View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19776_low_31 (Length: 352)

Name: NF19776_low_31
Description: NF19776
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19776_low_31
NF19776_low_31
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (7-334)||(40146893-40147220)
chr5 (1-334)||(38746631-38746964)
chr5 (7-334)||(213100-213424)
chr5 (10-334)||(27015168-27015491)
chr5 (25-334)||(5057698-5058006)
chr5 (23-334)||(28277963-28278275)
chr5 (26-334)||(27637823-27638131)
chr5 (7-213)||(16642208-16642413)
chr5 (6-333)||(316390-316720)
chr5 (3-334)||(4160262-4160590)
chr5 (13-332)||(35615809-35616125)
chr5 (9-333)||(14689622-14689942)
chr5 (6-216)||(30792871-30793080)
chr5 (13-216)||(30802579-30802782)
chr5 (12-217)||(10055032-10055238)
chr5 (80-279)||(33906294-33906491)
chr5 (220-322)||(16641162-16641263)
chr5 (119-322)||(21205874-21206076)
chr5 (9-89)||(33906585-33906665)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (1-334)||(6954-7286)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (1-334)||(49199679-49200013)
chr3 (1-334)||(6095808-6096142)
chr3 (1-334)||(4569577-4569910)
chr3 (1-334)||(40912963-40913298)
chr3 (24-334)||(34490862-34491172)
chr3 (14-334)||(30235764-30236084)
chr3 (7-334)||(55302174-55302501)
chr3 (1-334)||(36018476-36018810)
chr3 (14-332)||(47303891-47304208)
chr3 (1-301)||(43402032-43402332)
chr3 (7-334)||(54593336-54593663)
chr3 (1-301)||(43403975-43404275)
chr3 (25-334)||(46860120-46860431)
chr3 (24-334)||(41819733-41820040)
chr3 (7-247)||(28074249-28074488)
chr3 (12-334)||(5434087-5434410)
chr3 (13-327)||(34795507-34795819)
chr3 (71-329)||(1683184-1683440)
chr3 (14-235)||(26323821-26324042)
chr3 (3-334)||(35138917-35139254)
chr3 (6-205)||(39127190-39127389)
chr3 (1-83)||(31340501-31340583)
chr3 (237-333)||(26323286-26323381)
chr3 (33-235)||(36796064-36796271)
chr3 (219-333)||(20937501-20937613)
chr3 (116-160)||(31340459-31340503)
chr3 (287-334)||(31340410-31340457)
chr3 (6-40)||(20937374-20937408)
chr3 (249-333)||(39127421-39127503)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (7-334)||(1631941-1632268)
chr2 (7-334)||(45726562-45726888)
chr2 (7-334)||(35447093-35447420)
chr2 (24-334)||(42288319-42288628)
chr2 (7-322)||(17450223-17450537)
chr2 (14-233)||(7450940-7451158)
chr2 (12-334)||(24397701-24398012)
chr2 (24-322)||(33647817-33648115)
chr2 (4-329)||(42261826-42262149)
chr2 (5-329)||(30218250-30218572)
chr2 (33-181)||(40935542-40935690)
chr2 (218-322)||(43730991-43731092)
chr2 (22-54)||(44750240-44750272)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (1-334)||(42435200-42435533)
chr8 (10-334)||(11383621-11383945)
chr8 (7-334)||(44353427-44353751)
chr8 (1-334)||(40221370-40221704)
chr8 (1-334)||(4283172-4283483)
chr8 (72-334)||(40328476-40328738)
chr8 (9-231)||(22976168-22976389)
chr8 (6-321)||(40585355-40585669)
chr8 (27-240)||(2999823-3000037)
chr8 (14-144)||(20686456-20686586)
chr8 (40-320)||(3846045-3846321)
chr8 (220-334)||(18655246-18655359)
chr8 (71-264)||(9633816-9634007)
chr8 (31-223)||(11136796-11136989)
chr8 (33-232)||(40535510-40535707)
chr8 (37-236)||(3817640-3817840)
chr8 (219-322)||(33655526-33655628)
chr8 (85-159)||(10020150-10020224)
chr8 (119-153)||(28461305-28461339)
chr8 (91-159)||(10101543-10101611)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (1-334)||(50674055-50674388)
chr4 (1-334)||(54882646-54882979)
chr4 (7-332)||(26363897-26364222)
chr4 (14-334)||(8665046-8665366)
chr4 (1-269)||(40630610-40630878)
chr4 (3-334)||(50262907-50263238)
chr4 (1-334)||(55085574-55085908)
chr4 (1-334)||(6655582-6655915)
chr4 (24-334)||(12073042-12073351)
chr4 (7-334)||(41964048-41964373)
chr4 (27-334)||(35662094-35662399)
chr4 (7-334)||(27417170-27417487)
chr4 (25-334)||(379028-379337)
chr4 (9-334)||(46703135-46703458)
chr4 (1-334)||(2209334-2209672)
chr4 (14-330)||(33989501-33989816)
chr4 (98-330)||(8647861-8648093)
chr4 (7-273)||(46569816-46570082)
chr4 (9-332)||(22882964-22883287)
chr4 (9-332)||(22934628-22934951)
chr4 (6-321)||(3785721-3786034)
chr4 (14-169)||(10071524-10071679)
chr4 (14-160)||(8653239-8653385)
chr4 (58-329)||(33089582-33089841)
chr4 (116-334)||(12119281-12119496)
chr4 (12-334)||(26699655-26699979)
chr4 (5-329)||(35370553-35370876)
chr4 (32-217)||(38811405-38811590)
chr4 (67-163)||(10071963-10072059)
chr4 (5-333)||(35369652-35369973)
chr4 (6-205)||(25723554-25723753)
chr4 (78-333)||(41961110-41961368)
chr4 (264-334)||(40632334-40632404)
chr4 (1-144)||(47514900-47515044)
chr4 (77-303)||(34112314-34112539)
chr4 (28-130)||(32091222-32091326)
chr4 (33-141)||(22629290-22629399)
chr4 (294-334)||(41639345-41639385)
chr4 (78-144)||(6719289-6719355)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (7-334)||(11348330-11348657)
chr1 (1-334)||(29135874-29136206)
chr1 (1-334)||(37879120-37879453)
chr1 (11-334)||(42298184-42298507)
chr1 (5-334)||(13547298-13547627)
chr1 (5-334)||(13549209-13549538)
chr1 (1-334)||(193238-193570)
chr1 (7-334)||(34603208-34603534)
chr1 (1-334)||(37033282-37033611)
chr1 (23-334)||(7482441-7482751)
chr1 (7-334)||(47255549-47255870)
chr1 (26-334)||(37167948-37168256)
chr1 (7-329)||(19754123-19754448)
chr1 (7-322)||(34602561-34602875)
chr1 (28-334)||(47114825-47115130)
chr1 (28-334)||(28242041-28242347)
chr1 (7-327)||(19752318-19752637)
chr1 (6-329)||(41135451-41135773)
chr1 (150-322)||(31925927-31926099)
chr1 (12-329)||(6808083-6808399)
chr1 (6-264)||(9109680-9109939)
chr1 (28-333)||(22078995-22079278)
chr1 (7-143)||(31928208-31928337)
chr1 (70-332)||(16216709-16216966)
chr1 (157-234)||(4535783-4535861)
chr1 (168-305)||(12318720-12318856)
chr1 (221-334)||(25651931-25652044)
chr1 (114-159)||(3331283-3331328)
chr1 (249-329)||(3331428-3331505)
chr1 (260-332)||(10157501-10157571)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (7-334)||(6431603-6431930)
chr7 (27-334)||(2389934-2390241)
chr7 (1-334)||(29608367-29608695)
chr7 (7-334)||(4512599-4512925)
chr7 (1-332)||(6360123-6360454)
chr7 (7-334)||(34310925-34311253)
chr7 (1-334)||(48599543-48599866)
chr7 (1-334)||(2361181-2361513)
chr7 (7-334)||(4508915-4509233)
chr7 (7-334)||(4510757-4511075)
chr7 (7-332)||(22269606-22269929)
chr7 (27-334)||(3258647-3258953)
chr7 (12-334)||(22328607-22328931)
chr7 (7-190)||(32358189-32358372)
chr7 (158-334)||(8359526-8359703)
chr7 (1-115)||(30814391-30814505)
chr7 (31-292)||(5116290-5116551)
chr7 (218-333)||(1360364-1360479)
chr7 (83-154)||(22552826-22552897)
chr7 (116-291)||(43363667-43363839)
chr7 (71-141)||(37545308-37545379)
chr7 (192-332)||(23794039-23794176)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (1-334)||(3808918-3809251)
chr6 (10-334)||(17762622-17762948)
chr6 (9-334)||(21593300-21593623)
chr6 (25-334)||(5043278-5043586)
chr6 (27-334)||(2973148-2973456)
chr6 (11-334)||(26830333-26830656)
chr6 (73-334)||(603289-603550)
chr6 (6-334)||(22425037-22425363)
chr6 (82-279)||(17757789-17757988)
chr6 (43-235)||(26800438-26800630)
chr6 (4-267)||(25072814-25073076)
chr6 (213-333)||(5741001-5741120)
chr6 (283-333)||(25073475-25073525)
chr6 (1-47)||(26661575-26661621)
chr6 (1-47)||(26767546-26767592)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (1-334)||(80492-80825)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (1-329)||(11184-11512)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (7-334)||(18212-18536)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (4-329)||(490661-490984)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (6-332)||(1609-1943)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 40146893 - 40147220
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40146893 tgacccatttgttggttaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 40146992  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40146993 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaatggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 40147092  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40147093 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 40147192  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40147193 ttagattctagagttgggaaacaattgt 40147220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 38746631 - 38746964
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38746631 attctttgactcatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 38746730  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38746731 gaggttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaagaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 38746830  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38746831 cacgtgagtggagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttattgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 38746930  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38746931 tgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 38746964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 213100 - 213424
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  213100 tgacccattttttgggtaagcttgatgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 213199  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttgg-agaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  213200 caaagcttcaagatgtgaatcttgggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacat 213299  T
Q  206 gagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||||||||    
T  213300 gagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaag----ggttctcttttgggg 213395  T
Q  306 gttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  213396 gttagattctagagttgggaaacaattgt 213424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Original strand, 27015168 - 27015491
Alignment:
Q  10 cccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaa 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27015168 cccatttgt-gggtatgcttggcgaatctaatggaaatcaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggatcaa 27015266  T
Q  110 agcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27015267 agcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagaatcatggggttgggaaacacatgagt 27015366  T
Q  210 ggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggtta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27015367 ggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtta 27015466  T
Q  310 gattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  27015467 gattctagagttgggaaacaattgt 27015491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 25 - 334
Target Start/End: Original strand, 5057698 - 5058006
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtga 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5057698 agctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggatcaaagcttcaagatgtga 5057797  T
Q  125 atcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtg 224  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5057798 atctttgagaaccaaaagaggg-gcttttgggaaaaaggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttgtg 5057896  T
Q  225 agcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  5057897 agcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgga 5057996  T
Q  325 aaacaattgt 334  Q
    ||||||||||    
T  5057997 aaacaattgt 5058006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Original strand, 28277963 - 28278275
Alignment:
Q  23 taagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28277963 taagcttggtgaatctcaaggaaactaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgt 28278062  T
Q  123 gaatcttggagaaccaaaagagggag-ctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtctttt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  28278063 gaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagactatt 28278162  T
Q  222 gtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagtt 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28278163 gtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagattgttagtgaaatcaaatgctaagggttggctctcttttaggggttagattctagagtt 28278262  T
Q  322 gagaaacaattgt 334  Q
    | |||||||||||    
T  28278263 gggaaacaattgt 28278275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27638131 - 27637823
Alignment:
Q  26 gcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27638131 gcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaaggttttagatactaaaggttgagaatctttgggtgaggttcaaag-ttcaagatgtgaa 27638033  T
Q  126 tcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27638032 tcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgcatttt-gggaagattcatggggttaggaaacacatgagtgaagagtcttttatga 27637934  T
Q  226 gcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaa--agaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttga 323  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||   |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  27637933 gcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagagaagatccttagtgaaatcaaagactaaaagtttgttctcttttgggggttagatgctagagttgg 27637834  T
Q  324 gaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||    
T  27637833 gaaacaattgt 27637823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16642413 - 16642208
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16642413 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagcacttttagggtatttagatactaaaggttgatggtctttgggtgaggt 16642314  T
Q  106 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacaca 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16642313 tcaaagcttcaagaagtgaatcttgaagaaccaaaagagg--gctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggacagattcatggggttaggaaacaca 16642217  T
Q  205 tgagtggag 213  Q
    |||||||||    
T  16642216 tgagtggag 16642208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 333
Target Start/End: Original strand, 316390 - 316720
Alignment:
Q  6 ttgacccatttgttgggtaagcttggt------gaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgg 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||      ||||||||||||||| ||||||   ||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  316390 ttgacccatttgttgagtaagcttggtaatggtgaatctcatggaaactaaaggagagaacttttattgtacttagatactaaaggttgagggtctttgg 316489  T
Q  99 gtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttggg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | | |||| || ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  316490 gtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagggggggctcttg-ggagagggttggtgccttttggggagagattcataaggttggg 316588  T
Q  198 aaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctc 297  Q
    |||||||| |   ||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||| || |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  316589 aaacacatcaaaagagagtc-tttgtgagcaactt-ggtgaatcttgggagaccaaaagagaaaatcc-tag-gaaatcaaaggctaagggttggttctc 316684  T
Q  298 ttttgggggttagattctagagttgagaaacaattg 333  Q
    |||||||||||||||| || |||||  |||||||||    
T  316685 ttttgggggttagattttaaagttggaaaacaattg 316720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 334
Target Start/End: Original strand, 4160262 - 4160590
Alignment:
Q  3 tctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtg 101  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  4160262 tctttaacctattttttgagtgagctcggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacatttagggtatttagatactaaagtttgagggt-tttgggtg 4160360  T
Q  102 aggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaa 200  Q
    | |||||||| || |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || | || | | || |||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  4160361 atgttcaaagtttaaagaagtgaatcctggagaactaaaagagggggctcttgggagagggtaag-tgtcttttggggagagattcatagggttgggaa- 4160458  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  4160459 cacgtaagtggagagtcatttgtgagcaactagggtgaatcttgggaaaccaaaagagaagatccttag-gtaattaaaggctaagggttggttctcttt 4160557  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4160558 tgggggttagattc-agagttgagaaacaattgt 4160590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Original strand, 35615809 - 35616125
Alignment:
Q  13 atttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaag 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35615809 atttgttgcgtaagcttggtgaatctccttgaaaccaaatgaaaaaacttttagagtatttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggttcaaag 35615908  T
Q  112 cttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |  |    
T  35615909 cttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggactcttg-ggaaaggggtgatgccttttggggagagattcatggagttgagaaacacataaaag 35616007  T
Q  211 gagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttag 310  Q
     |||||| ||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||  |||||| | |  ||||||||| | | || |||| ||||||||| | ||||||    
T  35616008 aagagtc-tttgtaatcaactttggtgagtcttgggaaaccaaaagcgaagatcatca-agaaatcaaaggct-agagttgattctctttt-gtggttag 35616103  T
Q  311 attctagagttgagaaacaatt 332  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  35616104 attctagagtttggaaacaatt 35616125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14689942 - 14689622
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttc 107  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||||| | |||||| || ||||||| |||| ||||    
T  14689942 acccatttgttgagtaggcttggtgaatctcatggaaactaaaggagaaaacttttagggcatttagatagtgaaggttaagggtctttgagtgatgttc 14689843  T
Q  108 aaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatga 207  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| |||||| || |||||||||| | |||||| || |  |||||||||||| |    
T  14689842 aaagtttcaagatgtgaattttggagaaccaaaagaaggggttcttgtg-aaagggttggtgccttttggag-agattcgtgagaatgggaaacacataa 14689745  T
Q  208 gtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggt 307  Q
      |||||||  |||||||||||||| |   ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||| ||||     
T  14689744 aaggagagt-atttgtgagcaacttagataagtcttgggacaccaaaagaaaagatccttag-aaaatcaaaggctaggggttggttctctttt-gggga 14689648  T
Q  308 tagattctagagttgagaaacaattg 333  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14689647 tagattctagagttgtgaaacaattg 14689622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 216
Target Start/End: Original strand, 30792871 - 30793080
Alignment:
Q  6 ttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgagg 104  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  30792871 ttgacccatttgttaagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagtaaacttttagggtaattagatactaaaggttgagggtctttaggtgatg 30792970  T
