View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19795_high_6 (Length: 506)

Name: NF19795_high_6
Description: NF19795
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19795_high_6
NF19795_high_6
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (204-394)||(253013-253204)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (204-394)||(14564171-14564362)
chr4 (212-350)||(4954084-4954223)
chr4 (212-326)||(29149340-29149454)
chr4 (212-326)||(39636724-39636838)
chr4 (212-337)||(49136450-49136575)
chr4 (212-350)||(51922853-51922993)
chr4 (212-322)||(48550460-48550570)
chr4 (212-332)||(43781552-43781671)
chr4 (212-326)||(13167464-13167578)
chr4 (212-326)||(42944931-42945045)
chr4 (212-326)||(49519669-49519783)
chr4 (212-352)||(16566217-16566358)
chr4 (252-325)||(26426187-26426260)
chr4 (212-337)||(46830102-46830227)
chr4 (212-320)||(54488550-54488658)
chr4 (212-330)||(28986956-28987071)
chr4 (212-375)||(30842019-30842184)
chr4 (212-375)||(48407731-48407896)
chr4 (212-350)||(56241868-56242007)
chr4 (212-326)||(6138653-6138766)
chr4 (212-326)||(25312654-25312768)
chr4 (212-326)||(26651881-26651995)
chr4 (212-326)||(43772156-43772270)
chr4 (212-337)||(2175180-2175305)
chr4 (212-347)||(19592264-19592400)
chr4 (255-337)||(9889410-9889492)
chr4 (212-322)||(9893654-9893764)
chr4 (256-337)||(14072431-14072512)
chr4 (253-326)||(30887227-30887300)
chr4 (212-320)||(54150471-54150579)
chr4 (212-332)||(54152978-54153097)
chr4 (204-323)||(6505143-6505262)
chr4 (212-353)||(15603271-15603413)
chr4 (252-326)||(31520443-31520517)
chr4 (212-326)||(38305950-38306064)
chr4 (212-326)||(46925987-46926101)
chr4 (253-350)||(55638861-55638959)
chr4 (212-309)||(48550173-48550270)
chr4 (212-309)||(48908231-48908326)
chr4 (256-332)||(32238135-32238211)
chr4 (212-352)||(15619529-15619667)
chr4 (223-313)||(26402984-26403074)
chr4 (222-326)||(13183093-13183197)
chr4 (252-326)||(54735723-54735797)
chr4 (253-314)||(48257054-48257115)
chr4 (278-326)||(20191784-20191832)
chr4 (212-274)||(38263890-38263952)
chr4 (231-316)||(38693997-38694082)
chr4 (212-244)||(33574199-33574231)
chr4 (212-240)||(41866179-41866207)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (204-394)||(440214-440404)
chr8 (212-330)||(8124929-8125046)
chr8 (212-337)||(6399141-6399266)
chr8 (212-332)||(3097239-3097359)
chr8 (212-335)||(44926794-44926916)
chr8 (212-316)||(33627067-33627171)
chr8 (212-350)||(28425505-28425644)
chr8 (212-326)||(3467495-3467609)
chr8 (212-326)||(31246348-31246462)
chr8 (212-309)||(25697993-25698089)
chr8 (232-309)||(36114093-36114170)
chr8 (212-337)||(40742075-40742200)
chr8 (212-352)||(43550826-43550967)
chr8 (253-337)||(41981108-41981192)
chr8 (223-326)||(29023201-29023304)
chr8 (252-309)||(27649725-27649782)
chr8 (255-326)||(3619144-3619215)
chr8 (212-331)||(4941814-4941933)
chr8 (212-314)||(41289091-41289193)
chr8 (212-322)||(42148971-42149081)
chr8 (212-323)||(22936826-22936937)
chr8 (212-326)||(15206658-15206772)
chr8 (253-323)||(16915026-16915096)
chr8 (253-350)||(26125509-26125607)
chr8 (212-326)||(38152207-38152321)
chr8 (256-326)||(40742370-40742440)
chr8 (252-309)||(45147323-45147380)
chr8 (278-326)||(24297690-24297738)
chr8 (212-302)||(24897621-24897710)
chr8 (279-320)||(37458403-37458444)
chr8 (261-337)||(30081732-30081808)
chr8 (223-346)||(34342897-34343019)
chr8 (214-273)||(38114460-38114518)
chr8 (212-273)||(26243139-26243200)
chr8 (278-314)||(26243065-26243101)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (219-392)||(7826395-7826571)
chr1 (219-350)||(4369843-4369975)
chr1 (212-326)||(31223352-31223466)
chr1 (212-337)||(42850253-42850378)
chr1 (212-350)||(5410593-5410731)
chr1 (212-352)||(20800311-20800452)
chr1 (212-352)||(35569236-35569377)
chr1 (212-330)||(6166084-6166201)
chr1 (212-337)||(11051345-11051469)
chr1 (212-337)||(12468180-12468304)
chr1 (212-323)||(13055979-13056089)
chr1 (222-330)||(11023374-11023481)
chr1 (212-332)||(45710021-45710140)
chr1 (212-350)||(48510861-48511000)
chr1 (212-326)||(50406108-50406222)
chr1 (212-326)||(43728912-43729025)
chr1 (212-320)||(47123370-47123478)
chr1 (256-332)||(6464580-6464656)
chr1 (212-346)||(1199784-1199919)
chr1 (252-326)||(36205169-36205243)
chr1 (256-332)||(10470562-10470638)
chr1 (212-326)||(15884204-15884319)
chr1 (212-326)||(40229504-40229618)
chr1 (256-337)||(25229974-25230055)
chr1 (252-309)||(35536067-35536124)
chr1 (212-323)||(50977374-50977484)
chr1 (225-312)||(25061218-25061305)
chr1 (212-309)||(12247415-12247511)
chr1 (205-322)||(13931605-13931721)
chr1 (204-245)||(49243008-49243049)
chr1 (219-309)||(26058236-26058326)
chr1 (259-337)||(31933694-31933772)
chr1 (212-293)||(27801686-27801767)
chr1 (252-304)||(9447533-9447585)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (204-392)||(28641540-28641727)
chr2 (212-326)||(2213469-2213583)
chr2 (212-326)||(28127318-28127432)
chr2 (212-337)||(28261246-28261371)
chr2 (212-326)||(9988532-9988646)
chr2 (212-332)||(7472705-7472824)
chr2 (212-332)||(25940272-25940392)
chr2 (222-330)||(32501945-32502052)
chr2 (231-326)||(23358221-23358316)
chr2 (212-352)||(5916273-5916413)
chr2 (204-356)||(7296087-7296240)
chr2 (214-350)||(26207962-26208099)
chr2 (212-352)||(36312213-36312353)
chr2 (212-309)||(39141501-39141597)
chr2 (212-337)||(42516007-42516131)
chr2 (252-320)||(31562755-31562823)
chr2 (258-332)||(8170270-8170344)
chr2 (224-326)||(44619104-44619206)
chr2 (212-308)||(1945070-1945166)
chr2 (253-317)||(2234899-2234962)
chr2 (256-332)||(14821120-14821196)
chr2 (212-320)||(3853869-3853977)
chr2 (252-320)||(42089603-42089671)
chr2 (219-353)||(36548135-36548269)
chr2 (256-326)||(3552921-3552991)
chr2 (204-337)||(7295371-7295502)
chr2 (213-326)||(11240634-11240747)
chr2 (212-273)||(31224696-31224757)
chr2 (204-244)||(34997259-34997299)
chr2 (212-332)||(39106700-39106819)
chr2 (212-326)||(16467049-16467163)
chr2 (212-326)||(27911369-27911483)
chr2 (219-309)||(43436319-43436409)
chr2 (205-263)||(45714692-45714750)
chr2 (253-326)||(3602531-3602604)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (219-350)||(52966849-52966981)
chr3 (212-326)||(26519618-26519732)
chr3 (222-337)||(31618930-31619045)
chr3 (223-331)||(25847982-25848089)
chr3 (332-394)||(31619069-31619131)
chr3 (212-350)||(31084137-31084275)
chr3 (225-332)||(10853313-10853420)
chr3 (212-375)||(42318232-42318397)
chr3 (256-338)||(35425276-35425358)
chr3 (212-326)||(38172340-38172454)
chr3 (212-326)||(42475663-42475777)
chr3 (212-330)||(53074853-53074970)
chr3 (212-323)||(15511409-15511519)
chr3 (212-337)||(44224705-44224830)
chr3 (212-337)||(53179792-53179916)
chr3 (212-323)||(20813103-20813214)
chr3 (212-352)||(23496251-23496385)
chr3 (212-337)||(3348186-3348311)
chr3 (214-350)||(10334067-10334204)
chr3 (222-375)||(38125485-38125640)
chr3 (212-353)||(38340732-38340873)
chr3 (256-332)||(48189518-48189594)
chr3 (256-322)||(30811608-30811674)
chr3 (252-331)||(22736930-22737009)
chr3 (256-322)||(16246171-16246237)
chr3 (212-337)||(50664702-50664826)
chr3 (212-284)||(4984577-4984649)
chr3 (256-332)||(8424806-8424882)
chr3 (212-331)||(21224939-21225058)
chr3 (256-350)||(35930667-35930762)
chr3 (204-326)||(23207093-23207213)
chr3 (219-309)||(32357482-32357572)
chr3 (253-326)||(45423842-45423915)
chr3 (278-326)||(37698488-37698536)
chr3 (274-326)||(40244068-40244120)
chr3 (256-332)||(44939491-44939567)
chr3 (220-312)||(30809986-30810078)
chr3 (212-320)||(34561068-34561176)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (212-326)||(3667822-3667936)
chr5 (212-326)||(35760157-35760271)
chr5 (204-394)||(27021024-27021218)
chr5 (212-337)||(40885167-40885293)
chr5 (212-352)||(22482130-22482271)
chr5 (212-332)||(32454499-32454618)
chr5 (223-326)||(41740634-41740737)
chr5 (252-325)||(40791139-40791212)
chr5 (252-325)||(42146277-42146350)
chr5 (214-353)||(28869535-28869674)
chr5 (212-326)||(34106977-34107091)
chr5 (212-350)||(41834835-41834974)
chr5 (255-332)||(3060296-3060372)
chr5 (212-337)||(9275514-9275639)
chr5 (212-309)||(13253113-13253209)
chr5 (256-332)||(2430370-2430446)
chr5 (205-323)||(4292120-4292238)
chr5 (222-312)||(7385972-7386062)
chr5 (212-337)||(40495388-40495512)
chr5 (259-337)||(7714897-7714975)
chr5 (256-337)||(33953975-33954056)
chr5 (212-312)||(39987997-39988097)
chr5 (212-308)||(5710416-5710511)
chr5 (219-337)||(24045788-24045905)
chr5 (254-350)||(32030659-32030754)
chr5 (212-309)||(10058059-10058156)
chr5 (212-312)||(8049081-8049181)
chr5 (212-326)||(7178746-7178859)
chr5 (252-322)||(16158535-16158605)
chr5 (278-326)||(3747686-3747734)
chr5 (262-326)||(13676477-13676541)
chr5 (253-309)||(41959446-41959502)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (252-382)||(9456023-9456154)
chr7 (212-394)||(46541504-46541689)
chr7 (212-353)||(12632103-12632245)
chr7 (254-394)||(386543-386685)
chr7 (212-323)||(38230046-38230157)
chr7 (212-326)||(37562545-37562659)
chr7 (212-315)||(3622480-3622583)
chr7 (212-337)||(44967419-44967544)
chr7 (212-326)||(3342765-3342879)
chr7 (206-320)||(42904534-42904648)
chr7 (212-337)||(47217561-47217686)
chr7 (212-336)||(36920198-36920322)
chr7 (252-320)||(43631755-43631823)
chr7 (212-350)||(3375440-3375579)
chr7 (214-326)||(34366004-34366115)
chr7 (252-326)||(42740367-42740441)
chr7 (252-326)||(43737999-43738073)
chr7 (212-326)||(48459685-48459799)
chr7 (212-309)||(34010332-34010428)
chr7 (252-352)||(37639378-37639479)
chr7 (257-353)||(47301622-47301719)
chr7 (219-315)||(32205913-32206007)
chr7 (212-324)||(39391157-39391269)
chr7 (252-324)||(48134557-48134629)
chr7 (212-352)||(10371978-10372118)
chr7 (212-326)||(3750662-3750775)
chr7 (232-309)||(19095929-19096005)
chr7 (212-309)||(32186932-32187029)
chr7 (212-309)||(41715649-41715746)
chr7 (278-320)||(37886856-37886898)
chr7 (212-326)||(39634185-39634299)
chr7 (225-325)||(34010994-34011095)
chr7 (258-350)||(47021869-47021962)
chr7 (212-320)||(42752211-42752319)
chr7 (225-326)||(2839266-2839367)
chr7 (253-326)||(40903228-40903301)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (212-326)||(29409284-29409398)
chr6 (212-326)||(16442383-16442497)
chr6 (212-332)||(13739154-13739273)
chr6 (212-332)||(13744654-13744773)
chr6 (212-350)||(33899038-33899177)
chr6 (212-352)||(16548066-16548207)
chr6 (252-349)||(21455812-21455910)
chr6 (252-326)||(10826045-10826119)
chr6 (212-332)||(6208096-6208215)
chr6 (252-322)||(7215533-7215603)
chr6 (252-309)||(31132435-31132492)
chr6 (212-352)||(17830031-17830171)
chr6 (212-326)||(1312472-1312586)
chr6 (212-326)||(699512-699625)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (212-337)||(8392-8517)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (255-337)||(9054-9136)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (256-332)||(29199-29275)
[»] scaffold0983 (1 HSPs)
scaffold0983 (212-337)||(2301-2426)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (225-326)||(138554-138655)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (278-320)||(9257-9299)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (291-352)||(5943-6004)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (253-326)||(46717-46790)


Alignment Details
Target: scaffold0005 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 204 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 253204 - 253013
Alignment:
Q  204 gttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaatt 303  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  253204 gttaaatgtgagttggatatgaattgatttatgtttggataccttcagttaaaagtgattcttatgagttaatgttgtttggatagattgaatcaaaatt 253105  T
Q  304 gattttaaatgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaactagacccctttctcattttagataatcatttatatttatgttg 394  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253104 gattttgaatatataatgaccaacttatcctttttgttgtatttaaaactagacccctttctcattttagataatcatttatatttatgttg 253013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 204 - 394
Target Start/End: Original strand, 14564171 - 14564362
Alignment:
Q  204 gttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaatt 303  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14564171 gttaaatgtgagttggatatgaattgatttatgtttggataccttcagttaaaagtgattcttatgagttaatgttgtttggatagattgaatcaaaatt 14564270  T
Q  304 gattttaaatgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaactagacccctttctcattttagataatcatttatatttatgttg 394  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14564271 gattttgaatatataatgaccaacttatcctttttgttgtatttaaaactagacccctttctcattttagataatcatttatatttatgttg 14564362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Original strand, 4954084 - 4954223
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4954084 tgagtttgatgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataggttgaatcaaaattaattttaa 4954183  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaa 350  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||  ||||||||||||    
T  4954184 atgtgtaatgacctaattatccttttaattgtatttaaaa 4954223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 29149340 - 29149454
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29149340 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaa 29149439  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||||| |||||||||    
T  29149440 atgtaaaatgaccaa 29149454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 39636838 - 39636724
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |   |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39636838 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttacgagttgatgttgtttggatagtatgaatcaaaattgattttaa 39636739  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    |||| ||| ||||||    
T  39636738 atgtgtaacgaccaa 39636724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 49136575 - 49136450
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||  || |||||||||||||||| |    
T  49136575 tgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaataattttaatcaaaattgattttga 49136476  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  49136475 atgtacaatgaccaaattatcctttt 49136450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 51922993 - 51922853
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||  |    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  51922993 tgagttgaatctgaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 51922894  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc--tttttgttgtatttaaaa 350  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||    
T  51922893 atgtataatgaccaaactatcctttttagttgtatttaaaa 51922853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Original strand, 48550460 - 48550570
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    || |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48550460 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggataaactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaa 48550559  T
Q  312 atgtataatga 322  Q
    |||| ||||||    
T  48550560 atgtgtaatga 48550570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Original strand, 43781552 - 43781671
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||  | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  43781552 tgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttga 43781650  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc 332  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  43781651 atgtaaaatgaccaaattatc 43781671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13167578 - 13167464
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   |  ||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13167578 tgagttgaatgtgaattgatttatatttggatacacccatttaaaagtgattcttatgtattaatgatgtttggatagattgaatcaaaattgcttttaa 13167479  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||| ||||| |||||    
T  13167478 atgcataattaccaa 13167464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 42944931 - 42945045
