View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19851_low_19 (Length: 213)

Name: NF19851_low_19
Description: NF19851
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19851_low_19
NF19851_low_19
[»] chr6 (109 HSPs)
chr6 (1-205)||(31479058-31479262)
chr6 (3-205)||(14471354-14471556)
chr6 (6-205)||(22948178-22948376)
chr6 (6-205)||(22952134-22952332)
chr6 (6-205)||(23870622-23870820)
chr6 (6-205)||(23874578-23874776)
chr6 (3-205)||(11565923-11566124)
chr6 (3-205)||(19869690-19869891)
chr6 (3-205)||(23394129-23394330)
chr6 (3-205)||(23989021-23989222)
chr6 (3-205)||(8242935-8243136)
chr6 (3-205)||(12619686-12619887)
chr6 (3-205)||(16759298-16759499)
chr6 (3-188)||(1643619-1643804)
chr6 (3-195)||(22862017-22862208)
chr6 (3-188)||(23400974-23401158)
chr6 (3-188)||(18918219-18918403)
chr6 (3-188)||(18953051-18953236)
chr6 (3-109)||(18952971-18953077)
chr6 (3-182)||(16623219-16623387)
chr6 (3-109)||(16623441-16623547)
chr6 (3-109)||(18952931-18953037)
chr6 (3-109)||(18953011-18953117)
chr6 (3-96)||(31478828-31478921)
chr6 (3-107)||(12619606-12619710)
chr6 (1-109)||(16623361-16623469)
chr6 (1-109)||(31478978-31479086)
chr6 (3-109)||(1643738-1643844)
chr6 (19-109)||(1643778-1643868)
chr6 (3-109)||(12619646-12619752)
chr6 (3-109)||(16623401-16623507)
chr6 (1-107)||(23401095-23401200)
chr6 (111-205)||(23414037-23414130)
chr6 (3-107)||(11566100-11566204)
chr6 (1-109)||(18918177-18918285)
chr6 (3-107)||(22862184-22862288)
chr6 (3-107)||(22948355-22948459)
chr6 (3-107)||(22952311-22952415)
chr6 (3-107)||(23394306-23394410)
chr6 (3-107)||(23870799-23870903)
chr6 (3-107)||(23874755-23874859)
chr6 (126-205)||(16623083-16623162)
chr6 (3-109)||(11566058-11566164)
chr6 (3-109)||(19869825-19869931)
chr6 (3-109)||(22862142-22862248)
chr6 (3-109)||(23394264-23394370)
chr6 (3-109)||(23989156-23989262)
chr6 (3-109)||(31479020-31479126)
chr6 (19-120)||(27555949-27556050)
chr6 (111-195)||(22074982-22075066)
chr6 (3-109)||(16759433-16759539)
chr6 (3-109)||(22948313-22948419)
chr6 (3-109)||(22952269-22952375)
chr6 (3-109)||(23870757-23870863)
chr6 (3-109)||(23874713-23874819)
chr6 (3-80)||(16623350-16623427)
chr6 (3-107)||(16759475-16759579)
chr6 (22-109)||(31478919-31479006)
chr6 (3-109)||(8243070-8243175)
chr6 (19-109)||(18918115-18918205)
chr6 (19-96)||(31478732-31478809)
chr6 (3-107)||(18918139-18918243)
chr6 (111-195)||(22074875-22074958)
chr6 (22-109)||(11566138-11566225)
chr6 (22-109)||(12619585-12619672)
chr6 (22-109)||(16623481-16623568)
chr6 (22-109)||(22862222-22862309)
chr6 (22-109)||(22948393-22948480)
chr6 (22-109)||(22952349-22952436)
chr6 (22-109)||(23394344-23394431)
chr6 (22-109)||(23870837-23870924)
chr6 (22-109)||(23874793-23874880)
chr6 (22-109)||(31478807-31478894)
chr6 (23-109)||(14471490-14471576)
chr6 (3-109)||(31478940-31479046)
chr6 (19-96)||(16623635-16623712)
chr6 (22-107)||(19869867-19869952)
chr6 (22-107)||(23989198-23989283)
chr6 (3-109)||(31478756-31478854)
chr6 (22-109)||(8243110-8243196)
chr6 (22-109)||(16759513-16759600)
chr6 (3-74)||(27555955-27556026)
chr6 (29-109)||(23401132-23401212)
chr6 (114-195)||(2076635-2076718)
chr6 (3-74)||(22948268-22948339)
chr6 (3-74)||(22952224-22952295)
chr6 (3-74)||(23870712-23870783)
chr6 (3-74)||(23874668-23874739)
chr6 (3-109)||(16623590-16623688)
chr6 (22-96)||(16623566-16623637)
chr6 (42-109)||(18952930-18952997)
chr6 (19-74)||(22074734-22074789)
chr6 (19-74)||(23414208-23414263)
chr6 (22-64)||(23401209-23401251)
chr6 (111-152)||(27555836-27555877)
chr6 (62-109)||(19869905-19869952)
chr6 (61-120)||(23414202-23414261)
chr6 (62-109)||(23989236-23989283)
chr6 (114-195)||(14981134-14981214)
chr6 (61-109)||(22074736-22074784)
chr6 (61-109)||(31478734-31478782)
chr6 (19-74)||(2076775-2076830)
chr6 (166-195)||(1643471-1643500)
chr6 (166-195)||(2076519-2076548)
chr6 (110-151)||(14470986-14471027)
chr6 (110-151)||(18918513-18918554)
chr6 (166-195)||(23400889-23400918)
chr6 (27-104)||(7825301-7825382)
chr6 (61-109)||(16623662-16623710)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (1-205)||(10752096-10752300)
chr5 (3-205)||(40724379-40724581)
chr5 (3-205)||(19473528-19473729)
chr5 (3-205)||(20294962-20295163)
chr5 (111-205)||(18355335-18355429)
chr5 (3-109)||(10752232-10752338)
chr5 (7-109)||(10752464-10752566)
chr5 (3-95)||(10752358-10752450)
chr5 (1-109)||(10752384-10752492)
chr5 (3-107)||(19473448-19473552)
chr5 (111-199)||(20911821-20911909)
chr5 (3-109)||(19473488-19473594)
chr5 (19-109)||(40724355-40724445)
chr5 (3-109)||(10752424-10752530)
chr5 (3-109)||(20295097-20295203)
chr5 (26-110)||(15237661-15237745)
chr5 (111-195)||(24768149-24768232)
chr5 (22-109)||(19473427-19473514)
chr5 (25-109)||(10752272-10752356)
chr5 (3-69)||(15237678-15237744)
chr5 (126-195)||(15237908-15237977)
chr5 (22-107)||(20295139-20295224)
chr5 (26-104)||(15237589-15237667)
chr5 (24-120)||(20911654-20911749)
chr5 (126-182)||(15237795-15237851)
chr5 (19-102)||(18355493-18355575)
chr5 (6-109)||(15237609-15237704)
chr5 (3-64)||(20911673-20911733)
chr5 (19-74)||(24768016-24768071)
chr5 (61-120)||(24768018-24768077)
chr5 (114-195)||(29447377-29447457)
chr5 (19-59)||(11220041-11220081)
chr5 (19-59)||(11224627-11224667)
chr5 (19-59)||(11228450-11228490)
chr5 (19-59)||(11230439-11230479)
chr5 (3-59)||(18355496-18355551)
chr5 (111-151)||(22108275-22108315)
chr5 (62-109)||(20295177-20295224)
chr5 (61-103)||(11220037-11220079)
chr5 (61-103)||(11224623-11224665)
chr5 (61-103)||(11228446-11228488)
chr5 (61-103)||(11230435-11230477)
chr5 (111-165)||(22120420-22120474)
chr5 (166-195)||(40727230-40727259)
chr5 (114-195)||(29447334-29447417)
[»] chr7 (83 HSPs)
chr7 (3-205)||(32170-32371)
chr7 (3-205)||(12713985-12714186)
chr7 (3-205)||(18278504-18278705)
chr7 (3-205)||(71651-71852)
chr7 (3-205)||(75760-75961)
chr7 (3-205)||(12705511-12705712)
chr7 (3-205)||(18282467-18282668)
chr7 (3-205)||(12717809-12718010)
chr7 (3-205)||(12722720-12722921)
chr7 (3-188)||(26291441-26291626)
chr7 (3-195)||(16908054-16908246)
chr7 (3-139)||(18424781-18424917)
chr7 (3-109)||(26291600-26291706)
chr7 (3-120)||(45170794-45170911)
chr7 (3-109)||(26291560-26291666)
chr7 (22-142)||(16116637-16116757)
chr7 (3-109)||(71571-71677)
chr7 (3-109)||(75680-75786)
chr7 (3-109)||(18278639-18278745)
chr7 (111-205)||(45170983-45171076)
chr7 (3-107)||(71531-71635)
chr7 (3-107)||(75640-75744)
chr7 (22-142)||(16113484-16113604)
chr7 (126-205)||(18424530-18424609)
chr7 (3-109)||(32305-32411)
chr7 (3-109)||(12705471-12705577)
chr7 (3-109)||(12714120-12714226)
chr7 (3-109)||(12714200-12714306)
chr7 (3-109)||(16908014-16908120)
chr7 (3-107)||(71611-71715)
chr7 (3-107)||(75720-75824)
chr7 (111-195)||(2833078-2833162)
chr7 (3-107)||(12705431-12705535)
chr7 (3-107)||(12714162-12714266)
chr7 (111-194)||(39721383-39721466)
chr7 (3-109)||(32345-32451)
chr7 (3-109)||(18282602-18282708)
chr7 (2-107)||(18424853-18424958)
chr7 (7-107)||(18424933-18425034)
chr7 (111-195)||(7519918-7520002)
chr7 (3-107)||(16907975-16908078)
chr7 (3-109)||(18424891-18424998)
chr7 (19-109)||(26291640-26291730)
chr7 (22-109)||(71510-71597)
chr7 (22-109)||(75619-75706)
chr7 (22-109)||(18278679-18278766)
chr7 (22-109)||(12705410-12705497)
chr7 (19-109)||(12717944-12718034)
chr7 (19-109)||(12722855-12722945)
chr7 (22-107)||(12714242-12714327)
chr7 (22-109)||(16907954-16908040)
chr7 (22-109)||(18282642-18282729)
chr7 (22-109)||(45170773-45170860)
chr7 (129-195)||(2530979-2531045)
chr7 (22-107)||(32387-32472)
chr7 (137-194)||(15083413-15083470)
chr7 (114-195)||(25928100-25928183)
chr7 (3-74)||(16116665-16116736)
chr7 (19-80)||(2530902-2530963)
chr7 (114-195)||(20486971-20487051)
chr7 (126-182)||(18424666-18424722)
chr7 (19-74)||(1859572-1859627)
chr7 (61-120)||(1859574-1859633)
chr7 (3-74)||(16113512-16113583)
chr7 (19-74)||(13919243-13919298)
chr7 (61-120)||(13919245-13919304)
chr7 (61-120)||(39721538-39721597)
chr7 (19-74)||(39721544-39721599)
chr7 (47-109)||(18424972-18425034)
chr7 (19-59)||(7519788-7519828)
chr7 (19-59)||(15083489-15083529)
chr7 (19-74)||(2832945-2833000)
chr7 (62-108)||(12714281-12714327)
chr7 (111-195)||(9752255-9752340)
chr7 (61-120)||(2832947-2833006)
chr7 (61-112)||(15083476-15083527)
chr7 (61-103)||(7519790-7519832)
chr7 (3-44)||(2530926-2530967)
chr7 (19-76)||(25927991-25928048)
chr7 (61-109)||(2530904-2530952)
chr7 (126-190)||(8467742-8467805)
chr7 (126-190)||(17231747-17231810)
chr7 (126-190)||(37728238-37728301)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (3-205)||(14758270-14758471)
chr4 (3-205)||(9555591-9555792)
chr4 (3-205)||(14955035-14955236)
chr4 (3-205)||(25688964-25689165)
chr4 (3-205)||(12486746-12486947)
chr4 (3-205)||(33741361-33741562)
chr4 (3-205)||(4562129-4562330)
chr4 (22-205)||(5757673-5757855)
chr4 (3-191)||(17807243-17807430)
chr4 (3-188)||(27533008-27533193)
chr4 (3-109)||(15224090-15224196)
chr4 (3-109)||(33741576-33741682)
chr4 (3-139)||(15223979-15224116)
chr4 (3-107)||(33741538-33741642)
chr4 (3-107)||(33741618-33741722)
chr4 (3-109)||(14758230-14758336)
chr4 (3-109)||(25689099-25689205)
chr4 (3-109)||(27533207-27533313)
chr4 (3-109)||(33741496-33741602)
chr4 (3-107)||(15224051-15224156)
chr4 (3-107)||(9555768-9555872)
chr4 (3-107)||(12486923-12487027)
chr4 (111-195)||(20158183-20158267)
chr4 (111-195)||(20160859-20160943)
chr4 (111-195)||(20163637-20163721)
chr4 (3-107)||(25689141-25689245)
chr4 (1-109)||(27533247-27533355)
chr4 (3-109)||(9555726-9555832)
chr4 (3-109)||(12486881-12486987)
chr4 (3-109)||(14954995-14955101)
chr4 (3-96)||(15224215-15224308)
chr4 (3-107)||(14954955-14955059)
chr4 (7-96)||(15224327-15224416)
chr4 (3-107)||(4562089-4562193)
chr4 (3-107)||(17807366-17807470)
chr4 (1-109)||(27533127-27533235)
chr4 (126-205)||(15223841-15223920)
chr4 (112-194)||(10712012-10712094)
chr4 (112-194)||(10925782-10925864)
chr4 (3-109)||(14758191-14758296)
chr4 (111-195)||(20158076-20158159)
chr4 (22-109)||(9555806-9555893)
chr4 (22-109)||(12486961-12487048)
chr4 (22-109)||(15224130-15224217)
chr4 (22-109)||(25689179-25689266)
chr4 (22-109)||(33741656-33741743)
chr4 (111-195)||(20163530-20163613)
chr4 (22-109)||(4562068-4562155)
chr4 (22-109)||(14758170-14758256)
chr4 (22-109)||(14954934-14955021)
chr4 (22-109)||(15224242-15224329)
chr4 (22-107)||(17807406-17807491)
chr4 (3-104)||(27533172-27533273)
chr4 (111-195)||(20160752-20160835)
chr4 (19-109)||(27533287-27533377)
chr4 (2-74)||(15224004-15224076)
chr4 (3-109)||(15224282-15224380)
chr4 (3-74)||(5757694-5757765)
chr4 (19-74)||(10712181-10712236)
chr4 (19-74)||(10925951-10926006)
chr4 (19-74)||(20157943-20157998)
chr4 (61-120)||(20157945-20158004)
chr4 (19-74)||(20160619-20160674)
chr4 (61-120)||(20160621-20160680)
chr4 (47-109)||(15224354-15224416)
chr4 (19-74)||(20163397-20163452)
chr4 (65-120)||(20163403-20163458)
chr4 (111-151)||(12423140-12423180)
chr4 (111-151)||(23996834-23996874)
chr4 (110-151)||(27532857-27532898)
chr4 (61-97)||(10712198-10712234)
chr4 (61-97)||(10925968-10926004)
[»] chr3 (129 HSPs)
chr3 (3-205)||(22320728-22320929)
chr3 (3-205)||(22335783-22335984)
chr3 (3-205)||(7108760-7108961)
chr3 (3-205)||(7112695-7112896)
chr3 (3-205)||(11166372-11166573)
chr3 (1-188)||(4589683-4589870)
chr3 (3-205)||(11069212-11069413)
chr3 (3-205)||(14498469-14498670)
chr3 (3-205)||(17317980-17318182)
chr3 (27-195)||(8489940-8490108)
chr3 (22-205)||(28948906-28949088)
chr3 (22-205)||(55022049-55022231)
chr3 (3-205)||(30064911-30065105)
chr3 (22-182)||(19774613-19774773)
chr3 (62-205)||(4108142-4108284)
chr3 (62-205)||(4111994-4112136)
chr3 (108-205)||(27411026-27411123)
chr3 (3-109)||(17317940-17318046)
chr3 (3-109)||(19774798-19774904)
chr3 (42-188)||(27410807-27410953)
chr3 (3-109)||(14067378-14067484)
chr3 (111-205)||(15964000-15964093)
chr3 (3-109)||(27410408-27410514)
chr3 (3-139)||(16751412-16751549)
chr3 (3-96)||(19774771-19774864)
chr3 (3-107)||(22320905-22321009)
chr3 (3-107)||(22335960-22336064)
chr3 (126-205)||(16751608-16751687)
chr3 (126-205)||(19774477-19774556)
chr3 (3-94)||(27410448-27410539)
chr3 (3-109)||(11166332-11166438)
chr3 (3-97)||(14067458-14067552)
chr3 (3-97)||(15964196-15964290)
chr3 (111-205)||(15967924-15968017)
chr3 (3-97)||(15968120-15968214)
chr3 (111-205)||(15971848-15971941)
chr3 (3-97)||(15972044-15972138)
chr3 (3-109)||(22320863-22320969)
chr3 (3-109)||(22335918-22336024)
chr3 (3-108)||(30065140-30065245)
chr3 (3-107)||(7108937-7109041)
chr3 (3-107)||(7112872-7112976)
chr3 (111-195)||(14664794-14664878)
chr3 (111-195)||(14667958-14668042)
chr3 (7-103)||(16751073-16751169)
chr3 (17-120)||(5220303-5220406)
chr3 (111-194)||(37440489-37440572)
chr3 (3-109)||(7108895-7109001)
chr3 (3-109)||(7112830-7112936)
chr3 (9-107)||(11166298-11166396)
chr3 (19-109)||(19774838-19774928)
chr3 (3-80)||(16751240-16751317)
chr3 (10-94)||(27410635-27410719)
chr3 (3-109)||(14067418-14067524)
chr3 (19-109)||(17317876-17317966)
chr3 (111-195)||(5220147-5220231)
chr3 (111-195)||(8490132-8490215)
chr3 (115-195)||(11301266-11301346)
chr3 (22-109)||(22320943-22321030)
chr3 (22-109)||(22335998-22336085)
chr3 (22-109)||(27410387-27410474)
chr3 (4-95)||(27410529-27410620)
chr3 (6-104)||(17317903-17318001)
chr3 (3-109)||(27410488-27410594)
chr3 (26-104)||(30065044-30065122)
chr3 (3-109)||(30065219-30065325)
chr3 (4-104)||(27410709-27410809)
chr3 (3-90)||(5220402-5220489)
chr3 (22-109)||(7108975-7109062)
chr3 (22-109)||(7112910-7112997)
chr3 (5-109)||(16751170-16751266)
chr3 (22-97)||(16751219-16751294)
chr3 (19-109)||(4589661-4589751)
chr3 (19-109)||(5220423-5220513)
chr3 (116-198)||(11853911-11853993)
chr3 (22-107)||(16751391-16751477)
chr3 (3-109)||(27410668-27410774)
chr3 (3-109)||(30065179-30065285)
chr3 (22-107)||(14498606-14498691)
chr3 (3-74)||(8489956-8490027)
chr3 (22-109)||(11069347-11069434)
chr3 (22-109)||(11166272-11166358)
chr3 (22-109)||(15964224-15964311)
chr3 (22-109)||(15968148-15968235)
chr3 (22-109)||(15972072-15972159)
chr3 (3-109)||(14067498-14067601)
chr3 (2-74)||(16751452-16751524)
chr3 (3-74)||(5220309-5220380)
chr3 (22-109)||(30065259-30065346)
chr3 (143-205)||(15616699-15616760)
chr3 (114-195)||(14670231-14670311)
chr3 (3-103)||(16751280-16751381)
chr3 (3-64)||(27410808-27410869)
chr3 (3-59)||(16751109-16751165)
chr3 (2-109)||(16751320-16751438)
chr3 (3-55)||(27410568-27410620)
chr3 (3-58)||(15964195-15964250)
chr3 (3-58)||(15968119-15968174)
chr3 (3-58)||(15972043-15972098)
chr3 (39-109)||(14067374-14067444)
chr3 (3-69)||(19774686-19774752)
chr3 (114-195)||(14681753-14681833)
chr3 (3-55)||(27410748-27410800)
chr3 (3-74)||(28948996-28949067)
chr3 (3-74)||(55022139-55022210)
chr3 (39-109)||(27410624-27410694)
chr3 (61-120)||(14664950-14665009)
chr3 (19-74)||(14664956-14665011)
chr3 (47-109)||(16751073-16751135)
chr3 (111-152)||(12338908-12338949)
chr3 (19-59)||(14668127-14668167)
chr3 (19-59)||(37440376-37440416)
chr3 (19-74)||(14670368-14670423)
chr3 (22-69)||(15464410-15464457)
chr3 (3-71)||(14067538-14067603)
chr3 (171-205)||(14159826-14159860)
chr3 (62-111)||(15464408-15464457)
chr3 (61-112)||(14670370-14670421)
chr3 (166-200)||(4589991-4590025)
chr3 (61-103)||(37440378-37440420)
chr3 (126-195)||(16613398-16613466)
chr3 (126-195)||(22045787-22045855)
chr3 (114-195)||(22651462-22651542)
chr3 (22-74)||(4108142-4108194)
chr3 (22-74)||(4111994-4112046)
chr3 (61-120)||(11854139-11854199)
chr3 (19-74)||(11854145-11854201)
chr3 (61-97)||(14668129-14668165)
chr3 (19-59)||(14681905-14681945)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (3-205)||(24629323-24629524)
chr2 (3-205)||(27384242-27384443)
chr2 (3-205)||(27600893-27601094)
chr2 (3-205)||(30345859-30346060)
chr2 (3-205)||(10102652-10102853)
chr2 (3-205)||(24648416-24648617)
chr2 (3-205)||(27380196-27380397)
chr2 (42-195)||(12902268-12902420)
chr2 (111-205)||(1282512-1282605)
chr2 (111-205)||(41531925-41532018)
chr2 (3-107)||(30345779-30345883)
chr2 (3-109)||(10102612-10102718)
chr2 (3-109)||(24629283-24629389)
chr2 (3-109)||(24648551-24648657)
chr2 (3-109)||(30345819-30345925)
chr2 (3-107)||(24629243-24629347)
chr2 (111-195)||(31344279-31344363)
chr2 (3-109)||(27601028-27601134)
chr2 (6-107)||(24648593-24648694)
chr2 (3-109)||(10102411-10102518)
chr2 (3-107)||(10102532-10102636)
chr2 (3-107)||(10102572-10102676)
chr2 (3-109)||(10102491-10102598)
chr2 (22-109)||(30345758-30345845)
chr2 (22-109)||(10102390-10102477)
chr2 (22-109)||(24629222-24629309)
chr2 (22-109)||(27380175-27380262)
chr2 (22-109)||(27384221-27384308)
chr2 (22-109)||(27601068-27601155)
chr2 (22-109)||(24648631-24648718)
chr2 (25-104)||(12902191-12902270)
chr2 (22-97)||(41531747-41531822)
chr2 (3-55)||(12902209-12902261)
chr2 (3-74)||(12902269-12902340)
chr2 (3-74)||(41531768-41531839)
chr2 (19-74)||(1282691-1282746)
chr2 (19-69)||(31344446-31344496)
chr2 (111-195)||(20319573-20319656)
chr2 (61-120)||(31344435-31344494)
chr2 (124-195)||(9784216-9784287)
chr2 (62-107)||(41531747-41531792)
chr2 (61-97)||(1282708-1282744)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (3-205)||(1009784-1009985)
chr1 (3-205)||(1925997-1926198)
chr1 (3-205)||(20925011-20925212)
chr1 (3-205)||(16376248-16376449)
chr1 (3-205)||(52634855-52635056)
chr1 (19-188)||(20229755-20229928)
chr1 (3-182)||(41389130-41389310)
chr1 (3-182)||(39244691-39244862)
chr1 (3-182)||(39248246-39248417)
chr1 (3-109)||(41388918-41389024)
chr1 (3-107)||(41388958-41389063)
chr1 (3-107)||(1009961-1010065)
chr1 (3-107)||(1925917-1926021)
chr1 (3-107)||(20924931-20925035)
chr1 (21-129)||(21406604-21406712)
chr1 (7-103)||(41388751-41388847)
chr1 (3-107)||(52635032-52635136)
chr1 (111-205)||(33796634-33796731)
chr1 (126-205)||(39244919-39244998)
chr1 (126-205)||(39248474-39248553)
chr1 (3-109)||(1009919-1010025)
chr1 (3-109)||(1925957-1926063)
chr1 (3-109)||(20924971-20925077)
chr1 (3-109)||(16376208-16376314)
chr1 (3-109)||(52634990-52635096)
chr1 (22-109)||(41388897-41388984)
chr1 (126-205)||(41389367-41389446)
chr1 (22-109)||(1009999-1010086)
chr1 (22-109)||(1925896-1925983)
chr1 (22-109)||(20924910-20924997)
chr1 (22-107)||(16376187-16376272)
chr1 (19-96)||(39244667-39244744)
chr1 (19-96)||(39248222-39248299)
chr1 (5-109)||(41388848-41388944)
chr1 (26-109)||(52635070-52635153)
chr1 (22-107)||(41389109-41389195)
chr1 (3-103)||(41388998-41389099)
chr1 (3-74)||(20229779-20229850)
chr1 (3-59)||(41388787-41388843)
chr1 (2-109)||(41389038-41389156)
chr1 (2-74)||(41389170-41389242)
chr1 (3-74)||(21406619-21406690)
chr1 (19-120)||(33796777-33796877)
chr1 (114-195)||(41801000-41801080)
chr1 (47-109)||(41388751-41388813)
chr1 (62-109)||(16376187-16376234)
chr1 (114-180)||(13883343-13883411)
chr1 (114-151)||(20307984-20308021)
chr1 (110-151)||(21406358-21406399)
chr1 (166-195)||(21406469-21406498)
chr1 (19-64)||(22131622-22131667)
chr1 (111-151)||(22131966-22132006)
chr1 (61-109)||(39244669-39244717)
chr1 (61-109)||(39248224-39248272)
chr1 (126-190)||(41306397-41306460)
chr1 (19-59)||(48519683-48519723)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (3-205)||(11563-11764)
scaffold0349 (22-109)||(11698-11785)
[»] scaffold0157 (4 HSPs)
scaffold0157 (3-205)||(33530-33731)
scaffold0157 (3-107)||(33450-33554)
scaffold0157 (3-109)||(33490-33596)
scaffold0157 (22-109)||(33429-33516)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (3-205)||(21977476-21977677)
chr8 (3-205)||(43250872-43251073)
chr8 (22-205)||(22111112-22111294)
chr8 (3-201)||(21973385-21973582)
chr8 (3-188)||(15924099-15924284)
chr8 (27-195)||(21386515-21386683)
chr8 (3-109)||(15924059-15924165)
chr8 (19-109)||(15924035-15924125)
chr8 (111-205)||(21828928-21829021)
chr8 (111-205)||(30941062-30941155)
chr8 (3-107)||(21977436-21977540)
chr8 (3-107)||(43251049-43251153)
chr8 (3-97)||(30940865-30940959)
chr8 (3-109)||(43251007-43251113)
chr8 (19-120)||(14398594-14398695)
chr8 (6-107)||(21973348-21973449)
chr8 (111-195)||(21386407-21386491)
chr8 (111-194)||(21410088-21410171)
chr8 (111-194)||(21804580-21804663)
chr8 (111-195)||(14398755-14398839)
chr8 (22-109)||(21977415-21977502)
chr8 (22-109)||(43251087-43251174)
chr8 (111-205)||(18863591-18863680)
chr8 (22-109)||(21973324-21973411)
chr8 (22-120)||(18863421-18863519)
chr8 (3-74)||(14398618-14398689)
chr8 (22-109)||(30940844-30940931)
chr8 (3-74)||(21386596-21386667)
chr8 (3-74)||(30940905-30940976)
chr8 (3-74)||(22111202-22111273)
chr8 (3-74)||(18863442-18863513)
chr8 (111-152)||(21386342-21386383)
chr8 (114-195)||(23913437-23913517)
chr8 (19-74)||(21410228-21410283)
chr8 (19-74)||(21804720-21804775)
chr8 (19-74)||(21828787-21828842)
chr8 (126-197)||(1323887-1323957)
chr8 (61-112)||(21410230-21410281)
chr8 (61-112)||(21804722-21804773)
chr8 (116-192)||(20983317-20983392)
chr8 (111-151)||(44385557-44385597)
chr8 (111-151)||(44385701-44385741)
chr8 (19-74)||(23913574-23913629)
chr8 (61-97)||(21828789-21828825)
[»] scaffold0372 (2 HSPs)
scaffold0372 (3-205)||(5863-6064)
scaffold0372 (22-107)||(5842-5927)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (3-190)||(36801-36988)
scaffold0109 (19-109)||(36737-36827)
scaffold0109 (3-109)||(36761-36867)
[»] scaffold0029 (12 HSPs)
scaffold0029 (3-188)||(66287-66471)
scaffold0029 (3-205)||(79634-79835)
scaffold0029 (3-188)||(62371-62555)
scaffold0029 (19-109)||(66263-66353)
scaffold0029 (19-109)||(62347-62437)
scaffold0029 (3-107)||(79771-79875)
scaffold0029 (19-97)||(79821-79899)
scaffold0029 (1-74)||(66325-66397)
scaffold0029 (1-74)||(62409-62481)
scaffold0029 (166-199)||(62675-62708)
scaffold0029 (110-151)||(62774-62815)
scaffold0029 (166-195)||(66591-66620)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (22-205)||(68044-68225)
scaffold0061 (3-74)||(68065-68135)
[»] scaffold0525 (7 HSPs)
scaffold0525 (42-205)||(4741-4903)
scaffold0525 (3-94)||(4562-4653)
scaffold0525 (4-104)||(4643-4743)
scaffold0525 (25-109)||(4544-4628)
scaffold0525 (3-109)||(4602-4708)
scaffold0525 (3-55)||(4682-4734)
scaffold0525 (3-74)||(4742-4813)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (111-205)||(15072-15165)
scaffold0141 (3-97)||(14875-14969)
scaffold0141 (22-109)||(14854-14941)
scaffold0141 (3-59)||(14915-14971)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (110-195)||(11996-12081)
scaffold0023 (111-195)||(12104-12187)
[»] scaffold0486 (3 HSPs)
scaffold0486 (111-195)||(8944-9028)
scaffold0486 (19-109)||(9119-9209)
scaffold0486 (3-74)||(9114-9185)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (3-107)||(59564-59668)
scaffold0028 (3-109)||(59523-59630)
scaffold0028 (3-97)||(59604-59698)
scaffold0028 (3-107)||(59483-59588)
scaffold0028 (22-109)||(59462-59549)
scaffold0028 (3-64)||(59644-59705)
scaffold0028 (118-195)||(59834-59910)
[»] scaffold0166 (3 HSPs)
scaffold0166 (111-195)||(10646-10729)
scaffold0166 (19-74)||(10513-10568)
scaffold0166 (61-120)||(10515-10574)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (19-96)||(51401-51478)
scaffold0074 (3-56)||(51425-51478)
scaffold0074 (61-109)||(51403-51451)
[»] scaffold0575 (2 HSPs)
scaffold0575 (114-195)||(6751-6831)
scaffold0575 (19-74)||(6639-6694)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (114-195)||(36971-37051)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (19-120)||(208361-208461)
scaffold0016 (111-164)||(208507-208560)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (114-195)||(21068-21151)
scaffold0293 (19-74)||(20956-21011)
[»] scaffold1852 (5 HSPs)
scaffold1852 (144-195)||(526-577)
scaffold1852 (112-152)||(602-642)
scaffold1852 (19-74)||(265-320)
scaffold1852 (61-120)||(267-326)
scaffold1852 (111-151)||(467-507)
[»] scaffold0299 (2 HSPs)
scaffold0299 (111-152)||(6109-6150)
scaffold0299 (61-120)||(6327-6387)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (116-190)||(231-304)
scaffold0335 (116-190)||(9310-9383)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (114-190)||(8885-8963)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (62-120)||(11268-11325)
scaffold0200 (22-74)||(11274-11325)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (111-165)||(74163-74217)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (166-195)||(19291-19320)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (124-189)||(22185-22249)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (110-151)||(22288-22329)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (111-151)||(8379-8419)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (126-190)||(6848-6911)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (126-190)||(44594-44657)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (19-59)||(1013-1053)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (126-190)||(361945-362008)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 109)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 31479058 - 31479262
Alignment:
Q  1 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |     
T  31479058 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgatatgttgctatgttgtgtaagatgttgattatgatattgttaa 31479157  T
Q  101 gttgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattga 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31479158 gttgttatgatgatatatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattga 31479257  T
Q  201 tgatg 205  Q
    |||||    
T  31479258 tgatg 31479262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14471556 - 14471354
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  14471556 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatgttgttatgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagt 14471457  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14471456 tgttatgatgttgtatataattgttactattgagtgatgattatgtcgttctatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 14471357  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  14471356 atg 14471354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22948376 - 22948178
Alignment:
Q  6 ttatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgc 105  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||     
T  22948376 ttatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgt 22948277  T
Q  106 tatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948276 tatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 22948178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22952332 - 22952134
Alignment:
Q  6 ttatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgc 105  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||     
T  22952332 ttatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgt 22952233  T
Q  106 tatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22952232 tatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 22952134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23870820 - 23870622
Alignment:
Q  6 ttatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgc 105  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||     
T  23870820 ttatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgt 23870721  T
Q  106 tatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23870720 tatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 23870622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23874776 - 23874578
Alignment:
Q  6 ttatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgc 105  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||     
T  23874776 ttatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgt 23874677  T
