View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19760_low_1 (Length: 519)

Name: NF19760_low_1
Description: NF19760
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19760_low_1
NF19760_low_1
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (1-509)||(16743998-16744507)
chr3 (98-466)||(14842487-14842856)
chr3 (98-466)||(12030073-12030443)
chr3 (98-466)||(2049777-2050147)
chr3 (104-392)||(17912483-17912771)
chr3 (88-466)||(13838852-13839232)
chr3 (87-429)||(15858986-15859331)
chr3 (87-402)||(51158008-51158325)
chr3 (330-509)||(19231982-19232164)
chr3 (227-392)||(2449238-2449404)
chr3 (98-385)||(15936634-15936922)
chr3 (98-385)||(15938476-15938764)
chr3 (105-467)||(15614808-15615170)
chr3 (346-466)||(19260749-19260869)
chr3 (11-207)||(15468520-15468717)
chr3 (11-207)||(22275088-22275285)
chr3 (98-392)||(45860773-45861068)
chr3 (98-392)||(13954890-13955185)
chr3 (98-392)||(13975722-13976017)
chr3 (431-509)||(15857120-15857198)
chr3 (434-509)||(3992873-3992948)
chr3 (434-509)||(55513193-55513268)
chr3 (98-380)||(55316187-55316471)
chr3 (90-358)||(16821099-16821369)
chr3 (434-509)||(2844514-2844589)
chr3 (105-240)||(47984624-47984759)
chr3 (105-240)||(48003198-48003333)
chr3 (98-380)||(41270043-41270327)
chr3 (1-72)||(2449391-2449462)
chr3 (105-240)||(47993911-47994046)
chr3 (105-240)||(48012484-48012619)
chr3 (434-509)||(54037981-54038056)
chr3 (434-509)||(17955837-17955916)
chr3 (434-509)||(7854305-7854380)
chr3 (434-495)||(45581954-45582016)
chr3 (450-507)||(17205019-17205076)
chr3 (98-147)||(19231945-19231994)
chr3 (434-507)||(38810868-38810941)
chr3 (452-507)||(12031849-12031904)
chr3 (434-507)||(13301323-13301396)
chr3 (434-507)||(13311979-13312052)
chr3 (335-376)||(14080715-14080756)
chr3 (450-507)||(17191879-17191936)
chr3 (434-466)||(2449152-2449184)
chr3 (434-466)||(16261777-16261809)
chr3 (434-466)||(16933869-16933901)
chr3 (434-466)||(17912398-17912430)
chr3 (11-91)||(18969968-18970048)
chr3 (87-119)||(22144532-22144564)
chr3 (434-466)||(23492696-23492728)
chr3 (434-466)||(38168237-38168269)
chr3 (434-466)||(53771365-53771397)
chr3 (450-507)||(3576290-3576347)
chr3 (127-248)||(12264932-12265053)
chr3 (435-500)||(15550922-15550987)
chr3 (127-242)||(11329098-11329214)
chr3 (434-466)||(11986080-11986112)
chr3 (434-466)||(13954804-13954836)
chr3 (434-466)||(14285289-14285321)
chr3 (434-466)||(19947026-19947058)
chr3 (434-466)||(30153265-30153297)
chr3 (434-466)||(33342204-33342236)
chr3 (434-466)||(45861122-45861154)
chr3 (434-466)||(51961031-51961063)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (1-392)||(22907214-22907606)
chr8 (98-509)||(16404857-16405268)
chr8 (105-466)||(16193643-16194005)
chr8 (98-466)||(43373392-43373761)
chr8 (88-466)||(24928716-24929096)
chr8 (227-392)||(5238184-5238350)
chr8 (227-392)||(24661248-24661414)
chr8 (227-392)||(43685643-43685809)
chr8 (101-392)||(17345540-17345832)
chr8 (105-380)||(24548956-24549233)
chr8 (105-380)||(6774258-6774535)
chr8 (98-358)||(21844594-21844856)
chr8 (98-358)||(21851987-21852249)
chr8 (98-380)||(30120690-30120974)
chr8 (434-509)||(274766-274841)
chr8 (434-509)||(641008-641083)
chr8 (434-509)||(826814-826889)
chr8 (1-72)||(5238126-5238197)
chr8 (1-72)||(24661401-24661472)
chr8 (434-509)||(24716719-24716794)
chr8 (98-317)||(222754-222975)
chr8 (98-317)||(736377-736598)
chr8 (98-317)||(860272-860493)
chr8 (1-72)||(43685585-43685656)
chr8 (102-380)||(16674392-16674672)
chr8 (434-509)||(39115598-39115673)
chr8 (88-242)||(23837154-23837308)
chr8 (87-209)||(41246613-41246735)
chr8 (450-507)||(17285543-17285600)
chr8 (450-507)||(21198005-21198062)
chr8 (11-68)||(22321597-22321654)
chr8 (335-376)||(23226076-23226117)
chr8 (434-466)||(5238404-5238436)
chr8 (434-466)||(22907128-22907160)
chr8 (434-466)||(24385652-24385684)
chr8 (434-466)||(24661162-24661194)
chr8 (434-466)||(43685863-43685895)
chr8 (90-160)||(13662492-13662561)
chr8 (434-466)||(2545265-2545297)
chr8 (434-466)||(3431176-3431208)
chr8 (434-466)||(22886654-22886686)
chr8 (11-91)||(23217924-23218004)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (1-392)||(26680071-26680463)
chr4 (87-509)||(54118125-54118551)
chr4 (87-466)||(13246386-13246769)
chr4 (102-466)||(15675009-15675381)
chr4 (260-466)||(122020-122226)
chr4 (102-466)||(10104170-10104523)
chr4 (227-392)||(10488659-10488825)
chr4 (227-392)||(16327926-16328092)
chr4 (105-365)||(31115603-31115865)
chr4 (98-358)||(10644187-10644449)
chr4 (98-392)||(13048221-13048517)
chr4 (330-466)||(33240901-33241043)
chr4 (98-229)||(111362-111493)
chr4 (98-380)||(47357622-47357906)
chr4 (434-509)||(25119064-25119139)
chr4 (1-72)||(10488601-10488672)
chr4 (16-72)||(16328079-16328135)
chr4 (434-509)||(5682385-5682460)
chr4 (360-466)||(31132545-31132657)
chr4 (434-507)||(41165808-41165881)
chr4 (195-376)||(40885570-40885753)
chr4 (101-176)||(7849970-7850044)
chr4 (98-242)||(15044794-15044938)
chr4 (153-242)||(41166083-41166172)
chr4 (450-507)||(47534933-47534990)
chr4 (434-466)||(14952085-14952117)
chr4 (434-466)||(15135907-15135939)
chr4 (434-466)||(15272211-15272243)
chr4 (434-466)||(16327840-16327872)
chr4 (434-466)||(16609013-16609045)
chr4 (434-466)||(26680517-26680549)
chr4 (87-119)||(44055870-44055902)
chr4 (155-242)||(7185981-7186068)
chr4 (11-72)||(19559410-19559471)
chr4 (434-466)||(8045272-8045304)
chr4 (434-466)||(16523146-16523178)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (1-392)||(7292887-7293279)
chr7 (86-466)||(13036938-13037322)
chr7 (98-507)||(3059933-3060344)
chr7 (98-466)||(16211733-16212103)
chr7 (98-466)||(11580661-11581035)
chr7 (98-466)||(36052634-36053003)
chr7 (105-392)||(47481031-47481320)
chr7 (227-392)||(11516324-11516490)
chr7 (227-392)||(15441564-15441730)
chr7 (227-392)||(30262129-30262295)
chr7 (98-385)||(18253842-18254130)
chr7 (105-391)||(13320988-13321278)
chr7 (101-357)||(16478985-16479244)
chr7 (98-392)||(25292338-25292633)
chr7 (98-358)||(13572644-13572906)
chr7 (98-380)||(10989378-10989661)
chr7 (116-358)||(13911046-13911292)
chr7 (1-72)||(15441717-15441788)
chr7 (1-72)||(30262282-30262353)
chr7 (434-509)||(32493903-32493978)
chr7 (98-358)||(2437425-2437687)
chr7 (434-509)||(126738-126813)
chr7 (1-72)||(11516266-11516337)
chr7 (101-464)||(295893-296257)
chr7 (434-509)||(1936874-1936949)
chr7 (434-509)||(111126-111201)
chr7 (400-507)||(13377819-13377924)
chr7 (435-509)||(7283913-7283987)
chr7 (450-507)||(13389693-13389750)
chr7 (350-392)||(14113989-14114031)
chr7 (350-392)||(14423639-14423681)
chr7 (434-466)||(2029244-2029276)
chr7 (434-466)||(7293333-7293365)
chr7 (434-466)||(11516544-11516576)
chr7 (434-466)||(14113903-14113935)
chr7 (434-466)||(15441478-15441510)
chr7 (397-466)||(15709428-15709501)
chr7 (87-119)||(15822691-15822723)
chr7 (451-507)||(16919870-16919926)
chr7 (434-466)||(30262043-30262075)
chr7 (434-466)||(42056188-42056220)
chr7 (434-466)||(371417-371449)
chr7 (434-466)||(3049905-3049937)
chr7 (434-466)||(13321334-13321366)
chr7 (11-91)||(13351999-13352079)
chr7 (434-462)||(15516765-15516793)
chr7 (87-242)||(17224075-17224230)
chr7 (434-466)||(25124450-25124482)
chr7 (434-466)||(47480944-47480976)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (17-392)||(37066-37442)
scaffold0078 (434-509)||(41632-41707)
scaffold0078 (434-466)||(36980-37012)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (101-509)||(41394191-41394602)
chr1 (98-466)||(20931312-20931682)
chr1 (98-466)||(20445646-20446019)
chr1 (98-466)||(20913004-20913367)
chr1 (98-466)||(20531411-20531783)
chr1 (87-466)||(20893551-20893933)
chr1 (98-466)||(37844374-37844746)
chr1 (227-392)||(51452589-51452755)
chr1 (98-342)||(22227777-22228022)
chr1 (98-342)||(22232474-22232719)
chr1 (105-358)||(2116228-2116484)
chr1 (434-509)||(21860334-21860409)
chr1 (434-508)||(44034829-44034903)
chr1 (1-72)||(51452531-51452602)
chr1 (260-467)||(45051554-45051759)
chr1 (98-358)||(18601140-18601402)
chr1 (105-185)||(45051416-45051496)
chr1 (98-380)||(5072388-5072672)
chr1 (400-507)||(27675086-27675191)
chr1 (434-509)||(41218728-41218803)
chr1 (450-507)||(13376711-13376768)
chr1 (450-507)||(20177513-20177570)
chr1 (434-465)||(15861327-15861358)
chr1 (88-119)||(49967607-49967638)
chr1 (434-466)||(51452809-51452841)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (87-509)||(19794586-19795011)
chr2 (98-466)||(36982364-36982737)
chr2 (98-509)||(20627195-20627609)
chr2 (98-509)||(43642838-43643250)
chr2 (98-466)||(462706-463075)
chr2 (98-466)||(8891209-8891581)
chr2 (102-466)||(24341309-24341681)
chr2 (227-392)||(19689401-19689567)
chr2 (227-392)||(23820168-23820334)
chr2 (227-392)||(14906440-14906606)
chr2 (105-392)||(25265390-25265679)
chr2 (227-392)||(20015108-20015274)
chr2 (101-342)||(7507894-7508138)
chr2 (98-392)||(17396653-17396948)
chr2 (98-380)||(19886661-19886945)
chr2 (372-466)||(22863171-22863267)
chr2 (434-509)||(22275045-22275120)
chr2 (434-509)||(22284278-22284353)
chr2 (435-509)||(15633538-15633612)
chr2 (1-72)||(14906593-14906664)
chr2 (1-72)||(20015050-20015121)
chr2 (1-72)||(23820110-23820181)
chr2 (26-72)||(19689554-19689600)
chr2 (450-507)||(43646232-43646289)
chr2 (434-467)||(19689314-19689347)
chr2 (434-466)||(9652796-9652828)
chr2 (434-466)||(14906354-14906386)
chr2 (455-507)||(19660221-19660273)
chr2 (153-209)||(19669279-19669335)
chr2 (434-466)||(23820388-23820420)
chr2 (434-465)||(25213372-25213403)
chr2 (434-507)||(19666848-19666921)
chr2 (450-507)||(25305769-25305826)
chr2 (400-507)||(31146032-31146138)
chr2 (434-466)||(7507757-7507789)
chr2 (434-466)||(17396567-17396599)
chr2 (434-466)||(20015328-20015360)
chr2 (434-466)||(28031134-28031166)
chr2 (87-119)||(32465813-32465845)
chr2 (434-466)||(33128372-33128404)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (98-466)||(48565-48935)
scaffold0023 (102-358)||(36065-36323)
scaffold0023 (434-466)||(61122-61154)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (98-466)||(1091-1462)
scaffold0266 (98-466)||(3508-3877)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (87-466)||(23153403-23153786)
chr6 (105-465)||(14626045-14626407)
chr6 (98-392)||(35009439-35009735)
chr6 (101-392)||(1657748-1658040)
chr6 (101-392)||(15862443-15862734)
chr6 (105-467)||(1650020-1650382)
chr6 (98-352)||(25175531-25175787)
chr6 (98-380)||(27653983-27654267)
chr6 (397-466)||(23148266-23148335)
chr6 (434-509)||(19983149-19983224)
chr6 (434-509)||(35015014-35015089)
chr6 (98-380)||(16825752-16826038)
chr6 (101-234)||(27740808-27740941)
chr6 (434-509)||(18583640-18583715)
chr6 (87-241)||(18381821-18381975)
chr6 (309-392)||(27751605-27751688)
chr6 (450-507)||(21623506-21623563)
chr6 (450-507)||(22361619-22361676)
chr6 (435-507)||(14152632-14152704)
chr6 (434-466)||(18002395-18002427)
chr6 (434-466)||(23995247-23995279)
chr6 (434-466)||(26090059-26090091)
chr6 (434-465)||(4991396-4991427)
chr6 (112-218)||(22361926-22362032)
chr6 (436-466)||(15742120-15742150)
chr6 (195-392)||(29665937-29666137)
chr6 (11-72)||(15889853-15889914)
chr6 (87-116)||(32898745-32898774)
chr6 (434-466)||(1657661-1657693)
chr6 (434-466)||(15862789-15862821)
chr6 (434-466)||(18823283-18823315)
chr6 (434-466)||(18839138-18839170)
chr6 (127-242)||(25367374-25367490)
chr6 (434-466)||(27751742-27751774)
chr6 (434-466)||(32276659-32276691)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (98-463)||(19173-19543)
scaffold0195 (98-392)||(21257-21553)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (98-467)||(36836-37209)
scaffold0077 (435-509)||(15324-15398)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (98-466)||(23506932-23507302)
chr5 (87-466)||(27182471-27182854)
chr5 (106-466)||(18530988-18531355)
chr5 (102-466)||(22053753-22054125)
chr5 (227-392)||(20623066-20623232)
chr5 (227-392)||(21233528-21233694)
chr5 (230-392)||(37052844-37053007)
chr5 (227-392)||(16536294-16536460)
chr5 (101-392)||(34939248-34939540)
chr5 (227-390)||(25900408-25900571)
chr5 (98-380)||(22366481-22366765)
chr5 (98-380)||(25426596-25426880)
chr5 (98-358)||(18778014-18778276)
chr5 (98-380)||(12342-12626)
chr5 (98-380)||(19499867-19500151)
chr5 (98-380)||(21073595-21073879)
chr5 (117-358)||(4200007-4200251)
chr5 (98-358)||(27009809-27010071)
chr5 (98-358)||(43443417-43443679)
chr5 (88-207)||(17471768-17471887)
chr5 (1-72)||(20623008-20623079)
chr5 (1-72)||(21233681-21233752)
chr5 (105-179)||(29190478-29190552)
chr5 (260-380)||(29188284-29188404)
chr5 (1-72)||(25900558-25900629)
chr5 (1-72)||(37052783-37052854)
chr5 (1-72)||(16536236-16536307)
chr5 (435-509)||(11584374-11584448)
chr5 (109-242)||(19862186-19862319)
chr5 (434-507)||(5450695-5450768)
chr5 (450-507)||(21222462-21222519)
chr5 (98-242)||(23493885-23494029)
chr5 (434-466)||(16105967-16105999)
chr5 (434-466)||(20623286-20623318)
chr5 (434-466)||(21233442-21233474)
chr5 (434-466)||(25900320-25900352)
chr5 (434-466)||(37053061-37053093)
chr5 (434-466)||(108728-108760)
chr5 (434-466)||(9730278-9730310)
chr5 (434-466)||(16536514-16536546)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (87-466)||(41686-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (98-466)||(882-1250)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (98-466)||(128095-128464)
scaffold0008 (117-358)||(31697-31942)
scaffold0008 (91-119)||(22650-22678)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (98-466)||(5990-6358)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (98-466)||(247366-247738)
scaffold0012 (434-466)||(34075-34107)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (98-466)||(12083-12450)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (88-466)||(171863-172242)
scaffold0001 (88-466)||(177566-177945)
scaffold0001 (87-119)||(70882-70914)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (98-466)||(8846-9215)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (98-466)||(123087-123460)
scaffold0011 (87-119)||(255074-255106)
scaffold0011 (87-119)||(261680-261712)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (98-466)||(26340-26710)
scaffold0162 (105-392)||(8180-8466)
scaffold0162 (450-507)||(6877-6934)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (98-456)||(4996-5356)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (102-466)||(8820-9192)
scaffold0025 (98-418)||(148688-149012)
scaffold0025 (372-466)||(146844-146938)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (88-466)||(271983-272362)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (260-464)||(51110-51314)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (98-385)||(48155-48443)
scaffold0049 (435-509)||(20493-20567)
[»] scaffold0141 (6 HSPs)
scaffold0141 (227-392)||(26892-27058)
scaffold0141 (227-385)||(22637-22796)
scaffold0141 (1-72)||(22579-22650)
scaffold0141 (1-72)||(26834-26905)
scaffold0141 (434-466)||(22857-22889)
scaffold0141 (434-466)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (227-392)||(1582-1748)
scaffold0124 (1-72)||(1735-1806)
scaffold0124 (434-466)||(1496-1528)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (260-466)||(89378-89586)
scaffold0028 (341-466)||(107708-107835)
scaffold0028 (127-209)||(79533-79616)
scaffold0028 (434-465)||(130880-130911)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (105-392)||(41622-41911)
scaffold0125 (426-466)||(41957-41997)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (105-392)||(13480-13769)
scaffold0132 (434-509)||(42677-42749)
scaffold0132 (434-466)||(13824-13856)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (98-385)||(107715-108003)
scaffold0026 (98-323)||(64585-64812)
scaffold0026 (335-377)||(89863-89905)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (100-392)||(534-828)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (105-358)||(9371-9626)
scaffold0215 (105-358)||(16269-16524)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (101-392)||(34460-34755)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (105-381)||(2936-3215)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (87-229)||(9338-9480)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (98-357)||(42965-43226)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (260-385)||(5660-5785)
scaffold0772 (434-466)||(5846-5878)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (98-342)||(5254-5498)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (98-342)||(3690-3936)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (98-358)||(3-265)
scaffold0116 (434-509)||(30417-30492)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (98-358)||(14083-14344)
scaffold0139 (98-358)||(21138-21399)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (434-509)||(80187-80262)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (433-509)||(166121-166197)
scaffold0016 (433-508)||(162036-162111)
scaffold0016 (434-507)||(116410-116483)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (434-509)||(31137-31212)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (434-508)||(5735-5809)
scaffold0686 (434-508)||(5941-6015)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (98-220)||(48482-48603)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (98-220)||(26-147)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (260-358)||(13347-13445)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (433-509)||(309-385)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (435-509)||(1701-1775)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (435-509)||(19807-19881)
scaffold0122 (435-509)||(24111-24185)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (260-380)||(1304-1424)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (435-505)||(94-164)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (435-509)||(6261-6335)
scaffold0310 (435-472)||(4-41)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (98-147)||(1815-1863)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (106-175)||(3183-3252)
scaffold0361 (309-392)||(3370-3453)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (127-342)||(54412-54630)
scaffold0066 (127-171)||(45007-45051)
scaffold0066 (434-466)||(45338-45370)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (434-507)||(1363-1436)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (450-507)||(35816-35873)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (87-242)||(76984-77139)
scaffold0053 (450-507)||(76699-76756)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (87-209)||(132420-132542)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (450-507)||(442-499)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (434-467)||(193396-193429)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (434-466)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (434-466)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (434-466)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (434-466)||(13285-13317)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (434-466)||(57392-57424)
scaffold0058 (335-376)||(70307-70348)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (434-466)||(55904-55936)
scaffold0032 (434-466)||(108075-108107)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (423-466)||(18015-18058)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (450-507)||(632-689)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (11-72)||(1028-1089)
scaffold0483 (450-507)||(6999-7056)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (335-376)||(1546-1587)
scaffold0456 (335-376)||(8691-8732)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (87-116)||(7522-7551)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (335-376)||(8216-8257)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (11-72)||(45815-45876)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (267-385)||(56106-56226)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (450-507)||(43651-43708)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (87-116)||(38253-38282)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (450-507)||(31357-31414)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (153-209)||(2476-2532)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (434-466)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (434-466)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (434-466)||(4346-4378)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (434-466)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (434-466)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (434-466)||(34308-34340)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (434-466)||(12418-12450)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16744507 - 16743998
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaattt 100  Q
    |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744507 atgagatcaacatcaactatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaattt 16744408  T
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16744407 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaa 16744308  T
Q  201 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  16744307 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaa 16744208  T
Q  300 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaa 399  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16744207 tgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaa 16744108  T
Q  400 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16744107 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttt 16744008  T
Q  500 agctcctatg 509  Q
    ||||||||||    
T  16744007 agctcctatg 16743998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14842856 - 14842487
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  14842856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 14842758  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||     
T  14842757 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttg 14842658  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14842657 aacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 14842558  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842557 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 14842487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12030443 - 12030073
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
T  12030443 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaacca 12030344  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     | ||||||||| |||||||||| |  |||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||     
T  12030343 tagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttg 12030244  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  12030243 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 12030144  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12030143 caaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataatgattaacccccttacctta 12030073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 2049777 - 2050147
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  2049777 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 2049876  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     | ||||||||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||| | |||||||||     
T  2049877 tagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttg 2049976  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  2049977 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 2050076  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050077 caaaattgatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 2050147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 104 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17912771 - 17912483
Alignment:
Q  104 caaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacat 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||    
T  17912771 caaaacacccacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacat 17912672  T
