View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19851_high_8 (Length: 324)

Name: NF19851_high_8
Description: NF19851
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19851_high_8
NF19851_high_8
[»] chr3 (89 HSPs)
chr3 (1-121)||(16751664-16751784)
chr3 (1-121)||(4108261-4108383)
chr3 (1-121)||(4112113-4112235)
chr3 (1-121)||(7108661-7108783)
chr3 (1-121)||(7112596-7112718)
chr3 (1-121)||(11166550-11166672)
chr3 (1-121)||(22320629-22320751)
chr3 (1-121)||(22335684-22335806)
chr3 (1-121)||(28948807-28948929)
chr3 (1-121)||(30064812-30064934)
chr3 (1-121)||(55021950-55022072)
chr3 (1-119)||(15616602-15616722)
chr3 (1-109)||(27411100-27411208)
chr3 (1-121)||(11069113-11069235)
chr3 (1-121)||(14498370-14498492)
chr3 (1-121)||(17318159-17318281)
chr3 (1-109)||(15963913-15964023)
chr3 (1-109)||(15967837-15967947)
chr3 (1-109)||(15971761-15971871)
chr3 (1-95)||(14159837-14159933)
chr3 (1-94)||(19774407-19774500)
chr3 (4-64)||(14067598-14067658)
chr3 (5-66)||(31097889-31097950)
chr3 (70-121)||(15963871-15963922)
chr3 (70-121)||(15967795-15967846)
chr3 (70-121)||(15971719-15971770)
chr3 (261-316)||(16751890-16751945)
chr3 (265-312)||(8928860-8928907)
chr3 (261-316)||(19774233-19774288)
chr3 (265-315)||(12853356-12853406)
chr3 (265-315)||(16795539-16795589)
chr3 (5-66)||(1983181-1983242)
chr3 (5-66)||(7574705-7574766)
chr3 (5-66)||(7793697-7793757)
chr3 (266-315)||(10834935-10834984)
chr3 (5-66)||(15482372-15482433)
chr3 (267-315)||(14670062-14670110)
chr3 (3-66)||(2898173-2898236)
chr3 (265-316)||(11301658-11301709)
chr3 (265-315)||(4590153-4590203)
chr3 (265-315)||(13435854-13435904)
chr3 (265-315)||(18933348-18933398)
chr3 (265-315)||(30064421-30064471)
chr3 (5-66)||(327512-327572)
chr3 (5-66)||(20461847-20461907)
chr3 (265-316)||(5219882-5219933)
chr3 (265-316)||(7108273-7108324)
chr3 (265-316)||(7112208-7112259)
chr3 (265-316)||(11068648-11068699)
chr3 (265-316)||(11853741-11853792)
chr3 (276-315)||(11912463-11912502)
chr3 (265-316)||(14497982-14498033)
chr3 (265-316)||(22320164-22320215)
chr3 (265-316)||(22335219-22335270)
chr3 (265-316)||(55021411-55021462)
chr3 (265-315)||(3802006-3802056)
chr3 (265-315)||(14764788-14764838)
chr3 (265-315)||(18899489-18899539)
chr3 (265-315)||(20249842-20249892)
chr3 (265-315)||(29545931-29545981)
chr3 (265-315)||(37440673-37440723)
chr3 (265-315)||(54519633-54519683)
chr3 (5-58)||(3403327-3403380)
chr3 (9-86)||(3833360-3833439)
chr3 (5-66)||(11557756-11557817)
chr3 (283-315)||(9532294-9532326)
chr3 (283-315)||(12304210-12304242)
chr3 (276-315)||(8491736-8491775)
chr3 (265-316)||(11167086-11167137)
chr3 (265-316)||(14664460-14664511)
chr3 (265-316)||(14667624-14667675)
chr3 (265-316)||(15616212-15616263)
chr3 (276-315)||(16840207-16840246)
chr3 (15-66)||(23419705-23419755)
chr3 (265-316)||(28948496-28948547)
chr3 (5-88)||(322237-322322)
chr3 (267-313)||(15463916-15463962)
chr3 (265-315)||(17318502-17318552)
chr3 (5-88)||(19726289-19726374)
chr3 (10-104)||(12172430-12172526)
chr3 (267-315)||(14681586-14681632)
chr3 (8-65)||(16809218-16809274)
chr3 (265-314)||(23372536-23372585)
chr3 (9-86)||(38814070-38814149)
chr3 (265-314)||(51299570-51299619)
chr3 (87-119)||(855758-855790)
chr3 (87-119)||(16369077-16369109)
chr3 (91-119)||(16909550-16909578)
chr3 (283-315)||(38312868-38312900)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (1-121)||(41389423-41389543)
chr1 (1-119)||(39244975-39245093)
chr1 (1-119)||(39248530-39248648)
chr1 (1-121)||(1009685-1009807)
chr1 (1-121)||(1926175-1926297)
chr1 (1-121)||(20925189-20925311)
chr1 (1-121)||(16376426-16376548)
chr1 (1-94)||(52634783-52634878)
chr1 (1-103)||(33796553-33796657)
chr1 (261-316)||(41389653-41389708)
chr1 (264-316)||(39245162-39245214)
chr1 (264-316)||(39248717-39248769)
chr1 (70-121)||(33796505-33796556)
chr1 (265-315)||(41801271-41801321)
chr1 (5-66)||(3705436-3705497)
chr1 (265-315)||(22132091-22132141)
chr1 (5-66)||(18394334-18394395)
chr1 (5-66)||(36819644-36819705)
chr1 (265-315)||(20230131-20230181)
chr1 (265-315)||(21406289-21406339)
chr1 (5-66)||(21172711-21172771)
chr1 (5-66)||(21312827-21312887)
chr1 (84-121)||(52634771-52634808)
chr1 (265-316)||(1009297-1009348)
chr1 (265-316)||(1926788-1926839)
chr1 (265-316)||(16376808-16376859)
chr1 (265-316)||(20925802-20925853)
chr1 (265-316)||(33796068-33796119)
chr1 (265-316)||(52634303-52634354)
chr1 (265-315)||(16370961-16371011)
chr1 (87-119)||(22831790-22831822)
chr1 (5-104)||(3473309-3473409)
chr1 (5-88)||(18182512-18182597)
chr1 (276-313)||(11809953-11809990)
chr1 (278-314)||(32649104-32649140)
chr1 (87-119)||(42865679-42865711)
chr1 (34-86)||(46975176-46975231)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (1-121)||(16759199-16759321)
chr6 (1-119)||(16622988-16623106)
chr6 (1-121)||(11565824-11565946)
chr6 (1-121)||(12619864-12619986)
chr6 (1-121)||(23988922-23989044)
chr6 (1-121)||(8242836-8242958)
chr6 (1-121)||(22948079-22948201)
chr6 (1-121)||(22952035-22952157)
chr6 (1-121)||(23870523-23870645)
chr6 (1-121)||(23874479-23874601)
chr6 (1-94)||(31479239-31479332)
chr6 (1-109)||(23394042-23394152)
chr6 (1-109)||(19869603-19869713)
chr6 (1-109)||(23413950-23414060)
chr6 (1-61)||(14471317-14471377)
chr6 (67-121)||(23413923-23413977)
chr6 (70-121)||(19869561-19869612)
chr6 (70-121)||(23394015-23394066)
chr6 (261-316)||(31479451-31479506)
chr6 (264-316)||(16622870-16622922)
chr6 (265-315)||(23400714-23400764)
chr6 (5-66)||(27567981-27568042)
chr6 (265-315)||(2076322-2076372)
chr6 (265-315)||(18918573-18918623)
chr6 (265-316)||(8242447-8242498)
chr6 (265-316)||(11565436-11565487)
chr6 (265-316)||(11716933-11716984)
chr6 (265-316)||(12620326-12620377)
chr6 (265-316)||(23988338-23988389)
chr6 (265-316)||(27555574-27555625)
chr6 (5-88)||(16523770-16523855)
chr6 (265-315)||(18953476-18953526)
chr6 (8-66)||(19298105-19298162)
chr6 (269-315)||(23538017-23538063)
chr6 (265-315)||(27222868-27222918)
chr6 (5-66)||(17803896-17803956)
chr6 (5-66)||(27553942-27554003)
chr6 (283-315)||(12941257-12941289)
chr6 (265-316)||(22861790-22861841)
chr6 (276-315)||(25737928-25737967)
chr6 (276-315)||(34297776-34297815)
chr6 (8-66)||(12706398-12706455)
chr6 (8-66)||(16740916-16740974)
chr6 (266-315)||(12741889-12741938)
chr6 (5-54)||(25767477-25767526)
chr6 (287-315)||(1254195-1254223)
chr6 (278-314)||(4475832-4475868)
chr6 (284-316)||(19869222-19869254)
chr6 (87-119)||(21740434-21740466)
chr6 (284-316)||(22075402-22075434)
chr6 (284-316)||(22947702-22947734)
chr6 (284-316)||(22951658-22951690)
chr6 (284-316)||(23393676-23393708)
chr6 (284-316)||(23413584-23413616)
chr6 (284-316)||(23870146-23870178)
chr6 (284-316)||(23874102-23874134)
chr6 (283-315)||(28290905-28290937)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (1-121)||(18424432-18424553)
chr7 (1-121)||(12713886-12714008)
chr7 (1-121)||(32071-32193)
chr7 (1-121)||(12705689-12705811)
chr7 (1-121)||(18278405-18278527)
chr7 (1-121)||(18282368-18282490)
chr7 (1-121)||(12717710-12717832)
chr7 (1-121)||(12722621-12722743)
chr7 (1-109)||(71829-71939)
chr7 (1-109)||(75938-76048)
chr7 (1-109)||(45171053-45171163)
chr7 (67-121)||(71912-71966)
chr7 (67-121)||(76021-76075)
chr7 (70-121)||(45171154-45171205)
chr7 (264-316)||(18424270-18424322)
chr7 (5-66)||(12317834-12317895)
chr7 (5-64)||(15605609-15605668)
chr7 (70-121)||(16582854-16582905)
chr7 (265-315)||(7520208-7520258)
chr7 (265-315)||(10607313-10607363)
chr7 (265-315)||(11660318-11660368)
chr7 (265-315)||(13891666-13891716)
chr7 (265-315)||(20486778-20486828)
chr7 (265-315)||(39268306-39268356)
chr7 (5-86)||(2759785-2759868)
chr7 (6-66)||(9446531-9446591)
chr7 (267-315)||(13892049-13892097)
chr7 (265-316)||(18278029-18278080)
chr7 (265-315)||(16582457-16582507)
chr7 (265-315)||(18301387-18301437)
chr7 (265-315)||(25928364-25928414)
chr7 (265-315)||(26291193-26291243)
chr7 (9-66)||(13635803-13635860)
chr7 (266-315)||(39721232-39721281)
chr7 (5-66)||(42203681-42203742)
chr7 (265-316)||(31760-31811)
chr7 (265-316)||(2833474-2833525)
chr7 (265-316)||(12706115-12706166)
chr7 (265-316)||(12713575-12713626)
chr7 (265-316)||(12722233-12722284)
chr7 (265-316)||(16908502-16908553)
chr7 (265-316)||(18281993-18282044)
chr7 (8-66)||(20692-20749)
chr7 (8-66)||(9593056-9593113)
chr7 (265-315)||(9752500-9752550)
chr7 (265-315)||(14420823-14420873)
chr7 (5-88)||(14429529-14429614)
chr7 (265-315)||(15083262-15083312)
chr7 (265-315)||(16005040-16005090)
chr7 (265-315)||(18606374-18606424)
chr7 (265-315)||(18871333-18871383)
chr7 (9-86)||(13148841-13148920)
chr7 (5-66)||(14152340-14152400)
chr7 (283-316)||(23666463-23666496)
chr7 (283-315)||(146536-146568)
chr7 (265-315)||(838125-838176)
chr7 (265-315)||(1203305-1203356)
chr7 (84-119)||(9702941-9702976)
chr7 (265-316)||(12717322-12717373)
chr7 (276-315)||(15213084-15213123)
chr7 (265-315)||(16109967-16110018)
chr7 (84-119)||(32216952-32216987)
chr7 (267-313)||(1860016-1860062)
chr7 (91-121)||(9752124-9752154)
chr7 (265-315)||(10897889-10897939)
chr7 (267-313)||(13919407-13919453)
chr7 (8-66)||(14216633-14216690)
chr7 (276-313)||(16185562-16185599)
chr7 (87-119)||(17138527-17138559)
chr7 (284-316)||(45171512-45171544)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (1-121)||(15223743-15223864)
chr4 (1-121)||(5757832-5757954)
chr4 (1-121)||(9555492-9555614)
chr4 (1-121)||(14758448-14758570)
chr4 (1-121)||(14955213-14955335)
chr4 (1-121)||(33741262-33741384)
chr4 (5-121)||(4562311-4562429)
chr4 (1-121)||(25688865-25688987)
chr4 (1-109)||(12486659-12486769)
chr4 (70-121)||(12486617-12486668)
chr4 (70-121)||(13813683-13813734)
chr4 (70-119)||(13818195-13818244)
chr4 (264-316)||(15223581-15223633)
chr4 (5-66)||(15353677-15353738)
chr4 (265-315)||(631740-631790)
chr4 (265-315)||(13813825-13813875)
chr4 (265-315)||(13818313-13818363)
chr4 (265-315)||(17052438-17052488)
chr4 (265-315)||(22634919-22634969)
chr4 (265-315)||(23996959-23997009)
chr4 (265-315)||(24048377-24048427)
chr4 (265-314)||(12422980-12423029)
chr4 (265-315)||(10711861-10711911)
chr4 (265-315)||(10925631-10925681)
chr4 (265-315)||(27532788-27532838)
chr4 (5-66)||(36134286-36134346)
chr4 (265-316)||(4562766-4562817)
chr4 (265-316)||(5758448-5758499)
chr4 (265-316)||(9555104-9555155)
chr4 (265-316)||(14758984-14759035)
chr4 (265-316)||(14955752-14955803)
chr4 (265-316)||(17807089-17807140)
chr4 (265-316)||(25688477-25688528)
chr4 (265-316)||(33740871-33740922)
chr4 (8-66)||(1952099-1952156)
chr4 (265-315)||(15533255-15533305)
chr4 (8-66)||(17152823-17152880)
chr4 (265-315)||(18211640-18211690)
chr4 (8-66)||(18222717-18222774)
chr4 (265-315)||(20158440-20158490)
chr4 (265-315)||(49549075-49549125)
chr4 (267-316)||(12486306-12486355)
chr4 (8-65)||(18236603-18236659)
chr4 (5-66)||(18603067-18603127)
chr4 (283-315)||(36036988-36037020)
chr4 (84-119)||(13569180-13569215)
chr4 (265-316)||(20163891-20163942)
chr4 (265-315)||(30145819-30145870)
chr4 (8-66)||(3412507-3412564)
chr4 (54-109)||(13818162-13818219)
chr4 (8-66)||(14708974-14709031)
chr4 (8-66)||(18229192-18229249)
chr4 (8-66)||(18609642-18609699)
chr4 (91-121)||(22634750-22634780)
chr4 (9-86)||(2014465-2014544)
chr4 (5-66)||(11250930-11250991)
chr4 (70-103)||(13813639-13813672)
chr4 (54-104)||(15093394-15093446)
chr4 (9-86)||(16243740-16243819)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (1-121)||(40724558-40724680)
chr5 (1-121)||(18355236-18355358)
chr5 (1-121)||(20294863-20294985)
chr5 (1-121)||(19473706-19473828)
chr5 (1-94)||(10752026-10752119)
chr5 (6-109)||(11219940-11220045)
chr5 (6-109)||(11224526-11224631)
chr5 (6-109)||(11228349-11228454)
chr5 (6-109)||(11230338-11230443)
chr5 (261-316)||(10751852-10751907)
chr5 (5-104)||(23439625-23439726)
chr5 (5-104)||(23450992-23451093)
chr5 (5-104)||(23458236-23458337)
chr5 (5-104)||(23462497-23462598)
chr5 (265-316)||(15238110-15238161)
chr5 (265-316)||(22108442-22108493)
chr5 (60-105)||(11226495-11226540)
chr5 (265-316)||(20912245-20912296)
chr5 (5-60)||(24221568-24221623)
chr5 (5-104)||(1859351-1859452)
chr5 (5-66)||(17919525-17919587)
chr5 (8-66)||(18773913-18773970)
chr5 (8-66)||(18783756-18783813)
chr5 (265-315)||(22120584-22120634)
chr5 (5-66)||(17410179-17410239)
chr5 (277-316)||(9774975-9775014)
chr5 (265-316)||(18354832-18354883)
chr5 (265-316)||(19474165-19474216)
chr5 (265-316)||(20294549-20294600)
chr5 (265-315)||(19510498-19510548)
chr5 (265-315)||(22339048-22339098)
chr5 (265-315)||(23113395-23113445)
chr5 (265-315)||(28372074-28372124)
chr5 (265-315)||(37600001-37600051)
chr5 (265-315)||(38146411-38146461)
chr5 (8-66)||(42805130-42805187)
chr5 (9-86)||(33408914-33408993)
chr5 (265-314)||(41878644-41878693)
chr5 (265-316)||(24768555-24768606)
chr5 (276-315)||(36459584-36459623)
chr5 (5-66)||(123685-123747)
chr5 (8-66)||(17730747-17730804)
chr5 (70-104)||(20766628-20766662)
chr5 (5-88)||(21367052-21367137)
chr5 (265-315)||(22335518-22335568)
chr5 (265-315)||(22749197-22749247)
chr5 (8-66)||(23535904-23535962)
chr5 (8-66)||(26743084-26743141)
chr5 (284-316)||(11219590-11219622)
chr5 (284-316)||(11224176-11224208)
chr5 (284-316)||(11226192-11226224)
chr5 (284-316)||(11227998-11228030)
chr5 (284-316)||(11229988-11230020)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (1-121)||(4880-5002)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (1-121)||(68202-68324)
scaffold0061 (265-312)||(68548-68595)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (1-121)||(21977654-21977776)
chr8 (1-121)||(22111013-22111135)
chr8 (1-121)||(43250773-43250895)
chr8 (1-121)||(21973563-21973685)
chr8 (1-109)||(21828998-21829108)
chr8 (1-109)||(18863657-18863767)
chr8 (1-109)||(30941132-30941242)
chr8 (67-121)||(21829081-21829135)
chr8 (70-121)||(18863758-18863809)
chr8 (5-66)||(20856811-20856872)
chr8 (265-315)||(44385826-44385876)
chr8 (265-315)||(21386195-21386245)
chr8 (265-315)||(23427862-23427912)
chr8 (8-66)||(23833882-23833939)
chr8 (265-315)||(23913301-23913351)
chr8 (265-316)||(14399085-14399136)
chr8 (276-315)||(21328602-21328641)
chr8 (265-316)||(21974176-21974227)
chr8 (265-316)||(21978286-21978337)
chr8 (265-316)||(43250237-43250288)
chr8 (5-104)||(16184339-16184440)
chr8 (8-66)||(16231813-16231870)
chr8 (265-315)||(21409937-21409987)
chr8 (265-315)||(21804429-21804479)
chr8 (8-66)||(22044594-22044651)
chr8 (87-121)||(30941235-30941269)
chr8 (9-86)||(23847355-23847434)
chr8 (265-315)||(27942677-27942728)
chr8 (8-66)||(32598387-32598444)
chr8 (8-66)||(32604919-32604976)
chr8 (276-313)||(21967996-21968033)
chr8 (276-313)||(21980836-21980873)
chr8 (276-313)||(21985819-21985856)
chr8 (276-313)||(22000782-22000819)
chr8 (276-313)||(22009200-22009237)
chr8 (276-313)||(34950124-34950161)
chr8 (277-313)||(11252087-11252123)
chr8 (284-316)||(18864116-18864148)
chr8 (91-119)||(19259961-19259989)
chr8 (87-119)||(20466450-20466482)
chr8 (284-316)||(21829472-21829504)
chr8 (284-316)||(30941576-30941608)
chr8 (276-312)||(42560885-42560921)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (1-121)||(10102830-10102952)
chr2 (1-121)||(24629501-24629623)
chr2 (1-121)||(24648317-24648439)
chr2 (1-121)||(27380374-27380496)
chr2 (1-121)||(27384420-27384542)
chr2 (1-121)||(27600794-27600916)
chr2 (1-121)||(30346037-30346159)
chr2 (1-109)||(41531995-41532105)
chr2 (1-109)||(1282425-1282535)
chr2 (67-121)||(1282398-1282452)
chr2 (70-121)||(41532096-41532147)
chr2 (5-66)||(24174485-24174546)
chr2 (5-109)||(22812291-22812397)
chr2 (5-60)||(24869571-24869626)
chr2 (265-315)||(9784030-9784080)
chr2 (5-66)||(25961903-25961965)
chr2 (5-104)||(25964102-25964203)
chr2 (5-66)||(19691982-19692042)
chr2 (6-66)||(24735102-24735161)
chr2 (276-315)||(21074511-21074550)
chr2 (265-316)||(24630040-24630091)
chr2 (265-316)||(24645186-24645237)
chr2 (265-316)||(24647962-24648013)
chr2 (265-316)||(27380986-27381037)
chr2 (265-316)||(27384956-27385007)
chr2 (265-316)||(27600406-27600457)
chr2 (265-316)||(30346650-30346701)
chr2 (265-315)||(6481820-6481870)
chr2 (265-315)||(6485287-6485337)
chr2 (265-315)||(19663550-19663600)
chr2 (8-70)||(19928841-19928902)
chr2 (265-315)||(20260293-20260343)
chr2 (5-66)||(24655708-24655770)
chr2 (5-88)||(37524329-37524414)
chr2 (278-315)||(9240710-9240747)
chr2 (265-316)||(10103289-10103340)
chr2 (265-316)||(12902599-12902650)
chr2 (11-66)||(26124894-26124948)
chr2 (84-119)||(40622673-40622708)
chr2 (8-66)||(60526-60583)
chr2 (70-104)||(22812373-22812407)
chr2 (5-104)||(24673185-24673286)
chr2 (5-104)||(24679810-24679911)
chr2 (284-316)||(24647129-24647161)
chr2 (284-316)||(41532454-41532486)
[»] scaffold0372 (2 HSPs)
scaffold0372 (1-121)||(6041-6163)
scaffold0372 (265-316)||(6313-6364)
[»] scaffold0157 (3 HSPs)
scaffold0157 (1-109)||(33708-33818)
scaffold0157 (70-121)||(33809-33860)
scaffold0157 (267-316)||(34122-34171)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-109)||(15142-15252)
scaffold0141 (284-316)||(15586-15618)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-121)||(79537-79657)
scaffold0029 (265-315)||(62832-62882)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (1-94)||(11491-11586)
scaffold0349 (84-121)||(11479-11516)
scaffold0349 (265-316)||(11086-11137)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (5-88)||(1452-1537)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (5-66)||(18897-18958)
scaffold0044 (5-60)||(12619-12674)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (5-66)||(195296-195357)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (5-66)||(173003-173064)
scaffold0001 (84-119)||(204503-204538)
scaffold0001 (28-88)||(422914-422977)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (263-315)||(37193-37245)
scaffold0031 (5-66)||(53264-53324)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (5-88)||(414419-414505)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (265-315)||(6953-7003)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (9-88)||(7136-7217)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (5-104)||(5222-5323)
scaffold0476 (5-104)||(6417-6518)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (265-315)||(21332-21382)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (5-66)||(4572-4633)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (5-66)||(20347-20408)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (265-314)||(28509-28558)
scaffold0080 (265-314)||(33974-34023)
scaffold0080 (87-119)||(19114-19146)
scaffold0080 (87-119)||(55850-55882)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (5-66)||(228705-228766)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (5-101)||(34223-34322)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (265-316)||(813-864)
[»] scaffold0013 (3 HSPs)
scaffold0013 (268-315)||(74327-74374)
scaffold0013 (8-66)||(81563-81620)
scaffold0013 (5-61)||(3007-3062)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (265-315)||(25560-25610)
scaffold0124 (5-104)||(42265-42366)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (265-315)||(37190-37240)
