View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF19878_low_91 (Length: 290)

Name: NF19878_low_91
Description: NF19878
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF19878_low_91
NF19878_low_91
[»] chr5 (113 HSPs)
chr5 (70-282)||(4175510-4175722)
chr5 (70-283)||(34261289-34261502)
chr5 (70-282)||(18794760-18794972)
chr5 (74-282)||(25343941-25344149)
chr5 (70-281)||(6072429-6072640)
chr5 (81-283)||(18020797-18020999)
chr5 (78-283)||(9076056-9076261)
chr5 (70-283)||(38702118-38702331)
chr5 (70-283)||(12664835-12665048)
chr5 (70-283)||(12869928-12870141)
chr5 (70-283)||(38910251-38910463)
chr5 (70-276)||(7579703-7579910)
chr5 (82-276)||(10359271-10359465)
chr5 (70-283)||(26854124-26854336)
chr5 (70-283)||(39073021-39073234)
chr5 (70-282)||(8825034-8825246)
chr5 (70-281)||(1297768-1297980)
chr5 (70-283)||(38363168-38363379)
chr5 (70-282)||(40198765-40198977)
chr5 (90-281)||(38017308-38017499)
chr5 (70-276)||(24074874-24075080)
chr5 (106-283)||(1087962-1088139)
chr5 (70-283)||(28024288-28024501)
chr5 (70-283)||(42911527-42911740)
chr5 (90-283)||(6754208-6754401)
chr5 (96-282)||(36239461-36239647)
chr5 (70-283)||(4098308-4098521)
chr5 (70-283)||(4985204-4985416)
chr5 (70-276)||(18465678-18465880)
chr5 (70-281)||(8229834-8230045)
chr5 (70-276)||(14793826-14794032)
chr5 (68-268)||(16124304-16124504)
chr5 (68-283)||(4694739-4694954)
chr5 (70-276)||(6007860-6008067)
chr5 (70-241)||(28463456-28463627)
chr5 (74-283)||(7403835-7404042)
chr5 (70-283)||(2133936-2134148)
chr5 (70-259)||(9127404-9127593)
chr5 (70-276)||(5119155-5119361)
chr5 (98-283)||(2674007-2674192)
chr5 (70-283)||(28447014-28447226)
chr5 (70-282)||(4017391-4017603)
chr5 (69-269)||(6689575-6689775)
chr5 (70-261)||(4427457-4427648)
chr5 (70-241)||(21606329-21606500)
chr5 (70-263)||(31802766-31802958)
chr5 (70-263)||(37303156-37303349)
chr5 (70-268)||(38502848-38503042)
chr5 (70-241)||(4688869-4689039)
chr5 (70-241)||(18437394-18437565)
chr5 (129-282)||(22582508-22582661)
chr5 (69-259)||(4962239-4962430)
chr5 (70-229)||(32439995-32440154)
chr5 (68-215)||(425104-425251)
chr5 (70-229)||(5144081-5144240)
chr5 (71-263)||(26906470-26906660)
chr5 (90-263)||(24228945-24229118)
chr5 (70-241)||(38297687-38297859)
chr5 (70-283)||(12784472-12784684)
chr5 (106-283)||(32388999-32389176)
chr5 (70-194)||(25027842-25027966)
chr5 (70-198)||(42394242-42394370)
chr5 (70-241)||(1795188-1795359)
chr5 (102-260)||(7408340-7408498)
chr5 (70-283)||(19831571-19831782)
chr5 (98-236)||(39893885-39894023)
chr5 (68-236)||(3892788-3892955)
chr5 (70-229)||(38297885-38298041)
chr5 (70-221)||(12723050-12723201)
chr5 (70-229)||(21157610-21157769)
chr5 (73-216)||(40209064-40209207)
chr5 (70-263)||(37809736-37809929)
chr5 (70-236)||(7735159-7735326)
chr5 (70-229)||(21150469-21150628)
chr5 (70-229)||(25785884-25786043)
chr5 (70-163)||(10889243-10889336)
chr5 (96-239)||(38160295-38160435)
chr5 (70-236)||(37306775-37306940)
chr5 (70-236)||(37633653-37633819)
chr5 (70-223)||(31803301-31803454)
chr5 (70-229)||(18676498-18676655)
chr5 (70-241)||(24469708-24469878)
chr5 (99-229)||(13461016-13461146)
chr5 (70-263)||(18393020-18393213)
chr5 (98-229)||(3243801-3243932)
chr5 (118-229)||(7466207-7466318)
chr5 (70-181)||(9959008-9959119)
chr5 (70-229)||(11413613-11413772)
chr5 (70-215)||(12638037-12638182)
chr5 (70-236)||(13703072-13703239)
chr5 (70-178)||(31985184-31985292)
chr5 (78-263)||(8849186-8849373)
chr5 (96-179)||(4440092-4440175)
chr5 (90-236)||(5843070-5843215)
chr5 (96-262)||(36481078-36481244)
chr5 (70-194)||(3686371-3686494)
chr5 (95-236)||(38308202-38308343)
chr5 (78-263)||(40927138-40927323)
chr5 (70-228)||(4609001-4609159)
chr5 (70-175)||(30368251-30368357)
chr5 (78-214)||(13957258-13957394)
chr5 (131-223)||(18000377-18000469)
chr5 (193-281)||(25027606-25027694)
chr5 (150-228)||(23418603-23418681)
chr5 (70-261)||(17869354-17869546)
chr5 (207-283)||(31546028-31546104)
chr5 (83-154)||(10735457-10735528)
chr5 (99-175)||(17872426-17872503)
chr5 (70-188)||(6330769-6330889)
chr5 (70-133)||(3818174-3818237)
chr5 (70-133)||(3818263-3818326)
chr5 (80-143)||(42174259-42174322)
chr5 (193-261)||(3686790-3686858)
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (70-283)||(31430554-31430767)
chr7 (70-272)||(17896569-17896771)
chr7 (70-283)||(18470302-18470515)
chr7 (70-283)||(22950853-22951066)
chr7 (70-282)||(7312612-7312824)
chr7 (70-282)||(32528364-32528576)
chr7 (70-281)||(32966086-32966297)
chr7 (70-272)||(26632226-26632427)
chr7 (70-283)||(12838113-12838326)
chr7 (70-282)||(20035043-20035255)
chr7 (70-282)||(20045454-20045666)
chr7 (72-276)||(29497576-29497780)
chr7 (70-283)||(33099870-33100081)
chr7 (70-282)||(36922234-36922447)
chr7 (70-283)||(44480177-44480390)
chr7 (70-283)||(41891264-41891478)
chr7 (70-268)||(7477248-7477446)
chr7 (70-276)||(36298216-36298422)
chr7 (68-268)||(33921824-33922024)
chr7 (70-263)||(26723919-26724112)
chr7 (70-283)||(41675222-41675434)
chr7 (70-282)||(10227251-10227463)
chr7 (70-268)||(33173802-33174000)
chr7 (70-283)||(8264942-8265157)
chr7 (70-263)||(33257876-33258069)
chr7 (70-283)||(29722340-29722552)
chr7 (68-282)||(3837855-3838069)
chr7 (70-283)||(31398967-31399179)
chr7 (70-236)||(42841948-42842114)
chr7 (70-235)||(30866819-30866984)
chr7 (70-241)||(36406746-36406917)
chr7 (102-260)||(36648063-36648221)
chr7 (70-263)||(35112424-35112617)
chr7 (70-263)||(41889372-41889565)
chr7 (70-238)||(3310211-3310379)
chr7 (68-221)||(6799116-6799270)
chr7 (150-283)||(8381901-8382034)
chr7 (124-268)||(5732123-5732267)
chr7 (70-281)||(35746682-35746892)
chr7 (70-241)||(46285922-46286093)
chr7 (99-237)||(44820678-44820816)
chr7 (70-223)||(42880962-42881115)
chr7 (70-276)||(37353912-37354107)
chr7 (70-263)||(31815123-31815314)
chr7 (70-236)||(1553510-1553674)
chr7 (70-236)||(43874165-43874330)
chr7 (70-283)||(18194249-18194462)
chr7 (70-257)||(45324023-45324206)
chr7 (70-263)||(3177925-3178118)
chr7 (70-241)||(47459639-47459809)
chr7 (139-263)||(38168844-38168968)
chr7 (70-229)||(8965989-8966148)
chr7 (70-282)||(28608590-28608801)
chr7 (106-229)||(17354115-17354238)
chr7 (70-229)||(46563212-46563371)
chr7 (70-236)||(22382156-22382322)
chr7 (114-281)||(22057447-22057620)
chr7 (70-263)||(48981434-48981628)
chr7 (96-229)||(9601982-9602115)
chr7 (96-229)||(9829553-9829686)
chr7 (70-212)||(36339303-36339447)
chr7 (70-162)||(2408818-2408909)
chr7 (98-236)||(24283605-24283741)
chr7 (106-223)||(34368754-34368871)
chr7 (165-236)||(8380674-8380745)
chr7 (78-229)||(30586765-30586916)
chr7 (98-229)||(46715391-46715522)
chr7 (78-201)||(33071909-33072032)
chr7 (189-263)||(47408227-47408301)
chr7 (70-226)||(19327878-19328034)
chr7 (70-141)||(13431308-13431379)
chr7 (70-229)||(26803519-26803678)
chr7 (103-262)||(35859995-35860152)
chr7 (70-115)||(47408133-47408178)
chr7 (118-162)||(41409766-41409810)
chr7 (78-143)||(16662282-16662347)
chr7 (78-143)||(17636642-17636707)
chr7 (69-162)||(24233145-24233237)
chr7 (70-143)||(46392612-46392685)
chr7 (96-128)||(8921067-8921099)
chr7 (109-153)||(27235437-27235481)
[»] chr4 (152 HSPs)
chr4 (70-283)||(3436100-3436313)
chr4 (70-283)||(13629226-13629439)
chr4 (70-283)||(44069029-44069242)
chr4 (70-283)||(46871919-46872132)
chr4 (70-276)||(16464822-16465028)
chr4 (70-283)||(44217704-44217917)
chr4 (70-282)||(16664239-16664451)
chr4 (70-276)||(38617347-38617553)
chr4 (70-283)||(39683747-39683960)
chr4 (70-283)||(48782198-48782410)
chr4 (70-283)||(21044780-21044993)
chr4 (70-282)||(5374384-5374596)
chr4 (70-281)||(35231688-35231899)
chr4 (70-283)||(29295352-29295565)
chr4 (70-283)||(53599819-53600032)
chr4 (70-282)||(42513060-42513272)
chr4 (70-283)||(56576137-56576349)
chr4 (70-283)||(19093186-19093399)
chr4 (70-283)||(35232331-35232543)
chr4 (78-283)||(39671331-39671536)
chr4 (69-268)||(353963-354162)
chr4 (68-283)||(8735386-8735600)
chr4 (70-273)||(26620394-26620597)
chr4 (70-276)||(34464275-34464481)
chr4 (70-283)||(36408721-36408934)
chr4 (70-283)||(36422887-36423100)
chr4 (70-283)||(42099706-42099919)
chr4 (70-283)||(44013946-44014159)
chr4 (70-283)||(50623412-50623624)
chr4 (70-283)||(19527253-19527454)
chr4 (70-282)||(12252098-12252302)
chr4 (70-281)||(31862021-31862232)
chr4 (70-283)||(37502019-37502233)
chr4 (70-283)||(22828434-22828647)
chr4 (70-283)||(53125271-53125484)
chr4 (70-283)||(55147094-55147307)
chr4 (70-283)||(22678342-22678556)
chr4 (70-272)||(8741668-8741870)
chr4 (70-276)||(33084476-33084682)
chr4 (70-268)||(47251411-47251609)
chr4 (70-236)||(52677225-52677391)
chr4 (70-257)||(4201377-4201564)
chr4 (74-257)||(47428531-47428714)
chr4 (73-283)||(6195025-6195235)
chr4 (112-276)||(23237667-23237834)
chr4 (67-263)||(52057504-52057702)
chr4 (70-223)||(27492357-27492511)
chr4 (70-282)||(32239398-32239606)
chr4 (70-276)||(47093810-47094016)
chr4 (70-269)||(40411941-40412140)
chr4 (70-283)||(55702918-55703131)
chr4 (92-276)||(26906429-26906613)
chr4 (70-221)||(9834262-9834413)
chr4 (70-236)||(55935105-55935271)
chr4 (70-263)||(23719837-23720030)
chr4 (70-229)||(35381502-35381660)
chr4 (84-283)||(38542309-38542508)
chr4 (70-236)||(30939153-30939319)
chr4 (70-236)||(41415006-41415171)
chr4 (71-241)||(52257866-52258036)
chr4 (70-263)||(44549641-44549834)
chr4 (70-202)||(23623609-23623741)
chr4 (70-281)||(18781477-18781688)
chr4 (70-263)||(47596666-47596859)
chr4 (70-221)||(36750175-36750326)
chr4 (72-263)||(45725536-45725727)
chr4 (108-282)||(54231574-54231749)
chr4 (70-276)||(26933812-26934017)
chr4 (70-282)||(52061561-52061768)
chr4 (70-283)||(53691687-53691900)
chr4 (70-222)||(33809085-33809237)
chr4 (68-283)||(42629313-42629528)
chr4 (96-236)||(30151696-30151836)
chr4 (90-282)||(36659461-36659653)
chr4 (144-281)||(33755066-33755201)
chr4 (70-236)||(42133035-42133200)
chr4 (70-260)||(47885043-47885242)
chr4 (68-241)||(29833001-29833174)
chr4 (70-175)||(33755223-33755328)
chr4 (78-229)||(34603630-34603781)
chr4 (70-236)||(43887981-43888146)
chr4 (70-221)||(34361054-34361204)
chr4 (70-229)||(36750547-36750706)
chr4 (107-214)||(41955776-41955883)
chr4 (70-216)||(37551765-37551911)
chr4 (68-229)||(14090236-14090397)
chr4 (70-214)||(9220143-9220287)
chr4 (78-262)||(18091248-18091432)
chr4 (70-229)||(3802158-3802317)
chr4 (107-229)||(19399569-19399690)
chr4 (106-236)||(31369835-31369965)
chr4 (92-204)||(8752160-8752272)
chr4 (70-257)||(18135110-18135296)
chr4 (70-257)||(49122320-49122506)
chr4 (128-263)||(44176642-44176777)
chr4 (96-262)||(14949138-14949304)
chr4 (71-229)||(56499699-56499859)
chr4 (70-229)||(1180988-1181148)
chr4 (70-218)||(27918600-27918747)
chr4 (109-229)||(54029135-54029255)
chr4 (100-218)||(3036413-3036529)
chr4 (78-177)||(37394298-37394397)
chr4 (116-241)||(6091428-6091553)
chr4 (70-263)||(6150692-6150885)
chr4 (103-236)||(7242270-7242403)
chr4 (92-229)||(39308951-39309088)
chr4 (70-263)||(47751535-47751721)
chr4 (97-202)||(51347287-51347392)
chr4 (70-202)||(38617814-38617946)
chr4 (70-229)||(41813640-41813800)
chr4 (70-229)||(1146136-1146295)
chr4 (190-281)||(42645379-42645470)
chr4 (78-263)||(38865910-38866094)
chr4 (70-146)||(17698566-17698642)
chr4 (99-227)||(20087203-20087331)
chr4 (78-229)||(55430390-55430541)
chr4 (99-229)||(1391258-1391388)
chr4 (96-214)||(48087722-48087840)
chr4 (81-214)||(34925444-34925577)
chr4 (128-221)||(36292672-36292765)
chr4 (79-262)||(8456965-8457148)
chr4 (70-212)||(20294282-20294424)
chr4 (140-222)||(25098341-25098423)
chr4 (78-203)||(30151942-30152067)
chr4 (78-263)||(48509922-48510107)
chr4 (109-263)||(1615108-1615260)
chr4 (74-145)||(37987552-37987623)
chr4 (205-263)||(23621905-23621963)
chr4 (96-214)||(38009868-38009986)
chr4 (107-203)||(17978104-17978199)
chr4 (100-263)||(27654797-27654961)
chr4 (70-142)||(42645306-42645377)
chr4 (94-229)||(43086427-43086560)
chr4 (165-236)||(19731452-19731523)
chr4 (209-276)||(31984192-31984259)
chr4 (98-261)||(51654927-51655090)
chr4 (94-236)||(56486407-56486549)
chr4 (78-227)||(6128972-6129120)
chr4 (120-204)||(7037045-7037129)
chr4 (70-141)||(19740714-19740785)
chr4 (70-121)||(31984296-31984347)
chr4 (71-196)||(7037159-7037289)
chr4 (171-229)||(13435248-13435306)
chr4 (105-202)||(53219136-53219233)
chr4 (150-218)||(53467650-53467718)
chr4 (91-194)||(3588358-3588461)
chr4 (97-176)||(24948641-24948720)
chr4 (171-229)||(52978313-52978371)
chr4 (113-153)||(1615268-1615308)
chr4 (96-128)||(7627667-7627699)
chr4 (97-229)||(19692826-19692957)
chr4 (97-229)||(19703411-19703542)
[»] chr2 (80 HSPs)
chr2 (70-283)||(479008-479221)
chr2 (70-283)||(14295792-14296005)
chr2 (70-283)||(26342575-26342788)
chr2 (70-283)||(15183036-15183249)
chr2 (70-283)||(10812194-10812407)
chr2 (70-283)||(30264637-30264850)
chr2 (70-283)||(41885620-41885833)
chr2 (70-282)||(28145609-28145820)
chr2 (70-283)||(15893615-15893828)
chr2 (68-268)||(36404891-36405092)
chr2 (75-283)||(3363584-3363792)
chr2 (70-281)||(14288426-14288637)
chr2 (70-283)||(15677327-15677539)
chr2 (70-283)||(34399197-34399410)
chr2 (70-281)||(19594346-19594556)
chr2 (73-283)||(11560082-11560292)
chr2 (70-283)||(25558221-25558431)
chr2 (70-283)||(37093445-37093657)
chr2 (70-283)||(36375566-36375781)
chr2 (70-268)||(11222366-11222564)
chr2 (70-283)||(34357173-34357386)
chr2 (70-276)||(38072274-38072474)
chr2 (73-268)||(4883601-4883796)
chr2 (70-283)||(44360429-44360641)
chr2 (70-263)||(13753950-13754144)
chr2 (84-268)||(4654728-4654912)
chr2 (99-269)||(10263780-10263951)
chr2 (106-281)||(38186089-38186264)
chr2 (70-236)||(14541326-14541492)
chr2 (70-263)||(35158406-35158599)
chr2 (70-222)||(43077287-43077439)
chr2 (70-241)||(2012856-2013027)
chr2 (114-283)||(14308434-14308601)
chr2 (70-263)||(9706783-9706975)
chr2 (73-281)||(13000948-13001156)
chr2 (70-236)||(9369969-9370135)
chr2 (70-236)||(31025022-31025188)
chr2 (70-263)||(13215388-13215581)
chr2 (70-236)||(13849797-13849963)
chr2 (68-222)||(32854876-32855030)
chr2 (70-283)||(13965602-13965815)
chr2 (70-241)||(1395559-1395730)
chr2 (70-192)||(14284123-14284245)
chr2 (68-236)||(8443684-8443852)
chr2 (70-236)||(32674206-32674376)
chr2 (90-221)||(6013490-6013621)
chr2 (68-263)||(37077163-37077358)
chr2 (70-227)||(34309141-34309297)
chr2 (70-236)||(34884620-34884786)
chr2 (71-220)||(32543885-32544034)
chr2 (96-221)||(37116690-37116815)
chr2 (90-202)||(25187243-25187355)
chr2 (70-229)||(30544515-30544674)
chr2 (96-262)||(838126-838292)
chr2 (68-153)||(37660137-37660222)
chr2 (81-263)||(7529759-7529942)
chr2 (78-229)||(33947518-33947669)
chr2 (70-229)||(38148124-38148282)
chr2 (98-229)||(42088917-42089048)
chr2 (70-236)||(29041947-29042108)
chr2 (79-150)||(18904079-18904150)
chr2 (78-229)||(928122-928271)
chr2 (186-282)||(3376313-3376409)
chr2 (78-229)||(25787340-25787491)
chr2 (225-283)||(1259664-1259722)
chr2 (73-147)||(28301670-28301744)
chr2 (129-283)||(31011753-31011905)
chr2 (70-263)||(45065067-45065260)
chr2 (70-146)||(4952860-4952936)
chr2 (181-241)||(34721568-34721628)
chr2 (70-229)||(28967320-28967478)
chr2 (96-195)||(36173089-36173188)
chr2 (107-203)||(2991843-2991938)
chr2 (103-203)||(42263618-42263718)
chr2 (99-214)||(37354013-37354128)
chr2 (238-283)||(14284247-14284292)
chr2 (170-274)||(36824486-36824590)
chr2 (84-214)||(14117631-14117761)
chr2 (165-231)||(18904007-18904073)
chr2 (182-222)||(4952792-4952832)
[»] chr1 (100 HSPs)
chr1 (70-283)||(30686406-30686619)
chr1 (70-281)||(21927727-21927938)
chr1 (70-283)||(7782946-7783158)
chr1 (70-283)||(35531324-35531537)
chr1 (70-281)||(45226608-45226819)
chr1 (70-276)||(45368083-45368289)
chr1 (70-283)||(19349408-19349621)
chr1 (74-281)||(1429283-1429490)
chr1 (70-282)||(37609334-37609543)
chr1 (70-283)||(43500501-43500714)
chr1 (70-282)||(13507765-13507977)
chr1 (70-282)||(13514953-13515165)
chr1 (70-282)||(38648452-38648664)
chr1 (70-283)||(13566671-13566887)
chr1 (70-283)||(18033854-18034068)
chr1 (70-283)||(20605653-20605866)
chr1 (70-283)||(31588769-31588981)
chr1 (68-276)||(35483817-35484023)
chr1 (70-281)||(28679016-28679227)
chr1 (70-276)||(1024551-1024757)
chr1 (70-268)||(13699169-13699367)
chr1 (70-283)||(37437082-37437295)
chr1 (70-283)||(50825602-50825814)
chr1 (70-281)||(49908210-49908424)
chr1 (70-260)||(10675897-10676087)
chr1 (70-282)||(52749012-52749222)
chr1 (70-266)||(44818449-44818645)
chr1 (108-282)||(12124677-12124851)
chr1 (70-283)||(19929495-19929708)
chr1 (70-241)||(9361968-9362139)
chr1 (70-283)||(32994498-32994715)
chr1 (70-283)||(35255481-35255694)
chr1 (70-281)||(49497147-49497358)
chr1 (70-283)||(44182755-44182966)
chr1 (70-262)||(43952783-43952975)
chr1 (70-241)||(15660582-15660753)
chr1 (70-263)||(32347973-32348166)
chr1 (68-263)||(10506806-10506999)
chr1 (70-281)||(51972312-51972523)
chr1 (70-236)||(32168388-32168554)
chr1 (70-282)||(35700405-35700617)
chr1 (70-241)||(38597586-38597757)
chr1 (70-283)||(51613406-51613619)
chr1 (138-283)||(12231100-12231245)
chr1 (74-263)||(19455448-19455636)
chr1 (70-262)||(36318348-36318539)
chr1 (135-282)||(1677258-1677405)
chr1 (168-283)||(8464286-8464401)
chr1 (70-236)||(31570713-31570879)
chr1 (142-283)||(29830820-29830961)
chr1 (70-283)||(37735168-37735381)
chr1 (70-263)||(51974220-51974413)
chr1 (90-241)||(38817996-38818147)
chr1 (70-176)||(8464585-8464691)
chr1 (70-263)||(9127662-9127857)
chr1 (90-282)||(52649759-52649951)
chr1 (130-236)||(24781810-24781916)
chr1 (70-235)||(12721435-12721600)
chr1 (70-259)||(18344321-18344510)
chr1 (150-276)||(2059848-2059974)
chr1 (70-174)||(19093263-19093367)
chr1 (70-220)||(1038078-1038229)
chr1 (70-220)||(1044984-1045135)
chr1 (93-236)||(1427697-1427840)
chr1 (70-236)||(4100985-4101151)
chr1 (70-276)||(40926789-40926985)
chr1 (70-236)||(17013417-17013587)
chr1 (70-261)||(48265087-48265278)
chr1 (70-260)||(48508128-48508318)
chr1 (83-241)||(8008240-8008398)
chr1 (70-276)||(30702326-30702532)
chr1 (99-263)||(46096573-46096734)
chr1 (70-281)||(43808893-43809110)
chr1 (69-172)||(35605452-35605555)
chr1 (100-263)||(42787335-42787498)
chr1 (70-200)||(37296838-37296967)
chr1 (78-229)||(52759031-52759182)
chr1 (70-172)||(5597818-5597920)
chr1 (90-236)||(48174748-48174894)
chr1 (70-235)||(1039445-1039609)
chr1 (70-235)||(1046351-1046515)
chr1 (165-238)||(5598145-5598218)
chr1 (68-263)||(11248773-11248969)
chr1 (70-220)||(42800103-42800250)
chr1 (150-276)||(39412547-39412673)
chr1 (70-261)||(31487830-31488021)
chr1 (70-180)||(36850640-36850748)
chr1 (70-227)||(50152428-50152585)
chr1 (96-208)||(52825298-52825410)
chr1 (97-229)||(8973534-8973666)
chr1 (70-137)||(1428214-1428281)
chr1 (120-263)||(2572016-2572159)
chr1 (82-229)||(1859102-1859247)
chr1 (92-229)||(41155292-41155429)
chr1 (189-241)||(1428519-1428571)
chr1 (70-114)||(1677211-1677255)
chr1 (106-178)||(8466514-8466586)
chr1 (140-221)||(33720582-33720662)
chr1 (199-236)||(35605722-35605759)
chr1 (172-229)||(38569703-38569760)
[»] chr8 (112 HSPs)
chr8 (70-282)||(23429904-23430116)
chr8 (70-283)||(9954644-9954857)
chr8 (70-283)||(33935092-33935305)
chr8 (70-283)||(14263539-14263752)
chr8 (70-283)||(34046846-34047059)
chr8 (70-282)||(39303549-39303761)
chr8 (70-276)||(34981824-34982030)
chr8 (97-283)||(38482824-38483010)
chr8 (70-283)||(23848588-23848801)
chr8 (70-282)||(25703611-25703822)
chr8 (70-282)||(26062703-26062914)
chr8 (70-283)||(38128579-38128785)
chr8 (70-282)||(25812782-25812993)
chr8 (70-268)||(18291459-18291656)
chr8 (78-283)||(35052056-35052261)
chr8 (80-283)||(40228300-40228503)
chr8 (70-283)||(14228354-14228567)
chr8 (70-268)||(36058228-36058425)
chr8 (70-283)||(15596339-15596552)
chr8 (70-282)||(40603884-40604096)
chr8 (91-282)||(1202477-1202668)
chr8 (70-282)||(11993888-11994088)
chr8 (70-268)||(10180365-10180563)
chr8 (70-283)||(45281410-45281623)
chr8 (70-283)||(16656696-16656908)
chr8 (97-283)||(4057310-4057496)
chr8 (70-268)||(12342661-12342859)
chr8 (70-263)||(21651798-21651991)
chr8 (70-283)||(43553035-43553247)
chr8 (96-281)||(43642023-43642208)
chr8 (70-234)||(13327774-13327938)
chr8 (70-249)||(2335428-2335607)
chr8 (70-257)||(12763430-12763616)
chr8 (70-236)||(167556-167722)
chr8 (70-219)||(16700989-16701138)
chr8 (101-281)||(9808008-9808188)
chr8 (70-241)||(6750610-6750781)
chr8 (70-241)||(6757401-6757572)
chr8 (70-268)||(27518760-27518952)
chr8 (96-241)||(11707559-11707704)
chr8 (70-263)||(14061201-14061394)
chr8 (108-276)||(3513390-3513558)
chr8 (111-283)||(32010116-32010288)
chr8 (84-268)||(33314553-33314737)
chr8 (70-236)||(3720675-3720841)
chr8 (70-236)||(13173924-13174090)
chr8 (108-262)||(15647452-15647606)
chr8 (70-236)||(35296039-35296205)
chr8 (70-236)||(43553322-43553488)
chr8 (70-282)||(1245304-1245519)
chr8 (70-283)||(17718498-17718711)
chr8 (70-263)||(12248822-12249016)
chr8 (108-262)||(15623664-15623818)
chr8 (70-236)||(7483739-7483903)
chr8 (70-241)||(19972275-19972445)
chr8 (70-241)||(21020388-21020558)
chr8 (70-236)||(35051843-35052007)
chr8 (105-268)||(2456162-2456320)
chr8 (78-236)||(31028657-31028815)
chr8 (70-281)||(8453270-8453478)
chr8 (70-282)||(18842525-18842736)
chr8 (70-260)||(7605954-7606142)
chr8 (74-241)||(8730903-8731068)
chr8 (96-263)||(35498122-35498289)
chr8 (70-236)||(23793354-23793520)
chr8 (102-283)||(26740169-26740350)
chr8 (70-263)||(23855551-23855745)
chr8 (78-262)||(13132169-13132353)
chr8 (70-283)||(2888500-2888713)
chr8 (70-282)||(8554049-8554261)
chr8 (70-220)||(40521337-40521488)
chr8 (71-261)||(17074636-17074825)
chr8 (71-261)||(17573445-17573634)
chr8 (70-229)||(38074271-38074430)
chr8 (109-282)||(27911705-27911878)
chr8 (109-282)||(27958124-27958297)
chr8 (70-229)||(43553536-43553696)
chr8 (70-241)||(38221808-38221978)
chr8 (70-229)||(41890517-41890676)
chr8 (96-241)||(41701556-41701701)
chr8 (165-249)||(36112007-36112091)
chr8 (70-229)||(8954785-8954944)
chr8 (70-263)||(11163261-11163454)
chr8 (97-194)||(41305666-41305763)
chr8 (124-224)||(17313126-17313226)
chr8 (70-197)||(13935194-13935321)
chr8 (96-214)||(6660974-6661092)
chr8 (96-214)||(6741376-6741494)
chr8 (100-237)||(40602834-40602972)
chr8 (70-162)||(8672297-8672389)
chr8 (114-241)||(9687588-9687711)
chr8 (70-214)||(10086256-10086398)
chr8 (70-236)||(14511509-14511683)
chr8 (96-260)||(39615507-39615671)
chr8 (78-263)||(29125905-29126090)
chr8 (70-162)||(35028603-35028693)
chr8 (193-283)||(41308013-41308104)
chr8 (70-263)||(9301595-9301786)
chr8 (168-262)||(35029640-35029733)
chr8 (78-263)||(42352742-42352926)
chr8 (78-203)||(45317655-45317780)
chr8 (165-263)||(41643542-41643640)
chr8 (120-234)||(11015945-11016060)
chr8 (96-188)||(30205481-30205573)
chr8 (96-204)||(37998222-37998329)
chr8 (91-146)||(40608051-40608106)
chr8 (120-229)||(27193139-27193248)
chr8 (96-162)||(41644319-41644383)
chr8 (83-143)||(38238925-38238985)
chr8 (98-221)||(39663772-39663894)
chr8 (84-179)||(45400799-45400894)
chr8 (70-143)||(28206570-28206643)
[»] chr3 (105 HSPs)
chr3 (70-283)||(790545-790758)
chr3 (70-283)||(43554385-43554597)
chr3 (70-283)||(54898124-54898337)
chr3 (70-283)||(47069895-47070108)
chr3 (70-283)||(54106258-54106471)
chr3 (72-283)||(34266478-34266687)
chr3 (70-281)||(19550241-19550452)
chr3 (70-276)||(29651667-29651869)
chr3 (70-283)||(53745320-53745532)
chr3 (70-276)||(27483833-27484037)
chr3 (70-263)||(45513673-45513866)
chr3 (70-283)||(51244619-51244832)
chr3 (70-281)||(42671930-42672141)
chr3 (68-283)||(52663435-52663650)
chr3 (70-268)||(33491192-33491390)
chr3 (90-275)||(6902293-6902478)
chr3 (70-281)||(29697986-29698197)
chr3 (80-276)||(46973428-46973624)
chr3 (71-283)||(51697601-51697816)
chr3 (74-260)||(36234366-36234552)
chr3 (70-283)||(40139872-40140080)
chr3 (68-268)||(28885671-28885870)
chr3 (121-276)||(27992286-27992441)
chr3 (70-268)||(43775443-43775641)
chr3 (70-269)||(17102749-17102948)
chr3 (70-283)||(52627276-52627489)
chr3 (70-283)||(13158477-13158692)
chr3 (70-241)||(50091940-50092111)
chr3 (70-260)||(7328450-7328640)
chr3 (97-283)||(45101396-45101582)
chr3 (70-223)||(20105187-20105340)
chr3 (70-281)||(24981290-24981496)
chr3 (70-283)||(32980635-32980848)
chr3 (80-241)||(32854028-32854189)
chr3 (96-281)||(54911341-54911526)
chr3 (70-281)||(3376344-3376559)
chr3 (70-255)||(13168011-13168197)
chr3 (70-236)||(27039691-27039857)
chr3 (70-282)||(35315127-35315339)
chr3 (70-283)||(41168756-41168966)
chr3 (70-236)||(48151980-48152146)
chr3 (90-273)||(51219144-51219315)
chr3 (70-283)||(39866887-39867099)
chr3 (70-276)||(3643241-3643447)
chr3 (70-241)||(5244015-5244186)
chr3 (70-241)||(11473397-11473568)
chr3 (68-241)||(30861622-30861795)
chr3 (108-270)||(49123556-49123720)
chr3 (139-283)||(43945443-43945587)
chr3 (84-283)||(45145138-45145336)
chr3 (70-236)||(47104240-47104406)
chr3 (72-236)||(40010749-40010913)
chr3 (72-236)||(42515257-42515421)
chr3 (70-194)||(44544296-44544420)
chr3 (70-202)||(48214062-48214194)
chr3 (70-236)||(55141561-55141724)
chr3 (109-263)||(24122-24276)
chr3 (95-221)||(27028115-27028241)
chr3 (70-263)||(41351252-41351446)
chr3 (70-229)||(54334275-54334433)
chr3 (78-236)||(33874631-33874789)
chr3 (70-263)||(23771282-23771475)
chr3 (70-283)||(51064878-51065091)
chr3 (78-262)||(35077390-35077574)
chr3 (70-263)||(41926671-41926866)
chr3 (70-241)||(53281974-53282145)
chr3 (115-281)||(25983703-25983868)
chr3 (70-283)||(41425624-41425837)
chr3 (70-283)||(40318966-40319179)
chr3 (71-283)||(33074316-33074527)
chr3 (68-260)||(45055180-45055372)
chr3 (70-222)||(43159859-43160011)
chr3 (69-236)||(22099909-22100076)
chr3 (70-229)||(49168359-49168518)
chr3 (98-220)||(52175743-52175865)
chr3 (78-236)||(20848809-20848962)
chr3 (96-229)||(28226448-28226579)
chr3 (96-229)||(53290853-53290986)
chr3 (151-241)||(28943614-28943704)
chr3 (128-261)||(42671473-42671605)
chr3 (70-154)||(2642705-2642789)
chr3 (68-236)||(22173925-22174093)
chr3 (68-148)||(29803628-29803708)
chr3 (96-263)||(31610167-31610333)
chr3 (78-223)||(52173749-52173895)
chr3 (78-263)||(34750658-34750843)
chr3 (99-162)||(2154198-2154261)
chr3 (99-262)||(35458563-35458726)
chr3 (70-169)||(44092181-44092280)
chr3 (70-283)||(36370866-36371081)
chr3 (142-283)||(29803727-29803856)
chr3 (70-146)||(1201058-1201134)
chr3 (96-260)||(24569571-24569735)
chr3 (171-262)||(8236954-8237045)
chr3 (109-263)||(26748387-26748541)
chr3 (182-283)||(29458241-29458342)
chr3 (193-269)||(44544079-44544155)
chr3 (78-153)||(47844006-47844081)
chr3 (109-203)||(40113365-40113459)
chr3 (100-236)||(42634431-42634568)
chr3 (70-175)||(29458865-29458973)
chr3 (84-194)||(18355897-18356007)
chr3 (98-145)||(3035589-3035636)
chr3 (243-282)||(20105349-20105388)
chr3 (137-281)||(32853400-32853542)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (70-283)||(69095-69307)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (70-283)||(26160-26373)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (70-283)||(17193153-17193366)
chr6 (70-283)||(24663374-24663587)
chr6 (70-282)||(1751465-1751677)
chr6 (70-283)||(3621585-3621798)
chr6 (70-283)||(17835888-17836101)
chr6 (68-283)||(373716-373931)
chr6 (70-283)||(23923746-23923959)
chr6 (70-255)||(30388716-30388901)
chr6 (70-283)||(364575-364789)
chr6 (70-283)||(26470756-26470969)
chr6 (84-281)||(17124020-17124215)
chr6 (70-263)||(8992543-8992736)
chr6 (70-263)||(9016990-9017183)
chr6 (70-283)||(22784701-22784914)
chr6 (96-283)||(30416108-30416295)
chr6 (70-276)||(9838162-9838368)
chr6 (85-282)||(12732186-12732382)
chr6 (70-283)||(22050044-22050256)
chr6 (70-282)||(8176431-8176640)
chr6 (70-263)||(23777291-23777484)
chr6 (70-281)||(1252161-1252372)
chr6 (96-260)||(7056196-7056362)
chr6 (70-236)||(17251336-17251502)
chr6 (70-236)||(24356134-24356300)
chr6 (70-283)||(27313495-27313711)
chr6 (70-236)||(34378854-34379020)
chr6 (70-246)||(52658-52834)
chr6 (68-236)||(31244829-31244997)
chr6 (108-282)||(7632071-7632245)
chr6 (70-263)||(34730555-34730748)
chr6 (70-235)||(31854570-31854737)
chr6 (103-283)||(32359473-32359648)
chr6 (70-235)||(24635703-24635868)
chr6 (70-263)||(30236973-30237166)
chr6 (90-229)||(33260715-33260854)
chr6 (71-263)||(7235435-7235628)
chr6 (70-263)||(34607093-34607286)
chr6 (82-236)||(11676695-11676846)
chr6 (107-261)||(11431212-11431366)
chr6 (78-231)||(24948246-24948399)
chr6 (70-236)||(22400644-22400810)
chr6 (70-162)||(3849060-3849152)
chr6 (70-236)||(17601220-17601386)
chr6 (165-283)||(3850408-3850528)
chr6 (78-263)||(32251004-32251188)
chr6 (108-263)||(13597443-13597597)
chr6 (70-281)||(1249543-1249745)
chr6 (96-229)||(7170173-7170306)
chr6 (70-142)||(19645846-19645918)
chr6 (70-229)||(19811951-19812110)
chr6 (78-229)||(11000896-11001047)
chr6 (121-236)||(11128877-11128992)
chr6 (185-263)||(26485738-26485816)
chr6 (96-283)||(1923872-1924060)
chr6 (109-263)||(15432705-15432859)
chr6 (70-227)||(1135270-1135421)
chr6 (78-229)||(2381096-2381247)
chr6 (79-143)||(847800-847864)
chr6 (78-160)||(879267-879349)
chr6 (114-229)||(30734542-30734657)
chr6 (98-160)||(11835103-11835165)
chr6 (241-283)||(30388932-30388974)
chr6 (95-216)||(7632463-7632584)
chr6 (109-161)||(31282675-31282727)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (70-283)||(49142-49354)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (73-283)||(8152-8362)
[»] scaffold0831 (1 HSPs)
scaffold0831 (68-263)||(2800-2995)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (99-282)||(77112-77295)
[»] scaffold0886 (1 HSPs)
scaffold0886 (70-283)||(4511-4723)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (70-283)||(148296-148511)
scaffold0002 (70-255)||(138791-138977)
scaffold0002 (73-229)||(369402-369557)
scaffold0002 (103-203)||(492453-492553)
[»] scaffold1213 (1 HSPs)
scaffold1213 (70-282)||(1-217)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (70-263)||(14774-14967)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (70-241)||(184202-184373)
[»] scaffold0274 (1 HSPs)
scaffold0274 (70-263)||(292-485)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (70-236)||(147207-147374)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (70-236)||(7419-7585)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (114-283)||(419525-419694)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (70-229)||(23131-23290)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (70-196)||(72067-72193)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (70-172)||(195882-195984)
scaffold0014 (164-283)||(195620-195738)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (71-211)||(1029-1169)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (71-211)||(6460-6600)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (70-214)||(30794-30938)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (70-221)||(310-461)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (165-249)||(1884-1968)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (70-263)||(96114-96307)
[»] scaffold2146 (1 HSPs)
scaffold2146 (122-262)||(599-739)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (70-229)||(252589-252748)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (78-263)||(14303-14488)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (102-154)||(20999-21051)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 113)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4175722 - 4175510
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4175722 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtcctta 4175623  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4175622 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtatcaatt 4175523  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||| ||| |||||    
T  4175522 gtttattgtcttg 4175510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 34261289 - 34261502
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  34261289 tttttaagtgtcaattttgcagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatcctta 34261388  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34261389 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgtatcaaaagtagtatcaatt 34261488  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  34261489 gttgattgtcttgg 34261502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 18794760 - 18794972
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18794760 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 18794859  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  18794860 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattacatcaaaagtatgatcaatt 18794959  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  18794960 gttgattgtcttg 18794972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 74 - 282
Target Start/End: Original strand, 25343941 - 25344149
Alignment:
Q  74 taagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtta 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25343941 taagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaaccgttactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtta 25344040  T
Q  174 tttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttg 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25344041 tttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaggatcaattgttg 25344140  T
Q  274 attttcttg 282  Q
    ||| |||||    
T  25344141 attgtcttg 25344149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 6072429 - 6072640
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6072429 tttttaagcgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 6072528  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6072529 gttatttattacggagagagaaatatattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 6072628  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
    ||||||| ||||    
T  6072629 gttgattgtctt 6072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 81 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18020999 - 18020797
Alignment:
Q  81 cacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttatta 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  18020999 cacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattg 18020900  T
Q  181 cggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttct 280  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18020899 cggagagagaaatatatgaaatgagatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaagtagtatcaattgttgattgtct 18020800  T
Q  281 tgg 283  Q
    |||    
T  18020799 tgg 18020797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 78 - 283
Target Start/End: Original strand, 9076056 - 9076261
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9076056 tgtcacttttggataaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttattta 9076155  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattt 277  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9076156 ttgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattg 9076255  T
Q  278 tcttgg 283  Q
    ||||||    
T  9076256 tcttgg 9076261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 38702118 - 38702331
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38702118 tttttaagtgtcaattttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattgtcctta 38702217  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38702218 attatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 38702317  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  38702318 gttgattgtcttgg 38702331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 12664835 - 12665048
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  12664835 tttttaagtgttacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattgtcctta 12664934  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  12664935 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacatcatattgcatcaaaagtagtatcaatt 12665034  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  12665035 gttgattgtcttgg 12665048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12870141 - 12869928
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  12870141 tttttaagtgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgttctta 12870042  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12870041 gttatttattgcggagagagaaatatataaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 12869942  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  12869941 gttgattatcttgg 12869928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 38910251 - 38910463
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  38910251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 38910350  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38910351 gttatttattatggagagataaatatatgaaat-ggatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 38910449  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  38910450 gttgattatcttgg 38910463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7579910 - 7579703
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7579910 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 7579811  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatc-aaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  7579810 gttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcaacaaaaagtagtatcaat 7579711  T
Q  269 tgttgatt 276  Q
    ||||||||    
T  7579710 tgttgatt 7579703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10359465 - 10359271
Alignment:
Q  82 acttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattac 181  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  10359465 acttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgc 10359366  T
Q  182 ggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgatt 276  Q
    ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10359365 ggagaaaaaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcatcatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgatt 10359271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26854336 - 26854124
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  26854336 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttccaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 26854237  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26854236 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-ggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 26854138  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  26854137 attgattatcttgg 26854124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 39073021 - 39073234
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  39073021 tttttaagtgtcaattttggaaaaaaaatttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 39073120  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39073121 gttatttattgcgaagtgagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 39073220  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  39073221 gttgattgtcttgg 39073234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 8825034 - 8825246
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8825034 tttttaagtgtcattttttgagaaattttttgttcatatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 8825133  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8825134 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt 8825233  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  8825234 gttgattgtcttg 8825246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1297980 - 1297768
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  1297980 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattgtcctta 1297881  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatc-aaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  1297880 gttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaaatagtattaat 1297781  T
Q  269 tgttgattttctt 281  Q
    |||||||| ||||    
T  1297780 tgttgattgtctt 1297768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 38363168 - 38363379
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  38363168 tttttaagtgttacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat--tcctta 38363265  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  38363266 gttattaattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaattagtatcaatt 38363365  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  38363366 gttgattgtcttgg 38363379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 40198765 - 40198977
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||    
T  40198765 tttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatccgta 40198864  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  40198865 gttatttattgcggagagagaaataaatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatt 40198964  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  40198965 gttgattgtcttg 40198977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 90 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38017499 - 38017308
Alignment:
Q  90 agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagag 189  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  38017499 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagag 38017400  T
Q  190 aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttctt 281  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38017399 aaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtctt 38017308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24075080 - 24074874
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||    
T  24075080 tttttaagtgtctcttttaaagaatttttttgtttatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattactctta 24074981  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24074980 attatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatt 24074881  T
Q  270 gttgatt 276  Q
     ||||||    
T  24074880 attgatt 24074874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 106 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1088139 - 1087962
Alignment:
Q  106 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  1088139 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 1088040  T
Q  206 atattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1088039 atattaaatgaataaagtcgttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgg 1087962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28024501 - 28024288
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  28024501 tttttaagtgtctcttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 28024402  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  28024401 gttatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaataatt 28024302  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  28024301 attgattgtcttgg 28024288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 42911527 - 42911740
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  42911527 tttttaagtgtctcttttggagaaaatttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 42911626  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||| | | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  42911627 gttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaatatgatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatt 42911726  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  42911727 attgattgtcttgg 42911740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6754401 - 6754208
Alignment:
Q  90 agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagag 189  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||    
T  6754401 agaaaagttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatatcatttttagttatttattgcggagagag 6754302  T
Q  190 aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||    
T  6754301 aaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtatgatcaattattgattgtcttgg 6754208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 36239461 - 36239647
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  36239461 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatat 36239560  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||    
T  36239561 atgaaataagatattaaattaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaactattgattgtcttg 36239647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 4098308 - 4098521
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||  ||||||| |||||     
T  4098308 tttttaagtatcacttttggagaaaatttttgtttcaatttaactgtcacttttaaagttcagtacaacattaaatgttgttttgccaatattatccttt 4098407  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4098408 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaggtataacttattgtatcaaaagtaatatcaatt 4098507  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  4098508 tttgattgtcttgg 4098521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4985416 - 4985204
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||    
T  4985416 tttttaagtgtctcttttggagatt-tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattaccctta 4985318  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4985317 attatttattgaggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaact 4985218  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  4985217 attgattgtcttgg 4985204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Original strand, 18465678 - 18465880
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  18465678 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 18465777  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||     |||||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18465778 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaat----gattaaatgaacaaaattattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagtagtatcaatt 18465873  T
Q  270 gttgatt 276  Q
    |||||||    
T  18465874 gttgatt 18465880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8230045 - 8229834
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  8230045 tttttaagtgtctattttgaagaaattttttattcctatttaactgtcattttccaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 8229946  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  8229945 gttatttattccggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcactatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtattaacaatt 8229846  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
     |||||| ||||    
T  8229845 attgattgtctt 8229834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14794032 - 14793826
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14794032 tttttaaatgtctgttttggagaaattttttgtttctatttaaatgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatcctta 14793933  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  14793932 gttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtaataatt 14793833  T
Q  270 gttgatt 276  Q
     ||||||    
T  14793832 attgatt 14793826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16124504 - 16124304
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  16124504 catttttaagtatctcttttgaataaattttttattactatttaactgttaccttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcct 16124405  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| |||    
T  16124404 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaa 16124305  T
Q  268 t 268  Q
    |    
T  16124304 t 16124304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 283
Target Start/End: Original strand, 4694739 - 4694954
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  4694739 catttttaagtatctcttttggagaatttttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattagatgttattttactaatattatcct 4694838  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||    
T  4694839 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagtattagcaa 4694938  T
Q  268 ttgttgattttcttgg 283  Q
    || |||||| ||||||    
T  4694939 ttattgattatcttgg 4694954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Original strand, 6007860 - 6008067
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  6007860 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattgtcttta 6007959  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat-ggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||  | |||| ||||||||||||| ||||    
T  6007960 gttatatattacagagagagaaatatatgaaatgtggtattaaattaataaggctattatagttaaaaatataaatcattgtatcaaaagtagtaacaat 6008059  T
Q  269 tgttgatt 276  Q
    | ||||||    
T  6008060 tattgatt 6008067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28463627 - 28463456
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  28463627 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 28463528  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  28463527 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtata 28463456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 283
Target Start/End: Original strand, 7403835 - 7404042
Alignment:
Q  74 taagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtta 173  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  7403835 taagtgtcactttg--agaaattttttgttcatatttaactctcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagtta 7403932  T
Q  174 tttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttg 273  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7403933 tttattgcggagaaataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaaatagtatcaattgttg 7404032  T
Q  274 attttcttgg 283  Q
    ||| ||||||    
T  7404033 attatcttgg 7404042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2134148 - 2133936
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  2134148 tttttaagtgtctcttttaaagaaattttttgttcttatttaattgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatcctta 2134049  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2134048 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaa-tagtaacaatt 2133950  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  2133949 attgattgtcttgg 2133936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9127593 - 9127404
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  9127593 tttttaagtgtctattttgatgaaattttttgttcgtatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcttta 9127494  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagt 259  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  9127493 attatttattacggagagagaaatatataaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagt 9127404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Original strand, 5119155 - 5119361
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||     
T  5119155 tttttaagtttctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgccactttcaaagttcaatgcatcattaaatattgttttaccaatattatccttt 5119254  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  5119255 gttatttattactgagagaaaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaacaatt 5119354  T
Q  270 gttgatt 276  Q
     ||||||    
T  5119355 attgatt 5119361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 98 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2674192 - 2674007
Alignment:
Q  98 tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatat 197  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  2674192 tttgtttgtatataactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctcagttatttactgcgaagagagaaatatat 2674093  T
Q  198 gaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    ||||| | |||||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2674092 gaaattagatattaaatgaataaaatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttgg 2674007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28447226 - 28447014
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  28447226 tttttaagtgtctcttttggagaaaatttttgttcctatttaactctcactttcaaagttaaatgcaacattaaatgttattttataaatattatcctta 28447127  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    | ||||||||  | | ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  28447126 g-tatttattgagaaaagagatatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaaatagtaacaatt 28447028  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  28447027 attgattatcttgg 28447014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 4017391 - 4017603
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  4017391 tttttaaccgtctcttttgaagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaatattaaatgttgatttaccaatattatcctta 4017490  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  4017491 gttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggttattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaaacaatt 4017590  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
     |||||| |||||    
T  4017591 attgattatcttg 4017603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 269
Target Start/End: Original strand, 6689575 - 6689775
Alignment:
Q  69 atttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||    
T  6689575 attttcaagtgtctcttttggagaaattttttgtttctgtttatctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattctt 6689674  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  6689675 aattatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatgttaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaaatagtaacaat 6689774  T
Q  269 t 269  Q
    |    
T  6689775 t 6689775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4427648 - 4427457
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  4427648 tttttaagtgtttcttttggagaaattttttgttcatattcaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 4427549  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtag 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  4427548 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgagtgaggtcattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtag 4427457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21606500 - 21606329
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  21606500 tttttaaatgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 21606401  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  21606400 attatttattacggagaaagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaaatata 21606329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 31802766 - 31802958
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  31802766 tttttaagtgtctcttttggagaaaatttt-gtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccctta 31802864  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  31802865 gttatttattgtggagagaaaattatatgaaagaagatattaaattaataaggtcattatgataaaagtataaattattgtatcaaaagtagta 31802958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37303349 - 37303156
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||| |||||  |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  37303349 tttttatgtgtcttttttgaagattttttctgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatacaacattaaatgttgtttcaccaatattatcctta 37303250  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  37303249 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattacatcaaaagtagta 37303156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38503042 - 38502848
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  38503042 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatcctta 38502943  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    |||| ||||| |||||| || | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  38502942 actatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg----aggtcattatagtaaaagtacaacttattacatcaaaagtagtaacaat 38502848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4689039 - 4688869