Q  204 caattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 302  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  17912671 cgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgt 17912572  T
Q  303 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17912571 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatc-aagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 88 - 466
Target Start/End: Original strand, 13838852 - 13839232
Alignment:
Q  88 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 187  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |    
T  13838852 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaa 13838950  T
Q  188 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 285  Q
    ||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||     
T  13838951 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 13839050  T
Q  286 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 385  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13839051 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 13839150  T
Q  386 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13839151 tattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 13839232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 87 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15859331 - 15858986
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 186  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  15859331 caattcaccattttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 15859232  T
Q  187 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcattt 284  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  15859231 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 15859132  T
Q  285 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 384  Q
     | ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15859131 gttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 15859032  T
Q  385 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat 429  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15859031 ttatccattatgcaaaaattcatacaacaattg-aaatttacaaaat 15858986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 51158325 - 51158008
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacacc-aacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 185  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  51158325 caattcacaaattt-agcaaaacacttaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 51158227  T
Q  186 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 283  Q
     |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  51158226 aattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 51158127  T
Q  284 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca 383  Q
    | ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51158126 tttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 51158027  T
Q  384 atcatccataatcaaaatt 402  Q
    || |||||||| |||||||    
T  51158026 attatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 330 - 509
Target Start/End: Original strand, 19231982 - 19232164
Alignment:
Q  330 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattt-acaa 426  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19231982 atcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 19232081  T
Q  427 aatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19232082 aatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg 19232164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449238
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  2449404 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 2449305  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2449304 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15936922 - 15936634
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  15936922 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15936824  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  15936823 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15936724  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 385  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15936723 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15938764 - 15938476
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  15938764 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcagcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15938666  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  15938665 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15938566  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 385  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||||||    
T  15938565 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 467
Target Start/End: Original strand, 15614808 - 15615170
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  15614808 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 15614907  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 302  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| || |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  15614908 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 15615007  T
Q  303 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaat 401  Q
    ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||||||||| |||||  |||  | ||| || | |  |    
T  15615008 aatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattt 15615107  T
Q  402 tcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 467  Q
    |||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15615108 tcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatta-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 15615170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 346 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260749
Alignment:
Q  346 aaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgata 445  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
Q  446 aagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19260769 aagactaacccccttacctta 19260749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15468717 - 15468520
Alignment:
Q  11 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt-cacaaatttcaccaaaac 109  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  15468717 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatacattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaatttcaccaaaac 15468618  T
Q  110 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
T  15468617 aacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 15468520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Original strand, 22275088 - 22275285
Alignment:
Q  11 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttc-ctcaattcacaaatttcaccaaaac 109  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||  |||||||||||| | ||||| ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  22275088 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcactaatttcacaaatttcaccaaaac 22275187  T
Q  110 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
T  22275188 accaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 22275285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 45860773 - 45861068
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  45860773 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 45860871  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  45860872 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 45860971  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45860972 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13955185 - 13954890
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  13955185 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 13955087  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||    
T  13955086 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttattt 13954987  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13954986 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13976017 - 13975722
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  13976017 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 13975919  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  13975918 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 13975819  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13975818 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857120
Alignment:
Q  431 atgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatg 15857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992948
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3992873 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 3992948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513268
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  55513193 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 55513268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Original strand, 55316187 - 55316471
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  55316187 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 55316285  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  55316286 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 55316385  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  55316386 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 358
Target Start/End: Original strand, 16821099 - 16821369
Alignment:
Q  90 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctatt 189  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |  || ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | |    
T  16821099 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttat-ttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaat 16821197  T
Q  190 agcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttct 286  Q
    | |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  ||||| |||  ||||| |    
T  16821198 aacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattttt 16821297  T
Q  287 acatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16821298 acatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatca 16821369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844589
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2844514 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 2844589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 47984624 - 47984759
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
T  47984624 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 47984723  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 240  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  47984724 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47984759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 48003198 - 48003333
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
T  48003198 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 48003297  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 240  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  48003298 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48003333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Original strand, 41270043 - 41270327
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  41270043 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 41270141  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  41270142 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 41270241  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| |||   |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  41270242 gaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2449462 - 2449391
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2449462 atgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 2449391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 47993911 - 47994046
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| ||||||    
T  47993911 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 47994010  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 240  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  47994011 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47994046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 240
Target Start/End: Original strand, 48012484 - 48012619
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| ||||||    
T  48012484 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 48012583  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 240  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
T  48012584 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48012619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54037981
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  54038056 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 54037981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955837
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagct----ctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||| |||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctacctagcttcacttttgctcctatg 17955837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854380
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 7854380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 495
Target Start/End: Original strand, 45581954 - 45582016
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccc-cttaccttaattatctccaactactagctctagcttca 495  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45581954 atgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca 45582016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Original strand, 17205019 - 17205076
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  17205019 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 17205076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 147
Target Start/End: Original strand, 19231945 - 19231994
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  19231945 tttcaccaaaacaccaacaacaatccaaattatcatcatcaattcatgaa 19231994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 38810941 - 38810868
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  38810941 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 38810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 452 - 507
Target Start/End: Original strand, 12031849 - 12031904
Alignment:
Q  452 aacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  12031849 aacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 12031904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13301396 - 13301323
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  13301396 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13301323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13312052 - 13311979
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  13312052 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13311979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  335 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Original strand, 17191879 - 17191936
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  17191879 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 17191936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449152
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2449152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261809
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16261809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933869
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16933869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912398
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17912398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 18969968 - 18970048
Alignment:
Q  11 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 91  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  18969968 catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgctttccatcagaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 18970048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22144564 - 22144532
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144564 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22144532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492728
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23492728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168269
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttacctta 38168269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771397
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttacctta 53771397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 3576347 - 3576290
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || | ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3576347 ctaacccccttaccttaattatcacaaattcctagcccaagcttcactttacctccta 3576290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12265053 - 12264932
Alignment:
Q  127 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 226  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||  || ||||| | || | ||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
T  12265053 ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 12264954  T
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaa 248  Q
    | |||||| ||||||| |||||    
T  12264953 atttcaacaacaacatatcaaa 12264932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 500
Target Start/End: Original strand, 15550922 - 15550987
Alignment:
Q  435 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttta 500  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
T  15550922 tgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttta 15550987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11329214 - 11329098
Alignment:
Q  127 ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 225  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||| |||| | |||| | | ||||||  |||||| |||||||||||||||  || ||||| || |     
T  11329214 ttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatca 11329115  T
Q  226 caattcaactacaacat 242  Q
    ||||||||| |||||||    
T  11329114 caattcaacaacaacat 11329098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986080
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 11986080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13954836 - 13954804
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13954836 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 13954804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285321
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 14285321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947058
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 19947058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 30153265 - 30153297
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30153265 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 30153297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342236
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttacctta 33342236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 45861122 - 45861154
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45861122 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 45861154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51961031
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 51961031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22907606 - 22907214
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaattt 100  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22907606 atgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaattt 22907507  T
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907506 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 22907407  T
Q  201 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22907406 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaaca 22907307  T
Q  300 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22907306 tgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 98 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16405268 - 16404857
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||    
T  16405268 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaa 16405169  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
T  16405168 taacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatttaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 16405072  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
T  16405071 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcat 16404972  T
Q  396 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagctt 493  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16404971 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagctt 16404873  T
Q  494 cactttagctcctatg 509  Q
    |||||| |||||||||    
T  16404872 cacttttgctcctatg 16404857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 105 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16194005 - 16193643
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||    
T  16194005 aaaacaccaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 16193906  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 302  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  16193905 aattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16193806  T
Q  303 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 402  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16193805 aatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaatt 16193706  T
Q  403 catacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16193705 catacaatatttgaaaatttaccaaatgatgatgattatgataaagactaa-ccccttacctta 16193643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 43373761 - 43373392
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  43373761 tttcaccaaaacaccaacaa---ttcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 43373665  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     | ||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  43373664 tagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 43373565  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||    
T  43373564 aacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattat 43373465  T
Q  396 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
       |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373464 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 43373392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 88 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24929096 - 24928716
Alignment:
Q  88 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 187  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |    
T  24929096 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaa 24928998  T
Q  188 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 285  Q
    ||| || | | ||| ||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||     
T  24928997 ttaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaacttagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 24928898  T
Q  286 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 385  Q
    | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24928897 ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 24928798  T
Q  386 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24928797 tatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatgattatgataaagactaaccccattacctta 24928716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238350
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  5238184 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 5238283  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5238284 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661248
