View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19783_low_1 (Length: 1629)

Name: NF19783_low_1
Description: NF19783
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19783_low_1
NF19783_low_1
[»] chr4 (90 HSPs)
chr4 (11-1549)||(35855018-35856568)
chr4 (9-1547)||(49709289-49710835)
chr4 (160-1549)||(1859788-1861189)
chr4 (11-1549)||(49786410-49787936)
chr4 (199-1181)||(38517579-38518569)
chr4 (702-1549)||(31920585-31921436)
chr4 (706-1479)||(787065-787839)
chr4 (547-1110)||(55559139-55559703)
chr4 (11-580)||(13337320-13337896)
chr4 (901-1527)||(37531860-37532489)
chr4 (9-461)||(55558679-55559131)
chr4 (185-499)||(617956-618270)
chr4 (1190-1549)||(55559710-55560078)
chr4 (11-166)||(13344441-13344596)
chr4 (1432-1527)||(618302-618397)
chr4 (1565-1629)||(25708653-25708717)
chr4 (1565-1629)||(53277160-53277224)
chr4 (1566-1628)||(15241479-15241541)
chr4 (1567-1629)||(20455156-20455218)
chr4 (1567-1628)||(10588075-10588136)
chr4 (1567-1628)||(17609996-17610057)
chr4 (1565-1629)||(47806858-47806923)
chr4 (1566-1629)||(34273193-34273257)
chr4 (1565-1628)||(52977980-52978044)
chr4 (1567-1629)||(2615919-2615982)
chr4 (1567-1629)||(4035825-4035888)
chr4 (1567-1629)||(5375531-5375594)
chr4 (1567-1629)||(28501360-28501423)
chr4 (1570-1629)||(37352547-37352606)
chr4 (1570-1629)||(37357446-37357505)
chr4 (1567-1629)||(45742780-45742843)
chr4 (1559-1629)||(20391412-20391482)
chr4 (1564-1629)||(43387967-43388033)
chr4 (1567-1627)||(9328216-9328277)
chr4 (1567-1629)||(25124219-25124283)
chr4 (1567-1627)||(33413518-33413579)
chr4 (1567-1627)||(52870644-52870705)
chr4 (1557-1628)||(6807419-6807491)
chr4 (1567-1629)||(1859144-1859207)
chr4 (1567-1629)||(4415965-4416028)
chr4 (1567-1629)||(6753525-6753588)
chr4 (1567-1629)||(24754078-24754141)
chr4 (1567-1629)||(26625976-26626039)
chr4 (1567-1629)||(31937076-31937139)
chr4 (1567-1629)||(32032965-32033030)
chr4 (1567-1629)||(36391854-36391917)
chr4 (1567-1629)||(44294789-44294852)
chr4 (1567-1629)||(46949992-46950055)
chr4 (1567-1629)||(48030313-48030376)
chr4 (1565-1611)||(30771526-30771572)
chr4 (1567-1629)||(32899193-32899255)
chr4 (1564-1629)||(49373667-49373733)
chr4 (1564-1629)||(55632233-55632299)
chr4 (1573-1629)||(422902-422959)
chr4 (1572-1628)||(41620519-41620576)
chr4 (1567-1627)||(45097141-45097202)
chr4 (1569-1629)||(54676549-54676610)
chr4 (1566-1629)||(5743633-5743697)
chr4 (1566-1629)||(19282055-19282119)
chr4 (1592-1628)||(20788957-20788993)
chr4 (1566-1629)||(50352063-50352127)
chr4 (1586-1629)||(9808572-9808615)
chr4 (1566-1629)||(14793997-14794060)
chr4 (1567-1629)||(17339078-17339141)
chr4 (1567-1629)||(28298345-28298408)
chr4 (1566-1629)||(33988766-33988829)
chr4 (1563-1629)||(36990910-36990977)
chr4 (1563-1629)||(37173829-37173896)
chr4 (1573-1627)||(39184279-39184334)
chr4 (1566-1628)||(47228703-47228766)
chr4 (1567-1625)||(49793091-49793150)
chr4 (1570-1628)||(50424829-50424888)
chr4 (1567-1629)||(53629792-53629855)
chr4 (1565-1629)||(55563100-55563166)
chr4 (1572-1629)||(468479-468537)
chr4 (1567-1625)||(8343908-8343966)
chr4 (1564-1629)||(37842172-37842238)
chr4 (1565-1627)||(38900019-38900081)
chr4 (1567-1629)||(50533884-50533946)
chr4 (1584-1629)||(51335810-51335856)
chr4 (1567-1628)||(56432518-56432580)
chr4 (1567-1629)||(4455060-4455124)
chr4 (1563-1629)||(7698442-7698510)
chr4 (1567-1628)||(11469211-11469275)
chr4 (1567-1628)||(11522186-11522250)
chr4 (1567-1627)||(20768192-20768253)
chr4 (1584-1629)||(23621476-23621521)
chr4 (1564-1601)||(35675923-35675960)
chr4 (1565-1629)||(51536168-51536230)
chr4 (1572-1628)||(54623806-54623863)
[»] chr8 (70 HSPs)
chr8 (11-1549)||(25218123-25219677)
chr8 (30-1549)||(7820949-7822480)
chr8 (274-1549)||(30306283-30307575)
chr8 (459-1549)||(31978533-31979633)
chr8 (9-1110)||(21113300-21114409)
chr8 (702-1549)||(33861636-33862491)
chr8 (11-1047)||(25208605-25209635)
chr8 (805-1549)||(7780859-7781608)
chr8 (957-1527)||(14713417-14713999)
chr8 (759-1234)||(14766990-14767469)
chr8 (1099-1385)||(25209632-25209917)
chr8 (1039-1526)||(13424761-13425242)
chr8 (1180-1549)||(21114407-21114789)
chr8 (11-270)||(30325877-30326136)
chr8 (706-927)||(14714003-14714224)
chr8 (1230-1527)||(14764764-14765059)
chr8 (1567-1629)||(29806197-29806259)
chr8 (1555-1629)||(2944246-2944321)
chr8 (1565-1629)||(28192149-28192214)
chr8 (1560-1629)||(44502613-44502682)
chr8 (1566-1629)||(51069-51133)
chr8 (1566-1629)||(39029177-39029241)
chr8 (1567-1629)||(8251907-8251970)
chr8 (1567-1629)||(13153928-13153991)
chr8 (1567-1629)||(18754144-18754207)
chr8 (1567-1629)||(40741265-40741328)
chr8 (1567-1628)||(7758884-7758946)
chr8 (1567-1628)||(8951403-8951465)
chr8 (1567-1629)||(12802611-12802673)
chr8 (1564-1629)||(36177077-36177143)
chr8 (1567-1629)||(40529307-40529369)
chr8 (1564-1629)||(44251095-44251161)
chr8 (1565-1629)||(8948325-8948390)
chr8 (1567-1627)||(28572046-28572107)
chr8 (1567-1627)||(28579639-28579700)
chr8 (1567-1628)||(33980465-33980526)
chr8 (1567-1628)||(40784891-40784952)
chr8 (1565-1628)||(1774340-1774404)
chr8 (1567-1627)||(33745872-33745932)
chr8 (1567-1629)||(2152214-2152277)
chr8 (1567-1629)||(5162304-5162367)
chr8 (1567-1629)||(11798605-11798668)
chr8 (1567-1629)||(18455720-18455783)
chr8 (1563-1629)||(19176132-19176199)
chr8 (1567-1629)||(29321268-29321331)
chr8 (1567-1629)||(34568490-34568553)
chr8 (1567-1629)||(38878721-38878784)
chr8 (1567-1629)||(5593421-5593482)
chr8 (1567-1628)||(29598224-29598286)
chr8 (1567-1628)||(43654178-43654240)
chr8 (1572-1629)||(44580853-44580911)
chr8 (1563-1611)||(9035532-9035580)
chr8 (1573-1628)||(33865516-33865572)
chr8 (1567-1629)||(5774048-5774111)
chr8 (1567-1629)||(14699452-14699515)
chr8 (1567-1629)||(32475201-32475264)
chr8 (1567-1629)||(32675731-32675794)
chr8 (1567-1629)||(34490517-34490580)
chr8 (1567-1628)||(14584106-14584168)
chr8 (1567-1629)||(17856751-17856813)
chr8 (985-1019)||(17886246-17886280)
chr8 (1572-1629)||(23995582-23995640)
chr8 (985-1019)||(25089468-25089502)
chr8 (1578-1628)||(35143495-35143545)
chr8 (1565-1629)||(12255094-12255158)
chr8 (1565-1629)||(12260637-12260701)
chr8 (1567-1628)||(13335871-13335932)
chr8 (1564-1629)||(17336416-17336481)
chr8 (1566-1611)||(18641373-18641418)
chr8 (1576-1629)||(44057010-44057063)
[»] chr5 (85 HSPs)
chr5 (11-1549)||(27880199-27881745)
chr5 (9-1549)||(39882294-39883838)
chr5 (11-1549)||(37372038-37373597)
chr5 (9-1549)||(3689099-3690640)
chr5 (9-1549)||(3876147-3877688)
chr5 (11-1549)||(8428143-8429683)
chr5 (9-1507)||(25542349-25543849)
chr5 (9-1527)||(14192368-14193890)
chr5 (17-1549)||(37260429-37261958)
chr5 (706-1549)||(4050918-4051765)
chr5 (643-1527)||(6088353-6089232)
chr5 (9-677)||(17871195-17871868)
chr5 (706-1527)||(15032841-15033661)
chr5 (967-1549)||(43448590-43449174)
chr5 (547-1110)||(30346645-30347209)
chr5 (547-1110)||(10024617-10025181)
chr5 (547-1102)||(24629962-24630518)
chr5 (9-461)||(30346185-30346637)
chr5 (957-1527)||(2261499-2262071)
chr5 (9-461)||(24629509-24629954)
chr5 (9-461)||(10025189-10025641)
chr5 (942-1394)||(26831890-26832344)
chr5 (1190-1549)||(10024243-10024610)
chr5 (902-1254)||(43524286-43524640)
chr5 (706-1054)||(30313813-30314156)
chr5 (1190-1549)||(30347216-30347588)
chr5 (1192-1549)||(24630535-24630908)
chr5 (1303-1549)||(26792920-26793170)
chr5 (706-927)||(2261274-2261495)
chr5 (1152-1326)||(30313613-30313786)
chr5 (1065-1254)||(18116270-18116458)
chr5 (1411-1527)||(17871867-17871983)
chr5 (1409-1525)||(18115947-18116063)
chr5 (1409-1527)||(43524845-43524963)
chr5 (1426-1527)||(26831771-26831872)
chr5 (1457-1527)||(14193883-14193953)
chr5 (1246-1384)||(18116095-18116235)
chr5 (1408-1480)||(30313517-30313589)
chr5 (1290-1384)||(43524720-43524815)
chr5 (1566-1629)||(7951561-7951624)
chr5 (1567-1629)||(26894847-26894910)
chr5 (1567-1629)||(32147294-32147356)
chr5 (1565-1629)||(1265947-1266012)
chr5 (1572-1629)||(8284082-8284139)
chr5 (1563-1627)||(24170130-24170194)
chr5 (1567-1629)||(3497774-3497837)
chr5 (1567-1629)||(6673202-6673265)
chr5 (1567-1629)||(9828393-9828456)
chr5 (1567-1629)||(16127259-16127322)
chr5 (1567-1629)||(22527692-22527755)
chr5 (1567-1629)||(40004383-40004446)
chr5 (1567-1629)||(11780764-11780826)
chr5 (1567-1629)||(14913648-14913712)
chr5 (1567-1627)||(15521918-15521979)
chr5 (1572-1629)||(20987753-20987810)
chr5 (1565-1629)||(23286448-23286513)
chr5 (1565-1629)||(43060385-43060450)
chr5 (1570-1629)||(4985090-4985150)
chr5 (1567-1629)||(15190789-15190852)
chr5 (1567-1629)||(16153229-16153292)
chr5 (1567-1629)||(34662204-34662267)
chr5 (1572-1629)||(24308115-24308172)
chr5 (1572-1629)||(24365151-24365208)
chr5 (1584-1629)||(26605597-26605642)
chr5 (1573-1629)||(27873319-27873376)
chr5 (1573-1629)||(32478144-32478201)
chr5 (1567-1628)||(32964133-32964194)
chr5 (1558-1629)||(41641086-41641158)
chr5 (1570-1628)||(4753193-4753252)
chr5 (1134-1193)||(10692495-10692554)
chr5 (1567-1629)||(13660861-13660924)
chr5 (1567-1625)||(13862973-13863032)
chr5 (1567-1629)||(16440931-16440994)
chr5 (1565-1629)||(19571912-19571978)
chr5 (1567-1629)||(25601034-25601097)
chr5 (1567-1629)||(28041325-28041388)
chr5 (1567-1628)||(13759422-13759484)
chr5 (1584-1629)||(18616040-18616086)
chr5 (1564-1625)||(23092618-23092680)
chr5 (1574-1628)||(31657692-31657746)
chr5 (1567-1629)||(41418311-41418373)
chr5 (1567-1627)||(4976266-4976327)
chr5 (1567-1627)||(22657768-22657829)
chr5 (1577-1629)||(30182093-30182146)
chr5 (1559-1628)||(39984762-39984831)
[»] chr1 (80 HSPs)
chr1 (9-1549)||(16041138-16042688)
chr1 (17-1549)||(6310558-6312098)
chr1 (11-1549)||(37389710-37391253)
chr1 (38-1549)||(48774920-48776441)
chr1 (9-1527)||(36206355-36207878)
chr1 (9-1372)||(2328462-2329829)
chr1 (286-1527)||(18147824-18149074)
chr1 (27-869)||(2452690-2453538)
chr1 (706-1549)||(25074115-25074963)
chr1 (495-1208)||(48238519-48239240)
chr1 (547-1110)||(52500223-52500787)
chr1 (1035-1547)||(16748259-16748772)
chr1 (901-1527)||(28961209-28961838)
chr1 (9-461)||(52500795-52501240)
chr1 (185-543)||(48233507-48233865)
chr1 (1192-1549)||(52499844-52500214)
chr1 (1233-1526)||(2453541-2453832)
chr1 (1423-1549)||(36519048-36519178)
chr1 (1283-1515)||(7102120-7102348)
chr1 (1312-1527)||(48239660-48239872)
chr1 (1564-1629)||(14171539-14171604)
chr1 (1565-1629)||(30290263-30290328)
chr1 (1559-1629)||(15811206-15811277)
chr1 (1567-1629)||(46075841-46075904)
chr1 (1567-1629)||(25509209-25509271)
chr1 (1199-1298)||(12451094-12451189)
chr1 (1565-1629)||(49907019-49907084)
chr1 (1566-1629)||(16456635-16456699)
chr1 (1567-1629)||(1039355-1039418)
chr1 (1567-1629)||(1046261-1046324)
chr1 (1567-1629)||(4102688-4102751)
chr1 (1567-1629)||(11741397-11741460)
chr1 (757-800)||(12451185-12451228)
chr1 (1567-1629)||(23541979-23542042)
chr1 (1567-1629)||(36694854-36694917)
chr1 (1567-1629)||(36710955-36711018)
chr1 (1567-1629)||(37951923-37951986)
chr1 (1565-1627)||(39363170-39363233)
chr1 (1567-1629)||(39497433-39497496)
chr1 (1565-1627)||(44649627-44649690)
chr1 (1567-1629)||(45039412-45039475)
chr1 (1567-1629)||(52431148-52431211)
chr1 (1567-1629)||(1048226-1048287)
chr1 (1568-1629)||(30289836-30289898)
chr1 (1565-1628)||(943612-943676)
chr1 (1567-1627)||(2489376-2489436)
chr1 (1558-1629)||(7783982-7784054)
chr1 (1574-1629)||(8472056-8472112)
chr1 (1558-1629)||(47068780-47068851)
chr1 (1570-1628)||(13343776-13343835)
chr1 (1566-1629)||(15892538-15892601)
chr1 (1567-1629)||(27037269-27037332)
chr1 (1567-1629)||(41855447-41855510)
chr1 (1567-1629)||(52601991-52602054)
chr1 (1567-1629)||(8104263-8104325)
chr1 (1567-1629)||(50007975-50008037)
chr1 (1567-1629)||(50937779-50937841)
chr1 (1567-1627)||(7763725-7763786)
chr1 (1567-1628)||(18237094-18237154)
chr1 (1564-1628)||(38261337-38261402)
chr1 (1566-1629)||(45335884-45335948)
chr1 (1567-1629)||(16576066-16576129)
chr1 (1567-1629)||(39750355-39750418)
chr1 (985-1024)||(42032100-42032139)
chr1 (1561-1600)||(44646535-44646574)
chr1 (1561-1600)||(44649893-44649932)
chr1 (1567-1629)||(11353038-11353099)
chr1 (1584-1629)||(15111598-15111644)
chr1 (1572-1629)||(31238724-31238782)
chr1 (1572-1625)||(45285788-45285842)
chr1 (1567-1628)||(3934606-3934667)
chr1 (1573-1629)||(5858261-5858318)
chr1 (1564-1628)||(12814762-12814827)
chr1 (1564-1628)||(24855278-24855343)
chr1 (1566-1627)||(26768385-26768446)
chr1 (1576-1629)||(37584963-37585016)
chr1 (1567-1629)||(42276134-42276198)
chr1 (1567-1627)||(43456597-43456658)
chr1 (1565-1629)||(44646269-44646334)
chr1 (1567-1628)||(50246905-50246966)
[»] chr2 (76 HSPs)
chr2 (28-1527)||(21394505-21396014)
chr2 (17-1527)||(27508517-27510029)
chr2 (11-1549)||(41919755-41921281)
chr2 (11-1549)||(28665754-28667284)
chr2 (11-1549)||(37824588-37826118)
chr2 (9-1208)||(27191946-27193152)
chr2 (9-1208)||(27841760-27842966)
chr2 (233-1527)||(17683609-17684897)
chr2 (9-1110)||(24268626-24269735)
chr2 (492-1390)||(35608957-35609865)
chr2 (9-678)||(24245812-24246486)
chr2 (734-1527)||(24245004-24245783)
chr2 (9-448)||(35609877-35610315)
chr2 (1042-1527)||(40488287-40488774)
chr2 (1180-1549)||(24269733-24270114)
chr2 (967-1208)||(2867577-2867821)
chr2 (199-344)||(3642920-3643065)
chr2 (1347-1549)||(39441572-39441778)
chr2 (1312-1527)||(2868236-2868448)
chr2 (1312-1527)||(2881344-2881556)
chr2 (1317-1527)||(3642206-3642413)
chr2 (9-123)||(17683469-17683583)
chr2 (1129-1208)||(3642841-3642919)
chr2 (1559-1629)||(34883822-34883893)
chr2 (1567-1629)||(40607702-40607765)
chr2 (1560-1629)||(2438218-2438288)
chr2 (1567-1629)||(16845047-16845109)
chr2 (1567-1629)||(25624733-25624795)
chr2 (1565-1629)||(23788967-23789032)
chr2 (1566-1629)||(8716866-8716930)
chr2 (1566-1629)||(27560205-27560269)
chr2 (1567-1626)||(4711728-4711787)
chr2 (1566-1628)||(7491843-7491906)
chr2 (1574-1629)||(28840646-28840701)
chr2 (1567-1629)||(36131002-36131065)
chr2 (1558-1629)||(40680636-40680706)
chr2 (1567-1629)||(44573857-44573919)
chr2 (1567-1627)||(17408270-17408331)
chr2 (1572-1629)||(32511026-32511082)
chr2 (1567-1627)||(34062641-34062702)
chr2 (1567-1627)||(41450516-41450577)
chr2 (1566-1629)||(8912848-8912912)
chr2 (1567-1627)||(11852162-11852222)
chr2 (1565-1628)||(44436796-44436860)
chr2 (1567-1629)||(5664638-5664701)
chr2 (1567-1629)||(8841631-8841694)
chr2 (1567-1629)||(15228123-15228186)
chr2 (1567-1629)||(16805765-16805828)
chr2 (1567-1629)||(20252210-20252273)
chr2 (1567-1629)||(31751069-31751132)
chr2 (1567-1629)||(34113531-34113594)
chr2 (1567-1629)||(40680727-40680790)
chr2 (1567-1628)||(11201683-11201745)
chr2 (1567-1629)||(12360457-12360519)
chr2 (1567-1628)||(26322268-26322330)
chr2 (1565-1629)||(1359789-1359854)
chr2 (1563-1628)||(15918054-15918119)
chr2 (1565-1629)||(16669624-16669689)
chr2 (1572-1629)||(30466110-30466167)
chr2 (1565-1629)||(39833973-39834038)
chr2 (1566-1629)||(16108449-16108513)
chr2 (1574-1629)||(16456846-16456902)
chr2 (1566-1629)||(24345416-24345480)
chr2 (1567-1629)||(7531603-7531666)
chr2 (1565-1629)||(10757952-10758017)
chr2 (1567-1629)||(15404681-15404744)
chr2 (1567-1625)||(22897391-22897450)
chr2 (1567-1629)||(37229440-37229503)
chr2 (1563-1628)||(10399437-10399503)
chr2 (1573-1628)||(17665529-17665586)
chr2 (985-1018)||(3571845-3571878)
chr2 (1569-1629)||(24300325-24300386)
chr2 (1567-1628)||(29830731-29830791)
chr2 (1572-1625)||(41968181-41968234)
chr2 (1559-1629)||(42629363-42629435)
chr2 (1566-1627)||(45628857-45628917)
[»] chr3 (124 HSPs)
chr3 (9-1527)||(11367786-11369301)
chr3 (9-1549)||(10037755-10039282)
chr3 (11-1524)||(10968340-10969859)
chr3 (9-1527)||(50409306-50410831)
chr3 (9-1394)||(10109867-10111263)
chr3 (9-1340)||(13529364-13530702)
chr3 (252-1549)||(11361370-11362681)
chr3 (10-1394)||(9999675-10001069)
chr3 (702-1549)||(41763618-41764473)
chr3 (498-1480)||(46912259-46913245)
chr3 (32-896)||(10237326-10238194)
chr3 (816-1546)||(31925-32659)
chr3 (9-778)||(32658-33434)
chr3 (759-1527)||(15328876-15329649)
chr3 (547-918)||(47692716-47693087)
chr3 (900-1394)||(10234691-10235187)
chr3 (11-366)||(52918332-52918687)
chr3 (409-737)||(52917994-52918328)
chr3 (942-1394)||(10231093-10231547)
chr3 (1114-1390)||(41221455-41221732)
chr3 (1303-1549)||(10109094-10109343)
chr3 (1303-1527)||(10233951-10234174)
chr3 (1303-1549)||(10230333-10230582)
chr3 (967-1208)||(37801944-37802188)
chr3 (1236-1527)||(47692170-47692454)
chr3 (1312-1527)||(37802622-37802834)
chr3 (1303-1465)||(9999000-9999163)
chr3 (1445-1527)||(23092683-23092765)
chr3 (1426-1527)||(9999557-9999658)
chr3 (1426-1527)||(10109748-10109849)
chr3 (1426-1527)||(10230974-10231075)
chr3 (1432-1527)||(10041199-10041294)
chr3 (1445-1519)||(41221343-41221417)
chr3 (1426-1527)||(10234572-10234673)
chr3 (1259-1384)||(10041312-10041438)
chr3 (1564-1628)||(10220930-10220994)
chr3 (1564-1629)||(14428607-14428673)
chr3 (1567-1629)||(50726758-50726820)
chr3 (1567-1629)||(50786028-50786090)
chr3 (1557-1629)||(12050367-12050439)
chr3 (1565-1629)||(36098964-36099028)
chr3 (1459-1527)||(52917890-52917958)
chr3 (1567-1629)||(7181350-7181413)
chr3 (1563-1629)||(21756482-21756549)
chr3 (1567-1625)||(51284041-51284099)
chr3 (1564-1629)||(16435211-16435276)
chr3 (1565-1629)||(46049960-46050025)
chr3 (1562-1629)||(25149096-25149164)
chr3 (1567-1629)||(9499471-9499534)
chr3 (1567-1629)||(12683156-12683219)
chr3 (1567-1629)||(22103903-22103966)
chr3 (1566-1628)||(26593740-26593803)
chr3 (1567-1629)||(32568997-32569060)
chr3 (1567-1629)||(35868057-35868120)
chr3 (1567-1629)||(37728713-37728776)
chr3 (1567-1629)||(43868103-43868166)
chr3 (1567-1629)||(44543782-44543845)
chr3 (1567-1629)||(45252773-45252836)
chr3 (1567-1629)||(46878413-46878476)
chr3 (1567-1629)||(47066934-47066997)
chr3 (1565-1627)||(33212395-33212457)
chr3 (1565-1629)||(47008476-47008541)
chr3 (1566-1629)||(4024051-4024115)
chr3 (1567-1627)||(17699008-17699068)
chr3 (1567-1629)||(7051694-7051757)
chr3 (1567-1629)||(8321925-8321988)
chr3 (1567-1629)||(9582243-9582306)
chr3 (1567-1629)||(20862196-20862259)
chr3 (1573-1627)||(22527597-22527652)
chr3 (1567-1629)||(23700759-23700822)
chr3 (1567-1629)||(23719214-23719277)
chr3 (1567-1629)||(23737670-23737733)
chr3 (1567-1629)||(26058546-26058609)
chr3 (1567-1629)||(26221288-26221351)
chr3 (1567-1629)||(33868448-33868511)
chr3 (1563-1629)||(45324061-45324128)
chr3 (1567-1629)||(46845466-46845529)
chr3 (1567-1629)||(48909872-48909935)
chr3 (1567-1629)||(54782891-54782954)
chr3 (1567-1629)||(22832583-22832644)
chr3 (1564-1629)||(35165936-35166002)
chr3 (1567-1628)||(43701178-43701240)
chr3 (1572-1629)||(46703032-46703090)
chr3 (1567-1628)||(53361830-53361892)
chr3 (1573-1629)||(1111622-1111679)
chr3 (1567-1627)||(4759327-4759388)
chr3 (1565-1629)||(30040991-30041056)
chr3 (1567-1629)||(32963078-32963142)
chr3 (1584-1629)||(39952289-39952334)
chr3 (1574-1629)||(25148466-25148522)
chr3 (1574-1629)||(46862340-46862396)
chr3 (1570-1629)||(54107356-54107416)
chr3 (1567-1629)||(6784463-6784526)
chr3 (1567-1629)||(10656691-10656754)
chr3 (1567-1629)||(17753509-17753572)
chr3 (1567-1629)||(19054829-19054892)
chr3 (985-1024)||(20777756-20777795)
chr3 (1567-1629)||(24087309-24087372)
chr3 (1567-1629)||(26306581-26306644)
chr3 (1567-1629)||(27646280-27646343)
chr3 (1567-1629)||(28673268-28673331)
chr3 (1567-1629)||(32467425-32467488)
chr3 (985-1024)||(38356474-38356513)
chr3 (1567-1629)||(41392854-41392917)
chr3 (1574-1629)||(43408703-43408758)
chr3 (1566-1628)||(49127173-49127236)
chr3 (1574-1628)||(49543684-49543739)
chr3 (1567-1629)||(50433363-50433426)
chr3 (1567-1629)||(50647918-50647981)
chr3 (1567-1629)||(52673187-52673250)
chr3 (1567-1628)||(7251257-7251319)
chr3 (1572-1629)||(8546909-8546967)
chr3 (1572-1629)||(14758843-14758901)
chr3 (1567-1605)||(15095198-15095236)
chr3 (1567-1628)||(27687986-27688048)
chr3 (985-1019)||(35685133-35685167)
chr3 (1567-1628)||(53164163-53164225)
chr3 (985-1019)||(55368943-55368977)
chr3 (1573-1629)||(1572337-1572394)
chr3 (1572-1624)||(20918224-20918277)
chr3 (1572-1624)||(20927186-20927239)
chr3 (1567-1628)||(35572430-35572491)
chr3 (1584-1629)||(48942878-48942922)
chr3 (1584-1628)||(53686972-53687017)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (9-1546)||(9000701-9002228)
chr7 (9-1526)||(21069618-21071136)
chr7 (11-1388)||(7035998-7037381)
chr7 (75-1527)||(5828177-5829631)
chr7 (11-1549)||(12785560-12787088)
chr7 (11-824)||(12780706-12781527)
chr7 (9-677)||(22843792-22844466)
chr7 (547-1110)||(42231638-42232202)
chr7 (9-461)||(42232210-42232663)
chr7 (1190-1549)||(42231265-42231631)
chr7 (1408-1527)||(7035845-7035964)
chr7 (1411-1527)||(22843677-22843793)
chr7 (1459-1549)||(45122365-45122461)
chr7 (1559-1629)||(26255088-26255158)
chr7 (1567-1629)||(36698105-36698168)
chr7 (1567-1629)||(39871587-39871650)
chr7 (1567-1629)||(7449270-7449332)
chr7 (1567-1629)||(25247665-25247727)
chr7 (1567-1628)||(34012493-34012554)
chr7 (1565-1628)||(39197716-39197780)
chr7 (1567-1629)||(21295151-21295214)
chr7 (1574-1629)||(26299323-26299378)
chr7 (1567-1629)||(29177226-29177289)
chr7 (1567-1629)||(29286011-29286074)
chr7 (1567-1629)||(32814433-32814496)
chr7 (1567-1629)||(33858840-33858903)
chr7 (1567-1629)||(38858298-38858361)
chr7 (1567-1629)||(41026070-41026133)
chr7 (1567-1629)||(41252335-41252398)
chr7 (1572-1629)||(31769306-31769364)
chr7 (1567-1629)||(33381548-33381610)
chr7 (1564-1629)||(40300227-40300293)
chr7 (1567-1627)||(12616359-12616420)
chr7 (1565-1629)||(31457995-31458060)
chr7 (1567-1627)||(32872351-32872412)
chr7 (1567-1629)||(19920563-19920626)
chr7 (1558-1629)||(25950822-25950893)
chr7 (1567-1629)||(34979051-34979114)
chr7 (1567-1629)||(36646611-36646674)
chr7 (1560-1629)||(20074882-20074952)
chr7 (1567-1628)||(36711273-36711335)
chr7 (1566-1627)||(41003130-41003192)
chr7 (498-543)||(18939139-18939184)
chr7 (1567-1627)||(44547426-44547487)
chr7 (1573-1628)||(9140508-9140564)
chr7 (1574-1629)||(11647808-11647864)
chr7 (1566-1629)||(29643117-29643181)
chr7 (1567-1611)||(48521029-48521073)
chr7 (1567-1629)||(1275707-1275770)
chr7 (1567-1629)||(2289990-2290053)
chr7 (1567-1629)||(6387325-6387388)
chr7 (1567-1629)||(7703794-7703857)
chr7 (1560-1627)||(28016522-28016589)
chr7 (1584-1629)||(8612549-8612595)
chr7 (985-1019)||(12983007-12983041)
chr7 (1572-1629)||(17317446-17317504)
chr7 (985-1019)||(18292589-18292623)
chr7 (1567-1629)||(18751958-18752019)
chr7 (985-1019)||(26368005-26368039)
chr7 (1575-1629)||(41803446-41803500)
chr7 (1564-1629)||(43279702-43279768)
chr7 (1567-1628)||(46414980-46415042)
chr7 (1567-1629)||(28060717-28060781)
chr7 (1581-1629)||(29064431-29064480)
chr7 (1567-1627)||(34895857-34895918)
chr7 (1567-1625)||(43093386-43093446)
chr7 (1565-1629)||(44510317-44510382)
[»] scaffold0073 (4 HSPs)
scaffold0073 (9-1388)||(31207-32595)
scaffold0073 (459-1549)||(18569-19670)
scaffold0073 (11-420)||(3-412)
scaffold0073 (1408-1549)||(31027-31173)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (107-1549)||(164641-166098)
scaffold0003 (9-1236)||(182240-183474)
scaffold0003 (1158-1549)||(172756-173151)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (9-1527)||(18140-19668)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (9-1527)||(4816-6338)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (9-1527)||(185708-187215)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (11-1549)||(48518-50047)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (9-1498)||(165-1680)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (112-1368)||(2201838-2203102)
chr6 (233-1390)||(10186820-10187983)
chr6 (296-1340)||(15332967-15334019)
chr6 (547-1549)||(12516500-12517506)
chr6 (185-1208)||(18343582-18344612)
chr6 (767-1549)||(29641668-29642460)
chr6 (767-1547)||(31511832-31512598)
chr6 (9-677)||(30881315-30881988)
chr6 (706-1527)||(12518751-12519566)
chr6 (967-1549)||(24196013-24196598)
chr6 (9-420)||(12517526-12517937)
chr6 (372-772)||(29639947-29640355)
chr6 (372-772)||(31510118-31510525)
chr6 (967-1208)||(4220226-4220470)
chr6 (1334-1549)||(15330652-15330869)
chr6 (1312-1546)||(4220884-4221113)
chr6 (222-364)||(18814054-18814196)
chr6 (1411-1527)||(30881200-30881316)
chr6 (9-123)||(10188571-10188685)
chr6 (9-116)||(2200454-2200561)
chr6 (1566-1629)||(231080-231143)
chr6 (1567-1629)||(8743188-8743250)
chr6 (1572-1629)||(17227502-17227559)
chr6 (1567-1629)||(25197152-25197215)
chr6 (1562-1626)||(32614984-32615048)
chr6 (1566-1629)||(34301806-34301870)
chr6 (1561-1627)||(925909-925976)
chr6 (1567-1629)||(23398113-23398176)
chr6 (1565-1628)||(29036124-29036187)
chr6 (1567-1629)||(30248647-30248710)
chr6 (1567-1629)||(10195968-10196030)
chr6 (1567-1629)||(402595-402658)
chr6 (1567-1629)||(9388765-9388828)
chr6 (1567-1629)||(25045617-25045680)
chr6 (1564-1629)||(1147241-1147307)
chr6 (1567-1629)||(1730076-1730138)
chr6 (1567-1629)||(33487833-33487894)
chr6 (1557-1626)||(34915520-34915590)
chr6 (1567-1627)||(287390-287451)
chr6 (1565-1629)||(6147381-6147446)
chr6 (1567-1627)||(15498629-15498690)
chr6 (1569-1629)||(6417878-6417938)
chr6 (1566-1629)||(12106038-12106102)
chr6 (1567-1611)||(23604460-23604504)
chr6 (1567-1610)||(4844400-4844443)
chr6 (1567-1629)||(5457412-5457475)
chr6 (1567-1629)||(9038642-9038705)
chr6 (1567-1629)||(19097775-19097838)
chr6 (1566-1629)||(23282780-23282843)
chr6 (1567-1628)||(13648104-13648166)
chr6 (985-1019)||(15877026-15877060)
chr6 (1576-1629)||(31487345-31487399)
chr6 (1565-1629)||(1780018-1780083)
chr6 (1566-1611)||(2090657-2090702)
chr6 (985-1018)||(29965978-29966011)
[»] scaffold0550 (2 HSPs)
scaffold0550 (9-1275)||(124-1401)
scaffold0550 (1090-1549)||(4171-4637)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (9-840)||(17433-18263)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (26-885)||(320909-321775)
scaffold0002 (821-1527)||(310067-310775)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (568-1377)||(24-834)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (821-1527)||(132250-132947)
scaffold0029 (1567-1627)||(51658-51719)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (706-1527)||(97083-97902)
scaffold0012 (1567-1628)||(47640-47702)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (707-1527)||(125363-126187)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (467-1121)||(16227-16889)
scaffold0025 (1115-1527)||(13632-14038)
scaffold0025 (1567-1629)||(65612-65674)
[»] scaffold1424 (2 HSPs)
scaffold1424 (771-1527)||(824-1575)
scaffold1424 (610-741)||(1572-1703)
[»] scaffold0118 (3 HSPs)
scaffold0118 (547-1110)||(28735-29299)
scaffold0118 (9-461)||(28275-28727)
scaffold0118 (1190-1549)||(29306-29676)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (1038-1527)||(23484-23969)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (17-338)||(13841-14162)
[»] scaffold0107 (4 HSPs)
scaffold0107 (1137-1372)||(34258-34492)
scaffold0107 (244-491)||(39937-40184)
scaffold0107 (9-213)||(42434-42638)
scaffold0107 (1566-1629)||(48653-48718)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (1459-1549)||(10257-10352)
[»] scaffold1370 (2 HSPs)
scaffold1370 (1432-1527)||(1170-1265)
scaffold1370 (1313-1384)||(1081-1152)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (1567-1629)||(3757-3819)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1567-1629)||(12065-12127)
scaffold0122 (1567-1600)||(12328-12361)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1565-1629)||(5149-5213)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (1565-1629)||(10157-10221)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1565-1629)||(18495-18559)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (1565-1629)||(3436-3500)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1567-1627)||(259098-259159)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (1567-1629)||(14322-14385)
[»] scaffold0649 (1 HSPs)
scaffold0649 (1572-1629)||(4272-4330)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (1566-1629)||(117845-117909)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (1566-1628)||(7115-7178)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1566-1629)||(45671-45734)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (1567-1628)||(1422-1483)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (1566-1627)||(104038-104099)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 1094; Significance: 0; HSPs: 90)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 1094; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 35856568 - 35855018
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35856568 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 35856469  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  35856468 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 35856369  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35856368 ttttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttg 35856269  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  35856268 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 35856169  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35856168 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 35856069  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35856068 gtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaattt 35855969  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35855968 atgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacac 35855869  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35855868 cagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 35855769  T
Q  804 taatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgta 903  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||| |||    
T  35855768 caatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtactagggta 35855669  T
Q  904 ttcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataa 1003  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35855668 ttcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataa 35855569  T
Q  1004 ataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttc 1102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35855568 ataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaacttc 35855469  T
Q  1103 aagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatc 1202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35855468 aagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatc 35855370  T
Q  1203 attggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtact 1302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35855369 attggttatgttttagaattgttgttgctataatttataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtact 35855270  T
Q  1303 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnn 1402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||            
T  35855269 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgtgaaactttttttt 35855170  T
Q  1403 nnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaac 1502  Q
         ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35855169 tttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagccaaaac 35855070  T
Q  1503 tatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||| |||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  35855069 tatatttatacacatccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 35855018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 1037; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1547
Target Start/End: Complemental strand, 49710835 - 49709289
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49710835 catcatcgcttaagatgcaaaaggatagtcctagggcagaccttgtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcatcgatggtg 49710736  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  49710735 ttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcgcttaaacctttcggtggaatgacaatagttttaggtggt 49710636  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||| ||| || |||| | ||| || |||  |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||    
T  49710635 gattttaggcagatattgcctgttgttcgaggaggaacgaggccagatattgttgatgcctccgtcaattcgttaaagatatgagcttattgtaatgtgt 49710536  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  49710535 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagaacagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggacacgg 49710436  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49710435 caacgatgcttcggatgaaaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatcc-ttgatgtcacttatagacttt 49710337  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49710336 gtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 49710237  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49710236 ttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 49710137  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49710136 accggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatagatcag 49710037  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||  ||||| ||| || |    
T  49710036 gccattggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacatgaaaaagggcagttaccagcg 49709937  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  49709936 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggtgcagacaatttccattgacgctttgttttgcaatgtcaat 49709837  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  49709836 aaataaaagtcaaggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagtaact 49709737  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  49709736 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatga 49709638  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49709637 tccttggttatgttttagaattgttgttgctataatttataaaaccaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgta 49709538  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnn 1400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  49709537 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc---tt 49709441  T
Q  1401 nnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaa 1500  Q
           ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  49709440 ttttattacatcgttgttaccctaaaatataatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaacaacaaacaacaatcggcgtttctgtagcccaa 49709341  T
Q  1501 actatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactac 1547  Q
    ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||    
T  49709340 actatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactac 49709289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 978; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 160 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 1861189 - 1859788
Alignment:
Q  160 cctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatatt 259  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1861189 cctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagtgtaaggtggtgatttcaggcaaatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatatt 1861090  T
Q  260 gttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagc 359  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1861089 gttgatgcatcaatcaattcattaaagatatgggcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagc 1860990  T
Q  360 aggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaaga 459  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1860989 agaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacgacaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaaga 1860890  T
Q  460 tttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaa 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  1860889 tttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaa 1860790  T
Q  553 aggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgatt 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1860789 aggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattctgggtgaagagaaagagtatttaagctctgatt 1860690  T
Q  653 ctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggtt 752  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1860689 ctgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctatggaattccaaatcaccggtt 1860590  T
Q  753 gaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaag 852  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860589 gaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgataagaaacatcgatcatgccaatggattgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaag 1860490  T
Q  853 agcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttca 952  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1860489 agcacgatagttgctaccgtaattacagtaaaaagggcaggtaccaaggtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttca 1860390  T
Q  953 aattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaa 1051  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1860389 aattcaggcgcatgcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagctagggtcaatctttatctcaagtgggggtttatcttcctaa 1860290  T
Q  1052 gcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgt 1151  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1860289 gcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctactcatcgtggatgaagataataatgtttgt 1860190  T
Q  1152 aaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagt 1251  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1860189 aaggagactacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttataaaactaaagt 1860091  T
Q  1252 tgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattg 1351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  1860090 tgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttataaggcgtactggtcattacagacatgcaatttctatataaatagatcctcctgccattg 1859991  T
Q  1352 actattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccattt 1451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||            ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1859990 actattaattcatgcacttttcaggtttaacaatctgcggaacc-tttttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccattt 1859892  T
Q  1452 gttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa------aaacgtttgcatttaccgact 1545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||    
T  1859891 gttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttatacacatccgtaaaaaaattaaacgtttgcatttaccgact 1859792  T
Q  1546 acgt 1549  Q
    ||||    
T  1859791 acgt 1859788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 873; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1549
Target Start/End: Original strand, 49786410 - 49787936
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49786410 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtccttgggcagacctggtgtgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 49786509  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || |||| |||||||| ||| || ||||||          
T  49786510 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacacacttaaactttttggtggaatggcaatagttttaggc----- 49786604  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
            || |||| ||||| ||| ||  |||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49786605 --------agatattgcatgttgtctgaggaggaacgatgccagatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttg 49786696  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    |||||| ||           ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  49786697 aggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctacagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 49786785  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49786786 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgt 49786885  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  49786886 gtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatattaacgaattt 49786985  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  49786986 atgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttaacac 49787085  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49787086 cagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacagattgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcgatcaggc 49787185  T
Q  804 taatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttc-aggaaaagtggcaggtactagtgt 902  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| | |||||||  |||||||||||| ||    
T  49787186 caatggattgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattacaaggaaaaagggcaggtactagggt 49787285  T
Q  903 attcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaata 1002  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  49787286 attcattcccaggatgaatcttattccgaatgatccaggactacccttcaaattcagacgcagacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaata 49787385  T
Q  1003 aataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaactt 1101  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  49787386 aataaaagcca-ggtcaatctttatctcgggtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatagacaactttatgtcgttgtctctcgagtaactt 49787484  T
Q  1102 caagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgat 1201  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49787485 catgaaaaggtccgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgat 49787583  T
Q  1202 cattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtac 1301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49787584 cattggttatgttttagaattgttgttgctataatatataaaactaaagctgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtac 49787683  T
Q  1302 tggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnn 1401  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||          
T  49787684 cggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgtgaaacctttttt 49787783  T
Q  1402 nnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaa 1501  Q
          ||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49787784 ttttttacatcgttgttaccctaaaacacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaa 49787883  T
Q  1502 ctatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||||    
T  49787884 ctatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgtatttaccgactacgt 49787936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 629; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 199 - 1181
Target Start/End: Complemental strand, 38518569 - 38517579
Alignment:
Q  199 tttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttat 298  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||   ||| ||| ||  ||||||||| | |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||    
T  38518569 tttaggtggtgattttaggcagatattaactgttgtctgaggaggaacgagaccggatattgttaatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttat 38518470  T
Q  299 tgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaa 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38518469 tgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaa 38518370  T
Q  399 ttggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcact 498  Q
    ||||| ||| |||||| ||||    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38518369 ttggagacggcaacgatgctttgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcact 38518270  T
Q  499 tatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcat 591  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38518269 tatagactttgtgtatcccgatctaaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcaattgagcat 38518170  T
Q  592 gttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcg 691  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38518169 gttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcg 38518070  T
Q  692 agtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaa 791  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38518069 agtggttcacaccaaaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaa 38517970  T
Q  792 catcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggca 891  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||    
T  38517969 catcgatcaggtcaatggactgtgtaatggtactaggctgaaagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattacaggaaaaagggca 38517870  T
Q  892 ggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttg 991  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  38517869 ggtactagggtattcattcccaggatgaattttattctgaatgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaggcaatttcctttgacgctttgttttg 38517770  T
Q  992 caatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgg-ggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcac 1090  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||| | |||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |    
T  38517769 caatgacaataaataaaagccaaggtcaatctttatcttgaatggagttttagcttcataagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctc 38517670  T
Q  1091 tcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaa 1181  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38517669 tcgggtaacttcaagaaaaggtctaaagctgctcatcctggatgacgataataatgtttgtaaggagaccacagatgttgtgtatcgtgaa 38517579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 626; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 702 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 31921436 - 31920585
Alignment:
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31921436 aacagaattttttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgagatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcat 31921337  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  31921336 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgatagttacacatctagggaagagcacgatagttgatactgtaattacaggaaaaggggaaggtaccagtg 31921237  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31921236 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggcgcaggcaatttccattgacgtgttgttttgcaatgacaat 31921137  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31921136 acataaaagtgagggtcaatctttatctcaagtgggggtttatcttcttaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaact 31921037  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31921036 tcaagaaaaggtctgaagttggtcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaaatttttcaaaaaagtatga 31920937  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31920936 tcattggttatgttttagaattgttattgctataatttcgaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgta 31920837  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnn 1400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  31920836 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccttttt 31920737  T
Q  1401 nnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaa 1500  Q
            |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31920736 tttttt--catcattgttaccctaaaatacattatttacattacaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggtgtttctgtagcccaa 31920639  T
Q  1501 actatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  31920638 actatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 31920585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 706 - 1479
Target Start/End: Complemental strand, 787839 - 787065
Alignment:
Q  706 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggcta 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  787839 gaatttcttaatggtattaagagctatggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgagatgttcagttatgctgatgagaaacatcgatcaggcca 787740  T
Q  806 atggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtatt 905  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| | ||||||  ||||||||  || |||||    
T  787739 atggaacgtgtaatggtacgaggctgacaattacacatctagggaagagcacgatagctgctaacgtaattacgggaaaaagggcaggtatcagggtatt 787640  T
Q  906 cattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaat 1005  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  787639 cattccc-ggatgaatcttattccaagtgatccagaactacccttcaaattcaggcgcagacaatttccattgacactttgttttgcaatgacaataaat 787541  T
Q  1006 aaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaa 1104  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||| || |  |    
T  787540 aaaagtcagggtcaatctttatctcaagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacacatgaacaactctatgttgttgtctctcgagttacatata 787441  T
Q  1105 gaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcat 1204  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  787440 gaaaaggtgtgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtatatcctgaagtttttc-aaaaagtatgatctt 787342  T
Q  1205 tggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttattttt------aatttctatgtaaggcg 1298  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||      ||||||| ||||||||     
T  787341 agattatgttttagaattgttgttgctataattaagaaaactaaagttgcgtattgtttggaagtcgttttttttttttttaaaatttctttgtaaggct 787242  T
Q  1299 tactggtcatta-tagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnn 1397  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |         
T  787241 tactggtcattacgtgacatgcaatttctatataagtagattctcctgccattgacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatacgcgaa----- 787147  T
Q  1398 nnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataaca 1479  Q
              ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  787146 ttttttttttacatcgttgttaccctaaaatagaatatttacattagaccattggttttctaaaaaataaaaacaaataaca 787065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 547 - 1110
Target Start/End: Original strand, 55559139 - 55559703
Alignment:
Q  547 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagct 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55559139 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaact 55559238  T
Q  647 ttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatca 746  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  55559239 ctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaactgaattccttaatggtatttagagctctggaatttcaaatca 55559338  T
Q  747 ccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatcta 846  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55559339 ccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgttgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatcta 55559438  T
Q  847 gggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactat 946  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  55559439 gggaagatcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccaaggtattcattcccaggatgaatcttattccgagtggtccaggactac 55559538  T
Q  947 ccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatct 1045  Q
    |||||||||||| | |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  55559539 ccttcaaattcatgcgcagataatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttattt 55559638  T
Q  1046 tcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaag 1110  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  55559639 tcctaagcctgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctagaaaag 55559703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13337896 - 13337320
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13337896 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtggt 13337797  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  13337796 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacacacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 13337697  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  13337696 ttttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgatattattgtaatgtgttg 13337597  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13337596 aggtttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacgaca 13337497  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13337496 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcatgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgtttatgtcacttatagactttgt 13337397  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgatt 580  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13337396 gtatctcgatttgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttgatt 13337320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 316; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 901 - 1527
Target Start/End: Original strand, 37531860 - 37532489
Alignment:
Q  901 gtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaa 1000  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  37531860 gtattcattctcaggatgaatcttattccgcatgatccaggactacccttcaaattcagacgcatgcaatttccattgacactttgttttgcaatgacaa 37531959  T
Q  1001 taaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaac 1099  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||| |  ||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  37531960 taaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtggaagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgga--actctatgtcgctgtctctcgagttac 37532057  T
Q  1100 ttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaag---t 1196  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||     |    
T  37532058 ttctagaaaaagtttgaagctgctcatcttgaatgaagataataatgtttgcaaggagaccacgaatgttgtgtatggtgaagtttttcaaaaagtatat 37532157  T
Q  1197 atgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttattttt---aatttctatgta 1293  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   ||||||| ||||    
T  37532158 atgaccattggttatgttttagagttgttgttgctataatttagaaaacaaaagttgcgtattgtttggaagtcattttttttttttaaatttctttgta 37532257  T
Q  1294 aggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcgga 1392  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| |    
T  37532258 agacgtactggtcattacaggacatgcaatttctatataagcaggtcctcctgccattgacttttaattgatgcatttttcaggtataacaatacgcgaa 37532357  T
Q  1393 accnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctg 1492  Q
    ||             ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37532358 ac---ttttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcggcgtttctg 37532454  T
Q  1493 tagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532455 tagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 37532489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 461
Target Start/End: Original strand, 55558679 - 55559131
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  55558679 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 55558778  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  55558779 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaaaaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 55558878  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||| ||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  55558879 gatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcagtatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttaatgtgt 55558978  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  55558979 tgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacgg 55559078  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 461  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  55559079 caacaacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 55559131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 185 - 499
Target Start/End: Original strand, 617956 - 618270
Alignment:
Q  185 ggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaa 284  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617956 ggaatgacaatagctttaggtggtgatttcaagcagatattgcatgttgtctgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcaattcatcaa 618055  T
Q  285 agatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaa 384  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  618056 agatataggcttattgtaatttgttgaggctaactgttaatatgagattgagtgcatctttggtatctgcagagcaggaagaaattcctaattttaacaa 618155  T
Q  385 gtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaat 484  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  618156 gtgaatactctcaattggagacgacaacgaagcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaat 618255  T
Q  485 ccgttgatgtcactt 499  Q
    ||||| |||||||||    
T  618256 ccgttcatgtcactt 618270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1190 - 1549
Target Start/End: Original strand, 55559710 - 55560078
Alignment:
Q  1190 aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgtt------ttatttttaa 1283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||  ||      || |||||||    
T  55559710 aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgctgctataatttagaaaactaaagttgcgcattgattgaaagttattgtttttttttttttaa 55559809  T
Q  1284 tttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaaca 1383  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55559810 tttctttgtaaggcgtaccggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcttcctgccattgactattaattcatgcatttttcaggtttaaca 55559909  T
Q  1384 atccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggtta-ccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatc 1482  Q
    ||||||||||||            ||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55559910 atccgcggaacc--ttttttttttacatcgttgttacccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatt 55560007  T
Q  1483 gacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  55560008 ggtgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 55560078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13344596 - 13344441
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13344596 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtggt 13344497  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaac 166  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13344496 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaac 13344441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1432 - 1527
Target Start/End: Original strand, 618302 - 618397
Alignment:
Q  1432 atatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  618302 atatttacattagaccattgattttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcgacgtttttgtagcccaaactatatctatacacacccgtaaaaaa 618397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 25708717 - 25708653
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25708717 attactccctccgtccctaattataagacctttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 25708653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 53277224 - 53277160
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53277224 attactccctccgtccctaattataagacccttttaagaatttttttgtccctttttataagacc 53277160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1628
Target Start/End: Original strand, 15241479 - 15241541
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15241479 ttactccctccgtccctaattataagactcttttgagaatttttttgtccctttttataagac 15241541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 20455218 - 20455156
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20455218 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 20455156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 10588075 - 10588136
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10588075 tactccctccgtccctaattataacatccttttgagaatttttttgtccctttttataagac 10588136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 17610057 - 17609996
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17610057 tactccctccgtccctaattataagatccttttgagaatttttttgtccctttttataagac 17609996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 47806858 - 47806923
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  47806858 attactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 47806923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 34273257 - 34273193
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  34273257 ttactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 34273193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1628
Target Start/End: Original strand, 52977980 - 52978044
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  52977980 attactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 52978044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 2615982 - 2615919
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2615982 tactccctccgtccctaatcataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 2615919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 4035825 - 4035888
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  4035825 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 4035888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 5375594 - 5375531
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  5375594 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 5375531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 28501423 - 28501360
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28501423 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 28501360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1570 - 1629
Target Start/End: Original strand, 37352547 - 37352606
Alignment:
Q  1570 tccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37352547 tccctccgtccttaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 37352606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1570 - 1629
Target Start/End: Original strand, 37357446 - 37357505
Alignment:
Q  1570 tccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37357446 tccctccgtccttaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 37357505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 45742843 - 45742780
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  45742843 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 45742780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1559 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 20391482 - 20391412
Alignment:
Q  1559 aaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||    
T  20391482 aaataaactactccctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaaaatttgtccctttttataagacc 20391412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 43388033 - 43387967
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  43388033 aattacttcctccgtccctaattataagacccttttgagaatttcttttgtccctttttataagacc 43387967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 9328277 - 9328216
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  9328277 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 9328216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 25124283 - 25124219
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttat--ccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  25124283 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaaattttttttgaccctttttataagacc 25124219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Original strand, 33413518 - 33413579
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  33413518 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccttttttataaga 33413579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Original strand, 52870644 - 52870705
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataaga 1627  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  52870644 tactccctccgtctctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataaga 52870705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1557 - 1628
Target Start/End: Original strand, 6807419 - 6807491
Alignment:
Q  1557 caaaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  6807419 caaaatcaaatactccctctgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 6807491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 1859144 - 1859207
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  1859144 tactccctccgtccctaattataagacctttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 1859207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 4415965 - 4416028
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  4415965 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaatgttttttgtccctttttataagacc 4416028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 6753525 - 6753588
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  6753525 tactccctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 6753588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 24754078 - 24754141
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  24754078 tactccctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 24754141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 26626039 - 26625976
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgaga-aattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  26626039 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagatttttttttgtccctttttataagacc 26625976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 31937076 - 31937139
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  31937076 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 31937139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 32033030 - 32032965
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa---attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||    
T  32033030 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttttgtccctttttataagacc 32032965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 36391854 - 36391917
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  36391854 tactccctccgtccttaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 36391917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 44294789 - 44294852
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||    
T  44294789 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccttttttataagacc 44294852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 46949992 - 46950055
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  46949992 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaatattttttgttcctttttataagacc 46950055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 48030313 - 48030376
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  48030313 tactccctccatccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 48030376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1611
Target Start/End: Original strand, 30771526 - 30771572
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttt 1611  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30771526 attactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttt 30771572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 32899255 - 32899193
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||    
T  32899255 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagattttttttgttcctttttataagacc 32899193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 49373733 - 49373667
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  49373733 aattactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttggccctttttataagacc 49373667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 55632299 - 55632233
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  55632299 aattactccctccgtctctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 55632233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1573 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 422959 - 422902
Alignment:
Q  1573 ctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttt-atccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  422959 ctccgtctctaattataagacccttttgagaattttttttatccctttttataagacc 422902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1628
Target Start/End: Original strand, 41620519 - 41620576
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaat-tttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  41620519 cctccgtccctaattataagacccttttgagaattatttttatctctttttataagac 41620576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 45097202 - 45097141
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  45097202 tactccatccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 45097141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1569 - 1629
Target Start/End: Original strand, 54676549 - 54676610
Alignment:
Q  1569 ctccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  54676549 ctccctccgtccctaattataagacctttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 54676610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 5743697 - 5743633
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattt-tttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||    
T  5743697 ttactccctccgtccctaattataagacccttttgagaaaaaaatttgtccctttttataagacc 5743633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 19282119 - 19282055
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  19282119 ttactccctacgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 19282055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1592 - 1628
Target Start/End: Original strand, 20788957 - 20788993
Alignment:
Q  1592 acccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20788957 acccttttgagaaattttttgtccctttttataagac 20788993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Original strand, 50352063 - 50352127
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  50352063 ttactccctccgtctctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 50352127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1586 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 9808615 - 9808572
Alignment:
Q  1586 tataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9808615 tataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 9808572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 14794060 - 14793997
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  14794060 ttactacctccgtctctaattataagacccttttaagaatttttttgtccatttttataagacc 14793997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 17339078 - 17339141
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  17339078 tactacctccgtctctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 17339141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 28298408 - 28298345
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  28298408 tactacctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 28298345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 33988829 - 33988766