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  4689039 tttttaagtgtca-ttttgaagaaaaattttgttcatatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 4688941  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  4688940 gttatttattgcagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattaaagtaaaagtata 4688869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18437565 - 18437394
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  18437565 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgtttcaatttaagtgtcactttcaaaatccaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattaccctta 18437466  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  18437465 gttatttattatggagagagaaatatatgaaatgagataataaataaataaggttattatagtaaaagtata 18437394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 129 - 282
Target Start/End: Original strand, 22582508 - 22582661
Alignment:
Q  129 tcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttatta 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  22582508 tcaatgtaacattaaatgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatta 22582607  T
Q  229 tggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22582608 tagtacaagtatagtttattgcatcaaaagtagtataaattgttgattgtcttg 22582661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4962430 - 4962239
Alignment:
Q  69 atttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttc-tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| || |    
T  4962430 atttttaagtgtctcttttagaaaaactttttgtttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatggaacattaaatgttgttttacaaatattatctt 4962331  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagt 259  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||  | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  4962330 tagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaaatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagt 4962239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32440154 - 32439995
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  | |||    
T  32440154 tttttaagtgtcactttaggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccttta 32440055  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  32440054 gttatttattgcagagagagaaatacatgaaataagatattaaatgactaaggctattat 32439995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Original strand, 425104 - 425251
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||   ||    
T  425104 catttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctgtttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacatttctct 425203  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatg 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  425204 tagttatttattgcggagagagaaataaatgaaataagatattaaatg 425251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5144240 - 5144081
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||  |||||    
T  5144240 tttttaattgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatcttgttttaccaacattaccctta 5144141  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5144140 attatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattat 5144081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 263
Target Start/End: Original strand, 26906470 - 26906660
Alignment:
Q  71 ttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt-attttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||   |||||    
T  26906470 ttttaagtatcacttttgtagaaa-tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcagcattaaatgttgtttttaccaatatcaccctta 26906568  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||| | ||||  |||  |||||| |||||||||||||    
T  26906569 gttatttattac--agagagaaatatatgaaacaagatattaaatgaatgatgttattattggaaaaggataaattattgtatcaaaagtagta 26906660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 263
Target Start/End: Original strand, 24228945 - 24229118
Alignment:
Q  90 agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagag 189  Q
    ||||| |||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||    
T  24228945 agaaattttttgctcctatttaattgttactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatctttacttatttattgcggagagag 24229044  T
Q  190 aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||  || ||| |||||||||||||    
T  24229045 aaatatatgaaattagatattgaatgaataaggttattatagtaaaagtgtatattgttgtatcaaaagtagta 24229118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38297859 - 38297687
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttc-tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  ||||    
T  38297859 tttttaagtgtcacttttggagaaatttttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctt 38297760  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||| |||||| ||||    
T  38297759 agttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattacatgattaaggcgattatagtaaaagtata 38297687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12784684 - 12784472
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||  |||||    
T  12784684 tttttaactgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacactaattgttgttttaccaatattaccctta 12784585  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| | |||||| || | |  |||| ||||||||||||| || ||    
T  12784584 tatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattttagtaaaagtaaaac-aattgtatcaaaagtagtaacattt 12784486  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  12784485 attgattgtcttgg 12784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 283
Target Start/End: Original strand, 32388999 - 32389176
Alignment:
Q  106 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||    
T  32388999 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaatgaa 32389098  T
Q  206 atattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||||| || |  | |||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  32389099 atattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacacttattgattgtcttgg 32389176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25027966 - 25027842
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  25027966 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 25027867  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaata 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  25027866 gttatttattgcggagagagaaata 25027842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42394370 - 42394242
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||  |||||    
T  42394370 tttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttatgaacattaccctta 42394271  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatg 198  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  42394270 ggtatttattggggagagagaaatatatg 42394242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1795359 - 1795188
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  1795359 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgttacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 1795260  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
     ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||| |||||| ||||    
T  1795259 tttatttattgcgaagagagaaatatacgaaataagatattaaatgactaaagctattatagtaaaagtata 1795188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 260
Target Start/End: Original strand, 7408340 - 7408498
Alignment:
Q  102 tttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaa 201  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7408340 tttcaatttaattgtcactttcaaagttcaaagcaatattaaatattgttttaccaatattactcttacttatttattatggagagaaaaatatatgaaa 7408439  T
Q  202 taaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagta 260  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  7408440 tgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagta 7408498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19831782 - 19831571
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  19831782 tttttaagtgtcttttttagagaaattttttgtttctatttaactctcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccctta 19831683  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
      ||||||||  ||| ||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||  |||||| ||||||| || || || ||    
T  19831682 actatttattgtggaaagagaa--atattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaacatataaattattgtatcaaaaatattaacattt 19831585  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  19831584 attgattgtcttgg 19831571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39894023 - 39893885
Alignment:
Q  98 tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatat 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  39894023 tttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttaaatatttattgcggagagagaaacatat 39893924  T
Q  198 gaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  39893923 gaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 39893885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 236
Target Start/End: Original strand, 3892788 - 3892955
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    |||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  |||    
T  3892788 catttttaaccgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactatcacttt-aaagttcaatgcaacgttaaatgttattttaccagtattaccct 3892886  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||  |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  3892887 taaatatttattgcggagagagaaacatatataataaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 3892955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38298041 - 38297885
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||| | |||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||     
T  38298041 tttttaagtgcctcttttgaataattttttt-ttcctatttaactgtcactttcaaagtt--atgcatcattaaatgttgttttaccaatattatccttt 38297945  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  38297944 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatgttaaattaataaggttattat 38297885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12723201 - 12723050
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||  |||||    
T  12723201 tttttaactgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacactaattgttgttttaccaatattaccctta 12723102  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataag 221  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12723101 tatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataag 12723050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 21157610 - 21157769
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||  ||||     
T  21157610 tttttaattgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttg 21157709  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||||||   |||||| || |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  21157710 attatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaaggtttttat 21157769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40209207 - 40209064
Alignment:
Q  73 ttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtt 172  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  ||||||||    
T  40209207 ttaagtgtcacttctggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagtt 40209108  T
Q  173 atttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatga 216  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  40209107 atttattgtggatagagaaatataggaaatatgatattaaatga 40209064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 37809736 - 37809929
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||  |||||    
T  37809736 tttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgatgttttaccaatattaccctta 37809835  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
      |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||||| || |    ||||||||||||||||||    
T  37809836 tatatttattgcagagagagaaacatatgaattaaaatattaaattaacaagatcattatagtaaaagtaaaaacaattgcatcaaaagtagta 37809929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7735326 - 7735159
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatt-tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  7735326 tttttaaccgtcacttttaaagaaaaaaatttgtttttatttaactgtcactgtcaaaattcaatgcaaaattcaatgttgttttaccaacattatcctt 7735227  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  7735226 atatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaa 7735159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 21150469 - 21150628
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||  ||||     
T  21150469 tttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttg 21150568  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||||||   |||||| || |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  21150569 attatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaaggtttttat 21150628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 25785884 - 25786043
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||  ||||     
T  25785884 tttttaattgtcacttctgcagaaatttttagtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttggcattattacccttg 25785983  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  25785984 attatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattat 25786043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10889336 - 10889243
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattg 163  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10889336 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattg 10889243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 239
Target Start/End: Original strand, 38160295 - 38160435
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  | ||    
T  38160295 tttttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattatccttaaatatttattacggagagag--acat 38160392  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaatta 239  Q
    ||||| | |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  38160393 atgaagtgaaat-ttaaatcaataagattattatagtaaaatta 38160435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37306940 - 37306775
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||  |||||    
T  37306940 tttttaactgtcacttttagagaaaaattt-gttcctaattaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttaccaatattaccctta 37306842  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | |||||||| | |||||| ||| ||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  37306841 gatatttattgcagagagaaaaacatatgaattgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaa 37306775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 37633653 - 37633819
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||  |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||  |||||    
T  37633653 tttttaaccgtcacttttagagaaaaaatttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgatgttttaccaatattaccctta 37633752  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
      |||||||| | || ||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||    
T  37633753 tatatttattgcagaaagagaaacatatgaattaaaatattaaattaacaagatcattatagtaaaa 37633819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 223
Target Start/End: Original strand, 31803301 - 31803454
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||  |||||| ||||||    
T  31803301 tttttaactgtcatttttagagaaaaaatttgttcttatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgatgttttactaatattatcctta 31803400  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggt 223  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||    
T  31803401 gatatttattgcggagagagaaacatatgaattgaaatattaaattaacaaggt 31803454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18676655 - 18676498
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||     
T  18676655 tttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttttaatta--tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattatccttg 18676558  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||||||   ||||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  18676557 attatttattgtagagagagaagtatatgaaataggatattaaatgatgaaggttattat 18676498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24469878 - 24469708
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaa-gttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  24469878 tttttaagtatcacttt-gaagaaa-tttttgttcatatttaactgtcactttaaaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttaccaacattatcctt 24469781  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    | ||||||||| | |||||  |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  24469780 aattatttattgcagagaggaaaatttattaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaaatata 24469708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 229
Target Start/End: Original strand, 13461016 - 13461146
Alignment:
Q  99 ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| |||   |||| |||||||||  ||||||||||||||||     
T  13461016 ttgtttctatttaactgtcacttttaatgttgaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattactcttaattatttattgtggagagagaaatatata 13461115  T
Q  199 aaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  13461116 aaataagatattaaatgaaaaagattattat 13461146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18393213 - 18393020
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |  ||||  ||||     
T  18393213 tttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttg 18393114  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     |||||||||   ||||||||| || ||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | ||||  ||   || |||||||||||||||||    
T  18393113 attatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagta 18393020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 3243801 - 3243932
Alignment:
Q  98 tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatat 197  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  3243801 tttgtttctatttaaccatcgttttcaaaaatcaatgcaatattaaatgttgttttatcaaatttgtcctttgttatttattgtggagagaaaaatatat 3243900  T
Q  198 gaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  3243901 aaaatgagatattaaatgaataaggctattat 3243932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Original strand, 7466207 - 7466318
Alignment:
Q  118 actttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  7466207 actttcaaacttcaatgcaacattaaatagtgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaa 7466306  T
Q  218 taaggttattat 229  Q
    |||||| |||||    
T  7466307 taaggtcattat 7466318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9959119 - 9959008
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9959119 tttttacgtgtcacatttagagaaaatttttgtttctatttaaccgtcgctttcaaagttcaatgcaatatcaaatgttgttttaccaatattatcctta 9959020  T
Q  170 gttatttattac 181  Q
      ||||||||||    
T  9959019 cctatttattac 9959008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11413772 - 11413613
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||  | ||     
T  11413772 tttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttttaattaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacatttattacctttg 11413673  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     ||||||||||  ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  11413672 attatttattatagagagagaagtatgtgaaattagatattaaatgatgaaggttattat 11413613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12638182 - 12638037
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||| ||||||  ||||||  ||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||    
T  12638182 tttttaattgttacttttagagaaaaaatttgttcgtatttaattgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaaaattaccttta 12638083  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatg 215  Q
    | |||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12638082 gatatttattgcagaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaatg 12638037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 13703072 - 13703239
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaa--ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    |||||||  |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  | |    
T  13703072 tttttaatcgtcacttttagagaaattttttatttctatttaagactgttgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattacctt 13703171  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  13703172 tagatatttattgcggagagagaaacatatgaagtgaaat-ttaaatcaataagactattatagtaaaa 13703239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31985292 - 31985184
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||  | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||    
T  31985292 tttttaagtgtctcttgcggagaaattttttgtttatattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaaagttattttaccgatattaccctta 31985193  T
Q  170 gttatttat 178  Q
     ||||||||    
T  31985192 attatttat 31985184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 8849373 - 8849186
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| | |||||||||| | |||| | |||||  |||||  ||||||    
T  8849373 tgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactatcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatattacccttatatattta 8849274  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaat--aaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    || | ||||||||||| ||||||||   || |||||||||| |||||||||||| | ||||  |||  || ||| |||||||||||||    
T  8849273 ttgcagagagagaaatgtatgaaatgagaagtattaaatgattaaggttattatagaaaaaagataattttttgtatcaaaagtagta 8849186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 4440092 - 4440175
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttatt 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| || ||||||| |||||||    
T  4440092 tttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttatttttcctataatgcccttagtaatttatt 4440175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5843215 - 5843070
Alignment:
Q  90 agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagag 189  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||   | |||| |||||||| | ||| |||    
T  5843215 agaaattttttgttcctatttaactgtcgttttcaaagttcaatgcaatattaaatgtagttttatcaatatcacctttagatatttattgcagagtgag 5843116  T
Q  190 aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  5843115 aaacatatgaagtgaaat-ttaaatcaataagactattatagtaaaa 5843070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 262
Target Start/End: Original strand, 36481078 - 36481244
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    ||| || ||||||| ||||||| | |||||| |||| |    
T  36481078 tttttgtttctaattaagtgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcttataatgcccttagtaatttattgcagagagataaattt 36481177  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    | |||||| |||||||||| | ||||| |||||| |  |||  |||  |||||| ||||||||||||    
T  36481178 aagaaatataatattaaataattaaggatattataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagt 36481244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 194
Target Start/End: Original strand, 3686371 - 3686494
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  3686371 tttttaagtgtcacttttggagatt-tttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattaccctt 3686469  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaata 194  Q
    | ||| |||||  |||||||||||||    
T  3686470 attta-ttattgtggagagagaaata 3686494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38308343 - 38308202
Alignment:
Q  95 atttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaata 194  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||| || || | |||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||    ||||||| |||    
T  38308343 atttttgttcctgtttaactatcactttcaaaattcattgtaataataaatgttgttttatcaacattacccttagttatatattgtaaagagagacata 38308244  T
Q  195 tatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  38308243 catgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaa 38308202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 263
Target Start/End: Original strand, 40927138 - 40927323
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||   ||||  ||||||    
T  40927138 tgtcacttttgcataaaaattttgtttctaattaattgtcgttttcaaaattcaatgtatcattaaatgtggttttacctatattactcttatatattta 40927237  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    || | ||||||| ||||||| |||| || |||||||||| |||| ||||||| | ||||  |||  || |||||||||||||||||    
T  40927238 ttgcagagagagcaatatataaaatgaagtattaaatgattaagattattataggaaaaagataaattgttgcatcaaaagtagta 40927323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 228
Target Start/End: Original strand, 4609001 - 4609159
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |  ||||  | ||     
T  4609001 tttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttttaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacctttg 4609100  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttatta 228  Q
     |||||||||   ||||||||| || ||||||| | |||||||||||  ||||||||||    
T  4609101 attatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttatta 4609159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 30368357 - 30368251
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  30368357 tttttaagtgtctcttttaaagaatttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagatcaatgcaacattaaatgttattttactaatattaccctt 30368258  T
Q  169 agttatt 175  Q
    | |||||    
T  30368257 atttatt 30368251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13957394 - 13957258
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||    
T  13957394 tgtcacttttacagaatttttttgtttccaattaactgtcactctcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataaagctcttagtaattta 13957295  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaat 214  Q
    ||   ||||||  | |||||||||||  |||||||||    
T  13957294 ttgaagagagaagagtatatgaaatatgatattaaat 13957258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Original strand, 18000377 - 18000469
Alignment:
Q  131 aatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggt 223  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| | | ||||||||||| || |||||    
T  18000377 aatgcaacattaaatgatgttttatcaatattaaccttagatatttattgtggagagagaaacatatgtattgaaatattaaattaacaaggt 18000469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25027694 - 25027606
Alignment:
Q  193 tatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttctt 281  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||   |||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||    
T  25027694 tatatgaaatgaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtctt 25027606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 23418603 - 23418681
Alignment:
Q  150 ttttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttatta 228  Q
    ||||| ||||||| |  ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23418603 ttttaccaatattatggttagttatttattagagatagagaaatatacgaaataaaatattaaatgaatgaggctatta 23418681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 17869546 - 17869354
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaattt-ttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||||| ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||  |||    
T  17869546 tttttaggtgtctcttttgaagaaaaaaaattgtttctatttaagtgtcattttacatagttaaatggaacattaaatgttattttactaatattaccct 17869447  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtag 261  Q
    || ||||| ||   ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||  ||||| || |  |||||  |||||||||||    
T  17869446 tatttatt-atcgtggagtaagaaatatatgtaatgagatattaaataaataagattattataataaaaatagaaattattatatcaaaagtag 17869354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31546104 - 31546028
Alignment:
Q  207 tattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    |||||| ||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31546104 tattaattgaatcaggtcattgtagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttgg 31546028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10735528 - 10735457
Alignment:
Q  83 cttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta 154  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  10735528 cttttggagaaattttttgttcatatttaaatgtcacttttaaagtttaacgcaacattaaatattatttta 10735457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17872503 - 17872426
Alignment:
Q  99 ttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatt 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||    
T  17872503 ttgtttctatttaagtgtcactttacatagttaaatggaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt 17872426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 188
Target Start/End: Original strand, 6330769 - 6330889
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaat-ttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt-attttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||  ||||| || |||| || ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||  ||     
T  6330769 tttttaattgttacttttgaataaaaaattttgattatattcaattgtcattttcaaagtttaatataacattaaatgttgtttttatcaatattacccc 6330868  T
Q  168 tagttatttattacggagaga 188  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  6330869 tagttatatattgcggagaga 6330889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Original strand, 3818174 - 3818237
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaat 133  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||||||    
T  3818174 tttttaattgccacttttgaagaaattttttatttctaatcaagtatcactttcaaagttcaat 3818237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Original strand, 3818263 - 3818326
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaat 133  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||||||    
T  3818263 tttttaattgccacttttgaagaaattttttatttctaatcaagtatcactttcaaagttcaat 3818326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 143
Target Start/End: Original strand, 42174259 - 42174322
Alignment:
Q  80 tcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaa 143  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||    
T  42174259 tcacttttgaagaataattttgtttcaatttacctgtcacttttatatttcaatgcaatattaa 42174322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 261
Target Start/End: Original strand, 3686790 - 3686858
Alignment:
Q  193 tatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtag 261  Q
    |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||| |||||||||||    
T  3686790 tatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtag 3686858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 31430554 - 31430767
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31430554 tttttaagtgtcacttttgtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 31430653  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31430654 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatgaaaaatagtatcaatt 31430753  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  31430754 gttgattgtcttgg 31430767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17896771 - 17896569
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17896771 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 17896672  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17896671 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaatatcaatt 17896572  T
Q  270 gtt 272  Q
    |||    
T  17896571 gtt 17896569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 18470302 - 18470515
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  18470302 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 18470401  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18470402 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcgttatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtatcaatt 18470501  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  18470502 gttgattgtcttgg 18470515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22951066 - 22950853
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  22951066 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattctcctta 22950967  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22950966 gttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattataataaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtatcaatt 22950867  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     || ||| ||||||    
T  22950866 ttttattgtcttgg 22950853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 7312612 - 7312824
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7312612 tttttaagtgtcacttttggataaattttttatttctatttaagtgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 7312711  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7312712 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 7312811  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  7312812 gttgattgtcttg 7312824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32528576 - 32528364
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  32528576 tttttaagtgttacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgaaatattaaatgttgttttaccaatattatcctta 32528477  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32528476 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagcatcaatt 32528377  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  32528376 gttgattgtcttg 32528364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 32966297 - 32966086
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  32966297 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcattttcaaagttaaatgcaacattaaatgttggtttaccaatattgtcctta 32966198  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32966197 gttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtggtatcaatt 32966098  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
    ||||||| ||||    
T  32966097 gttgattgtctt 32966086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26632427 - 26632226
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26632427 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttatc-ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcctta 26632329  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  26632328 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcattt 26632229  T
Q  270 gtt 272  Q
    |||    
T  26632228 gtt 26632226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12838326 - 12838113
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  12838326 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcagtgcaacattaaatgttgttttgccaatattatcctta 12838227  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12838226 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaggtatagcttattgtatcaaaagtaatatcaatt 12838127  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  12838126 tttgattgtcttgg 12838113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 20035043 - 20035255
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  20035043 tttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcctatttaactggcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 20035142  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  20035143 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaaggaatatcaatt 20035242  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  20035243 gttgattgtcttg 20035255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 20045454 - 20045666
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  20045454 tttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcctatttaactggcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 20045553  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  20045554 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaaggaatatcaatt 20045653  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  20045654 gttgattgtcttg 20045666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29497780 - 29497576
Alignment:
Q  72 tttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagt 171  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  29497780 tttaactgtcactttttgagaaaaattttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgttcttcgt 29497681  T
Q  172 tatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgt 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  29497680 tatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatggcataaaaagtagtatcaattgt 29497581  T
Q  272 tgatt 276  Q
    |||||    
T  29497580 tgatt 29497576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33100081 - 33099870
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  33100081 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatcttgttttaccaatattgtcctta 33099982  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  |  |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33099981 gttatttatt--gtggagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 33099884  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  33099883 gttgattgtcttgg 33099870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 36922234 - 36922447
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  36922234 tttttaagtgtcacttttagagaaaatttttatttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 36922333  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatc-aaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  36922334 gttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaacatagcttattgcatcaaaaagtaatatcaat 36922433  T
Q  269 tgttgattttcttg 282  Q
    |||||||| |||||    
T  36922434 tgttgattgtcttg 36922447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44480390 - 44480177
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44480390 tttttaagtgtctcttttgaagaaaaaatttgttcttatttaaccgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattatcctta 44480291  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  44480290 gttatttattgtgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcataaaaaatagtatcaatt 44480191  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  44480190 gttgattgtcttgg 44480177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 41891264 - 41891478
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatt-tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  41891264 tttttaagtgtcacttttggagaaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattgaatgttgttttaccaatattgtcctg 41891363  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41891364 agttatttattgcggagagagaaatatataaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaattagtatcaat 41891463  T
Q  269 tgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||| ||||||    
T  41891464 tgttgattgtcttgg 41891478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7477446 - 7477248
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  7477446 tttttaagtgtctcttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccgatattatcctta 7477347  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7477346 gttatttattacgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaat 7477248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 36298422 - 36298216
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||  |||||    
T  36298422 tttttaagtgtctcttttgaagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaatgttcaatgcaacattaaatgatgttttatcagtattaccctta 36298323  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  36298322 attatttatttcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaatt 36298223  T
Q  270 gttgatt 276  Q
     ||||||    
T  36298222 attgatt 36298216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33922024 - 33921824
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||    
T  33922024 catttttaagtgtctcttttgaagaaaatttgtgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattgaatgttgttttaccgatattatcct 33921925  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  33921924 taattatttattacgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataatttattgcatcaaaagtagtaacaa 33921825  T
Q  268 t 268  Q
    |    
T  33921824 t 33921824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 26723919 - 26724112
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  26723919 tttttaagtgtctctttcggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattaccctta 26724018  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26724019 attatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagta 26724112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41675434 - 41675222
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  41675434 tttttaagtgtcacttttgcagaaaatttttgttcttgtttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 41675335  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  41675334 gttatttattgcaaagaaataaatatattaaataaaatattaaatgaataaggtcgttatagtaaaactatagcttattgcatcaaaaatag-atcaatt 41675236  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  41675235 attgattgtcttgg 41675222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 10227251 - 10227463
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10227251 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattatccttt 10227350  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | || |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||    
T  10227351 gttatttattgcggagggagaaatatataaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaataatt 10227450  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
     |||||| |||||    
T  10227451 attgattgtcttg 10227463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Original strand, 33173802 - 33174000
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  33173802 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 33173901  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| | |||||  ||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33173902 gttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagattttaaatgaataagatcattatattaaaagtacaacttattgtatcaaaagtagtaacaat 33174000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 8264942 - 8265157
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatg----caacattaaatgttattttatcaatattgtc 165  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||  |||||| ||    
T  8264942 tttttaagtgtcacttttagagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaccaacattaaatgttgttttactaatattatc 8265041  T
Q  166 cttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatc 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||  | ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8265042 cttagttatttattgcggagagag--agatatgtaatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaaggagtatc 8265139  T
Q  266 aattgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  8265140 aattgttgattgtcttgg 8265157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 33257876 - 33258069
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||     
T  33257876 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttg 33257975  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    ||||| |||||||||||||    
T  33257976 gttatttattatggagagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagta 33258069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29722552 - 29722340
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  29722552 tttttaatcgtcacttttggagaaattttttgtttatacttaactttcactttcataattcaatgcaatattaaatgttgttttactaatattgtcctta 29722453  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29722452 attatttattgcggagatagaaatatatgaaataagatattaaataaataa-gtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcgatt 29722354  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  29722353 gttgattgtcttgg 29722340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 282
Target Start/End: Original strand, 3837855 - 3838069
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| || |    
T  3837855 catttttaagtgtttcttttggagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattatctt 3837954  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||    
T  3837955 tagttatttattgcggaaagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttatggcatcaaaagtaataacaa 3838054  T
Q  268 ttgttgattttcttg 282  Q
    || |||||| |||||    
T  3838055 ttattgattgtcttg 3838069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31399179 - 31398967
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||    
T  31399179 tttttaagtatcatttttggagaaaaaatttgtttctttttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcttta 31399080  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  31399079 gttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagata-taaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattatatcaaaagtagtatcaatt 31398981  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     || ||| ||||||    
T  31398980 tttaattgtcttgg 31398967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42842114 - 42841948
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  42842114 tttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattaccctta 42842015  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  42842014 gatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaa 42841948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30866984 - 30866819
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||  |||||    
T  30866984 tttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttggtttaccaacattaccctta 30866885  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  30866884 gttatttattacggagagagaaatatataaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaa 30866819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 36406746 - 36406917
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  36406746 tttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 36406845  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  36406846 gttatttattgcggatagagaaatatattaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtata 36406917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 102 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36648221 - 36648063
Alignment:
Q  102 tttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36648221 tttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttaatttatcaatattatccttagctatttatttcggagagagaaatatatgaaa 36648122  T
Q  202 taaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagta 260  Q
    | | || |||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  36648121 tgagatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagta 36648063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 35112424 - 35112617
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||    
T  35112424 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatattgttttaccaatattaccctta 35112523  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||    ||||| |||||||||||||    
T  35112524 gttatttattgtggagagaaaaatatataaaatgagatattaaataaataaagttattatagtaaaaatatgaagtattgtatcaaaagtagta 35112617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41889565 - 41889372
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | ||||    
T  41889565 tttttaagtgtcacttttaaagaatttttttgttccaatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaactttaaatattgttttatcaatattattctta 41889466  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||   |||||| |||||||||||||    
T  41889465 gttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagactattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 41889372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 238
Target Start/End: Original strand, 3310211 - 3310379
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||   ||||    
T  3310211 tttttaagtgtctcttttggagattttttttgtttttatttaactgtcacttctaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattactctta 3310310  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaatt 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3310311 gttatttattgcggagagagaaatatatgatataaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaatt 3310379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 6799116 - 6799270
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6799116 catttttaagtgtctgttttggagaaattttttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatcct 6799215  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaat-attaaatgaataag 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  6799216 taattatttattacggagagagaaatatataaaatgatataattaaatgaataag 6799270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 150 - 283
Target Start/End: Original strand, 8381901 - 8382034
Alignment:
Q  150 ttttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattg 249  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||    
T  8381901 ttttattaatattgtccttagttatttattgcggggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattg 8382000  T
Q  250 catcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8382001 catcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttgg 8382034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5732267 - 5732123
Alignment:
Q  124 aaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  5732267 aaagttcaatgcaacattaaatgctgttttaccaatattatccttagttatttatttcggagagagaaatatatgaaatgagattttaaatgaataaggt 5732168  T
Q  224 tattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
     ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5732167 cattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 5732123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35746892 - 35746682
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  35746892 tttttaattgtcacttttggagaaaatttttatttctatttaaatgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattaccctta 35746793  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    | |||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||| || |  | |||| ||||||| ||||| || ||    
T  35746792 gatatttattgc-gaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaaatagtaacattt 35746694  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
     |||||| ||||    
T  35746693 attgattgtctt 35746682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46286093 - 46285922
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||| |||  |||||    
T  46286093 tttttaactgtcacttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaagaataaatattgttttaccaacattaccctta 46285994  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| ||||    
T  46285993 gttatttattgcgtagagagaaatatatgaaataaaatattaaattactaaggctaatatagtaaaagtata 46285922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44820816 - 44820678
Alignment:
Q  99 ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatg 198  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44820816 ttgtttctatttaactgttatttttaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacatttagttatttatttcggagagaaaaatatatg 44820717  T
Q  199 aaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44820716 aaataaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaat 44820678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 223
Target Start/End: Original strand, 42880962 - 42881115
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  42880962 tttttaagtgttttttttggagaaaatttttgtttctatttaactatcactttttaaggtcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttg 42881061  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggt 223  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||    
T  42881062 gttattgattgcggagagagaaatatataaaattagatgttaaatgaataaggt 42881115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37354107 - 37353912
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||           || ||||| ||||||| ||||||    
T  37354107 tttttaagtgtctcttttgaagaaattatttgatcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgc-----------ttgttttaccaatattatcctta 37354019  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||| |||||    
T  37354018 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatgtaacttattgcatcagaagtagtaacaatt 37353919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31815314 - 31815123
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||    
T  31815314 tttttaactgtcatttttggagaaaattt--gtttctatttaactgttactttcaaaattcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattaccctta 31815217  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||| |||||| || |  | |||| |||||||||||||    
T  31815216 gatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagaccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagta 31815123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 1553510 - 1553674
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  1553510 tttttaatcgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 1553609  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
     |||||||||||  |||||||||| |||||| | |   |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1553610 cttatttattac--agagagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaa 1553674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43874330 - 43874165
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||    
T  43874330 tttttaagtgtcacttttagagaatttttttgttcctatttaactgtcactttcgaaattcaatgcaacattaaatgttattttgccaatattatcatta 43874231  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
     ||||||||| | || | ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  43874230 cttatttattgcagata-agaaatacatgaaattagatattcaatgaataaggttattatagtaaaa 43874165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18194462 - 18194249
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  18194462 tttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactatcattttcaaatttcaatgcaaaattaaatgttgttttaccaacattaccctta 18194363  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  | |    |||| |||||||||||||||| ||    
T  18194362 tatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaagcaaaaacaattgtatcaaaagtagtatcattt 18194263  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  18194262 attgattgtcttgg 18194249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 257
Target Start/End: Original strand, 45324023 - 45324206
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    || |||| | |||||||||||||   ||||    
T  45324023 ttttcaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgttactttcaaagttcaatgc----ttgaatgatgttttatcaatattactctta 45324118  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaa 257  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  | |||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  45324119 attatttattgcggagagagaaatatataaaataagatattaaataaataaaatcattataataaaagtataacttattgcatcaaaa 45324206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 3177925 - 3178118
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |  ||||  ||||     
T  3177925 tttttaattgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgccgttattacccttg 3178024  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||| | ||||  |||  || ||| |||||||||||||    
T  3178025 gttatttattgcagagagagaaatatatgaaaagatatattaaatgacgaaggttattatagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta 3178118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 47459639 - 47459809
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttat-caatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||| |||||    
