View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19795_high_4 (Length: 522)

Name: NF19795_high_4
Description: NF19795
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19795_high_4
NF19795_high_4
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (46-504)||(26460511-26460967)
chr6 (46-366)||(19272237-19272558)
chr6 (52-464)||(16597177-16597591)
chr6 (52-464)||(18258029-18258454)
chr6 (52-343)||(11794013-11794313)
chr6 (50-133)||(19084721-19084805)
chr6 (139-231)||(1557698-1557791)
chr6 (181-265)||(20440723-20440807)
chr6 (143-226)||(30755548-30755632)
chr6 (108-226)||(19405770-19405889)
chr6 (143-226)||(19038452-19038536)
chr6 (181-265)||(20438100-20438184)
chr6 (143-226)||(23496578-23496662)
chr6 (143-226)||(19025409-19025493)
chr6 (143-226)||(23431940-23432024)
chr6 (143-226)||(23490980-23491064)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (55-504)||(16831859-16832311)
chr5 (55-343)||(18156057-18156346)
chr5 (53-282)||(20024383-20024612)
chr5 (52-402)||(10624160-10624518)
chr5 (77-343)||(40932792-40933059)
chr5 (91-226)||(19859549-19859683)
chr5 (71-226)||(19212406-19212561)
chr5 (57-176)||(26836190-26836309)
chr5 (74-224)||(17432608-17432760)
chr5 (143-226)||(21530334-21530418)
chr5 (52-82)||(40936793-40936823)
chr5 (143-226)||(20506338-20506422)
chr5 (143-226)||(26274116-26274200)
[»] scaffold0417 (1 HSPs)
scaffold0417 (70-504)||(1060-1482)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (52-464)||(1335-1750)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (52-469)||(21256406-21256820)
chr2 (52-343)||(34827556-34827848)
chr2 (57-458)||(10480336-10480740)
chr2 (56-281)||(22593716-22593942)
chr2 (52-464)||(37130190-37130614)
chr2 (52-341)||(23814916-23815215)
chr2 (52-343)||(28567644-28567942)
chr2 (92-339)||(25349247-25349497)
chr2 (139-464)||(23870539-23870865)
chr2 (65-309)||(21904916-21905160)
chr2 (52-343)||(23803285-23803589)
chr2 (139-382)||(22708049-22708286)
chr2 (67-215)||(23769329-23769478)
chr2 (52-192)||(23829764-23829912)
chr2 (43-226)||(16664603-16664786)
chr2 (52-226)||(31817945-31818120)
chr2 (119-225)||(20524168-20524274)
chr2 (52-225)||(22880975-22881149)
chr2 (71-226)||(30089867-30090023)
chr2 (71-226)||(30126472-30126628)
chr2 (71-226)||(30051852-30052008)
chr2 (71-226)||(30142896-30143052)
chr2 (98-225)||(20442245-20442371)
chr2 (66-176)||(25966132-25966243)
chr2 (71-226)||(20281099-20281254)
chr2 (124-225)||(23995665-23995765)
chr2 (143-226)||(22633854-22633938)
chr2 (143-226)||(22648603-22648687)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (52-464)||(12110-12526)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (43-464)||(40342774-40343191)
chr7 (55-343)||(10827729-10828019)
chr7 (55-343)||(11021521-11021811)
chr7 (43-226)||(18752681-18752862)
chr7 (55-178)||(10864190-10864314)
chr7 (153-343)||(24876398-24876589)
chr7 (66-226)||(10478135-10478295)
chr7 (71-226)||(16713223-16713377)
chr7 (71-226)||(17687459-17687613)
chr7 (249-464)||(13346726-13346944)
chr7 (98-226)||(41239201-41239328)
chr7 (139-231)||(15758584-15758677)
chr7 (98-226)||(18450811-18450938)
chr7 (242-339)||(10864085-10864181)
chr7 (142-226)||(11989417-11989502)
chr7 (139-226)||(1978237-1978325)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (48-441)||(250008-250399)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (43-464)||(132373-132788)
chr3 (52-342)||(43135505-43135804)
chr3 (52-226)||(12844499-12844674)
chr3 (91-226)||(13101856-13101990)
chr3 (108-226)||(13023904-13024022)
chr3 (53-161)||(22445017-22445126)
chr3 (65-226)||(55002306-55002468)
chr3 (70-176)||(1934596-1934702)
chr3 (108-226)||(12491947-12492066)
chr3 (71-231)||(12021422-12021584)
chr3 (72-260)||(14133300-14133486)
chr3 (102-132)||(14345555-14345585)
chr3 (143-226)||(10139791-10139875)
chr3 (143-226)||(10171158-10171242)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (52-343)||(4361567-4361864)
chr1 (72-343)||(27901933-27902204)
chr1 (63-258)||(27131704-27131900)
chr1 (253-504)||(27130008-27130256)
chr1 (52-343)||(2603413-2603712)
chr1 (53-282)||(21168275-21168504)
chr1 (43-343)||(21381966-21382266)
chr1 (57-225)||(16406710-16406879)
chr1 (52-343)||(4229781-4230080)
chr1 (52-227)||(21076589-21076765)
chr1 (52-226)||(23511640-23511815)
chr1 (52-222)||(50826413-50826583)
chr1 (100-224)||(21550555-21550678)
chr1 (57-224)||(21137687-21137855)
chr1 (66-133)||(18530668-18530736)
chr1 (108-226)||(22684625-22684744)
chr1 (108-226)||(31845645-31845764)
chr1 (139-226)||(21310759-21310847)
chr1 (139-226)||(29305248-29305336)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (57-309)||(8716-8969)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (57-404)||(27818043-27818390)
chr8 (58-381)||(15337192-15337518)
chr8 (58-381)||(15426257-15426583)
chr8 (58-381)||(15517561-15517887)
chr8 (53-301)||(18735327-18735574)
chr8 (57-309)||(15911661-15911913)
chr8 (52-343)||(22698023-22698322)
chr8 (66-259)||(22698675-22698868)
chr8 (43-226)||(41438768-41438951)
chr8 (57-226)||(29708103-29708273)
chr8 (118-227)||(25388980-25389090)
chr8 (70-201)||(17637818-17637949)
chr8 (70-133)||(17839984-17840048)
chr8 (191-231)||(16668026-16668066)
chr8 (143-226)||(17426119-17426203)
chr8 (143-226)||(22352036-22352120)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (52-337)||(10267142-10267433)
chr4 (70-309)||(49526412-49526654)
chr4 (52-402)||(18566930-18567281)
chr4 (52-336)||(1658509-1658797)
chr4 (60-276)||(31079699-31079919)
chr4 (46-226)||(50687566-50687747)
chr4 (52-226)||(3077875-3078049)
chr4 (52-226)||(14022358-14022533)
chr4 (71-260)||(27812265-27812468)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (52-402)||(14068-14421)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (53-282)||(8955-9184)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (52-464)||(7206-7631)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (52-343)||(3605-3897)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (43-287)||(70604-70848)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (102-282)||(101986-102165)
scaffold0029 (43-80)||(101951-101987)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (52-402)||(36180-36534)
[»] scaffold0770 (2 HSPs)
scaffold0770 (102-282)||(3682-3861)
scaffold0770 (43-80)||(3647-3683)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (43-283)||(7399-7635)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (43-226)||(200148-200330)
[»] scaffold0013 (5 HSPs)
scaffold0013 (57-276)||(129137-129358)
scaffold0013 (57-226)||(107444-107614)
scaffold0013 (57-129)||(129898-129971)
scaffold0013 (57-129)||(136016-136089)
scaffold0013 (57-129)||(144729-144802)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (66-221)||(26873-27027)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (52-226)||(33268-33443)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (57-225)||(68043-68212)
scaffold0059 (57-225)||(76148-76317)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (52-169)||(116490-116608)
scaffold0023 (139-224)||(6674-6760)
scaffold0023 (143-226)||(62171-62255)
scaffold0023 (143-226)||(71349-71433)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (43-226)||(16915-17099)
scaffold0239 (181-226)||(5572-5617)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (43-226)||(45155-45339)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (65-226)||(14971-15132)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (102-226)||(25734-25857)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (108-226)||(32102-32221)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (108-226)||(390108-390227)
[»] scaffold1496 (1 HSPs)
scaffold1496 (107-260)||(1393-1545)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (99-176)||(43649-43726)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (139-231)||(151418-151511)
[»] scaffold0509 (2 HSPs)
scaffold0509 (108-226)||(1206-1325)
scaffold0509 (108-226)||(7634-7753)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (108-226)||(11325-11444)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (108-226)||(30616-30735)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (99-216)||(31202-31318)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (143-226)||(15741-15825)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (143-226)||(39885-39969)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (143-226)||(44282-44366)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (108-226)||(19957-20076)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (181-226)||(683-728)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (143-226)||(8780-8864)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (143-226)||(8100-8184)
scaffold0270 (143-226)||(15230-15314)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (143-226)||(23053-23137)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (143-226)||(50927-51011)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (143-226)||(142238-142322)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (143-226)||(58527-58611)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 46 - 504
Target Start/End: Original strand, 26460511 - 26460967
Alignment:
Q  46 aaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgtt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26460511 aaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagacatttaagaaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgtt 26460610  T
Q  145 catacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaa 244  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26460611 catacattgcaacttgtgactcgtttatctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaa 26460710  T
Q  245 ctattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaata 344  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26460711 ctactatttatactaatagaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaactaacaatacttatccattcgatttgaatttcgaata 26460810  T
Q  345 tgtgcgcctttggaaatatctgttgcttgaccttatccaaaacaaaactgcccttcgatac-cattcgtctgtcgaactgaaacatgtgcttcgagcatt 443  Q
    | |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26460811 tatgcgcc-tcggaaatattcgttgcttgaccttatccgaaac-aaactgctcttcgatactcatt--tctgtcgaactgaaacacgcgcttcgagcatt 26460906  T
Q  444 tccagcaagtccaacttcgatttaaatacataagaataagaaagcattctttatttcttcg 504  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||    
T  26460907 tccaccaagtccaacttcgatttaaatacataagagcaaaagagcattctttatttcttcg 26460967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 46 - 366
Target Start/End: Original strand, 19272237 - 19272558
Alignment:
Q  46 aaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgtt 144  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19272237 aaagtaaaatagattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagacgtttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgtt 19272336  T
Q  145 catacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaa 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  19272337 catacat-gcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcagataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccgttttctcttgcgagaaa 19272435  T
Q  245 ctattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaa-caacacctatccattcgatttgaa-tttcgaa 342  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  19272436 ctactatttatactaatagacataactacctatgtttgaatttaaaactacaactgctataaactaaccaacacccatatattcgatttgaattttcgaa 19272535  T
Q  343 tatgtgcgcctttggaaatatctg 366  Q
    |||| ||||| |||||||||||||    
T  19272536 tatgcgcgcc-ttggaaatatctg 19272558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 52 - 464
Target Start/End: Original strand, 16597177 - 16597591
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16597177 aaatgtattacttaaaagaaacaagtaaattgtaaagacatttaagaaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttcataca 16597276  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactatta 250  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||| ||||  || |||||| ||    
T  16597277 ttgcaacttgtcactcgtttctttcttccatgcggataatttgagtgtaagttttttatatgattggattgtcacctgttttccttaggaaaaactacta 16597376  T
Q  251 tttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaatatgtgcg 350  Q
      ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||   ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||        
T  16597377 cgtatacaaatagaaataactacctagatttgaatttaaaactataactgtagtaaactaacaacacttatccatttgatttgaatttcgaatgtg---- 16597472  T
Q  351 cctttggaaatatctgtt-gcttgaccttatc-----caaaacaaaactgcccttcgataccattcgtctgtcgaactgaaacatgtgcttcgagcattt 444  Q
     | ||| ||||||| ||| || ||||||||||     |||||||||||||| |||||||| | || | |||||||||||||||  | ||||||||||| |    
T  16597473 -ccttgcaaatatccgttggcatgaccttatccaagacaaaacaaaactgctcttcgataacttttgcctgtcgaactgaaacgcgcgcttcgagcatct 16597571  T
Q  445 ccagcaagtccaacttcgat 464  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16597572 ccagcaagtccaacttcgat 16597591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 464
Target Start/End: Original strand, 18258029 - 18258454
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgta-------aagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||       || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18258029 aaatgaattgttcaaaagaaacaaataaattgtagattgcaaaaacatttaagaaaatgaacttaaattgtattgattgaatgtaaattgatacacatgt 18258128  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaa 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||||||  |||    |  |  ||    
T  18258129 tcatacattgcaacttgtgactcgtttctctctttcatgcggataatttgagtgtaacttttttgtattaatgaattgtgaccctttttttctaaggaaa 18258228  T
Q  244 actattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaat 343  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| ||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  18258229 actactatttatacaaatagaaataactgcctagatttgaatttaaaactataactgcaatatactaactatacttatccattcgatttgaatttcgaat 18258328  T
Q  344 atgtgcgcctttggaaatatctgttgc-ttgacctt------atccaaaacaaaactgcccttcgataccattc-gtctgtcgaactgaaacatgtgc-t 434  Q
     |||    |||   ||||| | ||||| ||||||||      ||||| ||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| |||||| | || |    
T  18258329 gtgt----cttgaaaaatacccgttgctttgaccttatctaaatccataacaaaactgccctttgataactttctgtctgtcgaaccgaaacacgcgctt 18258424  T
Q  435 tcgagcatttccagcaagtccaacttcgat 464  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  18258425 tcgagtatctccaacaagtccaacttcgat 18258454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11794313 - 11794013
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaa-------gac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||       ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  11794313 aaatgaattgctcaaaagagacaagtcaattgtaaattgcagagacatttaagaaaatgaacttaaattgtattgattgaatgtaagttggtacacatgt 11794214  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaa 243  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||  |||  | |  |  ||    
T  11794213 tcatacattgcaacttgtgattcgtttatatcttccatgcggataatttgagtgtaaattttttgtataattgaattgtgacccttttttcctatggaaa 11794114  T
Q  244 actattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctat-aaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaa 342  Q
    |||| |||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| ||| |||  |||||||||||||| |||||||||    
T  11794113 actactatttatacatatagaaataactgcctacatttgaatttaaaactataactgcaataaaactaactacatttatccattcgatttaaatttcgaa 11794014  T
Q  343 t 343  Q
    |    
T  11794013 t 11794013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19084805 - 19084721
Alignment:
Q  50 taaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagact-ttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattg 133  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19084805 taaaaggaattgcttgaaataaacaagtaaattgcaaagacaattaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattg 19084721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Original strand, 1557698 - 1557791
Alignment:
Q  139 catgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccacttt 231  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  1557698 catgttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacaatattgagtgtaagttttgagtatgattgaattgtgacctcttt 1557791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20440807 - 20440723
Alignment:
Q  181 tgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttatactaataaaa 265  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| || |  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20440807 tgcggatagtttgagtgtaagttttctatatgaatgtattgtgacctcttttccctatgagaaactgttatttatactaaaaaaa 20440723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 30755548 - 30755632
