View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19820_low_3 (Length: 249)

Name: NF19820_low_3
Description: NF19820
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19820_low_3
NF19820_low_3
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (14-249)||(27623761-27623996)
chr6 (21-249)||(27284421-27284649)
chr6 (21-249)||(29555468-29555697)
chr6 (14-249)||(13518246-13518481)
chr6 (14-249)||(22928935-22929170)
chr6 (14-249)||(8899751-8899987)
chr6 (21-247)||(26772687-26772914)
chr6 (21-249)||(26110469-26110698)
chr6 (14-249)||(27356163-27356399)
chr6 (14-249)||(33370483-33370719)
chr6 (21-249)||(27200096-27200326)
chr6 (14-249)||(34458558-34458794)
chr6 (21-249)||(26791726-26791955)
chr6 (21-249)||(27248907-27249138)
chr6 (21-248)||(27491044-27491272)
chr6 (14-249)||(28166404-28166640)
chr6 (21-249)||(16755730-16755959)
chr6 (14-249)||(24869620-24869856)
chr6 (14-249)||(27025055-27025291)
chr6 (14-249)||(4763674-4763909)
chr6 (21-249)||(4531198-4531427)
chr6 (22-210)||(30552060-30552249)
chr6 (21-249)||(4539817-4540047)
chr6 (14-249)||(27030932-27031169)
chr6 (21-249)||(28213364-28213594)
chr6 (21-249)||(13293004-13293233)
chr6 (14-249)||(27063392-27063628)
chr6 (21-249)||(4778790-4779020)
chr6 (21-249)||(14139453-14139682)
chr6 (21-249)||(27013643-27013872)
chr6 (14-249)||(24299807-24300043)
chr6 (14-249)||(29578925-29579161)
chr6 (21-216)||(27208848-27209043)
chr6 (21-216)||(27240185-27240380)
chr6 (14-249)||(16938076-16938313)
chr6 (84-249)||(23851450-23851615)
chr6 (14-249)||(26926680-26926914)
chr6 (21-249)||(29507326-29507555)
chr6 (21-249)||(16680049-16680278)
chr6 (14-249)||(15406580-15406817)
chr6 (14-249)||(15418367-15418604)
chr6 (22-163)||(20174545-20174687)
chr6 (22-163)||(22161304-22161446)
chr6 (21-79)||(26666716-26666774)
chr6 (176-249)||(4718349-4718423)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (14-249)||(3286-3522)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (14-249)||(16618641-16618876)
chr3 (14-249)||(32296505-32296741)
chr3 (14-249)||(29142905-29143141)
chr3 (14-249)||(4629661-4629897)
chr3 (14-249)||(8217508-8217744)
chr3 (21-249)||(28027167-28027396)
chr3 (14-247)||(4340824-4341059)
chr3 (14-249)||(21680577-21680813)
chr3 (14-249)||(28110103-28110340)
chr3 (14-249)||(16422059-16422294)
chr3 (14-249)||(29659116-29659352)
chr3 (14-249)||(5472864-5473100)
chr3 (14-249)||(18231069-18231305)
chr3 (14-249)||(4422795-4423030)
chr3 (22-249)||(17979107-17979337)
chr3 (21-249)||(22381735-22381963)
chr3 (14-249)||(5727854-5728090)
chr3 (14-249)||(18248614-18248850)
chr3 (14-249)||(20570994-20571230)
chr3 (14-249)||(24334049-24334285)
chr3 (14-215)||(47029364-47029565)
chr3 (14-249)||(5603463-5603699)
chr3 (14-249)||(5716944-5717180)
chr3 (14-249)||(5764278-5764514)
chr3 (14-249)||(10402025-10402261)
chr3 (14-249)||(10648947-10649183)
chr3 (14-249)||(31958605-31958841)
chr3 (14-249)||(19700363-19700598)
chr3 (21-249)||(6536898-6537127)
chr3 (21-249)||(32445030-32445259)
chr3 (14-249)||(15735243-15735479)
chr3 (14-249)||(17971012-17971248)
chr3 (14-249)||(18286502-18286738)
chr3 (14-249)||(18301803-18302039)
chr3 (14-249)||(28345047-28345283)
chr3 (14-249)||(51787898-51788134)
chr3 (21-249)||(4727509-4727738)
chr3 (14-249)||(6207776-6208013)
chr3 (21-249)||(8283624-8283853)
chr3 (21-249)||(22865001-22865230)
chr3 (21-249)||(22880060-22880289)
chr3 (14-249)||(31030386-31030622)
chr3 (21-249)||(18336504-18336734)
chr3 (14-249)||(35886640-35886877)
chr3 (21-249)||(48471803-48472032)
chr3 (14-247)||(4689529-4689764)
chr3 (20-249)||(18057136-18057367)
chr3 (21-249)||(7079100-7079327)
chr3 (21-249)||(5019589-5019818)
chr3 (14-249)||(5590509-5590745)
chr3 (14-249)||(11104510-11104746)
chr3 (21-249)||(4790788-4791018)
chr3 (31-249)||(5658011-5658229)
chr3 (14-249)||(20071911-20072145)
chr3 (55-247)||(15886894-15887089)
chr3 (79-249)||(8002436-8002607)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (14-249)||(27602974-27603209)
chr8 (14-247)||(16260138-16260372)
chr8 (14-249)||(28356019-28356256)
chr8 (14-249)||(31360441-31360677)
chr8 (14-249)||(29835236-29835472)
chr8 (14-249)||(19680361-19680598)
chr8 (14-249)||(9360535-9360771)
chr8 (14-248)||(19202430-19202666)
chr8 (14-249)||(44566894-44567130)
chr8 (21-247)||(22138822-22139049)
chr8 (14-249)||(19655409-19655647)
chr8 (21-249)||(12086797-12087027)
chr8 (14-249)||(19694008-19694245)
chr8 (21-249)||(33248279-33248508)
chr8 (21-245)||(33264648-33264873)
chr8 (14-249)||(31483939-31484175)
chr8 (19-234)||(22075002-22075216)
chr8 (21-249)||(15773487-15773716)
chr8 (14-249)||(21342237-21342474)
chr8 (14-249)||(2131329-2131565)
chr8 (14-249)||(19911231-19911467)
chr8 (21-249)||(18796619-18796849)
chr8 (14-249)||(18715395-18715629)
chr8 (14-249)||(14569070-14569305)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (14-249)||(3795458-3795694)
chr5 (14-249)||(22894337-22894572)
chr5 (14-249)||(33881047-33881282)
chr5 (14-249)||(33298453-33298689)
chr5 (14-249)||(28953785-28954021)
chr5 (21-249)||(15752864-15753092)
chr5 (14-249)||(37746333-37746568)
chr5 (14-249)||(32590280-32590516)
chr5 (14-249)||(37352649-37352885)
chr5 (14-249)||(37760902-37761138)
chr5 (14-249)||(41680624-41680860)
chr5 (14-249)||(30035347-30035582)
chr5 (22-249)||(33522299-33522530)
chr5 (21-249)||(37665498-37665727)
chr5 (14-249)||(24729890-24730126)
chr5 (14-249)||(28655162-28655398)
chr5 (14-247)||(33783409-33783643)
chr5 (14-249)||(9323397-9323634)
chr5 (21-249)||(11555274-11555503)
chr5 (14-249)||(26486316-26486553)
chr5 (14-249)||(18494772-18495008)
chr5 (14-249)||(25206198-25206434)
chr5 (14-249)||(25270354-25270590)
chr5 (14-249)||(30174385-30174621)
chr5 (14-249)||(31820413-31820649)
chr5 (16-246)||(8659479-8659709)
chr5 (21-249)||(2516985-2517214)
chr5 (14-249)||(6880223-6880460)
chr5 (14-249)||(13180793-13181030)
chr5 (14-249)||(11329557-11329793)
chr5 (18-249)||(18369541-18369773)
chr5 (21-249)||(23897795-23898023)
chr5 (14-215)||(12138131-12138333)
chr5 (22-247)||(24975771-24975997)
chr5 (21-249)||(18122428-18122657)
chr5 (21-249)||(22993128-22993357)
chr5 (14-249)||(9544714-9544949)
chr5 (14-249)||(43084178-43084414)
chr5 (21-249)||(13436691-13436922)
chr5 (21-249)||(30157953-30158183)
chr5 (21-249)||(13318839-13319068)
chr5 (21-249)||(23631889-23632118)
chr5 (21-249)||(24608166-24608395)
chr5 (21-249)||(31437384-31437613)
chr5 (21-249)||(34622438-34622668)
chr5 (21-249)||(15652770-15652999)
chr5 (14-249)||(30940556-30940793)
chr5 (21-249)||(40467565-40467794)
chr5 (14-249)||(5643722-5643956)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (14-249)||(21891853-21892089)
chr1 (23-249)||(20334531-20334757)
chr1 (14-247)||(16202140-16202373)
chr1 (14-249)||(20466694-20466928)
chr1 (14-249)||(10968580-10968816)
chr1 (14-249)||(3647061-3647297)
chr1 (14-249)||(10951006-10951242)
chr1 (14-249)||(51644135-51644371)
chr1 (21-249)||(28590998-28591227)
chr1 (21-249)||(41787422-41787652)
chr1 (14-249)||(28155643-28155877)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (14-249)||(16047226-16047461)
chr7 (21-249)||(11446798-11447027)
chr7 (14-249)||(5141326-5141562)
chr7 (14-249)||(16745512-16745748)
chr7 (14-249)||(26441163-26441399)
chr7 (21-249)||(3451228-3451457)
chr7 (14-234)||(10847509-10847729)
chr7 (14-249)||(16443995-16444230)
chr7 (14-249)||(26518703-26518939)
chr7 (21-246)||(45393131-45393358)
chr7 (14-249)||(31558385-31558620)
chr7 (14-247)||(16512425-16512659)
chr7 (14-249)||(4205299-4205536)
chr7 (21-249)||(5153994-5154223)
chr7 (17-249)||(26663907-26664140)
chr7 (14-249)||(4139238-4139474)
chr7 (21-249)||(31084620-31084850)
chr7 (14-247)||(2160483-2160716)
chr7 (21-249)||(5164294-5164523)
chr7 (14-249)||(24586525-24586762)
chr7 (14-249)||(26313838-26314075)
chr7 (17-249)||(26679099-26679332)
chr7 (14-249)||(39207130-39207366)
chr7 (14-249)||(11418770-11419006)
chr7 (14-249)||(26269080-26269316)
chr7 (21-249)||(2779162-2779391)
chr7 (14-249)||(26509687-26509924)
chr7 (21-249)||(31129815-31130044)
chr7 (14-249)||(45737213-45737447)
chr7 (14-249)||(10910911-10911147)
chr7 (79-249)||(26531926-26532097)
chr7 (14-78)||(26595750-26595814)
chr7 (177-249)||(16732684-16732757)
chr7 (218-249)||(2104357-2104388)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (14-249)||(1570-1807)
scaffold0322 (25-249)||(11960-12184)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (22-249)||(1906177-1906404)
chr4 (21-249)||(14104468-14104696)
chr4 (14-249)||(39856561-39856797)
chr4 (14-234)||(15276737-15276957)
chr4 (14-249)||(15233741-15233976)
chr4 (14-249)||(54839316-54839551)
chr4 (14-249)||(18794722-18794958)
chr4 (22-249)||(21975625-21975856)
chr4 (14-249)||(24586466-24586703)
chr4 (14-238)||(15380343-15380567)
chr4 (14-249)||(20332528-20332764)
chr4 (14-249)||(30759688-30759924)
chr4 (14-249)||(27157419-27157656)
chr4 (21-249)||(6575786-6576015)
chr4 (17-249)||(40099745-40099978)
chr4 (14-249)||(14753598-14753834)
chr4 (14-249)||(33667906-33668142)
chr4 (21-249)||(5700464-5700694)
chr4 (14-249)||(5011801-5012038)
chr4 (14-249)||(17018976-17019213)
chr4 (22-249)||(31120624-31120855)
chr4 (21-249)||(36338630-36338859)
chr4 (20-249)||(14670940-14671171)
chr4 (21-249)||(34183074-34183303)
chr4 (21-249)||(24118586-24118816)
chr4 (14-157)||(1673877-1674020)
chr4 (111-247)||(18311379-18311518)
chr4 (21-84)||(36324421-36324484)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (14-249)||(21697271-21697506)
chr2 (21-249)||(12710703-12710932)
chr2 (14-249)||(40239420-40239656)
chr2 (14-249)||(11629279-11629515)
chr2 (14-249)||(12592721-12592957)
chr2 (14-249)||(27809612-27809848)
chr2 (14-234)||(27396250-27396470)
chr2 (14-249)||(21671267-21671504)
chr2 (14-249)||(37679987-37680224)
chr2 (14-249)||(37695252-37695489)
chr2 (14-249)||(27782143-27782379)
chr2 (22-249)||(16823440-16823671)
chr2 (22-249)||(16897809-16898040)
chr2 (14-249)||(3788405-3788641)
chr2 (14-249)||(32055714-32055949)
chr2 (14-249)||(19410581-19410818)
chr2 (21-249)||(12661450-12661679)
chr2 (21-234)||(19450529-19450742)
chr2 (21-249)||(34160755-34160984)
chr2 (14-249)||(13930641-13930877)
chr2 (14-249)||(37931283-37931519)
chr2 (14-249)||(37945961-37946197)
chr2 (14-248)||(22922240-22922475)
chr2 (14-249)||(254747-254983)
chr2 (14-249)||(16167389-16167625)
chr2 (14-249)||(34867594-34867830)
chr2 (14-247)||(27428541-27428775)
chr2 (21-249)||(37383588-37383818)
chr2 (14-249)||(27122436-27122672)
chr2 (14-249)||(28888190-28888426)
chr2 (21-249)||(34269023-34269251)
chr2 (21-249)||(34297068-34297296)
chr2 (21-249)||(9344089-9344318)
chr2 (21-247)||(39895981-39896209)
chr2 (14-249)||(20843824-20844060)
chr2 (14-249)||(23122667-23122904)
chr2 (21-249)||(31882198-31882427)
chr2 (21-249)||(39045924-39046153)
chr2 (14-113)||(31868880-31868979)
chr2 (108-249)||(31887682-31887824)
chr2 (176-249)||(27821900-27821974)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (14-249)||(11951-12185)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (14-249)||(15482-15718)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (19-234)||(25044-25259)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (21-249)||(9040-9269)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (21-249)||(9753-9981)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (14-249)||(9827-10063)
scaffold0143 (14-249)||(33210-33447)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (21-249)||(290-519)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (21-249)||(13862-14092)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (21-249)||(4716-4947)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (14-249)||(25006-25243)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (19-234)||(26243-26458)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (21-249)||(18498-18728)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (14-249)||(5979-6216)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (25-210)||(40759-40953)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 27623761 - 27623996
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623761 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 27623860  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623861 acattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttctgatggagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 27623960  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623961 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 27623996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 27284421 - 27284649
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284421 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 27284520  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27284521 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatgg 27284620  T
Q  221 tgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  27284621 tggttggccagatatagttacttgccttt 27284649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29555697 - 29555468
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555697 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 29555598  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  29555597 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacg 29555498  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29555497 gtggttggccagatatagttacttgccttt 29555468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 13518246 - 13518481
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518246 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 13518345  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518346 acattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 13518445  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13518446 gggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 13518481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 22928935 - 22929170
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928935 agcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 22929034  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929035 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 22929134  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22929135 ggaatggtggttggccagatatagttacttgccttt 22929170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 8899751 - 8899987
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899751 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 8899850  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899851 acattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 8899950  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8899951 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 8899987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Original strand, 26772687 - 26772914
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772687 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 26772786  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  26772787 acacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 26772886  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  26772887 gtggttggccagatatagttacttgcct 26772914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 26110469 - 26110698
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110469 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 26110568  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||      
T  26110569 acacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacg 26110668  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26110669 gtggttggccagatatagttacttgccttt 26110698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 27356163 - 27356399
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356163 agcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 27356262  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||     
T  27356263 acattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaag 27356362  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27356363 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 27356399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 33370483 - 33370719
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370483 agcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 33370582  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||     
T  33370583 acattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaag 33370682  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33370683 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 33370719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27200326 - 27200096
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27200326 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 27200227  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  27200226 aacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 27200127  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27200126 ggtggttggccagatatagttacttgccttt 27200096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 34458558 - 34458794
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458558 agcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 34458657  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  34458658 acattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaag 34458757  T
Q  214 ggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| |  | | || |||||||||||||||||||||||    
T  34458758 ggggacggcggttggccagatatagttacttgccttt 34458794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26791955 - 26791726
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791955 gctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgattccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 26791856  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  26791855 acacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 26791756  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26791755 gtggttggccagatatagttacttgccttt 26791726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 27248907 - 27249138
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27248907 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 27249006  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc--aagggga 217  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  27249007 aacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccccaaggggga 27249106  T
Q  218 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27249107 cggtggttggccagatatagttacttgccttt 27249138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27491272 - 27491044
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491272 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 27491173  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    |||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| | || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  27491172 acacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 27491073  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgcctt 248  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27491072 gtggttggccagatatagttacttgcctt 27491044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28166640 - 28166404
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166640 agcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 28166541  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  28166540 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttggattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 28166441  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28166440 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 28166404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16755959 - 16755730
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755959 gctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 16755860  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  16755859 acacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 16755760  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16755759 gtggttggccagatatagttacttgccttt 16755730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24869856 - 24869620
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869856 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 24869757  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  24869756 acattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 24869657  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24869656 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 24869620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27025291 - 27025055