T  47459639 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatatttttttttccaatattatcctt 47459738  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
      | |||||||  |  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  47459739 gctcatttatt--gtggagagaaatatatcaaatgaaatattaaataaataaggttattatagtaaaaatata 47459809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38168968 - 38168844
Alignment:
Q  139 attaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaatt 238  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||  ||||| |    
T  38168968 attaagtgttgttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagt 38168869  T
Q  239 atagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||    
T  38168868 ataacttattgcatcaaaaatagta 38168844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8966148 - 8965989
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |  ||||  ||||     
T  8966148 tttttaattgtcacttttgcataaaaattttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacattgttttacctttattacccttg 8966049  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  8966048 attatttattgtagagagagaaatacatgaaataagatattaaatgatgaaggttattat 8965989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 28608590 - 28608801
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  28608590 tttttaaatgtctcttttgtagaatttttttgttcttatttaagtgtcctttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattaccctta 28608689  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||| |||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||||| | || ||    
T  28608690 tttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgatatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagcaacattt 28608788  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
     |||||| |||||    
T  28608789 attgattgtcttg 28608801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17354238 - 17354115
Alignment:
Q  106 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||| ||| |||| || | ||||||| ||||||||| ||    
T  17354238 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacgaatattacccttagatatatattgcgaaaagagaaacatatgaaatgaa 17354139  T
Q  206 atattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||||||||| |||||||| |||||    
T  17354138 atattaaattaataaggtcattat 17354115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46563371 - 46563212
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||  || ||||  ||||     
T  46563371 tttttaattgtcacttttgcagaaattttttgtttataattaactgtcactttcaaagttcagtacaacattaaatattgttttgacattattacccttg 46563272  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  46563271 attatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattat 46563212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22382322 - 22382156
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtt--tctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    |||||||  |||||||||  ||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||    
T  22382322 tttttaaccgtcacttttagagaaaaaatttgttcctctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttaccaatattatcct 22382223  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  22382222 tagatatttatt--gcagagagaaacatatgaattgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaa 22382156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22057620 - 22057447
Alignment:
Q  114 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattac------ggagagagaaatatatgaaataaaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| || ||    
T  22057620 tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttagcaatattacccttagttatttattacagagagagagagagaaatatatgaaacaagat 22057521  T
Q  208 attaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttctt 281  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | ||||| | |  |||||| |||||||||| || || || |||||| ||||    
T  22057520 attaaatgaatgaggctattattgaaaaatgacaaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtctt 22057447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48981628 - 48981434
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtca-ctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  |  ||||  ||||    
T  48981628 tttttaattgtcacttttgcagaatttttttgtttctaattacctgtcaactttcaaagttcaatataacattaaatgttgttttgcctttattaccctt 48981529  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||| | ||||   |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||  |||  || ||| |||||||||||||    
T  48981528 agttatttattgcagagatgaaaatatatgaaaaaaaatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta 48981434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9602115 - 9601982
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  9602115 tttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatat 9602016  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    | ||||||  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  9602015 aagaaatatgatattaaataattaaggatattat 9601982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9829686 - 9829553
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  9829686 tttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatat 9829587  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    | ||||||  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  9829586 aagaaatatgatattaaataattaaggatattat 9829553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36339447 - 36339303
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaa--atgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  || || ||||| |||||||  |||    
T  36339447 tttttaagtgtctcttttgtagaaaagttttgtttttatttaagtgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatatatttttttaccaatattaccct 36339348  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaa 212  Q
    |  ||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  36339347 tgattattaattatggagagagaaatatatgaaacaagatattaa 36339303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2408909 - 2408818
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatatt 162  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2408909 tttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt-gtttatcaatatt 2408818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 236
Target Start/End: Original strand, 24283605 - 24283741
Alignment:
Q  98 tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatat 197  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||||| ||  |||||||| ||||    
T  24283605 tttgttcctatttacctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttagatatttattgcg--gagagaaacatat 24283702  T
Q  198 gaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
     || | ||||||||||| || || || ||||| ||||||    
T  24283703 aaattgaaatattaaattaacaaagtcattatagtaaaa 24283741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34368871 - 34368754
Alignment:
Q  106 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  | ||   |||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||    
T  34368871 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattacctttgaatatttattgcgaagagaaaaacatatgaaatgaa 34368772  T
Q  206 atattaaatgaataaggt 223  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  34368771 atattaaattaataaggt 34368754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8380745 - 8380674
Alignment:
Q  165 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8380745 ccttagttatttattacggggagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaa 8380674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30586916 - 30586765
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||| ||| ||| ||||| |||  || |||||||||||  |||||| |||||  |||||| ||||||    
T  30586916 tgtcacttttgcataaattttttgtttccaattaactttcatttttaaagtccaacacatcattaaatgttgatttatctatattacccttagatattta 30586817  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     | | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  30586816 ctgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgattaaggttattat 30586765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46715522 - 46715391
Alignment:
Q  98 tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatat 197  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  46715522 tttgtttccaattaactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttatctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatat 46715423  T
Q  198 gaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  46715422 ggaataaaatattaaattattaaggttattat 46715391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 201
Target Start/End: Original strand, 33071909 - 33072032
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  | |||  | ||||| | |||||    
T  33071909 tgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataacgcccttaataattta 33072008  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaa 201  Q
    || | |||||||||||||||||||    
T  33072009 ttgcagagagagaaatatatgaaa 33072032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Original strand, 47408227 - 47408301
Alignment:
Q  189 gaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  47408227 gaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagta 47408301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19328034 - 19327878
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||  ||||| |||   |||||||| |||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||    
T  19328034 tttttaagtgtcttttttggagattttttttgttcctatttaaatgtcattttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattactctt 19327935  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttat 226  Q
    | ||| ||| |  |||| |||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  19327934 attta-ttactgtggagggagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttat 19327878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13431379 - 13431308
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacatt 141  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13431379 tttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacatt 13431308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26803678 - 26803519
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||  |||||||||| ||||  ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||  |  ||||  ||||     
T  26803678 tttttaatagtcacttttgcagaatttttttgtttttaattaactgtcgcttttaaagttcaatacaacattaaatattgttttccccttattacccttg 26803579  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     ||||||||    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  26803578 attatttatcgtagagagagaaatatataaaatgagatattaaatgatgaaggttattat 26803519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 262
Target Start/End: Original strand, 35859995 - 35860152
Alignment:
Q  103 ttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaat 202  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  | |||  | ||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  35859995 ttctaattaagtgtcattttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataacgcccttagtaatttatt--gcagagagaaatataagaaat 35860092  T
Q  203 aaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    |  ||||||||| | ||||  |||||| | ||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  35860093 atgatattaaataattaagaatattatagaaaaaccataagttattgcatcaaaagtagt 35860152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 115
Target Start/End: Original strand, 47408133 - 47408178
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactg 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  47408133 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactg 47408178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41409810 - 41409766
Alignment:
Q  118 actttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatatt 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  41409810 actttcaaagttcaacgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 41409766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16662347 - 16662282
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaa 143  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  | |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16662347 tgtcacttttgaagaataattttgttttaaattacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaa 16662282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17636707 - 17636642
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaa 143  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  | |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17636707 tgtcacttttgaagaataattttgttttaaattacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaa 17636642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 162
Target Start/End: Original strand, 24233145 - 24233237
Alignment:
Q  69 atttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatatt 162  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||  || |||  ||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  24233145 atttgtaagtgtctctttt-aataaattttttgtttctatttaactagcatttttgaagtttaatgcaacattacaagttgttttaccaatatt 24233237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 46392685 - 46392612
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaa 143  Q
    ||||||| | || |||||| |||| | ||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  46392685 tttttaattttcgcttttgtagaacaattttgttcctatttatttgtcgttttcaaagttcaatgcaacattaa 46392612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 128
Target Start/End: Original strand, 8921067 - 8921099
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagt 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8921067 tttttgtttctaattaactgtcactttcaaagt 8921099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27235481 - 27235437
Alignment:
Q  109 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  27235481 ttaactgtcactttcaaagttcaataaaacattagatgttgtttt 27235437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 152)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3436313 - 3436100
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  3436313 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 3436214  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3436213 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtattaatt 3436114  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  3436113 gttgattgtcttgg 3436100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13629439 - 13629226
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13629439 tttttaagtgtcacttttgtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 13629340  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13629339 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatgaaaaatagtatcaatt 13629240  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  13629239 gttgattgtcttgg 13629226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 44069029 - 44069242
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  44069029 tttttaagtgtcacttttgtagaaaaattttgttcctatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgttctta 44069128  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44069129 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 44069228  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  44069229 gttgattgtcttgg 44069242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 46871919 - 46872132
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46871919 tttttaagtgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 46872018  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46872019 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 46872118  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  46872119 gttgattgtcttgg 46872132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16465028 - 16464822
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16465028 tttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 16464929  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16464928 gttatttagtgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaatt 16464829  T
Q  270 gttgatt 276  Q
    |||||||    
T  16464828 gttgatt 16464822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 44217704 - 44217917
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  44217704 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 44217803  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44217804 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaagaaggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 44217903  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  44217904 gttgattgtcttgg 44217917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 16664239 - 16664451
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16664239 tttttaagtgtcacttttggagaaatattttgtccctatttaacggtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccagtattgtcctta 16664338  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16664339 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 16664438  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  16664439 gttgattgtcttg 16664451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38617553 - 38617347
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38617553 tttttaagtgtcacttttggagaaatattttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 38617454  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38617453 gttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 38617354  T
Q  270 gttgatt 276  Q
    |||||||    
T  38617353 gttgatt 38617347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39683960 - 39683747
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39683960 tttttaagtgtcatttttgtagaaaaattttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttatcaatattgtcctta 39683861  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39683860 gttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcgttatactaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 39683761  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  39683760 gttgattgtcttgg 39683747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 48782198 - 48782410
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48782198 tttttaagtgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 48782297  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48782298 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-agatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtattgcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 48782396  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  48782397 gttgattatcttgg 48782410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21044993 - 21044780
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||    
T  21044993 tttttaagtgtcactttttgagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcttta 21044894  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21044893 gttatttattgcggagagagaaatatatgcaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaatt 21044794  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  21044793 gttgattgtcttgg 21044780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5374596 - 5374384
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  5374596 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcttgtttaactgtcactttcaaagctcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 5374497  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5374496 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 5374397  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  5374396 gttgattgtcttg 5374384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 35231688 - 35231899
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35231688 tttttaagtatcatttttggagaaaaattttatttttatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 35231787  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35231788 attatttattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt 35231887  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
    ||||||| ||||    
T  35231888 gttgattgtctt 35231899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 29295352 - 29295565
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  29295352 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtgactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 29295451  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29295452 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtataacttattgcatcgaaagtagtatcaatt 29295551  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  29295552 attgattgtcttgg 29295565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53600032 - 53599819
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  53600032 tttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 53599933  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  53599932 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatatcaatt 53599833  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  53599832 gttgattgtcttgg 53599819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42513272 - 42513060
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  42513272 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttactatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 42513173  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42513172 gttatttattgcggagagagaaatatataaaatgtgatattaaatgaataaggtcatgatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtattaatt 42513073  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  42513072 gttgattgtcttg 42513060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 56576349 - 56576137
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  56576349 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 56576250  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56576249 gttatttattgtggagagaaaaatatatgaaat-ggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaggtagtatcaatt 56576151  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  56576150 gttgattatcttgg 56576137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19093399 - 19093186
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  19093399 tttttaagtgtctcttttaaagaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 19093300  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19093299 gttatttattgcggagagaggaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatt 19093200  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||| | ||||||    
T  19093199 attgactatcttgg 19093186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35232543 - 35232331
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  35232543 tttttaagtgtca-ttttggagaaaattttggttcctatttaactatcacgttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 35232445  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35232444 cttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatcaaaagcagtatcaatt 35232345  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  35232344 gttgattgtcttgg 35232331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 78 - 283
Target Start/End: Original strand, 39671331 - 39671536
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39671331 tgtcacttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattgtccttaattattta 39671430  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattt 277  Q
    || | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  39671431 ttgcagagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattg 39671530  T
Q  278 tcttgg 283  Q
    ||||||    
T  39671531 tcttgg 39671536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Original strand, 353963 - 354162
Alignment:
Q  69 atttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  353963 atttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcctt 354062  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  354063 agttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaaatagtaacaat 354162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 283
Target Start/End: Original strand, 8735386 - 8735600
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| | ||    
T  8735386 catttttaagtgtcattttaga-gaaaaattttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatattgttttaccaatattattct 8735484  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8735485 tagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 8735584  T
Q  268 ttgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||||| ||||||    
T  8735585 ttgttgattgtcttgg 8735600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26620597 - 26620394
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  26620597 tttttaagtgtcacatttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 26620498  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26620497 gttatttattgcggataaataaatatatgaaatgagatattaaattaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 26620398  T
Q  270 gttg 273  Q
    ||||    
T  26620397 gttg 26620394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Original strand, 34464275 - 34464481
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  34464275 tttttaagtgtcatttttgaagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcatagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattatcatta 34464374  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34464375 gttatttattgtgaagagataaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaatt 34464474  T
Q  270 gttgatt 276  Q
     ||||||    
T  34464475 attgatt 34464481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 36408721 - 36408934
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||    
T  36408721 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaattgtaattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaacaatattctcttta 36408820  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36408821 gttatttatagcggagagagaaatatatgaaatgagatattgaattaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaaat 36408920  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||| ||| ||||||    
T  36408921 gtttattgtcttgg 36408934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 36422887 - 36423100
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||    
T  36422887 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaattgtaattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaacaatattctcttta 36422986  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36422987 gttatttatagcggagagagaaatatatgaaatgagatattgaattaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaaat 36423086  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||| ||| ||||||    
T  36423087 gtttattgtcttgg 36423100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 42099706 - 42099919
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||    
T  42099706 tttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatggtgttttatcaatattaccctta 42099805  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  42099806 attatttattgcggaaagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatt 42099905  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  42099906 attgattgtcttgg 42099919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44014159 - 44013946
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  44014159 tttttatgtgtcatttttggagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 44014060  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  44014059 gttatttattgtggagagataaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtttcaatt 44013960  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  44013959 gttgattgtcttgg 44013946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 50623412 - 50623624
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  50623412 tttttaagtgtcactttaggagaaaaaatttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 50623511  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50623512 attatttattgcggagagataaatatatgaaatgagata-taaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtatcaatt 50623610  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  50623611 tttgattgtcttgg 50623624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19527454 - 19527253
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  19527454 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 19527355  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19527354 gttatttattgtggagagagaaatatatg------------aaatgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgtatcaaaagtagtatcaatt 19527267  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  19527266 gttgattatcttgg 19527253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 12252098 - 12252302
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  12252098 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 12252197  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12252198 gttatttat--------atgaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtattatcaatt 12252289  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  12252290 gttgattgtcttg 12252302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 31862232 - 31862021
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  31862232 tttttaagtgtctcttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 31862133  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  31862132 tttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgatatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataattttttgcatcaaaagtagtaacaatt 31862033  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
     |||||| ||||    
T  31862032 attgattatctt 31862021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 37502019 - 37502233
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagt-tcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  37502019 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagggtcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattaccctt 37502118  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||| || |    
T  37502119 agttatttattatggagagataaatatatgaaatgtaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagtagtaacatt 37502218  T
Q  269 tgttgattttcttgg 283  Q
    | |||||| ||||||    
T  37502219 tattgattgtcttgg 37502233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22828647 - 22828434
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||    
T  22828647 tttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattacatgatgttttatcaatattaccctta 22828548  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22828547 attatttattgcagatagagaaatatatgaaataatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagcaatt 22828448  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     ||| || ||||||    
T  22828447 attggttgtcttgg 22828434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53125484 - 53125271
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||    
T  53125484 tttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactttcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattaccctta 53125385  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  53125384 attatttattgcggagaaagaaatgtatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcataaaaaatagtaacaatt 53125285  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  53125284 attgattatcttgg 53125271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 55147307 - 55147094
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  55147307 tttttaagtgtcttttttggagaaattttttgttttcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 55147208  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  55147207 cttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattacagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaataacaatt 55147108  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     || ||| ||||||    
T  55147107 attaattgtcttgg 55147094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22678556 - 22678342
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttg--aagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  || |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  22678556 tttttaagtgtcacttttggaaagaaaaaatt-gttcttatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatcct 22678458  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22678457 tagtaatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaatagtagtatcaa 22678358  T
Q  268 ttgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||||| ||||||    
T  22678357 ttgttgattatcttgg 22678342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8741870 - 8741668
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||    
T  8741870 tttttaagtgtcaattttgaagaaaaatttggttcatatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatcttta 8741771  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8741770 gttatttattgtggagagtgaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaatt 8741671  T
Q  270 gtt 272  Q
    |||    
T  8741670 gtt 8741668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Original strand, 33084476 - 33084682
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||    
T  33084476 tttttaagtgtctcttttgaagaaactttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatcttta 33084575  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33084576 gttatttgttgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatt 33084675  T
Q  270 gttgatt 276  Q
     ||||||    
T  33084676 attgatt 33084682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Original strand, 47251411 - 47251609
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  47251411 tttttaactgtctcttttgaagaaattttttgtttctattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattattctta 47251510  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47251511 gctatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 47251609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52677391 - 52677225
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  52677391 tttttaagtgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 52677292  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  52677291 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa 52677225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4201564 - 4201377
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  4201564 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaattcaacattaaatgttgttttactaatattatcctta 4201465  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaa 257  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||| ||||    
T  4201464 attatttattgcggagagataaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcataaaaa 4201377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 257
Target Start/End: Original strand, 47428531 - 47428714
Alignment:
Q  74 taagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtta 173  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47428531 taagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtta 47428630  T
Q  174 tttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaa 257  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||    
T  47428631 tttattgcggagaaataaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtattacttattgcatcaaaa 47428714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Original strand, 6195025 - 6195235
Alignment:
Q  73 ttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtt 172  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  6195025 ttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacattcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagtt 6195124  T
Q  173 atttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgtt 272  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| | || |||||| || ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  6195125 atttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaataaacaaggtcatcatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagcaattatg 6195224  T
Q  273 gattttcttgg 283  Q
    |||| ||||||    
T  6195225 gattgtcttgg 6195235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 112 - 276
Target Start/End: Original strand, 23237667 - 23237834
Alignment:
Q  112 actgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagag---agaaatatatgaaataaaata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||   | ||||||||||||| | |||    
T  23237667 actgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagattataaatatatgaaatgagata 23237766  T
Q  209 ttaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgatt 276  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23237767 ttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatcgcatcaaaagtagtatcaattgttgatt 23237834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 67 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 52057702 - 52057504
Alignment:
Q  67 ccatttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttct--atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  52057702 ccatttttaagtgtcacttttgaagaatttttttttttttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttattttatcaatattat 52057603  T
Q  165 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||    ||||| |||||||||||||    
T  52057602 ccttagttatttattgtggagagagaaatatataaaatgaaatattaaataaataagattattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagta 52057504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 223
Target Start/End: Original strand, 27492357 - 27492511
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||    
T  27492357 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatgctta 27492456  T
Q  170 gt-tatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggt 223  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27492457 gtcaatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggt 27492511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 32239398 - 32239606
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  32239398 tttttaaatgtcacttttggagaaaaattttgttcatatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 32239497  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |   | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32239498 gttatttattgtggagaaagaaatatatgaaat-gaatattaaatgaataaag---tcatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 32239593  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||| ||| |||||    
T  32239594 gttaattgtcttg 32239606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Original strand, 47093810 - 47094016
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||     
T  47093810 tttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcatcattatatgttgttttaccaatattatccttt 47093909  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||| | || |||||| |||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  47093910 gttatttattgcgaagagagaaatatataaaatgatatgttaaattaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaacaatt 47094009  T
Q  270 gttgatt 276  Q
     ||||||    
T  47094010 attgatt 47094016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 269
Target Start/End: Original strand, 40411941 - 40412140
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  40411941 tttttaagtgtctcttttggaaaaaaaaattgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatattgttttatcaatattatcctta 40412040  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  40412041 attatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattacatcaaaaatagtaacaatt 40412140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 55702918 - 55703131
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||  || ||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||    
T  55702918 tttttaagcatctcttttgaagattttttttgtttttatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgataatttattaatattaccctta 55703017  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  55703018 attatttattgcagagagagaaatatatgaaataagataataaatgaataaggtcgttatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtaataacaatt 55703117  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  55703118 attgattgtcttgg 55703131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26906613 - 26906429
Alignment:
Q  92 aaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaa 191  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||  |||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  26906613 aaaaattttgtttttatttaactgtcactttcaaggttcaatgcaacattaaatattgttttactaatattattcttagttatttattgcggagagagaa 26906514  T
Q  192 atatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgatt 276  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26906513 atatatgaaatgagatattaaattaataaggtcattaaagtaaaagtataacttattgcataaaaagtaatatcaattgttgatt 26906429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Original strand, 9834262 - 9834413
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  9834262 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatcttattttacatatattgtcctta 9834361  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataag 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  9834362 gttatttattgcggagagagaaatatattaaatgagatattaaatgaataag 9834413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 55935105 - 55935271
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  55935105 tttttaagtgttatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 55935204  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  55935205 gttatttattatggagagagaaatacatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaa 55935271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23720030 - 23719837
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||     
T  23720030 tttttaagtgtcacttttagagaaattttttgttcctgtttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttg 23719931  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     | |||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  23719930 ctcatttattgtggagaaagaaatatatgaaaagaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagta 23719837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35381660 - 35381502
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  35381660 tttttatgtgtctcttttgaagatt-tttttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatcctta 35381562  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  35381561 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattat 35381502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38542508 - 38542309
Alignment:
Q  84 ttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacgg 183  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||     
T  38542508 ttttggagaaaaattttgttcctatttaaatgtcactttcaaaattcagtgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcga 38542409  T
Q  184 agagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| | ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  38542408 agagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataagttcattatagtaaaagtctaacttattgcatcaaaagtagtaacaattattaattgtcttgg 38542309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 30939153 - 30939319
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||     
T  30939153 tttttaattgtcacttttagagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttg 30939252  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  30939253 gatatttattgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 30939319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 41415006 - 41415171
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  41415006 tttttaagtgtcatttttgaagaaa-tttttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 41415104  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  41415105 gctatttattatggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaa 41415171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 71 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 52258036 - 52257866
Alignment:
Q  71 ttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttag 170  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| || ||||    
T  52258036 ttttaagtgtcattttttgagaaattttttatttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattatctttag 52257937  T
Q  171 ttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  52257936 ttatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtata 52257866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 44549641 - 44549834
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  44549641 tttttaagtatcttttttggagaaattttttgttattatttaactgtcgctttcaaagtttaatgcaacattaaatgctgttttatcaatattattctta 44549740  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  44549741 gttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgtatcaaaagtagta 44549834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23623741 - 23623609
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23623741 tttttaagtgtcactttttgagaaaatttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 23623642  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaat 202  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23623641 agtatttattgcggagagagaaatatatgaaat 23623609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 18781477 - 18781688
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||| |||||||||  | |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| || |||    
T  18781477 tttttaagtctcacttttgttggattttttttcttcaatttaactgtcactttcaaatttcaatgcaatattaaatattcttttaccaatattatcttta 18781576  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||||    
T  18781577 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaattgaataaggtaattataataaaagtatatcttattgcatcaaaagtaataataatt 18781676  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
     |||||| ||||    
T  18781677 attgattatctt 18781688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47596859 - 47596666
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | | || |||||||||||||   ||||    
T  47596859 tttttaagtgtctcttttgtagaaaatttttgtttctatttaattgtcattttcaaagttcaatgcaatattgagtattgttttatcaatattactctta 47596760  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     |||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||  |||  |||||| |||||||||||||    
T  47596759 attatttattacggagacagaaataattgaaacaatatattaaatgaataaggttattattggaaaaggataatttattgtatcaaaagtagta 47596666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Original strand, 36750175 - 36750326
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||   ||||    
T  36750175 tttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatacaatattaaatgttgttttaccaatattaatctta 36750274  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataag 221  Q
     |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36750275 cttatttattgtggagagacaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataag 36750326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 263
Target Start/End: Original strand, 45725536 - 45725727
Alignment:
Q  72 tttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagt 171  Q
    |||||||||| |||||| | ||||   |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  45725536 tttaagtgtctcttttgtaaaaaaaaattgtttctatttaattgtcatttttaaagttcaatgcaatattaaatattattttatcaatattatccttaat 45725635  T
Q  172 tatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  45725636 tatttattacagagagagaaataattgaaacaagatattaaatgaatgaggttattattggaaaatgataatttattgtatcaaaagtagta 45725727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 282
Target Start/End: Original strand, 54231574 - 54231749
Alignment:
Q  108 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaca-ttaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaa 206  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | |    
T  54231574 tttaactgtcatttttaaagttcaattcaacaattaaatgttattttactaatattatccttagttatttattatggaaagagaaatatattaaatgaga 54231673  T
Q  207 tattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  54231674 tgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttg 54231749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26934017 - 26933812
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||| || | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  26934017 tttttaagcgttatttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 26933918  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||   ||||||  |||||||||||| || ||    
T  26933917 gttatttatcgcagagagagaaatatatgaaatgaaatattaaa-gaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtgtcaaaagtagtaacattt 26933819  T
Q  270 gttgatt 276  Q
     ||||||    
T  26933818 attgatt 26933812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 52061561 - 52061768
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| ||||||||||   |||||  || ||||||| | |||||||||||||     ||||||||||||| | |||||||||||||  |||||    
T  52061561 tttttaagtgtctcttttgaagatttttttttgttttatttaattatcactttcaaagt-----gcaacattaaatgatgttttatcaatattaccctta 52061655  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  52061656 attatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatg 52061755  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
     |||||| |||||    
T  52061756 attgattgtcttg 52061768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53691900 - 53691687
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  53691900 tttttaattgtcacttttagagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatacatcattaaatgttgttttatcaatattaccctta 53691801  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa-ttatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
      ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | ||| |  |||| |||||||||||||||| |    
T  53691800 aatatttattgtggaaagagaaacatatgaaataaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataac-aattgtatcaaaagtagtatcatt 53691702  T
Q  269 tgttgattttcttgg 283  Q
    | |||||| ||||||    
T  53691701 tattgattgtcttgg 53691687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 222
Target Start/End: Original strand, 33809085 - 33809237
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||||  || ||    
T  33809085 tttttaattgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcacattcaaagtttaatgcaatagtaaatgttgttttaccaatattaccccta 33809184  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataagg 222  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33809185 gatatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaataagg 33809237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 283
Target Start/End: Original strand, 42629313 - 42629528
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||    
T  42629313 catttataattgtcatttttagagaaattttttatttcaatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaattttgttttatcaatattaccct 42629412  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    || ||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||| || ||||  ||| || | ||||||||||| ||     
T  42629413 taattatttaatgcggagagagaaatttatgaaacaaaatattaaatgaaaaaggctattttagtacaagtataaattactgtaccaaaagtagtaacat 42629512  T
Q  268 ttgttgattttcttgg 283  Q
    || |||||| ||||||    
T  42629513 ttattgattgtcttgg 42629528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 236
Target Start/End: Original strand, 30151696 - 30151836
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  30151696 tttttgttcttatttaactgtcattttcgaagttcaacgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttacttatttattgcgcatagagaaatat 30151795  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  30151796 atgaaattaaatattgaatgaataaggctattatagtaaaa 30151836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36659653 - 36659461
Alignment:
Q  90 agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagag 189  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  36659653 agaaattttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttattaatattattcttagttatttattgcggagagag 36659554  T
Q  190 aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    ||||||||||||| | || ||| || || || || ||||| ||||||  ||| |||||||||| |||| ||  | ||||| |||||| |||||    
T  36659553 aaatatatgaaatgagatgttagataaacaatgtcattatagtaaaagcataacttattgcattaaaaataaaaacaattattgattgtcttg 36659461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33755201 - 33755066
Alignment:
Q  144 atgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagc 243  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  33755201 atgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagc 33755104  T
Q  244 ttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttctt 281  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33755103 ttattgcattaaaaggagtatcaattgttgattgtctt 33755066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 42133035 - 42133200
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||  |||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  42133035 tttttaatcgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttatcaatattatcctta 42133134  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||  | |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  42133135 gatatttattgcggagtgagaaacatatgatgtgaaat-ttaaatcaataaggctattatagtaaaa 42133200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47885242 - 47885043
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaa--------agttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatat 161  Q
    |||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  47885242 tttttaagtgtctcttatggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaagttcaataagtttaatgcaacattaaatgatgttttatcaatat 47885143  T
Q  162 tgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatg-aataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagta 260  Q
    |  ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  47885142 tacccttaattatttattggagagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaaataaggtcattatagtaaaagtcaaacttattgcatcaaaagta 47885043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29833174 - 29833001
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| || || |    
T  29833174 catttttaagtgtctcttttggagaaatttcttgttcctatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatgttatcgt 29833075  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  | ||||| |||||| ||||    
T  29833074 tggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgctaaatgaataaaatcattatagtaaaagtata 29833001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33755328 - 33755223
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  33755328 tttttaagtgtcacttttagagaaaatttttatttctctttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 33755229  T
Q  170 gttatt 175  Q
    ||||||    
T  33755228 gttatt 33755223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 34603630 - 34603781
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |  ||||||| |||||    
T  34603630 tgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatacccttagtaattta 34603729  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    || | |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  34603730 ttgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattat 34603781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 43887981 - 43888146
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||  |||||    
T  43887981 tttttaattgtcacttttagataaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatacatcattaa-tgttgttttatcaatattaccctta 43888079  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  43888080 gatatttattgcggatagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaa 43888146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Original strand, 34361054 - 34361204
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| | |||||  |||||    
T  34361054 tttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatg---ttttaccgatattaccctta 34361150  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaat--aaaatattaaatgaataag 221  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  34361151 gatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaaaatattaaattaataag 34361204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 36750547 - 36750706
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||| | ||||| | ||||   |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  36750547 tttttaagtgttatttttggaaaaaaaaattgttcttatttaactgtcacttacaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 36750646  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  36750647 attatttattgcggagagagaaatatataaaataatatattaaatgattaaggctattat 36750706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41955883 - 41955776
Alignment:
Q  107 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaa 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||    
T  41955883 atttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatataattttatcaatattatccttagatatttattgcagagagagaaaaatatgaaatgaaa 41955784  T
Q  207 tattaaat 214  Q
    ||||||||    
T  41955783 tattaaat 41955776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37551911 - 37551765
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |  ||||  ||||     
T  37551911 tttttaattgtcacttttgtagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttgtgcctttattacccttg 37551812  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatga 216  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37551811 gttatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaatga 37551765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 229
Target Start/End: Original strand, 14090236 - 14090397
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |  |||    
T  14090236 catttataactgtcacttttatagaaattttttgtttataattaactgttactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataataccct 14090335  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  14090336 tagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattat 14090397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9220287 - 9220143
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  |||||    
T  9220287 tttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttaccaatattaccctta 9220188  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaat 214  Q
    | |||||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  9220187 gatatttattgcagagagagaaacatatgaattgaaatattaaat 9220143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 262
Target Start/End: Original strand, 18091248 - 18091432
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |  | ||| || ||||||| |||||    
T  18091248 tgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttcttcctataatgcccttagtaattta 18091347  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    || | |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||  | |||  |||  |||||||||||||||||||    
T  18091348 ttgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataattaaaacataagttattgcatcaaaagtagt 18091432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 3802158 - 3802317
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  ||||  ||||     
T  3802158 tttttaattgtcatttttgcataaattttttgtttctaattaaccgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatattgttttacctttattacccttg 3802257  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3802258 attatttattgtagagagagaagtatatgaaataaaatattaaatgatgaaggttattat 3802317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 19399569 - 19399690
Alignment:
Q  107 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19399569 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaataataaa-gttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaga 19399667  T
Q  207 tattaaatgaataaggttattat 229  Q
    |||||||| | ||||| ||||||    
T  19399668 tattaaattactaaggctattat 19399690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 236
Target Start/End: Original strand, 31369835 - 31369965
Alignment:
Q  106 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaa 205  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |     
T  31369835 tatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttag 31369934  T
Q  206 atattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
      ||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  31369935 tgattaaacaaataaggttattatagtaaaa 31369965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 204
Target Start/End: Original strand, 8752160 - 8752272
Alignment:
Q  92 aaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaa 191  Q
    ||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8752160 aaaatatttgttcctatttgattgtcaatttcaaattttaaagcaacattaaatgttattttagcaatattacccttagttatttattaaggagagagaa 8752259  T
Q  192 atatatgaaataa 204  Q
    |||||||||||||    
T  8752260 atatatgaaataa 8752272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18135296 - 18135110
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||  ||  |||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  18135296 tttttaagtgtctcttttgtaaaaaaaattgttttc-atttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattaccctt 18135198  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaa 257  Q
    | ||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||| |||||||    
T  18135197 atttatt-attatagagagagaaatatatgtaatgaaatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaa 18135110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 49122506 - 49122320
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||  ||  |||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  49122506 tttttaagtgtctcttttgtaaaaaaaattgttttc-atttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattaccctt 49122408  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaa 257  Q
    | ||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||| |||||||    
T  49122407 atttatt-attatagagagagaaatatatgtaatgaaatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaa 49122320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44176777 - 44176642
Alignment:
Q  128 ttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttatt 227  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44176777 ttcaatgcaaaattaaattttgttttaccaatattattcttgcttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaagttatt 44176678  T
Q  228 atggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||  ||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  44176677 ataataaaagtatatattattgtatcaaaagtagta 44176642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14949304 - 14949138
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  14949304 tttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatat 14949205  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    | ||||||  ||||||||| | ||||| |||||| |  |||  |||  |||||| ||||||||||||    
T  14949204 aagaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagt 14949138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 56499859 - 56499699
Alignment:
Q  71 ttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttag 170  Q
    |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    |||||  |||||     
T  56499859 ttttaattttcacttttgcagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgtttttcttatattacccttat 56499760  T
Q  171 ttatttattacggagagag--aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||    
T  56499759 ttatttattgcagagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgattagggctattat 56499699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1181148 - 1180988
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaattttt-gtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  || | ||  | ||    
T  1181148 tttttaattgtcacttttgcagaaatttttttgtttctaattacctgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttggcattcttaccttt 1181049  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
      ||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  1181048 gattatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgagaaaggttattat 1180988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 218
Target Start/End: Original strand, 27918600 - 27918747
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||||||  | |||    
T  27918600 tttttaagtatctcttttgtagaaatgttttgtttctatttagctgtcactttcaaagttcaatcaaatattaaatgtt-gtttatcaatattaccatta 27918698  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaat 218  Q
    ||||| |||| |  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  27918699 gttatatattgcaaagagagaaatatatgaaacaagatataaaatgaat 27918747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 229
Target Start/End: Original strand, 54029135 - 54029255
Alignment:
Q  109 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||  |||||||||   |||||| || |||||||||||| |||    
T  54029135 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttacctttattaaccttgattatttattgtagagagataattatatgaaataagata 54029234  T
Q  209 ttaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  54029235 ttaaatgatgaaggttattat 54029255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 218
Target Start/End: Original strand, 3036413 - 3036529
Alignment:
Q  100 tgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatga 199  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| | |||||  ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  3036413 tgtttatatttaattgtcactttcaaagtttaatgtaatattaaatgttattttaccgatattacccttagtaatttatta--tagagagaaatatatga 3036510  T
Q  200 aataaaatattaaatgaat 218  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  3036511 aataagatattaaatgaat 3036529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37394397 - 37394298
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  ||||| |||||||    
T  37394397 tgtcatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttaattattta 37394298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6091553 - 6091428
Alignment:
Q  116 tcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatg 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |  |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6091553 tcactttcaaaattcaatgcaacaataaatattgttttttcaatattatttttagttatttattgtgcagagagaaatatatgaaataagatattaaatg 6091454  T
Q  216 aataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    | ||| | |||||| |||||| ||||    
T  6091453 actaaagctattatagtaaaagtata 6091428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 6150692 - 6150885
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |  ||||  ||||     
T  6150692 tttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttg 6150791  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     |||||||||   ||||||||| || ||||| | | |||||||||||  ||||||||||| | ||||  ||   || |||||||||||||||||    
T  6150792 attatttattgtagagagagaagtaaatgaagtgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagta 6150885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 236
Target Start/End: Original strand, 7242270 - 7242403
Alignment:
Q  103 ttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaat 202  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| | |||| ||||||    
T  7242270 ttctatgtaactgtcgctttcaaagtttaatacaacattaaatattgttttatcaatattatctttagttatttattaatgagagaaatatatgtgaaat 7242369  T
Q  203 aaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
     | ||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  7242370 gagatattaaattaataaggctatcatagtaaaa 7242403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 229
Target Start/End: Original strand, 39308951 - 39309088
Alignment:
Q  92 aaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaa 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||  ||||| | ||||| ||||||  |||||||| | |||||||||    
T  39308951 aaaatttttgtttctaattaactgtaatttttaaagtacaatgtatcattaaatgtagttttacctatattatccttatatatttattgcagagagagaa 39309050  T
Q  192 atatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  39309051 atatatgaaatgaagtattaaattattaaggttattat 39309088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 47751535 - 47751721
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||   |||||||||| ||  |||||    
T  47751535 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtca-tttttaaggtcaatgcaactttaaatg---ttttatcaatgttaccctta 47751630  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||   || ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||||| |||||| |||   |||||| ||||||| |||||    
T  47751631 gttat---ttgcggagagagaaatatctgaaatgagatattaaatgaataaaactattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaaatagta 47751721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Original strand, 51347287 - 51347392
Alignment:
Q  97 ttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatata 196  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||| ||| |||    
T  51347287 ttttgttcctatttatctgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagaaaaacata 51347386  T
Q  197 tgaaat 202  Q
    ||||||    
T  51347387 tgaaat 51347392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 202
Target Start/End: Original strand, 38617814 - 38617946
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  38617814 tttttaattgtcacttttagagaaactatctgttcctatttaattgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattatcctta 38617913  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaat 202  Q
      |||||||| | |||||| ||| |||| ||||    
T  38617914 tatatttattgcagagagaaaaacatattaaat 38617946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 41813640 - 41813800
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatc-aatattgtcctt 168  Q
    ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |   ||||  ||||    
T  41813640 tttttaattgttacttttgcataaaatttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccttttattaccctt 41813739  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
      |||||||||   |||||| || | |||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  41813740 gattatttattgtagagagataagtgtatgaaataatatattaaatgatgaaggttattat 41813800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1146295 - 1146136
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||  ||||     
T  1146295 tttttaattgtcacttttgcagattttttttgtttcttattaactatcactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttgcctttattacccttg 1146196  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||    
T  1146195 attatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgatgaaggtaattat 1146136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 281
Target Start/End: Original strand, 42645379 - 42645470
Alignment:
Q  190 aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttctt 281  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||    
T  42645379 aaatatatgaaataagatattaaatgaataagatcattatggtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaataacaattattgattatctt 42645470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 263
Target Start/End: Original strand, 38865910 - 38866094
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||| | | |||||  |||| | |||||     
T  38865910 tgtcacttttgtataaaaattttgtttctaattcactgtcattttcaaagtccaatacatcattaaatgttgttt-acctatattacccttggatatttg 38866008  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||   |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| | ||||  |||  || |||||||||||||||||    
T  38866009 ttgtagagagagaaatatatgtaatgagatattaaatgattaaggttattatagaaaaaagataaattgttgcatcaaaagtagta 38866094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 17698566 - 17698642
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatg 146  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17698566 ttttttagtgtcgtttttgaagaaattttttgtttctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatg 17698642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 227
Target Start/End: Original strand, 20087203 - 20087331
Alignment:
Q  99 ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatg 198  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||      
T  20087203 ttgttcctatttaactgttacttataaagtttaatgcaatgttaaatgttgttttattaatgttattcttatttatttattgcggagagagaaatataga 20087302  T
Q  199 aaataaaatattaaatgaataaggttatt 227  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  20087303 aaataatatattaaatgagtaagtttatt 20087331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 55430541 - 55430390
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||  ||||| | ||||| ||||||| || |||    
T  55430541 tgtcacttttgcataaaaaatttgtttctaattaactgtcgttttcaaagttcattgtatcattaaatgtggttttacctatattatccttagatactta 55430442  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||  | ||||| ||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||    
T  55430441 ttgtgaagagataaatatatgaaattaagtattaaatgattgaggttattat 55430390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1391388 - 1391258
Alignment:
Q  99 ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatg 198  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  | ||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||| ||    
T  1391388 ttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacactaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaatttattgtagagagagaaatatgtg 1391289  T
Q  199 aaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||| |  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  1391288 aaaaatgatattaaataattaaggatattat 1391258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Original strand, 48087722 - 48087840
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| |  ||||||| ||||||| | |||||| ||||||    
T  48087722 tttttgtttttaattaactctcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatacccttagtaatttattgcagagagaaaaatat 48087821  T
Q  196 atgaaataaaatattaaat 214  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  48087822 atgaaatatgatattaaat 48087840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34925577 - 34925444
Alignment:
Q  81 cacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttatta 180  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||  | | || |||||  |||||||||     
T  34925577 cacttttgcagaaattttttgtttttaattaattgtcactttcaaaattcaatataacattaaatgttgttttaatattgttatccttgattatttattg 34925478  T
Q  181 cggagagagaaatatatgaaataaaatattaaat 214  Q
    | || ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34925477 cagaaagagaaatatatgaaatgagatattaaat 34925444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 221
Target Start/End: Original strand, 36292672 - 36292765
Alignment:
Q  128 ttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataag 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36292672 ttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattacttttagatatttaatgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataag 36292765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8457148 - 8456965
Alignment:
Q  79 gtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttat 178  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | || |    ||| || ||||||| ||||||    
T  8457148 gtcacttttacagaatttttttgtttcttattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaagggtgttcttcttataatgcccttagtaatttat 8457049  T
Q  179 tacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    | | |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||| |  |||  |||  |||||| ||||||||||||    
T  8457048 tgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagt 8456965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 212
Target Start/End: Original strand, 20294282 - 20294424
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||  ||||  || |     
T  20294282 tttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactatcactttcaaagttcaatacaacattaaatcttgttttgtctttattacccgtg 20294381  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaa 212  Q
     |||||||||   || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  20294382 attatttattctagaaagagaaatatatgaaatgagatattaa 20294424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25098423 - 25098341
Alignment:
Q  140 ttaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataagg 222  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25098423 ttaaatgttgttttattaatattacccttgtttatttattacggagagagaaatgtatgaaataagatattaaataaataagg 25098341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30152067 - 30151942
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |  | ||| || ||||| | |||||    
T  30152067 tgtcacttttacataaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttattcctataatgcccttaataattta 30151968  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaata 203  Q
    || | |||| ||||||||||||||||    
T  30151967 ttgcagagatagaaatatatgaaata 30151942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 48510107 - 48509922
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | |||  |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||   |||| | |||||   ||||  ||||||    
T  48510107 tgtcacttttgcataaagattttgtttttaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttacctatattactcttatatattta 48510008  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    || |  ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||| | ||||| |||  || ||| |||||||||||||    
T  48510007 ttgcatagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattaagaatattatagaaaaatgataaatttttgtatcaaaagtagta 48509922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1615260 - 1615108
Alignment:
Q  109 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaata 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||  |  ||||  | ||  |||||||||  | ||||||||||||||||||| | |||    
T  1615260 ttaactgtcactttcaaatttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattaccattgattatttatt--gtagagagaaatatatgaaatgagata 1615163  T
Q  209 ttaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||  ||||||||||| | |||| |||    | |||||||||||||||||    
T  1615162 ttaaatgatgaaggttattataggaaaaatatgaactgttgcatcaaaagtagta 1615108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 145
Target Start/End: Original strand, 37987552 - 37987623
Alignment:
Q  74 taagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaat 145  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37987552 taagtgttatttttgaagaaaaattttgttcctatttaaccgtcatttttaaagttcaatgcaacattaaat 37987623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23621963 - 23621905
Alignment:
Q  205 aatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23621963 aatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagta 23621905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38009986 - 38009868
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  | |||  | ||||||| |||||||   |||||| || |||    
T  38009986 tttttgtttccaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaactttaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattggagagagaaaagtat 38009887  T
Q  196 atgaaataaaatattaaat 214  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  38009886 atgaaatatgatattaaat 38009868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Original strand, 17978104 - 17978199
Alignment:
Q  107 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaata 203  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||    
T  17978104 atttaacattcactttcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagagacacatatgaaata 17978199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27654961 - 27654797
Alignment:
Q  100 tgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac-attaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatg 198  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||  | | ||||| |||||  ||||||||||||||| | ||  || |||||||||    
T  27654961 tgtttctttttaattgtcactttcaaagttcaacacaaatattaaattatgtgttatctatattacccttagttatttattgcagattgataaatatatg 27654862  T
Q  199 aaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||| |||||||||||||  || | |||||| | ||||| |||  || ||| |||||||||||||    
T  27654861 aaatgaaatattaaatgatgaaagctattatagaaaaatgataaattgttgtatcaaaagtagta 27654797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 142
Target Start/End: Original strand, 42645306 - 42645377
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacatta 142  Q
    |||||||| ||| ||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42645306 tttttaagcgtctcttttgaagatttttttt-tctctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacatta 42645377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 229
Target Start/End: Original strand, 43086427 - 43086560
Alignment:
Q  94 aatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaat 193  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  |  ||||  ||||  ||||||| |  | ||||||||||    
T  43086427 aatttttatttttaattaactgtgactttcaaagttcaatataacattaaatgttgtttttcctttattacccttgattatttact--gcagagagaaat 43086524  T
Q  194 atatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  43086525 atatgaaaagaaatattaaatgatgaaggttattat 43086560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19731523 - 19731452
Alignment:
Q  165 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  19731523 ccttagatatttattgcggagagagaaacatttgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 19731452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31984259 - 31984192
Alignment:
Q  209 ttaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgatt 276  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31984259 ttaaatgaataaggtcattacagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgatt 31984192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 51655090 - 51654927
Alignment:
Q  98 tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatat 197  Q
    |||||||| | |||||| ||  ||||||||| ||||| | ||||||||||   |||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  51655090 tttgtttccaattaactctcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggctttatctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatat 51654991  T
Q  198 gaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtag 261  Q
    | ||| || |||||||| | |||||||||||  ||||||  |||  || ||| |||||||||||    
T  51654990 ggaatgaactattaaattattaaggttattacagtaaaaagataaattgttgtatcaaaagtag 51654927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 236
Target Start/End: Original strand, 56486407 - 56486549
Alignment:
Q  94 aatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaat 193  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||  |||||| |||||  | |||  ||||||||    | | ||||||    
T  56486407 aattttttattctaattaattgtcattttcaaagttcaatacatcattaaatgttggtttatctatattacctttaaatatttattgtaaataaagaaat 56486506  T
Q  194 atatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  56486507 atataaaatgaaatattaaatgattaaggttattgtagtaaaa 56486549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 227
Target Start/End: Original strand, 6128972 - 6129120
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||  ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||  |||||||||| |  |||||  ||||||    
T  6128972 tgtcgcttttgaagaataattttgtttcattttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataatacccttatctattta 6129071  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttatt 227  Q
    ||   |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  6129072 ttgtagagagagaaata-atggaatgaaataataaatgattaagggtatt 6129120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7037129 - 7037045
Alignment:
Q  120 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataa 204  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||| |  ||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  7037129 tttcaaagttcaatacaatattaaatattgctttacctgtattgcccttagttatttattatagagaaagaaatatatgaaataa 7037045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19740785 - 19740714
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacatt 141  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||   |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19740785 tttttaattgtcacttttagagaaaacaattgttcttatttaactgtcactatcaaagttcaatgcaacatt 19740714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 31984347 - 31984296
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactt 121  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31984347 tttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactt 31984296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7037289 - 7037159
Alignment:
Q  71 ttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaact-----gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtc 165  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||     | || |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| | |||||| |    
T  7037289 ttttaattgtcacttttgcaggaaaattatgtttctagttaacttagctggcagtttcaaagttcaatacaatattaaatattgttttacctatattgcc 7037190  T
Q  166 cttagttatttattacggagagagaaatata 196  Q
    |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  7037189 cttaattatttattatagagaaagaaatata 7037159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13435306 - 13435248
Alignment:
Q  171 ttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  13435306 ttatttattacagagaaagaaatatatgaaatgagatattaaattaataatgttattat 13435248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 53219233 - 53219136
Alignment:
Q  105 ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaat 202  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||||||    |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  53219233 ctatttaactgttcttttcaaagttcaatgcaacattaattattgatttgtcaataacccccttagctatttattacatagagagaaatagatgaaat 53219136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 53467718 - 53467650
Alignment:
Q  150 ttttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaat 218  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  53467718 ttttatcaataccgtctttaattatttattacatagagagaagtatatgaaatgagatattaaatgaat 53467650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 194
Target Start/End: Original strand, 3588358 - 3588461
Alignment:
Q  91 gaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagaga 190  Q
    |||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| | |||||| | ||||| |||| |||||||   ||||| ||||||||| | ||| ||||    
T  3588358 gaaagtttttgtttctatctatttgtcattttcaaagttcatttcaacatcacatgttgttttgtcaatatcacccttaattatttattgcagagcgaga 3588457  T
Q  191 aata 194  Q
    ||||    
T  3588458 aata 3588461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Original strand, 24948641 - 24948720
Alignment:
Q  97 ttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattt 176  Q
    |||||||  ||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  24948641 ttttgttcatatttagttgtcatttttaaagttcaatgaaacattaattgttattttgtcaataatacccttagttattt 24948720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52978371 - 52978313
Alignment:
Q  171 ttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  52978371 ttatttattgtgtagagagaaatatatgaaaagagatattaaatgaataaggctattat 52978313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1615308 - 1615268
Alignment:
Q  113 ctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  1615308 ctgtcactttcaaatttcaatacaacattaaatgttgtttt 1615268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7627699 - 7627667
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagt 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7627699 tttttgtttctaattaactgtcactttcaaagt 7627667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19692957 - 19692826
Alignment:
Q  97 ttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatata 196  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||  ||||||||||    ||||| |||||||||   |||||||||||| |    
T  19692957 ttttgtttcactttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataacacccttacttatttattgtagagagagaaata-a 19692859  T
Q  197 tgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    |  ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  19692858 tagaatgaaataataaatgagtaaggatattat 19692826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19703542 - 19703411
Alignment:
Q  97 ttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatata 196  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||  ||||||||||    ||||| |||||||||   |||||||||||| |    
T  19703542 ttttgtttcactttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataacacccttacttatttattgtagagagagaaata-a 19703444  T
Q  197 tgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    |  ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  19703443 tagaatgaaataataaatgagtaaggatattat 19703411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 80)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 479221 - 479008
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  479221 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatcctta 479122  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  479121 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 479022  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  479021 attgattatcttgg 479008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14296005 - 14295792
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14296005 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 14295906  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14295905 gttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataccttattgcatcaaaagtagtatcaatt 14295806  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  14295805 gttgattgtcttgg 14295792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 26342575 - 26342788
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26342575 tttttaagtgtcacttttggagaaatttttggttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 26342674  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26342675 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 26342774  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  26342775 gttgattgtcttgg 26342788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15183249 - 15183036
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15183249 tttttaagtgtcactttttgagaaattttttgtttctatttaattgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 15183150  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15183149 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 15183050  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  15183049 gttgattatcttgg 15183036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 10812194 - 10812407
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  10812194 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 10812293  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10812294 attatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatggcatcaaaagtagtatcaatt 10812393  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  10812394 gttgattgtcttgg 10812407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30264850 - 30264637
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30264850 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 30264751  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30264750 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt 30264651  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  30264650 gttgattgtcttgg 30264637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 41885620 - 41885833
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41885620 tttttaggtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtcctta 41885719  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41885720 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaagtacagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 41885819  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  41885820 gttgattgtcttgg 41885833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28145820 - 28145609
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28145820 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 28145721  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28145720 gttatttattgcggagagagaattatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagt-aaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 28145622  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  28145621 gttgattgtcttg 28145609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15893828 - 15893615
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| | || |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  15893828 tttttaagtgtcaattttggaaaataaatttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 15893729  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15893728 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 15893629  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  15893628 gttgattgtcttgg 15893615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36405092 - 36404891
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36405092 catttttaagtgtctcttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttattttaccaatattatcct 36404993  T
Q  168 tagttattta-ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatca 266  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  36404992 tagttatttatttacggatagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaaca 36404893  T
Q  267 at 268  Q
    ||    
T  36404892 at 36404891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 75 - 283
Target Start/End: Original strand, 3363584 - 3363792
Alignment:
Q  75 aagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttat 174  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  3363584 aagtgtcacttttggagaaaagttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttat 3363683  T
Q  175 ttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttga 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3363684 ttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatcaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattga 3363783  T
Q  275 ttttcttgg 283  Q
    || ||||||    
T  3363784 ttgtcttgg 3363792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 14288426 - 14288637
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14288426 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatataacattaaatgttgttttatcaatattgtcctta 14288525  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14288526 attatttatcgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtatcaatt 14288625  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
     |||||| ||||    
T  14288626 attgattgtctt 14288637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15677539 - 15677327
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15677539 tttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattattttatcaatattatcctta 15677440  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  15677439 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaa-t 15677341  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  15677340 gttgattgtcttgg 15677327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 34399197 - 34399410
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  34399197 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaaccatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 34399296  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34399297 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt 34399396  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  34399397 gttgattgtcttgg 34399410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 19594346 - 19594556
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  19594346 tttttaattgtcactttttgagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaa-ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccata 19594444  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19594445 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaatatcaatt 19594544  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
    ||||||| ||||    
T  19594545 gttgattatctt 19594556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11560292 - 11560082
Alignment:
Q  73 ttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtt 172  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11560292 ttaagtgtcagttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtt 11560193  T
Q  173 atttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgtt 272  Q
    |||||||  | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11560192 atttattgtgaagagagaaatatatgcaatgagatattaaatgaataagataattatagtaaaagtacagcttattacatcaaaagtaatatcaattgtt 11560093  T
Q  273 gattttcttgg 283  Q
    |||| ||||||    
T  11560092 gattgtcttgg 11560082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25558431 - 25558221
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25558431 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagtt-aatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatcctta 25558333  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25558332 gttatttattgcggagagata--tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtctagcttattgtatcaaaagtagtatcaatt 25558235  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  25558234 tttgattgtcttgg 25558221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 37093445 - 37093657
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37093445 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttatcaatattgtcctta 37093544  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37093545 gttatttattgcagaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa-gtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 37093643  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||| ||| ||||||    
T  37093644 gttaattgtcttgg 37093657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 36375566 - 36375781
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtc--ct 167  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |   ||    
T  36375566 tttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatagtattatct 36375665  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36375666 tggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaaggtagtatcaa 36375765  T
Q  268 ttgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||||| ||||||    
T  36375766 ttgttgattgtcttgg 36375781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11222564 - 11222366
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  11222564 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 11222465  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11222464 gttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 11222366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 34357173 - 34357386
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  34357173 tttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 34357272  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||| |  ||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34357273 gttatttactgtggaaagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaaatagtataaatt 34357372  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  34357373 gttgattatcttgg 34357386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38072474 - 38072274
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  38072474 ttttcaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcatttttgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcttta 38072375  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||      | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38072374 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagttcattat------aatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 38072281  T
Q  270 gttgatt 276  Q
    |||||||    
T  38072280 gttgatt 38072274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 268
Target Start/End: Original strand, 4883601 - 4883796
Alignment:
Q  73 ttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtt 172  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  4883601 ttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagtt 4883700  T
Q  173 atttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  4883701 atttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattacatcaaaagtagtaacaat 4883796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 44360429 - 44360641
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||    
T  44360429 tttttaatcgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatatac-cctta 44360527  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44360528 aatatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatt 44360627  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  44360628 attgattgtcttgg 44360641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 13753950 - 13754144
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13753950 tttttaagtgtctcttttggagaacatttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatattaccctta 13754049  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaatta-tagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||||    
T  13754050 gttatttattgcggagagagaaatatatgacatgaaatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtagtaaattattgtatcaaaagtagta 13754144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 84 - 268
Target Start/End: Original strand, 4654728 - 4654912
Alignment:
Q  84 ttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacgg 183  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||    
T  4654728 ttttgaagaaatttttcgtttctatttaactgtcacttgcaaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttagttatttatagcgg 4654827  T
Q  184 agagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4654828 agagagaaatgtatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaacacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 4654912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 99 - 269
Target Start/End: Original strand, 10263780 - 10263951
Alignment:
Q  99 ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtt-atttattacggagagagaaatatat 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10263780 ttgttcctatttaactgtcactttcaaatttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagtttatttattgcggagagagaaatatat 10263879  T
Q  198 gaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10263880 gaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt 10263951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 106 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38186264 - 38186089
Alignment:
Q  106 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaa 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |     
T  38186264 tatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaaagaaatatatgaaatgag 38186165  T
Q  206 atattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttctt 281  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  38186164 atattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattacatcaaaaataatatcaattgttgattgtctt 38186089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 14541326 - 14541492
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  14541326 tttttaaatgtcacttttggagaaaaatattgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattatcctta 14541425  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14541426 gttatttattgtggagagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaa 14541492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35158599 - 35158406
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||     
T  35158599 tttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaaattcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttg 35158500  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     ||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  35158499 cttatttactgtggagaaagaaatatatgaaatgaaatagtaaatgaataaggttattacagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagta 35158406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 222
Target Start/End: Original strand, 43077287 - 43077439
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||    
T  43077287 tttttaattgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattaccctta 43077386  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataagg 222  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43077387 gatatttattgcggagagagaaacatatgaaataaaatattaaattaataagg 43077439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 2012856 - 2013027
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  2012856 tttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 2012955  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||    
T  2012956 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaattactaaggttattatagtaaaagtata 2013027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Original strand, 14308434 - 14308601
Alignment:
Q  114 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  14308434 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatatcgttttatcaat--tgtacttaattatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 14308531  T
Q  214 tgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14308532 tgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgg 14308601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 9706783 - 9706975
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9706783 tttttaagtgtcatttttgaagaaaaattt-gttttaatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 9706881  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||    ||||| |||||||||||||    
T  9706882 gttatttattatggagagataaatatataaaatgagatatcaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaaatattgtatcaaaagtagta 9706975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13001156 - 13000948
Alignment:
Q  73 ttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtt 172  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||  ||||||||    
T  13001156 ttaagtgttacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatcttgttttatcagtattacccttagtt 13001057  T
Q  173 atttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgtt 272  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||   |||||| ||||||||||||| || || ||    
T  13001056 atttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggctattatagcaaaaatattaattattgtatcaaaagtagtaacatttatt 13000957  T
Q  273 gattttctt 281  Q
    |||| ||||    
T  13000956 gattgtctt 13000948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 9369969 - 9370135
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||||    
T  9369969 tttttaattgtcatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaagtgttgttttatcaatattaccctta 9370068  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  9370069 aatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 9370135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31025188 - 31025022
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||  |||||    
T  31025188 tttttaagtgtcattttgggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatcttgttttaccaacattaccctta 31025089  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31025088 gttatttattatggagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaa 31025022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 13215388 - 13215581
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||  ||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  13215388 tttttaagtgtctcttttagagaattattttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 13215487  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||| |||||| || |  | |||| |||||||||||||    
T  13215488 cttatttattacggagagagaaatatatgaaattagattttaaattaatagggttattatagtaaaaatacatatcattgtatcaaaagtagta 13215581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13849963 - 13849797
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||    
T  13849963 tttttaattgtcacttttaaagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattaccttta 13849864  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  13849863 gatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaa 13849797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32855030 - 32854876
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||    
T  32855030 catttataattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccct 32854931  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataagg 222  Q
    ||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32854930 tagatgtttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagg 32854876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 13965602 - 13965815
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||    
T  13965602 tttttaaatgtctcttttggagaaattttttgttcatatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgatataccaatattatcctta 13965701  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||| ||||||| |||||| |||  | |||||    
T  13965702 gttatttattgcggagagagaaatatattaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattggatcaaatgtaaaaacaatt 13965801  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  13965802 attgattgtcttgg 13965815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 1395559 - 1395730
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaattttt-gtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  ||||    
T  1395559 tttttaagtgtcacatttgtagaaattttttcgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgtt-ttttaccaacattaccctt 1395657  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| |||||| ||||    
T  1395658 agttaattattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaaagactaagactattatagtaaaaatata 1395730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 192
Target Start/End: Original strand, 14284123 - 14284245
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14284123 tttttaagtgtcacttttgaagaaattttttattcctgtttagttgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtcctta 14284222  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaa 192  Q
     ||||||||| ||||||||||||    
T  14284223 attatttattgcggagagagaaa 14284245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 236
Target Start/End: Original strand, 8443684 - 8443852
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt-attttatcaatattgtcc 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||  ||    
T  8443684 catttttaattgtcatttttgaagaaattttttgtccctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaa-attaaatgttgtttttaccaatattaccc 8443782  T
Q  167 ttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  8443783 ttagatatttattgcggagagagaaacaaatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 8443852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 32674206 - 32674376