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  30755548 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacaatattgagtgtaagttttgagtatgattgaattgtgacc 30755632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 19405770 - 19405889
Alignment:
Q  108 aaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttg 206  Q
    |||||||||||| | |||| || ||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||     
T  19405770 aaattgcattgacttaatgaaagttggtgcacatgttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagttttt 19405869  T
Q  207 tgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  19405870 agtatgattgaattgtgacc 19405889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 19038452 - 19038536
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  19038452 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacaatattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 19038536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20438184 - 20438100
Alignment:
Q  181 tgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttatactaataaaa 265  Q
    ||||| || |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| || |  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20438184 tgcgggtagtttgagtgtaagttttctatatgaatgtattgtgacctcttttccctatgagaaactgttatttatactaaaaaaa 20438100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23496662 - 23496578
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23496662 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggatagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 23496578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 19025409 - 19025493
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  19025409 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 19025493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23432024 - 23431940
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | || | ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23432024 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacgaacaatattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 23431940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23491064 - 23490980
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23491064 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggaaagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 23490980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 55 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 16832311 - 16831859
Alignment:
Q  55 tgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagactttaa-gaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatag 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  16832311 tgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagacataaaagaaaatgaatttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttcatacattg 16832212  T
Q  154 caacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattattt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16832211 caacttgtgactcgtttctctcttcaatgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgatcacgttcccttgcgagaaactactattt 16832112  T
Q  254 atactaataaaaataa----ctacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaatatgtgc 349  Q
    ||||||||| ||||||    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16832111 atactaatagaaataacttcctagctatatttgaatttgaaattacaacggctaaaaacgaacaacacttatccattcgatttgaatttcgaatatgtgc 16832012  T
Q  350 gcctttggaaatatctgttgcttgaccttatccaaaacaaaactgcccttcgataccattcgtctgtcgaactgaaacatgtgcttcgagcatttccagc 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16832011 gcctttggaaatatccgttgcttgaccttatccaaaac-aaactgcctttcgatacc-tacgtctgttgaactgaaacacgcgcttcgagcatttccagc 16831914  T
Q  450 aagtccaacttcgatttaaatacataagaataagaaagcattctttatttcttcg 504  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16831913 aagtctaacttcgatttaaatgcataagaataagagagcattctttatttcttcg 16831859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 55 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18156346 - 18156057
Alignment:
Q  55 tgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatag 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||| |    
T  18156346 tgaattgctcaaacgaaacaagtaaattgtaaagacatttaggaaaatgaacttaaattgcattgattgaatataaattggtacacagattcatacattg 18156247  T
Q  154 caacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattattt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  || || ||| |||||    
T  18156246 caacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccttttttccttaggaaaagctactattt 18156147  T
Q  254 atactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcga-tttgaatttcgaat 343  Q
    |||| |||| |||||||| |||| |||| ||||| |||||| || ||| |  ||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18156146 atacaaatagaaataactgcctagatttaaatttaaaactataaatgc-agtaactaacgaaacttatccattcgattttgaatttcgaat 18156057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 282
Target Start/End: Original strand, 20024383 - 20024612
Alignment:
Q  53 aatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacat 151  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||    
T  20024383 aatgagttgcttaaaagaaacaagtaaattgcaaagacatttaagaaaatgaacttaaaatgcattgattgaatgtagattggtacacatattcatacat 20024482  T
Q  152 agcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattat 251  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||    
T  20024483 tgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagtttt-tgtatgattgaattgtgaccctttttccttaagagaaactactat 20024581  T
Q  252 ttatactaataaaaataactacctatatttg 282  Q
    ||||||  ||| |||||||| |||| |||||    
T  20024582 ttatacagatagaaataactgcctagatttg 20024612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10624518 - 10624160
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaa-------gac--tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||  ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  10624518 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaattgcaaagacattttaagaaaatgaacttaaagtgtatttattgaatgtaaattggtacacatg 10624419  T
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc--actttcccttgcga 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    ||||||| |  |    
T  10624418 ttcatacattgcaacttgtgactcatttatctcttccatgcggataatttgagtgtaagtttt-tgtatgatagaattgtgacccttttttccctaggaa 10624320  T
Q  241 gaa--actatt-atttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatt 337  Q
     ||  |||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  10624319 aaactactattaatttatacaaatagaaataactgcctatatttgaatttaaaactataactgc-agtaactaacgaaacttatccattcgatttgaatt 10624221  T
Q  338 tcgaatatgtgcgcctttggaaatatctgttg-cttgaccttatccaaaacaaaactgcccttcga 402  Q
    |||||| |||      ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10624220 tcgaatgtgt-----cttgaaaatatccgttgttttgaccttatccaaaaagaaactgcccttcga 10624160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 77 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40933059 - 40932792
Alignment:
Q  77 taaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctc 175  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40933059 taaattgcaaagacatttaaggaaatgaacttaaattgtattgattgaatgtaaattggtacacatattcatacattgcaacttgtgactcgtttatctc 40932960  T
Q  176 ttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccacttt-cccttgcgagaaactattatttatactaataaaaataactacc 274  Q
    |||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||  ||| |||| | || |||||| ||||||||| |||  ||||||||  |    
T  40932959 ttccatgcagataatttgagtgttagttttttgtatgatagaattgtgaccctttttccctaggga-aaactactatttatacaaattgaaataactgtc 40932861  T
Q  275 tatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaat 343  Q
    || |||||||| | |||||| |||| |  ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  40932860 tagatttgaatctaaaactataactacagtaaactaacgatacttatccattcgatttgaatttcgaat 40932792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Original strand, 19859549 - 19859683
Alignment:
Q  91 tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||   ||  |||| |    
T  19859549 tttaagaaaacaaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacaaattcatacattgggacttgtaactcgtttctct-ttagatgttgatagt 19859647  T
Q  191 ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||    
T  19859648 ttgagtgtaagttttctgtattgttgaattgtgacc 19859683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19212561 - 19212406
Alignment:
Q  71 aacaagtaaattgtaaag-actttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtt 169  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| |||||    |  ||| |||||||    
T  19212561 aacaagtaaattgcaaaggaatttaaagaaacaaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacagattcgtacattttgatgtgtaactcgtt 19212462  T
Q  170 tctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    | |||| |   |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  19212461 tatctc-taaatgcggatagtttgagtgtaagttttttatatgattgaattgtgacc 19212406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 176
Target Start/End: Original strand, 26836190 - 26836309
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagactttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaa 156  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||  | || |||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |  |    
T  26836190 aattgcttgaaaggaacaagtaaattgctaggaatttaaaggaataaacttaaattgcataaattgaatgtaaattgatacacagattcatacatcgaga 26836289  T
Q  157 cttgtgactcgtttctctct 176  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  26836290 cttgttactagtttctctct 26836309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 224
Target Start/End: Original strand, 17432608 - 17432760
Alignment:
Q  74 aagtaaattgtaaagactttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca-tagcaacttgtgactcgtttct 172  Q
    |||||||||| || || |||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||  |||||||| | |  |||||| ||||||||||    
T  17432608 aagtaaattgcaaggaatttaaagagataaacttaaattgcataaattgaatgtaaattggtacacagattcatacatttgttacttgttactcgtttct 17432707  T
Q  173 ctcttctttgcggataatttga--gtgtaagttttgtgtatgattggattgtga 224  Q
    | |||   ||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17432708 c-cttgaatgcagatagtttgagtgtgtaagttttgtgtgtgattgaattgtga 17432760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21530418 - 21530334
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  21530418 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggatagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 21530334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 40936823 - 40936793
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaatt 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40936823 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaatt 40936793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 20506338 - 20506422
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20506338 ttcatactttgcaacttgtaactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagttttgagtatgattgaattgtgacc 20506422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 26274116 - 26274200
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  26274116 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcacttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 26274200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0417 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0417
Description:

Target: scaffold0417; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 70 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 1482 - 1060
Alignment:
Q  70 aaacaagtaaattgtaaagactttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtt 169  Q
    ||||||||||| || |||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1482 aaacaagtaaaatgcaaagatatttagaaaaaaaacttaaactgcattgattgaatgtaaattggtacacatgatcatacattgcaacttgtgactcgtt 1383  T
Q  170 tctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttatactaataaaaataa 269  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  1382 tctctcttccatgcgaataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtaaccactttcccttgagagaaactactatttttactaatagaaataa 1283  T
Q  270 ctacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcga-tttgaatttcgaatatgtgcgcctttggaaatatctgtt 368  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||     |||| |||||| ||||||||||||||||||||            ||| |||    
T  1282 ctacctatatttgaatctgaaattacaactgctataaatgaacagtgtttatctattcgattttgaatttcgaatatgtgc------------atccgtt 1195  T
Q  369 gcttgaccttatccaaaacaaaactgcccttcgataccattcgtctgtcgaactgaaacatgtgcttcgagcatttccagcaagtccaacttcgatttaa 468  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1194 gtttgaccttatccgaaac-aaactgcccttcgatacctcttgcttgtcgaactgaaatacgtgcttcgagcatttcgagcaagtccaacttcgatttaa 1096  T
Q  469 atacataagaataagaaagcattctttatttcttcg 504  Q
    |||  || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  1095 atatttaggaataagagagtattctttatttcttcg 1060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 52 - 464
Target Start/End: Original strand, 1335 - 1750
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1335 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagacatttaagaaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttcataca 1434  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactatta 250  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| ||||  || |||||| ||    
T  1435 ttgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttttgtatgattgacttgtgaccctttttccttaggaaaaactacta 1534  T
Q  251 tttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaatatgtgcg 350  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||  ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||       
T  1535 tttatacaaatagaaataactacctagatttgaatttaaaactataattgcagtaaactaacgatgcatatccattcgatttgaatttcgaatgtgt--- 1631  T
Q  351 cctttggaaatatctgttgcttgaccttat-----ccaaaacaaaactgcccttcgat-accattcgtctgtcgaactgaaacatgtgctt-cgagcatt 443  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||     ||| || |||||| || |||||| ||  ||||  ||||||||||||| | |||||| |||| |||    
T  1632 --cttggaaatatttgttgcttgaccttatctgaaccataaaaaaacttcctttcgataacttttcgcttgtcgaactgaaagacgtgcttccgagtatt 1729  T
Q  444 tccagcaagtccaacttcgat 464  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1730 tccagcaagtccaacttcgat 1750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 52 - 469
Target Start/End: Original strand, 21256406 - 21256820
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21256406 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagacatttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttcataca 21256505  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactatta 250  Q
    |       ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |  |||||| ||    
T  21256506 t-------tgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttttgtatgattgaattgtgaccacttttccttagggaaaactacta 21256598  T
Q  251 tttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaatatgtgcg 350  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||   ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||       
T  21256599 tttatacaaatagaaataactacctatatttaaatttaaaactataactgtggtaaactaacaatacttatccattcgatttgaattttgaatgtgt--- 21256695  T
Q  351 cctttggaaatatctgttgcttgaccttatccaa-----aacaaaactgcccttcgatacc--attcgtctgtcgaactgaaacatgtgc-ttcgagcat 442  Q
       ||| ||||||  |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  21256696 --cttgaaaatattcgttgcttgaccttatccaaaccacaacaaaactgcccttcgataactttttcgcctgtcgaactaaaacacgcgctttcgagcat 21256793  T
Q  443 ttccagcaagtccaacttcgatttaaa 469  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21256794 tttcagcaagtccaactttgatataaa 21256820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Original strand, 34827556 - 34827848
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34827556 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaactgtaaagacatttaagaaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttcataca 34827655  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactatta 250  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||| | || |||||| ||    
T  34827656 ttacaacttgtgactcgtttctctcttccatgcagataatttgagtgtaagttttttgtatgattgaattgtgaccctttttcctagggaaaaactacta 34827755  T
Q  251 tttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaat 343  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  34827756 tttatataaatagaaataactacctagatttgaatttaaaactataactgcggtaaactaacaatacttatccattcgatttgaatttcgaat 34827848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 57 - 458
Target Start/End: Original strand, 10480336 - 10480740
