View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19789_high_5 (Length: 343)

Name: NF19789_high_5
Description: NF19789
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19789_high_5
NF19789_high_5
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (24-343)||(2043-2362)
scaffold0234 (24-343)||(10934-11253)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (24-343)||(21940831-21941150)
chr8 (24-343)||(22171653-22171972)
chr8 (24-343)||(6094289-6094608)
chr8 (24-343)||(24642815-24643133)
chr8 (82-343)||(15326422-15326683)
chr8 (82-343)||(15506791-15507052)
chr8 (204-343)||(28548393-28548532)
chr8 (35-278)||(14983710-14983950)
chr8 (33-230)||(24797224-24797419)
chr8 (30-329)||(38232115-38232412)
chr8 (30-343)||(8371255-8371563)
chr8 (38-343)||(21969333-21969633)
chr8 (38-343)||(12562123-12562423)
chr8 (38-343)||(27007519-27007819)
chr8 (38-343)||(27014662-27014962)
chr8 (38-343)||(27880489-27880789)
chr8 (38-343)||(28020670-28020970)
chr8 (38-343)||(22130611-22130911)
chr8 (38-343)||(25611195-25611495)
chr8 (39-343)||(22659496-22659795)
chr8 (38-343)||(21916676-21916976)
chr8 (38-343)||(45534275-45534575)
chr8 (30-243)||(18835342-18835551)
chr8 (38-343)||(26240484-26240784)
chr8 (114-328)||(8781892-8782102)
chr8 (26-165)||(32872741-32872880)
chr8 (106-343)||(6430953-6431186)
chr8 (61-236)||(2375214-2375386)
chr8 (238-335)||(24796731-24796826)
chr8 (41-135)||(29645537-29645631)
chr8 (106-343)||(2962934-2963171)
chr8 (183-329)||(20535226-20535371)
chr8 (38-145)||(36970265-36970371)
chr8 (85-137)||(10920427-10920479)
chr8 (285-333)||(41368106-41368154)
chr8 (285-333)||(41375077-41375125)
chr8 (57-112)||(24535514-24535569)
chr8 (24-59)||(28555049-28555084)
chr8 (112-171)||(34659059-34659118)
chr8 (196-241)||(29645675-29645720)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (24-343)||(17684191-17684510)
chr6 (24-343)||(27380974-27381293)
chr6 (24-343)||(27471357-27471676)
chr6 (24-343)||(11651889-11652208)
chr6 (24-343)||(17691162-17691481)
chr6 (24-343)||(29309056-29309375)
chr6 (24-343)||(29316016-29316334)
chr6 (24-343)||(188699-189018)
chr6 (106-343)||(27296877-27297114)
chr6 (72-343)||(16394167-16394438)
chr6 (104-341)||(25536915-25537152)
chr6 (123-343)||(16559194-16559414)
chr6 (20-328)||(13359010-13359314)
chr6 (24-128)||(16566257-16566361)
chr6 (38-343)||(16789071-16789371)
chr6 (38-343)||(22859890-22860190)
chr6 (38-343)||(27508349-27508649)
chr6 (38-343)||(1586110-1586410)
chr6 (38-331)||(27527947-27528235)
chr6 (41-335)||(2669476-2669768)
chr6 (38-204)||(18019981-18020143)
chr6 (38-343)||(14074480-14074780)
chr6 (39-167)||(27925935-27926062)
chr6 (30-323)||(10359073-10359359)
chr6 (39-242)||(17850321-17850521)
chr6 (56-161)||(28172754-28172859)
chr6 (38-343)||(8612915-8613219)
chr6 (30-162)||(20553492-20553622)
chr6 (108-260)||(20736413-20736562)
chr6 (91-276)||(8510155-8510338)
chr6 (52-173)||(19347092-19347212)
chr6 (37-217)||(22560311-22560487)
chr6 (106-241)||(21994655-21994787)
chr6 (24-76)||(25537148-25537200)
chr6 (38-133)||(13995151-13995245)
chr6 (36-245)||(19218427-19218627)
chr6 (113-172)||(5758650-5758709)
chr6 (189-328)||(28756145-28756283)
chr6 (106-343)||(17120507-17120740)
chr6 (204-267)||(28172899-28172963)
chr6 (36-245)||(4073574-4073778)
chr6 (232-343)||(33317055-33317165)
chr6 (38-74)||(20736594-20736630)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (24-343)||(18262378-18262697)
chr4 (24-343)||(18269239-18269558)
chr4 (24-343)||(55612849-55613168)
chr4 (24-343)||(26963806-26964125)
chr4 (24-343)||(26970629-26970948)
chr4 (24-343)||(868763-869082)
chr4 (24-343)||(19926482-19926801)
chr4 (24-343)||(5707486-5707805)
chr4 (24-343)||(5714114-5714433)
chr4 (24-343)||(8858333-8858652)
chr4 (24-343)||(10621055-10621374)
chr4 (30-343)||(10628134-10628447)
chr4 (24-343)||(28392856-28393175)
chr4 (24-343)||(8845369-8845688)
chr4 (24-343)||(4426338-4426645)
chr4 (30-343)||(35223732-35224045)
chr4 (34-343)||(5667851-5668156)
chr4 (24-343)||(20311458-20311775)
chr4 (113-340)||(10677308-10677534)
chr4 (113-340)||(10890948-10891174)
chr4 (38-343)||(15461497-15461797)
chr4 (38-343)||(34975551-34975851)
chr4 (38-343)||(2677013-2677313)
chr4 (38-343)||(15815021-15815321)
chr4 (38-343)||(18111045-18111345)
chr4 (34-170)||(56516232-56516368)
chr4 (38-343)||(3369025-3369325)
chr4 (38-327)||(17299977-17300261)
chr4 (38-343)||(18163162-18163462)
chr4 (38-343)||(20243937-20244237)
chr4 (94-244)||(21453961-21454110)
chr4 (38-343)||(26531613-26531913)
chr4 (38-343)||(4675985-4676285)
chr4 (39-343)||(5870419-5870718)
chr4 (38-329)||(19365519-19365806)
chr4 (38-343)||(1941724-1942024)
chr4 (59-332)||(32646536-32646807)
chr4 (38-243)||(32636484-32636685)
chr4 (30-329)||(5616387-5616681)
chr4 (106-328)||(19362477-19362695)
chr4 (42-120)||(24700213-24700291)
chr4 (106-329)||(5528495-5528714)
chr4 (38-260)||(4546080-4546298)
chr4 (113-343)||(9487625-9487851)
chr4 (125-343)||(30040491-30040705)
chr4 (113-329)||(9538033-9538244)
chr4 (85-212)||(34777850-34777975)
chr4 (217-267)||(24701361-24701411)
chr4 (94-245)||(33888594-33888740)
chr4 (30-82)||(10677538-10677590)
chr4 (30-82)||(10891178-10891230)
chr4 (128-343)||(11421096-11421307)
chr4 (26-96)||(9937933-9938003)
chr4 (38-74)||(11421016-11421052)
chr4 (30-74)||(30040740-30040784)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (24-343)||(6110230-6110549)
chr3 (24-343)||(16482205-16482524)
chr3 (24-343)||(10579077-10579396)
chr3 (24-343)||(15600606-15600925)
chr3 (24-343)||(15607151-15607470)
chr3 (24-343)||(10572314-10572633)
chr3 (24-343)||(18520141-18520460)
chr3 (31-341)||(18522836-18523146)
chr3 (39-343)||(8490676-8490980)
chr3 (24-343)||(15357308-15357627)
chr3 (24-343)||(17780840-17781159)
chr3 (24-343)||(13211468-13211787)
chr3 (24-343)||(15341941-15342260)
chr3 (30-343)||(13248779-13249092)
chr3 (24-343)||(32056621-32056941)
chr3 (24-343)||(17199906-17200225)
chr3 (24-343)||(13516977-13517292)
chr3 (30-343)||(1647243-1647556)
chr3 (24-343)||(17136525-17136838)
chr3 (24-343)||(29925137-29925456)
chr3 (24-343)||(29974290-29974609)
chr3 (55-343)||(16200627-16200915)
chr3 (38-343)||(21034238-21034538)
chr3 (38-343)||(15846538-15846838)
chr3 (38-343)||(20147556-20147856)
chr3 (30-278)||(24253179-24253423)
chr3 (38-343)||(14890391-14890691)
chr3 (38-343)||(21398792-21399092)
chr3 (38-343)||(55427021-55427321)
chr3 (38-343)||(12299911-12300210)
chr3 (106-343)||(25978730-25978963)
chr3 (30-245)||(14147013-14147224)
chr3 (113-303)||(15526827-15527013)
chr3 (24-76)||(19089734-19089786)
chr3 (79-271)||(32280313-32280507)
chr3 (106-173)||(11787654-11787721)
chr3 (77-206)||(28953965-28954093)
chr3 (30-123)||(9504455-9504548)
chr3 (41-343)||(15317178-15317472)
chr3 (187-343)||(28088251-28088406)
chr3 (34-149)||(8251933-8252048)
chr3 (24-97)||(16200291-16200363)
chr3 (192-301)||(30464147-30464255)
chr3 (184-245)||(36138036-36138097)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (24-343)||(18252196-18252515)
chr1 (24-343)||(18532236-18532555)
chr1 (24-343)||(27131132-27131450)
chr1 (24-343)||(27310299-27310618)
chr1 (24-343)||(16358757-16359076)
chr1 (30-343)||(3855641-3855954)
chr1 (30-336)||(36816363-36816668)
chr1 (64-343)||(22641596-22641871)
chr1 (30-343)||(27277280-27277592)
chr1 (24-217)||(21171081-21171274)
chr1 (24-178)||(22657108-22657262)
chr1 (38-343)||(19706441-19706741)
chr1 (38-343)||(43802367-43802667)
chr1 (30-267)||(12014084-12014319)
chr1 (54-343)||(23507096-23507383)
chr1 (38-343)||(28134725-28135025)
chr1 (38-343)||(9456116-9456416)
chr1 (38-343)||(20391241-20391541)
chr1 (38-343)||(20779647-20779947)
chr1 (38-343)||(22670259-22670559)
chr1 (38-343)||(42816991-42817291)
chr1 (153-343)||(9916499-9916688)
chr1 (38-343)||(22612492-22612792)
chr1 (29-325)||(633925-634216)
chr1 (31-147)||(9917837-9917952)
chr1 (38-343)||(8727667-8727967)
chr1 (38-147)||(47667668-47667776)
chr1 (38-170)||(35930582-35930713)
chr1 (54-143)||(12006461-12006550)
chr1 (113-245)||(21881475-21881604)
chr1 (106-258)||(29096789-29096938)
chr1 (46-172)||(26923553-26923678)
chr1 (113-166)||(51997353-51997406)
chr1 (187-343)||(47667487-47667642)
chr1 (232-343)||(28145725-28145835)
chr1 (198-278)||(12006332-12006413)
chr1 (93-236)||(24301713-24301855)
chr1 (184-243)||(10852402-10852461)
chr1 (287-343)||(35132342-35132398)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (24-341)||(15152609-15152926)
chr7 (24-343)||(29327950-29328269)
chr7 (24-343)||(11535784-11536103)
chr7 (24-343)||(11542702-11543021)
chr7 (19-343)||(12750987-12751311)
chr7 (24-343)||(12738702-12739021)
chr7 (24-343)||(18561173-18561483)
chr7 (34-343)||(13392326-13392635)
chr7 (33-333)||(18257577-18257874)
chr7 (38-343)||(2204552-2204852)
chr7 (38-343)||(8464999-8465299)
chr7 (38-343)||(18400104-18400404)
chr7 (38-343)||(18407088-18407388)
chr7 (38-343)||(48808498-48808798)
chr7 (38-333)||(30254138-30254428)
chr7 (38-343)||(15729751-15730051)
chr7 (38-343)||(18139340-18139640)
chr7 (38-343)||(19230888-19231188)
chr7 (105-327)||(2365169-2365389)
chr7 (106-343)||(41680970-41681203)
chr7 (38-333)||(47166871-47167161)
chr7 (38-343)||(10668903-10669204)
chr7 (57-170)||(10235361-10235474)
chr7 (39-323)||(24443349-24443628)
chr7 (36-323)||(25845498-25845780)
chr7 (36-323)||(25845917-25846199)
chr7 (38-343)||(28130561-28130861)
chr7 (30-260)||(19388544-19388774)
chr7 (38-301)||(19393468-19393726)
chr7 (39-147)||(47833875-47833983)
chr7 (24-79)||(15148308-15148363)
chr7 (113-343)||(34128647-34128873)
chr7 (43-161)||(7662569-7662686)
chr7 (29-138)||(19859113-19859221)
chr7 (106-343)||(18259126-18259359)
chr7 (120-245)||(31190538-31190660)
chr7 (113-245)||(14591924-14592053)
chr7 (113-245)||(16011515-16011644)
chr7 (113-245)||(22969024-22969153)
chr7 (197-334)||(39112138-39112275)
chr7 (30-116)||(7396361-7396450)
chr7 (33-171)||(3132849-3132986)
chr7 (196-271)||(22948499-22948574)
chr7 (72-127)||(29983179-29983234)
chr7 (35-138)||(39111989-39112092)
chr7 (34-76)||(2365070-2365112)
chr7 (103-145)||(7396469-7396511)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (30-343)||(24695188-24695501)
chr5 (24-343)||(19714220-19714539)
chr5 (24-343)||(19706941-19707259)
chr5 (24-343)||(18569583-18569904)
chr5 (24-223)||(39538754-39538953)
chr5 (54-339)||(17298627-17298912)
chr5 (54-339)||(17285476-17285759)
chr5 (30-258)||(18806843-18807069)
chr5 (183-343)||(27347258-27347417)
chr5 (35-169)||(22546912-22547046)
chr5 (238-343)||(24701952-24702057)
chr5 (38-343)||(20941027-20941327)
chr5 (38-343)||(25805387-25805687)
chr5 (38-343)||(31899-32199)
chr5 (38-343)||(12789665-12789965)
chr5 (38-343)||(22941250-22941550)
chr5 (38-343)||(23545922-23546222)
chr5 (38-343)||(24933308-24933608)
chr5 (40-333)||(20100255-20100543)
chr5 (38-343)||(31096816-31097116)
chr5 (38-332)||(5097651-5097940)
chr5 (38-343)||(12764992-12765296)
chr5 (38-343)||(7865432-7865736)
chr5 (120-258)||(18806483-18806619)
chr5 (120-258)||(18806663-18806799)
chr5 (30-118)||(27347425-27347513)
chr5 (38-343)||(9811735-9812039)
chr5 (38-343)||(12703876-12704180)
chr5 (96-343)||(18829283-18829530)
chr5 (260-343)||(28719477-28719558)
chr5 (38-343)||(26245102-26245402)
chr5 (106-343)||(26129695-26129928)
chr5 (264-343)||(39538954-39539033)
chr5 (41-170)||(33477193-33477321)
chr5 (39-83)||(39535465-39535509)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (24-343)||(7273-7592)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (24-343)||(6656-6975)
scaffold0390 (24-343)||(13672-13991)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (24-343)||(18454-18772)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (24-343)||(25712-26031)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (24-343)||(21329970-21330289)
chr2 (24-343)||(18796672-18796991)
chr2 (30-336)||(18619976-18620281)
chr2 (30-343)||(36270338-36270648)
chr2 (74-336)||(20978091-20978351)
chr2 (24-333)||(18822249-18822556)
chr2 (30-331)||(22183220-22183518)
chr2 (33-331)||(6991847-6992146)
chr2 (38-343)||(30174377-30174677)
chr2 (38-343)||(24250034-24250334)
chr2 (38-343)||(24229217-24229517)
chr2 (39-168)||(18851956-18852085)
chr2 (30-170)||(19279460-19279600)
chr2 (106-333)||(15342014-15342237)
chr2 (39-329)||(29800468-29800757)
chr2 (182-316)||(17241034-17241167)
chr2 (44-147)||(36801899-36802003)
chr2 (38-260)||(19616435-19616653)
chr2 (113-245)||(40301036-40301164)
chr2 (40-147)||(28741220-28741326)
chr2 (278-340)||(41661694-41661756)
chr2 (113-245)||(21626824-21626952)
chr2 (198-278)||(36799745-36799826)
chr2 (115-320)||(41316305-41316506)
chr2 (30-147)||(24763751-24763867)
chr2 (34-74)||(12098609-12098649)
chr2 (184-260)||(28740910-28740986)
chr2 (109-172)||(28718943-28719006)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (24-326)||(1159-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (24-343)||(5695-6007)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (89-343)||(230113-230367)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (38-343)||(183-483)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (38-343)||(3677-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (38-343)||(119730-120030)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (38-333)||(12961-13251)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (38-301)||(130268-130526)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (38-343)||(67376-67676)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (38-245)||(8305-8508)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (38-343)||(39990-40290)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (106-343)||(26609-26842)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (30-161)||(90019-90151)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (30-317)||(8723-9005)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (113-343)||(11528-11758)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (155-343)||(102-286)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (113-243)||(83116-83243)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (77-168)||(45956-46051)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (39-204)||(53766-53927)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (30-74)||(15089-15133)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2362 - 2043
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2362 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 2263  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 2163  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2162 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 2063  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2062 gatgggtactccatgaatca 2043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11253 - 10934
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11253 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11154  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11153 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 11054  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11053 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10954  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10953 gatgggtactccatgaatca 10934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 21940831 - 21941150
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940831 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21940930  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21941030  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21941031 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 21941130  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21941131 gatgggtactccatgaatca 21941150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 22171653 - 22171972
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22171653 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcatagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 22171752  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171753 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 22171852  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22171853 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 22171952  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22171953 gatgggtactccatgaatca 22171972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 6094289 - 6094608
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094289 atcattaaagcatagagactattatatgggtagagtgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6094388  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094389 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6094488  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6094489 cacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggtt 6094588  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6094589 gatgggtactccatgaatca 6094608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 24642815 - 24643133
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642815 atcattaaagtatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 24642914  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24642915 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactacatagtaaaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 24643013  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24643014 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggtt 24643113  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24643114 gatgggtactccatgaatca 24643133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 82 - 343
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326683
Alignment:
Q  82 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttata 181  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  182 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  282 cattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 15326683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 82 - 343
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507052
Alignment:
Q  82 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttata 181  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  182 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  282 cattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 15507052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 204 - 343
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548532
Alignment:
Q  204 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  304 tgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 28548532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14983950 - 14983710
Alignment:
Q  35 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 134  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  14983950 atagggactattatgtgggtagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-t 14983852  T
Q  135 tatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcga 233  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  14983851 tatattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcga 14983755  T
Q  234 cctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 278  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  14983754 cctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactttgt 14983710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24797419 - 24797224
Alignment:
Q  33 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 132  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||||||  ||||||||  | ||||||||| || | ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |    
T  24797419 gcatagagactattatgtgagtatattgatgactacatctcatgggtcatggatatag-gatatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaa 24797321  T
Q  133 tttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 230  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797320 tttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 38232412 - 38232115
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | |||    
T  38232412 aaagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcacatctcacggatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggta 38232313  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||  ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||    
T  38232312 atatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaagttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcc 38232216  T
Q  229 ttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgg 328  Q
    |  ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||||| ||||||   | | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38232215 tcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactttgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatgg 38232116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8371563 - 8371255
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  8371563 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaagagta 8371465  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||    
T  8371464 atatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctct 8371368  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    | |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |||||  |||| |||||||||||||    
T  8371367 tagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatggg 8371269  T
Q  330 tactccatgaatca 343  Q
    ||||  ||||||||    
T  8371268 tacttgatgaatca 8371255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 21969333 - 21969633
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969333 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggatcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21969431  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21969432 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21969528  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21969529 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21969627  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  21969628 gaatca 21969633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 12562123 - 12562423
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12562123 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 12562221  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  12562222 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 12562318  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12562319 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 12562417  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  12562418 gaatca 12562423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27007819 - 27007519
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007819 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27007721  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27007720 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27007624  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27007623 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27007525  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  27007524 gaatca 27007519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27014962 - 27014662
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014962 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27014864  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27014863 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27014767  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27014766 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27014668  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  27014667 gaatca 27014662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27880789 - 27880489
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27880789 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 27880691  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27880690 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27880594  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  27880593 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 27880495  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  27880494 gaatca 27880489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28020970 - 28020670
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28020970 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28020872  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  28020871 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 28020775  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  28020774 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 28020676  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  28020675 gaatca 28020670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22130911 - 22130611
