View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19874_high_23 (Length: 294)

Name: NF19874_high_23
Description: NF19874
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19874_high_23
NF19874_high_23
[»] chr3 (157 HSPs)
chr3 (1-272)||(51674752-51675023)
chr3 (27-272)||(1313435-1313680)
chr3 (27-272)||(4308267-4308512)
chr3 (27-272)||(18099156-18099401)
chr3 (27-272)||(53917650-53917895)
chr3 (27-272)||(38890066-38890311)
chr3 (27-272)||(43423449-43423694)
chr3 (27-272)||(18096886-18097131)
chr3 (28-272)||(45882966-45883211)
chr3 (27-272)||(3314710-3314956)
chr3 (1-272)||(5522613-5522883)
chr3 (27-266)||(43226111-43226350)
chr3 (27-272)||(1321505-1321750)
chr3 (35-272)||(1626669-1626906)
chr3 (27-272)||(25533468-25533713)
chr3 (27-272)||(30005867-30006112)
chr3 (27-272)||(42990330-42990575)
chr3 (27-272)||(43228317-43228562)
chr3 (27-272)||(43421401-43421646)
chr3 (41-272)||(880437-880668)
chr3 (1-260)||(53591184-53591442)
chr3 (27-272)||(27101167-27101412)
chr3 (4-272)||(32219087-32219356)
chr3 (27-272)||(51726993-51727237)
chr3 (52-272)||(6484411-6484631)
chr3 (28-272)||(53915482-53915726)
chr3 (27-270)||(11170430-11170673)
chr3 (27-272)||(9604593-9604838)
chr3 (27-272)||(10084375-10084620)
chr3 (27-272)||(10956013-10956258)
chr3 (27-272)||(28101988-28102233)
chr3 (27-272)||(18162689-18162934)
chr3 (27-267)||(5926755-5926995)
chr3 (29-272)||(4103882-4104124)
chr3 (27-272)||(3859554-3859798)
chr3 (27-272)||(7606574-7606818)
chr3 (27-268)||(10958313-10958554)
chr3 (27-272)||(51943397-51943641)
chr3 (27-272)||(24979733-24979979)
chr3 (27-272)||(22114291-22114536)
chr3 (52-272)||(25688146-25688367)
chr3 (27-272)||(53468439-53468687)
chr3 (27-272)||(25388932-25389176)
chr3 (27-272)||(5191679-5191922)
chr3 (27-272)||(36011853-36012098)
chr3 (27-272)||(48361657-48361902)
chr3 (11-272)||(4666524-4666785)
chr3 (27-272)||(28413017-28413263)
chr3 (27-272)||(746783-747028)
chr3 (27-272)||(10621516-10621761)
chr3 (28-272)||(6065782-6066026)
chr3 (27-262)||(458310-458545)
chr3 (27-272)||(12267961-12268196)
chr3 (27-262)||(50494025-50494260)
chr3 (27-272)||(32264024-32264270)
chr3 (27-272)||(47148881-47149126)
chr3 (27-272)||(26720574-26720818)
chr3 (27-262)||(455933-456168)
chr3 (27-263)||(10191305-10191540)
chr3 (65-272)||(11168165-11168372)
chr3 (27-272)||(39715495-39715736)
chr3 (43-272)||(6063432-6063661)
chr3 (27-268)||(54691564-54691805)
chr3 (49-272)||(6231849-6232071)
chr3 (35-262)||(38210404-38210631)
chr3 (27-178)||(6561836-6561987)
chr3 (41-270)||(28761415-28761646)
chr3 (62-272)||(5886261-5886469)
chr3 (62-272)||(5899734-5899942)
chr3 (41-250)||(889781-889989)
chr3 (27-270)||(15780897-15781148)
chr3 (27-222)||(29956712-29956907)
chr3 (41-272)||(17795301-17795530)
chr3 (41-272)||(19103741-19103970)
chr3 (42-250)||(35917952-35918159)
chr3 (41-272)||(23633498-23633724)
chr3 (79-272)||(3306839-3307031)
chr3 (27-272)||(42992312-42992541)
chr3 (41-263)||(25635423-25635644)
chr3 (1-149)||(28137415-28137563)
chr3 (27-160)||(35777447-35777581)
chr3 (60-265)||(31151404-31151609)
chr3 (41-248)||(13420195-13420400)
chr3 (125-272)||(27635644-27635791)
chr3 (27-156)||(28100143-28100272)
chr3 (128-269)||(47701660-47701801)
chr3 (41-263)||(561769-561992)
chr3 (35-194)||(54884189-54884347)
chr3 (41-248)||(53597278-53597485)
chr3 (27-156)||(28181048-28181177)
chr3 (41-178)||(23637065-23637200)
chr3 (41-182)||(1674014-1674153)
chr3 (41-263)||(36871295-36871517)
chr3 (63-261)||(1620457-1620657)
chr3 (45-141)||(4560401-4560497)
chr3 (184-272)||(41849242-41849330)
chr3 (63-194)||(14634506-14634638)
chr3 (145-263)||(25634031-25634150)
chr3 (107-263)||(24181486-24181644)
chr3 (196-272)||(35919101-35919177)
chr3 (205-272)||(53894043-53894110)
chr3 (27-93)||(41849178-41849244)
chr3 (41-137)||(13419921-13420015)
chr3 (90-236)||(11007545-11007683)
chr3 (63-140)||(11066652-11066731)
chr3 (60-105)||(24177335-24177380)
chr3 (81-140)||(27762107-27762165)
chr3 (86-140)||(4535622-4535675)
chr3 (78-140)||(10094195-10094256)
chr3 (78-140)||(10201075-10201136)
chr3 (78-140)||(16462203-16462264)
chr3 (78-140)||(16996875-16996936)
chr3 (78-140)||(22626105-22626166)
chr3 (78-140)||(47883003-47883064)
chr3 (195-260)||(1736323-1736388)
chr3 (45-90)||(7606828-7606873)
chr3 (63-140)||(7768632-7768709)
chr3 (195-260)||(18552901-18552966)
chr3 (195-260)||(30709808-30709873)
chr3 (41-103)||(31021300-31021361)
chr3 (81-140)||(29914074-29914132)
chr3 (81-140)||(47878292-47878350)
chr3 (81-140)||(54193229-54193287)
chr3 (78-116)||(6303310-6303348)
chr3 (78-116)||(10100235-10100273)
chr3 (78-140)||(10208121-10208182)
chr3 (63-105)||(25633982-25634024)
chr3 (78-116)||(27544273-27544311)
chr3 (195-257)||(48438221-48438283)
chr3 (195-260)||(8370504-8370569)
chr3 (195-260)||(16264354-16264419)
chr3 (195-260)||(27974970-27975035)
chr3 (195-260)||(27986464-27986529)
chr3 (195-260)||(32143325-32143390)
chr3 (198-250)||(28181185-28181236)
chr3 (226-270)||(42992611-42992655)
chr3 (208-260)||(47923937-47923989)
chr3 (216-260)||(51398938-51398982)
chr3 (205-260)||(1417518-1417573)
chr3 (205-260)||(3716030-3716085)
chr3 (81-140)||(10897008-10897066)
chr3 (81-116)||(20031462-20031497)
chr3 (205-260)||(25795785-25795840)
chr3 (81-140)||(54188512-54188570)
chr3 (82-116)||(10949404-10949438)
chr3 (27-69)||(11163176-11163218)
chr3 (216-266)||(30236249-30236299)
chr3 (78-123)||(7418064-7418109)
chr3 (211-260)||(21711227-21711276)
chr3 (207-260)||(24695194-24695247)
chr3 (74-111)||(27635793-27635830)
chr3 (195-260)||(33386684-33386749)
chr3 (63-140)||(11073007-11073084)
chr3 (216-260)||(29682483-29682527)
chr3 (78-138)||(38002869-38002928)
chr3 (216-260)||(40913417-40913461)
chr3 (216-260)||(44331669-44331713)
[»] chr4 (142 HSPs)
chr4 (1-272)||(17662233-17662504)
chr4 (27-272)||(14633419-14633663)
chr4 (27-272)||(40637174-40637419)
chr4 (27-272)||(24880551-24880797)
chr4 (27-272)||(36919572-36919818)
chr4 (27-272)||(24888896-24889141)
chr4 (35-272)||(48486427-48486664)
chr4 (27-272)||(24879089-24879335)
chr4 (27-272)||(36921481-36921727)
chr4 (27-272)||(38928165-38928411)
chr4 (27-272)||(8631407-8631652)
chr4 (27-272)||(22800850-22801095)
chr4 (27-272)||(24348318-24348563)
chr4 (27-272)||(40091403-40091648)
chr4 (27-272)||(22802722-22802967)
chr4 (27-272)||(37089360-37089604)
chr4 (27-272)||(47274826-47275070)
chr4 (41-272)||(12395833-12396064)
chr4 (27-272)||(5198520-5198765)
chr4 (27-272)||(9148353-9148597)
chr4 (36-272)||(6764953-6765189)
chr4 (41-272)||(12400795-12401026)
chr4 (27-272)||(19095982-19096228)
chr4 (37-272)||(33415476-33415711)
chr4 (27-272)||(16453409-16453655)
chr4 (47-272)||(7941443-7941668)
chr4 (27-272)||(11435055-11435299)
chr4 (39-272)||(22046674-22046906)
chr4 (27-272)||(26085965-26086209)
chr4 (27-272)||(51015346-51015590)
chr4 (27-272)||(18847253-18847497)
chr4 (27-272)||(22044379-22044623)
chr4 (27-272)||(47868501-47868746)
chr4 (40-263)||(22132389-22132611)
chr4 (27-266)||(14787423-14787664)
chr4 (27-269)||(38409305-38409546)
chr4 (27-272)||(11008556-11008799)
chr4 (40-266)||(16455354-16455581)
chr4 (27-272)||(11006225-11006470)
chr4 (27-272)||(619436-619680)
chr4 (27-272)||(2484861-2485105)
chr4 (27-270)||(37313055-37313299)
chr4 (27-262)||(44599836-44600071)
chr4 (27-256)||(56030544-56030770)
chr4 (27-272)||(9176462-9176707)
chr4 (27-272)||(36378392-36378638)
chr4 (75-272)||(13547302-13547499)
chr4 (27-262)||(22780371-22780606)
chr4 (27-262)||(22782736-22782971)
chr4 (27-272)||(16934131-16934376)
chr4 (41-263)||(22134615-22134835)
chr4 (27-272)||(31849587-31849832)
chr4 (27-272)||(18709152-18709396)
chr4 (27-263)||(41997592-41997828)
chr4 (30-272)||(16931777-16932019)
chr4 (50-272)||(36380472-36380695)
chr4 (27-240)||(13544059-13544272)
chr4 (27-272)||(9174134-9174379)
chr4 (41-272)||(19322809-19323040)
chr4 (27-201)||(3824629-3824803)
chr4 (27-201)||(5637524-5637698)
chr4 (69-272)||(2891433-2891637)
chr4 (104-272)||(4215483-4215651)
chr4 (60-263)||(18537470-18537675)
chr4 (73-250)||(47210762-47210939)
chr4 (27-272)||(27499145-27499387)
chr4 (27-263)||(18409344-18409580)
chr4 (41-263)||(18534828-18535050)
chr4 (125-272)||(5635464-5635611)
chr4 (60-263)||(38890221-38890426)
chr4 (125-272)||(11437561-11437707)
chr4 (41-272)||(30136665-30136895)
chr4 (27-268)||(53405230-53405474)
chr4 (62-263)||(12102221-12102425)
chr4 (27-190)||(52942528-52942679)
chr4 (41-263)||(8756247-8756470)
chr4 (63-263)||(28453818-28454020)
chr4 (128-272)||(5101130-5101273)
chr4 (41-143)||(6132986-6133088)
chr4 (39-155)||(3937314-3937430)
chr4 (61-250)||(15032557-15032748)
chr4 (62-223)||(31983564-31983727)
chr4 (63-272)||(25357772-25357988)
chr4 (175-272)||(47563009-47563106)
chr4 (78-263)||(16185831-16186018)
chr4 (66-249)||(3982186-3982374)
chr4 (63-248)||(47150904-47151092)
chr4 (147-272)||(24446642-24446754)
chr4 (63-263)||(9863842-9864049)
chr4 (41-250)||(10112983-10113194)
chr4 (63-193)||(40999017-40999148)
chr4 (78-272)||(5336768-5336964)
chr4 (196-266)||(14789422-14789494)
chr4 (27-88)||(24446756-24446817)
chr4 (149-267)||(49088791-49088911)
chr4 (63-224)||(9022438-9022603)
chr4 (41-88)||(38270158-38270205)
chr4 (212-272)||(6133122-6133182)
chr4 (41-120)||(10114443-10114520)
chr4 (81-140)||(16489352-16489410)
chr4 (81-140)||(25699752-25699810)
chr4 (221-272)||(52942476-52942527)
chr4 (78-140)||(4570094-4570155)
chr4 (78-140)||(7050378-7050439)
chr4 (78-140)||(11853549-11853610)
chr4 (195-260)||(5269219-5269284)
chr4 (195-260)||(10047383-10047448)
chr4 (195-260)||(39245998-39246063)
chr4 (195-259)||(6743443-6743507)
chr4 (81-140)||(4556180-4556238)
chr4 (81-140)||(4558314-4558372)
chr4 (81-140)||(8529270-8529328)
chr4 (81-140)||(15316961-15317019)
chr4 (81-140)||(18586969-18587027)
chr4 (81-140)||(31300427-31300485)
chr4 (81-140)||(47566496-47566554)
chr4 (226-272)||(3937262-3937308)
chr4 (78-116)||(55822265-55822303)
chr4 (63-119)||(54906722-54906779)
chr4 (27-63)||(5101097-5101133)
chr4 (195-259)||(36315257-36315321)
chr4 (195-259)||(36329466-36329530)
chr4 (208-260)||(54867188-54867239)
chr4 (81-116)||(4884877-4884912)
chr4 (205-260)||(5143263-5143318)
chr4 (81-116)||(15831144-15831179)
chr4 (81-140)||(16689061-16689119)
chr4 (77-140)||(29609591-29609654)
chr4 (78-120)||(16638827-16638869)
chr4 (78-119)||(4874620-4874661)
chr4 (195-260)||(5396699-5396764)
chr4 (195-260)||(31985662-31985726)
chr4 (195-260)||(38152467-38152532)
chr4 (84-139)||(3760105-3760161)
chr4 (240-272)||(3824598-3824630)
chr4 (216-260)||(12739550-12739594)
chr4 (64-120)||(22295294-22295350)
chr4 (216-260)||(26175636-26175680)
chr4 (196-263)||(26557854-26557922)
chr4 (216-260)||(36463389-36463433)
chr4 (216-260)||(48893638-48893682)
chr4 (216-260)||(52467354-52467398)
[»] chr1 (123 HSPs)
chr1 (27-272)||(17324626-17324871)
chr1 (27-268)||(50307540-50307782)
chr1 (27-272)||(10399818-10400063)
chr1 (27-272)||(47906316-47906561)
chr1 (27-272)||(12302495-12302740)
chr1 (27-272)||(15294824-15295069)
chr1 (27-272)||(51750085-51750330)
chr1 (27-272)||(38925471-38925713)
chr1 (27-272)||(39462565-39462810)
chr1 (27-272)||(50076662-50076907)
chr1 (27-272)||(6995690-6995935)
chr1 (27-272)||(28840726-28840970)
chr1 (27-272)||(31735511-31735756)
chr1 (48-272)||(11457465-11457689)
chr1 (27-270)||(13215127-13215375)
chr1 (27-272)||(2510315-2510559)
chr1 (27-272)||(15823592-15823837)
chr1 (27-272)||(14097959-14098205)
chr1 (1-272)||(16432414-16432687)
chr1 (41-272)||(16428713-16428945)
chr1 (27-272)||(18307155-18307400)
chr1 (27-272)||(2617562-2617807)
chr1 (27-272)||(6823061-6823305)
chr1 (27-272)||(20302505-20302749)
chr1 (27-272)||(24325709-24325954)
chr1 (27-272)||(41646966-41647211)
chr1 (28-272)||(27336930-27337173)
chr1 (27-272)||(46431696-46431942)
chr1 (35-272)||(18839641-18839879)
chr1 (27-272)||(25251264-25251510)
chr1 (27-272)||(39932119-39932365)
chr1 (27-272)||(50078810-50079056)
chr1 (27-272)||(2949222-2949466)
chr1 (27-272)||(3579607-3579851)
chr1 (27-272)||(13761883-13762127)
chr1 (27-272)||(31489959-31490203)
chr1 (41-272)||(25127932-25128164)
chr1 (44-272)||(28998243-28998471)
chr1 (44-272)||(29003959-29004187)
chr1 (27-272)||(50248560-50248807)
chr1 (27-272)||(28207058-28207301)
chr1 (27-272)||(51752411-51752654)
chr1 (27-262)||(16226213-16226448)
chr1 (48-272)||(25248541-25248766)
chr1 (27-272)||(27339121-27339365)
chr1 (27-272)||(28842541-28842785)
chr1 (41-272)||(31425005-31425239)
chr1 (28-272)||(40133991-40134236)
chr1 (27-266)||(17324109-17324349)
chr1 (66-272)||(16429042-16429249)
chr1 (27-268)||(9241079-9241321)
chr1 (27-272)||(17186117-17186363)
chr1 (27-272)||(9459407-9459652)
chr1 (27-272)||(9463234-9463479)
chr1 (27-272)||(4131365-4131614)
chr1 (27-268)||(6756573-6756815)
chr1 (27-262)||(47179759-47179993)
chr1 (27-268)||(20291503-20291743)
chr1 (27-224)||(21948226-21948422)
chr1 (27-272)||(17318939-17319178)
chr1 (27-201)||(48665223-48665398)
chr1 (27-262)||(47177408-47177642)
chr1 (48-262)||(16231630-16231843)
chr1 (41-271)||(14183581-14183811)
chr1 (61-272)||(6115092-6115304)
chr1 (73-272)||(51757623-51757821)
chr1 (44-271)||(31422851-31423091)
chr1 (77-263)||(23785935-23786121)
chr1 (41-236)||(15669419-15669613)
chr1 (41-263)||(42922292-42922514)
chr1 (27-258)||(47451694-47451919)
chr1 (59-249)||(8347284-8347476)
chr1 (62-266)||(49495206-49495411)
chr1 (125-272)||(23816030-23816177)
chr1 (27-180)||(6823931-6824091)
chr1 (63-263)||(30738625-30738830)
chr1 (41-263)||(8349049-8349271)
chr1 (60-234)||(18800600-18800775)
chr1 (42-263)||(13125455-13125677)
chr1 (60-263)||(16561545-16561751)
chr1 (61-250)||(30790412-30790602)
chr1 (63-263)||(26613237-26613440)
chr1 (63-238)||(155788-155963)
chr1 (41-263)||(27916556-27916780)
chr1 (206-272)||(13358798-13358864)
chr1 (41-272)||(28279326-28279560)
chr1 (61-170)||(26520205-26520321)
chr1 (153-263)||(15916562-15916674)
chr1 (63-138)||(26332613-26332688)
chr1 (63-140)||(14353047-14353126)
chr1 (78-140)||(4144804-4144865)
chr1 (67-194)||(43104245-43104374)
chr1 (78-140)||(2232597-2232658)
chr1 (78-140)||(14997040-14997101)
chr1 (81-266)||(21353342-21353525)
chr1 (195-260)||(9476265-9476330)
chr1 (41-105)||(26332719-26332781)
chr1 (81-140)||(2401342-2401400)
chr1 (81-140)||(9526469-9526527)
chr1 (81-140)||(25134074-25134132)
chr1 (205-260)||(47102879-47102934)
chr1 (234-272)||(13447263-13447301)
chr1 (195-260)||(13598402-13598467)
chr1 (195-260)||(16124544-16124609)
chr1 (195-260)||(47703964-47704029)
chr1 (63-119)||(49959129-49959186)
chr1 (77-140)||(37990772-37990836)
chr1 (81-140)||(9521718-9521776)
chr1 (205-260)||(19072932-19072987)
chr1 (205-260)||(19120822-19120877)
chr1 (205-260)||(26644935-26644990)
chr1 (221-260)||(37559867-37559906)
chr1 (205-260)||(47098862-47098917)
chr1 (81-139)||(2393404-2393461)
chr1 (195-257)||(29651818-29651880)
chr1 (216-260)||(834167-834211)
chr1 (205-257)||(3281715-3281767)
chr1 (216-260)||(3847121-3847165)
chr1 (216-260)||(13137976-13138020)
chr1 (196-260)||(21536598-21536662)
chr1 (216-260)||(28220226-28220270)
chr1 (216-260)||(28265554-28265598)
chr1 (216-260)||(50169210-50169254)
[»] chr5 (106 HSPs)
chr5 (27-272)||(18511200-18511445)
chr5 (1-272)||(695898-696169)
chr5 (27-268)||(10529091-10529332)
chr5 (27-272)||(21948072-21948317)
chr5 (27-272)||(6745115-6745359)
chr5 (27-272)||(25804071-25804315)
chr5 (27-272)||(18509306-18509551)
chr5 (27-272)||(25921461-25921706)
chr5 (27-272)||(39854529-39854774)
chr5 (27-272)||(658344-658586)
chr5 (41-272)||(24126916-24127147)
chr5 (27-272)||(2818323-2818569)
chr5 (27-272)||(4236675-4236919)
chr5 (27-272)||(25904149-25904394)
chr5 (27-271)||(40221568-40221813)
chr5 (27-272)||(1189595-1189842)
chr5 (30-272)||(16092187-16092430)
chr5 (27-270)||(18466730-18466973)
chr5 (27-272)||(2174965-2175209)
chr5 (27-272)||(10474311-10474556)
chr5 (27-272)||(27910496-27910741)
chr5 (27-269)||(17072929-17073172)
chr5 (59-272)||(20505831-20506042)
chr5 (27-272)||(16776204-16776448)
chr5 (27-272)||(36402316-36402561)
chr5 (27-272)||(38882152-38882396)
chr5 (48-272)||(41585732-41585956)
chr5 (27-272)||(31545126-31545371)
chr5 (28-266)||(37705774-37706012)
chr5 (1-272)||(10586851-10587123)
chr5 (27-272)||(27912582-27912827)
chr5 (28-272)||(6747353-6747595)
chr5 (27-272)||(18596691-18596937)
chr5 (27-272)||(31472600-31472846)
chr5 (43-272)||(2723964-2724184)
chr5 (27-272)||(6756540-6756783)
chr5 (27-272)||(34477041-34477287)
chr5 (27-272)||(31542781-31543025)
chr5 (27-272)||(39397981-39398226)
chr5 (28-272)||(2954463-2954707)
chr5 (27-272)||(26097779-26098022)
chr5 (27-269)||(18469057-18469297)
chr5 (27-272)||(34479406-34479652)
chr5 (35-272)||(17818480-17818715)
chr5 (27-272)||(21684440-21684684)
chr5 (27-263)||(31179368-31179604)
chr5 (48-272)||(4410090-4410313)
chr5 (43-272)||(15552307-15552536)
chr5 (60-272)||(39798126-39798338)
chr5 (27-270)||(31465979-31466211)
chr5 (77-267)||(10749796-10749986)
chr5 (27-272)||(12555911-12556156)
chr5 (62-270)||(36208656-36208865)
chr5 (27-270)||(21288810-21289050)
chr5 (77-272)||(15354563-15354757)
chr5 (77-272)||(23665140-23665334)
chr5 (77-272)||(23793253-23793447)
chr5 (77-272)||(3373125-3373320)
chr5 (77-272)||(15356839-15357033)
chr5 (77-267)||(10757273-10757462)
chr5 (27-182)||(34530744-34530899)
chr5 (60-263)||(6661181-6661386)
chr5 (77-272)||(38960120-38960314)
chr5 (41-272)||(9020280-9020511)
chr5 (84-272)||(23741847-23742034)
chr5 (27-143)||(20045056-20045172)
chr5 (27-139)||(20043096-20043208)
chr5 (63-236)||(15143547-15143722)
chr5 (41-249)||(17413176-17413385)
chr5 (41-272)||(20053905-20054128)
chr5 (27-132)||(26098379-26098484)
chr5 (169-268)||(26098280-26098380)
chr5 (107-194)||(42770936-42771023)
chr5 (81-194)||(4897828-4897942)
chr5 (77-264)||(23667415-23667601)
chr5 (63-138)||(34033691-34033768)
chr5 (60-139)||(42770847-42770924)
chr5 (41-140)||(4754215-4754312)
chr5 (213-272)||(20043222-20043281)
chr5 (78-140)||(31782578-31782639)
chr5 (63-223)||(2144599-2144763)
chr5 (78-263)||(15445263-15445453)
chr5 (78-140)||(1170811-1170872)
chr5 (78-140)||(35385573-35385634)
chr5 (41-135)||(29748408-29748502)
chr5 (81-140)||(25452498-25452556)
chr5 (63-140)||(35430259-35430338)
chr5 (78-140)||(1240428-1240489)
chr5 (78-116)||(2298145-2298183)
chr5 (78-120)||(10627364-10627406)
chr5 (195-260)||(9353360-9353425)
chr5 (83-140)||(25445501-25445557)
chr5 (195-260)||(36932378-36932443)
chr5 (77-140)||(32520533-32520597)
chr5 (78-113)||(16093438-16093473)
chr5 (81-116)||(28786407-28786442)
chr5 (205-260)||(28832263-28832318)
chr5 (41-140)||(15224889-15224988)
chr5 (195-260)||(10281755-10281820)
chr5 (211-260)||(14520234-14520283)
chr5 (195-260)||(15464536-15464601)
chr5 (211-260)||(17004004-17004053)
chr5 (195-260)||(19588750-19588815)
chr5 (196-260)||(11917001-11917065)
chr5 (216-260)||(19806487-19806531)
chr5 (216-260)||(32636948-32636992)
[»] chr8 (94 HSPs)
chr8 (27-272)||(30480491-30480736)
chr8 (27-272)||(3874112-3874357)
chr8 (27-272)||(32339411-32339656)
chr8 (1-272)||(18812958-18813228)
chr8 (27-268)||(608836-609077)
chr8 (27-272)||(27829399-27829643)
chr8 (27-272)||(15068083-15068328)
chr8 (27-272)||(27106885-27107130)
chr8 (27-272)||(14807853-14808108)
chr8 (27-271)||(27911116-27911359)
chr8 (27-271)||(27957535-27957778)
chr8 (27-272)||(1225268-1225514)
chr8 (27-272)||(15072812-15073058)
chr8 (27-272)||(22684641-22684889)
chr8 (27-272)||(4424120-4424365)
chr8 (27-272)||(27827088-27827332)
chr8 (27-272)||(28251555-28251800)
chr8 (35-272)||(28283209-28283444)
chr8 (36-272)||(15809329-15809565)
chr8 (27-272)||(14419178-14419424)
chr8 (27-272)||(43530217-43530462)
chr8 (27-272)||(18810810-18811054)
chr8 (27-272)||(25952622-25952868)
chr8 (27-272)||(43079704-43079949)
chr8 (27-268)||(41384846-41385087)
chr8 (27-272)||(43082075-43082320)
chr8 (30-272)||(44720948-44721190)
chr8 (41-267)||(13858477-13858703)
chr8 (28-272)||(41382776-41383009)
chr8 (27-272)||(36865640-36865884)
chr8 (41-270)||(15956076-15956303)
chr8 (27-268)||(5372168-5372411)
chr8 (41-250)||(21480621-21480828)
chr8 (27-268)||(15185706-15185943)
chr8 (41-263)||(21482429-21482649)
chr8 (27-263)||(24873178-24873414)
chr8 (59-263)||(31162343-31162551)
chr8 (27-171)||(14477378-14477522)
chr8 (27-272)||(33541398-33541621)
chr8 (63-266)||(3005624-3005829)
chr8 (48-224)||(181622-181798)
chr8 (63-263)||(31578273-31578476)
chr8 (60-263)||(31035252-31035459)
chr8 (63-192)||(31573794-31573924)
chr8 (131-263)||(2468126-2468259)
chr8 (27-143)||(37214317-37214424)
chr8 (39-121)||(5622877-5622959)
chr8 (63-236)||(17847661-17847830)
chr8 (147-272)||(35872441-35872553)
chr8 (27-102)||(26775303-26775378)
chr8 (210-272)||(37214252-37214314)
chr8 (27-88)||(35872555-35872616)
chr8 (78-140)||(13985199-13985262)
chr8 (41-105)||(2468261-2468322)
chr8 (78-263)||(6376141-6376328)
chr8 (205-260)||(19752432-19752487)
chr8 (78-140)||(9021228-9021289)
chr8 (63-139)||(13985933-13986011)
chr8 (78-140)||(16752643-16752704)
chr8 (78-140)||(16757388-16757449)
chr8 (78-140)||(28327908-28327969)
chr8 (78-140)||(28895502-28895563)
chr8 (78-140)||(30423212-30423274)
chr8 (196-272)||(14477521-14477598)
chr8 (81-140)||(590797-590855)
chr8 (81-140)||(33032657-33032715)
chr8 (63-140)||(3895957-3896035)
chr8 (78-140)||(4812608-4812669)
chr8 (78-116)||(17799568-17799606)
chr8 (78-140)||(28332631-28332692)
chr8 (195-260)||(4696624-4696689)
chr8 (195-260)||(26403258-26403323)
chr8 (81-138)||(29554908-29554964)
chr8 (41-97)||(31035184-31035238)
chr8 (195-260)||(31071257-31071322)
chr8 (196-260)||(9765848-9765912)
chr8 (216-260)||(12702634-12702678)
chr8 (78-177)||(15949534-15949634)
chr8 (63-140)||(33839043-33839120)
chr8 (81-140)||(3276347-3276405)
chr8 (81-140)||(25684646-25684704)
chr8 (78-140)||(2267144-2267205)
chr8 (216-266)||(10930193-10930243)
chr8 (195-260)||(7412345-7412410)
chr8 (63-115)||(11701102-11701155)
chr8 (145-261)||(16833769-16833886)
chr8 (195-260)||(19175782-19175847)
chr8 (195-260)||(23799605-23799670)
chr8 (216-260)||(15212910-15212954)
chr8 (78-114)||(21033870-21033906)
chr8 (216-260)||(27811402-27811446)
chr8 (196-236)||(33032771-33032811)
chr8 (216-260)||(33352274-33352318)
chr8 (216-260)||(40321204-40321248)
[»] chr7 (122 HSPs)
chr7 (27-272)||(44724635-44724880)
chr7 (27-272)||(38394042-38394287)
chr7 (27-272)||(48457709-48457954)
chr7 (27-272)||(443651-443897)
chr7 (27-266)||(27306224-27306463)
chr7 (27-272)||(9680875-9681121)
chr7 (27-272)||(20137097-20137342)
chr7 (27-272)||(21592131-21592376)
chr7 (41-272)||(7092201-7092431)
chr7 (27-272)||(13099462-13099709)
chr7 (27-272)||(4295922-4296168)
chr7 (27-272)||(20299515-20299761)
chr7 (27-272)||(35685-35930)
chr7 (27-272)||(20297418-20297663)
chr7 (27-272)||(20626094-20626339)
chr7 (27-272)||(20629985-20630230)
chr7 (27-272)||(20642404-20642649)
chr7 (27-272)||(21990206-21990451)
chr7 (27-272)||(42330985-42331232)
chr7 (29-272)||(7470010-7470253)
chr7 (29-272)||(7471968-7472211)
chr7 (27-272)||(24748650-24748896)
chr7 (27-272)||(1046913-1047157)
chr7 (27-272)||(31435034-31435280)
chr7 (27-272)||(1049284-1049528)
chr7 (27-272)||(40836731-40836975)
chr7 (27-272)||(3035777-3036025)
chr7 (27-272)||(44620-44865)
chr7 (27-272)||(1850037-1850282)
chr7 (27-272)||(3878633-3878878)
chr7 (27-268)||(11355314-11355555)
chr7 (27-270)||(42223213-42223457)
chr7 (41-272)||(7094448-7094678)
chr7 (27-272)||(9679115-9679360)
chr7 (27-272)||(18345597-18345842)
chr7 (27-272)||(28487609-28487854)
chr7 (27-266)||(21678122-21678361)
chr7 (27-272)||(39145974-39146220)
chr7 (27-272)||(28485622-28485866)
chr7 (41-272)||(37412113-37412346)
chr7 (27-272)||(40946384-40946629)
chr7 (27-272)||(25542586-25542829)
chr7 (27-250)||(21680083-21680306)
chr7 (27-241)||(27832651-27832866)
chr7 (27-272)||(7351640-7351885)
chr7 (27-272)||(43253505-43253749)
chr7 (27-272)||(31155899-31156144)
chr7 (49-272)||(38396713-38396935)
chr7 (27-248)||(7349285-7349506)
chr7 (27-201)||(11757285-11757460)
chr7 (27-194)||(25276197-25276364)
chr7 (27-272)||(24258519-24258769)
chr7 (77-263)||(2935374-2935560)
chr7 (77-272)||(22137184-22137378)
chr7 (77-272)||(40552211-40552405)
chr7 (77-272)||(22108173-22108367)
chr7 (77-272)||(40549933-40550127)
chr7 (44-263)||(24813494-24813712)
chr7 (35-254)||(24817358-24817576)
chr7 (60-224)||(20091583-20091745)
chr7 (41-220)||(22828672-22828852)
chr7 (77-263)||(1606486-1606671)
chr7 (77-263)||(9027191-9027376)
chr7 (124-272)||(22393875-22394024)
chr7 (27-160)||(26804625-26804761)
chr7 (41-263)||(7188611-7188833)
chr7 (27-173)||(22251637-22251775)
chr7 (63-263)||(24465629-24465829)
chr7 (63-263)||(6332311-6332514)
chr7 (104-266)||(26295580-26295743)
chr7 (41-263)||(11081578-11081803)
chr7 (63-263)||(16297018-16297222)
chr7 (101-194)||(6348912-6349005)
chr7 (41-118)||(22392534-22392608)
chr7 (27-89)||(18567669-18567731)
chr7 (208-272)||(11759364-11759428)
chr7 (63-140)||(11084467-11084544)
chr7 (119-248)||(6046641-6046772)
chr7 (66-169)||(40281468-40281572)
chr7 (63-140)||(26210631-26210710)
chr7 (78-140)||(21369642-21369703)
chr7 (62-140)||(2120881-2120960)
chr7 (195-260)||(46516338-46516403)
chr7 (41-140)||(6048941-6049039)
chr7 (41-119)||(12310157-12310234)
chr7 (78-140)||(3320171-3320232)
chr7 (78-140)||(3324919-3324980)
chr7 (87-265)||(6067193-6067373)
chr7 (78-140)||(7069780-7069841)
chr7 (78-140)||(7074787-7074848)
chr7 (78-140)||(25351353-25351414)
chr7 (78-140)||(25357047-25357108)
chr7 (78-140)||(25405393-25405454)
chr7 (78-140)||(25410130-25410191)
chr7 (226-272)||(26804765-26804811)
chr7 (78-140)||(42006663-42006724)
chr7 (195-260)||(29159807-29159872)
chr7 (205-260)||(9190046-9190101)
chr7 (205-260)||(20284093-20284148)
chr7 (81-140)||(30246973-30247031)
chr7 (81-140)||(44512646-44512704)
chr7 (78-140)||(8378625-8378686)
chr7 (78-116)||(15541139-15541177)
chr7 (195-260)||(21983288-21983353)
chr7 (216-260)||(14379861-14379905)
chr7 (81-129)||(44143997-44144045)
chr7 (205-260)||(2580394-2580449)
chr7 (1-32)||(22828872-22828903)
chr7 (81-116)||(34547007-34547042)
chr7 (205-260)||(35960820-35960875)
chr7 (195-257)||(55955-56016)
chr7 (195-260)||(2647724-2647789)
chr7 (207-260)||(4796707-4796760)
chr7 (78-119)||(8260584-8260625)
chr7 (64-140)||(13290595-13290672)
chr7 (216-260)||(2759197-2759241)
chr7 (216-260)||(12097867-12097911)
chr7 (216-260)||(14069833-14069877)
chr7 (240-272)||(22251573-22251605)
chr7 (216-260)||(27347941-27347985)
chr7 (216-260)||(41317434-41317478)
chr7 (196-263)||(44010747-44010815)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (27-272)||(183629-183873)
scaffold0005 (27-266)||(52066-52307)
scaffold0005 (196-266)||(50236-50308)
[»] chr2 (114 HSPs)
chr2 (27-272)||(42923497-42923742)
chr2 (27-272)||(19007662-19007907)
chr2 (27-272)||(21520681-21520926)
chr2 (30-272)||(22287324-22287566)
chr2 (27-272)||(23452225-23452470)
chr2 (27-272)||(45279972-45280217)
chr2 (55-272)||(5375334-5375550)
chr2 (27-272)||(19501999-19502244)
chr2 (47-272)||(43623568-43623793)
chr2 (27-272)||(6264136-6264382)
chr2 (27-272)||(27104821-27105064)
chr2 (41-272)||(42452817-42453047)
chr2 (27-272)||(11739547-11739793)
chr2 (27-272)||(28196659-28196902)
chr2 (27-272)||(6258805-6259048)
chr2 (27-272)||(42064537-42064782)
chr2 (27-272)||(13910033-13910277)
chr2 (27-272)||(19504334-19504578)
chr2 (27-270)||(40032043-40032291)
chr2 (27-272)||(17848465-17848707)
chr2 (41-237)||(45239000-45239196)
chr2 (27-272)||(34979565-34979812)
chr2 (41-272)||(44289055-44289287)
chr2 (27-272)||(14837295-14837535)
chr2 (35-272)||(17849147-17849384)
chr2 (27-262)||(35217961-35218196)
chr2 (27-262)||(35215584-35215819)
chr2 (27-272)||(3022185-3022439)
chr2 (77-272)||(36558852-36559047)
chr2 (77-272)||(36561129-36561324)
chr2 (41-272)||(18800301-18800530)
chr2 (27-272)||(24162211-24162445)
chr2 (41-272)||(28459178-28459409)
chr2 (27-182)||(15539553-15539708)
chr2 (118-272)||(22407442-22407596)
chr2 (60-263)||(11578104-11578309)
chr2 (77-262)||(45332179-45332364)
chr2 (27-264)||(31732772-31732998)
chr2 (41-272)||(22874169-22874398)
chr2 (63-263)||(20146604-20146806)
chr2 (61-263)||(40699429-40699634)
chr2 (63-263)||(17897242-17897443)
chr2 (145-272)||(22707739-22707868)
chr2 (171-272)||(22163010-22163111)
chr2 (140-269)||(23870951-23871080)
chr2 (131-257)||(7462950-7463077)
chr2 (41-182)||(27136203-27136343)
chr2 (63-272)||(35107351-35107563)
chr2 (48-143)||(38414198-38414291)
chr2 (78-194)||(20589763-20589880)
chr2 (27-105)||(38020224-38020302)
chr2 (62-263)||(37962938-37963137)
chr2 (27-102)||(22163106-22163180)
chr2 (62-194)||(15693958-15694093)
chr2 (63-140)||(17921754-17921833)
chr2 (41-140)||(43139412-43139509)
chr2 (64-120)||(27583479-27583535)
chr2 (27-78)||(22407591-22407642)
chr2 (78-140)||(28458949-28459011)
chr2 (62-138)||(26345661-26345738)
chr2 (78-140)||(2740941-2741002)
chr2 (101-263)||(13828338-13828503)
chr2 (63-140)||(34575230-34575308)
chr2 (78-140)||(2736205-2736266)
chr2 (77-138)||(10942634-10942696)
chr2 (77-138)||(10948503-10948565)
chr2 (78-140)||(17462436-17462497)
chr2 (78-140)||(20054886-20054947)
chr2 (78-140)||(22712637-22712698)
chr2 (78-140)||(22717346-22717407)
chr2 (41-194)||(35028612-35028764)
chr2 (78-140)||(39686983-39687044)
chr2 (78-140)||(45567409-45567470)
chr2 (63-138)||(7502975-7503052)
chr2 (195-260)||(14699035-14699100)
chr2 (81-140)||(12781342-12781400)
chr2 (81-140)||(17932637-17932695)
chr2 (81-140)||(17943540-17943598)
chr2 (81-140)||(27517760-27517818)
chr2 (81-140)||(30478997-30479055)
chr2 (63-140)||(30720732-30720811)
chr2 (195-260)||(8390178-8390243)
chr2 (195-260)||(13569332-13569397)
chr2 (195-260)||(20522224-20522289)
chr2 (236-272)||(15539517-15539553)
chr2 (216-260)||(17057369-17057413)
chr2 (216-260)||(17085352-17085396)
chr2 (216-260)||(33162450-33162494)
chr2 (1-32)||(5377668-5377699)
chr2 (216-259)||(17490149-17490192)
chr2 (205-260)||(31056048-31056103)
chr2 (81-140)||(37170873-37170931)
chr2 (84-138)||(41303155-41303210)
chr2 (78-116)||(20050166-20050204)
chr2 (87-140)||(27248021-27248075)
chr2 (78-116)||(38190997-38191035)
chr2 (78-116)||(39680045-39680083)
chr2 (213-266)||(1345587-1345640)
chr2 (213-266)||(2838076-2838129)
chr2 (195-260)||(8040064-8040129)
chr2 (206-266)||(27517633-27517694)
chr2 (195-260)||(28259205-28259270)
chr2 (81-114)||(33674551-33674584)
chr2 (195-260)||(39482935-39483000)
chr2 (216-260)||(723744-723788)
chr2 (196-260)||(10445473-10445537)
chr2 (176-272)||(10942498-10942597)
chr2 (176-272)||(10948367-10948466)
chr2 (216-260)||(11067429-11067473)
chr2 (216-260)||(34139770-34139814)
chr2 (196-260)||(34682363-34682427)
chr2 (216-260)||(36318009-36318053)
chr2 (211-266)||(38191144-38191200)
chr2 (216-260)||(39284960-39285004)
[»] chr6 (97 HSPs)
chr6 (27-272)||(11983017-11983262)
chr6 (27-272)||(13057275-13057521)
chr6 (27-272)||(9020007-9020252)
chr6 (27-272)||(13039835-13040081)
chr6 (27-272)||(1230237-1230482)
chr6 (27-272)||(28241309-28241554)
chr6 (27-272)||(4816219-4816464)
chr6 (27-272)||(14507164-14507408)
chr6 (27-272)||(14458755-14458998)
chr6 (27-272)||(32280077-32280323)
chr6 (35-271)||(3390468-3390705)
chr6 (27-272)||(3629853-3630097)
chr6 (27-272)||(30967282-30967527)
chr6 (27-272)||(19704555-19704802)
chr6 (27-272)||(30034591-30034836)
chr6 (27-272)||(3631927-3632171)
chr6 (27-265)||(20915351-20915589)
chr6 (27-272)||(2628874-2629118)
chr6 (35-268)||(15532674-15532906)
chr6 (27-270)||(25477355-25477606)
chr6 (27-272)||(15541128-15541373)
chr6 (27-272)||(3233713-3233964)
chr6 (44-272)||(26065081-26065307)
chr6 (44-272)||(26085050-26085276)
chr6 (45-263)||(5273213-5273431)
chr6 (27-272)||(30728812-30729061)
chr6 (27-217)||(15530166-15530355)
chr6 (43-272)||(26932549-26932779)
chr6 (27-260)||(12195515-12195748)
chr6 (66-268)||(1069710-1069913)
chr6 (1-272)||(14466377-14466650)
chr6 (77-272)||(26066112-26066307)
chr6 (38-272)||(12161546-12161779)
chr6 (41-263)||(15719740-15719961)
chr6 (77-272)||(26068383-26068578)
chr6 (77-272)||(29754697-29754892)
chr6 (41-272)||(24338436-24338667)
chr6 (77-272)||(33308988-33309182)
chr6 (41-263)||(15367129-15367349)
chr6 (61-263)||(16455421-16455625)
chr6 (77-272)||(33311257-33311451)
chr6 (35-194)||(22490729-22490888)
chr6 (62-272)||(12186059-12186271)
chr6 (41-236)||(3027876-3028071)
chr6 (27-154)||(19227514-19227641)
chr6 (61-263)||(26945258-26945463)
chr6 (41-193)||(17012137-17012287)
chr6 (63-263)||(19696556-19696759)
chr6 (125-263)||(15346526-15346664)
chr6 (41-263)||(22857949-22858172)
chr6 (64-194)||(28037796-28037927)
chr6 (196-272)||(10584246-10584322)
chr6 (63-263)||(25078554-25078755)
chr6 (41-221)||(20526902-20527081)
chr6 (63-138)||(11138423-11138499)
chr6 (63-177)||(7542465-7542581)
chr6 (86-140)||(5165936-5165989)
chr6 (78-140)||(13878727-13878788)
chr6 (78-140)||(13883475-13883536)
chr6 (78-140)||(16785919-16785980)
chr6 (78-140)||(26887345-26887406)
chr6 (78-140)||(31248835-31248896)
chr6 (78-140)||(35201447-35201508)
chr6 (195-260)||(5572269-5572334)
chr6 (78-140)||(3577636-3577696)
chr6 (78-235)||(12911471-12911629)
chr6 (81-140)||(17036058-17036116)
chr6 (81-140)||(17694972-17695030)
chr6 (81-140)||(22351973-22352031)
chr6 (195-260)||(5757506-5757571)
chr6 (195-260)||(10077193-10077258)
chr6 (125-236)||(30445702-30445815)
chr6 (41-91)||(15346477-15346524)
chr6 (145-263)||(25465587-25465706)
chr6 (27-70)||(1072067-1072110)
chr6 (205-260)||(5017507-5017562)
chr6 (85-140)||(12166267-12166321)
chr6 (81-116)||(13467607-13467642)
chr6 (27-74)||(13870608-13870655)
chr6 (196-266)||(17694846-17694917)
chr6 (81-116)||(19702006-19702041)
chr6 (81-140)||(22342922-22342980)
chr6 (205-260)||(31936591-31936646)
chr6 (205-260)||(31979517-31979572)
chr6 (86-140)||(11262596-11262649)
chr6 (80-140)||(17904470-17904531)
chr6 (195-260)||(21356040-21356105)
chr6 (84-140)||(25941650-25941704)
chr6 (145-194)||(28078262-28078310)
chr6 (196-272)||(30443538-30443615)
chr6 (216-260)||(603088-603132)
chr6 (195-247)||(18232862-18232914)
chr6 (211-266)||(22342795-22342851)
chr6 (206-250)||(24436010-24436054)
chr6 (81-160)||(26643179-26643258)
chr6 (81-160)||(26749145-26749224)
chr6 (216-260)||(33211185-33211229)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (27-266)||(14376-14615)
scaffold0131 (27-266)||(15074-15313)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (27-272)||(69280-69524)
scaffold0025 (37-87)||(73160-73210)
scaffold0025 (27-76)||(73207-73256)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (27-272)||(4051-4295)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (27-272)||(11461-11706)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (27-272)||(41471-41716)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (27-272)||(79240-79485)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (39-272)||(1441-1673)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (27-271)||(79914-80158)
scaffold0004 (78-140)||(188363-188424)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (27-272)||(6254-6499)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (27-272)||(29226-29470)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (27-272)||(96-341)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (27-272)||(2935-3179)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (27-272)||(85285-85531)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (27-224)||(2097-2293)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (41-263)||(1638-1860)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (41-263)||(15817-16039)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (77-272)||(22221-22415)
scaffold0140 (77-272)||(24496-24690)
scaffold0140 (195-260)||(8447-8512)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (27-152)||(35694-35819)
scaffold0011 (196-272)||(35818-35894)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (41-194)||(16717-16868)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (63-178)||(4901-5016)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (206-272)||(4667-4733)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (222-272)||(1439-1489)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (78-236)||(57452-57613)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (78-140)||(224819-224880)
scaffold0006 (195-260)||(5687-5752)
scaffold0006 (195-260)||(2496-2561)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (81-140)||(16328-16386)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (81-115)||(17131-17165)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (36-93)||(993-1050)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (211-260)||(36876-36925)
scaffold0087 (195-260)||(43989-44054)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (216-260)||(20415-20459)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 157)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 51675023 - 51674752
Alignment:
Q  1 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51675023 tttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctc 51674924  T
Q  101 ttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |    
T  51674923 ttggttacgagaagagattgggattttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatact 51674824  T
Q  201 gaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51674823 gaaatggagggctgctctctcccccataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 51674752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 1313435 - 1313680
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  1313435 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactt 1313534  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1313535 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccca 1313634  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1313635 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1313680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4308512 - 4308267
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4308512 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactt 4308413  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4308412 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccta 4308313  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4308312 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 4308267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18099401 - 18099156
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  18099401 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 18099302  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18099301 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccta 18099202  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18099201 gactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 18099156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 53917895 - 53917650
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917895 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 53917796  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  53917795 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccca 53917696  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53917695 gactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 53917650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 38890066 - 38890311
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38890066 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 38890165  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  38890166 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccta 38890265  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38890266 tactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 38890311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43423694 - 43423449
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43423694 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctt 43423595  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||  |    
T  43423594 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccctga 43423495  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43423494 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 43423449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18097131 - 18096886
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  18097131 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 18097032  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  18097031 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctccccta 18096932  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18096931 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgt 18096886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 272
Target Start/End: Original strand, 45882966 - 45883211
Alignment:
Q  28 tttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatttt 127  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  45882966 tttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggacttt 45883065  T
Q  128 gggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctct-ccccta 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  45883066 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccta 45883165  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45883166 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 45883211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 3314710 - 3314956
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  3314710 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctt 3314809  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  3314810 tgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccccc 3314909  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3314910 aaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 3314956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5522883 - 5522613
Alignment:
Q  1 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522883 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctc 5522784  T
Q  101 ttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagt 200  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  5522783 ttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagt 5522685  T
Q  201 gaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5522684 ggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 5522613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Original strand, 43226111 - 43226350
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  43226111 gtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 43226210  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  43226211 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccta 43226310  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43226311 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 43226350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 1321505 - 1321750
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||    
T  1321505 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactt 1321604  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  1321605 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 1321704  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1321705 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1321750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1626906 - 1626669
Alignment:
Q  35 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtaga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1626906 ctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtaga 1626807  T
Q  135 attaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggt 234  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  1626806 attaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgcccagactaggt 1626707  T
Q  235 caatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1626706 cgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 1626669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 25533468 - 25533713
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||    
T  25533468 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactt 25533567  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  25533568 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccta 25533667  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25533668 gactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 25533713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 30005867 - 30006112
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  30005867 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactt 30005966  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30005967 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccta 30006066  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30006067 gattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 30006112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 42990330 - 42990575
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  42990330 gtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 42990429  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| |    
T  42990430 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctccccca 42990529  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42990530 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 42990575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 43228317 - 43228562
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  43228317 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 43228416  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  43228417 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 43228516  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43228517 gactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgt 43228562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43421646 - 43421401
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  43421646 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatt 43421547  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| |    
T  43421546 tgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctccccca 43421447  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43421446 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 43421401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 880668 - 880437
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||     
T  880668 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattaga 880569  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 240  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880568 cgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 880469  T
Q  241 ggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  880468 ggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgt 880437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 53591184 - 53591442
Alignment:
Q  1 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  53591184 tttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctc 53591283  T
Q  101 ttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagt 200  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  53591284 ttggttacgagaatagatttggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagt 53591383  T
Q  201 gaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  53591384 gaaacgaagggatgctctctcccc-agactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27101412 - 27101167
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27101412 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactt 27101313  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |    
T  27101312 tgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctccccca 27101213  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27101212 gaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgt 27101167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Original strand, 32219087 - 32219356
Alignment:
Q  4 agaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32219087 agaaaggcaacaacaaaactagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttg 32219186  T
Q  104 gttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgt-aacattactcatcacatagtga 202  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  32219187 gttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtga 32219286  T
Q  203 aatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||| |||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32219287 aacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 32219356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 51727237 - 51726993
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || ||    
T  51727237 gtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactt 51727139  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |    
T  51727138 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctccccca 51727039  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51727038 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 51726993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 272
Target Start/End: Original strand, 6484411 - 6484631
Alignment:
Q  52 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagactta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  6484411 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaactta 6484510  T
Q  152 ttcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactt 251  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  6484511 ttcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactg 6484610  T
Q  252 ggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6484611 ggtcaacaaattcttttgtgt 6484631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 53915726 - 53915482
Alignment:
Q  28 tttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatttt 127  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53915726 tttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 53915627  T
Q  128 gggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctag 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  53915626 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctcccccag 53915527  T
Q  228 actaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  53915526 actaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 53915482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 11170430 - 11170673