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025291 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 27025192  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27025191 acattgaacacagtaatcattacatttcctagagactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 27025092  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27025091 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 27025055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4763909 - 4763674
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763909 agcaaaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 4763810  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4763809 acattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 4763710  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4763709 gggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 4763674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4531427 - 4531198
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531427 gctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 4531328  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||      
T  4531327 acacagtaatcatgacatttcccagaaacttcgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 4531228  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4531227 gtggttggccagatatagttacttgccttt 4531198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 210
Target Start/End: Original strand, 30552060 - 30552249
Alignment:
Q  22 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552060 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 30552159  T
Q  122 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc 210  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552160 cacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc 30552249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 4539817 - 4540047
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattg 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4539817 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 4539916  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4539917 aacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggac 4540016  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4540017 ggtggttggccagatatagttacttgccttt 4540047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27031169 - 27030932
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031169 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 27031070  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  27031069 acattgaatacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaac 27030970  T
Q  214 gggatt--gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27030969 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 27030932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28213594 - 28213364
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28213594 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 28213495  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  28213494 aacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggac 28213395  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28213394 ggtggttggccagatatagttacttgccttt 28213364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 13293004 - 13293233
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293004 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 13293103  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gatt 219  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  13293104 acacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaggcg 13293203  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13293204 gtggttggccagatatagttacttgccttt 13293233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27063628 - 27063392
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27063628 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggt 27063529  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||| |  | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063528 acattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcacaagcataagagctcttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 27063429  T
Q  214 gggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||   | || || |||||||||||||||||||||||    
T  27063428 ggggacgatggttagccagatatagttacttgccttt 27063392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4779020 - 4778790
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4779020 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 4778921  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||  || | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4778920 aacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 4778821  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4778820 ggtggttggccagatatagttacttgccttt 4778790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 14139453 - 14139682
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139453 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 14139552  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  14139553 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 14139652  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14139653 gtggttggccagatatagttacttgccttt 14139682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27013872 - 27013643
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013872 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 27013773  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  27013772 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 27013673  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27013672 gtggttggccagatatagttacttgccttt 27013643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 24299807 - 24300043
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24299807 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtgat 24299906  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24299907 acattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 24300006  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24300007 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 24300043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29579161 - 29578925
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579161 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 29579062  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||   || | |||  ||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||     
T  29579061 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatttgcaagtgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcggcagatgccccaag 29578962  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29578961 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 29578925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27209043 - 27208848
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27209043 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattga 27208944  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg 216  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27208943 acacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggg 27208848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 216
Target Start/End: Original strand, 27240185 - 27240380
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27240185 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattga 27240284  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg 216  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240285 acacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggg 27240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 16938076 - 16938313
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938076 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 16938175  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||  ||||||||| |||| ||| || |||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16938176 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcgcaagtacaaaagcttcagatggagatggccattaacagctgcagatgccccaa 16938275  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16938276 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 16938313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 84 - 249
Target Start/End: Original strand, 23851450 - 23851615
Alignment:
Q  84 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaag 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  23851450 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaag 23851549  T
Q  184 acggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23851550 atggtcattaacagctgcagatgccccaagggaatggtggttggccagatatagttacttgccttt 23851615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26926914 - 26926680
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926914 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 26926815  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||    ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  26926814 acattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgcttttgatgaagatggtcattaacagctgcggatgccccaag 26926717  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26926716 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 26926680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29507555 - 29507326
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507555 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 29507456  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gatt 219  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||      
T  29507455 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcatatgccccaagggagacg 29507356  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  29507355 gtggttggccagatatagttatttgccttt 29507326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16680278 - 16680049
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680278 gctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgacggcgtgactccacggattttcaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 16680179  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg 220  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  16680178 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaacgg 16680079  T
Q  221 tgatttgccaga-tatagttacttgccttt 249  Q
    || || |||||| |||||||||||||||||    
T  16680078 tggttggccagattatagttacttgccttt 16680049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 15406580 - 15406817
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15406580 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtga 15406679  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||| | || ||||||||| |||||  ||   ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15406680 tacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtaggggcttttgatgaagatggccattaacagctgcagatgccccaa 15406779  T
Q  213 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| ||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  15406780 gggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttt 15406817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 15418367 - 15418604
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15418367 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtga 15418466  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||| | || ||||||||| |||||  ||   ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15418467 tacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtaggggcttttgatgaagatggccattaacagctgcagatgccccaa 15418566  T
Q  213 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| ||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  15418567 gggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttt 15418604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20174687 - 20174545
Alignment:
Q  22 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20174687 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgag 20174588  T
Q  122 cacagtaatcactacatttcctgga-aattttgaattcacaag 163  Q
    ||  |||| ||||| |||||||  |  ||||||||||||||||    
T  20174587 catggtaaacactatatttcctttagcattttgaattcacaag 20174545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Original strand, 22161304 - 22161446
Alignment:
Q  22 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22161304 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgag 22161403  T
Q  122 cacagtaatcactacatttcctgga-aattttgaattcacaag 163  Q
    ||  |||| ||||| |||||||  |  ||||||||||||||||    
T  22161404 catggtaaacactatatttcctttagcattttgaattcacaag 22161446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 79
Target Start/End: Original strand, 26666716 - 26666774
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26666716 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaa 26666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Original strand, 4718349 - 4718423
Alignment:
Q  176 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4718349 tgatgaagataggcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 4718423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 3286 - 3522
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3286 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 3385  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3386 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 3485  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3486 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 3522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 16618641 - 16618876
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618641 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 16618740  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618741 acattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 16618840  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618841 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 16618876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32296741 - 32296505
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296741 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 32296642  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||     
T  32296641 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcgcagaaacttctgatgaaaatggtcattaacagctgcaaatgccccaag 32296542  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32296541 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 32296505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 29142905 - 29143141
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142905 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 29143004  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  29143005 acattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 29143104  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29143105 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 29143141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4629897 - 4629661
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629897 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattaacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 4629798  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  4629797 acattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 4629698  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4629697 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 4629661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8217744 - 8217508
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217744 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatccacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 8217645  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8217644 acattgaacacagtaatcactacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 8217545  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8217544 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 8217508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28027396 - 28027167
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027396 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcctgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 28027297  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gatt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  28027296 acacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 28027197  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28027196 gtggttggccagatatagttacttgccttt 28027167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 4340824 - 4341059
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340824 agcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 4340923  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340924 acattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 4341023  T
Q  213 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  4341024 gggagacagtggttggccagatatagttacttgcct 4341059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21680813 - 21680577
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680813 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 21680714  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||     
T  21680713 acattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaag 21680614  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  21680613 ggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttt 21680577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 28110103 - 28110340
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110103 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagcccaaggcatgactccacggattcataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 28110202  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28110203 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 28110302  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28110303 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 28110340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16422294 - 16422059
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422294 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 16422195  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16422194 acattgaacacagtaatcattacatttcc-ggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccctaag 16422096  T
Q  214 gggattgtgatttg-ccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || |  ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  16422095 ggaacggtggttggcccagatatagttacttgccttt 16422059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 29659116 - 29659352
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659116 agcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 29659215  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||     
T  29659216 acattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaag 29659315  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29659316 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 29659352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5473100 - 5472864
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473100 agcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 5473001  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5473000 acattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 5472901  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  5472900 ggggacggtggttggccaggtatagctacttgccttt 5472864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18231305 - 18231069
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231305 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcgcaaatcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 18231206  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||  || | |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18231205 acattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 18231106  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18231105 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 18231069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4423030 - 4422795
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423030 agcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 4422931  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4422930 acattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 4422831  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4422830 gggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 4422795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 17979107 - 17979337
Alignment:
Q  22 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979107 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 17979206  T
Q  122 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc--aaggggat 218  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||     