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagca 155  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  10480336 aattgctcgaaataaacaagtaaattgcaaagacatttaagaaaacaaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttcatacattgca 10480435  T
Q  156 acttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccacttt-cccttgcgagaaactattattta 254  Q
    ||||| |||| |||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   || |||||| ||||||    
T  10480436 acttgcgacttgtttctctcttgaatgcggatagttcgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacccttttcccctaaggaaaaactactattta 10480535  T
Q  255 tactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaatatgtgcgcctt 354  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||| ||| ||| || || ||  |  |    
T  10480536 tactaatagaaataactacctacattaagatttgaaactacaactactataaacggacatcagatatccgttcgattcgaaattcaaacatctg-tctct 10480634  T
Q  355 tggaaatatctgttgcttgaccttatccaaaacaaaactgcccttcgataccatt--cgtctgtcgaactgaaacatgtgcttcgagcatttccagcaag 452  Q
    || ||| || ||||||||||| ||||||| ||   |||||| ||||||||   ||  |||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||||    
T  10480635 tgaaaacatatgttgcttgactttatccagaaacgaactgctcttcgatattttttccgtctgtcgaactgaaatctacgtttcgagcatttccagcaag 10480734  T
Q  453 tccaac 458  Q
    ||||||    
T  10480735 tccaac 10480740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 56 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22593942 - 22593716
Alignment:
Q  56 gaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  22593942 gaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagacatttaagaaaatgaacttaaattgcattgattgaatataaattggtacacatgttcatacattgc 22593843  T
Q  155 aacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattattta 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||   | |||||| ||||||    
T  22593842 aacttgtgactcgtttctctcttccatgcgcataatttgagtgtaagttttttgtatgattgaattgtgacccttttcccttagaaaaaactactattta 22593743  T
Q  255 tactaataaaaataactacctatattt 281  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  22593742 tacaaatataaataactacctagattt 22593716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 37130614 - 37130190
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaa-------gac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  37130614 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaactgtaaattataaagacatttaaggaaatgaacttaaattgtactgattgaatgtaaattggtacacatgt 37130515  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtga-ccactttcccttgcgaga 242  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || ||  ||||||| | || |    
T  37130514 tcatacattgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgattgtaagttttttgtatgattgaattgcgaccctttttccctagggaaa 37130415  T
Q  243 aactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaa 342  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||||    
T  37130414 aactactatttatacaaatagaaataactgcctagatttgaatttaaaactataactgcagtaaactaacgatacttatccatttgatttgaatttcgaa 37130315  T
Q  343 tatgtgcgcctttggaaatatctgttgcttgaccttat-----ccaaaacaaaactgcccttcgatacc--attcgtctgtcgaactgaaacatgtgc-t 434  Q
      |||      ||| ||||||| |||||||||||||||     ||| ||| ||| || |||||| || |   |||| |||||||||| |||||  ||| |    
T  37130314 cgtgt-----cttgaaaatatccgttgcttgaccttatccgaaccacaaccaaattgtccttcggtaactttttcgcctgtcgaactaaaacacatgctt 37130220  T
Q  435 tcgagcatttccagcaagtccaacttcgat 464  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37130219 tcgagcattttcagcaagtccaacttcgat 37130190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 341
Target Start/End: Original strand, 23814916 - 23815215
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaa-------gac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23814916 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaactgcaaagacatttaagaaaatgaacttaaagtgtattgattgaatgtaaattggtacacatgt 23815015  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaag-ttttgtgtatgattggattgtga-ccactttcccttgcgag 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||| ||  ||| ||||  |      
T  23815016 tcatacattgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataattttagtgtaagtttttttgtatgatagaattgtgacccttttttccttaggga 23815115  T
Q  242 aaactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcga 341  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  23815116 aaactactatttatacaaatagaaataactgcctagatttgaatttaaaactataactgcagtaaactaactatacttatccattcgatttgaatttcga 23815215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Original strand, 28567644 - 28567942
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaa-------gtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28567644 aaatgaattgctcaaaagaaacaattaagttgtaaattgcaaagacatttaaggaaatgaacttaaattatattgattgaatgtaaattggtacacatgt 28567743  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaa 243  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||  ||| |||   |  ||    
T  28567744 tcatacattgcaacttgtgactcatttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagtttt-tgtatgatagaattgtgaccttttttcctgaaggaaa 28567842  T
Q  244 actattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaat 343  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  28567843 actactatttctacaaatagaaataactgcctagatttgaatttaaaactataactgcagtaaactaacgatacttatccattcgatttgaatttcgaat 28567942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 339
Target Start/End: Original strand, 25349247 - 25349497
Alignment:
Q  92 ttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatt 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||   |||||||| ||    
T  25349247 ttaagaaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatatccatacattgcaacttatgactcgttcctctcttgaatgcggatagtt 25349346  T
Q  192 tgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcg---agaaactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || |  |   | |||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||   |||||    
T  25349347 tgagtgtaagttttgtgtatgatttgattgtgacccgttttccctaagaaaaaaaactactatttatactaatagaagtagctacctacattaagatttg 25349446  T
Q  289 aaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttc 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  25349447 aaactacaactgctataaacgaacaacatatatccgttcgatttgaatttc 25349497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 139 - 464
Target Start/End: Original strand, 23870539 - 23870865
Alignment:
Q  139 catgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgc 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||      
T  23870539 catgttcatacattgcaacttgtgactcgtttctctctctcgtgcaaataatttgagtgtaagttttttgtatgattgaattgtgaccacttttttttag 23870638  T
Q  239 gagaaactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaattt 338  Q
    || |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||  ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  23870639 gaaaaactactatttatacaaatagaaataactacctagatttgaatttaaaactataacggcagtaaactaacaatacttattcattcgatttgaattt 23870738  T
Q  339 cgaatatgtgcgcctttggaaatatctgttgcttgaccttat-----ccaaaacaaaactgcccttcgataccatt-cgtctgtcgaactgaaacatgtg 432  Q
    ||||  |||    |||  ||||||||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||| | || || | |||||||| |||||   |    
T  23870739 cgaaagtgt----ctt--gaaatatctgttgcttgaccttatccgaaccacaacaaaactgcccttcgataactttccgcccgtcgaactaaaacacacg 23870832  T
Q  433 c-ttcgagcatttccagcaagtccaacttcgat 464  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23870833 ctttcgagcattttcagcaagtccaacttcgat 23870865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 309
Target Start/End: Original strand, 21904916 - 21905160
Alignment:
Q  65 aaaagaaacaagtaaattgtaaagact-ttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtga 163  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  21904916 aaaagaaacaagaaaattgcaaagacaattaagagaacaaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttcatacattgtaacttgtga 21905015  T
Q  164 ctcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttatactaataa 263  Q
    |||||| |||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| || |  || ||||||||||||||||| | ||    
T  21905016 ctcgttcctctcttgaatgtggatagtttgagtgtaagttttttgtatgattggtttgtgacctgttttccctatgaaaaactattatttatact-agaa 21905114  T
Q  264 aaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacg 309  Q
     |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  21905115 gaataactacctacattaagatttgaaactacaactgctagaaacg 21905160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Original strand, 23803285 - 23803589
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgta-------aagac-tttaagaaaataaacttaaat-tgcattgattgaatgtaaattgttacgcatg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||  ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23803285 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtagattgtaaagatatttaagaaaatgaacttaaaagtgtattgattgaatgtaaattggtacacatg 23803384  T
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaag-ttttgtgtatgattggattgtgaccactttccct---tgc 238  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||  |||   |   |      
T  23803385 ttcatacattgcaacttgttactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgcaagtttttttgtatgatagaattgtgacccttttttatttatag 23803484  T
Q  239 gagaaactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaattt 338  Q
    || |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| | || |||||| |||||||||||||    
T  23803485 gaaaaactactatttatacaaatagaaataactacctagatttgaatttaaaactataactgcagtaaactaactatacttatccactcgatttgaattt 23803584  T
Q  339 cgaat 343  Q
    |||||    
T  23803585 cgaat 23803589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22708286 - 22708049
Alignment:
Q  139 catgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgc 238  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||       
T  22708286 catgttcatacattgcaatttgtgattcgtttctctcttgcatgcggataatttaagtgtaagttttttgtataattgaattgtgaccacttttcctgag 22708187  T
Q  239 gagaaactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaattt 338  Q
    || |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||  || || || ||||||||||||||||||||    
T  22708186 gaaaaactactatttatagaaatagaaataactacctagatttgaatttaaaactataactgcagtaaattaataatacttatccattcgatttgaattt 22708087  T
Q  339 cgaatatgtgcgcctttggaaatatctgttgcttgaccttatcc 382  Q
    ||||| |||    |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22708086 cgaatgtgt----ctt--gaaatatctgttgcttgaccttatcc 22708049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Original strand, 23769329 - 23769478
Alignment:
Q  67 aagaaacaagtaaattgtaaagact-ttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgact 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  23769329 aagaaacaagtaaattgcaaagacaattaagagaacaaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttcatacattgtaacttgtgact 23769428  T
Q  166 cgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgatt 215  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23769429 cgtttctctcttgaatgcggataatttgagtgtaaattttgtgtatgatt 23769478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 192
Target Start/End: Original strand, 23829764 - 23829912
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgta-------aagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23829764 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtagactgcaaagacatttaagaaaatgaacttaaagtgtattgattgaatgtaaattggtacacatgt 23829863  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataattt 192  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23829864 tcatacattgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataattt 23829912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Original strand, 16664603 - 16664786
Alignment:
Q  43 ataaaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcat 141  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||  |     
T  16664603 ataaaagtaaa-tgaattactcaaaataaacaagtaaattgcaaagacatttaaagaaatgaacttaaattgcattgactgaatgtaggttggtacatag 16664701  T
Q  142 gttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  | |||||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  16664702 attcatacattgcaacttgtgactcgtttatcgcttccatacggatagtttgagcgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 16664786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31818120 - 31817945
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| || |||||  |||| || | |||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||| |    
T  31818120 aaatgaattactcaaaataaacaagtaaattgcaaaaacatttaaagaaatgaattgaaattgcattgactgaatgtaagttggtactcatattcatata 31818021  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||  | |||||| |||||| |||| ||||  ||| ||||| |||||||||    
T  31818020 ttgcaacttgtgactcgtttatcgcttccatacggatagtttgagcgtaaatttttagtacgattgaattgtgacc 31817945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20524274 - 20524168
Alignment:
Q  119 attgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattgga 218  Q
    ||||||||||||||| |||  |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  20524274 attgaatgtaaattggtacaaaaattcatacattgcaacttgtgactcgtttttctcttaaatgcggatagtttgagtgtaagttttctgtatgattgaa 20524175  T
Q  219 ttgtgac 225  Q
    |||||||    
T  20524174 ttgtgac 20524168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22881149 - 22880975
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||  | ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  22881149 aaatgaattactcaaaataaacaagtaaattgcaaagacatttaaagaaatgcatttaaatttcattgagtgaatgtaacttggtacacatattcataca 22881050  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgac 225  Q
    | |||||||||||||||||| || |||   | |||||| ||||||  || |||||  ||||||||| ||||||||    
T  22881049 ttgcaacttgtgactcgtttatcgctttcatacggatagtttgagcatatgtttttagtatgattgaattgtgac 22880975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Original strand, 30089867 - 30090023
Alignment:
Q  71 aacaagtaaattgtaaag-actttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttca-tacatagcaacttgtgactcgt 168  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |  |||||| |||| |    
T  30089867 aacaagtaaattgcaaaggaatttaaagaaataaacgtaaattgcatagactgaatgtaaattggtacacatattcaatacattgtgacttgttactcat 30089966  T
Q  169 ttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||||   | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30089967 ttctctctgaat-gcggatagtttgagtgtaagttttctgtatgattgaattgtgacc 30090023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Original strand, 30126472 - 30126628
Alignment:
Q  71 aacaagtaaattgtaaag-actttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttca-tacatagcaacttgtgactcgt 168  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |  |||||| |||| |    
T  30126472 aacaagtaaattgcaaaggaatttaaagaaataaacgtaaattgcatagactgaatgtaaattggtacacatattcaatacattgtgacttgttactcat 30126571  T
Q  169 ttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||||   | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30126572 ttctctctgaat-gcggatagtttgagtgtaagttttctgtatgattgaattgtgacc 30126628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Original strand, 30051852 - 30052008
Alignment:
Q  71 aacaagtaaattgtaaag-actttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttca-tacatagcaacttgtgactcgt 168  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||  |||||||  |||||||||| || ||||||||||||| ||| ||  |||| ||||| |  |||||| ||||||    
T  30051852 aacaagtaaattgcaaaggaatttaaagaaataaaagtaaattgcatagactgaatgtaaattggtacacagattcaatacattgtgacttgttactcgt 30051951  T
Q  169 ttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||||   | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30051952 ttctctctgaat-gcggatagtttgagtgtaagttttctgtatgattgaattgtgacc 30052008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Original strand, 30142896 - 30143052
Alignment:
Q  71 aacaagtaaattgtaaag-actttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttca-tacatagcaacttgtgactcgt 168  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||  |||||||  |||||||||| || ||||||||||||| ||| ||  |||| ||||| |  |||||| ||||||    
T  30142896 aacaagtaaattgcaaaggaatttaaagaaataaaagtaaattgcatagactgaatgtaaattggtacacagattcaatacattgtgacttgttactcgt 30142995  T
Q  169 ttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||||   | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30142996 ttctctctgaat-gcggatagtttgagtgtaagttttctgtatgattgaattgtgacc 30143052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20442371 - 20442245
Alignment:
Q  98 aaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtg 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |  ||||||||| |  |||||| |||||||| |||| |   |||||||| ||||| ||    
