View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1987_high_1 (Length: 426)

Name: NF1987_high_1
Description: NF1987
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1987_high_1
NF1987_high_1
[»] chr8 (146 HSPs)
chr8 (3-409)||(19808018-19808420)
chr8 (1-405)||(22237673-22238073)
chr8 (20-405)||(17460725-17461106)
chr8 (1-386)||(25483893-25484274)
chr8 (1-243)||(39694947-39695188)
chr8 (1-243)||(41680553-41680795)
chr8 (82-404)||(14397604-14397915)
chr8 (1-243)||(15635599-15635840)
chr8 (1-274)||(364148-364421)
chr8 (1-231)||(19882371-19882601)
chr8 (22-236)||(20454638-20454851)
chr8 (1-258)||(26454087-26454344)
chr8 (1-274)||(44522845-44523118)
chr8 (1-208)||(22207693-22207900)
chr8 (29-231)||(11775125-11775327)
chr8 (1-210)||(20178940-20179149)
chr8 (20-207)||(18833898-18834085)
chr8 (1-352)||(27941308-27941655)
chr8 (1-210)||(5760957-5761166)
chr8 (1-210)||(6102172-6102381)
chr8 (1-210)||(18024114-18024323)
chr8 (21-210)||(21861059-21861248)
chr8 (20-208)||(6573495-6573682)
chr8 (20-236)||(23478478-23478694)
chr8 (21-236)||(20455395-20455609)
chr8 (21-236)||(20460373-20460587)
chr8 (21-208)||(42818346-42818533)
chr8 (1-274)||(44432221-44432495)
chr8 (1-210)||(19140189-19140398)
chr8 (20-210)||(39936449-39936638)
chr8 (1-274)||(17795592-17795865)
chr8 (1-202)||(38185505-38185706)
chr8 (1-236)||(42559947-42560181)
chr8 (1-203)||(39363955-39364157)
chr8 (1-209)||(17437737-17437945)
chr8 (1-210)||(20084057-20084266)
chr8 (20-208)||(5082650-5082838)
chr8 (1-243)||(42266014-42266252)
chr8 (206-398)||(20533267-20533455)
chr8 (208-397)||(16799561-16799748)
chr8 (230-397)||(23943876-23944039)
chr8 (1-206)||(44476851-44477057)
chr8 (1-206)||(44480113-44480319)
chr8 (29-258)||(19880205-19880433)
chr8 (206-398)||(19154744-19154932)
chr8 (20-223)||(21579645-21579848)
chr8 (1-206)||(8728356-8728561)
chr8 (45-210)||(361675-361840)
chr8 (206-399)||(37515778-37515967)
chr8 (48-210)||(32950025-32950187)
chr8 (209-387)||(17439367-17439541)
chr8 (273-399)||(23659480-23659602)
chr8 (1-214)||(23914344-23914556)
chr8 (206-389)||(14103083-14103262)
chr8 (3-210)||(22483171-22483377)
chr8 (23-210)||(20517559-20517745)
chr8 (1-214)||(22258723-22258935)
chr8 (303-404)||(25363154-25363255)
chr8 (206-387)||(40492711-40492887)
chr8 (1-210)||(21321759-21321968)
chr8 (1-210)||(21326357-21326566)
chr8 (1-209)||(17501350-17501558)
chr8 (112-230)||(8414240-8414358)
chr8 (208-399)||(20501962-20502149)
chr8 (20-210)||(22344466-22344655)
chr8 (20-210)||(22356126-22356315)
chr8 (20-210)||(18816898-18817089)
chr8 (20-161)||(23660688-23660829)
chr8 (20-214)||(23670069-23670262)
chr8 (1-135)||(36732943-36733077)
chr8 (21-210)||(4381232-4381420)
chr8 (1-214)||(38988886-38989098)
chr8 (1-214)||(39019983-39020195)
chr8 (206-399)||(17086012-17086201)
chr8 (20-223)||(29763307-29763510)
chr8 (1-210)||(36305083-36305291)
chr8 (38-210)||(18815279-18815450)
chr8 (1-135)||(21399209-21399343)
chr8 (1-135)||(21793702-21793836)
chr8 (206-396)||(22253024-22253210)
chr8 (206-395)||(23667885-23668071)
chr8 (208-388)||(22995927-22996104)
chr8 (23-214)||(36405501-36405691)
chr8 (301-406)||(17438166-17438272)
chr8 (20-210)||(17978855-17979044)
chr8 (337-403)||(23409864-23409930)
chr8 (301-399)||(5083103-5083202)
chr8 (301-399)||(18833635-18833733)
chr8 (20-131)||(21513823-21513933)
chr8 (21-210)||(22474176-22474364)
chr8 (20-207)||(24907203-24907388)
chr8 (303-399)||(22963364-22963461)
chr8 (327-399)||(23914110-23914183)
chr8 (1-97)||(16198371-16198467)
chr8 (206-329)||(22525659-22525778)
chr8 (21-210)||(18118603-18118792)
chr8 (303-357)||(21346185-21346239)
chr8 (328-389)||(44476753-44476814)
chr8 (328-389)||(44480015-44480076)
chr8 (128-203)||(21345945-21346020)
chr8 (20-131)||(24624171-24624282)
chr8 (208-386)||(28397635-28397809)
chr8 (20-210)||(25757577-25757766)
chr8 (338-403)||(16401983-16402054)
chr8 (338-386)||(19936956-19937004)
chr8 (353-404)||(18862728-18862779)
chr8 (353-404)||(21410922-21410973)
chr8 (353-404)||(21805414-21805465)
chr8 (353-404)||(21828097-21828148)
chr8 (320-394)||(35026831-35026903)
chr8 (304-387)||(37116434-37116517)
chr8 (20-210)||(25295557-25295746)
chr8 (29-97)||(14397358-14397426)
chr8 (5-97)||(18677658-18677750)
chr8 (21-135)||(19332016-19332128)
chr8 (304-394)||(22419367-22419455)
chr8 (317-386)||(2418839-2418906)
chr8 (328-389)||(8728620-8728682)
chr8 (1-57)||(1484918-1484974)
chr8 (1-97)||(4541963-4542059)
chr8 (20-208)||(18827650-18827837)
chr8 (1-57)||(20045785-20045841)
chr8 (1-97)||(24485633-24485729)
chr8 (1-69)||(45290137-45290205)
chr8 (1-72)||(8414168-8414239)
chr8 (353-404)||(19278366-19278417)
chr8 (20-135)||(21495128-21495243)
chr8 (353-404)||(21972668-21972719)
chr8 (353-404)||(21976753-21976804)
chr8 (353-404)||(43251785-43251836)
chr8 (357-399)||(1327013-1327055)
chr8 (1-87)||(22002239-22002325)
chr8 (331-372)||(21346241-21346282)
chr8 (211-276)||(26222945-26223010)
chr8 (1-57)||(5852882-5852938)
chr8 (1-57)||(14409034-14409090)
chr8 (304-387)||(17266945-17267028)
chr8 (185-223)||(23410018-23410056)
chr8 (320-361)||(18024465-18024506)
chr8 (323-396)||(21329104-21329176)
chr8 (323-396)||(21967540-21967612)
chr8 (318-387)||(22364748-22364816)
chr8 (323-396)||(34950622-34950694)
chr8 (1-57)||(14824291-14824347)
chr8 (170-206)||(18122327-18122363)
chr8 (206-254)||(22381593-22381641)
[»] chr3 (199 HSPs)
chr3 (1-403)||(14966237-14966635)
chr3 (6-386)||(43550101-43550477)
chr3 (20-409)||(16643234-16643619)
chr3 (6-386)||(50242985-50243361)
chr3 (116-403)||(52989492-52989774)
chr3 (1-399)||(10833758-10834151)
chr3 (1-276)||(24152863-24153138)
chr3 (1-399)||(14763380-14763774)
chr3 (1-399)||(23371126-23371520)
chr3 (1-396)||(8928084-8928474)
chr3 (212-403)||(324303-324490)
chr3 (1-399)||(51300634-51301028)
chr3 (1-208)||(53646479-53646686)
chr3 (1-243)||(6158789-6159030)
chr3 (82-404)||(15465142-15465453)
chr3 (82-404)||(5223371-5223682)
chr3 (1-223)||(14641969-14642191)
chr3 (1-236)||(2248389-2248624)
chr3 (1-208)||(33564555-33564762)
chr3 (1-231)||(35961306-35961536)
chr3 (1-210)||(40807420-40807629)
chr3 (1-243)||(12275941-12276182)
chr3 (20-210)||(54875921-54876111)
chr3 (1-210)||(11192505-11192713)
chr3 (206-403)||(21837493-21837685)
chr3 (21-208)||(17044392-17044579)
chr3 (1-231)||(41930-42160)
chr3 (1-226)||(37038226-37038452)
chr3 (1-351)||(9533416-9533762)
chr3 (1-210)||(14441592-14441801)
chr3 (1-210)||(35065000-35065208)
chr3 (1-210)||(50351419-50351628)
chr3 (1-209)||(40812258-40812466)
chr3 (22-210)||(44273898-44274086)
chr3 (1-236)||(11913119-11913354)
chr3 (20-231)||(13029714-13029925)
chr3 (1-243)||(3394421-3394662)
chr3 (1-231)||(6805380-6805610)
chr3 (20-258)||(16979287-16979524)
chr3 (20-210)||(17538531-17538721)
chr3 (1-210)||(14508272-14508480)
chr3 (1-237)||(6819507-6819742)
chr3 (1-236)||(1988651-1988885)
chr3 (20-231)||(13026122-13026333)
chr3 (20-210)||(5206092-5206282)
chr3 (1-203)||(43889218-43889420)
chr3 (1-274)||(10989223-10989495)
chr3 (1-210)||(17693492-17693701)
chr3 (1-243)||(179126-179367)
chr3 (5-203)||(10541881-10542079)
chr3 (1-223)||(18367177-18367399)
chr3 (1-210)||(35354023-35354235)
chr3 (1-223)||(42324640-42324862)
chr3 (1-210)||(2841882-2842090)
chr3 (1-210)||(3803259-3803468)
chr3 (1-210)||(17519292-17519501)
chr3 (1-210)||(17534154-17534363)
chr3 (5-210)||(22307006-22307211)
chr3 (20-203)||(12511279-12511462)
chr3 (21-210)||(13519706-13519896)
chr3 (1-210)||(15931926-15932135)
chr3 (22-203)||(18699913-18700094)
chr3 (1-203)||(14671255-14671457)
chr3 (1-207)||(17685262-17685468)
chr3 (1-206)||(20248403-20248608)
chr3 (1-233)||(10554668-10554900)
chr3 (1-233)||(55292060-55292292)
chr3 (1-243)||(13522829-13523071)
chr3 (206-394)||(13919408-13919591)
chr3 (20-207)||(17670147-17670334)
chr3 (1-223)||(10563120-10563342)
chr3 (1-206)||(38311422-38311628)
chr3 (21-210)||(41172809-41172999)
chr3 (22-203)||(12470233-12470414)
chr3 (20-204)||(17513010-17513194)
chr3 (1-210)||(14519687-14519895)
chr3 (20-209)||(49900153-49900350)
chr3 (20-236)||(31224391-31224608)
chr3 (1-210)||(50348445-50348654)
chr3 (282-409)||(54876322-54876445)
chr3 (1-210)||(43928775-43928984)
chr3 (1-249)||(18889749-18889997)
chr3 (1-210)||(6156130-6156338)
chr3 (206-392)||(12378003-12378184)
chr3 (1-210)||(14152818-14153027)
chr3 (1-204)||(19443941-19444144)
chr3 (20-210)||(50755820-50756009)
chr3 (303-404)||(12339773-12339874)
chr3 (303-399)||(10542384-10542480)
chr3 (303-403)||(14179439-14179539)
chr3 (303-399)||(14670995-14671091)
chr3 (303-403)||(43889578-43889678)
chr3 (21-172)||(14567651-14567802)
chr3 (20-231)||(16324979-16325190)
chr3 (206-388)||(316202-316381)
chr3 (1-210)||(9511585-9511793)
chr3 (1-210)||(9519560-9519768)
chr3 (208-394)||(9577700-9577882)
chr3 (1-210)||(15565938-15566146)
chr3 (303-403)||(12469969-12470069)
chr3 (303-399)||(14682494-14682590)
chr3 (303-403)||(16796554-16796654)
chr3 (1-191)||(18893067-18893257)
chr3 (20-129)||(17046631-17046740)
chr3 (282-403)||(17691644-17691760)
chr3 (303-403)||(18700259-18700359)
chr3 (1-210)||(24546261-24546473)
chr3 (1-210)||(54330725-54330933)
chr3 (1-125)||(5215156-5215280)
chr3 (115-210)||(11258891-11258986)
chr3 (301-376)||(44494901-44494976)
chr3 (1-135)||(17938025-17938159)
chr3 (301-409)||(28194754-28194863)
chr3 (206-397)||(15246093-15246281)
chr3 (20-210)||(12952466-12952655)
chr3 (1-135)||(18739394-18739528)
chr3 (56-230)||(22652236-22652409)
chr3 (1-110)||(19568830-19568939)
chr3 (1-210)||(25104622-25104829)
chr3 (246-391)||(23318615-23318754)
chr3 (1-109)||(51603019-51603127)
chr3 (1-88)||(14647522-14647609)
chr3 (206-376)||(15207032-15207199)
chr3 (301-399)||(37427787-37427885)
chr3 (1-210)||(17207766-17207973)
chr3 (82-198)||(26055128-26055244)
chr3 (206-397)||(15265214-15265402)
chr3 (206-393)||(32402819-32403002)
chr3 (333-406)||(3264997-3265070)
chr3 (338-403)||(11914003-11914068)
chr3 (333-406)||(36527809-36527882)
chr3 (1-97)||(12305599-12305695)
chr3 (1-105)||(46723045-46723149)
chr3 (116-203)||(14682754-14682841)
chr3 (1-111)||(8631265-8631375)
chr3 (1-97)||(13436776-13436871)
chr3 (1-97)||(15465631-15465727)
chr3 (20-97)||(22764068-22764145)
chr3 (312-396)||(34852617-34852701)
chr3 (1-97)||(5223860-5223956)
chr3 (1-97)||(26054854-26054950)
chr3 (328-389)||(38311759-38311820)
chr3 (161-249)||(18892975-18893063)
chr3 (1-97)||(29544431-29544527)
chr3 (1-92)||(54521304-54521395)
chr3 (311-397)||(14568921-14569007)
chr3 (213-387)||(52523593-52523763)
chr3 (154-210)||(19568940-19568996)
chr3 (127-210)||(42353218-42353302)
chr3 (353-404)||(15964944-15964995)
chr3 (353-404)||(15968868-15968919)
chr3 (353-404)||(15972792-15972843)
chr3 (328-389)||(20248741-20248803)
chr3 (20-88)||(11986844-11986912)
chr3 (1-72)||(11258992-11259063)
chr3 (353-404)||(11854708-11854759)
chr3 (353-400)||(19775744-19775791)
chr3 (1-135)||(8023721-8023855)
chr3 (211-342)||(29172491-29172618)
chr3 (250-387)||(2051102-2051235)
chr3 (1-97)||(28848211-28848307)
chr3 (1-57)||(34159842-34159898)
chr3 (353-404)||(4107480-4107531)
chr3 (353-404)||(4111332-4111383)
chr3 (353-404)||(7109673-7109724)
chr3 (353-404)||(7113608-7113659)
chr3 (353-404)||(11070043-11070094)
chr3 (353-404)||(11165612-11165663)
chr3 (353-404)||(15617349-15617400)
chr3 (353-404)||(22321639-22321690)
chr3 (353-404)||(22336694-22336745)
chr3 (353-404)||(27409727-27409778)
chr3 (353-404)||(28949699-28949750)
chr3 (353-404)||(30065921-30065972)
chr3 (3-90)||(36528061-36528148)
chr3 (353-404)||(37439719-37439770)
chr3 (353-404)||(55022842-55022893)
chr3 (31-97)||(15978009-15978075)
chr3 (359-404)||(4588862-4588907)
chr3 (211-276)||(21618627-21618692)
chr3 (211-276)||(36166776-36166841)
chr3 (357-394)||(54520977-54521014)
chr3 (1-97)||(10247313-10247409)
chr3 (1-93)||(16453869-16453961)
chr3 (1-57)||(17463694-17463750)
chr3 (318-398)||(43926034-43926114)
chr3 (1-57)||(55477007-55477063)
chr3 (20-90)||(3264748-3264818)
chr3 (21-135)||(6002446-6002560)
chr3 (206-252)||(37427930-37427976)
chr3 (357-386)||(12567723-12567752)
chr3 (357-386)||(13544188-13544217)
chr3 (323-396)||(14647688-14647760)
chr3 (206-243)||(16059622-16059659)
chr3 (357-394)||(29544812-29544849)
chr3 (1-97)||(7780936-7781032)
chr3 (372-404)||(11300532-11300564)
chr3 (1-57)||(15412947-15413003)
chr3 (246-274)||(23274882-23274910)
[»] chr4 (129 HSPs)
chr4 (1-403)||(10056707-10057105)
chr4 (1-378)||(630322-630695)
chr4 (1-386)||(23802883-23803264)
chr4 (1-386)||(12611106-12611484)
chr4 (1-386)||(51463486-51463867)
chr4 (1-399)||(18212805-18213199)
chr4 (1-399)||(24046953-24047347)
chr4 (1-243)||(9638399-9638640)
chr4 (1-210)||(35660270-35660479)
chr4 (1-234)||(15990439-15990672)
chr4 (1-210)||(53630892-53631101)
chr4 (1-208)||(11479030-11479237)
chr4 (1-243)||(10704890-10705131)
chr4 (1-243)||(10918660-10918901)
chr4 (1-231)||(28385646-28385876)
chr4 (1-258)||(15008342-15008599)
chr4 (1-210)||(25091077-25091286)
chr4 (1-274)||(56115255-56115528)
chr4 (2-258)||(40619907-40620162)
chr4 (21-208)||(9923622-9923809)
chr4 (24-223)||(15447858-15448057)
chr4 (1-231)||(10694666-10694896)
chr4 (1-231)||(10908432-10908662)
chr4 (20-210)||(19609748-19609938)
chr4 (1-210)||(42875223-42875432)
chr4 (1-208)||(37019095-37019302)
chr4 (1-210)||(3337523-3337732)
chr4 (1-210)||(10356855-10357064)
chr4 (1-210)||(19435116-19435326)
chr4 (1-210)||(14549050-14549259)
chr4 (20-209)||(15114648-15114836)
chr4 (1-210)||(16997954-16998158)
chr4 (1-210)||(33243715-33243924)
chr4 (1-274)||(33849102-33849375)
chr4 (206-398)||(17333352-17333542)
chr4 (1-223)||(33186312-33186534)
chr4 (1-233)||(16277746-16277978)
chr4 (1-233)||(53387356-53387588)
chr4 (21-198)||(3485347-3485521)
chr4 (20-166)||(15011951-15012097)
chr4 (206-399)||(13591785-13591974)
chr4 (206-399)||(32306854-32307043)
chr4 (206-388)||(14825551-14825730)
chr4 (84-229)||(15883917-15884062)
chr4 (1-210)||(19566338-19566546)
chr4 (212-398)||(26050340-26050521)
chr4 (32-210)||(11425379-11425547)
chr4 (1-202)||(10237917-10238117)
chr4 (1-214)||(15344297-15344508)
chr4 (1-209)||(15214464-15214672)
chr4 (20-210)||(14630250-14630440)
chr4 (1-214)||(40229723-40229936)
chr4 (20-214)||(44024042-44024235)
chr4 (1-214)||(46740619-46740831)
chr4 (303-403)||(17048086-17048186)
chr4 (301-397)||(16043087-16043183)
chr4 (2-135)||(16026349-16026482)
chr4 (1-210)||(25513167-25513375)
chr4 (1-122)||(55582703-55582824)
chr4 (20-210)||(26445309-26445498)
chr4 (206-399)||(14852734-14852924)
chr4 (18-121)||(18108314-18108417)
chr4 (20-211)||(45314775-45314965)
chr4 (1-210)||(2425040-2425248)
chr4 (313-406)||(40907137-40907230)
chr4 (301-399)||(15041911-15042010)
chr4 (301-399)||(15112414-15112513)
chr4 (140-274)||(43251120-43251255)
chr4 (301-399)||(40906987-40907084)
chr4 (142-243)||(9871126-9871226)
chr4 (338-403)||(14746570-14746635)
chr4 (208-388)||(15791857-15792034)
chr4 (1-208)||(20595850-20596056)
chr4 (213-387)||(52243059-52243230)
chr4 (1-97)||(15534658-15534754)
chr4 (1-105)||(22725504-22725608)
chr4 (312-396)||(4831496-4831580)
chr4 (312-396)||(4834791-4834875)
chr4 (312-396)||(14047715-14047799)
chr4 (208-368)||(26789441-26789598)
chr4 (1-97)||(14049054-14049150)
chr4 (1-97)||(49547363-49547459)
chr4 (339-406)||(14185045-14185112)
chr4 (312-405)||(30146453-30146546)
chr4 (325-398)||(26045268-26045340)
chr4 (137-207)||(13036332-13036402)
chr4 (1-90)||(14185426-14185515)
chr4 (1-97)||(12033363-12033459)
chr4 (78-214)||(12622792-12622927)
chr4 (78-210)||(14508186-14508317)
chr4 (21-133)||(19081780-19081892)
chr4 (1-97)||(36038347-36038443)
chr4 (1-97)||(44615765-44615861)
chr4 (353-404)||(12487683-12487734)
chr4 (353-404)||(14954250-14954301)
chr4 (353-404)||(25689842-25689893)
chr4 (353-404)||(27533998-27534049)
chr4 (1-119)||(13046064-13046182)
chr4 (359-404)||(10712828-10712873)
chr4 (359-404)||(10926598-10926643)
chr4 (4-97)||(50221932-50222025)
chr4 (357-409)||(19857584-19857636)
chr4 (1-97)||(30147392-30147488)
chr4 (211-297)||(54798627-54798713)
chr4 (357-394)||(49547744-49547781)
chr4 (1-57)||(15117942-15117998)
chr4 (353-404)||(4561417-4561468)
chr4 (353-404)||(5757021-5757072)
chr4 (353-404)||(9556502-9556553)
chr4 (214-297)||(14280474-14280557)
chr4 (353-404)||(14757505-14757556)
chr4 (353-404)||(33742350-33742401)
chr4 (21-136)||(54364129-54364244)
chr4 (357-399)||(15497041-15497083)
chr4 (31-97)||(29267830-29267896)
chr4 (357-394)||(14048732-14048769)
chr4 (165-210)||(26922254-26922299)
chr4 (357-394)||(36038025-36038062)
chr4 (357-406)||(52873148-52873197)
chr4 (1-57)||(7640776-7640832)
chr4 (353-397)||(17810251-17810295)
chr4 (1-97)||(19243177-19243273)
chr4 (1-52)||(1837109-1837160)
chr4 (245-342)||(44928821-44928914)
chr4 (211-276)||(8574742-8574807)
chr4 (148-209)||(12134425-12134486)
chr4 (357-394)||(15534336-15534373)
chr4 (245-290)||(20157189-20157234)
chr4 (245-274)||(44102404-44102433)
[»] chr2 (123 HSPs)
chr2 (1-409)||(27472482-27472886)
chr2 (1-399)||(34873866-34874260)
chr2 (20-399)||(18358407-18358781)
chr2 (20-403)||(21081409-21081788)
chr2 (1-386)||(22173447-22173828)
chr2 (1-255)||(34858804-34859058)
chr2 (1-399)||(19662074-19662468)
chr2 (1-399)||(21073146-21073540)
chr2 (1-399)||(9241999-9242393)
chr2 (5-399)||(6260801-6261192)
chr2 (82-404)||(31345184-31345495)
chr2 (1-242)||(41301392-41301633)
chr2 (1-231)||(26903561-26903791)
chr2 (1-210)||(23969042-23969251)
chr2 (1-210)||(43707704-43707912)
chr2 (20-210)||(9975353-9975543)
chr2 (1-210)||(24273678-24273887)
chr2 (1-210)||(24781259-24781468)
chr2 (1-218)||(25183603-25183820)
chr2 (1-231)||(21915025-21915255)
chr2 (20-210)||(36839595-36839785)
chr2 (1-210)||(27484889-27485098)
chr2 (1-236)||(24883785-24884019)
chr2 (20-210)||(5031568-5031758)
chr2 (1-243)||(31520509-31520750)
chr2 (1-225)||(18388716-18388940)
chr2 (20-214)||(20915525-20915719)
chr2 (20-209)||(21368532-21368721)
chr2 (2-274)||(23338820-23339092)
chr2 (20-223)||(10039572-10039775)
chr2 (20-203)||(23068888-23069071)
chr2 (20-210)||(17306911-17307101)
chr2 (1-209)||(19201619-19201828)
chr2 (20-203)||(9785013-9785196)
chr2 (20-203)||(28652940-28653123)
chr2 (1-210)||(24515610-24515819)
chr2 (5-216)||(20590745-20590956)
chr2 (1-206)||(6482946-6483152)
chr2 (1-206)||(6486413-6486619)
chr2 (1-274)||(28349268-28349550)
chr2 (112-399)||(30643811-30644094)
chr2 (1-214)||(22690101-22690313)
chr2 (208-406)||(34137006-34137200)
chr2 (206-399)||(26392455-26392643)
chr2 (20-210)||(29113786-29113975)
chr2 (1-214)||(22694697-22694909)
chr2 (279-403)||(23069215-23069335)
chr2 (206-398)||(23287438-23287625)
chr2 (206-387)||(23004835-23005012)
chr2 (1-210)||(22686264-22686472)
chr2 (1-135)||(25587106-25587240)
chr2 (303-399)||(9784754-9784848)
chr2 (1-210)||(21316081-21316289)
chr2 (1-210)||(21335872-21336080)
chr2 (20-233)||(2524185-2524380)
chr2 (1-135)||(1384105-1384239)
chr2 (206-387)||(20520051-20520227)
chr2 (301-408)||(21237816-21237924)
chr2 (301-406)||(19201924-19202030)
chr2 (1-210)||(22332142-22332349)
chr2 (21-210)||(23609901-23610089)
chr2 (206-397)||(18546803-18546991)
chr2 (338-403)||(23707275-23707340)
chr2 (338-403)||(24918179-24918244)
chr2 (206-350)||(22412994-22413134)
chr2 (128-243)||(22501260-22501374)
chr2 (128-243)||(22509194-22509308)
chr2 (1-135)||(23778714-23778849)
chr2 (1-120)||(28345495-28345614)
chr2 (208-387)||(24697467-24697641)
chr2 (338-403)||(24681483-24681548)
chr2 (1-97)||(20261696-20261792)
chr2 (338-402)||(24671065-24671129)
chr2 (22-89)||(40911868-40911935)
chr2 (1-97)||(10684352-10684448)
chr2 (1-97)||(38967956-38968052)
chr2 (312-396)||(22703174-22703258)
chr2 (20-93)||(31345661-31345733)
chr2 (328-389)||(6482838-6482899)
chr2 (328-389)||(6486305-6486366)
chr2 (1-69)||(22255777-22255845)
chr2 (1-209)||(22786717-22786924)
chr2 (353-404)||(1283361-1283412)
chr2 (353-404)||(30345074-30345125)
chr2 (353-404)||(41531087-41531138)
chr2 (312-396)||(13101597-13101682)
chr2 (1-135)||(20272855-20272989)
chr2 (304-388)||(43947324-43947408)
chr2 (338-386)||(24642807-24642855)
chr2 (1-97)||(24897785-24897881)
chr2 (1-97)||(24900268-24900364)
chr2 (1-97)||(24902745-24902841)
chr2 (1-97)||(24905222-24905318)
chr2 (1-97)||(24907697-24907793)
chr2 (250-342)||(23708521-23708609)
chr2 (1-58)||(7186942-7186999)
chr2 (165-210)||(24841377-24841422)
chr2 (1-57)||(18809459-18809515)
chr2 (1-97)||(23136056-23136152)
chr2 (1-57)||(28577615-28577671)
chr2 (353-404)||(12901595-12901646)
chr2 (353-404)||(24628562-24628613)
chr2 (353-404)||(24649329-24649380)
chr2 (353-404)||(27379516-27379567)
chr2 (353-404)||(27383562-27383613)
chr2 (353-404)||(27601768-27601819)
chr2 (1-72)||(36734904-36734975)
chr2 (1-52)||(39682835-39682886)
chr2 (1-59)||(22501375-22501433)
chr2 (1-59)||(22509309-22509367)
chr2 (181-231)||(34492091-34492141)
chr2 (20-157)||(28031919-28032056)
chr2 (353-397)||(10101728-10101772)
chr2 (1-57)||(23711603-23711659)
chr2 (1-57)||(26505895-26505951)
chr2 (1-57)||(26508373-26508429)
chr2 (1-57)||(27920354-27920410)
chr2 (1-57)||(32039088-32039144)
chr2 (1-52)||(571919-571970)
chr2 (368-406)||(22459579-22459617)
chr2 (357-394)||(10684735-10684772)
chr2 (357-394)||(20261374-20261411)
chr2 (208-252)||(43947232-43947276)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (20-406)||(225-607)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (1-403)||(67330-67727)
scaffold0032 (22-134)||(62410-62522)
scaffold0032 (20-209)||(116843-117032)
[»] chr5 (103 HSPs)
chr5 (1-399)||(6765901-6766294)
chr5 (1-402)||(30138583-30138979)
chr5 (21-398)||(29448078-29448451)
chr5 (1-276)||(22412365-22412639)
chr5 (1-276)||(18418770-18419045)
chr5 (1-399)||(37598536-37598930)
chr5 (1-406)||(42960608-42961010)
chr5 (1-399)||(28370675-28371069)
chr5 (1-243)||(24277025-24277266)
chr5 (1-243)||(24384947-24385188)
chr5 (1-236)||(17812795-17813029)
chr5 (1-231)||(263260-263490)
chr5 (1-231)||(33472983-33473213)
chr5 (1-210)||(32607744-32607953)
chr5 (20-210)||(20565978-20566168)
chr5 (1-207)||(21399423-21399628)
chr5 (1-258)||(17011102-17011359)
chr5 (1-208)||(26761827-26762034)
chr5 (1-236)||(36460368-36460603)
chr5 (1-223)||(17875410-17875632)
chr5 (20-210)||(19921058-19921248)
chr5 (1-210)||(41876012-41876221)
chr5 (1-210)||(20198005-20198216)
chr5 (1-208)||(33895301-33895508)
chr5 (1-340)||(38145157-38145492)
chr5 (1-210)||(27868994-27869203)
chr5 (20-236)||(31456196-31456412)
chr5 (46-208)||(8833663-8833824)
chr5 (20-236)||(21557482-21557699)
chr5 (23-206)||(22750372-22750555)
chr5 (43-210)||(36509237-36509405)
chr5 (208-399)||(25576716-25576902)
chr5 (1-206)||(19511614-19511820)
chr5 (20-216)||(21554817-21555013)
chr5 (206-399)||(23469876-23470064)
chr5 (20-210)||(16062910-16063099)
chr5 (1-274)||(22758309-22758583)
chr5 (1-133)||(40917392-40917524)
chr5 (208-399)||(25574330-25574516)
chr5 (208-399)||(25575523-25575709)
chr5 (303-399)||(22107386-22107482)
chr5 (206-399)||(26740505-26740693)
chr5 (212-399)||(26732698-26732880)
chr5 (1-206)||(22336748-22336953)
chr5 (20-210)||(8504307-8504496)
chr5 (20-210)||(16605042-16605231)
chr5 (1-210)||(18744074-18744282)
chr5 (1-206)||(22340286-22340491)
chr5 (20-210)||(14026246-14026435)
chr5 (20-210)||(1627819-1628008)
chr5 (48-210)||(22111024-22111185)
chr5 (206-388)||(21328073-21328252)
chr5 (1-135)||(23199811-23199942)
chr5 (1-105)||(24617342-24617446)
chr5 (1-105)||(24713573-24713677)
chr5 (1-105)||(24746601-24746705)
chr5 (1-88)||(43243077-43243164)
chr5 (137-236)||(12122077-12122175)
chr5 (328-399)||(22336640-22336711)
chr5 (328-399)||(22340178-22340249)
chr5 (1-97)||(37804492-37804588)
chr5 (301-399)||(21809531-21809629)
chr5 (303-362)||(33895607-33895666)
chr5 (345-404)||(18356264-18356323)
chr5 (317-399)||(21731426-21731509)
chr5 (315-398)||(27988892-27988978)
chr5 (1-135)||(17908966-17909100)
chr5 (312-396)||(10816478-10816562)
chr5 (328-389)||(22750264-22750325)
chr5 (312-396)||(23538504-23538588)
chr5 (1-105)||(24668616-24668720)
chr5 (1-105)||(24738385-24738489)
chr5 (1-105)||(24751154-24751258)
chr5 (1-209)||(28901346-28901553)
chr5 (1-209)||(28937741-28937948)
chr5 (211-342)||(18318942-18319068)
chr5 (206-333)||(20572025-20572149)
chr5 (345-404)||(20910910-20910969)
chr5 (328-389)||(19511516-19511577)
chr5 (299-398)||(15796494-15796594)
chr5 (353-406)||(10753334-10753387)
chr5 (77-210)||(30613937-30614069)
chr5 (165-214)||(26749534-26749583)
chr5 (77-210)||(30611977-30612109)
chr5 (1-97)||(29346456-29346552)
chr5 (1-97)||(29348929-29349025)
chr5 (1-97)||(29351402-29351498)
chr5 (1-205)||(31478801-31479003)
chr5 (353-404)||(15236863-15236914)
chr5 (353-404)||(19472803-19472854)
chr5 (353-404)||(20295819-20295870)
chr5 (353-404)||(40723670-40723721)
chr5 (304-398)||(22178172-22178266)
chr5 (359-404)||(15236924-15236969)
chr5 (211-276)||(20765993-20766058)
chr5 (1-57)||(264358-264414)
chr5 (1-97)||(10732530-10732626)
chr5 (1-57)||(20909528-20909584)
chr5 (1-57)||(23065030-23065086)
chr5 (1-97)||(42244955-42245051)
chr5 (20-69)||(7528427-7528476)
chr5 (357-394)||(9776513-9776550)
chr5 (1-57)||(39245652-39245708)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-405)||(15809-16206)
[»] chr7 (206 HSPs)
chr7 (1-403)||(46580343-46580727)
chr7 (1-399)||(16998665-16999065)
chr7 (1-386)||(13647492-13647875)
chr7 (94-403)||(14273583-14273888)
chr7 (1-399)||(11661345-11661738)
chr7 (1-399)||(18872399-18872793)
chr7 (2-406)||(16008610-16009010)
chr7 (1-276)||(18456067-18456342)
chr7 (3-399)||(18607526-18607918)
chr7 (1-399)||(14566241-14566635)
chr7 (1-231)||(48812241-48812471)
chr7 (1-231)||(708974-709204)
chr7 (1-236)||(58837-59071)
chr7 (81-404)||(13918266-13918578)
chr7 (1-399)||(14422023-14422418)
chr7 (82-404)||(25926993-25927301)
chr7 (1-243)||(8756815-8757056)
chr7 (1-231)||(16462439-16462669)
chr7 (1-231)||(32160621-32160851)
chr7 (1-210)||(14415903-14416112)
chr7 (20-236)||(30820694-30820910)
chr7 (1-210)||(46386506-46386715)
chr7 (1-231)||(14191507-14191735)
chr7 (20-231)||(47975349-47975560)
chr7 (20-210)||(13745214-13745404)
chr7 (1-258)||(16550423-16550679)
chr7 (1-258)||(16614983-16615239)
chr7 (1-210)||(44374370-44374579)
chr7 (1-210)||(44383235-44383444)
chr7 (223-404)||(1858707-1858884)
chr7 (206-386)||(9177524-9177700)
chr7 (1-231)||(14188713-14188941)
chr7 (23-210)||(19282516-19282703)
chr7 (1-243)||(13699308-13699549)
chr7 (1-223)||(17070712-17070934)
chr7 (1-223)||(47094491-47094713)
chr7 (1-210)||(12371699-12371908)
chr7 (1-210)||(12465679-12465888)
chr7 (1-236)||(36685668-36685904)
chr7 (1-216)||(15213917-15214132)
chr7 (7-214)||(32434014-32434221)
chr7 (1-210)||(11066892-11067101)
chr7 (1-206)||(15167403-15167608)
chr7 (1-237)||(13408170-13408405)
chr7 (1-243)||(4325448-4325689)
chr7 (20-210)||(13147910-13148100)
chr7 (206-397)||(17017326-17017513)
chr7 (5-223)||(40555166-40555384)
chr7 (20-209)||(8851597-8851786)
chr7 (1-210)||(14928751-14928960)
chr7 (1-210)||(15352217-15352426)
chr7 (1-210)||(33001338-33001547)
chr7 (1-233)||(17505423-17505655)
chr7 (1-233)||(17547559-17547791)
chr7 (1-236)||(832442-832676)
chr7 (1-236)||(1197622-1197856)
chr7 (1-236)||(12755125-12755359)
chr7 (1-396)||(38828304-38828694)
chr7 (1-352)||(147704-148051)
chr7 (1-242)||(29004214-29004455)
chr7 (1-210)||(48743727-48743936)
chr7 (48-208)||(15119761-15119921)
chr7 (1-203)||(32301613-32301815)
chr7 (1-206)||(10896413-10896618)
chr7 (206-399)||(17060282-17060472)
chr7 (1-226)||(34957579-34957804)
chr7 (1-236)||(37727346-37727580)
chr7 (21-210)||(12127602-12127792)
chr7 (1-203)||(14258783-14258985)
chr7 (21-203)||(16580091-16580273)
chr7 (21-203)||(16585390-16585572)
chr7 (20-182)||(12323368-12323530)
chr7 (279-406)||(32301353-32301476)
chr7 (1-214)||(14153391-14153603)
chr7 (20-210)||(20585780-20585966)
chr7 (1-202)||(32771760-32771961)
chr7 (54-210)||(13745672-13745828)
chr7 (57-203)||(16460407-16460553)
chr7 (1-206)||(20619714-20619919)
chr7 (20-159)||(29052593-29052732)
chr7 (303-403)||(16460717-16460817)
chr7 (1-210)||(24270401-24270609)
chr7 (1-210)||(39292156-39292364)
chr7 (301-409)||(14157054-14157162)
chr7 (303-403)||(14258519-14258619)
chr7 (303-403)||(16579827-16579927)
chr7 (303-403)||(16585736-16585836)
chr7 (20-210)||(18875284-18875474)
chr7 (301-406)||(10501373-10501478)
chr7 (208-406)||(42462015-42462209)
chr7 (226-388)||(48991266-48991422)
chr7 (206-386)||(16091844-16092019)
chr7 (212-399)||(16996295-16996477)
chr7 (1-237)||(13864814-13865040)
chr7 (1-133)||(15720250-15720382)
chr7 (303-399)||(20487614-20487710)
chr7 (20-210)||(43277181-43277372)
chr7 (18-210)||(4691332-4691523)
chr7 (78-210)||(13894519-13894651)
chr7 (20-214)||(8514184-8514377)
chr7 (20-210)||(20252780-20252969)
chr7 (301-399)||(38519445-38519543)
chr7 (20-210)||(48213383-48213572)
chr7 (20-209)||(3192731-3192920)
chr7 (1-209)||(15978475-15978682)
chr7 (206-362)||(9725518-9725670)
chr7 (206-395)||(11768777-11768964)
chr7 (212-398)||(130680-130864)
chr7 (20-210)||(14161293-14161482)
chr7 (20-210)||(25941862-25942051)
chr7 (245-350)||(2529951-2530052)
chr7 (206-406)||(9033204-9033401)
chr7 (279-388)||(14929152-14929257)
chr7 (279-388)||(15352618-15352723)
chr7 (20-135)||(3287489-3287604)
chr7 (224-399)||(11525440-11525612)
chr7 (301-406)||(20619446-20619552)
chr7 (20-210)||(21538627-21538816)
chr7 (22-135)||(18080158-18080271)
chr7 (206-294)||(14044922-14045010)
chr7 (206-294)||(14354952-14355040)
chr7 (206-387)||(15008357-15008533)
chr7 (327-403)||(15720064-15720140)
chr7 (89-209)||(28719885-28720005)
chr7 (20-208)||(9743519-9743706)
chr7 (105-203)||(20487874-20487972)
chr7 (338-403)||(8940318-8940383)
chr7 (206-279)||(14036387-14036460)
chr7 (206-279)||(14346417-14346490)
chr7 (1-210)||(15576250-15576458)
chr7 (1-97)||(1856819-1856915)
chr7 (226-398)||(1867874-1868040)
chr7 (312-396)||(837317-837401)
chr7 (312-396)||(1202497-1202581)
chr7 (20-97)||(16108297-16108374)
chr7 (312-396)||(16109474-16109558)
chr7 (1-97)||(13917992-13918088)
chr7 (21-97)||(23664562-23664638)
chr7 (21-97)||(25926739-25926815)
chr7 (338-398)||(38898181-38898241)
chr7 (1-72)||(13897808-13897879)
chr7 (312-396)||(833321-833405)
chr7 (312-396)||(1198501-1198585)
chr7 (328-389)||(10896687-10896748)
chr7 (1-90)||(11309853-11309942)
chr7 (328-389)||(15167285-15167346)
chr7 (1-97)||(11303724-11303820)
chr7 (1-97)||(29800906-29801002)
chr7 (22-97)||(29797087-29797162)
chr7 (1-62)||(44190668-44190729)
chr7 (319-398)||(18203887-18203965)
chr7 (353-404)||(45170089-45170140)
chr7 (29-210)||(8564038-8564218)
chr7 (338-386)||(15081900-15081948)
chr7 (154-210)||(15720200-15720256)
chr7 (59-214)||(3136715-3136869)
chr7 (353-404)||(18279375-18279426)
chr7 (353-404)||(18283338-18283389)
chr7 (82-144)||(1857092-1857154)
chr7 (356-406)||(8468783-8468833)
chr7 (20-130)||(46473562-46473672)
chr7 (357-406)||(14270032-14270081)
chr7 (250-387)||(2280021-2280155)
chr7 (1-57)||(15376303-15376359)
chr7 (5-97)||(18431188-18431280)
chr7 (1-57)||(20384713-20384769)
chr7 (1-97)||(24702705-24702801)
chr7 (1-97)||(24705152-24705248)
chr7 (1-97)||(32125967-32126063)
chr7 (1-97)||(41523394-41523490)
chr7 (1-97)||(41525856-41525952)
chr7 (353-404)||(33079-33130)
chr7 (353-404)||(70848-70899)
chr7 (353-404)||(74957-75008)
chr7 (353-404)||(12704742-12704793)
chr7 (353-404)||(12714836-12714887)
chr7 (353-404)||(12718640-12718691)
chr7 (353-404)||(12723551-12723602)
chr7 (353-404)||(16907284-16907335)
chr7 (353-404)||(26292367-26292418)
chr7 (353-404)||(39722238-39722289)
chr7 (31-97)||(14948742-14948808)
chr7 (211-297)||(48273550-48273636)
chr7 (213-387)||(12255657-12255827)
chr7 (323-396)||(13892670-13892742)
chr7 (304-387)||(20220142-20220222)
chr7 (165-210)||(21675491-21675536)
chr7 (353-397)||(16114220-16114264)
chr7 (353-397)||(16117373-16117417)
chr7 (1-57)||(27217377-27217433)
chr7 (1-52)||(456843-456894)
chr7 (1-52)||(11392889-11392940)
chr7 (20-111)||(16065970-16066061)
chr7 (1-52)||(16233042-16233093)
chr7 (1-72)||(37538970-37539041)
chr7 (153-198)||(1858644-1858689)
chr7 (357-394)||(11303402-11303439)
chr7 (369-406)||(15113009-15113046)
chr7 (357-394)||(16108659-16108696)
chr7 (357-394)||(23664923-23664960)
chr7 (357-394)||(29796763-29796800)
chr7 (357-394)||(29800582-29800619)
chr7 (323-396)||(34957416-34957488)
chr7 (1-57)||(16410575-16410631)
chr7 (21-57)||(26355591-26355627)
chr7 (21-57)||(26358043-26358079)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (1-386)||(269-649)
[»] chr1 (102 HSPs)
chr1 (20-399)||(13881054-13881429)
chr1 (1-380)||(22130484-22130858)
chr1 (1-386)||(45574471-45574841)
chr1 (1-409)||(28312577-28312981)
chr1 (206-399)||(27653081-27653270)
chr1 (1-399)||(20437646-20438041)
chr1 (1-223)||(44822541-44822763)
chr1 (1-210)||(21239714-21239923)
chr1 (1-243)||(21180744-21180985)
chr1 (1-243)||(24815271-24815512)
chr1 (1-224)||(50000883-50001107)
chr1 (1-210)||(14238031-14238240)
chr1 (1-210)||(20588103-20588312)
chr1 (1-210)||(20592641-20592850)
chr1 (5-210)||(7052478-7052684)
chr1 (1-231)||(46198144-46198374)
chr1 (20-210)||(51082640-51082830)
chr1 (29-202)||(19676143-19676316)
chr1 (1-210)||(41227123-41227332)
chr1 (1-243)||(8276411-8276652)
chr1 (1-235)||(20031309-20031543)
chr1 (1-202)||(42912482-42912683)
chr1 (20-210)||(21046487-21046677)
chr1 (20-210)||(51323699-51323889)
chr1 (1-210)||(41225870-41226079)
chr1 (1-396)||(2332629-2333019)
chr1 (1-243)||(7792271-7792512)
chr1 (1-243)||(16401060-16401301)
chr1 (1-210)||(20634053-20634263)
chr1 (1-243)||(22349980-22350221)
chr1 (20-231)||(29764072-29764287)
chr1 (1-210)||(38887506-38887716)
chr1 (1-210)||(45496369-45496579)
chr1 (1-210)||(4596264-4596473)
chr1 (1-210)||(12710312-12710521)
chr1 (1-210)||(16058733-16058942)
chr1 (1-274)||(296715-296988)
chr1 (21-236)||(38057090-38057304)
chr1 (206-397)||(52940736-52940923)
chr1 (1-204)||(23194970-23195173)
chr1 (208-399)||(22124358-22124545)
chr1 (208-399)||(21043142-21043329)
chr1 (1-214)||(14792981-14793193)
chr1 (1-210)||(22823826-22824034)
chr1 (20-210)||(50544276-50544465)
chr1 (207-399)||(20958181-20958369)
chr1 (303-403)||(48603521-48603621)
chr1 (21-210)||(1643020-1643206)
chr1 (208-387)||(21533735-21533908)
chr1 (20-210)||(39060520-39060709)
chr1 (1-206)||(16372178-16372384)
chr1 (20-210)||(24720132-24720321)
chr1 (223-399)||(14800602-14800779)
chr1 (223-399)||(14809476-14809653)
chr1 (206-299)||(20345973-20346066)
chr1 (303-399)||(41781542-41781636)
chr1 (20-214)||(44891869-44892061)
chr1 (55-274)||(294396-294624)
chr1 (1-210)||(17902181-17902389)
chr1 (28-135)||(6833713-6833820)
chr1 (1-135)||(9784762-9784896)
chr1 (20-210)||(18121029-18121218)
chr1 (1-89)||(21659689-21659777)
chr1 (328-399)||(16372070-16372141)
chr1 (208-366)||(47190707-47190861)
chr1 (304-397)||(48520586-48520679)
chr1 (212-339)||(16093748-16093871)
chr1 (312-396)||(32649787-32649871)
chr1 (1-97)||(13227340-13227436)
chr1 (311-398)||(16381256-16381346)
chr1 (301-363)||(20329118-20329181)
chr1 (302-364)||(11945564-11945626)
chr1 (206-366)||(26065045-26065201)
chr1 (1-209)||(16655793-16656000)
chr1 (1-97)||(29535528-29535624)
chr1 (314-391)||(635944-636022)
chr1 (1-90)||(10812788-10812877)
chr1 (1-97)||(16362395-16362491)
chr1 (213-343)||(16758780-16758906)
chr1 (353-404)||(1925212-1925263)
chr1 (353-404)||(20924226-20924277)
chr1 (353-404)||(23819381-23819432)
chr1 (206-387)||(35260939-35261114)
chr1 (323-396)||(29534624-29534697)
chr1 (1-97)||(21841243-21841339)
chr1 (1-97)||(21922881-21922977)
chr1 (358-409)||(51326855-51326906)
chr1 (1-57)||(13989382-13989438)
chr1 (1-97)||(41372948-41373044)
chr1 (353-404)||(1010695-1010746)
chr1 (353-404)||(20228892-20228943)
chr1 (353-404)||(21407327-21407378)
chr1 (304-387)||(41049988-41050070)
chr1 (304-387)||(50614068-50614151)
chr1 (304-387)||(50621896-50621979)
chr1 (357-399)||(43543201-43543243)
chr1 (31-87)||(23593353-23593409)
chr1 (206-249)||(48520787-48520830)
chr1 (304-387)||(50686698-50686781)
chr1 (353-404)||(52639513-52639564)
chr1 (205-243)||(42697112-42697150)
chr1 (353-404)||(16375541-16375593)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-403)||(105149-105545)
scaffold0023 (1-271)||(162647-162917)
scaffold0023 (1-57)||(94927-94983)
[»] chr6 (150 HSPs)
chr6 (1-399)||(25619376-25619770)
chr6 (1-399)||(14979041-14979435)
chr6 (1-403)||(15817177-15817573)
chr6 (1-386)||(20556512-20556893)
chr6 (1-399)||(4476897-4477291)
chr6 (83-404)||(23414952-23415262)
chr6 (81-404)||(27556710-27557022)
chr6 (1-243)||(27851394-27851636)
chr6 (158-386)||(25754972-25755196)
chr6 (1-243)||(20733866-20734107)
chr6 (1-210)||(28947768-28947977)
chr6 (1-243)||(18658598-18658839)
chr6 (1-208)||(18928149-18928356)
chr6 (20-258)||(15173893-15174130)
chr6 (1-231)||(23956265-23956495)
chr6 (1-210)||(18708923-18709132)
chr6 (206-398)||(33443122-33443307)
chr6 (20-210)||(7827396-7827586)
chr6 (20-210)||(19655667-19655857)
chr6 (1-214)||(5834154-5834366)
chr6 (1-210)||(18702988-18703197)
chr6 (1-214)||(20177166-20177378)
chr6 (1-236)||(611139-611373)
chr6 (1-236)||(19825908-19826142)
chr6 (1-214)||(22158613-22158825)
chr6 (1-210)||(23491590-23491799)
chr6 (1-210)||(23497188-23497397)
chr6 (21-203)||(19773148-19773330)
chr6 (1-210)||(17318541-17318750)
chr6 (1-210)||(23150686-23150894)
chr6 (1-209)||(25601696-25601904)
chr6 (1-258)||(13764730-13764979)
chr6 (158-350)||(25752838-25753026)
chr6 (1-399)||(23838247-23838632)
chr6 (1-197)||(15891130-15891326)
chr6 (20-203)||(15705049-15705232)
chr6 (1-223)||(29847922-29848146)
chr6 (1-221)||(19443699-19443919)
chr6 (22-206)||(27317995-27318179)
chr6 (1-176)||(1254215-1254390)
chr6 (1-204)||(8767682-8767885)
chr6 (20-210)||(31734132-31734320)
chr6 (206-397)||(20224018-20224205)
chr6 (206-397)||(22118002-22118189)
chr6 (26-236)||(34296713-34296923)
chr6 (1-169)||(23655804-23655972)
chr6 (1-204)||(25347556-25347759)
chr6 (29-210)||(27125923-27126105)
chr6 (1-214)||(20182984-20183196)
chr6 (1-214)||(22152795-22153007)
chr6 (1-221)||(16133089-16133309)
chr6 (206-399)||(18453255-18453444)
chr6 (1-167)||(755-921)
chr6 (1-204)||(8759936-8760138)
chr6 (20-210)||(25921154-25921343)
chr6 (1-210)||(18455491-18455699)
chr6 (303-403)||(19773494-19773594)
chr6 (1-152)||(31022116-31022267)
chr6 (303-405)||(15705395-15705497)
chr6 (20-214)||(20411110-20411303)
chr6 (206-350)||(18696609-18696749)
chr6 (20-207)||(22556676-22556863)
chr6 (279-403)||(22806001-22806120)
chr6 (1-164)||(25807602-25807765)
chr6 (304-403)||(28103851-28103950)
chr6 (24-135)||(34141067-34141178)
chr6 (24-135)||(34153683-34153794)
chr6 (1-135)||(29044809-29044943)
chr6 (206-387)||(18706391-18706568)
chr6 (20-135)||(18585117-18585232)
chr6 (21-207)||(13285136-13285321)
chr6 (20-210)||(18398343-18398532)
chr6 (20-210)||(32259272-32259460)
chr6 (1-209)||(17857111-17857319)
chr6 (246-391)||(18896215-18896354)
chr6 (246-391)||(19362507-19362646)
chr6 (301-403)||(20136739-20136840)
chr6 (301-403)||(22196029-22196130)
chr6 (1-88)||(7430069-7430156)
chr6 (1-107)||(22806276-22806382)
chr6 (311-396)||(23539045-23539130)
chr6 (301-399)||(20182866-20182962)
chr6 (301-399)||(22153029-22153125)
chr6 (1-97)||(12942666-12942762)
chr6 (6-214)||(15938650-15938857)
chr6 (301-399)||(16493219-16493317)
chr6 (304-398)||(18177624-18177719)
chr6 (304-398)||(18199368-18199463)
chr6 (304-398)||(18204152-18204247)
chr6 (304-398)||(23076806-23076900)
chr6 (304-398)||(23538884-23538978)
chr6 (20-98)||(27330410-27330488)
chr6 (20-98)||(27391150-27391228)
chr6 (1-97)||(23415441-23415537)
chr6 (1-97)||(28288926-28289022)
chr6 (1-88)||(14594044-14594131)
chr6 (301-397)||(23528056-23528150)
chr6 (312-396)||(29416865-29416949)
chr6 (1-97)||(19858512-19858608)
chr6 (21-97)||(27557199-27557275)
chr6 (304-398)||(35008224-35008318)
chr6 (20-212)||(23221288-23221479)
chr6 (353-409)||(31477893-31477949)
chr6 (211-342)||(16448435-16448561)
chr6 (353-404)||(16760267-16760318)
chr6 (353-404)||(22949080-22949131)
chr6 (353-404)||(22953036-22953087)
chr6 (353-404)||(23871524-23871575)
chr6 (353-404)||(23875480-23875531)
chr6 (31-97)||(15892028-15892094)
chr6 (20-61)||(19234658-19234699)
chr6 (137-209)||(16135519-16135591)
chr6 (360-404)||(18955853-18955897)
chr6 (206-252)||(20078033-20078079)
chr6 (1-97)||(17883087-17883183)
chr6 (1-57)||(18334182-18334238)
chr6 (1-208)||(22523388-22523594)
chr6 (1-57)||(24423063-24423119)
chr6 (312-396)||(25738457-25738540)
chr6 (1-97)||(33862270-33862366)
chr6 (353-404)||(8243833-8243884)
chr6 (353-404)||(11566834-11566885)
chr6 (353-404)||(12618927-12618978)
chr6 (353-404)||(14472243-14472294)
chr6 (353-404)||(18917349-18917400)
chr6 (353-404)||(19870562-19870613)
chr6 (353-404)||(22862918-22862969)
chr6 (353-404)||(23395040-23395091)
chr6 (353-404)||(23989892-23989943)
chr6 (1-72)||(35057066-35057137)
chr6 (246-342)||(8227409-8227501)
chr6 (35-97)||(12742794-12742856)
chr6 (357-399)||(15875456-15875498)
chr6 (1-135)||(31161878-31162012)
chr6 (323-396)||(7429918-7429990)
chr6 (245-342)||(18456846-18456938)
chr6 (1-97)||(1540501-1540597)
chr6 (1-57)||(26924037-26924093)
chr6 (21-121)||(32277441-32277541)
chr6 (1-57)||(33864794-33864850)
chr6 (1-52)||(2290770-2290821)
chr6 (1-52)||(8055551-8055602)
chr6 (245-295)||(25644495-25644545)
chr6 (6-64)||(31163536-31163594)
chr6 (359-404)||(1644680-1644725)
chr6 (357-394)||(12942356-12942393)
chr6 (323-396)||(14594210-14594282)
chr6 (208-249)||(17229776-17229817)
chr6 (20-64)||(3007550-3007594)
chr6 (1-57)||(22782743-22782799)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (20-403)||(1547-1926)
scaffold0125 (1-210)||(27724-27933)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (1-403)||(486-882)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (1-386)||(12221-12602)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (1-403)||(169416-169801)
scaffold0020 (21-209)||(143038-143226)
scaffold0020 (301-399)||(142654-142753)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (20-386)||(82235-82600)
scaffold0037 (359-404)||(80424-80469)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (1-396)||(9375-9765)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (1-399)||(110726-111120)
scaffold0026 (1-231)||(21484-21714)
scaffold0026 (20-210)||(146156-146346)
scaffold0026 (23-204)||(124001-124182)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (206-403)||(9943-10136)
scaffold0107 (228-399)||(36253-36420)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (20-231)||(11100-11311)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (206-406)||(24456-24652)
[»] scaffold0019 (5 HSPs)
scaffold0019 (1-399)||(132989-133383)
scaffold0019 (31-210)||(29582-29761)
scaffold0019 (1-249)||(133583-133831)
scaffold0019 (279-397)||(29285-29390)
scaffold0019 (1-69)||(33803-33871)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (20-208)||(10885-11073)
scaffold0371 (78-170)||(17223-17315)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (1-231)||(3361-3591)
scaffold0338 (1-52)||(1-52)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (1-243)||(19063-19304)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (1-291)||(1113-1390)
[»] scaffold0117 (3 HSPs)
scaffold0117 (82-404)||(39320-39631)
scaffold0117 (1-110)||(21285-21394)
scaffold0117 (51-97)||(39809-39855)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (82-404)||(31191-31502)
scaffold0051 (20-207)||(64507-64694)
scaffold0051 (29-97)||(31680-31748)
[»] scaffold0108 (4 HSPs)
scaffold0108 (20-223)||(5828-6031)
scaffold0108 (1-210)||(7202-7409)
scaffold0108 (344-406)||(3323-3385)
scaffold0108 (206-249)||(3395-3438)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (82-404)||(17641-17952)
scaffold0200 (1-97)||(18130-18226)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (20-258)||(5835-6072)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (1-231)||(176195-176425)
scaffold0001 (1-235)||(152629-152863)
scaffold0001 (1-227)||(168846-169072)
scaffold0001 (1-223)||(77098-77320)
scaffold0001 (323-396)||(163071-163143)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (1-210)||(78488-78697)
scaffold0047 (206-388)||(22361-22540)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (206-386)||(3186-3362)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (1-223)||(3117-3339)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (1-210)||(5132-5341)
scaffold0737 (1-234)||(6096-6330)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-210)||(21679-21888)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (1-210)||(28787-28996)
scaffold0180 (1-72)||(9997-10068)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (20-208)||(1130-1318)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (16-208)||(5714-5906)
scaffold0109 (1-210)||(396-605)
scaffold0109 (1-271)||(2702-2971)
scaffold0109 (353-404)||(36025-36076)
[»] scaffold0293 (3 HSPs)
scaffold0293 (81-404)||(19951-20263)
scaffold0293 (206-399)||(17575-17764)
scaffold0293 (1-97)||(19678-19774)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (20-206)||(7027-7213)
scaffold0639 (301-399)||(7438-7537)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (20-210)||(7823-8013)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (1-163)||(4568-4730)
scaffold0153 (1-72)||(11679-11750)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (1-210)||(7975-8184)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (1-231)||(4433-4667)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (1-231)||(4433-4667)
scaffold0306 (338-400)||(15069-15131)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (1-210)||(58172-58381)
scaffold0064 (1-97)||(68438-68534)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (1-210)||(15005-15214)
scaffold0061 (1-210)||(24063-24272)
[»] scaffold1539 (2 HSPs)
scaffold1539 (1-209)||(1332-1540)
scaffold1539 (301-406)||(1004-1110)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (16-208)||(7401-7593)
scaffold0546 (1-88)||(10336-10423)
scaffold0546 (162-210)||(11219-11267)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (23-210)||(908-1095)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (1-220)||(8478-8697)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (1-236)||(395-630)
scaffold0599 (338-403)||(1279-1344)
[»] scaffold0575 (2 HSPs)
scaffold0575 (1-203)||(5745-5947)
scaffold0575 (303-399)||(6111-6207)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (1-352)||(2146-2493)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (1-231)||(70247-70477)
scaffold0057 (1-110)||(71935-72044)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-231)||(11926-12156)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (21-210)||(589-778)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (2-223)||(16175-16396)
scaffold0220 (1-223)||(13357-13579)
scaffold0220 (1-184)||(8686-8869)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (1-210)||(39523-39732)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-210)||(22210-22419)
scaffold0080 (21-242)||(29124-29345)
scaffold0080 (21-242)||(34589-34810)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (21-258)||(22208-22444)
scaffold0046 (246-391)||(16818-16957)
scaffold0046 (246-391)||(25978-26117)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (1-208)||(5086-5293)
[»] scaffold0123 (4 HSPs)
scaffold0123 (1-252)||(6407-6658)
scaffold0123 (209-351)||(658-796)
scaffold0123 (207-366)||(25213-25367)
scaffold0123 (47-210)||(16362-16524)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (20-203)||(21083-21266)
scaffold0018 (303-403)||(20819-20919)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (1-179)||(106622-106800)
scaffold0040 (301-399)||(11219-11316)
scaffold0040 (301-399)||(22319-22416)
[»] scaffold0077 (6 HSPs)
scaffold0077 (1-274)||(22929-23202)
scaffold0077 (18-182)||(33791-33955)
scaffold0077 (1-204)||(17676-17879)
scaffold0077 (206-399)||(55543-55733)
scaffold0077 (1-167)||(22598-22765)
scaffold0077 (78-204)||(23386-23512)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (31-207)||(8752-8928)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (20-223)||(7295-7498)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (20-203)||(21499-21682)
scaffold0096 (303-399)||(21239-21335)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (20-203)||(126179-126362)
scaffold0011 (303-403)||(126024-126124)
scaffold0011 (20-214)||(32874-33067)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-236)||(159369-159603)
[»] scaffold0452 (3 HSPs)
scaffold0452 (1-203)||(13084-13286)
scaffold0452 (20-209)||(8088-8277)
scaffold0452 (303-357)||(13450-13502)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (1-243)||(6191-6432)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-223)||(8468-8690)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (1-210)||(7557-7766)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-210)||(21157-21366)
scaffold0106 (206-398)||(19505-19693)
scaffold0106 (338-403)||(15225-15290)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (209-378)||(121-286)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (20-218)||(10636-10835)
scaffold0462 (20-214)||(740-932)
scaffold0462 (20-214)||(6246-6438)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (20-203)||(6944-7127)
scaffold0292 (303-399)||(6684-6780)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-236)||(35990-36224)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (28-210)||(7941-8123)
scaffold0529 (68-179)||(8152-8263)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (20-210)||(12974-13164)
scaffold0111 (301-391)||(7510-7601)
scaffold0111 (301-391)||(14629-14720)
scaffold0111 (148-210)||(19369-19431)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (1-210)||(1509-1718)
scaffold0334 (5-146)||(4-145)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (1-210)||(1988-2197)
scaffold0241 (1-130)||(5413-5542)
scaffold0241 (122-210)||(5141-5229)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (18-203)||(3701-3886)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (1-210)||(9479-9688)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-274)||(138135-138408)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (206-407)||(4555-4752)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (20-210)||(3843-4034)
scaffold0439 (1-210)||(11583-11792)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (24-238)||(51355-51568)
scaffold0042 (1-115)||(67187-67301)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (1-203)||(120341-120543)
scaffold0034 (22-170)||(29637-29785)
scaffold0034 (304-406)||(120074-120176)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (1-210)||(168861-169071)
scaffold0021 (312-396)||(146261-146345)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (1-210)||(30036-30245)
scaffold0205 (301-397)||(29747-29844)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (1-210)||(7643-7852)
scaffold0104 (1-210)||(14274-14483)
scaffold0104 (1-202)||(26358-26559)
scaffold0104 (1-202)||(27740-27941)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (22-210)||(422-610)
scaffold0083 (22-210)||(5726-5914)
scaffold0083 (20-89)||(1480-1549)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (59-210)||(22482-22633)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (20-206)||(10367-10554)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (208-399)||(621-808)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (206-369)||(2285-2444)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (20-207)||(632-819)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (226-406)||(10539-10715)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (22-178)||(11101-11257)
scaffold0413 (245-274)||(15513-15542)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (20-220)||(12748-12948)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (206-388)||(13979-14158)
scaffold0005 (20-210)||(186943-187133)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (206-366)||(3701-3857)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (206-389)||(520-699)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (66-207)||(9711-9851)
scaffold0134 (1-57)||(38338-38394)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-210)||(66451-66660)
scaffold0004 (246-364)||(332423-332537)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (206-399)||(18026-18215)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (1-177)||(23623-23799)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (82-236)||(21040-21193)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (1-209)||(769-977)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (20-210)||(10135-10314)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (20-210)||(1135-1325)
[»] scaffold0054 (3 HSPs)
scaffold0054 (20-214)||(65419-65612)
scaffold0054 (301-403)||(75778-75880)
scaffold0054 (205-252)||(75686-75733)
[»] scaffold0436 (2 HSPs)
scaffold0436 (301-406)||(8097-8202)
scaffold0436 (1-97)||(8495-8591)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (206-398)||(206383-206570)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (20-214)||(106-299)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (20-214)||(62139-62332)
scaffold0063 (1-45)||(39328-39372)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (208-406)||(713-906)
scaffold0010 (206-343)||(60573-60706)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (206-399)||(85618-85807)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (23-214)||(8240-8431)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (316-403)||(15030-15117)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (303-409)||(915-1021)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (276-399)||(1967-2086)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (20-214)||(56397-56590)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (83-218)||(33334-33469)
scaffold0138 (1-97)||(33648-33744)
scaffold0138 (304-398)||(18190-18284)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (1-103)||(767-869)
[»] scaffold0357 (4 HSPs)
scaffold0357 (206-317)||(2849-2956)
scaffold0357 (207-387)||(15959-16136)
scaffold0357 (207-387)||(13213-13391)
scaffold0357 (333-398)||(2737-2802)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (20-214)||(18092-18285)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (206-299)||(8296-8389)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-210)||(18589-18797)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-210)||(25940-26148)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (1-209)||(7931-8139)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (212-399)||(221072-221254)
scaffold0012 (353-404)||(189460-189511)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (28-209)||(11664-11844)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-209)||(11626-11833)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-210)||(34689-34893)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (2-210)||(35937-36144)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (20-135)||(7293-7408)
scaffold0230 (31-97)||(14424-14490)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (301-399)||(3029-3128)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (1-135)||(1-135)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (6-119)||(2403-2516)
scaffold0676 (353-404)||(422-473)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (206-399)||(29282-29472)
[»] scaffold0825 (2 HSPs)
scaffold0825 (5-121)||(1057-1173)
scaffold0825 (140-236)||(1373-1468)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (22-122)||(2493-2593)
scaffold0256 (120-210)||(3059-3149)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (276-399)||(3940-4060)
[»] scaffold0485 (2 HSPs)
scaffold0485 (301-399)||(10236-10334)
scaffold0485 (208-261)||(10358-10411)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (1-135)||(18545-18679)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (20-209)||(2218-2406)
scaffold0409 (20-209)||(10473-10661)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (1-88)||(102-189)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (20-135)||(8058-8173)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (301-399)||(2620-2719)
scaffold0507 (125-206)||(2377-2458)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (304-394)||(101-191)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (338-403)||(628-693)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (306-406)||(7900-8000)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-98)||(24482-24579)
scaffold0162 (165-214)||(24586-24635)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (338-406)||(4256-4324)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (246-391)||(57898-58037)
[»] scaffold0914 (2 HSPs)
scaffold0914 (306-388)||(1785-1868)
scaffold0914 (208-244)||(1928-1964)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (301-399)||(30404-30503)
scaffold0013 (1-116)||(7796-7911)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (28-210)||(11793-11974)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (338-403)||(53825-53890)
scaffold0022 (304-387)||(128922-129005)
scaffold0022 (211-276)||(116608-116673)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (304-391)||(6116-6203)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (20-208)||(13210-13402)
scaffold0317 (338-403)||(6889-6954)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (5-207)||(32671-32872)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (342-403)||(6932-6993)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (312-396)||(48403-48487)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (1-97)||(3500-3596)
scaffold0422 (357-394)||(3178-3215)
[»] scaffold0369 (2 HSPs)
scaffold0369 (1-87)||(16407-16493)
scaffold0369 (137-210)||(16525-16598)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (207-295)||(27526-27614)
scaffold0165 (245-387)||(27646-27785)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-97)||(21225-21321)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (353-404)||(367-418)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (353-404)||(11584-11635)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (353-404)||(32743-32794)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (353-404)||(36169-36220)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (304-387)||(97092-97175)
scaffold0006 (304-387)||(106370-106453)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-97)||(6423-6519)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (353-404)||(14170-14221)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (353-404)||(58802-58853)
[»] scaffold0956 (1 HSPs)
scaffold0956 (20-62)||(2361-2403)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (31-97)||(53-119)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (152-210)||(2364-2422)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (20-62)||(174586-174628)
scaffold0016 (359-404)||(207591-207636)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (21-214)||(874-1066)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-57)||(13909-13965)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-57)||(40916-40972)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (353-404)||(3958-4009)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (353-404)||(5184-5235)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (353-404)||(12394-12445)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (20-135)||(20512-20627)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (1-68)||(9606-9673)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (34-97)||(11766-11829)
scaffold0029 (353-404)||(65611-65662)
scaffold0029 (353-404)||(61695-61746)
scaffold0029 (353-404)||(80687-80738)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (304-398)||(6235-6329)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (304-398)||(38392-38486)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (357-394)||(1583-1620)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (162-210)||(1-49)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (358-406)||(10858-10906)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-97)||(9718-9814)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (20-135)||(17163-17278)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (245-274)||(11659-11688)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (323-396)||(16541-16613)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (20-69)||(35068-35117)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (323-396)||(209001-209073)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 146)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 409
Target Start/End: Original strand, 19808018 - 19808420
Alignment:
Q  3 agctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattc 102  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19808018 agctttccaatgatattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatcctctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 19808117  T
Q  103 agcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaa 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  19808118 agcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaa 19808217  T
Q  203 cctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagcta 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||    
T  19808218 cctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactgttataatatgatttaatgttga----ta 19808313  T
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808314 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 19808413  T
Q  403 gttgtct 409  Q
    | |||||    
T  19808414 gctgtct 19808420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 22237673 - 22238073
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||  ||||||    
T  22237673 ttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagagaaatcttaggaaaat 22237772  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||    
T  22237773 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattatgttgtttaagagtattt 22237872  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  22237873 aacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga---- 22237968  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237969 tagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 22238068  T
Q  401 gtgtt 405  Q
    |||||    
T  22238069 gtgtt 22238073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 405
Target Start/End: Original strand, 17460725 - 17461106
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||    
T  17460725 ggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcaacataaccgtttctaa 17460824  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17460825 gttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttga 17460924  T
Q  220 tctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttg 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  17460925 tccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttg 17461020  T
Q  320 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  17461021 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctctagatgtttatgtgtt 17461106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 25483893 - 25484274
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  25483893 ttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 25483992  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25483993 tcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 25484092  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  25484093 aacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga---- 25484188  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25484189 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttattatat 25484274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 39694947 - 39695188
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  39694947 ttagctttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaat 39695046  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  39695047 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgttt 39695146  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  39695147 aacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 39695188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 41680553 - 41680795
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  41680553 ttagctttccaatggctttggattgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 41680652  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  41680653 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtattt 41680752  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  41680753 aacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatggaggttg 41680795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 82 - 404
Target Start/End: Original strand, 14397604 - 14397915
Alignment:
Q  82 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 181  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  14397604 agtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 14397703  T
Q  182 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 281  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14397704 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 14397796  T
Q  282 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 381  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  14397797 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgctgttgattatcaattgatattgt 14397892  T
Q  382 tatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14397893 tatatcttgagatgtttacgtgt 14397915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 15635599 - 15635840
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15635599 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggcttttgagatataatgaagatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 15635698  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15635699 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatcctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 15635798  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  15635799 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 15635840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 364421 - 364148
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  364421 ttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 364322  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  364321 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattattt 364222  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    || | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  364221 aatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 364148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19882601 - 19882371
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19882601 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 19882502  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  19882501 tcagcataactgtttctaagttaatcccaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagggtattt 19882402  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  19882401 aacctatgttgtgagttggtccttagggtag 19882371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20454851 - 20454638
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20454851 tttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 20454752  T
Q  122 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20454751 taatccaaaacttatgggataattcaaacccacaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 20454652  T
Q  222 tttggggtaggaatg 236  Q
     ||||| ||||||||    
T  20454651 -ttgggataggaatg 20454638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26454344 - 26454087
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  26454344 ttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 26454245  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26454244 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 26454145  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 258  Q
    |||||||||| | ||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  26454144 aacctatgttgtaagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 26454087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 44522845 - 44523118
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  |||||||    
T  44522845 ttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctcatgaaaat 44522944  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  44522945 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtattt 44523044  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    || | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||  ||||||||||    
T  44523045 aatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgacgtgtgaagctg 44523118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22207900 - 22207693
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22207900 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttgggttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaat 22207801  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  22207800 tcagcataactgtttctaaattaatccaaaacttatggaataattccaaacctgaaaactagaagtatcaggggttcaattaaggtgtttaagagtattt 22207701  T
Q  201 aacctatg 208  Q
    ||||||||    
T  22207700 aacctatg 22207693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11775327 - 11775125
Alignment:
Q  29 tgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcca 128  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11775327 tgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcca 11775228  T
Q  129 aaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttgggg 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||    
T  11775227 aaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttgggg 11775128  T
Q  229 tag 231  Q
    |||    
T  11775127 tag 11775125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 20178940 - 20179149
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  20178940 ttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 20179039  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20179040 tcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtattt 20179139  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  20179140 aacctatgtt 20179149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18834085 - 18833898
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  18834085 ggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaa 18833986  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 207  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18833985 gttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctat 18833898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 27941308 - 27941655
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||  || |||||| ||||| || |||||||    
T  27941308 ttagctttccaatggcttcggtgtgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaat 27941407  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| ||||| |||||||    
T  27941408 tcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaatagtattt 27941507  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  27941508 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 27941603  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 352  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27941604 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatatgagatgttta 27941655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5761166 - 5760957
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  5761166 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 5761067  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  5761066 tcagcataactgtttctaggttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaattagggtgtttaagagtattt 5760967  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  5760966 aacctatgtt 5760957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 6102172 - 6102381
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  6102172 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgcaaatggtttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 6102271  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||    
T  6102272 tcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatatttaagagtattt 6102371  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  6102372 aacctatgtt 6102381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 18024114 - 18024323
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||  | | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  18024114 ttagctttccaatagctttgatttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 18024213  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18024214 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggcatagttccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 18024313  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  18024314 aacctatgtt 18024323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 21861059 - 21861248
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21861059 gtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgctgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 21861158  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21861159 tttatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 21861248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 6573495 - 6573682
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6573495 ggtttgacttgaaaatgatttttgatttt-gagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaa 6573593  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  6573594 gttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaggtactaggggttcaattaagttgtttaagagtatctaacatatg 6573682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23478694 - 23478478
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||| |||    
T  23478694 ggtttgacttgaaaatgatttttagtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatgcagcataaccatttataa 23478595  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||     
T  23478594 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttcatagtatttaacatatgttgtgagttgg 23478495  T
Q  220 tctttggggtaggaatg 236  Q
    || ||||||||| ||||    
T  23478494 tccttggggtagaaatg 23478478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20455609 - 20455395
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20455609 gtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 20455510  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat 220  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20455509 ttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgat 20455410  T
Q  221 ctttggggtaggaatg 236  Q
    | ||||| ||||||||    
T  20455409 c-ttgggataggaatg 20455395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20460587 - 20460373
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20460587 gtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 20460488  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat 220  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20460487 ttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgat 20460388  T
Q  221 ctttggggtaggaatg 236  Q
    | ||||| ||||||||    
T  20460387 c-ttgggataggaatg 20460373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 42818346 - 42818533
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42818346 gtttgacgtgaaaatgatttttggttcttaagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 42818445  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  42818446 ttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaatctatg 42818533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44432495 - 44432221
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa 99  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||  || ||||||    
T  44432495 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 44432396  T
Q  100 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  44432395 ttcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 44432296  T
Q  200 taacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    ||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  44432295 taatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 44432221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19140398 - 19140189
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  19140398 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgtgatatgatgcaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 19140299  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  19140298 tcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaacagtattt 19140199  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  19140198 aacctatgtt 19140189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 39936449 - 39936638
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39936449 ggtttgacgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 39936548  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39936549 gttaatccaaaacttaagaaataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatgtt 39936638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17795865 - 17795592
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  17795865 ttagctttccaatggcttgggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 17795766  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  17795765 tcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacaagtattt 17795666  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    || | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  17795665 aatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctg 17795592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 38185505 - 38185706
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  38185505 ttagctttccaatgactttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 38185604  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  38185605 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 38185704  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  38185705 aa 38185706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 42559947 - 42560181
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  42559947 ttagcttttcaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 42560046  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |    
T  42560047 tcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaagctc-aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgt 42560145  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    ||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  42560146 aacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 42560181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39364157 - 39363955
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |  ||||||    
T  39364157 ttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcgtaggaaaat 39364058  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  39364057 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttgagagtattt 39363958  T
Q  201 aac 203  Q
    |||    
T  39363957 aac 39363955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17437737 - 17437945
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17437737 ttagctttccagtggctttggtttgacgtaaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaat 17437836  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || || |||||  |||||||||||||    
T  17437837 tcagcacaaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataattccaaatctcaaaactagaaataataggattttaattaaggagtttaagagtattt 17437936  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  17437937 aacctatgt 17437945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 20084057 - 20084266
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20084057 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaat 20084156  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat-ttaagagtatt 199  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    |||||| ||||    
T  20084157 tcagcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagagaataattccaaacctcaaa-ctagaagtactaggagtttaattaagggggcttaagattatt 20084255  T
Q  200 taacctatgtt 210  Q
    |||||||||||    
T  20084256 taacctatgtt 20084266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 5082650 - 5082838
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  5082650 ggtttaacatgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctgagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaa 5082749  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  5082750 gttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacttatg 5082838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 42266014 - 42266252
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||   |||||    
T  42266014 ttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctt---aaaat 42266110  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||     
T  42266111 tcagtataaccttttctaagttaatccaaagcttatggaataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattc 42266210  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||  |||||  ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  42266211 aactcatgttgagagttaatc-ttgggataggaatggaagttg 42266252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 206 - 398
Target Start/End: Original strand, 20533267 - 20533455
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||    
T  20533267 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgttctgtgaagctgttataatgtgatttattgttga----tagta 20533362  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  20533363 atgtaatataattgtatatgcattttgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatcatcacttgatattattatatctggatatgttt 20533455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 208 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16799748 - 16799561
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatc-tttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 306  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||    
T  16799748 gttaagagttgatcctttggggtatgaatggaggatgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagtaa 16799653  T
Q  307 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  16799652 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaaatatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgtt 16799561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 230 - 397
Target Start/End: Original strand, 23943876 - 23944039
Alignment:
Q  230 aggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcatt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23943876 aggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcatt 23943971  T
Q  330 atgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  23943972 atgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 23944039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 44477057 - 44476851
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  44477057 ttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 44476958  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  44476957 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatt 44476858  T
Q  200 taaccta 206  Q
    |||||||    
T  44476857 taaccta 44476851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 44480319 - 44480113
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  44480319 ttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 44480220  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  44480219 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatt 44480120  T