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  24661414 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 24661315  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24661314 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685809
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  43685643 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 43685742  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43685743 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 392
Target Start/End: Original strand, 17345540 - 17345832
Alignment:
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
T  17345540 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 17345639  T
Q  201 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 298  Q
     ||||| || |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  17345640 tatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 17345738  T
Q  299 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  17345739 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 380
Target Start/End: Original strand, 24548956 - 24549233
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  24548956 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 24549055  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 302  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  24549056 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 24549155  T
Q  303 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| |||||    
T  24549156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 6774535 - 6774258
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
T  6774535 aaaacaccaacaacaaatcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 6774436  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 302  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  6774435 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 6774336  T
Q  303 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| |||||    
T  6774335 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21844856 - 21844594
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  21844856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21844758  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  21844757 taacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21844658  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21844657 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21844594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21852249 - 21851987
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  21852249 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21852151  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  21852150 taacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21852051  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21852050 aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21851987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Original strand, 30120690 - 30120974
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  30120690 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattatcatcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 30120788  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  30120789 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 30120888  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  30120889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274841
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  274766 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 274841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641008
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  641083 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 641008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826814
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  826889 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 826814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 5238126 - 5238197
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238126 atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 5238197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24661472 - 24661401
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661472 atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 24661401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716719
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 24716719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 222975 - 222754
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  222975 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 222877  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  222876 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 222777  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaat 317  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
T  222776 gaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 736598 - 736377
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  736598 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 736500  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  736499 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 736400  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaat 317  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
T  736399 gaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 860493 - 860272
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  860493 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 860395  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  860394 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 860295  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaat 317  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
T  860294 gaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 43685585 - 43685656
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685585 atgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 43685656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16674672 - 16674392
Alignment:
Q  102 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 201  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  | |||    
T  16674672 accaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataac 16674574  T
Q  202 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 298  Q
    |||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||    
T  16674573 atcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaac 16674474  T
Q  299 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||| ||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  16674473 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 39115598 - 39115673
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39115598 atgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 39115673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 242
Target Start/End: Original strand, 23837154 - 23837308
Alignment:
Q  88 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 186  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||     
T  23837154 aattcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca 23837252  T
Q  187 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 242  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||    
T  23837253 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacat 23837308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 209
Target Start/End: Original strand, 41246613 - 41246735
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | |||||     
T  41246613 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg 41246711  T
Q  186 tattagcatcaacaacatcaattg 209  Q
      ||| || |||||||||||||||    
T  41246712 acttaacaacaacaacatcaattg 41246735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Original strand, 17285543 - 17285600
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  17285543 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctaacccaagcttcactttagctccta 17285600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 21198062 - 21198005
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21198062 ctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21198005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 22321654 - 22321597
Alignment:
Q  11 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaa 68  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||    
T  22321654 catcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatgcattccatcacaatttaacaa 22321597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23226117 - 23226076
Alignment:
Q  335 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23226117 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 23226076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238436
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttacctta 5238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907128
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22907128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385652
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24385652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661162
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24661162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685895
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttacctta 43685895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13662561 - 13662492
Alignment:
Q  90 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaa 160  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13662561 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttag-ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaa 13662492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 2545265 - 2545297
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2545265 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 2545297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 3431208 - 3431176
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3431208 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 3431176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 22886654 - 22886686
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22886654 atgattatgattaagactaacccccttacctta 22886686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 23217924 - 23218004
Alignment:
Q  11 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 91  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  23217924 catcaacaatcaaccacaactacaacttataatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 23218004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 26680071 - 26680463
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaattt 100  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  26680071 atgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcgattcccaaattt 26680170  T
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680171 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 26680270  T
Q  201 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26680271 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaca 26680370  T
Q  300 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26680371 tgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 87 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 54118551 - 54118125
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 186  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  54118551 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 54118452  T
Q  187 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 284  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||| ||    
T  54118451 attaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaatt 54118352  T
Q  285 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 384  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  54118351 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaa 54118252  T
Q  385 tcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactact 482  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54118251 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactatt 54118152  T
Q  483 agctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  54118151 agctctagcttcacttttgctcttatg 54118125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 87 - 466
Target Start/End: Original strand, 13246386 - 13246769
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  13246386 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 13246485  T
Q  187 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 284  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  13246486 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 13246585  T
Q  285 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 384  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  13246586 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaa 13246685  T
Q  385 tcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246686 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 13246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 102 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15675381 - 15675009
Alignment:
Q  102 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||    
T  15675381 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataac 15675282  T
Q  202 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 299  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  15675281 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 15675182  T
Q  300 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 397  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   |    
T  15675181 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 15675082  T
Q  398 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15675081 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15675009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 260 - 466
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122226
Alignment:
Q  260 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 359  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  122020 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 122119  T
Q  360 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccct 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  122120 agttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaatcccct 122219  T
Q  460 tacctta 466  Q
    |||||||    
T  122220 tacctta 122226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10104523 - 10104170
Alignment:
Q  102 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
T  10104523 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac-------------------aacaac 10104443  T
Q  202 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 299  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  10104442 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 10104343  T
Q  300 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 397  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||   |    
T  10104342 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaattatgaa 10104243  T
Q  398 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10104242 aaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 10104170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Original strand, 10488659 - 10488825
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  10488659 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 10488758  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10488759 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327926
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16328092 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16327993  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16327992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 105 - 365
Target Start/End: Original strand, 31115603 - 31115865
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
T  31115603 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 31115702  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 302  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |  ||||||     
T  31115703 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgt 31115802  T
Q  303 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 365  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31115803 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 358
Target Start/End: Original strand, 10644187 - 10644449
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  10644187 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10644285  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||  | |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||    
T  10644286 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatattt 10644385  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
     |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10644386 gaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 10644449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13048517 - 13048221
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||||| || |||  |    
T  13048517 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaactatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattca 13048419  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | |||||   ||| ||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||    
T  13048418 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatattt 13048319  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  13048318 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 466
Target Start/End: Original strand, 33240901 - 33241043
Alignment:
Q  330 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  33240901 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaa 33241000  T
Q  428 ----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33241001 aatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 33241043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 111362 - 111493
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  111362 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 111461  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 229  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  111462 taacatcaattgaacaagaatcataactcaat 111493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Original strand, 47357622 - 47357906
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  47357622 tttcaccaaaacaccaaca-cagctcaaattctcatcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 47357720  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  47357721 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 47357820  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  47357821 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25119139 - 25119064
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25119139 atgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 25119064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 10488601 - 10488672
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10488601 atgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 10488672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16328135 - 16328079
Alignment:
Q  16 tcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16328135 tcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 16328079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5682460 - 5682385
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  5682460 atgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcctatg 5682385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 360 - 466
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132657
Alignment:
Q  360 agttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaa 453  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
Q  454 cccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||    
T  31132645 cccccttacctta 31132657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 41165881 - 41165808
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  41165881 atgattatgatgaattctaacccccttacgttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 41165808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40885753 - 40885570
Alignment:
Q  195 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacata- 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||| |||| | |||  ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||     
T  40885753 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatac 40885655  T
Q  292 tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 376  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  40885654 tttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Original strand, 7849970 - 7850044
Alignment:
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaac 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  7849970 caccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcaccaattcatgattatgtatactcaagtcatgattcatcaac 7850044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 242
Target Start/End: Original strand, 15044794 - 15044938
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatca 196  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||  |||||   ||| | |||||||| |||| |||||| | | ||||||  |||||| ||    
T  15044794 tttcaccaaagcaacaacaacaatttat-ttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 15044892  T
Q  197 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 242  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  15044893 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15044938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41166172 - 41166083
Alignment:
Q  153 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || |  | ||||||||| |||||||    
T  41166172 atacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacat 41166083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 47534990 - 47534933
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||    
T  47534990 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctcgcccaagcttcactttagctccta 47534933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952117
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14952117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135907
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15135907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272211
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15272211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327840
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16327840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609013
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16609013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680549
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26680549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 44055870 - 44055902
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44055870 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 44055902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7186068 - 7185981
Alignment:
Q  155 acccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 242  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
T  7186068 acccaagccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 7185981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Original strand, 19559410 - 19559471
Alignment:
Q  11 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    ||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  19559410 catcaacaatctaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcaacaacaac 19559471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 8045272 - 8045304