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||   |   |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  42944931 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttagatatacttacttaaaagtgattcttatgtgttgatgttgtttggatagtatgtatcaaaattgattttaa 42945030  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||||||    
T  42945031 atgtataatgaccaa 42945045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 49519783 - 49519669
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | | |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  49519783 tgagttggatgtgaatttatttatgtttggatacacttgcttaaaaatgattcttatgaattgatattgtttggatagtatgtattaaaattgattttaa 49519684  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
     ||| ||||||||||    
T  49519683 gtgtgtaatgaccaa 49519669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16566358 - 16566217
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16566358 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 16566259  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaact 352  Q
    |||| ||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  16566258 atgtgtaatgactaaactatccttttaattgtatttaaaact 16566217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 325
Target Start/End: Original strand, 26426187 - 26426260
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgacca 325  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26426187 ttaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgattgtgaatgtataatgacca 26426260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Original strand, 46830102 - 46830227
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |   |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||   |  |||||||||||||||||    
T  46830102 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttcttaaaattgattcttatgagttgatgttgtttggatattctacatcaaaattgattttaa 46830201  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    |||| || ||||||| ||||| ||||    
T  46830202 atgtgtattgaccaaattatcctttt 46830227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 54488658 - 54488550
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| | || || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  54488658 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttgaataccttaaagcaaaagtgattcttataaattcattttgtttggataacttggatcaaaattgattttaa 54488559  T
Q  312 atgtataat 320  Q
    ||| |||||    
T  54488558 atgcataat 54488550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28987071 - 28986956
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28987071 tgagtttgaggtgaattgatt-atgtttgaatacactcacttaa--gtgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaa 28986975  T
Q  312 atgtataatgaccaactta 330  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  28986974 atgggtaatgaccaactta 28986956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30842184 - 30842019
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||  | | || ||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  30842184 tgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcatttggatagtttgaatcaaaattgattttga 30842086  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaactagac--ccctttctcattttagata 375  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||  ||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||    
T  30842085 atgtaaaatgacaaaattatccttttaattgtatttaaaactaaacatcccattcttattttagata 30842019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 375
Target Start/End: Original strand, 48407731 - 48407896
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||  | | || ||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  48407731 tgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcatttggatagtttgaatcaaaattgattttga 48407829  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaactagac--ccctttctcattttagata 375  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||  ||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||    
T  48407830 atgtaaaatgacaaaattatccttttaattgtatttaaaactaaacatcccattcttattttagata 48407896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Original strand, 56241868 - 56242007
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||   || |||||||||||||||| |    
T  56241868 tgagtttgatatgaattgatttatgtttggatacattaatgtaaaagtgattcttatgagttgataatgtttagatgatttaaatcaaaattgattttga 56241967  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaa 350  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||    
T  56241968 atgtataatgaccaaaatatccttttaattgtatttaaaa 56242007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 6138653 - 6138766
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |   |||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  6138653 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaaatgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattga-tttga 6138751  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    |||| ||||||||||    
T  6138752 atgtgtaatgaccaa 6138766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25312768 - 25312654
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  |  |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  25312768 tgagttagatgtgaattgatttttgtttggatacactttgttaaaagcgattcttatgaattgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgcttttag 25312669  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||||||||| |||||    
T  25312668 atgtataattaccaa 25312654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 26651881 - 26651995
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  |    ||||||| ||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26651881 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttagatacactttactaaaagtaattcttatgagtcgatgttatttggatagtttgaatcaaaattgattttga 26651980  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||||||    
T  26651981 atgtataatgaccaa 26651995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 43772156 - 43772270
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |   ||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  43772156 tgagttggatgtgaatcgatttatgtttggatacacttttttagaagtgattcttacgagttgatgttgtttggataatatgaatcaaaattgattttaa 43772255  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
     ||| ||||||||||    
T  43772256 gtgtgtaatgaccaa 43772270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Original strand, 2175180 - 2175305
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||| | ||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  2175180 tgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatgcactcgcttaaaagtgattttgatgggttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttga 2175279  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    | ||| |||||| || ||||| ||||    
T  2175280 acgtacaatgactaaattatcctttt 2175305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 347
Target Start/End: Original strand, 19592264 - 19592400
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |    ||||||||||||||| || || |  |||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  19592264 tgagttggaagtgaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtgattcttacgaattgacgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttga 19592363  T
Q  312 atgtataatgaccaactta-tctttttgttgtattta 347  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||||    
T  19592364 atgtacaatgaccaaattattcttttaattgtattta 19592400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 337
Target Start/End: Original strand, 9889410 - 9889492
Alignment:
Q  255 aaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  9889410 aaagtgattcttatgagtagatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatcctttt 9889492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9893764 - 9893654
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||   |  || ||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||||||| |    
T  9893764 tgagttagatatgaattgatatatgtttggatacacccacttgaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttaaattaaaattgattttga 9893665  T
Q  312 atgtataatga 322  Q
    |||||||||||    
T  9893664 atgtataatga 9893654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14072512 - 14072431
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||||    
T  14072512 aagtgattctaatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattatcctttt 14072431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 326
Target Start/End: Original strand, 30887227 - 30887300
Alignment:
Q  253 taaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30887227 taaaagtgattcttatgagttaatgatgtttggatggtttgtatcaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaa 30887300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 54150579 - 54150471
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac-cttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttta 310  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  54150579 tgagttagatgtgaattgatttttgtttggatacacttcg-ttaaaaatgattcttataagttggtgttgtttggatacattaaatcaaaattgctttta 54150481  T
Q  311 aatgtataat 320  Q
     |||||||||    
T  54150480 gatgtataat 54150471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 54153097 - 54152978
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |    || |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  54153097 tgagttgaatgtgaattgatt-atgtttgaatacactttactagaagtgattctcatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttga 54152999  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc 332  Q
    |||| ||||||| || |||||    
T  54152998 atgtctaatgactaaattatc 54152978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6505262 - 6505143
Alignment:
Q  204 gttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaatt 303  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||   ||||||||||| | |||| || || |||||||||||| || | ||||||||    
T  6505262 gttaaaaatgagtttgatgtgaattgatttatgtttagatacactcatataaaagtgattatcatgacttgatgttgtttggatagtttaagtcaaaatt 6505163  T
Q  304 gattttaaatgtataatgac 323  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  6505162 gattttgaatatataatgac 6505143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15603413 - 15603271
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  |||   | | |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  || | |||||||||||||| |    
T  15603413 tgagtttgatgtgaattgatttgtgtttagatatacttgcttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggataatttaagtcaaaattgattttga 15603314  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatctttttg-ttgtatttaaaacta 353  Q
    ||| | ||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  15603313 atgcacaatgatcaaattatccttttgattgtttttaaaacta 15603271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 31520443 - 31520517
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31520443 ttaaaagtgatttttatgagttgatgttttttgggtagtttgaataaaaattgattttaaatgtgtaatgaccaa 31520517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 38306064 - 38305950
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||     ||||||||||||||| | || || |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |    
T  38306064 tgagttgaatgcgaattgatttatgtttggataccttaaagcaaaagtgattcttataaattcatgttgtttggataacttggatcaaaattgattttga 38305965  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||| ||||| |||||    
T  38305964 atgcataattaccaa 38305950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 46926101 - 46925987
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||||| ||||| || |||  |||  |||||||||||||  ||||||    
T  46926101 tgagttagatgtgaattgatttatgtttggatacactcgtttaaaagtgatttttatgaattaattttatttatatattttgaatcaaaattacttttaa 46926002  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||  ||||| |||||    
T  46926001 atacataattaccaa 46925987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 350
Target Start/End: Original strand, 55638861 - 55638959
Alignment:
Q  253 taaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc-tttttgttgtatttaaaa 350  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||    
T  55638861 taaaagggattcttatgagttgatattgtttggataatatgaatcaaaattgattttgaatatgtaatgaccaaactatcattttaattgtatttaaaa 55638959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 48550270 - 48550173
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| || |  ||  |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  48550270 tgagttagatgtaaattgatttatgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatattgtttggatagattggattaaaattgatttt 48550173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 48908326 - 48908231
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| || |||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48908326 tgagtttgatgtgaattggtt-atgtttggatacct-cgcttaaaagtaattcatataagttgatgttgtttggatagcttgaatcaaaattgatttt 48908231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 32238135 - 32238211
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc 332  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  32238135 aagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaactgattttgaatgtctaatgactaaattatc 32238211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15619667 - 15619529
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    || ||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| || |    
T  15619667 tgagttggatgtgaattgatgtatgtttggatacattac--tataagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaa-tgatcttga 15619571  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc-tttttgttgtatttaaaact 352  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  15619570 atgtgtaatgactaaattatcattttaattgtatttaaaact 15619529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 313
Target Start/End: Original strand, 26402984 - 26403074
Alignment:
Q  223 tgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  26402984 tgaattgatttatgtttgaatccatttctttaaaagtaattcttatgaattaattttgtttgtatattttgaatcataattgtttttaaat 26403074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 326
Target Start/End: Original strand, 13183093 - 13183197
Alignment:
Q  222 gtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatg 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |   |||||| ||||| |||| |||| || || ||||||||  || |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13183093 gtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaaatgatttttataagttgatgttttttggataatttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatg 13183192  T
Q  322 accaa 326  Q
    |||||    
T  13183193 accaa 13183197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 54735723 - 54735797
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||  ||  || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  54735723 ttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgagtattttaaatcaaaattgatcttgaatgtgtaatgaccaa 54735797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48257115 - 48257054
Alignment:
Q  253 taaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatg 314  Q
    |||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  48257115 taaaagtgattcttataaattcatgttgtttggataaattggatcaaaattgattttgaatg 48257054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 326
Target Start/End: Original strand, 20191784 - 20191832
Alignment:
Q  278 ttgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20191784 ttgtttggataacttgaatcaaaattaattttaaatgtataattaccaa 20191832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38263952 - 38263890
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagtta 274  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  38263952 tgagtttgatgtgaattaatttatgtttgaatatactcacttaaaagtgatacttatgagtta 38263890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 38694082 - 38693997
Alignment:
Q  231 tttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgta 316  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| ||| || ||| ||| |||  || |||||||||| ||||| ||||||    