Q  200 taaccta 206  Q
    |||||||    
T  44480119 taaccta 44480113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19880433 - 19880205
Alignment:
Q  29 tgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcca 128  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19880433 tgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcca 19880334  T
Q  129 aaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttgggg 228  Q
    |||||||  | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  19880333 aaacttattggataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggg 19880234  T
Q  229 taggaatggaggttgaatataatattaatg 258  Q
     | |||  || |||| ||||||||||||||    
T  19880233 ca-gaaacgaagttgtatataatattaatg 19880205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 206 - 398
Target Start/End: Original strand, 19154744 - 19154932
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||    
T  19154744 atgttacgagttgatccttggtgtaggaatggaggttatatgtaatattaatgatgatttgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tacta 19154839  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||    
T  19154840 atgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattagcacttgatattattatatctggatatgttt 19154932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 223
Target Start/End: Original strand, 21579645 - 21579848
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  |||||||    
T  21579645 ggtttgactcgaatatgatttttagtttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaa 21579744  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21579745 gttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaattagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttga 21579844  T
Q  220 tctt 223  Q
    ||||    
T  21579845 tctt 21579848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 8728356 - 8728561
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||||| || |||||||    
T  8728356 ttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgaattttagtttaggagttatgatgaaaatactacaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 8728455  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt-caaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8728456 tcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 8728554  T
Q  200 taaccta 206  Q
    |||||||    
T  8728555 taaccta 8728561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Original strand, 361675 - 361840
Alignment:
Q  45 tttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  361675 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 361774  T
Q  145 tcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  361775 tccaaagctcaaaactaggagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 361840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37515967 - 37515778
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| | | |||  ||| |||||| ||||||||||||| |||    ||    
T  37515967 atgttataagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttttatgagtctgatataatgtgatttaatgttgttag----ta 37515872  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37515871 atgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgttta 37515778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32950187 - 32950025
Alignment:
Q  48 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  32950187 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 32950088  T
Q  148 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32950087 aaagctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 32950025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 209 - 387
Target Start/End: Original strand, 17439367 - 17439541
Alignment:
Q  209 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||    
T  17439367 ttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacagtattaatgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataa----taatg 17439462  T
Q  309 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17439463 tgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17439541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 273 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23659602 - 23659480
Alignment:
Q  273 tgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23659602 tgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 23659507  T
Q  373 tgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||    
T  23659506 tgatgttgttatatctcaagatgttta 23659480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23914556 - 23914344
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||  || || || ||||||||| |||||||    
T  23914556 ttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcctattgaaattttatgaaaat 23914457  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||  ||||| |||||||    
T  23914456 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaagtagaagtactaggagtt-tattaaggggtttaacagtattt 23914358  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||| | ||||||||    
T  23914357 aacatgtgttatga 23914344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 206 - 389
Target Start/End: Original strand, 14103083 - 14103262
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagt 304  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||     |    
T  14103083 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatataaatgatgatctatgaagttgt-ataatatgattttaatgttgatat----t 14103177  T
Q  305 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 389  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14103178 aatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 14103262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22483377 - 22483171
Alignment:
Q  3 agctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattc 102  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22483377 agctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 22483278  T
Q  103 agcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaa 202  Q
     |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22483277 cgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 22483179  T
Q  203 cctatgtt 210  Q
    | ||||||    
T  22483178 cttatgtt 22483171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 20517559 - 20517745
Alignment:
Q  23 ttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20517559 ttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctaagtc 20517658  T
Q  123 aatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || |||||||||| |||     || |||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20517659 aacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20517745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22258723 - 22258935
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22258723 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 22258822  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22258823 tccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 22258921  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    || |||||||||||    
T  22258922 aaactatgttatga 22258935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 404
Target Start/End: Original strand, 25363154 - 25363255
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25363154 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 25363253  T
Q  403 gt 404  Q
    ||    
T  25363254 gt 25363255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 206 - 387
Target Start/End: Original strand, 40492711 - 40492887
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||     
T  40492711 atgttgtgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtg 40492806  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||| || ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  40492807 atgtaatatatttgtatatgcaat-catgaattatttatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 40492887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 21321759 - 21321968
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||||| |||| || |||||||    
T  21321759 ttagctttccaatggcttagatttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtaaaatcttatgaaaat 21321858  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||| || |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||    
T  21321859 tcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattataagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtattt 21321958  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  21321959 aacctatgtt 21321968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 21326357 - 21326566
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   | |||||||||||| || |||||||    
T  21326357 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtgaaatcttatgaaaat 21326456  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||| || |||||| | |||||||| ||| |  |||||||||||||    
T  21326457 tcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattaaaagtacaatgagttcaattaaagagtttaagagtattt 21326556  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  21326557 aacctatgtt 21326566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17501558 - 17501350
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||  |  |||| || || |||| ||||||     
T  17501558 ttagctttccaatggcttgggtttaacttaaaaatgatttttagattttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaaa 17501459  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||    
T  17501458 ttagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtattt 17501359  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  17501358 aacctatgt 17501350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 230
Target Start/End: Original strand, 8414240 - 8414358
Alignment:
Q  112 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  8414240 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttg 8414339  T
Q  212 tgagttgatctttggggta 230  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  8414340 tgagttggtccttggggta 8414358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 208 - 399
Target Start/End: Original strand, 20501962 - 20502149
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 307  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  20501962 gttatgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatataattgttgatgttcagtgaatctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 20502057  T
Q  308 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20502058 atgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgttgttggttatcatttgatattgttatatcttgagatattta 20502149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22344655 - 22344466
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  22344655 ggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaa 22344556  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22344555 gtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22344466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22356315 - 22356126
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  22356315 ggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaa 22356216  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22356215 gtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22356126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 18816898 - 18817089
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttg--gtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  18816898 ggtttgacttgaaaatgatttttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttct 18816997  T
Q  118 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18816998 aagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacatcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18817089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23660829 - 23660688
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||    
T  23660829 ggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaa 23660730  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 161  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  23660729 gttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaacta 23660688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23670262 - 23670069
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||     
T  23670262 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttattaaaattccgcataactatttctag 23670163  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || || |||||||||| | | |   || |||| |||||  | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23670162 gtcaacccaaaacttatgaattgtatccaaacttcaaagattg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 23670069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 36732943 - 36733077
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  36732943 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttggtgaaattttatgaaaat 36733042  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  36733043 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 36733077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 4381232 - 4381420
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4381232 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttacgataaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaag 4381331  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    | || |||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4381332 tcaacccaaaacttatgaattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 4381420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38989098 - 38988886
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  38989098 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 38988999  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||  | || ||| |||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  38988998 tccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtattt 38988900  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||||||||||||||    
T  38988899 aacctatgttatga 38988886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39020195 - 39019983
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  39020195 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 39020096  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||  | || ||| |||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39020095 tccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtattt 39019997  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||||||||||||||    
T  39019996 aacctatgttatga 39019983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Original strand, 17086012 - 17086201
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| ||  |||  |   ||||||||||||| ||||||||||    ||    
T  17086012 atgttatgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcaatgagtccaatataatatgatttgatgttgatag----ta 17086107  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17086108 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatgttta 17086201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 223
Target Start/End: Original strand, 29763307 - 29763510
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||| || ||||   |||||||    
T  29763307 ggtttgactcgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagaataatcatttctaa 29763406  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |    |||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  29763407 gttaatccgaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgggaaagagtgtttaacctatgttgtgaattga 29763506  T
Q  220 tctt 223  Q
    ||||    
T  29763507 tctt 29763510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36305291 - 36305083
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |  |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36305291 ttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatggtttttgctttttgagttatgataaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaat 36305192  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |  |||||||| ||||||||| || |||||||| | ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| |||| ||| |||| | |||||||||||||    
T  36305191 ttcgcataactatttctaagtaaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagtccaattaagatgtttaagagtattt 36305093  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  36305092 aacctatgtt 36305083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 18815279 - 18815450
Alignment:
Q  38 tttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |    
T  18815279 tttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 18815378  T
Q  138 gaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || |   || |||| |||||  | |  |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18815379 gattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 18815450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21399343 - 21399209
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  21399343 ttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaat 21399244  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    || |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  21399243 tctgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 21399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21793836 - 21793702
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  21793836 ttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaat 21793737  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    || |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  21793736 tctgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 21793702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 206 - 396
Target Start/End: Original strand, 22253024 - 22253210
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || || |  ||| ||||||||||||| |||||  |||    ||    
T  22253024 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtaagtctgatataatatgatttgatgttcttag----ta 22253119  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||| ||| | || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22253120 atgtgataaagttatatatgcattatgtggatcacataagatgtttaagttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 22253210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 206 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23668071 - 23667885
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||| || ||||  ||  ||| ||||||||| | |||| |||    ||    
T  23668071 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttaatgttcagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttag----ta 23667976  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt-gattatcatttgatgttgttatatcttgagatg 395  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23667975 atgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgtttaagttgatgttaaaatattatttgatattgttatatcttgagatg 23667885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 208 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22996104 - 22995927
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata-atatgatttaatgttgatagctagtaa 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || || |  ||||| |||||||  ||| |||| | ||||||| ||||| | |     |||    
T  22996104 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtctgctatatacatgatttgatgttaaaaa----taa 22996009  T
Q  307 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 388  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22996008 tgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 22995927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Original strand, 36405501 - 36405691
Alignment:
Q  23 ttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||     
T  36405501 ttgatttgaaaatgatttttgttttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtc 36405600  T
Q  123 aatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || |||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36405601 aacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaatgtgtttaatagtatttaacctaagttatga 36405691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 406
Target Start/End: Original strand, 17438166 - 17438272
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17438166 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 17438265  T
Q  400 cgtgttg 406  Q
     ||||||    
T  17438266 tgtgttg 17438272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 17978855 - 17979044
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||    
T  17978855 ggtttgacttgaaaataagttttggtttttgagttatgatgaaaatatttcaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaa 17978954  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| |||||  | |  |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17978955 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgtt 17979044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 337 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23409930 - 23409864
Alignment:
Q  337 ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23409930 ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 23409864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Original strand, 5083103 - 5083202
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5083103 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatccttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 5083202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18833733 - 18833635
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18833733 tagtaatgtgatatatgtgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgtttattatttgatattgttatatc-tgagatgttta 18833635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21513933 - 21513823
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  21513933 ggtttggcttgaaaatgatttttgggttttgagatatgatcaaaatactccaa-gaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctag 21513835  T
Q  120 gttaatccaaaa 131  Q
    || || ||||||    
T  21513834 gtcaacccaaaa 21513823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22474364 - 22474176
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||| | |||||| |    
T  22474364 gtttgacttgaaaacgatttttggtttttgaattatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaactccacataattatttctagg 22474265  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    | || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22474264 tcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 22474176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24907388 - 24907203
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || ||| | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||    
T  24907388 ggtttgactttaaaatgatttttgatttttgagttatgacgaaaatactctaaggaggtttgagtgaaattttatgaaaattccgcataactaattctaa 24907289  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 207  Q
    || || |||||||||| ||| |  |||  ||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  24907288 gtcaacccaaaacttatggattgtttc-caacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaagttgtttaagaatatttaacctat 24907203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 303 - 399
Target Start/End: Original strand, 22963364 - 22963461
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22963364 gtaatgtgatataattgtatatgcattgtgtgaattataaaatatgttaaagttgatgttgaattattatttgatattgttatatcttgagatgttta 22963461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 327 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23914183 - 23914110
Alignment:
Q  327 attatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23914183 attatgtgaattaatataagatgtttaagttgttgctgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 23914110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16198467 - 16198371
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  16198467 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgattaaaatactccacggaggtcttagtgaaattttatgaa 16198371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22525778 - 22525659
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||    | | |||    
T  22525778 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttaattataatactcctgatgttttgtgaatctgttataacatgatttaatgtt----gttggta 22525683  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcatt 329  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  22525682 atgtcatatatttgtatatgcatt 22525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 18118603 - 18118792
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||| ||||  || |||| || || ||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  18118603 gtttgacttaaaaatgatttttagattttgagataagatggaattacaccaagtaggtcttggtaaatttttacgaaaattcagcctaaccgtttctaag 18118702  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta-ggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    | ||||||||||||| ||  |  | | |||| |||||||| | |||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18118703 tcaatccaaaacttatggtttgttcccaaacttcaaaacttg-agtattagggagttcaattaaggtgttttagagtatttaacctatgtt 18118792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 303 - 357
Target Start/End: Original strand, 21346185 - 21346239
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21346185 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttg 21346239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 44476814 - 44476753
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 389  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44476814 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 44480076 - 44480015
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 389  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44480076 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44480015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 203
Target Start/End: Original strand, 21345945 - 21346020
Alignment:
Q  128 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  21345945 aaaacttagggaataattccaaatctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 21346020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24624282 - 24624171
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  24624282 ggtttgacttaaaaattatttttagattttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtctttgtgcaattttacgaaaattcaacataactatttctaa 24624183  T
Q  120 gttaatccaaaa 131  Q
    || || ||||||    
T  24624182 gtgaacccaaaa 24624171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28397809 - 28397635
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgat-ctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 306  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||  | | | ||  ||| ||||| |||||||||||||| ||     |||    
T  28397809 gttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattataatattgttgatttttcagagagtctgatataa-atgatttaatgttgttaa----taa 28397715  T
Q  307 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  28397714 tgtgatatatt-gtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatat 28397635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25757766 - 25757577
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||| | || ||||    
T  25757766 ggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaa 25757667  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||| |||||  ||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| |||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  25757666 gttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgtt 25757577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 338 - 403
Target Start/End: Original strand, 16401983 - 16402054
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatc------atttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401983 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgaatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 16402054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 338 - 386
Target Start/End: Original strand, 19936956 - 19937004
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936956 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 19937004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 18862728 - 18862779
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18862728 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 18862779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21410973 - 21410922
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21410973 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 21410922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21805465 - 21805414
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21805465 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 21805414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 21828097 - 21828148
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21828097 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 21828148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 394
Target Start/End: Original strand, 35026831 - 35026903
Alignment:
Q  320 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35026831 tatatgcattatgtgaattatatatgatgttttaa--gatgttgattatcgtttgatattgttatatcttgagat 35026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 37116517 - 37116434
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  37116517 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25295746 - 25295557
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| | || ||||    
T  25295746 ggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaacttcatgaaaattcagcataattattcctaa 25295647  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||| |||||  ||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| |||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  25295646 gttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgtt 25295557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 97
Target Start/End: Original strand, 14397358 - 14397426
Alignment:
Q  29 tgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  14397358 tgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaa 14397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Original strand, 18677658 - 18677750
Alignment:
Q  5 ctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  18677658 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 18677750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 19332016 - 19332128
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||||| |||   |||||||||| ||||||| | || |||||    
T  19332016 gtttgacttgaaaatgatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagtaaaa--ctttgaaaatttagcataaatattcctaag 19332113  T
Q  121 ttaatccaaaactta 135  Q
    |||| ||||| ||||    
T  19332114 ttaaaccaaatctta 19332128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 394
Target Start/End: Original strand, 22419367 - 22419455
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |   ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22419367 taatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatttatgatgtttta--agatgttgattatcgtttgaaattgttatatcttgagat 22419455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 386
Target Start/End: Original strand, 2418839 - 2418906
Alignment:
Q  317 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2418839 ttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttca--agatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Original strand, 8728620 - 8728682
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatctt 389  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  8728620 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattaccatttgatactgttatatctt 8728682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1484974 - 1484918
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1484974 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 1484918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 4541963 - 4542059
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  4541963 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 4542059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18827837 - 18827650
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||  |||||||||  ||||||||| ||||| | ||| | |    
T  18827837 ggtttggcttaaaaatgattgttagtttttgagttatggtgaaaatactacaagtagatcttgctgaaattttacgaaaattcaacataattatttttga 18827738  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    |  |||||||||  || ||  | |||| ||| ||||||||| || |||||||||||  || || | | ||||||||||||||| |||||    
T  18827737 gcgaatccaaaagatatggtttgattccaaaactcaaaacttga-gtactaggagtctaattaggatgtttaagagtatttaaactatg 18827650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 20045785 - 20045841
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20045785 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 20045841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 24485633 - 24485729
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | || ||| | ||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  24485633 ttagctttccaatggctttggcttggcgtgaaaatgacttttggtttaggagttatgattaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24485729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 45290137 - 45290205
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 69  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  45290137 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttgttttaggagttatgatgaaaatactc 45290205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 8414168 - 8414239
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 72  Q
    ||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  8414168 ttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaa 8414239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 19278366 - 19278417
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19278366 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 19278417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 21495128 - 21495243
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||| | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || |||||||||    
T  21495128 ggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaa 21495227  T
Q  120 gttaatccaaaactta 135  Q
    || || ||||| ||||    
T  21495228 gtcaacccaaacctta 21495243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 21972668 - 21972719
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21972668 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 21972719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 21976753 - 21976804
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21976753 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 21976804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 43251836 - 43251785
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43251836 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 43251785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 399
Target Start/End: Original strand, 1327013 - 1327055
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1327013 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 1327055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22002325 - 22002239
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaa 87  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| | ||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22002325 ttagctttccaatggctttggtttgacgtaaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaa 22002239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 372
Target Start/End: Original strand, 21346241 - 21346282
Alignment:
Q  331 tgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 372  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21346241 tgtgaattatataagatatttaagttgttgttgattatcatt 21346282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 276
Target Start/End: Original strand, 26222945 - 26223010
Alignment:
Q  211 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 276  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26222945 atgagttggtctttcgggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 26223010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 5852882 - 5852938
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5852882 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 5852938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 14409034 - 14409090
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14409034 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 14409090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 387
Target Start/End: Original strand, 17266945 - 17267028
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||   |||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17266945 taatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23410056 - 23410018
Alignment:
Q  185 gtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23410056 gtatttaagagtatttaacatatgttgtgagttgatctt 23410018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 361
Target Start/End: Original strand, 18024465 - 18024506
Alignment:
Q  320 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgt 361  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  18024465 tatatgcattatatggattatacaagatgtttaagttgatgt 18024506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21329176 - 21329104
Alignment:
Q  323 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  21329176 atgcattatgtggataatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgagatgt 21329104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Original strand, 21967540 - 21967612
Alignment:
Q  323 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  21967540 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 21967612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22364816 - 22364748
Alignment:
Q  318 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  22364816 tgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatc 22364748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 34950694 - 34950622
Alignment:
Q  323 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||    
T  34950694 atgcattatgtggattaagtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgttatattttgggatgt 34950622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 14824347 - 14824291
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  14824347 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaattatttttggtttatgagttatg 14824291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 206
Target Start/End: Original strand, 18122327 - 18122363
Alignment:
Q  170 aggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 206  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18122327 aggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 18122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Original strand, 22381593 - 22381641
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatt 254  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22381593 atgttatgggtttatccttggggtaggaatcgaggttgattataatatt 22381641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 199)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14966635 - 14966237
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  14966635 ttagcttttcaatgacattggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaat 14966536  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14966535 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattctaaacctaaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtattt 14966436  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  14966435 aacctatgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga---- 14966340  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14966339 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaattgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 14966240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 6 - 386
Target Start/End: Original strand, 43550101 - 43550477
Alignment:
Q  6 tttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagc 105  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  43550101 tttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagc 43550200  T
Q  106 ataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacct 205  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  43550201 ataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccc 43550300  T
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||    
T  43550301 atgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagta 43550396  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43550397 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 43550477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16643619 - 16643234
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||    
T  16643619 ggtttgacttgaaaatgatttatagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaa 16643520  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16643519 gttaatccaaaacttatggaataattccaacactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 16643420  T
Q  220 tctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttg 319  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  16643419 tccttggggtaggaatggagattgaagataacattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttg 16643324  T
Q  320 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 409  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  16643323 tatatgcattatgtgaattatataggatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgtct 16643234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 50243361 - 50242985
Alignment:
Q  6 tttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagc 105  Q
    ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  50243361 tttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagc 50243262  T
Q  106 ataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacct 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  50243261 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccc 50243162  T
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||    
T  50243161 atgttgtgagttgatccttggggtatgaatgagggttaaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagta 50243066  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50243065 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 50242985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 116 - 403
Target Start/End: Original strand, 52989492 - 52989774
Alignment:
Q  116 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989492 ctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgag 52989591  T
Q  216 ttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatata 315  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  52989592 ttgatccttggg-taggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaatata 52989686  T
Q  316 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989687 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 52989774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 10833758 - 10834151
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  10833758 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 10833857  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10833858 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 10833957  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  10833958 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggtttattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 10834053  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10834054 tagtaatgagatata-ttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 10834151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 24152863 - 24153138
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  24152863 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 24152962  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||    
T  24152963 tcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtctaagagtactt 24153062  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 276  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24153063 aacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 24153138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 14763380 - 14763774
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  14763380 ttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 14763479  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  14763480 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 14763579  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||||||| |||| |||||    |     
T  14763580 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatttgatgtt----gt 14763675  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14763676 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 14763774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 23371126 - 23371520
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  23371126 ttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 23371225  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  23371226 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 23371325  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  23371326 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 23371421  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23371422 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 23371520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 8928084 - 8928474
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  8928084 ttagatttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 8928183  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8928184 tcagcataaccatttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 8928283  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||| |  ||||| || ||||  ||| ||||| |||| || |||||    |     
T  8928284 aacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataagatga-ttgatgtt----gt 8928378  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    || | ||||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8928379 taatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 8928474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 212 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 324490 - 324303
Alignment:
Q  212 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  324490 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 324395  T
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324394 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 324303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 51301028 - 51300634
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||  |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  51301028 ttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggatttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 51300929  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||  || |||||| |||||||||||||    
T  51300928 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtattt 51300829  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  51300828 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 51300733  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51300732 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 51300634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 53646479 - 53646686
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  53646479 ttagatttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttgttttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaat 53646578  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  53646579 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattt 53646678  T
Q  201 aacctatg 208  Q
    ||| ||||    
T  53646679 aacatatg 53646686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6159030 - 6158789
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6159030 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatgtttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaat 6158931  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6158930 tcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 6158831  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  6158830 aacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 6158789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 82 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15465453 - 15465142
Alignment:
Q  82 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 181  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  15465453 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 15465354  T
Q  182 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 281  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15465353 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 15465261  T
Q  282 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 381  Q
    || ||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15465260 ataatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgcttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 15465165  T
Q  382 tatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15465164 tatatcttgagatgtttacgtgt 15465142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 5223682 - 5223371
Alignment:
Q  82 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 181  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  5223682 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 5223583  T
Q  182 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 281  Q
    ||||| |||||||||||   |   || ||||    ||    | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5223582 aaggtgtttaagagtataata---atattatttagtg----tcggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 5223490  T
Q  282 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 381  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5223489 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 5223394  T
Q  382 tatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5223393 tatatcttgagatgtttacgtgt 5223371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14641969 - 14642191
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  14641969 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 14642068  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14642069 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 14642168  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  14642169 aacctatgttgtgagttgatctt 14642191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 2248389 - 2248624
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2248389 ttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 2248488  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2248489 tcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 2248588  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  2248589 aacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatg 2248624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33564762 - 33564555
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33564762 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 33564663  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  33564662 tcagcctaacagtttctatgttaatccaaaacttatggaataattccaatcctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattt 33564563  T
Q  201 aacctatg 208  Q
    ||||||||    
T  33564562 aacctatg 33564555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 35961306 - 35961536
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||     
T  35961306 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaaa 35961405  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35961406 ttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 35961505  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  35961506 aacctatgttgtgagttggtccttggggtag 35961536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40807629 - 40807420
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  40807629 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 40807530  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  40807529 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 40807430  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  40807429 aacctatgtt 40807420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12276182 - 12275941
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  12276182 ttagctttccaatgactttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 12276083  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  12276082 tcagcataaccatttctaagttaagccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgttt 12275983  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  12275982 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 12275941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 54875921 - 54876111
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  54875921 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataactgtttctaa 54876020  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  54876021 gttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 54876111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11192713 - 11192505
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||    
T  11192713 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttt-tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttatgaaaat 11192615  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11192614 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 11192515  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  11192514 aacctatgtt 11192505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 206 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21837685 - 21837493
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    ||    
T  21837685 atgttatgagttgatccttcgggtaggaattgaggttgaatataatattactgatgatcagtgaagctgttacaatatgatttaatgatgatag----ta 21837590  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837589 atgtaataaatttgtatatgcatt-tgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 21837493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17044579 - 17044392
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17044579 gtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataactgtttctaag 17044480  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17044479 ttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaaatactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 17044392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42160 - 41930
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | ||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42160 ttagctttccaatgactctggtttggcatgaaaataatttttagtttaagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 42061  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  42060 tcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattt 41961  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  41960 aacctaagttgtgagttggtccttggggtag 41930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37038452 - 37038226
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa-tactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa 99  Q
    |||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||||| || ||||||    
T  37038452 ttagcttttcaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaaatactccagagaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 37038353  T
Q  100 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||    
T  37038352 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatt 37038253  T
Q  200 taacctatgttatgagttgatctttgg 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37038252 taacctatgttttgagttgatctttgg 37038226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9533762 - 9533416
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  9533762 ttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 9533663  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  9533662 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 9533563  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  9533562 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgtt----gt 9533467  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 351  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9533466 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 9533416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14441801 - 14441592
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  14441801 ttagttttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 14441702  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  14441701 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtattt 14441602  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  14441601 aacctatgtt 14441592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 35065000 - 35065208
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  35065000 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcccatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 35065099  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35065100 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattc-aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 35065198  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  35065199 aacctatgtt 35065208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 50351419 - 50351628
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  50351419 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 50351518  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  50351519 tcagcataaccatttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtattt 50351618  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  50351619 aacatatgtt 50351628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40812466 - 40812258
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  40812466 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 40812367  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  40812366 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtattt 40812267  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  40812266 aacctatgt 40812258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44274086 - 44273898
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 121  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44274086 tttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 44273987  T
Q  122 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44273986 taatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgtt 44273898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11913354 - 11913119
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  11913354 ttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 11913255  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |    
T  11913254 tcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgt 11913155  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    ||| |||||| ||| | || | ||||||||||||||    
T  11913154 aacttatgttttgattcgacccttggggtaggaatg 11913119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 13029714 - 13029925
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||    
T  13029714 ggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 13029813  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13029814 gttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgg 13029913  T
Q  220 tctttggggtag 231  Q
    || |||||||||    
T  13029914 tcattggggtag 13029925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 3394421 - 3394662
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  3394421 ttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 3394520  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  3394521 tcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtattt 3394620  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  3394621 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 3394662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 6805380 - 6805610
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| || |||||||    
T  6805380 ttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgatttctggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcctagtgaaatcttatgaaaat 6805479  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  6805480 tcagcataactgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtattt 6805579  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  6805580 aacctatgttgtgagttggttcttggggtag 6805610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16979524 - 16979287
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||| ||  |||||||    
T  16979524 ggtttgacttgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttataaaaattcagcatgaccatttctaa 16979425  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16979424 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgg 16979325  T
Q  220 tctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 258  Q
    || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16979324 tccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16979287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17538721 - 17538531
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||    
T  17538721 ggtttgacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccttttctaa 17538622  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17538621 gttaatccaaaacttaaggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17538531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14508480 - 14508272
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  14508480 ttagctttcctatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 14508381  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14508380 tcagcataaccgttt-taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 14508282  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  14508281 aacctatgtt 14508272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6819742 - 6819507
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  6819742 ttagctttccaatgactttggtttgacatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 6819643  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6819642 taaggataaccgtttctaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaagctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 6819543  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 237  Q
    || ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  6819542 aatctatgttgtgggttgatc-ttgggataggaatgg 6819507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 1988651 - 1988885
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  1988651 ttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgcaattttatgaaaat 1988750  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  1988751 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataactactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgttt 1988850  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1988851 aaccaatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1988885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 13026122 - 13026333
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||    
T  13026122 ggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 13026221  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13026222 gttaatccaaaaattatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgg 13026321  T
Q  220 tctttggggtag 231  Q
    || |||||||||    
T  13026322 tcattggggtag 13026333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 5206092 - 5206282
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5206092 ggtttgacatgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 5206191  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5206192 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattatggtgtttaagattatttaacctatgtt 5206282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 43889218 - 43889420
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  43889218 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 43889317  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  43889318 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggttttaagagtattt 43889417  T
Q  201 aac 203  Q
    |||    
T  43889418 aac 43889420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 10989223 - 10989495
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  10989223 ttagctttccaatggctttggtctgacatgaaaataatttt-ggtttttaagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 10989321  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10989322 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 10989421  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    || | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| | |||  |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  10989422 aatccatgttgtgagttgaactttgggatatcaatgaaagttatataggatattaaggatgatctgtgaagctg 10989495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17693701 - 17693492
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| ||||||||| | | |||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  17693701 ttagttttccaatggctttggtttgatgtgaaagttatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 17693602  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  17693601 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtattt 17693502  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  17693501 aacctatgtt 17693492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 179126 - 179367
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  179126 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaataccccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 179225  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  179226 tcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttgaattaaggtgtttaacagtattt 179325  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    || | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  179326 aatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaggttg 179367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 10541881 - 10542079
Alignment:
Q  5 ctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcag 104  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10541881 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatcatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 10541980  T
Q  105 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  10541981 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 10542079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18367177 - 18367399
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  18367177 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatatttcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaat 18367276  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18367277 tcagtataacccgttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaagctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 18367376  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  18367377 aacccatgttgtgagttgatctt 18367399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35354235 - 35354023
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgat---ttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  35354235 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagatcttagtgaaatcttatgaa 35354136  T
Q  98 aattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagta 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||    
T  35354135 aattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactgggagtttaattaaggggtttaagagta 35354036  T
Q  198 tttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||    
T  35354035 tttaacctatgtt 35354023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 42324640 - 42324862
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||| ||   |||||    
T  42324640 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatataatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaaat 42324739  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| |||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  42324740 tcagtataaccatttctaagttagtcaaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 42324839  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  42324840 aacccatgttgtgagttgatctt 42324862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 2841882 - 2842090
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  2841882 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 2841981  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2841982 tcagcataaccgttcc-aagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 2842080  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  2842081 aacctatgtt 2842090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3803468 - 3803259
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3803468 ttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 3803369  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  3803368 tcagcaaaaccgtttctaagttaatcaaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtattt 3803269  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  3803268 aacctatgtt 3803259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 17519292 - 17519501
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  17519292 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 17519391  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17519392 tcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtattt 17519491  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  17519492 aacatatgtt 17519501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 17534154 - 17534363
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  17534154 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 17534253  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17534254 tcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtattt 17534353  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  17534354 aacatatgtt 17534363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Original strand, 22307006 - 22307211
Alignment:
Q  5 ctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcag 104  Q
    ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||  | |||||||||||    
T  22307006 ctttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttgattattgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttactgaaatcctatgaaaattcag 22307105  T
Q  105 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 204  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  22307106 cataaccgtttctaagttaatcccaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaact 22307205  T
Q  205 tatgtt 210  Q
    ||||||    
T  22307206 tatgtt 22307211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12511462 - 12511279
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  12511462 ggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctta 12511363  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  12511362 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 12511279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13519896 - 13519706
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13519896 gtttgacttgaaattgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 13519797  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  13519796 ttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttgattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 13519706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 15931926 - 15932135
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||  || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  15931926 ttagctttccagtggccttggtttgatgtgcaaatgattttgggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 15932025  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15932026 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 15932125  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
     | |||||||    
T  15932126 catctatgtt 15932135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 203
Target Start/End: Original strand, 18699913 - 18700094
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 121  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18699913 tttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 18700012  T
Q  122 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  18700013 taatccaaaacttttggaataattccaaacctcaaaactagaagtgctaggagtttagttaagggatttaagagtatttaac 18700094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14671457 - 14671255
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  14671457 ttagctttccagtggtgtcgatttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 14671358  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||    
T  14671357 tcagcataactgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtattt 14671258  T
Q  201 aac 203  Q
    |||    
T  14671257 aac 14671255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 17685262 - 17685468
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  17685262 ttagctttccagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 17685361  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||| |||||||||||||    
T  17685362 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgaattcaattagggtgtttaagagtattt 17685461  T
Q  201 aacctat 207  Q
    || ||||    
T  17685462 aatctat 17685468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 20248403 - 20248608
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  20248403 ttagttttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 20248502  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  20248503 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaaaagtattt 20248602  T
Q  201 aaccta 206  Q
    ||||||    
T  20248603 aaccta 20248608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10554900 - 10554668
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  10554900 ttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 10554801  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  10554800 tcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtattt 10554701  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtagga 233  Q
    |||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  10554700 aacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 10554668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 55292060 - 55292292
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  55292060 ttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaat 55292159  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  55292160 tcagcataaccctttttaagttaacccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaaaagtattt 55292259  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtagga 233  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  55292260 aacccatgttatgagtagacctttgaggtagga 55292292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13522829 - 13523071
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  13522829 ttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgagaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 13522928  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatcc-aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13522929 tcagcataatcatttctaagttaatccaaaaacttatgcgataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 13523028  T
Q  200 taacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  13523029 taacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 13523071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 206 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13919591 - 13919408
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||         
T  13919591 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgttatgtgaagctgttataatatgatttaatgtttatagc----g 13919496  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  13919495 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaag-tgttgttgattattatgtgataatgttatatcttgagat 13919408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Original strand, 17670147 - 17670334
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17670147 ggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 17670246  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17670247 gttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaatctat 17670334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10563342 - 10563120
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||  || |||||||||||| || |||||||    
T  10563342 ttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaacatactcaaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 10563243  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| ||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10563242 tcagtataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 10563143  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  10563142 aacctatgttgtgagttgatctt 10563120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 38311422 - 38311628
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  38311422 ttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 38311521  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt-caaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  38311522 tcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 38311621  T
Q  200 taaccta 206  Q
    |||||||    
T  38311622 taaccta 38311628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 41172809 - 41172999
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41172809 gtttgacgtgaaaacaattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 41172908  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  41172909 tcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 41172999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12470414 - 12470233
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 121  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  12470414 tttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatt 12470315  T
Q  122 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  12470314 taatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 12470233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17513194 - 17513010
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  |||||||    
T  17513194 ggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaa 17513095  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 204  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  17513094 gttaatccaaaacttattgaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacc 17513010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14519895 - 14519687
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14519895 ttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 14519796  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14519795 tctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 14519697  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  14519696 aacctatgtt 14519687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 49900350 - 49900153
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttcta- 118  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||     
T  49900350 ggtttgacgtgaaaatggtttttggttattgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 49900251  T
Q  119 -------agttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 209  Q
           ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49900250 gtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactagaagtttaattaaggattttaagagtatttaacctatgt 49900153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 31224391 - 31224608
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| |||||  |||||||    
T  31224391 ggtttcacttgaaaatgatttttggtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaatttcagtataaccatttctaa 31224490  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggt-atttaagagtatttaacctatgttatgagttg 218  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  31224491 gttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgttttaagagtatttaacccatgctgtgagtcg 31224590  T
Q  219 atctttggggtaggaatg 236  Q
    | | ||||||| ||||||    
T  31224591 acccttggggtcggaatg 31224608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 50348445 - 50348654
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| || |||||||    
T  50348445 ttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaatcttatgaaaat 50348544  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||    
T  50348545 tcagtataaccatttctaagttaatccaaaactcatgggataattccaaacctcaaaactataagtactaggggtttaattaaggggtttaagagtattt 50348644  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  50348645 aacctatgtt 50348654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 282 - 409
Target Start/End: Original strand, 54876322 - 54876445
Alignment:
Q  282 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 381  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54876322 atgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 54876417  T
Q  382 tatatcttgagatgtttacgtgttgtct 409  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  54876418 tatatcttgagatgtttacgtgctgtct 54876445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43928984 - 43928775
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | | |||||  ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  43928984 ttagctttccaatggctttgatttgatctgaaaataatttttaatttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 43928885  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  43928884 tcagcataatcatttctaagttgatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtattt 43928785  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  43928784 aacatatgtt 43928775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18889997 - 18889749
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||   || |||||||||||| || |||||||    
T  18889997 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatgtttgagttatgatggaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 18889898  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || ||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||  |||||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18889897 tccgcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatagttccaaggctcaaatctagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 18889798  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 249  Q
    |||| ||||| |||| ||| | |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  18889797 aacccatgttgtgagatgacccttgggacaggaatggaggttgattata 18889749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6156338 - 6156130
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6156338 ttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 6156239  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6156238 ttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 6156140  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  6156139 aacctatgtt 6156130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12378184 - 12378003
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||    