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8045272 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 8045304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 16523146 - 16523178
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16523146 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 16523178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 392
Target Start/End: Original strand, 7292887 - 7293279
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaattt 100  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7292887 atgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaattt 7292986  T
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7292987 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 7293086  T
Q  201 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  7293087 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaaca 7293186  T
Q  300 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7293187 tgtaatttaaccaacaatcatacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 86 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13037322 - 13036938
Alignment:
Q  86 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13037322 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 13037223  T
Q  186 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 283  Q
     ||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  13037222 aattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 13037123  T
Q  284 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca 383  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13037122 tgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 13037023  T
Q  384 atcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    || |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13037022 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 13036938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 98 - 507
Target Start/End: Original strand, 3059933 - 3060344
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||   |    
T  3059933 tttcatcaaaacacccacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 3060032  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| |||||||  || |||||||| || || |||||| |||||||||    
T  3060033 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatattt 3060131  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataa 394  Q
     |||||| ||| | ||||||| |  |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3060132 gaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 3060231  T
Q  395 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttc 494  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3060232 gcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttc 3060331  T
Q  495 actttagctccta 507  Q
    ||||| |||||||    
T  3060332 acttttgctccta 3060344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 16211733 - 16212103
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | |    
T  16211733 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcttcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaacca 16211832  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  16211833 taacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 16211932  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||     
T  16211933 aacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataag 16212032  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212033 caaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 16212103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11581035 - 11580661
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  11581035 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcgtcctcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 11580936  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  11580935 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 11580836  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
T  11580835 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattat 11580736  T
Q  396 ---caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11580735 gcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 11580661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 36052634 - 36053003
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  36052634 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 36052733  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  36052734 caacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36052830  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||    
T  36052831 aacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattat 36052930  T
Q  396 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
       |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052931 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36053003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47481320 - 47481031
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | | ||||||    
T  47481320 aaaacaccaacaacaattcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatc 47481221  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 301  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  47481220 aattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 47481122  T
Q  302 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
     ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47481121 taatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516490
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  11516324 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 11516423  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11516424 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441564
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  15441730 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 15441631  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15441630 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262129
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  30262295 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 30262196  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30262195 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 98 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18254130 - 18253842
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  18254130 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 18254032  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  18254031 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 18253932  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 385  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18253931 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 391
Target Start/End: Original strand, 13320988 - 13321278
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
T  13320988 aaaacaccaacaacaatccaaattctcatcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 13321087  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaaca 299  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||| | |  ||||||| | |||  |||||| |||||||||||  ||||| ||||||  || |||||    
T  13321088 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaaca 13321186  T
Q  300 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca 391  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  13321187 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16479244 - 16478985
Alignment:
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
T  16479244 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 16479145  T
Q  200 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 297  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| | ||  | ||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
T  16479144 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 16479045  T
Q  298 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 357  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16479044 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatc 16478985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25292633 - 25292338
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| |   |||| ||| | || |||  |    
T  25292633 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattca 25292535  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |   | |||||| | |||  ||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  25292534 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacgacaacctaggagaattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatattta 25292435  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25292434 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 98 - 358
Target Start/End: Original strand, 13572644 - 13572906
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  13572644 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 13572742  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  13572743 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 13572842  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13572843 aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13572906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Original strand, 10989378 - 10989661
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  10989378 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10989476  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |  || |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  10989477 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat-tacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 10989575  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  10989576 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13911292 - 13911046
Alignment:
Q  116 aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |    
T  13911292 aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatg 13911193  T
Q  216 aatcatagctcaattcaactacaac---atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacc 311  Q
    ||||| | ||||| ||||| |||||   | |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||    
T  13911192 aatcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcacc 13911093  T
Q  312 aacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13911092 aacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 13911046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15441788 - 15441717
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441788 atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 15441717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 30262353 - 30262282
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262353 atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 30262282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493903
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32493978 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 32493903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 358
Target Start/End: Original strand, 2437425 - 2437687
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  2437425 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 2437523  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatt 293  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||  | ||| |||||  | |  ||||||| ||| |||  |||||| |||||||||| |||||| | |||||     
T  2437524 taacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaacaacttaggaaaaattca-ccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatata 2437622  T
Q  294 taaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2437623 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 2437687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126813
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  126738 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctatg 126813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 11516266 - 11516337
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516266 atgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatatactcatacactccatcataattcaacaacaac 11516337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 296257 - 295893
Alignment:
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||| | | |||||||| || | ||||||||||   |||||| ||||  | ||||||    
T  296257 caccaaaacaccaacacaaattcaatttttcaacatcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaac---aacatcaattaatagcaacaa 296161  T
Q  201 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacatgtcaaa-ttcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaa 296  Q
    ||||||||| ||| |||||| | | ||||||||  | |||  |  |||| |||| ||||||| | |  ||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  296160 catcaattgaacatgaatcacaacacaattcaaacatcaatttagcaaaattca-ccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattca 296062  T
Q  297 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat- 395  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||   |||| ||| ||||||||| ||||||||| || |  | || || ||| |||||||||||||| || ||| ||     
T  296061 acatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacacgaatttagcaacaattattcattatg 295962  T
Q  396 caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacct 464  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||  | ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  295961 caaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccccttacct 295893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1936949 - 1936874
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  1936949 atgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttctatg 1936874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111126
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  111201 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctatg 111126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 507
Target Start/End: Original strand, 13377819 - 13377924
Alignment:
Q  400 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 499  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||    
T  13377819 attcatacaacaattgaaaatttacactaaaa--atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcacttt 13377916  T
Q  500 agctccta 507  Q
    ||||||||    
T  13377917 agctccta 13377924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7283987 - 7283913
Alignment:
Q  435 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  7283987 tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgctcctatg 7283913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Original strand, 13389693 - 13389750
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  13389693 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 13389750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14114031 - 14113989
Alignment:
Q  350 atatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14114031 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14423681 - 14423639
Alignment:
Q  350 atatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14423681 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029276
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttacctta 2029276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293365
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttacctta 7293365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516576
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttacctta 11516576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113903
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14113903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441478
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15441478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 466
Target Start/End: Original strand, 15709428 - 15709501
Alignment:
Q  397 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaat----gatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  15709428 aaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaattgatgatgatgattatgatgaagactaatcctcttacctta 15709501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15822723 - 15822691
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15822723 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 15822691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 507
Target Start/End: Original strand, 16919870 - 16919926
Alignment:
Q  451 taacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  16919870 taacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 16919926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30262043
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttacctta 30262043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056188
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttacctta 42056188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 371417 - 371449
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  371417 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 371449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 3049905 - 3049937
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3049905 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 3049937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321366
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13321366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 13351999 - 13352079
Alignment:
Q  11 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 91  Q
    ||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  13351999 catcaacaatctaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcccaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 13352079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516765
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttac 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttac 15516765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17224230 - 17224075
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 185  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||   | ||||||    
T  17224230 caattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatc 17224132  T
Q  186 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 242  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || ||   ||||||||| |||||||    
T  17224131 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacat 17224075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124482
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 25124482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 47480976 - 47480944
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47480976 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 47480944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 17 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37442 - 37066
Alignment:
Q  17 caatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37442 caatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaaaaacttatcatatttcatcaattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 37343  T
Q  117 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37342 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 37243  T
Q  217 atcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaaca 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  37242 atcatagctcaatccaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaaca 37143  T
Q  316 atcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37142 atcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 41632 - 41707
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  41632 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 41707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36980
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttacctta 36980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 101 - 509
Target Start/End: Original strand, 41394191 - 41394602
Alignment:
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
T  41394191 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 41394290  T
Q  200 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 297  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||   ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
T  41394291 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 41394390  T
Q  298 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatca 397  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41394391 catgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatca 41394490  T
Q  398 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcact 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41394491 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcact 41394590  T
Q  498 ttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||||    
T  41394591 ttagctcctatg 41394602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 20931312 - 20931682
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  20931312 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 20931411  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  |  |||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
T  20931412 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20931511  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  20931512 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 20931611  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20931612 caaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattatgataaaggctaacccccttacctta 20931682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 20445646 - 20446019
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | |    
T  20445646 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20445745  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
T  20445746 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20445845  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  20445846 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20445945  T
Q  396 --caaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20445946 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttacctta 20446019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 20913004 - 20913367
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | |    
T  20913004 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaacca 20913103  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| ||||||||||      |||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
T  20913104 taacatcaattgaacaagaatca------aatt-aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20913196  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  20913197 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaag 20913296  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20913297 caaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattacgataaagactaacccccttacctta 20913367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 20531411 - 20531783
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | |    
T  20531411 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20531510  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
T  20531511 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20531610  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  20531611 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20531710  T
Q  396 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  20531711 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaatttccttacctta 20531783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 87 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20893933 - 20893551
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 186  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||     
T  20893933 caattcacaaatttcttcaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatca 20893834  T
Q  187 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 284  Q