scaffold0109 (8-65)||(6672-6728)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (5-104)||(5203-5304)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (8-66)||(22926-22983)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (5-66)||(10666-10726)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (5-66)||(18968-19029)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (5-66)||(66762-66822)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (276-315)||(4157-4196)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (265-316)||(8612-8663)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (265-316)||(60318-60369)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (265-315)||(236-286)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (265-315)||(5278-5328)
[»] scaffold0380 (1 HSPs)
scaffold0380 (269-315)||(4010-4056)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (5-66)||(7653-7715)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (265-315)||(10814-10864)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (265-315)||(8732-8782)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (5-104)||(47123-47224)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (265-315)||(109637-109687)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (265-315)||(224135-224185)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (8-65)||(6579-6635)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (9-86)||(9107-9186)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (5-101)||(29-127)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (5-104)||(8199-8294)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (265-316)||(14879-14930)
scaffold0410 (5-66)||(1857-1917)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (265-316)||(11052-11103)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (276-315)||(23941-23980)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (84-119)||(32066-32101)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (84-119)||(23303-23338)
scaffold0081 (84-119)||(38727-38762)
scaffold0081 (84-114)||(14287-14317)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (8-66)||(77-134)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (84-114)||(8278-8308)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (8-66)||(15046-15103)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (265-315)||(18859-18909)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (5-88)||(7524-7609)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (5-66)||(27505-27567)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (265-315)||(11813-11863)
[»] scaffold1873 (1 HSPs)
scaffold1873 (5-50)||(954-999)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (265-314)||(3509-3558)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (91-119)||(1800-1828)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (7-88)||(17507-17590)
[»] scaffold0210 (4 HSPs)
scaffold0210 (87-119)||(22271-22303)
scaffold0210 (87-119)||(22303-22335)
scaffold0210 (87-119)||(30163-30195)
scaffold0210 (87-119)||(30195-30227)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (87-119)||(69414-69446)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 89)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 16751664 - 16751784
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16751664 tattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgactatgtttaagatgtttat 16751763  T
Q  101 gttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16751764 gttgaagatttatgatgttga 16751784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 4108261 - 4108383
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4108261 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 4108360  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4108361 atgttgaagatttatgatgttga 4108383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 4112113 - 4112235
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4112113 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 4112212  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4112213 atgttgaagatttatgatgttga 4112235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 7108783 - 7108661
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7108783 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 7108684  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7108683 atgttgaagatttatgatgttga 7108661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 7112718 - 7112596
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7112718 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 7112619  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7112618 atgttgaagatttatgatgttga 7112596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 11166550 - 11166672
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11166550 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 11166649  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11166650 atgttgaagatttatgatgttga 11166672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22320751 - 22320629
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22320751 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 22320652  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22320651 atgttgaagatttatgatgttga 22320629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22335806 - 22335684
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22335806 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 22335707  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22335706 atgttgaagatttatgatgttga 22335684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28948929 - 28948807
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28948929 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 28948830  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28948829 atgttgaagatttatgatgttga 28948807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30064934 - 30064812
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30064934 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 30064835  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30064834 atgttgaagatttatgatgttga 30064812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 55022072 - 55021950
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  55022072 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 55021973  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  55021972 atgttgaagatttatgatgttga 55021950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15616722 - 15616602
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15616722 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 15616623  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15616622 atgttgaagatttatgatgtt 15616602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 27411100 - 27411208
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27411100 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgttattgtttaagatgattatgtttaagatgtatat 27411199  T
Q  101 gttgaagat 109  Q
    |||||||||    
T  27411200 gttgaagat 27411208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11069235 - 11069113
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11069235 tattatattatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 11069136  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11069135 atgttgaagatttatgatgttga 11069113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 14498492 - 14498370
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  14498492 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatatttaagatgatattgtttaagatgttt 14498393  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14498392 atgttgaagatttatgatgttga 14498370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 17318159 - 17318281
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318159 tattatgttatgttattgatgatgatcgaaagttgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgattatgtttaagatgttt 17318258  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  17318259 atgttgaagttttatgatgttga 17318281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15964023 - 15963913
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  15964023 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 15963924  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  15963923 atgtttaagat 15963913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15967947 - 15967837
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  15967947 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 15967848  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  15967847 atgtttaagat 15967837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15971871 - 15971761
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  15971871 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 15971772  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  15971771 atgtttaagat 15971761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 14159837 - 14159933
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  14159837 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatg 14159933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19774500 - 19774407
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagat 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19774500 tattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattttttatcaaagatgctattgtttaagatgtttatgttgaagat 19774407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 14067598 - 14067658
Alignment:
Q  4 tatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagat 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14067598 tatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagat 14067658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 31097889 - 31097950
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31097889 atgttatgttattgatgatgattgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 31097950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15963922 - 15963871
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15963922 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 15963871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15967846 - 15967795
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15967846 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 15967795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15971770 - 15971719
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15971770 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 15971719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Original strand, 16751890 - 16751945
Alignment:
Q  261 gggagatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751890 gggaaatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 16751945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 312
Target Start/End: Original strand, 8928860 - 8928907
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatg 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8928860 gatgatgattgcatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatg 8928907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19774288 - 19774233
Alignment:
Q  261 gggagatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19774288 gggagatgatgattacatgatattgtctgtgagttgttaaatgtacttgatgatgt 19774233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 12853356 - 12853406
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12853356 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 12853406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16795589 - 16795539
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16795589 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16795539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 1983181 - 1983242
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  1983181 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattatttatcaaagatgc 1983242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 7574766 - 7574705
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7574766 atgttatgttattgatgatgattgaaagctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 7574705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 7793697 - 7793757
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  7793697 atgttatgttattgatgatgattgaatgttgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 7793757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 315
Target Start/End: Original strand, 10834935 - 10834984
Alignment:
Q  266 atgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834935 atgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 10834984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 15482433 - 15482372
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  15482433 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataactgtttatcaaagatgc 15482372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14670110 - 14670062
Alignment:
Q  267 tgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670110 tgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 14670062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 66
Target Start/End: Original strand, 2898173 - 2898236
Alignment:
Q  3 ttatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2898173 ttatgttatgttattggtgatggttgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 2898236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 11301658 - 11301709
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11301658 gatgatgattgcatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11301709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 4590153 - 4590203
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4590153 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 4590203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13435904 - 13435854
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435904 gatgatgattacatgatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13435854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 18933348 - 18933398
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18933348 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 18933398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30064471 - 30064421
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30064471 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 30064421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 327512 - 327572
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  327512 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgttaattg-ttatcaaagatgc 327572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 20461847 - 20461907
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  20461847 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 20461907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5219933 - 5219882
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5219933 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 5219882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7108324 - 7108273
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7108324 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 7108273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7112259 - 7112208
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7112259 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 7112208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11068699 - 11068648
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11068699 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11068648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11853792 - 11853741
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11853792 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11853741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11912502 - 11912463
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11912502 catgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 11912463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14498033 - 14497982
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14498033 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14497982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22320215 - 22320164
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22320215 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 22320164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22335270 - 22335219
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22335270 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 22335219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 55021462 - 55021411
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55021462 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 55021411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3802056 - 3802006
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802056 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 3802006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 14764788 - 14764838
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764788 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 14764838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18899539 - 18899489
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18899539 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 18899489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 20249842 - 20249892
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249842 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 20249892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 29545931 - 29545981
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29545931 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 29545981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 37440673 - 37440723
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37440673 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 37440723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 54519683 - 54519633
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54519683 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 54519633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Original strand, 3403327 - 3403380
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatc 58  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  3403327 atgttttgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatc 3403380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3833439 - 3833360
Alignment:
Q  9 tatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaag-atgattatg 86  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  3833439 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagaatgattatg 3833360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 11557756 - 11557817
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  11557756 atgttatgttattgatgatgattgaatgaagtgattacttgataactgtttaacaaagatgc 11557817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9532326 - 9532294
Alignment:
Q  283 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9532326 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 9532294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12304242 - 12304210
Alignment:
Q  283 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12304242 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 12304210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 315
Target Start/End: Original strand, 8491736 - 8491775
