View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19839_low_33 (Length: 322)

Name: NF19839_low_33
Description: NF19839
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19839_low_33
NF19839_low_33
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (22-317)||(49002269-49002562)
chr7 (68-294)||(22955068-22955294)
chr7 (22-306)||(37854005-37854288)
chr7 (22-305)||(4618465-4618748)
chr7 (52-311)||(8133299-8133558)
chr7 (31-311)||(5781567-5781844)
chr7 (22-306)||(23402082-23402365)
chr7 (22-232)||(40382016-40382224)
chr7 (22-311)||(7742968-7743268)
chr7 (22-215)||(4902465-4902658)
chr7 (16-177)||(10674961-10675124)
chr7 (174-301)||(19786343-19786470)
chr7 (79-138)||(25470643-25470702)
chr7 (174-254)||(8758396-8758476)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (22-306)||(41643926-41644211)
chr2 (15-232)||(39788313-39788530)
chr2 (41-306)||(15650902-15651167)
chr2 (22-306)||(6177829-6178112)
chr2 (22-306)||(18059072-18059356)
chr2 (22-306)||(18779117-18779395)
chr2 (15-213)||(18947313-18947511)
chr2 (41-306)||(27138749-27139014)
chr2 (22-306)||(19073412-19073690)
chr2 (22-311)||(41713213-41713499)
chr2 (117-311)||(34441729-34441920)
chr2 (25-174)||(19093640-19093789)
chr2 (67-230)||(38249893-38250052)
chr2 (78-177)||(17244836-17244935)
chr2 (22-177)||(18514442-18514597)
chr2 (79-311)||(42005438-42005667)
chr2 (22-161)||(34441590-34441728)
chr2 (17-135)||(45411858-45411976)
chr2 (17-135)||(27355193-27355311)
chr2 (174-311)||(30844897-30845033)
chr2 (93-138)||(40912471-40912516)
chr2 (181-289)||(58097-58204)
chr2 (95-138)||(32652621-32652664)
chr2 (108-138)||(7565511-7565541)
chr2 (174-234)||(7553480-7553540)
chr2 (219-311)||(22963453-22963545)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (22-305)||(32180461-32180740)
chr3 (22-311)||(19606624-19606913)
chr3 (22-306)||(40640341-40640628)
chr3 (22-306)||(49359339-49359622)
chr3 (22-305)||(7568436-7568712)
chr3 (16-311)||(47930371-47930665)
chr3 (53-306)||(44880845-44881097)
chr3 (22-303)||(38392338-38392619)
chr3 (22-265)||(26000627-26000870)
chr3 (75-306)||(45879250-45879492)
chr3 (78-261)||(7758190-7758372)
chr3 (75-233)||(51878241-51878398)
chr3 (22-138)||(47871210-47871326)
chr3 (174-301)||(42204405-42204530)
chr3 (22-135)||(40744149-40744262)
chr3 (26-138)||(12121167-12121279)
chr3 (51-138)||(36689674-36689761)
chr3 (203-311)||(4556590-4556702)
chr3 (22-104)||(31706530-31706612)
chr3 (201-294)||(53811865-53811958)
chr3 (108-176)||(31706763-31706831)
chr3 (181-237)||(47870314-47870370)
chr3 (79-138)||(11019700-11019759)
chr3 (79-138)||(48154454-48154513)
chr3 (174-306)||(54606760-54606892)
chr3 (243-306)||(18272155-18272218)
chr3 (174-287)||(43485384-43485497)
chr3 (76-132)||(11872740-11872796)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (41-311)||(13876648-13876918)
chr1 (22-305)||(27118385-27118668)
chr1 (15-306)||(15964154-15964445)
chr1 (22-306)||(16127574-16127855)
chr1 (16-306)||(10758004-10758294)
chr1 (22-265)||(25943293-25943536)
chr1 (16-177)||(3120566-3120727)
chr1 (22-155)||(16135528-16135661)
chr1 (22-177)||(47554938-47555093)
chr1 (82-291)||(31804854-31805063)
chr1 (16-166)||(3120178-3120328)
chr1 (160-301)||(16132534-16132675)
chr1 (174-311)||(421442-421579)
chr1 (22-123)||(5500591-5500691)
chr1 (210-303)||(28012123-28012216)
chr1 (126-178)||(43579463-43579515)
chr1 (79-138)||(422205-422264)
chr1 (174-217)||(21263907-21263950)
chr1 (22-89)||(43579518-43579585)
chr1 (175-235)||(17695870-17695930)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (22-305)||(41417289-41417572)
chr5 (22-306)||(22616548-22616828)
chr5 (22-306)||(36055585-36055868)
chr5 (25-294)||(33163579-33163849)
chr5 (25-306)||(31878437-31878719)
chr5 (29-265)||(27579123-27579357)
chr5 (22-306)||(10237468-10237750)
chr5 (22-311)||(21320800-21321088)
chr5 (22-177)||(29766512-29766667)
chr5 (22-136)||(12080444-12080558)
chr5 (15-138)||(13381123-13381246)
chr5 (174-311)||(25653633-25653770)
chr5 (180-265)||(10053318-10053403)
chr5 (22-143)||(25654566-25654686)
chr5 (25-138)||(33752421-33752534)
chr5 (25-138)||(33848060-33848173)
chr5 (174-265)||(12081129-12081220)
chr5 (174-299)||(13380560-13380685)
chr5 (174-253)||(21266126-21266205)
chr5 (174-253)||(13887348-13887427)
chr5 (79-138)||(8762963-8763022)
chr5 (78-138)||(10053820-10053882)
chr5 (79-138)||(13888329-13888388)
chr5 (180-311)||(26411346-26411477)
chr5 (25-138)||(12164023-12164136)
chr5 (174-294)||(8777275-8777395)
chr5 (174-214)||(25521705-25521745)
chr5 (174-294)||(33752910-33753030)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (22-306)||(2266567-2266850)
chr4 (22-233)||(2570605-2570816)
chr4 (22-237)||(17612457-17612672)
chr4 (22-311)||(9743637-9743925)
chr4 (51-305)||(1012351-1012596)
chr4 (36-235)||(2707998-2708196)
chr4 (28-177)||(49878858-49879006)
chr4 (126-294)||(54995613-54995781)
chr4 (174-305)||(22756794-22756924)
chr4 (174-296)||(22729775-22729896)
chr4 (219-311)||(51204632-51204724)
chr4 (203-306)||(28293124-28293227)
chr4 (76-134)||(54995010-54995068)
chr4 (82-138)||(28292430-28292486)
chr4 (174-265)||(33036064-33036155)
chr4 (219-287)||(51959922-51959990)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (16-265)||(7290814-7291063)
chr8 (22-311)||(4108625-4108911)
chr8 (16-237)||(3038529-3038749)
chr8 (89-237)||(6267282-6267430)
chr8 (22-265)||(18756377-18756620)
chr8 (22-216)||(23176497-23176690)
chr8 (22-166)||(34685969-34686113)
chr8 (22-178)||(28220743-28220898)
chr8 (67-177)||(30650998-30651108)
chr8 (201-304)||(34463472-34463575)
chr8 (175-265)||(35735844-35735933)
chr8 (200-265)||(30381002-30381067)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (22-306)||(24528-24811)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (22-193)||(4104183-4104354)
chr6 (81-311)||(11083924-11084151)
chr6 (22-311)||(19631798-19632087)
chr6 (16-270)||(34993921-34994175)
chr6 (108-260)||(30341124-30341276)
chr6 (16-311)||(26301626-26301922)
chr6 (22-178)||(6613703-6613859)
chr6 (79-138)||(4487823-4487882)
chr6 (23-138)||(18306592-18306707)
chr6 (79-138)||(25441709-25441768)
chr6 (22-115)||(30341461-30341554)
chr6 (250-305)||(4102864-4102919)
chr6 (174-217)||(4488444-4488487)
chr6 (22-132)||(3148862-3148971)
chr6 (201-237)||(4103034-4103070)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (15-305)||(5645-5933)
[»] scaffold0312 (2 HSPs)
scaffold0312 (174-311)||(8993-9130)
scaffold0312 (79-138)||(8308-8367)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (78-138)||(65992-66052)
[»] scaffold0262 (2 HSPs)
scaffold0262 (180-237)||(12034-12091)
scaffold0262 (82-134)||(11443-11495)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (24-132)||(107955-108062)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 22 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 49002562 - 49002269
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49002562 tattttatttaatcaatagtataattgtcgatgtcatagcagctaatgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 49002463  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctaga-acacaattgcaataagtaagga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  49002462 ctcatacaaaatattaaggggaattttaatcttagtgcacaaatgggaatctatgtttaattttgatttaatc-agacacacaattgcaataagtaaaga 49002364  T
Q  221 tataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcatctcact 317  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49002363 tataatg--acaccttaagggaaaatgtgcaatacaccatataatctgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcatttcact 49002269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 68 - 294
Target Start/End: Original strand, 22955068 - 22955294
Alignment:
Q  68 tgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatgg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22955068 tgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttaccttattacaaatcagttctcatacaaaatattaagggaaatttcaatcttagtgcacaaatga 22955167  T
Q  168 aaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatat 267  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  22955168 gaatctatgtttaatgttgatttaataagggacacaattgcaataagtaaagatacaatgacataccttatgagcaaatgtgcaatacaccatataattt 22955267  T
Q  268 gatatggtatggattaaatacacaaat 294  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||||    
T  22955268 gacgtgacatggattaaatacacaaat 22955294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 37854005 - 37854288
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaat-cagt 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || | ||||| ||||  | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  37854005 tattttgtttagtcaatagtataaccgtaggtgtcacgtcagctagtgtcttgttggtggaccactctaaaattaaactttactttattccaaattcagt 37854104  T
Q  121 cctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaagga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| ||    
T  37854105 cctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgtacaaatgaaaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgcaatcagtaaaga 37854204  T
Q  221 tataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    |||||  ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37854205 tataa--acataccttatgagcaaatgtgcaatacaccatataatgtgacgtgacatggattaaatacacaaatgctcaataattg 37854288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 4618465 - 4618748
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |  |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  4618465 tattttgtttaaccaatggtataactgtcgatgtcatgtgagctaatgttctgctggtggaccactctaaaactaaactttatcttactacaaatcagtc 4618564  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   | | ||||||||||||| |||  ||    
T  4618565 atcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttggtgcacaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatgaggtatacaattgcaataaataaatat 4618664  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgatt 305  Q
    |||||||||||  ||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||   |  ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  4618665 ataatgacacattttatgaacaaatgtgcaatacaccatataatttgaagcgacatgaattaaatacacaaatgttcaatgatt 4618748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 311
Target Start/End: Original strand, 8133299 - 8133558
Alignment:
Q  52 atgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaat 151  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8133299 atgtcatgtcagctggtgtcttgctggtgaaccactctaaaactaaactttaccttattacaaatcagtcttcatgtaaaatattaaggggaatttcaat 8133398  T
Q  152 cttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgca 251  Q
    |||| |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||   | || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||| |||||    
T  8133399 cttactgcacaaataagaatctacgtttaattttgatttaattagggacgcaattgcaataagtaatgatataatgacagaccttataagcaaacgtgca 8133498  T
Q  252 atataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    ||| |||||||||| |||  ||   || ||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  8133499 atacaccatataatctgacgtgtcttgaattaaatacacaaatgcttaatgattgatcat 8133558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5781844 - 5781567
Alignment:
Q  31 tagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaa 130  Q
    ||||||||| ||||| || |||| ||||||||  | ||||| || ||||| |||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  5781844 tagtcaatagtataattgccgatatcatgtcagctagtgtcatgttggtgcaccactttaaaactaagttttactttattacaaatcagtcatcatacaa 5781745  T
Q  131 aatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgaca 230  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5781744 aatataaaggg-aatttcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatcaaggacacaattgcaataaataaagatataatgaca 5781646  T
Q  231 caccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    ||  ||| |   |||| ||||||| ||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  5781645 cattttatggtcaaatatgcaatacaccatata--atgacgtgacatggattaaatacacaaatatttaatgattgatcat 5781567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 23402082 - 23402365
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||  | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  23402082 tattttgtttagccaatagtataactgccgatgttatgtcagctagtgtcatgttgggggaccactctaaaactaaactttatcctattacaaatcagtc 23402181  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
     || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||    