T  38694082 tttatgtttggatacactcgcttaaaagtgattcttatgggttgatcttgcttgaataatttaaatcaaaattaattttgaatgta 38693997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33574231 - 33574199
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaata 244  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33574231 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttgaata 33574199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41866207 - 41866179
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41866207 tgagttggatgtgaattgatttatgtttg 41866179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 204 - 394
Target Start/End: Original strand, 440214 - 440404
Alignment:
Q  204 gttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaatt 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  440214 gttaaatgtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacattcagttaaaaatgattcttatgagttaacgttgtttggatagattgaatcaaaact 440313  T
Q  304 gattttaaatgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaactagacccctttctcattttagataatcatttatatttatgttg 394  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  440314 gattttgaatgtataatgaccaacttatcctttttgttgtatttaaaactagacccctttctca-tttagataatcatttatatttatgttg 440404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8125046 - 8124929
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  ||  |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8125046 tgagtttgatgtgaattgatt-atgtttggatacactcatttaaaagtgattcttaggagttgaagttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaa 8124948  T
Q  312 atgtataatgaccaactta 330  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  8124947 atggataatgaccaactta 8124929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Original strand, 6399141 - 6399266
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  || |||||||||||||||| |    
T  6399141 tgagtttgatgtgaattgatttatgtttcgatacactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataattttaatcaaaattgattttga 6399240  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||    
T  6399241 atgtgcaatgaccaaattatcttttt 6399266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Original strand, 3097239 - 3097359
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||   ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3097239 tgagtttgatatgaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 3097338  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc 332  Q
    | || || ||||||| |||||    
T  3097339 acgtgtattgaccaaattatc 3097359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44926916 - 44926794
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||  | | |||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  44926916 tgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttatttggatagtttgaatcaaaattaattttga 44926818  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttt 335  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    
T  44926817 atgtaaaatgaccaaattatcttt 44926794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 316
Target Start/End: Original strand, 33627067 - 33627171
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  33627067 tgagttggataagaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtgattcttatgagttaatgttgtttggatagtttgaatcaaaatcgattttga 33627166  T
Q  312 atgta 316  Q
    |||||    
T  33627167 atgta 33627171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Original strand, 28425505 - 28425644
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  |   ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28425505 tgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatacactttcttacaagtgattcttatgagttgacgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 28425604  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaa 350  Q
    | || ||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||    
T  28425605 acgtgtaatgaccaaactatccttttaattgtatttaaaa 28425644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3467609 - 3467495
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||  ||   ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3467609 tgagttgaatgtgaattgatttctgtttggatatatttatttaaaagtgattcttatgaattgatgttggttggatagtttgaatcaaaattgattttaa 3467510  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    || |  |||||||||    
T  3467509 atatggaatgaccaa 3467495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 31246348 - 31246462
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     ||||||||||||||| | || || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  31246348 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggataccttaaagcaaaagtgattcttataaattcatgttgtttggataacttggatcaaaattgattttaa 31246447  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||| ||||| |||||    
T  31246448 atgcataattaccaa 31246462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Original strand, 25697993 - 25698089
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25697993 tgagttggatgtgaattgatt-atgtttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 25698089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 232 - 309
Target Start/End: Original strand, 36114093 - 36114170
Alignment:
Q  232 ttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36114093 ttatgtttggatacactcgtttaaaagtgattcttatgagttgatattgtttggataatttgaatcaaaattgatttt 36114170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40742200 - 40742075
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| ||| |||||||| |    
T  40742200 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaataaaattgattcttatgagttgatattgtttggatgatttgaatgaaacttgattttga 40742101  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  40742100 atgtgtaatgatcaaattatcctttt 40742075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 43550967 - 43550826
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  43550967 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcttgtgggttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttga 43550868  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaact 352  Q
    |||| ||| ||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  43550867 atgtgtaaagactaaactatccttttaattgtatttaaaact 43550826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41981192 - 41981108
Alignment:
Q  253 taaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||    
T  41981192 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatactttgaatcaaaattgattttaaatatggaatgaccaaactatcttttt 41981108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29023304 - 29023201
Alignment:
Q  223 tgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatga 322  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||  | | |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29023304 tgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaattgattgttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 29023205  T
Q  323 ccaa 326  Q
    ||||    
T  29023204 ccaa 29023201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27649782 - 27649725
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27649782 ttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 27649725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 326
Target Start/End: Original strand, 3619144 - 3619215
Alignment:
Q  255 aaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||||| | |  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3619144 aaagtgattcttatcaatgtatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtataattaccaa 3619215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 4941814 - 4941933
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||   |   ||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||  |||||| |||||||||||| |    
T  4941814 tgagtttgaggtgaattgatttatgtttggataaaattatttaaaagcgattcttatgagttgatgttgtttgaataatttgaattaaaattgattttga 4941913  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat 331  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  4941914 atgtaaaatgaccaaattat 4941933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 314
Target Start/End: Original strand, 41289091 - 41289193
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |    ||||||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  41289091 tgagttgattgtgaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtgattcttataggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 41289190  T
Q  312 atg 314  Q
    |||    
T  41289191 atg 41289193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 42149081 - 42148971
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||   |   ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |    
T  42149081 tgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatagacttatttaaaagtgattcgtatgagttgatgttgtttagataatttgaatcaaaattgattttga 42148982  T
Q  312 atgtataatga 322  Q
    ||||| |||||    
T  42148981 atgtaaaatga 42148971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Original strand, 22936826 - 22936937
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |   ||| ||||||||||| ||  || || |||||||||||| |||||||||| ||| |||| |    
T  22936826 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattagaagtgattcttgtggattgatgttgtttggatagtttgaatcaaatttggttttga 22936925  T
Q  312 atgtataatgac 323  Q
    || |||||||||    
T  22936926 atatataatgac 22936937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15206772 - 15206658
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||  | || || |||||||||||| |||   ||||||||||||| |    
T  15206772 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacattgacttagaagtgattcttaaaaattcatgttgtttggatagtttggcccaaaattgattttga 15206673  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||| ||||| |||||    
T  15206672 atgcataattaccaa 15206658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16915096 - 16915026
Alignment:
Q  253 taaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgac 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16915096 taaaagtgattcttatgagttaatgatgtttggttggtttgtatcaaaattgattttgaatgtgtaatgac 16915026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26125607 - 26125509
Alignment:
Q  253 taaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatcttttt-gttgtatttaaaa 350  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  | || |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||    
T  26125607 taaaaatgattcttatgagttgataatgtttggacggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgacgaaaatatctttttaattgtatttaaaa 26125509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 38152207 - 38152321
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| | |  ||   |||||| ||||||||||||||| || | |||||||||  || |||||||||||||||| |    
T  38152207 tgagtttgatgtaaattgatttatgtttggaaatatttacttaaaaatgattcttatgagttgatgtggtttggatactttaaatcaaaattgattttga 38152306  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    | || ||||||||||    
T  38152307 acgtgtaatgaccaa 38152321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 326
Target Start/End: Original strand, 40742370 - 40742440
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  40742370 aagtgattcttatgagttgatgatgtttggatattttaaatcaaaattgattttaaatgtgtagtgaccaa 40742440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 309
Target Start/End: Original strand, 45147323 - 45147380
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  45147323 ttaaaagtgattcttataagttgatattgtttgaataacttgaatcaaaattgatttt 45147380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 326
Target Start/End: Original strand, 24297690 - 24297738
Alignment:
Q  278 ttgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24297690 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttacatgtataattaccaa 24297738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 24897621 - 24897710
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaat 302  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  24897621 tgagttggatatgaat-gaattatgtttggatacatttatttaaaattgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaat 24897710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 320
Target Start/End: Original strand, 37458403 - 37458444
Alignment:
Q  279 tgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataat 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37458403 tgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataat 37458444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 337
Target Start/End: Original strand, 30081732 - 30081808
Alignment:
Q  261 attcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||||||| | | || |||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||    
T  30081732 attcttatgggctgatgttgtttggatagtttgtttcaaaattgattttagatgtgtaatgaccaaattatcctttt 30081808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 346
Target Start/End: Original strand, 34342897 - 34343019
Alignment:
Q  223 tgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatga 322  Q
    ||||||||||| |||||| |||  ||   ||||||||||||||||| |||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  34342897 tgaattgatttttgtttggataaatttatttaaaagtgattcttat-agtggatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaa-gtgtaatga 34342994  T
Q  323 ccaactt-atctttttgttgtattt 346  Q
    |||| || |||||||  ||||||||    
T  34342995 ccaaattaatcttttaattgtattt 34343019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38114518 - 38114460
Alignment:
Q  214 agttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagtt 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  38114518 agttggatgtgaattgatt-atgtttggatacactcggtttcaagtgattcttatgagtt 38114460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26243200 - 26243139
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagtt 273  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||   | | ||||||||||||||||||||||    
T  26243200 tgagtttgatatgaattgatttatgtttggatataattgtttaaaagtgattcttatgagtt 26243139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26243101 - 26243065
Alignment:
Q  278 ttgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatg 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26243101 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatg 26243065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 219 - 392
Target Start/End: Original strand, 7826395 - 7826571
Alignment:
Q  219 gatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtata 318  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7826395 gatgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttggataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgta 7826494  T
Q  319 atgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaactag--acccctttctcattttagataatcatttatatttatgt 392  Q
    |||||||| |||| |||||  |||||||||||| |||  | ||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  7826495 atgaccaagttatccttttaattgtatttaaaattagatatcccattcccattttagataattatttaaacttatgt 7826571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 4369843 - 4369975
Alignment:
Q  219 gatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtata 318  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4369843 gatgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgta 4369942  T
Q  319 atgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaa 350  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  4369943 atgaccaaattatccttttaattgtatttaaaa 4369975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31223466 - 31223352
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    || |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  31223466 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttga 31223367  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    |||| ||||||||||    
T  31223366 atgtgtaatgaccaa 31223352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Original strand, 42850253 - 42850378
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac-cttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttta 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||  |||||||||||||||     