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22130813  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22130812 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 22130716  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22130715 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22130617  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  22130616 gaatca 22130611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 25611195 - 25611495
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611195 gagactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25611293  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  ||| ||| ||||||    
T  25611294 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaactgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcactcttagacctg 25611390  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||  ||||||||||||| |||  ||    
T  25611391 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgggcacttgat 25611489  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  25611490 gaatca 25611495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22659795 - 22659496
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22659795 agactattatgtatgtagactgatgactgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatgtata 22659697  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 238  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||    
T  22659696 ctggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctga 22659600  T
Q  239 aaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatg 338  Q
    ||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  |||    
T  22659599 aaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatg 22659501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 21916676 - 21916976
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21916676 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatgcatagatataaatattaggagtaatatttat 21916774  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||| ||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21916775 attggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21916871  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || ||||  |||||||||||| |||  ||    
T  21916872 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgggcacttgat 21916970  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  21916971 gaatca 21916976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 45534575 - 45534275
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45534575 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 45534477  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  45534476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 45534380  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  45534379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 45534281  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  45534280 gaatca 45534275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 18835342 - 18835551
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  18835342 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgattaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattaggagta 18835440  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||| ||    
T  18835441 atatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttttaaaaa-tgtcataagatattcacacagtgataatggtgtatatcactct 18835537  T
Q  230 tcgacctgaaacca 243  Q
    | ||||||||||||    
T  18835538 tagacctgaaacca 18835551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 26240484 - 26240784
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26240484 gagactattatgtatgaagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtatatacataggtataaatattaggagtaatatttat 26240582  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||  |  |||||  | | ||| |||||     
T  26240583 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgattataatgtatatcgctcttagaccta 26240679  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  26240680 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 26240778  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  26240779 gaatca 26240784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781892
Alignment:
Q  114 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  214 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactat 313  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||||||  |||||||||| || ||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgtcattcaaacgttgtttgtaacatgataaccat 8781907  T
Q  314 aaagttggttgatgg 328  Q
    || ||| ||| ||||    
T  8781906 aacgttcgttaatgg 8781892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 32872880 - 32872741
Alignment:
Q  26 catcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | | |||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||| ||||||     
T  32872880 catcaaagcatagagactattatgcggctggactcacgatcttatctcacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagt 32872781  T
Q  126 agtaatatttatattggattgatccgccatgagaatacta 165  Q
    | |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  32872780 aataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 343
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431186
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||  | | ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 305  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||  ||||||||| |||| ||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 6431186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 236
Target Start/End: Original strand, 2375214 - 2375386
Alignment:
Q  61 atgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaa 160  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||    
T  2375214 atgatcacatcacacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattgaccctccattataa 2375313  T
Q  161 tactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacct 236  Q
    | |||||||  |||||||||  |||   |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  2375314 ttctacata--aaaagttatgtaaa-actcat-agttattctcatagtgataagtggtgtattcaaccatttgacct 2375386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactcc 335  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 135
Target Start/End: Original strand, 29645537 - 29645631
Alignment:
Q  41 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 135  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||||  | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645537 actattacgtgggtaaactgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962934
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattct 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||||||||||||||||| |  ||||   |  || ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  203 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 302  Q
    || | ||||| | | ||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||| | |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  303 atgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    | ||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatca 2962934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20535371 - 20535226
Alignment:
Q  183 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 282  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||  || || ||  |||| || |||||||| |  ||    
T  20535371 aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaaccactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgcc 20535273  T
Q  283 attcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535272 attcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 36970265 - 36970371
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36970265 gagactatcatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 36970363  T
Q  138 attggatt 145  Q
    | ||||||    
T  36970364 actggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 137
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  85 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  285 tcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  285 tcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 112
Target Start/End: Original strand, 24535514 - 24535569
Alignment:
Q  57 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataga 112  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24535514 actgatgatcatatcttacggatcatgaataatgagttatcaagttttcacataga 24535569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 59
Target Start/End: Original strand, 28555049 - 28555084
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagact 59  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555049 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagact 28555084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 171
Target Start/End: Original strand, 34659059 - 34659118
Alignment:
Q  112 atataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 171  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||    
T  34659059 atatatatattaggactaatatttatattggatttatccaccatgcaaatactaaatagt 34659118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 241
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645720
Alignment:
Q  196 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaac 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaac 29645720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17684510 - 17684191
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684510 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17684411  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684410 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17684311  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17684310 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17684211  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17684210 gatgggtactccatgaatca 17684191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27381293 - 27380974
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381293 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27381194  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381193 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27381094  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27381093 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27380994  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27380993 gatgggtactccatgaatca 27380974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27471676 - 27471357
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471676 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27471577  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471576 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27471477  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27471476 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27471377  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27471376 gatgggtactccatgaatca 27471357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 11651889 - 11652208
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651889 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 11651988  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11651989 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattc 11652088  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11652089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11652188  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11652189 gatgggtactccatgaatca 11652208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17691481 - 17691162
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691481 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17691382  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691381 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17691282  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17691281 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17691182  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17691181 gatgggtactccatgaatca 17691162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 29309056 - 29309375
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309056 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29309155  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309156 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29309255  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29309256 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29309355  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29309356 gatgggtactccatgaatca 29309375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 29316016 - 29316334
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316016 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29316115  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316116 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29316215  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29316216 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc-agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 29316314  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29316315 gatgggtactccatgaatca 29316334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 189018 - 188699
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189018 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 188919  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188918 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 188819  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||    
T  188818 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgatt 188719  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  188718 gatggatactccataaatca 188699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 106 - 343
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297114
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 27297114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 72 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16394438 - 16394167
Alignment:
Q  72 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 171  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  16394438 tcacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagt 16394339  T
Q  172 aaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagt 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  16394338 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagt 16394239  T
Q  272 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394238 gctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 16394167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 104 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  104 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  204 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  304 tgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 341  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 123 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559194
Alignment:
Q  123 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  223 ccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggt 322  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  323 tgatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatca 16559194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13359314 - 13359010
Alignment:
Q  20 ggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 119  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  13359314 ggacaacattaaagcgtagagactattatatggatagactgatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagt 13359215  T
Q  120 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 218  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||   | ||||||  ||||||||| | |||  ||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  13359214 attagaagtagtatttatattgaattgtctcaccatga--atactacattgaaaa--ttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtg 13359120  T
Q  219 tattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||||  || | ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  13359119 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtattttgttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagt 13359020  T
Q  319 tggttgatgg 328  Q
     |||||||||    
T  13359019 cggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16566361 - 16566257
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566361 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16566262  T
Q  124 ggagt 128  Q
    |||||    
T  16566261 ggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 16789071 - 16789371
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16789071 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 16789169  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  16789170 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 16789266  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  16789267 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 16789365  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  16789366 gaatca 16789371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22860190 - 22859890
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22860190 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22860092  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22860091 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22859995  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22859994 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22859896  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  22859895 gaatca 22859890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27508649 - 27508349
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27508649 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27508551  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27508550 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27508454  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  27508453 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgat 27508355  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  27508354 gaatca 27508349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1586410 - 1586110
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1586410 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 1586312  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  1586311 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 1586215  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  1586214 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 1586116  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  1586115 gaatca 1586110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27528235 - 27527947
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27528235 gagactgttatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 27528137  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  27528136 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 27528040  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggta 331  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27528039 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 335
Target Start/End: Original strand, 2669476 - 2669768
Alignment:
Q  41 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 140  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2669476 actattatatgggtagattgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 2669575  T
Q  141 ggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaa 239  Q
     ||||||  |  ||||| ||||||||||||  || ||| |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||    
T  2669576 tgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgttgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaa 2669672  T
Q  240 accactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactcc 335  Q
    | || | ||||| |||||||| ||||||  || ||||||   | |||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669673 atcattatgtactctagatgtaggagtccggtactttgttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18020143 - 18019981
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020143 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18020045  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca 204  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  18020044 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctca 18019981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 14074480 - 14074780
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14074480 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattgggagtaatatttat 14074578  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||| ||| | |||||   ||||||    | ||| ||||||    
T  14074579 aatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattttcacaatgataaaagtgtatattgctcttagacctg 14074675  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  14074676 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 14074774  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  14074775 gaatca 14074780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Original strand, 27925935 - 27926062
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  27925935 agactattatgtggataaactgatgatctcatctcacggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttata 27926033  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactaca 167  Q
    ||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  27926034 ttgaattgactcgccatgataatactaca 27926062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10359359 - 10359073
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||  | ||||| ||   ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||   |||    
T  10359359 aaagcgtagagactattatatatgtagagtgatgaccacatctcatgg-tcatgaatgt-gagatattaagtctatacatagatataaatattataggta 10359262  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||    
T  10359261 atatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactct 10359166  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    | ||| |||||||||| ||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||    
T  10359165 tagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacaggataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17850521 - 17850321
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17850521 agactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatata 17850422  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttata-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    ||||||||| || || | |||||||||||| |     ||| ||   |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  17850421 ttggattgaccctccttaagaatactacattg----ggttttatgtaagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctg 17850326  T
Q  238 aaacc 242  Q
    |||||    
T  17850325 aaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 161
Target Start/End: Original strand, 28172754 - 28172859
Alignment:
Q  56 gactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccat 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| || ||||    
T  28172754 gactgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccat 28172853  T
Q  156 gagaat 161  Q
    ||||||    
T  28172854 gagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 8612915 - 8613219
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8612915 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 8613013  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 234  Q
    | ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||   |  || |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  8613014 actggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 8613111  T
Q  235 ctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactc 334  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| | ||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  8613112 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 8613210  T
Q  335 catgaatca 343  Q
     ||||||||    
T  8613211 gatgaatca 8613219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20553622 - 20553492
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||   ||||||||||||| ||||||| || ||    
T  20553622 aaagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatatcaaacattcacatagatat-aatattaagaata 20553524  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaata 162  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  20553523 atatttatatt-gattgacccatcatgagaata 20553492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736413