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  33988829 ttactacctccgtccctaattataagacgtttttaagaatttttttgtccctttttataagacc 33988766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1563 - 1629
Target Start/End: Original strand, 36990910 - 36990977
Alignment:
Q  1563 aaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttta-tccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  36990910 aaattactacctccgtctctaattataagacctttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 36990977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1563 - 1629
Target Start/End: Original strand, 37173829 - 37173896
Alignment:
Q  1563 aaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgaga-aattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  37173829 aaattactaccttcgtccctaattataagacccttttgagagttttttttgtccctttttataagacc 37173896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1573 - 1627
Target Start/End: Original strand, 39184279 - 39184334
Alignment:
Q  1573 ctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39184279 ctccgtccctaattataagaccattttgagaaatttttttgtccctttttataaga 39184334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 47228766 - 47228703
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  47228766 ttacttcctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccatttttataagac 47228703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1625
Target Start/End: Original strand, 49793091 - 49793150
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataa 1625  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  49793091 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataa 49793150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1570 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 50424888 - 50424829
Alignment:
Q  1570 tccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  50424888 tccctccgtctctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 50424829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 53629792 - 53629855
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||    
T  53629792 tactccctccatccctaattataagacccttttgagaattttttttgtctctttttataagacc 53629855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 55563166 - 55563100
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgaga--aattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||    
T  55563166 attactacctccgtccctaattataagacccttttgagattttttttttgtccctttttataagacc 55563100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 468537 - 468479
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  468537 cctccgttcctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttaaaagacc 468479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1625
Target Start/End: Original strand, 8343908 - 8343966
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataa 1625  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8343908 tactccttccgttcctaattataagacctttttgagaatttttttgtccctttttataa 8343966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Original strand, 37842172 - 37842238
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  37842172 aattattccctccgtccctaattataagactcttttgataattttttttgtccctttttataagacc 37842238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 38900081 - 38900019
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||| | |||||| || ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38900081 attactacatccgtctctaattataagatccttttgagaatttttttgtccctttttataaga 38900019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 50533884 - 50533946
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  50533884 tactccctccgtccctaattataagatcattttgagaatttttttggtcctttttataagacc 50533946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1584 - 1629
Target Start/End: Original strand, 51335810 - 51335856
Alignment:
Q  1584 attataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  51335810 attataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 51335856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 56432518 - 56432580
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||||    
T  56432518 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtctctttttataagac 56432580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 4455060 - 4455124
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttta--tccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  4455060 tactccatccgtccctaattataagactcttttgagaattttttttgttccctttttataagacc 4455124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1563 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 7698510 - 7698442
Alignment:
Q  1563 aaattactccctccgtccctgattataaaacccttttg--agaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  | ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  7698510 aaattactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaaataatttgtccctttttataagacc 7698442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 11469275 - 11469211
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaaccc-ttttgagaa--attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  11469275 tactacctccgtccctaattataaaaccctttttgagaatttttttttgtccctttttataagac 11469211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 11522186 - 11522250
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaaccc-ttttgagaa--attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  11522186 tactacctccgtccctaattataaaaccctttttgagaatttttttttgtccctttttataagac 11522250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 20768253 - 20768192
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  20768253 tactacctccgtccttaattataaaacccttttaagaattttttttgtccctttttataaga 20768192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1584 - 1629
Target Start/End: Original strand, 23621476 - 23621521
Alignment:
Q  1584 attataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  23621476 attataagacccttttgagaatttttttgtccttttttataagacc 23621521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1601
Target Start/End: Complemental strand, 35675960 - 35675923
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttga 1601  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35675960 aattactccctccgtccctaattataagacccttttga 35675923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 51536168 - 51536230
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  51536168 attactctctccctccctaattataagacctttttgagaa--tttttgtccctttttataagacc 51536230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1628
Target Start/End: Original strand, 54623806 - 54623863
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  54623806 cctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 54623863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 1093; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 1093; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1549
Target Start/End: Original strand, 25218123 - 25219677
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218123 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 25218222  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  25218223 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 25218322  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25218323 ttttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttg 25218422  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25218423 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 25218522  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218523 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 25218622  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25218623 gtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaattt 25218722  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25218723 atgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacac 25218822  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 803  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218823 cggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 25218922  T
Q  804 taatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgta 903  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| || |||    
T  25218923 caatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccagggta 25219022  T
Q  904 ttcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataa 1003  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25219023 ttcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataa 25219122  T
Q  1004 ataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttc 1102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25219123 ataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaacttc 25219222  T
Q  1103 aagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatc 1202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25219223 aagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatc 25219321  T
Q  1203 attggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtact 1302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25219322 attggttatgttttagaattgttgttgctataatttataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtact 25219421  T
Q  1303 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc----nnn 1398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||           
T  25219422 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgtgaaaccttttttt 25219521  T
Q  1399 nnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagccc 1498  Q
             ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25219522 tttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagccc 25219621  T
Q  1499 aaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||    
T  25219622 aaactatatttatacacacccgtaaaaaattaaacatttgcatttaccgactacgt 25219677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 988; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 7822480 - 7820949
Alignment:
Q  30 aggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatcgatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7822480 aggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgaccgatc 7822381  T
Q  130 aatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcat 229  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| ||| || |||| | |    
T  7822380 attgcatgatatcatgtccaaaaatgatcccctaaacacacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcct 7822281  T
Q  230 gtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatga 329  Q
     | ||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822280 attgtccgaggaggaacgaggccgattattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatga 7822181  T
Q  330 gattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaa 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||| ||    
T  7822180 gattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaagaaattgcgaatttttgtaagtggatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaa 7822081  T
Q  430 tggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgat 529  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7822080 tggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtattccgatctgaatgat 7821981  T
Q  530 aaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccag 622  Q
    |||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  7821980 aaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgatttcag 7821881  T
Q  623 gtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtat 722  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7821880 gtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaattgtat 7821781  T
Q  723 taagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggt 822  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7821780 taagagctctggaattccaaatcacatgttgaaactaaaggtggaatttccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggt 7821681  T
Q  823 acgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatc 922  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  7821680 actaggctgatagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaag-ggcaggtattagggtattcattcccaggatgtatc 7821582  T
Q  923 ttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatc 1022  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7821581 ttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagctagggtcaatc 7821482  T
Q  1023 tttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctg 1121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7821481 tttatctcgagtgggggtttatcttcctaagtctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaacttcaagaaaaggtctaaagctg 7821382  T
Q  1122 ctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaat 1221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7821381 ctcatcctggatgaagataataatgtttataaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggttaagttttagaat 7821283  T
Q  1222 tgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaa 1321  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7821282 tgttgtcgctataatttataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaa 7821183  T
Q  1322 tttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc-nnnnnnnnnnnnacatcgtggttac 1420  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             ||||||| |||||    
T  7821182 tttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcgaaacctttttttttttttacatcgttgttac 7821083  T
Q  1421 cttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccg 1520  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7821082 cctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactttatttatacacacccg 7820983  T
Q  1521 taaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||     |||| ||||||||||||||||||||    
T  7820982 taaaaaaataaacatttgcatttaccgactacgt 7820949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 872; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 274 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 30307575 - 30306283
Alignment:
Q  274 caattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgct 373  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30307575 caattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagtgggaagaaattgct 30307476  T
Q  374 aattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcgg 473  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  30307475 aatttttgcaagtagatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaatgtagaaattcctgaagatttgctgatatcgg 30307376  T
Q  474 acacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgc 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||    
T  30307375 acacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaacgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgc 30307276  T
Q  567 accaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcg 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | |||||    
T  30307275 accaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctccgattctatttttagatcg 30307176  T
Q  667 ggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgg 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  30307175 ggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctgcaattccaaatcacaagttgaaactaaaggtgg 30307076  T
Q  767 gatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgc 866  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30307075 gatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctaacagttacacatctagggaagagcacgatagctgc 30306976  T
Q  867 tactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaag 966  Q
    |||  ||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  30306975 taccgtaattacaggaaaaagggcaggtactagggtattcattcccaggatgaatcttattctgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcagg 30306876  T
Q  967 caatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatac 1065  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  30306875 caatttccattgacactttgttttgcaatgacaataaataaaagccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctatgttcacgc 30306776  T
Q  1066 atgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaa 1165  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30306775 atggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcattctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaa 30306676  T
Q  1166 tgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttgg 1265  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30306675 tgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttataaaactaaagttgcctattgtttgg 30306577  T
Q  1266 aagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatg 1365  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  30306576 aagtcattttatttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagaagatcctcctgtcattgactattaattcatg 30306477  T
Q  1366 cacttttcaggtttaacaatccgcggaacc-----nnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaa 1460  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||                 ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30306476 cacttttcatgtttaacaatccgtgaaacctttttctttttttttttacatcgttgataccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaa 30306377  T
Q  1461 aaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||    
T  30306376 aaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtataaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 30306283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 741; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 459 - 1549
Target Start/End: Original strand, 31978533 - 31979633
Alignment:
Q  459 atttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caaga 551  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||       |||||    
T  31978533 atttgctgatatcgggcacaacaaatctgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaaga 31978632  T
Q  552 aaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgat 651  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31978633 aaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgtcaacaaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgat 31978732  T
Q  652 tctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggt 751  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31978733 tctgtttgtagatcgggggaaaattcagatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggt 31978832  T
Q  752 tgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaa 851  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31978833 tgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaagccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaa 31978932  T
Q  852 gagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttc 951  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31978933 gagcacgatagctgctaccgtaattacaagaaaaatggcaggtaccagggtattcattccgaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttc 31979032  T
Q  952 aaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttccta 1050  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  31979033 aaattcaggcgcatgcaatttccattgacgctttgttttacaatgacaataaataaaaaccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttctta 31979132  T
Q  1051 agcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttg 1150  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31979133 agtctgtgttcacgcatgaacaactttatttcggtgtctctcgagtaacttgaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgttag 31979232  T
Q  1151 taaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaag 1250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31979233 taaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtacgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaag 31979331  T
Q  1251 ttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccatt 1350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31979332 ttgcctattgtttggaagtcattttatttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccatt 31979431  T
Q  1351 gactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatt 1450  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||            ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31979432 gactattaattcatgcacttttctagtttaacaatccgcggaacc--ttttttctttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatt 31979529  T
Q  1451 tgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgact 1545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |    
T  31979530 tgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcagcgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgagt 31979629  T
Q  1546 acgt 1549  Q
    ||||    
T  31979630 acgt 31979633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 736; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1110
Target Start/End: Original strand, 21113300 - 21114409
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21113300 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctaggacagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 21113399  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  21113400 ttttgcggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacaagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 21113499  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||| ||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||    
T  21113500 gatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcacagatatgtgcttattttaatgtgt 21113599  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  21113600 tgacgcttactgttaatatgcgattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacgg 21113699  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21113700 caacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgcttatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacttt 21113799  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21113800 gtgtatcttgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatacttgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaat 21113899  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21113900 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcac 21113999  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21114000 aacgaaattccttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaa 21114099  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| |  |    
T  21114100 gccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccaagg 21114199  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21114200 tattcattcctaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcatgcgcagataatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 21114299  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  21114300 aaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagtctgtgttcacgcatgagcaactctatgtcgctgtctctcgagttact 21114399  T
Q  1101 tcaagaaaag 1110  Q
    || |||||||    
T  21114400 tctagaaaag 21114409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 637; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 702 - 1549
Target Start/End: Original strand, 33861636 - 33862491
Alignment:
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33861636 aacagaattttttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgagatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcat 33861735  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  33861736 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgatagttacacatctagggaagagcacgatagttgatactgtaattacaggaaaaggggaaggtaccagtg 33861835  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33861836 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggcgcaggcaatttccattgacgtgttgttttgcaatgacaat 33861935  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33861936 acataaaagtgagggtcaatctttatctcaagtgggggtttatcttcttaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaact 33862035  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33862036 tcaagaaaaggtctgaagttggtcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaaatttttcaaaaaagtatga 33862135  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33862136 tcattggttatgttttagaattgttattgctataatttcgaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgta 33862235  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc-nnnn 1399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         
T  33862236 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccccctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatctgcggaaccttttt 33862335  T
Q  1400 nnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagccca 1499  Q
            ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33862336 ttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacatttttgtagccca 33862435  T
Q  1500 aactatatttatacacacccgtaaa------aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  33862436 aactatatttatacacacccgtaaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 33862491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 606; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1047
Target Start/End: Original strand, 25208605 - 25209635
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25208605 tcatcgcttacgatggaaaaggaaagtcctagggcagacctgatgcgtgctccaaagttgataatttgggatgagactccaatgatgcaccgatggtgtt 25208704  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||     ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  25208705 ttgaggcagttgaccgatcattgtgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaagacacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 25208804  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
    ||| ||| || |||| | |||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25208805 ttttaggcagatattgcctgttttccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgagcttattgtaatgtgttg 25208904  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25208905 aggcttaatgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggacgaaattactaatttttgcaagtggatactctcaattggagacgaca 25209004  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25209005 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatgtcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt-- 25209102  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
                 |||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25209103 -------------aatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaattt 25209189  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  25209190 atgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggcgaaaattctgatgtccaaagctagtggttcacac 25209289  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25209290 cagaatttcttaatggtattaagagctctggtattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 25209389  T
Q  804 taatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcagg-aaaagtggcaggtactagtgt 902  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||  |||||||||||| ||    
T  25209390 caatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaaagggcaggtactagggt 25209489  T
Q  903 attcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaata 1002  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  25209490 attcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcagacaatttccattgacgctttgttttgcaatgataata 25209589  T
Q  1003 aataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttc 1047  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25209590 aataaaagccagggtcagtctttatctcgagtgggggtttatcttc 25209635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 516; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 805 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 7781608 - 7780859
Alignment:
Q  805 aatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtat 904  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  7781608 aatggactgtgtaatggtactaggctgatagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaag-ggcaggtattagggtat 7781510  T
Q  905 tcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaa 1004  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7781509 tcattcccaggatgtatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaa 7781410  T
Q  1005 taaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttca 1103  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7781409 taaaagctagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagtctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaacttca 7781310  T
Q  1104 agaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatca 1203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7781309 agaaaaggtcttaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttataaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaa-gtatgatca 7781211  T
Q  1204 ttggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactg 1303  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7781210 ttggttaagttttagaattgttgtcgctataatttataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtactg 7781111  T
Q  1304 gtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc-nnnnnnn 1402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||            
T  7781110 gtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccttctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcgaaacctttttttt 7781011  T
Q  1403 nnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaac 1502  Q
         ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781010 tttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaac 7780911  T
Q  1503 tatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    | ||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||    
T  7780910 tttatttatacacacccgtaaaaaaataaacatttgcatttaccgactacgt 7780859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 957 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 14713999 - 14713417
Alignment:
Q  957 caggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggggtttatcttcctaagcctg 1056  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14713999 caggcgcatgcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaattcagggtcaatctttatctcgagtgggatttatcttcctaagcccg 14713900  T
Q  1057 tgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaagga 1156  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  14713899 tgttcacgtatgaacaactttatgtcgctgtctctcgagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttgaatggagataataatgtttgcaagga 14713800  T
Q  1157 gaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcct 1256  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  14713799 gaccacgaatgttgtttatcgtgaagtttttca-aaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctgtaatttagaaaaccaaagttgcgt 14713701  T
Q  1257 attgtttggaagtcgttttattttt--------aatttctatgtaaggcgtactggtcatta-tagacatgcaatttctatataagcagatccctctgcc 1347  Q
    |||||||||||||| |||| |||||         |||||| | |||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||    
T  14713700 attgtttggaagtcttttttttttttttttatatatttctttataagacgtattggtcattacaagacatgcaatttctatataagcatgtcctcctgcc 14713601  T
Q  1348 attgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaac----cnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacatta 1443  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||                 ||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  14713600 attgacttttaattgatgcatttttcaggtataacaatacgcgaaactttttttttttttttttacatcgttgttaccctaaaatataatatttacatta 14713501  T
Q  1444 aaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
     ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14713500 gaccattgattttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcgacatttctgtagtccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 14713417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 759 - 1234
Target Start/End: Complemental strand, 14767469 - 14766990
Alignment:
Q  759 aagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacg 858  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14767469 aagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcatgccaatggactgtgtaatggtgcgaggctgacagttacacatctagggaagagcacg 14767370  T
Q  859 atagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattca 958  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||    
T  14767369 atagctgctaccgtaattacaggaaaaaggacaggtaccagagtattcattcccaagatgaatcgtattccgagcgatcaaggactaccattcaaattca 14767270  T
Q  959 ggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgt 1057  Q
     |  || |  |||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| ||    
T  14767269 agcacaggtgatttccattgacacttttgtttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatcttgagtaggagttgatcttcctaagcccgt 14767170  T
Q  1058 gtt----catacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaa 1153  Q
     ||    |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||    
T  14767169 attcacgcatatatggacaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctataaaaggtttgaagctgctcattttgaatgaagataataatgtttgcaa 14767070  T
Q  1154 ggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctata 1234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14767069 ggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgttcattggttatattttagaattgttgttgctata 14766990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1099 - 1385
Target Start/End: Original strand, 25209632 - 25209917
Alignment:
Q  1099 cttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtat 1198  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25209632 cttcaagaaaaggtcttaagctgcttatcctggataaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa-agtat 25209730  T
Q  1199 gatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcg 1298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25209731 gatcattggttatgttttagaattattgttgctataatttataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcg 25209830  T
Q  1299 tactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaat 1385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25209831 tactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaat 25209917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1039 - 1526
Target Start/End: Complemental strand, 13425242 - 13424761
Alignment:
Q  1039 tttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaaga 1138  Q
    |||||||||||||| | |||||||  |||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13425242 tttatcttcctaagtccgtgttcacgcatggacaactctatgtcactgtctctcgagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaaga 13425143  T
Q  1139 taataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaa-ttgttgttgctataatt 1237  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  13425142 taataatgtttgcaaggagatcacaaatgttatgtatcgtgaagtttttca-aaaagtatgatcattggttatgttttagaatttttttttgctataatt 13425044  T
Q  1238 tagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcag 1336  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||   || |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13425043 tagaaagctaaagttgcgaattgtttggaagtc---ttttttttaatttctttgtaagacgtactagtcattataggacatgcaatttctatataagcag 13424947  T
Q  1337 atccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatt 1436  Q
    ||||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||             ||||||| |||| | |||| ||| |||||    
T  13424946 atcctcctgccattgaattttaattgatgcacttttcaggtataacaatacgtggaac----ttttttttaacatcgttgttaacctaaagtacaatatt 13424851  T
Q  1437 tacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaa 1526  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13424850 tacattaaacaattggttttataaaaaataaaaacaaataacaatcggcgtttctttagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaa 13424761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1180 - 1549
Target Start/End: Original strand, 21114407 - 21114789
Alignment:
Q  1180 aagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttat-- 1277  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| |      
T  21114407 aagtttttttaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgtcgttgctataatttagaaaactaaagttgcgcattgattgaaagttgtttttttt 21114506  T
Q  1278 ---ttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttca 1374  Q
       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21114507 ttcttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttttatataagcagatcttcctgccattgactattaattcatgcacttttca 21114606  T
Q  1375 ggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggtta-ccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaa 1473  Q
    |||||||||||||||||||||            ||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21114607 ggtttaacaatccgcggaaccgtttttttttttacatcgttgttacccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaataacaa 21114706  T
Q  1474 ataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacac-acccgtaaa------aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  21114707 ataacaatcggcgtttctgtaacccaaactatatttatacacaacccgtaaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 21114789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30326136 - 30325877
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326136 tcatcgcttacgatggaaaatgatagtcctagggcagacctggtgcatgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 30326037  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| ||||    
T  30326036 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggttgtga 30325937  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctc 270  Q
    ||| ||| || |||| | | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30325936 ttttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctc 30325877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 706 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 14714224 - 14714003
Alignment:
Q  706 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggcta 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||  |    
T  14714224 gaatttcttaatggtattaagagctctggcattccaaatcacaggttgaaactaagggtgggatgtctagttaggctgatgagaaacattgatgaggtca 14714125  T
Q  806 atggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtatt 905  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||   || ||||| || |||||    
T  14714124 atggtctgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgcaactgtaattacgagaaaaagagctggtaccagggtatt 14714025  T
Q  906 cattcccaggatgaatcttatt 927  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14714024 cattcccaggatgaatcttatt 14714003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1230 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 14765059 - 14764764
Alignment:
Q  1230 ctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttattttt-aatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttcta 1327  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||   |    
T  14765059 ctataattaagaaaactaaagttacgtattgtttggaagtgttttttttttttaatttctttgtaaggcgtattggtcattacacgacatgcaattga-a 14764961  T
Q  1328 tat-aagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaa 1426  Q
    ||| || |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||             |||| || ||||||| |||    
T  14764960 tattaaacagatcctcctgccattgacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatactctgaac----tttttttttacattgttgttacct-aaa 14764866  T
Q  1427 atacgatatttacattaaaccatttgtttt-gtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaa 1525  Q
    |||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14764865 atacaatatttacattagaccgttggtttttgtaaaaaataaaaataaataacaatcgacgtttccgtagcctaaactatatttatacacacccgtaaaa 14764766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 29806259 - 29806197
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29806259 tactacctccgtccctaattataaaacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 29806197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1555 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 2944321 - 2944246
Alignment:
Q  1555 tacaaaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  2944321 tacaaaaacaattactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 2944246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 28192214 - 28192149
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  28192214 attactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 28192149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1560 - 1629
Target Start/End: Original strand, 44502613 - 44502682
Alignment:
Q  1560 aataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  44502613 aatatattactccctccgtccctaattataagatccttttgagattttttttgtccctttttataagacc 44502682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 51133 - 51069
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  51133 ttactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 51069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Original strand, 39029177 - 39029241
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgag-aaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  39029177 ttactccctccgtccctaattataagacccttttgagaaaattttttgtccttttttataagacc 39029241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 8251970 - 8251907
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  8251970 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 8251907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 13153928 - 13153991
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  13153928 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 13153991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 18754144 - 18754207
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  18754144 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 18754207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 40741265 - 40741328
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  40741265 tactccctccgtccctaattataatacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 40741328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 7758946 - 7758884
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7758946 tactccctccgtccctaattataagacacttttgagaatattttttgtccctttttataagac 7758884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 8951465 - 8951403
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  8951465 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 8951403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 12802611 - 12802673
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  12802611 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaaaaaatttatccctttttataagacc 12802673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 36177143 - 36177077
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  36177143 aattactccctccgtccctaattataagactcttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 36177077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 40529307 - 40529369
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  40529307 tactccctccgtccctaattataagatccttttgagaatttttttgtccttttttataagacc 40529369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 44251161 - 44251095
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  44251161 aattactccctccgtccctaattataagaccattttgagaattttttttgtccctttttataagacc 44251095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 8948390 - 8948325
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  8948390 attactccatccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 8948325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Original strand, 28572046 - 28572107
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  28572046 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 28572107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Original strand, 28579639 - 28579700
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  28579639 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 28579700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 33980465 - 33980526
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33980465 tactacctccgtccctaattataagacttttttgagaaattttttgtccctttttataagac 33980526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 40784891 - 40784952
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40784891 tactacctccgtccctaattataagacctttttgagaatttttttgtccctttttataagac 40784952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1628
Target Start/End: Original strand, 1774340 - 1774404
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  1774340 attactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccttttttataagac 1774404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 33745932 - 33745872
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  33745932 tactccctccgttcctaattataagatccttttgagaatttttttgtccctttttataaga 33745872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 2152277 - 2152214
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  2152277 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 2152214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 5162304 - 5162367
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  5162304 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 5162367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 11798605 - 11798668
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  11798605 tactccctctgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 11798668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 18455720 - 18455783
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  18455720 tactccctccgtccctaattataagacccttttaagaattttttttgtccctttttataagacc 18455783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1563 - 1629
Target Start/End: Original strand, 19176132 - 19176199
Alignment:
Q  1563 aaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgag-aaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  19176132 aaattactacctccgtccttaattataagacccttttgagtaatttttttgtccctttttataagacc 19176199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 29321331 - 29321268
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29321331 tactacctccatccctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 29321268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 34568490 - 34568553
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||    
T  34568490 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtcccttattataagacc 34568553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 38878721 - 38878784
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  38878721 tactccctccgtctctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 38878784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 5593421 - 5593482
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  5593421 tactccttccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttat-catttttataagacc 5593482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 29598224 - 29598286
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  29598224 tactccctccgtctctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 29598286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 43654240 - 43654178
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  43654240 tactccctccgtccctaattataagactcttttgagaattttttttgtccctttttataagac 43654178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 44580911 - 44580853
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  44580911 cctccgtccctaattataagacctttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 44580853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1563 - 1611
Target Start/End: Complemental strand, 9035580 - 9035532
Alignment:
Q  1563 aaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttt 1611  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  9035580 aaattactccctccgtccctaattataagaccattttgagaattttttt 9035532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1573 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 33865572 - 33865516
Alignment:
Q  1573 ctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  33865572 ctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 33865516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 5774048 - 5774111
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  5774048 tactacctccgtccctaattataagactcttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 5774111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 14699452 - 14699515
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  14699452 tacttcctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 14699515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 32475264 - 32475201
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttta-tccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  32475264 tactccctctgtccctaattataagacccttttgggaattttttttgtccctttttataagacc 32475201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 32675794 - 32675731
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattt-tttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||    
T  32675794 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaaaaaaatttgtccctttttataagacc 32675731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 34490517 - 34490580
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  34490517 tactccctccgtccctaattataagatctttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 34490580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 14584168 - 14584106
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  14584168 tactacctccgttcctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 14584106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 17856813 - 17856751
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    || |||||||||||||||||    
T  17856813 tactccctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaaaaattgtccctttttataagacc 17856751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 985 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 17886280 - 17886246
Alignment:
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtca 1019  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17886280 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtca 17886246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Original strand, 23995582 - 23995640
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttg-agaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  23995582 cctccgtccctaattataaaacccttttgaaaaaataatttgtccctttttataagacc 23995640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 985 - 1019
Target Start/End: Original strand, 25089468 - 25089502
Alignment:
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtca 1019  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25089468 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtca 25089502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1578 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 35143545 - 35143495
Alignment:
Q  1578 tccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  35143545 tccctaattataagacccttttgagaatatttttgtccctttttataagac 35143495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 12255094 - 12255158
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  12255094 attactccctccgtccctaattataagatcc-tttgagaattttttttgtccctttttataagacc 12255158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 12260637 - 12260701
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  12260637 attactccctccgtccctaattataagatcc-tttgagaattttttttgtccctttttataagacc 12260701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 13335932 - 13335871
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | | | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13335932 tactacctccgtccctaattatcagatcgttttgagaatttttttatccatttttataagac 13335871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Original strand, 17336416 - 17336481
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||||||||||||    
T  17336416 aattactacatccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataattgtccctttttataagacc 17336481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1611
Target Start/End: Complemental strand, 18641418 - 18641373
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttt 1611  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18641418 ttactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttt 18641373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1576 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 44057063 - 44057010
Alignment:
Q  1576 cgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  44057063 cgtccctaattataagaccattttaagaaattttttgtccgtttttataagacc 44057010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 1049; Significance: 0; HSPs: 85)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 1049; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 27881745 - 27880199
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27881745 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcaaacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 27881646  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  27881645 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 27881546  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
    ||| ||| || |||| ||||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27881545 ttttaggcagatattgcatgttgtccgaggaggaacaaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgttg 27881446  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27881445 aggcttaccgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacatgcagagcaggtagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacggca 27881346  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27881345 acgatgcttcggatgacaatggtgaaataaaggtagaaactcctgaagatttgctgatatcggacccaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 27881246  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27881245 gtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagctgagcatgttaacgaattt 27881146  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  27881145 atgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtagatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggttcacac 27881046  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 803  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27881045 tggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 27880946  T
Q  804 taatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgta 903  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||| |||||| |||    
T  27880945 taatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattacaggaaaaagggcagatactagggta 27880846  T
Q  904 ttcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataa 1003  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27880845 ttcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaatttaggcgcatgcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataa 27880746  T
Q  1004 ataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttc 1102  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27880745 ataaaagtcagcgtcaatctttatctcgagtggggttttatcttcctaagcctgtgtttacgcatggacaac-ttatgtcgctgtctctcgagtaacttc 27880647  T
Q  1103 aagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatc 1202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27880646 aagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatc 27880548  T
Q  1203 attggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtact 1302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27880547 attgcttatgttttagaattgttgttgctataatttataaaactaaagttgcctattatttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtact 27880448  T
Q  1303 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnn 1402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||           
T  27880447 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgactattaattcatgcacttttcatgtttaacaatccgcgaaacc---tttt 27880351  T
Q  1403 nnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaac 1502  Q
         ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27880350 tttttacatcgttgataccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggtgtttctgtagcccaaac 27880251  T
Q  1503 tatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  27880250 tatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 27880199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 1027; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 39883838 - 39882294
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39883838 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctaaggcagacctggtgcgtgctgcaaagctgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 39883739  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||        ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || |||| |||||    
T  39883738 ttttgaggcagctgaccgatcattgc--------atgtccaagaatgatcccctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttacgtggt 39883647  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || |||| | ||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||    
T  39883646 gatttcaggcagatattgcctgttgtcctaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaagatattggcttattgtaatatgt 39883547  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39883546 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcagcttcggtacatgcagagcatgaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 39883447  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39883446 caacgacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagatattcctaaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 39883347  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39883346 gtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 39883247  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
     |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39883246 ttatgatgtcgttgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgacaattatgatgtccaaagcgagtggttcac 39883147  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39883146 atcggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacatgttgaaattaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 39883047  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| || |    
T  39883046 gccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccaggg 39882947  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39882946 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatcaagaactacccttcaaattcaggcgcagacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 39882847  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39882846 aaataaaagccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcataagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctatctctcgagtaact 39882747  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39882746 tcaagaaaaggtctgaagttgctcatcctggatgaaaataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatga 39882648  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39882647 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgta 39882548  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnn 1400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  39882547 ctggtcattatagacatgcaatttctttataagcagatcctcctgacattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacctgttt 39882448  T
Q  1401 nnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaa 1500  Q
           ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39882447 tttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaa 39882348  T
Q  1501 actatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  39882347 actatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 39882294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 1015; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 37373597 - 37372038
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37373597 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgagactccaatgatgcaccgatggtgtt 37373498  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||    
T  37373497 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatcacagtagttttaggtggtga 37373398  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
    ||| | | || |||| | ||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37373397 ttttaagcagatattgcctgttgtctgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcgtcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttg 37373298  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37373297 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 37373198  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37373197 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacataacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 37373098  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctc-------aagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37373097 gtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttcgaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaaccaattt 37372998  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37372997 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgataattctgatgtccaaagcgagtggttcacac 37372898  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37372897 cagaatttcttaatggtattaagagctttggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgattaggc 37372798  T
Q  804 taatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgta 903  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  37372797 caatggactgtgtaatggtactaggctgacaattacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaatggcaggtactagggta 37372698  T
Q  904 ttcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataa 1003  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37372697 ttcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccagaactacccttcaaattcaagcgcaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataa 37372598  T
Q  1004 ataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttc 1102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37372597 ataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtattcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaacttc 37372498  T
Q  1103 aagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatc 1202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37372497 aagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagatgataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatc 37372399  T
Q  1203 attggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtact 1302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37372398 attgattatgttttagaattgttgttgctataatttataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtatt 37372299  T
Q  1303 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc------- 1395  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||           
T  37372298 ggtcattatatacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgtgaaaccttttttt 37372199  T
Q  1396 --nnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgt 1493  Q
                  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37372198 ttatttttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgt 37372099  T
Q  1494 agcccaaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||||||    
T  37372098 agcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccaactacgt 37372038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 988; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 3690640 - 3689099
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3690640 catcatcacttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcctgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgaaccgatggtg 3690541  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||    
T  3690540 ttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcatatccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgatagtagttttaggtggt 3690441  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3690440 gatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 3690341  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3690340 tgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 3690241  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  3690240 caacgacacttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatggacttt 3690141  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctc-------aagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||       |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3690140 gtatatcccgatttgaatgataacattggtgacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaat 3690041  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  3690040 atatgatgtcagtgattccaagtggagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattctgatctctagagcgagtggttcac 3689941  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3689940 aacggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaatggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 3689841  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||  || |||||| || |    
T  3689840 gtcaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagatgctactgtaaatacatgaaaaagggaaggtaccaggg 3689741  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3689740 tattcattcccaagatgaatcttattccgagtgacccaggaatacccttcaaattca-gcgcaagcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 3689642  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3689641 aaataaaagtcaaggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcttgtgttcacgcatgggcaactttatgtcgctgtctctcgagtaact 3689542  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3689541 tcaagaaaaggtttgaagctgctcgtcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatattgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatga 3689443  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3689442 tcattggttatgttttagaattgttgctgctataatttagaaaaccaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaagacgta 3689343  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc---nn 1397  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |         
T  3689342 ttggtcattatagacatgcaatttctata--------------tgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcagaaacttttt 3689257  T
Q  1398 nnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcc 1497  Q
              |||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3689256 ttttttttttacattgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcc 3689157  T
Q  1498 caaactatatttatacacacccgtaaa------aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  3689156 caaactatatttatacacacccgtaaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 3689099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 984; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1549
Target Start/End: Original strand, 3876147 - 3877688
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3876147 catcatcacttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcctgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgaaccgatgatg 3876246  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||    
T  3876247 ttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcatatccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgatagtagttttaggtggt 3876346  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3876347 gatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 3876446  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3876447 tgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 3876546  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  3876547 caacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatggacttt 3876646  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctc-------aagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||       |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3876647 gtatatcccgatttgaatgataacattggggacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaat 3876746  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  3876747 atatgatgtcagtgattccaagtggagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattctgatctctagagcgagtggttcac 3876846  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3876847 aacggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaatggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 3876946  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||  || |||||| || |    
T  3876947 gtcaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagatgctactgtaaatacatgaaaaagggaaggtaccaggg 3877046  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3877047 tattcattcccaagatgaatcttattccgagtgacccaggaatacccttcaaattca-gcgcaagcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 3877145  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3877146 aaataaaagtcaaggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcttgtgttcacgcatgggcaactttatgtcgctgtctctcgagtaact 3877245  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3877246 tcaagaaaaggtttgaagctgctcgtcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatattgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatga 3877344  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3877345 tcattggttatgttttagaattgttgctgctataatttagaaaaccaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaagacgta 3877444  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc---nn 1397  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |         
T  3877445 ttggtcattatagacatgcaatttctata--------------tgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcagaaacttttt 3877530  T
Q  1398 nnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcc 1497  Q
              |||| || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3877531 ttttttttttacattgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcc 3877630  T
Q  1498 caaactatatttatacacacccgtaaa------aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  3877631 caaactatatttatacacacccgtaaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 3877688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 977; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1549
Target Start/End: Original strand, 8428143 - 8429683
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8428143 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 8428242  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||    