T  23402182 atcgtacaaaatattaagggaaatttcagtcttagtgcacaaatgagaatcaatgtt-tattttgatttaatcagggacacaattgaaataagtaaatat 23402280  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    ||||||||| | |||| |   ||||| |||||| ||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  23402281 ataatgacatatcttatggacaaatgcgcaatacaccatataatatgacgtgacatgaattaaatacacagatgttcaatgattg 23402365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40382224 - 40382016
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||   |||||||||| |   |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40382224 tattttttttagctaataatataactgcaaatgtcatgtcta---gtgtcctgctagtgcaccactctaaaactaaactttaccttattacaaatcagtc 40382128  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacac-aattgcaataagtaagga 220  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||   | |||| ||||| ||||||||| ||    
T  40382127 cgcatacaaaatattaagggaaatttcaatcttagtgcacaaatgataatctatgtttaatttttatttaattagggacacaaattgtaataagtaaaga 40382028  T
Q  221 tataatgacaca 232  Q
    ||||||||||||    
T  40382027 tataatgacaca 40382016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7743268 - 7742968
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |  |||  || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  7743268 tattttgtttagtcaatagtataactgtcgatgtcatgtcggctaatgtaatgttgatggaccactctaaaactaaactttaccttattacaaagcagcc 7743169  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaa-----------tctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaa 210  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| | |||||||||           |||||||| |||||| ||||||||  |  |||||||||||    
T  7743168 ctcatataaaatattaaagagcatttcaatcttagtgtataaatggaaaacaaatgagaatctatgtttaattttaatttaatcaggggcacaattgcaa 7743069  T
Q  211 taagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttca 310  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |   |||||| ||||| |||||||||| | |  ||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7743068 taagtaaagatataatgacacgccttatggacaaatgtacaatacaccatataatctaacgtgacatagattaaatacacaaatactcaatgattgatca 7742969  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  7742968 t 7742968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4902658 - 4902465
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  4902658 tattttgtttagtcaatagtataactgccgatatcatgttagttattgtcctgccagtaaaccactctaaaactaaactttaccttattacaaattagta 4902559  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  4902558 ctcatacaaaatattaaggggaatttctatcttagtgcataatttggaatctatgtttaattttgatttaatcagggacactattgcaataagt 4902465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 177
Target Start/End: Original strand, 10674961 - 10675124
Alignment:
Q  16 aaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtc--aattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattaca 113  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  ||| ||||||  || | |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  10674961 aaaaattattttgtttattcaatagtataactgttaatgccatgtctcaactagtgttctgcttgtggatcactctaagactaaactttactttattaca 10675060  T
Q  114 aatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgt 177  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||    
T  10675061 aattagtcctcatacaaaatattaaggggaatttaaatcttaatacacaaatgggaatccatgt 10675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 174 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19786470 - 19786343
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacacctta-agagaaaatgtgcaatataccatataatatgatat 272  Q
    ||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  | ||||||||||||  |    
T  19786470 atgtttaattttgatttaatcaaggactcaattgcaataagtaaagatataatgacacaccttacaga-caaatgtgcaatgcatcatataatatgacgt 19786372  T
Q  273 ggtatggattaaatacacaaatactcaat 301  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19786371 ggcatgaattaaatacacaaatgctcaat 19786343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25470702 - 25470643
Alignment:
Q  79 tggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    ||||||||  ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25470702 tggaccaccgtaacactaaattttactttattacaaatcagtcctcgtacaaaatattaa 25470643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8758476 - 8758396
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaata 254  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| |  |||||| || ||  ||||||||||||    
T  8758476 atgtttaattttaatttaatcaagagcacaattgcaataagtaaaaatatagtagcacaccgtatgaataaatgtgcaata 8758396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41644211 - 41643926
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41644211 tattttgtttagccaataatataattgttgatgtcatgtcagctagtgtcatgctggtggaccactctaaaactaaactctaccttattacaaatcagtc 41644112  T
Q  122 ctcatacaaaa-tattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaagga 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||    
T  41644111 ctcatacaaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatgagaaactatgtttaattttgatttaatcagggatacaattgcaataagtaaaga 41644012  T
Q  221 tataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41644011 tataatgacacaccttatgatcaaatgtgcaatacaccatataatctgacgtgacatgaattaaatacacaaatgctcaatgattg 41643926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 39788313 - 39788530
Alignment:
Q  15 gaaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  39788313 gaaaaagtattttgtttagtcaatagtataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaaataaactttaccttattacaa 39788412  T
Q  115 atcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctaga-acacaattgcaataa 213  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||    
T  39788413 atcagttctcatacgaaatattaaggggaatttcaattttagtgcacaaatcagaatctatgtttaattttgatttaa-ccagagacataattgcagtaa 39788511  T
Q  214 gtaaggatataatgacaca 232  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  39788512 gtaacaatataatgacaca 39788530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15651167 - 15650902
Alignment:
Q  41 tataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaagg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||  |  |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15651167 tataactgccgatgtcatgtcatctaatgtcctaccggtggaccactctaaaattaaactttactttattacaaatcagtcctcatacaaaatatttagg 15651068  T
Q  141 ggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaaga 240  Q
     |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  15651067 agaatttcaattttagtgcacaaatgagattctatgtttaattttgatttaatcaggaacacaattgcaataagtaaagatataatgacacaccttatgg 15650968  T
Q  241 gaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    | ||||||| |||| |||||||||| | |  || ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15650967 gcaaatgtgaaatacaccatataatcttacgtgatatggattaaatacacaaatatttaatgattg 15650902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6178112 - 6177829
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6178112 tattttgtttagccaatagtataactgccgatgtcatgtcagctagtgtcatgttggtggaccactctagaactaaactttaccttattacaaatcagtc 6178013  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||    
T  6178012 atcgtacaaaatattaagggaaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgtt-tattttgatttaatcagggacacaattggaataagtaaatat 6177914  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||| |||||| |||||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6177913 ataatgacataccttatgggcaaatgcgcaatacaccatataatctgacgtgacatgaattaaatacacaaatgctcaatgattg 6177829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 18059072 - 18059356
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  | |||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18059072 tattttgtttagtcaatagtataattgtcgatgtcatgttagctagtgtgctgctaatagaccactctaaaactaaactttaccttgttacaaatcagtc 18059171  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  18059172 atcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaacgagaatctatatttaattttaatctaatcaaggacacaattgcaataagtaaagat 18059271  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    ||||| |||||| ||| |   |||| ||||||| |||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18059272 ataataacacacattatggataaatatgcaatacaccatataatctgacatgacatgaattaaatacacaaatattcaataattg 18059356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 18779117 - 18779395
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |  | ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18779117 tattttgtttagtcaatagtataactaccgatgtcatgtaagctagtgtcctactggatgatcactctaaaactaaactttaccttattacaaatcagtc 18779216  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
     ||||| |||        || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  18779217 gtcatataaa--------ggaaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgtttaactttgatttaatcaggaacacaattgcaataagtaaagat 18779308  T
Q  222 ataatgacacacctta--agagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    | ||| |||||| |||  |  | |||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18779309 aaaataacacactttattatggcaaatgtgcaataaaccatataatctgatgtgacatgaattaaatacacaaatgctcaatgattg 18779395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 18947313 - 18947511
Alignment:
Q  15 gaaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaa 114  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||| | | || |||||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18947313 gaaaaattattttgtttagtcgatagtataacggccaatatcatgctagctagtgtcctgctggtgtaccactctaaaactaaactttaccttattacaa 18947412  T
Q  115 atcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||| ||||    
T  18947413 atcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttaatgcacaaatgagaatctatgtttacttttgatttaatcagggacacaattgctataa 18947511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 306
Target Start/End: Original strand, 27138749 - 27139014
Alignment:
Q  41 tataactgtcgatgtc-atgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaag 139  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| | |||||  |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27138749 tataactgccgatgtttatgtcaactagtgtcacgctgatggactactctaaaattaaattttaccttattacaaataagtcctcatgcaaaatattaag 27138848  T
Q  140 gggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaag 239  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||| |    
T  27138849 gtgaatttcaatcttagtgcacaaatgggaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgcaacccgtaaagatataatgacacactttatg 27138948  T
Q  240 agaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
     | |||| ||||||| ||| |||||| |||  ||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  27138949 ggcaaatatgcaatacaccgtataatctgacgtgacatggatt-aatacacaaatgatcaatgattg 27139014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19073690 - 19073412
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19073690 tattttatttagtcaatagtataattgttgatgtcatgtcagtcagtgtcctgctggtgaaccactttaaaactaaattttaccttattacaaatcagtc 19073591  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgc-acaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaagga 220  Q
    ||| || ||||||||||  ||||||||      ||||| | |||||  |||||||||| || ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||  |    
T  19073590 ctcgtataaaatattaa-aggaatttc------agtgcaaaaaatgagaatctatgtttaactttgatttaatcagggacacaatttcaataagtaaata 19073498  T
Q  221 tataatgacacacctta-agagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19073497 tataatgacacaccttataga-caaatgtggaatacaccatataatctgacgtgacatggattaaatacacaaattctcaatgattg 19073412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41713499 - 41713213
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | || || ||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  41713499 tattttgtttagtcaatagtataattatcaatatcatgtcagctagtgtcatgttggtggaccactctaaaactaagttttatcttattacaaatcagtc 41713400  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||   | | ||||||| ||||||||   ||    
T  41713399 ctcacacaaaata-taaggggaatttcatttttagtgcacaagtgagaatctatgtttaattttgatttaattagggaaacaattgtaataagtatacat 41713301  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||| || | ||||||||  ||||  ||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  41713300 ataatgacacatcttatgggcaaatgtgtaacacaccatata--atgacgtgacatgaattaaatacataaatattcaatgattggtcat 41713213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 311
Target Start/End: Original strand, 34441729 - 34441920
Alignment:
Q  117 cagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagta 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  34441729 cagtcctcatacaaaatat-aaggggaatttcaattttagtgcacaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgcaataagta 34441827  T