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  11170430 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactt 11170529  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  11170530 taggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccca 11170629  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11170630 gactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttttgt 11170673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9604838 - 9604593
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||    
T  9604838 gtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactt 9604739  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  9604738 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 9604639  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9604638 gactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 9604593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10084620 - 10084375
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  10084620 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 10084521  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  10084520 tgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccaa 10084421  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10084420 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgt 10084375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10956258 - 10956013
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  10956258 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 10956159  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | |    
T  10956158 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccacca 10956059  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10956058 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 10956013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28102233 - 28101988
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28102233 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctt 28102134  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |    
T  28102133 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctccccaa 28102034  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28102033 agctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgt 28101988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 18162689 - 18162934
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18162689 gtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 18162788  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgt-aacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  18162789 tgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 18162888  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  18162889 agactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgt 18162934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5926995 - 5926755
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5926995 gtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 5926896  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||  |    
T  5926895 ttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccgca 5926796  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5926795 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 5926755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4104124 - 4103882
Alignment:
Q  29 ttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttg 128  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  4104124 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttg 4104025  T
Q  129 ggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctaga 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||| |||    
T  4104024 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccaga 4103926  T
Q  229 ctaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4103925 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 4103882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 3859554 - 3859798
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  3859554 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 3859653  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||| |    
T  3859654 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctccccca 3859752  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3859753 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 3859798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7606818 - 7606574
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  7606818 gtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 7606719  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||||| |||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  7606718 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttct-atttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 7606620  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7606619 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 7606574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10958554 - 10958313
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  | ||    
T  10958554 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactt 10958455  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  10958454 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctccccca 10958355  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10958354 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10958313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 51943397 - 51943641
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  51943397 gtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctt 51943496  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  51943497 taggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccccca 51943595  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51943596 tactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgt 51943641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 24979733 - 24979979
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  24979733 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactt 24979832  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgt-aacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  24979833 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccccc 24979932  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24979933 aaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 24979979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22114536 - 22114291
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22114536 gtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattt 22114437  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||| || ||||||||| |    
T  22114436 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctctccccca 22114337  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     || | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22114336 aacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 22114291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 52 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688146
Alignment:
Q  52 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagactta 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  152 ttcttgtaatccattgatatctcttttgt-aacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaact 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  251 tggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     |||||| || |||||||||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttttgtgt 25688146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 53468687 - 53468439
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  53468687 gtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactt 53468588  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||     
T  53468587 tgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctacccccc 53468488  T
Q  226 ag--actaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53468487 agacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 53468439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 25388932 - 25389176
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25388932 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 25389030  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||     
T  25389031 ttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 25389129  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  25389130 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 25389176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 5191679 - 5191922
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  5191679 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 5191778  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| |   |||||||| ||||||||| |    
T  5191779 tgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctctcccc-a 5191876  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5191877 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 5191922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 36011853 - 36012098
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||    
T  36011853 gtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactt 36011952  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| |   |    
T  36011953 tgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttcttca 36012052  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36012053 gactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgt 36012098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 48361902 - 48361657
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  48361902 gtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggctt 48361803  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||| |    
T  48361802 ttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctctccccca 48361703  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  48361702 gactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 48361657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 272
Target Start/End: Original strand, 4666524 - 4666785
Alignment:
Q  11 caacaacaaaactaaggtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg 110  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4666524 caacaacaaaaatagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgg 4666623  T
Q  111 gaagagattgggattttgggtagaattaggcggtaga--cttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatgg 207  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||    
T  4666624 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg 4666723  T
Q  208 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4666724 agggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgt 4666785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28413263 - 28413017
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28413263 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggact 28413164  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  28413163 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 28413065  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa-ttcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  28413064 agactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgt 28413017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 746783 - 747028
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  746783 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 746882  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||     
T  746883 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctctctccccc 746981  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  746982 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 747028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10621761 - 10621516
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10621761 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 10621662  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  10621661 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 10621563  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  10621562 agactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 10621516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6066026 - 6065782
Alignment:
Q  28 tttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6066026 tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactt 6065927  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  6065926 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctctccccta 6065828  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||    
T  6065827 gactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgt 6065782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Original strand, 458310 - 458545
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  458310 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 458409  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  458410 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 458508  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  458509 agactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaat 458545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12268196 - 12267961
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  12268196 gtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 12268097  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||           |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||     
T  12268096 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccc 12268008  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12268007 aaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 12267961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Original strand, 50494025 - 50494260
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  50494025 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggact 50494124  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  50494125 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 50494223  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  50494224 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 50494260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 32264270 - 32264024
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||    
T  32264270 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactt 32264171  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||    
T  32264170 tgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 32264071  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     |||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||    
T  32264070 cagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-aattcttttgtgt 32264024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 47149126 - 47148881
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaa-caaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  47149126 gtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtct 47149028  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||     
T  47149027 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctctctccccc 47148928  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  47148927 agactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgt 47148881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 26720574 - 26720818
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  26720574 gtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactt 26720672  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  26720673 tgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctccccta 26720772  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26720773 gattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgt 26720818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Original strand, 455933 - 456168
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  455933 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 456032  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  456033 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 456131  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 262  Q
    ||||||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  456132 agactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaat 456168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10191540 - 10191305
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| | ||    
T  10191540 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggctgg-actt 10191442  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||  |    
T  10191441 tgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctaa 10191342  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10191341 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 65 - 272
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168372
Alignment:
Q  65 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatcca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  165 ttgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattc 264  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  265 ttttgtgt 272  Q
    ||||||||    
T  11168365 ttttgtgt 11168372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 39715495 - 39715736
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39715495 gtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 39715594  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||  || || ||  |||||||| |    
T  39715595 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat--catagtgaaacagatggttg--ctctccccca 39715690  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  39715691 tactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgt 39715736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6063661 - 6063432
Alignment:
Q  43 caaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggc 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6063661 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 6063562  T
Q  142 ggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttg 241  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  6063561 gggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattg 6063463  T
Q  242 gaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||| |||| |||||||  |||||||    
T  6063462 gaccgaactgggtccacaaatttctttgtgt 6063432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 54691805 - 54691564
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  54691805 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggctt 54691706  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  54691705 tgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctccccta 54691606  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  54691605 gactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattctttt 54691564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 272
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232071
Alignment:
Q  49 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagac 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  149 ttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccga 247  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||  | |||| || ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtg-aacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  248 acttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttgtgt 6232071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 262
Target Start/End: Original strand, 38210404 - 38210631
Alignment:
Q  35 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  38210404 ctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtag 38210503  T
Q  134 aattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactagg 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  38210504 aattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccatactagg 38210602  T
Q  234 tcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 262  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  38210603 tcagattggaccgaactgggtcaacaaat 38210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 178
Target Start/End: Original strand, 6561836 - 6561987
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6561836 gtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 6561935  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctctttt 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561936 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttt 6561987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28761646 - 28761415
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  28761646 aacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattagg 28761547  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaa-t 238  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  28761546 cgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatt 28761447  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  28761446 ttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgt 28761415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 62 - 272
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886469
Alignment:
Q  62 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaat 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 261  Q
    |||||||| | || |||| ||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5886458  T
Q  262 ttcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||    
T  5886459 ttcttttgtgt 5886469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 62 - 272
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899942
Alignment:
Q  62 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaat 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 261  Q
    |||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctc-tttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5899931  T
Q  262 ttcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||    
T  5899932 ttcttttgtgt 5899942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 889989 - 889781
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  889989 aacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttggggctttgggtagaattagg 889891  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 240  Q
    | | ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||||    
T  889890 caggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctcccgcagactaggtcaattt 889791  T
Q  241 ggaccgaact 250  Q
    ||||||||||    
T  889790 ggaccgaact 889781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 15780897 - 15781148
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  15780897 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 15780996  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgata----tctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggaggg---ctgctct 218  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||  ||| | ||||  |||||| || | ||||   |||||||    
T  15780997 tcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctct 15781096  T
Q  219 ctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15781097 ctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 15781148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 222
Target Start/End: Original strand, 29956712 - 29956907
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  29956712 gtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactt 29956811  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcc 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  29956812 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 17795301 - 17795530
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  17795301 aacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattagg 17795397  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795398 cggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatt 17795497  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || |||||| | ||| |||||||||| ||||||    
T  17795498 tgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgt 17795530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 19103741 - 19103970
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19103741 aacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattagg 19103837  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19103838 cggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatt 19103937  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || |||||| | ||| |||||||||| ||||||    
T  19103938 tgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgt 19103970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35918159 - 35917952
Alignment:
Q  42 acaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggc 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  35918159 acaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaatagga 35918060  T
Q  142 ggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttg 241  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||     
T  35918059 gggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgctctctccctcagact-ggtcaattta 35917961  T
Q  242 gaccgaact 250  Q
    |||||||||    
T  35917960 gaccgaact 35917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 23633498 - 23633724
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23633498 aacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 23633593  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23633594 cggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatt 23633691  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  23633692 tagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgt 23633724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 272
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307031
Alignment:
Q  79 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctctttt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  179 gtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||  ||||||||||  ||||||||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgt 3307031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 42992312 - 42992541
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||    
T  42992312 gtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagtgg-actt 42992410  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||               ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  || |||||||||||||||| |    
T  42992411 tgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctccccca 42992495  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42992496 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgt 42992541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Original strand, 25635423 - 25635644
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25635423 aacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 25635520  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||  || ||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||    
T  25635521 cggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaacagagggttgctctctcccctcggctaggccaatt 25635620  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||| ||||  || ||||||||    
T  25635621 tggaccaaactgcgtaaacaaatt 25635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28137563 - 28137415
Alignment:
Q  1 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28137563 tttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctc 28137464  T
Q  101 ttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagact 149  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  28137463 ttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 160
Target Start/End: Original strand, 35777447 - 35777581
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35777447 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 35777546  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaa 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35777547 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 35777581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 60 - 265
Target Start/End: Original strand, 31151404 - 31151609
Alignment:
Q  60 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgta 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31151404 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgta 31151503  T
Q  160 atccattgatatctcttttgtaacattactcatcac-atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaa 257  Q
    | ||  |||||||||||||||||  ||||||||    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||| ||| ||    
T  31151504 accc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaa 31151601  T
Q  258 caaattct 265  Q
    ||||||||    
T  31151602 caaattct 31151609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13420400 - 13420195
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13420400 aacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 13420304  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-at 238  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||| || || |||| ||||||||||| || |||||||||||  |    
T  13420303 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagctgctctctcacc-agactaggtcagtt 13420205  T
Q  239 ttggaccgaa 248  Q
    ||||||||||    
T  13420204 ttggaccgaa 13420195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 125 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27635791 - 27635644
Alignment:
Q  125 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27635791 tttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 27635692  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27635691 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 27635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28100272 - 28100143
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  28100272 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctt 28100173  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattctt 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28100172 tgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 128 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701660
Alignment:
Q  128 gggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctag 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  228 actaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 269  Q
    | |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttg 47701660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 561992 - 561769
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  561992 aacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattagg 561895  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctccc-ctagactaggtca-a 237  Q
     || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| || | |||||||||||||||| | |||||||||||      
T  561894 tgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactaggtcagt 561795  T
Q  238 tttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  561794 tttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Original strand, 54884189 - 54884347
Alignment:
Q  35 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtaga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||  ||||    
T  54884189 ctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaataga 54884288  T
Q  135 attaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca 194  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54884289 attaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatca 54884347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 248
Target Start/End: Original strand, 53597278 - 53597485
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  53597278 aacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattagg 53597375  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat- 238  Q
    |   |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||| |     
T  53597376 caagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctcccacaaactaggtcagta 53597475  T
Q  239 ttggaccgaa 248  Q
    ||||||||||    
T  53597476 ttggaccgaa 53597485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Original strand, 28181048 - 28181177
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28181048 gtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggactt 28181147  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattctt 156  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  28181148 tggatagaattaggcgggagacgtattctt 28181177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 178
Target Start/End: Original strand, 23637065 - 23637200
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  23637065 aacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattagg 23637162  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctctttt 178  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23637163 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 182
Target Start/End: Original strand, 1674014 - 1674153
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  1674014 aacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaataga 1674111  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaa 182  Q
    ||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  1674112 cgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaa 1674153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 36871517 - 36871295
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36871517 aacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattagg 36871420  T
Q  141 -cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 238  Q
       | ||||||||||||| || || ||| |||||| |||||||  ||| ||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  36871419 tttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctc-tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagt 36871321  T
Q  239 -ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
     |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  36871320 attggaccgaactgggtaaacgaatt 36871295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620457
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaat 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | || ||  |||||||||     
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
    || |||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||    
T  1620557 cctttgatatctc-tttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaaca 1620459  T
Q  260 aa 261  Q
    ||    
T  1620458 aa 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560401
Alignment:
Q  45 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggc 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 272
Target Start/End: Original strand, 41849242 - 41849330
Alignment:
Q  184 attactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41849242 attactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 41849330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634506
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaat 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| || ||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca 194  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatca 14634506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 263
Target Start/End: Original strand, 25634031 - 25634150
Alignment:
Q  145 agacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||| | |||||||| ||||||| |    
T  25634031 agacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgca 25634130  T
Q  244 ccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  25634131 ccgaactaggtaaacaaatt 25634150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 263
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181644
Alignment:
Q  107 acgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaat 205  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||| ||     
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 24181585  T
Q  206 ggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||| | ||||||||||| | | |||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  24181586 ggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35919177 - 35919101
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35919177 atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 35919101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 53894110 - 53894043
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  53894110 tggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 53894043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Original strand, 41849178 - 41849244
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 93  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849178 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Original strand, 13419921 - 13420015
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaatt 137  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  13419921 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatt 13420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007545
Alignment:
Q  90 gattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattact 189  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||         | |||||||||  | |||| |||||||||||||  |||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttact 11007593  T
Q  190 catcac-atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca 236  Q
    |||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11007592 catcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtca 11007545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 105
Target Start/End: Original strand, 24177335 - 24177380
Alignment:
Q  60 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177335 gggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttggga-cttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 140
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535675
Alignment:
Q  86 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattagg 4535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094195
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 10094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201075
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 10201075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16996936
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattagg 16996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626105
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 1736323 - 1736388
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  1736323 catagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  45 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 90  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768709
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||   | ||||| | |||| |||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattagg 7768709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 18552901 - 18552966
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  18552901 catagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 30709808 - 30709873
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  30709808 catagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttg 103  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29914074
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 29914074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878292
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 47878292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193287
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 54193287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 116
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303348
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 6303348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100235
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10100235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208121
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 10208121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 105
Target Start/End: Original strand, 25633982 - 25634024
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 105  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633982 ttgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 116
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544311
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27544311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 48438283 - 48438221
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaa 257  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  48438283 catagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 8370504 - 8370569
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  8370504 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16264419 - 16264354
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16264419 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 27974970 - 27975035
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  27974970 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 27986464 - 27986529
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  27986464 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32143390 - 32143325
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  32143390 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 250
Target Start/End: Original strand, 28181185 - 28181236
Alignment:
Q  198 agtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaact 250  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28181185 agtgaaacggaaggctgctctctccc-tagactaggtcaatttggactgaact 28181236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 270
Target Start/End: Original strand, 42992611 - 42992655
Alignment:
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  42992611 agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgt 42992655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 260
Target Start/End: Original strand, 47923937 - 47923989
Alignment:
Q  208 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  47923937 agggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 47923989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 51398938 - 51398982
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51398938 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 51398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Original strand, 1417518 - 1417573
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  1417518 tggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Original strand, 3716030 - 3716085
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  3716030 tggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 3716085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897066
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 10897066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031462
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 20031462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25795840 - 25795785
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  25795840 tggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188570
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  54188512 cactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 54188570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949404
Alignment:
Q  82 actattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10949404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 69
Target Start/End: Original strand, 11163176 - 11163218
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 69  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11163176 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236299
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatttctt 30236299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 123
Target Start/End: Original strand, 7418064 - 7418109
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 123  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7418064 aaacaccattatgattgagtctattggtcacgggaagagattggga 7418109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21711276 - 21711227
Alignment:
Q  211 gctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21711276 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Original strand, 24695194 - 24695247
Alignment:
Q  207 gagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  24695194 gagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 24695247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 27635830 - 27635793
Alignment:
Q  74 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 111  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27635830 tgggaaacaatattaagattgagtctcttggttacggg 27635793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 33386684 - 33386749
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  33386684 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Original strand, 11073007 - 11073084
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  11073007 ttgattcaccttcgagaaacact--tatgattgagtctcttggtcacgagaagagatttgggactttaggtagaattagg 11073084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 29682483 - 29682527
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  29682483 tctctcccctagattagatcaagttggaccgaactgggtcaacaa 29682527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38002928
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaatta 138  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  38002869 aaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 40913417 - 40913461
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40913417 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331713
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 142)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17662504 - 17662233
Alignment:
Q  1 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662504 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 17662405  T
Q  101 ttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagt 200  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17662404 ttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagt 17662305  T
Q  201 gaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17662304 ggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 17662233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 14633419 - 14633663
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14633419 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattgggactt 14633517  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  14633518 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctca 14633617  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14633618 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 14633663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 40637174 - 40637419
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  40637174 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 40637273  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |    
T  40637274 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctccccca 40637373  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40637374 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 40637419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 24880551 - 24880797
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24880551 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 24880650  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgt-aacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24880651 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 24880750  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24880751 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgt 24880797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36919818 - 36919572
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  36919818 gtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 36919719  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  36919718 tttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctctctcccct 36919619  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36919618 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 36919572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 24888896 - 24889141
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  24888896 gtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactt 24888995  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  24888996 tgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctccccca 24889095  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24889096 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 24889141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 272
Target Start/End: Original strand, 48486427 - 48486664
Alignment:
Q  35 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtaga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48486427 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtaga 48486526  T
Q  135 attaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggt 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  48486527 attaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggt 48486626  T
Q  235 caatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  48486627 caatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgt 48486664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 24879089 - 24879335
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24879089 gtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 24879188  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgt-aacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24879189 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 24879288  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24879289 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgt 24879335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36921727 - 36921481