T  8428243 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatggcagtagttttaggtggtga 8428342  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  8428343 ttttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccagatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgttttg 8428442  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    |||||| ||           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8428443 aggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 8428531  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8428532 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 8428631  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  8428632 gtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaattt 8428731  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8428732 atgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaatattctgatgtccaaagcgagtggttcacac 8428831  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8428832 cagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcgatcaggc 8428931  T
Q  804 taatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttc-aggaaaagtggcaggtactagtgt 902  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| | |||||||  |||||||||||| ||    
T  8428932 caatggactgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattacaaggaaaaagggcaggtactagggt 8429031  T
Q  903 attcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaata 1002  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8429032 attcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcagacgcaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaata 8429131  T
Q  1003 aataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaactt 1101  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8429132 aataaaagacagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcatgtgttcacgcatagacaactttatgtcgatgtctctcgagtaactt 8429231  T
Q  1102 caagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgat 1201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8429232 caagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgat 8429330  T
Q  1202 cattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtac 1301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8429331 cattggttatgttttagaattgttgttgctataatatataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtac 8429430  T
Q  1302 tggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnn 1401  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |          
T  8429431 cggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaattcgtgaaatctttttt 8429530  T
Q  1402 nnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaa 1501  Q
          ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8429531 ttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaa 8429630  T
Q  1502 ctatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  8429631 ctatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 8429683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 964; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1507
Target Start/End: Original strand, 25542349 - 25543849
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25542349 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttaagatgaggctccaatgatgcactgatggtg 25542448  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  25542449 ttttgaggaagttgaccgattaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacagtagttttaggtggt 25542548  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || ||||   ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25542549 gatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgtggcagaatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 25542648  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25542649 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcaaagcagaaagaaattgctaactttggcaagtggatactctcaattggagacgg 25542748  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25542749 caacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatatgttgatgtcacttatagacttt 25542848  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542849 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 25542948  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25542949 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggttcac 25543048  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25543049 aacgaaattccttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 25543148  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||  ||||||||| || |    
T  25543149 gccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctaaggaagagcacgatagctgctaccgtaactacaggaaaaagggcaggtaccaggg 25543248  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | |||||||||||||| || |||||||||  |||||||    
T  25543249 tattcattcccatgatgaatcttattccgagtgatccaggactatctttcaaattcatgcgaaggcaatttccattgacgctttgttttgcggtgacaat 25543348  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  25543349 aaataaaa--gagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatatccctaagcccgtgttcacgcatgggcaactgtatgtcgctgtctctcgagttact 25543446  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25543447 tctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaaaataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatga 25543545  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25543546 tcattgattatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcgtattgattggaagttattttttttttaatttctttgtaaggcgta 25543645  T
Q  1301 ctggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnn 1399  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||         
T  25543646 ctggtcattacaggacatgcaatttctatataagcagatcctcctgcctttgtcttttaattgatgcacttttcaggtataacaatacgcggaac----- 25543740  T
Q  1400 nnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgt-aaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagccc 1498  Q
            |||| || |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25543741 ttttttttacattgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccattggttttgtaaaaaaataaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagccc 25543840  T
Q  1499 aaactatat 1507  Q
    |||||||||    
T  25543841 aaactatat 25543849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 949; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1527
Target Start/End: Original strand, 14192368 - 14193890
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14192368 catcatcacttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatg-tgcaccgatggtg 14192466  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccc-taaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtgg 207  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||    
T  14192467 ttttgaagcaattgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatccccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgacagttgttttaggtgg 14192566  T
Q  208 tgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtg 307  Q
    |||||||||| |  |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  14192567 tgatttcaggcatatattgcatgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccccaattaattcattaaagatatgggcttattataatgtg 14192666  T
Q  308 ttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  14192667 ttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagtaggaagaaattgctaattttgacaagtggatactctcaattggagacg 14192766  T
Q  408 acaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactt 507  Q
     |||||| | |||  || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14192767 gcaacgaagtttcggatcagaatggtgaaatgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactt 14192866  T
Q  508 tgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14192867 tgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgatccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagttgagcatgttaacgaa 14192966  T
Q  601 tatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttca 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14192967 tatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttca 14193066  T
Q  701 caacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatca 800  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14193067 cgacggaatttcgtaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggttggatgtccagttatgctgatgagaaacattgatca 14193166  T
Q  801 ggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagt 900  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| ||     
T  14193167 ggccaatggactgtgtagtggtacaaggctgacagttacacgtctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccagg 14193266  T
Q  901 gtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaa 1000  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  14193267 gtattcattcccaagatgaatcttattccgagtgatccaagactacccttcaaattcagacgcttgcaatttccattgacattttgttttgcaatgacaa 14193366  T
Q  1001 taaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaac 1099  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||    
T  14193367 taaataaaagtcagggtcaatgtttatcttgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcaagcatgaacaactctatgttgctgtctctcgagttac 14193466  T
Q  1100 ttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtata-tcgtgaagtttttcaaaaaagtat 1198  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  14193467 ttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataacgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtattcgtgaagtttttc-aaaaagtat 14193565  T
Q  1199 gatcattggttatgttttagaa-ttgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggc 1297  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  14193566 gatcgttagttatgttttagaatttgttattgctataatttagaaaactaaagttgtgtattgtttggaagtc-tttttttttttatttctttgtaaggc 14193664  T
Q  1298 gtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccn 1396  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||      
T  14193665 gtactggtcattacatgacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatacgcgaaac-- 14193762  T
Q  1397 nnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagc 1496  Q
               ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  14193763 ---ttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccattgattttgtaaaaaataaaaataaataacaatcggcgtttatgtagc 14193859  T
Q  1497 ccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193860 ccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 14193890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 941; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 37261958 - 37260429
Alignment:
Q  17 cttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37261958 cttacgatggaaaaggatagtcctaggacagacctggtgcgtgctgtaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcattgatggtgttttgagg 37261859  T
Q  117 cagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcag 216  Q
     ||||||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  37261858 aagttgactgatcaatgcgcgatatcatgtctaggaatgatcctttaaacgagtttagacctttcggtggaatgacaatagttttatgtggtgatttcag 37261759  T
Q  217 gaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggctt 316  Q
    |||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37261758 gaagatattgcctgttgtctgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgtctcgatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggctt 37261659  T
Q  317 actgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacg 416  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37261658 actgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacggcaacgacg 37261559  T
Q  417 cttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcc 516  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||| || || |  |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||          |||||||||||    
T  37261558 cttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgcttatattggacacaacaa--ccgttgatgtc----------tttgtgtatcc 37261471  T
Q  517 cgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatg 609  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||| |       ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37261470 caatttgaatgataaccttaatgacccgttattttttcaagaaaggggaatacttgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatg 37261371  T
Q  610 tcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaat 709  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  37261370 tcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagcgaatggttcacaaaggaat 37261271  T
Q  710 ttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatgg 809  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37261270 ttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacattgatcaggccaatgg 37261171  T
Q  810 actgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcatt 909  Q
    ||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  37261170 actatgtagtggtacgaggctggaaattacacatctagggaagagcacgatagttgctaccataactacaggaaaaagggcaggtaccagggtattcatt 37261071  T
Q  910 cccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaa 1009  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37261070 ctcaggatggatcttattccgagtgatgcagaactacccttcaaattcaagcgcaggcaatttccatcgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaa 37260971  T
Q  1010 gtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaa 1108  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37260970 gtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgcgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaacttcaagaaa 37260871  T
Q  1109 aggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggt 1208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37260870 aggtctgaagctgctcatcatggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaattttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggt 37260772  T
Q  1209 tatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcat 1308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37260771 tatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaattaaagttgtttattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtactggtcat 37260672  T
Q  1309 tatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnna 1408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||            |    
T  37260671 tatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgactattaattcatgtacttttcacgtttaacaattcgcggaacc---ttttttttta 37260575  T
Q  1409 catcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatt 1508  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37260574 catcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtaacccaaactatatt 37260475  T
Q  1509 tatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||| ||||  |||||     |||||||||||||||| ||||||||    
T  37260474 tatatacacatgtaaaaaattaaacgtttgcatttacggactacgt 37260429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 706 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 4051765 - 4050918
Alignment:
Q  706 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggcta 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  4051765 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccaattatgctgatgagaaacatcgatcagacaa 4051666  T
Q  806 atggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtatt 905  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||  || || ||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  4051665 atggactgtgtaatagtactaggctgtcagttacac--ctagggaagagcacgatagctcctaccgtagttacaggaaaaagggctggtactagggtatt 4051568  T
Q  906 cattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaat 1005  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
T  4051567 cattcccatgatgaatcttattccgagtgatccatgactacccttcaaattcaggcgcatgcaatttccattgatgctttgttttgcaa---caatatat 4051471  T
Q  1006 aaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaa 1104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4051470 aaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacacatggacaactttatgttgctgtctctcgagtaacttcaa 4051371  T
Q  1105 gaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcat 1204  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4051370 gaaaaggtctgaaggtgctcattgtggatgaagataataatgtttgtaaggagaccagaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaa-gtatgattat 4051272  T
Q  1205 tggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactgg 1304  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4051271 ttgttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaatctaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtactgt 4051172  T
Q  1305 tcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc----nnnnn 1400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||             
T  4051171 tcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaaatcgtggatccttttttttt 4051072  T
Q  1401 nnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaa 1500  Q
           ||||||| |||| | |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4051071 tttttttacatcgttgttatcctaaagtacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaa 4050972  T
Q  1501 actatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||    
T  4050971 actatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgttttcatttaccgactacgt 4050918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 643 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 6089232 - 6088353
Alignment:
Q  643 agctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaa 742  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  6089232 agctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttaatatccaaggtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctgggatttcaa 6089133  T
Q  743 atcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacaca 842  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  6089132 atcactagttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatgaactgtgtaatggtacgaagctgccagtcacaca 6089033  T
Q  843 tctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccagga 942  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6089032 tctagggaagagcacgatagttgctactgtagttacaggaaaaagggcaggtacgagggtattcattcccaggatgaatcttattctgagtgatctagga 6088933  T
Q  943 ctatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gttt 1041  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6088932 ctacccttcaaattcaggtgcattcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaacctttatctcgagtgggagttt 6088833  T
Q  1042 atcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataa 1141  Q
    || |||||||||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6088832 atattcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctagaaaaggtttgaagttgctcatcttggatgaagataa 6088733  T
Q  1142 taatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttaga 1241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6088732 taatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgcatcgttaagtttttc-aaaaagtatgatcatttgttatgttttagaattgttgttgctataatttaga 6088634  T
Q  1242 aaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatcc 1340  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6088633 aaactaaagttgcgtattgtttggaagtcgttt--tttttaatttctttgtaagacgtactggtcattacaggacatgcaatttctatataagcagatcc 6088536  T
Q  1341 ctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttaca 1440  Q
      |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||             ||||| | |||||| |||||||| || ||||||    
T  6088535 tcctgccattgacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatacgcagaac----tttttttttacatcattgttaccctaaaatacaatgtttaca 6088440  T
Q  1441 ttaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||| |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6088439 ttagaccattggttttgtaaaatatataaacaaataacaatcggtgtttctgtagcccaaactatatctatacacacccgtaaaaaa 6088353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 677
Target Start/End: Original strand, 17871195 - 17871868
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17871195 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggaagacatggtgcatgtagaaaagttgataatatggaatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 17871294  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  17871295 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgt-atatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaaagacaaaagttttaggtggt 17871393  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17871394 gatttcaggcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgt 17871493  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |     
T  17871494 tgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaataaattgctaattttggcaaatggatactctcaattagagaagg 17871593  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17871594 caacggcgcttcggatgag-atggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacatt 17871692  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17871693 gtgtatctcgatttaaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattctgttgagcatgttaacgaat 17871792  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17871793 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 17871868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 706 - 1527
Target Start/End: Original strand, 15032841 - 15033661
Alignment:
Q  706 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggcta 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15032841 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcatcggttgaaactaagggtgtgatgtccaattatgctgatgagaaacatcgatcaggcca 15032940  T
Q  806 atggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtatt 905  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||||||||| || |||||    
T  15032941 atggaccgtgtaatggtacgaggctgacaattacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaataacaggaaaaagggcaggtaccagggtatt 15033040  T
Q  906 cattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaat 1005  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15033041 cattcccaggatgaatcttattttgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaggcaatttccattgaggctttgttttgcaatgacaataaat 15033140  T
Q  1006 aaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaa 1104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||  |    
T  15033141 aaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagttacttata 15033240  T
Q  1105 gaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcat 1204  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15033241 gaaaatgtttgaagttgctcatcttggatgaagataataatatttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatctt 15033339  T
Q  1205 tggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatt-----tttaatttctatgtaaggcgt 1299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||||||    
T  15033340 aggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcgtattgtttggaagtcgttttttttcttgtttaatttctttgtaaggcgt 15033439  T
Q  1300 actggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnn 1399  Q
    ||| |||||    |||||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| ||          
T  15033440 acttgtcat----gacatgcaatttctatgtaagtagatcctcctgtcattgacttttaattgatgcactttttaggtataacaatacgcgaaa--tatt 15033533  T
Q  1400 nnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagccca 1499  Q
            ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  15033534 ttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagatcattggttttctaaaaaataaaaacaaataacaattgtcgtatctgtagccca 15033633  T
Q  1500 aactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15033634 aaccatatttatacacacctgtaaaaaa 15033661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 967 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 43449174 - 43448590
Alignment:
Q  967 caatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatac 1065  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  43449174 caatttctattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgc 43449075  T
Q  1066 atgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaa 1165  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43449074 atggacaactctatgtcgctgtctctcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaa 43448975  T
Q  1166 tgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttgg 1265  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  43448974 tgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaa-gtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttataaaaccaaagttgtctattgtttgg 43448876  T
Q  1266 aagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatg 1365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  43448875 aagtcgttttatttttaatttctctgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgactattaattcatg 43448776  T
Q  1366 cacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaatt 1465  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||            ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43448775 cacttttcaggtttaacaatccgcggtacc---tttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccattagttttgtaaaaatt 43448679  T
Q  1466 aaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  43448678 aacaacaaataacaatcgacgtttctgtggcccgaactatatttatacacacccgtaaaaagttaaacgtttgcatttaccgactacgt 43448590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 547 - 1110
Target Start/End: Original strand, 30346645 - 30347209
Alignment:
Q  547 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagct 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30346645 caagaaaggggaatactcgcaccaacacttgattaagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaact 30346744  T
Q  647 ttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatca 746  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30346745 ctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctctggaattccaaatca 30346844  T
Q  747 ccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatcta 846  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30346845 ccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggttgacagttacacatcta 30346944  T
Q  847 gggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactat 946  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30346945 gggaagagcacaatagctgctactgtaattacaggaaaaagggcaggtaccaaggtattcattcccaggatgaattttattccgagtgatccaggactat 30347044  T
Q  947 ccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatct 1045  Q
    |||||||||||| | |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30347045 ccttcaaattcatgcgcagataatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatct 30347144  T
Q  1046 tcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaag 1110  Q
    |||||| || |||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30347145 tcctaaacccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctagaaaag 30347209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 547 - 1110
Target Start/End: Complemental strand, 10025181 - 10024617
Alignment:
Q  547 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagct 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10025181 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcattgattccaagtgaagagaaagagtatttaaact 10025082  T
Q  647 ttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatca 746  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10025081 ctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctctggtattccaaatca 10024982  T
Q  747 ccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatcta 846  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10024981 ccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatggatcaggccaatgaactgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatcta 10024882  T
Q  847 gggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactat 946  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||  |||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10024881 gggaagagcacgatagctgccaccgtaattacaggaaaaagggcaagtaccaaggtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactac 10024782  T
Q  947 ccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatct 1045  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10024781 ccttcaaattcatgcgcaaataatttctattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcaggttcaatctttatctcgagtgggagtttatct 10024682  T
Q  1046 tcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaag 1110  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  10024681 tcctaagcccgtgttcacacatgggcaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctagaaaag 10024617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 547 - 1102
Target Start/End: Original strand, 24629962 - 24630518
Alignment:
Q  547 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagct 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24629962 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaact 24630061  T
Q  647 ttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatca 746  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24630062 ctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaaatgagcggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctttggaattccaaatca 24630161  T
Q  747 ccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatcta 846  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24630162 ccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttgtgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatcta 24630261  T
Q  847 gggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactat 946  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24630262 gggaagagcacaatagatgctaccgtaattacaggaaaaagggcagataccaaggtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactac 24630361  T
Q  947 ccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatct 1045  Q
    |||||||||||| | |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24630362 ccttcaaattcatgcgcatataatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatct 24630461  T
Q  1046 tcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttc 1102  Q
    ||||||||| |||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  24630462 tcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctcgagttacttc 24630518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 301; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 461
Target Start/End: Original strand, 30346185 - 30346637
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  30346185 catcatcacttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgagactccattgatgcactgatggtg 30346284  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  30346285 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagattgatcccctaaacgagtttaaactatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 30346384  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  30346385 gatgtcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttaatgtgt 30346484  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  30346485 taagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacgg 30346584  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 461  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30346585 caacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 30346637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 286; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 957 - 1527
Target Start/End: Original strand, 2261499 - 2262071
Alignment:
Q  957 caggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcct 1055  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  2261499 caggcgcatgcaatttccattgatgctttgttttgcaacgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcaagtgggagtttatcttcctaagccc 2261598  T
Q  1056 gtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaagg 1155  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2261599 gtgttcacgtatgaacaactttatgtcgctgtctctcgagttacttctagaaaaggtttgaagttgctcatattggatggagataataatgtttgcaagg 2261698  T
Q  1156 agaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcc 1255  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2261699 agaccacgaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaacaaaagttgcg 2261797  T
Q  1256 tattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcatta-tagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgact 1354  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||    
T  2261798 tattgtttggaagtcgtt---ttttttatttctttgtaaggcgtattggtcattacaagacatgcaatttctatataagcatgtcgtcctgccattgact 2261894  T
Q  1355 attaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaac----cnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatt 1450  Q
     |||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||                 ||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  2261895 tttaattgatgcatttttcaggtataacaatacgtggaactttttttttttttttttacatcgttgttaccctaaaatataatatttatattagaccatt 2261994  T
Q  1451 tgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2261995 gattttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcggcatttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 2262071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 461
Target Start/End: Original strand, 24629509 - 24629954
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24629509 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggaagacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 24629608  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  24629609 ttttgaggcagttggccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 24629708  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  24629709 gatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttaatgtgt 24629808  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||       ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24629809 tgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaaga-------aatttcggcaagtggatactctgaattggagacga 24629901  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 461  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24629902 caacaacgcttcggatgagaatggttaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 24629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 10025641 - 10025189
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10025641 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctggggcagacctagtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 10025542  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  10025541 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 10025442  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||| | ||| || |||| | ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||    
T  10025441 gatattaggcagatattgcctgctgtccgaaaaggaacgaggcaatatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttgatgtgt 10025342  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||     
T  10025341 tgagacttactgttaatatgagactgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattagagacgg 10025242  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 461  Q
     ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10025241 taacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatt 10025189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 942 - 1394
Target Start/End: Complemental strand, 26832344 - 26831890
Alignment:
Q  942 actatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtt 1040  Q
    |||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  26832344 actacccttcaaattcatgcgcagacaatttccattgacgttttattttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtggcagtt 26832245  T
Q  1041 tatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagata 1140  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26832244 tatcttcctaagcccgtgttcacgcatgagcaactctatgtcgttgtctctcgagttacttctagaaaaggtttgaaactgctcatcttggatgaagata 26832145  T
Q  1141 ataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttag 1240  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26832144 ataatgttttcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagttttt-taaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgatgctataatttag 26832046  T
Q  1241 aaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgt-tttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagat 1338  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||  | | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26832045 aaaactaaagttgcgtattgattgaaagttatatctttttttaatttctttgtaaggtgtactggtcattacaggacatgcaatttctatataagcagat 26831946  T
Q  1339 ccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaac 1394  Q
    |    |||  |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26831945 cttcttgcttttgacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatacgcggaac 26831890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1190 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 10024610 - 10024243
Alignment:
Q  1190 aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttattttt-------a 1282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| |||||       |    
T  10024610 aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcgcattgattgaaagttgttttttttttttttttta 10024511  T
Q  1283 atttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaac 1382  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10024510 atttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcttcctgccattgactattaattcatgcatttttcaggtttaac 10024411  T
Q  1383 aatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggtta-ccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaat 1481  Q
    ||||||| |||||            ||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10024410 aatccgcagaacc----ttttttttacatcgttgttacccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaat 10024315  T
Q  1482 cgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  10024314 cggtgtttttgtagcccaaactatatttatacacacatttaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 10024243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 902 - 1254
Target Start/End: Original strand, 43524286 - 43524640
Alignment:
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  43524286 tattcattcctaggatgaatcttattctaagtgatccaagactacccttcaaattcaggcgcatgcaatttcccttaacgctttgttttgcaatgacaat 43524385  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtt--tatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaa 1098  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  43524386 aaataaaagtcagggtcaatctttatcccgagtgggagtttatatcttcctaggcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagtta 43524485  T
Q  1099 cttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtat 1198  Q
    |||| |||| |||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  43524486 cttctagaagaggtttgtagctgctcatattggatgaagataataatatgtgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtat 43524584  T
Q  1199 gatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgc 1254  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43524585 gataattgattatgttttaaaattgttgtagctataattgagaaaactaaagttgc 43524640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 706 - 1054
Target Start/End: Complemental strand, 30314156 - 30313813
Alignment:
Q  706 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggcta 805  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |    
T  30314156 gaatttcttcatggtattaagacctctggaattccaaatcaccgattgaaactaagggtgggatgtccaattatgctgatgagaaacatcgatcaaacaa 30314057  T
Q  806 atggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtatt 905  Q
    |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||   ||  ||||||  |||||    
T  30314056 atggactgtgtaatagtactaggttgtcagttacac--ctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagagc-tgtactatggtatt 30313960  T
Q  906 cattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaat 1005  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || ||||||||   | |||||||||    
T  30313959 catttccatgatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcatgcaattttcattgacgctttgttttg---taacaataaat 30313863  T
Q  1006 aaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcc 1054  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30313862 aaaagccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcc 30313813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1190 - 1549
Target Start/End: Original strand, 30347216 - 30347588
Alignment:
Q  1190 aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgtt-----------ttatt 1278  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||           || ||    
T  30347216 aaaaagtctgatcattggttatattttagaattgttgctgctataatttagaaaactaaagttgcgcattgattgaaagttgttgttgtttttttttttt 30347315  T
Q  1279 tttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtt 1378  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  30347316 tttaacttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcggatcttactgccattgactattaattcatgcagttttcaagtt 30347415  T
Q  1379 taacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttacct-taaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataa 1477  Q
    |||||||||||||||||            ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30347416 taacaatccgcggaaccttttttttt---acatcgttgttacccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataa 30347512  T
Q  1478 caatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  30347513 caatcggtgtttctgtagcccaaactacatttatacacacccgtaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 30347588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1192 - 1549
Target Start/End: Original strand, 24630535 - 24630908
Alignment:
Q  1192 aaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataattta-gaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttattttt--------- 1281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| |||||             
T  24630535 aaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttaagaaaactaaagttgcacattgattgaaagttgttttgtttttttttttttt 24630634  T
Q  1282 ----aatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggt 1377  Q
        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24630635 tttaattttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcttcctgccattgactattaattcatgcatttttcaggt 24630734  T
Q  1378 ttaacaatccgcgg-aaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttacct-taaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaat 1475  Q
    |||||||||||||| ||||            ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24630735 ttaacaatccgcggtaacctttttttt----acatcgttgttacccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaat 24630830  T
Q  1476 aacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  24630831 aacaatcggtgtttctgtagcccaaactacatttatacacactcgtaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 24630908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1303 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 26793170 - 26792920
Alignment:
Q  1303 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnn 1402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||            
T  26793170 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcagaac-atttttt 26793072  T
Q  1403 nnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaac 1502  Q
         ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26793071 tttttacatcattgttaccctaaaatacaatatttacattacaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggtgtttctgtagcccaaac 26792972  T
Q  1503 tatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  26792971 tatatttatacacacccgtaaaaagttaaacgtttgcatttaccgactacgt 26792920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 706 - 927
Target Start/End: Original strand, 2261274 - 2261495
Alignment:
Q  706 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggcta 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |    
T  2261274 gaatttcttaatggtattaagagctttggcattccaaatcacaggttgaaactaagggtgggatgtccagttaggctgatgagaaacattgatgaggtca 2261373  T
Q  806 atggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtatt 905  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||  ||| ||||| || |||||    
T  2261374 atggtctgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgcaaccgtaattacgggaaaaagggctggtaccagggtatt 2261473  T
Q  906 cattcccaggatgaatcttatt 927  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2261474 cattcccaggatgaatcttatt 2261495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1152 - 1326
Target Start/End: Complemental strand, 30313786 - 30313613
Alignment:
Q  1152 aaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagt 1251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30313786 aaggagaccacaaatgttgtatatcatgaagtttttcaaaaa-gtatgatcatttgttatgttttagaattcttgttgttataatttagaaatctaaagt 30313688  T
Q  1252 tgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttct 1326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30313687 tgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtacttttcattatagacatgcaatttct 30313613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1065 - 1254
Target Start/End: Complemental strand, 18116458 - 18116270
Alignment:
Q  1065 catgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaa 1164  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  18116458 catggacaactttatgtcgctgtctctcgagttacttctagaagaggtttgtagctgctcatattggatgaagataataatatgtgcaaggagaccacaa 18116359  T
Q  1165 atgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgc 1254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18116358 atgttgtgtatcgtgaagtttttca-aaaagtatgatcattggttatgttttaaaattgttgttactataattgagaaaactaaagttgc 18116270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1411 - 1527
Target Start/End: Original strand, 17871867 - 17871983
Alignment:
Q  1411 tcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatattta 1510  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17871867 tcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccgttggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatattta 17871966  T
Q  1511 tacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||||||||    
T  17871967 tacacacccgtaaaaaa 17871983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1409 - 1525
Target Start/End: Complemental strand, 18116063 - 18115947
Alignment:
Q  1409 catcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatt 1508  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||    
T  18116063 catcgttgttaccctaaaatacattatttacattagatcattggttttgtaaaaaataaaaacaaagaacattcaacgtttgtgtagcacaaactatatt 18115964  T
Q  1509 tatacacacccgtaaaa 1525  Q
    |||||||||||||||||    
T  18115963 tatacacacccgtaaaa 18115947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1409 - 1527
Target Start/End: Original strand, 43524845 - 43524963
Alignment:
Q  1409 catcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatt 1508  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  43524845 catcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagatcattgattttgtaaaaaataaaaacaaagaacattcagcgtttgtgtagcacaaactatatt 43524944  T
Q  1509 tatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43524945 tatacacacccgtaaaaaa 43524963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1426 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 26831872 - 26831771
Alignment:
Q  1426 aatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaa 1525  Q
    ||||| |||||||  ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26831872 aatacaatatttaacttagaccattgattttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttatatacacccataaaa 26831773  T
Q  1526 aa 1527  Q
    ||    
T  26831772 aa 26831771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1457 - 1527
Target Start/End: Original strand, 14193883 - 14193953
Alignment:
Q  1457 gtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193883 gtaaaaaataaaaacaaataacaatcggcgtttttgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 14193953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1246 - 1384
Target Start/End: Complemental strand, 18116235 - 18116095
Alignment:
Q  1246 taaagttgcctattgtttggaagtcgttttat-ttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctc 1343  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||| || | |||| | |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  18116235 taaagttgcgtaatgtttgtaagtcgtattttctttttacttcgttgtaaggcgtactggtcattacatgacatgcaatttctatataagcaaatcctcc 18116136  T
Q  1344 tgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaa 1384  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||    
T  18116135 tgcaattgacttttaattgatgcacttttcaagtataacaa 18116095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1408 - 1480
Target Start/End: Complemental strand, 30313589 - 30313517
Alignment:
Q  1408 acatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaa 1480  Q
    ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313589 acatcgttgttatcctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaa 30313517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1290 - 1384
Target Start/End: Original strand, 43524720 - 43524815
Alignment:
Q  1290 tgtaaggcgtactggtcattatag-acatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaa 1384  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||    
T  43524720 tgtaaggcgtactggtcattacaggacatgcaatttctatataagcaaatcctcctgcaattgacttttaattgatgcacttttcaagtataacaa 43524815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Original strand, 7951561 - 7951624
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  7951561 ttactccctccgtccctaattataagacccttttgagattttttttgtccctttttataagacc 7951624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 26894910 - 26894847
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26894910 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttatccctttttataagacc 26894847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 32147294 - 32147356
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32147294 tactccctccgtccctaattataagacctttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 32147356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 1265947 - 1266012
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  1265947 attactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 1266012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 8284139 - 8284082
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  8284139 cctccgtccctaattataaaacccttttgagattttttttgtccctttttataagacc 8284082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1563 - 1627
Target Start/End: Original strand, 24170130 - 24170194
Alignment:
Q  1563 aaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24170130 aaattactacctccatccctaattataaaactcttttgagaatttttttgtccctttttataaga 24170194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 3497837 - 3497774
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3497837 tactccctccgttcctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 3497774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 6673265 - 6673202
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  6673265 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 6673202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 9828393 - 9828456
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  9828393 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 9828456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 16127259 - 16127322
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  16127259 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 16127322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 22527692 - 22527755
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  22527692 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 22527755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 40004446 - 40004383
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  40004446 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 40004383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 11780764 - 11780826
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11780764 tactacctccgtccctagttataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 11780826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 14913648 - 14913712
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa--attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  14913648 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttttgtccctttttataagacc 14913712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 15521979 - 15521918
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  15521979 tactccctccgtccctaattataaaacccttttgagaattttttttgtccttttttataaga 15521918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Original strand, 20987753 - 20987810
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20987753 cctccgtctctaattataagaccctcttgagaaattttttgtccctttttataagacc 20987810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 23286513 - 23286448
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  23286513 attactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 23286448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 43060450 - 43060385
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  43060450 attactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 43060385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1570 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 4985150 - 4985090
Alignment:
Q  1570 tccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  4985150 tccctccgtccctaattataaaacctttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 4985090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 15190852 - 15190789
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  15190852 tactccctccgtccctaattataagactcttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 15190789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 16153292 - 16153229
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  16153292 tactccatccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 16153229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 34662204 - 34662267
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgaga-aattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  34662204 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagagttttttttgtccctttttataagacc 34662267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 24308172 - 24308115
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24308172 cctccgtccttaattataagactcttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 24308115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Original strand, 24365151 - 24365208
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24365151 cctccgtccttaattataagactcttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 24365208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1584 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 26605642 - 26605597
Alignment:
Q  1584 attataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26605642 attataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 26605597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1573 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 27873376 - 27873319
Alignment:
Q  1573 ctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  27873376 ctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 27873319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1573 - 1629
Target Start/End: Original strand, 32478144 - 32478201
Alignment:
Q  1573 ctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  32478144 ctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 32478201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 32964133 - 32964194
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  32964133 tactacctccgtccctaattataagaccattttgagattttttttgtccctttttataagac 32964194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1558 - 1629
Target Start/End: Original strand, 41641086 - 41641158
Alignment:
Q  1558 aaaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  41641086 aaaaaaaaatactccctccgtccctaattataagatcattttgagaattttttttgtccctttttataagacc 41641158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1570 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 4753252 - 4753193
Alignment:
Q  1570 tccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  4753252 tccctccgtccctaattataagacccttttaagaattttttttgtccctttttataagac 4753193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1134 - 1193
Target Start/End: Original strand, 10692495 - 10692554
Alignment:
Q  1134 gaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaa 1193  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  10692495 gaagataataatatttgcaaggagaccataaatattgtgtatcgtgaggtctttcaaaaa 10692554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 13660861 - 13660924
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  13660861 tactccctccgtctctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 13660924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1625
Target Start/End: Complemental strand, 13863032 - 13862973
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataa 1625  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  13863032 tactccctccgtccctaattatatgacccttttgagaattttttttgtccctttttataa 13862973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 16440931 - 16440994
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  16440931 tactccctccgtccctaattataagacccttttaagaattttttttgtccctctttataagacc 16440994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 19571978 - 19571912
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgaga--aattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||    
T  19571978 attactacctccgtccctaattataagacccttttgagattttttttttgtccctttttataagacc 19571912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 25601097 - 25601034
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||    
T  25601097 tactccctccgttcctaattataagacccttttgagaattttttttgttcctttttataagacc 25601034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 28041388 - 28041325
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttta-tccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  28041388 tactccctccatccctaattataagacccctttgagaattttttttgtccctttttataagacc 28041325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 13759484 - 13759422
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  13759484 tactacctccgttcctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 13759422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1584 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 18616086 - 18616040
Alignment:
Q  1584 attataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  18616086 attataaaacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 18616040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1625
Target Start/End: Complemental strand, 23092680 - 23092618
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataa 1625  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23092680 aattactacctccgtctctaactataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataa 23092618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1574 - 1628
Target Start/End: Original strand, 31657692 - 31657746
Alignment:
Q  1574 tccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  31657692 tccgtccctaattataagacccttttgaaaaataatttgtccctttttataagac 31657746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 41418311 - 41418373
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| | | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  41418311 tactacctccgtccctaattgtaagatctttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 41418373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 4976327 - 4976266
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaat-tttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||    
T  4976327 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaatatttttgtccccttttataaga 4976266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Original strand, 22657768 - 22657829
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22657768 tactacctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 22657829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1577 - 1629
Target Start/End: Original strand, 30182093 - 30182146
Alignment:
Q  1577 gtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  30182093 gtccctaattataaaaccattttgagaattttttttgtccctttttataagacc 30182146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1559 - 1628
Target Start/End: Original strand, 39984762 - 39984831
Alignment:
Q  1559 aaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  39984762 aaatcaattagtacctccgtccttaattataagacccttttaagaatttttttgtctctttttataagac 39984831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 1043; Significance: 0; HSPs: 80)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 1043; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 16042688 - 16041138
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16042688 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctcaaatgatgcaccgatggtg 16042589  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || |||| |||||    
T  16042588 ttttgaggcagctgactgatcattgtgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttacgtggt 16042489  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || |||| | ||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  16042488 gatttcaggcagatattgcctgttgtcctaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagttaattcgtcaaagatattggcttattgtaatgtgt 16042389  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16042388 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcagcttcggtacatgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 16042289  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16042288 caacgacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcgcttatagacttt 16042189  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| || |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16042188 gtgtatcccaatctgaatgataaccttggtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 16042089  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16042088 ttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 16041989  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16041988 atcggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgattag 16041889  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| |||||||||| || |    
T  16041888 gccaataaactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatttagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaatggcaggtaccaggg 16041789  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16041788 tattcattccctggatgaatcttattccgagtgatccaggactactcttcaaattcaggcgcatgcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 16041689  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16041688 aaataaaagccatggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcataagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcgagtaact 16041589  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16041588 tcaagaaaaggtctgaagttgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatga 16041490  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16041489 tcattggttatgttttagaattgttgttgatataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgta 16041390  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnn 1400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         
T  16041389 ctggtcattatagacatgcaatttctttataagcagatcctcctggcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgccgaacc--ttt 16041292  T
Q  1401 nnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaa 1500  Q
           |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16041291 tttttttacatcgttattaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaa 16041192  T
Q  1501 actatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  16041191 actatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 16041138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 1000; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 1549
Target Start/End: Original strand, 6310558 - 6312098
Alignment:
Q  17 cttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6310558 cttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctgatgcatgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgagg 6310657  T
Q  117 cagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcag 216  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||    
T  6310658 cagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaacgacaatagttttaggtggtgattttag 6310757  T
Q  217 gaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggctt 316  Q
    | || ||||   ||| ||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6310758 gcagatattgtctgttgtccgaggaggaatgaggcctgatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggctt 6310857  T
Q  317 actgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacg 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| |    
T  6310858 actgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatagtctccattggagacggcaacgatg 6310957  T
Q  417 cttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcc 516  Q
    ||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6310958 cttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcc 6311057  T
Q  517 cgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatg 609  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6311058 cgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatg 6311157  T
Q  610 tcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtc-gatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaa 708  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6311158 tcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaa 6311257  T
Q  709 tttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatg 808  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6311258 tttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatg 6311357  T
Q  809 gactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcat 908  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  6311358 gactgtgtaatggtactaggttgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacatgaaaaagggcaggtactagggtattcat 6311457  T
Q  909 tcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaa 1008  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  6311458 tcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttaaaatccag--gcaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgaaaataaataaa 6311555  T
Q  1009 agtgagggtcaatctttatctcgagtggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaa 1108  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6311556 agtcagggtcaatctttatctcgagtgggggttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactttatgccgctgtctctcgagtaacttcaagaaa 6311655  T
Q  1109 aggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggt 1208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6311656 aggtctgaagctgctcatcctggatgaatataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggt 6311754  T
Q  1209 tatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcat 1308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6311755 tatgttttagaattgttgttgctataatttataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtactggtcat 6311854  T
Q  1309 tatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnna 1408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||            |    
T  6311855 tatagacatgcaatttctatataagtagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccatgaaacc--tttttttttta 6311952  T
Q  1409 catcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatt 1508  Q
    |||| | |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6311953 catcattgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttattttgtaaaaattaaaaactaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatt 6312052  T
Q  1509 tatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  6312053 tatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 6312098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 972; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1549
Target Start/End: Original strand, 37389710 - 37391253
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  37389710 tcatcgcttacaatggaaaaggatagtcccagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgagactccaatgatacaatgatggtgtt 37389809  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  37389810 ttgaggcagttgaccaatcattgcgtgatatcatggccaagaatgatcccttaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacaatagttttaggtggtga 37389909  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37389910 ttttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggctggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttg 37390009  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  37390010 aggcttactattaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatattctcaattggagacggca 37390109  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    | || |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37390110 aagatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 37390209  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37390210 gtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaattt 37390309  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||     
T  37390310 atgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgt-------gagtggttcacac 37390402  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37390403 cagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaatatcgatcaggc 37390502  T
Q  804 taatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgta 903  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  ||||  |||||||||||| |||    
T  37390503 caatggactgtgtaatggtactagactgacagtcacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaataaaaagggcaggtactagggta 37390602  T