T  42850253 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttcc-ttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttg 42850351  T
Q  311 aatgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  42850352 aatgtgtattgaccaaattatcctttt 42850378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5410731 - 5410593
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac-cttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttta 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  5410731 tgagttggatgtaaattgatttatgtttgaatacactac--ttaaaagtgattcttatgacttgatgttgtttggatagtttgaatcataattgattttg 5410634  T
Q  311 aatgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaa 350  Q
    ||| | ||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||    
T  5410633 aatatgtaatgaccaaactatccttttaattgtatttaaaa 5410593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Original strand, 20800311 - 20800452
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  20800311 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaatattgattttga 20800410  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaact 352  Q
    |||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||    
T  20800411 atgtataatgactaaattatccttttaattgtatttaaaact 20800452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Original strand, 35569236 - 35569377
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  35569236 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 35569335  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc-tttttgttgtatttaaaact 352  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||  ||||||||||||||    
T  35569336 atgtataatgactaaactatcattttaattgtatttaaaact 35569377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6166201 - 6166084
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||  ||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6166201 tgagtttgatctgaattgatt-atgtttggatacactcatttaaaagtgattcttaggagttgatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaa 6166103  T
Q  312 atgtataatgaccaactta 330  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  6166102 atgggtaatgaccaactta 6166084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Original strand, 11051345 - 11051469
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |  |||||| || |||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  11051345 tgagtttgatgtgaattgatttatgtttgaatacacacacttaaaaatggttcttaagagtta-tgttgtttggatagtttgaataaaaattgattttga 11051443  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||    
T  11051444 atgtgtaatgaccaaattatcctttt 11051469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12468304 - 12468180
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||  |   |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12468304 tgagtttgatgtaaattgatttatatttggatacacttttttaaaagtgatttttatgagttgat-ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 12468206  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  12468205 atgtacaatgaccaaattatcctttt 12468180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13056089 - 13055979
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac-cttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttta 310  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  13056089 tgagttgagtgtgaattgatttatgtttgaatacgctta--ttaaaagtgatttttatgagttgatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttg 13055992  T
Q  311 aatgtataatgac 323  Q
    ||||  |||||||    
T  13055991 aatgcgtaatgac 13055979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 330
Target Start/End: Original strand, 11023374 - 11023481
Alignment:
Q  222 gtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatg 321  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11023374 gtgaattgatt-atgtttggatacattcaattaaaagtaatttttacgagttgatattgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatg 11023472  T
Q  322 accaactta 330  Q
    |||||||||    
T  11023473 accaactta 11023481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 45710140 - 45710021
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |    || |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  45710140 tgagttgtatgtgaattgatt-atgtttgaatacactttactagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 45710042  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc 332  Q
    |||| ||||||| || |||||    
T  45710041 atgtctaatgactaaattatc 45710021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48511000 - 48510861
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  48511000 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttgcttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttgaatagtatgtatcaaaattgattttaa 48510901  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatctttttg-ttgtatttaaaa 350  Q
     ||| |||||| |||  |||| ||||| || |||||||||    
T  48510900 gtgtgtaatgatcaaactatccttttgattatatttaaaa 48510861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 50406222 - 50406108
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac-cttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttta 310  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||| |||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  50406222 tgagttagatgtgaattgatttttgtttggatgcacttcg-ttaaaaatgattcttataagttgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgttttta 50406124  T
Q  311 aatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||| |||||    
T  50406123 aatgtataattaccaa 50406108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 43728912 - 43729025
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  43728912 tgagttggatgtgaattgatt-atgtttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 43729010  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    || |  |||||||||    
T  43729011 atattaaatgaccaa 43729025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 47123478 - 47123370
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac-cttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttta 310  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  47123478 tgagttagatgtgaattgatttttgtttggatacacttcg-ttaaaagtgattcttataagttggtgttgtttggatacattaaatcaaaattgctttta 47123380  T
Q  311 aatgtataat 320  Q
     |||||||||    
T  47123379 gatgtataat 47123370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6464656 - 6464580
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc 332  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  6464656 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtctaatgactaaattatc 6464580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1199919 - 1199784
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |   ||| ||||||||||| ||  || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1199919 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattagaagtgattcttgtggattgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 1199820  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt-gttgtattt 346  Q
    | || ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  1199819 acgtgtaatgactaaactatctttttagttgtattt 1199784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 36205243 - 36205169
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36205243 ttaaaagtgattcttacgagtgaatgttgcttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtttaatgaccaa 36205169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10470638 - 10470562
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc 332  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||| || |||||    
T  10470638 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtatagtgactaaattatc 10470562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15884319 - 15884204
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcg-gttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttta 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |   || |||||||||| |||| | || || |||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  15884319 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacaataaagtaaaaagtgatttttataaattcatgttgtttggatagtttggatcaaaattgattttg 15884220  T
Q  311 aatgtataatgaccaa 326  Q
    |||| ||||| |||||    
T  15884219 aatgcataattaccaa 15884204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 40229504 - 40229618
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  |   ||| | ||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  40229504 tgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatacactttcttacaggtgattcttctgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttga 40229603  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    | || ||||||||||    
T  40229604 acgtgtaatgaccaa 40229618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25230055 - 25229974
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||||    
T  25230055 aagtgattcttattagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgagtgtgtaatgaccaaattatcctttt 25229974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 35536124 - 35536067
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35536124 ttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgatttt 35536067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Original strand, 50977374 - 50977484
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac-cttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttta 310  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||| |||| |||   ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  50977374 tgagtttggtgtgaattgttttatgtttggatacgctta--ttacaagtgatttttatgagtagatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttg 50977471  T
Q  311 aatgtataatgac 323  Q
    ||||| |||||||    
T  50977472 aatgtgtaatgac 50977484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25061305 - 25061218
Alignment:
Q  225 aattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaa 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||| | || ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25061305 aattgatttatgtttggataccttaacataaaagtgattcttatcaattgatgatgtttggataatttgaatcaaaattgattttaaa 25061218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12247511 - 12247415
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||  | | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  12247511 tgagttggatgtaaattaatt-atgtttggatacacttgtttaaaagtgatttttatgagttgatgttgtttggagaatttgaatcaaaattgatttt 12247415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13931721 - 13931605
Alignment:
Q  205 ttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattg 304  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||   ||  |||||  |||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13931721 ttaaaaatgagtttgatgtgaattgatt-atgtttggatatactcacttaaacatgattcttacaagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattg 13931623  T
Q  305 attttaaatgtataatga 322  Q
    ||||| ||| | ||||||    
T  13931622 attttgaatatgtaatga 13931605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 245
Target Start/End: Original strand, 49243008 - 49243049
Alignment:
Q  204 gttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac 245  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49243008 gttaaaaatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac 49243049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26058326 - 26058236
Alignment:
Q  219 gatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |  ||  |||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26058326 gatgtaaattgatttatgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgatttt 26058236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31933772 - 31933694
Alignment:
Q  259 tgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  31933772 tgattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctttt 31933694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 293
Target Start/End: Original strand, 27801686 - 27801767
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattg 293  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| || |  ||  |||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  27801686 tgagttagatgtaaattgatttatgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattg 27801767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9447585 - 9447533
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattg 304  Q
    |||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||    
T  9447585 ttaaaagtgattctttcgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattg 9447533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 204 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28641727 - 28641540
Alignment:
Q  204 gttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaatt 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||  |||||||||||| |||| |||| || |||||||||||  |||||| ||||||    
T  28641727 gttaaatgtgagttggatgtgaattgatttatatttgggtaacttcatttaaaagtgattattataagttgatgttgtttggatatgttgaattaaaatt 28641628  T
Q  304 gattttaaatgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaactagacccctttctcattttagataatcatttatatttatgt 392  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||||    | |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28641627 gattttaaatgtgtaatgaccaaattatccttttaattgtatttaaaattaga--tatctctcattttagataattatttaaatttatgt 28641540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2213583 - 2213469
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2213583 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaa 2213484  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||||| |||||||||    
T  2213483 atgtaaaatgaccaa 2213469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 28127318 - 28127432
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28127318 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaa 28127417  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||||| |||||||||    
T  28127418 atgtaaaatgaccaa 28127432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28261371 - 28261246
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||   || |||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  28261371 tgagttggatgtgaattgatttatatttggatactctcacatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattaattttaa 28261272  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28261271 atgtataatgaccaacttatcctttt 28261246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 9988532 - 9988646
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  9988532 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttga 9988631  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    |||| ||||||||||    
T  9988632 atgtgtaatgaccaa 9988646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Original strand, 7472705 - 7472824
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7472705 tgagtttgatgtgaattgatt-atgtttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 7472803  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc 332  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  7472804 atgtaaaatgaccaaattatc 7472824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Original strand, 25940272 - 25940392
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||  || |||||||| ||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  25940272 tgagtttgatgtgaattgatttatatttgaatacactcgtatagaagtgattattatgagatgatgttgtttggacagtttgaatcaaaattgattttga 25940371  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc 332  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  25940372 atatataatgaccaaattatc 25940392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32502052 - 32501945
Alignment:
Q  222 gtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatg 321  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  32502052 gtgaattgatt-atgtttggatacattcaattaaaagtaatttttacgagttgatattgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatg 32501954  T