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  36921727 gtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 36921628  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||     
T  36921627 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctccccc 36921528  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36921527 agactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 36921481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38928411 - 38928165
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  38928411 gtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggct 38928312  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  38928311 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctccccc 38928212  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38928211 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 38928165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8631652 - 8631407
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  8631652 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 8631553  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  8631552 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 8631453  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8631452 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 8631407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22801095 - 22800850
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||    
T  22801095 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactt 22800996  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |    
T  22800995 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccca 22800896  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22800895 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 22800850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 24348318 - 24348563
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  24348318 gtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 24348417  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  24348418 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 24348517  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24348518 tactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 24348563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40091648 - 40091403
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  40091648 gtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 40091549  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  40091548 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccca 40091449  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40091448 tactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 40091403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22802967 - 22802722
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  22802967 gtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 22802868  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||| | |||||||||| |    
T  22802867 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctccccca 22802768  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22802767 gactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 22802722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37089604 - 37089360
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||    
T  37089604 gtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactt 37089505  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  37089504 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccca 37089406  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37089405 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 37089360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 47274826 - 47275070
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  47274826 gtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactt 47274925  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  47274926 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc-a 47275024  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  47275025 gactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgt 47275070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12396064 - 12395833
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12396064 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagg 12395965  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 240  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12395964 cgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaattt 12395865  T
Q  241 ggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  12395864 ggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgt 12395833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 5198520 - 5198765
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  5198520 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctt 5198619  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  5198620 tgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccca 5198719  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5198720 gactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgt 5198765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 9148353 - 9148597
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  9148353 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 9148452  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  9148453 taggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccca 9148551  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9148552 gactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 9148597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 272
Target Start/End: Original strand, 6764953 - 6765189
Alignment:
Q  36 tttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaa 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  6764953 tttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaa 6765052  T
Q  136 ttaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtc 235  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6765053 ttaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc 6765152  T
Q  236 aatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6765153 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 6765189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12401026 - 12400795
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12401026 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagg 12400927  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 240  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12400926 cgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaattt 12400827  T
Q  241 ggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  12400826 ggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgt 12400795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 19095982 - 19096228
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |    
T  19095982 gtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagct 19096081  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  19096082 ttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctccccc 19096181  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  19096182 agactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgt 19096228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33415711 - 33415476
Alignment:
Q  37 ttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaat 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  33415711 ttggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaat 33415612  T
Q  137 taggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  33415611 taggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggctaggtca 33415512  T
Q  237 atttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33415511 atttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgt 33415476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 16453409 - 16453655
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16453409 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactt 16453508  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||  || || ||||||||||||     
T  16453509 tgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctccccc 16453608  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  16453609 agactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgt 16453655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 47 - 272
Target Start/End: Original strand, 7941443 - 7941668
Alignment:
Q  47 cactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtag 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7941443 cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 7941542  T
Q  147 acttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccg 246  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7941543 acttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 7941642  T
Q  247 aacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  7941643 aactgggtcaacaaattcttttgtgt 7941668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 11435055 - 11435299
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | ||| ||    
T  11435055 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactt 11435154  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  11435155 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccta 11435253  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11435254 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 11435299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 39 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22046906 - 22046674
Alignment:
Q  39 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaatta 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22046906 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 22046807  T
Q  139 ggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 238  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22046806 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaat 22046708  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22046707 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 22046674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26086209 - 26085965
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  26086209 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctt 26086110  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||  ||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||  |    
T  26086109 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggaaggctgctctctccctca 26086011  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26086010 gactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgt 26085965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 51015346 - 51015590
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  51015346 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 51015445  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||  |    
T  51015446 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctccctca 51015544  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51015545 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 51015590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 18847253 - 18847497
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18847253 gtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 18847352  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  18847353 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc- 18847450  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18847451 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 18847497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22044623 - 22044379
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  22044623 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 22044524  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||  |    
T  22044523 tgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctca 22044425  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22044424 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 22044379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 47868501 - 47868746
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  47868501 gtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 47868600  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |    
T  47868601 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctccccca 47868700  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47868701 tactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgt 47868746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22132611 - 22132389
Alignment:
Q  40 gaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattag 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  22132611 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 22132512  T
Q  140 gcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22132511 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatt 22132413  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  22132412 tggaccgaactgggtcaacaaatt 22132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14787664 - 14787423
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  14787664 gtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactt 14787565  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctc--tctcccc 224  Q
    ||| |||||||||| || |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  14787564 tggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccc 14787465  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
     |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14787464 cagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 14787423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 269
Target Start/End: Original strand, 38409305 - 38409546
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  38409305 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 38409404  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  38409405 tgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 38409503  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 269  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38409504 tactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 38409546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11008799 - 11008556
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  11008799 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggact 11008700  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||   ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  11008699 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct---ttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 11008603  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11008602 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 11008556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 266
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455581
Alignment:
Q  40 gaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattag 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  140 gcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 238  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat 16455553  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16455554 ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 16455581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11006470 - 11006225
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  11006470 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggact 11006371  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||   ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||     
T  11006370 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 11006272  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11006271 agactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgt 11006225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 619680 - 619436
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  619680 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctt 619581  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  619580 tgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctccccta 619481  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  619480 -actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgt 619436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2485105 - 2484861
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2485105 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 2485006  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  2485005 tgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 2484907  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  2484906 gactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgt 2484861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37313299 - 37313055
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37313299 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattt 37313200  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||     
T  37313199 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccccc 37313100  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    |||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  37313099 agactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttgt 37313055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44600071 - 44599836
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44600071 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 44599972  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  44599971 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 44599873  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  44599872 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 44599836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 56030544 - 56030770
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||    
T  56030544 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctt 56030643  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||| ||| |||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  56030644 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctccccta 56030740  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56030741 gactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9176707 - 9176462
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  9176707 gtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagact 9176608  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  9176607 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 9176509  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||    
T  9176508 agactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgt 9176462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 36378392 - 36378638
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  36378392 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactt 36378491  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |  ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||     
T  36378492 tgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccccc 36378591  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  36378592 agactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgt 36378638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 75 - 272
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547499
Alignment:
Q  75 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  175 ttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgt 13547499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22780606 - 22780371
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22780606 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 22780507  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  22780506 tttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 22780408  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22780407 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 22780371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22782971 - 22782736
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22782971 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 22782872  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  22782871 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 22782773  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  22782772 agactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaat 22782736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16934376 - 16934131
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16934376 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagact 16934277  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  16934276 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 16934178  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  16934177 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 16934131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22134835 - 22134615
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||  |||||||||||||||    
T  22134835 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattagg 22134736  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 240  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22134735 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc-agactaggtcaattt 22134638  T
Q  241 ggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  22134637 ggaccgaactgggtcaacaaatt 22134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31849832 - 31849587
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || |    
T  31849832 gtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagact 31849733  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||     
T  31849732 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 31849634  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31849633 agactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 31849587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18709396 - 18709152
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  18709396 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactt 18709297  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |    
T  18709296 tgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctccccca 18709198  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  18709197 gactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 18709152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 263
Target Start/End: Original strand, 41997592 - 41997828
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  41997592 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattt 41997691  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| || || |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  41997692 tgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctctcccc- 41997790  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||    
T  41997791 agactaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16932019 - 16931777
Alignment:
Q  30 tgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttg 128  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16932019 tgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttg 16931920  T
Q  129 ggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctaga 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  16931919 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccaga 16931821  T
Q  229 ctaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  16931820 ctaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 16931777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 272
Target Start/End: Original strand, 36380472 - 36380695
Alignment:
Q  50 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagact 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  36380472 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact 36380571  T
Q  150 tattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaa 248  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36380572 tattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaa 36380671  T
Q  249 cttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||| |||||||||||||||||    
T  36380672 ctgggtaaacaaattcttttgtgt 36380695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 13544059 - 13544272
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  13544059 gtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggact 13544157  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||     
T  13544158 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttccc 13544257  T
Q  226 agactaggtcaattt 240  Q
    |||||||||||||||    
T  13544258 agactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9174379 - 9174134
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  9174379 gtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagact 9174280  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||     
T  9174279 ttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctctgcccc 9174181  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  9174180 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 9174134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 19322809 - 19323040
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19322809 aacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 19322906  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-at 238  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||  |    
T  19322907 cgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagtt 19323006  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  19323007 ttggaccgaactggataaacaaattctttagtgt 19323040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3824803 - 3824629
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||    
T  3824803 gtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactt 3824704  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtg 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3824703 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 3824629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5637698 - 5637524
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  5637698 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 5637599  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtg 201  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5637598 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 272
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891637
Alignment:
Q  69 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattga 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  169 tatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttt 267  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||  || | ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2891632  T
Q  268 tgtgt 272  Q
    |||||    
T  2891633 tgtgt 2891637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 272
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215651
Alignment:
Q  104 gttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaa 203  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  204 atggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 4215651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18537675 - 18537470
Alignment:
Q  60 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgta 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18537675 gggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgta 18537576  T
Q  160 atccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaa 257  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||  ||| ||||||||| ||| ||    
T  18537575 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaa 18537476  T
Q  258 caaatt 263  Q
    ||||||    
T  18537475 caaatt 18537470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 47210939 - 47210762
Alignment:
Q  73 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  47210939 ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 47210840  T
Q  173 tcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaact 250  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  47210839 tcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaact 47210762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 27499145 - 27499387
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |  ||    
T  27499145 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacgataagagattgaggctt 27499244  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |   | |||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||| | ||||||||||| |||||     
T  27499245 tgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaagggctgctctttcccc- 27499340  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27499341 agactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgt 27499387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18409580 - 18409344
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||    
T  18409580 gtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagactt 18409481  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||  ||| | |||||||||||      
T  18409480 ttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccctc 18409382  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  18409381 agactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18535050 - 18534828
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18535050 aacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgggtagaattagg 18534953  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-at 238  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||| |  |    
T  18534952 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctcccccccagactaggtaagtt 18534853  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||    
T  18534852 ttggaccgaacagggtaaacaaatt 18534828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5635611 - 5635464
Alignment:
Q  125 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  5635611 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc 5635512  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5635511 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 5635464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38890426 - 38890221
Alignment:
Q  60 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgta 159  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  38890426 gggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgta 38890327  T
Q  160 atccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaa 257  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  38890326 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaa 38890227  T
Q  258 caaatt 263  Q
    ||||||    
T  38890226 caaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 125 - 272
Target Start/End: Original strand, 11437561 - 11437707
Alignment:
Q  125 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  11437561 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc 11437659  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11437660 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 11437707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 30136665 - 30136895
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  30136665 aacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggtagaattagg 30136762  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
    ||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||  || ||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  30136763 cggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcctcaatactaggtcaatt 30136862  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  30136863 tggaccgaattggataaacaaattcttttgtgt 30136895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Original strand, 53405230 - 53405474
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || || ||    
T  53405230 gtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactt 53405328  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtaga------cttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctct 220  Q
    | |||||||||| |||| |||      ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||  ||| ||||  ||||    
T  53405329 taggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagctg--ctct 53405426  T
Q  221 cccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  53405427 cccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattctttt 53405474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 263
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  62 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  161 tccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaac 258  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  259 aaatt 263  Q
    |||||    
T  12102421 aaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52942679 - 52942528
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||    
T  52942679 gtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg-------------tt 52942593  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgt-aacattactc 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52942592 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacattactc 52942528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8756470 - 8756247
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgggaagagattgggattttgggtagaattag 139  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  8756470 aacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattag 8756373  T
Q  140 gcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtc-aa 237  Q
     ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||| || ||| || |||||||||| | ||||||||||       
T  8756372 acgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcctccagactaggtcggt 8756273  T
Q  238 tttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  8756272 tttggagcgaactgggtaaacaaatt 8756247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Original strand, 28453818 - 28454020
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatc 162  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |    
T  28453818 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaac 28453917  T
Q  163 cattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
      ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||  || |||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| |||||    
T  28453918 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaa 28454017  T
Q  261 att 263  Q
    |||    
T  28454018 att 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 128 - 272
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101273
Alignment:
Q  128 gggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctag 227  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctcccc-ag 5101228  T
Q  228 actaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 5101273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 143
Target Start/End: Original strand, 6132986 - 6133088
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6132986 aacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 6133085  T
Q  141 cgg 143  Q
    |||    
T  6133086 cgg 6133088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3937430 - 3937314
Alignment:
Q  39 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaatta 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  3937430 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaatta 3937331  T
Q  139 ggcggtagacttattct 155  Q
    || || |||||||||||    
T  3937330 ggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15032748 - 15032557
Alignment:
Q  61 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaa 160  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15032748 ggttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaa 15032649  T
Q  161 tccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaact 250  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||| || | || |||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||    
T  15032648 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaact 15032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983564
Alignment:
Q  62 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  161 tccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctccc 223  Q
     || ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 272
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357988
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgg----gtagaatt-aggcggtagacttattcttg 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||     ||||||| ||   | |||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  158 taatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtc 255  Q
    ||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||     
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggta 25357971  T
Q  256 aacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||| || |||||    
T  25357972 aacaaatttttgtgtgt 25357988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563106
Alignment:
Q  175 ttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 47563106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185831
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaatccattgatatctctt 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||   | ||||||||||||| || || ||||||| || |    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatc-t 16185920  T
Q  177 ttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||||||  ||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16185919 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982186
Alignment:
Q  66 attcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggattttgggtagaatt-aggcggtagacttattcttgtaatc 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||      
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  163 cattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaac 249  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaac 3982186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150904
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaat 161  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||     
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaa 248  Q
    || |||||||||||||| |||  || |||||||  |||||| ||  ||  | || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaa 47150904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446642
Alignment:
Q  147 acttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccg 246  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||             ||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccg 24446668  T
Q  247 aacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  24446667 aactgggtcaacaaattcttttgtgt 24446642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Original strand, 9863842 - 9864049
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaatt-aggcggtagacttattcttgtaat 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||     
T  9863842 ttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaac 9863941  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca----catagtgaaatggagggctgctctct--cccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggt 254  Q
    |  |||||||||| |||||||  ||||||||||     |||||| || |||| ||||||||||  |||| |||||| |||| | |||||||||||| |||    
T  9863942 cttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggt 9864040  T
Q  255 caacaaatt 263  Q
     ||||||||    
T  9864041 aaacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 250
Target Start/End: Original strand, 10112983 - 10113194
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-gggaagagattgggattttgggtagaattag 139  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10112983 aacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattag 10113080  T
Q  140 -gcggtagacttattcttgtaatc-cattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca 236  Q
        | ||||| |||||||||| |   |||||||||| |||||||  ||||| ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  10113081 atttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctc-tttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggtta 10113179  T
Q  237 at-ttggaccgaact 250  Q
     | ||||||||||||    
T  10113180 gtattggaccgaact 10113194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40999148 - 40999017
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaat 161  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||   | |||||   | ||||||     
T  40999148 ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaac 40999049  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatc 193  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40999048 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatc 40999017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336768
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaatccattgatatctctt 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||  | ||||||| |    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-cttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctc-t 5336867  T
Q  177 ttgtaaca-ttactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||| |   | ||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||   | |||||||||||||||||    
T  5336866 ttgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgt 5336768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14789494 - 14789422
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctc--ccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14789494 atagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14789422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24446817 - 24446756
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 88  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446817 gtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 267
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088911
Alignment:
Q  149 ttattcttgtaatccattgatatct-cttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct-agactaggtcaatttggaccg 246  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||  |||  || ||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccg 49088890  T
Q  247 aacttggtcaacaaattcttt 267  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  49088891 aactgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 224
Target Start/End: Original strand, 9022438 - 9022603
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaa 160  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  9022438 ttgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaa 9022537  T
Q  161 --tccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
      || ||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||| ||   |||||||||||||||||    
T  9022538 cctctattgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctcccc 9022603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 38270205 - 38270158
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270205 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 272
Target Start/End: Original strand, 6133122 - 6133182
Alignment:
Q  212 ctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  6133122 ctgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgt 6133182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 120
Target Start/End: Original strand, 10114443 - 10114520
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 120  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  10114443 aacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgataagagattg 10114520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489410
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactggga-cttgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942476
Alignment:
Q  221 cccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgt 52942476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570155
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttggga-cttgggtagaattagg 4570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050378
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 7050378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853610
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 11853610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 5269219 - 5269284
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5269219 catagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10047448 - 10047383
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  10047448 catagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39246063 - 39245998
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  39246063 catagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Original strand, 6743443 - 6743507
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  6743443 catagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529328
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 8529328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587027
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300485
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 31300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagact-ggaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3937308 - 3937262
Alignment:
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3937308 agactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgt 3937262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 116
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822303
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 55822303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 119
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906779
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 119  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagatt 54906779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 63
Target Start/End: Original strand, 5101097 - 5101133
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggt 63  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101097 gtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Original strand, 36315257 - 36315321
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  36315257 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Original strand, 36329466 - 36329530
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  36329466 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 54867239 - 54867188
Alignment:
Q  208 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  54867239 agggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 116
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4884912
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 4884912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5143318 - 5143263
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5143318 tggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 116
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831179
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15831179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16689061
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 16689061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29609654 - 29609591
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| || || | |||||||||||    
T  29609654 gaaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattagg 29609591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 120
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16638869
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattg 16638869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 4874661 - 4874620
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 119  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4874661 aaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagagatt 4874620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 5396699 - 5396764
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5396699 catagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 31985662 - 31985726
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31985662 catagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 38152467 - 38152532
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  38152467 catagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 139
Target Start/End: Original strand, 3760105 - 3760161
Alignment:
Q  84 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggattttgggtagaattag 139  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | | |||||||||||||||    
T  3760105 tattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatttagcactttgggtagaattag 3760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3824630 - 3824598
Alignment:
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3824630 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 3824598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739550
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Original strand, 22295294 - 22295350
Alignment:
Q  64 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 120  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  22295294 tgattcaccttagtaaacattgttaggatttagtctcttggtcacggaaagagattg 22295350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175636
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 263
Target Start/End: Original strand, 26557854 - 26557922
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26557854 atagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 26557922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36463433 - 36463389
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893638
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 52467398 - 52467354