Q  904 ttcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataa 1003  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37390603 ttcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcacaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataa 37390702  T
Q  1004 ataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttc 1102  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37390703 ataaaagccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtagctgtctctcgagtaacttc 37390802  T
Q  1103 aagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatc 1202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37390803 aagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaagaagaccacaaatgttttgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatc 37390901  T
Q  1203 attggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtact 1302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37390902 attggttatgttttagaattgttgttgctataatttataaaactaaagttgtctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtact 37391001  T
Q  1303 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnn 1402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||           
T  37391002 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcatatcttcatgtcattaactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgtgaaacctttttgt 37391101  T
Q  1403 nnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaac 1502  Q
         ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37391102 attttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagactatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagccaaaac 37391201  T
Q  1503 tatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||| |||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  37391202 tatatttatacacatccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 37391253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 962; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 1549
Target Start/End: Original strand, 48774920 - 48776441
Alignment:
Q  38 cctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtg 137  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  48774920 cctagggcagacctggtgcgtgcttcaaagttgataatttgtgatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaagcagttgaccaatcaatgcatg 48775019  T
Q  138 atatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccg 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||   || ||||||||||||||||||  |  ||||  |||| |||||    
T  48775020 atatcatatccaagaatgatcccttaaacgagtttagaccttttggaggaatgacggtagttttaggtggtgatttcagacaaatattgtatgttgtccg 48775119  T
Q  238 aaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48775120 aaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaatatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatcagattgggt 48775219  T
Q  338 gcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaa 437  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48775220 gcatcttcgggacctacagagcagaaagaaactgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaa 48775319  T
Q  438 tgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttgg 537  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  48775320 tgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaattctttgatgtcactaatacactttgtatatcccgattagaatgataacattgg 48775419  T
Q  538 tgacccgctc-------aagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagag 630  Q
    ||||| ||||       |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  48775420 tgacctgctctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtaaatgattccaggtgaagag 48775519  T
Q  631 aaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagct 730  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48775520 aaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcaaaaagtctgatgtccagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagct 48775619  T
Q  731 ctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggct 830  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  48775620 atggaattccaaatcaccagttgaaactgagggtgggatgtccaattatgctgatgagaaacatcgatcaggtcattggactgtgtaatggtacgaggct 48775719  T
Q  831 gacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccg 930  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  || |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48775720 gacagttacacatctagggaagagcacgataactgctattataattacaggaaaaagggaaggtaccagggtattcattcccaagatgaatcttattccg 48775819  T
Q  931 agtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctc 1030  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  48775820 agtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagcgagagtcaatctttatctc 48775919  T
Q  1031 gagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcct 1129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48775920 gagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacacatggacaactttatgtcactatctctcgagtaacttgaagaaaaggtctgaagttgctcatcct 48776019  T
Q  1130 ggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttg 1229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48776020 ggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcatgaagtttttc-aaaaagtatgaacattggttatgttttagaattgttgttg 48776118  T
Q  1230 ctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctata 1329  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48776119 ctataatatataaaactaaagctgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtacaggtcattatagacatgcaatttctata 48776218  T
Q  1330 taagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaata 1429  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||            ||||| | |||| | ||| |||    
T  48776219 taagcagatcctcttgccattgattattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcgaaacc-tttttttttttacatcattgttaacctaatata 48776317  T
Q  1430 cgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa----- 1524  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  48776318 caatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcg-tgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaatt 48776416  T
Q  1525 aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  48776417 aaacgcttgcatttaccgactacgt 48776441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 906; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 36207878 - 36206355
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  36207878 catcatcgcttacgatggaaaagaatagtcctagggtagacctggtgcgtgctgcaacgttgataatttgggatgaggctccaatcatgcactaatggtg 36207779  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  36207778 ttttgaggcagttgactgatcaatgtgtgataccatgtccaagaatgatcccttaaatgagtttagaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggt 36207679  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||  || |||| | ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  36207678 gatttcagacagatattgcctgttgtctgaaaaggaaagaggcaggatattattgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagtttattgtaatgtgt 36207579  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  36207578 tgaggcttactgttaatatgagattgggttcatcttcggtacctgcaaagcaggaagaaattgataattttggcaagtggatactctcaattgaagacgg 36207479  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36207478 caacgacgcttcggatgagaatggtgaattgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccgacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 36207379  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  36207378 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaat 36207279  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  36207278 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcgggtgaaaattatgatgtccaaagtgagttgttcac 36207179  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  36207178 aacggaatttcttaatggtattaagagctctgaaactccaaatcaccggttgaaactaaggatgagatgtccagttatgttgatgagaaacatcaatcaa 36207079  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||  ||||||||| || |    
T  36207078 gccaatggactatgtaatggtacgaggctggcagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacagaaaaaagggcaggtaccaggg 36206979  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||    
T  36206978 tattcattcccagtatgaatcttattgcgaatgatccaggactacccttcaaattcaggtgcatgcaattttcattgacgctttgttttgcaacgacaat 36206879  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaactt 1101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  36206878 aaataaaagttagggtcaatctttatctcgagtgagatttatcttcctaagcccgtgatcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagttactt 36206779  T
Q  1102 caagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgat 1201  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36206778 ctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagatcataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagttttt-taaaaagtatgat 36206680  T
Q  1202 cattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcg-ttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36206679 cattggttatgttttaaaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgtgtattgtttggaagtcgtttttttttttaatttctgtgtaaggcgta 36206580  T
Q  1301 ctggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnn 1399  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||   || | |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||  || ||||         
T  36206579 ctggtcattacatggcatgcaatttctatataagcagatcctcttgtcgttgacttttaattgatgcacttttcagatataacaatatgcagaac---tt 36206483  T
Q  1400 nnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagccca 1499  Q
            ||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| || |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36206482 ttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatattcacattagactattgattttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcggcgtttttgtagccca 36206383  T
Q  1500 aactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36206382 aactatatttatacacacccgtaaaaaa 36206355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 861; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1372
Target Start/End: Complemental strand, 2329829 - 2328462
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2329829 catcatcgcttactatggaaaaggacagtcctagggcagacctggtgtgtgctgcaaagttgataattttttatgagtctccaatgatgcaccaatggtg 2329730  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    |||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||    
T  2329729 ttttgagaaagtttaccgatcaatgtgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacaagtttagaccttttcgtggaatgatagtggttttaggtggt 2329630  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || || | | ||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  2329629 gatttcaggcagatactacctgttgtccgtgaagcaacgaggcacgatattgttaatgccttaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatatgt 2329530  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  2329529 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcctcttcgttacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattagagacgg 2329430  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  2329429 caacgacgcttcggatgagaatggtaaaatgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagac--- 2329333  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2329332 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgatccactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtcgagcatgttaacgaat 2329233  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2329232 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagagagtggttcac 2329133  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2329132 aacggaatttctaaatggtattaagagctatggaattccaaatcaccggttgaaactaagggcgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 2329033  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  || |||||| || |    
T  2329032 accaatggactgagtaatggtacgaggctgaccgttacacatatagggaagagcacgatagctgctaccataattacaggaaaaagggaaggtaccaggg 2328933  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2328932 tattcattccaaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaaacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 2328833  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaactt 1101  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  2328832 aaataaaagtcagggtcaatctttacctcgagtgggatttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagttactt 2328733  T
Q  1102 caagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgat 1201  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  2328732 ctagaaaaggtttgaagttgctcatcttggataaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtattgtgaactttttca-aaaagtatgat 2328634  T
Q  1202 cattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcg-ttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  2328633 cattggttat-ttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcatattgtttgaaagtcgtttttttttttaatttttttgtaaggcgta 2328535  T
Q  1301 ctggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcactttt 1372  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |  |||||||||    
T  2328534 ctggtcattagaggacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgacttttaactggtgcactttt 2328462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 686; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 286 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 18149074 - 18147824
Alignment:
Q  286 gatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 385  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18149074 gatatggacttattttaatgtgttaaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 18148975  T
Q  386 tggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 485  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18148974 tggatactctgaattggagacggcaataacgcttcgaaggagaatggtgaaatgaaggtagaaatttatgaagattttctcatatcggacacaacaaatc 18148875  T
Q  486 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 578  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18148874 tgttgatgtcacttatcgactttgtgtatctcaatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 18148775  T
Q  579 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 678  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18148774 ttcatttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctcttattctgtttgtcgatcggatgaaaattct 18148675  T
Q  679 gatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagtta 778  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  18148674 tatgtccaaagcaagtggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctctggaattctaaatcaccggttgaaactaaagatgagatgtccagtta 18148575  T
Q  779 tgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttc 878  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||| |    
T  18148574 tgctgattagaaacatcgataaggccaatggagtgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagatcatgatagctgctaccgtaattac 18148475  T
Q  879 aggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattg 978  Q
    |||||||  ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  18148474 aggaaaaagggcaggtaccaaggtattcattcccaagatgaatcttattccgaatgatccaggactacccttcaaattcatgcgcagacaatttccattg 18148375  T
Q  979 atgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaacttt 1077  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  || || ||||| |    
T  18148374 acgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagtgtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcacgagcaactct 18148275  T
Q  1078 atgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcg 1177  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18148274 atgtcgttgtctctcgagttacttctataaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcg 18148175  T
Q  1178 tgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaag-----tcgt 1272  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||     |  |    
T  18148174 tcaagttttt-taaaaagtatgatcattggttatgttttagtattattgtcgctataatttagaaaactaaagttgcgtattgattgacagttttttttt 18148076  T
Q  1273 tttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttt 1371  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    |||  |||||| |||||| |||||||||    
T  18148075 tttttttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattacatgacatgcaatttctgtataagcagatcttcttgcttttgacttttaattgatgcacttt 18147976  T
Q  1372 tcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaac 1471  Q
    |||||| ||||||| ||||||||             ||||| | |||||| |||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||| | ||||     
T  18147975 tcaggtataacaatacgcggaac---ttttttttttacatcattgttaccctaaaatacaatatttaacttagaccattggttttgtaaaaaat-aaaat 18147880  T
Q  1472 aaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18147879 aaataacaatcggcatttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 18147824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 869
Target Start/End: Original strand, 2452690 - 2453538
Alignment:
Q  27 aaaaggatagtcctaggga-agaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatc 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2452690 aaaaggatagtcctaggggcagacctggtgcgtgctgtaatgttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatc 2452789  T
Q  126 gatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatt 225  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2452790 gatcaatgtgtgatatcatgtccaagaatgaccccttaaacgagtttagaacttttggtggaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggaagatatt 2452889  T
Q  226 tcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaat 325  Q
     |   | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2452890 gcccattgtccgaaaaggatcgaggcaggatattgttgatgcttcaatcaattcatcaaagatataggcatattgtaatgtgtcgaggcttactgttaat 2452989  T
Q  326 atgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  2452990 atgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcatgaagaaattgctaattttgacaagtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcaaatg 2453089  T
Q  426 agaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaa 525  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2453090 agaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgaattccgatttgaa 2453189  T
Q  526 tgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgatt 618  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2453190 tgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgctttattgagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactaatt 2453289  T
Q  619 ccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatg 718  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||  |||||||||||||    
T  2453290 ccaggtgaagagaaagagtatttaggctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaaacga--gattcacaatggaatttcttaatg 2453387  T
Q  719 gtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaa 818  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  2453388 gtattaagagctctggaattccaaatcaccgattgaaactaacggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcatgcaaatggattgtgtaa 2453487  T
Q  819 tggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctac 869  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2453488 tggtacgaggttgacagttacacatctatggaagagcaagatagttgctac 2453538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 706 - 1549
Target Start/End: Original strand, 25074115 - 25074963
Alignment:
Q  706 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggcta 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  25074115 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccaattatgctgatgagaaacatcgatcagacaa 25074214  T
Q  806 atggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtatt 905  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||  || || ||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  25074215 atggactgtgtaatagtactaggctgtcagttacac--ctagggaagagcacgatagctcctaccgtagttacaggaaaaagggctggtactagggtatt 25074312  T
Q  906 cattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaat 1005  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||    
T  25074313 cattcccatgatgaatcttattccgagtgatccatgactacccttcaaattcaggcgcatgcaatttccattgatgctttgttttgcaa---caatatat 25074409  T
Q  1006 aaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaa 1104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25074410 aaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacacatggacaactttatgttgctgtctctcgagtaacttcaa 25074509  T
Q  1105 gaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcat 1204  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25074510 gaaaaggtctgaaggtgctcattgtggatgaagataataatgtttgtaaggagaccagaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaa-agtatgattat 25074608  T
Q  1205 tggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactgg 1304  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25074609 ttgttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaatctaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtactgt 25074708  T
Q  1305 tcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc-----nnnn 1399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||             
T  25074709 tcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaaatcgtggatccttttttttt 25074808  T
Q  1400 nnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagccca 1499  Q
            ||||||| |||| | |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25074809 ttttttttacatcgttgttatcctaaagtacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagccca 25074908  T
Q  1500 aactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||    
T  25074909 aactatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgttttcatttaccgactacgt 25074963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 495 - 1208
Target Start/End: Original strand, 48238519 - 48239240
Alignment:
Q  495 cacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttga 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48238519 cacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccctctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttgattcagttga 48238618  T
Q  588 gcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaa 687  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  48238619 gcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaa 48238718  T
Q  688 agcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatga 787  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| || |    
T  48238719 agcgagtatttcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccggttgaaaccaagggtgggatgtgcggctatgctcataa 48238818  T
Q  788 gaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagt 887  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |    
T  48238819 gaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggccggcagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattacaggagaaat 48238918  T
Q  888 ggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgt 987  Q
    ||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  48238919 ggcaggtaccagggtattcattcacaagatgaatcttattccgagtgatccaggactacacttgaaattcaggtgcatgcaatttcgattgacgctttgt 48239018  T
Q  988 tttgcaatgacaat-aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgct 1085  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||| |    
T  48239019 tttgcaatgacaataaaaaaaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgat 48239118  T
Q  1086 gtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagttt 1185  Q
    ||  ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48239119 gtatctcgaattacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagttt 48239218  T
Q  1186 ttcaaaaaagtatgatcattggt 1208  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  48239219 ttc-aaaaagtatgatcattggt 48239240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 547 - 1110
Target Start/End: Complemental strand, 52500787 - 52500223
Alignment:
Q  547 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagct 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52500787 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaact 52500688  T
Q  647 ttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatca 746  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  52500687 ctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaaatgagcggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctttggaattccaaatca 52500588  T
Q  747 ccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatcta 846  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52500587 ccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttgtgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatcta 52500488  T
Q  847 gggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactat 946  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52500487 gggaagagcacaatagatgctaccgtaattacaggaaaaagggcagataccaaggtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactac 52500388  T
Q  947 ccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatct 1045  Q
    |||||||||||| | |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52500387 ccttcaaattcatgcgcatataatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatct 52500288  T
Q  1046 tcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaag 1110  Q
    ||||||||| |||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  52500287 tcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctagaaaag 52500223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1035 - 1547
Target Start/End: Original strand, 16748259 - 16748772
Alignment:
Q  1035 ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatg 1134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748259 ggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatg 16748358  T
Q  1135 aagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctata 1234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748359 aagataataatgtttgcaaggagaccgcaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa-agtatgatccttggttatgttttagaattgttgttgctata 16748457  T
Q  1235 atttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagc 1334  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748458 atttataaaaccaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggtatactggtcattatagacatgcaatttctatataagc 16748557  T
Q  1335 agatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgata 1434  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||            ||||||| |||||| |||||||| |||    
T  16748558 agatcctcctgccattgactattaattcatgcactttttaggtttaacaatccgcggaacc---tttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaata 16748654  T
Q  1435 tttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacg 1529  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||    
T  16748655 tttacattagaccatttgttttgtaaaaattaagaacaaacaacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaattaaacg 16748754  T
Q  1530 tttgcatttaccgactac 1547  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16748755 tttgcatttaccgactac 16748772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 901 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 28961838 - 28961209
Alignment:
Q  901 gtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaa 1000  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  28961838 gtattcattctcaggatgaatcttattccgcatgatccaggactacccttcaaattcagacgcatgcaatttccattgacactttgttttgcaatgacaa 28961739  T
Q  1001 taaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaac 1099  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||| |  ||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  28961738 taaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtggaagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgga--actctatgtcgctgtctctcgagttac 28961641  T
Q  1100 ttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaag---t 1196  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||     |    
T  28961640 ttctagaaaaagtttgaagctgctcatcttgaatgaagataataatgtttgcaaggagaccacgaatgttgtgtatggtgaagtttttcaaaaagtatat 28961541  T
Q  1197 atgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttattttt---aatttctatgta 1293  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   ||||||| ||||    
T  28961540 atgaccattggttatgttttagagttgttgttgctataatttagaaaacaaaagttgcgtattgtttggaagtcattttttttttttaaatttctttgta 28961441  T
Q  1294 aggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcgga 1392  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  28961440 agacgtactggtcattacaggacatgcaatttctatataagcaggtcctcctgccattgacttttaattgatgcatttttcaggtataacaatacgcgga 28961341  T
Q  1393 accnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctg 1492  Q
    ||             ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28961340 ac---ttttttttttacatcgttgttaccctaaaatataatatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcggcgtttatg 28961244  T
Q  1493 tagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28961243 tagtccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 28961209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 52501240 - 52500795
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  52501240 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggaagacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 52501141  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  52501140 ttttgaggcagttggccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 52501041  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  52501040 gatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttaatgtgt 52500941  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||       ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  52500940 tgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaaga-------aatttcggcaagtggatactctgaattggagacga 52500848  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 461  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  52500847 caacaacgcttcggatgagaatggttaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 52500795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 185 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 48233865 - 48233507
Alignment:
Q  185 ggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaa 284  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48233865 ggaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaa 48233766  T
Q  285 agatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaa 384  Q
    |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  48233765 agatatgtgtttattgtaatttgttgaggcttactgttgatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaagaaattcctaattttgacaa 48233666  T
Q  385 gtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaat 484  Q
    ||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  48233665 gtgaatactctcaacttgagacgacaacgacgcttcagatgagaatggggaaatgaaggtagaaattcctgaagatttactcatatcgaacacaacaaat 48233566  T
Q  485 ccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccc 543  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48233565 ccgctgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccc 48233507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1192 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 52500214 - 52499844
Alignment:
Q  1192 aaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgtt-----------ttatttt 1280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||           || ||||    
T  52500214 aaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcacattgattgaaagttgttgttttttttttttttttt 52500115  T
Q  1281 taatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggttta 1380  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52500114 taatttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcttcctgccattgactattaattcatgcatttttcaggttta 52500015  T
Q  1381 acaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggtta-ccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataaca 1479  Q
    |||||||||||||||            ||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500014 acaatccgcggaacc---tttttttttacatcgttgttacccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataaca 52499918  T
Q  1480 atcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  52499917 atcggtgtttctgtagcccaaactacatttatacacactcgtaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 52499844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1233 - 1526
Target Start/End: Original strand, 2453541 - 2453832
Alignment:
Q  1233 taatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcatta-tag-acatgcaatttctatat 1330  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2453541 taatttagaaagctaaagttgcgtattgtttggaagtcgtttt-tttttaatttctttgtaaggcgtaccggtcattagtaggacatgcaatttctatat 2453639  T
Q  1331 aagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatac 1430  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||             ||||||| |||||| ||||||||    
T  2453640 aagcagatcctcctgccattgacttttaattgatgcatttttcaggtataacaatacgtggaac---ttttttttttacatcgttgttaccctaaaatac 2453736  T
Q  1431 gatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaa 1526  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2453737 aatatttacattaaaccattggttttataaaaaataaaaacaaataacaatcgacgtttctttagcccaaactatatttatacacaccggtaaaaa 2453832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1423 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 36519178 - 36519048
Alignment:
Q  1423 taaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgta 1522  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36519178 taaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggtgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgta 36519079  T
Q  1523 aa----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||||    
T  36519078 aaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 36519048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1283 - 1515
Target Start/End: Complemental strand, 7102348 - 7102120
Alignment:
Q  1283 atttctatgtaaggcgtactggtcattat-agacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaa 1381  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  7102348 atttctttgtaaggcgtactggtccttacgagacatgtaatttctatataagcagatccttctgccattgacttttaattgatgcacttttcaggtataa 7102249  T
Q  1382 caatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaat 1481  Q
    |||| ||||||               | || || ||||||  ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7102248 caatacgcgga-----ttttttttttatatggttgttaccccaaaatacaatatttacattagatcattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaat 7102154  T
Q  1482 cgacgtttctgtagcccaaactatatttatacac 1515  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7102153 cggcgtttctgtagcccaaactatatttatacac 7102120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1312 - 1527
Target Start/End: Original strand, 48239660 - 48239872
Alignment:
Q  1312 agacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacat 1411  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |  ||| |||             ||||    
T  48239660 agacatgcaatttctatataagcatatcctcctgccattgacttttaattgatgcactttttaggtataacagtatgcgaaac---ttttttttttacat 48239756  T
Q  1412 cgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttat 1511  Q
    | | ||||||  ||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48239757 ctttgttaccccaaaatataatatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatctttat 48239856  T
Q  1512 acacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||||||||||    
T  48239857 acacacccgtaaaaaa 48239872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Original strand, 14171539 - 14171604
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14171539 aattactccctccgtctctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 14171604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 30290263 - 30290328
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30290263 attactccctccgtccctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 30290328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1559 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 15811277 - 15811206
Alignment:
Q  1559 aaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  15811277 aaatatattactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 15811206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 46075904 - 46075841
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  46075904 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatattttttgtccctttttataagacc 46075841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 25509209 - 25509271
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25509209 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 25509271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1199 - 1298
Target Start/End: Complemental strand, 12451189 - 12451094
Alignment:
Q  1199 gatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcg 1298  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  12451189 gatcattagttatgttttaaaattgttg---ctataatttaaaaaactaaagttgtgtgttgtttagaagtc-ttttttttttaatttctttgtaaggcg 12451094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 49907019 - 49907084
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  49907019 attactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 49907084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Original strand, 16456635 - 16456699
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttt-tatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16456635 ttactccctccgtccctaattataagacccttctgagaaatttttctgtccctttttataagacc 16456699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 1039418 - 1039355
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  1039418 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 1039355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 1046324 - 1046261
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  1046324 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 1046261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 4102751 - 4102688
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  4102751 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 4102688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 11741397 - 11741460
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  11741397 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 11741460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 757 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 12451228 - 12451185
Alignment:
Q  757 ctaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatca 800  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12451228 ctaagagtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatca 12451185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 23541979 - 23542042
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  23541979 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 23542042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 36694854 - 36694917
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  36694854 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 36694917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 36710955 - 36711018
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  36710955 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 36711018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 37951986 - 37951923
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  37951986 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 37951923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 39363233 - 39363170
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  39363233 attactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 39363170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 39497433 - 39497496
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  39497433 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 39497496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1627
Target Start/End: Original strand, 44649627 - 44649690
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  44649627 attactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 44649690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 45039412 - 45039475
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  45039412 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 45039475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 52431211 - 52431148
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  52431211 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 52431148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 1048287 - 1048226
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1048287 tactccctccgtccct-attataagatccttttgagaatttttttatccctttttaaaagacc 1048226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1568 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 30289898 - 30289836
Alignment:
Q  1568 actccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  30289898 actccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 30289836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 943676 - 943612
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  943676 attactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccttttttataagac 943612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 2489436 - 2489376
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  2489436 tactaccttcgtccctaattataaaacccttttgaaaatttttttgtccctttttataaga 2489376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1558 - 1629
Target Start/End: Original strand, 7783982 - 7784054
Alignment:
Q  1558 aaaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||    
T  7783982 aaaatatactactccctccgtccctaattataatacccttttgagaattttttttgtcccttattataagacc 7784054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1574 - 1629
Target Start/End: Original strand, 8472056 - 8472112
Alignment:
Q  1574 tccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8472056 tccgtccctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 8472112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1558 - 1629
Target Start/End: Original strand, 47068780 - 47068851
Alignment:
Q  1558 aaaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttt-ttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47068780 aaaaaaaactactccttccgtccctaat-ataagacccttttgagaaatttttttatccctttttataagacc 47068851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1570 - 1628
Target Start/End: Original strand, 13343776 - 13343835
Alignment:
Q  1570 tccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  13343776 tccctccgtccctaattataagacccttttgagaatattttttgttcctttttataagac 13343835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 15892601 - 15892538
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  15892601 ttactacctccgttcctaattataagacccttttgaaaatttttttgtccctttttataagacc 15892538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 27037269 - 27037332
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  27037269 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 27037332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 41855510 - 41855447
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  41855510 tactccatccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 41855447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 52601991 - 52602054
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  52601991 tactccctccgtccctaattataagacccttttaagaattttttttgtccctttttataagacc 52602054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 8104325 - 8104263
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  8104325 tactccctccgtccctaattataagacccctttgaaattttttttatccttttttataagacc 8104263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 50007975 - 50008037
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  50007975 tactccctctgtccctaattataagactcttttgagaatttttttgtctctttttataagacc 50008037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 50937779 - 50937841
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  50937779 tactacctccgtccctaattataagaccattttgagaatttttttgtccttttttataagacc 50937841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 7763786 - 7763725
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7763786 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 7763725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 18237094 - 18237154
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18237094 tactacctccgtccctaattataagactcttttgag-aattttttgtccctttttataagac 18237154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1628
Target Start/End: Original strand, 38261337 - 38261402
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  38261337 aattactacctccgtccttaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 38261402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Original strand, 45335884 - 45335948
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||    
T  45335884 ttactccctccctccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccttttttataagacc 45335948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 16576129 - 16576066
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  16576129 tactccctccgtccctaattataagactcttttgataattttttttgtccctttttataagacc 16576066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 39750418 - 39750355
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||    
T  39750418 tactccctctgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgttcctttttataagacc 39750355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 42032139 - 42032100
Alignment:
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctt 1024  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42032139 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcagtctt 42032100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1561 - 1600
Target Start/End: Complemental strand, 44646574 - 44646535
Alignment:
Q  1561 ataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttg 1600  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44646574 ataaattactccctccgtccctaattataagacccttttg 44646535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1561 - 1600
Target Start/End: Complemental strand, 44649932 - 44649893
Alignment:
Q  1561 ataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttg 1600  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44649932 ataaattactccctccgtccctaattataagacccttttg 44649893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 11353099 - 11353038
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  11353099 tactacctccgttcctaattataagacccttttga-aatttttttgtccctttttataagacc 11353038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1584 - 1629
Target Start/End: Original strand, 15111598 - 15111644
Alignment:
Q  1584 attataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  15111598 attataaaacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 15111644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Original strand, 31238724 - 31238782
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  31238724 cctccgtccctaattataagacccgtttgagaattttttttgtccctttttataagacc 31238782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1625
Target Start/End: Complemental strand, 45285842 - 45285788
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataa 1625  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45285842 cctccgtccctaattataagactcttttgagaaatttttttgtccctttttataa 45285788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 3934606 - 3934667
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  3934606 tactacctccgtccctaattataagatccttttgataatttttttgcccctttttataagac 3934667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1573 - 1629
Target Start/End: Original strand, 5858261 - 5858318
Alignment:
Q  1573 ctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttta-tccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  5858261 ctccgtccctaattataagactcttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 5858318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 12814827 - 12814762
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttta-tccctttttataagac 1628  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  12814827 aattactacctccgtccataattataagaccattttgagaattttttttgtccctttttataagac 12814762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1628
Target Start/End: Original strand, 24855278 - 24855343
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttta-tccctttttataagac 1628  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  24855278 aattactacatccgtccctaattataagaccattttgagaattttttttgtccctttttataagac 24855343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1627
Target Start/End: Original strand, 26768385 - 26768446
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataaga 1627  Q
    ||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  26768385 ttactaccttcgtccctaaatataagacccttttgagaatttttttgtctctttttataaga 26768446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1576 - 1629
Target Start/End: Original strand, 37584963 - 37585016
Alignment:
Q  1576 cgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  37584963 cgtccctaattataagactcttttgagaatttttttgtccgtttttataagacc 37585016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 42276198 - 42276134
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgag--aaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||||    
T  42276198 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaaaaaaattttgtccctttttataagacc 42276134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 43456658 - 43456597
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttt-atccctttttataaga 1627  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||    
T  43456658 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttggtcccgttttataaga 43456597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 44646269 - 44646334
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttta-tccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||||    
T  44646269 attactccttccgtccctaattataagacccttttgaaatttttttttgtccctttttataagacc 44646334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 50246966 - 50246905
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  50246966 tactccctccgtccgtaattataagatccttttgagaatttttttgtctatttttataagac 50246905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 1004; Significance: 0; HSPs: 76)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 1004; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 21396014 - 21394505
Alignment:
Q  28 aaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatcga 127  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21396014 aaaggatagtcctagggcagacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggctgttgaccga 21395915  T
Q  128 tcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttc 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| ||| || |||| |    
T  21395914 tcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgaccgtagttttaggtggtgattttaggcagatattgc 21395815  T
Q  228 atgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatat 327  Q
     ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395814 ctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctccgtcaattcgtcaaagttatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatat 21395715  T
Q  328 gagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgag 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||    
T  21395714 gagattgggtgcatcttcggtacctgcagatcaggaagaaattgctaatttcggcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcggatgag 21395615  T
Q  428 aatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatg 527  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21395614 aatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcgcttatagactttgtatatcccgatctgaatg 21395515  T
Q  528 ataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattcc 620  Q
    |||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21395514 ataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattcc 21395415  T
Q  621 aggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggt 720  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  21395414 aggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacgccggaatttcttaatggt 21395315  T
Q  721 attaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatg 820  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21395314 attaagagctctggaattccaaatcacaggttgaagctaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatagatcaggccaatggactgtgtaatg 21395215  T
Q  821 gtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaa 920  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21395214 gtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccagcgtattcattcccaggatgaa 21395115  T
Q  921 tcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaa 1020  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21395114 tcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaagcgcaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaa 21395015  T
Q  1021 tctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagc 1119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395014 tctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagc 21394915  T
Q  1120 tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattgg----ttatgttt 1215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||    
T  21394914 tgctcatcctggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggttaattatgttt 21394816  T
Q  1216 tagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagac 1315  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  21394815 tagaattgttgttgctataatttataaaaccaaagttggctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgcaaggcgtgctggtcattatagac 21394716  T
Q  1316 atgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtg 1415  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||            |||||||     
T  21394715 atgcaatttctatataagcagatcctcctgccatttactattaattaatgcacttttcaggtttaactatctgcggaacc-tttttttttttacatcgtt 21394617  T
Q  1416 gttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacac 1515  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21394616 gttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttctgtaaaaattaacaacaaataacaattggcgtttctgtagcccaaactatatttatacac 21394517  T
Q  1516 acccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||| ||||    
T  21394516 acccgtagaaaa 21394505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 983; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 27510029 - 27508517
Alignment:
Q  17 cttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgagg 116  Q
    ||||| ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27510029 cttacgatgcaaaaggacagacctagggcagatctggtgcatgctgcaaagttgataatttaggatgaggcttcaatgatgcaccgatggtgttttgagg 27509930  T
Q  117 cagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcag 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  27509929 cagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaatgagtttagacattttggtggaatgacagtagttttaggtggtgatttcag 27509830  T
Q  217 gaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggctt 316  Q
    | || |||| | ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27509829 gcagatattgcctgttgtccaaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtattgaggctt 27509730  T
Q  317 actgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacg 416  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  27509729 actgttaatataagattgggtgcatctttgctacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtagatactctcaattggagacagcaacgacg 27509630  T
Q  417 cttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcc 516  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27509629 cttcagatgagaatggtgagatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatgtcggacacaacaaattcgttgatatcacttatagactttgtgtatcc 27509530  T
Q  517 cgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatg 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27509529 cgatttgaatgataaccttggtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatg 27509430  T
Q  610 tcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27509429 tcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctaatgtccaaagcgagtggttcacaacggaat 27509330  T
Q  710 ttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatgg 809  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27509329 ttcttaatggtattaagagctctggaatttcaaatcaccggttgaaaataagggtgggatgtccagttatgttgatgagaaacatcgatcaggccaatgg 27509230  T
Q  810 actgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcatt 909  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  27509229 actgtgtaatggtacgaggctgatagtcactcatctagggaagagcacgatagctgctaccatagttacaggaaaaagggcaggtacgagggtattcatt 27509130  T
Q  910 cccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaa 1009  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27509129 cccaggatgaatcttattctgagtgatccaggactacccttcaaattcaggaacatgcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaa 27509030  T
Q  1010 gtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaa 1108  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||  |||||    
T  27509029 gtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatattcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagttacttttagaaa 27508930  T
Q  1109 aggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggt 1208  Q
    |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27508929 aggtttgaagctacccatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggt 27508831  T
Q  1209 tatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcat 1308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  27508830 tatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcgtattgtttggaagttgttt--tttttaatttctttgtaagacgtaatggtcat 27508733  T
Q  1309 tata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnn 1407  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||                 
T  27508732 tataggacatgcaatttctatataagcagatcctcttgccattgacttttaa-tgatgcacttttcagctataacaatacgcggaac---tttttttttt 27508637  T
Q  1408 acatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatat 1507  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27508636 acatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccattgattttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatat 27508537  T
Q  1508 ttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27508536 ttatacacacccgtaaaaaa 27508517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 903; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1549
Target Start/End: Original strand, 41919755 - 41921281
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41919755 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 41919854  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||| ||  || ||||||          
T  41919855 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatggcagtagttttaggc----- 41919949  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
            || |||| | ||| ||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41919950 --------agatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccatatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttg 41920041  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    |||||| ||           ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  41920042 aggcttgct-----------attggatgcatctttggtacctgtagagcaggaagaaattgataatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 41920130  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41920131 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 41920230  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  41920231 gtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattaagcatgttaacgaattt 41920330  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41920331 atgatgtcgttgattccaggtgaagataaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacac 41920430  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41920431 cagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcgatcaggc 41920530  T
Q  804 taatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttc-aggaaaagtggcaggtactagtgt 902  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| | |||||||  |||||||||||| ||    
T  41920531 caatggactgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattacaaggaaaaagggcaggtactagggt 41920630  T
Q  903 attcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaata 1002  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41920631 attcgttcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcagacgcagacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaata 41920730  T
Q  1003 aataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaactt 1101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41920731 aataaaagccagggtcaatctttatctcgggtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatagacaactttatgtcgctgtctctcgagtaactt 41920830  T
Q  1102 caagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgat 1201  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41920831 catgaaaaggtctgaagctactcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagttttt-taaaaagtatgat 41920929  T
Q  1202 cattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtac 1301  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41920930 catcggttatgttttagaattgttgttgctataatatataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtac 41921029  T
Q  1302 tggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnn 1401  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||          
T  41921030 cggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattagttcatgcacttttcaggtttaacaatccgtgaaacctttttt 41921129  T
Q  1402 nnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaa 1501  Q
          ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41921130 ttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaa 41921229  T
Q  1502 ctatatttatacacacccgtaaa----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  41921230 ctatatttatacacacccgtaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 41921281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 859; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1549
Target Start/End: Original strand, 28665754 - 28667284
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28665754 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtccttgggcagacctggtgtgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 28665853  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||| |||||||| ||  || ||||||          
T  28665854 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaactttttggtggaatggcagtagttttaggc----- 28665948  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
            || |||| ||||| ||| ||  |||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28665949 --------agatattgcatgttgtctgaggaggaacgatgccagatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttg 28666040  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    |||||| ||           ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  28666041 aggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctacagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 28666129  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28666130 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgt 28666229  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  28666230 gtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaattt 28666329  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28666330 atgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacac 28666429  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaag-ggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcagg 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28666430 cagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcgatcagg 28666529  T
Q  803 ctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttca-ggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||  |||||||||||| |    
T  28666530 ccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattacaaggaaaaagggcaggtactaggg 28666629  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28666630 tattcattcccaggatgaatcttattccgaatgatccaggactacccttcaaattcagacgcagacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 28666729  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28666730 aaataaaagctagg-tcaatctttatctcgggtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatagacaactttatgtcgttgtctctcgagtaact 28666828  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28666829 tcatgaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa-agtatga 28666927  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28666928 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatatataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgta 28667027  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc---nn 1397  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||         
T  28667028 ccggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcactttttaggtttaacaatccgtgaaaccttttt 28667127  T
Q  1398 nnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcc 1497  Q
              ||||||| ||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28667128 ttttttttttacatcgttgttaccccaaaacacaatatttacattacaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcatttctgtagcc 28667227  T
Q  1498 caaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  28667228 caaactatatctatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 28667284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 859; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1549
Target Start/End: Original strand, 37824588 - 37826118
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37824588 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtccttgggcagacctggtgtgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 37824687  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||| |||||||| ||  || ||||||          
T  37824688 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaactttttggtggaatggcagtagttttaggc----- 37824782  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
            || |||| ||||| ||| ||  |||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37824783 --------agatattgcatgttgtctgaggaggaacgatgccagatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttg 37824874  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    |||||| ||           ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37824875 aggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctacagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 37824963  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37824964 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgt 37825063  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  37825064 gtatcccgatctaaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaattt 37825163  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37825164 atgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacac 37825263  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaag-ggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcagg 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37825264 cagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcgatcagg 37825363  T
Q  803 ctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttca-ggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||  |||||||||||| |    
T  37825364 ccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattacaaggaaaaagggcaggtactaggg 37825463  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  37825464 tattcattcccaggatgaatcttattccgaatgatccaggactacccttcaaattcagacgcagacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 37825563  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  37825564 aaataaaagctagg-tcaatctttatctcgggtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatagacaactttatgtcgttgtctctcgagtaact 37825662  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37825663 tcatgaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa-agtatga 37825761  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37825762 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatatataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgta 37825861  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc---nn 1397  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||         
T  37825862 ccggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcactttttaggtttaacaatccgtgaaaccttttt 37825961  T
Q  1398 nnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcc 1497  Q
              ||||||| ||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37825962 ttttttttttacatcgttgttaccccaaaacacaatatttacattacaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcatttctgtagcc 37826061  T
Q  1498 caaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  37826062 caaactatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 37826118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 802; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1208
Target Start/End: Complemental strand, 27193152 - 27191946
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27193152 catcatcgcttatgatggaaaaggatagtcctagggctgacctggtgcgtgctgcaaaattgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 27193053  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  27193052 ctttgaggcagttgaccgatcaatgcgttatatcatgtacaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgacaatagttttaggtggt 27192953  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27192952 gatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatttgt 27192853  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||     