T  17979207 cacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccccaagggggac 17979306  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17979307 ggtggttagccagatatagttacttgccttt 17979337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 22381735 - 22381963
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381735 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22381834  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  22381835 acacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctt-tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 22381933  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22381934 gtggttggccagatatagttacttgccttt 22381963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5728090 - 5727854
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728090 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 5727991  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||     
T  5727990 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaag 5727891  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5727890 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 5727854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18248850 - 18248614
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248850 agcaaaggctcaacttgatgtataagagtgatggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggt 18248751  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||     
T  18248750 acattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaag 18248651  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18248650 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 18248614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 20570994 - 20571230
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20570994 agcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 20571093  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  20571094 acattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaag 20571193  T
Q  214 ggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| |  ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  20571194 ggggacggtggtcggccagatatagttacttgccttt 20571230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24334285 - 24334049
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334285 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 24334186  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  24334185 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 24334086  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24334085 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 24334049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 47029565 - 47029364
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029565 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 47029466  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  47029465 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaag 47029366  T
Q  214 gg 215  Q
    ||    
T  47029365 gg 47029364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 5603463 - 5603699
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603463 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 5603562  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5603563 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 5603662  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  5603663 ggggacggtggttggccagatatagtcacttgccttt 5603699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5717180 - 5716944
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717180 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 5717081  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||     
T  5717080 acattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaag 5716981  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5716980 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 5716944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 5764278 - 5764514
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764278 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 5764377  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||     
T  5764378 acattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaag 5764477  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5764478 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 5764514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10402261 - 10402025
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402261 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 10402162  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10402161 acattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaag 10402062  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10402061 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 10402025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10649183 - 10648947
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649183 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 10649084  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||     
T  10649083 acattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaag 10648984  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  10648983 ggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttt 10648947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 31958605 - 31958841
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958605 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 31958704  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  31958705 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 31958804  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  31958805 ggggacggtggttggccagatatagtcacttgccttt 31958841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19700598 - 19700363
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19700598 agcacaggcttaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgat 19700499  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19700498 acattgaacacagtaatcactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacataggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagacgccccaag 19700399  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || |  ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  19700398 ggaacggtggttggcctgatatagttacttgccttt 19700363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 6536898 - 6537127
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536898 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 6536997  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  6536998 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 6537097  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  6537098 gtggttggtcagatatagttacttgccttt 6537127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32445259 - 32445030
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445259 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 32445160  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||| | |||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  32445159 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcgagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 32445060  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32445059 gtggttggccagatatagttacttgccttt 32445030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 15735243 - 15735479
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735243 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 15735342  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||   |   ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735343 acattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgttggggcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 15735442  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  15735443 ggagacggtggttggctagatatagttacttgccttt 15735479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 17971012 - 17971248
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971012 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 17971111  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    || |||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17971112 acgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattgacagctgcagatgccccaag 17971211  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17971212 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 17971248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 18286502 - 18286738
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286502 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 18286601  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||  |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18286602 acattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaag 18286701  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18286702 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 18286738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 18301803 - 18302039
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301803 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 18301902  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||  |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18301903 acattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaag 18302002  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18302003 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 18302039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28345283 - 28345047
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345283 agcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 28345184  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  28345183 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 28345084  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28345083 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 28345047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 51788134 - 51787898
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51788134 agcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggt 51788035  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||     
T  51788034 acattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaag 51787935  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  51787934 ggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttt 51787898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4727738 - 4727509
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727738 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 4727639  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  4727638 acacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 4727539  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4727538 gtggttagccagatatagttacttgccttt 4727509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6208013 - 6207776
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6208013 agcaaaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 6207914  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6207913 tacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 6207814  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6207813 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 6207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 8283624 - 8283853
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283624 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 8283723  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gatt 219  Q
    |||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  8283724 acacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 8283823  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8283824 gtggttagccagatatagttacttgccttt 8283853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 22865001 - 22865230
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865001 gctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22865100  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||      
T  22865101 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgccgatgccccaagggggacg 22865200  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22865201 gtggttggccagatatagttacttgccttt 22865230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 22880060 - 22880289
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880060 gctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22880159  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||      
T  22880160 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgccgatgccccaagggggacg 22880259  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22880260 gtggttggccagatatagttacttgccttt 22880289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 31030386 - 31030622
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030386 agcacaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 31030485  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  31030486 acattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 31030585  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31030586 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 31030622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18336734 - 18336504
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18336734 gctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 18336635  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| | || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18336634 aacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagtataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 18336535  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18336534 ggtggttggccagatatagttacttgccttt 18336504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35886877 - 35886640
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  35886877 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtga 35886778  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35886777 tacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 35886678  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35886677 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 35886640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48472032 - 48471803
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472032 gctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgagggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 48471933  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  48471932 acacatcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggaacttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 48471833  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  48471832 gtggttagccagatatagttacttgccttt 48471803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4689764 - 4689529
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4689764 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 4689665  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4689664 tacattgaacgcagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 4689565  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
     |||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  4689564 gggggatggtggttggccagatatagttacttgcct 4689529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18057367 - 18057136
Alignment:
Q  20 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18057367 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacatt 18057268  T
Q  119 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-gggga 217  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18057267 gaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggga 18057168  T
Q  218 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
      ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  18057167 cggtggttggccggatatagttacttgccttt 18057136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7079327 - 7079100
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079327 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 7079228  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  7079227 acacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgcttttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacg 7079130  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7079129 gtggttggccagatatagttacttgccttt 7079100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5019818 - 5019589
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019818 gctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 5019719  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||      
T  5019718 acacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacg 5019619  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  5019618 gtggttggtcagatatagttacttgccttt 5019589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 5590509 - 5590745
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590509 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 5590608  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  |||  || | |||| |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||     
T  5590609 acattgaacacagtaatcatgacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctttagatgaagatagtcatcaacggcggcagatgccccaag 5590708  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5590709 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 5590745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 11104510 - 11104746
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104510 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtggctccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 11104609  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| || |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||     
T  11104610 acattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaactcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaag 11104709  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11104710 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 11104746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 4790788 - 4791018
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4790788 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgaatccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 4790887  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-at 218  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  4790888 aacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 4790987  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     | | || | |||||||||||||||||||||    
T  4790988 ggcggttggtcagatatagttacttgccttt 4791018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5658229 - 5658011
Alignment:
Q  31 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5658229 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcctgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagcaat 5658130  T
Q  131 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgcca 230  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| || || |    
T  5658129 catgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccccagggaacggtggttggcta 5658030  T
Q  231 gatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5658029 gatatagttacttgccttt 5658011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20072145 - 20071911
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072145 agcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 20072046  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20072045 acattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 20071948  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20071947 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 20071911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 247
Target Start/End: Original strand, 15886894 - 15887089
Alignment:
Q  55 aaggcatgactccacggattc-acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaatttt 152  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||    
T  15886894 aaggcgtgactccacggattttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaacttt 15886993  T
Q  153 gaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
    |||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  15886994 gaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcct 15887089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8002607 - 8002436
Alignment:
Q  79 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||    
T  8002607 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttaga 8002508  T
Q  179 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  8002507 tgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttt 8002436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 27602974 - 27603209