Q  322 accaactta 330  Q
    |||||||||    
T  32501953 accaactta 32501945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23358316 - 23358221
Alignment:
Q  231 tttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||| ||||  | | |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23358316 tttatgtttggatacacttgtttaaaagtgattgtgatgagttaatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaa 23358221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Original strand, 5916273 - 5916413
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |   ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5916273 tgagttgaatgtgaattgatt-atgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 5916371  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaact 352  Q
    |||| ||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  5916372 atgtgtaatgactaaactatccttttaattgtatttaaaact 5916413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7296240 - 7296087
Alignment:
Q  204 gttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaatt 303  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||   ||||||||||| | |||| || || || ||||||||| || | ||||||||    
T  7296240 gttaaaaatgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacactcatataaaagtgattatcatgacttgatgttatttggatagtttaagtcaaaatt 7296141  T
Q  304 gattttaaatgtataatgaccaacttatctttttg-ttgtatttaaaactagac 356  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||| ||| |||||| |||||||    
T  7296140 gattttgaatatataatgaccgaattatccttttgattgcatttaacactagac 7296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 350
Target Start/End: Original strand, 26207962 - 26208099
Alignment:
Q  214 agttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||  |   |||||| |||||||||  |||| || ||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  26207962 agttggatgtgaattgatttatgttttgatacacttaattaaaattgattcttacaagttgatgttgtttggattatatgaatcaaaattgattttaaat 26208061  T
Q  314 gtataatgaccaacttatctttttg-ttgtatttaaaa 350  Q
    ||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  26208062 gtacaatgaccaaactatccttttgattgtatttaaaa 26208099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36312353 - 36312213
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |   ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  36312353 tgagttgaatgtgaattgatt-atgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 36312255  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaact 352  Q
    |||| ||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  36312254 atgtgtaatgactaaactatccttttaattgtatttaaaact 36312213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Original strand, 39141501 - 39141597
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||  |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39141501 tgagttggatatgaattgatt-atgtttggatacactcatttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 39141597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Original strand, 42516007 - 42516131
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||  | |||| ||||||||  ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  42516007 tgagtttgatgtgaattgatt-atgtttgaatatactcattaaaaaatgattctttcgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttga 42516105  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42516106 atgtataataaccaaattatcttttt 42516131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 320
Target Start/End: Original strand, 31562755 - 31562823
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataat 320  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31562755 ttaaaagtgattcttatgagtttatattgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaat 31562823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8170344 - 8170270
Alignment:
Q  258 gtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc 332  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  8170344 gtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatc 8170270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 326
Target Start/End: Original strand, 44619104 - 44619206
Alignment:
Q  224 gaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgac 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | | |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||    
T  44619104 gaattgatttatgtttggatacacttgtttaaaaatgattattatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaatcgattttgaatgtaaaatgac 44619203  T
Q  324 caa 326  Q
    |||    
T  44619204 caa 44619206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 308
Target Start/End: Original strand, 1945070 - 1945166
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattt 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1945070 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 1945166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2234962 - 2234899
Alignment:
Q  253 taaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtat 317  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2234962 taaaagtgattcttatgagtta-tgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtat 2234899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14821196 - 14821120
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc 332  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  14821196 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatattttgaatcaaaattgattttgaatgtctaatgactaaattatc 14821120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3853977 - 3853869
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||   ||||| |||||||||| | |  || |||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  3853977 tgagttgaatgtaaattgatttatgtttggatacattcatgtaaaattgattcttatcaatctatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgcttttga 3853878  T
Q  312 atgtataat 320  Q
    |||| ||||    
T  3853877 atgtgtaat 3853869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 320
Target Start/End: Original strand, 42089603 - 42089671
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataat 320  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  42089603 ttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataaatcgaatcaaaactgcttttagatgtataat 42089671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36548269 - 36548135
Alignment:
Q  219 gatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtata 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||  || ||| |||||||||||| || ||| |    
T  36548269 gatgtgaattgatttatgtttggatactctcacttaaaa-tgatttttatgggttgatgttgtttggataatttaaattaaaattgattttgaacgtaca 36548171  T
Q  319 atgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaacta 353  Q
    ||||| || |||| |||||  || ||||||||||||    
T  36548170 atgactaaattatccttttaattatatttaaaacta 36548135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 326
Target Start/End: Original strand, 3552921 - 3552991
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||| |||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  3552921 aagtaattcttatcatttcatattgtttggataatttgaatcaaaattgatcttaaatgtgtaattaccaa 3552991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 337
Target Start/End: Original strand, 7295371 - 7295502
Alignment:
Q  204 gttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaatt 303  Q
    |||||| ||||||| || || |||||||||||||||| ||||   |   ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| || | ||||| ||    
T  7295371 gttaaaaatgagtttgacgtaaattgatttatgtttggataca--catataaaagtgattatcatgagttgatgttgtttggatagtttaagtcaaactt 7295468  T
Q  304 gattttaaatgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||    
T  7295469 gattttgaatatataatgaccgaattatcctttt 7295502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11240747 - 11240634
Alignment:
Q  213 gagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaa 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||  | ||  | |||||||||||| |||  ||| |||||||||| ||    
T  11240747 gagttgaatgtgaattgatttatgtttgaatacattcacttagaattgattcttaaaaattcttgttgtttggatagtttggctcataattgattttgaa 11240648  T
Q  313 tgtataatgaccaa 326  Q
     | ||||| |||||    
T  11240647 cgcataattaccaa 11240634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31224757 - 31224696
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagtt 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    |||||||||||||||||||||    
T  31224757 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggatatattttactaaaagtgattcttatgagtt 31224696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 244
Target Start/End: Original strand, 34997259 - 34997299
Alignment:
Q  204 gttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaata 244  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34997259 gttaaaaatgaattggatgtgaattgatttatgtttgaata 34997299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Original strand, 39106700 - 39106819
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||| | ||||| || ||||||| |||| |||  |||||||||||||| | || || |  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  39106700 tgagtttgatataaattgtttaatgtttggatacattcacttaaaagtgattct-acgaatttaagttgtttagataatttgaatcaaaattgattttaa 39106798  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc 332  Q
    || || ||||||||| |||||    
T  39106799 atatacaatgaccaaattatc 39106819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16467163 - 16467049
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||   |    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| ||  ||||||||| |||||      
T  16467163 tgagttagatgtaaattgatttatgtttggatatgataatgtaaaagtgattcttatgggttgatgtagtttggatagtttagatcaaaattaatttttg 16467064  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||||||||| |||||    
T  16467063 atgtataattaccaa 16467049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27911483 - 27911369
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||  |||||||||||| ||   |||| || || ||||||||  || ||| |||||||||||||     
T  27911483 tgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatatactcatttaaaagtgattatttcaagttgatgttatttggatactttaaattaaaattgattttag 27911384  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    |||| |||| |||||    
T  27911383 atgtctaattaccaa 27911369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 309
Target Start/End: Original strand, 43436319 - 43436409
Alignment:
Q  219 gatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    ||||| |||||||||||||||  || |  ||  |||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  43436319 gatgtaaattgatttatgttttgatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgatttt 43436409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 263
Target Start/End: Original strand, 45714692 - 45714750
Alignment:
Q  205 ttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgatt 263  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||    
T  45714692 ttaaaaatgagttcgatgtgaattgatttatgtttggatacactccgttaaaaatgatt 45714750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 326
Target Start/End: Original strand, 3602531 - 3602604
Alignment:
Q  253 taaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    ||||||||||| |||| | || || |||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||||||| |||||    
T  3602531 taaaagtgatttttattaattcatgttgtttggatagtttgaattaaaattgatttttggtgtataattaccaa 3602604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 52966849 - 52966981
Alignment:
Q  219 gatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtata 318  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52966849 gatgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttagataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgta 52966948  T
Q  319 atgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaa 350  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  52966949 atgaccaaattatccttttaattgtatttaaaa 52966981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26519732 - 26519618
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26519732 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaaacaaaattgattttaa 26519633  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||||| |||||||||    
T  26519632 atgtaaaatgaccaa 26519618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 222 - 337
Target Start/End: Original strand, 31618930 - 31619045
Alignment:
Q  222 gtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatg 321  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||  ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31618930 gtgaattgatttatgtttggatactctcacttagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtataatg 31619029  T
Q  322 accaacttatcttttt 337  Q
    | ||||||||| ||||    
T  31619030 atcaacttatcctttt 31619045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25848089 - 25847982
Alignment:
Q  223 tgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatga 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25848089 tgaattgatttatgtttggataccttcacttaaaaatgattcttatgagtttgtgttgtttggatag-ttgaataaaaattgattttaaatgtgtaatga 25847991  T
Q  323 ccaacttat 331  Q
    |||| ||||    
T  25847990 ccaaattat 25847982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 332 - 394
Target Start/End: Original strand, 31619069 - 31619131
Alignment:
Q  332 ctttttgttgtatttaaaactagacccctttctcattttagataatcatttatatttatgttg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31619069 ctttttgttgtatttaaaactagacccctttcacattttagataatcatttatatttatgttg 31619131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31084275 - 31084137
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac-cttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttta 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  31084275 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttc--ttaaaagtgattcttatgacttgatattatttggatagtttgaatcataattgattttg 31084178  T
Q  311 aatgtataatgaccaacttatc-tttttgttgtatttaaaa 350  Q
    ||| | ||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||    
T  31084177 aatatgtaatgaccaaactatcattttaattgtatttaaaa 31084137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 332
Target Start/End: Original strand, 10853313 - 10853420
Alignment:
Q  225 aattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgacc 324  Q
    |||||||||||||||| |||   ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  10853313 aattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtattgacc 10853412  T
Q  325 aacttatc 332  Q
    || |||||    
T  10853413 aaattatc 10853420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42318397 - 42318232
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||  | | || ||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  42318397 tgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 42318299  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaactagac--ccctttctcattttagata 375  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||  ||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||    
T  42318298 atgtaaaatgacaaaattatccttttaattgtatttaaaactaaacatcccattcttattttagata 42318232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35425358 - 35425276
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatctttttg 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||    
T  35425358 aagtgattcttatgagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattatccttttg 35425276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 38172340 - 38172454
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |    || |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  38172340 tgagtgggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttga 38172439  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    |||| ||||||||||    
T  38172440 atgtgtaatgaccaa 38172454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 42475777 - 42475663