T  27192852 tgaggctgattgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgtagagcaggaagaaattcataattttgacaagtggatactctcaactggtgacgg 27192753  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27192752 caacgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacttt 27192653  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192652 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 27192553  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||    
T  27192552 atatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaatttttgatgtccaaagcgagtatttcac 27192453  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27192452 aatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaaatcaccggttgaaaccaagggtgggatgtccggctatgctgatgagaaacatcgatcag 27192353  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||| ||  ||||||||| |  |    
T  27192352 gccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattacaggagaaagggcaggtaccatgg 27192253  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  27192252 tattcattcacatgatgaatcttattccgagtgatccaggactacacttgaaattcaggtgcatgcaatttccatcgacgctttgttttgcaatgacaat 27192153  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
     || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  27192152 gaaaaaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagttact 27192053  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  27192052 tctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaatataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-agaaagtatga 27191954  T
Q  1201 tcattggt 1208  Q
    ||||||||    
T  27191953 tcattggt 27191946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 802; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1208
Target Start/End: Complemental strand, 27842966 - 27841760
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842966 catcatcgcttatgatggaaaaggatagtcctagggctgacctggtgcgtgctgcaaaattgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 27842867  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  27842866 ctttgaggcagttgaccgatcaatgcgttatatcatgtacaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgacaatagttttaggtggt 27842767  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27842766 gatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatttgt 27842667  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||     
T  27842666 tgaggctgattgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgtagagcaggaagaaattcataattttgacaagtggatactctcaactggtgacgg 27842567  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27842566 caacgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacttt 27842467  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842466 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 27842367  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||    
T  27842366 atatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaatttttgatgtccaaagcgagtatttcac 27842267  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27842266 aatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaaatcaccggttgaaaccaagggtgggatgtccggctatgctgatgagaaacatcgatcag 27842167  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||| ||  ||||||||| |  |    
T  27842166 gccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatatctgctaccgtaattacaggagaaagggcaggtaccatgg 27842067  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  27842066 tattcattcacatgatgaatcttattccgagtgatccaggactacacttgaaattcaggtgcatgcaatttccatcgacgctttgttttgcaatgacaat 27841967  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
     || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  27841966 gaaaaaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagttact 27841867  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  27841866 tctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaatataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-agaaagtatga 27841768  T
Q  1201 tcattggt 1208  Q
    ||||||||    
T  27841767 tcattggt 27841760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 776; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 233 - 1527
Target Start/End: Original strand, 17683609 - 17684897
Alignment:
Q  233 gtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17683609 gtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttaaggcttattgttaatatgagat 17683708  T
Q  333 tgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatgg 432  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17683709 tgggtgcatcttcgatacctgtagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcagatgagaatgg 17683808  T
Q  433 tgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataac 532  Q
    | |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17683809 taaaatgaaggtagaaattcctgaatattcgctcatattggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataac 17683908  T
Q  533 cttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtg 625  Q
    ||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17683909 cttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgctccaacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtg 17684008  T
Q  626 aagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaa 725  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17684009 aagagaaagagtatttaagctatgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaa 17684108  T
Q  726 gagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacg 825  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17684109 gagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggtcaatggactgtgtaatggtacg 17684208  T
Q  826 aggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatctta 925  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||   ||||| || |||||  || | |||| || || ||||||||  ||||||||||||    
T  17684209 aggctaacagttacacatctagggaagaccacgattgctgctaacgtaattacatgaaaaagggaaagtaccagggtgttcattccttggatgaatctta 17684308  T
Q  926 ttccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatcttt 1025  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17684309 ttctgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcatgcaatttccattgacgttttgttttgcaatgacgataaataaaagtcagggtcaatcttt 17684408  T
Q  1026 atctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctc 1124  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17684409 atctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcattgtctctcgagttacttctagaaaaggtttgaagctgctc 17684508  T
Q  1125 atcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgt 1224  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684509 atcttggatgaatataataatgtttgcaaggagaccacatatgttgtgtgtcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgt 17684607  T
Q  1225 tgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatt 1323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17684608 tgttgctataatttagaaaactaaagttgtgcattgtttggaagtcatt---tttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattacaggacatgcaatt 17684704  T
Q  1324 tctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttacctt 1423  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |            ||||||| |||| | |    
T  17684705 tctatataagcagatcctcctgccattgacttttaaatgatgcacttttcaggtataacaatacgc-gaaactattttttttttacatcgttgttaacct 17684803  T
Q  1424 aaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaa 1523  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||      ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     ||||||||||||||||    
T  17684804 aaaatacaatatttgcattagaccattgattttgtaa-----taaaacaaataacaatcggcgtttcagtagcccaaac-----ttatacacacccgtaa 17684893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 748; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1110
Target Start/End: Original strand, 24268626 - 24269735
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24268626 catcatcgcttacgatggaaaatgatagtcctaggacagacctggtgcatgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccactgatgcactgatggtg 24268725  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  24268726 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacaagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 24268825  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||| ||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||    
T  24268826 gatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcacagatatgtgcttattttaatgtgt 24268925  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  24268926 tgacgcttattgttaatatgcgattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacgg 24269025  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24269026 caacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacttt 24269125  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24269126 gtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaat 24269225  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24269226 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcac 24269325  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24269326 aacggaattccttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 24269425  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||  |    
T  24269426 gccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagaccacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtactaagg 24269525  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24269526 tattcattcctaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcatgcgcagataatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 24269625  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  24269626 aaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcatgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctcgagttact 24269725  T
Q  1101 tcaagaaaag 1110  Q
    || |||||||    
T  24269726 tctagaaaag 24269735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 492 - 1390
Target Start/End: Complemental strand, 35609865 - 35608957
Alignment:
Q  492 tgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagt 584  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35609865 tgtcacttatagactttgtgtattccgatttgaatgataacattggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagt 35609766  T
Q  585 tgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtc 684  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35609765 tgagtatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattatgtttgtcgatcgagtgaaaattctgatgtc 35609666  T
Q  685 caaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctga 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35609665 caaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcactggttgaaactaagggttggatgtccagttatgctga 35609566  T
Q  785 tgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaa 884  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||    
T  35609565 tgagaaacattgatcaggccaatggactgtgtagtggtacgaggctgacagttacacgtctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaagaaa 35609466  T
Q  885 agtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgt 984  Q
    |  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||    |    
T  35609465 aagggcaggtaccagggtattcattcccaagatgaatcttattccgagtgatctatgactacccttcaaattcagacgcttgcaatttccattgacattt 35609366  T
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcg 1083  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||| |    
T  35609365 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcaaggtcaatgtttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgttg 35609266  T
Q  1084 ctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtata-tcgtgaag 1182  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  35609265 ctgtctctcgagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataacttttgcaaggagaccacaaatgttgtgtattcatgaag 35609166  T
Q  1183 tttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaa-ttgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttattttt 1281  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  35609165 tttttc-aaaaagtatgatcattggttatgttttagaatttgttattgctataatttagaaaactaaagttgtgtattgtttggaagtcttttttttttt 35609067  T
Q  1282 aatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggttta 1380  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  35609066 tatttctttgtaaggcgtactggtcattacatgacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgacttttaattgatgcacttttcaggtata 35608967  T
Q  1381 acaatccgcg 1390  Q
    ||||| ||||    
T  35608966 acaatacgcg 35608957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 24246486 - 24245812
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||     
T  24246486 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttg--atgaggctccaatgatgcactgatggta 24246389  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||    
T  24246388 ttttgaggcagttgaccgatcaatacgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaatgagtttagaccttttggtggaatcatagtagttttaggtggt 24246289  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaa-ggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtg 307  Q
    ||||| ||| || |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24246288 gatttaaggcagatattgcatgttgtccgaaaaaggaatgatgcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtg 24246189  T
Q  308 ttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  24246188 ttgaggcttactgttaatatgagattgg-tgaatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatgttggcatgtggattctctcaattggagacg 24246090  T
Q  408 acaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactt 507  Q
     |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24246089 gcaacgacgctttggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcataacggacacaacaaatccgtggatgtcacttatagacct 24245990  T
Q  508 tgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgc-------tcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245989 tgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaa 24245890  T
Q  601 tatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245889 tatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagatctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 24245812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 734 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 24245783 - 24245004
Alignment:
Q  734 gaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgac 833  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245783 gaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacgaggctgac 24245684  T
Q  834 agttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagt 933  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||  |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245683 agttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattataggaaaaaaggcatgtaccagggtattcattcccaggatgaatcttattccgagt 24245584  T
Q  934 gatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatct-cga 1032  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||    
T  24245583 gatccaggactgcccttcaaattcaggcgcatgcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagttagggtcaatctttgtttccga 24245484  T
Q  1033 gtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctgg 1131  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  24245483 gtgggaatttatcttcctaagcccgtgttcatgcatgggcaactctatgtcgttgtctctcgagttacttctagaaaaggtatgaagctgctcatctagg 24245384  T
Q  1132 atgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgct 1231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245383 atgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgct 24245285  T
Q  1232 ataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatat 1330  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||       |||||  ||||| |||||||||||||| || ||| | | ||||||||||||||||    
T  24245284 ataatttagaaaactaaagttgtgtattgattggaagt-------ttttt--tttctttgtaaggcgtactgatcgttacagggcatgcaatttctatat 24245194  T
Q  1331 aagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatac 1430  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||   ||| ||||||| |||||||              ||||||| |||||| ||||||||    
T  24245193 aagcagatccttctgcctttgacttttaattgatgcactttcagggtataacaatacgcggaa-ttttattttttttacatcgttgttaccctaaaatac 24245095  T
Q  1431 gatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||      ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245094 gatatttacattagaccaatggttttgta------aaaaataaataacaatcggcatttttgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 24245004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 35610315 - 35609877
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35610315 catcatcacttacgatggaaaaggatagtcctaaggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatg-tgcaccgatggtg 35610217  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   | ||||||||||    
T  35610216 ttttgaagcaattgaccgatcaatacgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtagaatgacagttgttttaggtggt 35610117  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| |  |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35610116 gatttcaggcatatattgcctgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccccaatcaattcattaaagatatggacttattataatgtgt 35610017  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  35610016 tgaggcttactgttaatatgacattgggtgcatcttcggtacctttagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 35609917  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaa 448  Q
    |||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  35609916 caacgaagtttcggatcagaatggtgaaatgaaggtagaa 35609877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1042 - 1527
Target Start/End: Original strand, 40488287 - 40488774
Alignment:
Q  1042 atcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataa 1141  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40488287 atcttcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctagaaaaggtttgaagctgttcatcttggatgaagataa 40488386  T
Q  1142 taatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttaga 1241  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40488387 taatgtttgcaaggagaccataaatgttgtgtattgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattgattatgttttagaactgttgttgctataatttaga 40488485  T
Q  1242 aaactaaagttgcctattgtttggaagtcgtttt------atttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagc 1334  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||       |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |    
T  40488486 aaactaaagttgtgtattgattgaaagttgtttttttttattttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattacatgacatgcaatttctacataaac 40488585  T
Q  1335 agatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgata 1434  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||             ||||||| |||||| |||||||| |||    
T  40488586 agatccttctgcctttgacttttaattgatgcgcttttcaagtataacaatacgcggaac----tttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaata 40488681  T
Q  1435 tttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40488682 tttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaataaataacaatcaacgtttctgtagcccaaactatatttgtacacacccgtaaaaaa 40488774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1180 - 1549
Target Start/End: Original strand, 24269733 - 24270114
Alignment:
Q  1180 aagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttattt 1279  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||| |||    
T  24269733 aagtttttttaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgtcgttgctataatttagaaaactaaagttgcgcattgattgaaagttgtttttttt 24269832  T
Q  1280 tt-------aatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcactttt 1372  Q
    ||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24269833 ttttcttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttttatattagcagatcttcctgccattgactattaattcatgcactttt 24269932  T
Q  1373 caggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggtta-ccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaac 1471  Q
    |||||||||||| ||||||||||            ||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24269933 caggtttaacaacccgcggaacc--gttattttttacatcgttgttacccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaataac 24270030  T
Q  1472 aaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa------aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  24270031 aaataacaatcggcgtttctgtaacccaaactatatttatacacacccgtaaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 24270114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 967 - 1208
Target Start/End: Original strand, 2867577 - 2867821
Alignment:
Q  967 caatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatac 1065  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |    
T  2867577 caatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaaaaaaagttcgggtcaatctttatctcaagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgc 2867676  T
Q  1066 atgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaag---ataataatgtttgtaaggagaccac 1162  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||     
T  2867677 atggacaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataataatgtttgcaagtagaccat 2867776  T
Q  1163 aaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggt 1208  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2867777 aaatgttgtgtatcctgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggt 2867821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 199 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3643065 - 3642920
Alignment:
Q  199 tttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttat 298  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3643065 tttaggtggtgatttcaggtagatattgcctgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttat 3642966  T
Q  299 tgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctt 344  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3642965 tgtaatttgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctt 3642920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1347 - 1549
Target Start/End: Original strand, 39441572 - 39441778
Alignment:
Q  1347 cattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaac 1446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||            ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||    
T  39441572 cattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgtgaaaccttttttttgtt-acatcgttgttactctaaaatacaatatttacattagac 39441670  T
Q  1447 catttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa-----cgtttgcatttacc 1541  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | ||||||||||||    
T  39441671 catttattctgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaattaaacatttgcatttacc 39441770  T
Q  1542 gactacgt 1549  Q
    ||||||||    
T  39441771 gactacgt 39441778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1312 - 1527
Target Start/End: Original strand, 2868236 - 2868448
Alignment:
Q  1312 agacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacat 1411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |  ||| |||             ||||    
T  2868236 agacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgacttttaattgatgcactttttaggtataacagtaagcgaaac---ttttttttttacat 2868332  T
Q  1412 cgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttat 1511  Q
    | | ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2868333 cattgttaccccaaaatacaatatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttat 2868432  T
Q  1512 acacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||||||||||    
T  2868433 acacacccgtaaaaaa 2868448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1312 - 1527
Target Start/End: Original strand, 2881344 - 2881556
Alignment:
Q  1312 agacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacat 1411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |  ||| |||             ||||    
T  2881344 agacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgacttttaattgatgcactttttaggtataacagtaagcgaaac---ttttttttttacat 2881440  T
Q  1412 cgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttat 1511  Q
    | | ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2881441 cattgttaccccaaaatacaatatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttat 2881540  T
Q  1512 acacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||||||||||    
T  2881541 acacacccgtaaaaaa 2881556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1317 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 3642413 - 3642206
Alignment:
Q  1317 tgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtgg 1416  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| | |||| |||             ||||||| |    
T  3642413 tgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgacttttaattgatgcactttttaggtataacagtacgcgaaac---ttttttttttacatcgttg 3642317  T
Q  1417 ttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacaca 1516  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3642316 ttaccccaaaatacaatatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagccgaaattatatttatacaca 3642217  T
Q  1517 cccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||    
T  3642216 cccgtaaaaaa 3642206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 17683469 - 17683583
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17683469 catcatcgcttacgatgaaaaaggatagtcgtagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttggaatgaggctctaatgatgcaccaatggtg 17683568  T
Q  109 ttttgaggcagttga 123  Q
    |||||||||||||||    
T  17683569 ttttgaggcagttga 17683583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1129 - 1208
Target Start/End: Complemental strand, 3642919 - 3642841
Alignment:
Q  1129 tggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggt 1208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3642919 tggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttca-aaaagtatgatcattggt 3642841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1559 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 34883893 - 34883822
Alignment:
Q  1559 aaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  34883893 aaataaaatactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 34883822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 40607702 - 40607765
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40607702 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 40607765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1560 - 1629
Target Start/End: Original strand, 2438218 - 2438288
Alignment:
Q  1560 aataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  2438218 aatatattactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 2438288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 16845109 - 16845047
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16845109 tactccctccgtccctaattataagatccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 16845047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 25624733 - 25624795
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25624733 tactccctccgtccctaattataagacctttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 25624795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 23788967 - 23789032
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23788967 attactccctccgtccttaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 23789032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 8716930 - 8716866
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  8716930 ttactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 8716866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Original strand, 27560205 - 27560269
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgag-aaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27560205 ttactccctccgtccctaattataagacccttttgagaaaaatttttgtccctttttataagacc 27560269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1626
Target Start/End: Original strand, 4711728 - 4711787
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataag 1626  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4711728 tactccctccgtccctaattaaaagacccttttgagaatttttttgtccctttttataag 4711787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1628
Target Start/End: Original strand, 7491843 - 7491906
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7491843 ttactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 7491906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1574 - 1629
Target Start/End: Original strand, 28840646 - 28840701
Alignment:
Q  1574 tccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28840646 tccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 28840701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 36131065 - 36131002
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  36131065 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 36131002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1558 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 40680706 - 40680636
Alignment:
Q  1558 aaaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40680706 aaaataaat-actacctccgtccctaattataaaactcttttaagaatttttttttccctttttataagacc 40680636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 44573919 - 44573857
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  44573919 tactacctccgtccttaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 44573857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 17408331 - 17408270
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17408331 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 17408270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Original strand, 32511026 - 32511082
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32511026 cctccgtccct-attataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 32511082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 34062702 - 34062641
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  34062702 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 34062641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Original strand, 41450516 - 41450577
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  41450516 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 41450577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 8912912 - 8912848
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  8912912 ttactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 8912848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 11852222 - 11852162
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11852222 tactacctccgtccctaattataagatccttttgagaatttttttgtccctttttataaga 11852162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 44436860 - 44436796
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgag-aaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44436860 attactacctccgtccctaatgataagacccttttgagaaaattttttgtccctttttataagac 44436796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 5664638 - 5664701
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  5664638 tactccctccgtccctaattataagacctttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 5664701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 8841694 - 8841631
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  8841694 tactccctccgtccttaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 8841631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 15228186 - 15228123
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  15228186 tactccctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 15228123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 16805828 - 16805765
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  16805828 tactccctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 16805765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 20252210 - 20252273
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||    
T  20252210 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatttcttttgtcactttttataagacc 20252273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 31751069 - 31751132
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31751069 tactacctccgtccctaattataagacccttttgtgaaatttttttgtccctttttataagacc 31751132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 34113531 - 34113594
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  34113531 tactccatccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 34113594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 40680727 - 40680790
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  40680727 tactccatccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 40680790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 11201683 - 11201745
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||    
T  11201683 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatttatttttttcctttttataagac 11201745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 12360457 - 12360519
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12360457 tactacctccgtctttaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 12360519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 26322330 - 26322268
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  26322330 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 26322268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 1359789 - 1359854
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  1359789 attactccctccgtccctaattataagatcctttggagaattttttttgtccctttttataagacc 1359854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1563 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 15918119 - 15918054
Alignment:
Q  1563 aaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15918119 aaattactacctccatccctaattacaagaccctttcgagaatttttttgtccctttttataagac 15918054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 16669624 - 16669689
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaat-tttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  16669624 attactccctccgttcttaattataagacccttttgagaattatttttgtccctttttataagacc 16669689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Original strand, 30466110 - 30466167
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  30466110 cctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttttcctttttataagacc 30466167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 39834038 - 39833973
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  39834038 attactccctcagtccctaattataagacctttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 39833973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 16108513 - 16108449
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  16108513 ttactccctccgtccctaattataagattcttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 16108449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1574 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 16456902 - 16456846
Alignment:
Q  1574 tccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  16456902 tccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 16456846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Original strand, 24345416 - 24345480
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  24345416 ttactacctccgtccctaattataagaccctttcgagaattttttttgtccctttttataagacc 24345480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 7531603 - 7531666
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttt-ttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||| |||  || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7531603 tactcccttcgtttctaattataagacccttttaagaaatttttttatccctttttataagacc 7531666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 10758017 - 10757952
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa--attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  10758017 attactccctccgtccctaattataaga-ccttttgagaatttttttttgtccctttttataagacc 10757952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 15404744 - 15404681
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  15404744 tactccctccgtccttaattgtaagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 15404681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1625
Target Start/End: Original strand, 22897391 - 22897450
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataa 1625  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  22897391 tactccctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataa 22897450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 37229440 - 37229503
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  37229440 tactccttccgtccctaattataagaccattttgagaatttcttttgtccctttttataagacc 37229503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1563 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 10399503 - 10399437
Alignment:
Q  1563 aaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  10399503 aaattactacctccatccctaattataagacccttttgagaattttttttgtcccgttttataagac 10399437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1573 - 1628
Target Start/End: Original strand, 17665529 - 17665586
Alignment:
Q  1573 ctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattt--tttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  17665529 ctccgtccctaattataagacctttttgagaattttcttttatccctttttataagac 17665586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 985 - 1018
Target Start/End: Original strand, 3571845 - 3571878
Alignment:
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtc 1018  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3571845 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtc 3571878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1569 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 24300386 - 24300325
Alignment:
Q  1569 ctccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  24300386 ctccctccgtttctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 24300325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 29830791 - 29830731
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  29830791 tactacctccgtccctaattataagacctttttga-aaatttgttgtccctttttataagac 29830731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1625
Target Start/End: Complemental strand, 41968234 - 41968181
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataa 1625  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  41968234 cctccgtccctaattataagatccttttgagaatttttttgtccttttttataa 41968181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1559 - 1629
Target Start/End: Original strand, 42629363 - 42629435
Alignment:
Q  1559 aaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttg--agaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||  | |||  |||| |||||||||||||||||    
T  42629363 aaatatattgctccctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaaaaattttgtccctttttataagacc 42629435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 45628917 - 45628857
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataaga 1627  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  45628917 ttactacctccatccttaattataagacccttttgag-aattttttgtccctttttataaga 45628857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 1003; Significance: 0; HSPs: 124)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 1003; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 11369301 - 11367786
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11369301 catcatcgcttaagatggaaaaggatagtcctaggca-gacctggtgcatgcttcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 11369203  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| |||||    
T  11369202 ttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcatatccaagaatgatcccctatacgagtttagaccttttggtggaatgacagtagttttaagtggt 11369103  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| |  ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11369102 gatttcaggcatatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 11369003  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  11369002 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagaaggaagaaactgataattttggcaagtggataccctcaattggagagga 11368903  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||||         |||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11368902 caacga---------tgagaatggtgaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaatccgttgatgtcactcatagacttt 11368812  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctc--------aagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaa 600  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11368811 gtatatcccgatttgaatgataacattggtgacccgctcttttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaa 11368712  T
Q  601 tatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaat-tctgatgtccaaagcgagtggttc 699  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  11368711 tatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattcaatttgtcgattgggtgaaaaagtctgatgtccagagcgagtggttc 11368612  T
Q  700 acaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatc 799  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11368611 acaacggaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgttgatgagaaacatcgatc 11368512  T
Q  800 aggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactag 899  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  || ||| || ||    
T  11368511 aggtcaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctactgtaattacaggaaaaagggaaggcaccag 11368412  T
Q  900 tgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgaca 999  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11368411 ggtattcattcccaagatgaatcttattctgaatgatccaggactacccttaaaattcaggcgcaagcaatttccattgacgctttgttttgcaatgaca 11368312  T
Q  1000 ataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaa 1098  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11368311 ataaataaaagccagagtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcttaagtctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaa 11368212  T
Q  1099 cttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtat 1198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  11368211 cttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccaaaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtat 11368113  T
Q  1199 gatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcg 1298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11368112 gatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattatttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcg 11368013  T
Q  1299 tactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnn 1398  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||       
T  11368012 tacaagtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgactattaattcatgcatttttcaagtttaacaatccgcggaacc--t 11367915  T
Q  1399 nnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagccc 1498  Q
             ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11367914 tttttttttacatcgttgttacgctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaatgaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagccc 11367815  T
Q  1499 aaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11367814 aaactatatttatgcacacccgtaaaaaa 11367786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 930; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 10039282 - 10037755
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| |||||  |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||           ||     
T  10039282 catcatcgcttacgctggagaaggatagtcatagggcagacctggtgcgtactgtaaaattgataatttgggatggggctccaatg-----------gtc 10039194  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||    
T  10039193 ttttgaggaagttgactgatcaatgcgtgatatcatgtctaggaatgatcccttaaacgagtttagaccttttggtggaatgacaatagttttatgtggt 10039094  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10039093 gatttcaagaagatattgcatgttgtctgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 10038994  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  10038993 tgaggcttattgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattgaagacgg 10038894  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| || ||    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||          |||    
T  10038893 caacgacgctttagatgagaatggtgaaacgaaggtataaattttcgaagatttgcttatatcagacacaacaaatctgttgatgtc----------ttt 10038804  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  10038803 gtgtatcccaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcaattgagcatattaatgaat 10038704  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10038703 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatattatttaagctctcattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgcccaaagcgaatggttcac 10038604  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10038603 aaaggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaggttgggatgtccagttatgctgatgagaaacattgatcag 10038504  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||  |||| |||| || |    
T  10038503 gccaatggactgtgtagtggtacgaggctggcaattacacatctagggaagagcacaatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaagtaccaggg 10038404  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10038403 tattcattcccaggatgaatcttattctgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 10038304  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10038303 agataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcaagtaact 10038204  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10038203 tcaagagaaggtctaaagctgctcatcatggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatga 10038105  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10038104 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagtttcctattatttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgta 10038005  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnn 1400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||         
T  10038004 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcatgccattgactattaattcatgcacttttcacgtttaacaatccgcgaaacc----t 10037909  T
Q  1401 nnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaa 1500  Q
           ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10037908 tttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaa 10037809  T
Q  1501 actatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||| |||| ||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  10037808 actatatttatatacacacgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 10037755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 927; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1524
Target Start/End: Original strand, 10968340 - 10969859
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968340 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 10968439  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||||||    
T  10968440 ttgaggcagttgaccgatcaatgcatgatatcaggtccaagaatgatcccctaaacgattttagaccttttggtggaatgacagtagttttagatggtga 10968539  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
    ||||||| || ||||   ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10968540 tttcaggcagatattgtctgtagtccgaaacggatcgagggaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggtttattgtaatgtgttg 10968639  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||    
T  10968640 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcagtacctatagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggacactctcaattggagatggca 10968739  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10968740 acgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaatttctga-gatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgccacttatagactttgt 10968838  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctc-------aagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10968839 gtatcccgatttgaatgataaacttcgtgacctgctatttttctaagcaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtttagcatgttaacgaatat 10968938  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968939 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctcttattttgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 10969038  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 803  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10969039 cggaatttcttaatggtattaagagctctagaatttcaaatcaccggttgaaactaatggtggggagtcgagttatgctgatgagaaacatcaatcaggc 10969138  T
Q  804 taatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgta 903  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||  | ||||||| || |||    
T  10969139 caatggactgtataatggtacgaggctcacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaagaaaaaggacaggtaccagggta 10969238  T
Q  904 ttcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataa 1003  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10969239 ttcatccccaggatgaatcttattccgagtgatccgggagtacccttcaaattcaggcgcatgcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataa 10969338  T
Q  1004 ataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttc 1102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | |||| | ||| ||| || ||||||| |||||    
T  10969339 ataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggataactctgtgttgctttctctcgagttacttc 10969438  T
Q  1103 aagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatc 1202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10969439 aagaaaaggtctgaagctgctcatcttgaatgaagatgataatgtttgcaaggagaccacaa-tgttgtgtatcgtgaagtttttcgaaaa-gtatgatc 10969536  T
Q  1203 attggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttcta----tgtaaggcg 1298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||    
T  10969537 attggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaaataaagttgcgtattgtttggaagtcgttttatttataatttcttaatttgtaaggcg 10969636  T
Q  1299 tactggtcattatag-acatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnn 1397  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||  || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||      
T  10969637 tactggtcattacaggacatgcaatttctatataagcagatcctcctgcagtttacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatacgcggaacc-- 10969734  T
Q  1398 nnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcc 1497  Q
              | |||||  ||||| |||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  10969735 --tttttcttatatcgttattaccgtaaaatacaatatttacactagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcaacatttctgtagac 10969832  T
Q  1498 caaactatatttatacacacccgtaaa 1524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10969833 caaactatatttatacacacccgtaaa 10969859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 897; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 50410831 - 50409306
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50410831 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgtgatgaggctccaatgatgcaccaatggtg 50410732  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  50410731 ttttgaggcagttgaccgatcaatgtgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttataccttttcgtggaatgacagtagttttaggtggt 50410632  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || || | | ||| ||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  50410631 gatttcaggcagatactgcctgttgtccgtaaagcaacgaggcacgatatttttgatgcctcaatcaattcatcaaagatattggcttattctaatgtgt 50410532  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  50410531 tgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaagtggatactctcaattagagacgg 50410432  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
     ||||||||||   ||||||||||||||||||||    || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50410431 taacgacgctttggatgagaatggtgaaatgaag----aaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatccgctgatgtcacttatagacttt 50410336  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  50410335 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgacccactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtcgagcatgttaacaaat 50410236  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  50410235 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaatgagagtggttcac 50410136  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50410135 agcggaatttctaaatggtattaagagctctggaattccaaatcgctggttgaaactaagggtgagatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 50410036  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||||||| || |    
T  50410035 accaatggactgagtaatggtacgaggctgaccgttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccataattacaggaaaaagggcaggtaccaggg 50409936  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  50409935 tattcattcccaagatgaatcttattccgagtgatctaggactacccttcaaatttaggcgcaaacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 50409836  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||    
T  50409835 aaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagattatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgttgtcaatcgagttact 50409736  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  50409735 tctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggataaatataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtattgtgaagtttttc-aaaaagtatga 50409637  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtc------gttttatttttaatttctatgtaa 1294  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||| |||||||||||| |||||    
T  50409636 tcattggttat-ttttagaattgttgttgttataatttagaaaactaaagttgcatattgtttggaagtcttttttcttttttttttaatttctttgtaa 50409538  T
Q  1295 ggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaa 1393  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||   |||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||  ||  ||    
T  50409537 ggcgtactggtcattacaggacattcaatttatatataagcatatcttcctgccattgacttttaactggtgcacttttcaggtataaaaatatgcaaaa 50409438  T
Q  1394 ccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgt-aaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctg 1492  Q
    |             ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  50409437 c---ttttttttttacatcgttgttaccttaaaatacaatatttacattagaccattggttttgtaaaaaaatgaaaacaaataacaatcggcgtttctg 50409341  T
Q  1493 tagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50409340 tagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 50409306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 870; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1394
Target Start/End: Complemental strand, 10111263 - 10109867
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10111263 catcatctcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctctaatgatgcactgatggtg 10111164  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  10111163 ttttgaggcagttgaccgatcaatgtgtggtatcatgtccaagaatgattccctaaacgagtttaaaccatttgatggaatgacaatagttttaggtggt 10111064  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  10111063 gatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgagcttattttaatgtgt 10110964  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||     
T  10110963 taatgcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctacagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactatgaattggagacgg 10110864  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10110863 caacaacgcttcggaggagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacgcaacaaatctgttgatgtcacttacagacttt 10110764  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10110763 gtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 10110664  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10110663 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaatcaagtggttcac 10110564  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10110563 aacggaattccttaatgatattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcgg 10110464  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| |  |    
T  10110463 gccaatggactgtgtaatggtatgaggctgacagttacacatctagggaagagcatgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccaacg 10110364  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  10110363 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcatgcgcagacaatttccattgacgttttattttgcaatgacaat 10110264  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||    
T  10110263 aaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgagcaactctatgtcgttgtctctcgagttact 10110164  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  10110163 tctagaaaaggtttgaaactgctcatcttggatgaagataataatgttttcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagttttt-taaaaagtatga 10110065  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaag---tcgttttatttttaatttctatgtaaggc 1297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||   |  |||| |||||||||||| |||||| |    
T  10110064 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcgtattgattgaaagttttttttttttttttaatttctttgtaagac 10109965  T
Q  1298 gtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaac 1394  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    |||  |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10109964 gtactggtcattacaggacatgcaaattctatataagcagatcttcttgcttttgacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatacgcggaac 10109867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 855; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1340
Target Start/End: Complemental strand, 13530702 - 13529364
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  13530702 catcatcgcttacgatagaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggataaggctccgatgatacaccaatggtg 13530603  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  || ||||| ||||    
T  13530602 ttttgagacagttgaccgatcaatgcgtcatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagacctttcgatggaatgacagtagttttagctggt 13530503  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || |||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13530502 gatttcaggcagatattgcctgttgtccaaaaaggaacgaggcacgatattgttgatgcctcaatcaattcatcacagatatgggcttattgtaatgtgt 13530403  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||     
T  13530402 agaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaagtatatactctcaattggagacgg 13530303  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13530302 caacgacgcatcaggtgagaatggtgaaatgaaggtagaaattctagaagatttggtcatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 13530203  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13530202 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttcattcagttgagcattttaacgaat 13530103  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13530102 atatgatgtcactgagtccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgcttgtcgatcaggtgaaaattttggtgtccaaagcgagtggttcac 13530003  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  13530002 aacggaatttcttagtggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtctag-tatgctcatgagaaacatcgatcag 13529904  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||| ||||||||  ||||||||| || |    
T  13529903 gccaatggattgtgtaatggtatgaggctgacagtcacacatctagggaagagaacgatagctgctatcgtaattacaggaaaaagggcaggtaccaggg 13529804  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13529803 tattcattcctaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaatccaggcgcaggaaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 13529704  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||    
T  13529703 aaataaaagtcagggtcaatctttatctcgactgggagtttatcttcctaagcccgtgttcatgcatggacaactctatgtcgctgtctctcaagttact 13529604  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13529603 tctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaacgagaccacaaatattgtgtatcgtgaagtatttcaaaaaa-tatga 13529505  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  13529504 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcgtattgtttggaagtcgttttttgtttaatttctttgtaaggcgta 13529405  T
Q  1301 ctggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatcc 1340  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13529404 ttggtcattacatgacatgcaatttctatataagcagatcc 13529364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 840; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 252 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 11362681 - 11361370
Alignment:
Q  252 aggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11362681 aggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacc 11362582  T
Q  352 tgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggata--ctctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaag 449  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||     
T  11362581 tgcagagcaagaataaactgctaattttggcaagtggatatactctcaattggagacgacaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaagggggaaa 11362482  T
Q  450 ttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct--- 546  Q
    ||||  ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||       
T  11362481 ttcccgaagatttactcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttaaatgataacattggtgacccactatt 11362382  T
Q  547 ----caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtattt- 641  Q
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||     
T  11362381 tttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagattttttt 11362282  T
Q  642 aagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattcca 741  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11362281 aagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaagtctgatgtctagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaattcca 11362182  T
Q  742 aatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacac 841  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11362181 aatcaccggttgaaactaatggtgggatgtccagtcatgctgatgagaaacatcgatcaggtcaatggattgtgtaatggtacgaggctgatagttacac 11362082  T
Q  842 atctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccagg 941  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || |||||   | |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11362081 atctagggaagagcatgatagctgctactgtaattacatgaaaaaaagaaggtaccagggtattcattcccaagatgaatcttattccgagtgatccagg 11361982  T
Q  942 actatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtt 1040  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11361981 actacccttcaaattcaagcgcaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcaaggtcaatctttatctcaagtgggggtt 11361882  T
Q  1041 tatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagata 1140  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11361881 tatcttcctaagcctatgttcacgcatgggcaactttatgtcgctgtctctcgagtaacttcaagaaaaggtttgaagctgctcatcctggatgaagata 11361782  T
Q  1141 ataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttag 1240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11361781 ataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttag 11361683  T
Q  1241 aaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcc 1340  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11361682 aaaaccaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaagacgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcc 11361583  T
Q  1341 ctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttaca 1440  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |            |||| || |||||| |||||||| |||||||||    
T  11361582 tcctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaataatccgtgaaagc-tttttttttttacattgttgttaccctaaaatacaatatttaca 11361484  T
Q  1441 ttaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgca 1535  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     |||||||||||    
T  11361483 ttagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttatacacatccgtaaaaaattaaacgtttgca 11361384  T
Q  1536 tttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||| |||||    
T  11361383 tttaccgattacgt 11361370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 835; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 1394
Target Start/End: Complemental strand, 10001069 - 9999675
Alignment:
Q  10 atcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgt 109  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10001069 atcatctcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctctaatgatgcactgatggtgt 10000970  T
Q  110 tttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||||||| |    
T  10000969 tttgaggcagttgaccgatcaatgtgtggtatcatgtccaagaatgattccctaaacgagtttaaaccatttgatggaatgacaatagttttaggtgggg 10000870  T
Q  210 atttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgtt 309  Q
    |||||||| || | || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10000869 atttcaggcagatgttgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgggcttattttaatgtgtt 10000770  T
Q  310 gaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgac 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  10000769 aaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagtagaaagaaattgttaattttggcaagtggatactatgaattggagacggc 10000670  T
Q  410 aacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttg 509  Q
    ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  10000669 aacaacgcttcggaggagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagatgcaacaaatctgttgatatcacttacagactttg 10000570  T
Q  510 tgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaata 602  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10000569 tgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaata 10000470  T
Q  603 tatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcaca 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10000469 tatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaatcaagtggttcaca 10000370  T
Q  703 acagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcagg 802  Q
    || ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10000369 acggaattccctaatgatattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcggg 10000270  T
Q  803 ctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgt 902  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| |  ||    
T  10000269 ccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcatgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccaacgt 10000170  T
Q  903 attcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaata 1002  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  10000169 attcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcatgcgcagacaatttccattgacgttttattttgcaatgacaata 10000070  T
Q  1003 aataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtg-gggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaactt 1101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  10000069 aataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgtgagtttatcttcctaaacccgtgttcacgcatgagcaactctatgtcgttgtctctcaagttactt 9999970  T
Q  1102 caagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgat 1201  Q
    | ||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9999969 ctagaaaaggtttgaaactactcatcttggatgaaaataataatgttttcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagttttt-taaaaagtatgat 9999871  T
Q  1202 cattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaag--tcgttttatttttaatttctatgtaaggcgt 1299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9999870 cattggttatgttttagaattgttgttgctataatctagaaaactaaagttgcgtattgattgaaagtttttttttttttttaatttctttgtaaggcgt 9999771  T
Q  1300 actggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaac 1394  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    |||  |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9999770 tctggtcattacaggacatgcaatttctatataagcagatcttcttgcttttgacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatacgcggaac 9999675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 637; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 702 - 1549
Target Start/End: Original strand, 41763618 - 41764473
Alignment:
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41763618 aacagaattttttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgagatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcat 41763717  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  41763718 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgatagttacacatctagggaagagcacgatagttgatactgtaattacaggaaaaggggaaggtaccagtg 41763817  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41763818 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggcgcaggcaatttccattgacgtgttgttttgcaatgacaat 41763917  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41763918 acataaaagtgagggtcaatctttatctcaagtgggggtttatcttcttaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaact 41764017  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41764018 tcaagaaaaggtctgaagttggtcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaaatttttcaaaaaagtatga 41764117  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41764118 tcattggttatgttttagaattgttattgctataatttcgaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgta 41764217  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc-nnnn 1399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         
T  41764218 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccccctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatctgcggaaccttttt 41764317  T
Q  1400 nnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagccca 1499  Q
            ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41764318 ttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacatttttgtagccca 41764417  T
Q  1500 aactatatttatacacacccgtaaa------aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  41764418 aactatatttatacacacccgtaaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 41764473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 498 - 1480
Target Start/End: Complemental strand, 46913245 - 46912259
Alignment:
Q  498 ttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagca 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913245 ttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggcgacccgctatttttccaagaaaggagaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagca 46913146  T