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  52467398 tctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 52467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 123)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17324871 - 17324626
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17324871 gtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 17324772  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17324771 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccca 17324672  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17324671 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 17324626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50307782 - 50307540
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  50307782 gtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 50307683  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  50307682 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 50307583  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50307582 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 50307540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10400063 - 10399818
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10400063 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 10399964  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  10399963 tcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 10399864  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10399863 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 10399818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 47906316 - 47906561
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  47906316 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctt 47906415  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  47906416 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctccccca 47906515  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47906516 gacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 47906561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12302740 - 12302495
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12302740 gtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 12302641  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12302640 taggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccca 12302541  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12302540 gattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 12302495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15295069 - 15294824
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15295069 gtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactt 15294970  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  15294969 tgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctccccca 15294870  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15294869 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 15294824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 51750085 - 51750330
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  51750085 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 51750184  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  51750185 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 51750284  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51750285 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 51750330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38925713 - 38925471
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  38925713 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 38925614  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  38925613 tgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtaaaacggagggctgctctctcccc-a 38925517  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38925516 gactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgt 38925471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 39462565 - 39462810
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39462565 gtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 39462664  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  39462665 tgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctctccccca 39462764  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39462765 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 39462810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 50076907 - 50076662
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50076907 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaatt 50076808  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||| | |||||||||||||     
T  50076807 tgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc- 50076709  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50076708 agactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 50076662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6995935 - 6995690
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6995935 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctt 6995836  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  6995835 tgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcctcca 6995736  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6995735 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 6995690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 28840726 - 28840970
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  28840726 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 28840825  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  28840826 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 28840924  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28840925 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 28840970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31735756 - 31735511
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  31735756 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 31735657  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  31735656 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 31735557  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31735556 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 31735511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11457689 - 11457465
Alignment:
Q  48 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  11457689 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggaga 11457590  T
Q  148 cttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccga 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11457589 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 11457490  T
Q  248 acttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11457489 acttggtcaacaaattcttttgtgt 11457465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 13215127 - 13215375
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13215127 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 13215226  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgata----tctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctc 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||    
T  13215227 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 13215326  T
Q  222 ccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13215327 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgt 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2510559 - 2510315
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2510559 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactt 2510460  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  2510459 tgggtagaattaggcag-agacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccccca 2510361  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2510360 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 2510315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 15823592 - 15823837
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  15823592 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 15823691  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |    
T  15823692 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccca 15823791  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15823792 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 15823837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14098205 - 14097959
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  14098205 gtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctt 14098106  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgt-aacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||      
T  14098105 tgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccac 14098006  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14098005 aaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 14097959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 16432414 - 16432687
Alignment:
Q  1 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16432414 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctc 16432513  T
Q  101 ttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catag 199  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||    
T  16432514 ttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattatag 16432613  T
Q  200 tgaaatggagggctgctctct-cccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432614 tgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 16432687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 16428713 - 16428945
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16428713 aacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 16428812  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16428813 tgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatt 16428912  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16428913 tggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgt 16428945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 18307155 - 18307400
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18307155 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctt 18307254  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  18307255 tgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccc- 18307353  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  18307354 agactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgt 18307400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 2617562 - 2617807
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2617562 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 2617661  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||  |    
T  2617662 tgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctca 2617761  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  2617762 gactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgt 2617807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 6823061 - 6823305
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  6823061 gtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctt 6823159  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  6823160 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 6823259  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6823260 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 6823305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 20302505 - 20302749
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||    
T  20302505 gtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactt 20302604  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||| || |||||||||| |    
T  20302605 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctccccca 20302703  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302704 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 20302749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 24325709 - 24325954
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  24325709 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactt 24325808  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||||| |    
T  24325809 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctccccca 24325908  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24325909 gactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 24325954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 41646966 - 41647211
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  41646966 gtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactt 41647065  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  41647066 tgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccatca 41647165  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41647166 gactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgt 41647211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27337173 - 27336930
Alignment:
Q  28 tttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatttt 127  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || || |||    
T  27337173 tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgacttt 27337074  T
Q  128 gggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctag 227  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||    
T  27337073 gggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccag 27336975  T
Q  228 actaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27336974 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 27336930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 46431942 - 46431696
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  46431942 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactt 46431843  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctct--cccc 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  ||||    
T  46431842 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccc 46431744  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46431743 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 46431696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 272
Target Start/End: Original strand, 18839641 - 18839879
Alignment:
Q  35 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtaga 134  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  18839641 ctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtaga 18839740  T
Q  135 attaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactagg 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  18839741 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactagg 18839840  T
Q  234 tcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18839841 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgt 18839879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25251510 - 25251264
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25251510 gtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactt 25251411  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||     
T  25251410 tgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctcccca 25251311  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25251310 atactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 25251264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 39932119 - 39932365
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||    
T  39932119 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactt 39932218  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctc-tcccct 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||     
T  39932219 tgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttccccc 39932318  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39932319 atactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgt 39932365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 50079056 - 50078810
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  50079056 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactt 50078957  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||| ||  || |||||||||||||||     
T  50078956 tgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctccccc 50078857  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  50078856 agactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgt 50078810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2949466 - 2949222
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||    
T  2949466 gtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctt 2949367  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||      
T  2949366 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc-c 2949268  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2949267 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 2949222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3579851 - 3579607
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||    
T  3579851 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctt 3579752  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  3579751 tgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca-ttagtgaaacggatgattgctctctccccta 3579653  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3579652 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 3579607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 13761883 - 13762127
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  13761883 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactt 13761982  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||| |    
T  13761983 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctctccccca 13762081  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13762082 gactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 13762127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 31489959 - 31490203
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||    
T  31489959 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactt 31490058  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||| |||||||||||||| |||| |    
T  31490059 tggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-ccccca 31490157  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  31490158 gactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgt 31490203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 25127932 - 25128164
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  25127932 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattagg 25128031  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  25128032 cgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaatt 25128131  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25128132 aggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 25128164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28998471 - 28998243
Alignment:
Q  44 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28998471 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgg 28998372  T
Q  144 tagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgga 243  Q
     |||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28998371 gagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttgga 28998272  T
Q  244 ccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28998271 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 28998243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29004187 - 29003959
Alignment:
Q  44 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29004187 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgg 29004088  T
Q  144 tagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgga 243  Q
     |||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29004087 gagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttgga 29003988  T
Q  244 ccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29003987 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 29003959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 50248807 - 50248560
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||    
T  50248807 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactt 50248708  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctg--ctctctcccc 224  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||  || || ||  ||||||||||    
T  50248707 tgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctcccc 50248608  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  50248607 tagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgt 50248560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28207301 - 28207058
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  28207301 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctt 28207202  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||  || ||||| |||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28207201 tgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacggagggctgctctctccccca 28207104  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28207103 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 28207058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 51752411 - 51752654
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  51752411 gtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactattag-attgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 51752509  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  51752510 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctccccca 51752608  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51752609 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 51752654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Original strand, 16226213 - 16226448
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16226213 gtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 16226312  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  16226313 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 16226411  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  16226412 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 16226448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248541
Alignment:
Q  48 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  148 cttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccg 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  247 aacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaattcttttgtgt 25248541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27339365 - 27339121
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||    
T  27339365 gtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactt 27339266  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||| |    
T  27339265 tgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctctccccca 27339167  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27339166 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 27339121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 28842541 - 28842785
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||    
T  28842541 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactt 28842640  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||  ||||||||| |    
T  28842641 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctctccccca 28842739  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28842740 gactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgt 28842785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31425239 - 31425005
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt---ctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31425239 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaatt 31425140  T
Q  138 aggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca 236  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  31425139 aggcgggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctcccc-atactaggtca 31425041  T
Q  237 atttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31425040 atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 31425005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 272
Target Start/End: Original strand, 40133991 - 40134236
Alignment:
Q  28 tttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatttt 127  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  40133991 tttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggtttt 40134090  T
Q  128 gggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  40134091 gggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctccccca 40134190  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  40134191 aactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgt 40134236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Original strand, 17324109 - 17324349
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | ||    
T  17324109 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactt 17324208  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||| ||| ||||| |||||||||     
T  17324209 tgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctcccca 17324308  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17324309 tgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 17324349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 66 - 272
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429249
Alignment:
Q  66 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccat 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  166 tgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattc 264  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattc 16429241  T
Q  265 ttttgtgt 272  Q
    ||||||||    
T  16429242 ttttgtgt 16429249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9241321 - 9241079
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  9241321 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctt 9241222  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||     
T  9241221 tgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccccc 9241122  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  9241121 atactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattctttt 9241079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17186363 - 17186117
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  17186363 gtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactt 17186264  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||| || || |||| ||||||||||||||     
T  17186263 tgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctccccc 17186164  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  17186163 agactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgt 17186117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9459652 - 9459407
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  9459652 gtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagact 9459553  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  9459552 ttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 9459454  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  9459453 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 9459407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9463479 - 9463234
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  9463479 gtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagact 9463380  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  9463379 ttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 9463281  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  9463280 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 9463234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4131614 - 4131365
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| ||    
T  4131614 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactt 4131516  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgata----tctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctc 221  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||    
T  4131515 tgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 4131416  T
Q  222 ccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  4131415 ccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaacaaattcttttgtgt 4131365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Original strand, 6756573 - 6756815
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| |    
T  6756573 gtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct--tgattacgagaagagattgggact 6756670  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctct-ccc 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||| |||    
T  6756671 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctcccc 6756770  T
Q  224 ctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6756771 ccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattctttt 6756815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Original strand, 47179759 - 47179993
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47179759 gtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 47179858  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  47179859 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc- 47179956  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  47179957 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 47179993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Original strand, 20291503 - 20291743
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||    
T  20291503 gtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactt 20291602  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  | ||||||| |||||| |  |||||| || ||||||||| |    
T  20291603 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctccccca 20291701  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20291702 cactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 20291743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21948422 - 21948226
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  21948422 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactt 21948324  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  21948323 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 17318939 - 17319178
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  17318939 gtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactt 17319032  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17319033 tgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-ccct 17319131  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17319132 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 17319178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 201
Target Start/End: Original strand, 48665223 - 48665398
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-cgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |    
T  48665223 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggact 48665322  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtg 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  48665323 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 48665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Original strand, 47177408 - 47177642
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47177408 gtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggact 47177507  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  47177508 ttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc- 47177605  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 262  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  47177606 agactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaat 47177642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 262
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231843
Alignment:
Q  48 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtag 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  147 acttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccg 246  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 16231828  T
Q  247 aacttggtcaacaaat 262  Q
    ||| ||||||||||||    
T  16231829 aac-tggtcaacaaat 16231843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14183811 - 14183581
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14183811 aacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaattttgggtagaattagg 14183714  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-at 238  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  14183713 cggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtt 14183614  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtg 271  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  14183613 ttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtg 14183581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115092
Alignment:
Q  61 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaa 160  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  161 tccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  260 aattcttttgtgt 272  Q
    |||| ||||||||    
T  6115104 aattattttgtgt 6115092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 73 - 272
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757821
Alignment:
Q  73 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  173 tcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||||||  |||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51757723 tc-tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 51757821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31423091 - 31422851
Alignment:
Q  44 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgg 143  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31423091 aaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgg 31422992  T
Q  144 tagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaa-------tg-----gagggctgctctctcccctagact 230  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||       ||     |||||||||||||||| | |||||    
T  31422991 gagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaacagagggctgctctctcctccagact 31422892  T
Q  231 aggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtg 271  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  31422891 aggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttgtg 31422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 77 - 263
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786121
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 23786033  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  23786034 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15669613 - 15669419
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15669613 aacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 15669516  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca 236  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||   |||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15669515 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccgagactaggtca 15669419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Original strand, 42922292 - 42922514
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42922292 aacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 42922389  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat- 238  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||| || ||||| ||||||||| |||  |||||||||| |     
T  42922390 cgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtg 42922489  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  42922490 ttggaccgaactgggtaaacaaatt 42922514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 258
Target Start/End: Original strand, 47451694 - 47451919
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  47451694 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt------ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctt 47451787  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||| |||||||||| | |||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||||| |    
T  47451788 tgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctccccca 47451887  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaac 258  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47451888 tactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8347476 - 8347284
Alignment:
Q  59 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgt 158  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8347476 agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgt 8347377  T
Q  159 aatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaac 249  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8347376 aacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtcagttttggaccgaac 8347284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49495411 - 49495206
Alignment:
Q  62 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaat 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  49495411 gttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaac 49495312  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  49495311 ccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaa 49495212  T
Q  261 attctt 266  Q
    ||||||    
T  49495211 attctt 49495206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 272
Target Start/End: Original strand, 23816030 - 23816177
Alignment:
Q  125 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| || |  |||||| ||||||||||||    
T  23816030 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctcccc 23816129  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23816130 catactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 23816177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 180
Target Start/End: Original strand, 6823931 - 6824091
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-------ggttacgggaagagatt 119  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||       |||||||||||||||||    
T  6823931 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagatt 6824030  T
Q  120 gggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgt 180  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6824031 ggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738625
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaat 161  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||     
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca---catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaa 257  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||||||||||    ||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||| | ||||||| |||||||| ||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaa 30738631  T
Q  258 caaatt 263  Q
    ||||||    
T  30738630 caaatt 30738625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8349271 - 8349049
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  8349271 aacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattagg 8349174  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-at 238  Q
    |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |  ||||||||||  |||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||  |    
T  8349173 cgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagtt 8349074  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  8349073 ttagaccgaactgggtaaacaaatt 8349049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18800775 - 18800600
Alignment:
Q  60 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgta 159  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18800775 gggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgta 18800676  T
Q  160 atccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggt 234  Q
      |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||  ||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  18800675 tcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcccccaaactaggt 18800600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13125677 - 13125455
Alignment:
Q  42 acaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg- 140  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  13125677 acaaacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggt 13125580  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat- 238  Q
      | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || |||| | ||||||| ||||   ||||||||| |     
T  13125579 ttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggtcagta 13125480  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||    
T  13125479 taggaccgaactaggtaaacaaatt 13125455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561751
Alignment:
Q  60 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || |||||| || ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  159 aatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtca 256  Q
    || || ||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||   |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  257 acaaatt 263  Q
    |||||||    
T  16561745 acaaatt 16561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790412
Alignment:
Q  61 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgta 159  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | || |||| |||||||||||   | |||||||||||||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 30790504  T
Q  160 atccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaact 250  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  30790503 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttccc-agactaggtcagttttggaccgaact 30790412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613237
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||     
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
    || ||||||||||||||| ||  ||||| ||||  |||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||| ||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  260 aatt 263  Q
    ||||    
T  26613240 aatt 26613237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 238
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   | ||| | ||||||||||     
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 238  Q
    |  ||| |||||| |||||||  ||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc-aaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Original strand, 27916556 - 27916780
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27916556 aacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattagg 27916653  T
Q  141 -cggtagacttattcttgtaa--tccattgatatctcttttgtaacattactcatc-acatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca 236  Q
       | ||||| |||||| |||  | | |||||||||| |||||||  |||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27916654 tttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 27916752  T
Q  237 at-ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
     | |||||||||| | ||| ||||||||    
T  27916753 gtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 272
Target Start/End: Original strand, 13358798 - 13358864
Alignment:
Q  206 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13358798 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 13358864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 28279326 - 28279560
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattag 139  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28279326 aacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattag 28279423  T
Q  140 g-cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctct-cccctagactaggtca 236  Q
    |   | ||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||| | || ||| | ||||||||||||||||    
T  28279424 gtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaattgagagttgttctttccccctagactaggtca 28279523  T
Q  237 at-ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     | || || |||||| ||| |||||||| || |||||    
T  28279524 gtattagatcgaactgggtaaacaaatttttgtgtgt 28279560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26520321 - 26520205
Alignment:
Q  61 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg------gttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttatt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | | |||||||    
T  26520321 ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttatt 26520222  T
Q  154 cttgtaatccattgata 170  Q
    ||||||| |||||||||    
T  26520221 cttgtaacccattgata 26520205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 263
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916674
Alignment:
Q  153 tcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcac-atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaa-tttggaccgaact 250  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||  |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  251 tggtcaacaaatt 263  Q
     ||| ||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaatta 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactggga-cttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 194
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104374
Alignment:
Q  67 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtaga-cttattcttgtaatcca 164  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||  | ||||||||||||||||   | |||  || ||||||||| ||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  165 ttgatatctcttttgtaacattactcatca 194  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatca 43104374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232658
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgaga-cttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353342
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttg 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   ||||||| ||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 21353431  T
Q  180 taacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    |||    ||||||||  |||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  21353430 taaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaattctt 21353342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9476330 - 9476265
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9476330 catagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26332781 - 26332719
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 105  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26332781 aacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401342
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 2401342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526527
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Original strand, 47102879 - 47102934
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  47102879 tggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447263
Alignment:
Q  234 tcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 13447263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13598467 - 13598402
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  13598467 catagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 16124544 - 16124609
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  16124544 catagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 47703964 - 47704029
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  47703964 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 119
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959186
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagatt 49959186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 140
Target Start/End: Original strand, 37990772 - 37990836
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  37990772 gaaacactattagaattgagtctcttgatcacgagaagagattcgaaattttgggtagaattagg 37990836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521776
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19072987 - 19072932
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19072987 tggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19120877 - 19120822
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19120877 tggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Original strand, 26644935 - 26644990
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  26644935 tggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37559906 - 37559867
Alignment:
Q  221 cccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37559906 cccctagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 37559867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Original strand, 47098862 - 47098917
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  47098862 tggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393404
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattag 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||  ||||||||||||||    
T  2393461 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctggga-cttgggtagaattag 2393404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29651880 - 29651818
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaa 257  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  29651880 catagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834167
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3281767 - 3281715
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaa 257  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  3281767 tggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3847165 - 3847121
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3847165 tctcttccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 3847121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13138020 - 13137976
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  13138020 tctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13137976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 260
Target Start/End: Original strand, 21536598 - 21536662
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||| |||||||||    
T  21536598 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220226
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265554