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602974 agcacaggctcaaattgatgtctaagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 27603073  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27603074 acattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaa 27603173  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603174 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 27603209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16260372 - 16260138
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260372 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 16260273  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16260272 acattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccctaag 16260173  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  16260172 ggagacggtggttggccagatatagttacttgcct 16260138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 28356019 - 28356256
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356019 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 28356118  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||  |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  28356119 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagattcagatgaagatggtcattaacagttgtagatgccccaa 28356218  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28356219 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 28356256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31360677 - 31360441
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360677 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 31360578  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||     
T  31360577 acattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaag 31360478  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31360477 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 31360441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29835472 - 29835236
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835472 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 29835373  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  29835372 acattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaggcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 29835273  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29835272 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 29835236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19680598 - 19680361
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680598 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 19680499  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19680498 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 19680399  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  19680398 gggggacggtggttagccaggtatagttacttgccttt 19680361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9360771 - 9360535
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360771 agcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 9360672  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||| ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||     
T  9360671 acattggacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgtcccaag 9360572  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9360571 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 9360535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 19202430 - 19202666
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202430 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 19202529  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaa-attttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   || | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19202530 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaagactttgaattcacaagtacagaaacttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 19202629  T
Q  213 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgcctt 248  Q
    ||| ||  ||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  19202630 gggagacggtggttgactagatatagttacttgcctt 19202666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 44567130 - 44566894
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567130 agcacaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 44567031  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcct-ggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44567030 acattgaacacagcaatcattacatttcctgggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 44566931  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  44566930 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 44566894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22139049 - 22138822
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22139049 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 22138950  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatt 219  Q
    ||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22138949 aacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacg 22138850  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  22138849 gtggttggccagatatagttacttgcct 22138822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 19655409 - 19655647
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt--attggttggtg 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19655409 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgagactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttttattggttggtg 19655508  T
Q  112 gtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccca 211  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19655509 gtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 19655608  T
Q  212 a-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19655609 agggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 19655647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 12086797 - 12087027
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattg 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12086797 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 12086896  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12086897 aacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggac 12086996  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12086997 ggtggttggccagatatagttacttgccttt 12087027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19694245 - 19694008
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19694245 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 19694146  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19694145 tacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 19694046  T
Q  213 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19694045 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 19694008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33248508 - 33248279
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248508 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 33248409  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gatt 219  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||      
T  33248408 acacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaagggagacg 33248309  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  33248308 gtggttggtcagatatagttacttgccttt 33248279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33264873 - 33264648
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264873 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 33264774  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||   |||||||| | || ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||      
T  33264773 acacagtaatcatggcatttcctaggaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacg 33264674  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgc 245  Q
    ||| || |||||||||||||||||||    
T  33264673 gtggttggccagatatagttacttgc 33264648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 31483939 - 31484175
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483939 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 31484038  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||     ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  31484039 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgtggaagcttcagatgaagatggtcatcaacagctgcagatgccccaag 31484138  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  31484139 ggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttt 31484175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 22075002 - 22075216
Alignment:
Q  19 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22075002 aggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacatt 22075101  T
Q  119 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggat 218  Q
    |||||| | || ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22075102 gaacacggcaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacacaaaagcttctgatg-agatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggat 22075200  T
Q  219 tgtgatttgccagata 234  Q
     ||| |||||||||||    
T  22075201 ggtggtttgccagata 22075216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15773716 - 15773487
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773716 gctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 15773617  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg 220  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15773616 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggaacg 15773517  T
Q  221 -tgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     || || |||||||||||||||||||||||    
T  15773516 atggttagccagatatagttacttgccttt 15773487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 21342237 - 21342474
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21342237 agcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 21342336  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||| || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21342337 tacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 21342436  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  21342437 gggggacggtggttagccagatatagtcacttgccttt 21342474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 2131329 - 2131565
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2131329 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgat 2131428  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  2131429 acattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagaaggtcattaacagctgcagatgccccaag 2131528  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  2131529 ggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttt 2131565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 19911231 - 19911467
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19911231 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaaaggtaattttattggttggtggt 19911330  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  19911331 acattgaacacagtaatcattacatctcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatcgtcattaacagctgcagatgccccaag 19911430  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19911431 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 19911467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18796849 - 18796619
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18796849 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttataaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 18796750  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  18796749 aacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccctaagggggac 18796650  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  18796649 ggtggttggtcagatatagttacttgccttt 18796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18715629 - 18715395
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715629 agcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 18715530  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18715529 acattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 18715432  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18715431 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 18715395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14569305 - 14569070
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569305 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 14569206  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||   ||| ||||||||| | | || || | ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14569205 acattgaacacaacaatcattacattcccaa-aaactttgaattcgccatcataggagcttttgatgaagatagtcgttaacagctgcagatgccccaag 14569107  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14569106 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 14569070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3795694 - 3795458
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795694 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 3795595  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||     
T  3795594 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaggctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaag 3795495  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3795494 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 3795458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22894572 - 22894337
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894572 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 22894473  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894472 acattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 22894373  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||| ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  22894372 gggatggtagttggccagatatagttacttgccttt 22894337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33881282 - 33881047
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881282 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 33881183  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881182 acattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 33881083  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33881082 gggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 33881047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33298689 - 33298453
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298689 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 33298590  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  33298589 acattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 33298490  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33298489 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 33298453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 28953785 - 28954021
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953785 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 28953884  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28953885 acattgaacacagtaatcactacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 28953984  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  28953985 ggggacggtggttggccggatatagttacttgccttt 28954021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 15752864 - 15753092
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15752864 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattga 15752963  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg 220  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15752964 acacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacgg 15753063  T
Q  221 tgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  15753064 tggttagccagatatagttacttgccttt 15753092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 37746333 - 37746568
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746333 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 37746432  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746433 acattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 37746532  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37746533 gggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 37746568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 32590280 - 32590516
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590280 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcggccaaaggcatgaccccacgaattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 32590379  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590380 acattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 32590479  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32590480 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 32590516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 37352649 - 37352885
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352649 agcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 37352748  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  37352749 acattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttttgatgaagacagtcattaacagctgcagatgccccaag 37352848  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37352849 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 37352885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37761138 - 37760902
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761138 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 37761039  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  37761038 acattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaag 37760939  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37760938 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 37760902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41680860 - 41680624
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680860 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaagggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 41680761  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  41680760 acattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 41680661  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41680660 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 41680624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30035582 - 30035347
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30035582 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgat 30035483  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035482 acattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 30035383  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30035382 gggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 30035347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33522530 - 33522299
Alignment:
Q  22 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522530 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 33522431  T
Q  122 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aagggga 217  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||    
T  33522430 cacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaaggggga 33522331  T
Q  218 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33522330 cggtggttagccagatatagttacttgccttt 33522299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 37665498 - 37665727
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665498 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 37665597  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  37665598 acacagtaatcatgacatttcccagaaattttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 37665697  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37665698 gtggttggccagatatagttacttgccttt 37665727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24730126 - 24729890
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730126 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 24730027  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  24730026 acattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 24729927  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24729926 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 24729890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28655398 - 28655162
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655398 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 28655299  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28655298 acattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 28655199  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  28655198 ggagacggtagttggccagatatagttacttgccttt 28655162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33783643 - 33783409