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8491736 catgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 8491775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 11167086 - 11167137
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11167086 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtttacttgatgatgt 11167137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14664511 - 14664460
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14664511 gatgatgattacataatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14664460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14667675 - 14667624
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14667675 gatgatgattacatgatgagatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14667624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15616263 - 15616212
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15616263 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgaagatgt 15616212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 315
Target Start/End: Original strand, 16840207 - 16840246
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16840207 catgattttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatg 16840246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Original strand, 23419705 - 23419755
Alignment:
Q  15 attgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23419705 attgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 23419755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28948547 - 28948496
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28948547 gatgatgattacatgatgatatctataagttgttaagtgtacttgatgatgt 28948496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 322322 - 322237
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 88  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||  | ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  322322 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgacatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgtt 322237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15463962 - 15463916
Alignment:
Q  267 tgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 313  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15463962 tgatgattacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatga 15463916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 17318502 - 17318552
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17318502 gatgatgaatacatgaagttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 17318552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Original strand, 19726289 - 19726374
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 88  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  19726289 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgtt 19726374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 12172526 - 12172430
Alignment:
Q  10 atgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttg 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||  || ||  ||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12172526 atgttatttatgatgattgaatggagtgattacttaatattttattatcaatgatgctatgatatttaagatgcttatgttgaagatgtttatgttg 12172430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14681632 - 14681586
Alignment:
Q  267 tgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14681632 tgatgattacatgatgttatct--gagttgttaaatgtacttgatgatg 14681586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 65
Target Start/End: Original strand, 16809218 - 16809274
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatg 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16809218 ttatgttattgatgatgat-gaaagatctgattatgtgataattgtttatcaaagatg 16809274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 314
Target Start/End: Original strand, 23372536 - 23372585
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 314  Q
    ||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23372536 gatgatgattatgtgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgat 23372585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38814149 - 38814070
Alignment:
Q  9 tatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 86  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  38814149 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattggttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 38814070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 51299619 - 51299570
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 314  Q
    ||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51299619 gatgatgattatgtgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgat 51299570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 855790 - 855758
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  855790 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 855758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16369109 - 16369077
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16369109 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 16369077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16909578 - 16909550
Alignment:
Q  91 agatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16909578 agatgtttatgttgaagatttatgatgtt 16909550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 315
Target Start/End: Original strand, 38312868 - 38312900
Alignment:
Q  283 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38312868 ttatctatgagtggttaaatgtacttgatgatg 38312900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 41389423 - 41389543
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41389423 tattatattatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttat 41389522  T
Q  101 gttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41389523 gttgaagatttatgatgttga 41389543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 39244975 - 39245093
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244975 tattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttat 39245074  T
Q  101 gttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  39245075 gttaaagatttatgatgtt 39245093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 39248530 - 39248648
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39248530 tattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttat 39248629  T
Q  101 gttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  39248630 gttaaagatttatgatgtt 39248648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1009807 - 1009685
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1009807 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 1009708  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1009707 atgttgaagatttatgatgttga 1009685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 1926175 - 1926297
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1926175 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 1926274  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1926275 atgttgaagatttatgatgttga 1926297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 20925189 - 20925311
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20925189 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 20925288  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20925289 atgttgaagatttatgatgttga 20925311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 16376426 - 16376548
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16376426 tattatgttatgttattgatgatgatcaaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgccatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 16376525  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16376526 atgttgaagatttatgatgttga 16376548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 52634878 - 52634783
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  52634878 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgtttatgttgaagat 52634783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 33796657 - 33796553
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||| ||    
T  33796657 tattatgttatgttattgaagatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagataatactgtttaagatgatt 33796558  T
Q  99 atgtt 103  Q
    |||||    
T  33796557 atgtt 33796553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Original strand, 41389653 - 41389708
Alignment:
Q  261 gggagatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41389653 gggagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 41389708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Original strand, 39245162 - 39245214
Alignment:
Q  264 agatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245162 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 39245214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Original strand, 39248717 - 39248769
Alignment:
Q  264 agatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39248717 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 39248769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 33796556 - 33796505
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33796556 tgtttaaggtgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 33796505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 41801271 - 41801321
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41801271 gatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 41801321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 3705436 - 3705497
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3705436 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 3705497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 22132091 - 22132141
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132091 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 22132141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 18394334 - 18394395
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  18394334 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattaattgatgattgtttatcaaagatgc 18394395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 36819644 - 36819705
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  36819644 atgttatgttatagatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 36819705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 20230131 - 20230181
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20230131 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 20230181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21406339 - 21406289
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21406339 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 21406289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 21172771 - 21172711
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  21172771 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 21172711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 21312887 - 21312827
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  21312887 atgttatgttattgatgatgattgaatgttgggattacttgataattg-ttatcaaagatgc 21312827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 52634808 - 52634771
Alignment:
Q  84 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634808 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 52634771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1009348 - 1009297
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1009348 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 1009297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 1926788 - 1926839
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1926788 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 1926839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 16376808 - 16376859
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16376808 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 16376859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 20925802 - 20925853
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20925802 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 20925853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33796119 - 33796068
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33796119 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 33796068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 52634354 - 52634303
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52634354 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 52634303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16371011 - 16370961
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371011 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16370961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 22831790 - 22831822
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831790 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 22831822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Original strand, 3473309 - 3473409
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    ||||||||||||| ||| |  | |||||  ||||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3473309 atgttatgttatttatgttatttgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgatt-tgttgaagatgtttatgt 3473407  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  3473408 tg 3473409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Original strand, 18182512 - 18182597
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 88  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  18182512 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgtt 18182597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 313
Target Start/End: Original strand, 11809953 - 11809990
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 313  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11809953 catgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 11809990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32649140 - 32649104
Alignment:
Q  278 tgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 314  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32649140 tgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgat 32649104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 42865679 - 42865711
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42865679 tttaagatgtttatgttgaagatttatgttgtt 42865711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 46975231 - 46975176
Alignment:
Q  34 tgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 86  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  46975231 tgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 46975176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16759321 - 16759199
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16759321 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgattatgtttaagatgttt 16759222  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16759221 atgttgaagatttatgatgttga 16759199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16623106 - 16622988
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16623106 tattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttat 16623007  T
Q  101 gttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  16623006 gttaaagatttatgatgtt 16622988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11565946 - 11565824
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11565946 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 11565847  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11565846 atgttgaagatttatgatgttga 11565824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 12619864 - 12619986
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12619864 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 12619963  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12619964 atgttgaagatttatgatgttga 12619986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23989044 - 23988922
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23989044 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 23988945  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  23988944 atgtttaagatttatgatgttga 23988922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 8242958 - 8242836
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8242958 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttgctaattgtttatcaaatatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 8242859  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8242858 atgttgaagatttatgatgttga 8242836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22948201 - 22948079
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  22948201 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 22948102  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  22948101 atgtttaagatttatgatgttga 22948079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22952157 - 22952035
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  22952157 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 22952058  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  22952057 atgtttaagatttatgatgttga 22952035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23870645 - 23870523
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  23870645 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 23870546  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  23870545 atgtttaagatttatgatgttga 23870523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23874601 - 23874479
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  23874601 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 23874502  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  23874501 atgtttaagatttatgatgttga 23874479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 31479239 - 31479332
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31479239 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgttgaagat 31479332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23394152 - 23394042
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  23394152 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgataatgtttaagatgatt 23394053  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  23394052 atgtttaagat 23394042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19869713 - 19869603
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  19869713 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 19869614  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  19869613 atgtttaagat 19869603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23414060 - 23413950
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  23414060 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 23413961  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  23413960 atgtttaagat 23413950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 14471377 - 14471317
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaa 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14471377 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaa 14471317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23413977 - 23413923
Alignment:
Q  67 tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23413977 tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 23413923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 19869612 - 19869561
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19869612 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 19869561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23394066 - 23394015
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23394066 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 23394015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Original strand, 31479451 - 31479506
Alignment:
Q  261 gggagatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31479451 gggagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtatttgatgatgt 31479506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16622922 - 16622870
Alignment:
Q  264 agatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16622922 agatgatgattacatgatattatctatgaattgttaaatgtacttgatgatgt 16622870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23400764 - 23400714
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23400764 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 23400714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 27567981 - 27568042
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  27567981 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgaatacttgttaattgtttatcaaagatgc 27568042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2076372 - 2076322
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2076372 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatg 2076322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 18918573 - 18918623
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18918573 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 18918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8242498 - 8242447
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8242498 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 8242447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11565487 - 11565436
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11565487 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11565436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 11716933 - 11716984
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11716933 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11716984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 12620326 - 12620377
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12620326 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 12620377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23988389 - 23988338
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23988389 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 23988338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27555625 - 27555574
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27555625 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 27555574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Original strand, 16523770 - 16523855
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 88  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  16523770 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgtt 16523855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 18953476 - 18953526
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18953476 gatgatgattacatgatgtcatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 18953526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 19298162 - 19298105
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19298162 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 19298105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23538063 - 23538017
Alignment:
Q  269 atgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23538063 atgattacatgatgttgtctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 23538017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27222918 - 27222868
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27222918 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 27222868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 17803956 - 17803896
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  17803956 atgttatgttattgatgatgattgaatactgtgattacttgttaattg-ttatcaaagatgc 17803896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 27553942 - 27554003
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||  ||||||||||||||||||||    
T  27553942 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtggatacttattaattgtttatcaaagatgc 27554003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12941289 - 12941257
Alignment:
Q  283 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12941289 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 12941257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22861841 - 22861790
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22861841 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttggtgatgt 22861790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25737967 - 25737928
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25737967 catgatgttatctatgagttggtaaatgtacttgatgatg 25737928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 315
Target Start/End: Original strand, 34297776 - 34297815
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34297776 catgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgctgatg 34297815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 12706455 - 12706398
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  12706455 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattttttatcaaagatgc 12706398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16740974 - 16740916
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||   | | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16740974 ttatgttattgatgatgatttgaagctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 16740916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12741938 - 12741889
Alignment:
Q  266 atgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  12741938 atgatgattacatgatattgtctatgagttgttaaatatgattgatgatg 12741889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 54
Target Start/End: Original strand, 25767477 - 25767526
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtt 54  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  25767477 atgttatgttattggtgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtt 25767526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1254223 - 1254195
Alignment:
Q  287 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1254223 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 1254195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4475868 - 4475832
Alignment:
Q  278 tgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 314  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4475868 tgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgat 4475832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19869254 - 19869222
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19869254 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 19869222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 21740434 - 21740466
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21740434 tttaagatgtttatgttgaatatttatgatgtt 21740466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 22075402 - 22075434
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22075402 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 22075434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22947734 - 22947702
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22947734 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 22947702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22951690 - 22951658
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22951690 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 22951658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23393708 - 23393676
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23393708 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 23393676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23413616 - 23413584
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23413616 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 23413584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23870178 - 23870146
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23870178 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 23870146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23874134 - 23874102
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23874134 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 23874102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 315
Target Start/End: Original strand, 28290905 - 28290937
Alignment:
Q  283 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28290905 ttatctataagttgttaaatgtacttgatgatg 28290937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18424553 - 18424432
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaa-gatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgttta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18424553 tattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgttta 18424454  T
Q  100 tgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18424453 tgttgaagatttatgatgttga 18424432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12714008 - 12713886
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12714008 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 12713909  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12713908 atgttgaagatttatgatgttga 12713886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 32193 - 32071
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32193 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 32094  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32093 atgttgaagatttatgatgttga 32071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 12705689 - 12705811
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12705689 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 12705788  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12705789 atgttgaagatttatgatgttga 12705811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18278527 - 18278405
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18278527 tattatgttatgttattgatgatgatcgaattttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 18278428  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18278427 atgttgaagatttatgatgttga 18278405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18282490 - 18282368
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18282490 tattatgttatgttattgatgatgatcgaattttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 18282391  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18282390 atgttgaagatttatgatgttga 18282368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12717832 - 12717710
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  12717832 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctaggatgtttaaaatgatattgtttaacatgttt 12717733  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12717732 atgttgaagatttatgatgttga 12717710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12722743 - 12722621
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  12722743 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctaggatgtttaaaatgatattgtttaacatgttt 12722644  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12722643 atgttgaagatttatgatgttga 12722621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 71829 - 71939
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  71829 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 71928  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  71929 atgtttaagat 71939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 75938 - 76048
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  75938 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 76037  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  76038 atgtttaagat 76048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 45171053 - 45171163
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  45171053 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatttttaagatgatattgtttaagatgatt 45171152  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  45171153 atgtttaagat 45171163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 121
Target Start/End: Original strand, 71912 - 71966
Alignment:
Q  67 tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71912 tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 71966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 121
Target Start/End: Original strand, 76021 - 76075
Alignment:
Q  67 tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76021 tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 76075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Original strand, 45171154 - 45171205
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45171154 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 45171205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18424322 - 18424270
Alignment:
Q  264 agatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18424322 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 18424270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 12317895 - 12317834
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12317895 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 12317834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 64
Target Start/End: Original strand, 15605609 - 15605668
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagat 64  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15605609 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagat 15605668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16582905 - 16582854
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16582905 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgtttaagatttaagatgttga 16582854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 7520208 - 7520258
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7520208 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 7520258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 10607313 - 10607363
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10607313 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 10607363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11660368 - 11660318
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11660368 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 11660318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13891716 - 13891666
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13891716 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13891666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20486828 - 20486778
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20486828 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 20486778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 39268306 - 39268356
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39268306 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 39268356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2759868 - 2759785
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatg 86  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  2759868 atgttatgatattgatgatgattgaatgaagtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatg 2759785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Original strand, 9446531 - 9446591
Alignment:
Q  6 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  9446531 tgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgaatacttgttaattgtttatcaaagatgc 9446591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13892097 - 13892049
Alignment:
Q  267 tgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13892097 tgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13892049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18278080 - 18278029
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18278080 gatgatgattgcatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 18278029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16582507 - 16582457
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16582507 gatgatgattacatgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16582457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18301437 - 18301387
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18301437 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 18301387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 25928364 - 25928414
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25928364 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtactttatgatg 25928414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26291243 - 26291193
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26291243 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 26291193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 66
Target Start/End: Original strand, 13635803 - 13635860
Alignment:
Q  9 tatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  13635803 tatgttattgatgatgattgaatgctgtgattaattgataactgtttatcaaagatgc 13635860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39721281 - 39721232
Alignment:
Q  266 atgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39721281 atgatgattacatgatgatatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 39721232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 42203742 - 42203681
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  42203742 atgttatgttattgatgacgattgaatgatgtgaatacttgttaattgtttatcaaagatgc 42203681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31811 - 31760
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31811 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 31760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 2833474 - 2833525
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2833474 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 2833525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 12706115 - 12706166
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12706115 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 12706166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12713626 - 12713575
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12713626 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 12713575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12722284 - 12722233
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12722284 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 12722233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 16908502 - 16908553
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16908502 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 16908553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18282044 - 18281993
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18282044 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 18281993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 20692 - 20749