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  42475777 tgagttagatgtgaattgatttttgtttgaatacactttgttaaaagcgattcttatgaattgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgcttttag 42475678  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||||||||| |||||    
T  42475677 atgtataattaccaa 42475663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 53074970 - 53074853
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53074970 tgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagtggatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaa 53074872  T
Q  312 atgtataatgaccaactta 330  Q
    |||  ||| ||||||||||    
T  53074871 atgcgtaaagaccaactta 53074853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Original strand, 15511409 - 15511519
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac-cttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttta 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  15511409 tgagttgggtgtgaattgatttatgtttggatacgctta--ttaaaagtgatttttatgagttgatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttg 15511506  T
Q  311 aatgtataatgac 323  Q
    ||||  |||||||    
T  15511507 aatgcgtaatgac 15511519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 44224830 - 44224705
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  || | |||||||||||||| |    
T  44224830 tgagtttgatatgaattgatttatgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataattttagtcaaaattgattttga 44224731  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  44224730 atgtgcaatgaccaaattatcctttt 44224705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 53179916 - 53179792
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  |   |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  53179916 tgagtttgatgtaaattgatttatgtttggatacacttttttaaaagtgatttttatgagttgat-ttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttga 53179818  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  53179817 atgtacaatgaccaaattatcctttt 53179792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20813214 - 20813103
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||   |   | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20813214 tgagttggatttgaattgatttttgtttggatatacttattcaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 20813115  T
Q  312 atgtataatgac 323  Q
    |||| |||||||    
T  20813114 atgtgtaatgac 20813103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23496385 - 23496251
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||  | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23496385 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatac-------taaaagtgattcttgcgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 23496293  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc-tttttgttgtatttaaaact 352  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||  ||||||||||||||    
T  23496292 atgtataatgactaaactatcattttaattgtatttaaaact 23496251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3348311 - 3348186
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac-cttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttta 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||  |||||||||||||||     
T  3348311 tgagttggatgtaaattgatttatgtttggatacacttcc-ttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttatatcaaaattgattttg 3348213  T
Q  311 aatgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  3348212 aatgtgtattgaccaaattatcctttt 3348186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10334204 - 10334067
Alignment:
Q  214 agttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaat 313  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||  |    ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  10334204 agttgaatatgaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtaattcttatgagttgacgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaat 10334105  T
Q  314 gtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaa 350  Q
     ||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||    
T  10334104 ttataatgaccaaactatccttttaattgtatttaaaa 10334067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 375
Target Start/End: Original strand, 38125485 - 38125640
Alignment:
Q  222 gtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatg 321  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  | | || ||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  38125485 gtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatg 38125583  T
Q  322 accaacttat-ctttttgttgtatttaaaactagac--ccctttctcattttagata 375  Q
    || || |||| |||||  ||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||    
T  38125584 acaaaattatccttttaattgtatttaaaactaaacatcccattcttattttagata 38125640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38340873 - 38340732
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac-cttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttta 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||   |||||||| ||| |||| |||| |  |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  38340873 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggatatgctta--ttaaaagtaatttttataagttgacgttgtttggatagtttgaataaaaattgatttta 38340776  T
Q  311 aatgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaacta 353  Q
    ||||| || ||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||    
T  38340775 aatgtgtagtgaccaaattatcctttttattatatataaaacta 38340732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 48189518 - 48189594
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc 332  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  48189518 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatc 48189594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 30811608 - 30811674
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatga 322  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30811608 aagtgattcttatgacttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatga 30811674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22737009 - 22736930
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttat 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  22737009 ttaaaagtgattattatgagttaatgttgttgggatggtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgaacaaattat 22736930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Original strand, 16246171 - 16246237
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatga 322  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16246171 aagtgattcttaggagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatga 16246237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 50664826 - 50664702
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |  ||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||||| || ||| |||||||||||| |    
T  50664826 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacacacttagaagtgattcttaagagtt-atgttgtttagatagtttaaattaaaattgattttga 50664728  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  50664727 atgtgtaatgatcaaattatcctttt 50664702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4984649 - 4984577
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttg 284  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  4984649 tgagttagatgtgaattgatttatgtttggatacactcgtttaaaagtgattcttatgcattaattttgtttg 4984577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 8424806 - 8424882
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc 332  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||    
T  8424806 aagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtaatgactaaattatc 8424882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21225058 - 21224939
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||  |   ||||||| |||||||| ||||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||| | |    
T  21225058 tgagtttgatgtaaattgatatatgtttggatacactttcttaaaagcgattcttacgagttgatgtcgttttgatagtttgaatcaaaattgattatga 21224959  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat 331  Q
     |||||||||||||| ||||    
T  21224958 gtgtataatgaccaaattat 21224939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35930762 - 35930667
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc-tttttgttgtatttaaaa 350  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||    
T  35930762 aagtcattcttatgagttgataatgtttggatggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaaatatcattttaattgtatttaaaa 35930667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 326
Target Start/End: Original strand, 23207093 - 23207213
Alignment:
Q  204 gttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaatt 303  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |   ||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  23207093 gttaaaaatgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacacttttttacaagtgatt-ttatgagttgatgttgttt-gatagtttgaatcaaaatt 23207190  T
Q  304 gattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
     ||||| ||  | ||||||||||    
T  23207191 aattttgaacttgtaatgaccaa 23207213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32357572 - 32357482
Alignment:
Q  219 gatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||  |||||| ||||||||||||    
T  32357572 gatgtaaattgatttatgtttgaaaacactcatttaaaagtgattcttatgtgttgatgttgtttgggtactttgaattaaaattgatttt 32357482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 326
Target Start/End: Original strand, 45423842 - 45423915
Alignment:
Q  253 taaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||||||| | || || |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  45423842 taaaagtgattcttatcaattcatgttgtttggatagcttgaatcaaaattgattttggatgtacaattaccaa 45423915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 326
Target Start/End: Original strand, 37698488 - 37698536
Alignment:
Q  278 ttgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37698488 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttacatgtataattaccaa 37698536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40244120 - 40244068
Alignment:
Q  274 aatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40244120 aatattgtttggatagttttaatcaaaattgtttttaaatgtataattaccaa 40244068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 44939491 - 44939567
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc 332  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  44939491 aagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagttttaatcaaaattaattttgaatgtctaatgactaaattatc 44939567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 30809986 - 30810078
Alignment:
Q  220 atgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||  |   ||||||||||||||||| | || ||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  30809986 atgtgaattgatttatgattgattacgcttacttaaaagtgattcttataaattgatgatgtttggatagtttgaatcaaaattacttttaaa 30810078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34561176 - 34561068
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||   ||| || |||||||||  | ||||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |    
T  34561176 tgagttgaatgcgaattgatttatgtttggatacattgacttagaattgattcttaaaaattaatgttggttggatagtttgacccaaaattgattttga 34561077  T
Q  312 atgtataat 320  Q
    ||| |||||    
T  34561076 atgcataat 34561068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3667936 - 3667822
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3667936 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaa 3667837  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||||| |||||||||    
T  3667836 atgtaaaatgaccaa 3667822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 35760271 - 35760157
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35760271 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaactgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaa 35760172  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||||| |||||||||    
T  35760171 atgtaaaatgaccaa 35760157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27021218 - 27021024
Alignment:
Q  204 gttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttga-ataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggata-gattgaatcaaaa 301  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  27021218 gttaaaaatgagttaaatgtgaattgatttatgtttggtatac--tcacttaaaagtgattcttagaagttgatgttgtttggataagattgaatcaaaa 27021121  T
Q  302 ttgattttaaatgtataatgaccaacttatc-tttttgttgtatttaaaac-tagac--ccctttctcattttagataatcatttatatttatgttg 394  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| || | ||| |||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  27021120 ttgattttgaatgtataatgacgaaattatcctttttattatgttttaaacatagacatccctttctcattttagatgattatttagatttatgttg 27021024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40885293 - 40885167
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtga-ttcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttta 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  40885293 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggacacacttgtttaaaagtgagtttttatgagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 40885194  T
Q  311 aatgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||| | |||||| ||| ||||| ||||    
T  40885193 aatatgtaatgatcaaattatcctttt 40885167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22482271 - 22482130
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22482271 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 22482172  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaact 352  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  22482171 atgtataatgactaaactatccttttaattgtatttaaaact 22482130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32454618 - 32454499
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||  | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  32454618 tgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttga 32454520  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc 332  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  32454519 atgtaaaatgaccaaattatc 32454499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 326
Target Start/End: Original strand, 41740634 - 41740737
Alignment:
Q  223 tgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatga 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41740634 tgaattggtttatgtttgaatacacttgtttaaaagtgattgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 41740733  T
Q  323 ccaa 326  Q
    ||||    
T  41740734 ccaa 41740737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 325
Target Start/End: Original strand, 40791139 - 40791212
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgacca 325  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40791139 ttaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgattgtgaatgtataatgacca 40791212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42146350 - 42146277
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgacca 325  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42146350 ttaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgattgtgaatgtataatgacca 42146277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 353
Target Start/End: Original strand, 28869535 - 28869674
Alignment:
Q  214 agttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaat 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | ||||| |||||  | |    
T  28869535 agttggatgtggattgatttatgtttgaatacacttacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgagt-aaaatagatttcgagt 28869633  T
Q  314 gtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaacta 353  Q
    || |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||    
T  28869634 gtgtaatgaccaaattatccttttaattgtatttaaaacta 28869674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 34106977 - 34107091
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||||    
T  34106977 tgagttagatgtgaattgattaatgtttaaatacattcatttaaaagtaattcttatgaattaatgttgtttgaataggttgaatcaaaattacttttaa 34107076  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