T  20442371 aaataaacgtaaattgcattgatcgaatgtaaattggtacagagattcatacattgtgacttgttactcgtttatctc-tgaatgcggatagtttgattg 20442273  T
Q  198 taagttttgtgtatgattggattgtgac 225  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20442272 taagttttctgtatgattgaattgtgac 20442245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 176
Target Start/End: Original strand, 25966132 - 25966243
Alignment:
Q  66 aaagaaacaagtaaattgtaaaga-ctttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgac 164  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |   ||||||||| |  |||| | ||    
T  25966132 aaagtaacaagtaaattgcaaagggctttaagaaaacaaacttaaattgcgttgattgaaagtaaattgatacacggattcatacattgtgacttttaac 25966231  T
Q  165 tcgtttctctct 176  Q
    ||||||||||||    
T  25966232 tcgtttctctct 25966243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Original strand, 20281099 - 20281254
Alignment:
Q  71 aacaagtaaattgtaaag-actttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtt 169  Q
    ||||||||||||| || | | ||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||   ||||||||    |||||| |||||||    
T  20281099 aacaagtaaattgcaatggaatttaaaaaaataaacgtaaattgcatagatcgaatgtaaattggtacacagaatcatacattctgacttgttactcgtt 20281198  T
Q  170 tctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    |||||| |   |||||||| | ||||||||| |||| ||||||| || |||||||||    
T  20281199 tctctc-tgaatgcggatagtatgagtgtaaattttctgtatgactgaattgtgacc 20281254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 23995665 - 23995765
Alignment:
Q  124 atgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtg 223  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||   | || |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23995665 atgtaaattggtacacagattcatacattgtgacttgttactcgtttctctctaaat-gcagatagtttgagtgtaagttttctgtatgattgaattgtg 23995763  T
Q  224 ac 225  Q
    ||    
T  23995764 ac 23995765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22633938 - 22633854
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  22633938 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 22633854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22648687 - 22648603
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  22648687 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 22648603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 52 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 12526 - 12110
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  12526 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagacatttaagaaaatgaacttaaattgcattggttgaatgcaaattggtacacatgttcataca 12427  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactatta 250  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||   || |||||| ||    
T  12426 ttgcaacttgtgacttgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttttgtatgattgatttgtgacctcttttcctaaggaaaaactacta 12327  T
Q  251 tttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaatatgtgcg 350  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||       
T  12326 tttatataaatagaaataactacctagatttgaatttaaaactataactgcaataaactaacaatacttatccattcgatttgaatttcgaatgtgt--- 12230  T
Q  351 cctttggaaatatctgttgcttgaccttat-----ccaaaacaaaactgcccttcgatacc--attcgtctgtcgaactgaaacatgtgc-ttcgagcat 442  Q
       ||| ||||||  |||||||| ||||||     ||| |||||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||| ||||| | || |||||||||    
T  12229 --cttgaaaatattcgttgcttgtccttatccgaaccacaacaaaactgcccttcgataactttttcgcccatcgaactaaaacacgcgctttcgagcat 12132  T
Q  443 ttccagcaagtccaacttcgat 464  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  12131 tttcaacaagtccaacttcgat 12110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 43 - 464
Target Start/End: Original strand, 40342774 - 40343191
Alignment:
Q  43 ataaaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcat 141  Q
    ||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  40342774 ataaaagtaaagtaaaatgttcaaaagaaacaagtaaattgcaaagacatttaagaaaacaaacttaaattgcattgattaaatgtaaattggtacacat 40342873  T
Q  142 gttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgag 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||  |      
T  40342874 gttcatacattgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttttgtatgattgaattgtgaccacttttcattaagga 40342973  T
Q  242 aaactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcga 341  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||   ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  40342974 aaactactatttatacaaatagaaataactacctagatttgaattcaaaactataactgtagtaaactaacaatacttattcattcgatttgaatttcga 40343073  T
Q  342 atatgtgcgcctttggaaatatctgttgcttgaccttatccaaaacaaaactgcccttcgatacc--attcgtctgtcgaactgaaacatgtg-cttcga 438  Q
    || |||      ||| ||||||| ||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||| |   |||  | |||||||| ||||| | |  |||||    
T  40343074 atgtgt-----cttgaaaatatcggttgcttgaccttatccga---aaacctgcccttcgataactttttcacccgtcgaactaaaacacgcgttttcga 40343165  T
Q  439 gcatttccagcaagtccaacttcgat 464  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  40343166 gcattttcagcaagtccaacttcgat 40343191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 343
Target Start/End: Original strand, 10827729 - 10828019
Alignment:
Q  55 tgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatag 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||||| |    
T  10827729 tgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagacatttaggaaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtgaattggtacacagattcatacattg 10827828  T
Q  154 caacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc--actttcccttgcgagaaactattat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||  |  |||||| |||    
T  10827829 caacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggactgtgacccttttttcccttagggaaaactactat 10827928  T
Q  252 ttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaat 343  Q
    |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |  ||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  10827929 ttatacaaatagaaataactgcctagatttgaatttaaaactataactgc-agtaactaacgaaacttatccattcaatttgaatttcgaat 10828019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 343
Target Start/End: Original strand, 11021521 - 11021811
Alignment:
Q  55 tgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatag 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||||| |    
T  11021521 tgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagacatttaggaaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtgaattggtacacagattcatacattg 11021620  T
Q  154 caacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc--actttcccttgcgagaaactattat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||  |  |||||| |||    
T  11021621 caacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggactgtgacccttttttcccttagggaaaactactat 11021720  T
Q  252 ttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaat 343  Q
    |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |  ||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  11021721 ttatacaaatagaaataactgcctagatttgaatttaaaactataactgc-agtaactaacgaaacttatccattcaatttgaatttcgaat 11021811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18752862 - 18752681
Alignment:
Q  43 ataaaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcat 141  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||     
T  18752862 ataaaagtaaa-tgaattactcaaaagaaacaagtaaattgcaaagacatttaaagaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtaagttggtacacag 18752764  T
Q  142 gttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||  | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  18752763 attcatacattgcaacttgtgactcatttctcgattccatacggataatttgagcgtaagttt--tgtatgattgaattgtgacc 18752681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10864314 - 10864190
Alignment:
Q  55 tgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatag 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||||| |    
T  10864314 tgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaggacatttaggaaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtgaattggtacacagattcatacattg 10864215  T
Q  154 caacttgtgactcgtttctctcttc 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10864214 caacttgtgactcgtttctctcttc 10864190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 343
Target Start/End: Original strand, 24876398 - 24876589
Alignment:
Q  153 gcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc--actttcccttgcgagaaactatta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||| ||| | || |||||| ||    
T  24876398 gcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttttgtatgattgaattgtgaccctttttttcctaggga-aaactacta 24876496  T
Q  251 tttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaat 343  Q
    ||||||| |||| | | | || |||| |||||||||||||| || |||||    |||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  24876497 tttatacaaatagataaagcttcctagatttgaatttgaaattataactgtagaaaactaactatacttatccattcgatttgaatttcgaat 24876589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 226
Target Start/End: Original strand, 10478135 - 10478295
Alignment:
Q  66 aaagaaacaagtaaattgtaaa-gactttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgac 164  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||    |||||| ||    
T  10478135 aaagaaacaagtaaattgcaaaagaatttaagaaaacaaacttaaattgcactaattgaatgtaaattggtacacagattcatacattttgacttgtaac 10478234  T
Q  165 tcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||||||| |   || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  10478235 tcgtttctctc-taaatgtggatagtttgagtgtaagttttctgtatggttgaattgtgacc 10478295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Original strand, 16713223 - 16713377
Alignment:
Q  71 aacaagtaaattgtaaagactttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgttt 170  Q
    ||||||||||||| || || |||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |  |||| | ||||||||    
T  16713223 aacaagtaaattgcaaggaatttaaaggaataaacttaaattgcataaattgaatgtaaattggtacacatattcatacatcgtgacttattactcgttt 16713322  T
Q  171 ctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||| |   ||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  16713323 ctctc-tgaatgcagatagtttgagtgtacgttttctgtatgattgaattgtgacc 16713377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Original strand, 17687459 - 17687613
Alignment:
Q  71 aacaagtaaattgtaaagactttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgttt 170  Q
    ||||||||||||| || || |||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |  |||| | ||||||||    
T  17687459 aacaagtaaattgcaaggaatttaaaggaataaacttaaattgcataaattgaatgtaaattggtacacatattcatacatcgtgacttattactcgttt 17687558  T
Q  171 ctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||| |   ||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  17687559 ctctc-tgaatgcagatagtttgagtgtacgttttctgtatgattgaattgtgacc 17687613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 464
Target Start/End: Original strand, 13346726 - 13346944
Alignment:
Q  249 tatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaatatgtg 348  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||   |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13346726 tatttatacaaatagaaataactatctagatttgaatttaaaactataactgcaggaaactaacaatacttatccattcgatttgaatttcgaatgtgt- 13346824  T
Q  349 cgcctttggaaatatctgttgcttgaccttat-----ccaaaacaaaactgcccttcgatacc--attcgtctgtcgaactgaaacatgtgc-ttcgagc 440  Q
         |||||||||| |||| |||||| ||||     ||| |||||||||||||||| ||| |   || | | ||| |||| ||||| | || |||||||    
T  13346825 ----cttggaaatatttgttacttgactttatccgaaccacaacaaaactgcccttcaataacttttttgcccgtcaaactaaaacacgcgctttcgagc 13346920  T
Q  441 atttccagcaagtccaacttcgat 464  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  13346921 attttcagcaagtccaacttcgat 13346944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 226
Target Start/End: Original strand, 41239201 - 41239328
Alignment:
Q  98 aaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtg 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||| |  |||||| ||||||||||||| |   | |||||| |||||| |    
T  41239201 aaataaacgtaaattgcattgattaaatgtaaattggtacacagattcatacattgtgacttgttactcgtttctctc-tgaatccggatagtttgagcg 41239299  T
Q  198 taagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41239300 taagttttatgtatgattgaattgtgacc 41239328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15758677 - 15758584
Alignment:
Q  139 catgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccacttt 231  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  15758677 catgttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacaatattgagtgtaagttttgagtatgattgaattgtgacctcttt 15758584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18450938 - 18450811
Alignment:
Q  98 aaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtg 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||    |||||| ||||||||||||| |   |||| ||| ||| ||||    
T  18450938 aaataaacataaattgcattgattgaatgtacattggtacacaaattcatacattatgacttgttactcgtttctctc-taaatgcgaatagtttaagtg 18450840  T
Q  198 taagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  18450839 taagttttctgtatggttgaattgtgacc 18450811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10864181 - 10864085
Alignment:
Q  242 aaactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttc 339  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||||  ||| | ||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  10864181 aaactactatttatacaaatagaaataactgtctagatttgaatttaaaactataactgcagtaa-ctaacaaaacttatccattcgaattgaatttc 10864085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 226
Target Start/End: Original strand, 11989417 - 11989502
Alignment:
Q  142 gttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||  | |||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  11989417 gttcatacattgcaacttatgactcgtttgtcgcttccatacggatagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 11989502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Original strand, 1978237 - 1978325
Alignment:
Q  139 catgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||   | |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  1978237 catgttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgctttcatacggacaatattgagtgtaaattttgagtatgattgaattgtgacc 1978325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 48 - 441
Target Start/End: Original strand, 250008 - 250399
Alignment:
Q  48 agtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagact-ttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttca 146  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||    
T  250008 agtaaaataaattgttcaaaagaaacaagtaaaatgtaaaggcacttaagaaaataaacttaaaatgtattgattgaatgtaaattggtacacaaattca 250107  T
Q  147 tacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaact 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  250108 tacattgcaacttgtgactcgtttctcgcttccatatggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccacttttccttgggaaaaact 250207  T
Q  247 attatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaatatg 346  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||  || ||| ||||||  ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||        
T  250208 actatttatacaaatcaaaataactacctagattcgaattcaaacctataactgcagtaaactaacaagtcttatccattcgatttgaatttcgaa---- 250303  T
Q  347 tgcgcctttggaaatatctgttgcttgaccttatcc-aaaacaaaactgcccttcgata-ccattcgtctgtcgaactgaaacatgtgcttcgagca 441  Q
    |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |  || |||  ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  250304 tgcgcc-ttggaaatatccattgtttgaccttatccgaaatcaaaattgcccttcgatagctttttgtccttcgaactgaaacacgtgcttccagca 250399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 43 - 464
Target Start/End: Original strand, 132373 - 132788
Alignment:
Q  43 ataaaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcat 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  132373 ataaaagtaaa-tgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgcaaagacatttaagaaaacaaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacat 132471  T
Q  142 gttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttc-ccttgcga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||  ||| | ||    
T  132472 gttcatacattgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcaaataatttgcgtgtaagttttttgtatgattgaattgtgacccttttttcctaggga 132571  T
Q  241 gaaactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcg 340  Q
     || ||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  132572 aaagctactatttatataaatagaaataactacctaaatttgaatttaaatctataactgcagtaaactaacaatatttatccattcgatttgaatttcg 132671  T