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  32674206 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaacaatcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccgta 32674305  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataa----aatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    | |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  32674306 gttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagaggagtattaaatgaataaggctattatagtaaaa 32674376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 221
Target Start/End: Original strand, 6013490 - 6013621
Alignment:
Q  90 agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagag 189  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  6013490 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggaaagag 6013589  T
Q  190 aaatatatgaaataaaatattaaatgaataag 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6013590 aaatatatgaaataagatattaaatgactaag 6013621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 263
Target Start/End: Original strand, 37077163 - 37077358
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  | |    
T  37077163 catttttaattgtcacttttgaagaaattttttgtttttatttaagtgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttattttgtcattattaccat 37077262  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    | |||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||| | ||||  |||  |||||| || ||||||||||    
T  37077263 tggttatttattgcagatagagaaatatatgaaatgagatattaaattatgaaggttattatagaaaaaagataaattattgtataaaaagtagta 37077358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34309297 - 34309141
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || || ||     
T  34309297 tttttaagtgtcacttttgaagaattttttt-ttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatgttatcattg 34309199  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttatt 227  Q
     ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  34309198 cttattcattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaatatggttatt 34309141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34884786 - 34884620
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||    
T  34884786 tttttaactgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactttcacttttaaagttcattgcaacattaaatgttgttttatcaatattaccttta 34884687  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | | |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  34884686 gatgtttattgcggaaagaaaaacatatgaaataaaacattaaattaataaggtcattatagtaaaa 34884620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32544034 - 32543885
Alignment:
Q  71 ttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttag 170  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||    
T  32544034 ttttaagagtcatttttggagaatttttttgttctaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacctttag 32543935  T
Q  171 ttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataa 220  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32543934 ttatttattacagagaaaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 32543885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37116815 - 37116690
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||| ||| |     
T  37116815 tttttgtatctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatcttacccttagataattattacggagagaaaaacac 37116716  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataag 221  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||    
T  37116715 aagaaataaaatattaaataaataag 37116690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25187355 - 25187243
Alignment:
Q  90 agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagag 189  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||   ||||  |||||||| |||||||||    
T  25187355 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttattttaccaatattactcttaaatatttattgcggagagag 25187256  T
Q  190 aaatatatgaaat 202  Q
    ||| |||||||||    
T  25187255 aaacatatgaaat 25187243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 30544515 - 30544674
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||  ||||     
T  30544515 tttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttg 30544614  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     ||||||| |   ||| || || |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  30544615 attatttactgtagagggataagtatatgaaataagatattaaatgaagaaagttattat 30544674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 838292 - 838126
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  838292 tttttgtttctaattaactgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctattatgtccttagtaatttattgcagagagagaaatat 838193  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||| | |||||| |  |||  |||  |||||||||||||||||||    
T  838192 atgaaatatgatattaaataattaaagatattataggcaaaacataagttattgcatcaaaagtagt 838126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 153
Target Start/End: Original strand, 37660137 - 37660222
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttt 153  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37660137 catttttaattgtcacttttgcagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttt 37660222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7529942 - 7529759
Alignment:
Q  81 cacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttatta 180  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||| | | ||| | |||||  |||||||||||||||     
T  7529942 cacttttgtataaattttttgtttctaaataagtttcactttcaaagttcaacacaatattaaatgatgtgttacctatattacccttagttatttattg 7529843  T
Q  181 cggagagagaaatatatgaaat-aaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| | ||||| |||  || ||| |||||||||||||    
T  7529842 cagagagagaaatatatgaaatgaaaatattaaatgatgaaggctattataggaaaatgataaattgttgtatcaaaagtagta 7529759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33947669 - 33947518
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |  | ||| |||||||||| |||||    
T  33947669 tgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttcttcctataatgtccttagtaattta 33947570  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||   ||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  33947569 ttgtagagagagaaatatataaaatatgatattaaataattaaggatattat 33947518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38148282 - 38148124
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||  ||||     
T  38148282 tttttaattgtcacttttgcaaaaaaattt-gtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttatttttcctttattacccttg 38148184  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||||||   ||||||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||||||    
T  38148183 attatttattgtagagagagaagtatatgaaatgagatattaaatgatgaaagttattat 38148124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 42088917 - 42089048
Alignment:
Q  98 tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatat 197  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| || ||||||| ||||||| | ||||||||||||||     
T  42088917 tttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataa 42089016  T
Q  198 gaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||||||  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  42089017 gaaatatgatattaaataattaaggatattat 42089048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 29041947 - 29042108
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||  || ||    
T  29041947 tttttaattgtcactttt--agataaattttttttctatttaactgtcactttcaaagtccaatgcaacattagatattgttttaccaatattacccgta 29042044  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | ||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  29042045 gatatttatt--gcagagagaaacatatgaaatgaaa-attaaattaataacgtcattattgtaaaa 29042108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18904150 - 18904079
Alignment:
Q  79 gtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttat 150  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18904150 gtcacttttatagaaaatttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttat 18904079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 928271 - 928122
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  ||| || ||||||||||| |||||   ||||| | ||||  ||||||    
T  928271 tgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcgttttcaaagtctaatacatcattaaatgttgttttacatatattattcttaaatattta 928172  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||  | |||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  928171 tt--gtagagagaaatatattaaatgaagtattaaatgattaaggttattat 928122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 186 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3376409 - 3376313
Alignment:
Q  186 agagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3376409 agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgttattataataaaaatatagcttattatattaaaagtagtatcaattattgattgtcttg 3376313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 25787340 - 25787491
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | |||  |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| | |||| | |||||  |||||  ||||||    
T  25787340 tgtcacttttgcataaatattttgtttttaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatattacccttatatattta 25787439  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    || |  ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  25787440 ttgcatagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattaaggatattat 25787491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1259722 - 1259664
Alignment:
Q  225 attatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1259722 attatggtaaaattatagtttattgcgtcaaaagtagtatcaattgttgattctcttgg 1259664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28301744 - 28301670
Alignment:
Q  73 ttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgt 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  28301744 ttaagtgtctcttttgaagaaaaattttgtttcaatttaaatgtcactttcaaagatcaatacaacattgaatgt 28301670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31011905 - 31011753
Alignment:
Q  129 tcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttatta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||| ||||| |||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  31011905 tcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacctttatttatt-attgtggagagagaaatgtatgtaataagatattaaataaacaaggttatta 31011807  T
Q  229 tggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    | |||||| || |  |||||| ||||||||||| | || || |||||| ||||||    
T  31011806 tagtaaaaataga-attattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttgg 31011753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 45065067 - 45065260
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | |   |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |  ||||  ||||     
T  45065067 tttttaattgtcacttttgcatattttttttgtttctaattaagtgttactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttg 45065166  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     |||||||||    |||||||| || ||||||||| |||||||||||  || |||||||| | ||||  ||   || |||||||||||||||||    
T  45065167 attatttattgtaaagagagaagtaaatgaaataagatattaaatgatgaatgttattatagaaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagta 45065260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4952936 - 4952860
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatg 146  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4952936 tttttaattgtcatttttagagaaattttttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatg 4952860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Original strand, 34721568 - 34721628
Alignment:
Q  181 cggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  34721568 cggagagagaaatatatgaaataatatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtata 34721628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28967478 - 28967320
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |  ||||  ||||     
T  28967478 tttttaattgtcacttttgcataat-ttttagtttctaattaaatgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttg 28967380  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     ||||||||    ||||||||| || ||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  28967379 attatttatcgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgataaaggttattat 28967320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Original strand, 36173089 - 36173188
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| || ||| || ||||||| ||||||| | | |||||||||||    
T  36173089 tttttgtttctaattaagtgtcattttcaaagttcaatataacattaaatgttgttttttctataatgaccttagtaatttattgcagggagagaaatat 36173188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Original strand, 2991843 - 2991938
Alignment:
Q  107 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaata 203  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||    
T  2991843 atttaacattcactttcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagagacacatatgaaata 2991938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42263718 - 42263618
Alignment:
Q  103 ttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaat 202  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  | ||| || | ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  42263718 ttctaattaagtgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcctttagtaatttattgcagagatagaaatatatgaaat 42263619  T
Q  203 a 203  Q
    |    
T  42263618 a 42263618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 214
Target Start/End: Original strand, 37354013 - 37354128
Alignment:
Q  99 ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatg 198  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  | |||  | ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||     
T  37354013 ttgtttttaattaactgtcactttcaaagttcaacgtgacattaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattagagagagaaaaatatata 37354112  T
Q  199 aaataaaatattaaat 214  Q
    |||||  |||||||||    
T  37354113 aaatatgatattaaat 37354128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 283
Target Start/End: Original strand, 14284247 - 14284292
Alignment:
Q  238 tatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  14284247 tatagcttattgcatcaaaattagtatcaattgttgattgtcttgg 14284292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 274
Target Start/End: Original strand, 36824486 - 36824590
Alignment:
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||  |||||| |  | |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  36824486 gttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaataaataagatcattacagtaaaagtgcaacttattgcattaaaaatagtaacaatt 36824585  T
Q  270 gttga 274  Q
     ||||    
T  36824586 attga 36824590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 214
Target Start/End: Original strand, 14117631 - 14117761
Alignment:
Q  84 ttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacgg 183  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  |  ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |  |||||  | |||||| | |    
T  14117631 ttttgtagaaaattattgtttatatacatttgtcattttcaaagttcaatgtaacgttaactgttattttgtcaataatacccttaactgtttattccag 14117730  T
Q  184 agagagaaatatatgaaataaaatattaaat 214  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  14117731 agagataaatagatgaaataagataataaat 14117761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18904073 - 18904007
Alignment:
Q  165 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatgg 231  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  18904073 ccttagtaatttattgcagagagagaaatatataaaatatgatattaaataattaaggatattatgg 18904007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4952832 - 4952792
Alignment:
Q  182 ggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataagg 222  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4952832 ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagg 4952792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 100)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 30686406 - 30686619
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30686406 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 30686505  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30686506 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 30686605  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  30686606 gttgattgtcttgg 30686619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21927938 - 21927727
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21927938 tttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcctta 21927839  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21927838 gttatttattgcggagagagaaatatataaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 21927739  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
    ||||||| ||||    
T  21927738 gttgattgtctt 21927727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 7782946 - 7783158
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7782946 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattagatgttgttttatcaatattgttctta 7783045  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7783046 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-aaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagttaattgcatcaaaagtagtatcaatt 7783144  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  7783145 gttgattatcttgg 7783158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35531537 - 35531324
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  35531537 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 35531438  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35531437 gttatttattgcagagagataaatatatgaaataggatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 35531338  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  35531337 gttgattgtcttgg 35531324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 45226819 - 45226608
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45226819 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtcctta 45226720  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45226719 gttatttattgtggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattataataaaagtatagcttattacatcaaaagtagtatcaatt 45226620  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
    ||||||| ||||    
T  45226619 gttgattgtctt 45226608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Original strand, 45368083 - 45368289
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  45368083 tttttaaatgtcacttttggggaaaatttttgtttctatttatctgtcactttcaaagttcaatgaaacattgaatgttgttttaccaatattatcctta 45368182  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368183 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 45368282  T
Q  270 gttgatt 276  Q
    |||||||    
T  45368283 gttgatt 45368289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19349621 - 19349408
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19349621 tttttaaatgtcactttcggagaaaaattttgttcctatttaacagtcactttcaaagttgaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 19349522  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19349521 gttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 19349422  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  19349421 gttgattgtcttgg 19349408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 74 - 281
Target Start/End: Original strand, 1429283 - 1429490
Alignment:
Q  74 taagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtta 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1429283 taagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcattgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtta 1429382  T
Q  174 tttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttg 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  1429383 tttattgcggagagagaaatatacaaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcatttgtag 1429482  T
Q  274 attttctt 281  Q
    ||| ||||    
T  1429483 attgtctt 1429490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37609543 - 37609334
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  37609543 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatcctta 37609444  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  37609443 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaa---agtatcaatt 37609347  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  37609346 gttgattgtcttg 37609334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 43500501 - 43500714
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  43500501 tttttaagtgtcatttttggagaaaatatttgttcctatttaagtgtcacttttaaagttcaatgcagtattaaatgttgttttaccaatattatcctta 43500600  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43500601 gttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 43500700  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  43500701 gttgattgtcttgg 43500714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 13507765 - 13507977
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  13507765 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 13507864  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13507865 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatccaaagtagtatcaatt 13507964  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
     |||||| |||||    
T  13507965 attgattgtcttg 13507977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 13514953 - 13515165
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  13514953 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 13515052  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13515053 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatccaaagtagtatcaatt 13515152  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
     |||||| |||||    
T  13515153 attgattgtcttg 13515165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 38648452 - 38648664
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  38648452 tttttaaatgtcactttttgagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaacttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 38648551  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38648552 gttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaatt 38648651  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  38648652 gttgattgtcttg 38648664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 13566671 - 13566887
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13566671 tttttaagtgtcattttttgagaaaaattttatttttatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 13566770  T
Q  170 gttatt---tattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatca 266  Q
     |||||   |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566771 attattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatca 13566870  T
Q  267 attgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||||| ||||||    
T  13566871 attgttgattgtcttgg 13566887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18034068 - 18033854
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  18034068 tttttaagtgtcactttttgagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatccaacattaaatattgttttatcaatattatcctta 18033969  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggt-aaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18033968 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaaatatagcttattgcatcaaaatgagtatcaat 18033869  T
Q  269 tgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||| ||||||    
T  18033868 tgttgattgtcttgg 18033854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20605866 - 20605653
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||     
T  20605866 tttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcttattaaactgtcactttcaaacttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcattg 20605767  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20605766 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 20605667  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  20605666 gttgattgtcttgg 20605653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31588981 - 31588769
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31588981 tttttaagtgtcatttttagagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcctta 31588882  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31588881 gttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagata-taaatgaataaggtcatcatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtattaatt 31588783  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  31588782 tttgattatcttgg 31588769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 68 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35484023 - 35483817
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  35484023 catttttaagtgtcatttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattatcct 35483924  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35483923 tagttatttatt--gcagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaataatatcaa 35483826  T
Q  268 ttgttgatt 276  Q
    |||||||||    
T  35483825 ttgttgatt 35483817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 28679016 - 28679227
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  28679016 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcttgtttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcttta 28679115  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28679116 gttatttattgcggagagagaaatatatcaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtataaatt 28679215  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
    ||| ||| ||||    
T  28679216 gttaattgtctt 28679227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Original strand, 1024551 - 1024757
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  1024551 tttttaagtgtcacttttgaaaaaaaaaattatttttatttaactgttactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattgtcgtta 1024650  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1024651 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt 1024750  T
Q  270 gttgatt 276  Q
    |||||||    
T  1024751 gttgatt 1024757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Original strand, 13699169 - 13699367
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||    
T  13699169 tttttaagtgtcgcttttgaataaattttttatttctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacgaatactatcctta 13699268  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13699269 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaat 13699367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37437295 - 37437082
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||| || | | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  37437295 tttttaagtgtcacgttaggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgttctta 37437196  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37437195 gttatttattgcggagataaaaatatattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtggtatcaatt 37437096  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  37437095 attgattgtcttgg 37437082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 50825814 - 50825602
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  50825814 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcttacttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatcctta 50825715  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  50825714 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagcaa-t 50825616  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  50825615 gttgattgtcttgg 50825602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 49908424 - 49908210
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  49908424 tttttaagtgtcacttttaaagaaaaattttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 49908325  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaa---attatagcttattgcatcaaaagtagtatca 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||| ||||| |||||   || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49908324 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatcgaattaataaggtcattatagtaaaaatataatagtttattgcatcaaaagtagtatca 49908225  T
Q  267 attgttgattttctt 281  Q
    |||||||||| ||||    
T  49908224 attgttgattgtctt 49908210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 260
Target Start/End: Original strand, 10675897 - 10676087
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |    
T  10675897 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctaa 10675996  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagta 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  10675997 gttatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagta 10676087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 52749012 - 52749222
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  52749012 tttttaaatgtcatttttgaagaaattttttgttcctatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttatatcaatattatcctta 52749111  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  52749112 gttatttatt--gtggagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagattattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaaatagtatcaatt 52749209  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  52749210 gttgattgtcttg 52749222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 266
Target Start/End: Original strand, 44818449 - 44818645
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  44818449 tttttaagcgtcacttttgcagaaaatctttgttcctatttaactttcattttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 44818548  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatca 266  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44818549 gttatttattgcatagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaactatagcttattgcatcaaaagtagtatca 44818645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 282
Target Start/End: Original strand, 12124677 - 12124851
Alignment:
Q  108 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaat 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  12124677 tttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactagtattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagat 12124776  T
Q  208 attaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12124777 attaaatgaataagattattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagcatcaattgttgattatcttg 12124851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19929708 - 19929495
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | |||     
T  19929708 tttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttaccaatattattcttt 19929609  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  19929608 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaacaatt 19929509  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  19929508 attgattgtcttgg 19929495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 9361968 - 9362139
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  9361968 tttttaagtgtcatttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 9362067  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  9362068 gttatttattacgaagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtata 9362139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32994715 - 32994498
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaa---attt-ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtc 165  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||   |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  32994715 tttttaagtgtctcttttaaagaaattaatttgttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 32994616  T
Q  166 cttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatc 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||      
T  32994615 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaat 32994516  T
Q  266 aattgttgattttcttgg 283  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  32994515 aattattgattgtcttgg 32994498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 35255481 - 35255694
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  35255481 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattatcctta 35255580  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||| | || ||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  35255581 gttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaaaaacaatt 35255680  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  35255681 attgattgtcttgg 35255694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 49497147 - 49497358
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||| | |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49497147 tttttaagtgtcacttttaaagaatttttttgttcttatttaactgttatttttgaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 49497246  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  49497247 gttatttattgcggagagataaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaataatatcaatt 49497346  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
    ||| ||| ||||    
T  49497347 gttaattgtctt 49497358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 44182755 - 44182966
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  44182755 tttttaagtgtcaattttggagaaaaaatttgtttctatttaactgtcactctcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 44182854  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||  ||| |||||| ||||||||    
T  44182855 gttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagata-taaataaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattatatc-aaagtaatatcaatt 44182952  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  44182953 tttgattgtcttgg 44182966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 262
Target Start/End: Original strand, 43952783 - 43952975
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| || |||    
T  43952783 tttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttacaaatattatcttta 43952882  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  43952883 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgcgatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagtagt 43952975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 15660582 - 15660753
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  15660582 tttttaagtgtcatttttggagaaatattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 15660681  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||    
T  15660682 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgactaagactattatagtaaaagtata 15660753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 32347973 - 32348166
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  32347973 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccctta 32348072  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | |||||| |||    ||||| |||||||||||||    
T  32348073 gttatttattgtggagaaagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattctagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagta 32348166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 68 - 263
Target Start/End: Original strand, 10506806 - 10506999
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||    
T  10506806 cattttaaagtgtcacttttggagaaattttttgttctaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcgatattaccct 10506905  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||| || |||   ||||||||||||||||||||    
T  10506906 tagttatttattgcg--gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtacaagtatcaattattgcatcaaaagtagta 10506999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 51972523 - 51972312
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| || |||    
T  51972523 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcttatttaattgtcactttcaaaattcaatgcaacatgaaatattattttaccaatattatcatta 51972424  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    | |||||||| | |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  51972423 gctatttattgcagagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataatatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaact 51972324  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
     |||||| ||||    
T  51972323 attgattgtctt 51972312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32168554 - 32168388
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  32168554 tttttaattgtcacttttagagaaaatttttgtttctatttaactgtcagtttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattaccctta 32168455  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  32168454 gatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaa 32168388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35700617 - 35700405
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||   ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  35700617 tttttaagtgtcacttttggaaaaaaaaattgttccaatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 35700518  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||   |||||  ||||||||||||| || ||    
T  35700517 gttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattatatcaaaagtagtaacattt 35700418  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
     |||||| |||||    
T  35700417 attgattgtcttg 35700405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 38597586 - 38597757
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||  |||||    
T  38597586 ttttaaagtgtcatttttggagaaacttttcgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattaccctta 38597685  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  38597686 gttatttattatggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtata 38597757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 51613406 - 51613619
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  51613406 tttttaattgtcacttttagagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattactctta 51613505  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa-ttatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    | |||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | ||| |  |||| |||||||||||||||| |    
T  51613506 gatatttattgcggatagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataac-aattgtatcaaaagtagtatcatt 51613604  T
Q  269 tgttgattttcttgg 283  Q
    | |||||| ||||||    
T  51613605 tattgattgtcttgg 51613619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 138 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12231245 - 12231100
Alignment:
Q  138 cattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaat 237  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  12231245 cattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaag 12231146  T
Q  238 tatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12231145 tacagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgg 12231100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19455636 - 19455448
Alignment:
Q  74 taagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtta 173  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| |||    
T  19455636 taagtgtcacttttggagaaa-tttttgtttcaatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttaatta 19455538  T
Q  174 tttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||| | |||||  ||||  |||||| |||||||||||||    
T  19455537 tttattgcggagagagaaatctatgaaacataatattaaatgaataagactattttagtaaaggtataaattattgtatcaaaagtagta 19455448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 262
Target Start/End: Original strand, 36318348 - 36318539
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36318348 tttttaagtgtcacttttagataaattttttgtttctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatcctta 36318447  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
     |||||||||||  ||||| |||| |||||||| | | ||||||  |||||||||||||| |||||  | ||  |||||| ||||||||||||    
T  36318448 tttatttattacaaagagaaaaat-tatgaaatgacacattaaacaaataaggttattatagtaaaggtgtaaattattgtatcaaaagtagt 36318539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 135 - 282
Target Start/End: Original strand, 1677258 - 1677405
Alignment:
Q  135 caacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaa 234  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  1677258 caacattaaatgttgttttaccaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcaatatagtaa 1677357  T
Q  235 aattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1677358 aagtatagcttattgcattaaaagtagtatcaattattgattgtcttg 1677405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 168 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8464401 - 8464286
Alignment:
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464401 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 8464302  T
Q  268 ttgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||||| ||||||    
T  8464301 ttgttgattgtcttgg 8464286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31570879 - 31570713
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  31570879 tttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatcctta 31570780  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
     |||||||| |||||| ||||||| |||||| | |   |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31570779 cttatttatcacggagtgagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaa 31570713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 283
Target Start/End: Original strand, 29830820 - 29830961
Alignment:
Q  142 aaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  29830820 aaattttattttaccaatattggtcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata 29830919  T
Q  242 gcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  29830920 gcttattgcatcaaaagtaatatcaattattgattgtcttgg 29830961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37735381 - 37735168
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||  |||||    
T  37735381 tttttaactgtcacttttaaagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactgtcaaagttcaatgcaaaattaaatattgttttaccaacattaccctta 37735282  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
      |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |    |||| |||||||||||||||| ||    
T  37735281 tatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaatcaaaaacaattgtatcaaaagtagtatcattt 37735182  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  37735181 attgattgtcttgg 37735168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 51974413 - 51974220
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||   ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||     
T  51974413 tttttaagtgtcatttttttaaaaaaaaattgtttccatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaatattaaatattgttttaccaatattatccttg 51974314  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  51974313 cttatttattgtgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatacattattgtatcaaaagtagta 51974220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38818147 - 38817996
Alignment:
Q  90 agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagag 189  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  38818147 agaaattttttatttctatttaactgtcacttttaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttagcaacattacccttagttatttattacggagagag 38818048  T
Q  190 aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||    
T  38818047 aaatatgtgaaataatatattaaatgaataaggctgttatagtaaaagtata 38817996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8464691 - 8464585
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8464691 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 8464592  T
Q  170 gttattt 176  Q
    |||||||    
T  8464591 gttattt 8464585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 9127662 - 9127857
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  || |||| |||||     
T  9127662 tttttaagtgtcacttttggataaattttttgtgtttatttaattgtcactttcgaagttcaatgcaatattaaatgttgtttttccagtattatccttg 9127761  T
Q  170 gttatttattacg--gagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     | |||||||  |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  9127762 ctcatttattgtggagagagagaaatatatgaagtgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagta 9127857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 52649951 - 52649759
Alignment:
Q  90 agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagag 189  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |    
T  52649951 agaaaagttttgtttatatttaattatcactttcaaagttcaaagcaatattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattacagagagtg 52649852  T
Q  190 aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| | ||||  |||  |||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  52649851 aaatatatgaaacaagatattaaatgaatgaggctattattggaaaaggatatattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttg 52649759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24781916 - 24781810
Alignment:
Q  130 caatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24781916 caatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattat 24781817  T
Q  230 ggtaaaa 236  Q
     ||||||    
T  24781816 agtaaaa 24781810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 235
Target Start/End: Original strand, 12721435 - 12721600
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||   ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  12721435 tttttaattgtcacttttagagaaaaaaattgttcctatttaactatcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaagatttccctta 12721534  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaa 235  Q
    | |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  12721535 gatatttattgcagagagagaaacatatgaaataaaatattaaattaataaggtcattatagtaaa 12721600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 259
Target Start/End: Original strand, 18344321 - 18344510
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  18344321 tttttaagtgtctcttttaacgaaaatttttgtttcaatttaagtgtcaattttaaaattcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattaccctta 18344420  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagt 259  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||   ||||| |||||||||    
T  18344421 gttatttattgtgcagagagaaatatatgaaatgagataataaacaaataaggttattatagtaaaagtataaagtattgtatcaaaagt 18344510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2059974 - 2059848
Alignment:
Q  150 ttttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattg 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||||    
T  2059974 ttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtgaaagtataacttattg 2059875  T
Q  250 catcaaaagtagtatcaattgttgatt 276  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  2059874 catcaaatgtagtaacaattattgatt 2059848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Original strand, 19093263 - 19093367
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  19093263 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttacctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatcctta 19093362  T
Q  170 gttat 174  Q
    |||||    
T  19093363 gttat 19093367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 220
Target Start/End: Original strand, 1038078 - 1038229
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt-attttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  1038078 tttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatattatcctt 1038177  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataa 220  Q
       ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1038178 gaatatttattacggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataa 1038229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 220
Target Start/End: Original strand, 1044984 - 1045135
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt-attttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  1044984 tttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatattatcctt 1045083  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataa 220  Q
       ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1045084 gaatatttattacggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataa 1045135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 236
Target Start/End: Original strand, 1427697 - 1427840
Alignment:
Q  93 aaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaa 192  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||    
T  1427697 aaatttttgttcttatttaactgtcattttcaaaggtcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattatccttagttatttattgcaaagagagaaa 1427796  T
Q  193 tatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||||    
T  1427797 tatatgaaataagatattaaatgactaatgctattatagtaaaa 1427840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4101151 - 4100985
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  4101151 tttttaattgtcacttttggaaaaatcttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgtagcattaaatgttgttttaccaatattaccctta 4101052  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
      |||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  4101051 tatatttattgcggagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattatagtaaaa 4100985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 40926985 - 40926789
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||   ||||    
T  40926985 tttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaacgatgttttatcaatattactctta 40926886  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||         |||||||  |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40926885 -ttatttatggcggagagagaaatatatgaaacgaaat---------ataaggtcgttatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtagtaacaatt 40926796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 17013417 - 17013587
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||  |||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||    
T  17013417 tttttaagtgtttcttttggagaattttttttcttctatttaactgtcacttttgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcttta 17013516  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataa---aat-attaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| | |   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17013517 cttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagtgaatgattaaatgaataaggttattatagtaaaa 17013587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 48265278 - 48265087
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||  |||   |||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  48265278 tttttaagtgtcacttttcgagattttttttgttcctatttaagtgtcactttacgtagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattaccctt 48265179  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtag 261  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||| |||||||||||    
T  48265178 atttatt-attatggagagagaaatatatgtaatgagacattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtag 48265087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 260
Target Start/End: Original strand, 48508128 - 48508318
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||    
T  48508128 tttttaagtgtctattttgaagaatttttatgttcctatttaattgtcactttacacagttcaatgcaacattaaaagttattttactaatattaccctt 48508227  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagta 260  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||||    
T  48508228 atttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagta 48508318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8008398 - 8008240
Alignment:
Q  83 cttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacg 182  Q
    |||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||||  |    
T  8008398 cttttggagaaaaaatttgtctcaatttaactgtcacttttaaagatcaatacaatattaaatgttgttttatcaatattactcttaattatttattgtg 8008299  T
Q  183 gagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  8008298 gagagagaagtatatgaaagaagatattaaattaataagatcattatggtaaaattata 8008240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30702532 - 30702326
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||  |||||| | ||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  30702532 tttttaagtgtttcttttgcataaattttttgttttaatttaaatctcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatcctta 30702433  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||   |||| | |||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||   ||||| ||||||||| ||| || ||    
T  30702432 gttatttattgtagagaaaaaaatatataaaatgagataataaataaataatgttattatagtaaaagtataaaatattgtatcaaaagtggtaacattt 30702333  T
Q  270 gttgatt 276  Q
     ||||||    
T  30702332 attgatt 30702326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Original strand, 46096573 - 46096734
Alignment:
Q  99 ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatg 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||||||||     
T  46096573 ttgtttcaatttaactgtcactt---aaattcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatctttagttattaattatggggagagaaatatata 46096669  T
Q  199 aaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||    ||||| |||||||||||||    
T  46096670 aaatgagatattaaatgaataagattattgtagtaaaagtatgaaatattgtatcaaaagtagta 46096734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 43808893 - 43809110
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt-attttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||    
T  43808893 tttttaattgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaaccatcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttttaccaatattaccctt 43808992  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaa-----tattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    || |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||     |||||||| ||||||| |||||| |||||| || |  | |||| |||||||| ||||    
T  43808993 agatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatactgtattaaattaataaggctattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagcagta 43809092  T
Q  264 tcaattgttgattttctt 281  Q
     || || |||||| ||||    
T  43809093 acacttattgattgtctt 43809110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 172
Target Start/End: Original strand, 35605452 - 35605555
Alignment:
Q  69 atttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  35605452 atttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgtttaaatttaactgtcactttcaaaatttaatgcaaaattaaatgttgttttaccaatattatcctt 35605551  T
Q  169 agtt 172  Q
    ||||    
T  35605552 agtt 35605555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42787498 - 42787335
Alignment:
Q  100 tgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatga 199  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  42787498 tgtttgtaattaaccgccactttcaaaattcaatggaatattaactgttcttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatacatta 42787399  T
Q  200 aataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| |  |||  |||  |||||| |||||||||||||    
T  42787398 tacaagatattaaatgaataaggttattattgagaaaggataaattattgtatcaaaagtagta 42787335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37296967 - 37296838
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  37296967 tttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcgaagttcaacgcaacattgaatattattttaccaatattatcctta 37296868  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaa 200  Q