Q  217 aggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    | ||||||| |||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||  ||  ||  ||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  34441828 aagatataacgacacatcttatgggcaaatgtgcaatacaccatataat--gacgtgacatgaattaaatacacaaatattcaataattggtcat 34441920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19093789 - 19093640
Alignment:
Q  25 tttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctc 124  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| ||||| || |||| | ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19093789 tttgtttaatcaatagtataattgttgatgttatctcaactagtgtcttgttggaggaccactctaaaactaaactttaccttattacaaatcagtcctc 19093690  T
Q  125 atacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatcta 174  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19093689 ttacaaaatattaaggagaatttcaatcttactgcacaaatgggaatcta 19093640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 38249893 - 38250052
Alignment:
Q  67 gtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatg 166  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  38249893 gtgttctgctggtggaccactctaaaactaaattttaccttgttacaaatcagtcctcatac--aatattaaggggaatttcaatcttagagcgcaaatt 38249990  T
Q  167 gaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgaca 230  Q
    | ||||  || | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38249991 ggaatc--tgattaattttgatttaatcagggacacaattgcaataagtaaagatataatgaca 38250052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 177
Target Start/End: Original strand, 17244836 - 17244935
Alignment:
Q  78 gtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17244836 gtggaccactctaaaactaaactttaccttattacaaatcactcctcatacaaaatattaaggaaaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgt 17244935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 177
Target Start/End: Original strand, 18514442 - 18514597
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | |||| |||||| ||    
T  18514442 tattttgtttagctaatagtataactgttaatgtcatgtcaactagtgtcgtgctggtggaccactataagactgaactttactttattataaatcaatc 18514541  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgt 177  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18514542 atcatacaaaatattaatggaaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgt 18514597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42005667 - 42005438
Alignment:
Q  79 tggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgtt 178  Q
    ||||||||| ||||| |||  ||||  | ||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42005667 tggaccactttaaaattaagttttattttattacaaatcagctctcatacaaaatat-aaggaaaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgtt 42005569  T
Q  179 gaattttgatttaatctaga-acacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtat 277  Q
     |||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||  ||  ||  ||    
T  42005568 taattttgatttaatcaggggacacaattacaataagtaaagatgtaatgacacaccttatgggcaa-tgtgcaatacaccatataat--gacgtgacat 42005472  T
Q  278 ggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||    
T  42005471 ggattaaataaacaaatattcaatggttgatcat 42005438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 161
Target Start/End: Original strand, 34441590 - 34441728
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||| || || | ||||||||  | ||||| || ||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  34441590 tattttatttggtcaatagtataattgccgttatcatgtcagctagtgtcatgttggtggatcactttaaaactaagctttatcttattacaaatcagtc 34441689  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcac 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  34441690 ctcatacaaaata-taaggggaatttcaattttagtgcac 34441728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Original strand, 45411858 - 45411976
Alignment:
Q  17 aaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaat 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  ||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||    
T  45411858 aaaattattttgtttagtcaatatcataattgttgatgacatgtccgttggtgttccgttggtggaccactctaagactaaattttccttcactacaaat 45411957  T
Q  117 cagtcctcatacaaaatat 135  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  45411958 cagtcataatacaaaatat 45411976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27355311 - 27355193
Alignment:
Q  17 aaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaat 116  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||  |||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||    
T  27355311 aaaattattttgtttaatcaatatcataattgttgatgatatgtccgctggtgtcccgctggtggaccactctaagactaaactttcattcactacaaat 27355212  T
Q  117 cagtcctcatacaaaatat 135  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  27355211 cagtcataatacaaaatat 27355193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30845033 - 30844897
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctaga-acacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatat 272  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |   |||||||||||||| |||||||| |||  |    
T  30845033 atgtttaattttgatttaat-tagagactcaaatgcaataagtaaagatttaatgacacatcttatggacaaatgtgcaatatatcatataatctgacgt 30844935  T
Q  273 ggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    |  ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||    
T  30844934 gacatggattaaataca-gaatgctcaatgattgatcat 30844897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 138
Target Start/End: Original strand, 40912471 - 40912516
Alignment:
Q  93 actaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40912471 actaaattttactttattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 40912516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 58204 - 58097
Alignment:
Q  181 attttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatgga 280  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||  || |||||| || ||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||| |    
T  58204 attttaatttaatc-aggacacaattgcaataagtaaaaatattgtggcacaccgtatgaacaaatgtgcaatacaccatataatttgatctgacatgaa 58106  T
Q  281 ttaaataca 289  Q
    |||||||||    
T  58105 ttaaataca 58097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 32652664 - 32652621
Alignment:
Q  95 taaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32652664 taaattttactttattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 32652621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7565541 - 7565511
Alignment:
Q  108 attacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7565541 attacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 7565511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7553540 - 7553480
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacacc 234  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  7553540 atgtttaattttgatttaatcaatgacacaattgcaataagtaaaaatatagtgatacacc 7553480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22963545 - 22963453
Alignment:
Q  219 gatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || | || |||||||||| |||  | | || |||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  22963545 gatataatgacacaccttaagaacaaatatgtagtacaccatataatctgacgttgcattgattaaatacacaaaagctaaatgattggtcat 22963453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 32180461 - 32180740
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32180461 tattttgtttagccaatagtataactgctgatgtcatgtcggctagtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttaccttattacaaatcagtc 32180560  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||    
T  32180561 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgcaataagtaaagat 32180660  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgatt 305  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||  ||||| |||||| |||  ||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32180661 ataatgacacacctt-aga-caaatgtgca--ataccgtataatctgacgtgacataaattaaatacacaaatgctcaatgatt 32180740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Original strand, 19606624 - 19606913
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19606624 tattttgtttagtcaatagtattaccgccgatgtcatgtcagctagtgtcctgctcgtggaccactctaaaactaaactttaccttattacaaatcagtc 19606723  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||| ||||||| |||||| |||    
T  19606724 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttggtgcacaaatggaaatctatgtttaattttgatttaataagggacacgattgcaacaagtaaagat 19606823  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||| |||  ||   || ||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  19606824 ataatgacacaccttatggaaaaatgttcaatacaccatataatctgacgtgacctgaattaaatacacaaatgctcaatcattggtcat 19606913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 40640341 - 40640628
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  40640341 tattttgtttagtcaatagtataagtgcctatgtcatgtcaactggtgccctgctggtagatcactctaaaactaaactttattttattacaaatcagtc 40640440  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaatt---gcaataagtaag 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||     
T  40640441 ctcatacaaaatattaaggagaatttcaattttagtgcacaaatgagaatatatctttaattttgatttaatcaaggacacaattgcagcaataagtaaa 40640540  T
Q  219 gatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
     ||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40640541 aatataatgacacatcttatgggcaaatgtgcaatacaccatataatatgacgtgacatggattaaatacacaaatgctcaatgattg 40640628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 49359339 - 49359622
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||| || || ||||||   |||||||||||||  | |||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  49359339 tattttgtttagccattagtataacaaccgatgtcatgtcagctagtgtcctagtggtagaccaatctaaa-ctaaactttaccttattataaatcagtc 49359437  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||    
T  49359438 ctcatacaaaatattaaagggaatttcaatcttagtgcacaaatagaaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgcattaagtaaagat 49359537  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49359538 ataatgacacaccttatgagcaaatgtgcaatacatcatataatatgacgtgtcatggattaaatacacaaatgttcaatgattg 49359622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 7568436 - 7568712
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  7568436 tattttgtttagtcaatagtataactgtcgattttatgtcagctagtgttctgctggtggaccactctaaaactaaacttt-------tacaaatcagtc 7568528  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctaga-acacaattgcaataagtaagga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  7568529 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatc-agagacacaattgtaataagtaaaga 7568627  T
Q  221 tataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgatt 305  Q
    ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||   |||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7568628 tataatgacacactttatgtgcaaatgtgcaatactgcatataatctgacgtgacatgaattaaatacacaaatgctcaatgatt 7568712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 47930371 - 47930665
Alignment:
Q  16 aaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaa 115  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  47930371 aaaaattattttgtttagctaatagtataactgccgatgtcatatcagttagtgtcctgttagtggaccactctaaaactaagctttactttattacaaa 47930470  T
Q  116 tcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagt 215  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  47930471 tcagtcattatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatgagggacacaattgcaataagt 47930570  T
Q  216 aaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    || |  ||||||||||  |||| |   ||| |||||||| ||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  47930571 aaaggaataatgacacgtcttagggacaaaggtgcaatacaccatataat-cgatataacatggattaaatacacaaatgttcaatgattggtcat 47930665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44881097 - 44880845
Alignment:
Q  53 tgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatc 152  Q
    |||||||||| || |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44881097 tgtcatgtcagttagtgttctgctgacggaccaatctaaaactaaactttaccttattacaaatcaatcctcatataaaatattaaggggaatttcaatc 44880998  T
Q  153 ttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaa 252  Q
     |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  44880997 ctagtgcacaaatgtgaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgtaataagtaaagatataatgacac-ccttatgagcaaatgtgcaa 44880899  T
Q  253 tataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    || ||||||| || |||  ||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  44880898 tacaccatattatctgacgtgacatggattaaatacataaatgttcaatgattg 44880845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Original strand, 38392338 - 38392619