Alignment:
Q  108 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatag 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |  | | ||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctcacag 20736466  T
Q  208 tgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgt 260  Q
    ||||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||| ||| ||  ||||||||||    
T  20736465 tgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 276
Target Start/End: Original strand, 8510155 - 8510338
Alignment:
Q  91 agttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgt 189  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||  || |||||  || ||||    
T  8510155 agttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgt 8510251  T
Q  190 cataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 276  Q
    ||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  8510252 cattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19347212 - 19347092
Alignment:
Q  52 ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 151  Q
    |||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| || |||||||| | |    
T  19347212 ggtagattgatgaccatatctcacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacatta-gaataatatttgtaatggattgaactg 19347114  T
Q  152 ccatgagaatactacatagtaa 173  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  19347113 ccattagaatactacatagtaa 19347092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22560487 - 22560311
Alignment:
Q  37 agagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta 136  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22560487 agagactattatgcatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtttatacataggtttaaatattaggagtaatattta 22560389  T
Q  137 tattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 217  Q
    || || ||||| |  | ||||||| ||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22560388 tactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 241
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994787
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaac 241  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaac 21994787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 25537200 - 25537148
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 76  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537200 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13995245 - 13995151
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995245 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Original strand, 19218427 - 19218627
Alignment:
Q  36 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19218427 tagagactattatgtatgtagactgatgaccacacctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaaaattt 19218525  T
Q  136 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 235  Q
    ||||||     | || || ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| || | ||| | || ||| ||||    
T  19218526 atattg-----acccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatt-tcataagatattctcagaatgataatgatatatactactcttagacc 19218617  T
Q  236 tgaaaccact 245  Q
    ||||||||||    
T  19218618 tgaaaccact 19218627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758650
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagta 5758650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  189 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  289 acgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgg 328  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120507
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |  ||||||| ||| ||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 305  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | | |    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatca 17120507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28172963
Alignment:
Q  204 atagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtc 267  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Original strand, 4073574 - 4073778
Alignment:
Q  36 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 135  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||  ||| ||| ||||||  |||||  | ||||||||||  |||||||||    
T  4073574 tagagactattatgtttgtagattgaggatcacatcccataggtcatgaatat-gagatattaagtctatacataagtgtaaatattagaggtaatattt 4073672  T
Q  136 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 235  Q
    ||||| |||||| |  || |||||||||||||||  | | ||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||  ||| ||||    
T  4073673 atatttgattgacctaccgtgagaatactacata--atatgttatgaaaa--ttcataagatattctcataatgataacgatgtataccaatcttagacc 4073768  T
Q  236 tgaaaccact 245  Q
    | ||||||||    
T  4073769 taaaaccact 4073778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 343
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317165
Alignment:
Q  232 gacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggta 331  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  332 ctccatgaatca 343  Q
    ||  ||||||||    
T  33317154 cttgatgaatca 33317165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20736630 - 20736594
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 74  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20736630 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 20736594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 18262378 - 18262697
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262378 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18262477  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262478 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18262577  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18262578 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18262677  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18262678 gatgggtactccatgaatca 18262697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 18269239 - 18269558
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269239 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18269338  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269339 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18269438  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18269439 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18269538  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18269539 gatgggtactccatgaatca 18269558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 55612849 - 55613168
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612849 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 55612948  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612949 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 55613048  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55613049 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 55613148  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  55613149 gatgggtactccatgaatca 55613168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 26963806 - 26964125
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963806 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26963905  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963906 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26964005  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26964006 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26964105  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26964106 gatgggtactccatgaatca 26964125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 26970629 - 26970948
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970629 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 26970728  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970729 gcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 26970828  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26970829 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 26970928  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26970929 gatgggtactccatgaatca 26970948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 868763 - 869082
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868763 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 868862  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  868863 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattc 868962  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  868963 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 869062  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  869063 gatgggtactccatgaatca 869082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19926801 - 19926482
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19926801 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatatta 19926702  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926701 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 19926602  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19926601 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19926502  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19926501 gatgggtactccatgaatca 19926482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 5707486 - 5707805
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707486 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5707585  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707586 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5707685  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5707686 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5707785  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5707786 gatgggtactccatgaatca 5707805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 5714114 - 5714433
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714114 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5714213  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714214 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 5714313  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5714314 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 5714413  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5714414 gatgggtactccatgaatca 5714433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 8858333 - 8858652
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8858333 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatatta 8858432  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858433 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 8858532  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8858533 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 8858632  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8858633 gatgggtactccatgaatca 8858652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10621374 - 10621055
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621374 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatttta 10621275  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621274 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttc 10621175  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10621174 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10621075  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10621074 gatgggtactccatgaatca 10621055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 30 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10628447 - 10628134
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628447 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 10628348  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10628347 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccaccct 10628248  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10628247 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 10628148  T
Q  330 tactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||    
T  10628147 tactccatgaatca 10628134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28393175 - 28392856
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393175 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 28393076  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393075 gaagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 28392976  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28392975 cacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 28392876  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  28392875 gatgagtactccatgaatca 28392856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 8845369 - 8845688
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8845369 atcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatatta 8845468  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845469 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 8845568  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8845569 catccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggtt 8845668  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8845669 gatgggtactccatgaatca 8845688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4426645 - 4426338
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426645 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 4426546  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||            |||||||||||||||||||||||||    
T  4426545 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaatctatgaaaag------------ttctcatagtgatagtggtgtattc 4426458  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4426457 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggtt 4426358  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4426357 gatgggtactccatgaatca 4426338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 343
Target Start/End: Original strand, 35223732 - 35224045
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  35223732 aaagcatatagactattatgtgggtagacggatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagta 35223831  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35223832 atatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccct 35223931  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    | |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  35223932 ttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgctttatcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtg 35224031  T
Q  330 tactccatgaatca 343  Q
    ||||||| ||||||    
T  35224032 tactccacgaatca 35224045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 34 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5668156 - 5667851
Alignment:
Q  34 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 133  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5668156 catagagactattatgtggatagaccgatgatca--tctcacggatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatat 5668059  T
Q  134 ttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 233  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5668058 ttatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttaga 5667959  T
Q  234 cctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5667958 cctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtact 5667861  T
Q  334 ccatgaatca 343  Q
    ||| ||||||    
T  5667860 ccacgaatca 5667851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 20311458 - 20311775
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20311458 atcattaaagcatagagactattttgtgggtagattgatgatcacatatcatggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatatta 20311557  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtatt 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  | ||||||   || | |||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20311558 ggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acagttat-gtaactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtatt 20311654  T
Q  223 ccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggt 322  Q
    ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||  || | ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  20311655 ccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactttgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggt 20311754  T
Q  323 tgatgggtactccatgaatca 343  Q
    | || ||||||||| ||||||    
T  20311755 taatcggtactccacgaatca 20311775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677308
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 312  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  313 taaagttggttgatgggtactccatgaa 340  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaa 10677308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890948
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 312  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  313 taaagttggttgatgggtactccatgaa 340  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaa 10890948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 15461497 - 15461797
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461497 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15461595  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15461596 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15461692  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15461693 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15461791  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  15461792 gaatca 15461797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 34975551 - 34975851
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34975551 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 34975649  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  34975650 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 34975746  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  34975747 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 34975845  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  34975846 gaatca 34975851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 2677013 - 2677313
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677013 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2677111  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  2677112 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2677208  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2677209 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2677307  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  2677308 gaatca 2677313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 15815021 - 15815321
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15815021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15815119  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15815120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15815216  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  15815217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 15815315  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  15815316 gaatca 15815321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18111345 - 18111045
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111345 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18111247  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18111246 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18111150  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18111149 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18111051  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  18111050 gaatca 18111045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 170
Target Start/End: Original strand, 56516232 - 56516368
Alignment:
Q  34 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  56516232 catagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatat 56516331  T
Q  134 ttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 170  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  56516332 ttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3369325 - 3369025
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3369325 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 3369227  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  3369226 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3369130  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  3369129 aaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 3369031  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  3369030 gaatca 3369025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17300261 - 17299977
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17300261 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 17300163  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  17300162 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 17300066  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatg 327  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||    
T  17300065 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatg 17299977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 18163162 - 18163462
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18163162 gagactattatgtatgtagactgatgatcgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 18163260  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||| | || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  18163261 attggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 18163357  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18163358 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 18163456  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  18163457 gaatca 18163462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 20243937 - 20244237
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20243937 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 20244035  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  20244036 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 20244132  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20244133 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20244231  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  20244232 gaatca 20244237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453961
Alignment:
Q  94 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 193  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  194 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 244  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 26531613 - 26531913
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26531613 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaaggctatacataaatataaatattaggagtaatatttat 26531711  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  26531712 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 26531808  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  26531809 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 26531907  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  26531908 gaatca 26531913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4676285 - 4675985
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4676285 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 4676187  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  4676186 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 4676090  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  4676089 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 4675991  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  4675990 gaatca 4675985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 343
Target Start/End: Original strand, 5870419 - 5870718
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5870419 agactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 5870517  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 238  Q
    ||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||    
T  5870518 ttggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcatatgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctga 5870614  T
Q  239 aaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatg 338  Q
    ||||||| ||  | ||||||| |||| || |||| |||||   ||||| |||||||||  ||| | ||| || |||| ||||||||||| |||||  |||    
T  5870615 aaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatg 5870713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 329
Target Start/End: Original strand, 19365519 - 19365806