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20692 ttatgttatttatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 20749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 9593113 - 9593056
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9593113 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 9593056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 9752500 - 9752550
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9752500 gatgataattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttggtgatg 9752550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14420873 - 14420823
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14420873 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 14420823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 14429614 - 14429529
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 88  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  14429614 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgtt 14429529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15083312 - 15083262
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15083312 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 15083262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16005090 - 16005040
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16005090 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16005040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18606424 - 18606374
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18606424 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 18606374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18871383 - 18871333
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18871383 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 18871333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13148920 - 13148841
Alignment:
Q  9 tatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 86  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  13148920 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 13148841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 14152340 - 14152400
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  14152340 atgttatgttattaatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 14152400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 316
Target Start/End: Original strand, 23666463 - 23666496
Alignment:
Q  283 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23666463 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 23666496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 146568 - 146536
Alignment:
Q  283 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146568 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 146536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 838125 - 838176
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  838125 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 838176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 1203305 - 1203356
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1203305 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 1203356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 9702976 - 9702941
Alignment:
Q  84 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9702976 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgtt 9702941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12717373 - 12717322
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12717373 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgctgatgt 12717322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15213123 - 15213084
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15213123 catgatgttatccatgagttgttaaatgtacttgatgatg 15213084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 16109967 - 16110018
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16109967 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16110018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 119
Target Start/End: Original strand, 32216952 - 32216987
Alignment:
Q  84 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32216952 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgtt 32216987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 313
Target Start/End: Original strand, 1860016 - 1860062
Alignment:
Q  267 tgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 313  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1860016 tgatgattacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatga 1860062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 121
Target Start/End: Original strand, 9752124 - 9752154
Alignment:
Q  91 agatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9752124 agatgtttatgttgaagatttatgatgttga 9752154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 10897889 - 10897939
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10897889 gatgatgattatgtgatgttatctatgagtcgttaaatgtacttgatgatg 10897939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 313
Target Start/End: Original strand, 13919407 - 13919453
Alignment:
Q  267 tgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 313  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919407 tgatgattacaggatgttatatatgagttgttaaatgtacttgatga 13919453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 14216690 - 14216633
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  14216690 ttatgttattgatgaagattgaa-gttgtgattatgtgatacttgtttatcaaagatgc 14216633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16185599 - 16185562
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 313  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16185599 catgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 16185562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 17138527 - 17138559
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17138527 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 17138559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 45171512 - 45171544
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45171512 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 45171544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15223864 - 15223743
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaa-gatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgttta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15223864 tattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgttta 15223765  T
Q  100 tgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15223764 tgttgaagatttatgatgttga 15223743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 5757832 - 5757954
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5757832 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 5757931  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5757932 atgttgaagatttatgatgttga 5757954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 9555614 - 9555492
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9555614 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 9555515  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9555514 atgttgaagatttatgatgttga 9555492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 14758448 - 14758570
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14758448 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 14758547  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14758548 atgttgaagatttatgatgttga 14758570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 14955213 - 14955335
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14955213 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 14955312  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14955313 atgttgaagatttatgatgttga 14955335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 33741384 - 33741262
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33741384 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 33741285  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33741284 atgttgaagatttatgatgttga 33741262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 121
Target Start/End: Original strand, 4562311 - 4562429
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  4562311 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagaagatattgtttaagatgtttatgt 4562410  T
Q  103 tgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4562411 tgaagatttatgatgttga 4562429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 25688987 - 25688865
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  25688987 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 25688888  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  25688887 atgtttaagatttatgatgttga 25688865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 12486769 - 12486659
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  12486769 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 12486670  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  12486669 atgtttaagat 12486659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12486668 - 12486617
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12486668 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 12486617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Original strand, 13813683 - 13813734
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813683 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 13813734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 119
Target Start/End: Original strand, 13818195 - 13818244
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13818195 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 13818244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15223633 - 15223581
Alignment:
Q  264 agatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15223633 agatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 15223581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 15353677 - 15353738
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15353677 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 15353738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 631740 - 631790
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  631740 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 631790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 13813825 - 13813875
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813825 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13813875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 13818313 - 13818363
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13818313 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13818363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 17052438 - 17052488
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17052438 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 17052488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 22634919 - 22634969
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634919 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 22634969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 23996959 - 23997009
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996959 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 23997009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 24048377 - 24048427
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048377 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 24048427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12423029 - 12422980
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 314  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12423029 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 12422980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10711911 - 10711861
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10711911 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 10711861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10925681 - 10925631
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10925681 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 10925631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27532838 - 27532788
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27532838 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 27532788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 36134286 - 36134346
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  36134286 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 36134346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 4562766 - 4562817
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4562766 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 4562817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 5758448 - 5758499
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5758448 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 5758499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9555155 - 9555104
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9555155 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 9555104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 14758984 - 14759035
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14758984 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14759035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 14955752 - 14955803
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14955752 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14955803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17807140 - 17807089
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17807140 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 17807089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25688528 - 25688477
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25688528 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 25688477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33740922 - 33740871
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33740922 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 33740871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 1952099 - 1952156
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1952099 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 1952156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15533305 - 15533255
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533305 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 15533255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 17152823 - 17152880
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17152823 ttatgttattgatgacgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 17152880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18211690 - 18211640
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18211690 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 18211640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 18222717 - 18222774
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18222717 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaatgatgc 18222774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 20158440 - 20158490
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20158440 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 20158490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 49549075 - 49549125
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49549075 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 49549125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12486355 - 12486306
Alignment:
Q  267 tgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12486355 tgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 12486306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 18236659 - 18236603
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatg 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  18236659 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgtttatgtgataattgtttatcaaagatg 18236603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 18603067 - 18603127
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18603067 atgttatgtcattgatgatgattgaa-gttgtgattaagtgataattgtttatcaaagatgc 18603127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 36037020 - 36036988
Alignment:
Q  283 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36037020 ttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 36036988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13569215 - 13569180
Alignment:
Q  84 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13569215 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgtt 13569180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 20163891 - 20163942
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20163891 gatgacgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 20163942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30145870 - 30145819
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30145870 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 30145819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 3412564 - 3412507
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  3412564 ttatgtcattgatgatgattgaa-gttgtgattaagtgataattgtttatcaaagatgc 3412507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 109
Target Start/End: Original strand, 13818162 - 13818219
Alignment:
Q  54 ttatcaaagatgctatt--gtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagat 109  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  13818162 ttatcaatgatgctattatgtttaagatgatgatgtttaagatgattatgtttaagat 13818219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 14708974 - 14709031
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  14708974 ttatgttattgatgaagattgaa-gttgtgattatgtgatacttgtttatcaaagatgc 14709031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 18229192 - 18229249
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  18229192 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtaattatgtgatacttgtttatcaaagatgc 18229249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 18609642 - 18609699
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18609642 ttatgtcattgatgatgattgaa-gttgtgattaagtgataattgtttatcaaagatgc 18609699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 121
Target Start/End: Original strand, 22634750 - 22634780
Alignment:
Q  91 agatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634750 agatgtttatgttgaagatttatgatgttga 22634780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2014544 - 2014465
Alignment:
Q  9 tatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 86  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  2014544 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttggtaattgtttatccaggatgctatgttgtttaagactgattatg 2014465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 11250930 - 11250991
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  11250930 atgttatgttgttgatgatgattgaacgatgtgattacttgctaattgtttattgaagatgc 11250991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 103
Target Start/End: Original strand, 13813639 - 13813672