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||  | ||||| || ||||| |||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  38392338 tattttgtttagccaataatataactgctgatatcatatcagctagtgtcatgttggtgaaccgttctaaaactaaattttacattattacaaatcagtc 38392437  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  ||    
T  38392438 atcttacaaaatattaagggaaatttcaatcttagtgcataaatgaaaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgcaataagtaaatat 38392537  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatga 303  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||||||||| | |||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  38392538 ataatgacacacattatgggcaaatgtgcaatacatcatataatctgtcatgacatggattaaatacacaaatgttcaatga 38392619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26000870 - 26000627
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||  |  | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  26000870 tattttgttgaatcaatagtataactgtcgatatcatgtcagctactatcctactgatagaccactctaaaactaaactttactttattacaaatcagta 26000771  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |      
T  26000770 ctcatacaaaatattaagggaaatttcaattttagtgcacaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatcaatgacacaattgcaataagtaaagcg 26000671  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataat 265  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  26000670 ataatgacacactttacgagaaaatatgcaatacaccgtataat 26000627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 306
Target Start/End: Original strand, 45879250 - 45879492
Alignment:
Q  75 ctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatcta 174  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  45879250 ctggtggaccactttaaagctaaactttaccttattacaaatcagtcctcatacaaaatataaaggggaatttcaatgttagtgcacaaatgagaatcta 45879349  T
Q  175 tgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaag-----------agaaaatgtgcaatataccatata 263  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |           |  |||||||||||| ||||||||    
T  45879350 tgtttaattttgatttaatcaggaaaacaatttcaataagtaaagatataacgacacaccttatgggcaaatgtgcaacaaatgtgcaatacaccatata 45879449  T
Q  264 atatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    || |||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45879450 atctgacgtggcatggattaaatacacaaatgctcaatgattg 45879492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 7758190 - 7758372
Alignment:
Q  78 gtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgt 177  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7758190 gtggagcactctaaaactaagctttatctttttacaaatcagtcttcatacaaaatat-aaggggaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgt 7758288  T
Q  178 tgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccata 261  Q
    | ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||| ||||||    
T  7758289 ttaattttgatttaattagggacacaattgcaataagtaaagatataatgacgcaccttatgggcaaatgtacaatacaccata 7758372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 51878398 - 51878241
Alignment:
Q  75 ctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatcta 174  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  51878398 ctggtgggtcactctaaaattaaactttaccttattacaattcagtactcatacaaaatattaa-gagaatttcaatcttagtgcataaatgagaatcta 51878300  T
Q  175 tgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacac 233  Q
    |||| |||||| ||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  51878299 tgtttaatttttatttaatcggagacacaattgcaataagtaacaatataataacacac 51878241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 47871326 - 47871210
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||    |||||||||||||    
T  47871326 tattttatttagccaataatataactgttgatgtcatgtcaactagtgtcctgctgccggatcactctaagattaaactttacaatgttacaaatcagtc 47871227  T
Q  122 ctcatacaaaatattaa 138  Q
    |||||| ||||||||||    
T  47871226 ctcatataaaatattaa 47871210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42204530 - 42204405
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatg 273  Q
    ||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||  ||| ||    
T  42204530 atgtttaattttgatttaatc-aggactcaattgcaataagtaaagatata-tgacacaccttatgagtaaatatgcaatacaccatataatccgatgtg 42204433  T
Q  274 gtatggattaaatacacaaatactcaat 301  Q
      || |||||||||||||||| ||||||    
T  42204432 acatagattaaatacacaaatgctcaat 42204405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 40744149 - 40744262
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| || |||| ||||  | || || |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  40744149 tattttgtttagccaatagcataacggttgatgccatggtagttagtatcctactggtagaccactctaagactaaacattaccttattacaaatcaatc 40744248  T
Q  122 ctcatacaaaatat 135  Q
    ||||||||||||||    
T  40744249 ctcatacaaaatat 40744262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 138
Target Start/End: Original strand, 12121167 - 12121279
Alignment:
Q  26 ttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctca 125  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||  |  ||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |    
T  12121167 ttgttttgtcaataatatatctgttgatgccatgtcagctaatgttctgatggtgaaccactataagactaaactttaccttattacaaataactcctta 12121266  T
Q  126 tacaaaatattaa 138  Q
    |||||||||||||    
T  12121267 tacaaaatattaa 12121279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 36689761 - 36689674
Alignment:
Q  51 gatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    ||||||||||||  | ||||| || || ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36689761 gatgtcatgtcagctagtgtcttgttgatggaccaccgtaaaactaaactttactttattacaaataagtcctcatacaaaatattaa 36689674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4556702 - 4556590
Alignment:
Q  203 aattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatg----gtatggattaaatacacaaatactc 298  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||  ||    | ||  |||||||||||||||||||    
T  4556702 aattgtaataagtaaagatataatgacacacattatgagcaaatgtgcaatacgccatataatctgacgtgacatgaattaattaaatacacaaatactc 4556603  T
Q  299 aatgattgttcat 311  Q
    |||||||| ||||    
T  4556602 aatgattggtcat 4556590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Original strand, 31706530 - 31706612
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttac 104  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| | | |||||||||| || | |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31706530 tattttgtttaatcaatagtataatttttgatgtcatgttaactagtgtcctgttgatggaccactctaagactaaactttac 31706612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 294
Target Start/End: Original strand, 53811865 - 53811958
Alignment:
Q  201 acaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaat 294  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||| |||| |||||||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||    
T  53811865 acaattgcattaagtaaagatataatgacacaccttatgtacaaatgtggaatacaccatataatctgacgtgacatggattaaatacataaat 53811958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 176
Target Start/End: Original strand, 31706763 - 31706831
Alignment:
Q  108 attacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatg 176  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  31706763 attataaatcaatccacatacaaaatattaaagggagtttcaatcgtagtgcacaaatgagaatctatg 31706831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47870370 - 47870314
Alignment:
Q  181 attttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacacctta 237  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  47870370 attttgatttaatcaaggactcaattgcaatacgtaaagatataatgacacacctta 47870314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11019759 - 11019700
Alignment:
Q  79 tggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11019759 tggaccactctaagactaaattttatcttattacaaatcagtcctcgtataaaatattaa 11019700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 48154454 - 48154513
Alignment:
Q  79 tggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48154454 tggaccactgtaacactaaattttactttattacaaatcagtcctcatacaaaacattaa 48154513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 54606892 - 54606760
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatg 273  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||  |||||    |||||| || ||| |||||||||||| ||| ||| || ||| |||    
T  54606892 atgtttaattttaatttaatcaagggcacaattgcaataagtaaaaatatagcagcacaccgtatgagtaaatgtgcaatacaccgtatgatttgacatg 54606793  T
Q  274 gtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
      ||  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  54606792 acatacattaaatacacaaatgttcaatgattg 54606760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 306
Target Start/End: Original strand, 18272155 - 18272218
Alignment:
Q  243 aaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  18272155 aaatgtgcaatacaccatataatctgacttgatatgaattaaatacacaaatgttcaatgattg 18272218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43485497 - 43485384
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatg 273  Q
    ||||| |||||| ||||||||  | || ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||  |||||||||| |||  ||    
T  43485497 atgtttaattttaatttaatcagggactcaattacaataagtaaaaatataatgacacatcttaggggcaaatatgcaatgcaccatataatctgaagtg 43485398  T
Q  274 gtatggattaaata 287  Q
    | ||| ||||||||    
T  43485397 gcatgaattaaata 43485384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11872796 - 11872740
Alignment:
Q  76 tggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaa 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||    
T  11872796 tggtggaccactctaagtctaaacttttctttattacgaatcagtcctcatagaaaa 11872740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 311
Target Start/End: Original strand, 13876648 - 13876918
Alignment:
Q  41 tataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13876648 tataactgtcgatgtcatgtcagctagtgtcatgctggtggaccactctaaaactaaactttaccttattacaaatcggtactcatacaaaatattaagg 13876747  T
Q  141 ggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaaga 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| |     
T  13876748 ggaatttcaatattagtgcacaaatgggaatctatgtttaattttgatttaatcaaggatacaattgcaataactaaaaatataatgacacactttatgg 13876847  T
Q  241 gaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    | ||||||| |||| ||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13876848 gcaaatgtgtaatacaccatatgatatgacgtggcattgattaaatacacaaatactcaatgattgatcat 13876918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27118668 - 27118385
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  | |  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27118668 tattgtgtttagtcaataatataactatcaatgtcacgtcagctaggatcctgctggtggatcactctaaaactatactttaccttattacaaatcagtc 27118569  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||    
T  27118568 atcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacgaatgagaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgcaataagtaaagat 27118469  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgatt 305  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  27118468 ataatgacacaccttatgaacaaatgtgcaatacatcatataatatgacgtggcatggattaaatacataaatgctccatgatt 27118385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15964445 - 15964154
Alignment:
Q  15 gaaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaa 114  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15964445 gaaaaattattttgtttagccaatagtataactgtcgatgtcatgtcagctagtgtcctactaatgtaccactctaaaactaaattttaccttattacaa 15964346  T
Q  115 atcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataag 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||  || ||    
T  15964345 atcagtcctcatataaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatgtgaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgatatcag 15964246  T
Q  215 taaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |   |||||||||||| || ||||||| |||  ||  || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  15964245 taagtatataatgacacatcttatggacaaatgtgcaatacactatataatttgacgtgacatagattaaatacacaaatgcttaatgattg 15964154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16127855 - 16127574
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16127855 tattttatttagtcaatagtattactgtcgatgttatgtcagttagtgtcctgcaggtggactactttaaaactaaactttaccttattacaaaccagtc 16127756  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||| ||  |   |||||||||||||||||  ||    