T  12378184 atgttttgagttgatccttagggtagcaatggaggttaaatacaatattaatgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagta 12378089  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgag 392  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  12378088 atttaatata-ttgtatatgtattatttgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgag 12378003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 14152818 - 14153027
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||| |||| |||||||    
T  14152818 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaaagaattttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaacttttatgaaaat 14152917  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  14152918 tccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtattt 14153017  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  14153018 aacctatgtt 14153027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19444144 - 19443941
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||| |||||| | | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||    
T  19444144 ttagcttcccaatggctttggtttgacatgaaagtgatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttattaaaattttatgaaaat 19444045  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| | | |||||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  19444044 tcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctccaaactagaagtgccatgagttcaattaaggtgtttgagaatattt 19443945  T
Q  201 aacc 204  Q
    ||||    
T  19443944 aacc 19443941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 50755820 - 50756009
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  50755820 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggtggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaa 50755919  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50755920 gtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 50756009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12339874 - 12339773
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12339874 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 12339775  T
Q  403 gt 404  Q
    ||    
T  12339774 gt 12339773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 399
Target Start/End: Original strand, 10542384 - 10542480
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10542384 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 10542480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14179539 - 14179439
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14179539 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 14179440  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  14179439 g 14179439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14671091 - 14670995
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671091 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 14670995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Original strand, 43889578 - 43889678
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43889578 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 43889677  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  43889678 g 43889678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Original strand, 14567651 - 14567802
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14567651 gtttgaattgaaaatgacatttagtttttgatttatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 14567750  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactagg 172  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14567751 ttaatccaaaacttatgaaataattccaaacctcaaaactagaagtactagg 14567802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 16324979 - 16325190
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  16324979 ggtttggcgtgaaaatgatttatggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttagcaaaaccgtttctaa 16325078  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||  ||  || |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| || |||||| |||| ||| |||||||     
T  16325079 gttaatccaaaacttatcggataatttcaaggctaaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttatgaatatttatcctaagttgtgagttgg 16325178  T
Q  220 tctttggggtag 231  Q
    || |||||||||    
T  16325179 tccttggggtag 16325190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 206 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 316381 - 316202
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||| || || |||| |||||||||||||||||    ||    
T  316381 atgttatgagttgatcattgggatatgaatggaggttgattatgatattactgatgctatgtgaatctattgtaatgtgatttaatgttgatag----ta 316286  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  316285 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 316202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 9511585 - 9511793
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9511585 ttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 9511684  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||| |  |||||| ||| | || ||||||  ||||||||||||    
T  9511685 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagattaattaaggtgcttaagagtattt 9511783  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  9511784 aacctatgtt 9511793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 9519560 - 9519768
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9519560 ttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 9519659  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||| |  |||||| ||| | || ||||||  ||||||||||||    
T  9519660 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagattaattaaggtgcttaagagtattt 9519758  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  9519759 aacctatgtt 9519768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 208 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9577882 - 9577700
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 307  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  9577882 gttataagttgatccttggggtgggaacgaaggttgattataatattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 9577787  T
Q  308 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9577786 gtgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggtgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 9577700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15566146 - 15565938
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||    
T  15566146 ttagctttccagtggcatcagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaattttatgaaaat 15566047  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |   |  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15566046 ttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-ctatttactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 15565948  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  15565947 aacctatgtt 15565938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12470069 - 12469969
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12470069 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttcacgt 12469970  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  12469969 g 12469969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 303 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14682590 - 14682494
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14682590 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatcttgttatatcttgagatgttta 14682494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16796654 - 16796554
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16796654 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgaaatgtttacgt 16796555  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  16796554 g 16796554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18893257 - 18893067
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  18893257 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 18893158  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtattta 191  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  18893157 tcagcagaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactacaagtaatatgagtttaattaaggtgttta 18893067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17046740 - 17046631
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17046740 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 17046641  T
Q  120 gttaatccaa 129  Q
    ||||||||||    
T  17046640 gttaatccaa 17046631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 282 - 403
Target Start/End: Original strand, 17691644 - 17691760
Alignment:
Q  282 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 381  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17691644 atgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgataatcatttgatgttat 17691739  T
Q  382 tatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  17691740 tatatc-tgagatgtttacgtg 17691760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Original strand, 18700259 - 18700359
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18700259 gtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 18700358  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  18700359 g 18700359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24546473 - 24546261
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttga---- 96  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||        
T  24546473 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaatt 24546374  T
Q  97 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagt 196  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| | ||| |   || |||| ||||| |  |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  24546373 aaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 24546275  T
Q  197 atttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||||    
T  24546274 atttaacctatgtt 24546261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 54330725 - 54330933
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  54330725 ttagctttccagtggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 54330824  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  54330825 tccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 54330923  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  54330924 aacctatgtt 54330933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5215280 - 5215156
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  5215280 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaat 5215181  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaat 125  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  5215180 tcagcataaccgtttctaagttaat 5215156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11258986 - 11258891
Alignment:
Q  115 tctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11258986 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 11258891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44494976 - 44494901
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44494976 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 44494901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17938159 - 17938025
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  ||||||    
T  17938159 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaat 17938060  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    || |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  17938059 tccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 17938025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 301 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28194863 - 28194754
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28194863 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 28194764  T
Q  400 cgtgttgtct 409  Q
     ||| |||||    
T  28194763 tgtgctgtct 28194754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15246281 - 15246093
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   || || |  ||||| |||||||  ||| |||||| |||||| |||||| ||     ||    
T  15246281 atgttatgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttat----ta 15246186  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||    
T  15246185 atgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgtt 15246093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12952655 - 12952466
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| | |||||||| |||| ||    
T  12952655 ggtttgacttgaaactgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaatcccgcataactatttcaaa 12952556  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || ||||||||||  || |   || |||| ||||| || |  || ||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12952555 gtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaatcttg-tgttctatgagctcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 12952466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18739528 - 18739394
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||    
T  18739528 ttagctttccaatggctttggtttcactttaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaat 18739429  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    || |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  18739428 tccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 18739394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22652409 - 22652236
Alignment:
Q  56 tgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctca 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||    
T  22652409 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttca 22652310  T
Q  156 aaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggta 230  Q
    || || |  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  22652309 aagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta 22652236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 19568830 - 19568939
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||   |||||    
T  19568830 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcttagtgaaatcttagcaaaat 19568929  T
Q  101 tcagcataac 110  Q
    |||| |||||    
T  19568930 tcagtataac 19568939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 25104622 - 25104829
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||    
T  25104622 ttagctttccagtggctttgatttgacttgaaa-tgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttacgaaaat 25104720  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||| | |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25104721 tccgcataactatttccaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactatcagttcaattaaggtgtttaagagtattt 25104819  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  25104820 aacttatgtt 25104829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 246 - 391
Target Start/End: Original strand, 23318615 - 23318754
Alignment:
Q  246 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 345  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23318615 tataatattactgatgaactgtgaatctgttataa-atgatttaatgttgttag----taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 23318709  T
Q  346 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 391  Q
     |||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  23318710 ttgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 23318754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 51603019 - 51603127
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  51603019 ttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 51603118  T
Q  101 tcagcataa 109  Q
    |||| ||||    
T  51603119 tcagtataa 51603127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 14647522 - 14647609
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 88  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14647522 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 14647609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 206 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15207199 - 15207032
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || || |  ||||| |||||||  ||| |||||| |||||| |||||| ||     ||    
T  15207199 atgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttat----ta 15207104  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 376  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15207103 atgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgat 15207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 37427885 - 37427787
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37427885 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgatgattatcatttgatactgttatatcttgagatgttta 37427787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17207973 - 17207766
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||| | ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  17207973 ttagctttccagtggctttggttttaattgcaaatgaattttggtttt-gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatgttatgaaaat 17207875  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17207874 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttattgattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaaataaggtgtttaagagtattt 17207776  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  17207775 aacctatgtt 17207766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 198
Target Start/End: Original strand, 26055128 - 26055244
Alignment:
Q  82 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 181  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  26055128 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 26055227  T
Q  182 aaggtatttaagagtat 198  Q
    ||||| |||||||||||    
T  26055228 aaggtgtttaagagtat 26055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15265402 - 15265214
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   || || |  |||||  | ||||  ||| |||||| |||||| |||||| ||     ||    
T  15265402 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgtacagtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttat----ta 15265307  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||    
T  15265306 atgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgtt 15265214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 393
Target Start/End: Original strand, 32402819 - 32403002
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||| |||| ||||||||  |||||    | ||||    
T  32402819 atgttatgagttgatctttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgctcagtgagtctgatata-tatgatttgttgttg----cgagta 32402913  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaga 393  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32402914 atgtgatatagttttatatgcattatgtgaattatctaagatgtttaaagttgctattgattattatttgatattgttatatcttgaga 32403002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Original strand, 3264997 - 3265070
Alignment:
Q  333 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3264997 tgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcatgagatgtttatgtgttg 3265070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 403
Target Start/End: Original strand, 11914003 - 11914068
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11914003 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 11914068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 36527882 - 36527809
Alignment:
Q  333 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36527882 tgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatatttatgtgttg 36527809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 12305695 - 12305599
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  12305695 ttagctttccaatgactttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12305599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 46723045 - 46723149
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| || |||||||    
T  46723045 ttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactaaaatcttatgaaaat 46723144  T
Q  101 tcagc 105  Q
    |||||    
T  46723145 tcagc 46723149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14682841 - 14682754
Alignment:
Q  116 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  14682841 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 14682754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 8631375 - 8631265
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||    
T  8631375 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgttgaaaacactccaaggagatcttattgaaattttacgaaaat 8631276  T
Q  101 tcagcataact 111  Q
    || | ||||||    
T  8631275 tccgtataact 8631265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13436871 - 13436776
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  13436871 ttagctttccaatggatttggtttggcttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa-gagatctcagtgaatttttatgaa 13436776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15465727 - 15465631
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  15465727 ttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15465631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 97
Target Start/End: Original strand, 22764068 - 22764145
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||    
T  22764068 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaatttttatgaa 22764145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Original strand, 34852617 - 34852701
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34852617 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 34852701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5223956 - 5223860
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  5223956 ttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgcgatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 5223860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 26054854 - 26054950
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  26054854 ttagctttccagtggcttcggttttacatgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 26054950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Original strand, 38311759 - 38311820
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 389  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38311759 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 38311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18893063 - 18892975
Alignment:
Q  161 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 249  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18893063 agaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattata 18892975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 29544431 - 29544527
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||    
T  29544431 ttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaatttttatgaa 29544527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 54521395 - 54521304
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatttt 92  Q
    |||||||||||||| | |   ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  54521395 ttagctttccaatggctttaattttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaattttt 54521304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 397
Target Start/End: Original strand, 14568921 - 14569007
Alignment:
Q  311 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||| ||||    
T  14568921 atataattgtatatgcgttatgtgaattatatatgatgtttaggttgatgttgactgtcacttgatattgttatatcatgagctgtt 14569007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 387
Target Start/End: Original strand, 52523593 - 52523763
Alignment:
Q  213 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 312  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| |   || |||||| ||    
T  52523593 gagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagatattaatgatgatctgagaagctgttataagatga-ttgatgttgtt---ta-taatgtgat 52523687  T
Q  313 atatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || || ||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  52523688 ataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatc 52523763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Original strand, 19568940 - 19568996
Alignment:
Q  154 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19568940 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19568996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Original strand, 42353218 - 42353302
Alignment:
Q  127 caaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggta-tttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  42353218 caaaacttagggaataattctaaacctcaaaacaaaaagtattaggagtttaattaagggagtttaagagtatttaacgtatgtt 42353302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15964995 - 15964944
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15964995 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15964944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15968919 - 15968868
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15968919 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15968868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15972843 - 15972792
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15972843 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15972792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Original strand, 20248741 - 20248803
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatctt 389  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  20248741 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattatcatttgatactgttatatctt 20248803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Original strand, 11986844 - 11986912
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 88  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  11986844 ggtttgacttgaaaatgatctttagtttttgagttatgatgaaaatactacaagggggtcttagtgaaa 11986912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 11259063 - 11258992
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 72  Q
    ||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11259063 ttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaa 11258992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 11854759 - 11854708
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11854759 agttgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 11854708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19775791 - 19775744
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19775791 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 19775744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8023855 - 8023721
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| |||  || | || ||| |||||   ||||||    
T  8023855 ttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtaggttttggtgcaatttaacgaaaat 8023756  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    | ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  8023755 ttagcataactatttttaagtcaacccaaaactta 8023721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 342
Target Start/End: Original strand, 29172491 - 29172618
Alignment:
Q  211 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||  ||||| || ||||  ||| |||||||| |||| |||||||    ||||| |||     
T  29172491 atgagttgatccttggggtaggaatggaggtcggttatagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatataatttgatgttga----tagtattgtg 29172586  T
Q  311 atatatttgtatatgcattatgtgaattatat 342  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatat 29172618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 387
Target Start/End: Original strand, 2051102 - 2051235
Alignment:
Q  250 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atg 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||| |   || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||    
T  2051102 atattaatgatgatttgtgaagctgctataagatgattga-tgttgtt---ta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatg 2051196  T
Q  349 tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    ||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  2051197 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 2051235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 28848211 - 28848307
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  28848211 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 28848307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 34159898 - 34159842
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34159898 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 34159842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 4107480 - 4107531
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4107480 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 4107531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 4111332 - 4111383
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4111332 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 4111383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 7109724 - 7109673
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7109724 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 7109673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 7113659 - 7113608
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7113659 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 7113608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 11070094 - 11070043
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11070094 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 11070043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 11165612 - 11165663
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11165612 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 11165663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15617400 - 15617349
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15617400 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 15617349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22321690 - 22321639
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22321690 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 22321639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22336745 - 22336694
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22336745 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 22336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 27409727 - 27409778
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27409727 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 27409778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 28949750 - 28949699
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28949750 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 28949699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 30065972 - 30065921
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30065972 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 30065921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 36528148 - 36528061
Alignment:
Q  3 agctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 90  Q
    ||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  36528148 agctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgattcttggtgtttgatttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaatt 36528061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 37439719 - 37439770
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37439719 agttgttgttgattattatttgatatggttatatcttgagatgtttacgtgt 37439770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 55022893 - 55022842
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  55022893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 55022842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15978075 - 15978009
Alignment:
Q  31 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  15978075 aaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15978009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Original strand, 4588862 - 4588907
Alignment:
Q  359 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4588862 tgttgattatcatttgaaattgttatatcttgagatgtttatgtgt 4588907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21618692 - 21618627
Alignment:
Q  211 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21618692 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 21618627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 36166841 - 36166776
Alignment:
Q  211 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36166841 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 36166776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 54521014 - 54520977
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54521014 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 54520977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 10247313 - 10247409
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||| |||| ||  ||| |||||||||| |||| ||||    
T  10247313 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgtgttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 10247409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 16453869 - 16453961
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttt 93  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  16453869 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttt 16453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 17463750 - 17463694
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17463750 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 17463694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 43926114 - 43926034
Alignment:
Q  318 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  43926114 tgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttt 43926034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 55477063 - 55477007
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  55477063 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 55477007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Original strand, 3264748 - 3264818
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 90  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  3264748 ggtttgacgtgaaaatgatttttgatgtttgatttgtgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaatt 3264818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6002560 - 6002446
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||  || |||| | ||||||||    ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6002560 gtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttggggaaattttaaagaaatttagcataactatttccaag 6002461  T
Q  121 ttaatccaaaactta 135  Q
    | | ||||| |||||    
T  6002460 tcattccaatactta 6002446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37427976 - 37427930
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  37427976 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataata 37427930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12567752 - 12567723
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567752 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 12567723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13544217 - 13544188
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544217 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 13544188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Original strand, 14647688 - 14647760
Alignment:
Q  323 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  14647688 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 14647760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16059659 - 16059622
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16059659 atgttatgagttggtctttggggtaggaatggaagttg 16059622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Original strand, 29544812 - 29544849
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  29544812 gatgttgattaccatttgatgttgttatgtcttgagat 29544849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 7780936 - 7781032
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| || ||||||  | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  7780936 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttctggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 7781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 404
Target Start/End: Original strand, 11300532 - 11300564
Alignment:
Q  372 ttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11300532 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 11300564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15413003 - 15412947
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  15413003 ttagctttccagtggcgtcgatttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 15412947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23274910 - 23274882
Alignment:
Q  246 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274910 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 23274882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 129)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 10057105 - 10056707
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10057105 ttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 10057006  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10057005 tcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaatctagaagtaccaggagttcaattaaggtgtttaagagtattt 10056906  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  10056905 aacatatgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga---- 10056810  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056809 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 10056710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 378
Target Start/End: Original strand, 630322 - 630695
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  630322 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 630421  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  630422 tcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 630521  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  630522 aacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga---- 630617  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  630618 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgt 630695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 23802883 - 23803264
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  23802883 ttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 23802982  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23802983 ttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 23803082  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  23803083 aacccatgttatgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga---- 23803178  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23803179 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgattttatgttgttatat 23803264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12611484 - 12611106
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  12611484 ttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaacgaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 12611385  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12611384 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 12611285  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  12611284 aacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctatgaagctattataatatgatttaatgttga---- 12611189  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12611188 tagtaatgtaatatatttgtatatgcatt---tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 12611106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 51463486 - 51463867
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||  || |||||||    
T  51463486 ttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtctaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 51463585  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||    
T  51463586 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatgcgataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggcgtttaagagtattt 51463685  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  51463686 aacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga---- 51463781  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51463782 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 51463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18213199 - 18212805
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||| || |||||||    
T  18213199 ttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaat 18213100  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  18213099 tcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 18213000  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  18212999 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 18212904  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18212903 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 18212805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 24046953 - 24047347
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |   || |||||||||||  || |||||||    
T  24046953 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatggaaatactctaggtaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 24047052  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24047053 tcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 24047152  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  24047153 aacccatgttgtgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 24047248  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24047249 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttaagatgttta 24047347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9638640 - 9638399
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  9638640 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 9638541  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9638540 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaatctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 9638441  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  9638440 aatctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 9638399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35660479 - 35660270
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35660479 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 35660380  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  35660379 tcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataatctcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaagagtattt 35660280  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  35660279 aacctatgtt 35660270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15990672 - 15990439
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  15990672 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 15990573  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  15990572 tcagcacaaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagattattt 15990473  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaa 234  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15990472 aacctatgttgtgagttggtcattggggtaggaa 15990439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 53630892 - 53631101
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  53630892 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 53630991  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  53630992 tcggcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtattt 53631091  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  53631092 aacctatgtt 53631101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 11479030 - 11479237
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11479030 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaat 11479129  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  11479130 tcagcctaacagtttccaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagattattt 11479229  T
Q  201 aacctatg 208  Q
    ||||||||    
T  11479230 aacctatg 11479237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10705131 - 10704890
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  10705131 ttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaat 10705032  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10705031 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 10704932  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  10704931 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 10704890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10918901 - 10918660
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  10918901 ttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaat 10918802  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10918801 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 10918702  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  10918701 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 10918660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28385876 - 28385646
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  28385876 ttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaat 28385777  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  28385776 tcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattt 28385677  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||| | ||| ||||||| || |||||||||    
T  28385676 aacccaagttgtgagttggtccttggggtag 28385646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15008599 - 15008342
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  15008599 ttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 15008500  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15008499 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggcataattcgaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 15008400  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 258  Q
    |||||||||| | ||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  15008399 aacctatgttgtaagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 15008342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25091286 - 25091077
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  25091286 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 25091187  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25091186 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcgaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 25091087  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    |||| |||||    
T  25091086 aaccaatgtt 25091077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 56115255 - 56115528
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  56115255 ttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 56115354  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||    
T  56115355 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaagcagaagtactatgagttctattaaggtgtttaagagtattt 56115454  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    || | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  56115455 aatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 56115528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40620162 - 40619907
Alignment:
Q  2 tagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaatt 101  Q
    |||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  40620162 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 40620063  T
Q  102 cagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattta 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||      
T  40620062 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaatctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtattat 40619963  T
Q  202 acctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 258  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  40619962 acctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 40619907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9923809 - 9923622
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  9923809 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaag 9923710  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  9923709 ttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaatagtgtttaacctatg 9923622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 223
Target Start/End: Original strand, 15447858 - 15448057
Alignment:
Q  24 tgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtta 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15447858 tgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtta 15447957  T
Q  124 atccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15447958 atccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactggaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttctgagttgatctt 15448057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 10694666 - 10694896
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  10694666 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 10694765  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  10694766 tcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattattt 10694865  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  10694866 aacctatgttgtgagttggtccttggggtag 10694896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 10908432 - 10908662
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  10908432 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 10908531  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  10908532 tcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattattt 10908631  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  10908632 aacctatgttgtgagttggtccttggggtag 10908662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19609938 - 19609748
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19609938 ggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 19609839  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
     ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19609838 attaatccaaaacttaaggtataattccaaacctcaaaactagaagtactatcagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19609748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42875432 - 42875223
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  42875432 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 42875333  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  42875332 tcagcgtaactgtttctaagttaatccaaaacttaatgaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaggagtattt 42875233  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  42875232 aacctatgtt 42875223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37019302 - 37019095
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  37019302 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 37019203  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37019202 tcagcataatcgtttataagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgggttcaactaaggtgtttaagagtattt 37019103  T
Q  201 aacctatg 208  Q
    ||||||||    
T  37019102 aacctatg 37019095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3337732 - 3337523
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  3337732 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttcaatatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 3337633  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3337632 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 3337533  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  3337532 aacctatgtt 3337523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 10356855 - 10357064
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  10356855 ttagctttccagtggctttggtgtgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 10356954  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10356955 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 10357054  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  10357055 aacctatgtt 10357064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 19435116 - 19435326
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  19435116 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattatatgaaaat 19435215  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatt 199  Q
    |||||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||    
T  19435216 tcagcataaccgtttctaagtcagtctaaaatttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatt 19435315  T
Q  200 taacctatgtt 210  Q
    |||||||||||    
T  19435316 taacctatgtt 19435326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14549259 - 14549050
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| || |||||||    
T  14549259 ttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaagtactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 14549160  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14549159 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaagactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 14549060  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    | ||||||||    
T  14549059 agcctatgtt 14549050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15114836 - 15114648
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15114836 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaaatttat-gaaaattcagcataaccgtttctaa 15114738  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15114737 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggagtttaagagtatttaacctatgt 15114648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16998158 - 16997954
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  16998158 ttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 16998059  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  16998058 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaa-----aagtactatgagttgaactagggtgtttaagagtattt 16997964  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  16997963 aacctatgtt 16997954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 33243715 - 33243924
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||    
T  33243715 ttagctttccaatgattttgatttgacttgaaaataatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaaggggtcttagtgaaatcttatgaaaat 33243814  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||  |    
T  33243815 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattgaggtgtttaagagtagct 33243914  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  33243915 aacctatgtt 33243924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33849375 - 33849102
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  33849375 ttagctttccaatggctttggtttgaatcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 33849276  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  33849275 tcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtattt 33849176  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    || | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| | ||||||||    
T  33849175 aatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtttgaagctg 33849102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 206 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17333542 - 17333352
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||    
T  17333542 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataataatactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt----gttagta 17333447  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17333446 atgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgattaagtgttgttgattattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 17333352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33186534 - 33186312
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||    
T  33186534 ttagctttccagtggctttggtttgactcgaaaataatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaat 33186435  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | || |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  33186434 ttagtataacattttctaagttagtccaaaacttatggaataactccaaccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgttt 33186335  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  33186334 aacctatgttgtgagttgatctt 33186312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 16277746 - 16277978
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||||| || |||||||    
T  16277746 ttagctttccaacggctttggtttgactcgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggttttactgaaatcttatgaaaat 16277845  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  16277846 tcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtattt 16277945  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtagga 233  Q
    |||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  16277946 aacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 16277978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 53387356 - 53387588
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  53387356 ttagctttccaatggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaat 53387455  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  53387456 tcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaattagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtattt 53387555  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtagga 233  Q
    |||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  53387556 aacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 53387588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3485521 - 3485347
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  3485521 gtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaa--ttgttaaaaattcagcataaccgtttctaag 3485424  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  3485423 ttaatccaaaacttagggaataattc-caaccccaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 3485347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 15011951 - 15012097
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15011951 ggtttgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 15012050  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagt 166  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15012051 gttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagt 15012097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Original strand, 13591785 - 13591974
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||    ||    
T  13591785 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttag----ta 13591880  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13591881 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatattttgagatgttta 13591974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Original strand, 32306854 - 32307043
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || |  ||| ||||||||| ||| ||||||||||    ||    
T  32306854 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattattgatgttcagtaagtctgatataatatggtttgatgttgatag----ta 32306949  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32306950 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttaatattgttatatcttgagatgttta 32307043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 206 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14825730 - 14825551
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  14825730 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 14825635  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  14825634 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 14825551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 229
Target Start/End: Original strand, 15883917 - 15884062
Alignment:
Q  84 tgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa 183  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  15883917 tgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttgatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 15884016  T
Q  184 ggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggt 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  15884017 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggt 15884062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 19566338 - 19566546
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  19566338 ttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaattttgtgaaaat 19566437  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19566438 tctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 19566536  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  19566537 aacctatgtt 19566546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 398
Target Start/End: Original strand, 26050340 - 26050521
Alignment:
Q  212 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 311  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| |    
T  26050340 tgagttgatccttgggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcaatgagtctgatataatatgatttgatgttgatag----taatgtga 26050435  T
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26050436 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgttt 26050521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11425547 - 11425379
Alignment:
Q  32 aaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaa 131  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11425547 aaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaa----------attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaa 11425458  T
Q  132 cttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11425457 cttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 11425379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 10237917 - 10238117
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10237917 ttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 10238016  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||| || |||||||||||||    
T  10238017 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttaaattaatgtgtttaagagtattt 10238115  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  10238116 aa 10238117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15344508 - 15344297
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15344508 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 15344409  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || || ||||||| ||| |   || |||  ||||| ||  | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15344408 tccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatggattgtctccaaa-ttcaaagct-tatgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 15344311  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||||||||||||||    
T  15344310 aacctatgttatga 15344297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15214464 - 15214672
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |  |||| || || |||| |||||||    
T  15214464 ttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaat 15214563  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||    
T  15214564 tcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaatatttccaaacctcgaaactggaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtattt 15214663  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  15214664 aacctatgt 15214672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14630440 - 14630250
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||     
T  14630440 ggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctag 14630341  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14630340 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 14630250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40229936 - 40229723
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt-agtgaaattttttgaaaa 99  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  40229936 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttaagtgaaattttatgaaaa 40229837  T
Q  100 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    ||| |||||| | |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40229836 ttctgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatt 40229738  T
Q  200 taacctatgttatga 214  Q
    |||||||||||||||    
T  40229737 taacctatgttatga 40229723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Original strand, 44024042 - 44024235
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  44024042 ggtttgacttgaaaataatttttggtttctgagttattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctag 44024141  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44024142 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 44024235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 46740831 - 46740619
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  46740831 ttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgataaaaatactccaaagacgtcttagtgaaattttgtgaaaat 46740732  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  46740731 tccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtattt 46740633  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||||||||||||||    
T  46740632 aacctatgttatga 46740619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Original strand, 17048086 - 17048186
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17048086 gtaatgtaatatatttgtacatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 17048185  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  17048186 g 17048186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 301 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16043183 - 16043087
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16043183 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 16043087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 16026349 - 16026482
Alignment:
Q  2 tagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaatt 101  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16026349 tagctttccagtggcttcagtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 16026448  T
Q  102 cagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    | |||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  16026449 ccgcataagtatttctaagttaacccaaaactta 16026482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25513375 - 25513167
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  25513375 ttagctttccattgactttggttcgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaagt 25513276  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |   |  |||||||||| || |  |||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  25513275 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgggttgtcttcaaacctcaaagcttg-tgtactacgagttcaattacggtgtttaagaatattt 25513177  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  25513176 aacctatgtt 25513167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 55582824 - 55582703
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  55582824 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaat 55582725  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagtt 122  Q
    || |||||||| ||||||||||    
T  55582724 tccgcataactatttctaagtt 55582703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26445498 - 26445309
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||    
T  26445498 ggtttgaattgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaatttcggataactatttctaa 26445399  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26445398 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26445309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Original strand, 14852734 - 14852924
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||  ||||||||||||| | |||| |||    ||    
T  14852734 atgttataagttgacccttggggtgggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttag----ta 14852829  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14852830 atgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttta 14852924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Original strand, 18108314 - 18108417
Alignment:
Q  18 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18108314 tcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttct 18108413  T
Q  118 aagt 121  Q
    ||||    
T  18108414 aagt 18108417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Original strand, 45314775 - 45314965
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  45314775 ggtttgacttgagtctggtttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaa 45314874  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 211  Q
    || || |||||||||  ||| |   || |||| ||||| || |  | | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45314875 gtcaacccaaaacttgtggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtta 45314965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 2425040 - 2425248
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  2425040 ttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaactactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatt 2425139  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||  |||||  | |  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2425140 tccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaaggttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 2425238  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  2425239 aacctatgtt 2425248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40907230 - 40907137
Alignment:
Q  313 atatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40907230 atatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttgattatcatttgatatttttatatcttgagatgtttatgtgttg 40907137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Original strand, 15041911 - 15042010
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  15041911 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgatatatcttaagatgttta 15042010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15112513 - 15112414
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  15112513 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgatatatcttaagatgttta 15112414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 274
Target Start/End: Original strand, 43251120 - 43251255
Alignment:
Q  140 ataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgga 238  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| |    
T  43251120 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggataacaatgaa 43251219  T
Q  239 ggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43251220 agttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctg 43251255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 40907084 - 40906987
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40907084 tagtaatgtgatatagttatatatgcatgatgtggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 40906987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 243
Target Start/End: Original strand, 9871126 - 9871226
Alignment:
Q  142 aattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||    
T  9871126 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatggaagt 9871224  T
Q  242 tg 243  Q
    ||    
T  9871225 tg 9871226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 403
Target Start/End: Original strand, 14746570 - 14746635
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746570 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 14746635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15792034 - 15791857
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgat-ctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 306  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| | | | ||  ||| ||||| ||||||| |||||| ||     |||    
T  15792034 gttatgagttgatcattgaggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttaa----taa 15791940  T
Q  307 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatct 388  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  15791939 tgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatacaagatgtttaagttgatgttgaattatcctttgatattgttatatct 15791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 20595850 - 20596056
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||  ||||||    
T  20595850 ttagctttctaatggctttggtttgacatgaaaataatttttagattttgagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaat 20595949  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||| | ||| ||||| || || ||||||| ||  | || | ||||||||||||| | |||  ||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  20595950 tcagcataattatttgtaagtcaaccccaaacttatggtttgatgccaaacctcaaaacttg-agttataggagttcaattatgatgtttaagagtattt 20596048  T
Q  201 aacctatg 208  Q
    ||||||||    
T  20596049 aacctatg 20596056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 387
Target Start/End: Original strand, 52243059 - 52243230
Alignment:
Q  213 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 312  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||| ||    
T  52243059 gagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtt---ta-taatgtgat 52243154  T
Q  313 atatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    ||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  52243155 ataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatc 52243230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15534754 - 15534658
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  15534754 ttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15534658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 22725504 - 22725608
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||| | | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| || |||||||    
T  22725504 ttagctttccaaaggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttactgaaatcttatgaaaat 22725603  T
Q  101 tcagc 105  Q
    |||||    
T  22725604 tcagc 22725608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Original strand, 4831496 - 4831580
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4831496 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 4831580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Original strand, 4834791 - 4834875
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4834791 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 4834875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14047799 - 14047715
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14047799 tatattcgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 14047715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26789598 - 26789441
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg-atctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||  || | ||  ||| ||||| || |||| |||||    | || |||    
T  26789598 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatgttgtagatgtttcagagagtctgatataa-ataatttgatgtt----gttaataa 26789504  T
Q  307 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttgattat 368  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789503 tgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattat 26789441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 14049150 - 14049054
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  14049150 ttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatcataaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14049054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 49547363 - 49547459
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||    
T  49547363 ttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaatttttatgaa 49547459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14185112 - 14185045
Alignment:
Q  339 atataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14185112 atatgagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagacgtttatgtgttg 14185045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 30146546 - 30146453
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 405  Q
    |||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  30146546 tatatttgcaaatgcattaagtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgtt 30146453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 325 - 398
Target Start/End: Original strand, 26045268 - 26045340
Alignment:
Q  325 gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26045268 gcattatgtggattatataagatgtttaagt-gttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgttt 26045340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Original strand, 13036332 - 13036402
Alignment:
Q  137 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  13036332 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctat 13036402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 14185515 - 14185426
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 90  Q
    ||||||||||| || | | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  14185515 ttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagcgaaatt 14185426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 12033363 - 12033459
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  12033363 ttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12033459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12622927 - 12622792
Alignment:
Q  78 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  12622927 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgt-gtactatgagttc 12622829  T
Q  178 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12622828 aattaaggtgtttaagagtatttaacctattttatga 12622792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14508317 - 14508186
Alignment:
Q  78 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| | ||| || |  |||||| ||||||    
T  14508317 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttgt-gtactatgagttc 14508219  T
Q  178 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14508218 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14508186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 19081780 - 19081892
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||| | ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||    
T  19081780 gtttgacatcaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacacttcaaggagatcttggtaaaattttacgaaaattcagcataaccgtttccaag 19081879  T
Q  121 ttaatccaaaact 133  Q
    | || ||||||||    
T  19081880 tcaacccaaaact 19081892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 36038443 - 36038347
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||||    
T  36038443 ttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgataaaaatactcaaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 36038347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 44615861 - 44615765
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  44615861 ttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 44615765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12487734 - 12487683
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12487734 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 12487683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 14954250 - 14954301
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14954250 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 14954301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 25689893 - 25689842
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25689893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 25689842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27534049 - 27533998
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27534049 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 27533998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 13046064 - 13046182
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||||||||||  || |||| || |||||||  ||||||    
T  13046064 ttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttatatttttatttatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttacgaaaat 13046163  T
Q  101 tcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||| ||||||  |||||||    
T  13046164 tcaacataaccatttctaa 13046182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10712873 - 10712828
Alignment:
Q  359 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10712873 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 10712828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10926643 - 10926598
Alignment:
Q  359 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10926643 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 10926598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Original strand, 50221932 - 50222025
Alignment:
Q  4 gctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  50221932 gctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 50222025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 19857636 - 19857584
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 409  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19857636 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgtct 19857584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 30147488 - 30147392
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||| ||||    
T  30147488 ttagctttccaatggctttggttttacttaaaaatgatttttaacttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 30147392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 297
Target Start/End: Original strand, 54798627 - 54798713
Alignment:
Q  211 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  54798627 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 54798713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Original strand, 49547744 - 49547781
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49547744 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 49547781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 15117942 - 15117998
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15117942 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 15117998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 4561417 - 4561468
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4561417 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 4561468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 5757021 - 5757072
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5757021 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 5757072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 9556553 - 9556502
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9556553 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 9556502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14280557 - 14280474
Alignment:
Q  214 agttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  14280557 agttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 14280474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 14757505 - 14757556
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14757505 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 14757556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33742401 - 33742350
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33742401 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 33742350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 54364129 - 54364244
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||   | |||| | ||||||||  | ||| | ||||||||| |||| |||    
T  54364129 gtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacactccaagtgggtcttggagaaattttaagtaaacttagcataactatttccaag 54364228  T
Q  121 ttaatccaaaacttag 136  Q
    | || |||||||||||    
T  54364229 tcaacccaaaacttag 54364244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 399
Target Start/End: Original strand, 15497041 - 15497083