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13813639 tgtttaagatgattatgtttaagatgattatgtt 13813672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15093446 - 15093394
Alignment:
Q  54 ttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttg 104  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15093446 ttatcaatgatgctatgatgtttaagatgcttatgttgaagatgtttatgttg 15093394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 16243740 - 16243819
Alignment:
Q  9 tatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 86  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  16243740 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgactacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 16243819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 40724558 - 40724680
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40724558 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttagcaaagatgctatgatgtttaagatgattatgtttaagatgttt 40724657  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40724658 atgttgaagatttatgatgttga 40724680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 18355358 - 18355236
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  18355358 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagacgatattgtttaagatgttt 18355259  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18355258 atgttgaagatttatgatgttga 18355236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 20294985 - 20294863
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20294985 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgccatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 20294886  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20294885 atgttgaagatttatgatgttga 20294863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 19473706 - 19473828
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  19473706 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 19473805  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  19473806 atgtttaagatttatgatgttga 19473828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 10752119 - 10752026
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgtttaagat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10752119 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctattgtttaagatgattatgttgaagat 10752026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11220045 - 11219940
Alignment:
Q  6 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  11220045 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtt 11219946  T
Q  104 gaagat 109  Q
     |||||    
T  11219945 taagat 11219940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11224631 - 11224526
Alignment:
Q  6 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  11224631 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtt 11224532  T
Q  104 gaagat 109  Q
     |||||    
T  11224531 taagat 11224526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11228454 - 11228349
Alignment:
Q  6 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  11228454 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtt 11228355  T
Q  104 gaagat 109  Q
     |||||    
T  11228354 taagat 11228349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11230443 - 11230338
Alignment:
Q  6 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  11230443 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgattatgtt 11230344  T
Q  104 gaagat 109  Q
     |||||    
T  11230343 taagat 11230338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10751907 - 10751852
Alignment:
Q  261 gggagatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10751907 gggagatgatgattacatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 10751852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23439726 - 23439625
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23439726 atgttatgttatttgtgatgattgaatgaagtgattacttgataatttgttatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 23439627  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  23439626 tg 23439625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23451093 - 23450992
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23451093 atgttatgttatttgtgatgattgaatgaagtgattacttgataatttgttatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 23450994  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  23450993 tg 23450992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23458337 - 23458236
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23458337 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgataatttgttatgaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 23458238  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  23458237 tg 23458236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23462598 - 23462497
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23462598 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgataatttgttatgaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 23462499  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  23462498 tg 23462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 15238110 - 15238161
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15238110 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 15238161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 22108442 - 22108493
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108442 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 22108493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11226540 - 11226495
Alignment:
Q  60 aagatgctattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttga 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11226540 aagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttga 11226495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 20912245 - 20912296
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20912245 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 20912296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24221623 - 24221568
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24221623 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaa 24221568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Original strand, 1859351 - 1859452
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||| ||| || ||  ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1859351 atgttatgttaattgtgatgattgaatgatgtgattacttgatattttattatcaatgatgttatgatgtttaagatgattatgttaaagatgtttatgt 1859450  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  1859451 tg 1859452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 17919525 - 17919587
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaa-tgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17919525 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 17919587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18773970 - 18773913
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18773970 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 18773913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18783813 - 18783756
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18783813 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 18783756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 22120584 - 22120634
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120584 gatgatgattatatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 22120634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 17410239 - 17410179
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  17410239 atgttatgttattggtgatgattgaatgttgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 17410179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9775014 - 9774975
Alignment:
Q  277 atgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9775014 atgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 9774975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18354883 - 18354832
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18354883 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 18354832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 19474165 - 19474216
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19474165 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 19474216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20294600 - 20294549
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20294600 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 20294549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19510548 - 19510498
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19510548 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 19510498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22339098 - 22339048
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22339098 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 22339048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 23113395 - 23113445
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23113395 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 23113445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 28372074 - 28372124
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28372074 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 28372124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 37600001 - 37600051
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37600001 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 37600051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 38146411 - 38146461
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38146411 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 38146461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 42805187 - 42805130
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  42805187 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgcgataattgtttatcaaagatgc 42805130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 33408993 - 33408914
Alignment:
Q  9 tatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 86  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33408993 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 33408914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 314
Target Start/End: Original strand, 41878644 - 41878693
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 314  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41878644 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 41878693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 24768555 - 24768606
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24768555 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacctgatgatgt 24768606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 36459623 - 36459584
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36459623 catgatgttatctatgagttgttaaatgtacttaatgatg 36459584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 123685 - 123747
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcg-aatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  123685 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttattgaagatgc 123747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 17730747 - 17730804
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  17730747 ttatgtcattgatgatgattgaa-gttgtgattaagtgataattgtttatcaaagatgc 17730804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20766662 - 20766628
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20766662 tgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgttg 20766628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Original strand, 21367052 - 21367137
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 88  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  21367052 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgtt 21367137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22335568 - 22335518
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22335568 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtatttgatgatg 22335518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22749247 - 22749197
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22749247 gatgatgattatgtgatgttatctatgagtggttaaatgtacttgatgatg 22749197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 23535904 - 23535962
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  23535904 ttatgttattgatgatgattgaaatctgtgattacttgataactgtttatcaaagatgc 23535962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 26743084 - 26743141
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  26743084 ttatgttgttgatgatgattgaa-gttgtgattacgtgataattgtttatcaaagatgc 26743141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11219622 - 11219590
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11219622 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11219590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11224208 - 11224176
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11224208 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11224176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11226224 - 11226192
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11226224 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11226192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11228030 - 11227998
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11228030 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11227998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11230020 - 11229988
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11230020 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11229988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 4880 - 5002
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4880 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 4979  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4980 atgttgaagatttatgatgttga 5002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 68202 - 68324
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  68202 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 68301  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  68302 atgttgaagatttatgatgttga 68324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 312
Target Start/End: Original strand, 68548 - 68595
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatg 312  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  68548 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatg 68595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 21977654 - 21977776
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21977654 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 21977753  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21977754 atgttgaagatttatgatgttga 21977776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22111135 - 22111013
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22111135 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 22111036  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22111035 atgttgaagatttatgatgttga 22111013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 43250895 - 43250773
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43250895 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 43250796  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43250795 atgttgaagatttatgatgttga 43250773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 21973563 - 21973685
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21973563 tattatgttatgttattgataatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 21973662  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21973663 atgttgaagatttatgatgttga 21973685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 21828998 - 21829108
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  21828998 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 21829097  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  21829098 atgtttaagat 21829108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 18863657 - 18863767
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  18863657 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttgtcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 18863756  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  18863757 atgtttaagat 18863767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 30941132 - 30941242
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  30941132 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 30941231  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    || || |||||    
T  30941232 atatttaagat 30941242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 121
Target Start/End: Original strand, 21829081 - 21829135
Alignment:
Q  67 tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21829081 tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 21829135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Original strand, 18863758 - 18863809
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18863758 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 18863809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 20856811 - 20856872
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20856811 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 20856872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 44385826 - 44385876
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44385826 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 44385876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21386245 - 21386195
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21386245 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 21386195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23427912 - 23427862
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23427912 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttaatgatg 23427862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 23833939 - 23833882
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23833939 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 23833882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23913351 - 23913301
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23913351 gatgatgattacatgatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatg 23913301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 14399085 - 14399136
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14399085 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14399136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21328641 - 21328602
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21328641 catgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 21328602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 21974176 - 21974227
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21974176 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 21974227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 21978286 - 21978337
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21978286 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 21978337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43250288 - 43250237