Q  341 aatatgtgcgcctttggaaatatctgttgcttgaccttatccaaaacaaaactgcccttcgataccattcgtctgtcgaactgaaacatgtgc-ttcgag 439  Q
    ||| |||      ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||| |   | | | |||||||| || ||| | || ||||||    
T  132672 aatgtgt-----cttggaaatatctgttacttgaccttatccaa---aaaattgcccttcgagagtttccatttgtcgaaccgacacacgcgctttcgag 132763  T
Q  440 catttccagcaagtccaacttcgat 464  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  132764 tatctccagcaagtccaacttcgat 132788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 342
Target Start/End: Original strand, 43135505 - 43135804
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgta-------aagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43135505 aaatgaattgttcaaaagaaacaagtaaattgtatattgcaaagacatttaagaaaatgaacttaaattgtattgattgaatgtaaattggtacacatgt 43135604  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc--actttcccttgcgag 241  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    ||| ||| | ||     
T  43135605 tcatacattacaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttttgtatgattgaattgtgaccttttttttcctaggga- 43135703  T
Q  242 aaactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcga 341  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| || |||  ||||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||    
T  43135704 aaactactatttatacaaatagaaataactgcctagatttgaatttaaaactataattgcagtaaactaactatacttatccattcaatttgaatttcga 43135803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Original strand, 12844499 - 12844674
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||| |   ||| ||||||||    
T  12844499 aaatgaattacttaaaataaacaagtaaattgcaaagacatttaaagaaatgtattgaaattgcattgattgaatgtaagttggtgtacattttcataca 12844598  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    | ||||||||| |||||||  || ||||  | |||| | |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  12844599 ttgcaacttgtaactcgttagtcgcttccatacggacagtttgagcgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 12844674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13101990 - 13101856
Alignment:
Q  91 tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat 190  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||||  | |||||| ||||||||||||| |   |||||||| |    
T  13101990 tttaagaaaacaaacttaaattacattgattgaatgtaaattggtacacagatttatacatttcgacttgtaactcgtttctctc-taaatgcggatagt 13101892  T
Q  191 ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||| | |||||||    
T  13101891 ttgagtgtatgttttctgtatggttgaactgtgacc 13101856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13024022 - 13023904
Alignment:
Q  108 aaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |  ||||  | |||| ||||||||||||||||||      
T  13024022 aaattgaattgattgaatgtaagttggtacacatattcatacattgcaacttgtgactcgtcagtggcttccatacggacaatttgagtgtaagttttta 13023923  T
Q  208 gtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  13023922 gtatgattgaattgtgacc 13023904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22445126 - 22445017
Alignment:
Q  53 aatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacat 151  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||| ||  |||||||||    
T  22445126 aatgaattactcaaaataaacaagtaaattgcaaagacatttaaagaaatgaacttaaattggattgactaaatgtaagttggtacacaaattcatacat 22445027  T
Q  152 agcaacttgt 161  Q
     |||||||||    
T  22445026 tgcaacttgt 22445017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 226
Target Start/End: Original strand, 55002306 - 55002468
Alignment:
Q  65 aaaagaaacaagtaaattgtaaa-gactttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgt-g 162  Q
    |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||  ||||||||| |  ||||||      
T  55002306 aaaagaaacaagtagattgcaaatgaatttaagaaaacaaatttaaattgcattgattgaaagtagattgatacacagattcatacattgtgacttgtaa 55002405  T
Q  163 actcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    |||| | | |||| |   |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  55002406 actcatctgtctc-taaatgcggatagtttgcgtgtaagttttttgtatgattgaattgtgacc 55002468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Original strand, 1934596 - 1934702
Alignment:
Q  70 aaacaagtaaattgtaaagactttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtt 169  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| ||  |||||| || |  |||||| |||||||    
T  1934596 aaacaagtaaattgcaaggaatttaaaagaataaacttaaattgcataaattgaatgtaagttggtacacagattcatatattgtgacttgttactcgtt 1934695  T
Q  170 tctctct 176  Q
    |||||||    
T  1934696 tctctct 1934702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12492066 - 12491947
Alignment:
Q  108 aaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttg 206  Q
    |||||||||||| |||||  || ||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | || ||||||||||||     
T  12492066 aaattgcattgactgaataaaagttggtgcacatgttcatacattgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacattatttagtgtaagttttt 12491967  T
Q  207 tgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  12491966 agtatgattgaattgtgacc 12491947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Original strand, 12021422 - 12021584
Alignment:
Q  71 aacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtt 169  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  ||||  | | |||||||  ||| ||||||||| ||| | | ||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  12021422 aacaagtaaattgcaaagacatttaaagaaatgtattgaaattgccatgactgaatgtaagttggtgcacatattcatacattgcaacttgtgacttgtt 12021521  T
Q  170 tctctcttctttgcggataa-tttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccacttt 231  Q
    | || ||||  | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  12021522 tgtcgcttccatacgaacaattttgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacctcttt 12021584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14133486 - 14133300
Alignment:
Q  72 acaagtaaattgtaaagactttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttc 171  Q
    |||||||||||| || || |||||   ||| |||||||||| |||  |||||||||| |||| |||  |  ||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  14133486 acaagtaaattgcaaggaatttaaaggaatgaacttaaatttcataaattgaatgtatattggtacatagattcatacattgtgacttgttactcgtttc 14133387  T
Q  172 tctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttatactaa 260  Q
    |||| |   |||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||   |||  |||  || |||||||||||||||||||    
T  14133386 tctc-tgaatgcggatagtttgagtataagtttt-tttatgattgaattgtgactcgtttttcttatgaaaaactattatttatactaa 14133300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 132
Target Start/End: Original strand, 14345555 - 14345585
Alignment:
Q  102 aaacttaaattgcattgattgaatgtaaatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14345555 aaacttaaattgcattgattgaatgtaaatt 14345585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10139875 - 10139791
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  10139875 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 10139791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10171242 - 10171158
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  10171242 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 10171158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Original strand, 4361567 - 4361864
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaa----attgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttca 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4361567 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagacatttaagaaaatgaacttaattaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttca 4361666  T
Q  147 tacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc-actttcccttgcgagaaac 245  Q
    || || ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||   |||| || | || ||||    
T  4361667 tatattgcaacttgttactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtataagttttttgtatgattgaattgtgaccttttttcgctagggaaaaac 4361766  T
Q  246 tattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaat 343  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4361767 tactatttatacaaatagaaataactacatagatttcaatttaaaactataactgcagtaaactaacaatacttatccattcgatttgaatttcgaat 4361864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 72 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27902204 - 27901933
Alignment:
Q  72 acaagtaaattgtaaagactttaagaaaa-taaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgttt 170  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27902204 acaagtaaattgcaaagacatttagaaaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttcatacattgcaacttgtgactccttt 27902105  T
Q  171 ctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttatactaataaaaataac 270  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  27902104 ctctcttccatgtggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacctttttcccttgggaaaaactactatttatacaaatagaaataac 27902005  T
Q  271 tacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaat 343  Q
    | |||| |||||||||| ||||||  | || ||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27902004 tgcctagatttgaatttaaaactatgattg-tagtaactaacaaaacttatccattcgatttgaatttcgaat 27901933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 63 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27131900 - 27131704
Alignment:
Q  63 tcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgt 161  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||    
T  27131900 tcaaaagaaaaaagtaaattgtaaagacatttaagaaaatgaacttaaattgcattgattggatgtaaattggtacacatgttcatacagtgcaacttgt 27131801  T
Q  162 gactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttatact 258  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27131800 gactcgtttctctcttccatgaggataatttgagtgtaagttttgtgtatgataggattgtgaccactttcccttgcgataaactactatttatact 27131704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 253 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 27130256 - 27130008
Alignment:
Q  253 tatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaatatgtgcgcc 352  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  || |||    
T  27130256 tatacgaatagaaataaatacctatatttgaatttgaaactaaaactgctataaactaacaacacttatctattggatttgaatttcgaatacatgtgcc 27130157  T
Q  353 tttggaaatatctgttgcttgaccttatccaaaacaaaactgcccttcgata-ccattcgtctgtcgaactgaaacatgtgcttcgagcatttccagcaa 451  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  27130156 -ttggaaatattcgttgcttgaccttatccgaaac-aaactgctcttcgatattca--cgtctgtcgaactgaaacacgcgcttcaagcatttccagcaa 27130061  T
Q  452 gtccaacttcgatttaaatacataagaataagaaagcattctttatttcttcg 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27130060 gtccaacttcaatttaaatacataagaataagagagcattctttatttcttcg 27130008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Original strand, 2603413 - 2603712
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  2603413 aaatgaattactcaaaagaaacaagtaaattgtaaagacatttaagaaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtatacatgttcataca 2603512  T
Q  151 tagcaacttgtga-ctcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtga-ccactttcccttgcgagaa----- 243  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||||||   || ||         
T  2603513 ttgcaacttgtgatctcgtttctctcttccatgcggataatttgagtttaagtttt-tgtatgattgaattgtaaccctttttccctacagaaaaactac 2603611  T
Q  244 -actattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaa 342  Q
     |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  2603612 tactactatttatacaaatagaaataactacctagatttgaatttaaaactataactgcagtaaactaacaatacttatccattctatttgaatttcgaa 2603711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 53 - 282
Target Start/End: Original strand, 21168275 - 21168504
Alignment:
Q  53 aatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagactt-taagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacat 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||    
T  21168275 aatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgcaaagacatgtaagaaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtagattgctacacatattcatacat 21168374  T
Q  152 agcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattat 251  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| | ||  || |||||| |||    
T  21168375 tgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagtttt-tgtatgattgaattgtgaccctttttcgttaagaaaaactactat 21168473  T
Q  252 ttatactaataaaaataactacctatatttg 282  Q
    |||||| |||| |||||||| |||| |||||    
T  21168474 ttatacaaatagaaataactgcctagatttg 21168504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 343
Target Start/End: Original strand, 21381966 - 21382266
Alignment:
Q  43 ataaaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcat 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||    
T  21381966 ataaaagtaaa-tgaattgctcaaaagaaacaagaaaggtgtaaagacatttaagaaaatgaacttaaattgcattgatcgaatatagattggtacacat 21382064  T
Q  142 gttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcga- 240  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| |||| ||||  ||     
T  21382065 gttcatacattgtaacttgtgactcgtttctctcttccatgcgaataatttgagtgtaagctttttgtatgattgaatcgtgaccccttttcctttggag 21382164  T
Q  241 gaaactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcg 340  Q
    ||||| | ||||||||| |||| | |||| | |||| |||| ||||  |||||| |||||| |  ||| ||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  21382165 gaaaccactatttatacaaatagagataattgcctaaatttaaattaaaaactataactgc-agtaactaacagaacttatccattcgatttgaatttcg 21382263  T
Q  341 aat 343  Q
    |||    
T  21382264 aat 21382266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 16406710 - 16406879
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagca 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||   |    
T  16406710 aattgcttaaaagaaacaagtaaattgcaaagacatttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtcaattggtacacatgttcatacattata 16406809  T
Q  156 acttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  16406810 acttgtgactcgtttctctcttgaatgtggatagtttaagtgtaagtttcgtgtatgatcggtttgtgac 16406879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Original strand, 4229781 - 4230080
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagt-------aaattgtaaagact-ttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||       |||||||||||||  ||||  |||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  4229781 aaataaattgctcaaaagaaacaagtgaattgtaaattgtaaagacacttaaagaaatgaacttgaattgtgttgattgaatgtaagttggtacacatat 4229880  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttc-ccttgcgaga 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||  |||| ||| | || |    
T  4229881 tcatacattgcaacttgtgactcgtttatctcttccatgcggatagtttgagcgtaagttatttgtatgatagaattgtgacccttttctcctaggga-a 4229979  T
Q  243 aactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaa 342  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||  ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  4229980 aactactatttatacaaatagaaataactgcctagatttgaatctaaaactataactgcagtaaactaacgaaacttatccattcgatttgaatttcgaa 4230079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21076765 - 21076589
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  21076765 aaatgaattactcaaaataaacaagtaaattgcaaagacatttaaagaaatgtattgaaattgcattgattgaatgtaagttggtacacatattcataca 21076666  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacca 227  Q
    | ||||||| ||||||||   || ||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  21076665 ttgcaacttatgactcgtcagtcgcttccatacggataatttgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacca 21076589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23511815 - 23511640
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||  ||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  23511815 aaatgaattactcaaaataaacaagtaaattgcaaaggcatttaaagaaatgtatttaaattgcattgactgaatgtaagttggtacacatattcataca 23511716  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||  | |||||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23511715 ttgcaacttgtgactcgtttatcgcttccatacggatagtttgagcgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 23511640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 50826583 - 50826413
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||  |||||| |    
T  50826583 aaatgaattacttaaaagaaacaagtaaattgcaaagacatttaaagaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtaagttagtgcacagattcataga 50826484  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgt 222  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  50826483 ttgcaacctgtgactcgtttctcgcttccaaacggataatttgagtgtaagtttt-tgtatgattgaattgt 50826413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21550678 - 21550555