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33783643 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggt 33783544  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  33783543 acattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 33783444  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  33783443 ggggacggtggttggccagatatagttacttgcct 33783409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9323634 - 9323397
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323634 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 9323535  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9323534 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 9323435  T
Q  213 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  9323434 gggagacggtggttgactagatatagttacttgccttt 9323397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11555503 - 11555274
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555503 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 11555404  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  11555403 acacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 11555304  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11555303 gtggttagccagatatagttacttgccttt 11555274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26486553 - 26486316
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486553 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 26486454  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26486453 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 26486354  T
Q  213 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  26486353 gggagacggtggttgactagatatagttacttgccttt 26486316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 18494772 - 18495008
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494772 agcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 18494871  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| | |||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18494872 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaacttcgaattcgccagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 18494971  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18494972 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 18495008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25206434 - 25206198
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25206434 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 25206335  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||| || || | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25206334 tacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgtagatgccccaa 25206235  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25206234 cgggatggtggttggccagatatagttacttgccttt 25206198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25270590 - 25270354
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25270590 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 25270491  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||| || || | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25270490 tacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgtagatgccccaa 25270391  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25270390 cgggatggtggttggccagatatagttacttgccttt 25270354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30174621 - 30174385
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174621 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 30174522  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||    
T  30174521 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagataggcattaacagccgcagatgccccaag 30174422  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  30174421 ggagacggtggttgactagatatagttacttgccttt 30174385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 31820413 - 31820649
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820413 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 31820512  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||     
T  31820513 acattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaag 31820612  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31820613 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 31820649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 246
Target Start/End: Original strand, 8659479 - 8659709
Alignment:
Q  16 caaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8659479 caaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggcgaatggtaattttattggttggtggtac 8659578  T
Q  116 attgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-gg 214  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8659579 attgaacacagcaatcattacatttcc-cgaaactttgaattcacaagtacaagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg 8659677  T
Q  215 ggattgtgatttgccagatatagttacttgcc 246  Q
    |||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  8659678 ggacggtggttggccagatatagttacttgcc 8659709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2517214 - 2516985
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517214 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgagggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 2517115  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||      
T  2517114 acacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattgacagctgcagatgccccaagggggacg 2517015  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2517014 gtggttggccagatatagttacttgccttt 2516985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6880460 - 6880223
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880460 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 6880361  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||  |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6880360 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagattcagatgaagatggtcattaacagttgcagatgccccaa 6880261  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6880260 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 6880223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 13180793 - 13181030
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtgg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13180793 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 13180892  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  |  | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13180893 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtatgagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 13180992  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13180993 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 13181030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11329793 - 11329557
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329793 agcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 11329694  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||     
T  11329693 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaag 11329594  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  11329593 ggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttt 11329557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 18369541 - 18369773
Alignment:
Q  18 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369541 aaggttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 18369640  T
Q  118 tgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-gggg 216  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||   || |  || |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18369641 tgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagtttttgatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaaggggg 18369740  T
Q  217 attgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18369741 acagtggttagccagatatagttacttgccttt 18369773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23898023 - 23897795
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23898023 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgaatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 23897924  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg 220  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  23897923 acacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcggaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacgg 23897824  T
Q  221 tgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  23897823 tggttggccagatatagttacttgccttt 23897795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12138333 - 12138131
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138333 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 12138234  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12138233 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 12138134  T
Q  213 ggg 215  Q
    |||    
T  12138133 ggg 12138131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24975997 - 24975771
Alignment:
Q  22 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24975997 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 24975898  T
Q  122 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattg 220  Q
    ||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  24975897 cacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcgagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacgg 24975798  T
Q  221 tgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
    || || |||||||||||||||||||||    
T  24975797 tggttggccagatatagttacttgcct 24975771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 18122428 - 18122657
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122428 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 18122527  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  18122528 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 18122627  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18122628 gtggttggccagatatagttacttgccttt 18122657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 22993128 - 22993357
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993128 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22993227  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gatt 219  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  22993228 acacagcaatcgatacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaggatagtcattaacagctgcagatgccccaagggtgacg 22993327  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22993328 gtggttagccagatatagttacttgccttt 22993357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 9544714 - 9544949
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544714 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 9544813  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||     
T  9544814 acattgaacacagtaatcattacatttcct-gaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgtagatgccccaag 9544912  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9544913 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 9544949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43084414 - 43084178
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084414 agcaaaggctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 43084315  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| | |||| || | ||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  43084314 acattgaacacagtaatcattacatttcccgaaaactttgaattcgccagcataggagcttttgatgaagataatcattaacagcagcagatgcccccag 43084215  T
Q  214 gggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||   | || || | |||||||||||||||||||||    
T  43084214 gggggcggtggttggtcagatatagttacttgccttt 43084178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 13436691 - 13436922
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13436691 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 13436790  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctga-tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-ga 217  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13436791 aacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgattgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaga 13436890  T
Q  218 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13436891 cggtggttggccagatatagttacttgccttt 13436922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30158183 - 30157953
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158183 gctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 30158084  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-at 218  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| ||| || ||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  30158083 acacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacgagtacataagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcctcaaggggaac 30157984  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  30157983 ggtggttgactagatatagttacttgccttt 30157953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 13318839 - 13319068
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318839 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 13318938  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||| |||||  |  | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  13318939 acacagtaatcataacatttcccagaaactttgaattcgcaagcgtatgagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 13319038  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13319039 gtggttggccagatatagttacttgccttt 13319068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23632118 - 23631889
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632118 gctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacgaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 23632019  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gatt 219  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  23632018 acacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 23631919  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23631918 gtggttggccagatatagttacttgccttt 23631889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24608395 - 24608166
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24608395 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 24608296  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatt 219  Q
    ||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||      
T  24608295 aacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattagtagctgcagacgccccaaggggacg 24608196  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24608195 gtggttggccagatatagttacttgccttt 24608166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31437613 - 31437384
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437613 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 31437514  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  31437513 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 31437414  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31437413 gtggttggccagatatagttacttgccttt 31437384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34622668 - 34622438
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34622668 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 34622569  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||  || | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  34622568 aacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 34622469  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34622468 ggtggttggccagatatagttacttgccttt 34622438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 15652770 - 15652999
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15652770 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattga 15652869  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gatt 219  Q
    |||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||      
T  15652870 acacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccgagggagacg 15652969  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15652970 gtggtcggccagatatagttacttgccttt 15652999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30940793 - 30940556
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30940793 agcacaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 30940694  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30940693 tacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 30940594  T
Q  213 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30940593 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 30940556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 40467565 - 40467794
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467565 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 40467664  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||      
T  40467665 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacg 40467764  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40467765 gtggttggccagatatagttacttgccttt 40467794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5643956 - 5643722
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5643956 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggt 5643857  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| | || ||||||||| ||||  ||    ||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  5643856 acattgaacacagtgatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaag--cattcgcttttgatgaaaatgggcattaacagctgcagatgccccaag 5643759  T
Q  214 ggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5643758 gggaacggtggttggccagatatagttacttgccttt 5643722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 21891853 - 21892089
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21891853 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 21891952  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21891953 acattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 21892052  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21892053 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 21892089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 249
Target Start/End: Original strand, 20334531 - 20334757
Alignment:
Q  23 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334531 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaggcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 20334630  T
Q  123 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20334631 acagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtg 20334730  T
Q  223 atttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     || |||||||||||||||||||||||    
T  20334731 gttggccagatatagttacttgccttt 20334757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 16202140 - 16202373
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202140 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 16202239  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202240 acattgaacacagtaattactacatgtcctggaaactttgaattcgcaagcacaggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 16202339  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
     |||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  16202340 aggatggtggttggccagatatagttacttgcct 16202373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20466928 - 20466694
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466928 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 20466829  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466828 acattgaacacagtaacgactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcatagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 20466729  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20466728 gggatggtgatttgccaaatat-gttacttgccttt 20466694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10968816 - 10968580
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968816 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 10968717  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  10968716 acattgaacacagtaatcaggacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 10968617  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10968616 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 10968580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3647297 - 3647061
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647297 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 3647198  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  3647197 acattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 3647098  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3647097 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 3647061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10951242 - 10951006