Q  105 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacac 203  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |  ||| ||| ||||| || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  30792971 ttcaaagcttcaagatgt-tatcttggagaaccaaaatatgtggct-ttgggaaaa-ggttggtgccttttggggagatattcatggggttgggaaacac 30793067  T
Q  204 atgagtggagagt 216  Q
    |||||| ||||||    
T  30793068 atgagtagagagt 30793080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Original strand, 30802579 - 30802782
Alignment:
Q  13 atttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaag 111  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30802579 atttgttgagtacgcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggtatttagatattctaggttgagggtctttaggtgaggttcaaag 30802678  T
Q  112 cttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtg 210  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30802679 cttcatgatgt-tatcttagagaaccaaaagaggaggctcttg-ggaaagggtttgtgccttttggggagagattcatggggttagaaaacacatgagtg 30802776  T
Q  211 gagagt 216  Q
    ||||||    
T  30802777 gagagt 30802782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10055238 - 10055032
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaa 110  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||| ||  || |||||||||| ||||  || |||||||||| ||||||    
T  10055238 catttgttgagtaagtttggtgaatctcatagaaatcaaatgatggaacatttagagtacttggatactaaagattgaaggtttttgggtgagattcaaa 10055139  T
Q  111 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||  || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10055138 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagagggctcttg-ggaaaggtttggtgccttatggggagagattcacggggttgggaaacacatgagt 10055040  T
Q  210 ggagagtc 217  Q
     |||||||    
T  10055039 agagagtc 10055032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33906491 - 33906294
Alignment:
Q  80 aaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggg 179  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | | |||| || ||||||||||||    
T  33906491 aaaggttgagggtctttgagtgaggttcgaagcctcaaaatgtgaatcttgtagaaccaaaaaagggggctcttg-ggagagggttggtgccttttgggg 33906393  T
Q  180 a-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaa 278  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33906392 agagattcatggggttgagaaacacatcaaaggagagac-ttagtgagcaacttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaa 33906295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16641263 - 16641162
Alignment:
Q  220 ttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagag 319  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16641263 ttgtgaacaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatacttaaa-aaatcaaaggctaaaggttggttctcttttggggattagattctagag 16641165  T
Q  320 ttg 322  Q
    |||    
T  16641164 ttg 16641162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21206076 - 21205874
Alignment:
Q  119 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtc 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| || |||||| || || |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  21206076 atgtgaatcttagagaaccaaaagatggggttctt-tggaaagggttggtgtctttttcggagaggttcatagggttgggaaacacatgagtgaggagtc 21205978  T
Q  218 ttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctag 317  Q
     ||||| || || ||||| || | ||  ||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||| | |    
T  21205977 atttgtcagaaatttgggtgaattttaggaaactaaaagtgaagaacctta-tgaaatcaaagactaaggattggttctcttttgagggttagattatgg 21205879  T
Q  318 agttg 322  Q
    |||||    
T  21205878 agttg 21205874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 33906665 - 33906585
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgag 89  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33906665 acccatttgttgaacaagcttggtgaatctcat-gaaaccaaagaagagaacttttagggtatttagatattaaaggttgag 33906585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 6954 - 7286
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6954 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 7053  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7054 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaa 7153  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7154 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 7253  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7254 tgggggttagattctagagctg-gaaacaattgt 7286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 49200013 - 49199679
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49200013 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 49199914  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49199913 gaggttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 49199814  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttggg-cgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctctt 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  49199813 catatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctctt 49199714  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49199713 ttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 49199679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6096142 - 6095808
Alignment:
Q  1 attctttgacccattt-gttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttggg 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6096142 attctttgacccattttgttgggaaagcttggtgaatctcatggaaatcagaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggg 6096043  T
Q  100 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6096042 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttttgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaa 6095943  T
Q  200 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctctt 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  6095942 acacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaaaggttggttctctt 6095843  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6095842 ttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 6095808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 4569577 - 4569910
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4569577 attctttgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 4569676  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4569677 gaggttcaaagcttcaagatgtaaatcttggagaatcaaaagagggggctcttgggaaaagggggtgtgcctattggggaagattcatggggttgggaaa 4569776  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4569777 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagatgatctttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 4569876  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4569877 tggtggttagattctagagttggaaaacaattgt 4569910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 40912963 - 40913298
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaa-gcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttggg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40912963 attctttgacccatttgttgggtaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggggacttttagggttttagatactaaaggtttagggtctttggg 40913062  T
Q  100 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggg-gaagattcatggggttggga 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40913063 tgaggttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcctttttggagaagattcatggggttggga 40913162  T
Q  199 aacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctct 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40913163 aacacatgagtggagagtcatttgtgagcaaattgggtgagtcttgtgaaagcaaaagagaagatccttagtgaaattaaaggttaagggttggttctct 40913262  T
Q  299 tttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40913263 tttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 40913298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 24 - 334
Target Start/End: Original strand, 34490862 - 34491172
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34490862 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 34490961  T
Q  124 aatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  34490962 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggagttgaaaaacacatgagtggagagtcatttgt 34491061  T
Q  224 gagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttga 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34491062 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgg 34491161  T
Q  324 gaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||    
T  34491162 gaaacaattgt 34491172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 30235764 - 30236084
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30235764 tttgttgggtaagcttggtgaatctcaatgaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagct 30235863  T
Q  114 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30235864 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaatattcatggggttggaaaacacaagagtggag 30235963  T
Q  214 agtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagatt 313  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30235964 agtcatttgtgagcaagttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcgaaggctaatgattggttctcttttgggggttagatt 30236063  T
Q  314 ctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  30236064 ctagagttgggaaacaattgt 30236084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 55302501 - 55302174
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  55302501 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatttcattgaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaagttgagggtctttggatgaggtt 55302402  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||    
T  55302401 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgccttttgggaaaaattcatgaggttggaaaacacatg 55302302  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||    
T  55302301 agtggagattcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaggggttggttctcttttgtagg 55302202  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  55302201 ttagattatagagttgggaaacaattgt 55302174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 36018476 - 36018810
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttggg 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||     
T  36018476 attctttgacccatttgttggataagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaactttcagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgga 36018575  T
Q  100 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36018576 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgggaaaagggttggtgccttttggggaagatccatggggatgggaa 36018675  T
Q  200 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctctt 299  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||    
T  36018676 acacatgaatggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatggattggttctctt 36018775  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36018776 ttggggtttagattctagagttgggaaacaattgt 36018810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Original strand, 47303891 - 47304208
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  47303891 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagagaacttttatggttttagatactaaatgttgaaggtctttgggtgaggttcaaagct 47303990  T
Q  114 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47303991 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggag 47304090  T
Q  214 agtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagatt 313  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47304091 agt-ttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaatatccttagtgaaatcaaaaactaagggttggttctcttttgggggttagatt 47304189  T
Q  314 ctagagttgagaaacaatt 332  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  47304190 ctagagttggaaaacaatt 47304208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43402332 - 43402032
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43402332 attctttgactcatttgttgggtgagcttggtgaatcttatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 43402233  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43402232 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 43402133  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  43402132 cacatgagtggagaatcatttgtgaacaacttgggtaagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttt 43402033  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  43402032 t 43402032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 54593336 - 54593663
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggt 105  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  54593336 tgacccatttgttcgaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtccttgggtgaggt 54593435  T
Q  106 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  54593436 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtaccttttggggaagattcatggggatggaaaacacat 54593535  T
Q  206 gagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  54593536 gagtggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggg 54593634  T
Q  306 gttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54593635 gttagattctagagttgggaaacaattgt 54593663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43404275 - 43403975
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43404275 attctttgacccatttgttgggtgagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggttttagatactaaaagttgagggtctttgggt 43404176  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43404175 gaggttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaa 43404076  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  43404075 cacatgagtggagagtcatttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttt 43403976  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  43403975 t 43403975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 334
Target Start/End: Original strand, 46860120 - 46860431
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46860120 agcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtg 46860219  T
Q  124 aatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46860220 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatagggatgggaaacacatgagtggagagtcatttgt 46860319  T
Q  224 gagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagtta--agggttggttctcttttgggggttagattctagagtt 321  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46860320 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaagactaagagggttggttctcttttgggggttagattctagagtt 46860418  T
Q  322 gagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||    
T  46860419 gagaaacaattgt 46860431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 24 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41820040 - 41819733
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41820040 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagataacttttaggtttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 41819941  T
Q  124 aatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgt 223  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41819940 aatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcctttt-gggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagactcatttgt 41819842  T
Q  224 gagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttga 323  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  41819841 gagcaacttgagtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatcttta-tgaaatc-aaagctaagggttggttctcttttagcggttagattctagagttgg 41819744  T
Q  324 gaaacaattgt 334  Q
    |||| ||||||    
T  41819743 gaaataattgt 41819733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Original strand, 28074249 - 28074488
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28074249 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 28074348  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28074349 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaatagt-tggtgcgttttggggaagattcatggggatgggaaacacatg 28074447  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtga 247  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  28074448 agtggagagtctattgagagaaacttaggtgagtcttgtga 28074488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5434410 - 5434087
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||| ||| || ||||||| | |||||| |||    
T  5434410 catttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaggatatttagataccaaaagttaagggtctttgagggaggtttaaa 5434311  T
Q  111 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagt 209  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5434310 gcttcaagatgtaaatcttatagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagtgttttttagggagagattcatggggttaggaaacacatgagt 5434211  T
Q  210 ggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggtta 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||   ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  5434210 ggagagtcttttgtgagcaagttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatcctta-tgtaatcaaagactaaagattgattctcttttgggggtta 5434112  T
Q  310 gattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  5434111 gattatagagttgggaaacaattgt 5434087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 327
Target Start/End: Original strand, 34795507 - 34795819
Alignment:
Q  13 atttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaag 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  34795507 atttgttgggtaagtttggtgaatcctatgaaaaccaaaggagagatcttttagggtatttagatactaaaggttgatggtcgttgggtgatgttcaaag 34795606  T
Q  112 cttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtg 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| | | | |||  | |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |  |    
T  34795607 cttcaagatctgaatcttggagaaccagaagagggggttctag-ggagaggtttcatgccttttgaggagagattcatggggttgggatacacatcaaag 34795705  T
Q  211 gagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttag 310  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||     
T  34795706 gagagt-ttttgtaagaaacttgggtgagtcttgggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggctaagggatggttctctttt-gtggttaa 34795802  T
Q  311 attctagagttgagaaa 327  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  34795803 attctaaagttgggaaa 34795819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 329
Target Start/End: Original strand, 1683184 - 1683440
Alignment:
Q  71 ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaa-gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatg 169  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||  | |||||| || ||    
T  1683184 ttagaaactaaaggttgagggtctttgggtgagattcaaatgtttcaa-atgtgaatcttggagaaccaaaagaga-aggtttttcggaaagggttggtg 1683281  T