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||  ||  ||| ||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19365519 gagactattatatacgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgagtat-gagatattaaatctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19365617  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca-tagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 236  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  19365618 actggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatattctcaccaatgataatggtgtataccactcttagacct 19365714  T
Q  237 gaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    ||||||| | ||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365715 gaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacaggatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 1941724 - 1942024
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1941724 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 1941822  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  1941823 attggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 1941919  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  1941920 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 1942018  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  1942019 gaatca 1942024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32646807 - 32646536
Alignment:
Q  59 tgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgag 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||| ||    
T  32646807 tgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataag 32646708  T
Q  159 aatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctaga 257  Q
    ||| |||||||  ||| |||||  | |  |||| | || |||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  32646707 aatgctacata--aaaggttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctgga 32646611  T
Q  258 tgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtac 332  Q
    |||  |||||| || ||||||   | | |||||||  ||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  32646610 tgtatgagtcgggtactttgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtac 32646536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 243
Target Start/End: Original strand, 32636484 - 32636685
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | ||||| |||  ||| ||| |||||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32636484 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatgaatac-gagatattaagtccatgcataggtataaatattatgagtaatatttat 32636582  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| || |||| ||    
T  32636583 attggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactctccgacgtg 32636679  T
Q  238 aaacca 243  Q
    ||||||    
T  32636680 aaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 329
Target Start/End: Original strand, 5616387 - 5616681
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| | | |||| |  || ||| |||||||||||| ||||    
T  5616387 aaagcattgagactattatgtatgtagattgatgaccacatctcatgggtcataaatat-gagatgttaagtatatacgtaggtataaatattagaagta 5616485  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||| |||  |  |||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||  ||    
T  5616486 atatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatgaaa-gtgtcataagatattcttacaatgataatggtgtataccaatct 5616582  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    | || ||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  5616583 tagatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactgtaacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 328
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 305  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||| ||  || |||||| |||| |  | |||||| |   ||||||||||||||| |||||| |    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgg 328  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 120
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  42 ctattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 120  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 305  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||  |||||||||  || ||  ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || |||||| |    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  306 atgactataaagttggttgatggg 329  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 4546080 - 4546298
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4546080 gagactattatgtatgttgactgataatcgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 4546178  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | ||||  || || || |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||     
T  4546179 actggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctctttgaccta 4546275  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgt 260  Q
    |||||||| ||  ||||||||||    
T  4546276 aaaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 343
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487851
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 312  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| | ||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  313 taaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatca 9487851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040491
Alignment:
Q  125 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 224  Q
    |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  225 acccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttg 324  Q
    || ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| | ||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  325 atgggtactccatgaatca 343  Q
    ||| |||||  ||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatca 30040491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 329
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttat-gaaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 312  Q
     ||| ||  ||||  ||| ||||| |||||||  ||  || | |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||| || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  313 taaagttggttgatggg 329  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  85 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaa 184  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||||| | |   | ||||  ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  185 agtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 267
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  217 tgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtc 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 245
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888740
Alignment:
Q  94 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 193  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| || |||||| ||||| |||||  |  | ||||  ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  194 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 245  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcact 33888740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10677590 - 10677538
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 82  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10677590 aaagtatatagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10677538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10891230 - 10891178
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcat 82  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10891230 aaagtatatagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacggatcat 10891178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 343
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421307
Alignment:
Q  128 taatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 227  Q
    |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  228 cttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatg 327  Q
    | | |||||||||||||| ||  || |||||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  328 ggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||| ||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatca 11421307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 9938003 - 9937933
Alignment:
Q  26 catcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 96  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  9938003 catcgaagcatatagactattgtgtgggtagagtcatgatcacatctcataaatcatgaataaagagttat 9937933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Original strand, 11421016 - 11421052
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 74  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11421016 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctca 11421052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 30040784 - 30040740
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 74  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  30040784 aaagcatcgagactattatgtatatagactgatgaccacatctca 30040740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 6110230 - 6110549
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110230 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6110329  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110330 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6110429  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6110430 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 6110529  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6110530 gatgggtactccatgaatca 6110549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16482524 - 16482205
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482524 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 16482425  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482424 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16482325  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16482324 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 16482225  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16482224 gatgggtactccatgaatca 16482205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10579396 - 10579077
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579396 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10579297  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10579197  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10579196 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10579097  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10579096 gatgggtactccatgaatca 10579077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15600925 - 15600606
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600925 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15600826  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600825 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15600726  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15600725 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15600626  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15600625 gatgggtaccccatgaatca 15600606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15607470 - 15607151
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607470 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15607371  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607370 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15607271  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15607270 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15607171  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  15607170 gatgggtaccccatgaatca 15607151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10572633 - 10572314
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572633 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 10572534  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572533 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 10572434  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10572433 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 10572334  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10572333 gatgggtactccatgaatca 10572314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 18520141 - 18520460
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520141 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18520240  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520241 ggagtaatatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18520340  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18520341 cacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 18520440  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18520441 gatgggtactccatgaatca 18520460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 31 - 341
Target Start/End: Original strand, 18522836 - 18523146
Alignment:
Q  31 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522836 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 18522935  T
Q  131 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18522936 tatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcaccctt 18523035  T
Q  231 cgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggt 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18523036 cgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggt 18523135  T
Q  331 actccatgaat 341  Q
    |||||||||||    
T  18523136 actccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 39 - 343
Target Start/End: Original strand, 8490676 - 8490980
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490676 agacgattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 8490775  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490776 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 8490875  T
Q  239 aaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490876 aaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatg 8490975  T
Q  339 aatca 343  Q
    |||||    
T  8490976 aatca 8490980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15357627 - 15357308
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15357627 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15357528  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357527 ggagtaatatttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15357428  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15357427 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15357328  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15357327 gatgggtactccatgaatca 15357308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17781159 - 17780840
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17781060  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781059 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17780960  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17780959 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggtt 17780860  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17780859 gatgggtactccatgaatca 17780840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 13211468 - 13211787
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211468 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13211567  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211568 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattc 13211667  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13211668 cacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13211767  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13211768 gatgggtactccatgaatca 13211787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15342260 - 15341941
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15342260 atcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaatta 15342161  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342160 ggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15342061  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15342060 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15341961  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15341960 gatgggtactccatgaatca 15341941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 30 - 343
Target Start/End: Original strand, 13248779 - 13249092
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248779 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 13248878  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248879 atatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 13248978  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13248979 tcgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 13249078  T
Q  330 tactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||    
T  13249079 tactccatgaatca 13249092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32056941 - 32056621
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tatt 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32056941 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactaatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatatt 32056842  T
Q  123 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056841 atgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 32056742  T
Q  223 ccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggt 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32056741 ccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 32056642  T
Q  323 tgatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  32056641 tgatggatactccatgaatca 32056621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17200225 - 17199906
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200225 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 17200126  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200125 ggagtagtatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17200026  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  17200025 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggtt 17199926  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17199925 gatgggtactccatgaatca 17199906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 13516977 - 13517292
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516977 atcattaaagcacagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 13517076  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |    
T  13517077 ggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccc 13517172  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  13517173 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggta 13517272  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13517273 gatgggtactccatgaatca 13517292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1647556 - 1647243
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1647556 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 1647457  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    || |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1647456 atgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccaccct 1647357  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  1647356 tcgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgag 1647257  T
Q  330 tactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||    
T  1647256 tactccatgaatca 1647243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 17136525 - 17136838
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||    
T  17136525 atcattaaaacatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------ta 17136618  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136619 ggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 17136718  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17136719 cacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgcttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 17136818  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  17136819 gatggatactccatgaatca 17136838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 29925137 - 29925456
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29925137 atcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatatta 29925236  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29925237 ggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29925336  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29925337 caccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggtt 29925436  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  29925437 gatggatactccacgaatca 29925456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 29974290 - 29974609
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29974290 atcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatatta 29974389  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974390 ggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29974489  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  29974490 caccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctttgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggtt 29974589  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  29974590 gatggatactccacgaatca 29974609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 55 - 343
Target Start/End: Original strand, 16200627 - 16200915
Alignment:
Q  55 agactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcca 154  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||    
T  16200627 agactgatgatcatatcttacagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccacca 16200726  T
Q  155 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccct 254  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16200727 tgagaatactacatagtcaaaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccct 16200826  T
Q  255 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16200827 agatgttgaagtcgagtgctttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatca 16200915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 21034238 - 21034538
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21034238 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 21034336  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21034337 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21034433  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21034434 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 21034532  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  21034533 gaatca 21034538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15846838 - 15846538
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15846838 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 15846740  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  15846739 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 15846643  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15846642 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 15846544  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  15846543 gaatca 15846538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20147856 - 20147556
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147856 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20147758  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20147757 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20147661  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20147660 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20147562  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  20147561 gaatca 20147556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24253423 - 24253179
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||     
T  24253423 aaagcatagagactattatgtcggtagactaatgatcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagtt 24253324  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||  || |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |    
T  24253323 atatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttat-ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cat 24253228  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 278  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||  || |||||| ||||||    
T  24253227 tcgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgt 24253179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 14890391 - 14890691
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14890391 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 14890489  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  14890490 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 14890586  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    ||| |||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | ||| | ||||| |||||||||||||||||  ||    