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951242 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 10951143  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||   || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  10951142 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatccgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 10951043  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10951042 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 10951006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 51644371 - 51644135
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644371 agcaaaggctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 51644272  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||     
T  51644271 acattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattgacagctgcagatgccccaag 51644172  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  51644171 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 51644135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28591227 - 28590998
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591227 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 28591128  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||   || |  || |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||      
T  28591127 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagtttttgatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacg 28591028  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| |  ||||||||||| |||||||||||    
T  28591027 gtggtcggccagatatagctacttgccttt 28590998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 41787422 - 41787652
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41787422 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 41787521  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  41787522 aacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgtagatgccccaagggggac 41787621  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  41787622 ggtggttggtcagatatagttacttgccttt 41787652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28155877 - 28155643
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155877 agcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 28155778  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  28155777 acattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 28155680  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  28155679 ggggacggtggttggccagatatagttacttgtcttt 28155643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16047461 - 16047226
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047461 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 16047362  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047361 acattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 16047262  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  16047261 gggacggtggttgcccagatatagttacttgccttt 16047226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11447027 - 11446798
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447027 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 11446928  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  11446927 acacagtaatcactacatttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 11446828  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11446827 gtggttggccagatatagttacttgccttt 11446798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 5141326 - 5141562
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141326 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 5141425  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5141426 acattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 5141525  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5141526 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 5141562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 16745512 - 16745748
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745512 agcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 16745611  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16745612 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 16745711  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16745712 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 16745748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26441399 - 26441163
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441399 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggcggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 26441300  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  26441299 acattgaacacagtaaccactacagttcatagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagacgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 26441200  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26441199 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 26441163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3451457 - 3451228
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451457 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 3451358  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  3451357 acacagtgatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaggacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 3451258  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  3451257 gtggttggccggatatagttacttgccttt 3451228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10847729 - 10847509
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10847729 agcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggt 10847630  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10847629 acattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatgatcattaacagctgcagatgccccaag 10847530  T
Q  214 gggattgtgatttgccagata 234  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  10847529 gggatggtggtttgccagata 10847509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 16443995 - 16444230
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443995 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcaggcgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 16444094  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||| || |||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16444095 acattgaacacagtaacgactacatttcttagaaactttgaattcgcaagcacataagcttcagacgaagatggtcgttaacagctgcagatgccccaag 16444194  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16444195 gggatggtggttggccagatatagttacttgccttt 16444230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26518939 - 26518703
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518939 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 26518840  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  26518839 acattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 26518740  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26518739 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 26518703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45393358 - 45393131
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393358 gctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 45393259  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gat 218  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  45393258 acacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacataagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagac 45393159  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgcc 246  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||    
T  45393158 ggtggttggccagatatagttacttgcc 45393131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 31558385 - 31558620
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558385 agcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 31558484  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31558485 acattgaacacagtgatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 31558584  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31558585 gggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 31558620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 16512425 - 16512659
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16512425 agcacaggcttaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 16512524  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16512525 acattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 16512624  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  16512625 ggggacggtggttggccagatatagttacttgcct 16512659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4205536 - 4205299
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205536 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 4205437  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4205436 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 4205337  T
Q  213 ggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||   | || || |||||||||||||||||||||||    
T  4205336 gggggacgatggttagccagatatagttacttgccttt 4205299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5154223 - 5153994
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154223 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 5154124  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  5154123 acacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 5154024  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5154023 gtggttggccagatatagttacttgccttt 5153994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 26663907 - 26664140
Alignment:
Q  17 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663907 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 26664006  T
Q  117 ttgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg- 215  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||     
T  26664007 ttgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaaggga 26664106  T
Q  216 gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  26664107 gacggtggttgactagatatagttacttgccttt 26664140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 4139238 - 4139474
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139238 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 4139337  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  4139338 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 4139437  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  4139438 ggggacggtggttagccaggtatagttacttgccttt 4139474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 31084620 - 31084850
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31084620 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcaaccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 31084719  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    ||||||| ||||| |||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  31084720 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 31084819  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31084820 ggtggttagccagatatagttacttgccttt 31084850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2160716 - 2160483
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2160716 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgat 2160617  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2160616 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaag 2160517  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
    || || ||| || || ||||||||||||||||||    
T  2160516 ggaatggtggttggctagatatagttacttgcct 2160483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5164523 - 5164294
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164523 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 5164424  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gatt 219  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  5164423 acacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 5164324  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5164323 gtggttggccagatatagttacttgccttt 5164294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 24586525 - 24586762
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586525 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 24586624  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||  |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24586625 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagattcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcctcaa 24586724  T
Q  213 gggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24586725 ggggaacggtggttggccagatatagttacttgccttt 24586762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 26313838 - 26314075
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313838 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 26313937  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26313938 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 26314037  T
Q  213 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  26314038 gggagacggtggttgactagatatagttacttgccttt 26314075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 26679099 - 26679332
Alignment:
Q  17 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679099 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 26679198  T
Q  117 ttgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg- 215  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||     
T  26679199 ttgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttaggtgaagataggcattaacagctgcagatgccccaaggga 26679298  T
Q  216 gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  26679299 gacggtggttgactagatatagttacttgccttt 26679332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 39207130 - 39207366
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39207130 agcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggt 39207229  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||     
T  39207230 acattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaag 39207329  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  39207330 ggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttt 39207366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 11418770 - 11419006
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418770 agcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 11418869  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||| || | ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  11418870 acattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcatgaacagctgcagatgccctaag 11418969  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11418970 ggagacggtggttagccagatatagttacttgccttt 11419006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 26269080 - 26269316
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269080 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 26269179  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||     
T  26269180 acattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaag 26269279  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  26269280 ggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttt 26269316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2779391 - 2779162
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779391 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 2779292  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  2779291 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 2779192  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2779191 gtggttggccagatatagttacttgccttt 2779162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 26509687 - 26509924
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26509687 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 26509786  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26509787 tacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 26509886  T
Q  213 gggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||| |  | | || |||||||||||||||||||||||    
T  26509887 gggggacggcggttggccagatatagttacttgccttt 26509924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31130044 - 31129815
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130044 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 31129945  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  31129944 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 31129845  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31129844 gtggttggccagatatagttacttgccttt 31129815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45737447 - 45737213
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737447 agcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 45737348  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  45737347 acattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 45737250  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  45737249 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 45737213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 10910911 - 10911147
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  10910911 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttagtgat 10911010  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||| |||||  || | ||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10911011 acattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgtattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcgttaacagcggcagatgccccaag 10911110  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10911111 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 10911147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 26531926 - 26532097
Alignment:
Q  79 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||    
T  26531926 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttaga 26532025  T
Q  179 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26532026 tgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 26532097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26595814 - 26595750
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595814 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 26595750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 249
Target Start/End: Original strand, 16732684 - 16732757
Alignment:
Q  177 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16732684 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 16732757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 249
Target Start/End: Original strand, 2104357 - 2104388
Alignment:
Q  218 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2104357 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttt 2104388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1807 - 1570
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1807 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 1708  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1707 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcataagcacagaaacttctgatgaagatggtcattaacaactgcagatgccccaa 1608  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1607 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 1570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12184 - 11960
Alignment:
Q  25 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12184 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacat 12085  T
Q  125 agtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12084 agtaatcactacatttcctggaaactttgagttcgcaagtacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggt 11985  T
Q  225 ttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    | |||||||||||||||||| ||||    
T  11984 tggccagatatagttacttgtcttt 11960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1906404 - 1906177
Alignment:
Q  22 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906404 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagatatacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 1906305  T
Q  122 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1906304 cacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacatgagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggt 1906205  T
Q  222 gatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1906204 ggtttgccagatatagttacttgccttt 1906177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14104696 - 14104468
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104696 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 14104597  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg 220  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14104596 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacgg 14104497  T
Q  221 tgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  14104496 tggttagccagatatagttacttgccttt 14104468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39856797 - 39856561
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856797 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 39856698  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||     