Q  170 ccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatcctta 268  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1683282 cattttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgagtggataatcatttatgagcaactttggtgagtcttgtgagaccaaaagagaagatcctta 1683381  T
Q  269 gtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaaca 329  Q
    |  |||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1683382 g-aaaatcaaaggctaagggttggttatctttt-ggggttagaatctagagttgggaaaca 1683440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26324042 - 26323821
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagc 112  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  26324042 tttgttgagtaagtttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttaagatatttagatactaaaggttgagggtcattgggtgaagttcaaagc 26323943  T
Q  113 ttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtgg 211  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||| ||| | |||||| || ||| ||||  | | ||||||||||||||| ||||||||| |  ||    
T  26323942 ttcaagatgtaaatcttgaagaatcaaaagagagggctattg-ggaaagggttggtgcattttcagcagagattcatggggttgagaaacacatcaaagg 26323844  T
Q  212 agagtcttttgtgagcaacttggg 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  26323843 agagtc-tttgtgagcaacttggg 26323821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35139254 - 35138917
Alignment:
Q  3 tctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtg 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||    
T  35139254 tctttgacccatttgttaagtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagggtactttttgggtatttagatactaaacgttgagggtctttagatg 35139155  T
Q  102 aggttcaaagctt-------caagatgtgaatcttggagaaccaaaag-agggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatgggg 192  Q
    ||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||| |  | | ||||  | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  35139154 aggttcaaaactttaagatgtaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaaatgggttctt-cggaaagggttgatgccttttgaggagagattcatgagg 35139056  T
Q  193 ttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaat-caaaagttaagggttg 291  Q
    |||| ||||| || |   ||||||| ||| |||||||||||   |||||||| || ||||||| | ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||     
T  35139055 ttggaaaacaaatcaaatgagagtc-tttatgagcaacttgaatgagtcttgggagaccaaaatagaagatccttag-gaaataaaaaagctaagggtta 35138958  T
Q  292 gttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
     ||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  35138957 attctctttt-ggggttaaattttaaagttg-gaaacaattgt 35138917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Original strand, 39127190 - 39127389
Alignment:
Q  6 ttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgagg 104  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||| |||||    
T  39127190 ttgactcatttgttgagtaagcttagtgaatctcatggaaatcaacggagagaacttttagggtatttacatactaaaggtttggggcctttgg-tgagg 39127288  T
Q  105 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacac 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||  |||||| ||| || | || |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39127289 ttcaaagcttcaagatatgaatcttagagaactaaaataggggactcttg-gaagagagttggtgcctttttgggagagattcatgaggttgggaaacac 39127387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 31340583 - 31340501
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaag 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  31340583 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatcttatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaag 31340501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26323381 - 26323286
Alignment:
Q  237 gagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattg 333  Q
    |||||||| || ||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26323381 gagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag-gaaatcaaaagctaagggttggttctcttttgagggttagattttagagttgggaaacaattg 26323286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Original strand, 36796064 - 36796271
Alignment:
Q  33 gaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa----tc 127  Q
    |||||||||||||| |||||||   |||||||||||   ||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    |     
T  36796064 gaatctcatggaaatcaaaggagataacttttagggaacttagaaactaaaggttgaaggtctttagatgaggttcaaagcttcaagatgtaaacctctt 36796163  T
Q  128 ttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgag 226  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| |||||| ||  | |   ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| || || ||    
T  36796164 ttgaagaaccaaaagaggggactctt-tgaaaaaggtcggttgattttggggagagattcacggggtcgggagacacaagagtggagagtcattggttag 36796262  T
Q  227 caacttggg 235  Q
    |||||||||    
T  36796263 caacttggg 36796271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 333
Target Start/End: Original strand, 20937501 - 20937613
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctaga 318  Q
    |||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20937501 tttgtgacaaacttgggtgattcttgggagaccaaaagagaagattcttag-gaaatcaaaggataaaggttggttctcttttgggag-tagattctaga 20937598  T
Q  319 gttgagaaacaattg 333  Q
    ||||||||| |||||    
T  20937599 gttgagaaataattg 20937613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31340503 - 31340459
Alignment:
Q  116 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31340503 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaa 31340459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31340457 - 31340410
Alignment:
Q  287 ggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31340457 ggttggtgcccttttaggggttagattctagagttgggaaacaattgt 31340410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 40
Target Start/End: Original strand, 20937374 - 20937408
Alignment:
Q  6 ttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctca 40  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20937374 ttgacccattagttgggtaagcttggtgaatctca 20937408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 333
Target Start/End: Original strand, 39127421 - 39127503
Alignment:
Q  249 accaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattg 333  Q
    ||||||||| || | |||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  39127421 accaaaagagaatacccttag-gaaatcaaaggctaagggttagttctctttt-gtggttaaattctagagtttggaaacaattg 39127503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1632268 - 1631941
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1632268 tgacctatttgttgtgtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggtt 1632169  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1632168 caaagcttcaagatgtgaatcttggggaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 1632069  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1632068 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 1631969  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1631968 ttagattctagagttgggaaacaattgt 1631941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 45726562 - 45726888
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45726562 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 45726661  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45726662 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttg-ggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 45726760  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45726761 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 45726860  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||    
T  45726861 ttagattctagggttaggaaacaattgt 45726888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35447420 - 35447093
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35447420 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtatttgtgtgaggtt 35447321  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttg-gagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35447320 caaagcttcaagatgtgagtcttgagagaaccaaaagaggg-gctcttgtgaaaagggttggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaaacacat 35447222  T
Q  206 gagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  35447221 gagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggg 35447122  T
Q  306 gttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35447121 gttagattctagagttgggaaacaattgt 35447093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 24 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42288628 - 42288319
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42288628 aagctaggtgaatctcatggaaaccaaatgagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtg 42288529  T
Q  124 aatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgt 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42288528 aatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggg-aagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgt 42288430  T
Q  224 gagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttga 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  42288429 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttcgggtttagattctagagttgg 42288330  T
Q  324 gaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||    
T  42288329 gaaacaattgt 42288319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Original strand, 17450223 - 17450537
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17450223 tgacccatttgttgggcaaacttagagaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggtt 17450322  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17450323 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttg-ggaaagggttggtgccctttgtgaaagattcatggggatgggaaacacatg 17450421  T
Q  207 agtgga-gagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    || | | |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||    
T  17450422 agcgaaggagtcaattgtgagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattag-gaaatcaaaggctaagggttgattctctattgggg 17450520  T
Q  306 gttagattctagagttg 322  Q
    ||| |||||||||||||    
T  17450521 gttggattctagagttg 17450537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Original strand, 7450940 - 7451158
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7450940 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaacaaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttg-gcgtctttgggtgaggttcaaagct 7451038  T
Q  114 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggag 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7451039 tcaggatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctttggtaaagggttgatgacttttggagaagatttatggggttggaaaacacatgagtggag 7451138  T
Q  214 agtcttttgtgagcaacttg 233  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  7451139 agtcatttgtgagcaacttg 7451158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 334
Target Start/End: Original strand, 24397701 - 24398012
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaa 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  24397701 catttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaa--------cttttagggtatttagatactaaaggttgacggtctttgtgtgaggttcaaa 24397792  T
Q  111 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  24397793 gcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttagggagagactcatcgggctggtaaacacatgagt 24397892  T
Q  210 ggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggtta 309  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||   |||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  24397893 ggagagtcatttgtgaccaatttgggttagtcttgtgaaaccaaaagagaatatcctta--gaaagtcaaagctaagggttggttc---tttgggggtta 24397987  T
Q  310 gattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  24397988 gattatagagttgggaaacaattgt 24398012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 322
Target Start/End: Original strand, 33647817 - 33648115
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgt 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33647817 aagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagagaacttttagagtatttagatactaaaggttgaaggtctttgggtgaggttcaaagtttcaagatgt 33647916  T
Q  123 gaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtctttt 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  33647917 gaatcttggagaatcaaaagaggaggctcttgggaaaagggttggtgccttttgaggagagattcacgaggttggaaaacatatgagtagagagtcattt 33648016  T
Q  222 gtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagtt 321  Q
    || ||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33648017 gttagctacttaggcgagtcttataaaaccaaaagagaagatccttagggaaatcaaa--gcaagggttaattatcttttgggggttagattctagagtt 33648114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42262149 - 42261826
Alignment:
Q  4 ctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtga 102  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42262149 ctttgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatgagaaccaaaggagggagcttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtga 42262050  T
Q  103 ggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| || ||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  42262049 ggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctt-tggagagggttggtgcctttaggtgagagattcatgggattgggaaac 42261951  T
Q  202 acatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctctttt 301  Q
    |||| |  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||| |||| ||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  42261950 acatcaaaggagagt-ttttatgagcaacttgggcgagtcttacgagaccaaaagagtatatcattag-gaaatcaaaagctacggattggttc-ctttt 42261854  T
Q  302 gggggttagattctagagttgagaaaca 329  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42261853 aggggttagaatctagagttgggaaaca 42261826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 30218572 - 30218250
Alignment:
Q  5 tttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgag 103  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  30218572 tttgacctattcgttgggtaatcttggtgaatattatggaactcaaaggagggaacttttagggtatttagatactatatgttgagggtctttgggtgag 30218473  T
Q  104 gttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaaca 202  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||  | | |||  || | | || | |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30218472 gttcaaaacatcaaaatgtgaatcttggacaaccaaaaatgagggcttatg-ggagagagttagtgccttttggggagagattcatggggttgggaaaca 30218374  T
Q  203 catgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttg 302  Q
    ||  |  ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    ||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  30218373 caccaaaggagaatc-tttgtgagcaacttgagtgagtcttgcgaaaccaaaag-ggggatccttag-gaaatcaaaagctaaatattggttctcttttg 30218277  T
Q  303 ggggttagattctagagttgagaaaca 329  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30218276 ggggttaggctctagagttgggaaaca 30218250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40935690 - 40935542
Alignment:
Q  33 gaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttgg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||   | | |||||||   ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||  || | |||||||||| ||    
T  40935690 gaatctcatggaaaccaaaggagagaccgtttagggaacttagaaactaaaggttgagggcctttgggagagattcaaagtgtccaaatgtgaatctagg 40935591  T
Q  132 agaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaa 181  Q
    |||||||||||| |  ||||||| | |||||| || ||||| ||||||||    
T  40935590 agaaccaaaagatgaggctcttg-ggaaagggttggtgcctattggggaa 40935542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 322
Target Start/End: Original strand, 43730991 - 43731092
Alignment:
Q  218 ttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctag 317  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | || |||| ||| |||||||||   ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  43730991 ttttgtgagcaatttgggtgaatcttgggaaaccaaaatagaatatccgtag-gaaatcaaagtctaaaggttggtt-tctttt-ggggttaaattctag 43731087  T
Q  318 agttg 322  Q
    |||||    
T  43731088 agttg 43731092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 54
Target Start/End: Original strand, 44750240 - 44750272
Alignment:
Q  22 gtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaagga 54  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44750240 gtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaagga 44750272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42435533 - 42435200
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42435533 attctttgacccatttgttcggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 42435434  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42435433 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaaaggttggtgacttttggggaagattcatggggttgggaaa 42435334  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42435333 catatgaatggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 42435234  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42435233 tgagggttagattctagagttggtaaacaattgt 42435200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Original strand, 11383621 - 11383945
Alignment:
Q  10 cccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaa 109  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11383621 cccatttgttaggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaa 11383720  T
Q  110 agcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  11383721 agcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaagggttggtgccttttgaggaagattcatggggttgggaaatacataagt 11383820  T
Q  210 ggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggtta 309  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11383821 ggaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggtta 11383920  T
Q  310 gattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||    
T  11383921 gattctagagttgggaaataattgt 11383945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 44353427 - 44353751
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44353427 tgactcatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 44353526  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
     ||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  44353527 taaaacttcaaga---gaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaagagggttggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacatg 44353623  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  44353624 agtggagagtcatcggtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 44353723  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44353724 ttagattctagagttgggaaacaattgt 44353751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 40221370 - 40221704
