View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF19766_low_21 (Length: 227)
Name: NF19766_low_21
Description: NF19766
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF19766_low_21 |
 | |
|
| [»] scaffold0084 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold1295 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43567749 - 43567539
Alignment:
| Q |
1 |
tttgatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43567749 |
tttgatccacccattttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
43567650 |
T |
|
| Q |
101 |
cttaaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaaca |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43567649 |
cttaaatttttttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatattctctctaattgttatgcatagaacctgaaaacaaaattaaaagaaaaacaaca |
43567550 |
T |
|
| Q |
201 |
tcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
43567549 |
tcaatcttgtt |
43567539 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29458423 - 29458218
Alignment:
| Q |
1 |
tttgatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29458423 |
tttgatccatccattttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
29458324 |
T |
|
| Q |
101 |
cttaaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaaca |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29458323 |
cttaaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaac-----aacaaaattaaaagaaaaacaaca |
29458229 |
T |
|
| Q |
201 |
tcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
29458228 |
tcaatcttgtt |
29458218 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 7571034 - 7571241
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7571034 |
gatccaccaattttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaaccaattgctt |
7571133 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7571134 |
aaatttctttatatgactttgttataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttatgtatagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacgtca |
7571233 |
T |
|
| Q |
204 |
atcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
7571234 |
atcttgtt |
7571241 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 16665629 - 16665836
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16665629 |
gatccaccaattttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaaccaattgctt |
16665728 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16665729 |
aaatttctttatatgactttgttataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttatgtatagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacgtca |
16665828 |
T |
|
| Q |
204 |
atcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
16665829 |
atcttgtt |
16665836 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 25416518 - 25416725
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25416518 |
gatccaccaattttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaaccaattgctt |
25416617 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
25416618 |
aaatttctttatatgactttgttataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttatgtatagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacgtca |
25416717 |
T |
|
| Q |
204 |
atcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
25416718 |
atcttgtt |
25416725 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 47230858 - 47231064
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47230858 |
gatccaccaatttttccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttaccaatcaaaccaattgctt |
47230957 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47230958 |
aaatttctttatatgactttgttataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttattcatagaacct-aaaacaaaattaaaagaaaaacaacatca |
47231056 |
T |
|
| Q |
204 |
atcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
47231057 |
atcttgtt |
47231064 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5434494 - 5434284
Alignment:
| Q |
1 |
tttgatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5434494 |
tttgatccaccaattttgccacattatccactccattttgaaatataatattgtttatgatattttaaatgcaccatactgttgccaatcaaaccaattg |
5434395 |
T |
|
| Q |
101 |
cttaaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaaca |
200 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5434394 |
ctcaaacttctttacatgactttgctgtaacaaagctctaaaatgttctctttaattgttacgcatagaaactaaaaacaaaattaaaagaaaaacaaca |
5434295 |
T |
|
| Q |
201 |
tcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
5434294 |
tcaatcttgtt |
5434284 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 9934257 - 9934441
Alignment:
| Q |
13 |
attttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgcttaaatttctt |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
9934257 |
attttcccacattatccaccccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaactacaccatattgttagtgatcaaaccaattgcttaaacttatt |
9934356 |
T |
|
| Q |
113 |
tatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaaca |
197 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9934357 |
tacgtgactttgctgtaacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgtatagaacctgaaaacaaatataaaagaaaaaca |
9934441 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 39064091 - 39064211
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
39064091 |
gatccaccaattttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaattaaatcaattgctt |
39064190 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttg |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
39064191 |
aaatttctttatatgactttg |
39064211 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 211
Target Start/End: Original strand, 39064225 - 39064271
Alignment:
| Q |
165 |
atagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39064225 |
atagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacgtcaatcttgtt |
39064271 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 13430396 - 13430603
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13430396 |
gatccaccaattttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaaccaattgctt |
13430495 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13430496 |
aaatttctttatatgactttgttataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttatgtatagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacgtca |
13430595 |
T |
|
| Q |
204 |
atcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
13430596 |
atcttgtt |
13430603 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18885565 - 18885355
Alignment:
| Q |
1 |
tttgatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18885565 |
tttgatccaccaattttcccacattatccaccccacattgaaatataatattgtttctaatattttaaatgtaccatattgttgccaatcaaatcaattg |
18885466 |
T |
|
| Q |
101 |
cttaaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaaca |
200 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18885465 |
cctaaatttctttatgcgactttgctataacaaagctctaaaatgttatctctaattgttatgcatacaacctgaaaacaaaattaaaagaaaaacaaca |
18885366 |
T |
|
| Q |
201 |
tcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
18885365 |
tcaatcttgtt |
18885355 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10792319 - 10792109
Alignment:
| Q |
1 |
tttgatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10792319 |
tttgatccaccaattttcgcacattatccacccaactttgaaatataatattgtttctaatatttcaaatgtaccatattgttgccaataaaaccaattg |
10792220 |
T |
|
| Q |
101 |
cttaaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaaca |
200 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10792219 |
ttcaaacttctttaggtgactttgttgtaacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaaccaaaattaaaagaaaaacaaca |
10792120 |
T |
|
| Q |
201 |
tcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
10792119 |
tcaatcttgtt |
10792109 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 53827340 - 53827547
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
53827340 |
gatccaccaattttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaataaaaccaattgctt |
53827439 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53827440 |
aaatttctttatatgactttgttataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttatgtatagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacatca |
53827539 |
T |
|
| Q |
204 |
atcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
53827540 |
atcttgtt |
53827547 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 211
Target Start/End: Original strand, 2501956 - 2502152
Alignment:
| Q |
15 |
tttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgcttaaatttcttta |
114 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2501956 |
tttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaaccaattgcttaaatttcttta |
2502055 |
T |
|
| Q |
115 |
tgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2502056 |
tatgactttgttataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttatgtatagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacgtcaatcttgtt |
2502152 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20040304 - 20040094
Alignment:
| Q |
1 |
tttgatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20040304 |
tttgatccaccaattttcccacattatctaccccaacttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaaccaattg |
20040205 |
T |
|
| Q |
101 |
cttaaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaaca |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20040204 |
gttaaacttctttacgtgactttgttgtaacaaagctttaaaatgttctctctaattgttatgcataaaacatgaaaacaaaattaaaataaaaacaaca |
20040105 |
T |
|
| Q |
201 |
tcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
20040104 |
tcaatcttgtt |
20040094 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 21629955 - 21630165
Alignment:
| Q |
1 |
tttgatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
21629955 |
tttgatccaccagtttttccacattattcatcctaccttaaaatataatattgtttctaatattttaaatgcatcatattgttgtcagtcaaaccaattg |
21630054 |
T |
|
| Q |
101 |
cttaaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaaca |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21630055 |
cttaaatatctttatgtgactttacgataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacctgaaaacaaaattaaaagaaaaacaaca |
21630154 |
T |
|
| Q |
201 |
tcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
21630155 |
tcaatcttgtt |
21630165 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 46096415 - 46096210
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46096415 |
gatccaccaattttcctacattatccatcctaccttaaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaaccaattgctt |
46096316 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
46096315 |
aaatttctttatatgacttt--tataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttatgtatagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacgtca |
46096218 |
T |
|
| Q |
204 |
atcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
46096217 |
atcttgtt |
46096210 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 46138907 - 46138711
Alignment:
| Q |
13 |
attttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgcttaaatttctt |
112 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46138907 |
attttcctacattatccatcctaccttaaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaaccaattgcttaaatttctt |
46138808 |
T |
|
| Q |
113 |
tatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
46138807 |
tatatgacttt--tataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttatgtatagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacgtcaatcttgtt |
46138711 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 52352925 - 52352718