T  14890587 aaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgat 14890685  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  14890686 gaatca 14890691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 21398792 - 21399092
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398792 gagactattatgtatgtagacttatgacctcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 21398890  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||| | | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  21398891 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 21398987  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21398988 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 21399086  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  21399087 gaatca 21399092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 55427021 - 55427321
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55427021 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 55427119  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  55427120 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 55427216  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  55427217 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 55427315  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  55427316 gaatca 55427321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 12299911 - 12300210
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12299911 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctat-catagatataaatgttaggagtaatatttat 12300008  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  12300009 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 12300105  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12300106 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 12300204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978730
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 305  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 25978730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 245
Target Start/End: Original strand, 14147013 - 14147224
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||| |    
T  14147013 aaagcacagagactattatatatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagga 14147111  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||  |||||||  ||| ||    
T  14147112 atatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgataaaggtgtatatcactct 14147208  T
Q  230 tcgacctgaaaccact 245  Q
    | ||||||||||||||    
T  14147209 tagacctgaaaccact 14147224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 303
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527013
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||   | ||| |||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 303  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||  || || ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaaca 15527013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 19089786 - 19089734
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 76  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089786 atcattaaatcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 19089734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 271
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  79 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 178  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| || | ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  179 ataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac----tttgtaccctagatgttggagtcgagt 271  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    | |||||||||||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 173
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787721
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 173  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa 11787721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 206
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  77 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 175  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | ||  |||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  176 gttataaaaagtgtcataagatattctcata 206  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Original strand, 9504455 - 9504548
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  9504455 aaaggatagaaactattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagttatcaagtattaacatacataaaaatatta 9504548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15317472 - 15317178
Alignment:
Q  41 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 140  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15317472 actattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatact 15317374  T
Q  141 ggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 240  Q
     ||| || || || |||||||||||||||||  | |||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| | |||||   | | ||| |||||||||    
T  15317373 agatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaa 15317277  T
Q  241 ccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaa 340  Q
    ||||| ||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||   ||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  15317276 ccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacggataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaa 15317181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Original strand, 28088251 - 28088406
Alignment:
Q  187 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 286  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || || |||||||  ||||||    
T  28088251 tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagggctttgttgccattc 28088349  T
Q  287 aaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
     ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  28088350 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatca 28088406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8252048 - 8251933
Alignment:
Q  34 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 133  Q
    |||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||    
T  8252048 catatagactatcatgtggatggactgaagatcacatcttacggatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatat 8251949  T
Q  134 ttatattggattgatc 149  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8251948 ttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 97
Target Start/End: Original strand, 16200291 - 16200363
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatc 97  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16200291 atcattaaagcatggagactatt-tgtggagagactgatgatcatatcttacagatcatggataaagagttatc 16200363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 301
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464255
Alignment:
Q  192 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 291  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  292 ttgtccgtaa 301  Q
    ||||| ||||    
T  30464246 ttgtctgtaa 30464255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138036
Alignment:
Q  184 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 245  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcact 36138036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 18252196 - 18252515
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252196 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18252295  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252296 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18252395  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18252396 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18252495  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18252496 gatgggtactccatgaatca 18252515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18532555 - 18532236
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532555 atcattaaagcatagagactattatgtagatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18532456  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532455 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18532356  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18532355 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18532256  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18532255 gatgggtactccatgaatca 18532236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27131450 - 27131132
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131450 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 27131351  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131350 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 27131251  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27131250 cacccttcgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 27131152  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27131151 gatgggtactccatgaatca 27131132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27310618 - 27310299
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27310618 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatatta 27310519  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27310518 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattc 27310419  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27310418 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 27310319  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27310318 gatgggtactccatgaatca 27310299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16359076 - 16358757
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16359076 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatatta 16358977  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358976 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 16358877  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16358876 cacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggtt 16358777  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16358776 gatgggtactccatgaatca 16358757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 30 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3855954 - 3855641
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3855954 aaagcatggagactattacgtgggtagactgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagta 3855855  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  3855854 atatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagtaaaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccat 3855755  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  3855754 tcgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcgctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccgg 3855655  T
Q  330 tactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||    
T  3855654 tactccatgaatca 3855641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 30 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36816668 - 36816363
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36816668 aaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagta 36816569  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36816568 atatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccct 36816470  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  36816469 ttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcgttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgatagg 36816370  T
Q  330 tactcca 336  Q
    |||||||    
T  36816369 tactcca 36816363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 64 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22641871 - 22641596
Alignment:
Q  64 atcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatac 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||    
T  22641871 atcacatctcatagatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-ac 22641776  T
Q  164 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttgg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22641775 tacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttgg 22641676  T
Q  264 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22641675 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatca 22641596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27277592 - 27277280
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27277592 aaagcatagagactattatgtgggtagaccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagta 27277493  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| | |||||| || |||| |||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27277492 atatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaagtcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccct 27277394  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  27277393 ttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttatcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaaggg 27277294  T
Q  330 tactccatgaatca 343  Q
    |||||||| |||||    
T  27277293 tactccataaatca 27277280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 24 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21171274 - 21171081
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171274 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgataacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21171175  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171174 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22657262 - 22657108
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22657262 atcattaaagcatagagactatcatgtggatagactgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatatta 22657163  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 178  Q
     |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22657162 tgagtaatatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19706741 - 19706441
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19706741 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19706643  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  19706642 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19706546  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19706545 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 19706447  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  19706446 gaatca 19706441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43802667 - 43802367
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43802667 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 43802569  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  43802568 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 43802472  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  43802471 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 43802373  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  43802372 gaatca 43802367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12014319 - 12014084
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12014319 aaagcgtaaagaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacggatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagta 12014220  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 228  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||  | ||||||   ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12014219 atattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaatatgtaaaaa---tcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcaccc 12014123  T
Q  229 ttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtc 267  Q
    ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014122 ttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 343
Target Start/End: Original strand, 23507096 - 23507383
Alignment:
Q  54 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  23507096 tagactgatgatcacatctcacggatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccacc 23507195  T
Q  154 atgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtacc 252  Q
    || ||||| ||||| || |     | |||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23507196 attagaatgctacagagaacgttgtgtaaaaag---cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtacc 23507292  T
Q  253 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||  || | |||| |||||| | ||| ||||    ||| |||| | |||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||    
T  23507293 ctagatgtaagatttgagtactttgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatca 23507383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28135025 - 28134725
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135025 gagacaattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 28134927  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  28134926 attggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 28134830  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  28134829 aaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 28134731  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  28134730 gaatca 28134725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 9456116 - 9456416
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9456116 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 9456214  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  9456215 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 9456311  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  9456312 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 9456410  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  9456411 gaatca 9456416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20391541 - 20391241
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20391541 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatgttaggagtaatatttat 20391443  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||||  ||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| |  ||||| || | ||| ||||||    
T  20391442 attggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaattt-tcataagatattctcacaatgataataatgtataccgctcttagacctg 20391346  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20391345 aaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 20391247  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  20391246 gaatca 20391241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20779947 - 20779647
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779947 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20779849  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20779848 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20779752  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  20779751 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 20779653  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  20779652 gaatca 20779647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22670559 - 22670259
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670559 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22670461  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22670460 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22670364  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  22670363 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 22670265  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  22670264 gaatca 22670259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42817291 - 42816991
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817291 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 42817193  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  42817192 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 42817096  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  42817095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 42816997  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  42816996 gaatca 42816991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9916688 - 9916499
Alignment:
Q  153 catgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactttgta 250  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9916688 catgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgta 9916592  T
Q  251 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||    
T  9916591 ccctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatca 9916499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 22612492 - 22612792
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22612492 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gatatatcaagtctatacatagatataaatattgggagtaatattttt 22612590  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22612591 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22612687  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| | ||| |  |||| |||||||||||| ||||  ||    
T  22612688 aaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaaggataatcataacgttggttgatggctacttgat 22612786  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  22612787 gaatca 22612792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Original strand, 633925 - 634216
Alignment:
Q  29 caaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 128  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| | ||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  633925 caaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagctat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagt 634023  T
Q  129 aatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccc 228  Q
    |||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | |    
T  634024 aatatttatactggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctc 634120  T
Q  229 ttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttga 325  Q
    || |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||    
T  634121 ttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9917952 - 9917837
Alignment:
Q  31 aagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaa 130  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9917952 aagcatagagaatactatgtcggtaggttgatgatcacatctcgtggatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaa 9917854  T
Q  131 tatttatattggattga 147  Q
    |||||||||||||||||    
T  9917853 tatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 8727667 - 8727967
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  8727667 gagactattatctatgtagactgatgactacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattagaagtaatatttat 8727765  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||   ||||||  ||| ||| ||||||    
T  8727766 actggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgataagagtgtatatcactcttagacctg 8727862  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
     ||||||| ||  |||||||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || ||||  |||| | |||||||||  ||    
T  8727863 gaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggctaatgggtacttgat 8727961  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  8727962 gaatca 8727967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 47667776 - 47667668
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47667776 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattatgagtaatatttat 47667678  T
Q  138 attggattga 147  Q
    ||||||||||    
T  47667677 attggattga 47667668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 170
Target Start/End: Original strand, 35930582 - 35930713
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35930582 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 35930680  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatag 170  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  35930681 attggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12006550 - 12006461
Alignment:
Q  54 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 143  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006550 tagactgatgatcacaacttacgaatcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 245  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 258
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29096938
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatag--catgttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagat 258  Q
    | ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat 29096938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26923678 - 26923553
Alignment:
Q  46 tatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 145  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26923678 tatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacattggtatgaatattaggagtaatatttatactgaatt 26923580  T
Q  146 gatccgccatgagaatactacatagta 172  Q
    || || || ||||||||||||||||||    