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatga-aacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttggg 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||     
T  40221370 attctttgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccataggaggggaacttttagggtttttgatactaaaggtggaaggtctttgga 40221469  T
Q  100 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaa 199  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221470 tgaggtttagaacttcaagatgtgaatcttcgagaaccaaaatagggggctcttgggaaaggggttagtgccttttggggaagattcatggggttgggaa 40221569  T
Q  200 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctctt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  40221570 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctctt 40221669  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40221670 ttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 40221704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 4283172 - 4283483
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4283172 attctttgacccatttgttgtgtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 4283271  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||                      |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4283272 gaggttcaaagcttcaagatgtggatcttggagaaccaaaagagggggct----------------------tttgggaaagattcatggggttgggaaa 4283349  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4283350 cacatgagtggaaagtcttttgtgagaaacttggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 4283449  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4283450 tgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 4283483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 72 - 334
Target Start/End: Original strand, 40328476 - 40328738
Alignment:
Q  72 tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgcc 171  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||    
T  40328476 tagatactaaagatttagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggttcttgggaaaagggttggtgcc 40328575  T
Q  172 ttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtg 271  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40328576 ttttagggaagattcatggggatgggaaacacatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatctttagtg 40328675  T
Q  272 aaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40328676 aaatcaaaggctatgagttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 40328738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 22976168 - 22976389
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttca 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22976168 acccatttgttgggtaagcttagtgaatctcttcgaaaccaaaggagtgaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttca 22976267  T
Q  109 aagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22976268 aagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggaggctcttggaaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt-gaaaacacatgag 22976366  T
Q  209 tggagagtcttttgtgagcaact 231  Q
    || ||||||| ||||||||||||    
T  22976367 tgaagagtctattgtgagcaact 22976389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 40585355 - 40585669
Alignment:
Q  6 ttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgagg 104  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40585355 ttgacccatttgttgcgtgagcttgattaatctcatgaaaaccaaaggaaataacttttagagtatttagatactaaaggttaagagtctttggttgagg 40585454  T
Q  105 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacac 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||| || | |||| ||||| ||||||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  40585455 ttcaaagcttcaagatgtgaatatttgagaatcaaaagagtgggctcttttggagagggttgatgtcttttggtgagagattcatggggtttgaaaacac 40585554  T
Q  204 atgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgg 303  Q
    || |  |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  40585555 atcaaaggagagtc-tttgtgagcaatttgggtgagtattggtagaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaagactaagggttggttctcttttgg 40585652  T
Q  304 gggttagattctagagtt 321  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  40585653 ggg-tagattctaaagtt 40585669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3000037 - 2999823
Alignment:
Q  27 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3000037 cttggtgaatctcatagaaaccaaaggagagaacttttagggaatttagatactaaaggttgagggtctttgggtgatgttcaaagcttcaagatgtgaa 2999938  T
Q  126 tcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggg-aagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| | | | || || || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||||    
T  2999937 tcttggagaaccaaaagagggggttcttg-ggatatggttggtgtcttttggggaaagattcatggggatgagaaacacatgagtagagagtcaattgtg 2999839  T
Q  225 agcaacttgggcgagt 240  Q
    ||||||||||||||||    
T  2999838 agcaacttgggcgagt 2999823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20686586 - 20686456
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  20686586 tttgttgggtaagctcggtgaatctcattgaaaccaaaggagggaactttcagggtacttagatactaaatgttgaggatctttgg-tgaagttcaaagc 20686488  T
Q  113 ttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagag 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20686487 ttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagag 20686456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3846321 - 3846045
Alignment:
Q  40 atggaaaccaaaggatgaaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacca 138  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||  || || ||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  3846321 atggaaaccaaaggagaaaactttcagggtactttgaaactaaaggttgagggttcttgagtgagattcaaaggttcataatgtgaatcttgaagaacca 3846222  T
Q  139 aaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcg 237  Q
    |||||  ||||||||| |||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||||      
T  3846221 aaaga-agagctcttg-gaaaagagttggtgtcttttggggagagattcatggggttgggaaacacatgagagaagattc-tttgtgagcaaattgggta 3846125  T
Q  238 agtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagt 320  Q
    | ||||  || ||||||||| | |||| || | ||||||||| || || |||||||  || ||| ||||||||| ||||||||    
T  3846124 aatctttggataccaaaagagacgatcttttg-gaaatcaaaggtaaatggttggt--tcattttggggttagaatctagagt 3846045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 334
Target Start/End: Original strand, 18655246 - 18655359
Alignment:
Q  220 ttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagag 319  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||     
T  18655246 ttgtgagcaacttcggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgatactctttt-ggggttagattctagac 18655344  T
Q  320 ttgagaaacaattgt 334  Q
    ||  |||||||||||    
T  18655345 ttaggaaacaattgt 18655359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9634007 - 9633816
Alignment:
Q  71 ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgc 170  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||| | || ||||||| || |||||||  |||| || || | |    
T  9634007 ttagaaactaaaggtcgaacgtctttgggtgagattcaaagtgtccaaatgtgaatcttgaataatcaaaagatggcgctcttg--aaaaaggttggtac 9633910  T
Q  171 cttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatc 264  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| || ||||||    
T  9633909 cttttgggagagattaatggggttggtaaacacataagatgagagtcatttgtgagcaacttgggtgaatcttaggaaaccaaacgagaagatc 9633816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 223
Target Start/End: Original strand, 11136796 - 11136989
Alignment:
Q  31 gtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttaggg-ttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatctt 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||   ||| | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||   || | || ||||| ||    
T  11136796 gtgaatctcatggaaactaaaggatgagatttttagggaacttaaaaactaaaggttgggggtctttgggtgagattcaaattgtccaaatatgaatttt 11136895  T
Q  130 ggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgt 223  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| || ||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  11136896 ggagaactaaaagagagggctcttg-gaaattggtcgatgccttttggggagaggttcattgggtaggaaaacacatgagtggagagtcatttgt 11136989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 232
Target Start/End: Original strand, 40535510 - 40535707
Alignment:
Q  33 gaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttgg 131  Q
    ||||||||||||||  |||| |  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||||      
T  40535510 gaatctcatggaaattaaagtacaaaatttttagggtatttagatactaaagattgatggtctttgggtg--gttcaaagtttcaagttgtggatctttt 40535607  T
Q  132 agaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaaga-ttcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaac 230  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||||||||||  || | |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  40535608 agaaccaaaagagggggttcttgag-aaagggttgatgccttttggataaaagttcatgtgattggaaaacacatgagagaagagtc-attgtgagcaac 40535705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3817840 - 3817640
Alignment:
Q  37 ctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaa 135  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || | || || |  ||||||| || |||||| || ||||| ||||    
T  3817840 ctcatggaaaccaaaggagaaaacttttagggtacttagaaactaaaggttgagggtttctgagt-aaattcaaaggttgaagatgggattcttgaagaa 3817742  T
Q  136 ccaaaaga--gggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgg-ggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaactt 232  Q
    ||||||||    | ||||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| || | ||| || ||||||||||| ||    
T  3817741 ccaaaagaattagggctcttg-gaaaagggttggtgccttttggagaaagattcatggggttggaaaatacataagagaagattc-tttgtgagcaaatt 3817644  T
Q  233 gggc 236  Q
    ||||    
T  3817643 gggc 3817640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33655628 - 33655526
Alignment:
Q  219 tttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctaga 318  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||  || | ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||    
T  33655628 tttgtgagcaatttgggtgaatcttaggagaacaaaagagaagatccttaga-aaatcaaaggttaagggttggttctctttcaagggttaaattttaga 33655530  T
Q  319 gttg 322  Q
    ||||    
T  33655529 gttg 33655526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 10020150 - 10020224
Alignment:
Q  85 ttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaa 159  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10020150 ttgagggtctttaggtgagattcaaatgatcaatatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaa 10020224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 153
Target Start/End: Original strand, 28461305 - 28461339
Alignment:
Q  119 atgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctctt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28461305 atgtgaatcttggagaaccaaaagaggaagctctt 28461339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10101611 - 10101543
Alignment:
Q  91 gtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaa 159  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  10101611 gtctttgagtgagattcaatgggtcaaaatgtgaaccttggagaaccaaaagaggaggctcttgggaaa 10101543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 50674388 - 50674055
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||    
T  50674388 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttaaatactaaatgttaagggtctttgggt 50674289  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  50674288 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctaatgaaaagggttggtgccttatgggaaagattcatggggttgggaaa 50674189  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50674188 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 50674089  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50674088 tgggggttagattctagagttggaaaacaattgt 50674055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 54882646 - 54882979
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54882646 attctttgactcatttgttgggtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 54882745  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54882746 gaggttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 54882845  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  54882846 cacatgagtgtagagtcttttgtgagaaacttgggtgagtctcgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 54882945  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54882946 tgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 54882979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 332
Target Start/End: Original strand, 26363897 - 26364222
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26363897 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaagggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggcctttgggtgaggtt 26363996  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26363997 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggggccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatg 26364096  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  26364097 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttggtgg 26364196  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaatt 332  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||    
T  26364197 ttagattttagagttgggaaacaatt 26364222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 334
Target Start/End: Original strand, 8665046 - 8665366
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagct 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8665046 tttgttaggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagct 8665145  T
Q  114 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8665146 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacaggagtggag 8665245  T
Q  214 agtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagatt 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8665246 agtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggttatgtgttggttttcttttgggggttagatt 8665345  T
Q  314 ctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  8665346 ctggagttgggaaacaattgt 8665366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 40630610 - 40630878
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40630610 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 40630709  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40630710 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 40630809  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttag 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40630810 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag 40630878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 50263238 - 50262907
Alignment:
Q  3 tctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtga 102  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50263238 tctttgacccatttgttgaaaaagtttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggttttagacactaaaggttgagagtctttgggtga 50263139  T
Q  103 ggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaaca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50263138 ggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggaaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaaca 50263039  T
Q  203 catgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  50263038 catgagtggagagtcttttgtgagcaacctcggtgactcttgtgaaaccaaaagagaagacccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttg 50262939  T
Q  303 ggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50262938 ggggttagattctagagttgggaaacaattgt 50262907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 55085908 - 55085574
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55085908 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcaatgaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 55085809  T
Q  101 gaggttcaaagctt-caagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaa 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55085808 gaggttaaaagctttcaagatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaa 55085709  T
Q  200 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctctt 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |    
T  55085708 acacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgtgtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgattctcct 55085609  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  55085608 ttgggggttagattctagagttcggaaacaattgt 55085574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 6655582 - 6655915
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6655582 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtaaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 6655681  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6655682 gaggttcaaaactttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 6655781  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  6655782 cacatgagtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctcttt 6655881  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6655882 ttggggttagattctagagttgggaaacaattgt 6655915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 24 - 334
Target Start/End: Original strand, 12073042 - 12073351
Alignment:
Q  24 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12073042 aagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgta 12073141  T
Q  124 aatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaa-gggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12073142 aatcttggagaaccaaaagaggg-gctcttgggaaaaagggttggtgccttttggg-aagattcatggggttggaaaacacatgagtgaagagtcttttg 12073239  T
Q  223 tgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttg 322  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12073240 tgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttg 12073339  T
Q  323 agaaacaattgt 334  Q
     |||||||||||    
T  12073340 ggaaacaattgt 12073351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 41964048 - 41964373
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggt 105  Q
    ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41964048 tgacccatttggtgagaaagtttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggt 41964147  T
Q  106 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41964148 tcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagt--cttttgggaaagattcatggggttgggaaacacat 41964245  T
Q  206 gagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  41964246 gagtagagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-ggg 41964344  T
Q  306 gttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41964345 gttagattctagagttgggaaacaattgt 41964373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Original strand, 35662094 - 35662399