Q  106 tatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23874676 tatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 23874578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11566124 - 11565923
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  11566124 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 11566025  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566024 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 11565926  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  11565925 atg 11565923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19869891 - 19869690
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  19869891 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 19869792  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19869791 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 19869693  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  19869692 atg 19869690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23394330 - 23394129
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  23394330 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 23394231  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23394230 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 23394132  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  23394131 atg 23394129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23989222 - 23989021
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  23989222 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 23989123  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989122 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttcaatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 23989024  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  23989023 atg 23989021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8243136 - 8242935
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  8243136 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 8243037  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8243036 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaaatgaatattatgttatgttattgatg 8242938  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  8242937 atg 8242935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 12619686 - 12619887
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||| | ||    
T  12619686 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgattttgttaagt 12619785  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12619786 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgacgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 12619884  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  12619885 atg 12619887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16759499 - 16759298
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  16759499 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagacattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 16759400  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16759399 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtaaatattatgttatgttattgatg 16759301  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  16759300 atg 16759298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1643804 - 1643619
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  1643804 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagt 1643705  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 188  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1643704 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaatatgttttactatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 1643619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22862208 - 22862017
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  22862208 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 22862109  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22862108 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgatt-attattattaagtgaatatcatgttatgtt 22862017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23401158 - 23400974
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||| | ||    
T  23401158 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatatgg-ttatgatattgttatgttgctacgttgtttaacatattaattatgatattgttaagt 23401060  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 188  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23401059 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatg 23400974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Original strand, 18918219 - 18918403
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  18918219 tgatcatgatattgttatgttgctaagttgtttaagatgttgattatgatatgtttatgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagt 18918318  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 188  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18918319 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaat-tgttgtaccatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 18918403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Original strand, 18953051 - 18953236
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | | ||    
T  18953051 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattattaagt 18953150  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 188  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18953151 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtaacgagtatgttgtactatatatgattaattgttattaagtgaatgttatg 18953236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 18952971 - 18953077
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18952971 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgttaaagatgttgattatgatattgttatgt 18953070  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  18953071 tgctatg 18953077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16623387 - 16623219
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  16623387 tgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagataatgattatg-----------ttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttaagt 16623299  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 182  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16623298 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgatggatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaat 16623219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16623547 - 16623441
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  16623547 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgt 16623448  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  16623447 tgctatg 16623441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 18952931 - 18953037
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||    
T  18952931 tgattatgatatcgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgt 18953030  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  18953031 tgctatg 18953037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 18953011 - 18953117
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18953011 tgattatgatattgttatgttgctatgttgttaaagatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgt 18953110  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  18953111 tgctatg 18953117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Original strand, 31478828 - 31478921
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattg 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31478828 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg 31478921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 12619606 - 12619710
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  12619606 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgt 12619705  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  12619706 tgcta 12619710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16623469 - 16623361
Alignment:
Q  1 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |     
T  16623469 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttac 16623370  T
Q  101 gttgctatg 109  Q
    |||||||||    
T  16623369 gttgctatg 16623361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 31478978 - 31479086
Alignment:
Q  1 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| ||    
T  31478978 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatcttgattatgatattcttacgttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttat 31479077  T
Q  101 gttgctatg 109  Q
    |||||||||    
T  31479078 gttgctatg 31479086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1643844 - 1643738
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||    
T  1643844 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgt 1643745  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  1643744 tgctatg 1643738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1643868 - 1643778
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1643868 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatg 1643778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 12619646 - 12619752
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  12619646 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 12619745  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  12619746 tgctatg 12619752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16623507 - 16623401
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16623507 tgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgt 16623408  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  16623407 tgctatg 16623401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23401200 - 23401095
Alignment:
Q  1 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgat 100  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  23401200 aatgaatatgatattgttacgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagat-atggttatgatattgttat 23401102  T
Q  101 gttgcta 107  Q
    |||||||    
T  23401101 gttgcta 23401095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23414130 - 23414037
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414130 tgatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 23414037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 11566204 - 11566100
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  11566204 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 11566105  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  11566104 tgcta 11566100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 18918177 - 18918285
Alignment:
Q  1 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||    
T  18918177 aatgaatatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgatcatgatattgttatgttgctaagttgtttaagatgttgattatgatatgtttat 18918276  T
Q  101 gttgctatg 109  Q
    |||||||||    
T  18918277 gttgctatg 18918285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22862288 - 22862184
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  22862288 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 22862189  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  22862188 tgcta 22862184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22948459 - 22948355
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  22948459 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgcttatgatactgttatgt 22948360  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  22948359 tgcta 22948355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22952415 - 22952311
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  22952415 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgcttatgatactgttatgt 22952316  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  22952315 tgcta 22952311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23394410 - 23394306
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  23394410 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 23394311  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  23394310 tgcta 23394306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23870903 - 23870799
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  23870903 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgcttatgatactgttatgt 23870804  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  23870803 tgcta 23870799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23874859 - 23874755
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  23874859 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgcttatgatactgttatgt 23874760  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  23874759 tgcta 23874755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16623162 - 16623083
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16623162 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 16623083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11566164 - 11566058
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  11566164 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 11566065  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  11566064 tgctatg 11566058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19869931 - 19869825
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  19869931 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 19869832  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  19869831 tgctatg 19869825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22862248 - 22862142
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  22862248 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 22862149  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  22862148 tgctatg 22862142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23394370 - 23394264
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  23394370 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 23394271  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  23394270 tgctatg 23394264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23989262 - 23989156
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  23989262 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 23989163  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  23989162 tgctatg 23989156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 31479020 - 31479126
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  31479020 tgattatgatattcttacgttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgatatgt 31479119  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  31479120 tgctatg 31479126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27556050 - 27555949
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  27556050 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtat 27555951  T
Q  119 at 120  Q
    ||    
T  27555950 at 27555949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 22074982 - 22075066
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074982 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttttactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 22075066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16759539 - 16759433
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| | ||    
T  16759539 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagacattgattatgatattgttacgt 16759440  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  16759439 tgctatg 16759433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22948419 - 22948313
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  22948419 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgcttatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 22948320  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  22948319 tgctatg 22948313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22952375 - 22952269
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  22952375 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgcttatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 22952276  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  22952275 tgctatg 22952269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23870863 - 23870757
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  23870863 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgcttatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 23870764  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  23870763 tgctatg 23870757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23874819 - 23874713
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  23874819 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgcttatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 23874720  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  23874719 tgctatg 23874713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16623427 - 16623350
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagat 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16623427 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagat 16623350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16759579 - 16759475
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  16759579 tgattatcatattcttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 16759480  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  16759479 tgcta 16759475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 31478919 - 31479006
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||    
T  31478919 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgttgctatg 31479006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8243175 - 8243070
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  8243175 tgattatgatattgttacgttgctacgttgtt-aagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 8243077  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  8243076 tgctatg 8243070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Original strand, 18918115 - 18918205
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  18918115 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgaatatgatattgttatgttgctatg 18918205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 31478732 - 31478809
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31478732 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg 31478809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 18918139 - 18918243
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||    
T  18918139 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgaatatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgatcatgatattgttatgt 18918238  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  18918239 tgcta 18918243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 22074875 - 22074958
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074875 tgatgtatataattgttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgatt-attattattaagtgaatattatgttatgtt 22074958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11566225 - 11566138
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11566225 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 11566138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 12619585 - 12619672
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12619585 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 12619672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16623568 - 16623481
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  16623568 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 16623481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22862309 - 22862222
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22862309 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 22862222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22948480 - 22948393
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22948480 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 22948393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22952436 - 22952349
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22952436 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 22952349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23394431 - 23394344
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23394431 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 23394344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23870924 - 23870837
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23870924 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 23870837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23874880 - 23874793
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23874880 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 23874793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 31478807 - 31478894
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  31478807 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 31478894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 14471576 - 14471490
Alignment:
Q  23 tgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  14471576 tgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatgttgttatgttgctatg 14471490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 31478940 - 31479046
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | | ||    
T  31478940 tgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatcttgattatgatattcttacgt 31479039  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  31479040 tgctatg 31479046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16623712 - 16623635
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattg 96  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16623712 atgttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg 16623635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 19869952 - 19869867
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgcta 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  19869952 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgcta 19869867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23989283 - 23989198
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgcta 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  23989283 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgcta 23989198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 31478756 - 31478854
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  31478756 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgata--------ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgt 31478847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 8243196 - 8243110
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8243196 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctacgttg-ttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 8243110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16759600 - 16759513
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16759600 ttgctatgttgtttaacatgttgattatcatattcttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 16759513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 27556026 - 27555955
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  27556026 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 27555955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23401212 - 23401132
Alignment:
Q  29 gttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23401212 gttgtttaagataatgaatatgatattgttacgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 23401132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2076718 - 2076635
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--attattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2076718 tgtatataattattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgattattattattattaagtgaatattatgttatgtt 2076635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22948339 - 22948268
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  22948339 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 22948268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22952295 - 22952224
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  22952295 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 22952224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23870783 - 23870712
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  23870783 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 23870712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23874739 - 23874668
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  23874739 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 23874668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16623688 - 16623590
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||    
T  16623688 tgattacgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgata--------ttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgt 16623597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16623637 - 16623566
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattg 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||    
T  16623637 ttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgttgcta---tgtttaagatattgattatgatattg 16623566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Original strand, 18952930 - 18952997
Alignment:
Q  42 ttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18952930 ttgattatgatatcgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 18952997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 22074734 - 22074789
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22074734 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgttgtt 22074789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23414263 - 23414208
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23414263 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgttgtt 23414208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23401251 - 23401209
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttg 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23401251 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttg 23401209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27555877 - 27555836
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgtt 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27555877 tgatgtatataattgttatcattaagtgatgaatatgttgtt 27555836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19869952 - 19869905
Alignment:
Q  62 ttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19869952 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 19869905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23414261 - 23414202
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| || |||||||    
T  23414261 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgttgttgtatat 23414202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23989283 - 23989236
Alignment:
Q  62 ttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23989283 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 23989236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Original strand, 14981134 - 14981214
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  14981134 tgtatatgattattattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attattattaagtgatgattatgttgtgtt 14981214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 109