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15497041 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 15497083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29267896 - 29267830
Alignment:
Q  31 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||    
T  29267896 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctcagtgaatttttatgaa 29267830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14048769 - 14048732
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14048769 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 14048732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 210
Target Start/End: Original strand, 26922254 - 26922299
Alignment:
Q  165 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26922254 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26922299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36038062 - 36038025
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36038062 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 36038025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Original strand, 52873148 - 52873197
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  52873148 gatgttgattattatttgatgttgttataccttgaggtgtttaagtgttg 52873197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 7640776 - 7640832
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  7640776 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 7640832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 17810295 - 17810251
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17810295 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 17810251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19243273 - 19243177
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||||||   | || ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  19243273 ttagctttccaatggctttggtttggagtaaatatgatttttggtttaggtgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 19243177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 1837109 - 1837160
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 52  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1837109 ttagctttccagtgtcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 1837160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 342
Target Start/End: Original strand, 44928821 - 44928914
Alignment:
Q  245 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| |   || || ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44928821 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtt---ta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44928914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 276
Target Start/End: Original strand, 8574742 - 8574807
Alignment:
Q  211 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 276  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8574742 atgagttggtctttagggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 8574807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 209
Target Start/End: Original strand, 12134425 - 12134486
Alignment:
Q  148 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 209  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  12134425 aaacttcaaaactaaaagtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 12134486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15534373 - 15534336
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15534373 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 15534336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 290
Target Start/End: Original strand, 20157189 - 20157234
Alignment:
Q  245 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaa 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  20157189 atatgatattaatgatgatctgtgaagttgttatatgatgatttaa 20157234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44102433 - 44102404
Alignment:
Q  245 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102433 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 44102404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 123)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27472886 - 27472482
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27472886 ttagctttccagtgaaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 27472787  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27472786 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 27472687  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  27472686 aacttatgttatgagttgatccttggggtaggactggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttaaaatatgatttaatgttga---- 27472591  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472590 tagtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 27472491  T
Q  401 gtgttgtct 409  Q
    ||| |||||    
T  27472490 gtgctgtct 27472482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 34873866 - 34874260
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||  ||||||    
T  34873866 ttagctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaat 34873965  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34873966 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtattt 34874065  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  34874066 aacctatgttatgagttgatccttgggataggaatggaggttgaatataatattactgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttga---- 34874161  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34874162 aagtattgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 34874260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 399
Target Start/End: Original strand, 18358407 - 18358781
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||    
T  18358407 ggtttgacttgaaaatgttttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaa 18358506  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18358507 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttga 18358606  T
Q  220 tctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttg 319  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||    
T  18358607 tccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaccgatgatctgcgaagctgttat-atatgatttaatgttga----tagtaatgtattatatttg 18358701  T
Q  320 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18358702 tatatgcaatatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgttta 18358781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 403
Target Start/End: Original strand, 21081409 - 21081788
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||    
T  21081409 ggtttgacttaaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaa 21081508  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21081509 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgg 21081608  T
Q  220 tctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttg 319  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||    
T  21081609 tccttggggtaggaatggaggatgaatataatattactgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tactaatgtaatatatttg 21081704  T
Q  320 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21081705 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgtttttatatctttagatgtttacgtg 21081788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 22173447 - 22173828
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  22173447 ttagctttccaatgggtttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 22173546  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22173547 ttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaccctcaaaactcaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 22173646  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  22173647 aacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga---- 22173742  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22173743 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattaagtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 22173828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 34858804 - 34859058
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||  ||||||    
T  34858804 ttagctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaat 34858903  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34858904 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtattt 34859003  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatta 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34859004 aacctatgttatgagttgatccttgggataggaatggaggttgaatataatatta 34859058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 19662074 - 19662468
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  19662074 ttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 19662173  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  19662174 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 19662273  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  19662274 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 19662369  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19662370 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 19662468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 21073146 - 21073540
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |  |||||||||||| || |||||||    
T  21073146 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaat 21073245  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21073246 tcagcacaaccatttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaatactcaaaactagaagcaatatgagttcaattaaggtatttcagagtattt 21073345  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  21073346 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 21073441  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21073442 tagtaatgagatatatttgtatattcattatgtggattatataagatatttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 21073540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9242393 - 9241999
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||| |||||| | | |||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||||    
T  9242393 ttagcttcccaatggctttggtttgactttaaagtgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagatcttagggaaatcttatgaaaat 9242294  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9242293 tcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaactaaggtgtttaagagtattt 9242194  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| |   |||    | ||||||||||||| |||||    |     
T  9242193 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttgatgttgaatgagtaagatataatatgatttgatgtt----gt 9242098  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9242097 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 9241999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 399
Target Start/End: Original strand, 6260801 - 6261192
Alignment:
Q  5 ctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcag 104  Q
    |||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  6260801 ctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 6260900  T
Q  105 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 204  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||  || |||||| |||||||||||||||||    
T  6260901 caaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaaatattacgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaacc 6261000  T
Q  205 tatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagt 304  Q
     ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||||||| |||| |||||    | ||||    
T  6261001 catgttgtgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatttgatgtt----gttagt 6261096  T
Q  305 aatgtaatatatttgtata-tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6261097 aatgagatatatttgtatattgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagacgttta 6261192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 31345495 - 31345184
Alignment:
Q  82 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 181  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  31345495 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttataggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 31345396  T
Q  182 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 281  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  31345395 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattattgatgatttgtgaagctattataat 31345303  T
Q  282 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 381  Q
    |||| ||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31345302 atgaattagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 31345207  T
Q  382 tatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31345206 tatatcttgagatgtttacgtgt 31345184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 41301392 - 41301633
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41301392 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaagtgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 41301491  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41301492 tcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 41301591  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 242  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  41301592 aacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 41301633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26903791 - 26903561
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  26903791 ttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 26903692  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26903691 tcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtattt 26903592  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    ||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  26903591 aacctatattgtgagttggtcattggggtag 26903561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 23969042 - 23969251
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |  ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23969042 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatacgatgaaaataattaatggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 23969141  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23969142 tcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 23969241  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  23969242 aacctatgtt 23969251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 43707704 - 43707912
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  43707704 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 43707803  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  43707804 tcagcataaccg-ttctaagttaatctaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagattattt 43707902  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  43707903 aacctatgtt 43707912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9975543 - 9975353
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9975543 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 9975444  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9975443 gttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 9975353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 24273678 - 24273887
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  24273678 ttagctttccaatgactttggtttgacctgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 24273777  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  24273778 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgtattt 24273877  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  24273878 aacctatgtt 24273887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 24781259 - 24781468
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  24781259 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaat 24781358  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  24781359 tcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagaatattt 24781458  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  24781459 aacctatgtt 24781468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25183820 - 25183603
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  25183820 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 25183721  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25183720 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 25183621  T
Q  201 aacctatgttatgagttg 218  Q
    |||||||||| |||||||    
T  25183620 aacctatgttgtgagttg 25183603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21915255 - 21915025
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| ||||||||| | | |||||| | ||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21915255 ttagatttccaatggctttggtttggcgtgaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 21915156  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21915155 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 21915056  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  21915055 aacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21915025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36839785 - 36839595
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  36839785 ggttttacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaa 36839686  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36839685 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 36839595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 27484889 - 27485098
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||| |||||| |||||||    
T  27484889 ttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaagtaggtcttagtggaattttatgaaaat 27484988  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27484989 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 27485088  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  27485089 aacatatgtt 27485098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24884019 - 24883785
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  24884019 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 24883920  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24883919 tcagtataaccctttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 24883820  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    |||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24883819 aacccatgtagtgagttgatc-ttgggataggaatg 24883785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 5031568 - 5031758
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5031568 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 5031667  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||    
T  5031668 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaactaggctgtttaagagtatttaacatatgtt 5031758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31520750 - 31520509
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| || |||||||    
T  31520750 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaatcttatgaaaat 31520651  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31520650 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactgaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 31520551  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  31520550 aactcatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatggaagttg 31520509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18388716 - 18388940
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  18388716 ttagctttccagtgactttggtttgacttaaaaatgatttatggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctttggaaaat 18388815  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18388816 tcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 18388915  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttg 225  Q
     ||  |||||  |||||||| ||||    
T  18388916 tactcatgttgagagttgatttttg 18388940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20915719 - 20915525
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| ||    
T  20915719 ggtttgacttgaaaatgattcttattttttgagatatgatgaaaatactccaatgatatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaa 20915620  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20915619 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagctgtttaagagtatttaacctatgctatga 20915525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21368721 - 21368532
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  21368721 ggtttggcttgaaaatgagttttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataaccgtttctaa 21368622  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 209  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21368621 gttaatccaaaaattatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaaataagaggtttaagagtatttaacctatgt 21368532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 23338820 - 23339092
Alignment:
Q  2 tagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaatt 101  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  23338820 tagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 23338919  T
Q  102 cagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattta 201  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  23338920 cagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtattta 23339019  T
Q  202 acctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    | | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  23339020 atccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctg 23339092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 223
Target Start/End: Original strand, 10039572 - 10039775
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||    
T  10039572 ggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 10039671  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  10039672 gttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttga 10039771  T
Q  220 tctt 223  Q
    ||||    
T  10039772 tctt 10039775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Original strand, 23068888 - 23069071
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23068888 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 23068987  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  23068988 gttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactataagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 23069071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17307101 - 17306911
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |    
T  17307101 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctta 17307002  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  17307001 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagatcatttaacatatgtt 17306911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19201619 - 19201828
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa-tactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa 99  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19201619 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatatgtggttcttgagatatgatgaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 19201718  T
Q  100 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  19201719 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatttaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 19201818  T
Q  200 taacctatgt 209  Q
    ||||||||||    
T  19201819 taacctatgt 19201828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9785196 - 9785013
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9785196 ggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataattgtttctaa 9785097  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  9785096 gttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 9785013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Original strand, 28652940 - 28653123
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||     
T  28652940 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatggaaattcagcataaccgtttttag 28653039  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28653040 gttaatccgaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaac 28653123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24515819 - 24515610
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  24515819 ttagctttccagtgtctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttctttagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 24515720  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24515719 tcagtataatcgtttctacgttaatccaaaacttaaggaataaattcaaatctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 24515620  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    || |||||||    
T  24515619 aatctatgtt 24515610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Original strand, 20590745 - 20590956
Alignment:
Q  5 ctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcag 104  Q
    |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||    
T  20590745 ctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcag 20590844  T
Q  105 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 204  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  20590845 cataaccctttttaagttaatccaaaacttaagggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacc 20590944  T
Q  205 tatgttatgagt 216  Q
     |||||||||||    
T  20590945 catgttatgagt 20590956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6483152 - 6482946
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  6483152 ttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 6483053  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  6483052 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatt 6482953  T
Q  200 taaccta 206  Q
    |||||||    
T  6482952 taaccta 6482946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6486619 - 6486413
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  6486619 ttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 6486520  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  6486519 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatt 6486420  T
Q  200 taaccta 206  Q
    |||||||    
T  6486419 taaccta 6486413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28349550 - 28349268
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||| || |||||||    
T  28349550 ttagctttgcaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttcgtgaaatcttatgaaaat 28349451  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta-ggga--------ataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtattta 191  Q
    |||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  28349450 tcagctcaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttta 28349351  T
Q  192 agagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28349350 agagtatttaatccatgttgtgatttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaatgatgatctgtgaagctg 28349268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 112 - 399
Target Start/End: Original strand, 30643811 - 30644094
Alignment:
Q  112 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  30643811 gtttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttg 30643910  T
Q  212 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 311  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||||||  |||| |||||| |||    |||||  |    
T  30643911 tgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatacaatttgatgttgttag----taatgaga 30644006  T
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  30644007 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagtagatattgattatcatttgatattgttatatcttgagacgttta 30644094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22690313 - 22690101
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22690313 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 22690214  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||  ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||   ||  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  22690213 tccacataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtattt 22690115  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||||||||||||||    
T  22690114 aacctatgttatga 22690101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 208 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 34137200 - 34137006
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 307  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| || ||||  ||| ||||||||||| | |||||     ||||||||    
T  34137200 gttatgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttcagtgagtctgatataatatgatgtgatgtta----ctagtaat 34137105  T
Q  308 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34137104 gtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatctcttgagatgtttatgtgttg 34137006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26392643 - 26392455
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  ||      
T  26392643 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaatttgttattacatgatctaatgttgatagaaag-- 26392546  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
      || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26392545 --gtgatatatttgtatatgcattatgtggattagataagatgtttaag-tattgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgttta 26392455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29113975 - 29113786
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||    
T  29113975 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattcctaa 29113876  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||| | |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29113875 gtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 29113786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22694909 - 22694697
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22694909 ttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 22694810  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||  ||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||||   ||  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  22694809 tccacataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtattt 22694711  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||||||||||||||    
T  22694710 aacctatgttatga 22694697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 279 - 403
Target Start/End: Original strand, 23069215 - 23069335
Alignment:
Q  279 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 378  Q
    |||||||||| |||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  23069215 aatatgatttgatgttgatggc----aatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatat 23069310  T
Q  379 tgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23069311 tgttatatcttgagatgtttacgtg 23069335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 206 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23287625 - 23287438
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| || |||||| | |||    |||||    
T  23287625 atgttgtgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtggatctgttataacattatttaacgatga----tagta 23287530  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23287529 atgtgatatatttgtatatgcaatatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 23287438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 206 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23005012 - 23004835
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    | || |     
T  23005012 atgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgatttaacgtt----gttaatg 23004917  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| || |||||||    
T  23004916 atgttaaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 23004835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22686472 - 22686264
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  22686472 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaatatgatttttggtttttgaggtatgatgaaaacactctaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 22686373  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || ||| |||| ||||||| | || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22686372 tccgcacaactatttctaattcaacccaaaacttatggattgtctcgaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 22686274  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  22686273 aacctatgtt 22686264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 25587106 - 25587240
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25587106 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 25587205  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    ||  ||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  25587206 tccacataactatttctaggtcaacccaaaactta 25587240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 303 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9784848 - 9784754
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9784848 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttgttgattatcattggatgttgttatatcttgagatgttta 9784754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 21316081 - 21316289
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |  ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21316081 ttagctttccagtgtccttcgtttgacgtgaaaataatatttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 21316180  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || || ||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21316181 tccgcttaactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 21316279  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  21316280 aacctatgtt 21316289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 21335872 - 21336080
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  21335872 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaagttttatgaaaat 21335971  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || ||||||  || ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  21335972 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaagctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtattt 21336070  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  21336071 aacctatgtt 21336080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 2524185 - 2524380
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |                || |||||||||||||||||    |||||    
T  2524185 ggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagg----------------ttatgaaaattcagcataacc---tctaa 2524265  T
Q  120 -gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 218  Q
     ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2524266 agttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaatcaaggtatttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 2524365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 1384105 - 1384239
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1384105 ttagctttccagtggctttggattgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaat 1384204  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    ||  ||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  1384205 tccacataactatttctaagtcaactcaaaactta 1384239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 206 - 387
Target Start/End: Original strand, 20520051 - 20520227
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||    | | || ||    
T  20520051 atgttatgagtttatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatg----tcgttaata 20520146  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  20520147 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 20520227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 301 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21237924 - 21237816
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21237924 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgatgaattattatttgatattgttatatcttgagatgttta 21237825  T
Q  400 cgtgttgtc 408  Q
     ||| ||||    
T  21237824 tgtgctgtc 21237816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 406
Target Start/End: Original strand, 19201924 - 19202030
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19201924 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 19202023  T
Q  400 cgtgttg 406  Q
     ||||||    
T  19202024 tgtgttg 19202030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22332349 - 22332142
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  22332349 ttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatggcgaaaacactccaatgaggtcttggtg-aattttatgaaaat 22332251  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||| | |  |||||| |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  22332250 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaaattg-tgtactatgagttcaattaaggtgttcaagagtattt 22332152  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  22332151 aacctatgtt 22332142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23610089 - 23609901
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||    
T  23610089 gtttgacttgaaaatgatttacgatttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttagtgaaattttatgcaaattctgcataactatttctaag 23609990  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    | || ||||||| || ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23609989 tcaacccaaaacctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23609901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 397
Target Start/End: Original strand, 18546803 - 18546991
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || || |  ||||| |||||||   || ||||||||  ||| |||||| |||    ||    
T  18546803 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtttgatataatatattttgatgttgttag----ta 18546898  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||    
T  18546899 atgtgatacatttgtatatgcattatgtaaattaatgtaagatgtctaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgtt 18546991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 403
Target Start/End: Original strand, 23707275 - 23707340
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707275 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 23707340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24918244 - 24918179
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918244 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 24918179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 350
Target Start/End: Original strand, 22412994 - 22413134
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | || ||    
T  22412994 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgttaatctgtgaagctgttataagatgatttgatgtt----gttaata 22413089  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 350  Q
    |||| |||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||||    
T  22413090 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgtt 22413134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22501374 - 22501260
Alignment:
Q  128 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 227  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  22501374 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatc-ttggg 22501276  T
Q  228 gtaggaatggaggttg 243  Q
     |||||||||| ||||    
T  22501275 ataggaatggaagttg 22501260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22509308 - 22509194
Alignment:
Q  128 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 227  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  22509308 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatc-ttggg 22509210  T
Q  228 gtaggaatggaggttg 243  Q
     |||||||||| ||||    
T  22509209 ataggaatggaagttg 22509194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 23778714 - 23778849
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttg-aaaa 99  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||  | ||||    
T  23778714 ttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggttttagtgaaattttacgaaaaa 23778813  T
Q  100 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    ||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  23778814 ttccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 23778849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 28345495 - 28345614
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||  ||||||    
T  28345495 ttagctttccagtggctttgattttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttacgaaaat 28345594  T
Q  101 tcagcataactgtttctaag 120  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  28345595 tccgcataactatttctaag 28345614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 387
Target Start/End: Original strand, 24697467 - 24697641
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 307  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    | || ||||    
T  24697467 gttatgagtagatccttagggtaggagtggaggttgtatttaatattaatgatgatctgtgaagctg-tataatatgattttatgtt----gttaataat 24697561  T
Q  308 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    || |||||  |||||||||||||  |||||| |||| || |||| || || |||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  24697562 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24681548 - 24681483
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681548 tatatatgatgtttaagttgatgttgatcatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 24681483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20261792 - 20261696
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  20261792 ttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 20261696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 24671129 - 24671065
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24671129 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 24671065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 40911935 - 40911868
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaat 89  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40911935 tttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaat 40911868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 10684352 - 10684448
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | |  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  10684352 ttagctttccaatggctttagttttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 10684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 38968052 - 38967956
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  38968052 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttttgtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 38967956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22703258 - 22703174
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22703258 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaaattg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 22703174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 31345733 - 31345661
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttt 93  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  31345733 ggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagt-aaattttt 31345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 6482899 - 6482838
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  6482899 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttaattaccatttgatattgttatatctt 6482838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 6486366 - 6486305
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  6486366 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttaattaccatttgatattgttatatctt 6486305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22255845 - 22255777
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 69  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22255845 ttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactc 22255777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22786717 - 22786924
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | |  ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||| ||||  |  |||| || || |||| |||||||    
T  22786717 ttagctttccaatggctttagtttgacttaaaaatgttttttagattttgagatatgagggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttgtgaaaat 22786816  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |  ||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||  |||  |||||||||    
T  22786817 tt-gcataaccgtttctaactcaatccaaaacctatggaacgtttccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaatcgagagattggagagtattt 22786915  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  22786916 aacctatgt 22786924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1283412 - 1283361
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1283412 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 1283361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 30345074 - 30345125
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30345074 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 30345125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 41531087 - 41531138
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41531087 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 41531138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Original strand, 13101597 - 13101682
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat-gttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13101597 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgataatttttatatcttgagatgt 13101682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 20272989 - 20272855
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||  |  | |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||  || |||| || || ||||   |||||    
T  20272989 ttagctttccaatgaatttagattgatttaaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttggtaaatttttaccaaaat 20272890  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  20272889 tcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaactta 20272855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 388
Target Start/End: Original strand, 43947324 - 43947408
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt-taagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 388  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  43947324 taatgtgatatatt-gtatatgcactatgtgaattatatgagatgttgtaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 43947408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 386
Target Start/End: Original strand, 24642807 - 24642855
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24642807 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 24642855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 24897785 - 24897881
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  24897785 ttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24897881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 24900268 - 24900364
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  24900268 ttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24900364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 24902745 - 24902841
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  24902745 ttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24902841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 24905222 - 24905318
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  24905222 ttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24905318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 24907697 - 24907793
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  24907697 ttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24907793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 342
Target Start/End: Original strand, 23708521 - 23708609
Alignment:
Q  250 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |   || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23708521 atattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtt---ta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23708609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 7186999 - 7186942
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatga 58  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7186999 ttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatga 7186942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24841422 - 24841377
Alignment:
Q  165 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24841422 gtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 24841377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18809515 - 18809459
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18809515 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 18809459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23136152 - 23136056
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  23136152 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23136056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28577671 - 28577615
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28577671 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 28577615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 12901595 - 12901646
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12901595 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12901646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 24628562 - 24628613
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24628562 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 24628613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24649380 - 24649329
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24649380 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 24649329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 27379516 - 27379567
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27379516 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 27379567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 27383562 - 27383613
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27383562 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 27383613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27601819 - 27601768
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27601819 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 27601768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 36734904 - 36734975
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 72  Q
    |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36734904 ttagatttccaatggctttggtttgacttgaaaatgttttgtgggttttgagttatgatgaaaacactccaa 36734975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 39682886 - 39682835
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 52  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39682886 ttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 39682835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 22501433 - 22501375
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 59  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22501433 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22501375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 22509367 - 22509309
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 59  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22509367 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22509309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Original strand, 34492091 - 34492141
Alignment:
Q  181 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  34492091 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 34492141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 28031919 - 28032056
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||| | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || |||||||||    
T  28031919 ggtttggcttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaa 28032018  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaa 157  Q
    || || ||||| |||| ||| || ||| |||| |||||    
T  28032019 gtcaacccaaaccttatggattatttccaaacttcaaa 28032056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 397
Target Start/End: Original strand, 10101728 - 10101772
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10101728 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 10101772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 23711603 - 23711659
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23711603 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 23711659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 26505951 - 26505895
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26505951 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26505895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 26508429 - 26508373
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26508429 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26508373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 27920354 - 27920410
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27920354 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 27920410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 32039088 - 32039144
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32039088 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 32039144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 571970 - 571919
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 52  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  571970 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 571919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 406
Target Start/End: Original strand, 22459579 - 22459617
Alignment:
Q  368 tcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22459579 tcatttgatgttgttatatctttagatgtttatgtgttg 22459617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Original strand, 10684735 - 10684772
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10684735 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 10684772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20261411 - 20261374
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20261411 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 20261374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 252
Target Start/End: Original strand, 43947232 - 43947276
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 252  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43947232 gttatgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattataata 43947276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 607 - 225
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  607 ggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaa 508  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  507 gttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagcatttaacccgtgttgtgagttga 408  T
Q  220 tctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttg 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  407 tccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttg 312  T
Q  320 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  311 tatatgcattatttgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttg 225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 67727 - 67330
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  67727 ttagctttcctatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 67628  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||    
T  67627 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaatctgaaaactagaagtactaggatttcaattaaggtgtttaagaatattt 67528  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        
T  67527 aacctatgttaagagttgatcattggggtaggaatggatgttgaatataatattacttatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgttga---- 67432  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  67431 tagtaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattgtataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttg-ggtgtttac 67333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 134
Target Start/End: Original strand, 62410 - 62522
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  62410 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagt 62509  T
Q  122 taatccaaaactt 134  Q
     || |||||||||    
T  62510 caaaccaaaactt 62522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 116843 - 117032
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||  | ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||   |||||| |||||||    
T  116843 ggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgaggaaaccattccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattctatataactatttctaa 116942  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 209  Q
    || || |||||||||| ||  |  ||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| || ||||   |||||||||||| |||||||||    
T  116943 gtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaaccagaagtattaggagtttaagtaagaggtttaagagtattaaacctatgt 117032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 103)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6766294 - 6765901
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||| |||||||    
T  6766294 ttagctttccaatgacttttgtttgacttaaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtaaaattttatgaaaat 6766195  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6766194 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 6766095  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        
T  6766094 aacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggtggaatataatattgctgttgatctgtgaagctgttat-atatgatttaatgttga---- 6766000  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765999 tagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgttta 6765901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 30138583 - 30138979
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  || | ||||||    
T  30138583 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaccttat-gaaaat 30138681  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30138682 tcagcataaccgtttctaagttaacccaaaatttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 30138781  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          
T  30138782 aacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgtt----cg 30138877  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30138878 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 30138977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29448451 - 29448078
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  29448451 gtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaag 29448352  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat 220  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29448351 ttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtagtatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgat 29448252  T
Q  221 ctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgt 320  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    || ||| || || |||||||    
T  29448251 ccttggggtaggaatggaggatgaatactatattaatgatgatttgtgaagttgttataatatgatttgatgttga----taataaggtgatgtatttgt 29448156  T
Q  321 atatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    ||||||||||  |||||||  || ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  29448155 atatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttt 29448078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22412639 - 22412365
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |    
T  22412639 ttagctttccaatgactttattttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaagt 22412540  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  22412539 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgttt 22412440  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 276  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22412439 aacctatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 22412365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18419045 - 18418770
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  18419045 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 18418946  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||    
T  18418945 tcagcataatcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtattt 18418846  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 276  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18418845 aacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataacctgtgaagctgtt 18418770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 37598536 - 37598930
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| ||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  37598536 ttagatttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 37598635  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || | ||||| ||  ||||||||||||| || || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  37598636 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggacaattccaaggctcaaaactagaattaatatgagtgcaattaaggtttttaagagtattt 37598735  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  37598736 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 37598831  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37598832 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 37598930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42961010 - 42960608
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||| | |||||||| |||||||    
T  42961010 ttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatggtttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttcgggaaattttatgaaaat 42960911  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  42960910 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgcttaagagtattt 42960811  T
Q  201 aacctatgttatgagttgat-ctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 299  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |    
T  42960810 aacccatgttgtgagttgatccttgggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----g 42960715  T
Q  300 ctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42960714 ttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 42960615  T
Q  400 cgtgttg 406  Q
     ||||||    
T  42960614 tgtgttg 42960608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 28370675 - 28371069
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  28370675 ttagctttccagtggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 28370774  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||  || |||||| |||||||||||||    
T  28370775 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtattt 28370874  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||| | |||||    |     
T  28370875 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatctgatgtt----gt 28370970  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28370971 tagtaatgagatatatttgcatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 28371069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24277025 - 24277266
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24277025 ttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 24277124  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24277125 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 24277224  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24277225 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24277266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24385188 - 24384947
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24385188 ttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 24385089  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24385088 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 24384989  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24384988 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24384947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17813029 - 17812795
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17813029 ttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 17812930  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  17812929 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtattt 17812830  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  17812829 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 17812795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 263490 - 263260
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  263490 ttagctttccgatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 263391  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  263390 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 263291  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  263290 aacctatgttgtgagttggtccttggggtag 263260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 33472983 - 33473213
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33472983 ttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 33473082  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||    
T  33473083 tcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtattt 33473182  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  33473183 aacctaagttgtgagttggtccttggggtag 33473213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 32607744 - 32607953
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||    
T  32607744 ttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaat 32607843  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  32607844 tcagcataaccgtttctaagctaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtattt 32607943  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  32607944 aacctatgtt 32607953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20566168 - 20565978
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20566168 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 20566069  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20566068 gttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaattactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20565978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 21399423 - 21399628
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||    
T  21399423 ttagctttccaatgactttggtttgactt-aaaatgattttcagtttttgagatatgataaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaat 21399521  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21399522 ttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 21399621  T
Q  201 aacctat 207  Q
    |||||||    
T  21399622 aacctat 21399628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17011359 - 17011102
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  17011359 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttcagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 17011260  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17011259 ttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacttcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 17011160  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 258  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  17011159 aacctatgttgtgagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 17011102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26762034 - 26761827
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  26762034 ttagctttccagtggctttggttttacttgaaactgatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaacat 26761935  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  26761934 tcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattt 26761835  T
Q  201 aacctatg 208  Q
    ||||||||    
T  26761834 aacctatg 26761827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36460603 - 36460368
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  36460603 ttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 36460504  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |    
T  36460503 tcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgt 36460404  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    ||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  36460403 aacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 36460368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17875632 - 17875410
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||    
T  17875632 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 17875533  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17875532 tcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 17875433  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    ||||  | || ||||||||||||    
T  17875432 aacccctattgtgagttgatctt 17875410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19921248 - 19921058
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19921248 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaaatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 19921149  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19921148 gttaatccaaaacttaaggaataatttcaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacatatgtt 19921058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 41876012 - 41876221
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| |||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41876012 ttagatttccaatgactctggtttggcatgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 41876111  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  41876112 tcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtattt 41876211  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  41876212 aacctatgtt 41876221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 20198005 - 20198216
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttg--agatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaa 98  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  20198005 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttttagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaa 20198104  T
Q  99 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtat 198  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  | |||||||||    
T  20198105 attcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactaggagtttaattaaggggtataagagtat 20198204  T
Q  199 ttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||    
T  20198205 ttaacctatgtt 20198216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 33895301 - 33895508
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  33895301 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattgtgaaaat 33895400  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  33895401 tcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatagaataaatccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtattt 33895500  T
Q  201 aacctatg 208  Q
    ||||||||    
T  33895501 aacctatg 33895508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 38145157 - 38145492
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  38145157 ttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 38145256  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  38145257 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatacgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 38145356  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |   |||  | | |||||||| |||| |||||    |     
T  38145357 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgactgagtcagatataatataatttgatgtt----gt 38145452  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattat 340  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38145453 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattat 38145492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 27868994 - 27869203
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  27868994 ttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 27869093  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  27869094 tcagcacaaacatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtattt 27869193  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  27869194 aacctatgtt 27869203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31456412 - 31456196
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  |||||||    
T  31456412 ggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgggaaaattaagtataaccttttctaa 31456313  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  31456312 gttaatccaaaacttatggaaaaattccaaccctcaaaactagaaatactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacccatattgtgagtcga 31456213  T
Q  220 tctttggggtaggaatg 236  Q
     | ||||||||||||||    
T  31456212 cccttggggtaggaatg 31456196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 208
Target Start/End: Original strand, 8833663 - 8833824
Alignment:
Q  46 ttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8833663 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatt 8833762  T
Q  146 caaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||    
T  8833763 ccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc-attaagttgtttaagagtatttaacctatg 8833824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 21557482 - 21557699
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||    
T  21557482 ggtttgacttgaaaatgatttttggcttttaagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaatcttacgaaaattcagtataaccatttctaa 21557581  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagttg 218  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  21557582 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaaactatgttgtgagtcg 21557681  T
Q  219 atctttggggtaggaatg 236  Q
    | | ||||||||||||||    
T  21557682 acccttggggtaggaatg 21557699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22750555 - 22750372
Alignment:
Q  23 ttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 122  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |  |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22750555 ttgacttgaaaataacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtt 22750456  T
Q  123 aatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22750455 aatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22750372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 36509237 - 36509405
Alignment:
Q  43 ggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaata 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36509237 ggtttttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaata 36509336  T
Q  143 attcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  36509337 atttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 36509405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 208 - 399
Target Start/End: Original strand, 25576716 - 25576902
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 307  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  25576716 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattacagatgttcagtgagtctgatataatatgattttatgttgatag----taat 25576811  T
Q  308 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25576812 gtgatatagttgtatatgcatgatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgatattgttatatcttgagatgttta 25576902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19511820 - 19511614
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  || |||||||| ||| || |||||||    
T  19511820 ttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtggaatcttatgaaaat 19511721  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | || || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  19511720 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagcattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatt 19511621  T
Q  200 taaccta 206  Q
    |||||||    
T  19511620 taaccta 19511614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Original strand, 21554817 - 21555013
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||  ||||||||||  ||||  |||||||    
T  21554817 ggtttgacttgaaaatgatttt-ggtttttaagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtctaaccatttctaa 21554915  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagt 216  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  21554916 gttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaacccatgttgtgagt 21555013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23470064 - 23469876
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||    ||    
T  23470064 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagtctgttataatatgatttgatgttgttag----ta 23469969  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  23469968 atgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat-atggtatatcttgagatgttta 23469876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16063099 - 16062910
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  16063099 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaa 16063000  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || ||||||||||  || |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16062999 gtcaacccaaaacttatagattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 16062910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 22758309 - 22758583
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttg-agatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa 99  Q
    |||||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||  || ||||||    
T  22758309 ttagctttccaatggctttagcttgacttgaaaatgatttttggtttttttagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 22758408  T
Q  100 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  22758409 ttcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagcactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatt 22758508  T
Q  200 taacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    ||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  22758509 taatccatgttgtgagttgaactttgggataacaatgaaagttgtataagatattaaggatgatatgtgaagctg 22758583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 40917392 - 40917524
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  40917392 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactcaaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 40917491  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40917492 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 40917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 208 - 399
Target Start/End: Original strand, 25574330 - 25574516
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  25574330 gttatgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatag----taat 25574425  T
Q  308 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  25574426 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgaaatagttatatcttgagatgttta 25574516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 208 - 399
Target Start/End: Original strand, 25575523 - 25575709
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  25575523 gttatgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatag----taat 25575618  T
Q  308 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  25575619 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgaaatagttatatcttgagatgttta 25575709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 399
Target Start/End: Original strand, 22107386 - 22107482
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107386 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 22107482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Original strand, 26740505 - 26740693
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||     |    
T  26740505 atgttgtgagttgatccttggggtaggagtggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatttgttattacatgatttaatgttgataga----a 26740600  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  26740601 atgtgatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatccttagatgttta 26740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 399
Target Start/End: Original strand, 26732698 - 26732880
Alignment:
Q  212 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 311  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||     ||||| |    
T  26732698 tgagttgatccttggggtaagaatggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatatgttattacatgatttaatgttgataga----aatgtga 26732793  T
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26732794 tatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgtcgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgttta 26732880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22336953 - 22336748
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||| || |||||||    
T  22336953 ttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaat 22336854  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||  || |||||| |||||||||||||    
T  22336853 tcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtattt 22336754  T
Q  201 aaccta 206  Q
    ||||||    
T  22336753 aaccta 22336748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 8504307 - 8504496
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  8504307 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctag 8504406  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   |  |||| ||||| || |  |||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8504407 gtcaacccaaaacttatggattgtcttcaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 8504496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 16605042 - 16605231
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||    
T  16605042 ggtttgacttgaaaatggtttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttataa 16605141  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16605142 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 16605231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18744282 - 18744074
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||    
T  18744282 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaaaat 18744183  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18744182 tccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 18744084  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  18744083 aacctatgtt 18744074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22340491 - 22340286
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||| || |||||||    
T  22340491 ttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaagagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaat 22340392  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||  || |||||| |||||||||||||    
T  22340391 tcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttataggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtattt 22340292  T
Q  201 aaccta 206  Q
    ||||||    
T  22340291 aaccta 22340286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 14026246 - 14026435
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||||    
T  14026246 ggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatcccgcctaactatttctaa 14026345  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || ||||||| || ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14026346 gtcaacccaaaacatatggattgtctccaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttgaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14026435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 1627819 - 1628008
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  1627819 ggtttgacttgaaaatgatttttaacttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttaatgaaattttatgaaaattccgcataactatttctag 1627918  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1627919 gtcaacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaacgtgtttaagagtatttaacctatgtt 1628008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22111185 - 22111024
Alignment:
Q  48 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||     