Alignment:
Q  27 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaat 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35662094 cttggtgaatctcatggacaccaaatgagagaacttttaggattttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaatatgtgaat 35662193  T
Q  127 cttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgag 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  35662194 cttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgaatggagagttctttgtgag 35662293  T
Q  227 caacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaa 326  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  35662294 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatc-aaagctaagggttggttctcttttgggtgttagattctagagttgggaa 35662391  T
Q  327 acaattgt 334  Q
    ||||||||    
T  35662392 acaattgt 35662399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27417487 - 27417170
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27417487 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 27417388  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27417387 caaagctttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaaggggctcttgggaaaggggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 27417288  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    ||||||||||||||          ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  27417287 agtggagagtcttt----------ttgggtgagtcttgtaaaaccaaaaaagaagatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttttggggg 27417198  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||    
T  27417197 ttagattcttgagttttgaaacaattgt 27417170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 334
Target Start/End: Original strand, 379028 - 379337
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtg 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  379028 agcttggtgaatctcgtggaaaccaaaggagagaacttttaggatttgtagatactaaaggttgagggactttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtg 379127  T
Q  124 aatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  379128 aatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggtcggtgccttttggggaagattcatgagaatgggaaacacatgagtggagagtcatttgt 379227  T
Q  224 gagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttga 323  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  379228 gagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgtgggttagattctagagttgg 379326  T
Q  324 gaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||    
T  379327 gaaacaattgt 379337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 46703135 - 46703458
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttca 108  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46703135 acccatttgctgaggaggcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttca 46703234  T
Q  109 aagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgag 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  46703235 aagcttcaagatgtgaatcttcgagaatcaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaaa-acatgaa 46703333  T
Q  209 tggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggtt 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||    
T  46703334 tggagagtcttttgtcagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaaatccttag-gaaatcaaaggctaaaagttggttctcttttgggggtt 46703432  T
Q  309 agattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  46703433 agattatagtgttgggaaacaattgt 46703458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 2209334 - 2209672
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2209334 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaagcaaatgagggaacttttagggttttagatactaaagattgagggtctttgggt 2209433  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209434 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaacgaggggactcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 2209533  T
Q  201 cacatgagtggagagtc-----ttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttc 295  Q
    |||||||||||||||||      | || |       |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  2209534 cacatgagtggagagtcaaaggctatgggttggttctcagcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttc 2209633  T
Q  296 tcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2209634 tcttttgggggttagattctagagttgggaaataattgt 2209672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Original strand, 33989501 - 33989816
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagc 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33989501 tttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaagcagataacttttagggtatttagatactaaagtttgagggtctttgggtgaggttcaaagc 33989600  T
Q  113 ttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtgga 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||  || |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33989601 ttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaatagggggctcttgggagaaggt-tggtgccttttgggagagattcatgggattgggaaacacatgagtgga 33989699  T
Q  213 gagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagat 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  33989700 gagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttttgaaaccaaaagagaagatccttag-gtaatcaaaggctaaggatttgttctcttttggaggttagat 33989798  T
Q  313 tctagagttgagaaacaa 330  Q
    |||||||||| |||||||    
T  33989799 tctagagttgggaaacaa 33989816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 98 - 330
Target Start/End: Original strand, 8647861 - 8648093
Alignment:
Q  98 ggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttggg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8647861 ggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggg 8647960  T
Q  198 aaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctc 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  8647961 aaacacaggagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgttatgtgttggttctc 8648060  T
Q  298 ttttgggggttagattctagagttgagaaacaa 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  8648061 ttttgggggttagattctggagttaggaaacaa 8648093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46570082 - 46569816
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  46570082 tgacccatttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaaattttagggttttagatactaaatgttgaaggtctttaggtgaggtt 46569983  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  46569982 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaaggattggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaaacaaatg 46569883  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaa 273  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  46569882 agtggaaagtcttttgtgaacaacttaggtgaatcttatgaaaccaaaagagaaggtccttattgaa 46569816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22883287 - 22882964
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttc 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  22883287 acccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaaattttagggtatttagatactaaaggttgagactatttgagtgaggttc 22883188  T
Q  108 aaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||| |||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||     
T  22883187 aaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttg-ggagagggctgataccttttggagagagactcatagggttaggaaacacatc 22883089  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctctttt-gggg 305  Q
    |   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22883088 aaatgagagtc-tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggataatggttggttctcttttggggg 22882991  T
Q  306 gttagattctagagttgagaaacaatt 332  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22882990 gttagattctagaattggaaaacaatt 22882964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22934951 - 22934628
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttc 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  22934951 acccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaatgagggaaattttagggtatttagatactaaaggttgagactatttgagtgaggttc 22934852  T
Q  108 aaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||| |||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||     
T  22934851 aaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttg-ggagagggctgataccttttggagagagactcatagggttaggaaacacatc 22934753  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctctttt-gggg 305  Q
    |   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22934752 aaatgagagtc-tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatccttag-aaaatcaaaggataatggttggttctcttttggggg 22934655  T
Q  306 gttagattctagagttgagaaacaatt 332  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22934654 gttagattctagaattggaaaacaatt 22934628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Original strand, 3785721 - 3786034
Alignment:
Q  6 ttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgagg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  3785721 ttgacccatttgttgagtaagtttggtggatctcatggaaatcaaaggatggaacttttaggatacatggatactaaaggttgagagtctttaggcgaga 3785820  T
Q  105 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| | ||||||| | | |||||    
T  3785821 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttg-gaaaagggttggtgccttttgaggagagaattatggggtcgaggaacac 3785919  T
Q  204 atgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgg 303  Q
     | |  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  3785920 ttcaaaggagagtc-tttgtgagcaaattgtgcgagtcttgggagaccaaaagagaatatccttag-gaaatcaaaggctaagagttggttctcttttgg 3786017  T
Q  304 gggttagattctagagtt 321  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  3786018 ggg-tagattctagagtt 3786034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Original strand, 10071524 - 10071679
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagct 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10071524 tttgttgggtaatcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagct 10071623  T
Q  114 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatg 169  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10071624 ttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttgatg 10071679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 8653239 - 8653385
Alignment:
Q  14 tttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagct 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8653239 tttgttaggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagct 8653338  T
Q  114 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8653339 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaa 8653385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 58 - 329
Target Start/End: Original strand, 33089582 - 33089841
Alignment:
Q  58 aacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtga 157  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |     
T  33089582 aacttttaggtatttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagtttgaagatgtgaatcttggagaatcaaaagagggggctcttg-gg 33089680  T
Q  158 aaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaag 256  Q
    | |||| || || ||||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           || ||||||||    
T  33089681 agagggttggtgtcttttggagagagattcatggggtcgaaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgg-----------gagaccaaaag 33089769  T
Q  257 aaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaaca 329  Q
    | |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  33089770 agaagatccttag-aaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttggaggttagattatagagttgggaaaca 33089841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Original strand, 12119281 - 12119496
Alignment:
Q  116 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagag 215  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||| || | || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||     
T  12119281 aagatatgaatcttggagaattaaaaaagggaactcttgggaaa-gggttggttcccttttgggaagattcatggggttgcgaaacacattagtggtgaa 12119379  T
Q  216 tcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattct 315  Q
    || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12119380 tcatttgtgagcaatttgggtgtgtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta-agaaatc-gaagttaagggttggttctcttttgggggttagattat 12119477  T
Q  316 agagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  12119478 agagttgggaaacaattgt 12119496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26699979 - 26699655
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaa 110  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||  |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  26699979 catttgttgagcaagctttgtgaatctcatggaaaccaaatgagggaacttgtagggcatttagatactaaaggttgaagatctttggttgaggttcaaa 26699880  T
Q  111 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaag-agggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgag 208  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| | |||||  ||||||| || ||||||||  | | ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  26699879 acttcaagatgtgaatcttagagagccaaatgaagggggatcttggaaaaagggttggtgccttttcagaagagattcatggggtcgggagatacatgag 26699780  T
Q  209 tggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggtt 308  Q
    |||||| || || |||| |||||  |  |||||||   |||| |||||| | |||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26699779 tggagattcattagtgaacaactcagatgagtcttagaaaactaaaagagatgatcttta-tgtaatcaaaggttaaaggttggttctcttttaggggtt 26699681  T
Q  309 agattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||    
T  26699680 agattataaagttgggaaacaattgt 26699655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 35370876 - 35370553
Alignment:
Q  5 tttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgag 103  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  35370876 tttgacccatctattgagtaagcttgatgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttaaggtatttagatactaaaggttgagggtctttgggagag 35370777  T
Q  104 gttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacc-aaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaac 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | | |||| || | |||||| |  | ||||||||| |||||  |||     
T  35370776 gttcaaagctttaagatgtgaatcttggagaacctaaaagagggggttcttg-ggagagggttggtcccttttcgaaagagattcatgaggttgataaaa 35370678  T
Q  202 acatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctctttt 301  Q
    |||| |  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||   || ||||||| | ||||| ||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  35370677 acatcaaaggagagtc-tttgtaagcaacttgggtgagtctatggataccaaaatagaagat-ctttgggaaatcaaaggctaatggttggttctctttt 35370580  T
Q  302 gggggttagattctagagttgagaaaca 329  Q
     || |||||||| |||| ||| ||||||    
T  35370579 -ggagttagattatagaattgggaaaca 35370553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38811590 - 38811405
Alignment:
Q  32 tgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttg 130  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38811590 tgaatctcatggaaactaaaggagggaacttttagggtacttagatactaaaggttgagggtatttgggtgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttg 38811491  T
Q  131 gagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtc 217  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| || || |||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  38811490 gagaacccaaagaggg-gctcttg-ggaaagggttggtgtcttttgcggagagattcatgaggttaggaaacacataagtggagagtc 38811405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 163
Target Start/End: Original strand, 10071963 - 10072059
Alignment:
Q  67 ggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaaggg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10071963 ggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaaaaggg 10072059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35369973 - 35369652
Alignment:
Q  5 tttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgagg 104  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35369973 tttgacccatctgttgagtaagcttgatgaatctcatggaaattaaaggagggaactttta----tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgagg 35369878  T
Q  105 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacc-aaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaaca 202  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | | |||| || | |||||| |  | ||||||||| ||||  ||||||    
T  35369877 ttcaaagatttaagatgtgaatcttggagaacctaaaagagggggttcttg-ggagagggttggtcccttttcgaaagagattcatgaggtttagaaaca 35369779  T
Q  203 catgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttg 302  Q
    ||| |   || |||| ||||| ||||||||||| ||||||   || | ||||| | |||||| ||   | ||||||| | |||||||||||||||||||     
T  35369778 catcaaaagatagtc-tttgtaagcaacttgggtgagtctatggatagcaaaatagaagatcttt--gggaatcaaaggctaagggttggttctctttt- 35369683  T
Q  303 ggggttagattctagagttgagaaacaattg 333  Q
    |||||| |||| |||| ||| ||||||||||    
T  35369682 ggggttggattatagaattgggaaacaattg 35369652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25723753 - 25723554
Alignment:
Q  6 ttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttgg-gtgag 103  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||| |||||||  ||  |||||||| ||||||  ||||||| | |||    
T  25723753 ttgacctatttgttaagtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaatgagtgaactcttagggtacttcaatactaaatgttgag--tctttggagggag 25723656  T
Q  104 gttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaaca 202  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  25723655 gttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttg-gataatggttaatgccttttggagagagcttcgtggggttgggaaaca 25723557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 333
Target Start/End: Original strand, 41961110 - 41961368
Alignment:
Q  78 ctaaaggttgagagtctttggg-tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttg 176  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||  || | |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | || ||||   | ||| |||||    
T  41961110 ctaaagggtgagggtctttggggtgagattcaaagtgtccaaatgtgaatcttgtagaaccgaaaaagggggctctagggagaaggtcgg-tgctttttg 41961208  T
Q  177 ggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagc-----aacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagt 270  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| | |||||||     |||||||| |||||||| || ||||||| | || ||||||||     
T  41961209 gggagagattcatggg-ttgggaaacacattaaaggagagtc-tatgtgagcaacgtaacttgggtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag- 41961305  T