Q  591 tgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagc 690  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46913145 tgttaacgaatatatgatgtcaccaattccaggtgaagaaaaatagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcggggggaaattctgatgtccaaagc 46913046  T
Q  691 gagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaa 790  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913045 gagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctatggaattcaaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaa 46912946  T
Q  791 acatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggc 890  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||||| ||  |||    
T  46912945 atatcgatcaggccaatggattgtgtaatggtacgaggctgacagttacccatctagggaagagcatgatagctgctatcgtaattacaggataaagggc 46912846  T
Q  891 aggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgtttt 990  Q
    |||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||    
T  46912845 aggtatgagggtattcattcccacgatgaatcttattctgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaagcaatttccatcgacagtttgtttt 46912746  T
Q  991 gcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcac 1090  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||  |||| |    
T  46912745 gcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcattgtctc 46912646  T
Q  1091 tcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaa 1190  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  46912645 tcgagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttacaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-a 46912547  T
Q  1191 aaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcg-ttttatttttaatttcta 1289  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||     
T  46912546 aaaagtatgatcattgattatattttagaattgttattgctataatttagaaaactaaagttgcgtattgtttgaaagtcgtttttttttttaatttctt 46912447  T
Q  1290 tgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccg 1388  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||| ||    
T  46912446 tgtaaggcgtattggtcattacatgacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgacttttaatcgatgcactttttaggtataacaatacg 46912347  T
Q  1389 cggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaa 1480  Q
    ||||||             ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46912346 cggaac----tttttttatacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagatcattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaa 46912259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 10238194 - 10237326
Alignment:
Q  32 gatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaa 131  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10238194 gatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctctaatgatgcactgatggtgttttgaggcagttgaccgatcaa 10238095  T
Q  132 tgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgt 231  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  10238094 tgtgtggtatcatgtccaggaatgattccctaaacgagtttaaaccatttgatggaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcttgt 10237995  T
Q  232 ggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgaga 331  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  10237994 tgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgggcttattttaatgtgttaaggcttactgttaatataaga 10237895  T
Q  332 ttgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatg 431  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||  | | |||||    
T  10237894 ttggatgcatctttggtacctgctgagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcgga-gggaatg 10237796  T
Q  432 gtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataa 531  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10237795 gtgaaataacggtagaaattcctgaagaattgctcatatcagacgcaacaaatctgttgatgtcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataa 10237696  T
Q  532 ccttggtgacccgc-------tcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggt 624  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10237695 ccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgttactgattccaggt 10237596  T
Q  625 gaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtatta 724  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  10237595 gaagagaaagagta-ttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaatcaagtggttcacaacggaattccttaatgatatta 10237497  T
Q  725 agagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtac 824  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10237496 agagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtcc-gttatgctgatgagaaacatcgatcgggccaatggactgtgtaatggtac 10237398  T
Q  825 gaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtac 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||  |||||||||    
T  10237397 gaggctgacagttacacatctagggaagagcatgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtac 10237326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 816 - 1546
Target Start/End: Complemental strand, 32659 - 31925
Alignment:
Q  816 taatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccagg 915  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  32659 taatggcactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctatcgtaattacaggaaaaagggcaggtactagggtattcattcccagg 32560  T
Q  916 atgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagg 1015  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  32559 atgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcgggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagccagg 32460  T
Q  1016 gtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtct 1114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32459 gtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacacatggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaacttcaagaaaaggtct 32360  T
Q  1115 gaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgtt 1214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32359 gaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaa-gtatgatcattggttatgtt 32261  T
Q  1215 ttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattataga 1314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32260 ttagaattgttgttgctataatttataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattataga 32161  T
Q  1315 catgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgt 1414  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||            |||||||    
T  32160 catgcaatttctatataagcagatccttctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgtgaaacc-tttttttttttacatcgt 32062  T
Q  1415 ggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttataca 1514  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32061 tgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttataca 31962  T
Q  1515 cacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgacta 1546  Q
    ||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  31961 cacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgacta 31925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 33434 - 32658
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33434 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcatagttgataatttgggatgaggctccgatgatgcaccgatggtg 33335  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  33334 ttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacaatagttttaggtggt 33235  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||| ||| || |||| ||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33234 gattttaggcagatattgcatgttgtccgaggaggaacgacgccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 33135  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  33134 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattagagacgg 33035  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    |||| | |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33034 caacaatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatggacttt 32935  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32934 gtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 32835  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32834 ttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 32735  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagtta 778  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  32734 accataatttcttaatggtattaagagctctggaaatccaaatcacaggttgaaactaaaggtgagatgtccagtta 32658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 759 - 1527
Target Start/End: Original strand, 15328876 - 15329649
Alignment:
Q  759 aagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacg 858  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15328876 aagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcatgccaatggactgtgtaatggtgcgaggctgacagttacacatctagggaagagcacg 15328975  T
Q  859 atagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattca 958  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||    
T  15328976 atagctgctaccgtaattacaggaaaaaggacaggtaccagagtattcattcccaagatgaatcgtattccgagcgatcaaggactaccattcaaattca 15329075  T
Q  959 ggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgt 1057  Q
     |  || |  |||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| ||    
T  15329076 agcacaggtgatttccattgacacttttgtttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatcttgagtaggagttgatcttcctaagcccgt 15329175  T
Q  1058 gtt----catacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaa 1153  Q
     ||    |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||    
T  15329176 attcacgcatatatggacaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctataaaaggtttgaagctgctcattttgaatgaagataataatgtttgcaa 15329275  T
Q  1154 ggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttg 1253  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15329276 ggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgttcattggttatattttagaattgttgttgctataattaagaaaactaaagtta 15329374  T
Q  1254 cctattgtttggaag----tcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatt-tctatataagcagatccctctgcc 1347  Q
    | |||||||||||||    |  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||   ||| ||| |||||||  |||||    
T  15329375 cgtattgtttggaagtgtttttttttttttttaatttctttgtaaggcgtattggtcattacacgacatgcaattgaatat-taaacagatcctcctgcc 15329473  T
Q  1348 attgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaacc 1447  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |   ||||             |||| || |||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  15329474 attgacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatactttgaac----tttttttttacattgttgttacc-taaaatacaatatttacattagacc 15329568  T
Q  1448 att-tgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
     ||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15329569 gttgatttttgtaaaaaataaaaataaataacaatcgacgtttccgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 15329649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 547 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 47693087 - 47692716
Alignment:
Q  547 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagct 646  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47693087 caagaaaggggaatcctcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatacatgatgtcactaattccaggtgaagagaaagagtatttaacct 47692988  T
Q  647 ttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatca 746  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47692987 ctgattctgtttgtcgatcggacgaaaattctgatgtccagagcgagtggttcacaacgaaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatca 47692888  T
Q  747 ccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatcta 846  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47692887 ccggttgaaactaggggtaggttttccagttatgctgatgagaagcatcgatcaggtcaatggactgtgtaatggtatgaggctgacagttacacatcta 47692788  T
Q  847 gggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatg 918  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  47692787 gggaagagcacgatagttgctaccgtaattacagaaaaaatggcaggtaccagggtattcattcccaggatg 47692716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 900 - 1394
Target Start/End: Complemental strand, 10235187 - 10234691
Alignment:
Q  900 tgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgaca 999  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||| | |  || |||||||||||||    
T  10235187 tgtattcattcccaagatgaatcttattccgagtgatcccggactacccttcaaattcatgcgcagacaatttccatttacgttttattttgcaatgaca 10235088  T
Q  1000 ataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaa 1098  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| || |||| |    
T  10235087 ataaataaaagtcaaggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgagcaactctatgtcgttgtctcttgagtta 10234988  T
Q  1099 cttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtat 1198  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  10234987 cttctagaaaaggtttgaaactgctcatcttggatgaagataataatgttttcaaggagaccataaatgttgtgtatcgtgaagttttt-taaaaagtat 10234889  T
Q  1199 gatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaag-tcgttttatttttaatttctatgtaaggc 1297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  10234888 gatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcgtattgattgaaagttatttttttttttaatttctttgtaaggc 10234789  T
Q  1298 gtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaac 1394  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    |||  |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10234788 gtactggtcattacaggacatgcaatttctatataagcagatcttcttgcttttgacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatacgcggaac 10234691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 52918687 - 52918332
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52918687 tcatcgcttacgatggaaaaggataatcctagggtagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 52918588  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  52918587 ttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacaagtttagaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 52918488  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
    ||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  52918487 tttcaggcagatattgcatgtagtccgaaaaggatcgagggaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatacgagcttattgtaatgtgttg 52918388  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaaga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  52918387 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagtaggaaga 52918332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 409 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 52918328 - 52917994
Alignment:
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||   || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  52918328 caacgacgcttcggatgggaatggtgaaatgaaggtagaaattcctga-gatttgccgttaccggacacaacaaatctgttgatgccacttatagacttc 52918230  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52918229 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgactcgctatttttccaagaaaggggaatacccgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 52918130  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52918129 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 52918030  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaat 737  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  52918029 aacggaatttcttaatggtactaagagctctggaat 52917994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 942 - 1394
Target Start/End: Complemental strand, 10231547 - 10231093
Alignment:
Q  942 actatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtt 1040  Q
    |||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  10231547 actacccttcaaattcatgcgcagacaatttccattgacgttttattttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtggcagtt 10231448  T
Q  1041 tatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagata 1140  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||    
T  10231447 tatcttcctaagcccgtgttcacgcatgagcaactctatgtcgttgtctctcgagttacttctagaaaaggtttgaaactactcatcttggatgaagata 10231348  T
Q  1141 ataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttag 1240  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10231347 ataatgttttcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagttttt-tagaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgatgctataatttag 10231249  T
Q  1241 aaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgt-tttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagat 1338  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||  | | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10231248 aaaactaaagttgcgtattgattgaaagttatatctttttttaatttctttgtaaggtgtactggtcattacaggacatgcaatttctatataagcagat 10231149  T
Q  1339 ccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaac 1394  Q
         |||  |||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10231148 gttcttgcttttgaattttaattgatgcacttttcaggtataacaatacgcggaac 10231093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1114 - 1390
Target Start/End: Complemental strand, 41221732 - 41221455
Alignment:
Q  1114 tgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgt 1213  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41221732 tgaagttgctcatcttcgatgaagataataatgtttgcaaggagaccacatatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaa-gtatgatcattggttatgt 41221634  T
Q  1214 tttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcg-ttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata 1312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  41221633 tttagaattgttgttgctataatttagaaaatcaaagttgcgtattgtttggaagtcgtttttttttttaatttctttgtaaggtgtactggtcattaca 41221534  T
Q  1313 -gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcg 1390  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41221533 ggacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgacttttagttgatgcacttttcaggtataacaatacgcg 41221455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1303 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 10109343 - 10109094
Alignment:
Q  1303 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnn 1402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  10109343 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaac--attttt 10109246  T
Q  1403 nnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaac 1502  Q
         ||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10109245 tttttacatcattgttaccctaaaatacattatttacattacaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggtgtttctgtagcccaaac 10109146  T
Q  1503 tatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  10109145 tatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 10109094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1303 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 10234174 - 10233951
Alignment:
Q  1303 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnn 1402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  10234174 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccttttttt 10234075  T
Q  1403 nnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaac 1502  Q
         ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10234074 tttt-acatcattgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggtgtttctgtagcccaaac 10233976  T
Q  1503 tatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10233975 tatatttatacacacccgtaaaaaa 10233951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1303 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 10230582 - 10230333
Alignment:
Q  1303 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnn 1402  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  10230582 ggtcattatagacatgtaatttctatataagcagatcctcctgtcattaactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccttttttt 10230483  T
Q  1403 nnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaac 1502  Q
         ||||| | |||||| |||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10230482 ttt--acatcattgttaccctaaaaagcaatatttacattagaccatttgttctgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggtgtttctgtagcccaaac 10230385  T
Q  1503 tatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  10230384 tatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 10230333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 967 - 1208
Target Start/End: Original strand, 37801944 - 37802188
Alignment:
Q  967 caatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatac 1065  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |    
T  37801944 caattttcattgacgctttgttttgcaatgacaataaaaaaaagttagggtaaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgc 37802043  T
Q  1066 atgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaag---ataataatgtttgtaaggagaccac 1162  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||     
T  37802044 atggacaactctatgtcgctgtctctcgagttactcctataaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataataatgtttgcaagtagaccat 37802143  T
Q  1163 aaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggt 1208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37802144 aaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggt 37802188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1236 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 47692454 - 47692170
Alignment:
Q  1236 tttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatag-acatgcaatttctatataagc 1334  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  47692454 tttagaaaactaatgttacgtattgtttggaagtcttttt--ttttaatttctttgtaaggcgtactggtccttacaggacatgtaatttctatataagc 47692357  T
Q  1335 agatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgata 1434  Q
    ||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||  ||||             |||| || |||||| |||||||| |||    
T  47692356 agatcctcctgccattgagttttaattgatgcactttttaggtataacaatacg--gaac----tttttttttacatggttgttaccctaaaatacaata 47692263  T
Q  1435 tttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47692262 tttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaataaataacaatcagcgtttctgtagcccaaactatatttatacacacctgtaaaaaa 47692170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1312 - 1527
Target Start/End: Original strand, 37802622 - 37802834
Alignment:
Q  1312 agacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacat 1411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| | |||  |||             ||||    
T  37802622 agacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgacttttaattgatgcactttttaggtataacagtacgcaaaac---ttttttttttacat 37802718  T
Q  1412 cgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttat 1511  Q
    | | ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37802719 cattgttaccccaaaatacaatatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcgacgtttttgtagcccaaactatatttat 37802818  T
Q  1512 acacacccgtaaaaaa 1527  Q
    | ||||||||||||||    
T  37802819 atacacccgtaaaaaa 37802834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1303 - 1465
Target Start/End: Complemental strand, 9999163 - 9999000
Alignment:
Q  1303 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc-nnnnnn 1401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  9999163 ggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccttttttt 9999064  T
Q  1402 nnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaatt 1465  Q
          ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9999063 ttttttacatcattgttaccctaaaatacaatatttacattacaccatttgttttgtaaaaatt 9999000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1445 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 23092765 - 23092683
Alignment:
Q  1445 accatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23092765 accatttgttttgtaaaaattaacaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtagaaaa 23092683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1426 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 9999658 - 9999557
Alignment:
Q  1426 aatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaa 1525  Q
    ||||| |||||||  ||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9999658 aatacaatatttaacttagaccattggttttataaaaaataaaaataaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttatatacacccgtaaaa 9999559  T
Q  1526 aa 1527  Q
    ||    
T  9999558 aa 9999557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1426 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 10109849 - 10109748
Alignment:
Q  1426 aatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaa 1525  Q
    ||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10109849 aatacaatatttaacttagaccattggttttgtaaaatataaaaataaataacaatcgacgtttatgtagcccaaactatatttatatacacccgtaaaa 10109750  T
Q  1526 aa 1527  Q
    ||    
T  10109749 aa 10109748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1426 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 10231075 - 10230974
Alignment:
Q  1426 aatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaa 1525  Q
    ||||| |||||||  ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10231075 aatacaatatttaacttagaccattgattttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttatatacacccataaaa 10230976  T
Q  1526 aa 1527  Q
    ||    
T  10230975 aa 10230974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1432 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 10041294 - 10041199
Alignment:
Q  1432 atatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  10041294 atatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaagaacaatcagcgtttctgtagcccaaactatatttacacacacatgtaaaaaa 10041199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1445 - 1519
Target Start/End: Complemental strand, 41221417 - 41221343
Alignment:
Q  1445 accatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacaccc 1519  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41221417 accattggttttgtaaaatataaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttatacacaccc 41221343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1426 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 10234673 - 10234572
Alignment:
Q  1426 aatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaa 1525  Q
    ||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10234673 aatacaatatttaacttagaccattggttttgtaaaaaagaaaaataaataacaatcggcgtttctgtaacccaaactatatttatatacacccgtaaaa 10234574  T
Q  1526 aa 1527  Q
    ||    
T  10234573 aa 10234572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1259 - 1384
Target Start/End: Complemental strand, 10041438 - 10041312
Alignment:
Q  1259 tgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactatt 1357  Q
    |||| |||| ||||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||    
T  10041438 tgttcggaaatcgtttttttttttatttcagtgtaaggcttactggtcattacatgacatgcaatttttatataaacagatccttctacaattgactttt 10041339  T
Q  1358 aattcatgcacttttcaggtttaacaa 1384  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  10041338 aattgatgaacttttcaggtataacaa 10041312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1628
Target Start/End: Original strand, 10220930 - 10220994
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10220930 aattactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagac 10220994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Original strand, 14428607 - 14428673
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14428607 aattactccctccgtccctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 14428673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 50726820 - 50726758
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  50726820 tactccctccgtccctgattataagacccttttgagaatttttttgttcctttttataagacc 50726758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 50786028 - 50786090
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  50786028 tactccctccgtccctgattataagacccttttgagaatttttttgttcctttttataagacc 50786090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1557 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 12050439 - 12050367
Alignment:
Q  1557 caaaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  12050439 caaaaaaaaatactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtacctttttataagacc 12050367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 36098964 - 36099028
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36098964 attactccatccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 36099028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1459 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 52917958 - 52917890
Alignment:
Q  1459 aaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52917958 aaaaaataaaaacaaataacaatcggcatttcattaacccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 52917890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 7181350 - 7181413
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7181350 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 7181413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1563 - 1629
Target Start/End: Original strand, 21756482 - 21756549
Alignment:
Q  1563 aaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  21756482 aaattactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 21756549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1625
Target Start/End: Complemental strand, 51284099 - 51284041
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataa 1625  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  51284099 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataa 51284041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 16435276 - 16435211
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16435276 aattactccctccgtctctaattataagatccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 16435211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 46050025 - 46049960
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  46050025 attactccctccgtccctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccttttttataagacc 46049960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1562 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 25149164 - 25149096
Alignment:
Q  1562 taaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  25149164 taaaatactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 25149096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 9499534 - 9499471
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  9499534 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 9499471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 12683219 - 12683156
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttta-tccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12683219 tactccctccgtccctaattataagaccattttgagaatttttttagtccctttttataagacc 12683156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 22103966 - 22103903
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  22103966 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 22103903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 26593803 - 26593740
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  26593803 ttactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 26593740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 32568997 - 32569060
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  32568997 tactccatccgtccctaattataaaacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 32569060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 35868120 - 35868057
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  35868120 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 35868057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 37728713 - 37728776
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  37728713 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatatttgttgtccctttttataagacc 37728776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 43868103 - 43868166
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  43868103 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 43868166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 44543782 - 44543845
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  44543782 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatttcttttgtccctttttataagacc 44543845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 45252773 - 45252836
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  45252773 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 45252836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 46878476 - 46878413
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  46878476 tactccctccgtccttaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 46878413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 47066934 - 47066997
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  47066934 tacttcctccgtccctaattataagacccttttgagaatattttttgtccctttttataagacc 47066997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1627
Target Start/End: Original strand, 33212395 - 33212457
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  33212395 attactacctccgtccctaattataagatccttttgagaatttttttgtccctttttataaga 33212457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 47008541 - 47008476
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  47008541 attactacctccgtccctaattataagacacttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 47008476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Original strand, 4024051 - 4024115
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgaga-aattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  4024051 ttactccctccgtccctaattataagacccttttgagatttttttttgtccctttttataagacc 4024115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 17699068 - 17699008
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17699068 tactacctccgtccctaattataagaccattttgagaaattttttgtccttttttataaga 17699008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 7051757 - 7051694
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  7051757 tactccctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 7051694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 8321925 - 8321988
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  8321925 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 8321988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 9582243 - 9582306
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9582243 tactacctccatccctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 9582306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 20862196 - 20862259
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  20862196 tactccatccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 20862259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1573 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 22527652 - 22527597
Alignment:
Q  1573 ctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22527652 ctccgtccttaattataagacccttttgagaaattattttatccctttttataaga 22527597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 23700822 - 23700759
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  23700822 tactccctccgtccctaattataagacctttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 23700759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 23719277 - 23719214
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  23719277 tactccctccgtccctaattataagacctttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 23719214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 23737733 - 23737670
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  23737733 tactccctccgtccctaattataagacctttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 23737670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 26058546 - 26058609
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  26058546 tacttcctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 26058609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 26221288 - 26221351
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  26221288 tactccctccgtccctaattataagactcttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 26221351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 33868448 - 33868511
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  33868448 tactccctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 33868511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1563 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 45324128 - 45324061
Alignment:
Q  1563 aaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttt-atccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  45324128 aaattactacctccgtccttaattataagaccattttgagaattttttttatccctttttataagacc 45324061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 46845529 - 46845466
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  46845529 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 46845466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 48909872 - 48909935
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  48909872 tactacctcagtccctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 48909935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 54782954 - 54782891
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  54782954 tactcccttcgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 54782891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 22832644 - 22832583
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  22832644 tactccttccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttat-catttttataagacc 22832583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 35166002 - 35165936
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  35166002 aattactcccttcgtccttaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 35165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 43701178 - 43701240
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  43701178 tactccctctgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 43701240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Original strand, 46703032 - 46703090
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  46703032 cctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 46703090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 53361892 - 53361830
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  53361892 tactccctccgtccctaattataagaccattttgagaattttttttgtccctttttataagac 53361830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1573 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 1111679 - 1111622
Alignment:
Q  1573 ctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  1111679 ctccgtccctaattataagacccttttgagaaatttttttgtctctttttataagacc 1111622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 4759388 - 4759327
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4759388 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 4759327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 30041056 - 30040991
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  30041056 attactccctccgttcctaattataagactcttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 30040991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 32963142 - 32963078
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa--attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  32963142 tactccctccgtccctaattataagatccttttgagaatttttttttgtccctttttataagacc 32963078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1584 - 1629
Target Start/End: Original strand, 39952289 - 39952334
Alignment:
Q  1584 attataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39952289 attataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 39952334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1574 - 1629
Target Start/End: Original strand, 25148466 - 25148522
Alignment:
Q  1574 tccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  25148466 tccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 25148522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1574 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 46862396 - 46862340
Alignment:
Q  1574 tccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  46862396 tccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 46862340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1570 - 1629
Target Start/End: Original strand, 54107356 - 54107416
Alignment:
Q  1570 tccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  54107356 tccctccgtccctgattataagatctttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 54107416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 6784463 - 6784526
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  6784463 tactacctccgtccttaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 6784526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 10656691 - 10656754
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  10656691 tactacctccgcccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 10656754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 17753572 - 17753509
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  17753572 tactacctccgtccctaattataaaacctttctgagaattttttttgtccctttttataagacc 17753509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 19054892 - 19054829
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  19054892 tactacctccgtccctaattataaaacctttctgagaattttttttgtccctttttataagacc 19054829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1024
Target Start/End: Complemental strand, 20777795 - 20777756
Alignment:
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctt 1024  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20777795 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcagtctt 20777756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 24087372 - 24087309
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  24087372 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtcccgttttataagacc 24087309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 26306644 - 26306581
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||    
T  26306644 tactccctccgttcctaattataagacccttttgagaattttttttgtccttttttataagacc 26306581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 27646343 - 27646280
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  27646343 tactacctccgtccctaattataagatccttttgagaaatttttttgtctctttttataagacc 27646280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 28673331 - 28673268
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  28673331 tactacctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 28673268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 32467425 - 32467488
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  32467425 tactctctccgtccttaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 32467488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 985 - 1024
Target Start/End: Original strand, 38356474 - 38356513
Alignment:
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctt 1024  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  38356474 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcagtctt 38356513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 41392917 - 41392854
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttt-atccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  41392917 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttcgtccctttttgtaagacc 41392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1574 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 43408758 - 43408703
Alignment:
Q  1574 tccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| ||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43408758 tccgttcctaattataatactcttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 43408703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 49127236 - 49127173
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  49127236 ttaccccctccgtccctaattataagacctttttgagaattttttttgtccctttttataagac 49127173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1574 - 1628
Target Start/End: Original strand, 49543684 - 49543739
Alignment:
Q  1574 tccgtccctgattataaaacccttttgag-aaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  49543684 tccgtccctaattataagacccttttgagaaaatttgttgtccctttttataagac 49543739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 50433426 - 50433363
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  50433426 tactacctccgtccctaattataagacccttgtgagaattttttttgtccctttttataagacc 50433363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 50647981 - 50647918
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgag-aaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  50647981 tactccctccgtctctaattataagacccttttgagaaaaaattttgtccctttttataagacc 50647918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 52673187 - 52673250
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  52673187 tactccctccatcactaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 52673250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 7251319 - 7251257
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7251319 tactccctccgtccctaattataagacccctttaagaattttttttgtccctttttataagac 7251257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Original strand, 8546909 - 8546967
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  8546909 cctccgtccttaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 8546967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Original strand, 14758843 - 14758901
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  14758843 cctccgtccctaattataagacccttttgataattttttttgtccctttttataagacc 14758901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1605
Target Start/End: Original strand, 15095198 - 15095236
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa 1605  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15095198 tactacctccgtccctaattataaaacccttttgagaaa 15095236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 27687986 - 27688048
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttta-tccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  27687986 tactacctccgtccttaattataagacccttttgacaaatttttttgtccctttttataagac 27688048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 985 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 35685167 - 35685133
Alignment:
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtca 1019  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35685167 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtca 35685133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 53164163 - 53164225
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  53164163 tactacctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 53164225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 985 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 55368977 - 55368943
Alignment:
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtca 1019  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55368977 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtca 55368943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1573 - 1629
Target Start/End: Original strand, 1572337 - 1572394
Alignment:
Q  1573 ctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||    
T  1572337 ctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccttttttataagacc 1572394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1624
Target Start/End: Original strand, 20918224 - 20918277
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttt-tatccctttttata 1624  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  20918224 cctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttgtgtccctttttata 20918277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1624
Target Start/End: Original strand, 20927186 - 20927239
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttt-tatccctttttata 1624  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  20927186 cctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttgtgtccctttttata 20927239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 35572491 - 35572430
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||| | | ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35572491 tactacctccgtccttaagtataagactcttttgagaatttttttgtccctttttataagac 35572430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1584 - 1629
Target Start/End: Original strand, 48942878 - 48942922
Alignment:
Q  1584 attataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  48942878 attataagacccttttgagaa-ttttttgtccctttttataagacc 48942922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1584 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 53687017 - 53686972
Alignment:
Q  1584 attataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  53687017 attataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagac 53686972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 958; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 958; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1546
Target Start/End: Original strand, 9000701 - 9002228
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9000701 catcatcgcttaagatggaaaaggatagtcctagggcagacctgatgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 9000800  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| ||    
T  9000801 ttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggttgt 9000900  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||| ||| || |||| | | | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000901 gattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 9001000  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9001001 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcatagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggatacgg 9001100  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9001101 caacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgttgatatcggacacaacaaatccgttgatgtctcttatagacttt 9001200  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9001201 gtttatcccgatctgattgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcactaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 9001300  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9001301 ttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 9001400  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9001401 accggaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatatccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 9001500  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||  |||||||||||| |    
T  9001501 gccaatggactgcgtaatggtactaggctgacaattacacatctagggaagagcacgatagctgctaccggaattacaggaaaaagggcaggtactaggg 9001600  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  9001601 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaggaaatttccattgacgctttattttgcaatgacaat 9001700  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9001701 aaataaaagccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcttgtgttcacgcatggacaactttatgtcgttgtctctcgagtaact 9001800  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9001801 tcaagaaaaggtctgaagttgcttatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagattttc-aaaaagtatga 9001899  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9001900 ccattggttatgttttagaattgttgttgctat--------------aagttgcctattg-ttggaagtcgttttatttttaatttctttataaggcgta 9001984  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnn 1400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         
T  9001985 ctgatcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgtggaacc---tt 9002081  T
Q  1401 nnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaatt---aaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcc 1497  Q
           ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9002082 tttttttacatcgttgttatcctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaaaaaaaaataacaatcgacgtttctgtagcc 9002181  T
Q  1498 caaactatatttatacacacccgtaaaaaacgtttgcatttaccgacta 1546  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  9002182 caaactatatttatacacacccgt--aaaacgtttgcattcacagacta 9002228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 942; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1526
Target Start/End: Original strand, 21069618 - 21071136
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| | | ||||||||||||||| |  |||||||    
T  21069618 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaacttgataatttcgaacgaggctccaatgatgtattgatggtg 21069717  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  || ||||||||||    
T  21069718 ttttgaggcatttcatcggtcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccatttggtggaatcacagtagttttaggtggt 21069817  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |    
T  21069818 gatttcaggtagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcattaaagatatgggtttattgtaatgtat 21069917  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  21069918 cgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttgacaagtggatactctcaattggagacgg 21070017  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21070018 caacgacgtttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 21070117  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21070118 gtgtatcccgatctgaatgataaccttggtaacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 21070217  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  21070218 atatgatgtcactgattcctggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaatttagatgtccaaagtgagtggttcac 21070317  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21070318 aacggaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 21070417  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || ||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||  ||||| ||| || |    
T  21070418 gccaatggactgtgtactgttgcgaggctgaaagttacacatctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattacatgaaaaagggcagctaccaggg 21070517  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  21070518 tattcattccaaggatgaatcttattccgagtgattcaggactacccttcaaattcaggcgcaaacaatttccattgtcgctttattttgcaatgacaat 21070617  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  21070618 aaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctcgagttact 21070717  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21070718 tctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgcatcgtgaagtttttc-aaaaagtatga 21070816  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21070817 tcattagttatgttttagaatcgttgttgctataatttagaaaactagagttgtgtattgattgaaagt--ttttttttttaatttctttgtaaggcgta 21070914  T
Q  1301 ctggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnn 1399  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||         
T  21070915 ttggtcattacaggacatgcaatttctatataagcagatcctcctgcctttgacttttaactgatgcacttttcaggtataacaatacgcggaac----- 21071009  T
Q  1400 nnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagccca 1499  Q
            ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21071010 ttttttttacatcattgttaccctaaaatacaatatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagccca 21071109  T
Q  1500 aactatatttatacacacccgtaaaaa 1526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21071110 aactatatttatacacacccgtaaaaa 21071136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 923; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1388
Target Start/End: Complemental strand, 7037381 - 7035998
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7037381 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctaatgcatgctgcaaagttgataatttggggtgaggctccaatgatgcaccaatggtgtt 7037282  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    |||||| |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  7037281 ttgaggtagttgaccgatcattacgtgatatcatgttcaagaatgatcccttaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 7037182  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
    ||| ||| || |||| | ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7037181 ttttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatataggcttattgtaatgtgttg 7037082  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7037081 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaagaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 7036982  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7036981 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 7036882  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7036881 gtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactacttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaattt 7036782  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7036781 atgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacac 7036682  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggc 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  7036681 cagaatttcttaatggtattaagagctttggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccggttatgctgatgagaaacatcgatcaagg 7036582  T
Q  804 taatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgta 903  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||  |||||||||||| |||    
T  7036581 caatggactgtgtaatggtactaggctgacaattacacgtctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacatgaaaaagggcaggtactagagta 7036482  T
Q  904 ttcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataa 1003  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  7036481 ttcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccagaactaccgttcaaattcaggcgcaggcaatttccactgacgctttgttttgcaatgacaataa 7036382  T
Q  1004 ataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttca 1103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7036381 ataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggttatcttcctaagcctgtgctcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcaagtaacttca 7036282  T
Q  1104 agaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatca 1203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7036281 agaaaaggtctgaagctgctcatcatggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttca-aaaagtatgatca 7036183  T
Q  1204 ttggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactg 1303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7036182 ttggttatgttttagaattgttgttgctataatttataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtactg 7036083  T
Q  1304 gtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccg 1388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7036082 gtcattatagacatgcaatttctatataagtagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccg 7035998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 897; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 75 - 1527
Target Start/End: Original strand, 5828177 - 5829631
Alignment:
Q  75 tttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttag 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5828177 tttgggatgaggctccaatgatgcactgatggtgttttgaggcagttgatcgatcaatgtgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaa 5828276  T
Q  175 accttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatc 274  Q
    ||| ||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5828277 accatttggtggaatgatattagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatc 5828376  T
Q  275 aattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgcta 374  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5828377 aattcatcaaagatatgggtttattttaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgcagagcagaaagaaattgcta 5828476  T
Q  375 attttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcgga 474  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5828477 attttggcaagtggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgga 5828576  T
Q  475 cacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgca 567  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  5828577 cacaacaaatcttttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgca 5828676  T
Q  568 ccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgg 667  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5828677 ccaacacttgactcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgg 5828776  T
Q  668 gtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtggg 767  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5828777 gtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggttcacattgtaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactagaggtggg 5828876  T
Q  768 atgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgct 867  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  5828877 atgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgcgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgacagctgct 5828976  T
Q  868 actataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagc 967  Q
    ||  ||||| ||| ||||  ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||| | |||  |    
T  5828977 accgtaattacagaaaaaagggcaggtaccaaggtattcattcccaagatgaatcttattctgagtaatccagaactacccttcaaattcatgcgcagac 5829076  T
Q  968 aatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcataca 1066  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  5829077 aatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtccgggtcaatctctatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgca 5829176  T
Q  1067 tgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaat 1166  Q
    ||  ||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||    
T  5829177 tgggcaactctatttcgctgtctctcaagttacttctagaaaaggtttgaaactgctcatcttggatgaagataataatgttttcaaggataccatatat 5829276  T
Q  1167 gttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttgga 1266  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  5829277 gttgtgtatcgtgaagttttt-taaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcgtattgattgaa 5829375  T
Q  1267 agtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatg 1365  Q
    ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   | || |||||| |||||| |||    
T  5829376 agttgttt--tttttaatttctttgtaaggcgtactagtcattacaggacatgcaatttctatataagcagatcctcttacctttgacttttaattgatg 5829473  T
Q  1366 cacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaatt 1465  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||             ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  5829474 cacttttcaggtataacaatacgcggaac----tttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccattggttttgtaaaaaat 5829569  T
Q  1466 aaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5829570 aaaaataaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 5829631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 871; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1549
Target Start/End: Original strand, 12785560 - 12787088
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12785560 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtccttgggcagacctggtgtgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 12785659  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||| |||||||| ||  || ||||||          
T  12785660 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaactttttggtggaatggcagtagttttaggc----- 12785754  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
            || |||| ||||| ||| ||  |||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12785755 --------agatattgcatgttgtctgaggaggaacgatgccagatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttg 12785846  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    |||||| ||           ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  12785847 aggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctacagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 12785935  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12785936 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgt 12786035  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12786036 gtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaattt 12786135  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12786136 atgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacac 12786235  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaag-ggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcagg 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12786236 cagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcgatcagg 12786335  T
Q  803 ctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttca-ggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||  |||||||||||| |    
T  12786336 ccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattacaaggaaaaagggcaggtactaggg 12786435  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12786436 tattcattcccaggatgaatcttattccgaatgatccaggactacccttcaaattcagacgcagacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 12786535  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12786536 aaataaaagctagg-tcaatctttatctcgggtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatagacaactttatgtcgttgtctctcgagtaact 12786634  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12786635 tcatgaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa-agtatga 12786733  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12786734 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatatataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgta 12786833  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc--nnn 1398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||         
T  12786834 ccggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgtgaaaccttttt 12786933  T
Q  1399 nnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagccc 1498  Q
               ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12786934 tttttttttttatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagccc 12787033  T
Q  1499 aaactatatttatacacacccgtaaa----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||    
T  12787034 aaactatatttatacacacccgaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 12787088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 824
Target Start/End: Original strand, 12780706 - 12781527
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12780706 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctacaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 12780805  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12780806 ttgaggcagttgtccgatcattgtttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacaatagttttaggtggtga 12780905  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
    ||| ||| || | || | ||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12780906 ttttaggcagatgttgcctgtagtccaaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgagcttattgtaatgtgttg 12781005  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12781006 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagcaagaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacgaca 12781105  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    | || |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12781106 atgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatataagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 12781205  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12781206 gtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaattt 12781305  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgt-cgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcaca 702  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12781306 atgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcaca 12781405  T
Q  703 acagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcagg 802  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12781406 ccagaatttcttaatggtattaagagctatggaattccaaatcacaggttgaaactaatggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcagg 12781505  T
Q  803 ctaatggactgtgtaatggtac 824  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  12781506 ccaatggactgtgtaatggtac 12781527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 22844466 - 22843792
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22844466 catcatcgcttacgattgaaaaggatagtcctagggaagacctggtgcatgtagcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 22844367  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  22844366 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaaagacaaaagttttaggtggt 22844267  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||| | || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22844266 gatttcatgcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgt 22844167  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |     
T  22844166 tgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaattggatactcttaattagagaagg 22844067  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22844066 caacgtcgcttcggatgag-atggtgaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgctcatatctgacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacatt 22843968  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22843967 gtgtatctcgatttaaatgataaccttggtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattctgttgagcatgttaacgaat 22843868  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22843867 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagttctgtttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 22843792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 547 - 1110
Target Start/End: Complemental strand, 42232202 - 42231638
Alignment:
Q  547 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagct 646  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42232202 caagaaaggggaatactctcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaact 42232103  T
