - 501550
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  501716 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg 501617  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  501616 tctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 501351 - 501305
Alignment:
Q  233 atatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  501351 atatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 501305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 139589 - 139687
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||| ||||  || ||||||||| ||| ||||    
T  139589 ggtgtaaacatgaaagtcgtaggtatgaaagttagctttctaatggctttggtttgagctccatatgatttttagatttttagttatggtgaaaatact 139687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31692 - 31497
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31692 gaatttttatgaatttcatcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 31593  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 206  Q
    ||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31592 gtattaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39817 - 39626
Alignment:
Q  15 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39817 ttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttat 39718  T
Q  115 ggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  39717 ggatgttagctttctaatgccattggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8507 - 8311
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  8507 gaatttttatgaatttcagcacagctttgtccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtatagaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtag 8408  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  8407 gtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Original strand, 19762 - 19957
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19762 gaatttttatgaatttcagcaaaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtag 19861  T
Q  111 gtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  19862 gtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgaattatataacttgagttatcgtcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18589 - 18423
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18589 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattgg 18490  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    | |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  18489 tctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18438 - 18352
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtc 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18438 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggcattgattggtacagaaatggtc 18352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1827 - 1646
Alignment:
Q  101 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  1827 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 1728  T
Q  201 agtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1727 agtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagt 1646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 43 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1904 - 1740
Alignment:
Q  43 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtt 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1904 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtt 1805  T
Q  143 tgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1804 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 1755 - 1634
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1755 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaaca 1656  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgt 120  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  1655 cgaaagttgtaggtatggatgt 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 36860 - 37068
Alignment:
Q  1 gtaggtcacag--aatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaaca 98  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||| | | |||| ||| ||| ||||||||    
T  36860 gtaggtcacagtgaatttttatgaatttcagcacaactttatcaaaatttgaaatgaaaactaatattgattggaaaaaaattagtcatagatgtaaaca 36959  T
Q  99 caaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtc 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  36960 cgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatc 37059  T
Q  199 agagtgaat 207  Q
    | |||||||    
T  37060 atagtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 207
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36875
Alignment:
Q  81 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtca 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  181 aattactgcacctaggtcagagtgaat 207  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 56
Target Start/End: Original strand, 37065 - 37110
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37065 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaa 37110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 116 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 57865 - 57708
Alignment:
Q  116 gatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaat 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||    
T  57865 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaat 57766  T
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgat 273  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  57765 atgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 10991
Alignment:
Q  130 aatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaatt 229  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  230 agtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 10991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 65 - 1
Alignment:
Q  11 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65 gaatttttatgaatttcagcacaactttgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 113475 - 113329
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttgg 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||| ||| | ||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  113475 ccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtgcggatttggcctttgatgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttgg 113376  T
Q  141 tttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  113375 tttgactccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaattact 113329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28186 - 28061
Alignment:
Q  155 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacctaggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28186 gatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatga 28087  T
Q  255 atactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
     ||  || ||||| ||||||||||||    
T  28086 gtatgatgttgtttatgattgatgaa 28061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 28007
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 28007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 122
Target Start/End: Original strand, 75605 - 75689
Alignment:
Q  38 tgtccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtta 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  75605 tgtccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 75689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 203 - 282
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10726
Alignment:
Q  203 tgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 10726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10831
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatactgtccataattgatgaagt 10831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 6195 - 6305
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6195 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatg 6294  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  6295 atcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30580 - 30470
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30580 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 30481  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  30480 atcaaattact 30470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 187
Target Start/End: Original strand, 12489 - 12590
Alignment:
Q  86 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 185  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||   |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12489 ttaggtgttaacctaaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 12588  T
Q  186 ct 187  Q
    ||    
T  12589 ct 12590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 478 - 398
Alignment:
Q  41 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtt 121  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  478 ccgaatttgaaataaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtatggatgtt 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9949
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagt 9949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  217 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatga 279  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8676 - 8566
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  8676 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatg 8577  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  8576 atcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 835 - 725
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  835 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatg 736  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  735 atcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 6970 - 7039
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6970 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15216
Alignment:
Q  215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacaatattgtccatgattgatgaagt 15216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 282
Target Start/End: Original strand, 15032 - 15111
Alignment:
Q  193 taggtcagagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagt 282  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15032 taggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaattagtat----------atgtttgtgaatactatattgttcataattgatgaagt 15111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41259
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 185  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||    
T  41327 atgttagatttctaatggctttggcttgacttccaaattatttttagaacttgcattatgatcaaatta 41259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1375
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1485 gaattggccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatg 1386  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  1385 atcaaattact 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 1267 - 1365
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1267 ggtgtaaacataaaagttttagataattgtgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15846 - 15780
Alignment:
Q  119 gttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 185  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15846 gttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Original strand, 32118 - 32216
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32118 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40726 - 40628
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40726 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 40628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 110064 - 110174
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  110064 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatg 110163  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  110164 atcaaattact 110174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 118565 - 118675
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  118565 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatg 118664  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  118665 atcaaattact 118675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 132
Target Start/End: Original strand, 15910 - 15953
Alignment:
Q  89 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 132  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15910 ggtgtacacataaaagttgtaggtatggaagttagctttctaat 15953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40035 - 39965
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40035 atgtcagctttctaatggctttggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45518 - 45448
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  45518 atgttagctttctaatggctttggttttacttccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 45448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 79073 - 79003
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  79073 atgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 79003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 979 - 912
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatta 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  979 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttataacttgaattatgatcaaatta 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 938 - 868
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  938 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgatttttagaacctgagttatgatcaaattact 868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18315 - 18205
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  18315 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatg 18216  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  18215 atcaaattact 18205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28579 - 28469
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  28579 gaattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatg 28480  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  28479 atcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38485 - 38375
Alignment:
Q  77 gaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatg 176  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38485 gaattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatg 38386  T
Q  177 gtcaaattact 187  Q
     ||||||||||    
T  38385 atcaaattact 38375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 54016 - 53946
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  54016 atgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 53946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Original strand, 19939 - 20009
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19939 atgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 20009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 1219
Alignment:
Q  85 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaatt 184  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  1333 cttagatgtaaacataaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtctcacttcaaaatgttttctaaaacttgatttatggtcaaatt 1234  T
Q  185 actgcacctaggtca 199  Q
    ||| ||| |||||||    
T  1233 actacacataggtca 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 187
Target Start/End: Original strand, 8122 - 8192
Alignment:
Q  117 atgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  8122 atgttagctatctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16263
Alignment:
Q  217 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2009 - 1959
Alignment:
Q  137 ttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2009 ttggtttgacgtccaaattatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 280
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36007
Alignment:
Q  227 attagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaa 36007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 167129 - 167198
Alignment:
Q  118 tgttagctttctaatgacgttggtttgacttccaaatgatttatagaacttgagttatggtcaaattact 187  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  167129 tgttagctttataatgtcgttggtttgaggaccaaattttttttagaacttgagttatgatcaaattact 167198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15361 - 15297
Alignment:
Q  216 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaa 280  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15361 atgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaa 15297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University