    |||| ||   | ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  20893833 attaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 20893734  T
Q  285 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 384  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  20893733 gttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaa 20893634  T
Q  385 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20893633 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaa-ttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 20893551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 37844746 - 37844374
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | |    
T  37844746 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaacca 37844648  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttca-taacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||||  |||  |||||||||||| ||  || |||||| | | || ||    
T  37844647 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctactt 37844548  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataa 394  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |    
T  37844547 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccatta 37844448  T
Q  395 tc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844447 tgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 37844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452755
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  51452589 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 51452688  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51452689 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 342
Target Start/End: Original strand, 22227777 - 22228022
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
T  22227777 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22227875  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  22227876 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22227975  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 342  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22227976 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 22228022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 342
Target Start/End: Original strand, 22232474 - 22232719
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
T  22232474 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22232572  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  22232573 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22232672  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 342  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22232673 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 22232719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 358
Target Start/End: Original strand, 2116228 - 2116484
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  2116228 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 2116327  T
Q  205 aattgcacaagaatc-atagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 301  Q
    |||||  |||||||| | |  |||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  2116328 aattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 2116427  T
Q  302 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2116428 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 2116484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860409
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21860334 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 21860409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034829
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 508  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44034903 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 44034829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 51452531 - 51452602
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452531 atgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 51452602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 467
Target Start/End: Original strand, 45051554 - 45051759
Alignment:
Q  260 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 359  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  45051554 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcac 45051653  T
Q  360 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccc 458  Q
    |||  || ||| ||| |||||  |||  | ||| || | |  ||||||||||||  |||||  | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  45051654 agtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatca-catgattatgataaagactaaccccc 45051750  T
Q  459 ttaccttaa 467  Q
    |||||||||    
T  45051751 ttaccttaa 45051759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18601402 - 18601140
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  18601402 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 18601304  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  18601303 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 18601204  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18601203 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 18601140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 185
Target Start/End: Original strand, 45051416 - 45051496
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45051416 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaataacatc 45051496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5072672 - 5072388
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
T  5072672 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 5072574  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  5072573 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 5072474  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  5072473 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 507
Target Start/End: Original strand, 27675086 - 27675191
Alignment:
Q  400 attcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcacttt 499  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  |  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  27675086 attcatacaacaattgaaaatttacactaaaa--acgattatgataaattctaacccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcacttt 27675183  T
Q  500 agctccta 507  Q
    ||||||||    
T  27675184 agctccta 27675191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 41218728 - 41218803
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41218728 atgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 41218803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13376768 - 13376711
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  13376768 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 13376711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Original strand, 20177513 - 20177570
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  20177513 ctaaccccattaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 20177570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861327
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 119
Target Start/End: Original strand, 49967607 - 49967638
Alignment:
Q  88 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49967607 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 49967638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 51452809 - 51452841
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51452809 atgattaagataaagactaacccccttacctta 51452841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 87 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19795011 - 19794586
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaa-caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 185  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19795011 caattcacaa-tttcaccaaaaacaccaacaaaaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 19794913  T
Q  186 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 283  Q
     |||| |   || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  19794912 aattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 19794813  T
Q  284 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca 383  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||    
T  19794812 tgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgaca 19794713  T
Q  384 atcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactac 481  Q
    || |||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19794712 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa-tttacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactat 19794614  T
Q  482 tagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19794613 tagctctagcttcacttttgctcttatg 19794586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 36982737 - 36982364
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
T  36982737 tttcactaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 36982638  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  36982637 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36982538  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  36982537 aacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 36982438  T
Q  396 --caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982437 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36982364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 98 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 20627609 - 20627195
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| || | |    
T  20627609 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaacca 20627510  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     || |||||||| |||||||| | | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| |||||||||     
T  20627509 taaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttg 20627410  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
     ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  20627409 gacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataat 20627310  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaa-tttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttc 494  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20627309 cataattcatacaatatttgaaaattttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttc 20627210  T
Q  495 actttagctcctatg 509  Q
    ||||| |||||||||    
T  20627209 acttttgctcctatg 20627195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 98 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43643250 - 43642838
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||    
T  43643250 tttcatcaaaacaccaacatc---tcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaa 43643154  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     | ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||  ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
T  43643153 tagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 43643054  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  43643053 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactat 43642954  T
Q  396 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagctt 493  Q
       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43642953 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagctt 43642854  T
Q  494 cactttagctcctatg 509  Q
    |||||| |||||||||    
T  43642853 cacttttgctcctatg 43642838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 462706 - 463075
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| || | |    
T  462706 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattcttatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagcca 462804  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  462805 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt 462903  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataa 394  Q
     |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  462904 gaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 463003  T
Q  395 tcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  463004 gcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 463075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 8891209 - 8891581
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | |    
T  8891209 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 8891308  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  8891309 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 8891408  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  8891409 aacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 8891508  T
Q  396 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8891509 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccctttacctta 8891581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 102 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24341681 - 24341309
Alignment:
Q  102 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || ||| |||    
T  24341681 accaaaacaccaacaataattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataac 24341582  T
Q  202 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 299  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  24341581 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 24341482  T
Q  300 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 397  Q
    |  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||  ||   |    
T  24341481 tataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaa 24341382  T
Q  398 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24341381 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 24341309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19689567 - 19689401
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  19689567 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 19689468  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19689467 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Original strand, 23820168 - 23820334
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  23820168 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 23820267  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23820268 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14906606 - 14906440
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  14906606 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 14906507  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14906506 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 105 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25265679 - 25265390
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||    
T  25265679 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 25265580  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 302  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
T  25265579 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 25265480  T
Q  303 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25265479 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Original strand, 20015108 - 20015274
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
T  20015108 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaat 20015207  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20015208 tattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7508138 - 7507894
Alignment:
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
T  7508138 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 7508039  T
Q  200 acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
    |||||||||   ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||     
T  7508038 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaatt-aacaacaacttagccaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttg 7507941  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 342  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7507940 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17396948 - 17396653
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  17396948 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattca 17396850  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  17396849 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 17396750  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17396749 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 19886945 - 19886661
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  19886945 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 19886847  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
T  19886846 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 19886747  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  19886746 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 372 - 466
Target Start/End: Original strand, 22863171 - 22863267
Alignment:
Q  372 aatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863171 aatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 22863267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275120
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22275045 atgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 22275120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284353
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg 22284353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Original strand, 15633538 - 15633612
Alignment:
Q  435 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  15633538 tgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatg 15633612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14906664 - 14906593
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14906664 atgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 14906593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 20015050 - 20015121
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20015050 atgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 20015121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 23820110 - 23820181
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23820110 atgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 23820181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19689600 - 19689554
Alignment:
Q  26 acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689600 acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 19689554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Original strand, 43646232 - 43646289
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43646232 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 43646289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689314
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 19689314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652796
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9652796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906354
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttacctta 14906354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 455 - 507
Target Start/End: Original strand, 19660221 - 19660273
Alignment:
Q  455 ccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  19660221 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 19660273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19669335 - 19669279
Alignment:
Q  153 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 209  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  19669335 atacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg 19669279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820420
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23820420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 465
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213403
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Original strand, 19666848 - 19666921
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  19666848 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaaacttcactttagctccta 19666921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Original strand, 25305769 - 25305826
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| | |||||||||||| ||||||    
T  25305769 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcatagcccaagcttcactttaactccta 25305826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 31146138 - 31146032
Alignment:
Q  400 attcatacaaca-tttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactt 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||  || |    ||||| | ||||||||||    
T  31146138 attcatacaacaatttgaaaatttacacaa--aagatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaattctctagcccaagcttcactt 31146041  T
Q  499 tagctccta 507  Q
    |||||||||    
T  31146040 tagctccta 31146032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507757
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 7507757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17396599 - 17396567
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17396599 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 17396567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015360
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttacctta 20015360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28031166 - 28031134
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28031166 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 28031134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 32465813 - 32465845
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32465813 caattcataaatttcaccaaaacaccaacaaca 32465845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128404
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 33128404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 48565 - 48935
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | |    
T  48565 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 48664  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | | ||||| |  |||| |||| | | |  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  48665 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttg 48764  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  48765 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 48864  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 48935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 358
Target Start/End: Original strand, 36065 - 36323
Alignment:
Q  102 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 201  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||  ||| | || |||  | |||    
T  36065 accataacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataac 36163  T
Q  202 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 298  Q
    ||| |||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | ||     
T  36164 atctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaat 36263  T
Q  299 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36264 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacataacatca 36323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 61154 - 61122
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  61154 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 61122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 1091 - 1462
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | |    
T  1091 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaacca 1190  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  1191 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 1290  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  1291 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 1390  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaattt-acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1391 aaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 3877 - 3508
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||  | |||||| |||| |||| |    