Q  647 ttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatca 746  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42232102 ctgattttgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaactgaattccttaatggtatttagagctctggaattccaaatca 42232003  T
Q  747 ccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatcta 846  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42232002 ccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatcta 42231903  T
Q  847 gggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactat 946  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42231902 gggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccaaggtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactac 42231803  T
Q  947 ccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatct 1045  Q
    |||||||||||| | |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42231802 ccttcaaattcatgcgcatataatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatct 42231703  T
Q  1046 tcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaag 1110  Q
    ||||||||| |||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  42231702 tcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctagaaaag 42231638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 42232663 - 42232210
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42232663 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 42232564  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagattt-aggtgg 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||    
T  42232563 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagtttttaggtgg 42232464  T
Q  208 tgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtg 307  Q
    |||| ||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  42232463 tgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcagtatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttaatgtg 42232364  T
Q  308 ttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacg 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  42232363 ttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagtagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattggagacg 42232264  T
Q  408 acaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 461  Q
     |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  42232263 gcaacaacggttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 42232210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1190 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 42231631 - 42231265
Alignment:
Q  1190 aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgtt-----ttatttttaat 1284  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||  ||     || ||||||||    
T  42231631 aaaaagtatgatcattggttatattttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcgcattgattgaaagttattgttttttttttttaat 42231532  T
Q  1285 ttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaa 1384  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42231531 ttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatctttctgccattgactattaattcatgcatttttcaggtttaacaa 42231432  T
Q  1385 tccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggtta-ccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcg 1483  Q
    |||||||||||            ||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42231431 tccgcggaacc---tttttttttacatcgttgttacccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcg 42231335  T
Q  1484 acgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  42231334 gtgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 42231265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1408 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 7035964 - 7035845
Alignment:
Q  1408 acatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatat 1507  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7035964 acatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatat 7035865  T
Q  1508 ttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7035864 ttatacacacccgtaaaaaa 7035845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1411 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 22843793 - 22843677
Alignment:
Q  1411 tcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatattta 1510  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22843793 tcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcggagtttctgtagcccaaactatattta 22843694  T
Q  1511 tacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||| ||||||||    
T  22843693 tacacaccagtaaaaaa 22843677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1459 - 1549
Target Start/End: Original strand, 45122365 - 45122461
Alignment:
Q  1459 aaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa------aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||||    
T  45122365 aaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaaattaaatgtttgcatttaccgactacgt 45122461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1559 - 1629
Target Start/End: Original strand, 26255088 - 26255158
Alignment:
Q  1559 aaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26255088 aaattaattactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 26255158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 36698168 - 36698105
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36698168 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttatccctttttataagacc 36698105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 39871650 - 39871587
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39871650 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 39871587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 7449270 - 7449332
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7449270 tactccctccgtccctaattataagaccattttgagaatttttttgtccctttttataagacc 7449332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 25247727 - 25247665
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25247727 tactccctccgtccctaattataagactcttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 25247665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 34012554 - 34012493
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34012554 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagac 34012493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1628
Target Start/End: Original strand, 39197716 - 39197780
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  39197716 attactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 39197780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 21295151 - 21295214
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  21295151 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 21295214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1574 - 1629
Target Start/End: Original strand, 26299323 - 26299378
Alignment:
Q  1574 tccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26299323 tccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 26299378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 29177289 - 29177226
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  29177289 tactccctccgtccctaattataagatccttttgagaatattttttgtccctttttataagacc 29177226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 29286074 - 29286011
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  29286074 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 29286011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 32814433 - 32814496
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  32814433 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 32814496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 33858903 - 33858840
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  33858903 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 33858840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 38858298 - 38858361
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  38858298 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 38858361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 41026133 - 41026070
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  41026133 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 41026070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 41252398 - 41252335
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  41252398 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 41252335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 31769364 - 31769306
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31769364 cctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttatccctttttataagacc 31769306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 33381610 - 33381548
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  33381610 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagattttttttgtccctttttataagacc 33381548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Original strand, 40300227 - 40300293
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgaga-aattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  40300227 aattactccctccgtccctaattataagacccttttgagatttttttttgtccctttttataagacc 40300293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 12616420 - 12616359
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttt-atccctttttataaga 1627  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12616420 tactacctccgtcccttattataagacccttttgagaatttttttgatccctttttataaga 12616359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 31457995 - 31458060
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  31457995 attacttcctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 31458060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 32872412 - 32872351
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  32872412 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 32872351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 19920563 - 19920626
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||    
T  19920563 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgttcctttttataagacc 19920626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1558 - 1629
Target Start/End: Original strand, 25950822 - 25950893
Alignment:
Q  1558 aaaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25950822 aaaacaaaatactacctccgtccttaattataagacctttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 25950893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 34979114 - 34979051
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  34979114 tactccctccgtccctaattataagactcttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 34979051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 36646674 - 36646611
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaat-tttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  36646674 tactccctccgtccctaattagaagacccttttgagaattctttttgtccctttttataagacc 36646611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1560 - 1629
Target Start/End: Original strand, 20074882 - 20074952
Alignment:
Q  1560 aataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  20074882 aatatattactccctccgtccctaattataatattcttttgagaatatttgttgtccctttttataagacc 20074952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 36711335 - 36711273
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaat-tttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  36711335 tactccctccgttcctaattataagacccttttgagaattatttttttccctttttataagac 36711273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 41003192 - 41003130
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  41003192 ttactccctccgtccttaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 41003130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 18939184 - 18939139
Alignment:
Q  498 ttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccc 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18939184 ttataaactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggtaaccc 18939139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Original strand, 44547426 - 44547487
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  44547426 tactccctccgtccctaattataagacctttttgagaattttttttgtccctttttataaga 44547487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1573 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 9140564 - 9140508
Alignment:
Q  1573 ctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  9140564 ctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 9140508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1574 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 11647864 - 11647808
Alignment:
Q  1574 tccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  11647864 tccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 11647808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 29643181 - 29643117
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  29643181 ttactccctccatctctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 29643117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1611
Target Start/End: Original strand, 48521029 - 48521073
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttt 1611  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  48521029 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttt 48521073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 1275770 - 1275707
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttta-tccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  1275770 tactccctccatccctaattataagacccttttgataattttttttgtccctttttataagacc 1275707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 2290053 - 2289990
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  2290053 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttctaagacc 2289990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 6387325 - 6387388
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  6387325 tactccctccgtctctaattataagactcttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 6387388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 7703857 - 7703794
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttt-atccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7703857 tactccctccgtccttaattataagattcttttgagaattttttttatccctttttataagacc 7703794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1560 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 28016589 - 28016522
Alignment:
Q  1560 aataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||    
T  28016589 aatatattactacttccgtccctaattataagacccttttgagaattatttagtccctttttataaga 28016522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1584 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 8612595 - 8612549
Alignment:
Q  1584 attataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8612595 attataagacccttttgagaaatttttttgtccctttttataagacc 8612549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 985 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 12983041 - 12983007
Alignment:
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtca 1019  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12983041 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtca 12983007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Original strand, 17317446 - 17317504
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  17317446 cctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 17317504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 985 - 1019
Target Start/End: Original strand, 18292589 - 18292623
Alignment:
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtca 1019  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18292589 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtca 18292623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 18752019 - 18751958
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  18752019 tactacctccgtccctaattataagactcttttgag-aattttttgtccatttttataagacc 18751958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 985 - 1019
Target Start/End: Original strand, 26368005 - 26368039
Alignment:
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtca 1019  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26368005 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtca 26368039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1575 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 41803500 - 41803446
Alignment:
Q  1575 ccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||    
T  41803500 ccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtcctttttataagacc 41803446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Original strand, 43279702 - 43279768
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  43279702 aattactacatccgtccctaattgtaagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 43279768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 46415042 - 46414980
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaat-tttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  46415042 tactacctccgtccctaattataagaccattttgagaattatttttatccttttttataagac 46414980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 28060717 - 28060781
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa--attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  28060717 tactccatccgtccttaattataagacccttttgagaatttttttttacccctttttataagacc 28060781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1581 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 29064480 - 29064431
Alignment:
Q  1581 ctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  29064480 ctgattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 29064431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Original strand, 34895857 - 34895918
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34895857 tactacctctgtcactggttataaaacccatttgagaaatttttttgtccctttttataaga 34895918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1625
Target Start/End: Complemental strand, 43093446 - 43093386
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgag--aaattttttatccctttttataa 1625  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  43093446 tactacctccgcccctaattataagacccttttgagaaaaattttttgtccctttttataa 43093386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 44510382 - 44510317
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttg-agaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  44510382 attactccctccgtccctaattataagaccattttgaaaaaataatttgtccctttttataagacc 44510317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 957; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 957; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1388
Target Start/End: Complemental strand, 32595 - 31207
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32595 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcttagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 32496  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  32495 ttttgaggcagctgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagcacgatcccgtaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggt 32396  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || |||| | ||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  32395 gatttcaggcagatattgcctgttgtccgacgaggaacgaggccagatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaagatatgtgcttattgtaatgtgt 32296  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  32295 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggatacgg 32196  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32195 caacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 32096  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32095 gtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaagaaagggga-tacttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 31997  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31996 ttatgatgttgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 31897  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    | | |||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31896 atcggaatttcttaatggtattaagatctttggaatcccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 31797  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||   |||||||| ||      
T  31796 gccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctaggg-agagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaaatgcaggtaccagga 31698  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31697 tattcattcctataatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcagacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 31598  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgg-ggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31597 aaataaaagccagggtcaatctttatctcgagtggcggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatgaacaactttatgtcgctgtctctcgagtaact 31498  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  31497 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcctgaaatttttc-aaaaagtatga 31399  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31398 taattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgta 31299  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctata----taagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccg 1388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31298 ctggtcattatagacatgcaatttctatataattaagcagatcctcctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccg 31207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 765; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 459 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 19670 - 18569
Alignment:
Q  459 atttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caaga 551  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||       |||||    
T  19670 atttgctgatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaaga 19571  T
Q  552 aaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgat 651  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19570 aaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgtcaacaaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgat 19471  T
Q  652 tctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggt 751  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19470 tctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggt 19371  T
Q  752 tgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaa 851  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19370 tgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcttgctaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaa 19271  T
Q  852 gagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttc 951  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19270 gagcacgatagctgctaccgtaattacaagaaaaatggcaggtaccagggtattcattccgaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttc 19171  T
Q  952 aaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttccta 1050  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19170 aaattcaggcgcatgcaatttccattgacgctttgttttacaatgacaataaataaaaaccagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttctta 19071  T
Q  1051 agcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttg 1150  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19070 agtctgtgttcacgcatgaacaactttatttcggtgtctctcgagtaacttgaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgttag 18971  T
Q  1151 taaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaag 1250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18970 taaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaag 18871  T
Q  1251 ttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccatt 1350  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18870 ttgcctattgtttggaagtcattttatttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccatt 18771  T
Q  1351 gactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatt 1450  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||            ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18770 gactattaattcatgcacttttctagtttaacaatccgcggaacc--ttttttctttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatt 18673  T
Q  1451 tgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgact 1545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |    
T  18672 tgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcagcgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgagt 18573  T
Q  1546 acgt 1549  Q
    ||||    
T  18572 acgt 18569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 412 - 3
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  412 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctaatgcatgctgcaaagttgataatttggggtgaggctccaatgatgcaccaatggtgtt 313  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    |||||| |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  312 ttgaggtagttgaccgatcattacgtgatatcatgttcaagaatgatcccttaaacgcacttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtga 213  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
    ||| ||| || |||| | | |  |||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| |||    
T  212 ttttaggcagatattgccttttttccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgtctcggtcaattcgtcaaatatattggcttattgtaatgttttg 113  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  112 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaagaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 13  T
Q  411 acgacgcttc 420  Q
    |||| |||||    
T  12 acgatgcttc 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1408 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 31173 - 31027
Alignment:
Q  1408 acatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatat 1507  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31173 acatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagactatttgttttgtaaaaattaaaaacaaaaaacaatcggcgtttctgtagccccaactatat 31074  T
Q  1508 ttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||    
T  31073 ttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaacgactacgt 31027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 939; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 939; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 166098 - 164641
Alignment:
Q  107 tgttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtg 206  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||    
T  166098 tgttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcatatccaagaatgatcacctaaacgagtttagaccttttggtggaatgatagtagttttaggtg 165999  T
Q  207 gtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgt 306  Q
    ||||||||||| || ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  165998 gtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgt 165899  T
Q  307 gttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggata--ctctcaattggaa 404  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  165898 gttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaagaataaactgctaattttggcaagtggatatactctcaattggag 165799  T
Q  405 acgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttataga 504  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  165798 acgacaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaagggggaaattcccgaagatttactcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaataga 165699  T
Q  505 ctttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaac 597  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  165698 ctttgtatatcccgatttaaatgataacattggtgacccactatttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaac 165599  T
Q  598 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtattt-aagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtgg 696  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  165598 gaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagatttttttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaagtctgatgtctagagcgagtgg 165499  T
Q  697 ttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcg 796  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  165498 ttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaatggtgggatgtccagtcatgctgatgagaaacatcg 165399  T
Q  797 atcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtac 896  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || |||||   | ||||||    
T  165398 atcaggtcaatggattgtgtaatggtacgaggctgatagttacacatctagggaagagcatgatagctgctactgtaattacatgaaaaaaagaaggtac 165299  T
Q  897 tagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatg 996  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  165298 cagggtattcattcccaagatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatg 165199  T
Q  997 acaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgag 1095  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  165198 acaataaataaaagtcaaggtcaatctttatctcaagtgggggtttatcttcctaagcctatgttcacgcatgggcaactttatgtcgctgtctctcgag 165099  T
Q  1096 taacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaag 1195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  165098 taacttcaagaaaaggtttgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaag 165000  T
Q  1196 tatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaag 1295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  164999 tatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaaccaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaag 164900  T
Q  1296 gcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc 1395  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  164899 acgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaataatccgcggaacc 164800  T
Q  1396 nnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtag 1495  Q
                |||| || |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  164799 -ttttattttttacattgttgttaccctaaaatacaatatttacattataccatttgttttgtaaaaattaaaaataaataacaatcggcgtttctgtag 164701  T
Q  1496 cccaaactatatttatacacacccgtaaa------aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  164700 cccaaactatatttatacacacccgtaaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 164641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 806; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1236
Target Start/End: Complemental strand, 183474 - 182240
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  183474 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttaataatttgggattaggctccaatgatgtaccgatggtg 183375  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||    
T  183374 ttttgaggcagttgaccaatcaatgcatgatatcatatccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgatagtagttttaggtggt 183275  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || ||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  183274 gatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaatgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatggccttattgtaatgtgt 183175  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  183174 tgaggcttacagttaatatgatattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 183075  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  183074 caacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagacttt 182975  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctc-------aagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    || ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||       |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  182974 gtatatcccgatttgaatgatatcattggtgacccactctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaat 182875  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | | || |||||||||||    
T  182874 atatgatgtcagtgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaaatctgatggctagagtgagtggttcac 182775  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  182774 aacggaatttcttaatggtattaagagctctggaatttcaaatcaccggttgaaactaatggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcaatcag 182675  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||||  || |||||  || |    
T  182674 gtcaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctactgtaattatatgaaaaagggaaggtaacaggg 182575  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||    
T  182574 tattcattcccaagatgaatcttattccgagtgatccaagactacccttcaaattcaggcgcaagcaatttgcattgacgctttgttttgcaatgataat 182475  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  182474 aaataaaagtcaaggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaaacctgtgttcacgcatgggcaactttatgtcgctgtctctcgattaact 182375  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  182374 tcaagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgtaaggaaaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatga 182276  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataat 1236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182275 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataat 182240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1158 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 173151 - 172756
Alignment:
Q  1158 accacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgccta 1257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  173151 accacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaa-gtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaaccaaagttgccta 173053  T
Q  1258 ttgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactatt 1357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  173052 ttgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaagacgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgactatt 172953  T
Q  1358 aattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttg 1457  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||            |||| || |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  172952 aattcatgcacttttcaggtttaataatccgcggaacc-ttttattttttacattgttgttaccctaaaatacaatatttacattataccatttgttttg 172854  T
Q  1458 taaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa------aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  172853 taaaaattaaaaataaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 172756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 935; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 935; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 19668 - 18140
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19668 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcttaggtcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcactgatggtg 19569  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  19568 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaatcatttggtggaatgacaatagttttaggtggt 19469  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
     |||||||| || ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19468 aatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgggcttattttaatgtgt 19369  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||     
T  19368 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgcagagcagaaagaaattgctaa-tttggcaaggggatactttgaattggagacgg 19270  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19269 caacaacgcttcggatgagaatgatgaaatgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatatgttgatgtcacttatagacttt 19170  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19169 gtgtatcttgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 19070  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19069 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgagtgaaaattctgatgtgcaaagcgagtggttcac 18970  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18969 aacggaattccttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 18870  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| | ||||||  || |||| | |       
T  18869 gccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagctacacatctagggaagagtacgatagctgctaccgtaattactggaaaaaaggtaggtgccaaga 18770  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18769 tattcattcctaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcatgtgcagacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 18670  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  18669 aaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcttgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctcgagttact 18570  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  18569 tctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacatatgttgtgtatcgtgaagttttt-taaaaagtatga 18471  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaag-------tcgttttatttttaatttctatgta 1293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||       |  |||| |||||||||||| ||||    
T  18470 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcgtattgattgaaagttttttttttttttttttttaatttctttgta 18371  T
Q  1294 aggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcgga 1392  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18370 aggcgtactggtcattacaggacatgtaatttctatataagcagatcctcctgcctttgacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatacgcgga 18271  T
Q  1393 accnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctg 1492  Q
    ||             ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18270 ac----tttttttttacatcgttgttacgctaaaatacaatatttacattagaccataggttttgtaaaaaataaaaataaataacaatcggcgtttctg 18175  T
Q  1493 tagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18174 tagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 18140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 921; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 921; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1527
Target Start/End: Original strand, 4816 - 6338
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4816 catcatcgcttacgatagaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggatccaatgatgcactgatggtg 4915  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  4916 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcatgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagttttagatggt 5015  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||| ||| || |||| | | | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  5016 gattttaggcagatattgcctattgttcgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcataaaagatatgtgcttattttaatgtgt 5115  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  5116 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgcaaagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgacttggagacga 5215  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5216 caacagcgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctattgatgtcacttatagacttt 5315  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaata 602  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5316 gtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaata 5415  T
Q  603 tatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcaca 702  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5416 tatgatgtcactgatttcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcaca 5515  T
Q  703 acagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcagg 802  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5516 acagaattccttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgatactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaga 5615  T
Q  803 ctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgt 902  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| |  ||    
T  5616 ccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccaaggt 5715  T
Q  903 attcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaata 1002  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5716 attcattcccaagatgaatcttattccgagtgatccaggattacccttcaaattcatgcgcacacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaata 5815  T
Q  1003 aataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtg-gggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaactt 1101  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||||   ||||  ||||||||||| ||||||| ||||    
T  5816 aataaaagttaggctcaaactttatctcgagtgagagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgggaaactccatgtcgctgtctctcgagttactt 5915  T
Q  1102 caagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgat 1201  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  5916 ctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacagatgttttgtattgtgaagttttt-taaaaagtatgat 6014  T
Q  1202 cattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaag---tcgttttatttttaatttctatgtaaggcg 1298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | |   |  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  6015 cattggttatgttttagaattgttgttcctataatttagaaaactaaagttacgtattgattgaatgttttttttttttttttaatttctttgtaaggcg 6114  T
Q  1299 tactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnn 1397  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||       
T  6115 tactggtcattataggacatgcaatttctatataagcagattttcatgcctttgacttttaattgatgcacttttcaagtataacaatacgcggaac--- 6211  T
Q  1398 nnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcc 1497  Q
              ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  6212 --ttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaataaataacaatcggcgtttctgtagcc 6309  T
Q  1498 caaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6310 cagactatatttata-acacccgtaaaaaa 6338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 906; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 906; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 187215 - 185708
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  187215 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcac--ctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgagatgaggctccaatgatgcactcatggtg 187118  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  187117 ttttgaggtagttgaacgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacagtagttttaggtggt 187018  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||| | || |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  187017 gatttcaagcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcaccaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgttt 186918  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  186917 taaggcctactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacttgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgg 186818  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  186817 caacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgtacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacttt 186718  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  186717 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagctgagcatgttaacgaat 186618  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcac 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  186617 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaa-ttctgatgtccaaagcgagtggttctc 186519  T
Q  702 aacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcag 801  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  186518 aacggaattccttaatggtattaagagctctgg--ttccaaatcaccggttgaaactaaaggtgggatgtctagttatgctgatgagaaacatcgatcag 186421  T
Q  802 gctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| || |    
T  186420 gccagtggactgtgtaatggtacgaggctgacagtttaacatctagggaagaggacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccaggg 186321  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  186320 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcatgcgcagacaatttccattgatgctttgttttacaatgacaat 186221  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  186220 aaataaaa--gagggtcaatctttatctcaagtgggagtttatctacctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctcgagttact 186123  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  186122 tctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaaaataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatga 186024  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  186023 tcattggttatgttttagaattggtgttgctataatttaaaaaactaaagttgcatattgattggaagttgttt--tttttaatttctttgtaaggcgta 185926  T
Q  1301 ctggtcatta-tagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnn 1399  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||         
T  185925 ctggtcatcacaagacatgcaatttgtatacaagcagatccttctgcctttgacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatacgcggaac----t 185830  T
Q  1400 nnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagccca 1499  Q
            ||||||| |     ||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||| ||||    
T  185829 ttttttttacatcgttg-----ttaaaatacaagaattacattagacca-ttgttttgtaaaaaatataaacaaataacaatcggcgttcttgtacccca 185736  T
Q  1500 aactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  185735 aactatatttatacacacccgtcaaaaa 185708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 877; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 877; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 1549
Target Start/End: Original strand, 48518 - 50047
Alignment:
Q  11 tcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48518 tcatcgcttacgatggaaaaggatagtccttgggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgtt 48617  T
Q  111 ttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||| |||||||| ||  || ||||||          
T  48618 ttgaggcagttgaccgatcattgcttgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgcacttaaactttttggtggaatggcagtagttttaggc----- 48712  T
Q  211 tttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttg 310  Q
            || |||| ||||| ||| ||  |||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48713 --------agatattgcatgttgtctgaggaggaacgatgccagatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttg 48804  T
Q  311 aggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgaca 410  Q
    |||||| ||           ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  48805 aggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctacagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggca 48893  T
Q  411 acgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgt 510  Q
    |||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48894 acgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgt 48993  T
Q  511 gtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatat 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  48994 gtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaattt 49093  T
Q  604 atgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaa 703  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49094 atgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacac 49193  T
Q  704 cagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaag-ggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcagg 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49194 cagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaaggtgggatgtccagttatgctgttgagaaacatcgatcagg 49293  T
Q  803 ctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttca-ggaaaagtggcaggtactagtg 901  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||  |||||||||||| |    
T  49294 ccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttatacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaattacaaggaaaaagggcaggtactaggg 49393  T
Q  902 tattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaat 1001  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  49394 tattcattcccaggatgaatcttattccgaatgatccaggactacccttcaaattcagacgcagacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaat 49493  T
Q  1002 aaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaact 1100  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  49494 aaataaaagctagg-tcaatctttatctcgggtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatagacaactttatgtcgttgtctctcgagtaact 49592  T
Q  1101 tcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatga 1200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  49593 tcatgaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaa-agtatga 49691  T
Q  1201 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgta 1300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49692 tcattggttatgttttagaattgttgttgctataatatataaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgta 49791  T
Q  1301 ctggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc--nnn 1398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||         
T  49792 ccggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgtcattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgtgaaaccttttt 49891  T
Q  1399 nnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagccc 1498  Q
               ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49892 tttttttttttatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagccc 49991  T
Q  1499 aaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  49992 aaactatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 50047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 848; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 848; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1498
Target Start/End: Complemental strand, 1680 - 165
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1680 catcatcgcttaaaatgaaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttaataattttggttgaggctcaaatgatgcaccgatggtg 1581  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||    
T  1580 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaataatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgatagtagttttaggtggt 1481  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcagga-----------------tattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatg 291  Q
    ||||||| | || |||| | ||| | ||||||| || ||||| ||||                 |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1480 gatttcaagtagatattgcctgttgcccgaaaaagatcgaggtaggaaaaagattgaggcatgatattatttatgcatcaatcaattcatcaaagatatg 1381  T
Q  292 gacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggata 391  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1380 agcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatcttaggtacatgtatagcaggaagaaatttctaattttggcaagtggata 1281  T
Q  392 ctctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttga 491  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1280 ctctcaattggagacgacaacgactcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttga 1181  T
Q  492 tgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagt 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1180 tgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagt 1081  T
Q  585 tgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtc 684  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  1080 cgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattttgtttgtcaatcgggcgaaaattctgatgac 981  T
Q  685 caaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctga 784  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  980 cagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaagctaagggtaggatgtccagttatgctga 881  T
Q  785 tgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaa 884  Q
    |||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  |||||  ||||||    
T  880 tgagaaatgttgatcaggccaatggattgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatctagggaagagcacaatagctactaccgtaattataggaaa 781  T
Q  885 agtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggacta---tccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatg 981  Q
    |  || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  780 aagggaaggtaccagggtattcattcccaggatgaatcttattctgagtgatctaggactacccgccttcaaattcaggcgcaagcaatttccattgacg 681  T
Q  982 cgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatg 1080  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||    
T  680 ctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatg 581  T
Q  1081 tcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtga 1180  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  580 tcgctgtctctcgagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgttcgcaaggagaccacaaatgtcgtgtatcgtga 481  T
Q  1181 agtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttt 1280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| | ||||    
T  480 agtttttc-aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaatttgcgtattttttgtaagtcgttctttttt 382  T
Q  1281 taatttctatgtaaggcgtactggtcatta-tagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggttt 1379  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |    
T  381 ttatttctttgtaaggcgtactgatcattactggacatgcaatttctatataagcagatcctcacgccattgacatttaattgatgcacttttcaggtat 282  T
Q  1380 aacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataac- 1478  Q
    |||||| ||||  ||             ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||     
T  281 aacaatacgcgagac---ttttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatcggttttgtaaaaaataaaaacaaataaca 185  T
Q  1479 aatcgacgtttctgtagccc 1498  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  184 aatcgacgtttctgtagccc 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 837; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 837; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 1368
Target Start/End: Original strand, 2201838 - 2203102
Alignment:
Q  112 tgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgat 211  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||     
T  2201838 tgaggcagttgaccgatcaaagcgtgatatcatgtccaagaatgaccccctaaacgagtttagaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggtgac 2201937  T
Q  212 ttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttga 311  Q
    |||||| || |||| |   | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||    
T  2201938 ttcaggcagatattgcccattgtccgaaaaggatcgaggcaggatattgttgatgcctcgatcaattcatcaaagatataggcatattgtaatgtgtcga 2202037  T
Q  312 ggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  2202038 ggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacttgcagagcatgaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagaaggcaa 2202137  T
Q  412 cgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtg 511  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2202138 cgacgcttcaaatgagaatggtgaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatcgaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtg 2202237  T
Q  512 tatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatata 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  2202238 tatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagtagaacatgttaacgaatata 2202337  T
Q  605 tgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaac 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2202338 tgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaac 2202437  T
Q  705 agaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggct 804  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  2202438 tgaattccttaatggtatttagagctctggaattccaaatcactggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgccgatgagaaacatcgatcaggca 2202537  T
Q  805 aatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtat 904  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||  || ||||    
T  2202538 aatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctaaggaagagcacgatagttgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtatcagggtat 2202637  T
Q  905 tcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgc-aatgacaataa 1003  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  2202638 tcattcccaagatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggtgcagacagtttccattgacgctttgttttgcaaatgacaataa 2202737  T
Q  1004 ataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttc 1102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||  |||| | |||||||||| | |||| ||||||| |||||    
T  2202738 ataaaagtcagggtcaatctttatctcaaatgggagtttatctttctaagcccgtgttcacgcatggaaaactttatgttgttgtctctcgagttacttc 2202837  T
Q  1103 aagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatc 1202  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2202838 tagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgaaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaaatttttc-aaaaagtatgatc 2202936  T
Q  1203 attggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtact 1302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  2202937 attggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcgtattgtttagaagtcatttt-ttttttatttctttgtaaggcgtact 2203035  T
Q  1303 ggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcac 1368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||    
T  2203036 ggtcattataggacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgaattttaattgatgcac 2203102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 734; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 233 - 1390
Target Start/End: Complemental strand, 10187983 - 10186820
Alignment:
Q  233 gtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagat 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10187983 gtccgaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttattgttaatatgagat 10187884  T
Q  333 tgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatgg 432  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  10187883 tgggtgcatcttcgatacctgtagagcaggaagaaattgctaattttcgcacgtggatgctctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatgg 10187784  T
Q  433 tgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataac 532  Q
    | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10187783 taaaatgaaggtagaaattcctgaatatttgctcatattggacacaaaaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataac 10187684  T
Q  533 cttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtg 625  Q
    ||||||||||||||       ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10187683 cttggtgacccgctatttttccaagaaaagggaatactcgctccaacacttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtg 10187584  T
Q  626 aagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaa 725  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10187583 aagagaaagagtatttaagctatgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaa 10187484  T
Q  726 gagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacg 825  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10187483 gagctcttgaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggtcaatggactgtgtaatggtacg 10187384  T
Q  826 aggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatctta 925  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||  ||||  || | |||| || || ||||||||| ||||||||||||    
T  10187383 aggctgacaattacacatctagggaagaccacgattgttgctaccgtaattacattaaaaagggaaagtaccagggtgttcattccctggatgaatctta 10187284  T
Q  926 ttccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatcttt 1025  Q
    ||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||   |||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  10187283 ttctgagtgatccaggactacctttcaaattcaggcgcatataatttccattgacgttttgttttgcaatgacgataaataaaagtcaaggtcaatcttt 10187184  T
Q  1026 atctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctc 1124  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||  |||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  10187183 atctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcattgtctctcgacttacttctagaaaaggtttgaagttgctc 10187084  T
Q  1125 atcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgt 1224  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10187083 atcttggatgaatataataatgtttgcaaggagaccacatatgttgtgtatcgtgaactttttc-aaaaagtatgatcattggttatggtttagaattgt 10186985  T
Q  1225 tgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatt 1323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10186984 tgttgctataatttagaaaactaaagttgtgcattgtttggaagtcattt--tttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattacatgacatgcaatt 10186887  T
Q  1324 tctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcg 1390  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10186886 tctatataagcagatcctcctgtcattgacttttaaatgatgcacttttcaggtataacaatacgcg 10186820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 708; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 296 - 1340
Target Start/End: Complemental strand, 15334019 - 15332967
Alignment:
Q  296 tattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactct 395  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15334019 tattgtaatgtgttgaagcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcgatacctgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaagtggatactct 15333920  T
Q  396 caattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc 495  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  15333919 caattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatagtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgttgatatcgtacgtaacaaatccgttgatgtc 15333820  T
Q  496 acttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgag 588  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||       ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15333819 actaatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaacaaatgggaatactcgcaccaacacttgattcagttgag 15333720  T
Q  589 catgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaa 688  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15333719 catgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaggctctgattctgtttgtagatcaggtgaaaattctgatgtccaaa 15333620  T
Q  689 gcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatg-a 787  Q
    ||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15333619 gcgagaggttcatatcgaaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttaaaactaaaggtgggatgtccagttatggtgatgga 15333520  T
Q  788 gaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagt 887  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||      
T  15333519 aaaacattgatcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttactcatctagggaagagcacaatagctgctaccgtaattacaggaaaaag 15333420  T
Q  888 ggcaggtact-agtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttg 986  Q
    |||||||||  || | || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || |||    
T  15333419 ggcaggtacccagggaatacattcccaggatgaatcttatttcgagtgattcaggactacccttcagattcaggcgcatgcaatttccattgacgctttg 15333320  T
Q  987 ttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctg 1086  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  15333319 ttttgaaataacaataaataaaagccagggtcaatctttatctcgagtggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactttatgtcgctg 15333220  T
Q  1087 tcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttt 1186  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15333219 tctctcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcctgaagtttt 15333120  T
Q  1187 tcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaattt 1286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  15333119 tca-aaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttattctaaattt 15333021  T
Q  1287 ctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcc 1340  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15333020 ctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcc 15332967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 672; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 547 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 12517506 - 12516500
Alignment:
Q  547 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagct 646  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517506 caagaaaggggaatatttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagct 12517407  T
Q  647 ttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatca 746  Q
     ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12517406 ctgattctgtttgatgatggggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagagctttggaattccaaatca 12517307  T
Q  747 ccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatcta 846  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||    
T  12517306 caggttgaaactaaaggtgggatgtccggttatgttgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtactagtctgacatttacacttcta 12517207  T
Q  847 gggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactat 946  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12517206 gggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccagggtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactac 12517107  T
Q  947 ccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatct 1045  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12517106 ccttcaaattcaggcgcagacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatct 12517007  T
Q  1046 tcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataat 1145  Q
    |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12517006 tcctaagcctatgttcacgcatggacaactttatgtcgctgtctctcaagtaacttcaagaaaaggtctgaagctactcatcctggatgaagatgataat 12516907  T
Q  1146 gtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaac 1245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12516906 gtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattgcttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaac 12516808  T
Q  1246 taaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctg 1345  Q
    || |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||    
T  12516807 tatagtttcctatttttttgaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaattcctatataatcagatcctcttg 12516708  T
Q  1346 ccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaa 1445  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |    
T  12516707 tcattgactattaattcatgcacttttcatgtttaacaatccgcggaacc-tttttttttttacatcgttgttaccctaaaataaaatatttacattaga 12516609  T
Q  1446 ccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttac 1540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  12516608 ccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcatttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttac 12516509  T
Q  1541 cgactacgt 1549  Q
    |||||||||    
T  12516508 cgactacgt 12516500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 666; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 185 - 1208
Target Start/End: Complemental strand, 18344612 - 18343582
Alignment:
Q  185 ggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaa 284  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18344612 ggaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaatttatcaa 18344513  T
Q  285 agatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaa 384  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18344512 agatatgggcttattgtaatttgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatctttggtatctacagagcaggaagaaattcctaattttgacaa 18344413  T
Q  385 gtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaat 484  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18344412 gtgaatactctcaattggagacgacaacgaagcttcagatgagaatagtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaat 18344313  T
Q  485 ccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttg 577  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18344312 ccgttcatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccatctatttttccaagaaaggggaatacttgcaccaacgcttg 18344213  T
Q  578 attcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 677  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18344212 attcagttgagcatgttgacgaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaagctttgattctatttgtcgatcgggtgaaaattt 18344113  T
Q  678 tgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagtt 777  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |    
T  18344112 tgatgtccaaagcgagtatttcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctaaaattccaaatcaccagttgaaaccaagggtgggatgtccggct 18344013  T
Q  778 atgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataattt 877  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||     
T  18344012 atgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggctaacagttacacatctagggaagagcacgataactgctaccgtaatta 18343913  T
Q  878 caggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccatt 977  Q
    ||||| ||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18343912 caggagaaagggcaggtaccagggtattcattcacaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacacttgaaattcaggtgcatgcaatttccatt 18343813  T
Q  978 gatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactt 1076  Q
    ||  | |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||  |||| ||||||     
T  18343812 gacactttgttttgcaattacaataaaaaaaagttagggtcaatctttatctcaagtgggagtttatcttcctaagcccatcttcacgcatggacaactc 18343713  T
Q  1077 tatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatc 1176  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||    
T  18343712 tatgtcgctgtctcttgagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggaaaccacaactgttgtgtatc 18343613  T
Q  1177 gtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggt 1208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18343612 gtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggt 18343582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 767 - 1549
Target Start/End: Original strand, 29641668 - 29642460
Alignment:
Q  767 gatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgc 866  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29641668 gatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgc 29641767  T
Q  867 tactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaag 966  Q
    |||  | ||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||      
T  29641768 taccgttattacaagaaaaagggcaggtactagggtattcattcccaggatgaatattattacgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaga 29641867  T
Q  967 caatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatac 1065  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  29641868 caatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagccagggtcaatctttatttcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgc 29641967  T