Target Start/End: Original strand, 22074736 - 22074784
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  22074736 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 22074784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 109
Target Start/End: Original strand, 31478734 - 31478782
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31478734 gttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 31478782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 2076830 - 2076775
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  2076830 atgttgctatgttgtctatgatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 2076775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1643500 - 1643471
Alignment:
Q  166 attattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1643500 attattattaagtgaatattatgttatgtt 1643471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2076548 - 2076519
Alignment:
Q  166 attattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2076548 attattattaagtgaatattatgttatgtt 2076519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14471027 - 14470986
Alignment:
Q  110 atgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14471027 atgatgtatataattattattattaagtgatgattatattgt 14470986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Original strand, 18918513 - 18918554
Alignment:
Q  110 atgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18918513 atgatgtatataattattattattaagtgatgattatattgt 18918554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23400918 - 23400889
Alignment:
Q  166 attattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23400918 attattattaagtgaatattatgttatgtt 23400889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 7825382 - 7825301
Alignment:
Q  27 atgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgct----atgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttg 104  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||    |||||||||| ||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  7825382 atgttgtttatgatattgattatgattttgttatgttgcttatgatgttgtttatgatattgattatgatgttatgatgttg 7825301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16623710 - 16623662
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  16623710 gttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgttgctatg 16623662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10752300 - 10752096
Alignment:
Q  1 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |     
T  10752300 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgatatgttgctatgttgtgtaagatgttgattatgatattgttaa 10752201  T
Q  101 gttgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattga 200  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752200 gttattatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattga 10752101  T
Q  201 tgatg 205  Q
    |||||    
T  10752100 tgatg 10752096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 40724379 - 40724581
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  40724379 tgattatgatattgttatgtcgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagt 40724478  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40724479 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 40724578  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  40724579 atg 40724581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 19473528 - 19473729
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  19473528 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 19473627  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19473628 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 19473726  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  19473727 atg 19473729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20295163 - 20294962
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  20295163 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattttgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 20295064  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295063 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 20294965  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  20294964 atg 20294962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18355429 - 18355335
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18355429 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 18355335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10752338 - 10752232
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10752338 tgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgatatgt 10752239  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  10752238 tgctatg 10752232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10752566 - 10752464
Alignment:
Q  7 tatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| ||||||||    
T  10752566 tatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgttgct 10752467  T
Q  107 atg 109  Q
    |||    
T  10752466 atg 10752464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10752450 - 10752358
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatatt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10752450 tgattatgatattgttatgttgctatgttatttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatatt 10752358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10752492 - 10752384
Alignment:
Q  1 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |     
T  10752492 aatgattatgatattgttatgttgctatgttatttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttatttaacatgttgattatgatattgttac 10752393  T
Q  101 gttgctatg 109  Q
    |||||||||    
T  10752392 gttgctatg 10752384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 19473448 - 19473552
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  19473448 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 19473547  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  19473548 tgcta 19473552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 199
Target Start/End: Original strand, 20911821 - 20911909
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911821 tgatgtatataattgttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattg 20911909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 19473488 - 19473594
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  19473488 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 19473587  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  19473588 tgctatg 19473594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Original strand, 40724355 - 40724445
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40724355 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgtcgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatg 40724445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10752530 - 10752424
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  10752530 tgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgttgctatgttatttaacatgttgattatgatattgttatgt 10752431  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  10752430 tgctatg 10752424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 20295203 - 20295097
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||| | ||    
T  20295203 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattttgatattgttacgt 20295104  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  20295103 tgctatg 20295097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 110
Target Start/End: Original strand, 15237661 - 15237745
Alignment:
Q  26 tatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatga 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  15237661 tatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatga 15237745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 24768149 - 24768232
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24768149 tgatgtatataattgttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtg-atattatgttatgtt 24768232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 19473427 - 19473514
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19473427 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 19473514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 10752356 - 10752272
Alignment:
Q  25 ctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||    
T  10752356 ctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagataatgattatgatattgttatgttgctatg 10752272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Original strand, 15237678 - 15237744
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatg 69  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15237678 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 15237744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Original strand, 15237908 - 15237977
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15237908 ttattataaagtgatgaacatgttgttacatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 15237977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20295224 - 20295139
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgcta 107  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  20295224 ttgctatgttttttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgcta 20295139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 104
Target Start/End: Original strand, 15237589 - 15237667
Alignment:
Q  26 tatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||| ||||||    
T  15237589 tatgttgtttaacatattggttatgatattgttacgttgctatgttgtttaaaatattgagtatgatattgttatgttg 15237667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 120
Target Start/End: Original strand, 20911654 - 20911749
Alignment:
Q  24 gctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||    
T  20911654 gctatgttgtttaagatattgattatgatattgttt-gttgttatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttataatgttgtatat 20911749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 182
Target Start/End: Original strand, 15237795 - 15237851
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 182  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15237795 ttattataaagtgatgaacatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 15237851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 18355575 - 18355493
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  18355575 atgttgctatgttgtttaagatattgattacgatattgtt-tgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 18355493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Original strand, 15237609 - 15237704
Alignment:
Q  6 ttatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgc 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||        |||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||    
T  15237609 ttatgatattgttacgttgctatgttgtttaaaatattgagtatgatattgt--------tatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgc 15237700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 20911673 - 20911733
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttg 64  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20911673 tgattatgatattgtt-tgttgttatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 20911733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 24768016 - 24768071
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  24768016 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 24768071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Original strand, 24768018 - 24768077
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  24768018 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtatat 24768077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29447457 - 29447377
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  29447457 tgtatatgattattattattaagtgatgattatgttgtgctgtatatgattaa-tattattaagtgatgattatgttgtgtt 29447377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 11220081 - 11220041
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11220081 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtta 11220041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 11224667 - 11224627
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11224667 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtta 11224627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 11228490 - 11228450
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11228490 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtta 11228450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 11230479 - 11230439
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11230479 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtta 11230439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 18355551 - 18355496
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18355551 tgattacgatattgtt-tgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgtta 18355496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Original strand, 22108275 - 22108315
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22108275 tgatgtatataattattattattaagtgatgattatgttgt 22108315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 20295224 - 20295177
Alignment:
Q  62 ttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20295224 ttgctatgttttttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 20295177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11220079 - 11220037
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  11220079 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 11220037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11224665 - 11224623
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  11224665 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 11224623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11228488 - 11228446
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  11228488 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 11228446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11230477 - 11230435
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  11230477 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 11230435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 165
Target Start/End: Original strand, 22120420 - 22120474
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||    
T  22120420 tgatgtatataattattattattaagtgaagagtatgttgtattatatatgatta 22120474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 195
Target Start/End: Original strand, 40727230 - 40727259
Alignment:
Q  166 attattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40727230 attattattaagtgaatattatgttatgtt 40727259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29447417 - 29447334
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--attattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  29447417 tgtatatgattaatattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgattattattattattaagtgatgattatgttgtgtt 29447334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 83)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32371 - 32170
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  32371 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 32272  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32271 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 32173  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  32172 atg 32170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12714186 - 12713985
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  12714186 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 12714087  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714086 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 12713988  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  12713987 atg 12713985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18278705 - 18278504
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  18278705 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 18278606  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18278605 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 18278507  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  18278506 atg 18278504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 71651 - 71852
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  71651 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 71750  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71751 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 71849  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  71850 atg 71852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 75760 - 75961
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  75760 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 75859  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75860 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 75958  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  75959 atg 75961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 12705511 - 12705712
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  12705511 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 12705610  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12705611 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagttatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 12705709  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  12705710 atg 12705712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18282668 - 18282467
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  18282668 tgattatgatattgctatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 18282569  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18282568 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 18282470  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  18282469 atg 18282467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12718010 - 12717809
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  12718010 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 12717911  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717910 tgttatgatgtcgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattgttaagtgaatattatgttatgttattgatg 12717812  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  12717811 atg 12717809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12722921 - 12722720
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  12722921 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 12722822  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12722821 tgttatgatgtcgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattgttaagtgaatattatgttatgttattgatg 12722723  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  12722722 atg 12722720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26291626 - 26291441
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  26291626 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttaagt 26291527  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 188  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26291526 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgataaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 26291441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Original strand, 16908054 - 16908246
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttg-tttaagatgttggttatgatattgtgatg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| | |    
T  16908054 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgttttaagataatgattatgatattgttaag 16908153  T
Q  102 ttgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16908154 ttgttatgatgttgtgtataattgttactattaggtgatgaatatattgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatatcatgctatgtt 16908246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 18424917 - 18424781
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| | ||    
T  18424917 tgattatgatattgttatgttgctatgttatttaacatattgattatgatattgttattttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttaagt 18424818  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtga 139  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18424817 tgttatgatgttgtatataattgttattattaagtga 18424781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26291706 - 26291600
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26291706 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgt 26291607  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  26291606 tgctatg 26291600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 120
Target Start/End: Original strand, 45170794 - 45170911
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  45170794 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 45170893  T
Q  103 tgctatgatgatgtatat 120  Q
    || ||||||| |||||||    
T  45170894 tgttatgatgttgtatat 45170911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26291666 - 26291560
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  26291666 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 26291567  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  26291566 tgctatg 26291560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16116757 - 16116637
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatata 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||    
T  16116757 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgttgtgtata 16116658  T
Q  122 attgttattattaagtgatga 142  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16116657 attgttactattaagtgatga 16116637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 71571 - 71677
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  71571 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 71670  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  71671 tgctatg 71677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 75680 - 75786
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  75680 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 75779  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  75780 tgctatg 75786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18278745 - 18278639
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  18278745 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 18278646  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  18278645 tgctatg 18278639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Original strand, 45170983 - 45171076
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45170983 tgatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 45171076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 71531 - 71635
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  71531 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 71630  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  71631 tgcta 71635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 75640 - 75744
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  75640 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 75739  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  75740 tgcta 75744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16113604 - 16113484
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatata 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||    
T  16113604 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgctgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgttgtgtata 16113505  T
Q  122 attgttattattaagtgatga 142  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16113504 attgttactattaagtgatga 16113484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18424609 - 18424530
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18424609 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 18424530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 32411 - 32305
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  32411 tgattttgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 32312  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  32311 tgctatg 32305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 12705471 - 12705577
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  12705471 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 12705570  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  12705571 tgctatg 12705577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 12714226 - 12714120
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  12714226 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 12714127  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  12714126 tgctatg 12714120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 12714306 - 12714200
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  12714306 tgattatgatattgttatgttgctatattgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 12714207  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  12714206 tgctatg 12714200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 16908014 - 16908120
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  16908014 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 16908113  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  16908114 tgctatg 16908120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 71611 - 71715
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  71611 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 71710  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  71711 tgcta 71715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 75720 - 75824
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  75720 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 75819  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  75820 tgcta 75824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 2833078 - 2833162
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2833078 tgatgtatataattgttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 2833162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 12705431 - 12705535
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  12705431 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 12705530  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  12705531 tgcta 12705535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12714266 - 12714162
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  12714266 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 12714167  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  12714166 tgcta 12714162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39721466 - 39721383
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39721466 tgatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 39721383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 32451 - 32345
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  32451 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattttgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 32352  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  32351 tgctatg 32345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18282708 - 18282602
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  18282708 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttacgatattgattatgatattgctatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 18282609  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  18282608 tgctatg 18282602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18424958 - 18424853