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43250288 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 43250237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 16184440 - 16184339
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    ||||||||||||| |||||  |  ||||  ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16184440 atgttatgttatttatgatctttaaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgtttaagatgtttatgt 16184341  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  16184340 tg 16184339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 16231813 - 16231870
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16231813 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 16231870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21409987 - 21409937
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21409987 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 21409937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21804479 - 21804429
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21804479 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 21804429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 22044651 - 22044594
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22044651 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 22044594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 121
Target Start/End: Original strand, 30941235 - 30941269
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30941235 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 30941269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Original strand, 23847355 - 23847434
Alignment:
Q  9 tatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 86  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  23847355 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 23847434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 27942677 - 27942728
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattat-ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27942677 gatgatgattacatgatgttaagctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 27942728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 32598444 - 32598387
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  32598444 ttatgttattgatgaagattgaa-gttgtgattatgtgataaatgtttatcaaagatgc 32598387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 32604976 - 32604919
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  32604976 ttatgttattgatgaagattgaa-gttgtgattatgtgataaatgtttatcaaagatgc 32604919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 313
Target Start/End: Original strand, 21967996 - 21968033
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 313  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21967996 catgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 21968033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 313
Target Start/End: Original strand, 21980836 - 21980873
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 313  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21980836 catgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 21980873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 313
Target Start/End: Original strand, 21985819 - 21985856
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 313  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21985819 catgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 21985856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 313
Target Start/End: Original strand, 22000782 - 22000819
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 313  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22000782 catgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 22000819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 313
Target Start/End: Original strand, 22009200 - 22009237
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 313  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22009200 catgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 22009237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34950161 - 34950124
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 313  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34950161 catgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 34950124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 313
Target Start/End: Original strand, 11252087 - 11252123
Alignment:
Q  277 atgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatga 313  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11252087 atgatgttacctatgagttgttaaatgtacttgatga 11252123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 18864116 - 18864148
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18864116 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 18864148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 119
Target Start/End: Original strand, 19259961 - 19259989
Alignment:
Q  91 agatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19259961 agatgtttatgttgaagatttatgatgtt 19259989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 20466450 - 20466482
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20466450 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 20466482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 21829472 - 21829504
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21829472 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 21829504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 30941576 - 30941608
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30941576 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 30941608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 312
Target Start/End: Original strand, 42560885 - 42560921
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatg 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42560885 catgatgttatctatgagttgttaaatgtacgtgatg 42560921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 10102830 - 10102952
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10102830 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 10102929  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10102930 atgttgaagatttatgatgttga 10102952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 24629501 - 24629623
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24629501 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 24629600  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24629601 atgttgaagatttatgatgttga 24629623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24648439 - 24648317
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24648439 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 24648340  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24648339 atgttgaagatttatgatgttga 24648317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 27380374 - 27380496
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27380374 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 27380473  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27380474 atgttgaagatttatgatgttga 27380496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 27384420 - 27384542
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27384420 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 27384519  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27384520 atgttgaagatttatgatgttga 27384542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27600916 - 27600794
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27600916 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 27600817  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27600816 atgttgaagatttatgatgttga 27600794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 30346037 - 30346159
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30346037 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 30346136  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30346137 atgttgaagatttatgatgttga 30346159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 41531995 - 41532105
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  41531995 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 41532094  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  41532095 atgtttaagat 41532105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1282535 - 1282425
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  1282535 tattatgttatgttattgatgatgatcaaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 1282436  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  1282435 atgtttaagat 1282425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1282452 - 1282398
Alignment:
Q  67 tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1282452 tattgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 1282398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Original strand, 41532096 - 41532147
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41532096 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 41532147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 24174546 - 24174485
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24174546 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 24174485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Original strand, 22812291 - 22812397
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    |||||||| |||| |||| ||| |||||  ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22812291 atgttatgatatttatgaagatagaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgtttaagatgattatgt 22812390  T
Q  103 tgaagat 109  Q
    |||||||    
T  22812391 tgaagat 22812397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24869626 - 24869571
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaa 60  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24869626 atgttatgttattcatgatgattgaatgatgtgattatttgataattgtttatcaa 24869571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9784080 - 9784030
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9784080 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgtttaatgtacttgatgatg 9784030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 25961903 - 25961965
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtga-ttatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25961903 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgatttacttgataattgtttatcaaagatgc 25961965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Original strand, 25964102 - 25964203
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||   ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25964102 atgttatgttatttatgatgattgaataaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgaatatgttgaagatgtttatgt 25964201  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  25964202 tg 25964203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 19691982 - 19692042
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  19691982 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgttaattg-ttatcaaagatgc 19692042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 24735161 - 24735102
Alignment:
Q  6 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  24735161 tgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 24735102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 315
Target Start/End: Original strand, 21074511 - 21074550
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21074511 catgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 21074550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 24630040 - 24630091
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24630040 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 24630091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24645237 - 24645186
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24645237 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 24645186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24648013 - 24647962
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24648013 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 24647962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 27380986 - 27381037
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27380986 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 27381037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 27384956 - 27385007
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27384956 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 27385007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27600457 - 27600406
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27600457 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 27600406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 30346650 - 30346701
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30346650 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 30346701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6481870 - 6481820
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6481870 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 6481820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6485337 - 6485287
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6485337 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 6485287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 19663550 - 19663600
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19663550 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 19663600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Original strand, 19928841 - 19928902
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctatt 70  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19928841 ttatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatt 19928902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20260343 - 20260293
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260343 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 20260293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 24655708 - 24655770
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttat-caaagatgc 66  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  24655708 atgttttgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatccaaagatgc 24655770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 37524414 - 37524329
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 88  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  37524414 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgtt 37524329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9240747 - 9240710
Alignment:
Q  278 tgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9240747 tgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 9240710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 10103289 - 10103340
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10103289 gatgatgattacatgttgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 10103340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 12902599 - 12902650
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12902599 gatgatgattacataatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 12902650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 26124948 - 26124894
Alignment:
Q  11 tgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  26124948 tgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttattaaagatgc 26124894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 119
Target Start/End: Original strand, 40622673 - 40622708
Alignment:
Q  84 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40622673 atgtttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 40622708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 60583 - 60526
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  60583 ttatgttattgatgaagattgaa-gttgtgattatgtgatacttgtttatcaaagatgc 60526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 104
Target Start/End: Original strand, 22812373 - 22812407
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22812373 tgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgttg 22812407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 24673286 - 24673185
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||| | |||| ||  ||||||| || | |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24673286 atgttaggttatttatgatgattgaatgaagtgattactgggtattttattatcaatgaagttatgatgtttaagatgcttatgttgaagatgtttatgt 24673187  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  24673186 tg 24673185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 24679911 - 24679810
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||| | |||| ||  ||||||| || | |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24679911 atgttaggttatttatgatgattgaatgaagtgattactgggtattttattatcaatgaagttatgatgtttaagatgcttatgttgaagatgtttatgt 24679812  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  24679811 tg 24679810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24647161 - 24647129
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24647161 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 24647129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 41532454 - 41532486
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41532454 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 41532486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 6041 - 6163
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  6041 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatatttaagatgatattgtttaagatgttt 6140  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6141 atgttgaagatttatgatgttga 6163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 6313 - 6364
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6313 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 6364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 33708 - 33818
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  33708 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 33807  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  33808 atgtttaagat 33818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Original strand, 33809 - 33860
Alignment:
Q  70 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33809 tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 33860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 316
Target Start/End: Original strand, 34122 - 34171
Alignment:
Q  267 tgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34122 tgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 34171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 15142 - 15252
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  15142 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgatt 15241  T
Q  99 atgttgaagat 109  Q
    ||||| |||||    
T  15242 atgtttaagat 15252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 316
Target Start/End: Original strand, 15586 - 15618
Alignment:
Q  284 tatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15586 tatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 15618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 79657 - 79537