T  22111185 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctcc 22111086  T
Q  148 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||| ||||| || |  |||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22111085 aaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttctattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22111024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 206 - 388
Target Start/End: Original strand, 21328073 - 21328252
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata-atatgatttaatgttgatagctagt 304  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||| ||||  ||||| |||||||   || |||| | ||||||| ||||| |||   | |    
T  21328073 atgttatgagttgatccatgggggaggaatggaggtttattatagtattgttgatgttctgtgagtttgctatatacatgatttgatgtt-ata---aat 21328168  T
Q  305 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 388  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21328169 aatgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgctatatct 21328252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 23199811 - 23199942
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23199811 ttagctttcccatggctttggtttgacttgaaaat---ttttggtttctgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 23199907  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    || |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  23199908 tccgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 23199942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 24617342 - 24617446
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  24617342 ttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaat 24617441  T
Q  101 tcagc 105  Q
    |||||    
T  24617442 tcagc 24617446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 24713573 - 24713677
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  24713573 ttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaat 24713672  T
Q  101 tcagc 105  Q
    |||||    
T  24713673 tcagc 24713677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 24746601 - 24746705
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  24746601 ttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaat 24746700  T
Q  101 tcagc 105  Q
    |||||    
T  24746701 tcagc 24746705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 43243077 - 43243164
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 88  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43243077 ttagctttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 43243164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Original strand, 12122077 - 12122175
Alignment:
Q  137 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12122077 ggaataattctaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 12122175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 328 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22336711 - 22336640
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22336711 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22336640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 328 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22340249 - 22340178
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22340249 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22340178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 37804492 - 37804588
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  37804492 ttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 37804588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Original strand, 21809531 - 21809629
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21809531 tagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgttta 21809629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 303 - 362
Target Start/End: Original strand, 33895607 - 33895666
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33895607 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgtt 33895666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18356323 - 18356264
Alignment:
Q  345 gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18356323 gatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 18356264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 399
Target Start/End: Original strand, 21731426 - 21731509
Alignment:
Q  317 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21731426 ttgtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgttta 21731509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 398
Target Start/End: Original strand, 27988892 - 27988978
Alignment:
Q  315 atttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  27988892 atttgtatatgcattgatgtgaattatacaagatgtttaaatgttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagctgttt 27988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17909100 - 17908966
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||| | ||| |||  ||||||    
T  17909100 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaat 17909001  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    || ||| || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  17909000 tccgcacaattgtctctaagtcaacccaaacctta 17908966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 10816562 - 10816478
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10816562 tatatttgcaaatgcattatgtggagttatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 10816478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 22750325 - 22750264
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 389  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22750325 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 22750264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23538588 - 23538504
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23538588 tatatttgaaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatgatttgatattgttatatcttgagatgt 23538504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 24668616 - 24668720
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | |  | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  24668616 ttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaat 24668715  T
Q  101 tcagc 105  Q
    |||||    
T  24668716 tcagc 24668720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 24738385 - 24738489
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | |  | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  24738385 ttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaat 24738484  T
Q  101 tcagc 105  Q
    |||||    
T  24738485 tcagc 24738489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 24751154 - 24751258
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | |  | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  24751154 ttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaat 24751253  T
Q  101 tcagc 105  Q
    |||||    
T  24751254 tcagc 24751258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28901553 - 28901346
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  |  |||| || || |||| |||||||    
T  28901553 ttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaat 28901454  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    ||  |||||||||    
T  28901453 t-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaaaaggttggagagtattt 28901355  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  28901354 aacctatgt 28901346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28937948 - 28937741
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  |  |||| || || |||| |||||||    
T  28937948 ttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaat 28937849  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    ||  |||||||||    
T  28937848 t-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaaaaggttggagagtattt 28937750  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  28937749 aacctatgt 28937741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 342
Target Start/End: Original strand, 18318942 - 18319068
Alignment:
Q  211 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||     || |||     
T  18318942 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgacgacctgtgaagctgttataacatgattcaatgttgtta-----tattgtg 18319036  T
Q  311 atatatttgtatatgcattatgtgaattatat 342  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18319037 atataattgtatatgcattaattgaattatat 18319068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20572149 - 20572025
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata-atatgatttaatgttgatagctagt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| |||||||  ||| || | | ||||||| |||||    | ||||    
T  20572149 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgattttactattgttgatgttctgtgagtctgctaaatacatgatttgatgtt----gttagt 20572054  T
Q  305 aatgtaatatatttgtatatgcattatgt 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20572053 aatgtaatatagttgtatatgcattatgt 20572025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 404
Target Start/End: Original strand, 20910910 - 20910969
Alignment:
Q  345 gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20910910 gatgtataagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 20910969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19511577 - 19511516
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 389  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  19511577 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatatcgttatatctt 19511516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15796594 - 15796494
Alignment:
Q  299 gctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  15796594 gctaataatgtgatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgctatatcatgagctgtt 15796495  T
Q  398 t 398  Q
    |    
T  15796494 t 15796494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10753387 - 10753334
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10753387 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacatgttg 10753334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30614069 - 30613937
Alignment:
Q  77 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   |  |||  ||||| || |  |||||| |||||    
T  30614069 atcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctttaaaattcaaagcttg-tgtactatgagtt 30613971  T
Q  177 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30613970 gaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 30613937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26749583 - 26749534
Alignment:
Q  165 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26749583 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 26749534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30612109 - 30611977
Alignment:
Q  77 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 176  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||| ||| ||| |   || |||  |||||||| |  |||||| |||||    
T  30612109 atcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttgtaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaaacttgt-gtactatgagtt 30612011  T
Q  177 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30612010 gaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 30611977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29346552 - 29346456
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||| ||  ||| |||||||||| |||| ||||    
T  29346552 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29346456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29349025 - 29348929
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||| ||  ||| |||||||||| |||| ||||    
T  29349025 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29348929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29351498 - 29351402
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||| ||  ||| |||||||||| |||| ||||    
T  29351498 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29351402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31479003 - 31478801
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||  |||||| | |||||||||| ||||  |||||| | ||||||  ||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||  ||||||    
T  31479003 ttagctttataatgactttggtttgacttaaaaagaatttttagattttgatttatgatgaaaatactacagt-aggtcttggtgaaattttacgaaaat 31478905  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||  |||||  || ||  |  ||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| || || | | |||||||||||||    
T  31478904 tcagcataaccatttttaagtgaactcaaaagctatggtttggttccaaaactcaaaacttg-agtactaggagtttaattatgatgtttaagagtattt 31478806  T
Q  201 aacct 205  Q
    |||||    
T  31478805 aacct 31478801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 15236863 - 15236914
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15236863 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 15236914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 19472803 - 19472854
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19472803 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 19472854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 20295870 - 20295819
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20295870 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 20295819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 40723670 - 40723721
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40723670 agttgttgttgattatcatttaatattgatatatcttgagatgtttacgtgt 40723721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 398
Target Start/End: Original strand, 22178172 - 22178266
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  22178172 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 22178266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Original strand, 15236924 - 15236969
Alignment:
Q  359 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15236924 tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 15236969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 276
Target Start/End: Original strand, 20765993 - 20766058
Alignment:
Q  211 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 276  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20765993 atgagttggtctttggggttggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 20766058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 264358 - 264414
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  264358 ttagctttacagtgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 264414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 10732530 - 10732626
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  10732530 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 10732626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20909584 - 20909528
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20909584 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 20909528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 23065086 - 23065030
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  23065086 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 23065030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 42244955 - 42245051
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| ||||    
T  42244955 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 42245051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7528476 - 7528427
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 69  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7528476 ggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactc 7528427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9776550 - 9776513
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9776550 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 9776513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 39245708 - 39245652
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  39245708 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaattattttcggtttatgagttatg 39245652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 15809
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  16206 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 16107  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  16106 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactataagttcaattaaggtgtttaatagtattt 16007  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    || |||||||||        
T  16006 aacctatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattggtgatgatctgtgaagctgttataa---catataatgttga---- 15914  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15913 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 15814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 206)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Original strand, 46580343 - 46580727
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  46580343 ttagttttccaatgactttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagttcttactgaaattttatgaaaat 46580442  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta-gggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    ||||||||             ||||  |  ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  46580443 tcagcata-------------taat--attactgatgggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatt 46580527  T
Q  200 taacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  46580528 taacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga--- 46580624  T
Q  300 ctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580625 -tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 46580723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16999065 - 16998665
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||    
T  16999065 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagagatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaat 16998966  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactag------gagttcaactaaggtatttaaga 194  Q
    |||| |||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |       |||||||| |||||| |||||||    
T  16998965 tcagtataaccttttctatgttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatcaccatgagttcaattaaggtgtttaaga 16998866  T
Q  195 gtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 294  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16998865 gtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaatataatattactgatgatctgtgaagcagttataatatgatttaatgtt 16998766  T
Q  295 gatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998765 gataa----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 16998670  T
Q  395 gttta 399  Q
    |||||    
T  16998669 gttta 16998665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13647875 - 13647492
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  13647875 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 13647776  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  13647775 tcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattattt 13647676  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata--atatgatttaatgttgata 298  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||      
T  13647675 aacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgcgaagctattataatatatgatttaatgttga-- 13647578  T
Q  299 gctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13647577 --tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 13647492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 94 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14273888 - 14273583
Alignment:
Q  94 tgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaag 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  14273888 tgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaag 14273789  T
Q  194 agtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 293  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14273788 agtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 14273689  T
Q  294 tgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaga 393  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14273688 tga----tagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaga 14273593  T
Q  394 tgtttacgtg 403  Q
    ||||||||||    
T  14273592 tgtttacgtg 14273583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11661738 - 11661345
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  11661738 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttattttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 11661639  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||| || |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||    
T  11661638 tcaacacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaatgtgtttaagagtattt 11661539  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  11661538 aacccatgttgtgagttga-ccctggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 11661444  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11661443 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 11661345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18872793 - 18872399
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  18872793 ttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 18872694  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  18872693 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 18872594  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  18872593 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 18872498  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18872497 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 18872399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16009010 - 16008610
Alignment:
Q  2 tagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaatt 101  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||    
T  16009010 tagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaatt 16008911  T
Q  102 cagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattta 201  Q
    ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  16008910 cagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattta 16008811  T
Q  202 acctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagct 301  Q
    ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||||||| |||| |||||    | |    
T  16008810 acccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatataatttgatgtt----gtt 16008715  T
Q  302 agtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacg 401  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16008714 agtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatg 16008615  T
Q  402 tgttg 406  Q
    |||||    
T  16008614 tgttg 16008610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 18456067 - 18456342
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  18456067 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 18456166  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18456167 tcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 18456266  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 276  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18456267 aacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttaaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 18456342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18607918 - 18607526
Alignment:
Q  3 agctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattc 102  Q
    |||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||  ||||| || |||||||||    
T  18607918 agctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttaaggaaatcttatgaaaattc 18607819  T
Q  103 agcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaa 202  Q
    |||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  18607818 agcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaa 18607719  T
Q  203 cctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagcta 302  Q
    || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||    
T  18607718 cccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gtta 18607623  T
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  18607622 gtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatatttttatatattgagatgttta 18607526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14566635 - 14566241
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  14566635 ttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 14566536  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||  || |||||| |||||||||||||    
T  14566535 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtattt 14566436  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  14566435 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 14566340  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14566339 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 14566241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48812471 - 48812241
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  48812471 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactgcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 48812372  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  48812371 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggtgtttaagagtattt 48812272  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  48812271 aacctatgttgtgagttggtccttggggtag 48812241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 708974 - 709204
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  708974 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 709073  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  709074 tcagcttaactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtattt 709173  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  709174 aacctatgttgtgagttggtccttggggtag 709204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 58837 - 59071
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  58837 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 58936  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  58937 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtattt 59036  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  59037 aacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 59071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 81 - 404
Target Start/End: Original strand, 13918266 - 13918578
Alignment:
Q  81 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 180  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  13918266 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaat 13918365  T
Q  181 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 280  Q
    |||||| |||||||||||       || |||||| ||  | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13918366 taaggtgtttaagagtata------atattatgatttagtgtttggg-taggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 13918458  T
Q  281 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 380  Q
    ||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |    
T  13918459 tatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatatcg 13918554  T
Q  381 ttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13918555 ttatatcttgagatgtttacgtgt 13918578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14422418 - 14422023
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||| || |||||||    
T  14422418 ttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaat 14422319  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  14422318 tcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagcattt 14422219  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  14422218 aacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 14422123  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14422122 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggatcatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaggtgttta 14422023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 404
Target Start/End: Original strand, 25926993 - 25927301
Alignment:
Q  82 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 181  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  25926993 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 25927092  T
Q  182 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 281  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | |  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25927093 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtc-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 25927185  T
Q  282 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 381  Q
    |||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  25927186 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagt---tgttgattatcatttgatattgt 25927278  T
Q  382 tatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25927279 tatatcttgagatgtttacgtgt 25927301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 8756815 - 8757056
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||    
T  8756815 ttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 8756914  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8756915 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 8757014  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  8757015 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 8757056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16462669 - 16462439
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  16462669 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 16462570  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  |||| |||||||    
T  16462569 tcagcatagctgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgattaacagtattt 16462470  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  16462469 aacctatgttgtgagttggtccttggggtag 16462439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 32160621 - 32160851
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  32160621 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 32160720  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32160721 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 32160820  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  32160821 aacctatgttgtgagttggtccttagggtag 32160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 14415903 - 14416112
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  14415903 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtgtttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 14416002  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14416003 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 14416102  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  14416103 aacctatgtt 14416112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 30820694 - 30820910
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30820694 ggtttgacttgaaaataatttttggtttttaagatatgataaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 30820793  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    | |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  30820794 gataatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtcga 30820893  T
Q  220 tctttggggtaggaatg 236  Q
     | ||||||||||||||    
T  30820894 cccttggggtaggaatg 30820910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 46386506 - 46386715
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  46386506 ttagctttccagtggctttggtttgaagtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 46386605  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  46386606 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactatggtgtttaagagtattt 46386705  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  46386706 aacctatgtt 46386715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14191507 - 14191735
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  14191507 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaat 14191604  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14191605 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtattt 14191704  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  14191705 aacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14191735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 47975349 - 47975560
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47975349 ggtttgacttgaaaatgatttttgatgtttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaa 47975448  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  47975449 gttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttcg 47975548  T
Q  220 tctttggggtag 231  Q
    || |||||||||    
T  47975549 tccttggggtag 47975560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 13745214 - 13745404
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13745214 ggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 13745313  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13745314 gtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttcagagtatttaacctatgtt 13745404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 16550423 - 16550679
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  16550423 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 16550522  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||    
T  16550523 tgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtattt 16550622  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 258  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16550623 aacctatgttgtgagttgttccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16550679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16615239 - 16614983
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  16615239 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 16615140  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||    
T  16615139 tgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtattt 16615040  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 258  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16615039 aacctatgttgtgagttgttccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16614983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44374579 - 44374370
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  44374579 ttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 44374480  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  44374479 tcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtattt 44374380  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  44374379 aacctatgtt 44374370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44383444 - 44383235
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  44383444 ttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 44383345  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  44383344 tcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtattt 44383245  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  44383244 aacctatgtt 44383235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 223 - 404
Target Start/End: Original strand, 1858707 - 1858884
Alignment:
Q  223 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 322  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  1858707 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtat 1858802  T
Q  323 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1858803 atgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 1858884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 206 - 386
Target Start/End: Original strand, 9177524 - 9177700
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    |||||    
T  9177524 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttttaacatgatttaatgttga----tagta 9177619  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  9177620 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattattatat 9177700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14188713 - 14188941
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  14188713 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtctttgtgaaatattatgaaaat 14188810  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14188811 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtattt 14188910  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  14188911 aacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14188941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19282703 - 19282516
Alignment:
Q  23 ttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19282703 ttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtt 19282604  T
Q  123 aatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19282603 aatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19282516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13699308 - 13699549
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||  ||||||    
T  13699308 ttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttaggaaaat 13699407  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  13699408 tcagtataaccatttctaagttaatctgaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtattt 13699507  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  13699508 aacccatgttgtgagttgatcttt-ggataggaatggaagttg 13699549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 17070712 - 17070934
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  17070712 ttagctttccaatgactttgttttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttattgaaatcttatgaaaat 17070811  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17070812 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaattctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 17070911  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||||||||| | ||||||||||    
T  17070912 aacctatgttgtaagttgatctt 17070934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47094713 - 47094491
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  47094713 ttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 47094614  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  47094613 tcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagtagtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtattt 47094514  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  47094513 aacctatgttgtgagttgatctt 47094491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12371908 - 12371699
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  12371908 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgcgatatggtaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 12371809  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||    
T  12371808 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtattt 12371709  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  12371708 aacctatgtt 12371699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 12465679 - 12465888
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  12465679 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 12465778  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || | | |||||||||||||    
T  12465779 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgacttcaattaggatgtttaagagtattt 12465878  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  12465879 aacttatgtt 12465888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 36685668 - 36685904
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  36685668 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 36685767  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggt-atttaagagtatt 199  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  36685768 tcagcgtaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgttttaagagtatt 36685867  T
Q  200 taacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    ||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  36685868 taacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 36685904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15214132 - 15213917
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  15214132 ttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 15214033  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |    
T  15214032 tcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgt 15213933  T
Q  201 aacctatgttatgagt 216  Q
    ||  |||||| |||||    
T  15213932 aatttatgttgtgagt 15213917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 32434014 - 32434221
Alignment:
Q  7 ttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagca 106  Q
    |||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  32434014 ttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 32434113  T
Q  107 taactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 206  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  32434114 taaccgtttctaaattaatccaaaacttaatgaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaatcta 32434213  T
Q  207 tgttatga 214  Q
    ||||||||    
T  32434214 tgttatga 32434221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11067101 - 11066892
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || |||||||    
T  11067101 ttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 11067002  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  11067001 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaactagggtgtttaagagtattt 11066902  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  11066901 aacttatgtt 11066892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15167608 - 15167403
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  15167608 ttagctttctaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 15167509  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15167508 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 15167409  T
Q  201 aaccta 206  Q
    ||||||    
T  15167408 aaccta 15167403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13408405 - 13408170
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  13408405 ttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaattctccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 13408306  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  13408305 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttttttaagagtattt 13408206  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 237  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  13408205 aacccatgttgtgagttgat-tttgggataggaatgg 13408170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4325689 - 4325448
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| || |||||||    
T  4325689 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttaatgaaatcttatgaaaat 4325590  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4325589 tcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgcgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 4325490  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    || | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  4325489 aatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 4325448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 13147910 - 13148100
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13147910 ggtttgacgtgaaaatcattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 13148009  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13148010 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactacaagtattatgagatcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13148100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 206 - 397
Target Start/End: Original strand, 17017326 - 17017513
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  17017326 atgttatgagttgatccttggggtagggatggaggttgaatatagtattactaatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 17017421  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  17017422 atgtaatatatttgtatatgcattatatgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatgttattatatctggatatgtt 17017513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Original strand, 40555166 - 40555384
Alignment:
Q  5 ctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcag 104  Q
    |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||    
T  40555166 ctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttgatttttgagatatgatgtaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 40555265  T
Q  105 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 204  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  40555266 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgtatttaacc 40555365  T
Q  205 tatgttatgagttgatctt 223  Q
     || || ||||||||||||    
T  40555366 catattgtgagttgatctt 40555384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 8851597 - 8851786
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8851597 ggtttgacgtgaaaatgagttttggttctggagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 8851696  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8851697 gttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagattatttaacctatgt 8851786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 14928751 - 14928960
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  14928751 ttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaat 14928850  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| |    
T  14928851 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaaaagtatct 14928950  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  14928951 aacctatgtt 14928960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 15352217 - 15352426
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  15352217 ttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaat 15352316  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| |    
T  15352317 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaatgtgtttaaaagtatct 15352416  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  15352417 aacctatgtt 15352426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33001547 - 33001338
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  33001547 ttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaat 33001448  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  33001447 tcagtatatccatttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagaattt 33001348  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  33001347 aacctatgtt 33001338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 17505423 - 17505655
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  17505423 ttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaat 17505522  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  17505523 tcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtattt 17505622  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtagga 233  Q
    |||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  17505623 aacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17547791 - 17547559
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  17547791 ttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaat 17547692  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  17547691 tcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtattt 17547592  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtagga 233  Q
    |||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  17547591 aacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17547559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 832442 - 832676
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  832442 ttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 832541  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  832542 tcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagtattt 832641  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  832642 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 832676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 1197622 - 1197856
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1197622 ttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 1197721  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  1197722 tcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagtattt 1197821  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1197822 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1197856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 12755125 - 12755359
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||    
T  12755125 ttagatttccaatggctttggtttgactagaaaatgagttttagattttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaatcttatgaaaat 12755224  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12755225 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 12755324  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
     ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12755325 gacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 12755359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 38828694 - 38828304
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||  || |||||||    
T  38828694 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 38828595  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  38828594 tcagcacaactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 38828495  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| | ||| |||||||||| | ||| || || || | ||| | ||||||| |  ||||| || ||||  ||| ||||| |||| || |||||    |     
T  38828494 aacccacgttgtgagttgatcctcgggttatgagtgaatgtttattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataagatga-ttgatgtt----gt 38828400  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    || | | ||  || ||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38828399 taatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattattatatcttgagatgt 38828304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 148051 - 147704
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||| ||||| | | |||||||||  ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  148051 ttagctttacaatggctttggtttgactctaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 147952  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  147951 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 147852  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  147851 aacccatgttgtgaattgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 147756  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 352  Q
     |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  147755 gagtaatgagatatatttgtataagcattatgtggattatatgagatgttta 147704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29004455 - 29004214
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||| || |||||||    
T  29004455 ttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaagggaggtcctagtgaaatcttatgaaaat 29004356  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| |   || |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  29004355 ttagcataaccgtttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 29004256  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 242  Q
    |||| ||||| |||||||||| || || |||||||| |||||    
T  29004255 aacccatgttgtgagttgatcctttggttaggaatgaaggtt 29004214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 48743936 - 48743727
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || | |||||    
T  48743936 ttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagaacttagtgaaatcttataaaaat 48743837  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  48743836 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagatgtactatgagttcaattaaggtgtttaggagtattt 48743737  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  48743736 aacatatgtt 48743727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Original strand, 15119761 - 15119921
Alignment:
Q  48 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15119761 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaatattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 15119860  T
Q  148 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15119861 aaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 15119921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32301815 - 32301613
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| |||||||    
T  32301815 ttagttttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaattttatgaaaat 32301716  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  32301715 acagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtattt 32301616  T
Q  201 aac 203  Q
    |||    
T  32301615 aac 32301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 10896413 - 10896618
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||| || |||||||    
T  10896413 ttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaat 10896512  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  10896513 tcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaagctgtttaagagtattt 10896612  T
Q  201 aaccta 206  Q
    ||||||    
T  10896613 aaccta 10896618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Original strand, 17060282 - 17060472
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  17060282 atgttatgagttgatccttggggtagaaacggaggttgaatataatattactgatgttctatgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 17060377  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17060378 atgtcaaatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgaagttgattatcgtttgatattgttatattttgagatgttta 17060472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34957804 - 34957579
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||| |||| | | |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  34957804 ttagctttcaaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagatatgattaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 34957705  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||   ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34957704 tcagcataaccatttctaaggtaatccaaaacttatgggataattccaaggatcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 34957605  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttgg 226  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  34957604 aacccatgttatgagttgatccttgg 34957579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 37727346 - 37727580
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  37727346 ttagctttccagtggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaat 37727445  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  37727446 ttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccatcaaaactagaagtactatgagttcaatcaaggtgtttaagagttttt 37727545  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  37727546 aacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 37727580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 12127602 - 12127792
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12127602 gtttgacgtgaaaatgattttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcagggaggtattagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 12127701  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12127702 gttaatccaaaagttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 12127792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14258985 - 14258783
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | | |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  14258985 ttagctttccagtggctttgctttgacatgaaaatgaactttggttcttgagatatgatgaaaggactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 14258886  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  14258885 tcagcataaccgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtattt 14258786  T
Q  201 aac 203  Q
    |||    
T  14258785 aac 14258783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16580273 - 16580091
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16580273 gtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 16580174  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  16580173 ttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 16580091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Original strand, 16585390 - 16585572
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16585390 gtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 16585489  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  16585490 ttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 16585572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Original strand, 12323368 - 12323530
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12323368 ggtttgacgtgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatacttgaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 12323467  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 182  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12323468 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaacta 12323530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 279 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 32301476 - 32301353
Alignment:
Q  279 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 378  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301476 aatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatctttaagttgatgttgattatcatttgatgt 32301381  T
Q  379 tgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301380 tgttatatcttgagatgtttacgtgttg 32301353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14153391 - 14153603
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||| ||||| | | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14153391 ttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaataatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 14153490  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| |  |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14153491 tcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 14153589  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||||||||||||||    
T  14153590 aacctatgttatga 14153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20585966 - 20585780
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20585966 ggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgaggtatgatgaaaatactccaaggaggt----gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 20585871  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20585870 gttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 20585780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32771961 - 32771760
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||   || |||||||||||| || |||||||    
T  32771961 ttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaataatccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 32771862  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32771861 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 32771762  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  32771761 aa 32771760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 210
Target Start/End: Original strand, 13745672 - 13745828
Alignment:
Q  54 tatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacct 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  13745672 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatagccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaataattccaaacct 13745771  T
Q  154 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13745772 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13745828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 57 - 203
Target Start/End: Original strand, 16460407 - 16460553
Alignment:
Q  57 gatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaa 156  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16460407 gatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaa 16460506  T
Q  157 aactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  ||||| | ||||||||    
T  16460507 aactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatattatttaac 16460553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20619919 - 20619714
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||| |||||||    
T  20619919 ttagctttccagtagcttcggtgtgacgtgaaaaagatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaataaaattttatgaaaat 20619820  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||  |||||||||||||    
T  20619819 tcagcataaccgtttctaagttaatccataacttatggaataattccaaaactcaaaattagaagtattaggattttaattaaggggtttaagagtattt 20619720  T
Q  201 aaccta 206  Q
    ||||||    
T  20619719 aaccta 20619714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 159
Target Start/End: Original strand, 29052593 - 29052732
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||    
T  29052593 ggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaa 29052692  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 159  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  29052693 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 29052732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Original strand, 16460717 - 16460817
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460717 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 16460816  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  16460817 g 16460817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 24270401 - 24270609
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24270401 ttagctttcaaatggaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaat 24270500  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||| ||||| || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24270501 tccgcataactatttttaagtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattgtgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 24270599  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  24270600 aacctatgtt 24270609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 39292156 - 39292364
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  39292156 ttagctttccattgactttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaat 39292255  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||| ||| | ||  ||||||||| ||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39292256 tccgcataactatttttaaatcaactcaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 39292354  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  39292355 aacctatgtt 39292364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 301 - 409
Target Start/End: Original strand, 14157054 - 14157162
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14157054 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttat 14157153  T
Q  401 gtgttgtct 409  Q
    |||||||||    
T  14157154 gtgttgtct 14157162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14258619 - 14258519
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14258619 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 14258520  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  14258519 g 14258519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16579927 - 16579827
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579927 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 16579828  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  16579827 g 16579827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Original strand, 16585736 - 16585836
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16585736 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 16585835  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  16585836 g 16585836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 18875284 - 18875474
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  18875284 ggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctag 18875383  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || ||||||||||||  ||| |   || ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18875384 gtcaatccaaaacttgtggattgtctccaaacctcaaaactagaagtaacaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 18875474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 301 - 406
Target Start/End: Original strand, 10501373 - 10501478
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10501373 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttat 10501472  T
Q  401 gtgttg 406  Q
    ||||||    
T  10501473 gtgttg 10501478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 208 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42462209 - 42462015
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 307  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| ||  |||  ||| |||||||| |||| |||||    | |||||||    
T  42462209 gttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttgatgttcaatgagtctgatataatataatttgatgtt----gttagtaat 42462114  T
Q  308 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42462113 gtgatatagttgtatattcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttg 42462015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 226 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 48991422 - 48991266
Alignment:
Q  226 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatg 325  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | ||||| |||||||||    
T  48991422 gggtaggaatagaggttgaatacaatattgatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaat-tgatata-ttgtatatg 48991329  T
Q  326 cattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 388  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  48991328 cattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatct 48991266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 206 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16092019 - 16091844
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    | || ||    
T  16092019 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgaattattgtt----gttaata 16091924  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||    
T  16091923 atgttacatatttgtatacgcattatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattatcatttgatattattatat 16091844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16996477 - 16996295
Alignment:
Q  212 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 311  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    |||||| |    
T  16996477 tgagttgacccttaggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taatgtga 16996382  T
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16996381 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaa-atgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgttta 16996295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 13864814 - 13865040
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||   |||||    
T  13864814 ttagctttccaatggatttgggttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgaggaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaaat 13864913  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| | |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||         ||||||||||||    
T  13864914 tcagtacaaccttttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaagtagaagtactatgagttcaa---------ttaagagtattt 13865004  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 237  Q
    || | |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13865005 aatccatgttatgagttgatc-ttgggataggaatgg 13865040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15720382 - 15720250
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| || |||||||    
T  15720382 ttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaggtatgataaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaat 15720283  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15720282 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 15720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 303 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20487710 - 20487614
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20487710 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatgtcttgagatattta 20487614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 43277181 - 43277372
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatttt-ttgaaaattcagcataactgtttcta 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||    
T  43277181 ggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatcaaaaattccgcataactatttcta 43277280  T
Q  119 agttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
     || ||  ||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  43277281 ggtcaactcaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatatgtt 43277372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 4691332 - 4691523
Alignment:
Q  18 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  4691332 tcggtttgacttgaaaataatttttggtttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttct 4691431  T
Q  118 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||  | |  |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4691432 aagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaaccaatgtt 4691523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13894651 - 13894519
Alignment:
Q  78 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 177  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13894651 tcttagtgaaatcttattaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 13894552  T
Q  178 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13894551 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13894519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Original strand, 8514184 - 8514377
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  8514184 ggtttgacttgaaaaagaattttgggttttgaattatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctag 8514283  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8514284 gtcaacccaaaacttatggattgtcttaaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttatga 8514377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 20252780 - 20252969
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||    
T  20252780 ggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactatttctaa 20252879  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| ||    |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20252880 gtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 20252969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38519543 - 38519445
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38519543 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattgtataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 38519445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 48213383 - 48213572
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||    
T  48213383 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaa 48213482  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| | |   |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48213483 gtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-atgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacctatgtt 48213572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 3192731 - 3192920
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||    
T  3192731 ggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattgtgcataactatttctaa 3192830  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 209  Q
    || || |||||||||| |   |  ||| |||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  3192831 gtcaacccaaaacttatgatttgtttctaaacttcaaaactagaagtattatgagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 3192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15978475 - 15978682
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||  || ||| ||| |||||||    
T  15978475 ttagctttccactgactttggcttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtctcggtaaaactttatgaaaat 15978574  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |  |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||   |||||||| | ||    
T  15978575 ttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggggtt-aattaagaggtttaagagcactt 15978673  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  15978674 aacctatgt 15978682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 206 - 362
Target Start/End: Original strand, 9725518 - 9725670
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||    ||    
T  9725518 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttag----ta 9725613  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt 362  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9725614 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgtt 9725670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 206 - 395
Target Start/End: Original strand, 11768777 - 11768964
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||  ||||||||||||| | |||| |||    ||    
T  11768777 atgttatgagtcgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgtttatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttag----ta 11768872  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg--attatcatttgatgttgttatatcttgagatg 395  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11768873 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaaatattatttgatattgttatatcttgagatg 11768964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 398
Target Start/End: Original strand, 130680 - 130864
Alignment:
Q  212 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgt-tataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || |  ||||| || ||||   ||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||     
T  130680 tgagttgatccttggggtaggaatggtggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtttgtatataatatgatttgatgtt-at---tagtaatgtg 130775  T
Q  311 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  130776 atatagttgtatatgcattatgtggattatataaggtgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 130864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 14161293 - 14161482
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  14161293 ggtttgacttgaaaatcatttttggtttttgaggtttgataaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctag 14161392  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14161393 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 14161482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25942051 - 25941862
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |   ||||||     
T  25942051 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcatgataatttctag 25941952  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || ||||| |||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25941951 gtcaacccaaatcttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25941862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Original strand, 2529951 - 2530052
Alignment:
Q  245 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataa 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2529951 atataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaa 2530046  T
Q  345 gatgtt 350  Q
    ||||||    
T  2530047 gatgtt 2530052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 206 - 406
Target Start/End: Original strand, 9033204 - 9033401
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| || |  | ||| || ||||  ||  |||||| |||||| |||||| ||     ||    
T  9033204 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttggttatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatgtgatttgatgttgttaa----ta 9033299  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  9033300 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgcattattatttgatattgttatatcctgagatatttatgtgt 9033399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 279 - 388
Target Start/End: Original strand, 14929152 - 14929257
Alignment:
Q  279 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 378  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14929152 aatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 14929247  T
Q  379 tgttatatct 388  Q
    |||| |||||    
T  14929248 tgttgtatct 14929257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 279 - 388
Target Start/End: Original strand, 15352618 - 15352723
Alignment:
Q  279 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 378  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15352618 aatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 15352713  T
Q  379 tgttatatct 388  Q
    |||| |||||    
T  15352714 tgttgtatct 15352723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3287604 - 3287489
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  3287604 ggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctag 3287505  T
Q  120 gttaatccaaaactta 135  Q
    || || ||||||||||    
T  3287504 gtcaacccaaaactta 3287489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 224 - 399
Target Start/End: Original strand, 11525440 - 11525612
Alignment:
Q  224 tggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 323  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||| |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||| | ||||| ||   ||||||| | ||||||| |||||    
T  11525440 tggggtaggaatgaaggtggattataataatgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatatgatgtt-at---tagtaatttgatatattggtata 11525535  T
Q  324 tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11525536 tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcctgagatgttta 11525612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20619552 - 20619446
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20619552 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 20619453  T
Q  400 cgtgttg 406  Q
     ||||||    
T  20619452 tgtgttg 20619446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 21538627 - 21538816
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||    
T  21538627 ggtttgacttgaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataatcatttctaa 21538726  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || ||||||||||  || |  ||| |||| |||||||| |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21538727 gtcaacccaaaacttatagattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21538816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 18080158 - 18080271
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  18080158 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgacttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatttaatgaaaattccgcataactatttctatgt 18080257  T
Q  122 taatccaaaactta 135  Q
     || ||||||||||    
T  18080258 caacccaaaactta 18080271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 206 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14045010 - 14044922
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14045010 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatgttaatgatgatctgtgaagctgttatactatgatttaatgtt 14044922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 206 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14355040 - 14354952
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14355040 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatgttaatgatgatctgtgaagctgttatactatgatttaatgtt 14354952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 206 - 387
Target Start/End: Original strand, 15008357 - 15008533
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||| | || | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | || ||    
T  15008357 atgttatgagttgaaccttcgagtatgaatggaggttgtatatgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgtt----gttaata 15008452  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  15008453 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 15008533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 327 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15720140 - 15720064
Alignment:
Q  327 attatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15720140 attaagtgaattagataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 15720064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28720005 - 28719885
Alignment:
Q  89 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 188  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||   |    
T  28720005 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcaaaactatgagtactaggagtttaattaagaggt 28719906  T
Q  189 ttaagagtatttaacctatgt 209  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  28719905 ttaaaagtatttaacctatgt 28719885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 9743519 - 9743706
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  9743519 ggtttgacttgaaaatgattttgtctttttaagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctag 9743618  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| | ||| || |  |||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  9743619 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggcgtttaagcgtatttaacctatg 9743706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20487972 - 20487874
Alignment:
Q  105 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  20487972 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactaggagtactaggtgtttaattaaggggtttaacagtatttaac 20487874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8940383 - 8940318
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940383 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 8940318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14036460 - 14036387
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata 279  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14036460 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctgttata 14036387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14346490 - 14346417
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata 279  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14346490 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctgttata 14346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 15576250 - 15576458
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||  || | ||||||||||||| |||||||    
T  15576250 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggtttttgagttatcataaaaatgctccaagaaggttttagtgaaattttatgaaaat 15576349  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |   ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  15576350 tctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tctactatgagttcaattaaggtgtttaagggtattt 15576448  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  15576449 aacttatgtt 15576458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 1856819 - 1856915
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  1856819 ttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1856915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 398
Target Start/End: Original strand, 1867874 - 1868040
Alignment:
Q  226 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatg 325  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    | || |||||| |||||||||||||||    
T  1867874 gggtaggaatggaggttatatatgatattaatgatgatctgtgaagct-ttttaagatgatttgatgtt----gttaataatgtgatatatttgtatatg 1867968  T
Q  326 cattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||| || || |||| |||  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  1867969 cattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatcatgagctgttt 1868040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Original strand, 837317 - 837401
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  837317 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 837401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Original strand, 1202497 - 1202581