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52352925 |
gatccaccaattttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaaccaattgctt |
52352826 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
52352825 |
aaatttctttatatgactttgttataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttatgtatagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacgtca |
52352726 |
T |
|
| Q |
204 |
atcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
52352725 |
atcttgtt |
52352718 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 35873471 - 35873263
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35873471 |
gatccaccaattttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaatcaattgctt |
35873372 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaac-aacatc |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35873371 |
aaatttctttatatgactttgttataacgaagctctaaaacgttctctcgtattgttatgtatagaaactaaaaacaaaattaaaagaaaaacaaacatc |
35873272 |
T |
|
| Q |
203 |
aatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
35873271 |
aatcttgtt |
35873263 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 48269386 - 48269181
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48269386 |
gatccatcaatttttccacattattcatcccaccttgaaatataatattgtttatgatattttaaatgcaccatattgttgtcaatcaaaccaattgctt |
48269287 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaa-----ttgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaa |
198 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| ||| |||||| | ||||||||||||| | |||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48269286 |
aaatttttttaaatgac-ttgttataac------caaaaatgttctctcgtattgtcttgtcatgtatagaacctaaaaccaaaattaaaagaaaaacaa |
48269194 |
T |
|
| Q |
199 |
catcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
48269193 |
tatcaatcttgtt |
48269181 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13789428 - 13789221
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13789428 |
gatccaccaattttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaaccaattgctt |
13789329 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13789328 |
aaatttctttatatgactttgttataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttatgtatagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacgtca |
13789229 |
T |
|
| Q |
204 |
atcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
13789228 |
atcttgtt |
13789221 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 25804714 - 25804921
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25804714 |
gatccaccaattttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaaccaattgctt |
25804813 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
25804814 |
aaatttctttatatgactttgttataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttatgtatagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacgtca |
25804913 |
T |
|
| Q |
204 |
atcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
25804914 |
atcttgtt |
25804921 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39626453 - 39626255
Alignment:
| Q |
13 |
attttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgcttaaatttctt |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39626453 |
attttcccacattatccaccccacattgaaatataatattgtttctaatattttaaatgtcccatattgttgccaatcaaatcaattgcctaaatttctt |
39626354 |
T |
|
| Q |
113 |
tatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39626353 |
tatgcgactttgctataacaaagctctaaaatgttatctctaattgttatccatacaacctgaaaacaaaattaaaagaaaaacaacatcaatcttgtt |
39626255 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 22909624 - 22909746
Alignment:
| Q |
14 |
ttttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgcttaaatttcttt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22909624 |
ttttcccacattaaccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgtattatattgttgccaatcaaaccaattgcttaaatttcttt |
22909723 |
T |
|
| Q |
114 |
atgtgactttgctataacaaagc |
136 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22909724 |
acgtgactttgttataacaaagc |
22909746 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 52975172 - 52975275
Alignment:
| Q |
1 |
tttgatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
52975172 |
tttgatccaccaatttttccacattatccatcccaccttaaaatataatattgtttttaatattttaaatgcatcatattgttgtcaatcaaaccaattg |
52975271 |
T |
|
| Q |
101 |
ctta |
104 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
52975272 |
ctta |
52975275 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28846137 - 28845930
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28846137 |
gatccaccaattttcccacattatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaacaaattgctt |
28846038 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatca |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
28846037 |
aaatttctttatatgactttgttataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttatgtatagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacgtca |
28845938 |
T |
|
| Q |
204 |
atcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
28845937 |
atcttgtt |
28845930 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4141276 - 4141066
Alignment:
| Q |
1 |
tttgatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
4141276 |
tttgatccaccagttttcccacattatccatcctaccttaaaatataatattgtttccaatattttaaatgcatcatattgttgtcagtcaaaccaattg |
4141177 |
T |
|
| Q |
101 |
cttaaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaaca |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4141176 |
cttaaatatctttatgtgactttgcgataacaaagctctaaaatgttctctctaattgctatgcatagaacctgaaaacaaaattaaaagaaaaacaaca |
4141077 |
T |
|
| Q |
201 |
tcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
4141076 |
tcaatcttgtt |
4141066 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12278642 - 12278462