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 50169254 - 50169210
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  50169254 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactggatcaacaa 50169210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 106)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18511445 - 18511200
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18511445 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 18511346  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18511345 tggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccta 18511246  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18511245 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 18511200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 695898 - 696169
Alignment:
Q  1 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  695898 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctc 695996  T
Q  101 ttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catag 199  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||    
T  695997 ttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatag 696096  T
Q  200 tgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  696097 tgaaacggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgt 696169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10529332 - 10529091
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10529332 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctt 10529233  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |    
T  10529232 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctccccca 10529133  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10529132 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10529091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 21948072 - 21948317
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||    
T  21948072 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactt 21948171  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21948172 tgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccca 21948271  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21948272 gactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 21948317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 6745115 - 6745359
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6745115 gtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactt 6745213  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  6745214 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 6745313  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6745314 gacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 6745359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 25804071 - 25804315
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  25804071 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctt 25804170  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  25804171 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc-a 25804269  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25804270 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgt 25804315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18509551 - 18509306
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18509551 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactt 18509452  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18509451 tgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctccccta 18509352  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18509351 gactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 18509306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25921706 - 25921461
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |     
T  25921706 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactc 25921607  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |    
T  25921606 tgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctccccca 25921507  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25921506 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 25921461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 39854529 - 39854774
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||    
T  39854529 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactt 39854628  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  39854629 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 39854728  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39854729 gactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 39854774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 658586 - 658344
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  658586 gtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 658487  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||   ||| |    
T  658486 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct---cccca 658390  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  658389 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 658344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 24126916 - 24127147
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24126916 aacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 24127015  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 240  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24127016 cgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 24127115  T
Q  241 ggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24127116 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 24127147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2818569 - 2818323
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggtt-gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  2818569 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggact 2818470  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  2818469 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctctccccc 2818370  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818369 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 2818323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 4236675 - 4236919
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  4236675 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 4236774  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  4236775 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 4236874  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4236875 aactaggtcaatttggaccgaac-tggtcaataaattcttttgtgt 4236919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 25904149 - 25904394
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  25904149 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctt 25904248  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| |    
T  25904249 tgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctccccca 25904348  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25904349 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgt 25904394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 271
Target Start/End: Original strand, 40221568 - 40221813
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  40221568 gtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggactt 40221667  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||||||     
T  40221668 ttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccc 40221767  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtg 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  40221768 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtg 40221813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1189842 - 1189595
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  1189842 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattgagactt 1189743  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcc-cc 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||||| || |||||| |||||||||| ||    
T  1189742 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctctctcctcc 1189643  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1189642 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1189595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16092430 - 16092187
Alignment:
Q  30 tgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgg 129  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16092430 tgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgg 16092331  T
Q  130 gtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctaga 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16092330 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctaga 16092231  T
Q  229 ctaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  16092230 ctaggtcaatttagactgaactggatcaacaaattcttttgtgt 16092187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 18466730 - 18466973
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||    
T  18466730 gtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactt 18466829  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||| |    
T  18466830 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctccccca 18466929  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18466930 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 18466973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 2174965 - 2175209
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2174965 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 2175064  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  2175065 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 2175163  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2175164 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 2175209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10474556 - 10474311
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10474556 gtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactt 10474457  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  10474456 tgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccccca 10474357  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10474356 tactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 10474311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 27910496 - 27910741
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || || ||    
T  27910496 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactt 27910595  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||| |    
T  27910596 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctccccca 27910695  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27910696 gattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 27910741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 269
Target Start/End: Original strand, 17072929 - 17073172
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  17072929 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctt 17073028  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  17073029 tcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccccc 17073128  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 269  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17073129 agactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17073172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 59 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505831
Alignment:
Q  59 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  159 aatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaac 258  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc--tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  259 aaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||    
T  20505844 aaattcttttgtgt 20505831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 16776204 - 16776448
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  16776204 gtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 16776303  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||||||| ||||||| |    
T  16776304 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatctccccca 16776402  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16776403 gactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 16776448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36402561 - 36402316
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  36402561 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactt 36402462  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||| |    
T  36402461 tgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctccccca 36402362  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36402361 gactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 36402316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 38882152 - 38882396
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  38882152 gtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 38882251  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| | |    
T  38882252 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcctcca 38882350  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38882351 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 38882396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585732
Alignment:
Q  48 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtaga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  148 cttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccga 247  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  248 acttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  41585756 actgggtcaacaaattcttttgtgt 41585732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 31545126 - 31545371
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  31545126 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggact 31545225  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  31545226 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 31545324  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  31545325 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 31545371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37706012 - 37705774
Alignment:
Q  28 tttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatttt 127  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  37706012 tttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtttt 37705913  T
Q  128 gggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctag 227  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | | ||||  ||||||||| ||    
T  37705912 ggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcccccag 37705813  T
Q  228 actaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37705812 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 37705774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 10586851 - 10587123
Alignment:
Q  1 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10586851 tttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtct 10586950  T
Q  100 cttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatag 199  Q
    |||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  10586951 cttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatag 10587049  T
Q  200 tgaaatggagggctgctctct-cccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10587050 tggatcggagggctgctctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 10587123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 27912582 - 27912827
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||    
T  27912582 gtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactt 27912681  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||  |||  ||||||||||||| |    
T  27912682 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgctctctccccca 27912781  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27912782 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 27912827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 272
Target Start/End: Original strand, 6747353 - 6747595
Alignment:
Q  28 tttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatttt 127  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6747353 tttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggacttt 6747451  T
Q  128 gggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctag 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||| |  ||    
T  6747452 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctctctcag 6747550  T
Q  228 actaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6747551 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 6747595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 18596691 - 18596937
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18596691 gtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 18596790  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| |     
T  18596791 tgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctcc 18596890  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18596891 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgt 18596937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31472846 - 31472600
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  31472846 gtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactt 31472747  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    | ||||||||||||||| |  | | ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  31472746 ttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctccccc 31472647  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31472646 atactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 31472600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 272
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724184
Alignment:
Q  43 caaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcg 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  143 gtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgg 242  Q
    |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  243 accgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 2724184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 6756540 - 6756783
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  6756540 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactt 6756639  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||     
T  6756640 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaa-cgagggctgctctctccccc 6756736  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  6756737 aaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgt 6756783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34477287 - 34477041
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34477287 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 34477188  T
Q  126 ttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    |||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  34477187 ttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc 34477089  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34477088 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgt 34477041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 31542781 - 31543025
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31542781 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 31542880  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  31542881 ttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctcttt-gtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 31542978  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  31542979 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 31543025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39398226 - 39397981
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  39398226 gtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaact 39398128  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || | ||||| ||| ||| ||||||||||||||      
T  39398127 ttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctcccac 39398028  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  39398027 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgt 39397981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 272
Target Start/End: Original strand, 2954463 - 2954707
Alignment:
Q  28 tttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  2954463 tttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactt 2954562  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| |    
T  2954563 tgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctccccca 2954661  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2954662 aactaggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 2954707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 26097779 - 26098022
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||| ||    
T  26097779 gtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactt 26097877  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||| | |    
T  26097878 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgctctctcctcca 26097976  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26097977 gactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 26098022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 269
Target Start/End: Original strand, 18469057 - 18469297
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  18469057 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 18469156  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||| || | || |||||||||||||  |    
T  18469157 taggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctctctccc--a 18469254  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 269  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  18469255 gactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttg 18469297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34479652 - 34479406
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  34479652 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagact 34479553  T
Q  126 ttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    |||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  34479552 ttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc 34479454  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34479453 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 34479406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17818715 - 17818480
Alignment:
Q  35 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtaga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  17818715 ctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga 17818616  T
Q  135 attaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggt 234  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||  |||||||  ||||||||| | |||||||    
T  17818615 attatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcccccaaactaggt 17818518  T
Q  235 caatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17818517 caatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 17818480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21684684 - 21684440
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  21684684 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctt 21684585  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  21684584 tgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 21684486  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21684485 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgt 21684440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31179604 - 31179368
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31179604 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 31179505  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  31179504 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 31179406  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31179405 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31179368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410313
Alignment:
Q  48 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtaga 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  148 cttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccga 247  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  248 acttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaattcttttgtgt 4410313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 272
Target Start/End: Original strand, 15552307 - 15552536
Alignment:
Q  43 caaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggc 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15552307 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 15552406  T
Q  142 ggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttg 241  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  15552407 gggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattg 15552505  T
Q  242 gaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  15552506 gaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 15552536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 60 - 272
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798338
Alignment:
Q  60 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgta 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  160 atccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
    | |||||||| |||||||| |||   ||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  260 aattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||    
T  39798326 aattcttttgtgt 39798338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31466211 - 31465979
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  31466211 gtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactt 31466112  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||          |||||||||||| |||| |    
T  31466111 tgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatat----------agggctgctctcaccccca 31466023  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31466022 gactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgt 31465979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 77 - 267
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749986
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 10749894  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttt 267  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10749895 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10749986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12556156 - 12555911
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  12556156 gtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagatt-ggagtt 12556058  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    | ||||||||||| |   |||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||  | || |||| ||||||||||| |||||||     
T  12556057 ttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatctccccc 12555958  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12555957 atactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgt 12555911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 270
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208865
Alignment:
Q  62 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  161 tccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttcccc-atactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 36208854  T
Q  260 aattcttttgt 270  Q
    |||||||||||    
T  36208855 aattcttttgt 36208865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 21288810 - 21289050
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtt------tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  21288810 gtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagatta 21288908  T
Q  121 ggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctct 220  Q
    ||| ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||  |||        |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  21288909 ggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactcat--------cttttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctct 21289000  T
Q  221 cccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21289001 cccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 21289050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354563
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15354658 tt-gtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 15354563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665334
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23665239 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 23665334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793253
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23793348 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 23793253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373125
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 3373222  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  3373221 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 3373125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356839
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15356934 tt-gtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 15356839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 77 - 267
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757462
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttt 267  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10757372 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattcttt 10757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 34530899 - 34530744
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  34530899 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactt 34530800  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaa 182  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34530799 tgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaa 34530744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6661386 - 6661181
Alignment:
Q  60 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgta 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  6661386 gggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgta 6661287  T
Q  160 atccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaa 257  Q
    | |||||||||||||||||||||  || ||||| |  |||||| || ||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | | ||    
T  6661286 acccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaa 6661187  T
Q  258 caaatt 263  Q
    ||||||    
T  6661186 caaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960120
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  38960215 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 38960120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 9020280 - 9020511
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9020280 aacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattagg 9020377  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtc-aat 238  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |  ||| ||||||||||||| | | | ||||||   |    
T  9020378 cggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgtt 9020477  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  9020478 ttggaccgaactggataaaccaattcttttgtgt 9020511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741847
Alignment:
Q  84 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaa 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctcttt-gtaa 23741937  T
Q  183 cattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23741936 cgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 23741847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 143
Target Start/End: Original strand, 20045056 - 20045172
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  20045056 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactt 20045155  T
Q  127 tgggtagaattaggcgg 143  Q
    |||||||||||||||||    
T  20045156 tgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 139
Target Start/End: Original strand, 20043096 - 20043208
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  20043096 gtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 20043195  T
Q  127 tgggtagaattag 139  Q
    ||| |||||||||    
T  20043196 tggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143722
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaat 161  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||     
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca 236  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtca 15143722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17413385 - 17413176
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  17413385 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattagg 17413288  T
Q  141 -cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 238  Q
       | | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||  ||||| |||||||||||| ||| | ||||| |    
T  17413287 tttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagt 17413188  T
Q  239 -ttggaccgaac 249  Q
     |||||||||||    
T  17413187 gttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 20053905 - 20054128
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     ||||||||| |||  |||||||||||    
T  20053905 aacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtttgg-----agattgggactttaagtagaattagg 20053997  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-at 238  Q
     || |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||  || ||| ||||||||||||| | | |||||||||  |    
T  20053998 tgggagacttattcttgtaaccc---gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagtt 20054094  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  20054095 ttggaccgaactgcgtaaacaaattcttttgtgt 20054128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26098484 - 26098379
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26098484 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattggggttt 26098385  T
Q  127 tgggta 132  Q
    ||||||    
T  26098384 tgggta 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 169 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26098380 - 26098280
Alignment:
Q  169 tatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctct-cccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttt 267  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26098380 tatctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttt 26098281  T
Q  268 t 268  Q
    |    
T  26098280 t 26098280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 194
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771023
Alignment:
Q  107 acgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca 194  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatca 42771023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 194
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897942
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggc-ggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttg 179  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  180 taacattactcatca 194  Q
    |||  ||||||||||    
T  4897928 taaagttactcatca 4897942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 264
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667601
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||| || |||| || |||||||| |||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattc 264  Q
    || ||||| | |||||||| ||| || |  ||||||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  23667514 tt-gtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattc 23667601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033691
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaatta 138  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaatta 34033691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 139
Target Start/End: Original strand, 42770847 - 42770924
Alignment:
Q  60 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattag 139  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  42770847 gggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 42770924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 140
Target Start/End: Original strand, 4754215 - 4754312
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  4754215 aacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 272
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043281
Alignment:
Q  213 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgt 20043281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782578
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2144763 - 2144599
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgta 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||    
T  2144763 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgta 2144664  T
Q  160 atc-cattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctccc 223  Q
    | |   || ||||||| |||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||    
T  2144663 accttttttatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15445453 - 15445263
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggtt---acgggaagagattgggattttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgtaatccattgatatct 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||     ||  |||||||||| || |||| |||||||||||   | ||| | |||||||||| || |||||||||    
T  15445453 aaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatct 15445354  T
Q  174 cttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||||||  ||||||||||  |||||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  15445353 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctcttccc-agactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170872
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 1170872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385573
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 35385573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 135
Target Start/End: Original strand, 29748408 - 29748502
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaa 135  Q
    |||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  29748408 aacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaaacactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452556
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430338
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattagg 35430338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240489
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattagg 1240489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298145
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2298145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 120
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627406
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 10627406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 9353360 - 9353425
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9353360 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445557
Alignment:
Q  83 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 25445557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 36932378 - 36932443
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  36932378 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 140
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520597
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  32520533 gaaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16093473 - 16093438
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16093473 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 16093438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 116
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786442
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28786442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28832318 - 28832263
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  28832318 tggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15224988 - 15224889
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaatta 138  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  15224988 aacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgggtaaaatta 15224891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10281820 - 10281755
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  10281820 catagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14520283 - 14520234
Alignment:
Q  211 gctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  14520283 gctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14520234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15464601 - 15464536
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||    
T  15464601 catagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 260
Target Start/End: Original strand, 17004004 - 17004053
Alignment:
Q  211 gctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  17004004 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19588815 - 19588750
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||    
T  19588815 catagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaa 19588750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 260
Target Start/End: Original strand, 11917001 - 11917065
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  11917001 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806531
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32636992
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 94)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30480736 - 30480491
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||    
T  30480736 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctt 30480637  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  30480636 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctccccca 30480537  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30480536 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 30480491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 3874112 - 3874357
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  3874112 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 3874211  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  3874212 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 3874311  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3874312 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 3874357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 32339411 - 32339656
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  32339411 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctt 32339510  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  32339511 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 32339610  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32339611 gactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgt 32339656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 18812958 - 18813228
Alignment:
Q  1 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18812958 tttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 18813057  T
Q  101 ttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagt 200  Q
    |||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  18813058 ttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagt 18813156  T
Q  201 gaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | | |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18813157 ggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 18813228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Original strand, 608836 - 609077
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||    
T  608836 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactt 608935  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  608936 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 609035  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  609036 gactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 609077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 27829399 - 27829643
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |    
T  27829399 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacct 27829498  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  27829499 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 27829597  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27829598 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 27829643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 15068083 - 15068328
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||    
T  15068083 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactt 15068182  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| |    
T  15068183 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctccccca 15068282  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  15068283 gactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgt 15068328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27107130 - 27106885
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  27107130 gtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactt 27107031  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  27107030 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctcca 27106931  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27106930 gactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgt 27106885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 14807853 - 14808108
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  14807853 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 14807952  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctg----------ct 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||          ||    
T  14807953 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccct 14808052  T
Q  217 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14808053 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 14808108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 271
Target Start/End: Original strand, 27911116 - 27911359
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27911116 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 27911215  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  27911216 tgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccc-a 27911314  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtg 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27911315 gactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtg 27911359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 271
Target Start/End: Original strand, 27957535 - 27957778
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27957535 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 27957634  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  27957635 tgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccc-a 27957733  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtg 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27957734 gactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtg 27957778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 1225268 - 1225514
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1225268 gtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctt 1225367  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||      
T  1225368 tgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctccctc 1225467  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1225468 atactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 1225514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 15072812 - 15073058
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggatt 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |    
T  15072812 gtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggact 15072911  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||     
T  15072912 ttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctctctccccc 15073011  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15073012 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgt 15073058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22684889 - 22684641
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  22684889 gtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 22684790  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatcc---attgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccc 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  22684789 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 22684690  T
Q  224 ctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22684689 ccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 22684641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 4424120 - 4424365
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  4424120 gtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctt 4424219  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||| |    
T  4424220 tggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccca 4424319  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4424320 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 4424365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 27827088 - 27827332
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |    
T  27827088 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggacct 27827187  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  27827188 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 27827286  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27827287 gactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 27827332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28251800 - 28251555