     || ||||| |||||    
T  34107077 gtgcataattaccaa 34107091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41834974 - 41834835
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |    || |||||||||||| || || || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  41834974 tgagttggaagtgaattgatttatgtttggatacactttactagaagtgattcttacgaattgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttga 41834875  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaa 350  Q
    ||||  ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  41834874 atgtgcaatgaccaaattatccttttaattgtatttaaaa 41834835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 332
Target Start/End: Original strand, 3060296 - 3060372
Alignment:
Q  255 aaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc 332  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  3060296 aaagtgattcttatgagtta-tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatc 3060372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Original strand, 9275514 - 9275639
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  |    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||   |||||| ||| |||||||| |    
T  9275514 tgagttagatgttaattgatttatgtttggatacactttaataaaattgattcttatgagttgatgttgtttggatgatttgaatgaaacttgattttga 9275613  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  9275614 atgtgtaatgaccaaattatcttttt 9275639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Original strand, 13253113 - 13253209
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13253113 tgagttgaatatgaattgatt-atgtttggatacactcatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgatttt 13253209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 2430370 - 2430446
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc 332  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||    
T  2430370 aagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtaatgactaaattatc 2430446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4292238 - 4292120
Alignment:
Q  205 ttaaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattg 304  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |   ||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||     
T  4292238 ttaaaaataagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttaattagaagtgattcttgttggttgatattgtttggataatttgaatcaaaatta 4292139  T
Q  305 attttaaatgtataatgac 323  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  4292138 attttgaatgtgtaatgac 4292120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 312
Target Start/End: Original strand, 7385972 - 7386062
Alignment:
Q  222 gtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||| |||||||    
T  7385972 gtgaattgatttatgtttaaatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttaaatcaaaattgcttttaaa 7386062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Original strand, 40495388 - 40495512
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  |   |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||||||||  |    
T  40495388 tgagtttgatgtaaattgatttatgtttggatacacttttttaaaagtgatttttatgagttgat-ttgtttgaatagtttaaatcaaaattgatttgga 40495486  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  40495487 atgtacaatgatcaaattatcctttt 40495512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7714975 - 7714897
Alignment:
Q  259 tgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||    
T  7714975 tgattcttataagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaaagtataatgactaaattatcctttt 7714897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 337
Target Start/End: Original strand, 33953975 - 33954056
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || ||||| ||||    
T  33953975 aagtgattctgatgagttgatgttgttcggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtgtaatgactaaattatcctttt 33954056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 312
Target Start/End: Original strand, 39987997 - 39988097
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  |   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||   || ||||||||||  ||||||    
T  39987997 tgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatgatttaaatcaaaatttcttttaa 39988096  T
Q  312 a 312  Q
    |    
T  39988097 a 39988097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 308
Target Start/End: Original strand, 5710416 - 5710511
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaatac-cttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattt 308  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||| |||| |||   ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5710416 tgagtttggtgtgaattgctttatgtttggatacgctta--ttacaagtgatttttatgagtagatattgtttggatagtttgaataaaaattgattt 5710511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24045905 - 24045788
Alignment:
Q  219 gatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtata 318  Q
    |||||||||||||||||||||| || |  ||  |||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||| |    
T  24045905 gatgtgaattgatttatgtttggatgctctcacttaaaa-tgatttttatgggttgatgttgtttggataatttgaattaaaattgattttgaacgtaca 24045807  T
Q  319 atgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||| || ||||| ||||    
T  24045806 atgactaaattatcctttt 24045788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32030754 - 32030659
Alignment:
Q  254 aaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaa 350  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||    
T  32030754 aaaagtgattcttatg--ttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaaggtgtaatgactaaactatccttttagttgtatttaaaa 32030659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10058156 - 10058059
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |    || |||||||||||| || || || |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10058156 tgagttggaaatgaattgatttatgtttggatacactttactagaagtgattcttacgaattgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgatttt 10058059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 312
Target Start/End: Original strand, 8049081 - 8049181
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || || |||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   || ||||||||||| ||||||    
T  8049081 tgagtttgaggttaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgttgttgtttggatgatttaaatcaaaattgcttttaa 8049180  T
Q  312 a 312  Q
    |    
T  8049181 a 8049181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7178859 - 7178746
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||  |    ||||| |||||||||| | || || |||||||| ||| |||||||||||||| |||| |    
T  7178859 tgagttgaatgt-aattgatttatgtttggatacaataacctaaaattgattcttatcaatttatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgcttttga 7178761  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    | ||||||| |||||    
T  7178760 aagtataattaccaa 7178746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 322
Target Start/End: Original strand, 16158535 - 16158605
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatga 322  Q
    |||||||||||||||| || || || || |||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16158535 ttaaaagtgattcttaggaattgatgttctttggatgatttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatga 16158605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 326
Target Start/End: Original strand, 3747686 - 3747734
Alignment:
Q  278 ttgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  3747686 ttgtttggatagttttaatcaaaattgattttacatgtaaaattaccaa 3747734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13676541 - 13676477
Alignment:
Q  262 ttcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||    
T  13676541 ttcttataaattaatgttgttcggatagattgaatcaaaattgtgtttaagtgcataattaccaa 13676477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41959502 - 41959446
Alignment:
Q  253 taaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||  | ||||||||||    
T  41959502 taaaagtgattcttatgagttaatgttgttttcatagtttgaaatagaattgatttt 41959446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9456154 - 9456023
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatcttttt-gttgtatttaaaa 350  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  9456154 ttaaaagtgattcttatgagttgatcttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaattatctttttaattgtatttaaaa 9456055  T
Q  351 ctagacccctttctcattttagataatcattt 382  Q
    ||| |   | || |||||||||||||| ||||    
T  9456054 ctaaatatcattttcattttagataattattt 9456023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 212 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 46541689 - 46541504
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattga-tttta 310  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  46541689 tgagttgaatgtgaattggtttatgtttgagtatattcaccgaaaagtgattcttatga-ttgatattgttttgatagattgaatcaaaattgattttta 46541591  T
Q  311 aatgtataatgaccaacttat-ctttttgttgta-tttaaaactagac--ccctttctcattttagataatcatttatatttatgttg 394  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||| |||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  46541590 aatgtataatgaccaaattatcctttttattctattttaaaaatagacatccctttctcatatta-ataattatttagatttatgttg 46541504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 353
Target Start/End: Original strand, 12632103 - 12632245
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||| |    
T  12632103 tgagttagatgtgaattgatttatgtttgagtgtactcgcttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaattgtttgaatcaaaattgattttga 12632202  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaacta 353  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  12632203 atgtgtaatgaccaaaatatccttttaattgtatttaaaacta 12632245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 394
Target Start/End: Original strand, 386543 - 386685
Alignment:
Q  254 aaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattga-ttttaaatgtataatgaccaacttatctttttgttgta-tttaaaac 351  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||     
T  386543 aaaagtgattcttatga-ttgatgttgtttggatagattgaatcaaaattgatttttaaatgtataatgaccaaattatccttttattctattttaaaaa 386641  T
Q  352 tagac--ccctttctcattttagataatcatttatatttatgttg 394  Q
    |||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  386642 tagacatccctttctcatatta-ataattatttagatttatgttg 386685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38230157 - 38230046
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38230157 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacattttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaa 38230058  T
Q  312 atgtataatgac 323  Q
    |||| |||||||    
T  38230057 atgtgtaatgac 38230046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37562659 - 37562545
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||      
T  37562659 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgt 37562560  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    |||| ||||||||||    
T  37562559 atgtgtaatgaccaa 37562545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 315
Target Start/End: Original strand, 3622480 - 3622583
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |   |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  3622480 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttacgagttgatgttgtttggatagtataaatcaaaattgattttaa 3622579  T
Q  312 atgt 315  Q
    ||||    
T  3622580 atgt 3622583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Original strand, 44967419 - 44967544
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    || |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  44967419 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttgaatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttga 44967518  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
     | | |||||||||| ||||| ||||    
T  44967519 gtttgtaatgaccaaattatcctttt 44967544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3342879 - 3342765
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |    || |||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  3342879 tgagttggatatgaattgatttatgtttggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttga 3342780  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    || | ||||||||||    
T  3342779 atatgtaatgaccaa 3342765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 206 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42904648 - 42904534
Alignment:
Q  206 taaatatgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattga 305  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  || ||||||||||      
T  42904648 taaaaatgagttagatgtgaattgatttatgttttgatacactcgtttaaaagtgattcttatgaattaattttgtttgtatattttaaatcaaaattac 42904549  T
Q  306 ttttaaatgtataat 320  Q
    ||||||||| |||||    
T  42904548 ttttaaatgcataat 42904534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Original strand, 47217561 - 47217686
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||| | ||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  47217561 tgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatgcactcgcttaaaagtgattttgatgggttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttga 47217660  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    | ||| |||||| || ||||| ||||    
T  47217661 acgtacaatgactaaattatcctttt 47217686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 336
Target Start/End: Original strand, 36920198 - 36920322
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||| |||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||   |    
T  36920198 tgagttagatataaattgatttatgtttgaatacgtttaattaaaggtgattcttttgagttgatgttgtttgggtacattgaatcaaaattgattgcga 36920297  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatctttt 336  Q
    || |||||||||||  |||||||||    
T  36920298 atatataatgaccatattatctttt 36920322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 320
Target Start/End: Original strand, 43631755 - 43631823
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataat 320  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43631755 ttaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatatattgaatcaaaattgattgtgaatgtataat 43631823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3375579 - 3375440
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||   ||| ||||||||||||||| |    
T  3375579 tgagtttggtgtgaattgatttgtgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagtcgatgttgtttggatgatttggatcaaaattgattttga 3375480  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaa 350  Q
    ||||  ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  3375479 atgtgcaatgaccaaattatccttttaattgtatttaaaa 3375440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 326
Target Start/End: Original strand, 34366004 - 34366115
Alignment:
Q  214 agttggatgtgaattgatttatgtttgaatac-cttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaa 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  34366004 agttgggtgtgaattgatttatgtttggatacgctta--ttaaaagtgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaa 34366101  T
Q  313 tgtataatgaccaa 326  Q
     |  ||||||||||    
T  34366102 ggcgtaatgaccaa 34366115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 42740441 - 42740367
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42740441 ttaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtatgtatcaaaattgattttaagtgtgtaatgaccaa 42740367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 43737999 - 43738073
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  43737999 ttaaaagtgattcttatgagtggatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgaaatgaccaa 43738073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 48459799 - 48459685
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  48459799 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttatgaatggatgttgtttggatagtatgtattaaaattgattttaa 48459700  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