Alignment:
| Q |
31 |
tcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgcttaaatttctttatgtgactttgctataa |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12278642 |
tcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaaccaattgcttaaatttctctatgtgactttgttataa |
12278543 |
T |
|
| Q |
131 |
caaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12278542 |
caaagctctaaaatattctctctaattgttatgcttagaacctaaaaacaaaactaaaagaaaaacaacatcaatcttgtt |
12278462 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 208
Target Start/End: Original strand, 916109 - 916286
Alignment:
| Q |
31 |
tcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgcttaaatttctttatgtgactttgctataa |
130 |
Q |
| |
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| T |
916109 |
tcccaccttgaaatataatattttttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaatcaattgcttaaatttctttatgtgattttgatataa |
916208 |
T |
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| Q |
131 |
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208 |
Q |
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| T |
916209 |
caaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacctaagaacaaaactaaaagaaaaacaacatcaatctt |
916286 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10189354 - 10189144
Alignment:
| Q |
1 |
tttgatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
100 |
Q |
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| T |
10189354 |
tttgatccaccagttttcccacattatccatcataccttaaaatataatattgtttctaatattttaaatgcatcatattgttgtcagtcaaaccaattg |
10189255 |
T |
|
| Q |
101 |
cttaaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaaca |
200 |
Q |
| |
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| T |
10189254 |
tttaaatatctttatgtgactttgcgataacaaagctctaaaatgttctctctaattgctatgcatagaacctgaaaacaaaattaaaagaaaaccaaca |
10189155 |
T |
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| Q |
201 |
tcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
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| T |
10189154 |
tcaatattgtt |
10189144 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 37285063 - 37285270
Alignment:
| Q |
4 |
gatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgctt |
103 |
Q |
| |
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|
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| T |
37285063 |
gatccaccaatttttccacattatccattccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgtaccatattgttgccaatcaaaccaattgctt |
37285162 |
T |
|
| Q |
104 |
aaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatca |
203 |
Q |
| |
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| T |
37285163 |
aaatttctttatatgactttgttataacaaaactctaaaatgttctctcgtattgttatgcatagaacctgaaaataaaattaaaagaaaaacaacatca |
37285262 |
T |
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| Q |
204 |
atcttgtt |
211 |
Q |
| |
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| T |
37285263 |
atcttgtt |
37285270 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 37010371 - 37010173
Alignment:
| Q |
13 |
attttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattgcttaaatttctt |
112 |
Q |
| |
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| T |
37010371 |
attttcctacattatccatcccaccttaaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattgttgccaatcaaactaattgcttaaatttctt |
37010272 |
T |
|
| Q |
113 |
tatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaacatcaatcttgtt |
211 |
Q |
| |
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| T |
37010271 |
tatatgactttgttataacaaagctctaaaatgttctctcgtattgttatgtatagaacctaaaaacaaaattaaaagaaaaacaacgtcaatcttgtt |
37010173 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0084 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:
Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14740 - 14530
Alignment:
| Q |
1 |
tttgatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
100 |
Q |
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| T |
14740 |
tttgatccaccaattttcgcacattatccacccaaccttgaaatataatattgtttcgaatatttcaaatgcaccatattgttgccaataaaatcaattg |
14641 |
T |
|
| Q |
101 |
cttaaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaattaaaagaaaaacaaca |
200 |
Q |
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| T |
14640 |
ctcaaacttctttaggtcactttgttgtaacaaagctcaaaaatgttctcgctaattgttatgcatagaacctgaaactaaaattaaaagaaaaacaaca |
14541 |
T |
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| Q |
201 |
tcaatcttgtt |
211 |
Q |
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| T |
14540 |
tcaatcttgtt |
14530 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1295 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:
Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 1236 - 1449
Alignment:
| Q |
1 |
tttgatccatccattttcccacactatccatcccaccttgaaatataatattgtttctaatattttaaatgcaccatattattgccaatcaaaccaattg |
100 |
Q |
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| T |
1236 |
tttgatccaccaattttcgcacattatccacccaaccttgaaatataatattgtttcgaatatttcaaatgcaccatattgttgccaataaaaccaattg |
1335 |
T |
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| Q |
101 |
cttaaatttctttatgtgactttgctataacaaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacttgaaagcaaaatt---aaaagaaaaaca |
197 |
Q |
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| T |
1336 |
ctcaaacttctttaggtgattttgctataataaagctctaaaatgttctctctaattgttatgcatagaacctcaaacccaaattaaaaaaaaaaaaaca |
1435 |
T |
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| Q |
198 |
acatcaatcttgtt |
211 |
Q |
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| T |
1436 |
acatcaatcttgtt |
1449 |
T |
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