Alignment:
Q  100 ataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgta 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||    
T  21550678 ataaacgtaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatattcatacattgtgacttgttactcgtttctctc-tgaatgcggatagtttgagtgta 21550580  T
Q  200 agttttgtgtatgattggattgtga 224  Q
    |||||| |||||||||| |||||||    
T  21550579 agttttctgtatgattgaattgtga 21550555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21137855 - 21137687
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagca 155  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||  ||||  | | |||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| |||    
T  21137855 aattactcaaaataaacaagtaaattgcaaaggcatttaaagaaatgtattgaaattgcattgactgaatgtaagttggtacacatattcatacattgca 21137756  T
Q  156 acttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtga 224  Q
    ||||||||||||||| || ||||  | |||||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  21137755 acttgtgactcgtttatcgcttccatacggatagtttgagcgtaagtttttagtatgattgaattgtga 21137687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18530736 - 18530668
Alignment:
Q  66 aaagaaacaagtaaattgtaaag-actttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattg 133  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530736 aaagaaacaagtaaattgcaaaggaatttaagaaaacaaacttaaattgcattgattgaatgtaaattg 18530668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 22684625 - 22684744
Alignment:
Q  108 aaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttg 206  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||| || |||||||| | |||||||||||||| ||| || ||||  | |||| | | ||||| |||||||||     
T  22684625 aaattgcattgattgaatgaaagttggtacacaggttcatactttgcaacttgtgactcatttgtcgcttccatacggacagtattgagcgtaagttttt 22684724  T
Q  207 tgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  22684725 agtatgattgaattgtgacc 22684744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 31845645 - 31845764
Alignment:
Q  108 aaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttg 206  Q
    ||||||||  |||| |||| |||||| | | ||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | ||||||||||||||||    
T  31845645 aaattgcaaagatttaatgaaaattggtgcacatattcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagttttg 31845744  T
Q  207 tgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  31845745 agtatgattgaattgtgacc 31845764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21310847 - 21310759
Alignment:
Q  139 catgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  21310847 catgttcatacattgcaacttctgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 21310759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29305336 - 29305248
Alignment:
Q  139 catgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  29305336 catgttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 29305248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 57 - 309
Target Start/End: Original strand, 8716 - 8969
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagca 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |    
T  8716 aattgcttaaaagaaacaagtaaattgcaaagacatttaagagaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttcatacattgta 8815  T
Q  156 acttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |  |||||| |||||||    
T  8816 acttgtgactcgtttctctcttgaatgtggatagtttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacccgttttccttatggaaaactactatttat 8915  T
Q  256 actaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacg 309  Q
    ||||  | ||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||| |||||    
T  8916 actagaagaaataactacctacattaagatttgaaactacagctgctagaaacg 8969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27818390 - 27818043
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagca 155  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  27818390 aattgcttgaaataaacaagtaaattgcaaagacatttaagaaaacaaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttcatacattgca 27818291  T
Q  156 acttgtgactcgtttctctcttctttgcggata--atttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattattt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  |||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   || |||||| |||||    
T  27818290 acttgtgactcgtttctctcttgcatatggatagtttttaagtgtaagttttgtgtatcattggattgtgacccctttccctaaggaaaaactactattt 27818191  T
Q  254 atactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaatatgtgcgcct 353  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||     ||||||||||| |||||||| || |||||||||  || || |||||||||||||||||| || |   | |    
T  27818190 atactaatagaagtaactacctgtagcaagatttgaaactaaaactgctaaaagcgaacaacatatagccgttcgatttgaatttcgaacatct--actt 27818093  T
Q  354 ttggaaatatctgttgcttgaccttatccaaaacaaaactgcccttcgata 404  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  27818092 ttggatgtatctgttgcttgtccttatccaaaac-gaactgctcttcgata 27818043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15337518 - 15337192
Alignment:
Q  58 attgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaa-------gacttt-aagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatac 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15337518 attgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaattgcaaagacttttaaggaaatgaacttaaattgtattgattgaatgtaaattggtacacatgttcatac 15337419  T
Q  150 atagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtga-ccactttcccttgcgagaaactat 248  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |   ||||||| | || ||||||     
T  15337418 attgcaacttgtgactcgttgctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttttgtatgatagaattgtgatcttttttccctaggga-aaactac 15337320  T
Q  249 tatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaatatgtg 348  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15337319 tatttatacaaatagaaattactgcctagatttgaatttaaaactataactgcagtaaactaacgatacttatccattcgatttgaatttcgaatgtgt- 15337221  T
Q  349 cgcctttggaaatatctgttgcttgaccttatc 381  Q
         ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15337220 ----cttgaaaatatctgttgcttgaccttatc 15337192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15426583 - 15426257
Alignment:
Q  58 attgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaa-------gacttt-aagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatac 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15426583 attgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaattgcaaagacttttaaggaaatgaacttaaattgtattgattgaatgtaaattggtacacatgttcatac 15426484  T
Q  150 atagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtga-ccactttcccttgcgagaaactat 248  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |   ||||||| | || ||||||     
T  15426483 attgcaacttgtgactcgttgctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttttgtatgatagaattgtgatcttttttccctaggga-aaactac 15426385  T
Q  249 tatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaatatgtg 348  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15426384 tatttatacaaatagaaattactgcctagatttgaatttaaaactataactgcagtaaactaacgatacttatccattcgatttgaatttcgaatgtgt- 15426286  T
Q  349 cgcctttggaaatatctgttgcttgaccttatc 381  Q
         ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15426285 ----cttgaaaatatctgttgcttgaccttatc 15426257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15517887 - 15517561
Alignment:
Q  58 attgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaa-------gacttt-aagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatac 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15517887 attgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaattgcaaagacttttaaggaaatgaacttaaattgtattgattgaatgtaaattggtacacatgttcatac 15517788  T
Q  150 atagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtga-ccactttcccttgcgagaaactat 248  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |   ||||||| | || ||||||     
T  15517787 attgcaacttgtgactcgttgctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttttgtatgatagaattgtgatcttttttccctaggga-aaactac 15517689  T
Q  249 tatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaatatgtg 348  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15517688 tatttatacaaatagaaattactgcctagatttgaatttaaaactataactgcagtaaactaacgatacttatccattcgatttgaatttcgaatgtgt- 15517590  T
Q  349 cgcctttggaaatatctgttgcttgaccttatc 381  Q
         ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15517589 ----cttgaaaatatctgttgcttgaccttatc 15517561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 53 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18735574 - 18735327
Alignment:
Q  53 aatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacat 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||    
T  18735574 aatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgcaaagacatttaagaaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtagattggtacagatattcatacat 18735475  T
Q  152 agcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattat 251  Q
     |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||  |||  ||||||||| |||    
T  18735474 tgcaacttgtgactcgtttctttcttccatgcggataatttgagtgtaagtttt-tgtatgattgaattgtgacccttttttcttaagagaaactactat 18735376  T
Q  252 ttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgc 301  Q
    |||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||    
T  18735375 ttatacaaatagaaataactgcctagatttg-atttaaaactataactgc 18735327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15911913 - 15911661
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagact-ttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagca 155  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |    
T  15911913 aattgcttaaaacaaacaagtaaattgtaaagacaattaagagaacaaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttcatacattgta 15911814  T
Q  156 acttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||  || |||||| |||||||    
T  15911813 acttgtgactcgtttctctcttgaatgcggatagtttgagtgtaagttttgtgtatgattggtttgtgacctattttccttatgaaaaactactatttat 15911714  T
Q  256 actaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacg 309  Q
    ||| | || |||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||| |||||    
T  15911713 act-agaagaataactacctacattaagatttgaaactataactgctaaaaacg 15911661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Original strand, 22698023 - 22698322
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgta-------aagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  22698023 aaatgaattactcaaaagaaacaagtaaattgtagactgccaagacatttaagaaaatgaacttaaaatgtattgattgactgtaaattggtacacatgt 22698122  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtga-ccactttcccttgcgaga 242  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||  ||| ||| | || |    
T  22698123 tcatacattgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttttgtatgatagaattgtgacccttttttcctaggga-a 22698221  T
Q  243 aactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaa 342  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||| |||||   |||||  ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  22698222 aactactatttatacaaatagaaataaccgcctagatttgaattttaaacttttactgcagtaaactaactatacttatccattcgatttgaatttcgaa 22698321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 259
Target Start/End: Original strand, 22698675 - 22698868
Alignment:
Q  66 aaagaaacaagtaaattgtaaag-actttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgac 164  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||    | |||| ||    
T  22698675 aaagaaacaagtaaattgaaaaggaatttaaggaaacaaacttaaattgcattgattgaaagtaaattggtatgcatattcatacattttgatttgtaac 22698774  T
Q  165 tcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttatacta 259  Q
    || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |||  | |  |||||||| ||||||||||||    
T  22698775 tcatttctctctac-atgcggataatttgagtgtaagttttctgtatggttgaattgtgacccttttttcctatgagaaactgttatttatacta 22698868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Original strand, 41438768 - 41438951
Alignment:
Q  43 ataaaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcat 141  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||  | | |||||||||||| || |||||| ||| ||  |||    
T  41438768 ataaaagtaaa-tgaattactcaaaataaacaagtaaattgcaaagacatttaaagaaatgtattgaaattgcattgactggatgtaagttggtatacat 41438866  T
Q  142 gttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||  || ||||  | |||||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  41438867 attcatacattgcaacttgtgactcgttcatcgcttccatacggatattttgagcgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 41438951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 226
Target Start/End: Original strand, 29708103 - 29708273
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagca 155  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||| || |||||  ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||| |||    
T  29708103 aattactcaaaataaacaagtaaattgcaaaaacatttaaagaaatgtattgaaattgcattgattgaatgtaagttggtgcacatattcatacattgca 29708202  T
Q  156 acttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||||||||||  || ||||  | | || |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  29708203 acttgtgactcgttagtcgcttccatacagacaatttgagcgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 29708273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 227
Target Start/End: Original strand, 25388980 - 25389090
Alignment:
Q  118 gattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattg 216  Q
    |||| |||| |||||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||| |||||||||    
T  25388980 gatttaatgaaaattggtgcacatgttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagttttgagtatgattg 25389079  T
Q  217 gattgtgacca 227  Q
     ||||||||||    
T  25389080 aattgtgacca 25389090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 201
Target Start/End: Original strand, 17637818 - 17637949
Alignment:
Q  70 aaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgt 168  Q
    |||||||||||||| || ||  |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||| |  |||||| ||||||    
T  17637818 aaacaagtaaattgaaatgaaatttaaataaacaaacgtaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacggattcatacattgtgacttgttactcgt 17637917  T
Q  169 ttctctcttctttgcggataatttgagtgtaag 201  Q
    ||||||| |   |||||||| ||||||||||||    
T  17637918 ttctctc-tgaatgcggatagtttgagtgtaag 17637949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Original strand, 17839984 - 17840048
Alignment:
Q  70 aaacaagtaaattgtaaag-actttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattg 133  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17839984 aaacaagtaaattgcaaaggaatttaagaagacaaacttaaattgcattgattgaaagtaaattg 17840048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 231
Target Start/End: Original strand, 16668026 - 16668066
Alignment:
Q  191 ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccacttt 231  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  16668026 ttgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgaccacttt 16668066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 17426119 - 17426203
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  17426119 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 17426203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 22352036 - 22352120
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  22352036 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 22352120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10267433 - 10267142
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaa-------gac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10267433 aaatgtattgctaaaaagaaacaagtaaattgtaaattgcaaagacatttaagaaaatgaacttaaagtgcattgattgaatgtaaattggtacacatgt 10267334  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaa 243  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||  |  ||    
T  10267333 tcatacattgcaacttgtgattcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagtttt-tgtatgattgaattttgaccacttttccttagggaaa 10267235  T
Q  244 actattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatt 337  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||| |||||| |||||| |  ||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  10267234 actactatttatacaaataaaaacaactgcctagattcgaatttaaaactataactgc-agtaactaacaaaacttatccattcgatttgaatt 10267142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 309
Target Start/End: Original strand, 49526412 - 49526654
Alignment:
Q  70 aaacaagtaaattgtaaagact-ttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49526412 aaacaagtaaattgcaaagacaattaagaaaacaaacttaaattgcattgattgaatgtaaattggtacacatgttcatacattgcaacttgtgactcgt 49526511  T