     |||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  37296867 cttatttatta-ggggagagaaatgtatgaa 37296838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 52759031 - 52759182
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |  | ||| || ||||||| |||||    
T  52759031 tgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttcttcctataatgcccttagtaattta 52759130  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    || | |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  52759131 ttgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattat 52759182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 172
Target Start/End: Original strand, 5597818 - 5597920
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||    
T  5597818 tttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcacttccaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattaccctta 5597917  T
Q  170 gtt 172  Q
    |||    
T  5597918 gtt 5597920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48174894 - 48174748
Alignment:
Q  90 agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagag 189  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| | |||||| ||||||  |||||  |||||||| |||||||||    
T  48174894 agaaattttttgtttttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcatagttaaatgctcttttatgaatattacccttaaatatttattgcggagagag 48174795  T
Q  190 aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  48174794 aaacatatgaaatgaaatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaa 48174748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1039609 - 1039445
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||   ||||    
T  1039609 tttttaattgtcacctttagagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaagattacactta 1039510  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaa 235  Q
    | |||||||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1039509 gatatttattgc-aagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaa 1039445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1046515 - 1046351
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||||| |||  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||   ||||    
T  1046515 tttttaattgtcacctttagagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaagattacactta 1046416  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaa 235  Q
    | |||||||| |  ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1046415 gatatttattgc-aagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaa 1046351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 5598145 - 5598218
Alignment:
Q  165 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaatt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5598145 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaatt 5598218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 263
Target Start/End: Original strand, 11248773 - 11248969
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaattt-ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcc 166  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||  ||    
T  11248773 catttttaattgtcatttttgaagaaaaaaaattgtttctaattaagtgtcgctttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattaccc 11248872  T
Q  167 ttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||  ||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||||||| |||   ||||  |||  |||||| |||||||||||||    
T  11248873 ttgattatttatttcagagagagaaatatatgaaatgagatattacatgatgaaggttactataagaaaaagataaattattgtatcaaaagtagta 11248969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 220
Target Start/End: Original strand, 42800103 - 42800250
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  42800103 tttttaattgtcattttttgagaaaagatttgtttatatttaactgttactttcaaa-ttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattatcctta 42800201  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataa 220  Q
      ||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42800202 tatatttatt--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataa 42800250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39412673 - 39412547
Alignment:
Q  150 ttttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattg 249  Q
    ||||| ||||||| || || |||||||||| | |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||    
T  39412673 ttttaccaatattatcttttgttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaaatataacttattg 39412574  T
Q  250 catcaaaagtagtatcaattgttgatt 276  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  39412573 catcaaaagtagaaacaattattgatt 39412547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31488021 - 31487830
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaa-agttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  |||||||| ||||| || |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  31488021 tttttaagtgtctctttttgagaatttttttgttcctattcaagtgtcactttatatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattaccctt 31487922  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtag 261  Q
    | ||||| |||   || ||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||| |||||||||||    
T  31487921 atttatt-attgtagaaagaaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtag 31487830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 180
Target Start/End: Original strand, 36850640 - 36850748
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||    |||    
T  36850640 ttttttagtgtcacttttgtagaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagttc-atgcaatattaaatg-tattttaccaatattactttta 36850737  T
Q  170 gttatttatta 180  Q
    |||||||||||    
T  36850738 gttatttatta 36850748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 227
Target Start/End: Original strand, 50152428 - 50152585
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||| |||||| | |||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||  ||||     
T  50152428 tttttaattgtcgcttttgcataaatgttttgtttctaattaacttttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttg 50152527  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttatt 227  Q
     |||||||||   || | | || |||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  50152528 attatttattgtagaaatataattatatgaaataagatattaaatgatgaaggttatt 50152585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 208
Target Start/End: Original strand, 52825298 - 52825410
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| || ||||| | |||||||   |||||||||||||    
T  52825298 tttttgtttttaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttaataatttattgtagagagagaaatat 52825397  T
Q  196 atgaaataaaata 208  Q
    |||| || |||||    
T  52825398 atgatattaaata 52825410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8973666 - 8973534
Alignment:
Q  97 ttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatata 196  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | |||||  |||||  ||||||||   | ||||||||||||    
T  8973666 ttttgtttctaattaactgttgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgattttacctatattacccttatatatttattgtagggagagaaatata 8973567  T
Q  197 tgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    |||||| || |||||||||| | | ||||||||    
T  8973566 tgaaatgaagtattaaatgattgatgttattat 8973534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 137
Target Start/End: Original strand, 1428214 - 1428281
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaa 137  Q
    ||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1428214 tttttaagtatcagttttagagaaattttttgtttctattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaa 1428281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 263
Target Start/End: Original strand, 2572016 - 2572159
Alignment:
Q  120 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaata 219  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||   |||| | |||||  | |||  |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  2572016 tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttacctatattacctttatatatttattgcagagagtgaaatatatgaaatgaaatattaaataatta 2572115  T
Q  220 aggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||| | ||||  |||  |||||  |||||||||||||    
T  2572116 aggttattatagaaaaaagataatttattatatcaaaagtagta 2572159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 229
Target Start/End: Original strand, 1859102 - 1859247
Alignment:
Q  82 acttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattac 181  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||| || |||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||  |||||  |||||||||     
T  1859102 acttttgcataaattttttatttttagttaagtgtcattttcaaagtttaatacatcattaaatgttgttttacctatattacccttatatatttatta- 1859200  T
Q  182 ggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
      |||||||| |||||||||| | |||||| |||| ||||||| ||||    
T  1859201 -tagagagaagtatatgaaatgagatattagatgattaaggttgttat 1859247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 229
Target Start/End: Original strand, 41155292 - 41155429
Alignment:
Q  92 aaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaa 191  Q
    ||||||||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||  | |||||||||| |||||| | |||||  | |||  ||||||||   |||  ||||    
T  41155292 aaaatttttgtttttaattaactgtcgttttcaaaattcaatttatcattaaatgtaattttacctatattacctttatatatttattggagaggaagaa 41155391  T
Q  192 atatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    | ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  41155392 aaatatgaaatgaagtattaaataattaaggttattat 41155429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 241
Target Start/End: Original strand, 1428519 - 1428571
Alignment:
Q  189 gaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  1428519 gaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtata 1428571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 114
Target Start/End: Original strand, 1677211 - 1677255
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaact 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  1677211 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaact 1677255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 178
Target Start/End: Original strand, 8466514 - 8466586
Alignment:
Q  106 tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttat 178  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||| || ||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  8466514 tatttaactatcgctttcaaaatttaatgtaatattaaatattattttatcaatattattcttaattatttat 8466586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Original strand, 33720582 - 33720662
Alignment:
Q  140 ttaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataag 221  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||  |||| ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33720582 ttaaatgttgttttaccaatattacccttaaatatt-attgcggagagagaaaaacatgaaatgaaatattaaattaataag 33720662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 236
Target Start/End: Original strand, 35605722 - 35605759
Alignment:
Q  199 aaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35605722 aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaa 35605759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38569760 - 38569703
Alignment:
Q  172 tatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  38569760 tatttattgccgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattattaaggttattat 38569703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 112)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 23429904 - 23430116
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23429904 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 23430003  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23430004 gttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 23430103  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  23430104 gttgattgtcttg 23430116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 9954644 - 9954857
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9954644 tttttaagtgtcacttttggagaaaaatttagttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 9954743  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9954744 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatggtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatatcaatt 9954843  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  9954844 gttgattgtcttgg 9954857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33935305 - 33935092
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  33935305 tttttaagtgttacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 33935206  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33935205 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 33935106  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  33935105 attgattgtcttgg 33935092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 14263539 - 14263752
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  14263539 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 14263638  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14263639 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatatcaatt 14263738  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  14263739 gttgattgtcttgg 14263752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 34046846 - 34047059
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  34046846 tttttaagtgtcacttttagagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattgtcctta 34046945  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34046946 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaaatagtatcaatt 34047045  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    |||||| |||||||    
T  34047046 gttgatattcttgg 34047059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39303761 - 39303549
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  39303761 tttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcttta 39303662  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39303661 gttttttattgcggagagagaaatatatgatataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 39303562  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  39303561 gttgattgtcttg 39303549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Original strand, 34981824 - 34982030
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34981824 tttttaagtgtcgcttttggagaaattttttgttcctacttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 34981923  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34981924 gttatttattgcggagagagaaatacatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtattaatt 34982023  T
Q  270 gttgatt 276  Q
    |||||||    
T  34982024 gttgatt 34982030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38483010 - 38482824
Alignment:
Q  97 ttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatata 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38483010 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 38482911  T
Q  197 tgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38482910 tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgg 38482824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23848801 - 23848588
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||     
T  23848801 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaaatttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttg 23848702  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23848701 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt 23848602  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  23848601 attgattgtcttgg 23848588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25703822 - 25703611
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25703822 tttttaagtgtcacttttgaagaaatattttgttcctatttaactggcattttcaaagttcaatgcagcattaaatgttattttaccaatattgtcctta 25703723  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25703722 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-gaatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtattaatt 25703624  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  25703623 gttgattatcttg 25703611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 26062703 - 26062914
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  26062703 tttttaagtgtcatttttagaaaatttttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaa-tgttgttttaccaatattgtcctta 26062801  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26062802 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 26062901  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  26062902 gttgattatcttg 26062914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38128785 - 38128579
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  38128785 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaa-------tgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 38128693  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38128692 gttatttactacggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 38128593  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  38128592 gttgattgtcttgg 38128579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25812993 - 25812782
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25812993 tttttaagtgtcacttttgaagaaatattttgttcctatttaactggcattttcaaagttcaatgcagcattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 25812894  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25812893 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-gaatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtattaatt 25812795  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  25812794 gttgattatcttg 25812782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Original strand, 18291459 - 18291656
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  18291459 tttttaagtgtctcctttgaagaaattttttgttgctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatattgttttacca-tattatcctta 18291557  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18291558 gttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaat 18291656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 78 - 283
Target Start/End: Original strand, 35052056 - 35052261
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  35052056 tgtcacttttggagaaaaaatttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttatttattta 35052155  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattt 277  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  35052156 ttgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattg 35052255  T
Q  278 tcttgg 283  Q
    ||||||    
T  35052256 tcttgg 35052261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 80 - 283
Target Start/End: Original strand, 40228300 - 40228503
Alignment:
Q  80 tcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttatt 179  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  40228300 tcacttttggagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttatt 40228399  T
Q  180 acggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttc 279  Q
      ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  40228400 gtggagagagaaatatatgaaatgacatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtc 40228499  T
Q  280 ttgg 283  Q
    ||||    
T  40228500 ttgg 40228503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14228567 - 14228354
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaaga-aaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  14228567 tttttaagtgtcacttttggagatttttttttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 14228468  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14228467 -gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatgacatcaaaagtagtatcaat 14228369  T
Q  269 tgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||| ||||||    
T  14228368 tgttgattgtcttgg 14228354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Original strand, 36058228 - 36058425
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  36058228 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta-caatattatcctta 36058326  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36058327 gttatttattgctgagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 36058425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 15596339 - 15596552
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||  | |||    
T  15596339 tttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaaaattaaatgatgttttatcaatattaccttta 15596438  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  15596439 attatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcataaaaagtaataacaatt 15596538  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  15596539 attgattatcttgg 15596552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40604096 - 40603884
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||||  || | |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40604096 tttttaagtgtcactgatggataaaaattttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcctta 40603997  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  40603996 attatttattgcggagagataaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcatcatagtaaaagtttagtttattacatcaaaaatagtatcaatt 40603897  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  40603896 gttgattgtcttg 40603884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 91 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1202668 - 1202477
Alignment:
Q  91 gaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagaga 190  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  1202668 gaaaatttttgttcatatttaactgtcacttttaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattgtctttagttatttattgcggaaagaga 1202569  T
Q  191 aatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1202568 aatatataaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttg 1202477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 11993888 - 11994088
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11993888 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 11993987  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||  |||||||||||||            |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11993988 gttatttatagcggagagagaaat------------atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 11994075  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||| ||| |||||    
T  11994076 gtttattgtcttg 11994088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Original strand, 10180365 - 10180563
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||    
T  10180365 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaacgttattttaccaatattatcttta 10180464  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10180465 gttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 10180563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45281623 - 45281410
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatt-tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  45281623 tttttaagtgtcacttttggagaaaaaaatttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatcctt 45281524  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45281523 agttatttattgtggagagggaaatatatgaaat-ggatattaaatgaataaggtgattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaat 45281425  T
Q  269 tgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||| ||||||    
T  45281424 tgttgattatcttgg 45281410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 16656696 - 16656908
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||||    
T  16656696 tttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgttttagcaatattattctta 16656795  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16656796 gttatt-attgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaattagtatcaatt 16656894  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||| | ||||||    
T  16656895 gttgagtgtcttgg 16656908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Original strand, 4057310 - 4057496
Alignment:
Q  97 ttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatata 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4057310 ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaatata 4057409  T
Q  197 tgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    |||||| | ||||||||| |||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4057410 tgaaatgagatattaaattaataagatcattatagtaaaagtatagcttatggcataaaaagtagtatcaattgttaattgtcttgg 4057496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12342859 - 12342661
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||    
T  12342859 tttttaactctctcttttgaagaaattttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcttta 12342760  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12342759 actatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 12342661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21651991 - 21651798
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21651991 tttttaagtgtcttttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgccacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 21651892  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || |  ||||||||||||||||||||    
T  21651891 gttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaagttattgcatcaaaagtagta 21651798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 43553035 - 43553247
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||    
T  43553035 tttttaagtgtcacttttggaaaaaaaatt-gtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaacgttgttttatcaatattaccctta 43553133  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||   |||||| ||||||||||||| || ||    
T  43553134 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 43553233  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  43553234 attgattgtcttgg 43553247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 43642208 - 43642023
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43642208 tttttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggggagagaaatat 43642109  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttctt 281  Q
    ||||||| | || ||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  43642108 atgaaattagatgttaaaagaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtctt 43642023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 234
Target Start/End: Original strand, 13327774 - 13327938
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||    
T  13327774 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatcttta 13327873  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaa 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13327874 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaa 13327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 249
Target Start/End: Original strand, 2335428 - 2335607
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  2335428 tttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 2335527  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattg 249  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  2335528 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtatagattattg 2335607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 257
Target Start/End: Original strand, 12763430 - 12763616
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  12763430 tttttaagtgtcacttttggagaaa-tttttgtttcaatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 12763528  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaa 257  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||| |||   |||||| |||||||    
T  12763529 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgatattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 12763616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 167722 - 167556
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  167722 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttttaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 167623  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  167622 gttatttattgtggagagataaatatataaaatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaa 167556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16701138 - 16700989
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  16701138 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatacaatattaaatgttgttttaccaatattatcctta 16701039  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaata 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16701038 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 16700989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 101 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 9808188 - 9808008
Alignment:
Q  101 gtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaa 200  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9808188 gtttctatttaactctcattttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttactaatattgtcattagttatttattgcggagagagaaatatatgaa 9808089  T
Q  201 ataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttctt 281  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  9808088 atgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtattaattgttaattatctt 9808008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 6750610 - 6750781
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  6750610 tttttaattgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 6750709  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||    
T  6750710 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtata 6750781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 6757401 - 6757572
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  6757401 tttttaattgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 6757500  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||    
T  6757501 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtata 6757572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27518952 - 27518760
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      |||| ||||||    
T  27518952 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttattt------tattatcctta 27518859  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||| | || | |||||||||| |||||||||| ||||    
T  27518858 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaagtcattatagtaacagtacaacttattgcataaaaagtagtaacaat 27518760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11707704 - 11707559
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11707704 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatat 11707605  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||    
T  11707604 atgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtata 11707559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14061394 - 14061201
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  14061394 tttttaagtgtcattttttgaaaaaaattttgtttctgtttaactgtcactttcaaaggtcaatgcaacattaaaagttgttttatcaatattgccctta 14061295  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||| ||| | |||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  14061294 gttatttattacagagagagaaataaataaaatgtaatattaaatgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagtagta 14061201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 276
Target Start/End: Original strand, 3513390 - 3513558
Alignment:
Q  108 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||    
T  3513390 tttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttacctatattatcattagttatttattacagagagataaatatatgaaatgagat 3513489  T
Q  208 attaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgatt 276  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  3513490 attaaatgaataaggtcattatagtaaatgtatagcttattgtatcaaaagtaatatcaatttttgatt 3513558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32010288 - 32010116
Alignment:
Q  111 aactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatatt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||    
T  32010288 aactgtcactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgtt 32010189  T
Q  211 aaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  32010188 aaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataaattattgcatcaaaagtagtagcaattattgattgtcttgg 32010116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 268
Target Start/End: Original strand, 33314553 - 33314737
Alignment:
Q  84 ttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacgg 183  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||  |||||| |||||||||||||    
T  33314553 ttttgaagaaattttttgtttccatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactagtatgatccttaattatttattacgg 33314652  T
Q  184 agagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||  | | |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  33314653 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaaggacaacttattgcataaaaaatagtaacaat 33314737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 3720675 - 3720841
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   || |    
T  3720675 tttttaattgtcacttttgaataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattactctaa 3720774  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  3720775 gatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaa 3720841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 13173924 - 13174090
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  || |||  |||||    
T  13173924 tttttaagtgtcactttaagagaaagtttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttactaacattaccctta 13174023  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  13174024 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaa 13174090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15647606 - 15647452
Alignment:
Q  108 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  15647606 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagat 15647507  T
Q  208 attaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||    
T  15647506 attaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaaatagt 15647452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 35296039 - 35296205
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | |||  | |||    
T  35296039 tttttaagtgtcactttagtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccgacattaccttta 35296138  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  35296139 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgattaaggctattatagtaaaa 35296205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43553488 - 43553322
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  43553488 tttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatcctta 43553389  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| | |    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43553388 cttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagtgcttaaatgaataaggttattatagtaaaa 43553322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 1245304 - 1245519
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaa---gaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcc 166  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||   |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1245304 tttttaagtgtctcttttgaacaagaaaaaaattgttcttatttaattgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcc 1245403  T
Q  167 ttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatca 266  Q
    ||| |||||||||  |||| || ||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  1245404 ttaattatttattgtggagtgaaaaatatatgaaatgagaatttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgaatcaaaagtagtaaca 1245503  T
Q  267 attgttgattttcttg 282  Q
    ||| |||||| |||||    
T  1245504 attattgattgtcttg 1245519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 17718498 - 17718711
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||    
T  17718498 tttttaattgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattaccctta 17718597  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    | |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||| || |    |||| ||||||| ||||| |||||    
T  17718598 gatatttattgcggagaaagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaatagtaacaatt 17718697  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  17718698 attgattgtcttgg 17718711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12249016 - 12248822
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttct-atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  12249016 tttttaagtgtcgcttttgaagaaaaaaaattgttctcatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatcctt 12248917  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
      |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  12248916 gcttatttattgtggagaaagaaatatataaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagta 12248822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15623818 - 15623664
Alignment:
Q  108 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaat 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  15623818 tttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagat 15623719  T
Q  208 attaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||    
T  15623718 attaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaaatagt 15623664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 7483739 - 7483903
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  7483739 tttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttcactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 7483838  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
     |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  7483839 attatttattatg--gagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaa 7483903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 19972275 - 19972445
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  19972275 tttttaagtatcacttttaaaaaaaaattt-gtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 19972373  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||    
T  19972374 gttatttattacagagagagaaatatattaaataagatattaaacgactaaggctattatagtaaaagtata 19972445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21020558 - 21020388
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  21020558 tttttaagtatcacttttaaaaaaaaattt-gtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 21020460  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||    
T  21020459 gttatttattacagagagagaaatatattaaataagatattaaacgactaaggctattatagtaaaagtata 21020388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 35051843 - 35052007
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  35051843 tttttaagtgtctcttttgaaaaaaagtt--gttcctctttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 35051940  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35051941 cttatttattacggagagagaaatgtatgaaattagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaa 35052007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2456320 - 2456162
Alignment:
Q  105 ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||   ||| ||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  2456320 ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcttta---attaattgcg--gagagaaatatataaaataa 2456226  T
Q  205 aatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2456225 aatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 2456162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 236
Target Start/End: Original strand, 31028657 - 31028815
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| | ||||    
T  31028657 tgtcacttttagggaaaatttttgtttttatttaactgtcactttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatgttta 31028756  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  31028757 ttgcggagagagaaacatatgaaatgaaacattaaattaataaggtcattatagtaaaa 31028815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8453478 - 8453270
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||| ||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||      
T  8453478 tttttaagcgtctcttttgaagaat-tttttgcttctatttaactgtcaattttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattaccctcg 8453380  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     |||||||||  |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  8453379 attatttatt--gtggagataaatatatgaaataagatattaaatgaataatgtcattataataaaagtataatttattgcatcaaaagtagtaacaatt 8453282  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
     |||||| ||||    
T  8453281 attgattatctt 8453270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 18842525 - 18842736
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  18842525 tttttaagtgtcacttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttactagttcaatgcaatattaaatgttattttactaatattaccctta 18842624  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||||||| || ||    
T  18842625 ttta-ttattgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagtaacattt 18842723  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
     |||||| |||||    
T  18842724 attgattatcttg 18842736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7606142 - 7605954
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7606142 tttttaagtgtatcttttgaagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttcaagttcaatacaatattaaatgttattttaccaatattatcctta 7606043  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagta 260  Q
     ||||||||   | ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| | ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  7606042 attatttat--ggtagagagaaatatatgaaattagatgttaaataaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcattaaaagta 7605954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8731068 - 8730903
Alignment:
Q  74 taagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtta 173  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||| ||    
T  8731068 taagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttag-ta 8730970  T
Q  174 tttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  8730969 tttattgcggagagagaaatatatg-aataagataataaatgattaaggctattatagtaaaagtata 8730903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35498289 - 35498122
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35498289 tttttgtttctatttaactgtcacttttaaagtttaatgcaacattagatgtagttttatcaatattgtccttagttatttattacagagatagaaatat 35498190  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||| ||   ||||| ||| ||||||  |||||| |||||| ||||  |||||  |||||||||||||    
T  35498189 atgatatgtgatattgaataaataagactattatagtaaaagtataaattattatatcaaaagtagta 35498122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23793520 - 23793354
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| |||| || |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23793520 tttttaattgtcatttttaaaaaaatattttgtttctatttaattgtcattttcaaagttcaatgtaacattgaatgttgttttaccaatattatcctta 23793421  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  23793420 gatatttattacggagagaaaaacatataaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 23793354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26740350 - 26740169
Alignment:
Q  102 tttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaa 201  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  26740350 tttctatttaactctcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaa 26740251  T
Q  202 taaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || |    |||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  26740250 tgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacacttattgattgtcttgg 26740169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 23855551 - 23855745
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaag--aaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  23855551 tttttaagtgtcatttttgaaagaaaaaaatttgtttcaatttaaccgtcactttcaaagtttattgcaacattaaatgttgttt-atcaatattaccct 23855649  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||  | ||||| |||||||||||||    
T  23855650 tagttatttattgtggagagataaatatataaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtatgacgtattgtatcaaaagtagta 23855745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13132353 - 13132169
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||| |||||    
T  13132353 tgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaattta 13132254  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    || | |||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||| |||||| |  |||  |||  |||||||||||||||||||    
T  13132253 ttgcagagagagaaatataggaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgcatcaaaagtagt 13132169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2888713 - 2888500
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||    
T  2888713 tttttaagtgtctcttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttactttactaatattaccctt 2888614  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||  |||||| || |  |||||| ||||||||||| | || |    
T  2888613 atttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatt 2888515  T
Q  269 tgttgattttcttgg 283  Q
    | |||||| ||||||    
T  2888514 tattgattgtcttgg 2888500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8554261 - 8554049
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||||| || ||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  8554261 tttttaagtgtctctcttgtagaatttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattatcctt 8554162  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||||| | || |    
T  8554161 atttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatgttaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagcaacatt 8554063  T
Q  269 tgttgattttcttg 282  Q
    | |||||| |||||    
T  8554062 tattgattgtcttg 8554049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40521488 - 40521337
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||    
T  40521488 tttttaattgtcacttttggagaaatttttt-ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattaccttta 40521390  T
Q  170 gttatttattacggagagagaa--atatatgaaataaaatattaaatgaataa 220  Q
      |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40521389 aatatttattgcggagagagaaacatatatgaaatgaaatattaaattaataa 40521337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 17074825 - 17074636
Alignment:
Q  71 ttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||| |||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  17074825 tttttagtgtctcttttgtagaat-tttttgttcctatttaaatgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgtaattttactaatattatcctta 17074727  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtag 261  Q
     ||||| |||  ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  17074726 tttatt-attgtggagagaaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgcatcaaaagtag 17074636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 261
Target Start/End: Original strand, 17573445 - 17573634
Alignment:
Q  71 ttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||| |||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  17573445 tttttagtgtctcttttgtagaat-tttttgttcctatttaaatgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgtaattttactaatattatcctta 17573543  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtag 261  Q
     ||||| |||  ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  17573544 tttatt-attgtggagagaaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgcatcaaaagtag 17573634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 38074271 - 38074430
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  || ||||  ||||     
T  38074271 tttttaattgtcacttttgtagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttgacattattacccttg 38074370  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     ||||||||| | |||||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||||    
T  38074371 attatttattgcagagagataaatatatgaaatgagatattaaatgagcaagattattat 38074430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27911878 - 27911705
Alignment:
Q  109 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaata 208  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||    
T  27911878 ttaattgtcactttcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaaata 27911779  T
Q  209 ttaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    |||||| |||||||  ||||| |||||| || |    |||| ||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  27911778 ttaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttg 27911705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27958297 - 27958124
Alignment:
Q  109 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaata 208  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||    
T  27958297 ttaattgtcactttcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaaata 27958198  T
Q  209 ttaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    |||||| |||||||  ||||| |||||| || |    |||| ||||||||||||| || || |||||| |||||    
T  27958197 ttaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttg 27958124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43553696 - 43553536
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||||    
T  43553696 tttttaagtgtctcttttagagaatttttttgttcctattaaactgtcactttcgaagttaaatgcaacattaaatgttgttttaccgatatcatcctta 43553597  T
Q  170 gtta-tttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  43553596 cttattttattgcggagagaaaaatatatgaaattagatattgaatgaataaggctattat 43553536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 38221808 - 38221978
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||  || |||  |||||    
T  38221808 tttttaagtgtcatttttagagaaattttttgtc-ctatttaattgtcactttcaaagttcaatataacaataaatgttgttttacaaacattaccctta 38221906  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
     |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  38221907 attatttatcatggagaaagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtata 38221978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 41890517 - 41890676
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||   |||     
T  41890517 tttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacacttg 41890616  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||| ||   |||||| || |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  41890617 attatttcttgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaaggttattat 41890676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41701701 - 41701556
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||    ||||||||||||| | || ||||||||||    
T  41701701 tttttgttcgtatttaactgacacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttcttttaccaacattacttttagttatttattgcagaaagagaaatat 41701602  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||    
T  41701601 atgaaataaaatattaaatgactaagactattatagtaaaaatata 41701556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36112091 - 36112007
Alignment:
Q  165 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  36112091 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattg 36112007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8954944 - 8954785
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||| |||||     
T  8954944 tttttaattgtcatttttgtagaatttttttgtttctaattaactgttactttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttatctttattatccttg 8954845  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||||||   |||||| || |||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  8954844 attatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaagattattat 8954785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 11163261 - 11163454
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |  ||||  ||||     
T  11163261 tttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttg 11163360  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     |||||||||   ||||||||| || ||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | ||||  ||   || |||||||||||||||||    
T  11163361 attatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagta 11163454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 194
Target Start/End: Original strand, 41305666 - 41305763
Alignment:
Q  97 ttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaata 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  41305666 ttttgtttttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagataaata 41305763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 224
Target Start/End: Original strand, 17313126 - 17313226
Alignment:
Q  124 aaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  17313126 aaagttcaacgcaacattaaatgttattttacaaatattaaccttagttatttattgcggagtgagaaatatattaaatgagatattaaatgaataaggt 17313225  T
Q  224 t 224  Q
    |    
T  17313226 t 17313226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13935321 - 13935194
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||  ||||||  ||| | |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||    
T  13935321 tttttaagtgtttcttttggtgaataattttgttcatatttaactgttactttcgaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattatcccta 13935222  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatat 197  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13935221 cttatttattatggagagagaaatatat 13935194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Original strand, 6660974 - 6661092
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||     
T  6660974 tttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatgtccttagtaatttattgcagagagaaaaataa 6661073  T
Q  196 atgaaataaaatattaaat 214  Q
    | ||||||  |||||||||    
T  6661074 aagaaatatgatattaaat 6661092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Original strand, 6741376 - 6741494
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||     
T  6741376 tttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatgtccttagtaatttattgcagagagaaaaataa 6741475  T
Q  196 atgaaataaaatattaaat 214  Q
    | ||||||  |||||||||    
T  6741476 aagaaatatgatattaaat 6741494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40602972 - 40602834
Alignment:
Q  100 tgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatga 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||  | || | || ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40602972 tgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatataacattaaataatgttctttctataatgtctttagtcatttattgcggagagagaaatatatga 40602873  T
Q  200 aataaaatattaaatgaataaggttattat-ggtaaaat 237  Q
    |||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  40602872 aatataatattaaataattaaggatattataggtaaaat 40602834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 162
Target Start/End: Original strand, 8672297 - 8672389
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatatt 162  Q
    ||||||| ||||||||||  | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8672297 tttttaattgtcacttttagaaaaaaaatttgtatctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 8672389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9687711 - 9687588
Alignment:
Q  114 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |  | |||    ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9687711 tgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacaataccatta----tttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaa 9687616  T
Q  214 tgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  9687615 tgactaaggttattatagtaaaagtata 9687588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10086398 - 10086256
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||  |||||||  | ||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| ||||| | | ||  ||||||    
T  10086398 tttttaagtgtcattttttgagaaa--ttttgttcttgtttaactgtcacttttaaagtttagtgcaacaataaatgttgttttaccgacatcatcctta 10086301  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaat 214  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10086300 attatttattgcagagagagaaatatatgaaataatatattaaat 10086256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14511683 - 14511509
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgc--------aacattaaatgttattttatcaatat 161  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |        || |||||||||| |||||  |||||    
T  14511683 tttttaattgtcacttttagagaaaaattttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatacttcaatgtaatattaaatgttgttttactaatat 14511584  T
Q  162 tgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |  |||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  14511583 tacccttagatatttattgcggagagagaagcatataaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 14511509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39615671 - 39615507
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaata 194  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||  | |  ||||||||    
T  39615671 tttttgttgctatttaagtgtcactttacatcgttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattatccttatttatt-attgtgaaatgagaaata 39615573  T
Q  195 tatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagta 260  Q
    |||  ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||||    
T  39615572 tatataatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagta 39615507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 263
Target Start/End: Original strand, 29125905 - 29126090
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | ||||  ||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||  ||||| | |||||   ||||  ||||||    
T  29125905 tgtcacttttgcataaaaaatttgtttttaattaactgtcgttttcaaagtccaatgcattattaaatgtggttttacctatattacgcttatatattta 29126004  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    || | |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| || | ||||  |||  || ||| |||||||||||||    
T  29126005 ttgcagagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattaaggttatcataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta 29126090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 162
Target Start/End: Original strand, 35028603 - 35028693
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatatt 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  35028603 tttttaaatgtcacttttgaagaaaaattttgtttcaattta--tgtcaattttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatatt 35028693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Original strand, 41308013 - 41308104
Alignment:
Q  193 tatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgc-atcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  41308013 tatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcaatcaaaagtagtaacaattattaattgtcttgg 41308104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9301786 - 9301595
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| |  || |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||     ||||  ||||     
T  9301786 tttttaattgtcacttttgca--aattttttgtttctaattaactgtcacttttaaatttcaatacaacattaaatgttgttttgcttttattacccttg 9301689  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     || || |||   | |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | |||| |||   || |||||||||||||||||    
T  9301688 atttttaattgtagggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaatatgaattgttgcatcaaaagtagta 9301595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Original strand, 35029640 - 35029733
Alignment:
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    ||||| ||||||||||||    
T  35029640 tagttatttattgtggagagagaaatatat-aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagt 35029733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 263
Target Start/End: Original strand, 42352742 - 42352926
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | ||||  ||||||| || |||||| ||| ||| |||||||| | || ||||||||||| ||||| | |||||  |||||| ||||||    
T  42352742 tgtcacttttgcataaaaaatttgtttttaattaactctcatttttaaagttcattacatcattaaatgttgtttta-ctatattacccttagatattta 42352840  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    || | ||  || ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   ||||  |||  || |||||||||||||||||    
T  42352841 ttgcagaatgataaatatatgaaatgaggtattaaatgaataaggttattatatgaaaaagataaattgttgcatcaaaagtagta 42352926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 203
Target Start/End: Original strand, 45317655 - 45317780
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||  | ||||| | |||||    
T  45317655 tgtcacttttacagaatttttttgtttccaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataaagcccttaataattta 45317754  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaata 203  Q
    ||   |||||| ||||||||||||||    
T  45317755 ttggagagagaaaaatatatgaaata 45317780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41643640 - 41643542
Alignment:
Q  165 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||  |||  |||||  |||||||||||||    
T  41643640 ccttagttatttattacgaagagagaaataattgaaacaagatattaaatgaatgaggttattattggaaaaggataatttattatatcaaaagtagta 41643542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11016060 - 11015945
Alignment:
Q  120 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatat-tgtccttagttatttatt-acggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaa 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||  | || ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  11016060 tttcaaagttcaatgtaacattaattatt-ttttatcaataaatatcattagttatttatttatggaatgagaaatatatgaaatcgaatattaaatgag 11015962  T
Q  218 taaggttattatggtaa 234  Q
    |||||||||||| ||||    
T  11015961 taaggttattatagtaa 11015945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 188
Target Start/End: Original strand, 30205481 - 30205573
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagaga 188  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| |||| ||||| ||||||| | ||||||    
T  30205481 tttttatttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgtctttagtaatttattgcagagaga 30205573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37998329 - 37998222
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | ||  | ||| | | |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  37998329 tttttgtttttaattaactgttactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgtctt-cctataatattcttagtaatttattgcagagagagaaatat 37998231  T
Q  196 atgaaataa 204  Q
    |||||||||    
T  37998230 atgaaataa 37998222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 146
Target Start/End: Original strand, 40608051 - 40608106
Alignment:
Q  91 gaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatg 146  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40608051 gaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatg 40608106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27193248 - 27193139
Alignment:
Q  120 tttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaata 219  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||||| | |||||  | |||  |||||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||    
T  27193248 tttcaaagttcaatttatcattaaatgtgattttacctatattacctttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattatta 27193149  T
Q  220 aggttattat 229  Q
    ||||||||||    
T  27193148 aggttattat 27193139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41644383 - 41644319
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatatt 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  41644383 tttttgtttctatttaattgtcattttcaaaattcaatgcaatattaaatat--ttttatcaatatt 41644319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 143
Target Start/End: Original strand, 38238925 - 38238985
Alignment:
Q  83 cttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaa 143  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38238925 cttttgtagaatttttttgtttctattcatttgtcattttcaaagttcaatgcaacattaa 38238985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 221
Target Start/End: Original strand, 39663772 - 39663894
Alignment:
Q  98 tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatat 197  Q
    ||||||||||||||| | | | ||||||| || ||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||| | || | | |||| ||||  ||||||||||| ||    
T  39663772 tttgtttctatttaattattattttcaaattttaatacaatattaaatgttgttttaccaaaattattctaattaattt-ttacaaagagagaaatacat 39663870  T
Q  198 gaaataaaatattaaatgaataag 221  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||    
T  39663871 gaaataatatattaaattaataag 39663894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 45400799 - 45400894
Alignment:
Q  84 ttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttatt 179  Q
    ||||| |||| | |||||||||  ||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| | | |||| |||||||||    
T  45400799 ttttggagaataattttgtttcactttatttgtcacttttaaatttcaatgcaacattaattattaatttatcaataatattcttacttatttatt 45400894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28206643 - 28206570
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaa 143  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||| |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||    
T  28206643 tttttaagtgtcatatttgaaagaaaattttgtttttttttaactgtcatttttaaagttcaatacaatattaa 28206570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 105)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 790545 - 790758
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  790545 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttatgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 790644  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  790645 gttatttattgcggagagagaattatatgaactgggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 790744  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  790745 gttgattgtcttgg 790758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 43554385 - 43554597
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43554385 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 43554484  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43554485 gttatttattgcggaaagagaaatatatgaaat-gaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtatgatcaatt 43554583  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  43554584 gttgattgtcttgg 43554597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 54898337 - 54898124
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  54898337 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 54898238  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54898237 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 54898138  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  54898137 gttgattgtcttgg 54898124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47070108 - 47069895
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47070108 tttttaagtgtcactttcgtagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 47070009  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47070008 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaaattattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 47069909  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  47069908 gttgattgtcttgg 47069895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 54106258 - 54106471
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  54106258 tttttaagtgtcacttttgaagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 54106357  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  54106358 gttatttattgcatagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtaatatcaatt 54106457  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  54106458 gttgattgtcttgg 54106471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34266687 - 34266478
Alignment:
Q  72 tttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagt 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34266687 tttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagt 34266588  T
Q  172 tatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgt 271  Q
    ||||||||  |  | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34266587 tatttatt--gctgcgagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgt 34266490  T
Q  272 tgattttcttgg 283  Q
    ||||| ||||||    
T  34266489 tgattgtcttgg 34266478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 19550241 - 19550452
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19550241 tttttaaatgttacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgttttatcaatattgttctta 19550340  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19550341 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaatatcaatt 19550440  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
    ||||||| ||||    
T  19550441 gttgattgtctt 19550452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Original strand, 29651667 - 29651869
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29651667 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttttatttaactgt----ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattatcctta 29651762  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29651763 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaact 29651862  T
Q  270 gttgatt 276  Q
    |||||||    
T  29651863 gttgatt 29651869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53745532 - 53745320
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  53745532 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 53745433  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53745432 gttatttcttgtggagagagaaatatatgaaat-ggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 53745334  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  53745333 gttgattatcttgg 53745320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27484037 - 27483833
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27484037 tttttaagtgttactttttaagaaagtttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 27483938  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27483937 gttatttattgcg--gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 27483840  T
Q  270 gttgatt 276  Q
    |||||||    
T  27483839 gttgatt 27483833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45513866 - 45513673
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45513866 tttttaagtgttacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatattgtcctta 45513767  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45513766 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 45513673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 51244619 - 51244832
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  51244619 tttttaaatgtcacttttgaagaaaaattttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatcctta 51244718  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  51244719 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattataataaaaatatggcttattgcatcaaaactagtatcaatt 51244818  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  51244819 gttgattgtcttgg 51244832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 42672141 - 42671930
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42672141 tttttaagcgtcatttttggagaaaatttttgttcctattcaactgtcacttttaaagttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 42672042  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42672041 gttatttattgcagaaagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtaatatcaatt 42671942  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
    ||||||| ||||    
T  42671941 gttgattgtctt 42671930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 283
Target Start/End: Original strand, 52663435 - 52663650
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  52663435 catttttaagtgtcagttttggagaaattttttgttactatttaattgtcattttcaaagttcaaagcaatattaaacgttgttttaccaatattgtcct 52663534  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52663535 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagcaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 52663634  T
Q  268 ttgttgattttcttgg 283  Q
    || |||||| ||||||    
T  52663635 ttattgattgtcttgg 52663650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33491390 - 33491192
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  33491390 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 33491291  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33491290 attatttattacggagagtgaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaat 33491192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 90 - 275
Target Start/End: Original strand, 6902293 - 6902478
Alignment:
Q  90 agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagag 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6902293 agaaaatttttgtttctatttaactgtcccttttaaagttcaatttaacattaaattttgttttatcaatattgttcttagttatttattacagagagag 6902392  T
Q  190 aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgat 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6902393 aaatatatgaaatgaaatattaaataaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaatgtagtatcaattgttgat 6902478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 29697986 - 29698197
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29697986 tttttaagtgtcattttttgagaaagtttttgttcctatttaattgtcattttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattgtcctta 29698085  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaata-aggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29698086 gttatttattgcggagagagaaatatatg-aatgagatattaaatgaatagaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaat 29698184  T
Q  269 tgttgattttctt 281  Q
    |||||||| ||||    
T  29698185 tgttgattgtctt 29698197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 80 - 276
Target Start/End: Original strand, 46973428 - 46973624
Alignment:
Q  80 tcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttatt 179  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  46973428 tcacttttggagaaaaattttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacatcaaatgttattttaccaatattatccttagttatttatt 46973527  T
Q  180 acggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgatt 276  Q
     |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46973528 gcggagaaagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgatt 46973624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 71 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 51697816 - 51697601
Alignment:
Q  71 ttttaagtgtcacttttg-aagaaaattt-ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  51697816 ttttaagtgtcacttttggaagaaaaaaaattgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttacgaatattgtcctt 51697717  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggt-aaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51697716 agttatttattgcggggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaa 51697617  T
Q  268 ttgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||||| ||||||    
T  51697616 ttgttgattgtcttgg 51697601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Original strand, 36234366 - 36234552
Alignment:
Q  74 taagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtta 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  36234366 taagtgtcacttatgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatccttagtta 36234465  T
Q  174 tttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagta 260  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36234466 ttttttgcggagagagaaatatatgaaataggatattaaatgaataagatcattacagtaaaagtatagcttattgtatcaaaagta 36234552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40140080 - 40139872
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  40140080 tttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcacttt-----ttcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattaccctta 40139986  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  40139985 attatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatt 40139886  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  40139885 attgattgtcttgg 40139872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 68 - 268
Target Start/End: Original strand, 28885671 - 28885870
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  28885671 catttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcct 28885770  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||| |||    
T  28885771 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagt-aaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaa 28885869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 121 - 276
Target Start/End: Original strand, 27992286 - 27992441
Alignment:
Q  121 ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27992286 ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgccgagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataa 27992385  T
Q  221 ggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgatt 276  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27992386 ggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgatt 27992441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43775641 - 43775443
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  43775641 tttttaactgtctcttttgaagaaattttttgttttcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 43775542  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43775541 gctatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 43775443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 269
Target Start/End: Original strand, 17102749 - 17102948
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  17102749 tttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 17102848  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17102849 gttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataaattattgcatcaaaagtagtaacaatt 17102948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 52627489 - 52627276
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaa-gttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  52627489 tttttaagtgtcacttttggagaagttttttgtttctatttaattgtcacttttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctt 52627390  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  52627389 agttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-ggatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatatcaat 52627291  T
Q  269 tgttgattttcttgg 283  Q
     ||| ||| ||||||    
T  52627290 cgttaattatcttgg 52627276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13158692 - 13158477
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaattt-ttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||    
T  13158692 tttttaagtgtcacttttgaagaaaaaaaattgtttctatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatataatcct 13158593  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  13158592 tagttatttattgcggagagagaaatataagaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattatatcaaaagtagtatcaa 13158493  T
Q  268 ttgttgattttcttgg 283  Q
    || || ||| ||||||    
T  13158492 ttttttattgtcttgg 13158477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 50091940 - 50092111
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  50091940 tttttaagtgttatttttggagaaactttttgttcctacttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattttcctta 50092039  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  50092040 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtata 50092111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 260
Target Start/End: Original strand, 7328450 - 7328640
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  7328450 tttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatcctta 7328549  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagta 260  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7328550 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataatgaaagtataacttattgcatcaaaagta 7328640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45101582 - 45101396
Alignment:
Q  97 ttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatata 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45101582 ttttgttcctatttaactgtcactttgaaagttccatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 45101483  T
Q  197 tgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  45101482 tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataggaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagcatcagctgttgattgtcttgg 45101396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 223
Target Start/End: Original strand, 20105187 - 20105340
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20105187 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctctttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 20105286  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggt 223  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  20105287 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgggatattaaatgaataaggt 20105340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 24981290 - 24981496
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||    
T  24981290 tttttaagtgtcacttt-gaagaaattttttgtt-caa---aactatcactttcaaagttcgatgcaacattaaatattgttttaccaatattgtcttta 24981384  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24981385 gttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt 24981484  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
    ||||||| ||||    
T  24981485 gttgattatctt 24981496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 32980635 - 32980848
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||  |||||    
T  32980635 tttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatacaacattaaataatgttttatcaatattaccctta 32980734  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  32980735 gttatttattgtagagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcagtataataaaagtataacttattgcatcaaaagtattaacaatt 32980834  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  32980835 attgattgtcttgg 32980848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32854189 - 32854028
Alignment:
Q  80 tcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttatt 179  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  32854189 tcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttatcaacattacccttagttatttatt 32854090  T
Q  180 acggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  32854089 gcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtata 32854028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 54911526 - 54911341
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  | ||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  54911526 tttttgtttatatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttatcaatattacctttaattatttattgtggagtgagaaatat 54911427  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttctt 281  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  54911426 atgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtctt 54911341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3376559 - 3376344
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3376559 tttttaagtgtctcttttaaagataatatttgtttctatttaactgtcagtttcaaagtccaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcctta 3376460  T
Q  170 gttatttattacggagagag----aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatc 265  Q
    |||||||||| |||||||||    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||| ||| |||| ||||| |    
T  3376459 gttatttattgcggagagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatacaacttattacataaaaaatagtaac 3376360  T
Q  266 aattgttgattttctt 281  Q
    |||  |||||| ||||    
T  3376359 aatcattgattatctt 3376344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 255
Target Start/End: Original strand, 13168011 - 13168197
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  13168011 tttttaagtgtcacttttagagaaaattattgttcttatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 13168110  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaa 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || || |||||| |||| |||||||||||||    
T  13168111 agttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagctaatcatagtaaaagtataacttattgcatcaa 13168197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27039857 - 27039691
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  ||||     
T  27039857 tttttaagtgtcactttaggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttg 27039758  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27039757 attatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggctattatagtaaaa 27039691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 35315127 - 35315339
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||  |||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| || |||    
T  35315127 tttttaagtgtctttttttaagaatttttttttttctatttaattgtcattttcaaagttcaatacaaccttaaatgttgttttaccaatattatcttta 35315226  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||||||| ||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  35315227 gttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatt 35315326  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  35315327 gttgattgtcttg 35315339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 41168756 - 41168966
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||||| || | ||||   ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || |||    
T  41168756 tttttaagtgtcacttctgcaaaaaaaaattgttcctatttaactgtcattttcaaacttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattatcttta 41168855  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaa---agtagtatca 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||      | |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  41168856 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattat------agtatagcttattgcatcaaaagtagtagtatca 41168949  T
Q  267 attgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||||| ||||||    
T  41168950 attgttgattgtcttgg 41168966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 48151980 - 48152146
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  48151980 tttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccctta 48152079  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||||||||||   || |||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  48152080 gttatttattgttgaaagagaaatatataaaatgagatatcaaatgaataaggttattatagtaaaa 48152146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 90 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 51219315 - 51219144
Alignment:
Q  90 agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagag 189  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  51219315 agaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag 51219216  T
Q  190 aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttg 273  Q
    |||||||||            ||||||||||| | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51219215 aaatatatg------------aaatgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttg 51219144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39867099 - 39866887
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | ||||    
T  39867099 tttttaagtgtctcttttggagaattttttt-ttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattattctta 39867001  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  39867000 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaaaaacaatt 39866901  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  39866900 attgattgtcttgg 39866887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3643447 - 3643241
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaattttt-gtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  3643447 tttttaattgtcacttttagagaaatttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac-ttaaatgttgttttatcaatattaccctt 3643349  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |  | |||| ||||||||||||| || |    
T  3643348 agatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacatt 3643249  T
Q  269 tgttgatt 276  Q
    | ||||||    
T  3643248 tcttgatt 3643241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5244186 - 5244015
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||| |||||||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  5244186 tttttacgtgtcactttcggataaaatttttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 5244087  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  5244086 gttatttattgcagagagagaaatatatggaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtata 5244015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 11473397 - 11473568
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  11473397 tttttaaatgtcacttttggagaaattttttgttcctgtttaactttcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 11473496  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  11473497 gttatttattgcggaaagagaagtatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtata 11473568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30861795 - 30861622
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||    
T  30861795 catttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcattatcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccct 30861696  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||    
T  30861695 tagctatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtata 30861622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 270
Target Start/End: Original strand, 49123556 - 49123720
Alignment:
Q  108 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaat 207  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  49123556 tttaagtgtcactttcaaagatcaatgcaacattaaatattgttttactaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagat 49123655  T
Q  208 attaaatgaataaggttattatggtaaaa--ttatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattg 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49123656 attaaatgaataaggtcattatagtaaaagtgtatagtttattgcatcaaatgtagtatcaattg 49123720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 283
Target Start/End: Original strand, 43945443 - 43945587
Alignment:
Q  139 attaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaatt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||  |||||| |    
T  43945443 attaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattacagtaaaagt 43945542  T
Q  239 atagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  43945543 atagtttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttgg 43945587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 84 - 283
Target Start/End: Original strand, 45145138 - 45145336
Alignment:
Q  84 ttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacgg 183  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  45145138 ttttggagaaaatttttattcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatcctta-ttatttattgcgg 45145236  T
Q  184 agagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    | ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||| ||  |||| |||||| ||||||    
T  45145237 aaagagatatatatgaaatgagatgttaaatgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcagcaaaagtaataataattattgattgtcttgg 45145336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47104406 - 47104240
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||    
T  47104406 tttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcatta 47104307  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | ||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  47104306 gatatttattgtgaagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaagtcattatagtaaaa 47104240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40010913 - 40010749
Alignment:
Q  72 tttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagt 171  Q
    |||||||||||||||   |||||| |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | |||  |||||||    
T  40010913 tttaagtgtcactttaagagaaaaattttgttcatatttaactttcattttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccgacattacccttagt 40010814  T
Q  172 tatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  40010813 tatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaa 40010749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42515421 - 42515257
Alignment:
Q  72 tttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagt 171  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||  | ||||     
T  42515421 tttaattgtcactttttgagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacaattattacctttaga 42515322  T
Q  172 tatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  42515321 tatctattacggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggcgattatagtaaaa 42515257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44544420 - 44544296
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  44544420 tttttaagtgtctcttttgaaaaaaaaaattgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcctta 44544321  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaata 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  44544320 gttatttattgcggagagagaaata 44544296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 202
Target Start/End: Original strand, 48214062 - 48214194
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  48214062 tttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccctta 48214161  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaat 202  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  48214162 gttatttattgtggagagagaaatatataaaat 48214194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 55141724 - 55141561
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  55141724 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttcaatttaactc---ctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccctta 55141628  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||||||||||   || ||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55141627 gttatttattgttgaaagataaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaa 55141561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24276 - 24122
Alignment:
Q  109 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaata 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||  | |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24276 ttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttgctaatttattttggagaaagaaatatatgaaatgaaata 24177  T
Q  209 ttaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  24176 ttaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagta 24122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27028241 - 27028115
Alignment:
Q  95 atttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27028241 atttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattacccttggttatttattgcggagagagaaata 27028142  T
Q  195 tatgaaataaaatattaaatgaataag 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27028141 tatgaaataagatattaaatgaataag 27028115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41351446 - 41351252
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttca-aagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| || ||    
T  41351446 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttttgaagttcaatgcatcattaaatattgttttaccaatattatcttt 41351347  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
      |  ||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||  |||||||||||||    
T  41351346 gttcgtttattgtgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattatatcaaaagtagta 41351252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54334433 - 54334275
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  54334433 tttttaagtgtca-ttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 54334335  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     ||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||    
T  54334334 tttatttatcgcggagagaaaaatatatgacataagatattaaataactaaggctattat 54334275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33874789 - 33874631
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  33874789 tgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatagtgttttaccaatattacccttagatattta 33874690  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    || ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  33874689 ttgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaa 33874631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 23771282 - 23771475
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||  ||||     
T  23771282 tttttaattgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttacctttattacccttg 23771381  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     |||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||  |||  || ||| |||||||||||||    
T  23771382 attatttattgtagagagagaaatacatgaaataagatattaaatgatgaaggttattatagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta 23771475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 51064878 - 51065091
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  51064878 tttttaattgtcatttttggagaatttttttgttcctgattaactgtcactttcaaagttcaatacaatattaaatgttattataccaatattatcctta 51064977  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| || ||| || |    |||| ||||||||||||| || ||    
T  51064978 gatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattatagtgaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacattt 51065077  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  51065078 attgattgtcttgg 51065091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 262
Target Start/End: Original strand, 35077390 - 35077574
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||| |||||    
T  35077390 tgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaattta 35077489  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    || | |||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||| |||||| |  |||  |||  |||||||||||||||||||    
T  35077490 ttgcagagagagaaatataggaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgcatcaaaagtagt 35077574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 41926671 - 41926866
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaattt-ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||    
T  41926671 tttttaagtgtctcttttgaagaaaaaaaattgttcctatttaactatcactttcaaagtttcatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatcgtt 41926770  T
Q  169 agttatttattacggaga-gagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||| | || ||||||||||||| | || || |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41926771 agttatttattgcggagataaaaaaaatatgaaatgagatgttaaatgaataagatcatcatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagta 41926866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 53281974 - 53282145
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||| | |||||| | | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  53281974 tttttaagggtcacttttggagaaattctttgctcctatttgagtatcactttcaaggttcaatgcagcaataaatgttgttttaccaacattaccctta 53282073  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||    
T  53282074 attatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaaatata 53282145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25983868 - 25983703
Alignment:
Q  115 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| | |  ||||||    
T  25983868 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatataaaatgagaagttaaat 25983769  T
Q  215 gaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttctt 281  Q
    ||| || || ||||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||    
T  25983768 gaacaaagtcattatagtaaaagtataacttatt-catcaaaaatagtaacaattgtagattatctt 25983703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 41425624 - 41425837
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||    
T  41425624 tttttaagtgtctcttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttactttactaatattaccctt 41425723  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||  |||||| || |  |||||| ||||||||||| | || |    
T  41425724 atttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatt 41425822  T
Q  269 tgttgattttcttgg 283  Q
    | |||||| ||||||    
T  41425823 tattgattgtcttgg 41425837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40319179 - 40318966
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||    
T  40319179 tttttaagtgtctcttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttactttactaatattaccctt 40319080  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||  |||||| || |  |||||| ||||||||||| | || |    
T  40319079 atttatt-attgtggagagagaaatatatctaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatt 40318981  T
Q  269 tgttgattttcttgg 283  Q
    | |||||| ||||||    
T  40318980 tattgattatcttgg 40318966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33074527 - 33074316
Alignment:
Q  71 ttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  ||||| || |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||    
T  33074527 ttttaagtgtctcttttaaagaat-tttttattcctatttaagtatcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattactctta 33074429  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||||| | || ||    
T  33074428 tttatt-attgcggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagcagcattt 33074330  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  33074329 attgattgtcttgg 33074316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 260
Target Start/End: Original strand, 45055180 - 45055372
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaattttt-gtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcc 166  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||     
T  45055180 catttttaagtgtctattttgaagaattttttttgttccaatttaac-gtcactttcaaagtttaatgcatcattaaatgttgttttactaatattatct 45055278  T
Q  167 ttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagta 260  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  45055279 tttattatttattgcggagagagaaatataagaaatgagatgttaaattaataatgtcattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagta 45055372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43160011 - 43159859
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  43160011 tttttaattatcacttttagagaaaaaaattgtttttatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgatttatcaatattaccctta 43159912  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataagg 222  Q
      |||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43159911 aatatttattgcagagagaaaaacatataaaataaaatattaaattaataagg 43159859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22100076 - 22099909
Alignment:
Q  69 atttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||||    
T  22100076 atttttaagtatctcttttggagaaaatttttgtttttatttaactgttattttcgaagttcaatgcaacattaaatattactttactaatattatcctt 22099977  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | |||||||||| ||| |||||||| || ||| |     |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22099976 acttatttattatggaaagagaaatgtaagaagtttgtgattaaatgaataagattattatagtaaaa 22099909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 49168359 - 49168518
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||   ||||    
T  49168359 tttttaagtatcatttttggagaaattttctgtttctatttaattgtcaattttaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattactctta 49168458  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  49168459 gttatttattgaggagagaaaaatatttgaaataatatattaaatgactaagattattat 49168518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 220
Target Start/End: Original strand, 52175743 - 52175865
Alignment:
Q  98 tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatat 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || ||   |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  52175743 tttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattatctttgaatatttattgcggagagaaaaacatat 52175842  T
Q  198 gaaataaaatattaaatgaataa 220  Q
    ||||| ||||||||||| |||||    
T  52175843 gaaatgaaatattaaattaataa 52175865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20848962 - 20848809
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||| |         
T  20848962 tgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattactcttagat----- 20848868  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  20848867 ttgcggaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaa 20848809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Original strand, 28226448 - 28226579
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| || ||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  28226448 tttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttatt--gcagagagaaatat 28226545  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  28226546 atgaaatatgatattaaataattaaggatattat 28226579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 53290986 - 53290853
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || ||||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  53290986 tttttgtttttaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttattttttctataatgcccttaataatttattgcagagagagaaatat 53290887  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    | ||||||  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  53290886 aagaaatatgatattaaataattaaggatattat 53290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28943704 - 28943614
Alignment:
Q  151 tttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||    
T  28943704 tttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtata 28943614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 42671605 - 42671473
Alignment:
Q  128 ttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttatt 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  42671605 ttcaatgcaacattaaatgttaatttattaatattatccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaagttatt 42671507  T
Q  228 atggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtag 261  Q
    || ||| || ||||  |||||| |||||||||||    
T  42671506 atagtacaaatataaattattgtatcaaaagtag 42671473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 2642705 - 2642789
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta 154  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2642705 tttttaattgtcacatttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 2642789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22174093 - 22173925
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| || |    
T  22174093 catttttaagtgtcttttttggataaattttttgtttttatttaactgttattttcgaagttcaatgcaacattaaatattactttactaatattatctt 22173994  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    || |||||||||| ||| |||||||| || ||| |     |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22173993 tacttatttattatggaaagagaaatgtaagaagtttgtgattaaatgaataagattattatagtaaaa 22173925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 148
Target Start/End: Original strand, 29803628 - 29803708
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29803628 catttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcatatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt 29803708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31610333 - 31610167
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||  | | | |||||||||||  |||||||||||||    
T  31610333 tttttctttctatttaagtgtcattttcaaagtttaatacaatattaaatgttattttaccaatatact-catggttatttattatagagagagaaatat 31610235  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||| || ||||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||  | |||| || ||||||||||    
T  31610234 atgaaacaatatattaaataaatgaggctattattgaaaaatgataaataattgtattaaaagtagta 31610167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Original strand, 52173749 - 52173895
Alignment:
Q  78 tgtcactttt-gaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattt 176  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  | ||   |||||    
T  52173749 tgtcacttttagaagaaaaaaattgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattacctttgaatattt 52173848  T
Q  177 attacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggt 223  Q
    ||| | |||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  52173849 attgcagagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaactaataaggt 52173895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 263
Target Start/End: Original strand, 34750658 - 34750843
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||   |||  | |||||  |||||  ||||||    
T  34750658 tgtcacttttgcataaaaattttgtttctaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttgcctatattacccttatatattta 34750757  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||  |||  || ||| |||||||||||||    
T  34750758 ttgcagagagagaaatatatgaaatgaagcattaaataattaaggttattataggaaaaagataatttgttgtatcaaaagtagta 34750843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2154261 - 2154198
Alignment:
Q  99 ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatatt 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2154261 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtcttatcaatatt 2154198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35458726 - 35458563
Alignment:
Q  99 ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatg 198  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  | |||  | ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||    
T  35458726 ttgtttttaattaactgtcactttcaaagttcaatgtgacattaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattagagagagaaaaatatatg 35458627  T
Q  199 aaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| |||||| |  |||  |||  |||||| ||||||||||||    
T  35458626 aaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagt 35458563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44092280 - 44092181
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  44092280 tttttaattgtcacttttagagaagaattttgttcatatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 44092181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36371081 - 36370866
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaattttt--gtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcc 166  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||  ||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  ||    
T  36371081 tttttaagtgtctcttttggagaatttttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaatattaaatgttactttactaatattaccc 36370982  T
Q  167 ttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatca 266  Q