T  26923579 gacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 166
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997406
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactac 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactac 51997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47667642 - 47667487
Alignment:
Q  187 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 286  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | |||||||| ||| || ||||||||||  ||||||    
T  47667642 tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattc 47667544  T
Q  287 aaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
     ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  47667543 taacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 47667487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145725
Alignment:
Q  232 gacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggta 331  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  332 ctccatgaatca 343  Q
    ||  ||||||||    
T  28145736 cttgatgaatca 28145725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12006413 - 12006332
Alignment:
Q  198 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 278  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006413 attctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24301855 - 24301713
Alignment:
Q  93 ttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtca 191  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | ||  || |||||||| ||||||| |  |||||   |||| |||    
T  24301855 ttatcaagatttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatca 24301758  T
Q  192 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  24301757 taagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacct 24301713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  184 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 243  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 343
Target Start/End: Original strand, 35132342 - 35132398
Alignment:
Q  287 aaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  35132342 aaacgttgtccataacatgataattataaagttgtttgatatgtacttcatgaatca 35132398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 24 - 341
Target Start/End: Original strand, 15152609 - 15152926
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152609 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 15152708  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152709 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 15152808  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15152809 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 15152908  T
Q  324 gatgggtactccatgaat 341  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15152909 gatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 29327950 - 29328269
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327950 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 29328049  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328050 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 29328149  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  29328150 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgctt 29328249  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29328250 gatgggtactccatgaatca 29328269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11536103 - 11535784
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11536103 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatatta 11536004  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11536003 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11535904  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11535903 caacattcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 11535804  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11535803 gatgggtactccatgaatca 11535784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11543021 - 11542702
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11543021 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatatta 11542922  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11542921 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattc 11542822  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11542821 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggtt 11542722  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11542721 gatgggtactccatgaatca 11542702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 19 - 343
Target Start/End: Original strand, 12750987 - 12751311
Alignment:
Q  19 tggacatcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 118  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12750987 tggatatcattaaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaa 12751086  T
Q  119 tattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751087 tattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtg 12751186  T
Q  219 tattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12751187 tattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagt 12751286  T
Q  319 tggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  12751287 tggttgatggatactccatgaatca 12751311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 12738702 - 12739021
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738702 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgaagatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 12738801  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738802 ctcataatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 12738901  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  12738902 caccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggtt 12739001  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12739002 gatgggtactccatgaatca 12739021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 18561173 - 18561483
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561173 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18561272  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  18561273 ggagtaatatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattc 18561363  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18561364 cacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtgatttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgatt 18561463  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||| |||||| || ||||||    
T  18561464 gataggtactgcacgaatca 18561483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 343
Target Start/End: Original strand, 13392326 - 13392635
Alignment:
Q  34 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 133  Q
    ||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  13392326 catagagactattgtattggtagatcgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatat 13392425  T
Q  134 ttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcga 233  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13392426 ttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttga 13392525  T
Q  234 cctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13392526 cctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgctttgtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtact 13392625  T
Q  334 ccatgaatca 343  Q
    ||||||||||    
T  13392626 ccatgaatca 13392635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18257874 - 18257577
Alignment:
Q  33 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 132  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257874 gcataaagactattatgtggatagattgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 18257775  T
Q  133 tttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcg 232  Q
    ||||||||||||| | || || | |||||| ||||||||  | || || |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |    
T  18257774 tttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagt--atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttag 18257677  T
Q  233 acctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtac 332  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18257676 acctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtac 18257578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 2204552 - 2204852
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2204552 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 2204650  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  2204651 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 2204747  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  2204748 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 2204846  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  2204847 gaatca 2204852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 8464999 - 8465299
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464999 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8465097  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8465098 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8465194  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  || |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  8465195 aaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 8465293  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  8465294 gaatca 8465299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 18400104 - 18400404
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18400104 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18400202  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18400203 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18400299  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18400300 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18400398  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  18400399 gaatca 18400404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 18407088 - 18407388
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18407088 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 18407186  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18407187 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctg 18407283  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  18407284 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 18407382  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  18407383 gaatca 18407388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48808798 - 48808498
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48808798 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 48808700  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  48808699 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 48808603  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  48808602 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 48808504  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  48808503 gaatca 48808498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 333
Target Start/End: Original strand, 30254138 - 30254428
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30254138 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 30254236  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||   || ||| ||| ||    
T  30254237 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattactcttagacttg 30254333  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  30254334 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 15729751 - 15730051
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15729751 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 15729849  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  15729850 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 15729946  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  15729947 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 15730045  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  15730046 gaatca 15730051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18139640 - 18139340
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18139640 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaggtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgt 18139542  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  18139541 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 18139445  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  18139444 aaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataataataacgttggttgatgggtacttgat 18139346  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  18139345 gaatca 18139340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 19230888 - 19231188
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19230888 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 19230986  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||  | |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  19230987 actggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 19231083  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  19231084 aaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 19231182  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  19231183 gaatca 19231188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 327
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365389
Alignment:
Q  105 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||   |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  205 tagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 303  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  304 tgatgactataaagttggttgatg 327  Q
       |||||||||||| ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatg 2365389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680970
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 305  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| | |    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatca 41680970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47167161 - 47166871
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  47167161 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattatgagtaatatttat 47167063  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | | ||| || || || |||||||||||||||||||  ||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  47167062 actagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 47166966  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||    
T  47166965 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10669204 - 10668903
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10669204 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 10669106  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc-atagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 236  Q
    | | |||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||   | ||||| | ||||||  | | ||| |||||    
T  10669105 actagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcgcaattgataatagtgtatatcgctcttagacct 10669009  T
Q  237 gaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactcca 336  Q
    ||||||||| ||  || || ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  |    
T  10669008 gaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttga 10668910  T
Q  337 tgaatca 343  Q
    |||||||    
T  10668909 tgaatca 10668903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Original strand, 10235361 - 10235474
Alignment:
Q  57 actgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | |||||    
T  10235361 actgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattgactcaccatg 10235460  T
Q  157 agaatactacatag 170  Q
    |||||  |||||||    
T  10235461 agaattatacatag 10235474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24443628 - 24443349
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| | || ||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24443628 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggtcatgaatata-agatattaagtttatacataggtatgaatattaggagtaatatttata 24443530  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctga 238  Q
     | |||| | || || ||||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||    
T  24443529 ctagattaacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagttattctcacagtgataatggtgtataacactcttagacttga 24443433  T
Q  239 aaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    ||||| | ||  ||||||||| |||| || |||||||| |    |||||||||||||  |||||| |||||| |||| |||||||    
T  24443432 aaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacaggatgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25845780 - 25845498
Alignment:
Q  36 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 135  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25845780 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25845682  T
Q  136 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 235  Q
    ||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25845681 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25845585  T
Q  236 tgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||| | ||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25845584 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25846199 - 25845917
Alignment:
Q  36 tagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 135  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  || ||  | | |||||||||||||||||||    
T  25846199 tagagactattatgcatgtagactgatgaccacatctcattgctcatgaatat-gagatattaagtctatacgtatgtgtcaatattaggagtaatattt 25846101  T
Q  136 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 235  Q
    ||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  25846100 atactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatgatgtataccactcttagacc 25846004  T
Q  236 tgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||| | ||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| ||||||| |||||||    
T  25846003 tgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataacgttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 28130561 - 28130861
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28130561 gagactattatgcatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatatcaggagtaatatttat 28130659  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | |||||||| || |  |||||||| ||||||||  | |||||  ||| |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||  ||  ||| ||||||    
T  28130660 actggattgacccactgtgagaatattacatagt--atgttat-gaaattgtcataagatattctcacaataataatagtgtatatcattcttagacctg 28130756  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    ||| |||| ||  || |||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  28130757 aaatcactatgatccgtagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttaat 28130855  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  28130856 gaatca 28130861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 260
Target Start/End: Original strand, 19388544 - 19388774
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||| | ||||| |||  ||| ||| |||| |  ||| || |||||||||||||||||    
T  19388544 aaagcatagagattattatgtatatagattgatgaccatatctcacgggtcatgaatat-gagatattaagtttgtacaaaggtataaatattaggagta 19388642  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa--aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 227  Q
    ||||||||| |||||||  |   |||||||||||||||||   |  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||     
T  19388643 atatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttat-gaaagtgtcataagatattctcatagtggtaatagtgtataccact 19388741  T
Q  228 cttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgt 260  Q
    ||| |||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  19388742 cttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19393726 - 19393468
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19393726 gagactattatgtatgtagactaatgaccacatttcatgggtcataaatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 19393628  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | | |||||| |  || |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  19393627 actagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctg 19393531  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 301  Q
    || ||| | ||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| ||||    
T  19393530 aatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaa 19393468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833875
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttata 47833884  T
Q  139 ttggattga 147  Q
    || ||||||    
T  47833883 tttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 79
Target Start/End: Original strand, 15148308 - 15148363
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 79  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148308 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 343
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128873
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||   ||||| | |  |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 312  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| | ||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  313 taaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatca 34128873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7662686 - 7662569
Alignment:
Q  43 tattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgg 142  Q
    |||||||| | || ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |    
T  7662686 tattatgtggatacactgatgatcatatcttacgaatcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattag 7662588  T
Q  143 attgatccgccatgagaat 161  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  7662587 attgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Original strand, 19859113 - 19859221
Alignment:
Q  29 caaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 128  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19859113 caaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagt 19859211  T
Q  129 aatatttata 138  Q
    ||||||||||    
T  19859212 aatatttata 19859221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259126
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || || || |||||||||| ||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 305  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||  | ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 18259126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190538
Alignment:
Q  120 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 219  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||  | ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgt--atgttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  220 attccacccttcgacctgaaaccact 245  Q
    ||  |||  || ||||||||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccact 31190538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592053
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 245  Q
     | ||||||  ||| ||| ||| ||||||||||    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccact 14592053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011644
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 245  Q
     |  |||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccact 16011644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 245  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 334
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  197 tattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||| ||||| |||||||| ||| || |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  297 cgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactc 334  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 116
Target Start/End: Original strand, 7396361 - 7396450
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgta---ggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatata 116  Q
    |||||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  7396361 aaagcatagagactattatgtgcagggtgaactgatgatcacatctcacatatcatgaataaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 171
Target Start/End: Original strand, 3132849 - 3132986
Alignment:
Q  33 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaata 132  Q
    ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| |||| |  ||  | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||    
T  3132849 gcatagagactacaatgtgattagactgatgatcacatctcatagataaatgaatatgagatatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taata 3132947  T
Q  133 tttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 171  Q
    ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  3132948 tttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  196 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagt 271  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 127
Target Start/End: Original strand, 29983179 - 29983234
Alignment:
Q  72 tcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983179 tcacggatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 138
Target Start/End: Original strand, 39111989 - 39112092
Alignment:
Q  35 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 134  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||| | | ||| || || |||||||||||||||||  |  |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  39111989 atagagactattataagggtagactaatggtaatatcacataggtcatggataaagagttacaatttcttcatatatacataaatattaggagtattatt 39112088  T
Q  135 tata 138  Q
    ||||    
T  39112089 tata 39112092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Original strand, 2365070 - 2365112
Alignment:
Q  34 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 76  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2365070 catagagactatcatgtgggtcgactgatgatcacatctcaca 2365112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 145
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396511
Alignment:
Q  103 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 145  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggatt 7396511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 30 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24695501 - 24695188
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695501 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 24695402  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695401 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 24695302  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24695301 tcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggg 24695202  T
Q  330 tactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||    
T  24695201 tactccatgaatca 24695188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19714539 - 19714220
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714539 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 19714440  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19714439 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattc 19714340  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19714339 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 19714240  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  19714239 gatgggtactacatgaatca 19714220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19707259 - 19706941
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19707259 atcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatacta 19707160  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  19707159 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattc 19707060  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19707059 cacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtgctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggtt 19706961  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19706960 gatgggtactccatgaatca 19706941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18569904 - 18569583
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggata--aagagttatcaagtcttcacatagatataaatat 121  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569904 atcattaaagcataaagactattatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatggatataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatat 18569805  T
Q  122 taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18569804 taggagtaatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtat 18569705  T
Q  222 tccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18569704 tccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattgg 18569605  T
Q  322 ttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18569604 ttgatgggtacttcatgaatca 18569583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 223
Target Start/End: Original strand, 39538754 - 39538953
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538754 atcattaaagcatgaagactattatgtgggtagactgatggtcatatttcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 39538853  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39538854 ggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17298912 - 17298627
Alignment:
Q  54 tagactgatgatcaca--tctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccg 151  Q
    ||||||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17298912 tagactgatgatcacacatatcacgggtcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgaccca 17298813  T
Q  152 ccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgta 250  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  17298812 ccatgagaatactacgtag--aaagttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgta 17298716  T
Q  251 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatga 339  Q
    |||||| | | |||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  17298715 ccctaggtttaggagtcgagtactttgtttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatga 17298627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17285759 - 17285476
Alignment:
Q  54 tagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgcc 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  17285759 tagactgatgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaca 17285660  T
Q  154 atgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtacc 252  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  | | | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || | ||||||    
T  17285659 atgagaatactacatag--aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtacc 17285563  T
Q  253 ctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatga 339  Q
    |||| | | ||| |||||| ||||||  || | ||||| |||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  17285562 ctaggtttaggattcgagtactttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatga 17285476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18807069 - 18806843
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18807069 aaagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagta 18806970  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 228  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| |   || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18806969 atgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagtt-ttgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccaccc 18806873  T
Q  229 ttcgacctgaaaccactttgtaccctagat 258  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18806872 ttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 183 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27347417 - 27347258
Alignment:
Q  183 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27347417 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgttttgtcacc 27347318  T
Q  283 attcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27347317 attcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatca 27347258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22547046 - 22546912
Alignment:
Q  35 atagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatt 134  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22547046 atagagactattatgtggatagaccgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatt 22546947  T
Q  135 tatattggattgatccgccatgagaatactacata 169  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22546946 tatattggattgaccagccatgagaatactacata 22546912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 238 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701952
Alignment:
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  24701957 gaatca 24701952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 20941027 - 20941327
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20941027 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 20941125  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  20941126 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 20941222  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  20941223 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 20941321  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  20941322 gaatca 20941327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25805687 - 25805387
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25805687 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 25805589  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |||  |||||    
T  25805588 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttacacctg 25805492  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  25805491 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 25805393  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  25805392 gaatca 25805387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 31899 - 32199
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31899 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 31997  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  31998 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 32094  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  32095 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 32193  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  32194 gaatca 32199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12789965 - 12789665
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12789965 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 12789867  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |  | ||| ||||||    
T  12789866 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatactgctcttagacctg 12789770  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  12789769 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 12789671  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  12789670 gaatca 12789665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 22941250 - 22941550
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||  | |||| ||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941250 gagactattatgtatgtagactgatgaccgtatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtttatacatagatataaatattaggagtaatatttat 22941348  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  22941349 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 22941445  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  22941446 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 22941544  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  22941545 gaatca 22941550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 23545922 - 23546222
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23545922 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 23546020  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  23546021 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 23546117  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  23546118 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 23546216  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  23546217 gaatca 23546222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24933608 - 24933308
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24933608 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttat 24933510  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||    
T  24933509 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctg 24933413  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  24933412 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgat 24933314  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  24933313 gaatca 24933308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20100543 - 20100255
Alignment:
Q  40 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||| ||| ||||||  | |||| ||| |||||||||||||||| |||||     
T  20100543 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgggtcatgaatat-gagatattaagtctatagataggtatcaatattaggagtaatacttatac 20100445  T
Q  140 tggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaa 239  Q
    ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  20100444 tggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacatgaa 20100348  T
Q  240 accactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||| ||  ||| ||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||    
T  20100347 accactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 31096816 - 31097116
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  31096816 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaattataggagtaatatttat 31096914  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  31096915 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 31097011  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||| | ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  31097012 aaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 31097110  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  31097111 gaatca 31097116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 332
Target Start/End: Original strand, 5097651 - 5097940
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  5097651 gagactattatgtatgtagactgatgactacatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtctatacataagtataaatattatgagtaatatttat 5097749  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||  | |||||  ||| ||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  5097750 attggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-gaaattgtcataagttattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 5097846  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtac 332  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| | ||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  5097847 aaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgtttgttgatgggtac 5097940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12765296 - 12764992
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12765296 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12765198  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 234  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||   |  || |||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12765197 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattaattgtcataagacattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12765100  T
Q  235 ctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactc 334  Q
    ||||||||||| ||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |  || || |||| |||||||||||||||||     
T  12765099 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12765001  T
Q  335 catgaatca 343  Q
     ||||||||    
T  12765000 gatgaatca 12764992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7865736 - 7865432
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7865736 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 7865638  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 234  Q
    | ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||   |  || |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  7865637 actggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 7865540  T
Q  235 ctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactc 334  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| |||| | ||| || ||||  ||||||||||||||||     
T  7865539 ctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacattggttgatgggtactt 7865441  T
Q  335 catgaatca 343  Q
     ||||||||    
T  7865440 gatgaatca 7865432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806483
Alignment:
Q  120 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 218  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  219 tattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagat 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806663
Alignment:
Q  120 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 218  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  219 tattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagat 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27347513 - 27347425
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347513 aaagcatagagactattttgtggataggccgatgatcacatctcacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9812039 - 9811735
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9812039 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 9811941  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 234  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  9811940 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 9811843  T
Q  235 ctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactc 334  Q
    ||||||||||| ||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |  || || |||| |||||||||||||||||     
T  9811842 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 9811744  T
Q  335 catgaatca 343  Q
     ||||||||    
T  9811743 gatgaatca 9811735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12704180 - 12703876
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12704180 gagactactatgtatgtagactgatgaccacatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaatatttat 12704082  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgac 234  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||    
T  12704081 attggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagac 12703984  T
Q  235 ctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactc 334  Q
    ||||||||||| ||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |  || || |||| |||||||||||||||||     
T  12703983 ctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataaccataacgttggttgatgggtactt 12703885  T
Q  335 catgaatca 343  Q
     ||||||||    
T  12703884 gatgaatca 12703876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829283
Alignment:
Q  96 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataag 195  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||  ||||||||   ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttat-gtaagttccataag 18829434  T
Q  196 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttg 294  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||      
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtca 18829335  T
Q  295 tccgtaacatgatgactataaagttgg---ttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  18829334 tctataaaatgatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatca 18829283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719477
Alignment:
Q  260 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatca 28719477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 26245102 - 26245402
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | |||| ||||  ||| ||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26245102 gagactattatgtatgtagactgatgattgcatctcatgggtcatagatat-gagatattaagtttatacataggtataaatattaggagtaatatttat 26245200  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | | ||||||||| |  | |||||||| ||||||  | |||||  ||| |||||||||||||||||| | || || | ||||||  | | ||| ||||||    
T  26245201 acttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgttaatagtgtatatcgctcttagacctg 26245297  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||| | ||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | ||| || |||  |||||||||||||||||  ||    
T  26245298 aaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccatagcgttggttgatgggtacttgat 26245396  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  26245397 gaatca 26245402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129695
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| |||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 305  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||| ||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatca 26129695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 343
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539033
Alignment:
Q  264 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || | ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatca 39539033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33477321 - 33477193
Alignment:
Q  41 actattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 140  Q
    ||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||  ||  |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||      
T  33477321 actattatgtgagtaaactgataatcacatatcaaaggtcatggatat-gaaatatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttataca 33477223  T
Q  141 ggattgatccgccatgagaatactacatag 170  Q
      ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33477222 taattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 83
Target Start/End: Original strand, 39535465 - 39535509
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatg 83  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  39535465 agactattatgtatgtagactgatgaccacatctcataggtcatg 39535509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 7273 - 7592
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7273 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 7372  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7373 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 7472  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7473 cacccttcgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 7572  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7573 gatgggtactccatgaatca 7592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6975 - 6656
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6975 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 6876  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6875 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 6776  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6775 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggtt 6676  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6675 gatgggtactccatgaatca 6656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13991 - 13672
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13991 atcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatatta 13892  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13891 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 13792  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13791 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 13692  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  13691 gatggttactccatgaatca 13672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 18454 - 18772
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18454 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18553  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18554 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 18653  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18654 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 18753  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  18754 gat-ggtactccatgaatca 18772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26031 - 25712
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26031 atcattaaagcatagcgactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatatta 25932  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25931 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 25832  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25831 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtt 25732  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  25731 gatgggtactccataaatca 25712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21330289 - 21329970
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330289 atcattaaagcatagagactattatgtaggtggactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 21330190  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330189 tgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 21330090  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21330089 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggtt 21329990  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  21329989 gatggggactccatgaatca 21329970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 18796672 - 18796991
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796672 atcattaaagcattgagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 18796771  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18796772 ggagtaatatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattc 18796871  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  18796872 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgtt 18796971  T