Alignment:
Q  2 atgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||     
T  18424958 atgattatgatattgttattttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttatttaacatattgattatgatattgttatt 18424859  T
Q  102 ttgcta 107  Q
    ||||||    
T  18424858 ttgcta 18424853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18425034 - 18424933
Alignment:
Q  7 tatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgt-tggttatgatattgtgatgttgc 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||| || ||||    
T  18425034 tatgatattattatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttattttgc 18424935  T
Q  106 ta 107  Q
    ||    
T  18424934 ta 18424933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 7519918 - 7520002
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7519918 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattaatattaagggaatattatgttatgtt 7520002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 16907975 - 16908078
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  16907975 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtt-aagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 16908073  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  16908074 tgcta 16908078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18424998 - 18424891
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatat-tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| |||    
T  18424998 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttattttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttatg 18424899  T
Q  102 ttgctatg 109  Q
    ||||||||    
T  18424898 ttgctatg 18424891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26291730 - 26291640
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26291730 atgttgctatgttgtttaaggtgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatg 26291640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 71510 - 71597
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  71510 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 71597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 75619 - 75706
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  75619 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 75706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18278766 - 18278679
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18278766 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 18278679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 12705410 - 12705497
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12705410 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 12705497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 12718034 - 12717944
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  12718034 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 12717944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 12722945 - 12722855
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  12722945 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 12722855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12714327 - 12714242
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgcta 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  12714327 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatattgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgcta 12714242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 16907954 - 16908040
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16907954 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttg-ttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 16908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18282729 - 18282642
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  18282729 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttacgatattgattatgatattgctatgttgctatg 18282642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 45170773 - 45170860
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  45170773 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 45170860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 195
Target Start/End: Original strand, 2530979 - 2531045
Alignment:
Q  129 ttattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2530979 ttattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagagaatattatgttatgtt 2531045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 32472 - 32387
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgcta 107  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  32472 ttgctacgttgtttaaaatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattttgatactgttatgttgcta 32387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15083470 - 15083413
Alignment:
Q  137 tgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 194  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15083470 tgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 15083413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Original strand, 25928100 - 25928183
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--attattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25928100 tgtatataattattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgattattattattattaagtgaatattatgttatgtt 25928183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16116736 - 16116665
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  16116736 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 16116665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 2530902 - 2530963
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagat 80  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  2530902 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgttatgttgtttaagat 2530963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20487051 - 20486971
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20487051 tgtatataattattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgatt-attattattaagtgaatattacgttatgtt 20486971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18424722 - 18424666
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 182  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18424722 ttattataaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaat 18424666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 1859572 - 1859627
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1859572 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgatgtt 1859627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Original strand, 1859574 - 1859633
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1859574 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgatgttgtatat 1859633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16113583 - 16113512
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  16113583 tgattatgatattgttacgttgctatgctgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 16113512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 13919243 - 13919298
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  13919243 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 13919298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Original strand, 13919245 - 13919304
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  13919245 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtatat 13919304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 39721597 - 39721538
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  39721597 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtatat 39721538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 39721599 - 39721544
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  39721599 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 39721544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 18425034 - 18424972
Alignment:
Q  47 tatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18425034 tatgatattattatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 18424972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Original strand, 7519788 - 7519828
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7519788 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtta 7519828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 15083529 - 15083489
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15083529 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtta 15083489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 2832945 - 2833000
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  2832945 atgttgctatgttgtttaaaatattgattatgatatcgttatgttgttatgatgtt 2833000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12714327 - 12714281
Alignment:
Q  62 ttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctat 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12714327 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctat 12714281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 9752255 - 9752340
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattg-ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    ||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  9752255 tgatgtatataatttattattattaagtgatgattatgttgtattgtatataatttattattattaagtgatgattacgttatgtt 9752340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Original strand, 2832947 - 2833006
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || |||||| ||||||| |||||||    
T  2832947 gttgctatgttgtttaaaatattgattatgatatcgttatgttgttatgatgttgtatat 2833006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15083527 - 15083476
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatg 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||    
T  15083527 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttattatgatg 15083476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 103
Target Start/End: Original strand, 7519790 - 7519832
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  7519790 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 7519832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 44
Target Start/End: Original strand, 2530926 - 2530967
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattg 44  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2530926 tgattatgatattgctatgttgttatgttgtttaagatattg 2530967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Original strand, 25927991 - 25928048
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgttta 76  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  25927991 atgttgctatgttgtctatgatattgattatgatattgttatgttatgatgttgttta 25928048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 109
Target Start/End: Original strand, 2530904 - 2530952
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  2530904 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgttatg 2530952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8467805 - 8467742
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtt 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  8467805 ttattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attattattaagtgatgattatgtt 8467742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17231810 - 17231747
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtt 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  17231810 ttattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attattattaagtgatgattatgtt 17231747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 37728238 - 37728301
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtt 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  37728238 ttattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attattattaagtgatgattatgtt 37728301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 14758270 - 14758471
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  14758270 tgattatgatactgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 14758369  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758370 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 14758468  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  14758469 atg 14758471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9555792 - 9555591
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  9555792 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 9555693  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9555692 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 9555594  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  9555593 atg 9555591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 14955035 - 14955236
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  14955035 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 14955134  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14955135 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 14955233  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  14955234 atg 14955236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25689165 - 25688964
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  25689165 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 25689066  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689065 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 25688967  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  25688966 atg 25688964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12486947 - 12486746
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  12486947 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 12486848  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12486847 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaaatgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 12486749  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  12486748 atg 12486746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33741562 - 33741361
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||| | ||    
T  33741562 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtctaagataatgattatgattttgttaagt 33741463  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33741462 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgacgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 33741364  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  33741363 atg 33741361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 4562129 - 4562330
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  4562129 tgattatgatattgttatgttgctatgttatttaacatgttaattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 4562228  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4562229 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatatcatgttatgttattgatg 4562327  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  4562328 atg 4562330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Original strand, 5757673 - 5757855
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatata 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||    
T  5757673 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgttgtgtata 5757772  T
Q  122 attgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757773 attgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaaatgaatattatgttatgttattgatgatg 5757855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17807430 - 17807243
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  17807430 tgattatgatattgttatgttgctacattgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttaagt 17807331  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtta 191  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17807330 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatattatt-attattattaagtgaatatcatgtta 17807243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27533193 - 27533008
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  27533193 tgatcatgatattgttatgttgttaagttgtttaagatgttgagtatgatatggttatgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagt 27533094  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 188  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27533093 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 27533008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15224196 - 15224090
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  15224196 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgt 15224097  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  15224096 tgctatg 15224090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 33741682 - 33741576
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  33741682 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 33741583  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  33741582 tgctatg 33741576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15224116 - 15223979
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatat-tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| | |    
T  15224116 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttattttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttaag 15224017  T
Q  102 ttgctatgatgatgtatataattgttattattaagtga 139  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15224016 ttgttatgatgttgtatataattgttattattaagtga 15223979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 33741642 - 33741538
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  33741642 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgt 33741543  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  33741542 tgcta 33741538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 33741722 - 33741618
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  33741722 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgt 33741623  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  33741622 tgcta 33741618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 14758230 - 14758336
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  14758230 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 14758329  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  14758330 tgctatg 14758336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 25689205 - 25689099
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  25689205 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 25689106  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  25689105 tgctatg 25689099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27533313 - 27533207
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||| ||||    
T  27533313 tgatcatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgaatataatattgttatgt 27533214  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  27533213 tgctatg 27533207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 33741602 - 33741496
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  33741602 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 33741503  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  33741502 tgctatg 33741496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15224156 - 15224051
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgt-tggttatgatattgtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||     
T  15224156 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttatt 15224057  T
Q  102 ttgcta 107  Q
    ||||||    
T  15224056 ttgcta 15224051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 9555872 - 9555768
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  9555872 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 9555773  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  9555772 tgcta 9555768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12487027 - 12486923
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  12487027 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 12486928  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  12486927 tgcta 12486923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 20158183 - 20158267
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20158183 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 20158267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 20160859 - 20160943
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20160859 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 20160943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 20163637 - 20163721
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20163637 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 20163721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25689245 - 25689141
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  25689245 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 25689146  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  25689145 tgcta 25689141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27533355 - 27533247
Alignment:
Q  1 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |     
T  27533355 aatgaatatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgatcatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttac 27533256  T
Q  101 gttgctatg 109  Q
    |||||||||    
T  27533255 gttgctatg 27533247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 9555832 - 9555726
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  9555832 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 9555733  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  9555732 tgctatg 9555726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 12486987 - 12486881
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  12486987 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 12486888  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  12486887 tgctatg 12486881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 14954995 - 14955101
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  14954995 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 14955094  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  14955095 tgctatg 14955101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15224308 - 15224215
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattg 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||    
T  15224308 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatcttgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagataatgattatgatattg 15224215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 14954955 - 14955059
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  14954955 tgattatgatattgttatgttgctactttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 14955054  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  14955055 tgcta 14955059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15224416 - 15224327
Alignment:
Q  7 tatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattg 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||    
T  15224416 tatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatcttgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagataatgattatgatattg 15224327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 4562089 - 4562193
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  4562089 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttatttaacatgttaattatgatattgttatgt 4562188  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  4562189 tgcta 4562193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17807470 - 17807366
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  17807470 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctacattgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 17807371  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  17807370 tgcta 17807366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27533235 - 27533127
Alignment:
Q  1 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgat 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||  |||||||| || ||    
T  27533235 aatgaatataatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgatcatgatattgttatgttgttaagttgtttaagatgttgagtatgatatggttat 27533136  T
Q  101 gttgctatg 109  Q
    |||||||||    
T  27533135 gttgctatg 27533127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15223920 - 15223841
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15223920 ttattataaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 15223841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10712094 - 10712012
Alignment:
Q  112 gatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712094 gatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgcactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 10712012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10925864 - 10925782
Alignment:
Q  112 gatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10925864 gatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgcactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 10925782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 14758191 - 14758296
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  14758191 tgattatgatattgttacgttgctacgttgtt-aagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 14758289  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  14758290 tgctatg 14758296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 20158076 - 20158159
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20158076 tgatgtatataattgttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgatt-attattattaagtgaatattatgttatgtt 20158159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 9555893 - 9555806
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9555893 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 9555806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 12487048 - 12486961
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  12487048 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 12486961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15224217 - 15224130
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15224217 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 15224130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 25689266 - 25689179
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25689266 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 25689179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 33741743 - 33741656
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33741743 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 33741656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 20163530 - 20163613
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20163530 tgatgtatataattgttattattaagtcatgattatgttgtactatatatgatt-attattattaagtgaatattatgttatgtt 20163613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 4562068 - 4562155
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4562068 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 4562155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 14758170 - 14758256
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14758170 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctacgttg-ttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 14758256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 14954934 - 14955021