Q  169 ttctctcttctt-tgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtga-ccactttcccttgcgagaaactattatttatactaataaaaa 266  Q
    |||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||   || |||||| |||||||| ||||| |||    
T  49526512 ttctctctttgaatgcggatagtttgattgtaagttttgtgtatgattggattgtcaccctttttccctaaggaaaaactactatttatattaatagaaa 49526611  T
Q  267 taactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacg 309  Q
     ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  49526612 aaactacctacattaagatttgaaactacaactgctataaacg 49526654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 402
Target Start/End: Original strand, 18566930 - 18567281
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaa-------gac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||| |    
T  18566930 aaatgaattgctaaaaagaaacaagtaaattgtaaattgcaaagacatttaagaaaatgaacttaaagtgtattgtttgaatgtaaattggtacacatat 18567029  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaa 243  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||  |||  || | || ||    
T  18567030 tcattcattgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcgggtaatttgagtgtaagtttt-tgtatgatagaattgtgacctttttttctaggga-aa 18567127  T
Q  244 actattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaat 343  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||| |||| | || ||| |  ||| ||| | || ||||||||| ||||||||||||||     
T  18567128 actactatttatacaaatagaaataattgcctagatttgaatttaaaacaataattgc-agtaactaacgaaacttatccattcaatttgaatttcgaa- 18567225  T
Q  344 atgtgcgcctttggaaatatctgttg-cttgaccttatccaaaacaaaactgcccttcga 402  Q
       |||| | ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18567226 ---tgcgtc-ttgaaaatatccgttgttttgaccttatccaaaaagaaactgcccttcga 18567281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1658797 - 1658509
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattg-------taaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  1658797 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgcaaattgtaaagacatttaaagaaatgaacttgaattgtattgattgaatgtaagttggtacacatat 1658698  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgac-cactttcccttgcgaga 242  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |  ||| || |  |  |    
T  1658697 tcatacattgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagtttt-tgtatgatagaattgtgacacttttttccctaaggaa 1658599  T
Q  243 aactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaat 336  Q
    ||||| | |||||||    |||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  1658598 aactactgtttatac----aaaaataactgcctagatttgaatttaaaactataactgcagtaaactaacgaaacttatccattcgatttgaat 1658509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 276
Target Start/End: Original strand, 31079699 - 31079919
Alignment:
Q  60 tgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagacttt--aagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaac 157  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||  || ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||| |||| ||||     
T  31079699 tgctcaaaagaaacaagaaagctctaaagacatttaaaaaaaatgaacttaaattgcattgatcgaatatagattggtacacatgttcacacattgcaat 31079798  T
Q  158 ttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccac--tttcccttgcgagaaactattatttat 255  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||| |||   ||||||| |||||||    
T  31079799 ttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttttgtatgattgaattgtgacccctttttcctttggaggaaactactatttat 31079898  T
Q  256 actaataaaaataactaccta 276  Q
    || |||| |||||||| ||||    
T  31079899 acaaatagaaataactgccta 31079919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 50687747 - 50687566
Alignment:
Q  46 aaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagact-ttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgtt 144  Q
    ||||||| || |||| || |||||||||||||| |||| ||||||  |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  50687747 aaagtaagataaattacttaaaagaaacaagtagattgcaaagacaattaagagaacaaacttaaattgcatttattgaatgtaaattggtacacatgtt 50687648  T
Q  145 catacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    |||||||   |||||||||||||||| ||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50687647 catacattataacttgtgactcgtttgtctcttgaatgcggatagcctgagtgtaagttttgtgtatgattggtttgtgacc 50687566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Original strand, 3077875 - 3078049
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||    
T  3077875 aaatgaatcacttaaaagaaacaagtaaattgcaaagacatttaaagaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtaagttggtacacagattcataca 3077974  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    |  ||||||||| |||||||||  ||||  | |||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3077975 ttacaacttgtggctcgtttcttgcttccatacggataatttgagcttaagtttt-tgtatgattgaattgtgacc 3078049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Original strand, 14022358 - 14022533
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaaga--ctttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatac 149  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||  ||| |||||| |  | | |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||    
T  14022358 aaatgaattactcaaaataaacaagtaaattgcaatgatacttaaagaaa-tgtattgaaattgcattgattgaatgtaagttagtacacatattcatac 14022456  T
Q  150 atagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    || ||||||||||||||||   |  ||||| | |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  14022457 attgcaacttgtgactcgtcagttgcttctatacggacaatttgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 14022533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 260
Target Start/End: Original strand, 27812265 - 27812468
Alignment:
Q  71 aacaagtaaattgtaaagactttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgac------ 164  Q
    ||||||||||||| || || |||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||          
T  27812265 aacaagtaaattgcaaggaatttaaaggaataaacttaaattgcataaattgaatgtaaattggtagacatattcatacattgcaacttgtgacttgttt 27812364  T
Q  165 --------tcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttata 256  Q
            | ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||  | || || |||||||||||||||    
T  27812365 gtttttgtttgtttctctctgaaatgcggataatttgagtgtaagttttctgtatgattgaattgtgacccgtttttcatgtgaaaaactattatttata 27812464  T
Q  257 ctaa 260  Q
    ||||    
T  27812465 ctaa 27812468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 402
Target Start/End: Original strand, 14068 - 14421
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaa-------gac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14068 aaatgaactgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaattgcaaagacatttaagaaaatgaacttaaaataaattgattgaatgtaaattggtacacatgt 14167  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaa 243  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||  |  ||    
T  14168 tcatacattgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagtttt-tgtatgattgaattgtgaccctttttccttagggaaa 14266  T
Q  244 actattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaat 343  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||| |  ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14267 actactatttatacaactagaaataactgcctagattcgaatttaaaactataactgc-agtaactaacaaaacttatccattcgatttgaatttcgaat 14365  T
Q  344 atgtgcgcctttggaaatatctgttg-cttgaccttatcc-aaaacaaaactgcccttcga 402  Q
     |||      ||| ||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14366 gtgt-----cttgaaaatatccgttgttttgaccttatccaaaaagaaaactgcccttcga 14421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 53 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9184 - 8955
Alignment:
Q  53 aatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacat 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||    
T  9184 aatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgcaaagacatttaagaaaatgaacttaaattgcattgattgaatgtagattggtacacatattcatacat 9085  T
Q  152 agcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattat 251  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||   ||| ||||  ||||||||| |||    
T  9084 tgcaacttgtgacttgtttctctcttccatgcggataatttgaatgtaagtttt-tgtatgattgaattgtgactctttttccttaagagaaactactat 8986  T
Q  252 ttatactaataaaaataactacctatatttg 282  Q
    |||||| |||| |||||||| |||| |||||    
T  8985 ttatacaaatagaaataactgcctagatttg 8955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 7631 - 7206
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaa-------gac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  7631 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaattgtaaagacatttaattaaatgaactttaattgtattgattgaatgtaagttgatacacatgt 7532  T
Q  144 tcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtga--ccactttcccttgcgag 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  |   ||||||| | |||    
T  7531 tcatacattgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtatgttttttgtatgattgaattgtgactcttttttccctagggag 7432  T
Q  242 aaactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcga 341  Q
     | ||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||    ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  7431 -agctattatttatacaaatagaaataactgcctagatttgaatttaaaactataactatagtaaactaacgatacttatccattcgatttgaatttcga 7333  T
Q  342 atatgtgcgcctttggaaatatctgttgcttgaccttat------ccaaaacaaaactgcccttcgataccatt-cgtctgtcgaactgaaacatgtgc- 433  Q
    || |||    |||   |||||| ||||||||||||||||      ||| |||||||||| ||||||||| | || || |||||||||| |||||   ||     
T  7332 atgtgt----cttgaaaaatatatgttgcttgaccttatctaaaaccacaacaaaactgtccttcgataactttccgcctgtcgaactaaaacacacgct 7237  T
Q  434 ttcgagcatttccagcaagtccaacttcgat 464  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7236 ttcgagtatctccagcaagtccaacttcgat 7206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3897 - 3605
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaa-gaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatac 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||    
T  3897 aaatgaattgctcaaaaagaaacaagtgaattgtaaagatgtttaaggaaatgaacttgaattatattgattgaatataaattggt-cacatgttcatac 3799  T
Q  150 atagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtga-ccactttcccttgcgagaaactat 248  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||| ||||||| | || ||||||     
T  3798 atttcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagttttttgtatgatagaattgtgacccattttccctaggga-aaactac 3700  T
Q  249 tatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcgaat 343  Q
    || |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3699 tacttatacaaatagaaataactgcctagatttgaattaaaaactataactgcagtaaactaacgacacttatccatttgatttgaatttcgaat 3605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 70848 - 70604
Alignment:
Q  43 ataaaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcat 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||    
T  70848 ataaaagtaaa-tgaattgctcaaaagagacaagaaagctgtaaagacatttaagaaaatgaacttaaattgcattgactgaatgtaaattggtaaacat 70750  T
Q  142 gttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtga-ccactttcccttgcga 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||  |||||||   ||    
T  70749 gttcatacattgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaagtattttgtatgattgaattgtgatccgttttccctatgga 70650  T
Q  241 gaaactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaattt 287  Q
     |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  70649 -aaactactatttatacaaatagaaataactgcctagattcgaattt 70604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 282
Target Start/End: Original strand, 101986 - 102165
Alignment:
Q  102 aaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaag 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  101986 aaacttaaaatgcattgattgaatgtagattggtacacatattcatacattgcaacttttgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaag 102085  T
Q  202 ttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttatactaataaaaataactacctatatttg 282  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||    
T  102086 tttt-tgtatgattgaattgtgaccctttttccttaagagaaactattatttatacaaatagaaataactgcctagatttg 102165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 80
Target Start/End: Original strand, 101951 - 101987
Alignment:
Q  43 ataaaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaa 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  101951 ataaaagtaaa-tgaattgctcaaaagaaacaagtaaa 101987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 36534 - 36180
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaa-------gac--tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatg 142  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||  |||||| |||| ||||| ||||| ||||||  ||||||| ||| ||| ||||    
T  36534 aaatgaattgctcaaatgaaacaagtaaattgtaaattgcaaagacattttaagtaaatgaacttgaattgaattgatcaaatgtaagttggtacacatg 36435  T
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgt-gaccactttcccttgcgag 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||| | ||  ||||||  ||||     
T  36434 ttcatacattgcaacttgtgactcgtttctctcttccatgcgaataattagagtgaaagtattttgtattattggattgtagccctttttccccagcga- 36336  T
Q  242 aaactattatttatactaataaaaataactacctatatttgaatttgaaactacaactgctataaacgaacaacacctatccattcgatttgaatttcga 341  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |  ||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  36335 aaactactatttatgcaaatattaataactgcctagatttgaatttaaaactataactgc-agtaactaacgaaacttatccattcgatttgaatttcga 36237  T
Q  342 atatgtgcgcctttggaaatatctgttg-cttgaccttatccaaaacaaaactgcccttcga 402  Q
    ||||||      ||| || |||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36236 atatgt-----cttgaaattatccgttgttttgaccttatccaaaagaaaactgcccttcga 36180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0770 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0770
Description:

Target: scaffold0770; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 282
Target Start/End: Original strand, 3682 - 3861
Alignment:
Q  102 aaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaag 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3682 aaacttaaaatgcattgattgaatgtagattggtacacatattcatacattgcaacttttgactcgtttctctcttccatgcggataatttgagtgtaag 3781  T
Q  202 ttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttatactaataaaaataactacctatatttg 282  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  |||  |||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||    
T  3782 tttt-tgtatgattgaattgtgaccctttttacttaagagaaactaatatttatacaaatagaaataactgcctagatttg 3861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0770; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 80
Target Start/End: Original strand, 3647 - 3683
Alignment:
Q  43 ataaaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaa 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3647 ataaaagtaaa-tgaattgctcaaaagaaacaagtaaa 3683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7635 - 7399
Alignment:
Q  43 ataaaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcat 141  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||  ||  | |    
T  7635 ataaaagtaaa-tgaattactcaaaagaaacaagtaaattgtaaagacatttaagaaaatgaacttaaaatgcattgattgaatgtagattcgta--ctt 7539  T
Q  142 gttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgag 241  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||  | | ||||  |||    
T  7538 actcatacattgcaacatgtgactcgtttatctcttccatgcggataatttgagtgtaagttt--tgtatgattgaattgcgacccttattccttaagag 7441  T
Q  242 aaactattatttatactaataaaaataactacctatatttga 283  Q
     ||| | ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||    
T  7440 gaacaactatttatacaaatagaaataactgcctagatttga 7399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 200330 - 200148
Alignment:
Q  43 ataaaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcat 141  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||     
T  200330 ataaaagtaaa-tgaattactcaaaagaaacaagtaaattgcaaagacgtttaaagaaatgaacttaaattgcattgatcgaatataagttggtacacag 200232  T
Q  142 gttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  200231 attcatacattgcaacttgtgactcatttctcgcttccataaggataatttgagtgtaagtttt-tgtatgattgaattgtgacc 200148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 129358 - 129137
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagactttaaga-aaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagca 155  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||    
T  129358 aattactcaaaataaacaagtaaattgcaaagacatttagagaaatgaacttaaattgcattgactgaatgtaagttgttacacagattcatacattgca 129259  T