T  16127755 ctcatttaaaatattaaggggaatctcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgtttaa-tttgatttattcagg--gacaattgcaataagtaaacat 16127659  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16127658 ataatgacacaccttatgagtaaatgtgcaatacatcatataatctgacgtgtcatggattaaatacacaaatgatcaatgattg 16127574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 10758004 - 10758294
Alignment:
Q  16 aaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaa 115  Q
    ||||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||      
T  10758004 aaaaattattttgtttagctaatagtataactgccgatgttatgtgagttagtgtcctgctggtggatcactctaaaactaaattttgctttattacact 10758103  T
Q  116 tcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagt 215  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  10758104 tcagtcatcatataaaatattaagagaaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatatatgtttaattttgatttaattagggacacaattgcaataagt 10758203  T
Q  216 aaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    ||  ||||||||||||||  ||   | |||||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10758204 aaaaatataatgacacacactataggcaaatgttcaatacaccatataatctgatgtggcatgaattaaatacacaaatgctcaatgattg 10758294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25943536 - 25943293
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |  | ||| |||||||||||||||  |||||| |||| || ||||||||||||||    
T  25943536 tattttgtttagccaatagtataattgtcgatctcatgtcaactagcattctgttggtggaccactctactactaaattttatcttattacaaatcagtc 25943437  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
     || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||||| ||| |||    
T  25943436 atcgtacaaaatattaagagaaatttcaatcttattgcacaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatcaaaaacaaaattacaataaataaagat 25943337  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataat 265  Q
    |||||| ||| | |||  || ||| |||||||| ||||||||||    
T  25943336 ataatggcacgcattatcagcaaacgtgcaatacaccatataat 25943293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 177
Target Start/End: Original strand, 3120566 - 3120727
Alignment:
Q  16 aaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaa 115  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  3120566 aaaaattattttgtttaaccaataatataactgttgatgctatgtcaattagtgtcctcttggtggaccactctaagattaaactttaccttattacaaa 3120665  T
Q  116 tcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgt 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  3120666 tcagtcctcatacaatatattaaggggtatttcaattttaatgcacaaatgtgaatctatgt 3120727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16135661 - 16135528
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  16135661 tattttgtttagctaatagtataactgtcgatgtcatgtcaactagtgtcatactggtggaccactctaaaactaaactttaccctattacaaatcagtt 16135562  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatctta 155  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16135561 ctcatacaaaatattaatgagaatttcaatctta 16135528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 47555093 - 47554938
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||| || | |||||||| | |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47555093 tattttgtttaaccaatagtataactgttgaggccatgtcaactagtgtcctgctagtagaccactctaagagtaaactttaccttattacaaatcagtc 47554994  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgt 177  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47554993 atcatacaaaatattaagaggaatttaaatcttagtgcacaaatgagaatctatgt 47554938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 291
Target Start/End: Original strand, 31804854 - 31805063
Alignment:
Q  82 accactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaa 181  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||    
T  31804854 accactataaaattaaactttaccttattacaaaccaattctcatataaaatattaagggaaatttcaatcttagtgcataaatgagaatctatgtttaa 31804953  T
Q  182 ttttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggat 281  Q
    |||||||||||||    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |  |||   | |||||||||||| |||||||||| | |  ||| || |||    
T  31804954 ttttgatttaatcagtgacacaatttcaagaagtaaagatataatgacatatgttatcggcaaatgtgcaatacaccatataatctaacgtggcatagat 31805053  T
Q  282 taaatacaca 291  Q
    ||||||||||    
T  31805054 taaatacaca 31805063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 3120178 - 3120328
Alignment:
Q  16 aaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaa 115  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||  |||||||| | ||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||||||||    
T  3120178 aaaaattattttgtttatcaaataatataactgttgataccatgtcaactagtgtcatgttggtggaccattctaagacttaactttactttattacaaa 3120277  T
Q  116 tcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatg 166  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  3120278 tcagtccacatacaatttattaagaggtattttaatcttagtgcacaaatg 3120328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16132675 - 16132534
Alignment:
Q  160 acaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctaga-acacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatatacc 258  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  16132675 acaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatc-agagacacaattgcaataagtaaagatataatgacacacattatgtgcaaatgtgcaatacacc 16132577  T
Q  259 atataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaat 301  Q
     |||||| | |  | | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16132576 gtataatctcacgttgcatggattaaatacacaaatgctcaat 16132534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 421579 - 421442
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatg 273  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| | ||  || |||||||||||| ||  |||||| ||| |||    
T  421579 atgtttaattttgatttaatcaaggacacaattgcaattagtaaagatataatggaacatcgtataagtaaatgtgcaataaactgtataatttgacatg 421480  T
Q  274 gtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
      ||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  421479 acatacattaaatacacaaatgttcaatgattgatcat 421442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5500691 - 5500591
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||  | |||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||    
T  5500691 tattttgtttagctaatagtataactatcgatgtcatgtcagctagtgttctg-tcgtggatcactctaaaactaaattttaccttattataaatcactc 5500593  T
Q  122 ct 123  Q
    ||    
T  5500592 ct 5500591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28012216 - 28012123
Alignment:
Q  210 ataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatga 303  Q
    |||||||| |||||| |  |||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| | || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28012216 ataagtaaagatatagtagcacatcttaggagcaaatgtgcaatacaccatataatttaatgtgacatgcattaaatacacaaatactcaatga 28012123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43579515 - 43579463
Alignment:
Q  126 tacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgtt 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  43579515 tacaaaatattaaggagaatttcaatcttagtgcacaaataagaatctatgtt 43579463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 422264 - 422205
Alignment:
Q  79 tggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  422264 tggaccactctacgactaaactttactttattacaacttagtcctcatacaaaatattaa 422205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 217
Target Start/End: Original strand, 21263907 - 21263950
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaa 217  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21263907 atgtttaattttgatttaatcaaggacacaattgcaataagtaa 21263950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 43579585 - 43579518
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactct 89  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  43579585 tattttgtttagtcaatagtataaccgttaatgccatgtcaactaatgttctgctggtggaccactct 43579518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 17695870 - 17695930
Alignment:
Q  175 tgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacacct 235  Q
    |||| ||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  17695870 tgtttaattttgatttaatcaaagactcaattacaataagtaaagttataatgacacacct 17695930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 305
Target Start/End: Original strand, 41417289 - 41417572
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41417289 tattttgtttaactaatagtataactgtcgatgtcatgtcagctggtgtcatgctggtggatcattttaaaactaaattttaccttattacaaatcagtc 41417388  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  41417389 atcatacaaaataataaggggaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatctgggacacaattgcaataagtaaagat 41417488  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgatt 305  Q
    | |||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||||  |||||||||    
T  41417489 aaaatgacacaccttatgagcaaatttgcaatacaccatataatctgacatgatataaattaaatacacaaatgttcaatgatt 41417572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22616828 - 22616548
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  |   ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22616828 tattttgtttagccaatagtataactgcag---tcatgtcagctagtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttaccttattacaaatcagtc 22616732  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||    
T  22616731 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaattttagtgcacaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgcaataagtaaagat 22616632  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    |||||||||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  22616631 ataatgacacaccttatgggcaaatgtccaatacaccatataatatgacgtgacatggattaaataca-taatgctcaatgattg 22616548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 36055585 - 36055868
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  36055585 tattttgtttagctaatagtataactggcgatgtcaagtcaactagtgtcgtgctggtggcccactctaaaactaaactttaccttattacaaatcaatt 36055684  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||    
T  36055685 ctcatacaagatattaaggg-aatttcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatcggggacacaattgtaataagtaaagat 36055783  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||  |  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36055784 ataatgacacaccttatgagcaaatgtgcaatacaccatgtaatctgatgcgacatgaattaaattcacaaatgctcaatgattg 36055868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33163849 - 33163579
Alignment:
Q  25 tttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctc 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  33163849 tttgtttagtcaatagtataactgccgatgtcatgtcagctagtgtcatgctg-tggaccactttaaaactaaactttaccttattacaaatcagtcttc 33163751  T
Q  125 atacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatata 224  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||  ||| |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33163750 atacaaaatattaaggaaaatttcaatcttaatgcacacatgagaatttatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgcaataagtaaagatata 33163651  T
Q  225 atgacacaccttaagagaaaatgtgcaatatacc--atataatatgatatggtatggattaaatacacaaat 294  Q
    ||| ||||||||| |   |||||||||||| |||  ||||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  33163650 atggcacaccttatggataaatgtgcaatacaccatatataatctgatgtggcatagattaaacacacaaat 33163579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31878719 - 31878437
Alignment:
Q  25 tttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctc 124  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| | |    
T  31878719 tttgtttaaccaatagtataactgtcgatgtcgtgccagctagtgtcctgttggtggaccactctaaaattaaactttaccttattacagatcagttccc 31878620  T
Q  125 atacaaaa-tattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatat 223  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||  |||||||| |||||    
T  31878619 atacaaaaatattaagaagaatttcaatcttagtgcacaaataggaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgtcataagtaaagatat 31878520  T
Q  224 aatgacacacctta-agagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  31878519 aatgacacaccttataga-caaatgtgcaatacaccatataatctgacgtgacatgaattaaatacacaaatgcttaatgattg 31878437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27579357 - 27579123
Alignment:
Q  29 tttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatac 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||    
T  27579357 tttagacaataatataactgtcgatgtcatgttagctagtgttctactggtggaccactctaaaactaaactttaccttattacaaatcattccttaaac 27579258  T
Q  129 aaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctaga-acacaattgcaataagtaaggatataatg 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27579257 aaaatattaaggagaatttcaatcttagtgcacaaatggaaa--tatgtttacttttgatttaat-tagagacacaattgcaataaataaagatataatg 27579161  T