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14954934 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctactttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 14955021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15224329 - 15224242
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  15224329 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatcttgattatgatattgttacgttgctatg 15224242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17807491 - 17807406
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgcta 107  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  17807491 ttgctaagttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgcta 17807406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27533273 - 27533172
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||    
T  27533273 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgaatataatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgatcatgatattgttatgt 27533174  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  27533173 tg 27533172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 20160752 - 20160835
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20160752 tgatgtttataattgttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgatt-attattattcagtgaatattatgttatgtt 20160835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27533377 - 27533287
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||||||||    
T  27533377 atgttgctatgttgtttaagataatgaatatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgatcatgatattgttatgttgctatg 27533287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15224076 - 15224004
Alignment:
Q  2 atgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  15224076 atgattatgatattgttattttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 15224004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15224380 - 15224282
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||        |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  15224380 tgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagataatgattatgata--------ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgt 15224289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 5757694 - 5757765
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  5757694 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 5757765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 10712236 - 10712181
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  10712236 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatattgttatgttgtt 10712181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 10926006 - 10925951
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  10926006 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatattgttatgttgtt 10925951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 20157943 - 20157998
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  20157943 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 20157998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Original strand, 20157945 - 20158004
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  20157945 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtatat 20158004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 20160619 - 20160674
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  20160619 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 20160674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Original strand, 20160621 - 20160680
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  20160621 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtatat 20160680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15224416 - 15224354
Alignment:
Q  47 tatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  15224416 tatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatcttgattatgatattgttacgttgctatg 15224354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 20163397 - 20163452
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  20163397 atgtttctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 20163452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 120
Target Start/End: Original strand, 20163403 - 20163458
Alignment:
Q  65 ctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  20163403 ctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtatat 20163458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12423180 - 12423140
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12423180 tgatgtatataattattattattaagtgatgattatgttgt 12423140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Original strand, 23996834 - 23996874
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23996834 tgatgtatataattattattattaagtgatgattatgttgt 23996874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27532898 - 27532857
Alignment:
Q  110 atgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27532898 atgatgtatataattattattattaagtgatgattatattgt 27532857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10712234 - 10712198
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10712234 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgt 10712198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10926004 - 10925968
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10926004 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgt 10925968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 129)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22320929 - 22320728
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  22320929 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 22320830  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22320829 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 22320731  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  22320730 atg 22320728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22335984 - 22335783
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  22335984 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 22335885  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22335884 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 22335786  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  22335785 atg 22335783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7108961 - 7108760
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  7108961 tgattttgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 7108862  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7108861 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 7108763  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  7108762 atg 7108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7112896 - 7112695
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  7112896 tgattttgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 7112797  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7112796 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 7112698  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  7112697 atg 7112695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 11166372 - 11166573
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  11166372 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 11166471  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11166472 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaaatgaatattatgttatgttattgatg 11166570  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  11166571 atg 11166573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 4589683 - 4589870
Alignment:
Q  1 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |     
T  4589683 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaa 4589782  T
Q  101 gttgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 188  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4589783 gttgttatgatgttgcatataattgttactattaagtgatgattatgttgtcctatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 4589870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11069413 - 11069212
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  11069413 tgattatgatattgtcatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 11069314  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11069313 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaaatgaatattatattatgttattgatg 11069215  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  11069214 atg 11069212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14498670 - 14498469
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  14498670 tgattatgatattgttatgttgctacattgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagataatggttatgatattgttaagt 14498571  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14498570 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattgttaagtgaatattatgttatgttattgatg 14498472  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  14498471 atg 14498469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 17317980 - 17318182
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  17317980 tgattatgatattgttatgttgtcatgttgtttaagatgttggttatgatattgttatgttgctatgttgtgaaagatattgattatgatattgttaagt 17318079  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318080 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaatatgttgatctatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 17318179  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  17318180 atg 17318182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Original strand, 8489940 - 8490108
Alignment:
Q  27 atgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatataattgt 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8489940 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtatataattgt 8490039  T
Q  127 tattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490040 tactattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 8490108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28949088 - 28948906
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatata 121  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||    
T  28949088 ttgctatgttgtttaagatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatactgttatgttgttatgatgttgtgtata 28948989  T
Q  122 attgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28948988 attgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 28948906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 55022231 - 55022049
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatata 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||    
T  55022231 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagataataattatgatattgttaagttgttatgatgttgtgtata 55022132  T
Q  122 attgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022131 attgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaaatgaatattatgttatgttattgatgatg 55022049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30065105 - 30064911
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  30065105 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtta--------tgttgtttaacatgttgattatgatattgttaagt 30065014  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| || |||||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30065013 tgttatgatgttgcatataattgttactaataagtgatgattatgttgtcctatataggattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 30064914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19774773 - 19774613
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatata 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  19774773 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgttacgttgtttaacatattgattatgatattgttaagttgttatgatgctgtatata 19774674  T
Q  122 attgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 182  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774673 attgttactattaagtgatggatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaat 19774613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 205
Target Start/End: Original strand, 4108142 - 4108284
Alignment:
Q  62 ttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatg 161  Q
    |||||| ||||||||||||  || |||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4108142 ttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatg 4108241  T
Q  162 attaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4108242 attaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 4108284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 205
Target Start/End: Original strand, 4111994 - 4112136
Alignment:
Q  62 ttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatg 161  Q
    |||||| ||||||||||||  || |||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4111994 ttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatg 4112093  T
Q  162 attaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4112094 attaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 4112136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 205
Target Start/End: Original strand, 27411026 - 27411123
Alignment:
Q  108 tgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27411026 tgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgataaattattattaagtaaatattatgttatgttattgatgatg 27411123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 17317940 - 17318046
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17317940 tgattatgatattgttatgtagctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgtcatgttgtttaagatgttggttatgatattgttatgt 17318039  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  17318040 tgctatg 17318046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19774904 - 19774798
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  19774904 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaaaatgttgattatgatattgttacgt 19774805  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  19774804 tgctatg 19774798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 188
Target Start/End: Original strand, 27410807 - 27410953
Alignment:
Q  42 ttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatg 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  27410807 ttgattatgatattgttatgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagttgttaggatgttgtatataattgttactattaagtgacg 27410906  T
Q  142 aatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 188  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27410907 agtatgttgtactatatatgattaattattattaactgaatgttatg 27410953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 14067378 - 14067484
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  14067378 tgattatgatattgttatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttctctaacatgttgattatgatattgttatgt 14067477  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  14067478 tgctatg 14067484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15964093 - 15964000
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15964093 tgatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 15964000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 27410408 - 27410514
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  27410408 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgt 27410507  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  27410508 tgctatg 27410514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 16751412 - 16751549
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatat-tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| | |    
T  16751412 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttattttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttaag 16751511  T
Q  102 ttgctatgatgatgtatataattgttattattaagtga 139  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16751512 ttgttatgatgttgtatataattgttactattaagtga 16751549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19774864 - 19774771
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19774864 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaaaatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg 19774771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22321009 - 22320905
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  22321009 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 22320910  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  22320909 tgcta 22320905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22336064 - 22335960
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  22336064 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 22335965  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  22335964 tgcta 22335960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 205
Target Start/End: Original strand, 16751608 - 16751687
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751608 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 16751687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19774556 - 19774477
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774556 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 19774477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 27410448 - 27410539
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatat 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  27410448 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatatagattatgatat 27410539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 11166332 - 11166438
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  11166332 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 11166431  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  11166432 tgctatg 11166438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 14067458 - 14067552
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  14067458 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtctaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgcttaagatattgattatgatattgt 14067552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15964290 - 15964196
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15964290 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgt 15964196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15968017 - 15967924
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15968017 tgatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgactaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 15967924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15968214 - 15968120
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15968214 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgt 15968120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15971941 - 15971848
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15971941 tgatgtatacaagtgttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 15971848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15972138 - 15972044
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15972138 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgt 15972044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22320969 - 22320863
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  22320969 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 22320870  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  22320869 tgctatg 22320863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22336024 - 22335918
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  22336024 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 22335925  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  22335924 tgctatg 22335918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 30065245 - 30065140
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  30065245 tgattatgatattgttatattgctatgttgtttaacagattgattatgatattgttatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgt 30065146  T
Q  103 tgctat 108  Q
    ||||||    
T  30065145 tgctat 30065140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 7109041 - 7108937
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| ||||    
T  7109041 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaaaatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattttgatactgttatgt 7108942  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  7108941 tgcta 7108937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 7112976 - 7112872
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| ||||    
T  7112976 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaaaatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattttgatactgttatgt 7112877  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  7112876 tgcta 7112872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14664878 - 14664794
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14664878 tgatgtatataattgttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 14664794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14668042 - 14667958
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668042 tgatgtatataattgttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 14667958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 103
Target Start/End: Original strand, 16751073 - 16751169
Alignment:
Q  7 tatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgtt 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  16751073 tatgatattattatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttatttaacatgttgattatgatattgttatgtt 16751169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 5220406 - 5220303
Alignment:
Q  17 ttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgt 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  5220406 ttatgttgctatgttgtttaaaatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtctaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgt 5220307  T
Q  117 atat 120  Q
    ||||    
T  5220306 atat 5220303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 37440489 - 37440572
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37440489 tgatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 37440572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 7109001 - 7108895
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  7109001 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattttgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 7108902  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  7108901 tgctatg 7108895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 7112936 - 7112830
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  7112936 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattttgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 7112837  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  7112836 tgctatg 7112830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Original strand, 11166298 - 11166396
Alignment:
Q  9 tgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgcta 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  11166298 tgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgcta 11166396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19774928 - 19774838
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19774928 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 19774838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Original strand, 16751240 - 16751317
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagat 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16751240 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttaccttgctatgttgtttaagat 16751317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 94
Target Start/End: Original strand, 27410635 - 27410719
Alignment:
Q  10 gatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  27410635 gatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatatagattatgatat 27410719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 14067418 - 14067524
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  14067418 tgattatgatattgttacgttgctatgttctctaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtctaacatgttgattatgatattgttacgt 14067517  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  14067518 tgctatg 14067524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Original strand, 17317876 - 17317966
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||    
T  17317876 atgttgctatgttgtttaacatattggttatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgctgattatgatattgttatgtagctatg 17317966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5220231 - 5220147
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5220231 tgatgtatataattgtcattattaagtgatgaatatgatgtactatatatgattaattattattaagagaatattatgttatgtt 5220147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 8490132 - 8490215
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490132 tgatgtatataattgttat-attaagttatgaatatgttgtacgatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 8490215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 195
Target Start/End: Original strand, 11301266 - 11301346
Alignment:
Q  115 gtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11301266 gtatataattgttattattaagtggcgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 11301346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22321030 - 22320943
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22321030 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 22320943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22336085 - 22335998
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22336085 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 22335998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 27410387 - 27410474
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27410387 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 27410474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Original strand, 27410529 - 27410620
Alignment:
Q  4 gattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatatt 95  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  27410529 gattatgatatggttatattcctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaacatattgattatgatatt 27410620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 104
Target Start/End: Original strand, 17317903 - 17318001
Alignment:
Q  6 ttatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||    
T  17317903 ttatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgctgattatgatattgttatgtagctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttg 17318001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 27410488 - 27410594
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  27410488 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatatagattatgatatggttatattcctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgt 27410587  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  27410588 tgctatg 27410594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 30065122 - 30065044
Alignment:
Q  26 tatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  30065122 tatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttg 30065044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 30065325 - 30065219
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || |    
T  30065325 tgattatgatattcatacgttgctatgtcgtttaagatattgattatggtattgttacgttgctatgtcgtttaagatattgattatgatattgttatat 30065226  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  30065225 tgctatg 30065219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Original strand, 27410709 - 27410809