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgttt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  79657 tattgtgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgatattgtttaagatgttt 79558  T
Q  99 atgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    |  |  |||||||||||||||||    
T  79557 a--tcaaagatttatgatgttga 79537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 62832 - 62882
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  62832 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 62882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11586 - 11491
Alignment:
Q  1 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  11586 tattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtagttgtttatcaaagatactatgatgtttaagatgtttatgttgaagat 11491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11516 - 11479
Alignment:
Q  84 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttga 11479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11137 - 11086
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11137 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 11086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 1537 - 1452
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 88  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  1537 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgtt 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18958 - 18897
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  18958 atgttatgttattgatgatgattgaatgttgtgattacttgataactgtttatcaaagatgc 18897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12674 - 12619
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaa 60  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  12674 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataactgtttatcaa 12619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 195296 - 195357
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  195296 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 195357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 173064 - 173003
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  173064 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 173003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 204538 - 204503
Alignment:
Q  84 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  204538 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgtt 204503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Original strand, 422914 - 422977
Alignment:
Q  28 gaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc---tattgtttaagatgattatgtt 88  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||    
T  422914 gaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgattgtttaagatgtttatgtt 422977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 315
Target Start/End: Original strand, 37193 - 37245
Alignment:
Q  263 gagatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37193 gagatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 37245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 53324 - 53264
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  53324 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 53264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Original strand, 414419 - 414505
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtga-ttatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 88  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  414419 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgatttacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgtt 414505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 6953 - 7003
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6953 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 7003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 7217 - 7136
Alignment:
Q  9 tatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc--tattgtttaagatgattatgtt 88  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| |||||||    
T  7217 tatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcattgatgtttaagatgtttatgtt 7136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5323 - 5222
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5323 atgttatgttatttacgatgattgaatgaagtgattaattgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 5224  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  5223 tg 5222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6518 - 6417
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6518 atgttatgttatttacgatgattgaatgaagtgattaattgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 6419  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  6418 tg 6417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 21332 - 21382
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21332 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 21382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 4572 - 4633
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  4572 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattaattgatgattgtttatcaaagatgc 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 20347 - 20408
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20347 atgttatgttatcgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 20408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28558 - 28509
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 314  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 28509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34023 - 33974
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 314  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34023 gatgatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 33974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 19114 - 19146
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19114 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 19146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 55850 - 55882
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55850 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 55882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 228705 - 228766
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  228705 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataactgtttatcaaagatgc 228766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 34223 - 34322
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tg-tttaagatgattatgtttaagatgtttatg 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34223 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgataatttattatcaatgatgctatgatgttttaagatgattatgttgaagatgtttatg 34322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 813 - 864
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  813 gatgatgattgcatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 315
Target Start/End: Original strand, 74327 - 74374
Alignment:
Q  268 gatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74327 gatgattacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 74374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Original strand, 81563 - 81620
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  81563 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 81620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Original strand, 3007 - 3062
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaa 61  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  3007 atgttatgt-attgatgatgattgaatgttttgatttcttggtaattgtttatcaaa 3062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 25560 - 25610
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25560 gatgatgaatacatgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 25610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 42366 - 42265
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||| | | ||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42366 atgttatgttatttatgatgatagaatgaagtggtaacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagatgtttatgt 42267  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  42266 tg 42265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 37190 - 37240
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37190 gatgatgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 37240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 6728 - 6672
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatg 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  6728 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgcgataattgtttatcaaagatg 6672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Original strand, 5203 - 5304
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||  ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5203 atgttatgttatttatgatgattaaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgcttatgttgaagatgtttatgt 5302  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  5303 tg 5304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 22983 - 22926
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22983 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 22926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 10666 - 10726
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10666 atgttatgttattgatgatgattgaatat-gtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 10726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 18968 - 19029
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  18968 atgttatgttattgatgatgattgaatactgtgattacttgataattgtttctcaaagatgc 19029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 66762 - 66822
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  66762 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgttaattg-ttatcaaagatgc 66822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4196 - 4157
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4196 catgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 4157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8663 - 8612
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8663 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 8612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 60318 - 60369
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  60318 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 60369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 286 - 236
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  286 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5328 - 5278
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5328 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 5278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:

Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4056 - 4010
Alignment:
Q  269 atgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4056 atgattacatgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 4010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 7653 - 7715
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcg-aatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  7653 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttataaaagatgc 7715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 10814 - 10864
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10814 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 10864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 8732 - 8782
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8732 gatgatgattacatgatgttatctacgagttgttaaatgtacatgatgatg 8782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47224
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| || ||   |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  47123 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttaatatcaatgatgctatgatgtttaagatgcttatgttgaagaagtttatgt 47222  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  47223 tg 47224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 109687 - 109637
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109687 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 109637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Original strand, 224135 - 224185
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  224135 gatgatgattatgtgatgttatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 224185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 65
Target Start/End: Original strand, 6579 - 6635
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatg 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  6579 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgcgataattgtttatcaaagatg 6635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 9186 - 9107
Alignment:
Q  9 tatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgcta--ttgtttaaga-tgattatg 86  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  9186 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgttgtttaagactgattatg 9107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 127 - 29
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatg 101  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||  |||||||  || || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  127 atgttatgttatttacgatgattgaatgaagtgattacctgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgcttatgttgaagatgtttatg 29  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 8294 - 8199
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtttaagatgtttatgt 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||||      |||||||||||||||||||    
T  8294 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaag------atgtttaagatgtttatgt 8201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14930 - 14879
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14930 gatgatgattacatgaagatatctatgagttgttaagtgtacttgatgatgt 14879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 1917 - 1857
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  1917 atgttatattattgatgatgattgaatgaagtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 1857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 11052 - 11103
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 316  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11052 gatgatgattacatgatgatatctatgagttgttaagtgtacctgatgatgt 11103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 315
Target Start/End: Original strand, 23941 - 23980
Alignment:
Q  276 catgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23941 catgatgttatctaggagttgttaaatgtacttgatgatg 23980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 32101 - 32066
Alignment:
Q  84 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32101 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgtt 32066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23338 - 23303
Alignment:
Q  84 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23338 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgtt 23303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 38762 - 38727
Alignment:
Q  84 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38762 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgtt 38727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14317 - 14287
Alignment:
Q  84 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14317 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatg 14287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 134 - 77
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  134 ttatgtcattgatgatgattgaa-gttgtgattaagtgataattgtttatcaaagatgc 77  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 114
Target Start/End: Original strand, 8278 - 8308
Alignment:
Q  84 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8278 atgtttaagatgtttatgttgaagatttatg 8308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 15103 - 15046
Alignment:
Q  8 ttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  15103 ttatgttattgatgaagattgaa-gttgtgattatgtgatacttgtttatcaaagatgc 15046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18909 - 18859
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    ||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18909 gatgatgattatgtgatgttatctataagttgttaaatgtacttgatgatg 18859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Original strand, 7524 - 7609
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 88  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  7524 atgttatgttatttatgatgtttgaatgtagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgtt 7609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 27505 - 27567
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatga-tcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgc 66  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  27505 atgttatgttattgatgatgatttaaatgatgtgattactcgataattgtttatcaaagatgc 27567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11863 - 11813
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 315  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11863 gatgatgattacatgatgaaatctatgagttgttaagtgtacttgatgatg 11813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 999 - 954
Alignment:
Q  5 atgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaat 50  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  999 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataat 954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 314
Target Start/End: Original strand, 3509 - 3558
Alignment:
Q  265 gatgatgattgcatgatattatctatgagttgttaaatgtacttgatgat 314  Q
    ||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3509 gatgatgattatgtgatgttatttatgagttgttaaatgtacttgatgat 3558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1828 - 1800
Alignment:
Q  91 agatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1828 agatgtttatgttgaagatttatgatgtt 1800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 88
Target Start/End: Original strand, 17507 - 17590
Alignment:
Q  7 gttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgattatgtt 88  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  17507 gttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgtt 17590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 4)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 22271 - 22303
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22271 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 22303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 22303 - 22335
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22303 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 22335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 30163 - 30195
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30163 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 30195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 30195 - 30227
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30195 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 30227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 69446 - 69414
Alignment:
Q  87 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  69446 tttaagatgtttatgttgaagatttatgttgtt 69414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University