Q  271 gaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattg 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41961306 gaaatcaaaagctaagggttggttctcttttgagggttagattctagagttgggaaacaattg 41961368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 264 - 334
Target Start/End: Original strand, 40632334 - 40632404
Alignment:
Q  264 ccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632334 ccttagtgaaatcaaatgttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 40632404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 47515044 - 47514900
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggtt-ttagatactaaaggttgagagtctttggg 99  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||  ||| | ||||||||||||  ||||| |||    
T  47515044 attctttgactcattgattgtgtaagcttgtggaatctcatggaaaccaaatgagtgaacttttagggtacttaaacactaaaggttgaaggtcttcggg 47514945  T
Q  100 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagag 144  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  47514944 tgaagttcaaagcttcaagatatgaatcttggtgaaccaaaagag 47514900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 303
Target Start/End: Original strand, 34112314 - 34112539
Alignment:
Q  77 actaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttg 176  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||   || |  ||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||  |||||||| || |||||||||    
T  34112314 actaaagattgagggtctttgtgtgagattcaaaatgtccaattgtgaatcttggataacctaaagacgaggctctta-gaaaagggttggtgccttttg 34112412  T
Q  177 ggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaat 275  Q
    |||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || |||||  ||| |||||   ||||||||||| |||||    
T  34112413 gggagaggttcacggggttggaaaacacatgagtggagagtcatctgtgagcaacttggatgaatcttggaaaaacaaaactgaagatccttag-gaaat 34112511  T
Q  276 caaaagttaagggttggttctcttttgg 303  Q
    |||| | ||| | |||||||||||||||    
T  34112512 caaaggctaaagtttggttctcttttgg 34112539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 130
Target Start/End: Original strand, 32091222 - 32091326
Alignment:
Q  28 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt--tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || | || ||||| |||  ||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32091222 ttggtgaatttcatggaaactaaaagagggaatttttaaggtattttggatactaaatgttgagggtctttgagtgaggttcaaaacttcaagatgtgaa 32091321  T
Q  126 tcttg 130  Q
    |||||    
T  32091322 tcttg 32091326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22629399 - 22629290
Alignment:
Q  33 gaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttgg 131  Q
    ||||||||| ||||||||| ||   ||||||||||   |||||| |||||||||| || |||| |||||||| || |||  |||||||||||||||||||    
T  22629399 gaatctcatagaaaccaaatgagtgaacttttaggaaatttagaaactaaaggttcagtgtctctgggtgagatttaaaagttcaagatgtgaatcttgg 22629300  T
Q  132 agaaccaaaa 141  Q
    ||||||||||    
T  22629299 agaaccaaaa 22629290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 294 - 334
Target Start/End: Original strand, 41639345 - 41639385
Alignment:
Q  294 tctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41639345 tctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 41639385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 144
Target Start/End: Original strand, 6719289 - 6719355
Alignment:
Q  78 ctaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagag 144  Q
    |||||||||||  || || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6719289 ctaaaggttgaaggttttagggtgagattcaaaggttcaagatgtgaatcttggaaaactaaaagag 6719355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 11348330 - 11348657
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11348330 tgacccatttgttgggtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaagggttgagggtctttgggtgaggtt 11348429  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11348430 caaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaaggtctggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacatg 11348529  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  11348530 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggggg 11348629  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11348630 ttagattctagagttgggaaacaattgt 11348657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 29135874 - 29136206
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29135874 attctttgacccatttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagt 29135973  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29135974 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggactcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggtt-ggaaa 29136072  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  29136073 aacatgagtggagagttttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctcttt 29136172  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29136173 tgggggttagattctagagttgtgaaacaattgt 29136206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37879453 - 37879120
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  37879453 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaatcaaaggaaggaactgttagggttttagatactaaatgttgaggatctttgggt 37879354  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37879353 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgtgaaaaaggttggtgccttttggggaaaattcatggggttgggaaa 37879254  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  37879253 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttt 37879154  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37879153 tgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 37879120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42298507 - 42298184
Alignment:
Q  11 ccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42298507 ccatttgttgggtaagcttggtgaatcccataacaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaa 42298408  T
Q  111 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42298407 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtg 42298308  T
Q  211 gagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttag 310  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42298307 gagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctaagtgaaatcaaaggctaagagttggttctcttttgggggttag 42298208  T
Q  311 attctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  42298207 attctagagttgtgaaacaattgt 42298184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13547627 - 13547298
Alignment:
Q  5 tttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgagg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13547627 tttgacccatttgtttggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgagg 13547528  T
Q  105 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  13547527 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacaca 13547428  T
Q  205 tgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13547427 tgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 13547328  T
Q  305 ggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13547327 ggttagattctagatttgggaaacaattgt 13547298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13549538 - 13549209
Alignment:
Q  5 tttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgagg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13549538 tttgacccatttgtttggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagagttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgagg 13549439  T
Q  105 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  13549438 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcggtgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacaca 13549339  T
Q  205 tgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13549338 tgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggg 13549239  T
Q  305 ggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13549238 ggttagattctagatttgggaaacaattgt 13549209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 193238 - 193570
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  193238 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagataacttttagggttttagatattaaaggttgagggtctttcggt 193337  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  193338 gaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaaaggttggtgcctttt-gggaagattcatggggttgggaaa 193436  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  193437 cacatgtgtgaagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 193536  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  193537 tgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 193570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 34603208 - 34603534
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||    
T  34603208 tgacccatttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatattaaaggttgaaggtctttgggtgatgtt 34603307  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34603308 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatg 34603407  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  34603408 agtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggagg 34603506  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34603507 ttagattctagagttgggaaacaattgt 34603534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37033611 - 37033282
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||    
T  37033611 attctttgacccttttgttgagtaagctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtttta----ctaaaggttgagggtctttgggt 37033516  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37033515 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttgaggaagattcatgaggttgggaaa 37033416  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  37033415 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttt 37033316  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37033315 ttggggttagattctagagttgggaaacaattgt 37033282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7482751 - 7482441
Alignment:
Q  23 taagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7482751 taagtttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaacggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgt 7482652  T
Q  123 gaatcttggagaaccaaaaga-gggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtctttt 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7482651 gaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtctttt 7482552  T
Q  222 gtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagtt 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7482551 gtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatccttag-gaaatc-aaagctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagtt 7482454  T
Q  322 gagaaacaattgt 334  Q
    | ||| |||||||    
T  7482453 gggaagcaattgt 7482441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47255870 - 47255549
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47255870 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 47255771  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47255770 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttgggaaa----atggtgccttttggggaagattcat-gggttgggaaacacatg 47255676  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  47255675 attggagagtcttttgtgagcaactt-agtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttttggggg 47255577  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  47255576 ttagattctagagttgggaaataattgt 47255549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 26 - 334
Target Start/End: Original strand, 37167948 - 37168256
Alignment:
Q  26 gcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167948 gcttggggaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttacagttttagatactaaaggttgagggtttttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa 37168047  T
Q  126 tcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtga 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37168048 tcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtga 37168147  T
Q  226 gcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgaga 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37168148 gcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttgattctcttttgggggttagattctagagttggga 37168247  T
Q  326 aacaattgt 334  Q
    |||||||||    
T  37168248 aacaattgt 37168256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Original strand, 19754123 - 19754448
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19754123 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttctagatactaaaggttaagggtctttgggtgaggtt 19754222  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19754223 caaagcaccatgatttgaatcttggaaaaccaagagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 19754322  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatcctt---agtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgg 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  19754323 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaaaatccttataagtgaaatcaaaggataatggttggttctcttttgg 19754422  T
Q  304 gggttagattctagagttgagaaaca 329  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19754423 gggttagattctagagttgggaaaca 19754448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34602875 - 34602561
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||    
T  34602875 tgacccatttgttggaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatattaaaggttgaaggtctttgggtgatgtt 34602776  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34602775 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttggtaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatg 34602676  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  34602675 agtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggagg 34602577  T
Q  307 ttagattctagagttg 322  Q
    ||||||||||||||||    
T  34602576 ttagattctagagttg 34602561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 47114825 - 47115130
Alignment:
Q  28 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47114825 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaaggctttagatattaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagctgtgaatc 47114924  T
Q  128 ttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagc 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47114925 ttggagaaccaaaagagggggctcttgggaacagggttggtaccttttggg-aagattcatggggttgggaaacacatgaatggagagtcttttgtgagc 47115023  T
Q  228 aacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaa 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47115024 aacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttaatgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaa 47115123  T
Q  328 caattgt 334  Q
    |||||||    
T  47115124 caattgt 47115130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 28242041 - 28242347
Alignment:
Q  28 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaat 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28242041 ttggtgaatctcatgaaaaccaaaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaaaatgtgaat 28242140  T
Q  127 cttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgag 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28242141 cttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggg-aagattcataaggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgag 28242239  T
Q  227 caacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaa 326  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  28242240 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttttaggggttagattctagagttggaaa 28242339  T
Q  327 acaattgt 334  Q
    ||||||||    
T  28242340 acaattgt 28242347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 327
Target Start/End: Original strand, 19752318 - 19752637
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19752318 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatgaaaaccaaatgagggaatttttagggttttagatactaaaggttgaaggtctttgggtgaggtt 19752417  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    | |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19752418 ctaagcgtcataatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttatgaaaaggt-tggtgccttttggggaagattcattgagttgggaaacacatg 19752516  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||    
T  19752517 agtggagagtattttgtgagcaacttagatgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatgattggttctcttttggggg 19752616  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaa 327  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  19752617 ttagattctagagttgggaaa 19752637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 329
Target Start/End: Original strand, 41135451 - 41135773
Alignment:
Q  6 ttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgagg 104  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41135451 ttgacccatttgttgaataagcttggttaatctcatggaaaccaaaggagggaaattttaatgtatttagatactaaaggttgagggtctttgggtgagg 41135550  T
Q  105 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacac 203  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| | | |||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41135551 ttcaaaccttcaagatgtggatcttggagaaccaaaagaggaagattttg-ggagagggttggtgccttttagggagagattcatggggttgggaaacac 41135649  T
Q  204 atgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgg 303  Q
    || |  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| || | ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  41135650 atcaaaggagagtc-tttgtgagaaacttgggtgagtcttaggaaaccaaaagagaagatcatttg-gaaattaaaggctaaggattggttctcttttgg 41135747  T
Q  304 gggttagattctagagttgagaaaca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41135748 gggttagattctagagttgagaaaca 41135773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 150 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31926099 - 31925927
Alignment:
Q  150 tcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaa 249  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31926099 tcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatgggtttgggaaacacgtgagtggagaatcttttgtgagcaacttgggtgagacttgtgaaa 31926000  T
Q  250 ccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttg 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31925999 ccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattctagagttg 31925927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 329
Target Start/End: Original strand, 6808083 - 6808399
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttag-ggttttagatactaaaggttga-gagtctttgggtgaggttcaa 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  6808083 catttgttgagtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagattttttagatactaaaggttgaggggtctttaggtgaggttcaa 6808182  T