Alignment:
Q  4 gattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgtt 103  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||    
T  27410709 gattatgatatggttatattcctatgttgtttaacatgttgattatcatattgttacgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattattatgtt 27410808  T
Q  104 g 104  Q
    |    
T  27410809 g 27410809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 5220489 - 5220402
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatg 90  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  5220489 tgattatgatcttgttatgttgctatgttgtttaaaatattgattatgatcttgttatgttgctatgttgtttaaaatattgattatg 5220402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 7109062 - 7108975
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7109062 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaaaatattgattatgatattgttatgttgctatg 7108975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 7112997 - 7112910
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7112997 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaaaatattgattatgatattgttatgttgctatg 7112910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Original strand, 16751170 - 16751266
Alignment:
Q  5 attatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  16751170 attatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgata--------ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 16751261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 97
Target Start/End: Original strand, 16751219 - 16751294
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16751219 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgt 16751294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Original strand, 4589661 - 4589751
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  4589661 atgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatg 4589751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5220513 - 5220423
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  5220513 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatcttgttatgttgctatgttgtttaaaatattgattatgatcttgttatgttgctatg 5220423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11853993 - 11853911
Alignment:
Q  116 tatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttatt 198  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11853993 tatataattattattattaactggtgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatattatt 11853911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Original strand, 16751391 - 16751477
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgt-tggttatgatattgtgatgttgcta 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| || ||||||    
T  16751391 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttattttgcta 16751477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 27410668 - 27410774
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| | ||    
T  27410668 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatatagattatgatatggttatattcctatgttgtttaacatgttgattatcatattgttacgt 27410767  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  27410768 tgctatg 27410774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 30065285 - 30065179
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| || |    
T  30065285 tgattatggtattgttacgttgctatgtcgtttaagatattgattatgatattgttatattgctatgttgtttaacagattgattatgatattgttatat 30065186  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  30065185 tgctatg 30065179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14498691 - 14498606
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgcta 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  14498691 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacattgtttaagatattgattatgatattgttatgttgcta 14498606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 8489956 - 8490027
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  8489956 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 8490027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11069434 - 11069347
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  11069434 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgtcatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 11069347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 11166272 - 11166358
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11166272 ttgctatgttgtttaacatgttgatt-tgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 11166358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15964311 - 15964224
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  15964311 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 15964224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15968235 - 15968148
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  15968235 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 15968148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15972159 - 15972072
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  15972159 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 15972072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 14067498 - 14067601
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||   |  || ||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  14067498 tgattatgatattgttacgttgctatgttgcttaagatattgattatgatattgtta---tattacgttgtttaacatgttgattatgttattgttatgt 14067594  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  14067595 tgctatg 14067601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Original strand, 16751452 - 16751524
Alignment:
Q  2 atgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  16751452 atgattatgatattgttattttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 16751524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 5220380 - 5220309
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  5220380 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtctaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 5220309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 30065346 - 30065259
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||    
T  30065346 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattcatacgttgctatgtcgtttaagatattgattatggtattgttacgttgctatg 30065259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15616760 - 15616699
Alignment:
Q  143 atatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15616760 atatgttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 15616699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14670311 - 14670231
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670311 tgtatataattattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgatta-ttattattaagtgaatattatgttatgtt 14670231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 103
Target Start/End: Original strand, 16751280 - 16751381
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatat-tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| |||    
T  16751280 tgattatgatattgttaccttgctatgttgtttaagatatatgattatgatatttttattttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttatg 16751379  T
Q  102 tt 103  Q
    ||    
T  16751380 tt 16751381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 27410808 - 27410869
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttg 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27410808 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagttg 27410869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Original strand, 16751109 - 16751165
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16751109 tgattatgatattgttatgttgctatgttatttaacatgttgattatgatattgtta 16751165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 109
Target Start/End: Original strand, 16751320 - 16751438
Alignment:
Q  2 atgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacg-----------ttgctatgttgtttaagatgttggttatg 90  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |           |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16751320 atgattatgatatttttattttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttattatgatattgctatgttgtttaacatgttgattatg 16751419  T
Q  91 atattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  16751420 atattgttacgttgctatg 16751438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 27410568 - 27410620
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatatt 55  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27410568 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaacatattgattatgatatt 27410620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 15964250 - 15964195
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtt 58  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15964250 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtt 15964195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 15968174 - 15968119
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtt 58  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15968174 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtt 15968119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 15972098 - 15972043
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtt 58  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15972098 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtt 15972043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Original strand, 14067374 - 14067444
Alignment:
Q  39 atattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  14067374 atattgattatgatattgttatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 14067444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19774752 - 19774686
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatg 69  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19774752 tgattatgatattgttacgttgttacgttgtttaacatattgattatgatattgttaagttgttatg 19774686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14681833 - 14681753
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681833 tgtatataatgattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgatta-ttattattaagtgaatattatgttatgtt 14681753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 27410748 - 27410800
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatatt 55  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27410748 tgattatcatattgttacgttgctatgttgtttaacatattgattatgatatt 27410800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 28949067 - 28948996
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  28949067 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatactgttatgttgttatgatgtt 28948996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 55022210 - 55022139
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  55022210 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagataataattatgatattgttaagttgttatgatgtt 55022139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Original strand, 27410624 - 27410694
Alignment:
Q  39 atattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  27410624 atattgatcacgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 27410694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14665009 - 14664950
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  14665009 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtatat 14664950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 14665011 - 14664956
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  14665011 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 14664956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 109
Target Start/End: Original strand, 16751073 - 16751135
Alignment:
Q  47 tatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16751073 tatgatattattatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 16751135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12338949 - 12338908
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgtt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12338949 tgatgtatataattgttattattaagtggtgaatatgttgtt 12338908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 14668167 - 14668127
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14668167 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtta 14668127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Original strand, 37440376 - 37440416
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37440376 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtta 37440416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 14670423 - 14670368
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  14670423 atgttgctatgttgtttatgatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 14670368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15464457 - 15464410
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatg 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15464457 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 15464410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Original strand, 14067538 - 14067603
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgtt 71  Q
    |||||||||||||||||| || |   |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14067538 tgattatgatattgttatattac---gttgtttaacatgttgattatgttattgttatgttgctatgtt 14067603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 205
Target Start/End: Original strand, 14159826 - 14159860
Alignment:
Q  171 tattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14159826 tattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 14159860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 15464457 - 15464408
Alignment:
Q  62 ttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgat 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  15464457 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgat 15464408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14670421 - 14670370
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatg 112  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  14670421 gttgctatgttgtttatgatattgattatgatattgttatgttgttatgatg 14670370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 200
Target Start/End: Original strand, 4589991 - 4590025
Alignment:
Q  166 attattattaagtgaatattatgttatgttattga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4589991 attattattaagtgaatattatgttatgttgttga 4590025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 103
Target Start/End: Original strand, 37440378 - 37440420
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  37440378 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtt 37440420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16613466 - 16613398
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  16613466 ttattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attattattaagtgatgattatgttgtgtt 16613398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Original strand, 22045787 - 22045855
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  22045787 ttattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attattattaagtgatgattatgttgtgtt 22045855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22651542 - 22651462
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  22651542 tgtatatgattatgattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attattattaagtgatgattatgttgtgtt 22651462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Original strand, 4108142 - 4108194
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  4108142 ttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 4108194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Original strand, 4111994 - 4112046
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  4111994 ttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 4112046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11854199 - 11854139
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaa-gatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  11854199 gttgctatgttgtttaaaggtattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtatat 11854139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11854201 - 11854145
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaaca-tattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  11854201 atgttgctatgttgtttaaaggtattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 11854145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 14668165 - 14668129
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14668165 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgt 14668129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 14681945 - 14681905
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  14681945 atgttgctatgttgtctatgatattgattatgatattgtta 14681905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 24629323 - 24629524
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  24629323 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 24629422  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24629423 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 24629521  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  24629522 atg 24629524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 27384242 - 27384443
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  27384242 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 27384341  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27384342 tgttatgatgttgtgtataattgttactattgagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 27384440  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  27384441 atg 27384443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27601094 - 27600893
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  27601094 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 27600995  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27600994 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaaatgaatattatgttatgttattgatg 27600896  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  27600895 atg 27600893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 30345859 - 30346060
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  30345859 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 30345958  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30345959 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 30346057  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  30346058 atg 30346060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 10102652 - 10102853
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  10102652 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 10102751  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10102752 tgttatgttgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 10102850  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  10102851 atg 10102853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24648617 - 24648416
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |  |    
T  24648617 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaaat 24648518  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24648517 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 24648419  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  24648418 atg 24648416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 27380196 - 27380397
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  27380196 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 27380295  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380296 tgttatgatgttgtgtacaattgttactattgagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 27380394  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  27380395 atg 27380397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Original strand, 12902268 - 12902420
Alignment:
Q  42 ttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatg 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12902268 ttgattatgatattgttatgttgctatgttatgtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatg 12902367  T
Q  142 aatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12902368 aatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatatcatgctatgtt 12902420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1282605 - 1282512
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1282605 tgatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 1282512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Original strand, 41531925 - 41532018
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531925 tgatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 41532018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 30345779 - 30345883
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  30345779 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 30345878  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  30345879 tgcta 30345883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 10102612 - 10102718
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  10102612 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatgttgattatgatattgttacgt 10102711  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  10102712 tgctatg 10102718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 24629283 - 24629389
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  24629283 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 24629382  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  24629383 tgctatg 24629389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 24648657 - 24648551
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  24648657 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 24648558  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  24648557 tgctatg 24648551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 30345819 - 30345925
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  30345819 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 30345918  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  30345919 tgctatg 30345925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 24629243 - 24629347
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  24629243 tgattatgatattgttatgttgctactttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 24629342  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  24629343 tgcta 24629347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31344363 - 31344279
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31344363 tgatgtatataattgtcattattaagtgatgattatgttgtaccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 31344279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27601134 - 27601028
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||    
T  27601134 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttacgt 27601035  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  27601034 tgctatg 27601028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 24648694 - 24648593
Alignment:
Q  6 ttatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgc 105  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  24648694 ttatgatattgtcatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgc 24648595  T
Q  106 ta 107  Q
    ||    
T  24648594 ta 24648593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 10102411 - 10102518
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattg-tgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||     
T  10102411 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtctaacatgttgattacgatattgttatgttgctatgttgtctaacatgttgattatgatattgttgata 10102510  T
Q  102 ttgctatg 109  Q
    ||||||||    
T  10102511 ttgctatg 10102518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 10102532 - 10102636
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  10102532 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgatatattgctatgttgtctaacatgttgattatgatactgttatgt 10102631  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  10102632 tgcta 10102636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 10102572 - 10102676
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  10102572 tgattatgatattgatatattgctatgttgtctaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgt 10102671  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  10102672 tgcta 10102676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 10102491 - 10102598
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgtt-atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatg 101  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  ||     
T  10102491 tgattatgatattgttgatattgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgatata 10102590  T
Q  102 ttgctatg 109  Q
    ||||||||    
T  10102591 ttgctatg 10102598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 30345758 - 30345845
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30345758 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 30345845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 10102390 - 10102477
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  10102390 ttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtctaacatgttgattacgatattgttatgttgctatg 10102477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 24629222 - 24629309
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24629222 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctactttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 24629309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 27380175 - 27380262
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  27380175 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 27380262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 27384221 - 27384308
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  27384221 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 27384308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27601155 - 27601068
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27601155 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 27601068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 24648718 - 24648631
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24648718 ttgctatgttgtttaacatgttggttatgatattgtcatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 24648631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 104
Target Start/End: Original strand, 12902191 - 12902270
Alignment:
Q  25 ctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttg 104  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | ||||||    
T  12902191 ctatgttgattaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattattatgttg 12902270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 97
Target Start/End: Original strand, 41531747 - 41531822
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41531747 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgt 41531822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 12902209 - 12902261
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatatt 55  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902209 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaacatattgattatgatatt 12902261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 12902269 - 12902340