Q  1066 atgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaa 1165  Q
     || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29641968 ttggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccataaa 29642067  T
Q  1166 tgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttgg 1265  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29642068 tgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttataaaactaaagttgcctattgtttgg 29642166  T
Q  1266 aagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatg 1365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  29642167 aagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctatcattgactattaattcatg 29642266  T
Q  1366 cacttttcaggtttaacaatccgcgga----accnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaa 1461  Q
    || |||||||||||||||||||| | |                   ||||||| |||| | |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29642267 catttttcaggtttaacaatccgtgaatttttttttttttttttttacatcgttgttatcctaaaatacaatatttacatcagaccatttgttttgtaaa 29642366  T
Q  1462 aattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacaca-cccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     |||||||||||||||||||||||||    
T  29642367 aattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttatacacaccccgttaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 29642460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 493; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 767 - 1547
Target Start/End: Original strand, 31511832 - 31512598
Alignment:
Q  767 gatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgc 866  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31511832 gatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactatgtaatggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgc 31511931  T
Q  867 tactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaag 966  Q
    |||  ||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||      
T  31511932 taccgtaattacaagaaaaagggcaggtactagggtattcattcccaggatgaatgttattacgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaga 31512031  T
Q  967 caatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatac 1065  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31512032 caatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagccagggtcaatctttatttcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgc 31512131  T
Q  1066 atgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaa 1165  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31512132 ttggacaactttatgtcgctgtctctcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaa 31512231  T
Q  1166 tgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttgg 1265  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31512232 tgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgttataatttataaaactaaagttgcctattgtttgg 31512330  T
Q  1266 aagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatg 1365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||    
T  31512331 aagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcc----------------taattcatg 31512414  T
Q  1366 cacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaatt 1465  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||            ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31512415 catttttcaggtttaacaatccgtgaaacc---tttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacatcagaccatttgttttgtaaaaatt 31512511  T
Q  1466 aaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactac 1547  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||    
T  31512512 aaaaacaaataacaatcggcgtttcggtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactac 31512598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 30881988 - 30881315
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30881988 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggaagacctggtgcatgtagaaaagttgataatatggaatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 30881889  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  30881888 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgt-atatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttggtggaaagacaaaagttttaggtggt 30881790  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30881789 gatttcaggcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgt 30881690  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |     
T  30881689 tgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaataaattgctaattttggcaaatggatactctcaattagagaagg 30881590  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30881589 caacggcgcttcggatgag-atggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacatt 30881491  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaat 601  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30881490 gtgtatctcgatttaaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattctgttgagcatgttaacgaat 30881391  T
Q  602 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30881390 atatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 30881315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 706 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 12519566 - 12518751
Alignment:
Q  706 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggcta 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12519566 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccaattatgctgatgagaagcatcgatcaggcca 12519467  T
Q  806 atggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtatt 905  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||  ||||||||| || |||||    
T  12519466 atggaccgtgtaatggtacgaggttgacaattatacgtctagggaagagcacgatagttgctaccgtaattacaaaaaaaagggcaggtaccagggtatt 12519367  T
Q  906 cattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaat 1005  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12519366 cattcccaggatgaatcttattccaagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcaaacaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaat 12519267  T
Q  1006 aaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaa 1104  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||  |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| || |  |    
T  12519266 aaaagtcaaggtcaatctttatctcgagtgggagtttatattcctaagcacgtgttcacgcatggacaactctatgttgctgtctctcgagttacatata 12519167  T
Q  1105 gaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcat 1204  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| |    
T  12519166 gaaaaggtttgaagctgctcatattggatgaagataataatgtttgcaaggagatcacaaatgttgtctatcgtaaattttttc-aaaaagtatgatctt 12519068  T
Q  1205 tggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactgg 1304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  12519067 aggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcatattgtttggaagttgttttttttttaatttatttgtaaggcgtactgg 12518968  T
Q  1305 tcatta-tagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnn 1403  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||                 
T  12518967 tcattacgtgacatgcaatttctatataagtagatcctcctgccattgacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatacacg-------attttt 12518875  T
Q  1404 nnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaact 1503  Q
        ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||     
T  12518874 ttttacatcgttgttaccctaaaatataatatttacattagaccattggttttctaaaaaataaaaacaaataacaattgccgtgtctgtagctcaaacc 12518775  T
Q  1504 atatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12518774 atatttatacacacccgtaaaaaa 12518751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 967 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 24196598 - 24196013
Alignment:
Q  967 caatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtgggg-tttatcttcctaagcctgtgttcatac 1065  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  24196598 caatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgc 24196499  T
Q  1066 atgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaa 1165  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24196498 atggacaactctatgtcgctgtctctcaagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctagatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaa 24196399  T
Q  1166 tgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttgg 1265  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24196398 tgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaa-gtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttataaaaccaaagttgcctattgtttgg 24196300  T
Q  1266 aagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatg 1365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24196299 aagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagtagatcctcctgccattgactattaattcatg 24196200  T
Q  1366 cacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaatt 1465  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||            ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24196199 cacttttcaggtttaacaatccgctgaacc--ttttttttttacatcattgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaatt 24196102  T
Q  1466 aaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  24196101 aacaacaaataacaatcagcgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 24196013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 9 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 12517937 - 12517526
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517937 catcatcgcttacgatggaaaatgatagtcctagggcaggcatggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 12517838  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  12517837 ttttgaggcagctgaccgatcattgtgtgatatcatgtccaagaatgatcctctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggt 12517738  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| || |||| | ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12517737 gatttcaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagttaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgt 12517638  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12517637 tgaagcttactgttaatatgagattgggtgcatcttctgttcctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggagacga 12517538  T
Q  409 caacgacgcttc 420  Q
    ||||||| ||||    
T  12517537 caacgacacttc 12517526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 372 - 772
Target Start/End: Original strand, 29639947 - 29640355
Alignment:
Q  372 ctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatc 471  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  29639947 ctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatc 29640046  T
Q  472 ggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactc 564  Q
       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||    
T  29640047 aaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactc 29640146  T
Q  565 gcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgat 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| | |||    
T  29640147 gcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctaattctatttttagat 29640246  T
Q  665 cgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaac-agaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaaggg 763  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  29640247 cgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccaagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaagg 29640346  T
Q  764 tgggatgtc 772  Q
    |||||||||    
T  29640347 tgggatgtc 29640355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 372 - 772
Target Start/End: Original strand, 31510118 - 31510525
Alignment:
Q  372 ctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatc 471  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||    
T  31510118 ctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgtttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaatttcttaagatttgctgatatc 31510217  T
Q  472 ggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactc 564  Q
       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||    
T  31510218 aaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctaatctgaatgataaccttggtgaccaactattttttcaagaaaggggaatactc 31510317  T
Q  565 gcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgat 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| | |||    
T  31510318 gcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctaattctatttttagat 31510417  T
Q  665 cgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggt 764  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  31510418 cgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggt 31510517  T
Q  765 gggatgtc 772  Q
    ||||||||    
T  31510518 gggatgtc 31510525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 967 - 1208
Target Start/End: Original strand, 4220226 - 4220470
Alignment:
Q  967 caatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatac 1065  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||  |    
T  4220226 caatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaaaaaaagttagggtcaatctttatctcgagtgggagtttatcttcctaagctcgtgttcacgc 4220325  T
Q  1066 atgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagata---ataatgtttgtaaggagaccac 1162  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||| ||||||     
T  4220326 atggacaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctataaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataatgataatgtttgcaagtagaccat 4220425  T
Q  1163 aaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggt 1208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4220426 aaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatcattggt 4220470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1334 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 15330869 - 15330652
Alignment:
Q  1334 cagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgat 1433  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||            ||||||| |||||| |||||||| ||    
T  15330869 cagatcctcctgccattgactattaattcatgcacttttcaagtttaacaatccgcggaaccttttttttt---acatcgttgttaccgtaaaatacaat 15330773  T
Q  1434 atttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa-----aaac 1528  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||    
T  15330772 atttacattagaccatttattttgtaaaaattaaaaacaaataacaagcggcgtttctgaagccgaaactatatttatacacacccgtaaaaaattaaac 15330673  T
Q  1529 gtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15330672 gtttgcatttaccgactacgt 15330652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1312 - 1546
Target Start/End: Original strand, 4220884 - 4221113
Alignment:
Q  1312 agacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacat 1411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||| | |||| |||             ||||    
T  4220884 agacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgacttttaattgatgcactttttaggtataacagtacgcgaaac---ttttttttttacat 4220980  T
Q  1412 cgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttat 1511  Q
    | | ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220981 cattgttaccccaaaatacaatatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttat 4221080  T
Q  1512 acacacccgtaaaaaacgtttgcatttaccgacta 1546  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  4221081 acacacccgt--aaaacgtttgcattcacagacta 4221113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 222 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18814196 - 18814054
Alignment:
Q  222 tatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgt 321  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18814196 tattgcatgttgtccgaaaaggaacgagacatgatattgttgatcccttaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgt 18814097  T
Q  322 taatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaa 364  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  18814096 taatatgagattgggtgcatcgttggtacctgtagagcaggaa 18814054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1411 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 30881316 - 30881200
Alignment:
Q  1411 tcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatattta 1510  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30881316 tcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccgttggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatattta 30881217  T
Q  1511 tacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||||||||    
T  30881216 tacacacccgtaaaaaa 30881200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10188685 - 10188571
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10188685 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcgtagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttggaatgaggctctaatgatgcaccaatggtg 10188586  T
Q  109 ttttgaggcagttga 123  Q
    |||||||||||||||    
T  10188585 ttttgaggcagttga 10188571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 116
Target Start/End: Original strand, 2200454 - 2200561
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2200454 catcatcgcttacgatggaaaaagatagtcctaggggagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttggaatgaggctccaatgatgcaccgatagtg 2200553  T
Q  109 ttttgagg 116  Q
    ||||||||    
T  2200554 ttttgagg 2200561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 231143 - 231080
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  231143 ttactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 231080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 8743188 - 8743250
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8743188 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 8743250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 17227559 - 17227502
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17227559 cctccgtccctaattataagacccttttgagaaattttttgtccctttttataagacc 17227502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 25197152 - 25197215
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaa-ttttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25197152 tactccctccgtccctaattataagatccttttgagaaatttttttatccctttttataagacc 25197215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1562 - 1626
Target Start/End: Original strand, 32614984 - 32615048
Alignment:
Q  1562 taaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataag 1626  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32614984 taaagtactacctccgtccctaattataagaaccttttgagaatttttttatccctttttataag 32615048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 34301870 - 34301806
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  34301870 ttactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 34301806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1561 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 925976 - 925909
Alignment:
Q  1561 ataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  925976 ataaattactccctccgttcctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 925909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 23398176 - 23398113
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttga-gaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23398176 tactccctccgtccctaattataagacccttttgaggattttttttatccctttttataagacc 23398113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1628
Target Start/End: Original strand, 29036124 - 29036187
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29036124 attactccctccgttcctaattataagatccttttgagaatttttttgtccctttttataagac 29036187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 30248647 - 30248710
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  30248647 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 30248710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 10196030 - 10195968
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  10196030 tactccctccgtctctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctctttataagacc 10195968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 402658 - 402595
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  402658 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 402595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 9388828 - 9388765
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  9388828 tactccctccgtccctaattataagacctttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 9388765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 25045680 - 25045617
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  25045680 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 25045617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1564 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 1147307 - 1147241
Alignment:
Q  1564 aattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttta-tccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  1147307 aattactccatccgtccctaattataagacccttttaagaattttttttgtccctttttataagacc 1147241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 1730138 - 1730076
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||||    
T  1730138 tactccctccgtccctaattataagatccttttgaaattttttttgtccctttttataagacc 1730076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 33487833 - 33487894
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  33487833 tactccctccgtccctaattataagacctttttgag-aattttttgtctctttttataagacc 33487894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1557 - 1626
Target Start/End: Complemental strand, 34915590 - 34915520
Alignment:
Q  1557 caaaataaattactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataag 1626  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  34915590 caaaaaaaaatactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataag 34915520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 287451 - 287390
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  287451 tactccctccgtccctaattataagacctttttgagaattttttttgtccctttttataaga 287390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 6147381 - 6147446
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttt-atccctttttataagacc 1629  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  6147381 attagtccctccgttcctaattataagacccttttgagaatttttttggtccctttttataagacc 6147446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Original strand, 15498629 - 15498690
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15498629 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 15498690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1569 - 1629
Target Start/End: Original strand, 6417878 - 6417938
Alignment:
Q  1569 ctccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  6417878 ctccctccgtccctaatcataagacctttttgagaatttttttgttcctttttataagacc 6417938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 12106102 - 12106038
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttta-tccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  12106102 ttactctctccgtccctaattataagacctttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 12106038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1611
Target Start/End: Original strand, 23604460 - 23604504
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttt 1611  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23604460 tactacctccgtccctaattataagacccttttgagaaatttttt 23604504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1610
Target Start/End: Original strand, 4844400 - 4844443
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttt 1610  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4844400 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttt 4844443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 5457412 - 5457475
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| | |||||||||||||||    
T  5457412 tactccctccgtccctaattataagacctttttgagaattttttttgttcctttttataagacc 5457475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 9038642 - 9038705
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttg-agaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  9038642 tactccctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaatcatttgtccctttttataagacc 9038705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 19097838 - 19097775
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||    
T  19097838 tactccctccgtctctaattataagacccttttgagaattttttttgtccttttttataagacc 19097775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 23282843 - 23282780
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  23282843 ttactacctccgtccctaaatataagacccttttgagaatttttttgtctcttattataagacc 23282780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 13648166 - 13648104
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgaga-aattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  13648166 tactccctccgtccttaattataagacccttttgagatttttttttgtccctttttataagac 13648104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 985 - 1019
Target Start/End: Complemental strand, 15877060 - 15877026
Alignment:
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtca 1019  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15877060 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtca 15877026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1576 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 31487399 - 31487345
Alignment:
Q  1576 cgtccctgattataaaacccttttgagaaatt-ttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||    
T  31487399 cgtccctaattataaaacccttttgagaatttcttttgtccttttttataagacc 31487345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 1780083 - 1780018
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  1780083 attactccctctatccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 1780018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1611
Target Start/End: Original strand, 2090657 - 2090702
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaatttttt 1611  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2090657 ttactacctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttt 2090702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 985 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 29966011 - 29965978
Alignment:
Q  985 tgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtc 1018  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29966011 tgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtc 29965978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 816; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 816; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1275
Target Start/End: Original strand, 124 - 1401
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  124 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcttagggcagaccaggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggttaaggctccaatgatgcactaatggtg 223  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcat----gtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttagg 204  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||    || ||||||    
T  224 ttttgaggcagctgaccgatcattgcgtgatatcattcatgtccaagcatgatcccctaaacgcgcttaaaccttttggtggaatgaaggtagttttagg 323  T
Q  205 tggtgatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaat 304  Q
    ||||||||||||| || ||||   ||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  324 tggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaggaggaacaaggccggatattgttgatgcctcaatcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaat 423  T
Q  305 gtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaa 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  424 gtgttgaggcttactattaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggag 523  T
Q  405 acgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttataga 504  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  524 acggcaacgacgcttcggatgagaatgatgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaacccgttgatgtcacttataaa 623  T
Q  505 ctttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaac 597  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  624 ctttgtgtatcccgatctaaatgataaccttggtgaccagctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaat 723  T
Q  598 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 697  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  724 gaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaaagaaagagtatttaacctctgattctgtttgtagattgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggt 823  T
Q  698 tcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcga 797  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  824 tcacatcggaatttcttaatggtattaagagctatggaattccaaatcacaggttgaagctaaaagtgggatgtccaattatgctgatgagaaacatcga 923  T
Q  798 tcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtact 897  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||     
T  924 tcaggccaatggactgtgtaatggtactaggctgacagttacaaatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaatggcaggtacc 1023  T
Q  898 agtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatga 997  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  1024 agggtattcattcccattatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattgaggcgcaggcaatttccattgacactttgttttacaatga 1123  T
Q  998 caataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagt 1096  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||  |||| | |||||||| |||||||| |||||||    
T  1124 caataaataaaagtcagggtcaatctttatctcgagtgggggtttatcttcttaagtttgtgttcacgcatggataactttatctcgctgtctctcgagt 1223  T
Q  1097 aacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagt 1196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1224 aacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagt 1322  T
Q  1197 atgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgtttt 1275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1323 atgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgtttt 1401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1090 - 1549
Target Start/End: Original strand, 4171 - 4637
Alignment:
Q  1090 ctcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttca 1189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4171 ctcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttca 4270  T
Q  1190 aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttcta 1289  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4271 aaa-agtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctt 4369  T
Q  1290 tgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgc 1389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4370 tgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatcctcctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgc 4469  T
Q  1390 ggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgttt 1489  Q
    ||||||            ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4470 ggaacc-ttcttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcggcgttt 4568  T
Q  1490 ctgtagcccaaac----tatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||||||    
T  4569 ctgtagcccaaactatatatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcattgaccgactacgt 4637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 736; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 736; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 840
Target Start/End: Original strand, 17433 - 18263
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17433 catcatcgcttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctgcaaagttaatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 17532  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  17533 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagacctttccgtggaatgacaagagttttatgtggt 17632  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17633 gatttcaggcagctattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggctt-ttgtaatgtgt 17731  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      
T  17732 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttagcaagtggatactctcaattggagacag 17831  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 508  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17832 caacgaagcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt 17931  T
Q  509 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgat 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17932 gtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgatccgctcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgatttagttgagcatgttaacgaatatatgat 18031  T
Q  609 gtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaa 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18032 gtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgccgatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaa 18131  T
Q  709 tttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatg 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18132 tttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatg 18231  T
Q  809 gactgtgtaatggtacgaggctgacagttaca 840  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18232 gactgtgtaatggtacgaggctgacagttaca 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 597; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 597; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 885
Target Start/End: Original strand, 320909 - 321775
Alignment:
Q  26 gaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgaggcagttgatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  320909 gaaaaggatagtcctagggaagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatacatcgatggtgttttgaggcatttgatc 321008  T
Q  126 gatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcaggaagctatt 225  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  321009 gatcaatgggtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacaactttagaccttttggtggaatgacaagagttttaggtggtgatttcaggcagatatt 321108  T
Q  226 tcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaat 325  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  321109 gtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccttaatcaattcatcaacgatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacttttaat 321208  T
Q  326 atgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||  | |||||   ||    
T  321209 atgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatattctcaatttgagacggcaattatgcttcggttg 321308  T
Q  426 agaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaa 525  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  321309 ataatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacaaaacaaatccgttgatgtcacttatagactttttgtatcccgatctgaa 321408  T
Q  526 tgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgatt 618  Q
    |||||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  321409 tgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaatgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatatcgctgatt 321508  T
Q  619 ccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatg 718  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  321509 tcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcagaatttcttaatg 321608  T
Q  719 gtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaa 818  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  321609 gtattcagagctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgataagaaacctcgatcaggccaatggactgtgtaa 321708  T
Q  819 tggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaa 885  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  321709 tggtactaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaa 321775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 821 - 1527
Target Start/End: Original strand, 310067 - 310775
Alignment:
Q  821 gtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaa 920  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  310067 gtactaggctgacagttacacatatagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccagggtattcattcccaggatgaa 310166  T
Q  921 tcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaa 1020  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  310167 tcttattctgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcacaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcaggatcaa 310266  T
Q  1021 tctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagc 1119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  310267 tctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactctatgtcactgtctctcgagtaacttcaagaaaatgtctgaagc 310366  T
Q  1120 tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttaga 1219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        || |||||||||||||||||    
T  310367 tgctcatcctggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaa--------attattggttatgttttaga 310458  T
Q  1220 attgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgc 1319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  310459 attgttgttgctataatttataaaaccaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtgctggtcattatagacatgc 310558  T
Q  1320 aatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaacc---------nnnnnnnnnnnnaca 1410  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||                     |||    
T  310559 aatttctatataagcagatcctcctgtcatttactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgtgaaacctttttttttatttttttttttaca 310658  T
Q  1411 tcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatattta 1510  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  310659 tcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaacaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatattta 310758  T
Q  1511 tacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||| ||||    
T  310759 tacacacccgtataaaa 310775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 479; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 568 - 1377
Target Start/End: Original strand, 24 - 834
Alignment:
Q  568 ccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgg 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  24 ccaaggcttgattcagttgagcatgttaacgaatatacgatgtcactgatttcaggtggcgagaaagagtatttaagctctgattttgtatgtcgatcgg 123  T
Q  668 gtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtggg 767  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  124 gtgaaaattctgatttccaaaacgagtggttcacaatggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccagttgaaactaagggtggg 223  T
Q  768 atgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgct 867  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  224 atgtccggttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgct 323  T
Q  868 actataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagc 967  Q
    ||  ||||| | ||||||  ||||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||       
T  324 accgtaattactggaaaaagggcaggtaccagggtattcattcccataacgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcgcagag 423  T
Q  968 aatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcataca 1066  Q
    ||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||  ||    
T  424 aatttcctttgacgcttttttttgcaatgacaataaataaaagtcagagtcaatctttatctcaagtgggagtttatcttcctaaacccgtgttcacgca 523  T
Q  1067 tgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaat 1166  Q
    || |||||| ||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  524 tggacaactctatgtcgctatctctcgagttactactagaaaaggtttgaagttgttcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaat 623  T
Q  1167 gttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaa-ttgttgttgctataatttag-aaaactaaagttgcctattgtttg 1264  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  624 gttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagaatgatcgttggttatgttttagaatttgttgttgctataatttagaaaaactaaagttgcgtattgttgt 722  T
Q  1265 gaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattca 1363  Q
    |||||| |||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||| |    
T  723 gaagtcattt--tttttaatttctttgtaagtcgtactggtcattacaggacatgcaatttctatatatgcagatcctcctgccattgacttttaattga 820  T
Q  1364 tgcacttttcaggt 1377  Q
    | ||||||||||||    
T  821 tacacttttcaggt 834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 450; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 821 - 1527
Target Start/End: Original strand, 132250 - 132947
Alignment:
Q  821 gtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaa 920  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  132250 gtactaggctgacagttacacatatagggaagagcacgatagctgctaccgtaattacaggaaaaagggcaggtaccagggtattcattcccaggatgaa 132349  T
Q  921 tcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaa 1020  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  132350 tcttattctgagtgatccaggactacccttcaaattcaggcacaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcaggatcaa 132449  T
Q  1021 tctttatctcgagt-ggggtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagc 1119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  132450 tctttatctcgagtgggggtttatcttcctaagcctgtgttcacgcatggacaactctatgtcactgtctctcgagtaacttcaagaaaatgtctgaagc 132549  T
Q  1120 tgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttaga 1219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        || |||||||||||||||||    
T  132550 tgctcatcctggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaa--------attattggttatgttttaga 132641  T
Q  1220 attgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgc 1319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  132642 attgttgttgctataatttataaaaccaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtgctggtcattatagacatgc 132741  T
Q  1320 aatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggtta 1419  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            ||||||| ||||    
T  132742 aatttctatataagcagatcctcctgtcatttactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccacggaacc--ttttttttttacatcgttgtta 132839  T
Q  1420 ccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacaccc 1519  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  132840 ccctaaaatacaatatttacattagaccatttgttttgtaaaaattaacaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatagttatacacaccc 132939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 51719 - 51658
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  51719 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 51658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 434; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 706 - 1527
Target Start/End: Original strand, 97083 - 97902
Alignment:
Q  706 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggcta 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |    
T  97083 gaatttcttaatggtattaagagctccagcattccaaatcacaggttgaaattaagggtgggatgtccagttaggctgatgagaaacattgatcaggtca 97182  T
Q  806 atggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcagg-aaaagtggcaggtactagtgtat 904  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | || ||||  ||  ||||| || ||||    
T  97183 atggactgtgtaatggtacgaggctgatagttacacatctagggaagagcacgatagttgctatcgtaattacggggaaaaagggttggtaccagggtat 97282  T
Q  905 tcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaa 1004  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  97283 tcattctcaggatgaatcttattccgcatgatccaggactacccttcaaattcaggcgcatgcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaataaa 97382  T
Q  1005 taaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggggttt-atcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttca 1103  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||     
T  97383 taaaagtcagggtcaatttttatctcgagtgggattttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgtcgctgtctctcgagttacttct 97482  T
Q  1104 agaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatca 1203  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  97483 agaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataacgtttgcaaggagaccacgaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aaaaagtatgatca 97581  T
Q  1204 ttggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactg 1303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  97582 ttggttatgttttagagttgttgttgctataatttagaaaaccaaagttgcgtattgtttggatgtagttt--ttttttatttctttgtaagacgtactg 97679  T
Q  1304 gtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnn 1402  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||            
T  97680 gtcattacaggacatacaatttctatataagcaggtcctcctgccattgacttttaactgatgcatttttcaggtataacaatacgcgaaac--tttttt 97777  T
Q  1403 nnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaac 1502  Q
         | ||||| |||||| |||||||  ||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97778 tttttaaatcgttgttaccctaaaatataatatttatattagaccattggttttttaaaaaataaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaac 97877  T
Q  1503 tatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  97878 tatatttatacacacccataaaaaa 97902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Original strand, 47640 - 47702
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  47640 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataagac 47702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 412; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 707 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 126187 - 125363
Alignment:
Q  707 aatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaa 806  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  126187 aattttttaatggtattaagagctctgacgttccaaatcacaggttgaaaataagggtgggatttccagttatgttgatgagaaacatcgatcagaccaa 126088  T
Q  807 tggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattc 906  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||  ||  ||||| || ||||||    
T  126087 tggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctaggaaagagcacgatagttgctaccgtaattacgggaaaaagggttggtaccagggtattc 125988  T
Q  907 attcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaata 1006  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  125987 attcccaggatgaatcttatttcgagtgatccaggactacctttcaaattcaagcgcaagcaattttcattaacgctttgttttgcaatgacaataaata 125888  T
Q  1007 aaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaag 1105  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||| | |||  ||||| | ||||| ||    
T  125887 aaagtcagggtcaatctttatcttgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatggacaactctatgttgttgtttctcgatttacttctag 125788  T
Q  1106 aaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcatt 1205  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  125787 aaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttc-aataagtatgatcatt 125689  T
Q  1206 ggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttattttta-------atttctatgtaaggcg 1298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||       |||||| ||||| | |    
T  125688 ggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaaccaaagttgcgtgttgttcggaagtcgttttttttttatttttttatttctttgtaaagtg 125589  T
Q  1299 tactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnn 1397  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |  | ||||||| |||||| || ||||||||| |  ||||||| ||||||||       
T  125588 taatggtcattacaggacatgcaatttctatataagcaggtcctccatctattgacttttaattgatacacttttcatgaataacaatacgcggaac--- 125492  T
Q  1398 nnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcc 1497  Q
              ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  125491 -tttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatacttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcc 125393  T
Q  1498 caaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125392 caaactatatttatacacacccgtaaaaaa 125363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 467 - 1121
Target Start/End: Complemental strand, 16889 - 16227
Alignment:
Q  467 atatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgct-------caagaaaggggaa 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||    
T  16889 atatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaa 16790  T
Q  560 tactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttg 659  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  16789 tactcgcaccaacgcttaatttagtggagtatgttaacgcatatatgatttcactgattctaggtgaagagaaagagtttttaagctatgattctgtttt 16690  T
Q  660 tcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaacta 759  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16689 tcaatcgagcgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatgaccggttgaaacta 16590  T
Q  760 agggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacga 859  Q
    ||| | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16589 agg-taggatgtccacttatgcttctgagaaacatcgatcaggccaatgaattgtgcaatggtacaaggctgaaagttacacatctaggaaagagcacga 16491  T
Q  860 tagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcag 959  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||  |||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  16490 tagttgctaccgtaattacaggaaaaagggcaagtaccaaggtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgattcaagactacccttcaaattcag 16391  T
Q  960 gtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtg 1058  Q
    | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16390 gcgcaggcaatttccattgacgctttgttttgcaatgacaatgaataaaagtcagggtcaatatttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtg 16291  T
Q  1059 ttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttca-agaaaaggtctgaagctg 1121  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  16290 ttcatgcatggacaactctatgtcgttgtctctcgagttatttcatagaaaaggtttgaagctg 16227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1115 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 14038 - 13632
Alignment:
Q  1115 gaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaa-gtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgt 1213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14038 gaagctgctcatcttggatgaagataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaaagtttttcaaaaa-gtatgatcattggttatgt 13940  T
Q  1214 tttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata- 1312  Q
    ||| ||    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  13939 ttttga----tcgttgctataatttagaaaactaaagttgcgtattgtttggaagtcgtttt-ttttcaatttctttgtaaggcgtactggtcattacag 13845  T
Q  1313 gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatc 1412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||| || | ||||||| ||||||||             ||||     
T  13844 gacatgcaatttctatataagcagatcctcctaccattgacttttaatttatgcaatttttagctataacaatacgcggaac----tttttttttacatt 13749  T
Q  1413 gtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgt--aaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatattta 1510  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13748 gttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccattgattttgtaaaaaaaataaaaataaataacaatcggcgtttctgtagcctaaactatattta 13649  T
Q  1511 tacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||||| |||||||    
T  13648 tacacacccataaaaaa 13632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 65674 - 65612
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  65674 tactccctccgtccctaattataagacctttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 65612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 771 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 1575 - 824
Alignment:
Q  771 tccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatctagggaagagcacgatagttgctact 870  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||     
T  1575 tccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggactgtgtaatggtacaaggctgacagttacacatgtagggaatagcacgatag---ctacc 1479  T
Q  871 ataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactatccttcaaattcaggtgcaagcaat 970  Q
     ||||| ||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||  ||||    
T  1478 gtaattacaggaaaaacggcaggtaccaaggtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactacccttcaaattcatgcacagacaat 1379  T
Q  971 ttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtggg-gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatga 1069  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||     
T  1378 ttccatcgacgctttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatttttatctcgagtgggagtttatcttcctaagcccgtgttcacgcatgg 1279  T
Q  1070 acaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaagataataatgtttgtaaggagaccacaaatgtt 1169  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1278 gcaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctataaaaggtttgaagctattcatcttggatgaagataataatgtttgcaacgagaccacaaatgtt 1179  T
Q  1170 gtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagt 1269  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  1178 gtgtatcgtgaagtttttc-agaaagtatgattattgattatgtttttgaattgctattgctataatttagaaaactaaagttgcgtattgattgaaagt 1080  T
Q  1270 cgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcac 1368  Q
     | ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||    
T  1079 tggttt-tttttaatttctttgtaaggcgtactgatcattacaggacatgcaatttctatataagcagatcctcctgcctttgacttttaattgatgcac 981  T
Q  1369 ttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaa 1468  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||             ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  980 tttgcaggtataacaatacgcggaac--ttcttttttttacatcgttgttaccctaaaatacaatatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaa 883  T
Q  1469 aacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  882 aataaataacaatcggcgtttctgttgcccaaattatatttgtacacacccgtaaaaaa 824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 610 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 1703 - 1572
Alignment:
Q  610 tcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaat 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1703 tcactgattccaggtgaagagaaagcgtatttaaactctgattatgtttatcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagcgagtggttcacaacggaat 1604  T
Q  710 ttcttaatggtattaagagctctagaattcca 741  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1603 ttcttaatggtattaagagcactagaattcca 1572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 547 - 1110
Target Start/End: Original strand, 28735 - 29299
Alignment:
Q  547 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagct 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28735 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaaaagtatttaaact 28834  T
Q  647 ttgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatca 746  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28835 ctgattctgtttgtcgcttgggtgaaaattttgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatca 28934  T
Q  747 ccggttgaaactaagggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggctaatggactgtgtaatggtacgaggctgacagttacacatcta 846  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28935 ccggttgaaactaaaggtgggatgtccagttatgctgatgagaaacatcgatcaggccaatggattgtgtaatggtacaagactgacagttacacatcta 29034  T
Q  847 gggaagagcacgatagttgctactataatttcaggaaaagtggcaggtactagtgtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactat 946  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29035 gggaagagcacaatagctgctaccgtaattacaggaaaaaaggcaggtaccaaggtattcattcccaggatgaatcttattccgagtgatccaggactac 29134  T
Q  947 ccttcaaattcaggtgcaagcaatttccattgatgcgttgttttgcaatgacaataaataaaagtgagggtcaatctttatctcgagtg-gggtttatct 1045  Q
    |||||||||||| | |||   |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  29135 ccttcaaattcatgcgcagataatttccattgacgttttgttttgcaatgacaataaataaaagtcagggtcaatatttatctcgagtgtgagtttatct 29234  T
Q  1046 tcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaag 1110  Q
    ||||||||| |||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  29235 tcctaagcccgtgttcacgcatgggcaactctatgtcgctgtctctcgagttacttctagaaaag 29299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 461
Target Start/End: Original strand, 28275 - 28727
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28275 catcatcgcttacgatggaaaaggatagtcctagggcagacctggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccattgatgcactgatggtg 28374  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || || |||||||    
T  28375 ttttgaggcagttgaccgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgacaatagtttaaggtggt 28474  T
Q  209 gatttcaggaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgt 308  Q
    ||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||    
T  28475 gatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaagatatgtgcttattttaatgagt 28574  T
Q  309 tgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacga 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||      
T  28575 tgagacttactgttaatatgagattggatgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaagtggatactctgaattgaagacag 28674  T
Q  409 caacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctaaagatt 461  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28675 caacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 28727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1190 - 1549
Target Start/End: Original strand, 29306 - 29676
Alignment:
Q  1190 aaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttattttt-------- 1281  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||| | |||||            
T  29306 aaaaagtatgatcattggttatattttagaattgttgttgctataatttagaaaactaaagttgcgaattgattgaaagttgttgtttttttttttaaaa 29405  T
Q  1282 aatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaa 1381  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29406 aaattctttgtaaggcgtactgttcattatagacatgcaatttctatataagcagatcttcctgccattgactattaattcatgcatttttcaggtttaa 29505  T
Q  1382 caatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttacct-taaaatacgatatttacattaaaccatttgtttt-gtaaaaattaaaaacaaataaca 1479  Q
    |||||||| |||||            ||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29506 caatccgcagaaccttttttttt---acatcgttgttacccctaaaatacaagatttacattagaccatttgtttttgtaaaaattaaaaacaaataaca 29602  T
Q  1480 atcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  29603 atcggtgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 29676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 252; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1038 - 1527
Target Start/End: Complemental strand, 23969 - 23484
Alignment:
Q  1038 gtttatcttcctaagcctgtgttcatacatgaacaactttatgtcgctgtcactcgagtaacttcaagaaaaggtctgaagctgctcatcctggatgaag 1137  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||||| |||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23969 gtttatcttcctaagtccatgttcacgcatggacaactctatgtcactatctctcgagttacttctagaaaaggtttgaagctgctcatcttggatgaag 23870  T
Q  1138 ataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataatt 1237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23869 ataataatgtttgcaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattattgttgctataatt 23770  T
Q  1238 tagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattata-gacatgcaatttctatataagcag 1336  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23769 tagaaaactaaagttg-gtattgtttggaagtcgttt--ttttttatttctttgtaaggtgtactggtcattacaggacatgcaatttctatataagcag 23673  T
Q  1337 atccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaatccgcggaaccnnnnnnnnnnnnacatcgtggttaccttaaaatacgatatt 1436  Q
    ||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||             |||| || |||||| |||||||| |||||    
T  23672 atcctcttgccattgacttttaattgatgcacttttcaggtataacaatacacggaac--tttttttttttacattgttgttaccctaaaatacaatatt 23575  T
Q  1437 tacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23574 tacattagaccattgattttgtaaaaaataaaaacaaataacaatcaacgtttttgaagcccaaactatatttatacatacccgtaaaaaa 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 202; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 338
Target Start/End: Original strand, 13841 - 14162
Alignment:
Q  17 cttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtgttttgagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13841 cttacgatggaaaaggatagtcttagggcagacctggtgcgtgctgcaaagatgataatttgggatgaggctccaatgatgcactaatggtgttttgagg 13940  T
Q  117 cagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggtgatttcag 216  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  13941 cagttgacagatcaatgagtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttaaaccatttggtggaatgataatagttttaggtggtgatttcag 14040  T
Q  217 gaagctatttcatgtggtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggctt 316  Q
    | || |||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  14041 gcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaagatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaatatatgggcttattttaatatgttgaggctt 14140  T
Q  317 actgttaatatgagattgggtg 338  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  14141 actattaatatgagattgggtg 14162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1137 - 1372
Target Start/End: Complemental strand, 34492 - 34258
Alignment:
Q  1137 gataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtatatcgtgaagtttttcaaaaaagtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataat 1236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34492 gataataatgtttgtaaggagaccacaaatgttgtgtatcgtgatgtttttcaaaaa-gtatgatcattggttatgttttagaattgttgttgctataat 34394  T
Q  1237 ttagaaaactaaagttgcctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctatgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcag 1336  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393 ttataaaactaaagttgtctattgtttggaagtcgttttatttttaatttctttgtaaggcgtactggtcattatagacatgcaatttctatataagcag 34294  T
Q  1337 atccctctgccattgactattaattcatgcactttt 1372  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34293 atcctcctgccattgactattaattcatgcactttt 34258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 244 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 40184 - 39937
Alignment:
Q  244 aacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatct 343  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40184 aacgaggccggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgtgtgcatct 40085  T
Q  344 tcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctcaattggaaacgacaacgacgcttcatatgagaatggtgaaatgaagg 443  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  40084 tcggtacctacagagcaggaagaaattgctaactttggcaagtgaatactctcaattggagatggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaataaagg 39985  T
Q  444 tagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttga 491  Q
    ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39984 tagaaattcttgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttga 39937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42638 - 42434
Alignment:
Q  9 catcatcacttacaatggaaaaggatagtcctagggaagaactggtgcgtgctggaaagttgatagtttgggatgaggctccaatgatgcaccgatggtg 108  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42638 catcatcgcttaagatggaaaaggatagtcttagggcatacttggtgcgtgctgcaaagttgataatttgggatgaggctccaatgatgcactgatggtg 42539  T
Q  109 ttttgaggcagttgatcgatcaatgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgagtttagaccttttcgtggaatgacaagagatttaggtggt 208  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  42538 ttttgaggcagttgaccgatcattgcgtgatatcatgtccaagaatgatcccctaaacgtgcttaaaccttttggtggaatgacagtagttttaggtggt 42439  T
Q  209 gattt 213  Q
    |||||    
T  42438 gattt 42434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Original strand, 48653 - 48718
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa--attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||    
T  48653 ttactacctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttttgtacctttttataagacc 48718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 72; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1459 - 1549
Target Start/End: Complemental strand, 10352 - 10257
Alignment:
Q  1459 aaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaa-----aaacgtttgcatttaccgactacgt 1549  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||    
T  10352 aaaaattaaaaacaaataacaatcggcgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaattaaacgtttgcatttaccgactacgt 10257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1370 (Bit Score: 68; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold1370
Description:

Target: scaffold1370; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1432 - 1527
Target Start/End: Original strand, 1170 - 1265
Alignment:
Q  1432 atatttacattaaaccatttgttttgtaaaaattaaaaacaaataacaatcgacgtttctgtagcccaaactatatttatacacacccgtaaaaaa 1527  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1170 atatttacattagaccattggttttgtaaaaaataaaaacaaagaacaatcagcgtttctgtagcccaaactatatttatacacacctgtaaaaaa 1265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1370; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1313 - 1384
Target Start/End: Original strand, 1081 - 1152
Alignment:
Q  1313 gacatgcaatttctatataagcagatccctctgccattgactattaattcatgcacttttcaggtttaacaa 1384  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  1081 gacatgcaattttcatataaacagatccttctacaattgacttttaattgatgaacttttcaggtataacaa 1152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 47; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 3819 - 3757
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3819 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 3757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 47; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Original strand, 12065 - 12127
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12065 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 12127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1600
Target Start/End: Complemental strand, 12361 - 12328
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttg 1600  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12361 tactccctccgtccctaattataaaacccttttg 12328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 45; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 5149 - 5213
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5149 attactacctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 5213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 45; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 10221 - 10157
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10221 attactacctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 10157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 45; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 18495 - 18559
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18495 attactacctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 18559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 45; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1565 - 1629
Target Start/End: Original strand, 3436 - 3500
Alignment:
Q  1565 attactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3436 attactacctccgtccctaattataagacccttttgagaatttttttgtccctttttataagacc 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 38; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 259159 - 259098
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataaga 1627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  259159 tactccctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccctttttataaga 259098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 36; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 14385 - 14322
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttt-tatccctttttataagacc 1629  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  14385 tactccctccgtccttaattataagacccttttgagaattttttctgtccctttttataagacc 14322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0649 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0649
Description:

Target: scaffold0649; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1572 - 1629
Target Start/End: Complemental strand, 4330 - 4272
Alignment:
Q  1572 cctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  4330 cctccgtccctgattataagactcttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 4272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 33; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Original strand, 117845 - 117909
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  117845 ttacttcctccgtccctaattataagatccttttgagaattttttttgtccctttttataagacc 117909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 7178 - 7115
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaa-attttttatccctttttataagac 1628  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  7178 ttacttcctccgtccctaattataagacccttttgagaattttttttgtccatttttataagac 7115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1629
Target Start/End: Original strand, 45671 - 45734
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagacc 1629  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  45671 ttactacctccgtctctaattataagacccttttaagaatttttttgtccatttttataagacc 45734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1567 - 1628
Target Start/End: Complemental strand, 1483 - 1422
Alignment:
Q  1567 tactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataagac 1628  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||    
T  1483 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaattttttttgtccctttttatgagac 1422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1566 - 1627
Target Start/End: Complemental strand, 104099 - 104038
Alignment:
Q  1566 ttactccctccgtccctgattataaaacccttttgagaaattttttatccctttttataaga 1627  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  104099 ttactacctccgtccctaattataagatctttttgagaatttttttgtctctttttataaga 104038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University