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  28251800 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 28251701  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  28251700 tgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 28251601  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28251600 tactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 28251555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28283444 - 28283209
Alignment:
Q  35 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtaga 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28283444 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaga 28283345  T
Q  135 attaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggt 234  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28283344 attaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggt 28283247  T
Q  235 caatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28283246 caatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 28283209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 36 - 272
Target Start/End: Original strand, 15809329 - 15809565
Alignment:
Q  36 tttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaa 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||    
T  15809329 tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaa 15809428  T
Q  136 ttaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtc 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |   |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15809429 ttaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtc 15809528  T
Q  236 aatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15809529 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 15809565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14419424 - 14419178
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14419424 gtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 14419325  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||     
T  14419324 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctccccc 14419225  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14419224 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 14419178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 43530217 - 43530462
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||    
T  43530217 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactt 43530316  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||| || |    
T  43530317 tgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctctccca 43530416  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43530417 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 43530462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 18810810 - 18811054
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  18810810 gtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactt 18810909  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  18810910 taggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccca 18811008  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18811009 gattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 18811054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 25952622 - 25952868
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  |    
T  25952622 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacat 25952721  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||     
T  25952722 tgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccccc 25952821  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25952822 agactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 25952868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 43079704 - 43079949
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43079704 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 43079803  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  43079804 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 43079902  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  43079903 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 43079949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Original strand, 41384846 - 41385087
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  41384846 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctt 41384945  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    | |||||||||||| || ||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  41384946 taggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccca 41385045  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41385046 tactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 41385087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 43082075 - 43082320
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43082075 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 43082174  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  43082175 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 43082273  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  43082274 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 43082320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 272
Target Start/End: Original strand, 44720948 - 44721190
Alignment:
Q  30 tgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttg 128  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  44720948 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttg 44721047  T
Q  129 ggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctaga 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||  |||    
T  44721048 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccgcaga 44721146  T
Q  229 ctaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  44721147 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 44721190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13858703 - 13858477
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  13858703 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaag 13858604  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
    ||| ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13858603 cgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 13858505  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttt 267  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  13858504 tggacagaactgggtaaacaaattcttt 13858477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 272
Target Start/End: Original strand, 41382776 - 41383009
Alignment:
Q  28 tttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatttt 127  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  41382776 tttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggcttt 41382864  T
Q  128 gggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctag 227  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  41382865 gggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccag 41382964  T
Q  228 actaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41382965 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 41383009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 36865640 - 36865884
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| | ||    
T  36865640 gtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaactt 36865736  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctct-cccc 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  36865737 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctccccc 36865836  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  36865837 aagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgt 36865884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 270
Target Start/End: Original strand, 15956076 - 15956303
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15956076 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 15956172  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||  ||| ||||||||||    
T  15956173 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtttctctctccctcagattaggtcaatt 15956272  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15956273 tggactgaactgggtcaacaaattcttttgt 15956303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5372411 - 5372168
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5372411 gtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactt 5372312  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctct-cccc 224  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  5372311 tgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccccc 5372212  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  5372211 cagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattatttt 5372168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 250
Target Start/End: Original strand, 21480621 - 21480828
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  21480621 aacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattagg 21480717  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21480718 cgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 21480817  T
Q  240 tggaccgaact 250  Q
    |||| ||||||    
T  21480818 tggaacgaact 21480828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15185943 - 15185706
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct--tggttacgggaagagattgggat 124  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||         
T  15185943 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagagatt----- 15185849  T
Q  125 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcac-atagtgaaatggagggctgctctctccc 223  Q
      ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  15185848 --tgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctccc 15185751  T
Q  224 ctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15185750 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 15185706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Original strand, 21482429 - 21482649
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21482429 aacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattagg 21482525  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
    ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21482526 cgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatt 21482625  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||    
T  21482626 tggaccgaactgggtaaacaaatt 21482649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24873414 - 24873178
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24873414 gtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggact 24873315  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  24873314 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 24873216  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    | |||||||||  |||||||||| |  |||||||||||    
T  24873215 atactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 263
Target Start/End: Original strand, 31162343 - 31162551
Alignment:
Q  59 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31162343 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgt 31162442  T
Q  159 aatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctct--cccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggt 254  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  31162443 aactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggt 31162542  T
Q  255 caacaaatt 263  Q
     ||||||||    
T  31162543 aaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 171
Target Start/End: Original strand, 14477378 - 14477522
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  14477378 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 14477477  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatat 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14477478 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33541621 - 33541398
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33541621 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggactt 33541522  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    | ||||||||||||                      ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  33541521 ttggtagaattagg----------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctccccca 33541444  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||    
T  33541443 gactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttttgtgt 33541398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3005829 - 3005624
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatc 162  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3005829 ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatc 3005730  T
Q  163 cattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||| || |||||| |||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  3005729 cattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaa 3005630  T
Q  261 attctt 266  Q
    ||||||    
T  3005629 attctt 3005624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 224
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181798
Alignment:
Q  48 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattgagtctcttggttacg--ggaagagattgggattttgggtagaattaggcggt 144  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  145 agacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||  || | |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcat--catagtgaaacagatgactgctctctcccc 181798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578273
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaat 161  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
    |  ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  260 aatt 263  Q
    ||||    
T  31578276 aatt 31578273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035459
Alignment:
Q  60 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  159 aatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagac--taggtcaat-ttggaccgaacttggt 254  Q
    || || |||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  255 caacaaatt 263  Q
     ||||||||    
T  31035451 aaacaaatt 31035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31573924 - 31573794
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaat 161  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31573924 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 31573825  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcat 192  Q
     | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31573824 tctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  131 tagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcac-atagtgaaatggagggctgctctctcccctagac 229  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  230 taggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37214424 - 37214317
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  37214424 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagcgattggaactt 37214334  T
Q  127 tgggtagaattaggcgg 143  Q
    |||||||||||||||||    
T  37214333 tgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5622959 - 5622877
Alignment:
Q  39 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5622959 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847830
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgta 159  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  160 atccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca 236  Q
    | || |||||||||||||||||| || | |      |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17847761 a-cctttgatatctcttttgtaaaatcatt------atagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtca 17847830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872441
Alignment:
Q  147 acttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccg 246  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||             ||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccg 35872467  T
Q  247 aacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  35872466 aactgggtcaacaaattcttttgtgt 35872441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Original strand, 26775303 - 26775378
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26775303 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37214314 - 37214252
Alignment:
Q  210 ggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37214314 ggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 37214252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 35872616 - 35872555
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 88  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872616 gtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985199
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 13985199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2468322 - 2468261
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 105  Q
    |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468322 aacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 263
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376328
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaatccattgatatctctt 176  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||  |||||||||||   | ||||| |||||||| | |  |||||||||| |    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctc-t 6376239  T
Q  177 ttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||||||  ||||||||||  |||||| ||  || ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  6376240 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaatt 6376328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Original strand, 19752432 - 19752487
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19752432 tggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021228
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattag 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752643
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757388
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 16757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28327969
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 28327969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895563
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 272
Target Start/End: Original strand, 14477521 - 14477598
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaact-tggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||| ||| |||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14477521 atagtgaaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgt 14477598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590855
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032715
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Original strand, 3895957 - 3896035
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||    
T  3895957 ttgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattagg 3896035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812608
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 4812608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799568
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17799568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332692
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctggga-cttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 4696624 - 4696689
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  4696624 catagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 26403258 - 26403323
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  26403258 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554908
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaatta 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaatta 29554908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 97
Target Start/End: Original strand, 31035184 - 31035238
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 97  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035184 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 31071257 - 31071322
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31071257 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 260
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9765912
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12702678 - 12702634
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12702678 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12702634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 177
Target Start/End: Original strand, 15949534 - 15949634
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaatccattgatatctctt 176  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  15949534 aaacactattaggatatagtctcttggtcacgggaagagattcgggacttgggtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaattctctgatatctctt 15949633  T
Q  177 t 177  Q
    |    
T  15949634 t 15949634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839043
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt--caggaagagattcaagactttgggtagaattagg 33839043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684704
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  25684646 cactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacaggga-cttgggtagaattagg 25684704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2267205 - 2267144
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  2267205 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattagga-cttgggtagaattagg 2267144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10930243 - 10930193
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttctt 10930193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7412410 - 7412345
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  7412410 catagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11701155 - 11701102
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 115  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11701155 ttgattcaccttgaagaaacattattagaattgagtctcttggtcacgggaaga 11701102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 261
Target Start/End: Original strand, 16833769 - 16833886
Alignment:
Q  145 agacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgga 243  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||| || | | ||||||||||||||  |||||| |||| ||| |     
T  16833769 agacttactcttgtaatcatttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtcacttttgg 16833868  T
Q  244 ccgaacttggtcaacaaa 261  Q
     |||||| ||| ||||||    
T  16833869 acgaactgggtaaacaaa 16833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 19175782 - 19175847
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19175782 catagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 23799605 - 23799670
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| | | | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  23799605 catagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212954
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 114
Target Start/End: Original strand, 21033870 - 21033906
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21033870 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag 21033906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811446
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Original strand, 33032771 - 33032811
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca 236  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33032771 atagtggaatggagagctgctctctctcctagactaggtca 33032811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352318
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 40321204 - 40321248
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 122)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 44724635 - 44724880
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  44724635 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactt 44724734  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  44724735 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccca 44724834  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44724835 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 44724880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 38394042 - 38394287
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  38394042 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 38394141  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  38394142 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 38394241  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38394242 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 38394287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 48457709 - 48457954
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  48457709 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 48457808  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  48457809 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccca 48457908  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48457909 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 48457954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 443651 - 443897
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  443651 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactt 443750  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctct-cccct 225  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||     
T  443751 tgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccc 443850  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  443851 cgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 443897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27306463 - 27306224
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  27306463 gtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 27306364  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27306363 tgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccta 27306264  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27306263 gactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 27306224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 9680875 - 9681121
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  9680875 gtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 9680974  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  9680975 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctccccc 9681074  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  9681075 agactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgt 9681121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20137342 - 20137097
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20137342 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactt 20137243  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20137242 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc- 20137144  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20137143 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 20137097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21592376 - 21592131
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21592376 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactt 21592277  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21592276 tgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccca 21592177  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21592176 tactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 21592131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092201
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 240  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaattt 7092233  T
Q  241 ggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7092232 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 7092201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13099709 - 13099462
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13099709 gtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctt 13099610  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13099609 tgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 13099510  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13099509 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 13099462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4296168 - 4295922
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4296168 gtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 4296069  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||     
T  4296068 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctccccc 4295969  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4295968 atactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgt 4295922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 20299515 - 20299761
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  20299515 gtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 20299614  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||     
T  20299615 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgctctctccccc 20299714  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20299715 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 20299761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 35685 - 35930
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  35685 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 35784  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||| |||||||||    
T  35785 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctccccta 35884  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  35885 gactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgt 35930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 20297418 - 20297663
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20297418 gtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctt 20297517  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  20297518 tgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccca 20297617  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20297618 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgt 20297663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 20626094 - 20626339
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20626094 gtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 20626193  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  20626194 tgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 20626293  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20626294 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 20626339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 20629985 - 20630230
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20629985 gtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 20630084  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  20630085 tgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 20630184  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20630185 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 20630230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 20642404 - 20642649
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20642404 gtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 20642503  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  20642504 tgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 20642603  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20642604 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 20642649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 21990206 - 21990451
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  21990206 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctt 21990305  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |    
T  21990306 tgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccaa 21990405  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21990406 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 21990451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42331232 - 42330985
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac--gggaagagattgggat 124  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||     
T  42331232 gtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagac 42331133  T
Q  125 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  42331132 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctctcccc 42331033  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42331032 cagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 42330985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7470253 - 7470010
Alignment:
Q  29 ttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttg 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||    
T  7470253 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttg 7470154  T
Q  129 ggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctaga 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||| |||    
T  7470153 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctcccccaga 7470054  T
Q  229 ctaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7470053 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 7470010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7472211 - 7471968
Alignment:
Q  29 ttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttg 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||    
T  7472211 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttg 7472112  T
Q  129 ggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctaga 228  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||| |||    
T  7472111 ggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctcccccaga 7472012  T
Q  229 ctaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7472011 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 7471968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 24748650 - 24748896
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24748650 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactt 24748749  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  24748750 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctcc 24748849  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24748850 agattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgt 24748896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1047157 - 1046913
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  1047157 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 1047058  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  1047057 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccca 1046959  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1046958 cactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1046913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31435280 - 31435034
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||    
T  31435280 gtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactt 31435181  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||     
T  31435180 tgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccccc 31435081  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31435080 aaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 31435034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1049528 - 1049284
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  1049528 gtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 1049429  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  1049428 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccca 1049330  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1049329 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1049284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40836975 - 40836731
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  40836975 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 40836876  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  40836875 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 40836777  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40836776 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 40836731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 3035777 - 3036025
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga---gattggga 123  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||    
T  3035777 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctggga 3035876  T
Q  124 ttttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccc 223  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  3035877 ctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 3035976  T
Q  224 ctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3035977 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 3036025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 44620 - 44865
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  44620 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactt 44719  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||  |||||| ||||||| |    
T  44720 tgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctccccca 44819  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44820 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 44865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 1850037 - 1850282
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||    
T  1850037 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactt 1850136  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  1850137 tgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 1850236  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1850237 tactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1850282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 3878633 - 3878878
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  3878633 gtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 3878732  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  3878733 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 3878832  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3878833 gactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 3878878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 268
Target Start/End: Original strand, 11355314 - 11355555
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  11355314 gtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactt 11355413  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  11355414 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctccccta 11355513  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11355514 gactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 11355555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 42223213 - 42223457
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  42223213 gtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 42223312  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  42223313 ttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctccccc 42223412  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    | ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  42223413 atactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgt 42223457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094448
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 240  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 7094480  T
Q  241 ggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7094479 ggactgaactgggtcaataaattcttttgtgt 7094448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 9679115 - 9679360
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9679115 gtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggact 9679213  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||  ||     
T  9679214 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttccc 9679313  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  9679314 agactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgt 9679360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 18345597 - 18345842
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||    
T  18345597 gtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactt 18345696  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||| |    
T  18345697 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttctctccccca 18345796  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18345797 gactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgt 18345842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 28487609 - 28487854
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  28487609 gtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctt 28487708  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||| |    
T  28487709 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctccccca 28487808  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28487809 gactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgt 28487854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Original strand, 21678122 - 21678361
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  21678122 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactt 21678221  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  21678222 tgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctccccta 21678321  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21678322 gactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattctt 21678361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39146220 - 39145974
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  39146220 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaactt 39146121  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  39146120 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttccct 39146021  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39146020 aaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 39145974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 28485622 - 28485866
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  28485622 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctt 28485721  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    || ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||   ||||| |||||||||| | |    
T  28485722 tgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctctctcctc-a 28485820  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28485821 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 28485866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37412346 - 37412113
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37412346 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattagg 37412247  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 238  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37412246 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaat 37412147  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  37412146 ttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgt 37412113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 40946384 - 40946629
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  40946384 gtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactt 40946483  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||| |    
T  40946484 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctccccca 40946583  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40946584 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 40946629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 25542586 - 25542829
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  25542586 gtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactt 25542684  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  25542685 tgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctccccta 25542783  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25542784 gactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 25542829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 21680083 - 21680306
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  21680083 gtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggactt 21680182  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| |    
T  21680183 tgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctccccca 21680282  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaact 250  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  21680283 gactaggtgaatttggaccgaact 21680306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27832866 - 27832651
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  27832866 gtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 27832767  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27832766 tgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctccccc 27832667  T
Q  226 agactaggtcaatttg 241  Q
    ||||||||||||||||    
T  27832666 agactaggtcaatttg 27832651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7351885 - 7351640
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7351885 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 7351786  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  7351785 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 7351687  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  7351686 atactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 7351640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43253749 - 43253505
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || || ||    
T  43253749 gtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactt 43253651  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||  |    
T  43253650 tggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccctca 43253551  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43253550 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgt 43253505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31156144 - 31155899
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  31156144 gtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggact 31156045  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  31156044 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctctccccc 31155946  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  31155945 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 31155899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 272
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396935
Alignment:
Q  49 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagac 148  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  149 ttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaa 248  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  249 cttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  38396912 ctgggtcaacaaattcttttgtgt 38396935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7349506 - 7349285
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7349506 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagact 7349407  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  7349406 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 7349308  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaa 248  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  7349307 agactaggtcagattggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 201
Target Start/End: Original strand, 11757285 - 11757460
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  11757285 gtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 11757384  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtg 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11757385 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 11757460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Original strand, 25276197 - 25276364
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  25276197 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 25276296  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25276297 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatca 25276364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 24258519 - 24258769
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||    
T  24258519 gtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactt 24258618  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca----catagtgaaatggagggctgctctctcc 222  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||     |||||| || ||||||||||||||||     
T  24258619 tggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctct 24258718  T
Q  223 cctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaac-aaattcttttgtgt 272  Q
       ||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||||||    
T  24258719 ttcagactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaaattcttttgtgt 24258769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 77 - 263
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935560
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 2935472  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2935473 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137378
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22137283 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 22137378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552405
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40552310 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 40552405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108367
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22108272 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 22108367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550127
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40550032 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 40550127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24813712 - 24813494
Alignment:
Q  44 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgg 143  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24813712 aaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtctcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgg 24813616  T