     ||| ||||||||||    
T  48459699 gtgtgtaatgaccaa 48459685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 34010428 - 34010332
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  34010428 tgagttggatatgaactgatt-atgtttgaatacactcatttaaaagtggttcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaatttt 34010332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 37639479 - 37639378
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaa 350  Q
    ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||    
T  37639479 ttaaaagtgattcttgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtgtaatgactaaactatccttttaattgtatttaaaa 37639380  T
Q  351 ct 352  Q
    ||    
T  37639379 ct 37639378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 47301622 - 47301719
Alignment:
Q  257 agtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaacta 353  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||  || ||||||||||||    
T  47301622 agtgattcttatgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgactaaattatccttttaattatatttaaaacta 47301719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32206007 - 32205913
Alignment:
Q  219 gatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgt 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32206007 gatgtgaattgatttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttatgagtta-tgttgtttg-atagtatgaatcaaaattgattttaaatgt 32205913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Original strand, 39391157 - 39391269
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  |   ||| ||||||||||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  39391157 tgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatacactttcttacaagtgattcttatgaattgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttga 39391256  T
Q  312 atgtataatgacc 324  Q
    | || ||||||||    
T  39391257 acgtgtaatgacc 39391269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48134629 - 48134557
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgacc 324  Q
    |||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48134629 ttaaaagtgatttttataagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgacc 48134557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Original strand, 10371978 - 10372118
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |   ||| ||||||||||| || ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  10371978 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggttacagtttattagaagtgattcttgtgggttgatgttgttcggatagtttgaatcaaaattgattttga 10372077  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatctttttgttgtatttaaaact 352  Q
    |||  ||||||| ||   ||| |||  ||||||||||||||    
T  10372078 atgcgtaatgactaaaccatcctttaattgtatttaaaact 10372118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3750775 - 3750662
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    || || ||| |||||||| || || |||||||||||| || |||||||||| ||||| |    
T  3750775 tgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaatataattgaatcttatgaattgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattaatttt-a 3750677  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    |||| ||||||||||    
T  3750676 atgtgtaatgaccaa 3750662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19096005 - 19095929
Alignment:
Q  232 ttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19096005 ttatgtttggatacactcgtttaaaaatgattcttatgagtta-tgttgtttggataatttgaatcaaaattgatttt 19095929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32187029 - 32186932
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| || |  ||  |||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  32187029 tgagttagatgtaaattgatttatgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgatttt 32186932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41715746 - 41715649
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| || |  ||  |||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41715746 tgagttagatgtaaattgatttatgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgatttt 41715649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 320
Target Start/End: Original strand, 37886856 - 37886898
Alignment:
Q  278 ttgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataat 320  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37886856 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatatataat 37886898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 39634185 - 39634299
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||     ||||||||||||||| | ||  | |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |    
T  39634185 tgagttgaatatgaattgatttatgtttggataacttaaaacaaaagtgattcttataaattcttgttgtttggataacttggatcaaaattgattttga 39634284  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||| ||||| |||||    
T  39634285 atgcataattaccaa 39634299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 325
Target Start/End: Original strand, 34010994 - 34011095
Alignment:
Q  225 aattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgttt-ggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgac 323  Q
    |||| ||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||| || |||||| || ||  || |||||||||||||||| || || |||||||    
T  34010994 aattaatttatgtttggaaacattcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggggtactttaaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgac 34011093  T
Q  324 ca 325  Q
    ||    
T  34011094 ca 34011095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 47021962 - 47021869
Alignment:
Q  258 gtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc-tttttgttgtatttaaaa 350  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  47021962 gtgattcttacgaattgatgttgtttggataatttgaatgaaaattgattttgaatgtgcaatgaccaaattatcattttaattgtatttaaaa 47021869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 320
Target Start/End: Original strand, 42752211 - 42752319
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     |||| | |||||||| | || || |||||||||||  ||  ||||||||||||||| |    
T  42752211 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggataccttaaagcaaaaataattcttataaattcatgttgtttggataacttagatcaaaattgattttga 42752310  T
Q  312 atgtataat 320  Q
    ||| |||||    
T  42752311 atgcataat 42752319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2839367 - 2839266
Alignment:
Q  225 aattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgacc 324  Q
    |||||||||||||||| || | ||  || ||||||||||||| | | || | ||||||||||||  |||| ||||||||  |||| |||||||||| |||    
T  2839367 aattgatttatgtttggattcattaagtcaaaagtgattcttgttaatttaaattgtttggatactttgagtcaaaattatttttgaatgtataattacc 2839268  T
Q  325 aa 326  Q
    ||    
T  2839267 aa 2839266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 326
Target Start/End: Original strand, 40903228 - 40903301
Alignment:
Q  253 taaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    ||||||||||| |||| | || || |||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  40903228 taaaagtgatttttatcaattcatgttgtttggatagttcaaatcaaaattgattttggatgtataattaccaa 40903301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 29409284 - 29409398
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |   |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  29409284 tgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacagttttttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttga 29409383  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||||||    
T  29409384 atgtataatgaccaa 29409398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 16442383 - 16442497
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |    
T  16442383 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttgatattgtttggataatttgaatgaaaattgattttga 16442482  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    |||| ||||||||||    
T  16442483 atgtgtaatgaccaa 16442497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13739273 - 13739154
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||  | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  13739273 tgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttga 13739175  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc 332  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  13739174 atgtaaaatgaccaaattatc 13739154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13744773 - 13744654
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||  | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  13744773 tgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttga 13744675  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc 332  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  13744674 atgtaaaatgaccaaattatc 13744654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 350
Target Start/End: Original strand, 33899038 - 33899177
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||| |    
T  33899038 tgagtttgatatgaattgatttatgtttggatacactaatgtaaaagtgattcttatgagttaataatgtttggatggtttaaatcaaaattgattttga 33899137  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaa 350  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||    
T  33899138 atgtgtaatgaccaaaatatccttttaattgtatttaaaa 33899177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16548207 - 16548066
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||| | || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16548207 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 16548108  T
Q  312 atgtataatgaccaacttat-ctttttgttgtatttaaaact 352  Q
    |||| ||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  16548107 atgtgtaatgactaaactatccttttaattgtatttaaaact 16548066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21455910 - 21455812
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatcttttt-gttgtatttaaa 349  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||  |||||||||||    
T  21455910 ttaaaagtgattctcatgagttaatgttgtttgcatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtgtaatgattaaattatctttttaattgtatttaaa 21455812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10826119 - 10826045
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  10826119 ttaaaagtgattcttatgagttgattttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatatggaatgaccaa 10826045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Original strand, 6208096 - 6208215
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  6208096 tgagttgaatgtgaattgatt-atgtttggatacactttactaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttagatagtttgaatcaaaattaattttga 6208194  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatc 332  Q
    |||| ||||||| || |||||    
T  6208195 atgtctaatgactaaattatc 6208215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7215603 - 7215533
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatga 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  7215603 ttaaaagtgattctcatgagttaatgttgtttgcataaattgaatcaaaattaattttaaatatgtaatga 7215533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31132492 - 31132435
Alignment:
Q  252 ttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 309  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31132492 ttaaaagtgattcttatgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 31132435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Original strand, 17830031 - 17830171
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||   |||  |   ||| ||||  ||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17830031 tgagttgaatgtgaattgatttatgtttagttacagtttattagaagtcgttcttgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 17830130  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatctttttgttgtatttaaaact 352  Q
    |||| |||||||  |  |||| |||  ||||||||||||||    
T  17830131 atgtgtaatgactgaactatcgtttaattgtatttaaaact 17830171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 1312472 - 1312586
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| ||   ||| || |||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |    
T  1312472 tgagttgaatgcgaattgatttatgttcggatacattgacttagaattgattcttaaaaattaatgttgtttggatagtttgacccaaaattgattttga 1312571  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    ||| ||||| |||||    
T  1312572 atgcataattaccaa 1312586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 699625 - 699512
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || |  |    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  699625 tgagttggataagaattgatttatgtttggatgcactttactaaaagtaattcttataagttaatgttgtt-ggatagtttgaatcaaaatcgattttga 699527  T
Q  312 atgtataatgaccaa 326  Q
    || || ||| |||||    
T  699526 atataaaattaccaa 699512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8517 - 8392
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |   |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8517 tgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacacttttttaaaaatgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 8418  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  8417 atgtacaatgaccaaattatcctttt 8392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9136 - 9054
Alignment:
Q  255 aaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  9136 aaagtgattcttatgagtagatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatcctttt 9054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 29199 - 29275
Alignment:
Q  256 aagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatc 332  Q
    |||| |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  29199 aagttattcttatgaattgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattatc 29275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0983 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:

Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Original strand, 2301 - 2426
Alignment:
Q  212 tgagttggatgtgaattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaa 311  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||||| || |||  |||| |  |||||| ||||| |||||||||||||||||||      
T  2301 tgagtttgaggtgaattgatttatgtttggacacacttgtttaaaagtggtttttacaagttgacgttgtttagatagtttgaatcaaaattgattttgg 2400  T
Q  312 atgtataatgaccaacttatcttttt 337  Q
    || | |||||||||| ||||| ||||    
T  2401 atatgtaatgaccaaattatcctttt 2426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 326
Target Start/End: Original strand, 138554 - 138655
Alignment:
Q  225 aattgatttatgtttgaataccttcggttaaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgacc 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||| | |  |||  |||| ||||  || |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  138554 aattgatttatgtttggataccttaacataaaagtgattcttatcaatccataaagtttagataatttaaatcaaaattgattttaaatgtgtaattacc 138653  T
Q  325 aa 326  Q
    ||    
T  138654 aa 138655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 320
Target Start/End: Original strand, 9257 - 9299
Alignment:
Q  278 ttgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataat 320  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9257 ttgtttggatagttttgatcaaaattgattttaaatgtataat 9299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 352
Target Start/End: Original strand, 5943 - 6004
Alignment:
Q  291 ttgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaacttatctttttgttgtatttaaaact 352  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||| |||  ||||||||||||||    
T  5943 ttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaactatcctttaattgtatttaaaact 6004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 46790 - 46717
Alignment:
Q  253 taaaagtgattcttatgagttaatattgtttggatagattgaatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaa 326  Q
    ||||||||||| |||| | || || |||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  46790 taaaagtgatttttatcaattcatgttgtttggatagttcaaatcaaaattgattttggatgtataattaccaa 46717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University