Q  228 acacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataat 265  Q
    || ||| |||   | |||| ||||||| ||||||||||    
T  27579160 acgcactttataggcaaatatgcaatacaccatataat 27579123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10237750 - 10237468
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  |  |||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10237750 tattttgtttagccaatagtataac-gtcgatgtcatgtcagctaatgtcatgttggtagaccactctagaactaaactttaccttattacaaattagtc 10237652  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||    
T  10237651 atcgtacaaaatattaagggaaatttcaatcttagtgtacaaatgagaatctatgtt-tattttgatttaatctgggacacaattggaataagtaaatat 10237553  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    ||||||| | |||||| |   ||||| |||||| |||||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10237552 ataatgaaataccttatggacaaatgcgcaatacaccatataatctgacgtgaaatgaattaaatacacaaatgctcaatgattg 10237468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21321088 - 21320800
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||  | |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||    
T  21321088 tattttgtttagccaatagtataactgacgatttcatgccagctagtgttctgctggtggatca-tctaaaactaaactttaccttcctacaaatcaatc 21320990  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctaga-acacaattgcaataagtaagga 220  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  21320989 ctcatacaaaatattaagcgaaatttcaattttagtgctcaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatc-agagacacaattgtaataagtaaaga 21320891  T
Q  221 tataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    |||||||| ||| ||||   | |||| ||||||| |||||||||| |||| ||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21320890 tataatgatacatcttatatgcaaatatgcaatacaccatataatctgatgtggcattagttaaatacacgaatgctcaatgattgatcat 21320800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 177
Target Start/End: Original strand, 29766512 - 29766667
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||| ||||  ||||| |||||||||  ||| |||||||| | |||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||     
T  29766512 tattttatttatccaatagtataactgttaatgccatgtcaactagtgttctactgatggaccactctaagactaaactttaccttattacaaattagtt 29766611  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  29766612 ctcatacaaaatattaaggggaatttaaatcttaatgcacaaatgggaatccatgt 29766667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 136
Target Start/End: Original strand, 12080444 - 12080558
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12080444 tattttgtttagtcgataacataattgttgatgtcatgtcagctagtgtcctgctggtggaccactttaagactaaactttaccttattacaaatcagtc 12080543  T
Q  122 ctcatacaaaatatt 136  Q
    |||||||||||||||    
T  12080544 ctcatacaaaatatt 12080558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13381246 - 13381123
Alignment:
Q  15 gaaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaa 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||    
T  13381246 gaaaaattattttgtttagtcaatagtataactgttgatgtcatgtcagctagtgttctgctggtggacctctctaaggctaaactttaccttattataa 13381147  T
Q  115 atcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  13381146 atcaatcctcatacaaaatattaa 13381123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25653770 - 25653633
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatg 273  Q
    ||||| |||||||||||||||  | | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |||  ||    
T  25653770 atgtttaattttgatttaatcagggaaatagttgcaataagtaaagatataatgacacaccttatgagcaaatgtgcaatacaccatacaatctgacgtg 25653671  T
Q  274 gtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25653670 atatgaattaaatacacaaatactcaatgattgatcat 25653633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10053403 - 10053318
Alignment:
Q  180 aattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataat 265  Q
    |||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  10053403 aattttgatttaatcagggactcaattgcaataagtaaagatataatgacacaccttatgagcaaatgtgcaatacacgatataat 10053318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25654686 - 25654566
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| | ||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25654686 tattttgtttaaccaatagtataattgttgatgt-atgtcaactagtgtattattgatggaccactctaaaactaaactttaccttattacaaatcagtc 25654588  T
Q  122 ctcatacaaaatattaagggga 143  Q
     |  |||||| |||||||||||    
T  25654587 tttgtacaaactattaagggga 25654566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Original strand, 33752421 - 33752534
Alignment:
Q  25 tttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| |  |  |||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  33752421 tttgtttagtcaataatataattgttaatgacatgtgagctactgtcatgttggtagactactctaagactaaactttaccttattaaaaatcaatcctc 33752520  T
Q  125 atacaaaatattaa 138  Q
    ||||||||||||||    
T  33752521 atacaaaatattaa 33752534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Original strand, 33848060 - 33848173
Alignment:
Q  25 tttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctc 124  Q
    |||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||| |  | ||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  33848060 tttgtttaatcaataatataattgttaatgacatgtaagctagtgtcatgctgatagactactctaagactaaactttaccttattaaaaatcaatcctc 33848159  T
Q  125 atacaaaatattaa 138  Q
    ||||||||||||||    
T  33848160 atacaaaatattaa 33848173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 265
Target Start/End: Original strand, 12081129 - 12081220
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataat 265  Q
    ||||| |||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| |||| ||||||||||    
T  12081129 atgtttaattttgatttaatcagggacttaattgcaataagtaaagatataaggacacaccttataagcaaatgtgtaatacaccatataat 12081220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13380685 - 13380560
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatg 273  Q
    ||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||| | | |||||||||||| ||||| || |||||  |     
T  13380685 atgtttaattttgatttaatcagggatacaattgcaataaataaagatataatgacatattttatgggtaaatgtgcaatacaccatgtagtatgacgtt 13380586  T
Q  274 gtatggattaaatacacaaatactca 299  Q
     ||  |||||||||||||||||||||    
T  13380585 ataaagattaaatacacaaatactca 13380560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21266205 - 21266126
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctaga-acacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaat 253  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  21266205 atgtttaaatttgatttaatc-agagactcaattgcaataagtaaagatataatgatacaccttatgagcaaatgtgcaat 21266126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13887427 - 13887348
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaat 253  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| || ||| |||||| ||||    
T  13887427 atgtttaattttgatttaatcaaggacacaattgcaataagtaaaaatataatggtacaccatatgagcaaatgtacaat 13887348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 8762963 - 8763022
Alignment:
Q  79 tggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    ||||||||  ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8762963 tggaccaccgtaacactaaattttactttattacaaatcagtcctcgtacaaaatattaa 8763022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10053882 - 10053820
Alignment:
Q  78 gtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaa--tcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10053882 gtggaccactctacgactaaattttactttattacaaaaatcagtcctcatacaaaatattaa 10053820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13888388 - 13888329
Alignment:
Q  79 tggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13888388 tggacccctgtaacactaaattttactttattataaatcagtcctcatacaaaatattaa 13888329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26411477 - 26411346
Alignment:
Q  180 aattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatgg 279  Q
    ||||||||||||||   | | |||||||||||||||||  ||||| || || ||  || ||| |||||| ||||| |||||||||| |||  ||  |||     
T  26411477 aattttgatttaattagggatacaattgcaataagtaaatatatagtggcatactgtatgagcaaatgtacaatacaccatataatttgacgtgacatgt 26411378  T
Q  280 attaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  26411377 attaaatacataaatattcaatgattggtcat 26411346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Original strand, 12164023 - 12164136
Alignment:
Q  25 tttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctc 124  Q
    |||||||||||||||  ||||   | ||||||||||||  | ||||  || |||||||||| | |||| |||||||||   | |||||||||||||||||    
T  12164023 tttgtttagtcaataggataatcattgatgtcatgtcagctagtgtattgttggtggaccattgtaaatctaaacttttttttattacaaatcagtcctc 12164122  T
Q  125 atacaaaatattaa 138  Q
    ||| |||| |||||    
T  12164123 ataaaaaacattaa 12164136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 294
Target Start/End: Original strand, 8777275 - 8777395
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatg 273  Q
    ||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||| || ||| |||||| ||||  ||  || ||| |||| ||    
T  8777275 atgtttaattttgatttaacgaaggacacaattgcaataagtaaaaatatagtggtacaccatatgagcaaatgtacaatgcacactaaaatttgatgtg 8777374  T
Q  274 gtatggattaaatacacaaat 294  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  8777375 gcatgcattaaatacacaaat 8777395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Original strand, 25521705 - 25521745
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25521705 atgtttaattttgatttaatcaaggacacaattgcaataag 25521745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 294
Target Start/End: Original strand, 33752910 - 33753030
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatg 273  Q
    ||||| || ||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||  |   |||||||||||| ||| |||||| |||  ||    
T  33752910 atgtttaaattttatttaatcagggacacaatggcaataagtaaagatacaataacacaccttgtggacaaatgtgcaataaaccctataatctgaagtg 33753009  T
Q  274 gtatggattaaatacacaaat 294  Q
      || ||||||||||||||||    
T  33753010 acattgattaaatacacaaat 33753030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 2266567 - 2266850
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  2266567 tattttgtttagccaatagtataactgtcgatgccatgtcagctagtgtcctgctggtggacccctctaaaa-taaactttacattattacaaatcagtc 2266665  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |   || | ||||||||||||| |||    
T  2266666 ctcatacaaaatattaagggaaatttcaatcttagtgcacaaatgggaatctatgtttaattttgatttaatcaaagtcatagttgcaataagtaaagat 2266765  T
Q  222 ataatgacacacctta-agagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||| |||| | |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2266766 ataatgacacaccttataga-caaatgtgtaatacaccatgtaatctaacgtggcatggattaaatacacaaatgctcaatgattg 2266850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2570816 - 2570605
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2570816 tattatgtttagacaataatataattgtcgatgtcatgttagctagtgttctgctggtggaccactctaaaactaaactttaccttattacaaatcattc 2570717  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   | ||||||||||||||| ||| |||    
T  2570716 ctcaaacaaaatattaaggtgaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgtttacttttgatttaattagggacacaattgcaataaataaagat 2570617  T
Q  222 ataatgacacac 233  Q
    ||||||||||||    
T  2570616 ataatgacacac 2570605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17612672 - 17612457
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  17612672 tattttatttagccaatagtataactgtcgatgtcatgtcagctagtgtcctgttggtggaccactctaaaactaaattttaccttattacaaattagtc 17612573  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  17612572 ctcatagaaaatataaaggggaatttcaatcttagcacacaaatggcaatctatgtttaattttgatttaatctaggacataattgcaataagtaaagat 17612473  T
Q  222 ataatgacacacctta 237  Q
      ||||||||||||||    
T  17612472 gcaatgacacacctta 17612457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9743925 - 9743637
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||| || | ||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||    
T  9743925 tattttgtttaaccaataatataattgtcaacgtcatgttaactagtgtcctg---gtggatcactctaaaactaaattttacattattacaaaccagtc 9743829  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatg-gaa-atctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaagg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  9743828 ctcatacaaaatattaaggggaacataaatcttagtgcacaaatgagaatatatatgtttaattttgatttaatcaagaacataattgcaataagtaaag 9743729  T