Q  144 tagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttg 241  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||  |||||| |  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||    
T  24813615 gagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattatagtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttg 24813516  T
Q  242 gaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||||||||| ||| ||||||||    
T  24813515 gaccgaactgggtaaacaaatt 24813494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24817576 - 24817358
Alignment:
Q  35 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtaga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  24817576 ctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtaga 24817480  T
Q  135 attaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactagg 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  24817479 attaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatactagg 24817380  T
Q  234 tca-atttggaccgaacttggt 254  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  24817379 tcagttttggaccgaacttggt 24817358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20091745 - 20091583
Alignment:
Q  60 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgta 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20091745 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 20091646  T
Q  160 atccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20091645 acccattgatatctcttttgtaaagttactcat--catagtggaacggagggctgctctctcccc 20091583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22828852 - 22828672
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22828852 aacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattagg 22828753  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctct 220  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||    
T  22828752 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 77 - 263
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606671
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||     
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 1606583  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  1606584 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 1606671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 77 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027191
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  9027277 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 124 - 272
Target Start/End: Original strand, 22393875 - 22394024
Alignment:
Q  124 ttttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcc 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||||    
T  22393875 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctcc 22393974  T
Q  223 cctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  22393975 cctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgt 22394024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 160
Target Start/End: Original strand, 26804625 - 26804761
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactag---ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  26804625 gtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgaga 26804724  T
Q  124 ttttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaa 160  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26804725 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26804761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Original strand, 7188611 - 7188833
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| |    
T  7188611 aacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaag 7188708  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-at 238  Q
    ||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||| ||| || ||| ||||  |    
T  7188709 cgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttccccagtctatgtcagtt 7188808  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  7188809 ttggactgaactaggtaaacaaatt 7188833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22251775 - 22251637
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  22251775 gtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctt 22251684  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatct 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22251683 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 22251637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Original strand, 24465629 - 24465829
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatc 162  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||      
T  24465629 ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaact 24465728  T
Q  163 cattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaa 261  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||  ||| ||||| ||  | ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||  || ||||||    
T  24465729 cattgatatgtcttttgtaa-agtactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctcccccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaa 24465827  T
Q  262 tt 263  Q
    ||    
T  24465828 tt 24465829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332514
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggc-ggtagacttattcttgtaat 161  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||     
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaac 6332410  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
    || || |||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||| | ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  6332411 cctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 6332510  T
Q  260 aatt 263  Q
    ||||    
T  6332511 aatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 266
Target Start/End: Original strand, 26295580 - 26295743
Alignment:
Q  104 gttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtga 202  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||    
T  26295580 gttacaggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtga 26295679  T
Q  203 aatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    ||  || | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  26295680 aacagatgactgctctctcctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattctt 26295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Original strand, 11081578 - 11081803
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  11081578 aacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattagg 11081675  T
Q  141 -cggtagacttattcttgtaatcc--attgatatctcttttgtaacattactcatc-acatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca 236  Q
       | ||||| |||||||||| ||   |||||||||||| |||||  |||||||||   | | || || ||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  11081676 tttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtca 11081775  T
Q  237 at-ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    || |||||||||||| ||| ||||||||    
T  11081776 atattggaccgaactgggtaaacaaatt 11081803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297018
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattag-gcggtagacttattcttgtaat 161  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    | ||| | ||||||||||     
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  162 cc-attgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaac 258  Q
    ||  || |||||||||||| ||  ||||||||||  |||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  || |||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  259 aaatt 263  Q
    |||||    
T  16297022 aaatt 16297018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349005
Alignment:
Q  101 ttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca 194  Q
    ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatca 6349005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 118
Target Start/End: Original strand, 22392534 - 22392608
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 118  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22392534 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Original strand, 18567669 - 18567731
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 89  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567669 gtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 272
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759428
Alignment:
Q  208 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 11759428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 248
Target Start/End: Original strand, 6046641 - 6046772
Alignment:
Q  119 tgggattttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgct 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||| |||| || ||||||    
T  6046641 tgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgct 6046739  T
Q  217 ctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaa 248  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  6046740 ctctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281468
Alignment:
Q  66 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaatcca 164  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||   | |||||||||||||||| ||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  165 ttgat 169  Q
    |||||    
T  40281472 ttgat 40281468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369703
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga-cttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 140
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2120960
Alignment:
Q  62 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 2120960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 46516338 - 46516403
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  46516338 catagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 140
Target Start/End: Original strand, 6048941 - 6049039
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattag 139  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  6048941 aacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattag 6049038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310157
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 119  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320171
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 3320171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324919
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 3324919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6067373 - 6067193
Alignment:
Q  87 taggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaca- 184  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||   | ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |     
T  6067373 taggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt-gatagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctc-tttgtaaaag 6067276  T
Q  185 ttactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaattct 265  Q
      |||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  6067275 gaactcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattct 6067193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069841
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 7069841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074848
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 7074848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351414
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 25351414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357108
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 25357108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405454
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 25405454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410191
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 25410191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 272
Target Start/End: Original strand, 26804765 - 26804811
Alignment:
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26804765 agactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 26804811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29159872 - 29159807
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  29159872 catagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Original strand, 9190046 - 9190101
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9190046 tggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20284148 - 20284093
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  20284148 tggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247031
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512646
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378625
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 8378625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541139
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15541139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21983353 - 21983288
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21983353 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14379905 - 14379861
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14379905 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14379861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143997
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2580449 - 2580394
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  2580449 tggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 22828903 - 22828872
Alignment:
Q  1 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgt 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828903 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgt 22828872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34547007
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 34547007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35960875 - 35960820
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  35960875 tggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaa 35960820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 56016 - 55955
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaa 257  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  56016 catagtggattggagggctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 2647724 - 2647789
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||| | |||||||||    
T  2647724 catagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Original strand, 4796707 - 4796760
Alignment:
Q  207 gagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  4796707 gagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 119
Target Start/End: Original strand, 8260584 - 8260625
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 119  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8260584 aaaccctattaggattgagtgtcttggtcacgggaagagatt 8260625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13290672 - 13290595
Alignment:
Q  64 tgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| ||| | | | ||||||||||||||    
T  13290672 tgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctcttggtcacaggaagatattagaactctgggtagaattagg 13290595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2759241 - 2759197
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2759241 tctcttccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 2759197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12097911 - 12097867
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12097911 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14069877 - 14069833
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14069877 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14069833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22251605 - 22251573
Alignment:
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22251605 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 22251573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27347985
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317434
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44010815 - 44010747
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  44010815 atagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaatt 44010747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 183873 - 183629
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  183873 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattgggactt 183775  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  183774 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctca 183675  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  183674 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 183629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Original strand, 52066 - 52307
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  52066 gtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactt 52165  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctg--ctctctcccc 224  Q
    ||| |||||||||| || |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  52166 tggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccc 52265  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
     |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  52266 cagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 52307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 266
Target Start/End: Original strand, 50236 - 50308
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctc--ccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  50236 atagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattctt 50308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 114)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42923742 - 42923497
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  42923742 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctt 42923643  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42923642 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctctccccta 42923543  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42923542 tactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 42923497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 19007662 - 19007907
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  19007662 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggctt 19007761  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  19007762 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctccccca 19007861  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19007862 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 19007907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21520926 - 21520681
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| ||    
T  21520926 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactt 21520827  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  21520826 tgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccccca 21520727  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21520726 gactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgt 21520681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 30 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22287566 - 22287324
Alignment:
Q  30 tgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgg 129  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||    
T  22287566 tgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgg 22287467  T
Q  130 gtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagac 229  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287466 gtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccctagac 22287367  T
Q  230 taggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22287366 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 22287324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23452470 - 23452225
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  23452470 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 23452371  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  23452370 tggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccca 23452271  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23452270 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 23452225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 45280217 - 45279972
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  45280217 gtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 45280118  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  45280117 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 45280018  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  45280017 gactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgt 45279972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 55 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375334
Alignment:
Q  55 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattc 154  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttattc 5375452  T
Q  155 ttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggt 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5375352  T
Q  255 caacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5375351 caacaaattcttttgtgt 5375334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19502244 - 19501999
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  19502244 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 19502145  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||||| |    
T  19502144 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctccccca 19502045  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19502044 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 19501999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 47 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43623793 - 43623568
Alignment:
Q  47 cactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtag 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  43623793 cactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 43623694  T
Q  147 acttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccg 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43623693 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 43623594  T
Q  247 aacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  43623593 aactaggtcaacaaattcttttgtgt 43623568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6264382 - 6264136
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||  ||    
T  6264382 gtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctt 6264283  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6264282 tggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccccc 6264183  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6264182 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 6264136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 27104821 - 27105064
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  27104821 gtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 27104919  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  27104920 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 27105018  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27105019 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 27105064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 42452817 - 42453047
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||    
T  42452817 aacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagg 42452916  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 240  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42452917 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaattt 42453015  T
Q  241 ggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42453016 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 42453047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11739793 - 11739547
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  11739793 gtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactt 11739694  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||| || ||| | |||||||||||||     
T  11739693 tgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccc 11739594  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11739593 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 11739547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 28196659 - 28196902
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||    
T  28196659 gtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctt 28196758  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  28196759 tgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctccccca 28196858  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28196859 gactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 28196902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6259048 - 6258805
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||    
T  6259048 gtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga--agattggggctt 6258951  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6258950 tgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctctcccc- 6258852  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6258851 atactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 6258805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 42064537 - 42064782
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  42064537 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 42064636  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  42064637 tggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 42064735  T
Q  227 gactaggtc-aatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42064736 gactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 42064782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13910277 - 13910033
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  13910277 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactt 13910178  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |   || ||||||||||||||| |    
T  13910177 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctccccca 13910079  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13910078 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 13910033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19504578 - 19504334
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||    
T  19504578 gtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagaggctgggactt 19504480  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||| |    
T  19504479 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctccccca 19504380  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19504379 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 19504334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40032291 - 40032043
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||    
T  40032291 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactt 40032192  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgata----tctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctc 221  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40032191 tgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctctc 40032092  T
Q  222 ccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40032091 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 40032043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 17848465 - 17848707
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  17848465 gtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 17848564  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||     
T  17848565 ttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctccccc 17848660  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17848661 atactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 17848707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45239196 - 45239000
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  45239196 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaag 45239097  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaa 237  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45239096 cgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34979812 - 34979565
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34979812 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactt 34979713  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctct-ctcccc 224  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||  |||||| || | |||||| |||| | ||||    
T  34979712 tcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccc 34979613  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34979612 caaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 34979565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 44289287 - 44289055
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  44289287 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaag 44289188  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
     || | |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  || || |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  44289187 tggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaatt 44289088  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44289087 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 44289055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 14837295 - 14837535
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| || ||    
T  14837295 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagactt 14837388  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcac-atagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |  ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||| || ||||||||||||     
T  14837389 taagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctccccc 14837488  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14837489 agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgt 14837535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 272
Target Start/End: Original strand, 17849147 - 17849384
Alignment:
Q  35 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtaga 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  17849147 ctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtaga 17849246  T
Q  135 attaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactagg 233  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||  | ||||||    
T  17849247 attaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctcccacatactagg 17849345  T
Q  234 tcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  17849346 tcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgt 17849384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35218196 - 35217961
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35218196 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 35218097  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  35218096 ttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 35217998  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  35217997 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 35217961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35215819 - 35215584
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  35215819 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggact 35215720  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  35215719 ttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 35215621  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 262  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  35215620 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 35215584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 3022185 - 3022439
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  3022185 gtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttt 3022284  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca----------catagtgaaatggagggctgct 216  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||  ||||||||||           ||| |||||  || |||||||    
T  3022285 taggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgct 3022383  T
Q  217 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3022384 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 3022439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558852
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36558949  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36558948 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 36558852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561129
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36561226  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36561225 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 36561129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18800530 - 18800301
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18800530 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattagg 18800434  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-at 238  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||  |    
T  18800433 agggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctctcccc-agaccaggtcagtt 18800335  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  18800334 ttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgt 18800301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24162445 - 24162211
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |          ||||| ||    
T  24162445 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc----------tgggactt 24162356  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||   ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||      
T  24162355 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccccg 24162257  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24162256 gactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgt 24162211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28459409 - 28459178
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||| |||||||    
T  28459409 aacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtttggggcttcaggtataattagg 28459310  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  28459309 tgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggcttctctct-acctagactaggtcaatt 28459211  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||| |||||| | | |||||||||||||||||    
T  28459210 tggatcgaactagataaacaaattcttttgtgt 28459178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15539708 - 15539553
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15539708 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactt 15539609  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaa 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15539608 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaa 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407442
Alignment:
Q  118 ttgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctc 217  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 22407497  T
Q  218 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407496 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 22407442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11578309 - 11578104
Alignment:
Q  60 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgta 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11578309 gggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 11578210  T
Q  160 atccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaa 257  Q
    |  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||  || ||||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||| ||||||||| ||| ||    
T  11578209 actcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaa 11578110  T
Q  258 caaatt 263  Q
    ||||||    
T  11578109 caaatt 11578104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 77 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332179
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||     
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc- 45332266  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 262  Q
    |||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  45332265 tttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 45332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31732998 - 31732772
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||            ||||| ||    
T  31732998 gtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt------------tgggactt 31732911  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||||     
T  31732910 tgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctccccc 31732811  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattc 264  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  31732810 agactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattc 31732772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 22874169 - 22874398
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  22874169 aacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattagg 22874265  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
     || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  22874266 tgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccctcatactaggtcaatt 22874365  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||| ||||||    
T  22874366 tggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgt 22874398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20146806 - 20146604
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatc 162  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  20146806 ttgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaact 20146707  T
Q  163 cattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||| ||| ||| |    
T  20146706 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacga 20146607  T
Q  261 att 263  Q
    |||    
T  20146606 att 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 61 - 263
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699634
Alignment:
Q  61 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgta 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  160 atccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaa 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||  ||||| |||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  258 caaatt 263  Q
    ||||||    
T  40699629 caaatt 40699634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17897443 - 17897242
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17897443 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 17897344  T
Q  163 cattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    | ||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||    
T  17897343 ctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctctcccc-agactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaa 17897245  T
Q  261 att 263  Q
    |||    
T  17897244 att 17897242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22707868 - 22707739
Alignment:
Q  145 agacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct--agactaggtcaatttgg 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  22707868 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaatttgg 22707769  T
Q  243 accgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22707768 actgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 22707739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 171 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163010
Alignment:
Q  171 tctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgt 22163012  T
Q  271 gt 272  Q
    ||    
T  22163011 gt 22163010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 269
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871080
Alignment:
Q  140 gcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 239  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 269  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttg 23871080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  131 tagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagact 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| ||| | |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  231 aggtcaa-tttggaccgaacttggtcaa 257  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27136343 - 27136203
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  27136343 aacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaattagg 27136246  T
Q  141 -cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaa 182  Q
       | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27136245 tttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaa 27136203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 272
Target Start/End: Original strand, 35107351 - 35107563
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattag--gcggtagacttattcttgtaa 160  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||     | ||||||||||||||||    
T  35107351 ttgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa 35107450  T
Q  161 tccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaac 258  Q
     || ||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||| || || |||||  || ||||||||||| | |||||||||| | ||| |||    
T  35107451 -cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaac 35107549  T
Q  259 aaattcttttgtgt 272  Q
    ||||  ||||||||    
T  35107550 aaatatttttgtgt 35107563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414198
Alignment:
Q  48 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgg 38414198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 194
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589880
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaatccattgatatctctt 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||   | |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  177 ttgtaacattactcatca 194  Q
    |||| |  ||||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatca 20589880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 105
Target Start/End: Original strand, 38020224 - 38020302
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 105  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020224 gtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37963137 - 37962938
Alignment:
Q  62 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaat 161  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  37963137 gttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaat 37963038  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||   | ||||||||  ||| ||||||  |||||||||  | || ||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  37963037 ccattgat---ttttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaa 37962941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 22163180 - 22163106
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163180 gtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 194
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694093
Alignment:
Q  62 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgt 158  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  159 aatccattgatatctcttttgtaacattactcatca 194  Q
    || |  ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatca 15694093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 140
Target Start/End: Original strand, 43139412 - 43139509
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  43139412 aacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattagg 43139509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583479
Alignment:
Q  64 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 27583479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22407642 - 22407591
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 78  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407642 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  62 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaatta 138  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741002
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttggga-cttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828338
Alignment:
Q  101 ttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-cata 198  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| |   | |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattata 13828404  T
Q  199 gtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt-tggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||| ||  |   ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | | ||||||||    
T  13828403 gtggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctggaccgaactggataaacaaatt 13828338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736266
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 2736266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaatta 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaatta 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462497
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 17462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054886
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Original strand, 35028612 - 35028764
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaatta-g 139  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||  | |||||||||||||| |    
T  35028612 aacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaattatg 35028709  T
Q  140 gcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca 194  Q
       | | ||| |||||||||| |  || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35028710 tttgaatactaattcttgtaaccttttaatatctcttttctaaaattactcatca 35028764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687044
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 39687044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 138
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggattttgggtagaatta 138  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 14699035 - 14699100
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  14699035 catagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932695
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943598
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 17943598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517760
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 27517760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479055
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactggga-cttgggtagaattagg 30479055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720732
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattagg 30720732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 8390178 - 8390243
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8390178 catagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13569397 - 13569332
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  13569397 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20522289 - 20522224
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  20522289 catagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539517
Alignment:
Q  236 aatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 15539517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33162494 - 33162450
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33162494 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 33162450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 5377699 - 5377668
Alignment:
Q  1 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgt 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5377699 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgt 5377668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17490192 - 17490149
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17490192 tctctcccctagagtaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 17490149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31056103 - 31056048
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  31056103 tggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaa 31056048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 41303210 - 41303155
Alignment:
Q  84 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaatta 138  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41303210 tattaggattaagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaatta 41303155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050166
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagag 20050166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27248075 - 27248021
Alignment:
Q  87 taggattgagtctcttggttacgggaagagat-tgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  27248075 taggattgagtctcttggtcacgggaagagatccaggactttgggtagaattagg 27248021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 116
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191035
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagag 38191035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 116
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680083
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 39680083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 1345587 - 1345640
Alignment:
Q  213 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1345587 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttctt 1345640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 2838076 - 2838129
Alignment:
Q  213 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2838076 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttctt 2838129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8040129 - 8040064
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  8040129 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27517694 - 27517633