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  12902269 tgattatgatattgttatgttgctatgttatgtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 12902340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 41531768 - 41531839
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  41531768 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatattgttatgttgtt 41531839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1282746 - 1282691
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  1282746 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatattgttatgttgtt 1282691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 31344496 - 31344446
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatg 69  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31344496 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatg 31344446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 20319573 - 20319656
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  20319573 tgatgtatataattattattattaagtaatgattatgttgtgatttatatgatt-attattattaagtgatgattatgttgtgtt 20319656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 31344494 - 31344435
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||    
T  31344494 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatattgtatat 31344435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9784287 - 9784216
Alignment:
Q  124 tgttattattaag-tgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784287 tgttattattaagataatgattatgttgtattagatatgatta-ttattattaagtgaatattatgttatgtt 9784216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 107
Target Start/End: Original strand, 41531747 - 41531792
Alignment:
Q  62 ttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgcta 107  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  41531747 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgcta 41531792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1282744 - 1282708
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1282744 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgt 1282708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1009985 - 1009784
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  1009985 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 1009886  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1009885 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 1009787  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  1009786 atg 1009784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 1925997 - 1926198
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  1925997 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 1926096  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1926097 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 1926195  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  1926196 atg 1926198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 20925011 - 20925212
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  20925011 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 20925110  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20925111 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 20925209  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  20925210 atg 20925212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 16376248 - 16376449
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||| | ||    
T  16376248 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattttgatattgttacgttgctatgttgtttaaaataatgattatgatattgttaagt 16376347  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376348 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 16376446  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  16376447 atg 16376449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 52635056 - 52634855
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  52635056 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatatttttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 52634957  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634956 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgatt-agtattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 52634858  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  52634857 atg 52634855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 20229755 - 20229928
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20229755 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatgatgttgtat 20229854  T
Q  119 ataattgtta----ttattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 188  Q
    ||||||||||     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20229855 ataattgttactatatattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 20229928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Original strand, 41389130 - 41389310
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatat-tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| | |    
T  41389130 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttattttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttaag 41389229  T
Q  102 ttgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 182  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41389230 ttgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 41389310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Original strand, 39244691 - 39244862
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  39244691 tgattacgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg--------ctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttaagt 39244782  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 182  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244783 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgatggatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaat 39244862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 182
Target Start/End: Original strand, 39248246 - 39248417
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  39248246 tgattacgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg--------ctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttaagt 39248337  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaat 182  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39248338 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgatggatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaat 39248417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 41388918 - 41389024
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  41388918 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgt 41389017  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  41389018 tgctatg 41389024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 41388958 - 41389063
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgt-tggttatgatattgtgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||     
T  41388958 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttatt 41389057  T
Q  102 ttgcta 107  Q
    ||||||    
T  41389058 ttgcta 41389063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1010065 - 1009961
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  1010065 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 1009966  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  1009965 tgcta 1009961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 1925917 - 1926021
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  1925917 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 1926016  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  1926017 tgcta 1926021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 20924931 - 20925035
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  20924931 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 20925030  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  20925031 tgcta 20925035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21406712 - 21406604
Alignment:
Q  21 gttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  21406712 gttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttaagttgttatgatgttgtatat 21406613  T
Q  121 aattgttat 129  Q
    |||| ||||    
T  21406612 aattattat 21406604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 103
Target Start/End: Original strand, 41388751 - 41388847
Alignment:
Q  7 tatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgtt 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  41388751 tatgatattattatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgtt 41388847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 52635136 - 52635032
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  52635136 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 52635037  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  52635036 tgcta 52635032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33796731 - 33796634
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattatt---attaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33796731 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaattattattattaagtgaatattatgttatgttattgaagatg 33796634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 205
Target Start/End: Original strand, 39244919 - 39244998
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244919 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 39244998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 205
Target Start/End: Original strand, 39248474 - 39248553
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39248474 ttattataaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 39248553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1010025 - 1009919
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  1010025 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 1009926  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  1009925 tgctatg 1009919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 1925957 - 1926063
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  1925957 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 1926056  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  1926057 tgctatg 1926063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 20924971 - 20925077
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  20924971 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 20925070  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  20925071 tgctatg 20925077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 16376208 - 16376314
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||| | ||    
T  16376208 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattttgatattgttacgt 16376307  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  16376308 tgctatg 16376314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 52635096 - 52634990
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | | ||    
T  52635096 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatatttttacgt 52634997  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  52634996 tgctatg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 41388897 - 41388984
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41388897 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 41388984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 205
Target Start/End: Original strand, 41389367 - 41389446
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41389367 ttattataaagtgatgaatatgttgtttcatatatgattaattattattaagtgaatattatattatgttattgatgatg 41389446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1010086 - 1009999
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1010086 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 1009999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 1925896 - 1925983
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1925896 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 1925983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 20924910 - 20924997
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20924910 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 20924997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Original strand, 16376187 - 16376272
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgcta 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  16376187 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgcta 16376272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 39244667 - 39244744
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattg 96  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  39244667 atgttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg 39244744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 39248222 - 39248299
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattg 96  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  39248222 atgttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg 39248299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Original strand, 41388848 - 41388944
Alignment:
Q  5 attatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  41388848 attatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgata--------ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttg 41388939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 52635153 - 52635070
Alignment:
Q  26 tatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  52635153 tatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 52635070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Original strand, 41389109 - 41389195
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgt-tggttatgatattgtgatgttgcta 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| || ||||||    
T  41389109 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttattttgcta 41389195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 103
Target Start/End: Original strand, 41388998 - 41389099
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatat-tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| |||    
T  41388998 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatatatgattatgatattgttattttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttatg 41389097  T
Q  102 tt 103  Q
    ||    
T  41389098 tt 41389099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 20229779 - 20229850
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20229779 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatgatgtt 20229850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Original strand, 41388787 - 41388843
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41388787 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgtta 41388843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 109
Target Start/End: Original strand, 41389038 - 41389156
Alignment:
Q  2 atgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacg-----------ttgctatgttgtttaagatgttggttatg 90  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |           |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41389038 atgattatgatattgttattttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttattatgatattgctatgttgtttaacatgttgattatg 41389137  T
Q  91 atattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  41389138 atattgttacgttgctatg 41389156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Original strand, 41389170 - 41389242
Alignment:
Q  2 atgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  41389170 atgattatgatattgttattttgctacgttgtttaacatattgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 41389242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21406690 - 21406619
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  21406690 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 21406619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 33796877 - 33796777
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  33796877 atgttgctatgttgtttaagatattgattacgatattgtt-tgttgttacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgtcgttatgatgttgtat 33796779  T
Q  119 at 120  Q
    ||    
T  33796778 at 33796777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Original strand, 41801000 - 41801080
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41801000 tgtatataattattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgatt-attattattaagtgaatattatgttatgtt 41801080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 109
Target Start/End: Original strand, 41388751 - 41388813
Alignment:
Q  47 tatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41388751 tatgatattattatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatg 41388813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 109
Target Start/End: Original strand, 16376187 - 16376234
Alignment:
Q  62 ttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16376187 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctatg 16376234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 180
Target Start/End: Original strand, 13883343 - 13883411
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--attattattaagtga 180  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||  |||||||||||||||    
T  13883343 tgtatatgattattattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgattattattattattaagtga 13883411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 20308021 - 20307984
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20308021 tgtatataattattattattaagtgatgattatgttgt 20307984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21406399 - 21406358
Alignment:
Q  110 atgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21406399 atgatgtatataattattattattaagtgatgattatattgt 21406358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21406498 - 21406469
Alignment:
Q  166 attattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21406498 attattattaagtgaatattatgttatgtt 21406469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 22131622 - 22131667
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttg 64  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  22131622 atgttgctatgttgtttatgatattgattatgatgttgttatgttg 22131667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Original strand, 22131966 - 22132006
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22131966 tgatgtatataattattattgttaagtgatgattatgttgt 22132006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 109
Target Start/End: Original strand, 39244669 - 39244717
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  39244669 gttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgttgctatg 39244717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 109
Target Start/End: Original strand, 39248224 - 39248272
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  39248224 gttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgttgctatg 39248272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 41306397 - 41306460
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtt 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  41306397 ttattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attattattaagtgatgattatgtt 41306460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 48519723 - 48519683
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  48519723 atgttgctatgttgtttatgatattgattatgatgttgtta 48519683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11764 - 11563
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  11764 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 11665  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11664 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaaatgaatattatgttatgttattgatg 11566  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  11565 atg 11563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11785 - 11698
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  11785 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 11698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 33530 - 33731
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  33530 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 33629  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33630 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaaatgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 33728  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  33729 atg 33731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 33450 - 33554
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  33450 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 33549  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  33550 tgcta 33554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 33490 - 33596
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  33490 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 33589  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  33590 tgctatg 33596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 33429 - 33516
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33429 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 33516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 21977476 - 21977677
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  21977476 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacattgtttaagataatgattatgatattgttaagt 21977575  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21977576 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 21977674  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  21977675 atg 21977677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43251073 - 43250872
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |  |    
T  43251073 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaaat 43250974  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43250973 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaaatgaatattatgttatgttattgatg 43250875  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  43250874 atg 43250872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22111294 - 22111112
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatata 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||    
T  22111294 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgttgtgtata 22111195  T
Q  122 attgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111194 attgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaaatgaatattatgttatgttattgatgatg 22111112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 21973385 - 21973582
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  21973385 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacattgtttaagataatgattatgatattgttaagt 21973484  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgat 201  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973485 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgataaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgat 21973582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Original strand, 15924099 - 15924284
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  15924099 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgagtaagatattgattatgatattgttaagt 15924198  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 188  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15924199 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatgttatg 15924284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21386683 - 21386515
Alignment:
Q  27 atgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatataattgt 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21386683 atgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgttatgatgttgtatataattgt 21386584  T
Q  127 tattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21386583 tactattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 21386515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 15924059 - 15924165
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15924059 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgt 15924158  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  15924159 tgctatg 15924165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Original strand, 15924035 - 15924125
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15924035 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgttgattatgatattgttatgttgctatg 15924125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Original strand, 21828928 - 21829021
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828928 tgatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 21829021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Original strand, 30941062 - 30941155
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30941062 tgatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 30941155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 21977436 - 21977540
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  21977436 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 21977535  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  21977536 tgcta 21977540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 43251153 - 43251049
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  43251153 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 43251054  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  43251053 tgcta 43251049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 30940865 - 30940959
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30940865 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgt 30940959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 43251113 - 43251007
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  43251113 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgt 43251014  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  43251013 tgctatg 43251007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Original strand, 14398594 - 14398695
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  14398594 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtat 14398693  T
Q  119 at 120  Q
    ||    
T  14398694 at 14398695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 107
Target Start/End: Original strand, 21973348 - 21973449
Alignment:
Q  6 ttatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgc 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  21973348 ttatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgc 21973447  T
Q  106 ta 107  Q
    ||    
T  21973448 ta 21973449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21386491 - 21386407
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21386491 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatgttatgttatgtt 21386407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21410171 - 21410088
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21410171 tgatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 21410088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21804663 - 21804580
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21804663 tgatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgt 21804580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 14398755 - 14398839