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1202497 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 1202581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 97
Target Start/End: Original strand, 16108297 - 16108374
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  16108297 ggtttggcttgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 16108374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Original strand, 16109474 - 16109558
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16109474 tatatttgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgctatatcttgagatgt 16109558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 13917992 - 13918088
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  13917992 ttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgattattggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 13918088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 23664562 - 23664638
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  23664562 gtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23664638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 25926739 - 25926815
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  25926739 gtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 25926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 338 - 398
Target Start/End: Original strand, 38898181 - 38898241
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38898181 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctagagatgttt 38898241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13897879 - 13897808
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 72  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13897879 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattattagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 13897808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Original strand, 833321 - 833405
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  833321 tatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgt 833405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Original strand, 1198501 - 1198585
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1198501 tatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgt 1198585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Original strand, 10896687 - 10896748
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 389  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10896687 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 10896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11309942 - 11309853
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 90  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||    
T  11309942 ttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaataccccaagggaatcttagcgaaatt 11309853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 15167346 - 15167285
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 389  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15167346 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 15167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 11303820 - 11303724
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | |   ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  11303820 ttagctttccaatggctttaatttgactcgaaattgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 11303724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29801002 - 29800906
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||    
T  29801002 ttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29797162 - 29797087
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||    
T  29797162 tttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29797087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 44190668 - 44190729
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 62  Q
    |||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44190668 ttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 44190729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 319 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18203965 - 18203887
Alignment:
Q  319 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18203965 gtatatgcattgtgtggattatatatgatgattaagt-gttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 18203887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 45170089 - 45170140
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45170089 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 45170140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Original strand, 8564038 - 8564218
Alignment:
Q  29 tgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcca 128  Q
    |||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||   | |||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  8564038 tgaagatgatttttagattttaagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttggtaaaactttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaaccca 8564137  T
Q  129 aaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || | ||  |  ||| ||||  ||||| | |  |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8564138 aagctaatggtttgtttccaaactccaaaaattg-tgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8564218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 386
Target Start/End: Original strand, 15081900 - 15081948
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15081900 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 15081948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15720256 - 15720200
Alignment:
Q  154 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15720256 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 15720200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3136869 - 3136715
Alignment:
Q  59 tgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaa 158  Q
    ||||||||||||||  || |||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| ||||||    
T  3136869 tgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttaagaaaattaagcataactgtttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacatcaaaa 3136770  T
Q  159 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || | ||||||| ||||| || || | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3136769 cttg-agtactaagagtttaattaggatgtttaagagtgtttaacctatgatatga 3136715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18279426 - 18279375
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18279426 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 18279375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18283389 - 18283338
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18283389 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 18283338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 1857092 - 1857154
Alignment:
Q  82 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 144  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1857092 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 1857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8468833 - 8468783
Alignment:
Q  356 tgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8468833 tgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttg 8468783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 46473672 - 46473562
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||| |||||||| ||||   ||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | || ||||    
T  46473672 ggtttgactagaaaatgaattttacatttggaggtatgatgaaaatactccaagcgggtcttagtaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaa 46473573  T
Q  120 gttaatccaaa 130  Q
    ||||| |||||    
T  46473572 gttaaaccaaa 46473562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Original strand, 14270032 - 14270081
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14270032 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttg 14270081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 387
Target Start/End: Original strand, 2280021 - 2280155
Alignment:
Q  250 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  2280021 atatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtt---ta-taatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaata 2280116  T
Q  349 tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    ||| || || ||||||||  |||||||| || |||||||    
T  2280117 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 2280155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 15376303 - 15376359
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15376303 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 15376359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18431280 - 18431188
Alignment:
Q  5 ctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||| ||  || |||||||||| |||| ||||    
T  18431280 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttaggtgttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 18431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 20384713 - 20384769
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20384713 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 20384769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24702801 - 24702705
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  24702801 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24702705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24705248 - 24705152
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  24705248 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24705152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 32126063 - 32125967
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  32126063 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 32125967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 41523490 - 41523394
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  41523490 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 41525952 - 41525856
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  41525952 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41525856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33130 - 33079
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33130 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 33079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 70848 - 70899
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  70848 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 70899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 74957 - 75008
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  74957 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 75008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 12704742 - 12704793
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12704742 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12704793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12714887 - 12714836
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12714887 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12714836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12718691 - 12718640
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12718691 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12718640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12723602 - 12723551
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12723602 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12723551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 16907284 - 16907335
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16907284 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 16907335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26292418 - 26292367
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26292418 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 26292367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 39722289 - 39722238
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39722289 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 39722238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 97
Target Start/End: Original strand, 14948742 - 14948808
Alignment:
Q  31 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  14948742 aaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 48273636 - 48273550
Alignment:
Q  211 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  | ||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  48273636 atgagttggtctttggggtaggaatggtagctgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 48273550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 387
Target Start/End: Original strand, 12255657 - 12255827
Alignment:
Q  213 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 312  Q
    |||||||  |||||||||| |||| || ||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||| |   || |||||| ||    
T  12255657 gagttgaattttggggtagtaatgaagattgtataatatattaatgatgatctatgaagttgttataagatga-ttgatgttgtt---ta-taatgtgat 12255751  T
Q  313 atatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    ||| ||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| || || ||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  12255752 ataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatc 12255827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13892742 - 13892670
Alignment:
Q  323 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  13892742 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgagatgt 13892670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 387
Target Start/End: Original strand, 20220142 - 20220222
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |   ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  20220142 taatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttga---gatgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 210
Target Start/End: Original strand, 21675491 - 21675536
Alignment:
Q  165 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21675491 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21675536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16114264 - 16114220
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16114264 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 16114220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16117417 - 16117373
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16117417 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 16117373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 27217433 - 27217377
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27217433 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 27217377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 456894 - 456843
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 52  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  456894 ttagctttccaatggcgtcggttggacttgaaaatgaattttggtttatgag 456843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 11392889 - 11392940
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 52  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11392889 ttagctttccagtgtcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 11392940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16066061 - 16065970
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataact 111  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||||  || |||| ||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  16066061 ggtttgactttaaaataatttttagattttgtgttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggtgcaattttacaaaaattcagcataact 16065970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 16233093 - 16233042
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 52  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16233093 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 16233042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 37539041 - 37538970
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 72  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  37539041 ttagctttccaatgtctttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttattatgaaaacactccaa 37538970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Original strand, 1858644 - 1858689
Alignment:
Q  153 tcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtat 198  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  1858644 tcaaaactagaagttctacgagttcaattaaggtgtttaagagtat 1858689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11303439 - 11303402
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11303439 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 11303402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15113046 - 15113009
Alignment:
Q  369 catttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15113046 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttg 15113009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Original strand, 16108659 - 16108696
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16108659 gatgttgattaccgtttgatgttgttatatcttgagat 16108696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Original strand, 23664923 - 23664960
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23664923 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 23664960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29796800 - 29796763
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29796800 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 29796763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29800619 - 29800582
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29800619 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 29800582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 34957488 - 34957416
Alignment:
Q  323 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  34957488 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtagg-gttgactatcatttgatattgtcatattttgagatgt 34957416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16410631 - 16410575
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16410631 ttagctttacagtggcgtcggcttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 16410575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Original strand, 26355591 - 26355627
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26355591 gtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26355627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Original strand, 26358043 - 26358079
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26358043 gtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26358079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 649 - 269
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  649 ttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttttttagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 550  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  549 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggt-gttaagagtattt 451  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  450 aacccatgttgtgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagcttttataatatgatttaatgttga---- 355  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  354 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagctgatgttgattatgatttgatgttgttatat 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 102)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 399
Target Start/End: Original strand, 13881054 - 13881429
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||    
T  13881054 ggtttgacttggaaatgatttttagtttttgtgatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaa 13881153  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13881154 gttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactaaaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 13881253  T
Q  220 tctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttg 319  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  13881254 tccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttg 13881349  T
Q  320 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13881350 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 13881429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Original strand, 22130484 - 22130858
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  22130484 ttagctttccaatggaattggtttgatttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 22130583  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||   ||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22130584 tcagcataatcttttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 22130683  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||        
T  22130684 aacccatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaagttgaatataatattactgatgatctgtgaagctactataatatgatttaatgttga---- 22130779  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22130780 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-tgattatgatttgatgttg 22130858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 45574471 - 45574841
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||               
T  45574471 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaat----------- 45574559  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  45574560 tcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttaagcgtattt 45574659  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  45574660 aacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga---- 45574755  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45574756 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgttcttatat 45574841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28312981 - 28312577
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  28312981 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 28312882  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28312881 tcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 28312782  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||          
T  28312781 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagccagatataatatgatttgatgtt----tt 28312686  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  28312685 tagtaatgagatatatttgtatatacattatgtggattttataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttat 28312586  T
Q  401 gtgttgtct 409  Q
    ||| |||||    
T  28312585 gtgctgtct 28312577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Original strand, 27653081 - 27653270
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  27653081 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgagaagcagttataatatgatttaatgttgatag----ta 27653176  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653177 atgtattatatttgtatatgcattatgagaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 27653270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 20437646 - 20438041
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||| || |||||||    
T  20437646 ttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaat 20437745  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || ||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  20437746 tcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggcttaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 20437845  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| ||| |    |     
T  20437846 aacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgactatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgct----gt 20437941  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20437942 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaggtgttta 20438041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 44822541 - 44822763
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  44822541 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 44822640  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  44822641 tcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttacgggataattccaaacctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggggtttaagagtattt 44822740  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  44822741 aacctatgttgtgagttgatctt 44822763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 21239714 - 21239923
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  21239714 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 21239813  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | |||    
T  21239814 tcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaattttt 21239913  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  21239914 aacctatgtt 21239923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 21180744 - 21180985
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  21180744 ttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatt 21180843  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21180844 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaattcttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 21180943  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  21180944 aacccatgttgtgagttgat-tttgggataggaatggaagttg 21180985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24815271 - 24815512
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24815271 ttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 24815370  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24815371 tcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattctaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 24815470  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24815471 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24815512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 50001107 - 50000883
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  50001107 ttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 50001008  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatcc-aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50001007 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaaacttatgagataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 50000908  T
Q  200 taacctatgttatgagttgatcttt 224  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||    
T  50000907 taacctatgttgtgagttggtcttt 50000883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 14238031 - 14238240
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14238031 ttagcttttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 14238130  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  14238131 tcagcataactgtttctgagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatct 14238230  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  14238231 aacctatgtt 14238240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20588312 - 20588103
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20588312 ttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaat 20588213  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20588212 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtattt 20588113  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  20588112 aacctatgtt 20588103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20592850 - 20592641
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20592850 ttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaat 20592751  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20592750 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtattt 20592651  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  20592650 aacctatgtt 20592641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Original strand, 7052478 - 7052684
Alignment:
Q  5 ctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcag 104  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| |    
T  7052478 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtattagtgaaattttatgaaaattctg 7052577  T
Q  105 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  7052578 cataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaac 7052677  T
Q  204 ctatgtt 210  Q
    |||||||    
T  7052678 ctatgtt 7052684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 46198144 - 46198374
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  46198144 ttagctttccggtgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttaatgaaatcttatgaaaat 46198243  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  46198244 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 46198343  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    ||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  46198344 aacctatattgtgagttggtccttggggtag 46198374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 51082830 - 51082640
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  51082830 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttaagaaaattcagcataaccgtttctaa 51082731  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  51082730 gttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 51082640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19676316 - 19676143
Alignment:
Q  29 tgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcca 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19676316 tgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcca 19676217  T
Q  129 aaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaa 202  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19676216 aaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaa 19676143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 41227123 - 41227332
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  41227123 ttagctttccagtggctttggtttgacgcgaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 41227222  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||    
T  41227223 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtattt 41227322  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  41227323 aacctatgtt 41227332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 8276411 - 8276652
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||    
T  8276411 ttagctttccaatggctttggtttggcttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaat 8276510  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| |||||  |||||||||||||    
T  8276511 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagtactataggttcaattaaggcgtttaagagtattt 8276610  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  8276611 aacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 8276652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20031309 - 20031543
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| || |||||||    
T  20031309 ttagctttccaatgtttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 20031408  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  20031409 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaggagtattt 20031508  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaat 235  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  20031509 aacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaat 20031543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42912683 - 42912482
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  42912683 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 42912584  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  42912583 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtattt 42912484  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  42912483 aa 42912482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 21046487 - 21046677
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21046487 ggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaataatccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 21046586  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21046587 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgggttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 21046677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 51323889 - 51323699
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  51323889 ggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaa 51323790  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || ||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51323789 gtcaattcaaaacttatggaataactccaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 51323699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 41225870 - 41226079
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | || |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  41225870 ttagctttccagtggctttggattgacgagaaaatgatttttagttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 41225969  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||    
T  41225970 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtattt 41226069  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  41226070 aacctatgtt 41226079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 2332629 - 2333019
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||  || |||||||    
T  2332629 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 2332728  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2332729 tcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 2332828  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||| |  || || ||||| | ||||||| |   |||| || ||||  ||| ||||| || | || |||||    |     
T  2332829 aacccatgttgtgagttgatcctcgggttttgagtgaaggtttattataatactgtcgatgttcagtgagtctgatataagat-aattgatgtt----gt 2332923  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    || | | ||  || ||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2332924 taatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 2333019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 7792271 - 7792512
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7792271 ttagatttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 7792370  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  7792371 tcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatgtgagttcaattaaggtgtttaagagcattt 7792470  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  7792471 aacccatgttgtgatttgatc-ttgggataggaatggaagttg 7792512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16401301 - 16401060
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  16401301 ttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgacttttagtgtttgagatatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 16401202  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  16401201 tcagcaaaatcgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtattt 16401102  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  16401101 aacccatgttttgagttgatc-ttgggacaggaatggaggttg 16401060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 20634053 - 20634263
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20634053 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 20634152  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaag-gtatttaagagtatt 199  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||    
T  20634153 tcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaacttggagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagagggtttaagagtatt 20634252  T
Q  200 taacctatgtt 210  Q
    |||||||||||    
T  20634253 taacctatgtt 20634263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22350221 - 22349980
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  22350221 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatcatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaat 22350122  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||     
T  22350121 tcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaagagtattc 22350022  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||  |||||  ||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  22350021 aactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 22349980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 29764072 - 29764287
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||    
T  29764072 ggtttaacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataa 29764171  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaa----aacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgag 215  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29764172 gttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgag 29764271  T
Q  216 ttgatctttggggtag 231  Q
    ||| || |||||||||    
T  29764272 ttggtccttggggtag 29764287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 38887506 - 38887716
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  38887506 ttagctttcgaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttgatttttgaggtatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaat 38887605  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatt 199  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||    
T  38887606 tcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattacaaaactcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatt 38887705  T
Q  200 taacctatgtt 210  Q
    |||||||||||    
T  38887706 taacctatgtt 38887716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 45496579 - 45496369
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||     
T  45496579 ttagctttctaatgactttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaac 45496480  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatt 199  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||| || |||||||||||||    
T  45496479 tcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaataatttcaaacctccaaactagaagtactctgagtttaattaaggggatttaagagtatt 45496380  T
Q  200 taacctatgtt 210  Q
    |||||||||||    
T  45496379 taacctatgtt 45496369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 4596264 - 4596473
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  4596264 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 4596363  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  4596364 tcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtaatataggttcaactagggtgcttaagagtattt 4596463  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  4596464 aacctatgtt 4596473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12710521 - 12710312
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  12710521 ttagctttccagtggcgttggtttgacttacaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaaaat 12710422  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12710421 tcagcataaccgtttctaagtcaatccgaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 12710322  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  12710321 aacctatgtt 12710312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 16058733 - 16058942
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||    
T  16058733 ttagctttccagtggctttgatttgacgagaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaat 16058832  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  16058833 tcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagattattt 16058932  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    || |||||||    
T  16058933 aagctatgtt 16058942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 296988 - 296715
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || |||||||    
T  296988 ttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttgatttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaat 296889  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  296888 tcagcacaaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttacgagtattt 296789  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    || | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  296788 aatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctg 296715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 38057090 - 38057304
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||    
T  38057090 gtttaacttgcaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagggggtattagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaag 38057189  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat 220  Q
    ||||| ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  38057190 ttaatacaaaacttatgggattattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttaat 38057289  T
Q  221 ctttggggtaggaatg 236  Q
    | ||||| ||||||||    
T  38057290 c-ttgggataggaatg 38057304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 206 - 397
Target Start/End: Original strand, 52940736 - 52940923
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||    
T  52940736 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattataatattactgatgttcagtgactctgatataatatgatttgatgttgttag----ta 52940831  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52940832 atgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatgtt 52940923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 23194970 - 23195173
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||    
T  23194970 ttagctttccaatgactttggtttaacttgaaaatgacttttagtgtttgagttatgataaaaatactcctaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 23195069  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  23195070 tcagcataaccctttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtattt 23195169  T
Q  201 aacc 204  Q
    ||||    
T  23195170 aacc 23195173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 208 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22124545 - 22124358
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 307  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  22124545 gttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgactatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 22124450  T
Q  308 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22124449 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22124358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 208 - 399
Target Start/End: Original strand, 21043142 - 21043329
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 307  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  21043142 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 21043237  T
Q  308 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21043238 gagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatttttattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 21043329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14792981 - 14793193
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14792981 ttagctttccagtgactttggttggacttgaaaatgatttttggttttagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 14793080  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |  |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14793081 ttcgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 14793179  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||||||||||||||    
T  14793180 aacctatgttatga 14793193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 22823826 - 22824034
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  22823826 ttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaat 22823925  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  22823926 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattattt 22824024  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  22824025 aacctatgtt 22824034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50544465 - 50544276
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  50544465 ggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaa 50544366  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||  ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50544365 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 50544276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 207 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20958369 - 20958181
Alignment:
Q  207 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 306  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| | || ||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||| ||| |||||| |||    |||    
T  20958369 tgttatgagttgatccttggtgtaagaatgaaggttgattgtagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgttttgatgttgttag----taa 20958274  T
Q  307 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20958273 tgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtcatatcttgagatgttta 20958181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 48603621 - 48603521
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  48603621 gtaatgtaatatatttgtatatacattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttagatcttgagatgtttacgt 48603522  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  48603521 g 48603521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1643206 - 1643020
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |    
T  1643206 gtttgacttgaa--tgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatg 1643109  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    | || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1643108 tcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1643020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 208 - 387
Target Start/End: Original strand, 21533735 - 21533908
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 307  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||     |||    
T  21533735 gttatgagttgatccttggg-taggaatggaggttgattataatattactaatgttctgtgaatttattattacatgatttaatgttgataga----aat 21533829  T
Q  308 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21533830 gtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatc 21533908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39060709 - 39060520
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||    
T  39060709 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgtataactatttctaa 39060610  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || ||||  |||| || |  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39060609 gtcaacccaaaacttatggattgtctctaaactccaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 39060520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16372384 - 16372178
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||| || |||||||    
T  16372384 ttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaat 16372285  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacct-caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 199  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || ||||| || ||||| || ||||  || |||||| ||||||||||||    
T  16372284 tcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctacaaaaataaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatt 16372185  T
Q  200 taaccta 206  Q
    |||||||    
T  16372184 taaccta 16372178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 24720132 - 24720321
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  24720132 ggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatacttcatggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaa 24720231  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  | |||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24720232 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttcagttaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24720321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14800779 - 14800602
Alignment:
Q  223 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatat----tt 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||   ||||| || ||||||    ||    
T  14800779 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgtta---agtaacgtgatatatatagtt 14800683  T
Q  319 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14800682 gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgttta 14800602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14809653 - 14809476
Alignment:
Q  223 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatat----tt 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||   ||||| || ||||||    ||    
T  14809653 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgtta---agtaacgtgatatatatagtt 14809557  T
Q  319 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14809556 gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgttta 14809476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 206 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20346066 - 20345973
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346066 atgttatgagttaatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctttgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 20345973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 303 - 399
Target Start/End: Original strand, 41781542 - 41781636
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41781542 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgttta 41781636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44892061 - 44891869
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  44892061 ggtttgccttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctag 44891962  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| || | | ||||| |||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44891961 gtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaatcttgta-tactatgagtacaattaaggtgtttaagagta-ttaacctatgttatga 44891869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 294624 - 294396
Alignment:
Q  55 atgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta-ggga--------ataatt 145  Q
    |||||| |||||||||||  |  |||||||||||| || |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||    
T  294624 atgatggaaatactccaagtatgtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataatt 294525  T
Q  146 caaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaa 245  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |    
T  294524 ccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgta 294425  T
Q  246 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  294424 taggatattaatgatgatctgtgatgctg 294396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 17902181 - 17902389
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||| |||||||    
T  17902181 ttagctttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggttttcaagttatgatgaaaatactccaaggtggtcttgatgaaattttatgaaaat 17902280  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||  ||||| | |   |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17902281 tctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagc-atgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 17902379  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  17902380 aacctatgtt 17902389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6833820 - 6833713
Alignment:
Q  28 ttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || ||    
T  6833820 ttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgaataactatttctaagtcaaccc 6833721  T
Q  128 aaaactta 135  Q
    ||||||||    
T  6833720 aaaactta 6833713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 9784762 - 9784896
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| | |||||    
T  9784762 ttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttggtgaaattttataaaaat 9784861  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    ||  ||||||| | || |||| || ||||||||||    
T  9784862 tccacataactatctccaagtcaacccaaaactta 9784896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18121218 - 18121029
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||||||     
T  18121218 ggttggacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataattatttctag 18121119  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |  |  | |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18121118 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgcactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18121029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21659777 - 21659689
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaat 89  Q
    |||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21659777 ttagctttccaatggcttcggtttggcatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 21659689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 328 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16372141 - 16372070
Alignment:
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16372141 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 16372070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 47190861 - 47190707
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgat-ctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 306  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| | | | ||  ||| ||||| ||||||| |||||| |||    |||    
T  47190861 gttataagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttag----taa 47190767  T
Q  307 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 366  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47190766 tgtgatatagttgtatatgcattatgtaaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 47190707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 304 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 48520679 - 48520586
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48520679 taatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgtttattatttgatattgttatatc-tgagatgtt 48520586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 339
Target Start/End: Original strand, 16093748 - 16093871
Alignment:
Q  212 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 311  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    |  |||||| |    
T  16093748 tgagttgatccttggggtagaattggagattgaatataatgttagtgatgatctgtgaagctgttataagatgattgaatgttga----ttttaatgtga 16093843  T
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtgaatta 339  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  16093844 tatatttgtatatacattacatgaatta 16093871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 32649871 - 32649787
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32649871 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 32649787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13227436 - 13227340
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||| ||||    
T  13227436 ttagctttccaatgactttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 13227340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16381346 - 16381256
Alignment:
Q  311 atatatttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16381346 atatatttgtatatgcattgatgtgaattatacaatatgtttaaatgttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 16381256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20329181 - 20329118
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20329181 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgttttaagttgatgttg 20329118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 302 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11945626 - 11945564
Alignment:
Q  302 agtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11945626 agtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagttgctgttga 11945564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 206 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 26065201 - 26065045
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||| | ||   || ||    
T  26065201 atgttatgagtttatccttggggtaggaatggatgttgtatatgatgttaatgataatctgtgaagttgttataagaggatttgatg-tcat---taata 26065106  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 366  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||| || || ||||||||    
T  26065105 atgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatt 26065045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16656000 - 16655793
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  |  |||| || || |||| |||||||    
T  16656000 ttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaat 16655901  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    ||  |||||||||    
T  16655900 t-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaaaaggttggagagtattt 16655802  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  16655801 aacctatgt 16655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29535624 - 29535528
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||| ||||    
T  29535624 ttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 29535528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 391
Target Start/End: Original strand, 635944 - 636022
Alignment:
Q  314 tatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttga 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  635944 tatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgatgattgaatattatttgacattgttatatcttga 636022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 10812788 - 10812877
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 90  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  10812788 ttagctttccagtgcctttggtttgacttagaaatgatttttggtctttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatt 10812877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16362491 - 16362395
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  16362491 ttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 16362395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16758906 - 16758780
Alignment:
Q  213 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 312  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |   || |||||| ||    
T  16758906 gagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtt---ta-taatgtgat 16758811  T
Q  313 atatttgtatatgcattatgtgaattatata 343  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16758810 ataattgtatatgcattacttgaattatata 16758780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 1925212 - 1925263
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1925212 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 1925263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 20924226 - 20924277
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20924226 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 20924277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 23819381 - 23819432
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23819381 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23819432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 387
Target Start/End: Original strand, 35260939 - 35261114
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||    | || ||    
T  35260939 atgttatgagttgaacattggggtagtaatggagattgtatatgatattaacgataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgtt----gttaata 35261034  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||| || || ||||||||||||||  |||||||| || | |||||| |   ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  35261035 atgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttga---gatgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 29534697 - 29534624
Alignment:
Q  323 atgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29534697 atgcattatgtggaattttatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatatcgttatatcttgagatgt 29534624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 21841339 - 21841243
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  21841339 ttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21841243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 21922881 - 21922977
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  21922881 ttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21922977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 51326906 - 51326855
Alignment:
Q  358 atgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  51326906 atgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgtct 51326855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 13989438 - 13989382
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13989438 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 13989382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 41373044 - 41372948
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||| ||||||||| | | |||||| | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  41373044 ttagatttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41372948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1010746 - 1010695
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1010746 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 1010695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 20228892 - 20228943
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20228892 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 20228943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21407378 - 21407327
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21407378 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 21407327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 387
Target Start/End: Original strand, 41049988 - 41050070
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  41049988 taatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 41050070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 387
Target Start/End: Original strand, 50614068 - 50614151
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  50614068 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50614151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 387
Target Start/End: Original strand, 50621896 - 50621979
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  50621896 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50621979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 43543243 - 43543201
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43543243 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 43543201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 87
Target Start/End: Original strand, 23593353 - 23593409
Alignment:
Q  31 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaa 87  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  23593353 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaattactccaaggaggtcttagtgaa 23593409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48520830 - 48520787
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 249  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48520830 atgttataagttgatcattggggtaggaatggaggttgattata 48520787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 50686781 - 50686698
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  50686781 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatc 50686698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 52639564 - 52639513
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  52639564 agttgttgttgattatcattcgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 52639513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42697150 - 42697112
Alignment:
Q  205 tatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42697150 tatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaagttg 42697112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 16375541 - 16375593
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttg-atgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16375541 agttgttgttgattatcatttgaatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 16375593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 105545 - 105149
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  105545 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtctaagtgaaattttatgaaaat 105446  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||    
T  105445 tcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtattt 105346  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    |     
T  105345 aacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatgaagctg-tataatatgatttgatgtt----gt 105252  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  105251 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattttttgaattatataagatgtttaatttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 105152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 162917 - 162647
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  162917 ttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 162818  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  162817 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacatatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 162718  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaag 271  Q
    ||   ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  162717 aattcatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaag 162647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 94983 - 94927
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  94983 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 94927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 150)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 25619376 - 25619770
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  25619376 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaat 25619475  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25619476 tcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 25619575  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||        
T  25619576 aacccatgttgtgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtgatgttgttataatatgatttaatgttga---- 25619671  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25619672 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatttttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 25619770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 14979041 - 14979435
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||  ||||||    
T  14979041 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttggtgaaatcttaggaaaat 14979140  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14979141 tcagtataaccttttctaatttaatccaaaacttatagaataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 14979240  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  14979241 aacccatgttgtgagttgatcattggggtagggatggaggttgaatataacattactgaggatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga---- 14979336  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14979337 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 14979435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Original strand, 15817177 - 15817573
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  15817177 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgataatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaat 15817276  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||| | ||||||| |||||    
T  15817277 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtattatgaggtcaattaagttgtttaagattattt 15817376  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    |     
T  15817377 aacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtgaagctg-tataatatgatttgatgtt----gt 15817470  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15817471 tagtaatgtggtatatttgaatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 15817570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 20556512 - 20556893
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  20556512 ttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 20556611  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| || ||||||||||    
T  20556612 tcagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgttaaagagtattt 20556711  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||        
T  20556712 aacccatgttgtgagttgatccttcgggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatatgagaagctattataatatgatttaatgttga---- 20556807  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20556808 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 20556893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4477291 - 4476897
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  4477291 ttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttatgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 4477192  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||| ||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  4477191 tcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 4477092  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||    ||||| |  ||||  | |||||||||| |||| |||||    |     
T  4477091 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtaccgttgatgttgagtgagtcagttataatataatttgatgtt----gt 4476996  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4476995 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 4476897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23415262 - 23414952
Alignment:
Q  83 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 182  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  23415262 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatta 23415163  T
Q  183 aggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataata 282  Q
    |||| ||||||| |||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23415162 aggtgtttaagaatata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataata 23415070  T
Q  283 tgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtt 382  Q
    ||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23415069 tgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 23414974  T
Q  383 atatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23414973 atatcttgagatgtttacgtgt 23414952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 81 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27557022 - 27556710
Alignment:
Q  81 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 180  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  27557022 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagttctatgagttcaat 27556923  T
Q  181 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 280  Q
    |||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27556922 taaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 27556830  T
Q  281 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 380  Q
    ||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27556829 tatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgatcatcatttgatgttg 27556734  T
Q  381 ttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  27556733 ttatatattgagatgtttacgtgt 27556710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27851636 - 27851394
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  27851636 ttagctttccaatggatttggtttcacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 27851537  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  27851536 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtattt 27851437  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  27851436 aacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 27851394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 158 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25755196 - 25754972
Alignment:
Q  158 actagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaat 257  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  25755196 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattact 25755097  T
Q  258 gatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 357  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25755096 gatgatctttgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattttataagatgtttaagttg 25755001  T
Q  358 atgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25755000 atgttgattatgatttgatgttgttatat 25754972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 20733866 - 20734107
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||    
T  20733866 ttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctat-gaaaat 20733964  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20733965 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtattt 20734064  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||    
T  20734065 aacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatgaaggttg 20734107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28947977 - 28947768
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  28947977 ttagctttccaatgactttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 28947878  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  28947877 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtattt 28947778  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  28947777 aacctatgtt 28947768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18658839 - 18658598
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||    
T  18658839 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaaatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 18658740  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18658739 tcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 18658640  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  18658639 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 18658598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18928356 - 18928149
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18928356 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 18928257  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  18928256 tcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattcaaaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattt 18928157  T
Q  201 aacctatg 208  Q
     |||||||    
T  18928156 tacctatg 18928149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 15173893 - 15174130
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||    
T  15173893 ggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccatttctaa 15173992  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  | |||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  15173993 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaattgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttgg 15174092  T
Q  220 tctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 258  Q
    || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  15174093 tccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 15174130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23956495 - 23956265
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23956495 ttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 23956396  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||    
T  23956395 tcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtattt 23956296  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  23956295 aacctaagttgtgagttggtccttggggtag 23956265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18709132 - 18708923
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |  |||||||    
T  18709132 ttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaat 18709033  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18709032 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 18708933  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  18708932 aacctatgtt 18708923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 206 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 33443307 - 33443122
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  33443307 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 33443212  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33443211 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagt---tgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 33443122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7827586 - 7827396
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7827586 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 7827487  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7827486 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7827396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 19655667 - 19655857
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19655667 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 19655766  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19655767 gttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19655857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 5834154 - 5834366
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  5834154 ttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatattatgaaaat 5834253  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  5834254 tcagcataaccgtttctaag-taatccaaaacatagggaataattctaaatctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagtattt 5834352  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||||||||||||||    
T  5834353 aacctatgttatga 5834366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18703197 - 18702988
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |  |||||||    
T  18703197 ttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaat 18703098  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  18703097 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtattt 18702998  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  18702997 aacctatgtt 18702988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20177378 - 20177166
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  20177378 ttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaat 20177279  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  20177278 tcagcataaccgtttctaag-caatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactataagtactaggagttcaattaaggtgtctaagagtattt 20177180  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||||||||||||||    
T  20177179 aacctatgttatga 20177166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 611373 - 611139
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  611373 ttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 611274  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  611273 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 611174  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  611173 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 611139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 19825908 - 19826142
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||    
T  19825908 ttagctttccaatgaatttgttttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaat 19826007  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19826008 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatcggataattccaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 19826107  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    ||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  19826108 aaattatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 19826142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22158613 - 22158825
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  22158613 ttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaat 22158712  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  22158713 tcagcataaccgtttctaag-aaatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactaaaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagtattt 22158811  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||||||||||||||    
T  22158812 aacctatgttatga 22158825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 23491590 - 23491799
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23491590 ttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 23491689  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  23491690 tcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatct 23491789  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  23491790 aacatatgtt 23491799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 23497188 - 23497397
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23497188 ttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 23497287  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  23497288 tcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatct 23497387  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  23497388 aacatatgtt 23497397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Original strand, 19773148 - 19773330
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19773148 gtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaatttagcataactgtttttaag 19773247  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  19773248 ttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 19773330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 17318541 - 17318750
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  17318541 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 17318640  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  17318641 tcagcataaccgtttctaaggtaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtattt 17318740  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  17318741 aacctatgtt 17318750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 23150686 - 23150894
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||| ||||| | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  23150686 ttagcttttcaatggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 23150785  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23150786 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtattt 23150884  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  23150885 aacctatgtt 23150894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 25601696 - 25601904
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||    
T  25601696 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgcgttatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaat 25601795  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||  |||||||||||||    
T  25601796 tcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaataagagtttaattaaggggtttaagagtattt 25601895  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  25601896 aacctatgt 25601904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13764979 - 13764730
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||       || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  13764979 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttg-------agttatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaaatattatgaaaat 13764887  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  13764886 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgttttagagtattt 13764787  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 258  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||||| ||| || ||||  |||||||||||||    
T  13764786 aacctatgttgtgagttggtccttagggtagaaat-gaagttgtttataatattaatg 13764730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 158 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25753026 - 25752838
Alignment:
Q  158 actagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaat 257  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  25753026 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattact 25752927  T
Q  258 gatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 350  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25752926 gatgatctatgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 25752838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23838632 - 23838247