Alignment:
Q  206 ggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  27517694 ggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaattctt 27517633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 28259205 - 28259270
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  28259205 catagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 33674584 - 33674551
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33674584 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 33674551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39483000 - 39482935
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  39483000 catagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39482935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723744
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 260
Target Start/End: Original strand, 10445473 - 10445537
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  10445473 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10942597 - 10942498
Alignment:
Q  176 tttgtaacattactcatcac--atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||| |||||||||||   |||||| || | || |||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  10942597 tttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattctcttgtgt 10942498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10948466 - 10948367
Alignment:
Q  176 tttgtaacattactcatcac--atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||| |||||||||||   |||||| || | || |||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  10948466 tttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattctcttgtgt 10948367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 11067429 - 11067473
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11067429 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactcggtcaacaa 11067473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139770
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 260
Target Start/End: Original strand, 34682363 - 34682427
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  34682363 atagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36318053 - 36318009
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36318053 tctctcccttagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36318009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 266
Target Start/End: Original strand, 38191144 - 38191200
Alignment:
Q  211 gctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  38191144 gctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 38191200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 39284960 - 39285004
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39284960 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 97)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11983262 - 11983017
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  11983262 gtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 11983163  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  11983162 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 11983063  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11983062 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 11983017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 13057275 - 13057521
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13057275 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactt 13057374  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  13057375 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctccccc 13057474  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13057475 aaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgt 13057521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 9020007 - 9020252
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  9020007 gtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactt 9020106  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  9020107 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccccca 9020206  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9020207 aactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 9020252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 13039835 - 13040081
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13039835 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactt 13039934  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13039935 tgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccct 13040034  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13040035 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 13040081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1230482 - 1230237
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||| ||    
T  1230482 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactt 1230383  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |    
T  1230382 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctccccca 1230283  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1230282 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1230237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28241554 - 28241309
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  28241554 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 28241455  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  28241454 tcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctccccca 28241355  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28241354 gactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 28241309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4816464 - 4816219
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  4816464 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 4816365  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  4816364 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccca 4816265  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4816264 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 4816219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14507408 - 14507164
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  14507408 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 14507309  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  14507308 tgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctctctccccca 14507210  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14507209 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 14507164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14458998 - 14458755
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  14458998 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 14458901  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||| |    
T  14458900 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccca 14458801  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14458800 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 14458755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 32280077 - 32280323
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32280077 gtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 32280176  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatc-acatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  32280177 caggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctccccc 32280276  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32280277 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgt 32280323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 271
Target Start/End: Original strand, 3390468 - 3390705
Alignment:
Q  35 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtaga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||    
T  3390468 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggtaga 3390567  T
Q  135 attaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactagg 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3390568 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcccccatactagg 3390667  T
Q  234 tcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtg 271  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  3390668 tcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtg 3390705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3630097 - 3629853
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3630097 gtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctt 3629998  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || | |||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  3629997 tgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctctcccc-a 3629899  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3629898 tactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 3629853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 30967282 - 30967527
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | ||    
T  30967282 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactt 30967381  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||| |    
T  30967382 tgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctccccca 30967481  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30967482 aactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 30967527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19704802 - 19704555
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19704802 gtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 19704703  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct-tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19704702 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 19704603  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19704602 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgt 19704555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30034836 - 30034591
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||| ||    
T  30034836 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactt 30034737  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||| |    
T  30034736 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctctctccccca 30034637  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30034636 gactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 30034591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3632171 - 3631927
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactt 3632072  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||      
T  3632071 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgtccc-- 3631974  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3631973 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 3631927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20915589 - 20915351
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  20915589 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggact 20915490  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  20915489 tcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 20915391  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattct 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20915390 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20915351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2629118 - 2628874
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2629118 gtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 2629019  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  2629018 tgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 2628920  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2628919 gactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgt 2628874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15532906 - 15532674
Alignment:
Q  35 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtaga 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15532906 ctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtaga 15532807  T
Q  135 attaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggt 234  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15532806 attaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctat-ccctagactaggt 15532708  T
Q  235 caatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 268  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15532707 caattttgactgaactaggtcaacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 25477355 - 25477606
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||    
T  25477355 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctt 25477454  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcac--------atagtgaaatggagggctgctct 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||        |||||||||  ||||||||||||    
T  25477455 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctct 25477554  T
Q  219 ctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgt 270  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25477555 ctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattcttttgt 25477606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15541373 - 15541128
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  15541373 gtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactt 15541274  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||  ||  |||||||||||| | |    
T  15541273 tgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgctctctcctcca 15541174  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15541173 gactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 15541128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3233964 - 3233713
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  3233964 gtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 3233865  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  3233864 ttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctccccc 3233765  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaactt-----ggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    | ||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  3233764 acactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 3233713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 272
Target Start/End: Original strand, 26065081 - 26065307
Alignment:
Q  44 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  26065081 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg 26065180  T
Q  144 tagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgga 243  Q
     |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| |||||| | | |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26065181 gagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttgga 26065278  T
Q  244 ccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26065279 ccgaactgggtcaacaaattattttgtgt 26065307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 272
Target Start/End: Original strand, 26085050 - 26085276
Alignment:
Q  44 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  26085050 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg 26085149  T
Q  144 tagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgga 243  Q
     |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| |||||| | | |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26085150 gagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttgga 26085247  T
Q  244 ccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26085248 ccgaactgggtcaacaaattattttgtgt 26085276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  45 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  144 tagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgga 243  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 5273233  T
Q  244 ccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  5273232 ccgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30729061 - 30728812
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||    
T  30729061 gtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggctt 30728962  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgata----tctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcc 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||    ||||||||||||  ||||||||   |||||| || ||| |||||||||||||    
T  30728961 tgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctgctctctcc 30728862  T
Q  223 cctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  30728861 cgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgt 30728812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15530355 - 15530166
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  15530355 gtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctt 15530256  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctc 217  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  15530255 tgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26932779 - 26932549
Alignment:
Q  43 caaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggc 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26932779 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggc 26932680  T
Q  142 ggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttg 241  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||    
T  26932679 gggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattg 26932581  T
Q  242 gaccgaacttggtcaacaaa-ttcttttgtgt 272  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26932580 gaccgaactgggtcaacaaatttcttttgtgt 26932549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12195748 - 12195515
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12195748 gtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggact 12195649  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  12195648 ttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 12195550  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  12195549 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069710
Alignment:
Q  66 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  166 tgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattc 264  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattc 1069714  T
Q  265 tttt 268  Q
    ||||    
T  1069713 tttt 1069710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 14466377 - 14466650
Alignment:
Q  1 tttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtccctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 99  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||  || | ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14466377 tttagaaagacaacagcaaaactagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtct 14466476  T
Q  100 cttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-cata 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||    
T  14466477 cttggttacggaaagagattgggagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattata 14466576  T
Q  199 gtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||  ||| | ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  14466577 gtgaaccggatgactgctgtttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgt 14466650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066112
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26066209  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  26066208 tttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 26066112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12161779 - 12161546
Alignment:
Q  38 tggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||    
T  12161779 tggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataatt 12161680  T
Q  138 aggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaa 237  Q
    | | || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||    
T  12161679 aagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-ccctaaactaggttaa 12161581  T
Q  238 tttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  12161580 tttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgt 12161546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Original strand, 15719740 - 15719961
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15719740 aacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 15719836  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctct-cccctagactaggtcaat 238  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||  ||| | |||||| | |||| | |||||||||||    
T  15719837 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaat 15719936  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  15719937 ttggaccgaacttggtaaacaaatt 15719961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068383
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| || ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  26068478 tt-gtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 26068383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754697
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc- 29754794  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29754793 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 29754697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24338667 - 24338436
Alignment:
Q  41 aacaaacactaggg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattag 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||    
T  24338667 aacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattag 24338568  T
Q  140 gcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 238  Q
     | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| ||||||    
T  24338567 tcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactatgtcaat 24338470  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  24338469 ttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgt 24338436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309182
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  33309087 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 33309182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Original strand, 15367129 - 15367349
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | |||||||| |||||      
T  15367129 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaat 15367225  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctc-ccctagactaggtcaatt 239  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15367226 cgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactaggtcaatt 15367325  T
Q  240 tggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||    
T  15367326 tggaccgaactgggtaaacaaatt 15367349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16455625 - 16455421
Alignment:
Q  61 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16455625 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaa 16455526  T
Q  161 tccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaac 258  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||  || |||    
T  16455525 ccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaac 16455426  T
Q  259 aaatt 263  Q
    |||||    
T  16455425 aaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311451
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  33311356 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 33311451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Original strand, 22490729 - 22490888
Alignment:
Q  35 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtaga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22490729 ctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtaga 22490828  T
Q  135 attaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca 194  Q
    |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22490829 attatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatca 22490888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186059
Alignment:
Q  62 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  161 tccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
      ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  260 aattcttttgtgt 272  Q
    |||| ||||||||    
T  12186071 aattattttgtgt 12186059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3028071 - 3027876
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||||||||||    
T  3028071 aacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgagtagaattagg 3027974  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctct-cccctagactaggtca 236  Q
    | | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  3027973 ctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccccccagactaggtca 3027876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19227641 - 19227514
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  19227641 gtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 19227542  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattc 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19227541 tgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 263
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  61 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgta 159  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  160 atccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaa 257  Q
    |  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||  || | ||||| |||||| |||| ||| || ||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  258 caaatt 263  Q
    ||||||    
T  26945458 caaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Original strand, 17012137 - 17012287
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  17012137 aacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggtagaattagg 17012234  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatc 193  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17012235 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Original strand, 19696556 - 19696759
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaat 161  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  19696556 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaat 19696655  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
    || ||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||| ||  ||  ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  19696656 cctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 19696755  T
Q  260 aatt 263  Q
    ||||    
T  19696756 aatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 263
Target Start/End: Original strand, 15346526 - 15346664
Alignment:
Q  125 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  15346526 tttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctctcccc 15346625  T
Q  225 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15346626 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22858172 - 22857949
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||| |||||| |||||    
T  22858172 aacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttagg 22858075  T
Q  141 -cggtagacttattcttgtaatcc-attgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaa 237  Q
       | ||||| |||||||||| ||  ||||||| || |||||||  ||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  22858074 tttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcag 22857976  T
Q  238 t-ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    | ||||||||||||  || ||||||||    
T  22857975 tattggaccgaactgtgtaaacaaatt 22857949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037796
Alignment:
Q  64 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtaga-cttattcttgtaatc 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| || |||||| || ||||||||||||||||    | | ||||||||||||| |    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  163 cattgatatctcttttgtaacattactcatca 194  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatca 28037796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 272
Target Start/End: Original strand, 10584246 - 10584322
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  10584246 atagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgt 10584322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078554
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgtaat 161  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  | ||||||||||   | ||||||||||||||||     
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgagatttaag-tagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  162 ccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaaca 259  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||| |||  | |||| || ||||| ||||| ||| ||| || |||||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttcttccc-agtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 25078558  T
Q  260 aatt 263  Q
    ||||    
T  25078557 aatt 25078554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 20526902 - 20527081
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  20526902 aacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattagg 20526999  T
Q  141 -cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctc 221  Q
       | ||||| |||||||||| |  |||||||||| |||||||  ||| ||||||  |||||| || |||| |||||||||||    
T  20527000 tttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 138
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaatta 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542465
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaa 160  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||| ||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  161 tccattgatatctcttt 177  Q
     || |||||||||||||    
T  7542481 ccctttgatatctcttt 7542465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165936
Alignment:
Q  86 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-cttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878788
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 13878788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883536
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 13883536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16785980
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 16785980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887345
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201447
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 5572269 - 5572334
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  5572269 catagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911471
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgtaatccattgatatctctt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||  || |||||| || ||| |||||| |||||   | || || |||||||||| |  || |||||||||    
T  12911629 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12911530  T
Q  177 ttgtaacattactcatcac-atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtc 235  Q
    | ||||  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12911529 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 12911471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694972
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 17694972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 5757506 - 5757571
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5757506 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 10077193 - 10077258
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  10077193 catagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 236
Target Start/End: Original strand, 30445702 - 30445815
Alignment:
Q  125 tttgggtagaattaggcg-gtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcc 222  Q
    ||||||||||||||||   | ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||||  |||||||||||    
T  30445702 tttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcc 30445801  T
Q  223 cctagactaggtca 236  Q
     | | |||||||||    
T  30445802 accatactaggtca 30445815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 91
Target Start/End: Original strand, 15346477 - 15346524
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 91  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346477 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25465706 - 25465587
Alignment:
Q  145 agacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttgg 242  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||| || | |||| |||| | ||||    
T  25465706 agacttattcttgtacccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtattgg 25465608  T
Q  243 accgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  25465607 accgaactgggtaaacaaatt 25465587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 1072110 - 1072067
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 70  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1072110 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Original strand, 5017507 - 5017562
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  5017507 tggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaa 5017562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166267
Alignment:
Q  85 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467607
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13467607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 13870655 - 13870608
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 74  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13870655 gtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17694917 - 17694846
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  17694917 atagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17694846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19702006
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 19702006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342922
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattagg 22342922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31936646 - 31936591
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31936646 tggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31979572 - 31979517
Alignment:
Q  205 tggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31979572 tggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 140
Target Start/End: Original strand, 11262596 - 11262649
Alignment:
Q  86 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  11262596 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattagg 11262649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17904531 - 17904470
Alignment:
Q  80 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  17904531 acactattaggactgaatctcttggtcatgggaagagatttaggattttggctagaattagg 17904470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21356105 - 21356040
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21356105 catagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 140
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941704
Alignment:
Q  84 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078262
Alignment:
Q  145 agacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca 194  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaa-cctttgatatctcttttgtaaagttactcatca 28078262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 272
Target Start/End: Original strand, 30443538 - 30443615
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  30443538 atagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatttttgtgtgt 30443615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 603132 - 603088
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  603132 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 603088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18232914 - 18232862
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccga 247  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||    
T  18232914 catagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccga 18232862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22342851 - 22342795
Alignment:
Q  211 gctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22342851 gctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22342795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 250
Target Start/End: Original strand, 24436010 - 24436054
Alignment:
Q  206 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaact 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  24436010 ggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaact 24436054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 160
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643258
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||  |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctggga-cttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaa 26643258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 160
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749224
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||  |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctggga-cttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaa 26749224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33211229 - 33211185
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14615 - 14376
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  14615 gtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 14516  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14515 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccta 14416  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14415 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Original strand, 15074 - 15313
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  15074 gtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactt 15173  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||||| |    
T  15174 tgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtctccccca 15273  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 266  Q
      ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  15274 tgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattctt 15313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 69524 - 69280
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  69524 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactt 69425  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||| |    
T  69424 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctccccca 69326  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  69325 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 69280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 73210 - 73160
Alignment:
Q  37 ttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 87  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73210 ttggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 73256 - 73207
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 76  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73256 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 4051 - 4295
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  4051 gtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactt 4150  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4151 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc-a 4249  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4250 gactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgt 4295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11706 - 11461
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11706 gtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 11607  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |    
T  11606 tgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctccccca 11507  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11506 gactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgt 11461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41716 - 41471
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  41716 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 41617  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  41616 tcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctccccca 41517  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41516 gactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 41471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 79240 - 79485
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  79240 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatt 79339  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  79340 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccca 79439  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  79440 gactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgt 79485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 39 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1441
Alignment:
Q  39 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaatta 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  139 ggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 238  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 271
Target Start/End: Original strand, 79914 - 80158
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  79914 gtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggct 80013  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  80014 ttgggtaga-ttaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 80112  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtg 271  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  80113 agactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtg 80158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 6254 - 6499
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6254 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggact 6353  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||     
T  6354 ttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctccccc 6452  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  6453 agactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgt 6499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 29226 - 29470
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  29226 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctt 29325  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  29326 tgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 29424  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29425 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgt 29470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 96 - 341
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggatt 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  96 gtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagact 195  T
Q  126 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||     
T  196 ttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 294  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  295 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 2935 - 3179
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||    
T  2935 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactt 3034  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctccccta 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |    
T  3035 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctccccga 3133  T
Q  227 gactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  3134 gactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgt 3179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 272
Target Start/End: Original strand, 85285 - 85531
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||    
T  85285 gtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactt 85384  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccct 225  Q
    || ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||| || ||| | |||||||||||||     
T  85385 tgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccc 85484  T
Q  226 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  85485 agactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgt 85531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 224
Target Start/End: Original strand, 2097 - 2293
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  2097 gtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactt 2195  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccc 224  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  2196 tgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctactctctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1860 - 1638
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1860 aacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 1763  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca-at 238  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||  |    
T  1762 cgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagtt 1663  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  1662 tttgaccgaactgggtaaacaaatt 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16039 - 15817
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16039 aacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 15942  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca-catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaat- 238  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||| || ||||| ||||||||| |||  |||||||||| |     
T  15941 cgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtg 15842  T
Q  239 ttggaccgaacttggtcaacaaatt 263  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  15841 ttggaccgaactgggtaaacaaatt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22415
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22320 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 22415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24690
Alignment:
Q  77 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  176 tttgtaacattactcatcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24595 tt-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgt 24690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 8447 - 8512
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  8447 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 152
Target Start/End: Original strand, 35694 - 35819
Alignment:
Q  27 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattt 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  35694 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 35793  T
Q  127 tgggtagaattaggcggtagacttat 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35794 tgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 272
Target Start/End: Original strand, 35818 - 35894
Alignment:
Q  196 atagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    |||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  35818 atagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgt 35894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16868 - 16717
Alignment:
Q  41 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16868 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 16771  T
Q  141 cggtagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacattactcatca 194  Q
    |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16770 ccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca 16717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 178
Target Start/End: Original strand, 4901 - 5016
Alignment:
Q  63 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaatc 162  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  4901 ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 5000  T
Q  163 cattgatatctctttt 178  Q
    ||||||||||||||||    
T  5001 cattgatatctctttt 5016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 206 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4667
Alignment:
Q  206 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgt 4667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1489 - 1439
Alignment:
Q  222 ccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1489 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57452
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggattttgggtagaattagg-cggtagacttattcttgtaatccattgatatctct 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||   | |||  ||||||||||| || ||||||||| |    
T  57613 aaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatctat 57514  T
Q  176 tttgtaacattactca-tcacatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtca 236  Q
    |||||||  ||||||| | | ||| || ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  57513 tttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 57452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  78 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5752 - 5687
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5752 catagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2561 - 2496
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  2561 catagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16386
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattagg 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattagg 16386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 17131
Alignment:
Q  81 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 17131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 1050 - 993
Alignment:
Q  36 tttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 93  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1050 tttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 260
Target Start/End: Original strand, 36876 - 36925
Alignment:
Q  211 gctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  36876 gctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 260
Target Start/End: Original strand, 43989 - 44054
Alignment:
Q  195 catagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||    
T  43989 catagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20415
Alignment:
Q  216 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaa 260  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University