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14398755 tgatgtatataattgttattattaagtaatgaatatgttgtaatatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 14398839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 21977415 - 21977502
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21977415 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 21977502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 43251174 - 43251087
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43251174 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 43251087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Original strand, 18863591 - 18863680
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18863591 tgatgtatataagtgttattattaagtgatga----gttgttctatatatgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 18863680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 21973324 - 21973411
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21973324 ttgctatgttgtttaacatgttgtttatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 21973411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 120
Target Start/End: Original strand, 18863421 - 18863519
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  18863421 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctccgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtatat 18863519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 14398618 - 14398689
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  14398618 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 14398689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 30940844 - 30940931
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  30940844 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 30940931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21386667 - 21386596
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  21386667 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgctatgttgttatgatgtt 21386596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 30940905 - 30940976
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  30940905 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatattgttatgttgtt 30940976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22111273 - 22111202
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  22111273 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 22111202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 18863442 - 18863513
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  18863442 tgattatgatactgttatgttgctccgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 18863513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 21386383 - 21386342
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgtt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21386383 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgtt 21386342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23913517 - 23913437
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23913517 tgtatataattattattattaaatgatgattatgttgtattagatatgatta-ttattattaagttaatattatgttatgtt 23913437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21410283 - 21410228
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  21410283 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 21410228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21804775 - 21804720
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  21804775 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 21804720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 21828787 - 21828842
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  21828787 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatattgttatgttgtt 21828842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 197
Target Start/End: Original strand, 1323887 - 1323957
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttat 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1323887 ttattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatta-ttattattaagtgattattatgttatattat 1323957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21410281 - 21410230
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatg 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  21410281 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatg 21410230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21804773 - 21804722
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatg 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  21804773 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatg 21804722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 20983317 - 20983392
Alignment:
Q  116 tatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttat 192  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  20983317 tatataattattattattaagtgatgattatgttgtattgtatatgatt-attatcattaagtgatgattatgttat 20983392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Original strand, 44385557 - 44385597
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44385557 tgatgtatataattattattattaagtgatgattatgttgt 44385597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Original strand, 44385701 - 44385741
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44385701 tgatgtatataattattattattaagtgatgattatgttgt 44385741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23913629 - 23913574
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  23913629 atgttgctatgttgtctatgatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 23913574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 97
Target Start/End: Original strand, 21828789 - 21828825
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21828789 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgt 21828825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 5863 - 6064
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||| | ||    
T  5863 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagataatgattatgatattgttaagt 5962  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgaggaatatgttgttctatatatgattaa-tattgttaagtgaatattatgttatgttattgatg 6061  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  6062 atg 6064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Original strand, 5842 - 5927
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgcta 107  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  5842 ttgctatgttgtttgacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgcta 5927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 36801 - 36988
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||    
T  36801 tgattatgatatcgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtgtaagatattgattatgatattgttaagt 36900  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtt 190  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36901 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtaacgagtatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatgttatgtt 36988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Original strand, 36737 - 36827
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  36737 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgttgctgtgttgtttaagatgttgattatgatatcgttatgttgctatg 36827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 36761 - 36867
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||    
T  36761 tgattatgatattgttatgttgctgtgttgtttaagatgttgattatgatatcgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttatgt 36860  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  36861 tgctatg 36867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 122; Significance: 9e-63; HSPs: 12)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Original strand, 66287 - 66471
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  66287 tgattatgatattgttacgttgctatattgtttaagataatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgtta-ttatgatattgttatgt 66385  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 188  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  66386 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaactattattaagtgaatgttatg 66471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 79835 - 79634
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||| | ||    
T  79835 tgattatgatattgttatattgttatgttgtttaacatgttgattatgttattgttatgttgctaggttgtgtaagataatgattatgatattgttaagt 79736  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatg 202  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  79735 tgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatgaatatgttgttttatatatgattaa-tattattaagtgaatattgtgttatgttattgatg 79637  T
Q  203 atg 205  Q
    |||    
T  79636 atg 79634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Original strand, 62371 - 62555
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  62371 tgattatgatattgttacgttgctatattgtttaagataatgattatggtattgttatgttgctatgttgtttaagatgtta-ttatgatattgttatgt 62469  T
Q  103 tgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatg 188  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  62470 tgttatgatgttgtatataattgttactattaagtcatgaatatgttgtactatatatgattaactattattaagtgaatgttatg 62555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Original strand, 66263 - 66353
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||    
T  66263 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatattgtttaagataatgattatgatattgttatgttgctatg 66353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Original strand, 62347 - 62437
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||    
T  62347 atgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatattgtttaagataatgattatggtattgttatgttgctatg 62437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 79875 - 79771
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  79875 tgattacgatattgttatattgctatgttgtctaacatgttgattatgatattgttatattgttatgttgtttaacatgttgattatgttattgttatgt 79776  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  79775 tgcta 79771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 79899 - 79821
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  79899 atgttgctatgtcgtttaacatgttgattacgatattgttatattgctatgttgtctaacatgttgattatgatattgt 79821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 66325 - 66397
Alignment:
Q  1 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  66325 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaagatgtt-attatgatattgttatgttgttatgatgtt 66397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 62409 - 62481
Alignment:
Q  1 aatgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  62409 aatgattatggtattgttatgttgctatgttgtttaagatgtt-attatgatattgttatgttgttatgatgtt 62481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 199
Target Start/End: Original strand, 62675 - 62708
Alignment:
Q  166 attattattaagtgaatattatgttatgttattg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62675 attattattaagtgaatattatgttatgttattg 62708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Original strand, 62774 - 62815
Alignment:
Q  110 atgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  62774 atgatgtatataattattattattaagtgatgattatattgt 62815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 195
Target Start/End: Original strand, 66591 - 66620
Alignment:
Q  166 attattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66591 attattattaagtgaatattatgttatgtt 66620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Original strand, 68044 - 68225
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatata 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || |||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||    
T  68044 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtt-aagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgttgtgtata 68142  T
Q  122 attgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  68143 attgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaaatgaatattatgttatgttattgatgatg 68225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 68065 - 68135
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  68065 tgattatgatattgttatgttgctacgttg-ttaagataatgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 68135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 7)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 205
Target Start/End: Original strand, 4741 - 4903
Alignment:
Q  42 ttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatataattgttattattaagtgatg 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4741 ttgattatgatattgttatgttgctatgttatgtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgttgtgtataattgttactattaagtgatg 4840  T
Q  142 aatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4841 aatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 4903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 4562 - 4653
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatat 94  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||    
T  4562 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagatatagattatgatat 4653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 104
Target Start/End: Original strand, 4643 - 4743
Alignment:
Q  4 gattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgtt 103  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||    
T  4643 gattatgatatggttatattcctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattattatgtt 4742  T
Q  104 g 104  Q
    |    
T  4743 g 4743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Original strand, 4544 - 4628
Alignment:
Q  25 ctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  4544 ctatgttgattaacatgttgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgttgctatg 4628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 4602 - 4708
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  4602 tgattatgatattgttacgttgctatgttatttaagatatagattatgatatggttatattcctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttacgt 4701  T
Q  103 tgctatg 109  Q
    |||||||    
T  4702 tgctatg 4708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 4682 - 4734
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatatt 55  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4682 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaacatattgattatgatatt 4734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 4742 - 4813
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  4742 tgattatgatattgttatgttgctatgttatgtaagatattgattatgatattgttaagttgttatgatgtt 4813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Original strand, 15072 - 15165
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072 tgatgtatataagtgttattattaagtgatgaatatgttgttctatatatgattaa-tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatg 15165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 14875 - 14969
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14875 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgt 14969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 14854 - 14941
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  14854 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttgctatg 14941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Original strand, 14915 - 14971
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14915 tgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgtta 14971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12081 - 11996
Alignment:
Q  110 atgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12081 atgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 11996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12187 - 12104
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187 tgatgtatataattgttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgatt-attattattaagtgaatattatgttatgtt 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9028 - 8944
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9028 tgatgtatataattgttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 8944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 9209 - 9119
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9209 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttcctatgttgtttaaaatattgattatgatattgttatgttgctatg 9119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 9185 - 9114
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9185 tgattatgatattgttatgttcctatgttgtttaaaatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtt 9114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 59564 - 59668
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  59564 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgt 59663  T
Q  103 tgcta 107  Q
    |||||    
T  59664 tgcta 59668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 59523 - 59630
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgttt-aacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  59523 tgattatgatattgttatgttgctatgttgttttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatg 59622  T
Q  102 ttgctatg 109  Q
    ||||||||    
T  59623 ttgctatg 59630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 59604 - 59698
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  59604 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatgttgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgt 59698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 59483 - 59588
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttg-tttaagatgttggttatgatattgtgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||    
T  59483 tgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatgttgttttaacatgttgattatgatactgttatg 59582  T
Q  102 ttgcta 107  Q
    ||||||    
T  59583 ttgcta 59588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 59462 - 59549
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  59462 ttgctatgttgtttaacatgttgattatgatattgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgctatg 59549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 59644 - 59705
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttg 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  59644 tgattatgatactgttatgttgctacgttgtttaagatattgattatgatattgttacgttg 59705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 195
Target Start/End: Original strand, 59834 - 59910
Alignment:
Q  118 tataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  59834 tataattgttactattaagtgatgaatatgttgttctatatattatt-attattattaagtgaatatcatgctatgtt 59910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 10646 - 10729
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10646 tgatgtatataattgttattattaagtgatgattatgttgtactatatatgattaattattattaagtg-atattatgttatgtt 10729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 10513 - 10568
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  10513 atgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 10568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Original strand, 10515 - 10574
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  10515 gttgctatgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtatat 10574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 51401 - 51478
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattg 96  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  51401 atgttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg 51478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Original strand, 51425 - 51478
Alignment:
Q  3 tgattatgatattgttatgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattg 56  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51425 tgattacgatattgttacgttgctatgttgtttaagatattgattatgatattg 51478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 109
Target Start/End: Original strand, 51403 - 51451
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatg 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  51403 gttgctatgttgtttaacatgttgattacgatattgttacgttgctatg 51451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Original strand, 6751 - 6831
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6751 tgtatataattattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgatt-attattattaagtgaatattatgttatgtt 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 6639 - 6694
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  6639 atgttgctatgttgtctatgatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 6694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Original strand, 36971 - 37051
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36971 tgtatataattattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgatt-attattattaagtgaatattatgttatgtt 37051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Original strand, 208361 - 208461
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtat 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  208361 atgttgctatgttgtttaagatattgattacgatattgtt-tgttgataagttgtttaagatattgattatgatattgttatgtcgttatgatgttgtat 208459  T
Q  119 at 120  Q
    ||    
T  208460 at 208461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 164
Target Start/End: Original strand, 208507 - 208560
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgatt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  208507 tgatgtatataattgttattattaagcgatgaacatgttgttctatatatgatt 208560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Original strand, 21068 - 21151
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--attattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21068 tgtatataattattattattaagtgatgattatgttgtattagatatgattattattattattaagtgaatattatgttatgtt 21151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 20956 - 21011
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  20956 atgttgctatgttgtatatgatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 21011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 5)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 195
Target Start/End: Original strand, 526 - 577
Alignment:
Q  144 tatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  526 tatgttgtactatatatgattaattattattaagtgaatattatgttatgtt 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 152
Target Start/End: Original strand, 602 - 642
Alignment:
Q  112 gatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgtt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  602 gatgtatataattgttattattaagagatgaatatgttgtt 642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 265 - 320
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  265 atgttgctgtgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Original strand, 267 - 326
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  267 gttgctgtgttgtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtatat 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Original strand, 467 - 507
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  467 tgatgtatataattattattattaagtgaagattatgttgt 507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 6150 - 6109
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgtt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6150 tgatgtatataattgttattattaagtggtgaatatgttgtt 6109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 6387 - 6327
Alignment:
Q  61 gttgctatgttgtttaa-gatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  6387 gttgctatgttgtttaaaggtattgattatgatattgttatgttgttatgatggtgtatat 6327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 304 - 231
Alignment:
Q  116 tatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtt 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  304 tatataattattattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attattattaagtgatgattatgtt 231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9383 - 9310
Alignment:
Q  116 tatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtt 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  9383 tatataattattattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attattattaagtgatgattatgtt 9310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8963 - 8885
Alignment:
Q  114 tgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta--attattattaagtgaatattatgtt 190  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  8963 tgtatatgattattattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgattattattattattaagtgatgattatgtt 8885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11325 - 11268
Alignment:
Q  62 ttgctatgttgtttaagatgttggttatgatattgtgatgttgctatgatgatgtatat 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  11325 ttgctatgt-gtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgttgtatat 11268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11325 - 11274
Alignment:
Q  22 ttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgttacgttgctatgttgtt 74  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  11325 ttgctatgt-gtttaagatattgattatgatattgttatgttgttatgatgtt 11274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 165
Target Start/End: Original strand, 74163 - 74217
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgatta 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||    
T  74163 tgatgtatataattattattattaagtgaagattatgttgtattatatatgatta 74217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19320 - 19291
Alignment:
Q  166 attattattaagtgaatattatgttatgtt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19320 attattattaagtgaatattatgttatgtt 19291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 189
Target Start/End: Original strand, 22185 - 22249
Alignment:
Q  124 tgttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgt 189  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  22185 tgttattatgaagtgatgattatgttgtgctgtatatgatta-ttattattaagtgatgattatgt 22249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 151
Target Start/End: Original strand, 22288 - 22329
Alignment:
Q  110 atgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22288 atgatgtatataattattattattaagtgatgattatattgt 22329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Original strand, 8379 - 8419
Alignment:
Q  111 tgatgtatataattgttattattaagtgatgaatatgttgt 151  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8379 tgatgtatataactattattattaagtgatgattatgttgt 8419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6911 - 6848
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtt 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  6911 ttattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attattattaagtgatgattatgtt 6848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 44594 - 44657
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtt 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  44594 ttattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attattattaagtgatgattatgtt 44657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Original strand, 1013 - 1053
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttgtttaacatattgattatgatattgtta 59  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  1013 atgttgctatgttgtttatgatattgattatgatgttgtta 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 362008 - 361945
Alignment:
Q  126 ttattattaagtgatgaatatgttgttccatatatgattaattattattaagtgaatattatgtt 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  362008 ttattattaagtgatgattatgttgtgttgtatatgatt-attattattaagtgatgattatgtt 361945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University