T  3877 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaactctcctcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatcca 3779  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  3778 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 3679  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  3678 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataat 3579  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3578 caaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaatgaagatgattatgacaaagactaacccccttacctta 3508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 87 - 466
Target Start/End: Original strand, 23153403 - 23153786
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||     
T  23153403 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatccttaattcatgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatca 23153502  T
Q  187 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 284  Q
    |||| || | | || |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  23153503 attaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 23153602  T
Q  285 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 384  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23153603 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaa 23153702  T
Q  385 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    | |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23153703 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23153786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 105 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14626407 - 14626045
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  14626407 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 14626308  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 301  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  || |||||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  14626307 aattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcataattca-ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatg 14626209  T
Q  302 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaat 401  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  14626208 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaat 14626109  T
Q  402 tcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 465  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  14626108 tcaaacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattgtgataataactaacccccttacctt 14626045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35009735 - 35009439
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
T  35009735 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 35009636  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
    |||||||||||| ||| |  ||  | |  |||||||| ||||||| |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||     
T  35009635 caacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg 35009536  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35009535 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 101 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1658040 - 1657748
Alignment:
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
T  1658040 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 1657941  T
Q  201 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 298  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  1657940 catcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 1657842  T
Q  299 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1657841 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 392
Target Start/End: Original strand, 15862443 - 15862734
Alignment:
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
T  15862443 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataa 15862542  T
Q  201 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 298  Q
    ||| ||| | |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  15862543 cataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaac 15862640  T
Q  299 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  15862641 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 1650382 - 1650020
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
T  1650382 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 1650283  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 302  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||     
T  1650282 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgt 1650183  T
Q  303 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat-aatcaaaat 401  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| ||| |||||  |||  | ||| || | |  |    
T  1650182 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattt 1650083  T
Q  402 tcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 467  Q
    |||||||||||  |||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1650082 tcatacaacatgagaaaa--tgcaaaatta-catgattatgataaagactaacccccttaccttaa 1650020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 352
Target Start/End: Original strand, 25175531 - 25175787
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  25175531 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25175629  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  25175630 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25175729  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 352  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  25175730 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 25175787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 27654267 - 27653983
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  27654267 tttcaccaaaacaccgaca-caattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 27654169  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| | | |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  27654168 taacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 27654069  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  27654068 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 397 - 466
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148335
Alignment:
Q  397 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983149
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19983224 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 19983149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015014
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35015089 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 35015014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16826038 - 16825752
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||  |||| |||   || |||  |    
T  16826038 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattca 16825940  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaa--catgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||   | |  |||| || | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  16825939 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 16825840  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatca--tacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |  ||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  16825839 gaacatgtaatttcaccaacaattaattacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 234
Target Start/End: Original strand, 27740808 - 27740941
Alignment:
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||| || | ||||||   ||  | |||| |    
T  27740808 caccaaaacaccaacaccaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaacca 27740907  T
Q  201 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 234  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  27740908 catcaattgaacatgaatcatatctcaattcaac 27740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583715
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 18583715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18381975 - 18381821
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 185  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||    
T  18381975 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc 18381877  T
Q  186 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 241  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| ||||||    
T  18381876 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 18381821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 392
Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751688
Alignment:
Q  309 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  27751605 accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Original strand, 21623506 - 21623563
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21623506 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21623563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22361676 - 22361619
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  | |||||||||||||||||||    
T  22361676 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctaggccaagcttcactttagctccta 22361619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 507
Target Start/End: Original strand, 14152632 - 14152704
Alignment:
Q  435 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  14152632 tgattatgatgaagaataacccccttgccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 14152704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002395
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttacctta 18002395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995279
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttacctta 23995279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090091
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttacctta 26090091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 465
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991427
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22362032 - 22361926
Alignment:
Q  112 caacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgc 210  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||| |||||||| | || |||  |||||| |||||||||||||||     
T  22362032 caacaacaactcaa-ttctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga 22361934  T
Q  211 acaagaat 218  Q
    ||| ||||    
T  22361933 acatgaat 22361926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742120
Alignment:
Q  436 gattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttacctta 15742120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 392
Target Start/End: Original strand, 29665937 - 29666137
Alignment:
Q  195 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatat 292  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | ||||||| ||||||||  ||||| | ||||     
T  29665937 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatac 29666035  T
Q  293 tt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc 390  Q
    ||  ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||  || ||| ||||| || | |||||| |||||| ||||||| ||||    
T  29666036 tttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatcc 29666135  T
Q  391 at 392  Q
    ||    
T  29666136 at 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15889914 - 15889853
Alignment:
Q  11 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||| |||||| |||||||    
T  15889914 catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcatcaacaac 15889853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 116
Target Start/End: Original strand, 32898745 - 32898774
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32898745 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 32898774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657661
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 1657661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862821
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 15862821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18823315 - 18823283
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18823315 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18823283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18839170 - 18839138
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18839170 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 18839138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25367490 - 25367374
Alignment:
Q  127 ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 225  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||| |||| | ||| |  | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |     
T  25367490 ttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatca 25367391  T
Q  226 caattcaactacaacat 242  Q
    ||||||||| |||||||    
T  25367390 caattcaacaacaacat 25367374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751774
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 27751774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276659
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 32276659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 98 - 463
Target Start/End: Original strand, 19173 - 19543
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
T  19173 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 19272  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  19273 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 19372  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  19373 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 19472  T
Q  396 --caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacc 463  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19473 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaattatgatgattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 21257 - 21553
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
T  21257 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 21356  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  21357 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 21456  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21457 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 98 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 37209 - 36836
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  37209 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 37110  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| | |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  37109 taacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 37010  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  37009 aacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattat 36910  T
Q  396 --caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 467  Q
       |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36909 gcaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 36836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 15398 - 15324
Alignment:
Q  435 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15398 tgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatg 15324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 23506932 - 23507302
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  23506932 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 23507031  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  23507032 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 23507131  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  23507132 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataag 23507231  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507232 caaaattcatacaacatttgaaatcttacaaaatggagatgattatgataaagactaacccccttacctta 23507302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 87 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27182854 - 27182471
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 186  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||     
T  27182854 caattcaaaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatca 27182755  T
Q  187 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 284  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  27182754 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 27182655  T
Q  285 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 384  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  27182654 gttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaa 27182555  T
Q  385 tcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    | |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27182554 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 27182471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 106 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18531355 - 18530988
Alignment:
Q  106 aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||||    
T  18531355 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatca 18531256  T
Q  206 attgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 302  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
T  18531255 attgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 18531157  T
Q  303 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-a 400  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || || ||| |    
T  18531156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaca 18531057  T
Q  401 ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgat---gattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18531056 ttcataccacatttgaaaaattgcaaaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttacctta 18530988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 102 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22054125 - 22053753
Alignment:
Q  102 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||    
T  22054125 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataac 22054026  T
Q  202 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 299  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  22054025 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 22053926  T
Q  300 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 397  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   |    
T  22053925 tgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 22053826  T
Q  398 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22053825 aaattcataccacatttgaaaaatttcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 22053753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623232
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  20623066 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 20623165  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20623166 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233528
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  21233694 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 21233595  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21233594 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 230 - 392
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37053007
Alignment:
Q  230 tcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 328  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37052844 tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 37052943  T
Q  329 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37052944 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536460
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16536294 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16536393  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16536394 tattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 392
Target Start/End: Original strand, 34939248 - 34939540
Alignment:
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
T  34939248 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataa 34939347  T
Q  201 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 298  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| | |  || |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  34939348 catcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 34939446  T
Q  299 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  34939447 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 227 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900408
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
T  25900571 aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat 25900473  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc 390  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25900472 tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 22366765 - 22366481
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  22366765 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 22366667  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  22366666 taacatcatttgaacaagcatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 22366567  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  22366566 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Original strand, 25426596 - 25426880
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  25426596 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25426694  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  25426695 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25426794  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  25426795 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18778276 - 18778014
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | ||  ||  |    
T  18778276 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattca 18778178  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  18778177 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 18778078  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18778077 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 18778014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Original strand, 12342 - 12626
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  12342 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 12440  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
T  12441 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 12540  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  12541 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Original strand, 19499867 - 19500151
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||| | || |||  |    
T  19499867 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattca 19499965  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  19499966 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 19500065  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  19500066 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21073879 - 21073595
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  21073879 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattga 21073781  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  |    ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  21073780 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 21073681  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 380  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
T  21073680 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4200251 - 4200007
Alignment:
Q  117 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
T  4200251 acaattcaaattctcatcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatga 4200152  T
Q  217 atcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaa 313  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||||  |  ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||    
T  4200151 atcacatctcaaatcaacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaa 4200052  T
Q  314 caatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4200051 caatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 4200007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 358