Q  110 agcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgag 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  || | ||   |  || |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||     
T  6808183 aacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagattgggctct--tggagagattttgtgtcttttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgaa 6808280  T
Q  209 tggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggtt 308  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||  ||||||||||| |||||| ||| || |||||||     | ||||||||||| ||| | ||||    
T  6808281 tgaagagtcatttgtgagcaactagggtgagtaatggaaaaccaaaagagaagatcatta-tgtaatcaaagacggaaggttggttctc-tttcgaggtt 6808378  T
Q  309 agattctagagttgagaaaca 329  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6808379 agattctagagttgagaaaca 6808399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9109939 - 9109680
Alignment:
Q  6 ttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgagg 104  Q
    ||||||||||| ||| |  | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9109939 ttgacccatttattgagacaacttggtgaatgtcatggaaatcaaatgatgaaacttttggggtatataaatactaaaggttgagggtatttgggtgagg 9109840  T
Q  105 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacac 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || | | |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  9109839 ttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaaggggactcatg-ggagagggttgatgtcttttggggagagattcatgaggttgggagacac 9109741  T
Q  204 atgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatc 264  Q
    || |   ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| | ||||||    
T  9109740 atcaaatgagagtcttttgtgagcaatttggatgagtcttgggaaatcaaaatagaagatc 9109680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Original strand, 22078995 - 22079278
Alignment:
Q  28 ttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatc 127  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||| |||       ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22078995 ttggtgaatcttatggaaactaaatgatggaacttttagggtatta-------aagtttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatc 22079087  T
Q  128 ttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagc 227  Q
    ||  ||||||||||||||| ||  ||| |  | ||| || || | ||||||||           |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  22079088 ttaaagaaccaaaagagggggcaattgggtga-gggttggtgtcgtttgggga-----------gttgggaaacacatcaagggagagtcttt-gtgagc 22079174  T
Q  228 aacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaa 327  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||||| | ||||| |||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22079175 aacttaggtgagtcttggcaaaccaaaatataagatgctta-tgaaatcaaaggctaaggattg-ttctcttttgggggttagattctagagttgagaaa 22079272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31928337 - 31928208
Alignment:
Q  7 tgacccatttg-ttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggt 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31928337 tgacccatttgattgggtaagcttggtgaatttcatggaaaccaaaggagggaacttttag--------atactaaaggttgagagtctttggatgaggt 31928246  T
Q  106 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31928245 tcaaagcttcaagatgtgaatcttagaaaaccaaaaga 31928208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16216966 - 16216709
Alignment:
Q  70 tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatg 169  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||    
T  16216966 tttagaaactaaaggttaagggtctttgggtgatattcaaaggttcaagatgtatatcttgaagaaccaaaagagggggctctt-cgaaaagggttggtg 16216868  T
Q  170 ccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatcctta 268  Q
    | ||||||  | | |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| | || | |||  ||   |||||| ||||||||||    
T  16216867 cattttggatagaaattcat-gtgttggcaaacacatgagaggagagtc-attgtgagcaacttgagtgaattttgaaaacttaaaagagaagatcctta 16216770  T
Q  269 gtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaatt 332  Q
    | ||||||||| | || | |||||||   |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16216769 g-gaaatcaaaggctacgagttggtttagttt--agggttagattctagagttgagaaacaatt 16216709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4535861 - 4535783
Alignment:
Q  157 aaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgg 234  Q
    ||||||| || || |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4535861 aaaagggttggtgtcttttgggaatagattcatggggttgaaaaacacatgagtggatagtcgtttgtgagcaacttgg 4535783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12318856 - 12318720
Alignment:
Q  168 tgccttttggggaaga-ttcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatcct 266  Q
    |||||||||||||  | ||||| || ||| ||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||| | || ||| |    
T  12318856 tgccttttggggagaagttcataggattgagaaacacatcaaaggagagt-ttttatgagcaacttgggtgagtcttgggagaccaaaatagaaaatctt 12318758  T
Q  267 tagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    | | ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  12318757 ttg-gaaatcaaaggctaagggttggttctctttggggg 12318720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Original strand, 25651931 - 25652044
Alignment:
Q  221 tgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctctttt-gggggttagattctagag 319  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||  |||||||||||  ||||||||  |||||  |||||||||||||  |  | ||||||||||||    
T  25651931 tgtgagcaacttgggtgaatcttgggaaagcaaaagtgaagatccttag-aaaatcaaatattaagaattggttctcttttatgaaggtagattctagag 25652029  T
Q  320 ttgagaaacaattgt 334  Q
    ||| |||||||||||    
T  25652030 ttgggaaacaattgt 25652044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 159
Target Start/End: Original strand, 3331283 - 3331328
Alignment:
Q  114 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaa 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3331283 tcaagatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaa 3331328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 329
Target Start/End: Original strand, 3331428 - 3331505
Alignment:
Q  249 accaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaaca 329  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  3331428 accaaaagaggagatccttag-gaaatcaaaggctaagggtttgtt-tcttttgggg-ttggattctagagttgggaaaca 3331505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 332
Target Start/End: Original strand, 10157501 - 10157571
Alignment:
Q  260 agatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaatt 332  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10157501 agatccttag-gaaatcaaagactaagggttggttca-tttagggggttagattctaaagttgaaaaacaatt 10157571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Original strand, 6431603 - 6431930
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6431603 tgacccatttattgggtaagcttggtgaatctcatagaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 6431702  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6431703 caaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatg 6431802  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  6431803 agtgtagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgaggg 6431902  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6431903 ttagattctagagttgggaaacaattgt 6431930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Original strand, 2389934 - 2390241
Alignment:
Q  27 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2389934 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggaggaaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaat 2390033  T
Q  127 cttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgag 226  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2390034 cttggaaaaccaaaagagggggctattgcgaaaagggttggtggcttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggatagtcttttgtgag 2390133  T
Q  227 caacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaa 326  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2390134 caacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaa 2390233  T
Q  327 acaattgt 334  Q
    ||||||||    
T  2390234 acaattgt 2390241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 29608367 - 29608695
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29608367 attctttgacccatatgttgataaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 29608466  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||     |||||||||||||||||||    
T  29608467 gaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttg-----gattcatggggttgggaaa 29608561  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29608562 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 29608661  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29608662 tgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 29608695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4512925 - 4512599
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4512925 tgacccatttaatgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagattctaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 4512826  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4512825 caaagcttcaagatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatg 4512727  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  4512726 agtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctcttttggggg 4512627  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4512626 ttatattctagagttgggaaacaattgt 4512599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6360454 - 6360123
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6360454 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagagaacttttagggttttagatattaaaggttgagggtctttgggt 6360355  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||||  |||    
T  6360354 gaggttaaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaaggaatggtgccttttgaagaagattcatggagttgaaaaa 6360255  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6360254 cacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 6360155  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaatt 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6360154 tgggggttagattctagagttgggaaacaatt 6360123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34311253 - 34310925
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggt 105  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34311253 tgaccaattttttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggaaggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtccttgggtgaggt 34311154  T
Q  106 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  34311153 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaaggttcatggggatggaaaacacat 34311054  T
Q  206 gagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  34311053 gagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttgggg 34310954  T
Q  306 gttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  34310953 gttagattctagagttgggaaataattgt 34310925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 48599866 - 48599543
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48599866 attcttttacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 48599767  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48599766 gaggttcaaagcttcaagatgtgaa----------ccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaa 48599677  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48599676 aacatgagtagagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 48599577  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  48599576 tgggggttatattctagagttgggaaacaattgt 48599543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2361513 - 2361181
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2361513 attctttgacccatttgttgggcaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttaggattttagatactaaagattgagggtctttgggt 2361414  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2361413 gagattcaatccttcaagatgtgaatcttgaagaatcaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggatgattcatggggttgggaaa 2361314  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2361313 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttt 2361214  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2361213 t-gaggttagattctagagttgggaaacaattgt 2361181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4509233 - 4508915
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4509233 tgacccatttgttgggtaagcttggttaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtttttgggtgaggtt 4509134  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4509133 caaagcttcaagatgtga--------gaaccaaaagagggagctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 4509043  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  |||    
T  4509042 agtggagagtcatttgtgagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagataagatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttttatggg 4508943  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4508942 ttagattctagagttgggaaacaattgt 4508915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4511075 - 4510757
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4511075 tgacccatttgttgggtaagcttggttaatctcatggaaaccaaaggatggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtttttgggtgaggtt 4510976  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 206  Q
    ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4510975 caaagcttcaagatgtga--------gaaccaaaagagggagctcttgggaaa-gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatg 4510885  T
Q  207 agtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||  |||    
T  4510884 agtggagagtcatttgtgagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaacgattggttctcttttatggg 4510785  T
Q  307 ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4510784 ttagattctagagttgggaaacaattgt 4510757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 332
Target Start/End: Original strand, 22269606 - 22269929
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggt 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22269606 tgacccatttgttgggcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacatttagggtatgtagatactaaagtttgagggtctttgggtgaggt 22269705  T
Q  106 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacat 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22269706 tcaaagctacaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggg-gctcttgggaaa-gagttggtgccttttggggaagattcatggggaggggaaacacat 22269803  T
Q  206 gagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||    
T  22269804 gagtggagagtctattgagagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtgaaatcataggctatgggttggttctcttttgggg 22269903  T
Q  306 gttagattctagagttgagaaacaatt 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22269904 gttagattctagagttg-gaaacaatt 22269929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Original strand, 3258647 - 3258953
Alignment:
Q  27 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3258647 cttggtgaatctcatggaaaccagaggagggaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaa 3258746  T
Q  126 tcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtga 225  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  3258747 tcttggagaacaaaaagatggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaaacatatgagtggagagtcttttatta 3258846  T
Q  226 gcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgaga 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  3258847 gcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatc-aaacctaagggttggttctcatttgggggttagattctagagttggga 3258944  T
Q  326 aacaattgt 334  Q
    |||||||||    
T  3258945 aacaattgt 3258953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22328931 - 22328607
Alignment:
Q  12 catttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaa 110  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||    
T  22328931 catttgttaagtaagcttagtgaatctcatggaaaccaaaggagaaaacttttagggtatttagatactaaaggttgaggatctttggtggaggttaaaa 22328832  T
Q  111 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagt 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22328831 gcttcaagatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagagttggtgccttttggggagagattcatagggttgggaaaaacatgagt 22328732  T
Q  210 ggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctctttt-gggggtt 308  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| || ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22328731 agagagtcatttgtgagcaacttgggtgaatcttgggaaactaaaagagaatatcctta-tgtaatcaaaagctaagggttggttctcttttggggggtt 22328633  T
Q  309 agattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  22328632 agatcctaaagttgggaaacaattgt 22328607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32358372 - 32358189
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32358372 tgacccatttgttgaaaaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtt 32358273  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatgg 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  32358272 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaaaattcatgg 32358189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 158 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8359703 - 8359526
Alignment:
Q  158 aaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaaga 257  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8359703 aaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaaaga 8359604  T
Q  258 aaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg-ttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
     || |||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  8359603 gaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagagttggttattttttgggggtttagattcttgagttggaaaacaattgt 8359526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 30814391 - 30814505
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30814391 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatacttaaggttgagggtctttgggt 30814490  T
Q  101 gaggttcaaagcttc 115  Q
    |||||||||||||||    
T  30814491 gaggttcaaagcttc 30814505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 292
Target Start/End: Original strand, 5116290 - 5116551
Alignment:
Q  31 gtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatctt 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5116290 gtgaatctcatggataccaaaggaggggacttttagggtatttaaatactaaaggttgagggtctttaggtgatgttcaaaacttcaagatgtgaatctt 5116389  T
Q  130 ggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagca 228  Q