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |  |||||| ||||| ||  ||||||    
T  23838632 ttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtatgtcttagggaaatcttaagaaaat 23838533  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  || | |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| ||| |||||| |||         |    
T  23838532 tcagcacaaccattaccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgttt---------t 23838442  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| || || |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||| | |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  23838441 aacccattttgtgagttgacccttgaggtaggaatggaggttgattatagtactgttgaggttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 23838346  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23838345 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 23838247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 15891130 - 15891326
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  15891130 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 15891229  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagta 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||    
T  15891230 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctaaaaactagaagtactatgatttcaattagggtgtttaagagta 15891326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Original strand, 15705049 - 15705232
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  15705049 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacctcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctta 15705148  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  15705149 gttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 15705232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 29847922 - 29848146
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa- 99  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| || ||||||     
T  29847922 ttagctttccaatgaatttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaatcttatgaaaaa 29848021  T
Q  100 -ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtat 198  Q
     ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  29848022 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 29848121  T
Q  199 ttaacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||    
T  29848122 ttaatccatgttgtgagttgatctt 29848146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19443699 - 19443919
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||| || |||||||    
T  19443699 ttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatactccacgtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 19443798  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| || ||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19443799 tcagcataaccatttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccagaactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 19443898  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatc 221  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  19443899 aacccatgttgtgagttgatc 19443919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Original strand, 27317995 - 27318179
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 121  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27317995 tttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 27318094  T
Q  122 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 206  Q
    |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  27318095 taattcaaaactagaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatatggtgtttaagagtatttaaccta 27318179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1254390 - 1254215
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  1254390 ttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 1254291  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 176  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1254290 tcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 1254215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 8767682 - 8767885
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  8767682 ttagctttccaatggctttggtttgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaagtactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 8767781  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  8767782 tcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatattt 8767881  T
Q  201 aacc 204  Q
    ||||    
T  8767882 aacc 8767885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31734320 - 31734132
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| ||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  31734320 ggtttgacgtgaaaataatattagattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaa 31734221  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31734220 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtact--gagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 31734132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 206 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20224205 - 20224018
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  20224205 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 20224110  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  20224109 atgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 20224018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 206 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 22118189 - 22118002
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  22118189 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 22118094  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  22118093 atgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 22118002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 34296713 - 34296923
Alignment:
Q  26 acttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34296713 acttgaaaatgatttttggtttttgggatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaat 34296812  T
Q  126 ccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttg 225  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || | |||    
T  34296813 ccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaaggactatgagtttaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttg 34296912  T
Q  226 gggtaggaatg 236  Q
    |||| ||||||    
T  34296913 gggttggaatg 34296923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23655972 - 23655804
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  23655972 ttagctttccagtggctttggtttgccttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaat 23655873  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtact 169  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23655872 tcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtact 23655804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25347759 - 25347556
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |  ||||||    
T  25347759 ttagctttccaatggcgttggtttaacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaat 25347660  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  25347659 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgccatgagttcaattaaggtgtttgagagtattt 25347560  T
Q  201 aacc 204  Q
    ||||    
T  25347559 aacc 25347556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Original strand, 27125923 - 27126105
Alignment:
Q  29 tgaaaatgattttt-ggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc 127  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27125923 tgaaaatgattttttggttcttgagatacgatgaaaatactttaaaaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc 27126022  T
Q  128 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27126023 aaaacttaaagaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 27126105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20183196 - 20182984
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  20183196 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 20183097  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  20183096 ttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtattt 20182998  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  20182997 aacctttgttatga 20182984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22152795 - 22153007
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  22152795 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 22152894  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  22152895 ttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtattt 22152993  T
Q  201 aacctatgttatga 214  Q
    ||||| ||||||||    
T  22152994 aacctttgttatga 22153007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16133089 - 16133309
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  |  ||||||    
T  16133089 ttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaattcataggaaaat 16133188  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||  ||||||| || ||||||| |   || |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16133189 tcagcataaccatttccaagttaatcggaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 16133288  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatc 221  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  16133289 aacccatgttgtgagttgatc 16133309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18453444 - 18453255
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||| ||||||||| |||||| |||    ||    
T  18453444 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatactactgttgatgttcagtgagtctgatattatatgatttgatgttgttag----ta 18453349  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18453348 atgtgatatagttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgattttgttatatcttgagatgttta 18453255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 921 - 755
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  921 ttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 822  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 167  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  821 tcagtataattgtttctaagttaatctaaaatttatggaataattccaaagctcaaaactagaagta 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 8759936 - 8760138
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| |   || ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  8759936 ttagctttccaatggctgtggattgacatgaaaataatttt-ggtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 8760034  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  8760035 tcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatattt 8760134  T
Q  201 aacc 204  Q
    ||||    
T  8760135 aacc 8760138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25921343 - 25921154
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  25921343 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaa 25921244  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| | | |   || |||| |||||  | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25921243 gtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25921154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 18455491 - 18455699
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||||    
T  18455491 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggttttagtgaaattttatgaaaat 18455590  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || | | ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18455591 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgta-tactatgagttcaattaaggtctttaagagtattt 18455689  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  18455690 aacctatgtt 18455699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Original strand, 19773494 - 19773594
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19773494 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttcttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 19773593  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  19773594 g 19773594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 31022116 - 31022267
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31022116 ttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaattttatgaaaat 31022215  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacc 152  Q
    |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31022216 tcactaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacc 31022267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 303 - 405
Target Start/End: Original strand, 15705395 - 15705497
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15705395 gtaatgtaatatatttgtttatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttactt 15705494  T
Q  403 gtt 405  Q
    |||    
T  15705495 gtt 15705497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Original strand, 20411110 - 20411303
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  20411110 ggtttgacttgaaaataagttttggtttttgaggtatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctag 20411209  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20411210 gtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtaatatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttatga 20411303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 206 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18696749 - 18696609
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    | || ||    
T  18696749 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttatcatatgatttaatgtt----gttaata 18696654  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 350  Q
    |||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  18696653 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 18696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22556863 - 22556676
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||     
T  22556863 ggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaacatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattttgcataaccatttctag 22556764  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 207  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22556763 gtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacatcaaaactagaagtactaggagtttcattaaggggtttaagagtatttaacctat 22556676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 279 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22806120 - 22806001
Alignment:
Q  279 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 378  Q
    ||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  22806120 aatatgatttaatgttgatgg----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-agttgttgttgattatcatttgatat 22806026  T
Q  379 tgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  22806025 tgttatatcttgtgatgtttacgtg 22806001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25807765 - 25807602
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25807765 ttagctttccaatgactctggtttgtcgtgaaaattatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 25807666  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaa 164  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||    
T  25807665 tcagcaaaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaa 25807602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 304 - 403
Target Start/End: Original strand, 28103851 - 28103950
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28103851 taatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatataagttgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttataccttgagatgtttacgtg 28103950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 135
Target Start/End: Original strand, 34141067 - 34141178
Alignment:
Q  24 tgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  34141067 tgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtca 34141166  T
Q  124 atccaaaactta 135  Q
    | ||||||||||    
T  34141167 acccaaaactta 34141178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 135
Target Start/End: Original strand, 34153683 - 34153794
Alignment:
Q  24 tgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  34153683 tgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtca 34153782  T
Q  124 atccaaaactta 135  Q
    | ||||||||||    
T  34153783 acccaaaactta 34153794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 29044943 - 29044809
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  29044943 ttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaatgttatgaaaat 29044844  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  29044843 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 29044809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 206 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 18706568 - 18706391
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggg-gtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    | || |    
T  18706568 atgttatgagttgatccttggttgtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgtt----gttaat 18706473  T
Q  305 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || | |||||| |  |||||| ||||||||||    
T  18706472 aatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatt-tgctttgatattgttatatc 18706391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18585232 - 18585117
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  18585232 ggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaa 18585133  T
Q  120 gttaatccaaaactta 135  Q
    || || || |||||||    
T  18585132 gtcaaccccaaactta 18585117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13285321 - 13285136
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13285321 gttttacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaag 13285222  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 207  Q
      || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13285221 ccaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcatttaaggtgtttaagagtatttaacctat 13285136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18398532 - 18398343
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||    
T  18398532 ggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaa 18398433  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || ||||||||||  || |   || |||| |||||||| |  || ||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18398432 gtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaaacttg-tgttctatgagctcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 18398343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32259460 - 32259272
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  32259460 ggtttgacgtgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctag 32259361  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| || || || |  |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32259360 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttc-aagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 32259272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17857111 - 17857319
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||| ||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  17857111 ttagatttccaatggctttggtatgacttgaaaatgatttttagattttgggttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaat 17857210  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| ||||||| ||||||| ||||| || || ||||   |||||||||||||    
T  17857211 tccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaacgagaagtattaggaatttaattaagaggtttaagagtattt 17857310  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  17857311 aacctatgt 17857319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 246 - 391
Target Start/End: Original strand, 18896215 - 18896354
Alignment:
Q  246 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18896215 tataatattactgatgatctgtgaatctgttataaaa-gatttaatgttgttag----taatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 18896309  T
Q  346 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 391  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18896310 atgtttaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 18896354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 246 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19362646 - 19362507
Alignment:
Q  246 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19362646 tataatattactgatgatctgtgaaactgttataa-atgatttaatgttgttag----taatgtgatataattttatatgcattatgtgaattatttaag 19362552  T
Q  346 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 391  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  19362551 atgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 19362507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20136840 - 20136739
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20136840 tagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 20136742  T
Q  401 gtg 403  Q
    |||    
T  20136741 gtg 20136739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 403
Target Start/End: Original strand, 22196029 - 22196130
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22196029 tagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 22196127  T
Q  401 gtg 403  Q
    |||    
T  22196128 gtg 22196130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 7430156 - 7430069
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 88  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7430156 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 7430069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22806382 - 22806276
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  22806382 ttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 22806283  T
Q  101 tcagcat 107  Q
    |||||||    
T  22806282 tcagcat 22806276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 311 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23539130 - 23539045
Alignment:
Q  311 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23539130 atatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 23539045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20182962 - 20182866
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20182962 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 20182866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Original strand, 22153029 - 22153125
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22153029 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22153125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 12942762 - 12942666
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  12942762 ttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12942666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 15938650 - 15938857
Alignment:
Q  6 tttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagc 105  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||  || |||| ||||||||||  ||||||| |||    
T  15938650 tttccaatggctttggtttgacttgaaaattatttttatcttttgagttatgatgaaaatactctaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaatttagc 15938749  T
Q  106 ataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacct 205  Q
    |||||| ||| ||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||  |||||| | | |||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  15938750 ataactatttttaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaaattcaaaaattg-agtgttaggagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacct 15938848  T
Q  206 atgttatga 214  Q
    ||| |||||    
T  15938849 atgatatga 15938857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16493317 - 16493219
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16493317 tagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgttta 16493219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 398
Target Start/End: Original strand, 18177624 - 18177719
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18177624 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18177719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 398
Target Start/End: Original strand, 18199368 - 18199463
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18199368 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18199463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18204247 - 18204152
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18204247 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18204152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 304 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23076900 - 23076806
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  23076900 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 23076806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 304 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23538978 - 23538884
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  23538978 taatgtgatatagttgtatatgcgttatgtgaatgatatatgatgtttaggttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcatgagctgttt 23538884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Original strand, 27330410 - 27330488
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaa 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||    
T  27330410 ggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27330488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Original strand, 27391150 - 27391228
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaa 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||    
T  27391150 ggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27391228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23415537 - 23415441
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  23415537 ttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttgttgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23415441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 28288926 - 28289022
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  28288926 ttagctttccaatggctttggttggactcgaaaatgagttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 28289022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 14594044 - 14594131
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 88  Q
    |||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14594044 ttagctttccgatggctttggtttgatttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 14594131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 397
Target Start/End: Original strand, 23528056 - 23528150
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||  |||||| |||||||||||||    
T  23528056 tagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagtcgatgttgatcgtcctttga--ttgttacatcttgagatgtt 23528150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Original strand, 29416865 - 29416949
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29416865 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 29416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 19858512 - 19858608
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||    
T  19858512 ttagctttctagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaaggagatcttagtgaatttttatgaa 19858608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 27557275 - 27557199
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||    
T  27557275 gtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaatttttatgaa 27557199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 304 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 35008318 - 35008224
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  35008318 taatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 35008224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23221479 - 23221288
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||    | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | || ||||    
T  23221479 ggtttgacttgaaaatgatatttagatttggagttatgatgaaaatactccatgtgggtcttagtaaaactttatgaaaattcagcataatttttcctaa 23221380  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttat 212  Q
    |||||  |||| |||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| |||||||| || |||| | |||||||||||| |||||| |||||    
T  23221379 gttaaatcaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagatgtttaagagtattaaacctaggttat 23221288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 409
Target Start/End: Original strand, 31477893 - 31477949
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31477893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgtct 31477949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 342
Target Start/End: Original strand, 16448435 - 16448561
Alignment:
Q  211 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||     || |||     
T  16448435 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgatggtctatgaagttgttataacatgattcaatgttgtta-----tattgtg 16448529  T
Q  311 atatatttgtatatgcattatgtgaattatat 342  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16448530 atataattgtatatgcattaattgaattatat 16448561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16760318 - 16760267
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16760318 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 16760267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22949131 - 22949080
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22949131 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 22949080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22953087 - 22953036
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22953087 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 22953036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23871575 - 23871524
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23871575 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23871524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23875531 - 23875480
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23875531 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23875480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 97
Target Start/End: Original strand, 15892028 - 15892094
Alignment:
Q  31 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  15892028 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaa 15892094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19234699 - 19234658
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19234699 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 19234658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16135591 - 16135519
Alignment:
Q  137 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 209  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16135591 ggaatatttccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 16135519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 404
Target Start/End: Original strand, 18955853 - 18955897
Alignment:
Q  360 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18955853 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 18955897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 252
Target Start/End: Original strand, 20078033 - 20078079
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20078033 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataata 20078079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 17883087 - 17883183
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | | ||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  17883087 ttagctttccaatggctttggtttggcgttaatttgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 17883183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 18334182 - 18334238
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18334182 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 18334238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 22523388 - 22523594
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||| |||| | | | |||| ||| || ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||  ||  || |||| ||||||||||  ||||||    
T  22523388 ttagctttctaatggctttgttttggcttaaagatgatttttaggttttgagttatggtgaaaatactaaaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaat 22523487  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaagg-tatttaagagtatt 199  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || ||| || ||| ||  |  |   ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  22523488 tcagcataactatttttaagtgaacccataagttatggtttggtcgcaaacctcaaaacttg-agtactaggagtttaa-taaggatgtttaagagtatt 22523585  T
Q  200 taacctatg 208  Q
    |||||||||    
T  22523586 taacctatg 22523594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 24423119 - 24423063
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24423119 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 24423063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25738540 - 25738457
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  25738540 tatatttgcaaatgcattatgtggattatgaatgatgtttaagttga-gttgattattaattgatattgtcatatcttgagatgt 25738457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 33862366 - 33862270
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  33862366 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 33862270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8243884 - 8243833
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8243884 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 8243833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 11566885 - 11566834
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11566885 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 11566834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 12618927 - 12618978
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12618927 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12618978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 14472294 - 14472243
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14472294 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 14472243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 18917349 - 18917400
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18917349 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 18917400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19870613 - 19870562
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19870613 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 19870562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22862969 - 22862918
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22862969 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 22862918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23395091 - 23395040
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23395091 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 23395040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23989943 - 23989892
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23989943 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 23989892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 35057137 - 35057066
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 72  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35057137 ttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgttttatggattttgagttatgatgaaaacactccaa 35057066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 342
Target Start/End: Original strand, 8227409 - 8227501
Alignment:
Q  246 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| |   || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8227409 tataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt---ta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8227501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 12742856 - 12742794
Alignment:
Q  35 tgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  12742856 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15875498 - 15875456
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15875498 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 15875456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 31161878 - 31162012
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||| |||||||||| | | |||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||  || |||| | ||||||||  | ||||    
T  31161878 ttagcattccaatgactttgatttgacatcaaaatgatttttagattttgagttatgttgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaagtaaat 31161977  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    | ||||| ||| |||| |||| || ||||||||||    
T  31161978 ttagcatgactatttccaagtcaacccaaaactta 31162012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7429990 - 7429918
Alignment:
Q  323 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  7429990 atgcattatgtgaattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 7429918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18456938 - 18456846
Alignment:
Q  245 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| ||     || ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18456938 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta-----tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18456846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 1540501 - 1540597
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  1540501 ttagctttccaatggctttggtgtggcataaaaatgagttttggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1540597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 26924037 - 26924093
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26924037 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26924093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Original strand, 32277441 - 32277541
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||| | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || ||||||||||    
T  32277441 gtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaag 32277540  T
Q  121 t 121  Q
    |    
T  32277541 t 32277541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 33864850 - 33864794
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33864850 ttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 33864794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 2290770 - 2290821
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 52  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2290770 ttagcttttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 2290821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 8055602 - 8055551
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 52  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8055602 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 8055551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25644545 - 25644495
Alignment:
Q  245 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  25644545 atatgatattaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttg 25644495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 31163594 - 31163536
Alignment:
Q  6 tttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 64  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  31163594 tttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 31163536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1644725 - 1644680
Alignment:
Q  359 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  1644725 tgttgattatcatttgatattgttatattctgagatgtttatgtgt 1644680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12942393 - 12942356
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  12942393 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 12942356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Original strand, 14594210 - 14594282
Alignment:
Q  323 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  14594210 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 14594282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 249
Target Start/End: Original strand, 17229776 - 17229817
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 249  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17229776 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 17229817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Original strand, 3007550 - 3007594
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 64  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  3007550 ggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 3007594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 22782799 - 22782743
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  22782799 ttagctttccactggcgtcagtttgacttgaaaatgatatttggtttatgagttatg 22782743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 403
Target Start/End: Original strand, 1547 - 1926
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaa-tgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttcta 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||    
T  1547 ggtttgacttgaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttcta 1646  T
Q  119 agttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  1647 agttaatccaaaacttatggaataattccaacccccaaaactagaagtactatgagttcaattaaggt-tttaagattatttaacccatgttgtgagttg 1745  T
Q  219 atctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatattt 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  1746 atccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaaatgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatattt 1841  T
Q  319 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1842 gtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagatgtttacgtg 1926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27933 - 27724
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  27933 ttagctttccagtggctttagtttgaattgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaataattccaggaggtcttactgaaattttatgaaaat 27834  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  27833 tcagcaaaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtattt 27734  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    || |||||||    
T  27733 aatctatgtt 27724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 882 - 486
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||| | |||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  882 ttagcttacgaatgactttggtttgacttgaaactgatatttcgtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 783  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  782 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattattt 683  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||    |     
T  682 aacccatgttatgagttgatc-ttggagtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatgaagctg-tataatataatttgatgtt----gt 589  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  588 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12602 - 12221
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  12602 ttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 12503  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||    
T  12502 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtattt 12403  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||        
T  12402 aacccattttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaatctattataatatggtttaatgttga---- 12307  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12306 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Original strand, 169416 - 169801
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| || |||||||    
T  169416 ttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaat 169515  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||             ||||||| |||||    
T  169516 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggag-------------tttaagaatattt 169602  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |        
T  169603 aacctatattataagttgatccttgggataggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtaaagctgttataatatgatttaatattta---- 169698  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169699 taataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 169798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 143226 - 143038
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  143226 gtttgacatgaaaagaatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 143127  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  143126 ttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 143038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 142753 - 142654
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  142753 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 142654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 82600 - 82235
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  82600 ggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 82501  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  82500 gttaattcaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggt-gttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 82402  T
Q  220 tctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttg 319  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  82401 tccttggggttggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattgtaatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttg 82306  T
Q  320 tat----atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  82305 tatatgcatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 82235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Original strand, 80424 - 80469
Alignment:
Q  359 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  80424 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 80469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 9375 - 9765
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || ||| |||    
T  9375 ttagctttccaatggctttggtttgactggaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgataat 9474  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  9475 tcagcacaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtacaattaaggtgtttaagagtattt 9574  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  9575 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 9670  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9671 tagtaatgagatatatttgtatatgcattgtatggattatataagatgtttaag-tgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 9765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 111120 - 110726
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  111120 ttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 111021  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  111020 tcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 110921  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  110920 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 110825  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  110824 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 110726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21714 - 21484
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  21714 ttagctttccagtggctttggtttaacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 21615  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21614 ccagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 21515  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
     ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  21514 cacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 146346 - 146156
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  146346 ggtttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagaataacagtttctaa 146247  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||||||| |||||||    
T  146246 gttaatccaaaacatatgtaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaatctatgtt 146156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 124001 - 124182
Alignment:
Q  23 ttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 122  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||     
T  124001 ttgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaatgaggtgttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtg 124100  T
Q  123 aatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 204  Q
    ||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  124101 aatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacc 124182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 206 - 403
Target Start/End: Original strand, 9943 - 10136
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  9943 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----ta 10038  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039 atgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagatgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 10136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 228 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 36420 - 36253
Alignment:
Q  228 gtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgca 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||  ||  ||||||||||||| |||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||    
T  36420 gtaggaatggaggttgattataatactattgatgttcagtgagtctaatataatatgatttgatgttgttag----taatgtgatatagttgtatatgca 36325  T
Q  328 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36324 ttatgtggattatataagatgtttaagttgtcgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 36253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11311 - 11100
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11311 ggtttgacttgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaa 11212  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  11211 gttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgg 11112  T
Q  220 tctttggggtag 231  Q
    || |||||||||    
T  11111 tccttggggtag 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 206 - 406
Target Start/End: Original strand, 24456 - 24652
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  24456 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgcaaagctgttataatatgatttaatgttgatag----ta 24551  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24552 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgtttaagtgtt 24651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 5)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 133383 - 132989
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||| ||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||||    
T  133383 ttagcttttcaatggctttggtttgacttttaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaat 133284  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||  |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| ||||   |||||| ||||||    
T  133283 tcagcacaaccattttcaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagaggtttaagtgtattt 133184  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  133183 aactcatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactattgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 133088  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  133087 tagtaataagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaaatgttta 132989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29761 - 29582
Alignment:
Q  31 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 130  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29761 aaaatgatttttggtttagtagttatgatgaaaatactacaaggaatacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 29662  T
Q  131 acttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29661 acttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaagagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 29582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 133583 - 133831
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||  || |||||| ||||| || ||||| |    
T  133583 ttagctttccaatggctttagtttgactttaaaatgattttttgtttaggagttatgttgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaatt 133682  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  133683 tcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 133782  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 249  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  133783 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 133831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 29390 - 29285
Alignment:
Q  279 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 378  Q
    ||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  29390 aatatgatttactgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaagta---------tttaagatgatgttgattatcatttgatat 29304  T
Q  379 tgttatatcttgagatgtt 397  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  29303 tgttatatcttgatatgtt 29285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 33871 - 33803
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 69  Q
    |||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  33871 ttagatttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactc 33803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 10885 - 11073
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10885 ggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcagaataactgtttctaa 10984  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10985 gttaatccaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 11073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17315 - 17223
Alignment:
Q  78 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta 170  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  17315 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattttaaatctcaaaactagaagtacta 17223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 3361 - 3591
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  3361 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttctgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaat 3460  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  3461 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtattt 3560  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  3561 aacctatgttgtgagttggcccttggggtag 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 52 - 1
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 52  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgag 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 19063 - 19304
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  19063 ttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaat 19162  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19163 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 19262  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  19263 aacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 1113 - 1390
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| || |||||||    
T  1113 ttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaat 1212  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||             ||||||| |||||    
T  1213 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggag-------------tttaagaatattt 1299  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaat 291  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1300 aacctatattataagttgatccttgggataggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtaaagctgttataatatgatttaat 1390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 39631 - 39320
Alignment:
Q  82 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 181  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||| | ||| |||||||| |    
T  39631 agtgaaatcttaagaaaattcaggataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaatttctatgagttcaatt 39532  T
Q  182 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 281  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  39531 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactattataat 39439  T
Q  282 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 381  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39438 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 39343  T
Q  382 tatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39342 tatatcttgagatgtttacgtgt 39320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 21394 - 21285
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21394 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 21295  T
Q  101 tcagcataac 110  Q
    ||||||||||    
T  21294 tcagcataac 21285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 39855 - 39809
Alignment:
Q  51 agatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  39855 agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaacttttatgaa 39809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 31502 - 31191
Alignment:
Q  82 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 181  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||||| |    
T  31502 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaatccttaaaactagaagttctatgagttcaatt 31403  T
Q  182 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 281  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||| | ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  31402 aaggtgtttaagagtata------ataatataatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatttgtgaagctattataat 31310  T
Q  282 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 381  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  31309 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgtttattatcatttgatattgt 31214  T
Q  382 tatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31213 tatatcttgagatgtttacgtgt 31191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Original strand, 64507 - 64694
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  64507 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaa 64606  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 207  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  64607 gttaatccaaaacttgtggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtagttaacctat 64694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 31748 - 31680
Alignment:
Q  29 tgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  31748 tgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 31680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6031 - 5828
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6031 ggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaa 5932  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5931 gtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttga 5832  T
Q  220 tctt 223  Q
    ||||    
T  5831 tctt 5828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 7202 - 7409
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7202 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataattttttgtttta-agttatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 7300  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |   || |||  |||||  | |  |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  7301 tctgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaagtttg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtattt 7399  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  7400 aacctatgtt 7409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3385 - 3323
Alignment:
Q  344 agatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3385 agatgtttcagttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgttg 3323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3438 - 3395
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 249  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  3438 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattata 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 82 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17641
Alignment:
Q  82 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 181  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |||| ||| |||||||| |    
T  17952 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtttatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactataagttctatgagttcaatt 17853  T
Q  182 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 281  Q
    ||| | |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  17852 aagatgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactattataat 17760  T
Q  282 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 381  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17759 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgaattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 17664  T
Q  382 tatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17663 tatatcttgagatgtttacgtgt 17641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18226 - 18130
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| || | |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  18226 ttagctttccagtggcttttgtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6072 - 5835
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||    
T  6072 ggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaa 5973  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  5972 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgagttgg 5873  T
Q  220 tctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 258  Q
    || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  5872 tccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 176425 - 176195
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  176425 ttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 176326  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  176325 tcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattt 176226  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  176225 aacctaagttgtgagttggtccttggggtag 176195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 152629 - 152863
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  152629 ttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatatttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 152728  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  152729 tcagcaaaactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 152828  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaat 235  Q
    || | ||||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  152829 aatccatgttgtaagttgatccttgggttaggaat 152863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 169072 - 168846
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  169072 ttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 168973  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||    
T  168972 tcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggagtttaagagtattt 168873  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggg 227  Q
    |||||| ||| ||||||| || |||||    
T  168872 aacctaagttgtgagttggtccttggg 168846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 77320 - 77098
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | | |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  77320 ttagctttccagtggctttgatttgacgtggaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 77221  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  77220 tcagcataagcgtttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacaatgagttcaattaaggtgtttaagattattt 77121  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  77120 aacctatgttgtgagttgatctt 77098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Original strand, 163071 - 163143
Alignment:
Q  323 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  163071 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgtagattatcatttggtattgtcatattttgagatgt 163143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 78697 - 78488
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  78697 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaat 78598  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  78597 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgttaaagagtattt 78498  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  78497 aacctatgtt 78488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 206 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22540 - 22361
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  22540 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 22445  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  22444 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 22361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 206 - 386
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3362
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||    
T  3186 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattactgatgatctgtgaagctgttataatatcatttaatgttga----tagta 3281  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3282 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgttgattatcatttaatgttgttatat 3362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3339 - 3117
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3339 ttagctttccaatgacttttgtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 3240  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  3239 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtattt 3140  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||| |||||  |||||||||||    
T  3139 aacccatgttgcgagttgatctt 3117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 5132 - 5341
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  5132 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgtttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 5231  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5232 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 5331  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    || |||||||    
T  5332 aaactatgtt 5341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 6096 - 6330
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || | |||||    
T  6096 ttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgaaatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttataaaaat 6195  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaagg-tatttaagagtatt 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||    
T  6196 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagatcaaaactagaagtactatgagttcaattagggttttttaagagtatt 6295  T
Q  200 taacctatgttatgagttgatctttggggtaggaa 234  Q
    |||| |||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  6296 taacttatgttgtgagtagacccttggggtaggaa 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21888 - 21679
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21888 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 21789  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21788 tcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtttttaagagtattt 21689  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    |||| |||||    
T  21688 aacccatgtt 21679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 28787 - 28996
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  28787 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 28886  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  28887 tcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtattt 28986  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  28987 aacctatgtt 28996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10068 - 9997
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 72  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10068 ttagctttccaatgattttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 9997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1318 - 1130
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  1318 ggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggatatcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaa 1219  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  1218 gttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaagatggttaagagtatttaacctatg 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 5714 - 5906
Alignment:
Q  16 catcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5714 catcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgttt 5813  T
Q  116 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5814 ctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatcaaacctatg 5906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 396 - 605
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  396 ttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaaagtattttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 495  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  496 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactcgaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatct 595  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  596 aacctatgtt 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2971 - 2702
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  2971 ttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 2872  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2871 tcagcataaccgtttctaagttaatcc-aagcttatgggataattccaaagctcaaaactagaaatactacgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 2773  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaag 271  Q
    || | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||  |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2772 aatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttttataggatattaaggatgatctgtgaag 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 36025 - 36076
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36025 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 36076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 81 - 404
Target Start/End: Original strand, 19951 - 20263
Alignment:
Q  81 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 180  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  19951 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaat 20050  T
Q  181 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 280  Q
    |||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | |  ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20051 taaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgta-ggggtaggaatgtggattgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 20143  T
Q  281 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 380  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  20144 tatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttttatatgcactatgtgaattatatataatgtttaagttgttgttgattagcatttgatattg 20239  T
Q  381 ttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  20240 ttaaatcttgagatgtttacgtgt 20263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17575
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| | |||| | |    ||    
T  17764 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagactgatataatatgatttgaagttgttgg----ta 17669  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17668 atgtgatatagttgtatatgccttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 17575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 19678 - 19774
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| || | |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  19678 ttagctttccattggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 19774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 7027 - 7213
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7027 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatattatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 7126  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  7127 gttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaccta 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Original strand, 7438 - 7537
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  7438 tagtaatgtgatatatttgtgtatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgatatatcttgagatgttta 7537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 7823 - 8013
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7823 ggttttacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 7922  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7923 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacttcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4730 - 4568
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4730 ttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 4631  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactaga 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4630 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactaga 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 11750 - 11679
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 72  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11750 ttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 11679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 7975 - 8184
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7975 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 8074  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||    
T  8075 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttatgattattt 8174  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    |||| |||||    
T  8175 aacccatgtt 8184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4667 - 4433
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  4667 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 4568  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaa----aacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagt 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  4567 tcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 4468  T
Q  197 atttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  4467 atttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4667 - 4433
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  4667 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 4568  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaa----aacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagt 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  4567 tcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 4468  T
Q  197 atttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  4467 atttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15131 - 15069
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15131 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 15069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 58381 - 58172
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  58381 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatctgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaat 58282  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  58281 tcagcataagcgtttctaagttaatccaaaacataaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 58182  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||| ||||    
T  58181 aacctgtgtt 58172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 68534 - 68438
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||   | |||||||||| |||| ||||    
T  68534 ttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttatcttttgagatatgatggaaatactccaagttggtcttagtgaatttttatgaa 68438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 15005 - 15214
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  15005 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 15104  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  15105 tcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtattt 15204  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  15205 aacctatgtt 15214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 24063 - 24272
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  24063 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 24162  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  24163 tcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtattt 24262  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  24263 aacctatgtt 24272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1540 - 1332
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  1540 ttagctttccagtgactttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgggatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 1441  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  1440 ttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtattt 1341  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  1340 aacctatgt 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1110 - 1004
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  1110 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattcttatatcttgagatgttta 1011  T
Q  400 cgtgttg 406  Q
     ||||||    
T  1010 tgtgttg 1004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7593 - 7401
Alignment:
Q  16 catcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7593 catcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgttt 7494  T
Q  116 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  7493 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatcaaacctatg 7401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 10336 - 10423
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 88  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10336 ttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 10423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11267 - 11219
Alignment:
Q  162 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11267 gaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 11219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 908 - 1095
Alignment:
Q  23 ttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  908 ttgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtt 1007  T
Q  123 aatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1008 aatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8697 - 8478
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| || |||||||    
T  8697 ttagctttccagtggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtgtttgatatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtgaaatcttatgaaaat 8598  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  8597 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactacaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtattt 8498  T
Q  201 aacctatgttatgagttgat 220  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  8497 aacctatgttgtgagttgat 8478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 630 - 395
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  630 ttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 531  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||| ||||||||||| |    
T  530 tcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactttgagttcaattagggtgtttaagagtatgt 431  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    ||| |||||| ||| | || | ||||||||||||||    
T  430 aacttatgttttgattcgacccttggggtaggaatg 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 403
Target Start/End: Original strand, 1279 - 1344
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1279 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 1344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 5745 - 5947
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  5745 ttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 5844  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||    
T  5845 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtattt 5944  T
Q  201 aac 203  Q
    |||    
T  5945 aac 5947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 399
Target Start/End: Original strand, 6111 - 6207
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6111 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 6207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 2146 - 2493
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||    
T  2146 ttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaat 2245  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  |||| ||||||||| ||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  2246 tcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtattt 2345  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagc 300  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |     
T  2346 aacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gt 2441  T
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 352  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2442 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 2493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 70247 - 70477
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  70247 ttagctttccagtggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 70346  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  70347 tcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgagataattccaaaactcaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtattt 70446  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  70447 aacctatgttatgagttggtccttggggtag 70477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 72044 - 71935
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  72044 ttagctttccaattgctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 71945  T
Q  101 tcagcataac 110  Q
    |||| |||||    
T  71944 tcaggataac 71935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11926 - 12156
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  11926 ttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgaattattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 12025  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  12026 ttagcataactgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtaatt 12125  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtag 231  Q
    |||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  12126 aacctatgttgtgagtttgtccttggggtag 12156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 589
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  778 gtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaag 679  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
     || ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  678 gtagtccaatatttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtccaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16396 - 16175
Alignment:
Q  2 tagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaatt 101  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| || |||| |||    
T  16396 tagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgcgatatgatgaaaatactttaaggaggtcttagtgaaatcttatgaatatt 16297  T
Q  102 cagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattta 201  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  16296 cagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataattctcaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatgaaggtgtttaagagtattta 16197  T
Q  202 acctatgttatgagttgatctt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  16196 acctatgttgtgagttgatctt 16175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13579 - 13357
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  13579 ttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 13480  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  13479 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtattt 13380  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  13379 aacctatgttgtgagttgatctt 13357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8869 - 8686