    ||| ||||| | |  ||||||| |||||||||  || | ||||||||| |||||||||||||  |||||| || |  |||||| ||||||||||| | ||    
T  36370981 ttatttatt-actgtggagagaaaaatatatgttatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaaca 36370883  T
Q  267 attgttgattttcttgg 283  Q
     || |||||| ||||||    
T  36370882 tttattgattgtcttgg 36370866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 283
Target Start/End: Original strand, 29803727 - 29803856
Alignment:
Q  142 aaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||            |||||||||||| | ||||| |||||| ||||    
T  29803727 aaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatat------------taaatgaataagatcattatagtaaaagtata 29803814  T
Q  242 gcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  29803815 acttattgcatcaataatagtatcaattgttgattgtcttgg 29803856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 1201058 - 1201134
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatg 146  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1201058 tttttaattgtcacatttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatg 1201134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Original strand, 24569571 - 24569735
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  | ||| ||  |||| | ||||||| | |||| | ||||||    
T  24569571 tttttgtttctaattaattgttactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttatttttcctataatgctcttaataatttattgcagagacaaaaatat 24569670  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagta 260  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||||  |||||| |  |||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  24569671 atgaaatatgatattaaataattaagaatattataggcaaaacataacttattgtatcaaaagta 24569735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8237045 - 8236954
Alignment:
Q  171 ttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||  | ||||||||||    
T  8237045 ttatttattaccgagagaaaaatatatgaaattagatattaaatgaacaaggttattatagtaaaagtataaattattataacaaaagtagt 8236954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Original strand, 26748387 - 26748541
Alignment:
Q  109 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaata 208  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||| | |||||  |||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||| || ||    
T  26748387 ttaactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagta 26748486  T
Q  209 ttaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||| | |||||||||||| | ||||  |||  || ||| |||||||||||||    
T  26748487 ttaaattattaaggttattatagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta 26748541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29458342 - 29458241
Alignment:
Q  182 ggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttctt 281  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||||||||| | || || |||||| ||||    
T  29458342 ggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtctt 29458243  T
Q  282 gg 283  Q
    ||    
T  29458242 gg 29458241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 44544155 - 44544079
Alignment:
Q  193 tatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| || |||||    
T  44544155 tatatgaaatgagatattaaatgaaaaaggttattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtattaacaatt 44544079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 47844081 - 47844006
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttt 153  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  47844081 tgtcacttttacataaattttttatttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgtttt 47844006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40113459 - 40113365
Alignment:
Q  109 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaata 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||  | ||||| | |||||||   |||||| || |||||||||||    
T  40113459 ttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataaagcccttaataatttattggagagagaaaagtatatgaaata 40113365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42634568 - 42634431
Alignment:
Q  100 tgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta---gttatttattacggagagagaaatata 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||| || |||    |||||||||| |  ||||||||||||    
T  42634568 tgtttatatttaactgtcacttttgaagttcagtgcaatattaaatattgttttataaatattatcgttacttcttatttattatg--gagagaaatata 42634471  T
Q  197 tgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |||| | |   ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42634470 tgaagttagtgattaaataaataaggttattatagtaaaa 42634431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29458973 - 29458865
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttt--ctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcc 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||| |||  |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||    
T  29458973 tttttaagtgtctcttttgaagatttttttttttttcctatttaagtgtcactctacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattaccc 29458874  T
Q  167 ttagttatt 175  Q
    ||| |||||    
T  29458873 ttatttatt 29458865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 194
Target Start/End: Original strand, 18355897 - 18356007
Alignment:
Q  84 ttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacgg 183  Q
    |||||||||| | |||||||||  ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||  |||||||||| |  ||||| |||||||||   |    
T  18355897 ttttgaagaataattttgtttcactttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgatttatcaataatacccttacttatttattgtag 18355996  T
Q  184 agagagaaata 194  Q
    |||||||||||    
T  18355997 agagagaaata 18356007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3035636 - 3035589
Alignment:
Q  98 tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaat 145  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3035636 tttgtttctatttatttgtcgttttcaaagttcaatgcaacattaaat 3035589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 243 - 282
Target Start/End: Original strand, 20105349 - 20105388
Alignment:
Q  243 cttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20105349 cttattgcatcaaaagtggtatcaattgttgattgtcttg 20105388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 32853542 - 32853400
Alignment:
Q  137 acattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  | |||  |||||||| | |||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  32853542 acattaaatgttgttttaccaatattacctttaaatatttattgcagagagagaaacat--gaaatgaaatattaaattaataaggtcgttatagtaaaa 32853445  T
Q  237 ttatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttctt 281  Q
     || |    |||| ||||||||||||| || || |||||| ||||    
T  32853444 gtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtctt 32853400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 69095 - 69307
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  69095 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 69194  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  69195 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtat-aatt 69293  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  69294 gttgattgtcttgg 69307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26373 - 26160
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26373 tttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 26274  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26273 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaattgaatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaatt 26174  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  26173 gttgattgtcttgg 26160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 17193153 - 17193366
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17193153 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaaatgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 17193252  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17193253 gttatttattgcggagagagatatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaataataacttattgcatcaaaagtaggatcaatt 17193352  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  17193353 gttgattgtcttgg 17193366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 24663374 - 24663587
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  24663374 tttttaagtatcacttttggagaaaatttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgttctta 24663473  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24663474 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaatt 24663573  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  24663574 gttgattgtcttgg 24663587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1751677 - 1751465
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1751677 tttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactttcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 1751578  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| | |||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1751577 attatttattgcagagaaagaaatatatgaaaagagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 1751478  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
    ||||||| |||||    
T  1751477 gttgattatcttg 1751465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 3621585 - 3621798
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||| ||||||    
T  3621585 tttttaagtgtcacttttgaagaaaaaatttatttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttctaccaatattatcctta 3621684  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3621685 gttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 3621784  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  3621785 gttgattgtcttgg 3621798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 17835888 - 17836101
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  17835888 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgttactttcaaattttaatgcaacattaaatgtttttttaccaatattatcctta 17835987  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17835988 attatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaagtagaatcaatt 17836087  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  17836088 gttgattgtcttgg 17836101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 283
Target Start/End: Original strand, 373716 - 373931
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  373716 catttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaattttaaatgttgttttaccaatattgtcat 373815  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  373816 tatttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaa 373915  T
Q  268 ttgttgattttcttgg 283  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  373916 ttgctgattgtcttgg 373931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23923959 - 23923746
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  23923959 tttttaagtgtcacttttggagagattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacgttaaatgctgttttatcaatattatcctta 23923860  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23923859 gttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaactgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattacattaaaagtagtatcaatt 23923760  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  23923759 gttgattgtcttgg 23923746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 255
Target Start/End: Original strand, 30388716 - 30388901
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||    
T  30388716 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatgctta 30388815  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaa 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30388816 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaa 30388901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 364789 - 364575
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttt-atcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||    
T  364789 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttactatttaactgtcattttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgtttttaccaatattgtcatt 364690  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  364689 aattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaagaaaatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaagatcaat 364590  T
Q  269 tgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||| ||||||    
T  364589 tgttgattgtcttgg 364575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26470969 - 26470756
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  26470969 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatcctta 26470870  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26470869 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatt 26470770  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  26470769 attgattgtcttgg 26470756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 84 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 17124215 - 17124020
Alignment:
Q  84 ttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacgg 183  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||     
T  17124215 ttttggagaaaagttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcg- 17124117  T
Q  184 agagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttctt 281  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17124116 -gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattgtctt 17124020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 8992543 - 8992736
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  8992543 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcatatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatcctta 8992642  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  8992643 gttatttattacggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagta 8992736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 9016990 - 9017183
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  9016990 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcatatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatcctta 9017089  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9017090 gttatttattacggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagta 9017183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22784914 - 22784701
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  22784914 tttttaagtgtctcttttgaagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 22784815  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
     |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| ||    
T  22784814 cttatttattgtggagagaaaaatatattaaataaattattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatacattattgtatcaaaagtagtatcattt 22784715  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||| | ||||||    
T  22784714 attgaatatcttgg 22784701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 96 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30416295 - 30416108
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30416295 tttttgtttctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttagttatttatggcggagagagaaatat 30416196  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  30416195 atgaaacagaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttgg 30416108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9838368 - 9838162
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  9838368 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctta 9838269  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||   |||||| ||||||||||||| || ||    
T  9838268 gttatttattgcggagagggaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacattt 9838169  T
Q  270 gttgatt 276  Q
     ||||||    
T  9838168 attgatt 9838162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 282
Target Start/End: Original strand, 12732186 - 12732382
Alignment:
Q  85 tttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacgga 184  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||| ||||    
T  12732186 tttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgttttaccactattatcct-agttatttattgcgga 12732284  T
Q  185 gagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12732285 gagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataatatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttaattgtcttg 12732382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 22050044 - 22050256
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||    
T  22050044 tttttaatcgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatatac-cctta 22050142  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22050143 aatatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatt 22050242  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  22050243 attgattgtcttgg 22050256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 8176431 - 8176640
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||| || ||     
T  8176431 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgtt---ttaccaatattatctttt 8176527  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  8176528 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaacaatt 8176627  T
Q  270 gttgattttcttg 282  Q
     |||||| |||||    
T  8176628 attgattgtcttg 8176640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 23777291 - 23777484
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||     
T  23777291 tttttaagtgtcaattttggagaaattttttgttcctatttaactatcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttg 23777390  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     | |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  23777391 ctcatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagta 23777484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 1252161 - 1252372
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||  || ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  1252161 tttttaagtgtcatttttggaaaaaaaatt-gttcctatttaattgtctttttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 1252259  T
Q  170 gttattt-attacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 268  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1252260 gttgttttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattacatcaaaagtagtatcaat 1252359  T
Q  269 tgttgattttctt 281  Q
    |||||||| ||||    
T  1252360 tgttgattgtctt 1252372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7056362 - 7056196
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaact--gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaat 193  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7056362 tttttgtttctatttaactctgtcactttcaaaattcaatccaacattaaatgttgatttatcaatattatctttagttatttattgcggagagagaaat 7056263  T
Q  194 atatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagta 260  Q
    ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  7056262 atatgaaatgagatattaaatgaccaaggttattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagta 7056196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17251502 - 17251336
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  17251502 tttttaattatcacttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccctta 17251403  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | |||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17251402 gatatttattgcaaagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 17251336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24356300 - 24356134
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  24356300 tttttaattgtcacttttagagaaatttattgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattaccctta 24356201  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  24356200 gatatttattccggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaatcaacaaggtcattatagtaaaa 24356134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 27313495 - 27313711
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  27313495 tttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaaatgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgttgatttaccaatattatcctta 27313594  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaa---tatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatca 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||   |||||||||| | || ||||||||| ||| | ||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||  | ||    
T  27313595 gttatttattgcggagagagaaatagtatatgaaatgagatgttaaatgaacaagataattatagaaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaaaca 27313694  T
Q  267 attgttgattttcttgg 283  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  27313695 attattgattatcttgg 27313711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 34378854 - 34379020
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  34378854 tttttaagtgtcatttttggaaaaaaaatttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 34378953  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||||    
T  34378954 gttatttattatggagagtgaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggcttttatagtaaaa 34379020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Original strand, 52658 - 52834
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||  |||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||    
T  52658 tttttaagtgtttcttttggagattttttttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaattatgttttatcaatattaccctta 52757  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagctta 246  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||    
T  52758 attatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataactta 52834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31244997 - 31244829
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| | ||    
T  31244997 catttttaattgtcatttttagagaaattttttgtttgtatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaattcttgttttatcaatattattct 31244898  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  31244897 tagatatttattgtggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 31244829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 108 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7632245 - 7632071
Alignment:
Q  108 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||    
T  7632245 tttaactgtcactttcaaagttcaaagcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagat 7632146  T
Q  208 attaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
     |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||||    
T  7632145 gttaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtaataattattgattgtcttg 7632071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 34730555 - 34730748
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||  |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  34730555 tttttaagtgtttcttttgaacaaatattttgtttcaatttaactgtcacttttaaagttcaacgtaacattaaatggtgttttatcaatattatcctta 34730654  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     ||||||||| |  ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||| |||||||||||||    
T  34730655 cttatttattgcaaagagataaatatatgaaattagatattgaatgaataaggttattatagtaaaaatatacattgttgtatcaaaagtagta 34730748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31854737 - 31854570
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  31854737 tttttaagtgttacttttggagaaaaattttgtttttatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttattttaccaacattaccctta 31854638  T
Q  170 gttatttatt--acggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaa 235  Q
    ||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  31854637 gttatttattgcaaagagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaa 31854570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32359648 - 32359473
Alignment:
Q  103 ttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  32359648 ttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaat-ttgttttaccaat--tatccttagttatttattgcggagagaga--tatatgaaat 32359554  T
Q  203 aaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
     | ||||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||| ||||||    
T  32359553 gagatatttaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagaagtgtcaattattaattgtcttgg 32359473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 235
Target Start/End: Original strand, 24635703 - 24635868
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  24635703 tttttaagtgtcccttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgtaacaatgaatgttgttttaccaacattaccctta 24635802  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaa 235  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  24635803 gttatttattgcagagagagaaatatgtgatataagatattaaatgactaaggctattatagtaaa 24635868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 30236973 - 30237166
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  |||||    
T  30236973 tttttaaatgttacttttggagaaaaaatttgtttcaatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattaccctta 30237072  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||   || |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    ||||| |||||||||||||    
T  30237073 gttatttattgttgaaagagaaatatataaaatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagta 30237166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 229
Target Start/End: Original strand, 33260715 - 33260854
Alignment:
Q  90 agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagag 189  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| | |||||| |||||||||    
T  33260715 agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatgtttattgcggagagag 33260814  T
Q  190 aaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  33260815 aaacatatgaaatgaaacattaaattaataaggtcattat 33260854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 263
Target Start/End: Original strand, 7235435 - 7235628
Alignment:
Q  71 ttttaagtgtcacttttgaagaaaatt-tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   ||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||  ||||||  |||||    
T  7235435 ttttaagtgtcatttttgaagaaaaaaatttattttaatttaactgtcactttcaaagtttaatgtaatattaaatgttgttttactaatattaccctta 7235534  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||| |||||||||||||    
T  7235535 gttatttattgtggagagagggatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatattgtattgtatcaaaagtagta 7235628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Original strand, 34607093 - 34607286
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||  |||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  34607093 tttttaagtgtttcttttgaacaaatattttgttccaatttaactgtcacttttaaagttcaatgtaatattaaatggtgttttaccaatattatcctta 34607192  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     ||||||||| | |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||  || ||| |||||||||||||    
T  34607193 cttatttattgcagagagagacatatatgaaattagatattaaacgaataagattattatagtaaaagtatacattgttgtatcaaaagtagta 34607286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11676846 - 11676695
Alignment:
Q  82 acttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattac 181  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||      
T  11676846 acttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattactcttagatatttatt-- 11676750  T
Q  182 ggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  11676749 gcagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaa 11676695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11431366 - 11431212
Alignment:
Q  107 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaa 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||| |    
T  11431366 atttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaaccttagttatttattgtcgagagataaatataggaaataaga 11431267  T
Q  207 tattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtag 261  Q
    |||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||    
T  11431266 tattaaattagtaaagttattatcgtaaaagtataagttattgtatcaaaagtag 11431212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Original strand, 24948246 - 24948399
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||  ||||||  |||| | ||||||    
T  24948246 tgtcacttttagagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatagtgttttactaatattacccttggatattta 24948345  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatgg 231  Q
    || ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24948346 ttgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatgg 24948399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22400810 - 22400644
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  22400810 tttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctta 22400711  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
     |||||||||| |  ||||||||| |||||| | |   ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22400710 cttatttattatgaggagagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataatgttattatagtaaaa 22400644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 162
Target Start/End: Original strand, 3849060 - 3849152
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatatt 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3849060 tttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 3849152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17601386 - 17601220
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  17601386 tttttaagtgtcacttttggagattttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattaccctt 17601287  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17601286 atttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaa 17601220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 283
Target Start/End: Original strand, 3850408 - 3850528
Alignment:
Q  165 ccttagttatttattacggagagagaaatat--atgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  3850408 ccttagttatttattacggagggagatatatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttgtggcatcaaaagtagt 3850507  T
Q  263 atcaattgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  3850508 atcaattgttgattgtcttgg 3850528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32251188 - 32251004
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| | |||||  |||||| || |||    
T  32251188 tgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcgttttcaaagtccaatacatcattaaatgttgttttacctatattacccttagata-tta 32251090  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    || | |||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| | ||||  |||  || |||||||||||||||||    
T  32251089 ttgcagagagagaaatatatgaaatgaggtattaaatgattaaggttattataggaaaaagataaattcttgcatcaaaagtagta 32251004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 263
Target Start/End: Original strand, 13597443 - 13597597
Alignment:
Q  108 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaat 207  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||    
T  13597443 tttaattgttactttcaaagtttaatgtaaaattaa-tgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagaaagaaatttatgaaatgagat 13597541  T
Q  208 attaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||| ||||  |||||  |||||||||||||    
T  13597542 attaaatgtaaaaggttattatagtaaaaatataaattattatatcaaaagtagta 13597597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 281
Target Start/End: Original strand, 1249543 - 1249745
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||        |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  1249543 tttttaaatgtcacttttggagaaa-tttttgttccaatttaactg--------aaagttcaattcaattttaaatgttgttttatcaatattaccctta 1249633  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||| |||||| |||   |||||| ||||||| ||||| || ||    
T  1249634 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaatgagacaattatagtaaaaatatcaattattgtatcaaaaatagtaacattt 1249733  T
Q  270 gttgattttctt 281  Q
     |||||| ||||    
T  1249734 attgattgtctt 1249745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Original strand, 7170173 - 7170306
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatat 195  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  || ||  |||||||| |||||||||||| ||    
T  7170173 tttttctttatatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccattattacccctaaatatttattgcggagagagaaacat 7170272  T
Q  196 atgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    || |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  7170273 ataaaatgaaatattaaatttataaggttattat 7170306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19645918 - 19645846
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacatta 142  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19645918 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaaggtcaatgcaacatta 19645846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 19811951 - 19812110
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |  ||||  |||||    
T  19811951 tttttaattgtcacgtttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattaccctta 19812050  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||||||   ||||||||| || ||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  19812051 attatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattat 19812110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11001047 - 11000896
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||||  |||||  ||||||    
T  11001047 tgtcacttttgcataaagattttgtttctaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatattta 11000948  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    || |  ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  11000947 ttgcatagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattaaggatattat 11000896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Original strand, 11128877 - 11128992
Alignment:
Q  121 ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataa 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  11128877 ttcaaagttcaattcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagatacatatgaattgaaatattaaattaataa 11128976  T
Q  221 ggttattatggtaaaa 236  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  11128977 ggtcattatagtaaaa 11128992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26485816 - 26485738
Alignment:
Q  185 gagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  26485816 gagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagta 26485738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 283
Target Start/End: Original strand, 1923872 - 1924060
Alignment:
Q  96 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttt-atcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaata 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||| || |||| |||||||||  | ||||||||||||| |   |||| |||||    
T  1923872 tttttgtttctatttaattgtcacttttaaattttaatgcaaccttaaatattgtttttatcaatattacctttagttatttattgcaatgagataaata 1923971  T
Q  195 tatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||| | |||||||||||||||   | |||| |||||| ||||  ||||| |||||||| || || || || |||||| ||||||    
T  1923972 tatgaaatgagatattaaatgaataatactgttatagtaaaagtataaattatttcatcaaaattaataacatttattgattatcttgg 1924060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 263
Target Start/End: Original strand, 15432705 - 15432859
Alignment:
Q  109 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaata 208  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||| | |||||  |||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  15432705 ttaactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattactgagagataaatatatgaaatgaaata 15432804  T
Q  209 ttaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||| | |||||||||||| | ||||  |||  || ||| |||||||||||||    
T  15432805 ttaaattattaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta 15432859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1135421 - 1135270
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| | ||||    
T  1135421 tttttaagtgtctcttttatagaaaatttttgtttctatttaactatcact----gagttcaatgcaatattaaatg---ttttatcaatattattctta 1135329  T
Q  170 gttatttat-tacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttatt 227  Q
    |||| |||| ||   ||||| |||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  1135328 gttaattatatagatagagaaaaataattgaaacaagatattaaatgaatatggttatt 1135270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2381247 - 2381096
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||   |||| | |||||  |||||  ||||||    
T  2381247 tgtcacttttgcataaaaattttgttttcaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtattattaaatgtggctttacctatattacccttatatattta 2381148  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    || |  ||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||    
T  2381147 ttgcaaagagagaaatatatgaaatgaagcattaaataattaaggttattat 2381096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 143
Target Start/End: Original strand, 847800 - 847864
Alignment:
Q  79 gtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaa 143  Q
    |||||||||| |||||| || |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  847800 gtcacttttgtagaaaaattgtgttcctatttacttgtcattttcaaagttcaatgcaacattaa 847864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 160
Target Start/End: Original strand, 879267 - 879349
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaata 160  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||    
T  879267 tgtcacttttgaagaaaaattgtgttcctatttacttttctttttcaaagttcaatgcaacattaattattgttttgtcaata 879349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Original strand, 30734542 - 30734657
Alignment:
Q  114 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaa 213  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||| |  ||||   ||||||||   |||||||||| | || |||| ||||| ||||    
T  30734542 tgtcattttcaaatttcaatgcaacattaattattatcttatcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 30734641  T
Q  214 tgaataaggttattat 229  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  30734642 tgattaagggtattat 30734657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 160
Target Start/End: Original strand, 11835103 - 11835165
Alignment:
Q  98 tttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaata 160  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||    
T  11835103 tttgttcctatttaagtatcactttcaaagttcaatggagcaataaatgttgttttgtcaata 11835165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 283
Target Start/End: Original strand, 30388932 - 30388974
Alignment:
Q  241 agcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  30388932 agcttattgcatcaaaaatagtattaattgttgattgtcttgg 30388974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Original strand, 7632463 - 7632584
Alignment:
Q  95 atttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaata 194  Q
    ||||||||||||| |||| ||| | |||| |||| ||||| | || |||||||| ||||||  |||||   ||||| ||||||||   |||| | |||||    
T  7632463 atttttgtttctaattaaatgttattttctaagtccaatgaatcaataaatgttgttttatttatattactcttagatatttattgtagagataaaaata 7632562  T
Q  195 tatgaaataaaatattaaatga 216  Q
    |||||||| | |||||||||||    
T  7632563 tatgaaatgagatattaaatga 7632584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31282727 - 31282675
Alignment:
Q  109 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatat 161  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||    
T  31282727 ttaattgtcattttcaaagttcaatacatcattaaatgttaatttatctatat 31282675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 49142 - 49354
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  49142 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 49241  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49242 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaa-attaaatgaataaggtcattataataaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt 49340  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
    ||||||| ||||||    
T  49341 gttgattgtcttgg 49354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8362
Alignment:
Q  73 ttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagtt 172  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  8152 ttaagtgtcacttttgaagaaattttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattcttcttagtt 8251  T
Q  173 atttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgtt 272  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8252 atttattgcagagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgtt 8351  T
Q  273 gattttcttgg 283  Q
    |||| ||||||    
T  8352 gattgtcttgg 8362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0831 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0831
Description:

Target: scaffold0831; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 263
Target Start/End: Original strand, 2800 - 2995
Alignment:
Q  68 catttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  2800 catttttaagtgtctcttttggagaatttttttatttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcct 2899  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2900 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagttgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagta 2995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Original strand, 77112 - 77295
Alignment:
Q  99 ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatg 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  77112 ttgttcctatttaactgtcactttcaaagtccaatgcaatattaaatgttgttttactaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatg 77211  T
Q  199 aaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttg 282  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  77212 aaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttg 77295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0886 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0886
Description:

Target: scaffold0886; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 4511 - 4723
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||| |||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||   |||||    
T  4511 tttttaagcgtcttttttgaagaatttttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttattaatatac-cctta 4609  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaatt 269  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4610 gttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaataaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaatt 4709  T
Q  270 gttgattttcttgg 283  Q
     |||||| ||||||    
T  4710 attgattgtcttgg 4723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 148296 - 148511
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaattt-ttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcct 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||    
T  148296 tttttaagtgtcacttttgaagaaaaaaaattgtttctatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatataatcct 148395  T
Q  168 tagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  148396 tagttatttattgcggagagagaaatataagaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattatatcaaaagtagtatcaa 148495  T
Q  268 ttgttgattttcttgg 283  Q
    || || ||| ||||||    
T  148496 ttttttattgtcttgg 148511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 138977 - 138791
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  138977 tttttaagtgtcacttttagagaaaattattgttcttatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 138878  T
Q  169 agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaa 255  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || || |||||| |||| |||||||||||||    
T  138877 agttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagctaatcatagtaaaagtataacttattgcatcaa 138791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 229
Target Start/End: Original strand, 369402 - 369557
Alignment:
Q  73 ttaagtgtcacttttgaagaaaatttt-tgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagt 171  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||  |||| ||    
T  369402 ttaattgtcacttttgaagaaatttttttgtttctagttaagtgtgactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttggt 369501  T
Q  172 tatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  369502 tatttatt--gcagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgataaaagttattat 369557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 492553 - 492453
Alignment:
Q  103 ttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaat 202  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  | ||| || | ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  492553 ttctaattaagtgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcctttagtaatttattgcagagatagaaatatatgaaat 492454  T
Q  203 a 203  Q
    |    
T  492453 a 492453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1213 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1213
Description:

Target: scaffold1213; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 217 - 1
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaa---attt-ttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtc 165  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||   |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  217 tttttaagtgtctcttttaaagaaattaatttgttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatc 118  T
Q  166 cttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatc 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||      
T  117 cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaat 18  T
Q  266 aattgttgattttcttg 282  Q
    |||| |||||| |||||    
T  17 aattattgattgtcttg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14967 - 14774
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  14967 tttttaagtgtcactttcggagaaactttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccccta 14868  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||   |||||| |||||||||||||    
T  14867 gttatttattgcggagagagaaatatatgacatgagatattaaatgaataagtctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 14774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 184373 - 184202
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||  |||||    
T  184373 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattaccctta 184274  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattata 241  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  184273 gttatttattgcggagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtata 184202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0274 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0274
Description:

Target: scaffold0274; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 292
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||  |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  485 tttttaagtgtttcttttgaacaaatattttgtttcaatttaactgtcacttttaaagttcaacgtaacattaaatggtgttttatcaatattatcctta 386  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     ||||||||| |  ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||| |||||||||||||    
T  385 cttatttattgcaaagagataaatatatgaaattagatattgaatgaataaggttattatagtaaaaatatacattgttgtatcaaaagtagta 292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 147374 - 147207
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  147374 tttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattaccctta 147275  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaat-aaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | ||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  147274 gatatttattgtgaagagagaaacatatgaaataaaaatattaaattaataaggccattatagtaaaa 147207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 236
Target Start/End: Original strand, 7419 - 7585
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7419 tttttaattgtcatttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattaccctta 7518  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaa 236  Q
    | |||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  7519 gatatttattgcggggagagaaacatacgaaatgaaatcttaaattaacaaggtcattatagtaaaa 7585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 419694 - 419525
Alignment:
Q  114 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaa 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  419694 tgtcactttcaaaattcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattactcttagttatttattacggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaa 419595  T
Q  214 tgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattttcttgg 283  Q
    | |||||| ||||||| |||||| |||   |||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  419594 taaataagattattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgg 419525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 23131 - 23290
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||  ||||     
T  23131 tttttaattgtcatttttgaagaaaatttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttg 23230  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  23231 gttatttattgccgagagaaaaatatataaaatgagatattaaatgataaaggttattat 23290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 72193 - 72067
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  72193 tttttaagtgtatcttttggagaaattttttgttcttatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattatcctta 72094  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatata 196  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  72093 gttatttattgcggagagagaaatata 72067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 195984 - 195882
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  195984 tttttaagtgtcatttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatcctta 195885  T
Q  170 gtt 172  Q
    |||    
T  195884 gtt 195882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 195738 - 195620
Alignment:
Q  164 tccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||| |||||| ||||||  |||||    
T  195738 tccttagttatttattgtggagagaaaaatatatgaaatgga-tattaaatgaataagatcgttatagtaaaagtatagtttattgtatcaaacatagta 195640  T
Q  264 tcaattgttgattttcttgg 283  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  195639 tcaattgtcgattatcttgg 195620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 211
Target Start/End: Original strand, 1029 - 1169
Alignment:
Q  71 ttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttag 170  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||    
T  1029 ttttatgtgtcttttttaaagaataattttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttag 1128  T
Q  171 ttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatatta 211  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1129 ttatttattacagaaagataaatatatgaaatgaaatatta 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6600 - 6460
Alignment:
Q  71 ttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttag 170  Q
    ||||| |||||  |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||    
T  6600 ttttatgtgtcttttttaaagaataattttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttag 6501  T
Q  171 ttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatatta 211  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6500 ttatttattacagaaagataaatatatgaaatgaaatatta 6460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30938 - 30794
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||  |||||    
T  30938 tttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttaccaatattaccctta 30839  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaat 214  Q
    | |||||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  30838 gatatttattgcagagagagaaacatatgaattgaaatattaaat 30794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Original strand, 310 - 461
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    |||    
T  310 tttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttactatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaaaattactttta 409  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataag 221  Q
    | |||||||| | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  410 gatatttattgcagagagggaaacatatgaaatgaaatattaaattaataag 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1968 - 1884
Alignment:
Q  165 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  1968 ccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattg 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 96307 - 96114
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |  ||||  ||||     
T  96307 tttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttg 96208  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
     |||||||||   ||||||||| || ||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | ||||  ||   || |||||||||||||||||    
T  96207 attatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagta 96114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2146 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2146
Description:

Target: scaffold2146; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 262
Target Start/End: Original strand, 599 - 739
Alignment:
Q  122 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataag 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  599 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttttcaatattacccttaattatttattacaaagagagaaatatatgaaacaatatattaaatgaatgag 698  T
Q  222 gttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagt 262  Q
    | |||||| | ||| | |||  |||||| |||| |||||||    
T  699 gctattattggaaattgataaattattgtatcagaagtagt 739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Original strand, 252589 - 252748
Alignment:
Q  70 tttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtcctta 169  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||  ||||  ||||     
T  252589 tttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatattgttttgtctttattacccttg 252688  T
Q  170 gttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattat 229  Q
     |||||||||   ||||||||| || ||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  252689 attatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattat 252748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14488 - 14303
Alignment:
Q  78 tgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattgtccttagttattta 177  Q
    ||||||||||| | ||  ||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||  ||||  |||||||    
T  14488 tgtcacttttgcataatttttttatttctaattaagcgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtctttattacccttgattattta 14389  T
Q  178 ttacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggttattatggtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagta 263  Q
    ||   ||||||||| || ||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | ||||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  14388 ttgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaaaataaattattgcatcaaaagtagta 14303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 154
Target Start/End: Original strand, 20999 - 21051
Alignment:
Q  102 tttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta 154  Q
    |||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20999 tttctatttagccgtcgttttcaaagttcaatgcaacattaaattttgtttta 21051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University