     |||||||||||||||| ||||||| | | ||||  | |||||||||| || |||||||| || |||| |||||| | |   ||| ||| |||||||  |    
T  5116390 tgagaaccaaaagagggggctcttg-ggagagggtcggtgccttttggagagagattcattggattggtaaacacttcaaatgagggtcatttgtgataa 5116488  T
Q  229 acttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttgg 292  Q
    |||| || |||||||| | |||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| |||||    
T  5116489 acttaggtgagtcttgggtaaccaaaagagaagatcctcag-gaaatcaaaggttaagagttgg 5116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1360479 - 1360364
Alignment:
Q  218 ttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttggggg-ttagattcta 316  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||||| || ||  || | ||||||||| | || || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1360479 ttttgcgagcaacttgagtgagtcttggaaaaccaaaagagaatatttttgg-gaaatcaaaggatatggattggttctcttttggggggttagattcta 1360381  T
Q  317 gagttgagaaacaattg 333  Q
    ||||||| |||||||||    
T  1360380 gagttgaaaaacaattg 1360364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22552897 - 22552826
Alignment:
Q  83 ggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttg 154  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22552897 ggttgagggtctttgggtgagatttaaagggtcaaaatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttg 22552826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 43363839 - 43363667
Alignment:
Q  116 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacacatgagtggaga 214  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |  | || | ||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||  ||||    
T  43363839 aagatgtgtatcttggagaactaaaagagggagctcttg-ggacattgttggttccttttgggaagagattca-agggttgagaaacacatgagatgaga 43363742  T
Q  215 gtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttg 291  Q
    |||  |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||| |||||| |||| ||||| ||| | |||||||||    
T  43363741 gtc-cttgtgagcaatttgggtgaatcttgagagaccaaaagagaagatctttag-gaaattaaatgctaagggttg 43363667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37545379 - 37545308
Alignment:
Q  71 ttagatactaaaggttgagag-tctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaa 141  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37545379 ttagagactaaaagttgagagatctttggataagattcaaaggtttaagatgtgaatcttggagaaccaaaa 37545308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23794176 - 23794039
Alignment:
Q  192 gttgggaaacacatgagtgga-gagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggtt 290  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || || |  || |||||||||  ||||||||||  |||||||| | ||| ||||    
T  23794176 gttgagaaacacatgagcggatgagtcttt-gtgagcaatttgggtgaatcgtaagagaccaaaagaggagatccttaga-aaatcaaaggctaatggtt 23794079  T
Q  291 ggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaatt 332  Q
    |||||  |||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23794078 ggttcatttt--gtggttagattctagagttgaaaaacaatt 23794039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3809251 - 3808918
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3809251 attctttgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 3809152  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaga-gggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3809151 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgtgaaaagggttggttccttttggagaagattcatggggttgggaa 3809052  T
Q  200 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctctt 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  3809051 acacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct-tt 3808953  T
Q  300 ttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3808952 ttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 3808918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Original strand, 17762622 - 17762948
Alignment:
Q  10 cccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  17762622 cccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaacaaaaggagagaacttttagggttttagatactaaaggttgaggatctttgggtgaagttcaa 17762721  T
Q  110 agcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga--agattcatggggttgggaaacacatga 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  17762722 ggcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaaggtttggtgccttttgggggttagattcatggggttgggaaacacatga 17762821  T
Q  208 gtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggt 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17762822 gtggagagtcttttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggt 17762921  T
Q  308 tagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17762922 tagattctagagttgggaaacaattgt 17762948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 334
Target Start/End: Original strand, 21593300 - 21593623
Alignment:
Q  9 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21593300 acccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggttagaacttttagggttttagatactaaatgttgagggtctttgggtgaggttca 21593399  T
Q  109 aagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgag 208  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21593400 aagatttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacatgag 21593499  T
Q  209 tggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggtt 308  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21593500 tggagagtcatttttgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-gaaatc-aaagctaagggttggttctcttttgggggtt 21593597  T
Q  309 agattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  21593598 agattctagagttgggaaacaattgt 21593623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 334
Target Start/End: Original strand, 5043278 - 5043586
Alignment:
Q  25 agcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtga 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5043278 agcttggtgaatctcatggaaatcaaaggagggaacttttagggttttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgaga 5043377  T
Q  125 atcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtg 224  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5043378 atcttggagaaccaaaagagagggctcttgggaaaagggttggtgccttttggg-aagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtg 5043476  T
Q  225 agcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgag 324  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5043477 agcaatttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtggaatcaaaggctaagagttggttctcttttgggggttagattctagagttggg 5043576  T
Q  325 aaacaattgt 334  Q
    ||||||||||    
T  5043577 aaacaattgt 5043586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2973456 - 2973148
Alignment:
Q  27 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2973456 cttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggtttgtagatactaaaggttgaaggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa 2973357  T
Q  126 tcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtga 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  2973356 tcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgcttttttgggaagattcatggggttgggaaacacatgaatgcagagtcatttgtga 2973257  T
Q  226 gcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgaga 325  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  2973256 acaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttagggattagattctagagttggga 2973157  T
Q  326 aacaattgt 334  Q
    |||||||||    
T  2973156 aacaattgt 2973148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26830656 - 26830333
Alignment:
Q  11 ccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||| |||    
T  26830656 ccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtttaaa 26830557  T
Q  111 gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtg 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26830556 acttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggagtctcttgggaaaaaggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcg 26830457  T
Q  211 gagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttag 310  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830456 cagagtcatttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaagattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttag 26830357  T
Q  311 attctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||||||||  ||||||||||    
T  26830356 attctagagttggaaaacaattgt 26830333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 73 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 603550 - 603289
Alignment:
Q  73 agatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgcct 172  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||    
T  603550 agatagtaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgaggaaagggttggtgcct 603451  T
Q  173 tttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtga 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  603450 tttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagtgtcctttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtga 603351  T
Q  273 aatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  603350 aatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattgt 603289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22425363 - 22425037
Alignment:
Q  6 ttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggt 105  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22425363 ttgatccatttgttggataagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttt-agggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgtggt 22425265  T
Q  106 tcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggag--ctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacac 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22425264 tcagagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggcctcttgggataagggttggtgcattttggggaagattcatggggttgtgaaacac 22425165  T
Q  204 atgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgg 303  Q
    ||| ||| |||||| |||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  22425164 atgggtgaagagtcatttaagagcaacttcggttagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttag-gaaatc-aaagctaagggttggttctctttt-g 22425068  T
Q  304 gggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22425067 gggttagattatagagttgggaaacaattgt 22425037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 82 - 279
Target Start/End: Original strand, 17757789 - 17757988
Alignment:
Q  82 aggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga- 180  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||      
T  17757789 aggttgatggtctttgggtgagattcaaagcttgaagatgtgaatgttggagaaccaaaatagggggctcttgtgaaaagggttggtgcattttgggggt 17757888  T
Q  181 -agattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaa 279  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  17757889 tagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatcatcagtgaaatcaaa 17757988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 26800438 - 26800630
Alignment:
Q  43 gaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaa 141  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  26800438 gaaaccaaaggagaaaacttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtggatcatggataaccaaaa 26800537  T
Q  142 gagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttggg 235  Q
    ||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26800538 gagggggctcttgggaaaaaggttggtgccttttggggaagattcat-gggatgggaaacacatgagtggagagtctattgagagcaacttggg 26800630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 25072814 - 25073076
Alignment:
Q  4 ctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtga 102  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25072814 ctttgactcatttgttgagtaagcttgatgaatctcatggaaatcaaagaagtgaacttttagggtatttagatactaaaggttgagggtctttgggtga 25072913  T
Q  103 ggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||    
T  25072914 ggttcaaagcttcaagatgtgaatctttgagaacccaaaggggg-gctcttg-gaaaagggattgtgcctcttgggaagagattcatagggtttggaaac 25073011  T
Q  202 acatgagtggagagtcttt-tgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatcctt 267  Q
    |||| |  ||||||||||| |||||  |||||||    |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25073012 acatcaaaggagagtctttatgtga--aacttggataggtcttgggaaaccaaaagagaagatcctt 25073076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5741120 - 5741001
Alignment:
Q  213 gagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggggttagat 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  5741120 gagtcttttgtgagcaatttgggtgaatcttgagaaacaaaaagtgaagatccttagt-aaatcaaaggctaagggttggttacttttggggggttagat 5741022  T
Q  313 tctagagttgagaaacaattg 333  Q
    |||| |||||  |||||||||    
T  5741021 tctaaagttggaaaacaattg 5741001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 333
Target Start/End: Original strand, 25073475 - 25073525
Alignment:
Q  283 taagggttggttctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaattg 333  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25073475 taagggttgattctcttttgggggttagattctagagttgggaaacaattg 25073525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 26661575 - 26661621
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 47  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661575 attctatgaccaatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 26661621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 26767546 - 26767592
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 47  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26767546 attctatgaccaatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaac 26767592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 80825 - 80492
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  80825 attctttcacccatttgttggaaaatcttggtgaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactagaggttgagggtctttgggt 80726  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80725 gaggttcaaagcttcaagatttgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 80626  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  80625 cacatgagcggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgggaaactaaaagagtagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctattt 80526  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  80525 tgggggttagattctagagttaggaaacaattgt 80492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 11184 - 11512
Alignment:
Q  1 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11184 attctttgacccatttgttgggtaagcttggtaaatctcatggaaaccaaaggagggaacttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggt 11283  T
Q  101 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttggggaagattcatggggttgggaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11284 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttggggaaagggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaa 11383  T
Q  201 cacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  11384 cacatgagtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctcttt 11483  T
Q  301 tgggggttagattctagagttgagaaaca 329  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11484 ttggggttagattctagagttgggaaaca 11512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18536 - 18212
Alignment:
Q  7 tgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggtt 106  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18536 tgacacatttgttgggtaagctgggtgaatctcatggaaaccaaaggagaaaacttatagg-ttttagatactaaaggttgcgggtctttgggtgaggtt 18438  T
Q  107 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgcctttt-ggggaagattcatggggttgggaaacacat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  18437 caaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgccttttgggggaagattcatgaggtt-gaaaacacat 18339  T
Q  206 gagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctcttttgggg 305  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||    
T  18338 gagtggagagttatttgtgagcaacttgagtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaagactaagagttggttctctttt-ggg 18240  T
Q  306 gttagattctagagttgagaaacaattgt 334  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18239 gttagattatagagttg-gaaacaattgt 18212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 490984 - 490661
Alignment:
Q  4 ctttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggttt-tagatactaaaggttgagagtctttgggtga 102  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  490984 ctttgacccatttgttgagcaagcttggtgaatctcatgagaaccaaaggagggagcttttagggtatgtagatactaaaggttgagggtctttgggtga 490885  T
Q  103 ggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||| || ||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  490884 ggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctt-tggagagggttggtgcctttaggtgagagattcatgggattgggaaac 490786  T
Q  202 acatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaagttaagggttggttctctttt 301  Q
    |||| |  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||| |||| ||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  490785 acatcaaaggagagt-ttttatgagcaacttgggcgagtcttacgagaccaaaagagtatatcattag-gaaatcaaaagctacggattggttc-ctttt 490689  T
Q  302 gggggttagattctagagttgagaaaca 329  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  490688 aggggttagaatctagagttgggaaaca 490661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1943 - 1609
Alignment:
Q  6 ttgacccatttgttgggtaagcttggtgaatctcatggaaaccaaaggatgaaacttttagggt-tttagatactaaaggttgagagtctttgggtgagg 104  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||||| | |||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  1943 ttgacctatttgttaagtaaacttggtgaattttatggaaaccaaatgagagaacttttagggtatttagatactaaaggttgaaggtctttgggtgagc 1844  T
Q  105 ttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggatgatgccttttgggga-agattcatggggttgggaaacac 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |   |||  || || |||||| ||| |||||||||  |||| |||||||    
T  1843 tccaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagaggggactcttg-ggcgaggcttggtgtcttttgtggagagattcatgtagttgagaaacac 1745  T
Q  204 atgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagaaaagatccttagtgaaatcaaaag----------ttaagggttggt 293  Q
    || |   |||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||||||||           |||| ||||||    
T  1744 atcatatgagagtc-attgtgagcaacttgggcgagtcttgggagatcaaaagagaagatccttag-gaaatcaaaagcttataacttataagtgttggt 1647  T
Q  294 tctcttttgggggttagattctagagttgagaaacaatt 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1646 tctctttt-ggggttagattctagagttgggaaacaatt 1609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University