Q  156 acttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttat 255  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |  ||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| |||||||||  |||  | |  || |||||| |||||||    
T  129258 acttgtgactcgtttatcgcttccataaggatagtttgagcgtaaatttttagtatgattgaattgtgacccttttttcctaagaaaaactactatttat 129159  T
Q  256 actaataaa-aataactaccta 276  Q
    || |||||| ||||||||||||    
T  129158 acaaataaagaataactaccta 129137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 107614 - 107444
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagca 155  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||  ||||||||| |||    
T  107614 aattactcaaaataaacaagcaaattgcaaagacatttaaagaaatgaacttaaattgcattgacggaatgtaagttggtacacagattcatacattgca 107515  T
Q  156 acttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |  ||||| | |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  107514 acttgtgactcgtttatcgcttccataaggatagtctgagcgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 107444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 129971 - 129898
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagactttaaga-aaataaacttaaattgcattgattgaatgtaa 129  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  129971 aattactcaaaataaacaagtaaattgcaaagacatttagagaaatgaacttaaattgcattgactgaatgtaa 129898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 136089 - 136016
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagactttaaga-aaataaacttaaattgcattgattgaatgtaa 129  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  136089 aattactcaaaataaacaagtaaattgcaaagacatttagagaaatgaacttaaattgcattgactgaatgtaa 136016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 144802 - 144729
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagactttaaga-aaataaacttaaattgcattgattgaatgtaa 129  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  144802 aattactcaaaataaacaagtaaattgcaaagacatttagagaaatgaacttaaattgcattgactgaatgtaa 144729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 221
Target Start/End: Original strand, 26873 - 27027
Alignment:
Q  66 aaagaaacaagtaaattgtaaagactttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgact 165  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||  |  |||||| |||    
T  26873 aaagaaacaagtaaattgcgaagaatttaagaaaacaaacttaaattgcattgattgaaagtaaattggtacacatattcatacagtgtgacttgtaact 26972  T
Q  166 cgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattg 221  Q
    |||||||||| |   ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||| ||||    
T  26973 cgtttctctc-taaatgcagatagtttgattgtaagttttttgtatggttgaattg 27027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Original strand, 33268 - 33443
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||  ||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  33268 aaatgaattactcaaaataaacaagtaaattgcaaaggcatttaaagaaatgtatttaaattgcattgactgaatgtaagttggtacacatattcataca 33367  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    |  ||||||||||||||||| || ||||  |  ||||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  33368 ttccaacttgtgactcgtttatcgcttccatatggatagtttgagcgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 33443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 68043 - 68212
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagactttaaga-aaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagca 155  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||  ||||||||| |||    
T  68043 aattactcaaaataaacaagcaaattgcaaagacatttagagaaatgaacttaaattgcattgactgaatgtaagttagtacacagattcatacattgca 68142  T
Q  156 acttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgac 225  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |  ||||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  68143 acttgtgactcgtttatcgcttccataaggatagtttgagcgtaagtttttagtatgattgaattgtgac 68212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 76148 - 76317
Alignment:
Q  57 aattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagactttaaga-aaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagca 155  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||  |  ||| ||  ||||||||| |||    
T  76148 aattactcaaaataaacaagcaaattgcaaagacatttagagaaatgaacttaaattgcattgacagaatgtaagatagtacacagattcatacattgca 76247  T
Q  156 acttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgac 225  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |  ||||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  76248 acttgtgactcgtttatcgcttccataaggatagtttgagcgtaagtttttagtatgattgaattgtgac 76317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 116608 - 116490
Alignment:
Q  52 aaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcataca 150  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||  | | |||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  116608 aaatgaattactcaaaataaacaagtaaattgcaaagacatttaaagaaatgtattgaaattgcattgactgaatgtaagttggtacacatattcataca 116509  T
Q  151 tagcaacttgtgactcgtt 169  Q
    | |||||||||||||||||    
T  116508 ttgcaacttgtgactcgtt 116490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 6674 - 6760
Alignment:
Q  139 catgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtga 224  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6674 catgttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagttttttgtatgattgaattgtga 6760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 62255 - 62171
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||| || ||||  | |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  62255 ttcatactttgcaacttgtgattcgtttgtcgcttccatacggacaatattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 62171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 71433 - 71349
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||| || ||||  | |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  71433 ttcatactttgcaacttgtgattcgtttgtcgcttccatacggacaatattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 71349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Original strand, 16915 - 17099
Alignment:
Q  43 ataaaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcat 141  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||| |||||| |||||  ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||| | | |||    
T  16915 ataaaagtaaa-tgaattacttaaaatgaacaagtaaattgcaaagacatttaaagaaatgtagtgaaattgcattgattgaatgtaagttggtgcacat 17013  T
Q  142 gttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  | || | ||| ||||| | |||||||  ||||||||| |||||||||    
T  17014 gttcatacattgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacgaacaatattgagcgcaagtttttagtatgattgaattgtgacc 17099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5617 - 5572
Alignment:
Q  181 tgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  5617 tgcggatagtttgagtgtaagttttctatatgattgaattgtgacc 5572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Original strand, 45155 - 45339
Alignment:
Q  43 ataaaagtaaaatgaattgctcaaaagaaacaagtaaattgtaaagac-tttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcat 141  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||| |||||| |||||  ||||  | | |||||||||||||||||||||| ||| | | |||    
T  45155 ataaaagtaaa-tgaattactaaaaatgaacaagtaaattgcaaagacatttaaagaaatgtattgaaattgcattgattgaatgtaagttggtgcacat 45253  T
Q  142 gttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||  | |||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  45254 attcatacattgcaacttgtgactcgtttgccgcttccatacggacaatattgagcgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 45339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 226
Target Start/End: Original strand, 14971 - 15132
Alignment:
Q  65 aaaagaaacaagtaaattgtaaag-actttaagaaaataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtga 163  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||||||    |||||| |    
T  14971 aaaagaaacaaataaattgcaaaggaatttaagaaaacaaactgaaattgcattgattgaatgtaaatcggtacacaaattcatacattttgacttgtaa 15070  T
Q  164 ctcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| |||| |   |||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  15071 ctcgtttatctc-tagatgcggatagttttagtgtaagttttttgtctggttgaattgtgacc 15132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 226
Target Start/End: Original strand, 25734 - 25857
Alignment:
Q  102 aaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaag 201  Q
    |||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||  ||||||||| |  |||||| |||| |||||||||   | ||||||||||| ||||||||    
T  25734 aaacgtaaattgcatttattaaacgtaaattggtacacagattcatacattgtgacttgttactcatttctctctaaat-gcggataatttaagtgtaag 25832  T
Q  202 ttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  25833 ttttctgtatgattgaattgtgacc 25857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32221 - 32102
Alignment:
Q  108 aaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttg 206  Q
    |||||||||||| | |||| |||||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||  | |||| ||| |||||||||||||||     
T  32221 aaattgcattgacttaatgaaaattggtgcacatgttcatactttgcaacttttgactcgtttgtcgcttccatacggacaatattgagtgtaagttttt 32122  T
Q  207 tgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  32121 agtatgattgaattgtgacc 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 390227 - 390108
Alignment:
Q  108 aaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttg 206  Q
    ||||||||  |||| |||| |||||| | | ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||  | |||| | | ||||||||||||||||    
T  390227 aaattgcaaagatttaatgaaaattggtgcacatattcatactttgcaacttgtgactcgtttgtctcttccatacggacagtattgagtgtaagttttg 390128  T
Q  207 tgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  390127 agtatgattgaattgtgacc 390108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1496 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1496
Description:

Target: scaffold1496; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1545 - 1393
Alignment:
Q  107 taaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgtaagttttg 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||    |||||| |||||||||||||     ||| |||| ||||||||||||||||     
T  1545 taaattgcaatgattgaatgtaaattggtacacagattcatacattctgacttgttactcgtttctctc-cgaatgcagatagtttgagtgtaagttttc 1447  T
Q  207 tgtatgattggattgtgaccactttcccttgcgagaaactattatttatactaa 260  Q
     ||||||||| |||||||||  |||  |||  || |||||| ||||||||||||    
T  1446 cgtatgattgaattgtgacccgtttttcttatgaaaaactactatttatactaa 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Original strand, 43649 - 43726
Alignment:
Q  99 aataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctct 176  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  43649 aataaacttaaattgcataaattgaatgtaaattggtacacagattcatacatcgagacttgttactcgtttctctct 43726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Original strand, 151418 - 151511
Alignment:
Q  139 catgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgaccacttt 231  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  151418 catgttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggatagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgaccccttt 151511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 1206 - 1325
Alignment:
Q  108 aaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttg 206  Q
    |||||||||||| | |||| |||||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | || ||||||||||||     
T  1206 aaattgcattgacttaatgaaaattggtgcacatgttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtatttagtgtaagttttt 1305  T
Q  207 tgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  1306 agtatgattgaattgtgacc 1325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 7634 - 7753
Alignment:
Q  108 aaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttg 206  Q
    |||||||||||| | |||| |||||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | || ||||||||||||     
T  7634 aaattgcattgacttaatgaaaattggtgcacatgttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtatttagtgtaagttttt 7733  T
Q  207 tgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  7734 agtatgattgaattgtgacc 7753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11444 - 11325
Alignment:
Q  108 aaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttg 206  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||| || |||||||| | |||||||||||||| ||| || ||||  | |||| | | ||||| |||||||||     
T  11444 aaattgcattgattgaatgaaatttggtacacaggttcatactttgcaacttgtgactcatttgtcgcttccatacggacagtattgagcgtaagttttt 11345  T
Q  207 tgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  11344 agtatgattgaattgtgacc 11325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30735 - 30616
Alignment:
Q  108 aaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttg 206  Q
    ||||| |||||| | |||| |||||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||     
T  30735 aaatttcattgacttaatgaaaattggtgcacatgttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagttttt 30636  T
Q  207 tgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  30635 agtatgattgaattgtgacc 30616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 31202 - 31318
Alignment:
Q  99 aataaacttaaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataatttgagtgt 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |  | |||| || ||||||||| ||   || ||||| |||||||||    
T  31202 aataaacttaaattgcataaattgaatgtaaattggtacacagattcatacattgtgatttgttacgcgtttctct-ttgaatgtggatagtttgagtgt 31300  T
Q  199 aagttttgtgtatgattg 216  Q
     |||||| ||||||||||    
T  31301 tagttttctgtatgattg 31318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15825 - 15741
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  15825 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggatagtattgagtgtaagttttgagtatgattgatttgtgacc 15741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39969 - 39885
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39969 ttcatacttcgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagttttttgtatgattgaattgtgacc 39885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 44282 - 44366
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44282 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagttttttgtatgattgaattgtgacc 44366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 226
Target Start/End: Original strand, 19957 - 20076
Alignment:
Q  108 aaattgcattgattgaatgtaaattgttacgcatgttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttg 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |   | ||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||  | |||| ||| ||||| |||||||||     
T  19957 aaattgcattgattgaatgtaagttggtgcatctattcatacattgcaacttgtgactcatttgtagcttccatacggacaatattgagcgtaagttttt 20056  T
Q  207 tgtatgattggattgtgacc 226  Q
     ||||||||| |||||||||    
T  20057 agtatgattgaattgtgacc 20076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 226
Target Start/End: Original strand, 683 - 728
Alignment:
Q  181 tgcggataatttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  683 tgcggatagtttgagtgtaagttttttgtatgactgaattgtgacc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 8780 - 8864
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  8780 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 8864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 8100 - 8184
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  8100 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 8184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 15230 - 15314
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  15230 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 15314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23137 - 23053
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23137 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 23053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 50927 - 51011
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  50927 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 51011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 142238 - 142322
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  142238 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagttttgaatatgattgaattgtgacc 142322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 58611 - 58527
Alignment:
Q  143 ttcatacatagcaacttgtgactcgtttctctcttctttgcggataat-ttgagtgtaagttttgtgtatgattggattgtgacc 226  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  | |||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  58611 ttcatactttgcaacttgtgactcgtttgtcgcttccatacggacagtattgagtgtaagtttttagtatgattgaattgtgacc 58527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University