Q  220 atataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    || |||||| |||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  9743728 atttaatgaaacactttatggaaaaatgtgcaatacaccatataatatgacgttacatggattaaatacacaaatgttcaataattggtcat 9743637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 51 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1012596 - 1012351
Alignment:
Q  51 gatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaa 150  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||          |||||||||||||    
T  1012596 gatgtcatgtcagctagtgtactgctagtggaccattctaaaactaaattttaccttattacaaatcaatcttcata----------aggggaatttcaa 1012507  T
Q  151 tcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaa-ttgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtg 249  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  1012506 ttttagtgcacaaataggaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaaattgcaataagtaaagatataatgacacaccttatgggcaaatgtg 1012407  T
Q  250 caatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgatt 305  Q
    ||||| |||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1012406 caatacaccatataatctgacgtgacatggattaaatacacaaatactcgatgatt 1012351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2708196 - 2707998
Alignment:
Q  36 aataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatat 135  Q
    |||| ||||| || |||| ||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||     
T  2708196 aatagtataattgccgatatcatgtcagctagtgtcatgttggtggaccactctaaaactaagctttatcttattacaaatcagccctcatacaaaatag 2708097  T
Q  136 taaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacacct 235  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2708096 -aaggggaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatccatgtttaattttgatttaatcagggactcaattgcaataagtaaagatataatgacacacct 2707998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 49879006 - 49878858
Alignment:
Q  28 gtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcata 127  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  49879006 gtttagtcaatgatataattgttgatgtcatgtcaactagtgtc-tgctggtggaccattctaagactaaactttaccttattataaatcagtcatcata 49878908  T
Q  128 caaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgt 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  49878907 caaaatattaagggaaatttcaatcttaatgcacaaatgaaaatttatgt 49878858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Original strand, 54995613 - 54995781
Alignment:
Q  126 tacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataa 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  54995613 tacaaaatattagggggaatttcaatcttagtacacaaataagaatctatatttaattttgatttaatcagggacacaattgcaataagtaaagatataa 54995712  T
Q  226 tgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaat 294  Q
     ||||||| ||| |   |||||||||||| | |||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  54995713 agacacacattatggacaaatgtgcaatacatcatataacctgacatgacatggattaaatacgcaaat 54995781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 305
Target Start/End: Original strand, 22756794 - 22756924
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatg 273  Q
    ||||| |||||||||| |||| || || |||||| ||||||||| |||||| || ||| |  || ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||    
T  22756794 atgtttaattttgattcaatc-aggacgcaattggaataagtaaagatatagtggcacgctgtatgagcaaatgtgcaatacaccgtataatttgatgtg 22756892  T
Q  274 gtatggattaaatacacaaatactcaatgatt 305  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22756893 gcatgcattaaatacacaaatactcaatgatt 22756924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22729896 - 22729775
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatg 273  Q
    ||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || |||||| || ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||    
T  22729896 atgtttaattttgattcaatc-aggacacagttgcaataagttaagatatagtggcacaccatatgagcaaatgtgcaatacaccgtataatttgatgtg 22729798  T
Q  274 gtatggattaaatacacaaatac 296  Q
    | ||| |||||||||||||||||    
T  22729797 gcatgcattaaatacacaaatac 22729775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 51204724 - 51204632
Alignment:
Q  219 gatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  51204724 gatataatgacacaccttattagcaaatgtgcaatgcaccatataatctgatgtgacatggattaaatacacaaaagctcaataattgatcat 51204632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 306
Target Start/End: Original strand, 28293124 - 28293227
Alignment:
Q  203 aattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatg 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||||   ||||||||||    
T  28293124 aattgcaataagtaaagatataataacacatcttataggtaaatgtgcaatacatcatataatttgatgtagcatggattaaatacattgatactcaatg 28293223  T
Q  303 attg 306  Q
    ||||    
T  28293224 attg 28293227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 134
Target Start/End: Original strand, 54995010 - 54995068
Alignment:
Q  76 tggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaata 134  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  54995010 tggtcgaccactctaaaactaacttttactttattacaaatcagtcctcatacaaaata 54995068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 28292430 - 28292486
Alignment:
Q  82 accactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  28292430 accactctaagactaaactttaccttattacaaatcaataatcatacaaaatattaa 28292486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 265
Target Start/End: Original strand, 33036064 - 33036155
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctaga-acacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataat 265  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   | |||||||||||| || |||||||    
T  33036064 atgtttaattttgatttaatc-agagactcaattgcaataagtaaagatataatgacaaaccttataggcaaatgtgcaatacacaatataat 33036155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 51959990 - 51959922
Alignment:
Q  219 gatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaata 287  Q
    ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||| |||  || ||| |||||||||    
T  51959990 gatataatgacacactttatgggcaaatgtgcaatacaccatataatctgacgtgatatagattaaata 51959922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7291063 - 7290814
Alignment:
Q  16 aaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaa 115  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7291063 aaaaattattttgtttaggcaatagtataactgtcgatgtcatatcaactagtgtcctgtttgtgaaccactctaaaactaaactttatcttattacaaa 7290964  T
Q  116 tcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagt 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  7290963 tcaatcctcatacaaaatattaagaggaatttcaatcttagtgcacaaatgaaaatctatgtctaattttgatttaatcaggaatacaattgcaataagt 7290864  T
Q  216 aaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataat 265  Q
    || |||||||| | ||| |||| | ||||||||  ||||  |||||||||    
T  7290863 aaagatataataatacatcttatgggaaaatgtctaatacgccatataat 7290814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Original strand, 4108625 - 4108911
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||  | ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  4108625 tattttgtttagtcaataatataattgccgttatcatgtcagctagtgtcatgttggtggaccactttaaaactaagctttatcttattacaaaacagtc 4108724  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||    
T  4108725 ttcatacaaaatat-aaggggaatttcaattttagtgcacaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgcaataagtaaagat 4108823  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    |||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||  ||  ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4108824 ataacgacacaccttatgggcaaatgtgcaatacaccatataat--gacgtggcattaattaaatacacaaatattcaatgattggtcat 4108911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3038749 - 3038529
Alignment:
Q  16 aaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaa 115  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| || || ||  |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3038749 aaaaattattttgtttagccaatagtagaattgctgatgtcatgtcaacaagtgtcttgctggtggaccactctaaaactaaactttaccttattacaaa 3038650  T
Q  116 tcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagt 215  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  3038649 tcaatcatcatacaaaatattaa-gggaatttcaatcttagtgcataaatgggaatctaagtttaattttgatttaatcagggacacaattgcaataagt 3038551  T
Q  216 aaggatataatgacacacctta 237  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  3038550 aaagatataatgacacacctta 3038529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Original strand, 6267282 - 6267430
Alignment:
Q  89 taaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgat 188  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6267282 taaaactaaactttatcttattacaaatcagtcatcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatgcaaatctatgtttaattttgat 6267381  T
Q  189 ttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacacctta 237  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6267382 ttaatcaaggacataattgcaataagtaaagatataataacacacctta 6267430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 18756377 - 18756620
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  18756377 tattttgtttagccaataatataattgccgatgttatgttagctaatgtcctactggtggaccactctaaaactaatctttaccttattacaaatctgtc 18756476  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| |||| | | |||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||| |||    
T  18756477 ctcatacaaaatattaaggggaattaaaatcttagtgcacaaaggggaatatatgcttacttttaattgaatcatggacacaattgcaataagtaaagat 18756576  T
Q  222 ataatgacacacctta-agagaaaatgtgcaatataccatataat 265  Q
    ||||||||||| |||| |||  |||||||||||| ||||||||||    
T  18756577 ataatgacacatcttataga-caaatgtgcaatagaccatataat 18756620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 216
Target Start/End: Original strand, 23176497 - 23176690
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |  |||| ||||||||  | ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  23176497 tattttgtttattcaatagtataatttccgatatcatgtcagctagtgtcatgttgatggaccactctaaaactaagctttatcttattacaaattagtc 23176596  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagta 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  23176597 ctcatacaaaatat-aaggggaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgcaataagta 23176690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34686113 - 34685969
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  34686113 tattttttttagttaatagtataactgttaatgtcatgtcaagcagtgtcctgccggtagaccactctaagactaaactttactttattacaaatcagtc 34686014  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatg 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34686013 ctcatacaaaatattaagggaaatttcagtcttagtgcacaaatg 34685969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Original strand, 28220743 - 28220898
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    |  |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  28220743 tattttgtttagtcaatagtataattgtcgatatcatgtttgctaatgtcatgttggtggaccactctaaaactaagctttatcttattacaaatcagtc 28220842  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgtt 178  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  28220843 ctcatacaaaata-taaggggaatttcaatcttagtgtacaaaagagaatctatgtt 28220898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 177
Target Start/End: Original strand, 30650998 - 30651108
Alignment:
Q  67 gtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatg 166  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30650998 gtgttctgctggtggaccactctaagattaaactttaccttattacaaatcagtcatcatactaaatattaagaggaattttaatcttagtgcacaaatg 30651097  T
Q  167 gaaatctatgt 177  Q
     ||||||||||    
T  30651098 aaaatctatgt 30651108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34463575 - 34463472
Alignment:
Q  201 acaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaa 300  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |   ||| |||||||| || ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  34463575 acaattacaataagtaaagatataatgacacaccatatgttcaaacgtgcaatacacaatataatgtgaagtggtatggattaaatacataaattttcaa 34463476  T
Q  301 tgat 304  Q
    ||||    
T  34463475 tgat 34463472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 265
Target Start/End: Original strand, 35735844 - 35735933
Alignment:
Q  175 tgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataat 265  Q
    |||| |||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35735844 tgtttaatttttatttaatc-aggacacaattgtaataggtaaagatatagtggcacaccttatgagcaaatgtgcaatacaccatataat 35735933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 265