T  39856697 acattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaag 39856598  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  39856597 ggggacggtggttggccagatacagttacttgccttt 39856561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 15276737 - 15276957
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15276737 agcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggt 15276836  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15276837 acattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 15276936  T
Q  214 gggattgtgatttgccagata 234  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  15276937 gggatggtggtttgccagata 15276957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15233976 - 15233741
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233976 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggttagccgaaggcgtgactctacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 15233877  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233876 acattggacatagtaaccactacatttcctataaactttgaattcgcaagcacaaaagcttatgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 15233777  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15233776 gggatggtggttggccagatatagttacttgccttt 15233741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54839551 - 54839316
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839551 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 54839452  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54839451 acattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacaactgcagatgccccaag 54839352  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54839351 gggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 54839316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 18794722 - 18794958
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794722 agcaaaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 18794821  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||  | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||     
T  18794822 acattgaacacggtaaccactacagtttttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaag 18794921  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18794922 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 18794958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21975856 - 21975625
Alignment:
Q  22 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975856 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 21975757  T
Q  122 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aagggga 217  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||    
T  21975756 cacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaaggggga 21975657  T
Q  218 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21975656 cggtggttagccagatatagttacttgccttt 21975625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 24586466 - 24586703
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtgg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24586466 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 24586565  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24586566 tacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 24586665  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24586666 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 24586703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 15380343 - 15380567
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15380343 agcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggt 15380442  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380443 acattgaacacgataaccactacatttccttgaaactttgaattcgcaagcacaaaagcttcggatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 15380542  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagt 238  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||    
T  15380543 gggatggtggtttgccagatatagt 15380567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 20332528 - 20332764
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332528 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 20332627  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||     
T  20332628 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaag 20332727  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20332728 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 20332764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30759924 - 30759688
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759924 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 30759825  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  30759824 acattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 30759725  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30759724 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 30759688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 27157419 - 27157656
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157419 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 27157518  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  27157519 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaag 27157618  T
Q  214 ggg--attgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27157619 ggggacgggtggttggccagatatagttacttgccttt 27157656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6576015 - 6575786
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576015 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 6575916  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  6575915 acacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 6575816  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6575815 gtggttagccagatatagttacttgccttt 6575786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 40099745 - 40099978
Alignment:
Q  17 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099745 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 40099844  T
Q  117 ttgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg- 215  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||     
T  40099845 ttgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaaggga 40099944  T
Q  216 gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  40099945 gacggtggttgactagatatagttacttgccttt 40099978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 14753598 - 14753834
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753598 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 14753697  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  14753698 acattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaag 14753797  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14753798 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 14753834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 33667906 - 33668142
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667906 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 33668005  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  33668006 acattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 33668105  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  33668106 ggggacggtggttagccagatatagttccttgccttt 33668142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5700694 - 5700464
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5700694 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 5700595  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagg-ggat 218  Q
    |||||||||||||  ||||||||   ||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5700594 aacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggaggac 5700495  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5700494 ggtggttggccagatatagttacttgccttt 5700464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5012038 - 5011801
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5012038 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 5011939  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  5011938 tacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaaaatggtcattaacagctgcagatgcctcaa 5011839  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5011838 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 5011801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17019213 - 17018976
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  17019213 agcataggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtga 17019114  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17019113 tacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 17019014  T
Q  213 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17019013 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 17018976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 31120624 - 31120855
Alignment:
Q  22 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120624 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 31120723  T
Q  122 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aagggga 217  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || || |||| |||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||    
T  31120724 cacagcaatcattacatttcctgggaacttcgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagataccccccaaggggga 31120823  T
Q  218 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31120824 cggtggttagccagatatagttacttgccttt 31120855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 36338630 - 36338859
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36338630 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggcggtacattga 36338729  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  36338730 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 36338829  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36338830 gtggttggccagatatagttacttgccttt 36338859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14671171 - 14670940
Alignment:
Q  20 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacatt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14671171 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacatt 14671072  T
Q  119 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-ga 217  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14671071 gaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaga 14670972  T
Q  218 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14670971 cggtggttggccagatatagttacttgccttt 14670940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 34183074 - 34183303
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183074 gctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 34183173  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  34183174 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatggagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 34183273  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34183274 gtggttggccagatatagttacttgccttt 34183303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24118816 - 24118586
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118816 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 24118717  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtca-ttaacagctgcagatgccccaaggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |      
T  24118716 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaggacggtcatttaacagctgcagatgccccaagggaacg 24118617  T
Q  220 gtgatttgccaga-tatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||| | |||||||||||||||||    
T  24118616 gtggttggccatattatagttacttgccttt 24118586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1674020 - 1673877
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674020 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggagtgacaccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 1673921  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaatt 157  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1673920 atattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaatt 1673877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 247
Target Start/End: Original strand, 18311379 - 18311518
Alignment:
Q  111 ggtacattgaaca-cagtaat-cactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttct-gatgaagacggtcattaacagctgcagatgc 207  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18311379 ggtacattgaacaacagtaatacactacatt-cttagaaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgc 18311477  T
Q  208 cccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
    |||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  18311478 cccaagggagacagtggttggccagatatagttacttgcct 18311518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 84
Target Start/End: Original strand, 36324421 - 36324484
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagctt 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36324421 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagctt 36324484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 21697271 - 21697506
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697271 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 21697370  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697371 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagctttagatgaaggtggtcattaacagctgcagatgccccaag 21697470  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21697471 gggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 21697506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 12710703 - 12710932
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710703 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 12710802  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  12710803 acacagtaatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagacggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacg 12710902  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  12710903 gtggttggccggatatagttacttgccttt 12710932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 40239656 - 40239420
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239656 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 40239557  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||     
T  40239556 acattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaag 40239457  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40239456 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 40239420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 11629279 - 11629515
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629279 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 11629378  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629379 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 11629478  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11629479 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 11629515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12592957 - 12592721
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592957 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 12592858  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  12592857 acattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagcagcagatgccccaag 12592758  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12592757 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 12592721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27809848 - 27809612
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809848 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 27809749  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  27809748 acattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagcagcagatgccccaag 27809649  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27809648 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 27809612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27396470 - 27396250
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27396470 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggt 27396371  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396370 acattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacaaaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 27396271  T
Q  214 gggattgtgatttgccagata 234  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  27396270 gggatggtggtttgccagata 27396250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 21671267 - 21671504
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21671267 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 21671366  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21671367 tacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 21671466  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21671467 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 21671504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 37679987 - 37680224
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37679987 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 37680086  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37680087 tacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 37680186  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37680187 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 37680224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 37695252 - 37695489
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37695252 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 37695351  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37695352 tacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 37695451  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37695452 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 37695489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27782379 - 27782143
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782379 agcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 27782280  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||     
T  27782279 acattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaag 27782180  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27782179 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 27782143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Original strand, 16823440 - 16823671
Alignment:
Q  22 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823440 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 16823539  T
Q  122 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aagggga 217  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||    
T  16823540 cacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaaggggga 16823639  T
Q  218 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16823640 cggtggttagccagatatagttacttgccttt 16823671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16898040 - 16897809
Alignment:
Q  22 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16898040 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 16897941  T
Q  122 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aagggga 217  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||    
T  16897940 cacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaaggggga 16897841  T
Q  218 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16897840 cggtggttagccagatatagttacttgccttt 16897809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3788641 - 3788405
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788641 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 3788542  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  3788541 acattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaag 3788442  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3788441 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 3788405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32055949 - 32055714
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32055949 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgat 32055850  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32055849 acattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggttattaacagctgcagatgccccaag 32055750  T
Q  214 gggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32055749 gggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 32055714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 19410581 - 19410818
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410581 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 19410680  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  19410681 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 19410780  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19410781 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 19410818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12661679 - 12661450