Target Start/End: Original strand, 27009809 - 27010071
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  27009809 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 27009907  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  27009908 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatattt 27010007  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27010008 aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 27010071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43443679 - 43443417
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  43443679 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaatcctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43443581  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||| |||||  |    ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
T  43443580 taacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 43443481  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43443480 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 43443417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 88 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17471887 - 17471768
Alignment:
Q  88 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||  || ||||||||      
T  17471887 aattcaccaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcattcacaataacatcag 17471788  T
Q  188 ttagcatcaacaacatcaat 207  Q
    ||| ||  ||||||||||||    
T  17471787 ttaacaataacaacatcaat 17471768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 20623008 - 20623079
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623008 atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 20623079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21233752 - 21233681
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233752 atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 21233681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29190552 - 29190478
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactat 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29190552 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactat 29190478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188284
Alignment:
Q  260 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 359  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  29188404 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 29188305  T
Q  360 agttggagcacaaatttagca 380  Q
    |||  |||||| ||| |||||    
T  29188304 agtaagagcacgaatctagca 29188284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25900629 - 25900558
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25900629 atgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 25900558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 37052783 - 37052854
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37052783 atgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcataccctccatcataactcaacaacaac 37052854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 16536236 - 16536307
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16536236 atgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatacaatcataccctccatcataattcaacaacaac 16536307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Original strand, 11584374 - 11584448
Alignment:
Q  435 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  11584374 tgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 11584448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Original strand, 19862186 - 19862319
Alignment:
Q  109 caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 207  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||  ||| | |||||||  |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  19862186 caccaacaacaactcat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaat 19862284  T
Q  208 tgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 242  Q
    |||||| || || || | ||||||||| |||||||    
T  19862285 tgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacat 19862319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 5450768 - 5450695
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||   ||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  5450768 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaattattatcaattcctagcccaagcttcactttagctccta 5450695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 21222519 - 21222462
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21222519 ctaacccccataccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 21222462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 242
Target Start/End: Original strand, 23493885 - 23494029
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatca 196  Q
    |||||||||| || ||||||||| | |  |||||||||||||  ||||||  ||| | |||||||| |||| |||||| | | ||||||  |||||| ||    
T  23493885 tttcaccaaaccaacaacaacaacttat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 23493983  T
Q  197 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 242  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
T  23493984 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 23494029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16105999
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16105999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623318
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttacctta 20623318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233442
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttacctta 21233442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900320
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttacctta 25900320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053093
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttacctta 37053093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108728
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 108728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 9730310 - 9730278
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9730310 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 9730278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 16536514 - 16536546
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16536514 atgattatgataaagactaacccccttatctta 16536546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 178; Significance: 9e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 87 - 466
Target Start/End: Original strand, 41686 - 42066
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |     
T  41686 caattcacaa-tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctaataatcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaaca 41784  T
Q  187 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 284  Q
    |||| || | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || ||||||    
T  41785 attaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcattt 41884  T
Q  285 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 384  Q
     ||||||||| | |||| ||| | |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41885 ttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 41984  T
Q  385 tcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41985 ttatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagaccaacccccttacctta 42066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 882
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||| |    
T  1250 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatcca 1152  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||| ||| |||||||| | | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||||| |||  |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||     
T  1151 taacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttg 1053  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1052 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 953  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    || |||||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  952 cacaattcatacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 128464 - 128095
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  128464 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatcca 128365  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| |||||  ||  | |||| ||||     
T  128364 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttg 128266  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  128265 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataag 128166  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128165 caaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 128095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31942 - 31697
Alignment:
Q  117 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||  | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
T  31942 acaattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatga 31843  T
Q  217 atcatagctcaattcaactacaac---atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacca 312  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||   | |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | ||||    
T  31842 atcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcacca 31743  T
Q  313 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31742 acaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacataacatca 31697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 119
Target Start/End: Original strand, 22650 - 22678
Alignment:
Q  91 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22650 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6358 - 5990
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||   |||| |||| |    
T  6358 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatcca 6260  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| | |||| |||||||||     
T  6259 taacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttg 6161  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6160 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 6061  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6060 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 247738 - 247366
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||   |    
T  247738 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcagttcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 247639  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  247638 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 247539  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  247538 aacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 247439  T
Q  396 c--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247438 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 247366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34075
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 12083 - 12450
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| |||  |    
T  12083 tttcactaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattca 12181  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | |||||||  || ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  12182 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacattta 12279  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| | | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12280 aacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataat 12379  T
Q  396 caaaa-ttcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12380 caaaatttcatacagcatttg-aaagttacaaaattaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 88 - 466
Target Start/End: Original strand, 171863 - 172242
Alignment:
Q  88 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 187  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| | || |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |    
T  171863 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 171961  T
Q  188 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 285  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
T  171962 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 172061  T
Q  286 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 385  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |    
T  172062 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagt 172161  T
Q  386 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172162 tatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 172242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 88 - 466
Target Start/End: Original strand, 177566 - 177945
Alignment:
Q  88 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 187  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| | || |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |    
T  177566 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 177664  T
Q  188 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 285  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
T  177665 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 177764  T
Q  286 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 385  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |    
T  177765 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagt 177864  T
Q  386 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177865 tatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 177945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 70914 - 70882
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70914 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 70882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Original strand, 8846 - 9215
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  8846 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 8944  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||     
T  8945 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattg 9044  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||  |||||||     
T  9045 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataag 9144  T
Q  396 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9145 caaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 123460 - 123087
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| || |||||||||| | |||||| |||| || | |    
T  123460 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 123361  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
T  123360 taacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 123261  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  123260 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 123161  T
Q  396 --caaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  123160 gcaaaaattcatacaacatttgcaaatttacaaaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 123087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 255106 - 255074
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  255106 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 255074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 261712 - 261680
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  261712 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 261680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 98 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 26710 - 26340
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | |    
T  26710 tttcatcaaaacaccaacaacact-caaattctcatcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 26612  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  26611 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 26512  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| | | | ||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||    
T  26511 aacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattat 26412  T
Q  396 -caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26411 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatcatgattatgataaagactaacccccttacctta 26340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8180
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||    
T  8466 aaaacaccagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 8367  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 302  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  ||||||||   |||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||| ||     
T  8366 aattgaacatggttctcatcataattcaac---aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgt 8270  T
Q  303 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8269 aatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 6934 - 6877
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  6934 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttaactccta 6877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 98 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5356 - 4996
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | |    
T  5356 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 5258  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  5257 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 5158  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| | | | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||    
T  5157 aacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattat 5058  T
Q  396 -caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccc 456  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5057 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 102 - 466
Target Start/End: Original strand, 8820 - 9192
Alignment:
Q  102 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | ||| |||    
T  8820 accaaaacaccaacaaaaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataac 8919  T
Q  202 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 299  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  8920 atcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 9019  T
Q  300 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 397  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  ||   |    
T  9020 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 9119  T
Q  398 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaa----atgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  9120 aaatacataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacacacttacctta 9192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 418
Target Start/End: Original strand, 148688 - 149012
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| || | |    
T  148688 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaacca 148787  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
T  148788 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 148887  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 395  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  148888 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattat 148987  T
Q  396 --caaaattcatacaacatttgaaa 418  Q
       ||||||||||||||||||||||    
T  148988 gcaaaaattcatacaacatttgaaa 149012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 372 - 466
Target Start/End: Original strand, 146844 - 146938
Alignment:
Q  372 aatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146844 aatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 146938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 88 - 466
Target Start/End: Original strand, 271983 - 272362
Alignment:
Q  88 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatcta 187  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||   | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  271983 aattcactaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctctataacaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 272081  T
Q  188 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 285  Q
    ||| || | | |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
T  272082 ttaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 272181  T
Q  286 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 385  Q
    | | ||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||||| | |    
T  272182 ttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatt 272281  T
Q  386 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272282 tatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 272362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 260 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 51314 - 51110
Alignment:
Q  260 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 359  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  51314 gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 51215  T
Q  360 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccct 459  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  51214 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaatctcct 51115  T
Q  460 tacct 464  Q
    |||||    
T  51114 tacct 51110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 385
Target Start/End: Original strand, 48155 - 48443
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  48155 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcta 48253  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
T  48254 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 48353  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 385  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  48354 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Original strand, 20493 - 20567
Alignment:
Q  435 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  20493 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatg 20567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 6)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27058
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  26892 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 26991  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 227 - 385
Target Start/End: Original strand, 22637 - 22796
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  22637 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 22736  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22737 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 22579 - 22650
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22579 atgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 26834 - 26905
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26834 atgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 26905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22889
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27144
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttacctta 27144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 227 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1582
Alignment:
Q  227 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  1748 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 1649  T
Q  326 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1648 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 1806 - 1735
Alignment:
Q  1 atgagatggacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1806 atgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1496
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttacctta 1496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 260 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89378
Alignment:
Q  260 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 359  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  89586 gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 89487  T
Q  360 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccc 457  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  89486 agttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatgatgaagactaacccc 89387  T
Q  458 cttacctta 466  Q
    |||||||||    