Q  324 gatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  18796972 gatgggtacaccatgaatca 18796991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 30 - 336
Target Start/End: Original strand, 18619976 - 18620281
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18619976 aaagcatatagactattatgtgggtaggccgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagta 18620075  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18620076 atatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttat-gaaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccct 18620174  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18620175 ttgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgctttatcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatggg 18620274  T
Q  330 tactcca 336  Q
    |||||||    
T  18620275 tactcca 18620281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 343
Target Start/End: Original strand, 36270338 - 36270648
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36270338 aaagtataaagactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagta 36270437  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 228  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||  ||| ||||  |||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36270438 atatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag-gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-caccc 36270533  T
Q  229 ttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgg 328  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||||||  ||||||| | ||||||  || | |||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  36270534 ttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgtacaaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgg 36270633  T
Q  329 gtactccatgaatca 343  Q
    |||||| ||||||||    
T  36270634 gtactcaatgaatca 36270648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 336
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978351
Alignment:
Q  74 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  174 aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 272  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||     
T  20978189 aaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagta 20978287  T
Q  273 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactcca 336  Q
    |||||    |||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  20978288 ctttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactcca 20978351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 333
Target Start/End: Original strand, 18822249 - 18822556
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18822249 atcattaaagcagatagattattatgtcaatagactgatgatcacatatcacggatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatatta 18822348  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtatt 222  Q
       ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||  ||| |||||  ||||  ||  |||  |||||||||  ||| |||||||||||    
T  18822349 atggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacgttatgtaaag-atctcaagtcattctcatatagataagtggtgtatt 18822445  T
Q  223 ccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |   |||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  18822446 ccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtacttttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggt 18822545  T
Q  323 tgatgggtact 333  Q
    | |||||||||    
T  18822546 taatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22183518 - 22183220
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22183518 aaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagta 22183419  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccc 228  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||   || |||||  |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22183418 ata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--taatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccc 22183323  T
Q  229 ttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgg 328  Q
    || ||||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| ||||||     | ||||||||||  |||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22183322 tttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagtactttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgg 22183223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6992146 - 6991847
Alignment:
Q  33 gcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaa 130  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  6992146 gcataaagattattatatgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaa 6992047  T
Q  131 tatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccct 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||| ||||   ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6992046 tatttatattggattgatcctccataagaacgctacatag--aaaattat-gtaagtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccaccct 6991950  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgg 328  Q
    ||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||  |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6991949 tcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgg 6991850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 30174377 - 30174677
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174377 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 30174475  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  30174476 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 30174572  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  30174573 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 30174671  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  30174672 gaatca 30174677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24250334 - 24250034
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24250334 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 24250236  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  24250235 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 24250139  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  24250138 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 24250040  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  24250039 gaatca 24250034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24229517 - 24229217
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24229517 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatggttcatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 24229419  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| | | ||    
T  24229418 actggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagccttg 24229322  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||| |||||||  ||    
T  24229321 aaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgaagggtacttgat 24229223  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  24229222 gaatca 24229217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18852085 - 18851956
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18852085 agactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacggatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttata 18851986  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacat 168  Q
    |||||||||  ||| || |||||| |||||    
T  18851985 ttggattgactcgctataagaatattacat 18851956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 170
Target Start/End: Original strand, 19279460 - 19279600
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    |||||||| |||||||||||   || |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  19279460 aaagcataaagactattatgcgagttgactaatgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagta 19279559  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 170  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  19279560 atatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||| |||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 305  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  |||||| |    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 329
Target Start/End: Original strand, 29800468 - 29800757
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggat---aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||   | | | | || |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29800468 agactattatgtatgtagactgatgatcacatcccatgggtcatggatgtgagatattaattaagtatatacatgggtataaatattaggagtaatattt 29800567  T
Q  136 atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacc 235  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  |||| |||||||| |||| ||| |||     
T  29800568 atactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggataatggtgtataccactcttagact 29800664  T
Q  236 tgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 329  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||| ||| |  |||| ||||||| |||||    
T  29800665 tgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatcataatgttggttaatggg 29800757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 316
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241167
Alignment:
Q  182 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttca-ccttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  282 cattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaa 316  Q
    |  |||||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaa 17241167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801899
Alignment:
Q  44 attatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacat-agatataaatattaggagtaatatttatattgg 142  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  143 attga 147  Q
    |||||    
T  36801903 attga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 260
Target Start/End: Original strand, 19616435 - 19616653
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    ||||  |||   || ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  19616435 gagactattatgtatgtagactgatgaccacatctcatgagtcataaatatt-agatattaagtctatacatatgtataaatattaggagtaacatttat 19616533  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
      || ||||| || || |||||||||||||||||  |  |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  19616534 tctgaattgacccaccgtgagaatactacatagt--attttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgataatagtgtatatcactcttagacctg 19616630  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgt 260  Q
    |||||||| ||  ||||||||||    
T  19616631 aaaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301036
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||  | | ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatgaa--gtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 245  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccact 40301036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28741326 - 28741220
Alignment:
Q  40 gactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatat 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||| || | ||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28741326 gactattatgtatgtagactgatgatcacatctcatgcgtcatgaat-atgagatattaagtatgtacataggtataaatattaggagtaatatttatac 28741228  T
Q  140 tggattga 147  Q
     |||||||    
T  28741227 cggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661756
Alignment:
Q  278 tcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaa 340  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaa 41661756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626952
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||   |  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgct--atgttat-gaaagtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 245  Q
     | |||| | ||||  || ||||||||| ||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcact 21626952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  198 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  115 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || || ||||||||||| || |||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  215 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactata 314  Q
    || | || |||  ||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  315 aagttg 320  Q
    ||||||    
T  41316310 aagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24763867 - 24763751
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||  | |||| || |  ||| ||| | ||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  24763867 aaagcatcgagactattatttatgtagactgatgaccacgtctcatgggtcatagacat-gagatattacgtctatacataggtataaatattatgagta 24763769  T
Q  130 atatttatattggattga 147  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24763768 atatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12098649 - 12098609
Alignment:
Q  34 catagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 74  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12098649 catagagactattatgtatgtagactgatgatcagatctca 12098609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  184 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  109 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |  | ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 24 - 326
Target Start/End: Original strand, 1159 - 1461
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1159 atcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatatta 1258  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1259 agagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 1358  T
Q  224 cacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggtt 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  1359 cacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggtt 1458  T
Q  324 gat 326  Q
    |||    
T  1459 gat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 5695 - 6007
Alignment:
Q  24 atcatcaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5695 atcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 5794  T
Q  124 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat-aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||| |||    
T  5795 ggagtaatatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagtaaaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcatt 5885  T
Q  223 cca-cccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgg 321  Q
    ||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5886 ccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgg 5985  T
Q  322 ttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5986 ttgatgggtactccatcaatca 6007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230113
Alignment:
Q  89 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  189 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  289 acgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatca 230113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 183 - 483
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 gagactattatgtatgtcgactgatgaccacatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 281  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  282 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 378  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||    
T  379 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgat 477  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  478 gaatca 483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3977 - 3677
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3977 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 3879  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  3878 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 3782  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  3781 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 3683  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  3682 gaatca 3677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Original strand, 119730 - 120030
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119730 gagactattatgtacgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 119828  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  119829 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 119925  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  119926 aaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgat 120024  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  120025 gaatca 120030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13251 - 12961
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  | ||||  |||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13251 gagactattatgtatgtagaccgatgaccacatctcatgggtcatatatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 13153  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |  ||||||| || || ||||||||||||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||| ||| ||||||    
T  13152 accggattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcataatgataatagtgtatatcactcttagacctg 13056  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtact 333  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| | ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13055 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 130526 - 130268
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130526 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 130428  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  130427 attggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 130331  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 301  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  130330 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaa 130268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 67676 - 67376
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||  | | || ||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  67676 gagactattatgtatatagactgatgaccgcatctcatgggttatagatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 67578  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||| ||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||    
T  67577 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcatgagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctg 67481  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||    
T  67480 aaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgat 67382  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  67381 gaatca 67376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 245
Target Start/End: Original strand, 8305 - 8508
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8305 gagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gagatatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttat 8403  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||    
T  8404 attggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctg 8500  T
Q  238 aaaccact 245  Q
    ||||||||    
T  8501 aaaccact 8508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40290 - 39990
Alignment:
Q  38 gagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  | |||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40290 gagactattatgtatgtagactgatggccacatctcatgggtcatggatat-gagatattaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttat 40192  T
Q  138 attggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctg 237  Q
    |  ||||||| || |  |||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||| ||| ||    
T  40191 accggattgacccactgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacagtgataatggtgtatataactcttagacttg 40095  T
Q  238 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 337  Q
    |||||||| ||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| | ||| || |||||||||| | |||| ||||  ||    
T  40094 aaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaaggataaccataaagttggctaatggttacttgat 39996  T
Q  338 gaatca 343  Q
    ||||||    
T  39995 gaatca 39990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 343
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26842
Alignment:
Q  106 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  206 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 305  Q
    ||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| | |    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  306 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatca 26842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 90151 - 90019
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaa-gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 128  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |    
T  90151 aaagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtat 90052  T
Q  129 aatatttatattggattgatccgccatgagaat 161  Q
    || ||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  90051 aacatttatattggattgacacgcgatgagaat 90019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 317
Target Start/End: Original strand, 8723 - 9005
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagta 129  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||  ||| ||| |||  |   ||||  | |||||||||||||||    
T  8723 aaagcgtagagactaatatgtatgtagattgatgatcacgtctcacatgtcatagatat-gagatattaaggatatgcatatgtgtaaatattaggagta 8821  T
Q  130 atatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccct 229  Q
    ||||||||| | |||||| || | ||||||||||||| |||||   ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |     
T  8822 atatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataatggtgtataccactcc 8918  T
Q  230 tcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaag 317  Q
    | |||||||||||||  ||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   |||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  8919 tagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactataaag 9005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11528
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||   |||||   |  || |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  210 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatga 309  Q
    |||   |||||   | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  310 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 11528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 343
Target Start/End: Original strand, 102 - 286
Alignment:
Q  155 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccct 254  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  255 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatca 343  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  199 agatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatca 286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83116
Alignment:
Q  113 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 212  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||  | ||||   || ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagt--atgtta-cgaaggtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  213 gtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 243  Q
     ||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaacca 83116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 168
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  77 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatat----taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 168  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 204
Target Start/End: Original strand, 53766 - 53927
Alignment:
Q  39 agactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 138  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||  | |||| ||||  ||| ||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||| | |    
T  53766 agactattatgtatgtagattgatgaccgcatctcatgggtcatagatat-gaggtattaattctatacataggtataaatattaagagtaatattcaca 53864  T
Q  139 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca 204  Q
     ||| |||| || || |||||||||||||||||  | |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  53865 ctgggttgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-gaaattgtcataagatattctca 53927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15133 - 15089
Alignment:
Q  30 aaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctca 74  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  15133 aaagcatcgagactattatgtatgtagactgatgaccgcatctca 15089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University