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661679 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 12661580  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gatt 219  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  12661579 acacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 12661480  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12661479 gtggttggccagatatagttacttgccttt 12661450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 19450529 - 19450742
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19450529 gctcgaattgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgattccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattga 19450628  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg 220  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19450629 acacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatgg 19450728  T
Q  221 tgatttgccagata 234  Q
    || |||||||||||    
T  19450729 tggtttgccagata 19450742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34160984 - 34160755
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160984 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 34160885  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  34160884 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 34160785  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34160784 gtggttggccagatatagttacttgccttt 34160755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 13930641 - 13930877
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930641 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 13930740  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||     
T  13930741 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaag 13930840  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13930841 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 13930877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37931519 - 37931283
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931519 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 37931420  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  37931419 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagataggcattaacagctgcagatgctccaag 37931320  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  37931319 ggagacggtggttgactagatatagttacttgccttt 37931283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 37945961 - 37946197
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945961 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 37946060  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||     
T  37946061 atattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaag 37946160  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37946161 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 37946197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 22922240 - 22922475
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922240 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 22922339  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922340 acattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 22922439  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgcctt 248  Q
    || ||  ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  22922440 ggagacggtggttgaccagatatagttacttgcctt 22922475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 254747 - 254983
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254747 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 254846  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||  || || ||||||||||||||    
T  254847 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcgacggcagcagatgccccaag 254946  T
Q  214 ggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| |  |||  | |||||||||||||||||||||||    
T  254947 ggggacggtggctggccagatatagttacttgccttt 254983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16167625 - 16167389
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167625 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 16167526  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||   |||||||  ||||| ||| || |||||||||||||     
T  16167525 acattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttatatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaag 16167426  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  16167425 ggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttt 16167389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34867830 - 34867594
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867830 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactctacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 34867731  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  34867730 acattgaacacagtaatcatttcatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 34867631  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34867630 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 34867594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 27428541 - 27428775
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27428541 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 27428640  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |  |  || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  27428641 acattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaactcacaagcataagagtttttgatgaagatggtcattaccagctgcagatgccccaag 27428740  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  27428741 ggggacggtggttggccagatatagttacttgcct 27428775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37383818 - 37383588
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37383818 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 37383719  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  37383718 aacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 37383619  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37383618 ggtggttggccagatatagttacttgccttt 37383588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27122672 - 27122436
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122672 agcaaaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 27122573  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27122572 acattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaag 27122473  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27122472 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 27122436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28888426 - 28888190
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888426 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 28888327  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28888326 acattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagattgtcattaacagctgcagatgccccaag 28888227  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28888226 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 28888190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 34269023 - 34269251
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34269023 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggagaatggtaattttattggttggtggtacattga 34269122  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg 220  Q
    |||||  |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||  | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  34269123 acacaacaatcatgacatttcctagaaactttgaattcacaagcatgggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacgg 34269222  T
Q  221 tgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || || || ||||||||||||||||||||    
T  34269223 tggttggctagatatagttacttgccttt 34269251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34297296 - 34297068
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297296 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 34297197  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg 220  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||    | ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  34297196 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcatgagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacgg 34297097  T
Q  221 tgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||    
T  34297096 tggttggccagatataattacttgccttt 34297068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 9344089 - 9344318
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344089 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 9344188  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||      
T  9344189 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacg 9344288  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9344289 gtggttggccagatatagttacttgccttt 9344318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39896209 - 39895981
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896209 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 39896110  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||  ||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  39896109 acacagtaatcattacatttccccaaaaactttgaattctcaagtacagaagcttcagatgacgatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggac 39896010  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgcct 247  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||    
T  39896009 ggtggttagccagatatagttacttgcct 39895981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20844060 - 20843824
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20844060 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtgtccagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 20843961  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||| |||||  || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20843960 tacattgaacacagcaatcattacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtag-agcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 20843862  T
Q  213 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20843861 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 20843824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 23122667 - 23122904
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  23122667 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttgcaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtga 23122766  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23122767 tacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 23122866  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  23122867 gggggacggtggttggctagatatagttacttgccttt 23122904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31882427 - 31882198
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31882427 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattga 31882328  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||      
T  31882327 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacg 31882228  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  31882227 gtggttagccaggtatagttacttgccttt 31882198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 39045924 - 39046153
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39045924 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttagtggtacattga 39046023  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||      
T  39046024 acacagtaatcattacattttctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacg 39046123  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  39046124 gtggttggccagatacagttacttgccttt 39046153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Original strand, 31868880 - 31868979
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31868880 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaatgcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 31868979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 108 - 249
Target Start/End: Original strand, 31887682 - 31887824
Alignment:
Q  108 ggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31887682 ggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgc 31887781  T
Q  208 cccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31887782 cccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttt 31887824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27821974 - 27821900
Alignment:
Q  176 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27821974 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 27821900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12185 - 11951
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12185 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 12086  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  12085 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaag--cattcgcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 11988  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11987 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 11951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15718 - 15482
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15718 agcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 15619  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 212  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||     
T  15618 acattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaag 15519  T
Q  213 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15518 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 15482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25259 - 25044
Alignment:
Q  19 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25259 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacatt 25160  T
Q  119 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggat 218  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25159 gaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggat 25060  T
Q  219 tgtgatttgccagata 234  Q
     ||| |||||||||||    
T  25059 ggtggtttgccagata 25044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 9040 - 9269
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9040 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 9139  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagg-ggatt 219  Q
    ||||||||||||  ||||||||   ||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  9140 acacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggaggacg 9239  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9240 gtggttggccagatatagttacttgccttt 9269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 9753 - 9981
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9753 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattga 9852  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg 220  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  9853 acacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacgg 9952  T
Q  221 tgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  9953 tggttggccagatatagttacttgccttt 9981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10063 - 9827
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10063 agcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcatggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgat 9964  T
Q  114 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9963 acattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaag 9864  T
Q  214 gg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9863 ggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 9827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33447 - 33210
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  33447 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtga 33348  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||   ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33347 tacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggggcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 33248  T
Q  213 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33247 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttt 33210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 519 - 290
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  519 gctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 420  T
Q  121 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggatt 219  Q
    |||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||      
T  419 acacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 320  T
Q  220 gtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  319 gtggttggccagatatagttacttgccttt 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14092 - 13862
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14092 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 13993  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13992 aacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggac 13893  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13892 ggtggttggccagatatagttacttgccttt 13862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 4716 - 4947
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattgg-ttggtggtacatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4716 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggtttggtggtacatt 4815  T
Q  119 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-ga 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4816 gaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaga 4915  T
Q  218 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
      ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  4916 cggtggttggccagacatagttacttgccttt 4947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 25006 - 25243
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25006 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgg 25105  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25106 tacattgaacccagcaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 25205  T
Q  213 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25206 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 25243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 26243 - 26458
Alignment:
Q  19 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26243 aggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcacagatttacaaagcttgaaaaatggaaattttatttgttggtggtacatt 26342  T
Q  119 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggat 218  Q
    || ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26343 gagcacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattagcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggat 26442  T
Q  219 tgtgatttgccagata 234  Q
     ||| ||||| |||||    
T  26443 ggtggtttgctagata 26458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18728 - 18498
Alignment:
Q  21 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18728 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 18629  T
Q  120 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggat 218  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  18628 aacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgtagatgccccaagggggac 18529  T
Q  219 tgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
     ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  18528 ggtggttggtcagatatagttacttgccttt 18498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6216 - 5979
Alignment:
Q  14 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtgg 112  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6216 agcacaggctcaatatgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttactggttggtgg 6117  T
Q  113 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6116 tacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 6017  T
Q  213 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttt 249  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6016 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttt 5979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Original strand, 40759 - 40953
Alignment:
Q  25 aaattgatgtataagagtggtggtc-agccaaaggcatgactcc-acggattcac-aaagcttgg-aaaatggtaa-ttttattggttggtggtac-att 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40759 aaattgatgtataagagtggtggtcaagccgaaggcgtgactccaacggatttacaaaagcttggaaaaatggtaatttttattggttggtggtacaatt 40858  T
Q  119 g-aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaa-ttcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc 210  Q
    | ||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||| ||| | |||| || | | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40859 gaaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaatttcgcgagcataggagctttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccc 40953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University