T  89386 cttacctta 89378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 341 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107708
Alignment:
Q  341 catacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 438  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
Q  439 tatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  107735 catgatgaagactaacccccttacctta 107708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 209
Target Start/End: Original strand, 79533 - 79616
Alignment:
Q  127 ttctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 209  Q
    ||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||    
T  79533 ttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattg 79616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 465
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130911
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 105 - 392
Target Start/End: Original strand, 41622 - 41911
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| || ||||||||||    
T  41622 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatc 41721  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 301  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| ||||||| |  ||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  41722 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 41820  T
Q  302 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  41821 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 426 - 466
Target Start/End: Original strand, 41957 - 41997
Alignment:
Q  426 aaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41957 aaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctta 41997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 105 - 392
Target Start/End: Original strand, 13480 - 13769
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||    
T  13480 aaaacacctacaaaaattcaaattctcatcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 13579  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 302  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
T  13580 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 13679  T
Q  303 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13680 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42749
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 42749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13856
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 13856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 98 - 385
Target Start/End: Original strand, 107715 - 108003
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
T  107715 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 107813  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||| | || ||||     
T  107814 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttg 107913  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 385  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  107914 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 64812 - 64585
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  64812 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 64714  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  64713 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 64614  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcataca 323  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  64613 aaacatgtaatttcaccaacaatcataca 64585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  335 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattta 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 534
Alignment:
Q  100 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | | |    
T  828 tcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccata 729  T
Q  200 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 297  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||  |||   ||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||  |||||| | | ||||| ||    
T  728 acatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaa 629  T
Q  298 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  628 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9626 - 9371
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  9626 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 9527  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 302  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  9526 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 9427  T
Q  303 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9426 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 9371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16269
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
T  16524 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 16425  T
Q  205 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 302  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  16424 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16325  T
Q  303 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16324 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 16269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34755 - 34460
Alignment:
Q  101 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
T  34755 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 34656  T
Q  200 acatcaattgca-caagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 296  Q
    |||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||||  |||| |||| | || |    
T  34655 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattga 34556  T
Q  297 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  34555 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 381
Target Start/End: Original strand, 2936 - 3215
Alignment:
Q  105 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
T  2936 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 3035  T
Q  205 aatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 301  Q
    ||||   ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  3036 aattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 3135  T
Q  302 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaa 381  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||| ||||||||||    
T  3136 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Original strand, 9338 - 9480
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 186  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  9338 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 9437  T
Q  187 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 229  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9438 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 9480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 357
Target Start/End: Original strand, 42965 - 43226
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
T  42965 tttcaccaaaacaccaaca-caatttaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43063  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  43064 taacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatattt 43163  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 357  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43164 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatc 43226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 260 - 385
Target Start/End: Original strand, 5660 - 5785
Alignment:
Q  260 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 359  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5660 gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa 5759  T
Q  360 agttggagcacaaatttagcaacaat 385  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5760 agttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5878
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttacctta 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5498 - 5254
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  | |||||| |||| |||  |    
T  5498 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattca 5401  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||   |  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5400 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaactcagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatattt 5302  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 342  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5301 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 342
Target Start/End: Original strand, 3690 - 3936
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
T  3690 tttcaccaaaacatcaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 3788  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctca-tttctacatattt 294  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  3789 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatattt 3888  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 342  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 358
Target Start/End: Original strand, 3 - 265
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
T  3 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 101  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 294  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
T  102 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatattt 201  T
Q  295 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  202 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 30417 - 30492
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||| ||| |||||    
T  30417 atgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgcttctatg 30492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14344 - 14083
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||||||| |  | |||  |    
T  14344 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattca 14246  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||| ||||| |||||||||  | ||||| | | | ||||| | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||     
T  14245 taacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaacaacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttc 14146  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14145 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatca 14083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21399 - 21138
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||||||| | || |||  |    
T  21399 tttcaccaaaacaccaaca-cagttcaaattttcatcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattca 21301  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 295  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||     
T  21300 taacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttg 21201  T
Q  296 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  21200 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatca 21138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80262
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 80262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 166197 - 166121
Alignment:
Q  433 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  166197 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 166121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 162111 - 162036
Alignment:
Q  433 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 508  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  162111 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 162036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 116483 - 116410
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  116483 atgattatgatgaaatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 116410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31212 - 31137
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31212 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 31137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 5809 - 5735
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 508  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5809 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 6015 - 5941
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctat 508  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6015 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 220
Target Start/End: Original strand, 48482 - 48603
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  48482 tttcatcaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 48580  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatca 220  Q
     |||||||| || ||||||||||    
T  48581 taacatcaagtgaacaagaatca 48603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 26
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
T  147 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 49  T
Q  198 caacatcaattgcacaagaatca 220  Q
     || |||| ||| ||||||||||    
T  48 taatatcatttgaacaagaatca 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13445 - 13347
Alignment:
Q  260 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 358  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13445 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 309
Alignment:
Q  433 gatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  385 gatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Original strand, 1701 - 1775
Alignment:
Q  435 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  1701 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 1775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19881 - 19807
Alignment:
Q  435 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  19881 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 19807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 24185 - 24111
Alignment:
Q  435 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  24185 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatg 24111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1304
Alignment:
Q  260 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 359  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  1424 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 1325  T
Q  360 agttggagcacaaatttagca 380  Q
    ||   |||||| |||||||||    
T  1324 agcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 505
Target Start/End: Original strand, 94 - 164
Alignment:
Q  435 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcc 505  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  94 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcc 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6335 - 6261
Alignment:
Q  435 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctcctatg 509  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  6335 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacccactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 41 - 4
Alignment:
Q  435 tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatc 472  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41 tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 147
Target Start/End: Original strand, 1815 - 1863
Alignment:
Q  98 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaa 1863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 175
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3252
Alignment:
Q  106 aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaa 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3183 aaacaccaacaacaattccaattctcttcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaa 3252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 392
Target Start/End: Original strand, 3370 - 3453
Alignment:
Q  309 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 392  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  3370 accaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 342
Target Start/End: Original strand, 54412 - 54630
Alignment:
Q  127 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 226  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||| | || | ||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
T  54412 ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 54511  T
Q  227 aattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatac 322  Q
    | |||||| ||||||| || ||||||| | |||  | |||| |||||||||||  ||||| ||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  54512 atttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatac 54610  T
Q  323 acttattatcaattcatgca 342  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  54611 aattatcatcaattcatgca 54630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 171
Target Start/End: Original strand, 45007 - 45051
Alignment:
Q  127 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattca 171  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  45007 ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaagtcatgattca 45051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45370
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 45370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 1436 - 1363
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1436 atgattatgatgaattctaacccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagcttcactttagttccta 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Original strand, 35816 - 35873
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  35816 ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 35873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 77139 - 76984
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 185  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||  | || |||    
T  77139 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatc 77041  T
Q  186 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 242  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
T  77040 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacat 76984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 76756 - 76699
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  76756 ctaacccccttaccttaattatcagcaattcctagcccaagcttcactttagctccta 76699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 132542 - 132420
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | |||||     
T  132542 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg 132444  T
Q  186 tattagcatcaacaacatcaattg 209  Q
      ||| || |||||||||||||||    
T  132443 acttaacaacaacaacatcaattg 132420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Original strand, 442 - 499
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  442 ctaacccccttacctcagttatcaccaattcctagctcaagcttcactttagctccta 499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193396
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttaccttaa 193396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6443
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttacctta 6443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 878
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttacctta 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9882
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttacctta 9882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13285
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttacctta 13285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57392
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttacctta 57392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
Q  335 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55936
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttacctta 55936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108075
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttacctta 108075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 466
Target Start/End: Original strand, 18015 - 18058
Alignment:
Q  423 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18015 acaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 18058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Original strand, 632 - 689
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  632 ctaacccccttaccataattatcactaattcctagcccaagcttcactttagctccta 689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 1089 - 1028
Alignment:
Q  11 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  1089 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 1028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Original strand, 6999 - 7056
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||||||    
T  6999 ctaacccccttaccataattatcaccaattcctagcccaaccttcactttagctccta 7056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
Q  335 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
Q  335 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 116
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7551
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7522 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 7551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8257
Alignment:
Q  335 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  8216 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 45876 - 45815
Alignment:
Q  11 catcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 72  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  45876 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 45815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 56226 - 56106
Alignment:
Q  267 tttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 364  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | | | ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||     
T  56226 tttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagtta 56127  T
Q  365 gagcacaaatttagcaacaat 385  Q
    |||||| |||||| |||||||    
T  56126 gagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 43708 - 43651
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43708 ctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 43651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 116
Target Start/End: Original strand, 38253 - 38282
Alignment:
Q  87 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38253 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 38282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Original strand, 31357 - 31414
Alignment:
Q  450 ctaacccccttaccttaattatctccaactactagctctagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  31357 ctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta 31414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 209
Target Start/End: Original strand, 2476 - 2532
Alignment:
Q  153 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 209  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2476 atacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 2532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17209
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 17209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 5508 - 5476
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5508 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4346
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4378 atgattatgataaagtctaacccccttacctta 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17336 - 17304
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17336 atgattatgataaagactaacccgcttacctta 17304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 5549 - 5581
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5549 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 5581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34308
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 34308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12418
Alignment:
Q  434 atgattatgataaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 atgattatgataaaaactaacccccttacctta 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University