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  8869 ttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaat 8770  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaag 184  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8769 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 8686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39732 - 39523
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||    
T  39732 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagggcttagtgaaatcttatgaaaat 39633  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| || | | |||||||||||||    
T  39632 tcaggataatcgtttctatgttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaattaggatgtttaagagtattt 39533  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  39532 aacctatgtt 39523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 22210 - 22419
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  22210 ttagctttccagtggctttggtttcacgtgaaaattatttttggttattgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 22309  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22310 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtattt 22409  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  22410 aacctatgtt 22419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29345 - 29124
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | |    
T  29345 gtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatg 29246  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat 220  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| |   || ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  29245 ttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgat 29146  T
Q  221 ctttggggtaggaatggaggtt 242  Q
    | ||||| |||||||| |||||    
T  29145 ccttgggttaggaatgaaggtt 29124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34810 - 34589
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | |    
T  34810 gtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatg 34711  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat 220  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| |   || ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  34710 ttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgat 34611  T
Q  221 ctttggggtaggaatggaggtt 242  Q
    | ||||| |||||||| |||||    
T  34610 ccttgggttaggaatgaaggtt 34589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 22208 - 22444
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  22208 gtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgacatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaagattcagcataaccatttctaag 22307  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat 220  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22308 ttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctaaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggt 22407  T
Q  221 ctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 258  Q
    | |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  22408 ccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 22444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 246 - 391
Target Start/End: Original strand, 16818 - 16957
Alignment:
Q  246 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16818 tataatattactgatgatctgtgaatctgttataa-attagttaatgtt----gttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 16912  T
Q  346 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 391  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16913 atgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 16957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 391
Target Start/End: Original strand, 25978 - 26117
Alignment:
Q  246 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 345  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25978 tataatattacttatgatctgtgaatctgttataa-attatttaatgttgttag----taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 26072  T
Q  346 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 391  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  26073 atgttcaagttgttgttgattgtc-cttgatattgttatatcttga 26117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 5086 - 5293
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  5086 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaat 5185  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  5186 tcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagttctaggggttcaattaaggtgtttaagagtattt 5285  T
Q  201 aacctatg 208  Q
    ||||||||    
T  5286 aacctatg 5293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6658 - 6407
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  6658 ttagctttccaatgacttcggtttgaattgaaaattagttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaat 6559  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| ||||   ||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||    
T  6558 tcagtataatcatttataagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtgttt 6459  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 252  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||| |||| | ||||| |||||||    
T  6458 aacctatgttatgagtagatccttagggtagaaatgcaagttgattataata 6407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 796 - 658
Alignment:
Q  209 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    | || |||||    
T  796 ttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgtt----gttaataatg 701  T
Q  309 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 351  Q
    | |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  700 tgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25367 - 25213
Alignment:
Q  207 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 306  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||     || |||    
T  25367 tgttgtgagttgatccttggggtagaaatgaaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataagacgatttgatgttg-----taataa 25273  T
Q  307 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 366  Q
    ||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  25272 tgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatt 25213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16362
Alignment:
Q  47 tttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc 146  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||    
T  16524 tttgagttatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattttctc 16425  T
Q  147 aaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
     |||| |||||  |  | |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16424 caaacttcaaagat-catgtactatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 16362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21266 - 21083
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21266 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 21167  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  21166 gttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatagtatttaac 21083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20919 - 20819
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20919 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 20820  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  20819 g 20819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 106622 - 106800
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  106622 ttagctttccagtgaaattggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 106721  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 179  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106722 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 106800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11316 - 11219
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11316 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatttggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttta 11219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22416 - 22319
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22416 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatatggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttta 22319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 6)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23202 - 22929
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||  || |||||||    
T  23202 ttagctttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 23103  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| | |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23102 tcagcacatccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 23003  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    || | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  23002 aatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 22929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33955 - 33791
Alignment:
Q  18 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 117  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  33955 tcggtttgacgtgaaaataaattttggttctcgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttct 33856  T
Q  118 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33855 aagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaacta 33791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17676 - 17879
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  ||  |||||||||||  || |||||||    
T  17676 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctagggatgtcttagtgaaaccttatgaaaat 17775  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| | |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  17776 tcagcacagccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagaatattt 17875  T
Q  201 aacc 204  Q
    ||||    
T  17876 aacc 17879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Original strand, 55543 - 55733
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||  ||||||||||||| | |||| |||    ||    
T  55543 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttag----ta 55638  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55639 atgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttta 55733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 22598 - 22765
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatg-agatcttagtgaaattttttgaaaa 99  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  | || |||||||||||  || ||||||    
T  22598 ttagcattccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctaggggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 22697  T
Q  100 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 167  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22698 ttcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagta 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 204
Target Start/End: Original strand, 23386 - 23512
Alignment:
Q  78 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 177  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  23386 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 23485  T
Q  178 aactaaggtatttaagagtatttaacc 204  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  23486 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 23512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 8752 - 8928
Alignment:
Q  31 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8752 aaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 8851  T
Q  131 acttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 207  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  8852 acttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaactat 8928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7498 - 7295
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||    
T  7498 ggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 7399  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  7398 gttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttga 7299  T
Q  220 tctt 223  Q
    ||||    
T  7298 tctt 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21682 - 21499
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21682 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaa 21583  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  21582 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 21499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 303 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21335 - 21239
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21335 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 21239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 126362 - 126179
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  126362 ggtttaacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 126263  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  126262 gttaatccaaaacttatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 126179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 126124 - 126024
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  126124 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 126025  T
Q  403 g 403  Q
    |    
T  126024 g 126024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33067 - 32874
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||     
T  33067 ggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactttttttag 32968  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32967 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 32874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 159369 - 159603
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  159369 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 159468  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||     
T  159469 tcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattcaaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgattaagagtattc 159568  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    |||  |||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  159569 aactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatg 159603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 13084 - 13286
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  13084 ttagctttccagtggctttggtgtgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 13183  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  13184 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtattt 13283  T
Q  201 aac 203  Q
    |||    
T  13284 aac 13286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 8088 - 8277
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||| ||||  |  |||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8088 ggtttgacttaaaaatgatgtttagatttagagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 8187  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 209  Q
     | ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||   |||||||||||||||| |||||    
T  8188 ctcaatccaaaacttatggaatatttccaaaactcaaaactagaaatactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacgtatgt 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 357
Target Start/End: Original strand, 13450 - 13502
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 357  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13450 gtaatgtaatatatttgtat--gcattatctgaattatataagatgtttaagttg 13502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6432 - 6191
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  6432 ttagctttgcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaaaactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 6333  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  6332 tcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagttttt 6233  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 243  Q
    || | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  6232 aatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 6191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8690 - 8468
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||| |||||||    
T  8690 ttagctttccagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtgttagtgaaattttatgaaaat 8591  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  8590 tcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtattt 8491  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    || | ||||| ||||||||||||    
T  8490 aatccatgttgtgagttgatctt 8468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7766 - 7557
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||    
T  7766 ttagctttccaatggttttgatttgacttgaaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtcaaatcttatgaaaat 7667  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  7666 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttattagtattt 7567  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  7566 aacctatgtt 7557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21366 - 21157
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  21366 ttagctttccaatggctttggtttgacttggaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaagaaaat 21267  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21266 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattttaattctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 21167  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  21166 aacctatgtt 21157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 398
Target Start/End: Original strand, 19505 - 19693
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||| ||| || |||||| |||||||||     ||    
T  19505 atgttatgagttaatcattggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctgatattatgtgatttgatgttgataa----ta 19600  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  19601 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagattttttaagttgatgttgattattgtttgacattgttatat-ttgagatgttt 19693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 403
Target Start/End: Original strand, 15225 - 15290
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15225 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 15290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 209 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 286 - 121
Alignment:
Q  209 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 308  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  286 ttatgagttgaaccttgggataggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatag----taatg 191  T
Q  309 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  190 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgt 121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10835 - 10636
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgttt-cta 118  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||    
T  10835 ggtttcacttgaaaattatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagaggacttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattttcta 10736  T
Q  119 agttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 218  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10735 agttaatccaaaacttaagggataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 932 - 740
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||     
T  932 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctat 834  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||    ||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  833 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6438 - 6246
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||     
T  6438 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctat 6340  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||    ||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6339 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 6246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7127 - 6944
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  7127 ggtttgacgtaaaaatgatttttggttcttgatatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctta 7028  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  7027 gttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 6944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 303 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6780 - 6684
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6780 gtaatgtaatatatttgtatatgtagtatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 35990 - 36224
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||  ||||||    
T  35990 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttctggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttaggaaaat 36089  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||     
T  36090 tcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattc 36189  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
     ||  |||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  36190 gactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatg 36224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8123 - 7941
Alignment:
Q  28 ttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc 127  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8123 ttgaaaatgatttttgactcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatcc 8024  T
Q  128 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8023 aaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 179
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8263
Alignment:
Q  68 tccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 167  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||     
T  8152 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtt 8251  T
Q  168 ctaggagttcaa 179  Q
    ||| ||||||||    
T  8252 ctatgagttcaa 8263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 12974 - 13164
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| |||    
T  12974 ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttttaa 13073  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13074 gttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7601 - 7510
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttga 391  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  7601 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttga 7510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14720 - 14629
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttga 391  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  14720 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttga 14629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 19369 - 19431
Alignment:
Q  148 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19369 aaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1718 - 1509
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  1718 ttagctttacaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 1619  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1618 tcggcataaccaattctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaacaagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 1519  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  1518 aacctatgtt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 145 - 4
Alignment:
Q  5 ctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcag 104  Q
    |||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| |    
T  145 ctttccaatggctttggtttaactggaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcgg 46  T
Q  105 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc 146  Q
    ||||||   ||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  45 cataaccaattctatgttaatccaaaacttatgggataattc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2197 - 1988
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  2197 ttagctttccagtgactttagtttgacgtgaaaataatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 2098  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||||| ||||||    
T  2097 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcatacctcaaaactagaagtattatgagttctattagggtatttaagggtattt 1998  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  1997 aacctatgtt 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 5542 - 5413
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| || |||||||    
T  5542 ttagctttccactgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 5443  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaa 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5442 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5229 - 5141
Alignment:
Q  122 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5229 taatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 5141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3886 - 3701
Alignment:
Q  18 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3886 tcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttct 3787  T
Q  118 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||| | ||||||||    
T  3786 aagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaggactaggagtttaattaaggggtttaacaatatttaac 3701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9688 - 9479
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  9688 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 9589  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  9588 taagcataactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattattt 9489  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  9488 aacctatgtt 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 138408 - 138135
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||  || |||||||    
T  138408 ttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttcgtgaaaccttatgaaaat 138309  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  138308 tcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgtgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtattt 138209  T
Q  201 aacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    || | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  138208 aatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatttgtgaagctg 138135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 206 - 407
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4752
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    |||||    
T  4555 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgatga----tagta 4650  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||| || ||||| | |||||    
T  4651 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttgaaatgtttaagttgttgatgattatcatatgatattattatatctggatatgttaatgtgtt 4750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4034 - 3843
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  4034 ggtttgacttgaaaatgacttttggtatttgagatatgatgaaaatactccatggagatcttagtgaaattttatgaaaatttagtttaacagtttctaa 3935  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  3934 gtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagtatttaacctatgtt 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11792 - 11583
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| ||| |||||| ||||| || |||||||    
T  11792 ttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttattatcaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaat 11693  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  11692 tcagcacagccgtttctaagttaatccaaaacctagggaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattacggtgtttaagagtattt 11593  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
     |||||||||    
T  11592 gacctatgtt 11583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 51568 - 51355
Alignment:
Q  24 tgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtta 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  51568 tgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatcaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagtta 51469  T
Q  124 atccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 223  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |    
T  51468 atccaaaacttatgagataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttaaaataaggtgtttaagagtatttaatcaatgttgtgagttgatc-t 51370  T
Q  224 tggggtaggaatgga 238  Q
    |||| ||||||||||    
T  51369 tgggataggaatgga 51355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 67301 - 67187
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  67301 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 67202  T
Q  101 tcagcataactgttt 115  Q
    |||||||||| ||||    
T  67201 tcagcataaccgttt 67187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 120543 - 120341
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |  |||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  120543 ttagctttccagtggctttagtttgacgcgaaaatgatttttttttcttgagatatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 120444  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||    
T  120443 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtattt 120344  T
Q  201 aac 203  Q
    |||    
T  120343 aac 120341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 170
Target Start/End: Original strand, 29637 - 29785
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 121  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  29637 tttgacttgaaaatcatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagt 29736  T
Q  122 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta 170  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29737 taatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacta 29785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 304 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 120176 - 120074
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  120176 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaactatatcagatgtttaagttattgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 120077  T
Q  404 ttg 406  Q
    |||    
T  120076 ttg 120074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 169071 - 168861
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  169071 ttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaat 168972  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatt 199  Q
    | || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| ||  ||| ||||||||    
T  168971 ttagtataacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctctaaactggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagtatt 168872  T
Q  200 taacctatgtt 210  Q
    |||| ||||||    
T  168871 taacttatgtt 168861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 146345 - 146261
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  146345 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 146261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30245 - 30036
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  30245 ttagctttccagtgtcgtaggtttgactagaaaatgatttttgatttaggagttatgatgaaaatactacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaat 30146  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  30145 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggaaataattccaaacctcaagactagaagtaataggagtttaattaaggtgtttaagagtatct 30046  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  30045 aacttatgtt 30036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 29844 - 29747
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatattt-gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 397  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  29844 tagtaatgtaatatattttgtatgtgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgtt 29747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7852 - 7643
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||| |||||||    
T  7852 ttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaat 7753  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||    
T  7752 tcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtattt 7653  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  7652 aacctatgtt 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14483 - 14274
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||| |||||||    
T  14483 ttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaat 14384  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||    
T  14383 tcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtattt 14284  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  14283 aacctatgtt 14274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26559 - 26358
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||| || |||||||    
T  26559 ttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 26460  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26459 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 26360  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  26359 aa 26358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27941 - 27740
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||| || |||||||    
T  27941 ttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 27842  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27841 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 27742  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  27741 aa 27740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 210
Target Start/End: Original strand, 422 - 610
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  |||||||||    
T  422 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagt 521  T
Q  122 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  522 taatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaatttaatctatgtt 610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 210
Target Start/End: Original strand, 5726 - 5914
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  |||||||||    
T  5726 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagt 5825  T
Q  122 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  5826 taatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaatttaatctatgtt 5914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 1549 - 1480
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaat 89  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1549 ggtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22633 - 22482
Alignment:
Q  59 tgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaa 158  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22633 tgaaaatactccaaggaggtcgtagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaa 22534  T
Q  159 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22533 ctagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 22482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 10367 - 10554
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  10367 ggtttaacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaacgtttctaa 10466  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaaccta 206  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  10467 gttaatccaaaacttatagaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttatgagtatttaaccta 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 208 - 399
Target Start/End: Original strand, 621 - 808
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 307  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || || |  ||| |||||| |||| | ||||||||||    ||||    
T  621 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtaagcctgatataatgtgatctgatgttgatag----taat 716  T
Q  308 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  717 gtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcttttgatattgttatatcttgagatgttta 808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 206 - 369
Target Start/End: Original strand, 2285 - 2444
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  2285 atgttatgagttggtccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgtcctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 2380  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatc 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2381 atttaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgtagttgattatc 2444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 819 - 632
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  819 ggtttgacgtgaaaatgaattttggttctcgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcaacataaccgtttctaa 720  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 207  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  719 gttaattcaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaactagggggtttaagagtatttaacctat 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 226 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10715 - 10539
Alignment:
Q  226 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     |||||| ||||| |||||||     
T  10715 gggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtgaagctgt-ataatatgattttaatgttgatat----taatgtgatataattgtatac 10621  T
Q  325 gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  10620 gcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttacatctagagatgtttatgtgttg 10539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11257 - 11101
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  11257 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagt 11158  T
Q  122 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 178  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11157 taatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 274
Target Start/End: Original strand, 15513 - 15542
Alignment:
Q  245 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15513 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 15542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12948 - 12748
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||    
T  12948 ggttttacttgaaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaa 12849  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||  |||||||    
T  12848 gttaatccaaaacttatggaataattccaatccataaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttga 12749  T
Q  220 t 220  Q
    |    
T  12748 t 12748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 206 - 388
Target Start/End: Original strand, 13979 - 14158
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  13979 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 14074  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  14075 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 14158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 186943 - 187133
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||     
T  186943 ggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctag 187042  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  187043 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 187133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 206 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3857 - 3701
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  3857 atgttatgagttgatccttgaggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 3762  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 366  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3761 atgtaatatatttgtatatgtattatgtggattatataagatgtttaagtgaatgttgatt 3701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 206 - 389
Target Start/End: Original strand, 520 - 699
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagt 304  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||     |    
T  520 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatataaatgatgatctatgaagttgt-ataatatgattttaatgttgatat----t 614  T
Q  305 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 389  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  615 aatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 207
Target Start/End: Original strand, 9711 - 9851
Alignment:
Q  66 actccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaag 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9711 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaag 9810  T
Q  166 tactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 207  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9811 tactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctat 9851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 38394 - 38338
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38394 ttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 38338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 66451 - 66660
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||||||    
T  66451 ttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 66550  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || || ||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  66551 tccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaagcttcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgcttaagagtattt 66650  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  66651 aacctatgtt 66660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 332537 - 332423
Alignment:
Q  246 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 345  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  332537 tataatattactgatgttctatgaatctgttatattatgattttatgttgaaag----taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattataaatt 332442  T
Q  346 atgtttaagttgatgttga 364  Q
    |||||||||||||||||||    
T  332441 atgtttaagttgatgttga 332423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Original strand, 18026 - 18215
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||    || | |||||    
T  18026 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgat----attgttagta 18121  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18122 atgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgtttattatcatttgatattgttatatcttgagatattta 18215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 23623 - 23799
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||    
T  23623 ttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaat 23722  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 177  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23723 tcagcataagcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 23799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21193 - 21040
Alignment:
Q  82 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21193 agtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 21094  T
Q  182 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21093 aagggttttaagagcatttaacctatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatg 21040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 769 - 977
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |  |||| || || |||| |||||||    
T  769 ttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaat 868  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||    
T  869 tcagcataaccgtttctaagtcaatacaaaacttatagaatatttccaaacctcgaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtattt 968  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  969 aacctatgt 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10314 - 10135
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||| || ||          ||||    
T  10314 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaa-ttttatgaaaagtccgc----------ctaa 10226  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  10225 gtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttgagagtatttaacctatgtt 10135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1325 - 1135
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||     
T  1325 ggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctag 1226  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1225 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Original strand, 65419 - 65612
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  65419 ggtttgacttgaaaaggagttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctag 65518  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || || |||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  65519 gtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 65612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 403
Target Start/End: Original strand, 75778 - 75880
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  75778 tagtaatgtgataaaattgtatttgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 75877  T
Q  401 gtg 403  Q
    |||    
T  75878 gtg 75880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 252
Target Start/End: Original strand, 75686 - 75733
Alignment:
Q  205 tatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  75686 tatgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataata 75733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 301 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8202 - 8097
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 400  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8202 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttat 8103  T
Q  401 gtgttg 406  Q
    ||||||    
T  8102 gtgttg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8591 - 8495
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  8591 ttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 206 - 398
Target Start/End: Original strand, 206383 - 206570
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||| ||| |||    ||    
T  206383 atgttatgaggtgatccttggtgtaggaacagaggttgattataatattactgatgttctatgaatatgttataacatgatttaatattgttag----ta 206478  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  206479 atgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatacaagatgattaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 206570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 299 - 106
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||     
T  299 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactgtaaggagatcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctag 200  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  199 gtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 62332 - 62139
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||     
T  62332 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactacttctag 62233  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  62232 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 62139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 39328 - 39372
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggt 45  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39328 ttagctttccaatggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 39372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 208 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 906 - 713
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 307  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  906 gttatgagatgacccttggggtagga-tggaggttgattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 812  T
Q  308 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  811 gtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttcatgatgtgatatcttgagatgtttatgtgttg 713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 343
Target Start/End: Original strand, 60573 - 60706
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | || |     
T  60573 atgttatgagttgaaccttggggtaggaatggagattgtatatgatattaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgtt----gttaatt 60668  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  60669 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatata 60706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 85807 - 85618
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagt 304  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||| ||||| ||||     |    
T  85807 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttggatatgatattaatgatgatccgcgaagctat-ataatatgattttaatgtcgatat----t 85713  T
Q  305 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||| ||||| | ||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  85712 aatgtgatataatcgtatacgcattacatgaattatatatgatgcttaagttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 85618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8431 - 8240
Alignment:
Q  23 ttgacttgaaaatgatttttggttttt-gagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8431 ttgacttgaaaatgatttttggttttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggt 8332  T
Q  122 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
     || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8331 caacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 8240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15117
Alignment:
Q  316 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15030 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 15117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 303 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 915
Alignment:
Q  303 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 402  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  1021 gtaatgtaatatatttatatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgt 922  T
Q  403 gttgtct 409  Q
    | |||||    
T  921 gctgtct 915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 276 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 2086 - 1967
Alignment:
Q  276 tataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 375  Q
    ||||||||||||| |||||    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2086 tataatatgatttgatgtt----gttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 1991  T
Q  376 tgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  1990 tattgttatatcttgagatgttta 1967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 56590 - 56397
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  56590 ggtttaacttgcaaatgatttttggttttggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattccgcataactatttctag 56491  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56490 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 56397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33469 - 33334
Alignment:
Q  83 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 182  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  33469 gtgaaatcttatgaaaattcagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagcactatgagttcaatta 33370  T
Q  183 aggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33369 aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 33334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 33744 - 33648
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||    
T  33744 ttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgagttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccgaggaggtcttagtgaatttttatgaa 33648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 398
Target Start/End: Original strand, 18190 - 18284
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  18190 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 18284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 869 - 767
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  869 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaaat 770  T
Q  101 tca 103  Q
    |||    
T  769 tca 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 206 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2956 - 2849
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  2956 atgttatgaattgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattaatgatgacctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 2861  T
Q  306 atgtaatatatt 317  Q
    ||||||||||||    
T  2860 atgtaatatatt 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 387
Target Start/End: Original strand, 15959 - 16136
Alignment:
Q  207 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 306  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | || |||    
T  15959 tgttatgagttgaacctttgggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg---gtta-taa 16054  T
Q  307 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  16055 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 16136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13391 - 13213
Alignment:
Q  207 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 306  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | || |||    
T  13391 tgttatgagttaaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg---gtta-taa 13296  T
Q  307 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga--tgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||   |||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  13295 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 13213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2802 - 2737
Alignment:
Q  333 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  2802 tgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 214
Target Start/End: Original strand, 18092 - 18285
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||     
T  18092 ggtttgacttgaaaatcatgttttgtttttgagttatgatgaaaatactccaagcaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctag 18191  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18192 gtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 18285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 206 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8389 - 8296
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389 atgttatgagttaatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctttgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 8296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18797 - 18589
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||| || |||||||    
T  18797 ttagctttccagtgactttggtttgacttgataatggtttttgtttttcgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttagagaaatcttatgaaaat 18698  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18697 tctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 18599  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||| ||||||    
T  18598 aacatatgtt 18589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26148 - 25940
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26148 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttagtttttgagctatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 26049  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    || |||||||| ||||||||| || |||||||| | |||     |  || | |||||||| |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26048 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaactgatggatcgtcttcaatcttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 25950  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  25949 aacctatgtt 25940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8139 - 7931
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| || ||| ||||  |  |||| || || |||| |||||||    
T  8139 ttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttgtagattttgagatatgatggaattaccccaagaaagtcttggtaaatttttatgaaaat 8040  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| || | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||| ||| |||||    
T  8039 tcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacatatgaaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttgagaatattt 7940  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  7939 aacctatgt 7931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 399
Target Start/End: Original strand, 221072 - 221254
Alignment:
Q  212 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 311  Q
    |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| |||||| |||||| |||||| |||    |||||| |    
T  221072 tgagttgacccttcgggtaggaatagaggttgattatagtagtgttgatgttcagtgagtctgatataatttgatttgatgttgttag----taatgtga 221167  T
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  221168 tatagttgtatatgcattatgtggattatataagac-tttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 221254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 189460 - 189511
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  189460 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 189511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 209
Target Start/End: Original strand, 11664 - 11844
Alignment:
Q  28 ttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc 127  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| | | |||| || ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || ||    
T  11664 ttgaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaaggcggtcttggtaaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaaccc 11763  T
Q  128 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 209  Q
    |||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |   |||||||||||||||||||||    
T  11764 aaaacttatggattgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa-gaggttaagagtatttaacctatgt 11844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 11626 - 11833
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||  ||||  || |||| || || |||| || ||||    
T  11626 ttagctttccaatgggtttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaacccaagcaggtcttggtaaatttttatggaaat 11725  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| |||    
T  11726 tcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagt-ttt 11824  T
Q  201 aacctatgt 209  Q
    |||||||||    
T  11825 aacctatgt 11833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34893 - 34689
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34893 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 34794  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattt 200  Q
     | |||||||| ||||||    || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34793 accgcataactatttcta----aacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 34699  T
Q  201 aacctatgtt 210  Q
    ||||||||||    
T  34698 aacctatgtt 34689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 35937 - 36144
Alignment:
Q  2 tagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaatt 101  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  35937 tagctttccaatgacttcagttttacttgaaaatgattttttgctttttagttatgatgaaaatactcaaaggatgtcttagtgaaattttataaaaatt 36036  T
Q  102 cagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtattta 201  Q
    | |||||||| ||||||||| ||  ||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  36037 ccgcataactatttctaagtcaactcaaaacttatgtattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtattta 36135  T
Q  202 acctatgtt 210  Q
    |||||||||    
T  36136 acctatgtt 36144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 7293 - 7408
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  7293 ggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttctaa 7392  T
Q  120 gttaatccaaaactta 135  Q
    || || || |||||||    
T  7393 gtcaaccccaaactta 7408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 14490 - 14424
Alignment:
Q  31 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  14490 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3128 - 3029
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3128 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 3029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 135 - 1
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  135 ttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaat 36  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35 tcagtataaccttttctaagttaatccaaaactta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 2516 - 2403
Alignment:
Q  6 tttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagc 105  Q
    ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2516 tttccaatggctttggttagacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactacaaagaggtcttagtgaagttttatgaaaattcagc 2417  T
Q  106 ataactgtttctaa 119  Q
    ||||| ||||||||    
T  2416 ataaccgtttctaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 422
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  473 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 206 - 399
Target Start/End: Original strand, 29282 - 29472
Alignment:
Q  206 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 305  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| |  ||||  ||  ||| ||||||||| | |||| |||    ||    
T  29282 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttaagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttag----ta 29377  T
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29378 atgtgatatatttgcatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagaagttta 29472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 121
Target Start/End: Original strand, 1057 - 1173
Alignment:
Q  5 ctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcag 104  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||||||    
T  1057 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 1156  T
Q  105 cataactgtttctaagt 121  Q
    || |||  |||||||||    
T  1157 cacaaccatttctaagt 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 236
Target Start/End: Original strand, 1373 - 1468
Alignment:
Q  140 ataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 236  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1373 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Original strand, 2493 - 2593
Alignment:
Q  22 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2493 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagt 2592  T
Q  122 t 122  Q
    |    
T  2593 t 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 210
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3149
Alignment:
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3059 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 276 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4060 - 3940
Alignment:
Q  276 tataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttg 374  Q
    ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4060 tataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttg 3965  T
Q  375 atgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
     |  |||||||||||||||||||||    
T  3964 gtaatgttatatcttgagatgttta 3940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10334 - 10236
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10334 tagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgatgattattatttgatattgttacatcttgagatgttta 10236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10411 - 10358
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg 261  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| || ||||||    
T  10411 gttatgagttgatccttggtgtaggaatagaggttgattataatgtttatgatg 10358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 18545 - 18679
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18545 ttagctttacagtggcgtcggtttgactcgaatataatttttggtttttgatttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 18644  T
Q  101 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 135  Q
    || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  18645 tcggcataactatttctaagtcaaaccaaaactta 18679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 2218 - 2406
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  || |||| || || |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  2218 ggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaa 2317  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 209  Q
     | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  2318 atcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 10473 - 10661
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  || |||| || || |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  10473 ggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaa 10572  T
Q  120 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 209  Q
     | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||   ||| ||||| ||||||||||||    
T  10573 atcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaagaggtttgagagt-tttaacctatgt 10661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 102 - 189
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 88  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  102 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagaacttaatgaaa 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 8058 - 8173
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |    
T  8058 ggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgaagaaaataccacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctta 8157  T
Q  120 gttaatccaaaactta 135  Q
    || || ||||||||||    
T  8158 gtcaacccaaaactta 8173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Original strand, 2620 - 2719
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  2620 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacatggatatatcttgagatgttta 2719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 206
Target Start/End: Original strand, 2377 - 2458
Alignment:
Q  125 tccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 206  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  2377 tccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaccta 2458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 304 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 191 - 101
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  191 taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgatgatgtttatcatttgatattgttatatcttgagat 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 693 - 628
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  693 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 306 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8000 - 7900
Alignment:
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8000 atgtaatatatttgtgtatggattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgcttattatttgatattgttatatc-tgagatgtttatgtgt 7902  T
Q  405 tg 406  Q
    ||    
T  7901 tg 7900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 24482 - 24579
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaa 98  Q
    ||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24482 ttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 214
Target Start/End: Original strand, 24586 - 24635
Alignment:
Q  165 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24586 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 24635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 406
Target Start/End: Original strand, 4256 - 4324
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4256 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttg 4324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 58037 - 57898
Alignment:
Q  246 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 345  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  58037 tataatattactgatgatctgttaaactgttataa-attatttaatgttgttag----taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatttaaa 57943  T
Q  346 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 391  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  57942 atgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 57898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 306 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1868 - 1785
Alignment:
Q  306 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattat-ataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 388  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1868 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattattataaggagtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 1785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1964 - 1928
Alignment:
Q  208 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1964 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttga 1928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 30503 - 30404
Alignment:
Q  301 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  30503 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgttgattgattattatttgacattgttatgtcttgagatgttta 30404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 7796 - 7911
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 100  Q
    ||||||||||| || | | ||||||| || |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||    
T  7796 ttagctttccagtggctttggtttgaattaaaaatgatttttggtttgagagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaat 7895  T
Q  101 tcagcataactgtttc 116  Q
    || |||||||| ||||    
T  7896 tccgcataactatttc 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 11793 - 11974
Alignment:
Q  28 ttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || || |     
T  11793 ttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaagggggtcttagtgaaattttatgaaaatttcacataactatttctaggtcaaccg 11892  T
Q  128 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    |||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11893 aaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 11974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 403
Target Start/End: Original strand, 53825 - 53890
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53825 tatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 53890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 387
Target Start/End: Original strand, 128922 - 129005
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  128922 taatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 116673 - 116608
Alignment:
Q  211 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  116673 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 116608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6203 - 6116
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 391  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6203 taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgaggatgtttatcatttgatattgttatatcttga 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 13210 - 13402
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttt---tgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgttt 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |   |||| ||||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  13210 ggtttgacttgaaaatgatatttaggttgtgagtgagttatgatgaaaacactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactattt 13309  T
Q  116 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 208  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |  | | |||| ||||||||| ||||| || ||||| || ||||   |||||||||||||||| ||||    
T  13310 ctaagtcaacccaaaacttatggattgttcccaaacttcaaaactataagtattacgagtttaattaagaggtttaagagtatttaacatatg 13402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 338 - 403
Target Start/End: Original strand, 6889 - 6954
Alignment:
Q  338 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6889 tatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 6954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32872 - 32671
Alignment:
Q  5 ctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcag 104  Q
    |||||||||| | | |||||||||| |||||||||| | | |||| |||||||||| || ||| ||||  |  ||||  | || |||| |||||||| ||    
T  32872 ctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttctagatttttagatatgatggaattaccccaagcaagtcttgataaatttttatgaaaatt-ag 32774  T
Q  105 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 204  Q
    |||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||  |||||||||||||    
T  32773 cataatcgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaagttggagagtatttaacc 32674  T
Q  205 tat 207  Q
    |||    
T  32673 tat 32671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 403
Target Start/End: Original strand, 6932 - 6993
Alignment:
Q  342 taagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 403  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6932 taagttgtttaagttgatgttgattatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 6993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 48487 - 48403
Alignment:
Q  312 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48487 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 48403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3500
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  3596 ttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgacgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 3178
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3215 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 3178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 16407 - 16493
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaa 87  Q
    |||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  16407 ttagatttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaa 16493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 210
Target Start/End: Original strand, 16525 - 16598
Alignment:
Q  137 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  16525 ggaataattcaaaacctcaaaactataagtactaggaatttaattaagggttttaaaaatatttaacctatgtt 16598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 295
Target Start/End: Original strand, 27526 - 27614
Alignment:
Q  207 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 295  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27526 tgttatgagttgaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 27614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 387
Target Start/End: Original strand, 27646 - 27785
Alignment:
Q  245 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataa 344  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | || |||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||      
T  27646 atatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg---gtta-taatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgt 27741  T
Q  345 g-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    | |||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  27742 gaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 27785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 21321 - 21225
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  21321 ttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 418 - 367
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  418 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 11584 - 11635
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11584 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 11635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 32743 - 32794
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32743 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 32794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 36169 - 36220
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36169 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 36220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 97175 - 97092
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  97175 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 106453 - 106370
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 387  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  106453 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 6519 - 6423
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| || ||| ||||| |||| |||| ||||    
T  6519 ttagctttccagtggcgtcggtgtgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgcaaatactcaaaggaggtcttaatgaatttttatgaa 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 14170 - 14221
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14170 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttacgtgt 14221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 58802 - 58853
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  58802 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 58853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0956 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0956
Description:

Target: scaffold0956; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 62
Target Start/End: Original strand, 2361 - 2403
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 62  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2361 ggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 119 - 53
Alignment:
Q  31 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  119 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2422 - 2364
Alignment:
Q  152 ctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  2422 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgtt 2364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 62
Target Start/End: Original strand, 174586 - 174628
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  174586 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaa 174628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 404
Target Start/End: Original strand, 207591 - 207636
Alignment:
Q  359 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  207591 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgt 207636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1066 - 874
Alignment:
Q  21 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||   | ||||||  ||| |||   |||||||||||||||  ||||| ||    
T  1066 gtttgacttgaaaatgatttttatattttaagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttaggaaaactttacaaaaattcagcataaccatttcttag 967  T
Q  121 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 214  Q
    | || ||||| |||| ||  |  ||| ||||  |||||||  | |||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  966 tcaacccaaagcttatggtttgtttccaaactccaaaact-tatgtactttgagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacctatgatatga 874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 13965 - 13909
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13965 ttagctttccagtggaatcggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgagttatg 13909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 40972 - 40916
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 57  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40972 ttagctttacagtggcatcggtttgacttgaaaatgattttcggtttttgagttatg 40916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 3958 - 4009
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3958 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 4009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5235
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5184 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 5235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12445 - 12394
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12445 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 20512 - 20627
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||  || |||| | ||||||||  | ||| | ||||||||| |||| ||    
T  20512 ggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgacggaaatactccaagtaggtcttggagaaattttaaggaaacttagcataactatttccaa 20611  T
Q  120 gttaatccaaaactta 135  Q
    || || || |||||||    
T  20612 gtcaacccgaaactta 20627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 9673 - 9606
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 68  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  9673 ttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatact 9606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 11829 - 11766
Alignment:
Q  34 atgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  11829 atgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 11766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 65611 - 65662
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  65611 agttgttgttgattatcgtttgatattgttatatcctgagatgtttacgtgt 65662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 61695 - 61746
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  61695 agttgttgttgattatcattagatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 61746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 80738 - 80687
Alignment:
Q  353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 404  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  80738 agttgttgttgattatcatttaatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 80687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 398
Target Start/End: Original strand, 6235 - 6329
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  6235 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 38486 - 38392
Alignment:
Q  304 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 398  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||||| |  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  38486 taatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 38392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1620 - 1583
Alignment:
Q  357 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 394  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1620 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 1583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 210
Target Start/End: Original strand, 1 - 49
Alignment:
Q  162 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 210  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1 gaagtgctatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 406
Target Start/End: Original strand, 10858 - 10906
Alignment:
Q  358 atgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 406  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10858 atgttgagtattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttg 10906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 9814 - 9718
Alignment:
Q  1 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 97  Q
    |||||||||||||| | | ||||||   | ||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  9814 ttagctttccaatggctttggtttggagtaaaaattatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17278 - 17163
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 119  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||  || | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || |||||||||    
T  17278 ggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaagaaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaa 17179  T
Q  120 gttaatccaaaactta 135  Q
    || || ||||| ||||    
T  17178 gtcaacccaaacctta 17163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11688 - 11659
Alignment:
Q  245 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11688 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 11659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Original strand, 16541 - 16613
Alignment:
Q  323 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  16541 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 16613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Original strand, 35068 - 35117
Alignment:
Q  20 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 69  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35068 ggtttgacttgaaaataatattttgtttttgagttatgaagaaaatactc 35117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 209073 - 209001
Alignment:
Q  323 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 396  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  209073 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 209001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University