Target Start/End: Original strand, 30381002 - 30381067
Alignment:
Q  200 cacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataat 265  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||| |||||||||| |||||||    
T  30381002 cacaattataataagtaaagatataatgacacatcttataagtaaatatgcaatatacgatataat 30381067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 24528 - 24811
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24528 tattttgttaagccaatagtataactgccgatgtcatgtcagctagtgtcatgttggtggatcactctagaactaaactttaccttattacaaatcagtc 24627  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggat 221  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||    
T  24628 atcgtacaaaatattaagggaaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatctatgtt-tattttgatttaatcagggacacaattggaataagtaaatat 24726  T
Q  222 ataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattg 306  Q
    ||||| ||| |||||| | | ||||| |||||| |||||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24727 ataataacataccttatgggcaaatgcgcaatacaccatataatctgacgtgacatgaattaaatacacaaatgctcaatgattg 24811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4104354 - 4104183
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  4104354 tattttgtcttgtcaatagtataattgtcgatgtcatgtcagttagtgtcgtgctggtggaccactctaaaactaaactttgccttattacaaatcaatc 4104255  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaat 193  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  4104254 ttcatacaaaatattaaggagaatttcaatcttagtgcacaaatgggaatttatgtttaattttgatttaat 4104183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 311
Target Start/End: Original strand, 11083924 - 11084151
Alignment:
Q  81 gaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttga 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| |    
T  11083924 gaccactctaaaactaagctttatcttattacaaatcagtccttatacaaaatat-aaggggaatttcaatcttaatgaacaaatgagaatctatgttta 11084022  T
Q  181 attttgatttaatctaga-acacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatgg 279  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||  ||  ||  ||||    
T  11084023 attttgatttaatc-agagacacaattgcaataagtaaagatataatgacacaccttatgggcaaatgtgtaatacaccatataat--gacgtgacatgg 11084119  T
Q  280 attaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  11084120 attaaatacataaatattcaatgattggtcat 11084151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19632087 - 19631798
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattgg--tgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcag 119  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||       
T  19632087 tattttgtttggacaatagtataactgtcgatgtcatgtcaccaggagtgtcctgctggtggaccactctaaaactaagttttaccttattattaattga 19631988  T
Q  120 tcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctaga-acacaattgcaataagtaag 218  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||     
T  19631987 tcctc--acaaaatattgaggggaatttcaatcttagtgcacaaatgagaatttatttttaattttgatttaatc-agagacacgattgcaataagtaaa 19631891  T
Q  219 gatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    |||||||||| ||||||||   | |||||||||||| |||||||||| | |  ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  19631890 gatataatgaaacaccttataggcaaatgtgcaatacaccatataatctaacgtgacatggattaaatacacaaatgttcaatgattggtcat 19631798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34994175 - 34993921
Alignment:
Q  16 aaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaa 115  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||| | |||||||||||| | || || ||||||||    
T  34994175 aaaaattattttgtttagccaatataataagtgttgatgtcatgtcggctagtgtcatgctggtggactattctaaaactaaattgtatcttattacaaa 34994076  T
Q  116 tcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagt 215  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  34994075 tcagttcttatataaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcataaatgagaatctatgtttaattttgatttaatcaaggacacaattgtaataagt 34993976  T
Q  216 aaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgat 270  Q
    || |||||||| ||| || ||| |   |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34993975 aaagatataataacatacattatggacaaatgtgcaatacaccatataatctgat 34993921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30341276 - 30341124
Alignment:
Q  108 attacaaatcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattg 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  30341276 attacaaattagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcactaatgggaatctatatttaattttgatttaatcatgaacacaattg 30341177  T
Q  208 caataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccat 260  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| | | |||||| ||||| |||||    
T  30341176 caataagtgaagatataatgacacaacttatgggcaaatgtacaatacaccat 30341124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 26301626 - 26301922
Alignment:
Q  16 aaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcatt-acaa 114  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||| || |||| |||||||   | ||||| || |||||| ||||||||||| |||  |||| || ||| ||||    
T  26301626 aaaaattattttatttagtcaatg-tataattgccgatatcatgtcggctagtgtcatgttggtgggccactctaaaattaagttttatcttatttacaa 26301724  T
Q  115 atcagtcctcatacaaaatat---taaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaat 211  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  26301725 atcagttctcatacaaaatatatataaagggaatttcaatcttagtacacaaatgagaatctatgtttaattttgatttaatcagggacacaattgcaat 26301824  T
Q  212 aagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |   |||| ||||||| | ||||||  ||||  ||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  26301825 aagtaaagatataatgacacatcttatggataaatatgcaatacatcatata--atgacgtgacatgaattaaatacataaatattcaatgattggtcat 26301922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Original strand, 6613703 - 6613859
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |  ||| |||||||| |  ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | ||    
T  6613703 tattttgtttagtcaatagtataagtcttaatgccatgtcaactaatggtctgctggtggaccactctaagactaaacttcaccttattacaaatgaatc 6613802  T
Q  122 ctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgtt 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  6613803 ctcatacaaaatattaaggagaatttcaatcttagtgcacaaataagaatctatgtt 6613859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 4487823 - 4487882
Alignment:
Q  79 tggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4487823 tggaccactgtaacactaaattttactttattacaaatcagtcctcatacaaaacattaa 4487882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Original strand, 18306592 - 18306707
Alignment:
Q  23 attttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcc 122  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||| |||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||||| | | |  ||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  18306592 attttgtttagccaatagaataaatgttgatgccatgtcagctagtgtcttgctgatggaccactgttagatcaaattttaccttattacaaatcaatcc 18306691  T
Q  123 tcatacaaaatattaa 138  Q
    || |||||||||||||    
T  18306692 tcgtacaaaatattaa 18306707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25441768 - 25441709
Alignment:
Q  79 tggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25441768 tggaccactgtaacactaaattttactttatcacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 25441709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 30341554 - 30341461
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaa 115  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||  |||||||||| |  | |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30341554 tattttgtttagccagtagtataattgctgatgtcatgttagctagtgtcctgatggtgaatcactctaaaactgaactttaccttattacaaa 30341461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 305
Target Start/End: Original strand, 4102864 - 4102919
Alignment:
Q  250 caatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgatt 305  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||||||||    
T  4102864 caatacaccatataatatgatgtggcatagattaaatacacaaatgttcaatgatt 4102919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 217
Target Start/End: Original strand, 4488444 - 4488487
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaa 217  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4488444 atgtttaattttgatttaatcaagaacacaattgcaacaagtaa 4488487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 132
Target Start/End: Original strand, 3148862 - 3148971
Alignment:
Q  22 tattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtc 121  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||| |||| | |||| | |||  ||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||     
T  3148862 tattttatttagctaatagtataacttt-gatgtcatatcaaatagtgtaccgctcatggaccactctaaatttaaacttttccttattacaaatcagtt 3148960  T
Q  122 ctcatacaaaa 132  Q
    |||||| ||||    
T  3148961 ctcatagaaaa 3148971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4103070 - 4103034
Alignment:
Q  201 acaattgcaataagtaaggatataatgacacacctta 237  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4103070 acaattgcaataagtaaaaatataatgacacacctta 4103034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5933 - 5645
Alignment:
Q  15 gaaaaagtattttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaa 114  Q
    |||||| |||||| |||| | |||| ||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  5933 gaaaaattattttatttaattaatagtataactgtggaagtcatgtcagttagtgtc-tgctagtggaccactctaaaactaaactttaccttattataa 5835  T
Q  115 atcagtcctcatacaaaatattaaggggaatttcaatcttagtgcacaaatggaaatctatgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataag 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||||| || |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||   | ||| ||||||||||||    
T  5834 atcagttctcatacaaaatattaaaga-aatttcgatcttaatgaacaaatgcgaatccatgtttaattttgatttaatgagggacataattgcaataag 5736  T
Q  215 taaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatggtatggattaaatacacaaatactcaatgatt 305  Q
     ||  ||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||| | | |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5735 gaaatatataatgacacaccttataggcaaatgtgcaatacaccatataatctaacatgacatgaattaaatacacaaatgctcaatgatt 5645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 311
Target Start/End: Original strand, 8993 - 9130
Alignment:
Q  174 atgttgaattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacaccttaagagaaaatgtgcaatataccatataatatgatatg 273  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| | ||  || |||||||||||| ||  |||||| ||| |||    
T  8993 atgtttaattttgatttaatcaaggacacaattgcaattagtaaagatataatggaacatcgtataagtaaatgtgcaataaactgtataatttgacatg 9092  T
Q  274 gtatggattaaatacacaaatactcaatgattgttcat 311  Q
      ||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  9093 acatacattaaatacacaaatgttcaatgattgatcat 9130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Original strand, 8308 - 8367
Alignment:
Q  79 tggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8308 tggaccactctacgactaaactttactttattacaacttagtcctcatacaaaatattaa 8367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 66052 - 65992
Alignment:
Q  78 gtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaatattaa 138  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  66052 gtggaccactttaacactaaactttaccttattataaattagtcctcatacaaaatattaa 65992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 237
Target Start/End: Original strand, 12034 - 12091
Alignment:
Q  180 aattttgatttaatctagaacacaattgcaataagtaaggatataatgacacacctta 237  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  12034 aattttgatttaatcaggaacacaattgcaataagtaaatatataatgacacatctta 12091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 134
Target Start/End: Original strand, 11443 - 11495
Alignment:
Q  82 accactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcctcatacaaaata 134  Q
    |||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11443 accactctaagactaaattttatcttattacaaatcagtcctcatacaaaata 11495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 108062 - 107955
Alignment:
Q  24 ttttgtttagtcaataatataactgtcgatgtcatgtcaattggtgtcctgctggtggaccactctaaaactaaactttacctcattacaaatcagtcct 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||  |  ||| | | ||||||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  108062 ttttgtttagccaataatataacttt-gatgccatgtcagctaatgtaccgttggtggatcactctaagtctaaacttttccttattacaaatcagtctt 107964  T
Q  124 catacaaaa 132  Q
    |||| ||||    
T  107963 catagaaaa 107955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University